View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1125_low_15 (Length: 510)

Name: NF1125_low_15
Description: NF1125
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1125_low_15
NF1125_low_15
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (30-502)||(18059582-18060057)
chr1 (30-502)||(17004595-17005070)
chr1 (30-502)||(38054915-38055390)
chr1 (153-502)||(17148647-17149000)
chr1 (78-450)||(46523394-46523768)
chr1 (210-502)||(19962323-19962617)
chr1 (209-496)||(22227947-22228236)
chr1 (209-447)||(22232644-22232882)
chr1 (192-450)||(22035568-22035827)
chr1 (192-450)||(7640810-7641069)
chr1 (299-476)||(5072237-5072411)
chr1 (209-408)||(2116393-2116589)
chr1 (209-408)||(45051561-45051757)
chr1 (377-476)||(15861258-15861358)
chr1 (299-390)||(18601052-18601141)
chr1 (386-456)||(18598845-18598914)
chr1 (33-77)||(13377085-13377129)
chr1 (30-74)||(21650295-21650339)
chr1 (30-82)||(17148524-17148576)
chr1 (33-73)||(20177133-20177173)
chr1 (67-115)||(22035442-22035490)
chr1 (30-74)||(44035226-44035270)
chr1 (334-450)||(51452765-51452882)
chr1 (72-114)||(20254311-20254353)
chr1 (67-115)||(7641147-7641195)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (30-502)||(22225562-22226037)
chr6 (30-502)||(16376197-16376672)
chr6 (30-502)||(16383521-16383996)
chr6 (30-502)||(10488656-10489131)
chr6 (30-492)||(16555973-16556438)
chr6 (30-492)||(16632529-16632994)
chr6 (41-497)||(1555974-1556434)
chr6 (67-476)||(19610012-19610425)
chr6 (244-502)||(22251390-22251648)
chr6 (153-476)||(16231972-16232297)
chr6 (210-502)||(19299375-19299669)
chr6 (153-459)||(18086690-18086999)
chr6 (153-450)||(23977849-23978149)
chr6 (153-408)||(13620712-13620970)
chr6 (299-494)||(27653814-27654006)
chr6 (192-476)||(29869627-29869911)
chr6 (42-160)||(33314387-33314505)
chr6 (142-404)||(29665942-29666208)
chr6 (299-451)||(25175792-25175945)
chr6 (209-502)||(14625953-14626243)
chr6 (299-397)||(16825678-16825775)
chr6 (299-408)||(1650022-1650128)
chr6 (334-502)||(15862744-15862916)
chr6 (334-502)||(1657566-1657738)
chr6 (377-450)||(4991396-4991470)
chr6 (392-486)||(16814837-16814930)
chr6 (30-82)||(16231849-16231901)
chr6 (33-77)||(18381928-18381972)
chr6 (30-74)||(19983547-19983591)
chr6 (30-82)||(23977726-23977778)
chr6 (30-74)||(35015413-35015457)
chr6 (138-253)||(27740903-27741021)
chr6 (30-82)||(18087070-18087122)
chr6 (30-82)||(13621041-13621093)
chr6 (45-81)||(18629852-18629888)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (30-502)||(49232393-49232868)
chr3 (30-502)||(1467563-1468038)
chr3 (41-502)||(12264615-12265080)
chr3 (67-497)||(25058733-25059168)
chr3 (170-502)||(12811938-12812273)
chr3 (33-486)||(22275168-22275626)
chr3 (33-502)||(15468162-15468637)
chr3 (67-476)||(5228307-5228719)
chr3 (55-408)||(12902008-12902364)
chr3 (153-502)||(18911073-18911427)
chr3 (243-497)||(18896871-18897127)
chr3 (145-450)||(54651529-54651837)
chr3 (67-408)||(44228979-44229323)
chr3 (55-189)||(18897139-18897273)
chr3 (30-497)||(16821096-16821564)
chr3 (299-476)||(41270304-41270478)
chr3 (299-476)||(55316448-55316622)
chr3 (307-408)||(15936553-15936654)
chr3 (307-408)||(15938395-15938496)
chr3 (269-408)||(15615032-15615168)
chr3 (377-502)||(23492696-23492823)
chr3 (377-502)||(14842392-14842519)
chr3 (376-450)||(8268609-8268683)
chr3 (376-450)||(8275709-8275783)
chr3 (142-326)||(11986174-11986361)
chr3 (30-74)||(16934229-16934273)
chr3 (30-74)||(17956240-17956284)
chr3 (30-82)||(18910950-18911002)
chr3 (353-450)||(2449111-2449208)
chr3 (33-74)||(13838854-13838895)
chr3 (334-474)||(13954738-13954880)
chr3 (45-81)||(33369149-33369185)
chr3 (377-428)||(30153265-30153316)
chr3 (40-81)||(1990767-1990808)
chr3 (377-450)||(38168237-38168310)
chr3 (334-474)||(45861078-45861220)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (30-502)||(39060-39535)
scaffold0076 (210-502)||(43137-43426)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (30-502)||(7822685-7823160)
chr7 (30-502)||(7829996-7830471)
chr7 (30-502)||(27176390-27176865)
chr7 (30-502)||(27101461-27101936)
chr7 (30-502)||(27108809-27109284)
chr7 (30-502)||(38783553-38784028)
chr7 (30-502)||(15950614-15951090)
chr7 (41-497)||(15759941-15760401)
chr7 (153-476)||(18979872-18980197)
chr7 (153-476)||(15927648-15927973)
chr7 (153-502)||(14250721-14251074)
chr7 (153-450)||(13758450-13758750)
chr7 (299-502)||(2437686-2437888)
chr7 (209-502)||(16478786-16479075)
chr7 (299-476)||(10989638-10989814)
chr7 (191-494)||(13910855-13911156)
chr7 (205-408)||(48622584-48622788)
chr7 (210-476)||(13572816-13573079)
chr7 (192-408)||(10000288-10000505)
chr7 (307-408)||(18253761-18253862)
chr7 (328-408)||(15862177-15862257)
chr7 (192-408)||(16418618-16418835)
chr7 (191-450)||(13321134-13321407)
chr7 (377-451)||(15516719-15516793)
chr7 (30-82)||(14251145-14251197)
chr7 (30-74)||(371045-371089)
chr7 (30-82)||(13758327-13758379)
chr7 (30-82)||(15927525-15927577)
chr7 (334-450)||(7293289-7293406)
chr7 (334-450)||(30262002-30262119)
chr7 (41-111)||(15852425-15852494)
chr7 (353-450)||(11516520-11516617)
chr7 (353-450)||(15441437-15441534)
chr7 (67-115)||(10000583-10000631)
chr7 (67-115)||(16418492-16418540)
chr7 (33-77)||(17224183-17224227)
chr7 (30-82)||(18980268-18980320)
chr7 (353-408)||(14113904-14113959)
chr7 (334-408)||(14423555-14423629)
chr7 (377-450)||(16212071-16212144)
chr7 (30-74)||(1937256-1937300)
chr7 (41-81)||(13377495-13377535)
chr7 (41-77)||(17947837-17947873)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (30-502)||(11231162-11231637)
chr2 (30-502)||(22513009-22513484)
chr2 (30-502)||(24685605-24686080)
chr2 (30-502)||(28775631-28776106)
chr2 (30-450)||(12728349-12728772)
chr2 (30-450)||(34824432-34824855)
chr2 (41-502)||(16935561-16936027)
chr2 (41-502)||(17006221-17006687)
chr2 (55-408)||(23777963-23778319)
chr2 (153-502)||(42177791-42178145)
chr2 (153-450)||(8943926-8944226)
chr2 (153-450)||(12635744-12636044)
chr2 (153-447)||(3798482-3798779)
chr2 (153-450)||(12641518-12641818)
chr2 (67-361)||(21141889-21142187)
chr2 (299-502)||(19886484-19886684)
chr2 (192-450)||(23774257-23774516)
chr2 (192-408)||(5888548-5888765)
chr2 (377-494)||(24826531-24826646)
chr2 (377-450)||(25213372-25213446)
chr2 (209-408)||(7507758-7507969)
chr2 (30-74)||(22283911-22283955)
chr2 (30-82)||(42178216-42178268)
chr2 (30-82)||(3798850-3798902)
chr2 (30-82)||(12636115-12636167)
chr2 (30-74)||(22274678-22274722)
chr2 (30-77)||(12641894-12641941)
chr2 (41-115)||(23774106-23774179)
chr2 (30-75)||(8943803-8943848)
chr2 (353-450)||(14906313-14906410)
chr2 (334-408)||(19689316-19689391)
chr2 (353-450)||(23820364-23820461)
chr2 (33-74)||(25601982-25602023)
chr2 (41-81)||(67958-67998)
chr2 (67-115)||(5888843-5888891)
chr2 (334-408)||(17396568-17396643)
chr2 (353-450)||(20015304-20015401)
chr2 (41-81)||(23821846-23821886)
chr2 (41-81)||(23830925-23830965)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (30-502)||(31266-31741)
scaffold0107 (30-359)||(39603-39935)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (30-502)||(271184-271659)
chr8 (30-502)||(644261-644736)
chr8 (30-502)||(829996-830471)
chr8 (30-502)||(22088618-22089093)
chr8 (30-502)||(15318983-15319458)
chr8 (30-502)||(15499352-15499827)
chr8 (30-476)||(22006107-22006557)
chr8 (30-502)||(13662087-13662564)
chr8 (153-502)||(13720750-13721104)
chr8 (67-450)||(16195224-16195611)
chr8 (153-450)||(16872927-16873227)
chr8 (209-502)||(6774083-6774371)
chr8 (209-502)||(24549120-24549409)
chr8 (299-494)||(30120951-30121144)
chr8 (210-502)||(21844394-21844684)
chr8 (210-502)||(21851787-21852077)
chr8 (299-459)||(16674258-16674415)
chr8 (334-474)||(17345842-17345985)
chr8 (30-82)||(13721175-13721227)
chr8 (30-74)||(3431536-3431580)
chr8 (462-502)||(17142854-17142894)
chr8 (30-77)||(16873303-16873350)
chr8 (334-450)||(22907087-22907204)
chr8 (353-450)||(5238380-5238477)
chr8 (353-450)||(24661121-24661218)
chr8 (33-74)||(24929053-24929094)
chr8 (353-450)||(43685839-43685936)
chr8 (33-77)||(23837156-23837200)
chr8 (30-64)||(24717128-24717162)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (30-502)||(21932205-21932680)
chr5 (30-502)||(21938375-21938850)
chr5 (30-502)||(22882908-22883383)
chr5 (30-502)||(35581993-35582468)
chr5 (30-502)||(36989594-36990069)
chr5 (30-450)||(1219396-1219819)
chr5 (67-476)||(7425318-7425729)
chr5 (153-502)||(10777794-10778146)
chr5 (33-486)||(17471427-17471885)
chr5 (67-476)||(35790947-35791361)
chr5 (41-502)||(11211886-11212352)
chr5 (153-502)||(23514641-23514995)
chr5 (299-502)||(18777815-18778015)
chr5 (299-502)||(19500128-19500327)
chr5 (299-502)||(21073418-21073618)
chr5 (299-502)||(12603-12803)
chr5 (299-494)||(22366311-22366504)
chr5 (209-494)||(29188116-29188397)
chr5 (192-450)||(23328678-23328937)
chr5 (210-476)||(27009981-27010244)
chr5 (192-450)||(24616282-24616541)
chr5 (192-450)||(24712658-24712917)
chr5 (192-450)||(24745676-24745935)
chr5 (299-494)||(4199816-4200008)
chr5 (299-459)||(43443261-43443418)
chr5 (299-451)||(25426857-25427009)
chr5 (377-502)||(11343008-11343133)
chr5 (377-502)||(16105967-16106092)
chr5 (142-326)||(32950762-32950950)
chr5 (30-77)||(23514518-23514565)
chr5 (30-74)||(9730638-9730682)
chr5 (30-82)||(10778217-10778269)
chr5 (72-115)||(23328557-23328600)
chr5 (353-450)||(20623262-20623359)
chr5 (353-450)||(21233401-21233498)
chr5 (353-450)||(37053037-37053134)
chr5 (75-115)||(24616165-24616205)
chr5 (75-115)||(24712541-24712581)
chr5 (75-115)||(24745559-24745599)
chr5 (353-408)||(25900321-25900376)
chr5 (353-450)||(16536490-16536587)
chr5 (41-81)||(3673828-3673868)
chr5 (41-81)||(5451084-5451124)
chr5 (41-77)||(23234730-23234766)
chr5 (41-81)||(23493885-23493925)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (30-502)||(18168927-18169402)
chr4 (67-476)||(15287096-15287507)
chr4 (67-459)||(15294221-15294616)
chr4 (46-408)||(19020459-19020824)
chr4 (153-502)||(7131887-7132241)
chr4 (67-502)||(17145479-17145919)
chr4 (153-450)||(20000803-20001103)
chr4 (67-420)||(18248212-18248568)
chr4 (193-408)||(22738390-22738607)
chr4 (211-502)||(10644360-10644647)
chr4 (207-476)||(22351915-22352184)
chr4 (192-450)||(26339140-26339399)
chr4 (284-399)||(8378365-8378480)
chr4 (299-476)||(47357883-47358057)
chr4 (67-286)||(8374502-8374724)
chr4 (376-502)||(14996444-14996572)
chr4 (333-408)||(9795490-9795564)
chr4 (377-476)||(14952085-14952183)
chr4 (142-303)||(40885585-40885748)
chr4 (67-114)||(22738263-22738310)
chr4 (30-74)||(5682783-5682827)
chr4 (30-82)||(20000680-20000732)
chr4 (67-115)||(22352260-22352308)
chr4 (30-74)||(25119464-25119508)
chr4 (370-408)||(8378486-8378524)
chr4 (353-450)||(16608972-16609069)
chr4 (353-450)||(26680493-26680590)
chr4 (33-74)||(34395215-34395256)
chr4 (30-82)||(7132312-7132364)
chr4 (55-115)||(26339002-26339062)
chr4 (353-408)||(16327841-16327896)
chr4 (36-82)||(14901193-14901239)
chr4 (35-77)||(41166191-41166233)
chr4 (41-81)||(15044794-15044834)
chr4 (41-81)||(15109590-15109630)
chr4 (41-81)||(15851597-15851637)
chr4 (45-81)||(40905174-40905210)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (30-459)||(29119-29551)
scaffold0213 (440-502)||(29565-29626)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (30-502)||(153829-154306)
scaffold0023 (299-497)||(169738-169935)
scaffold0023 (304-494)||(36327-36514)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (67-476)||(1424-1837)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (67-486)||(2386-2810)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (67-480)||(10184-10601)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (153-502)||(1336-1690)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (67-502)||(7279-7718)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (67-502)||(33980-34420)
scaffold0012 (33-77)||(253234-253278)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (55-319)||(3-270)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (209-502)||(5034-5329)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (299-502)||(20937-21139)
scaffold0139 (299-502)||(13883-14084)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (65-408)||(54408-54755)
scaffold0066 (142-408)||(45099-45369)
scaffold0066 (65-114)||(45003-45052)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (243-476)||(3895-4129)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (299-502)||(10570-10775)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (192-459)||(6718-6986)
scaffold0183 (72-115)||(6597-6640)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (205-408)||(54008-54212)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (209-502)||(3101-3395)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (377-502)||(130880-131005)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (304-494)||(31506-31693)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (299-476)||(1153-1327)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (299-476)||(64372-64546)
scaffold0026 (307-408)||(107983-108084)
scaffold0026 (41-81)||(90085-90125)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (209-482)||(13169-13438)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (212-476)||(177-438)
scaffold0116 (33-74)||(30049-30090)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (205-368)||(3547-3711)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (192-476)||(23600-23884)
scaffold0155 (67-115)||(23962-24010)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (377-491)||(17127-17241)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (192-408)||(7330-7547)
scaffold0003 (67-115)||(7204-7252)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (209-408)||(9266-9462)
scaffold0215 (209-408)||(16164-16360)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (304-408)||(12045-12149)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (142-326)||(56107-56294)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (333-408)||(13268-13342)
scaffold0032 (377-502)||(107980-108107)
scaffold0032 (33-74)||(13541-13582)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (377-486)||(803-914)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (384-476)||(154282-154373)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (377-476)||(5922-6022)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (334-408)||(34374-34450)
scaffold0075 (33-77)||(4899-4943)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (30-74)||(6339-6383)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (30-74)||(31536-31580)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (30-74)||(41264-41308)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (33-77)||(77092-77136)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (33-74)||(1357-1398)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (353-450)||(22833-22930)
scaffold0141 (353-450)||(27088-27185)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (353-450)||(1455-1552)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (33-74)||(162435-162476)
scaffold0016 (33-64)||(166523-166554)
scaffold0016 (33-77)||(116758-116802)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (41-81)||(2421-2461)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (33-64)||(171865-171896)
scaffold0001 (33-64)||(177568-177599)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (377-450)||(837-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (377-450)||(9841-9914)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (45-81)||(7372-7408)
scaffold0253 (45-81)||(16797-16833)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (41-81)||(2557-2597)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (377-409)||(42677-42709)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (45-81)||(1308-1344)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (45-81)||(23913-23949)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (45-81)||(6514-6550)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (33-73)||(271985-272025)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18060057 - 18059582
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18060057 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 18059958  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059957 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 18059858  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059857 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 18059758  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18059757 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattatacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccta 18059658  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18059657 acccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 18059582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Original strand, 17004595 - 17005070
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17004595 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 17004694  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004695 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 17004794  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004795 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 17004894  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  17004895 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 17004994  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17004995 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 17005070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 38055390 - 38054915
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38055390 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 38055291  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055290 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 38055191  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  38055190 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaa 38055091  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  38055090 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaagatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 38054991  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38054990 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 38054915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 153 - 502
Target Start/End: Original strand, 17148647 - 17149000
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17148647 atatgatttacatctcatttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 17148746  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17148747 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 17148846  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaa-cccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcc 448  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17148847 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaccccccttacctttgaagttgattatccccaacccttgcttcaattcagctcc 17148946  T
Q  449 taggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17148947 tatgtcaccccacttgattcctcaagctttcccttcaaccctcttgttcttctc 17149000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 450
Target Start/End: Original strand, 46523394 - 46523768
Alignment:
Q  78 tcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatc 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46523394 tcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatc 46523493  T
Q  178 aaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatc 274  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  46523494 aaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatc 46523593  T
Q  275 aattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  46523594 aattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-atgga 46523692  T
Q  375 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||| |||| | ||||||    
T  46523693 acatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgctttaatttatctccta 46523768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 210 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19962617 - 19962323
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  19962617 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19962518  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962517 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 19962418  T
Q  408 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19962417 ttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 19962323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 209 - 496
Target Start/End: Original strand, 22227947 - 22228236
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||    || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  22227947 tttcataacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaag 22228045  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22228046 agcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 22228145  T
Q  408 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgtt 496  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  22228146 ttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcttaagcttaccccaattgattcttcaagttattcccttcaaaacccttgtt 22228236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 209 - 447
Target Start/End: Original strand, 22232644 - 22232882
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||    || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  22232644 tttcataacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaag 22232742  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232743 agcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 22232842  T
Q  408 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctc 447  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  22232843 ttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctc 22232882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 192 - 450
Target Start/End: Original strand, 22035568 - 22035827
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  22035568 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 22035667  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  22035668 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 22035766  T
Q  390 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  22035767 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 22035827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7641069 - 7640810
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  7641069 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 7640970  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  7640969 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 7640871  T
Q  390 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  7640870 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 7640810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 299 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 5072411 - 5072237
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  5072411 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacttgagtaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacc 5072314  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    |||||||||||||||| |||||  || || | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  5072313 cccttacctttgaagaagattaaccctaatctttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 5072237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 408
Target Start/End: Original strand, 2116393 - 2116589
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| ||     
T  2116393 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaa 2116491  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    ||||||||| || ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2116492 agcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataatcactaacccctttacct 2116588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 408
Target Start/End: Original strand, 45051561 - 45051757
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  ||  || || ||||| |||    
T  45051561 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaag 45051659  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    | ||||||| || ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45051660 aacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--cacatgattatgataaagactaacccccttacct 45051756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 377 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861258
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctag-gtcacccaaattgattcctcaagc 475  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctagacttatcccaattgattcctcaagc 15861259  T
Q  476 t 476  Q
    |    
T  15861258 t 15861258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 299 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18601141 - 18601052
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataat 390  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  18601141 cacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataat 18601052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18598914 - 18598845
Alignment:
Q  386 ataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcac 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18598914 ataataactaacccccttaccttagaagaagatta-acccaactcttgcttcaattcagctcctaagtcac 18598845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 13377129 - 13377085
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13377129 ttcaccaatttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatca 13377085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21650339 - 21650295
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21650339 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctca 21650295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 17148524 - 17148576
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  17148524 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaat 17148576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Original strand, 20177133 - 20177173
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctc 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20177133 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctc 20177173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Original strand, 22035442 - 22035490
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22035442 atttttcatcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcact 22035490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 44035270 - 44035226
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  44035270 aacttcaccaattgcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 44035226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 450
Target Start/End: Original strand, 51452765 - 51452882
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaaccct 431  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  51452765 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattaagataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 51452863  T
Q  432 tgcttcaattcagctccta 450  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  51452864 ggcttcaatttagctccta 51452882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 114
Target Start/End: Original strand, 20254311 - 20254353
Alignment:
Q  72 tcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcac 114  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20254311 tcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcac 20254353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 7641195 - 7641147
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  7641195 atttttcatcatcaatccataattaagtacacccaagttataattcact 7641147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22226037 - 22225562
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22226037 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaagaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 22225938  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225937 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatttcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 22225838  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22225837 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaa 22225738  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22225737 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattccta 22225638  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22225637 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccattcaacactcttgttcttctc 22225562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16376672 - 16376197
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16376672 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 16376573  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376572 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 16376473  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376472 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 16376373  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  16376372 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 16376273  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16376272 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 16376197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16383996 - 16383521
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16383996 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 16383897  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383896 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 16383797  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383796 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 16383697  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  16383696 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 16383597  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16383596 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 16383521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Original strand, 10488656 - 10489131
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10488656 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 10488755  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488756 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 10488855  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488856 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 10488955  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  10488956 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 10489055  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10489056 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 10489131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16556438 - 16555973
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16556438 aactttaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 16556339  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556338 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 16556239  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16556238 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaa 16556139  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  16556138 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 16556039  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactct 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16556038 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactct 16555973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16632994 - 16632529
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16632994 aactttaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 16632895  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632894 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 16632795  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16632794 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaa 16632695  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  16632694 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 16632595  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactct 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16632594 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactct 16632529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 41 - 497
Target Start/End: Original strand, 1555974 - 1556434
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataac 140  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  1555974 tttcacaaaacaac-aacaacatctcatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcactcacaataacatcagttaacaataac 1556072  T
Q  141 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttga 239  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556073 aacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttga 1556172  T
Q  240 aac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaa 337  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1556173 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 1556272  T
Q  338 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| ||||||||    
T  1556273 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttc 1556372  T
Q  438 aattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 497  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  1556373 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttc 1556434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 67 - 476
Target Start/End: Original strand, 19610012 - 19610425
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  19610012 atttctcatcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaactacatc 19610111  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  19610112 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataattttataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 19610211  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 363  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19610212 ccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatcagaaaat 19610311  T
Q  364 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaat 462  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||    
T  19610312 gcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaat 19610411  T
Q  463 tgattcctcaagct 476  Q
    ||||||||||||||    
T  19610412 tgattcctcaagct 19610425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 244 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251390
Alignment:
Q  244 taatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccatt 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22251648 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 22251549  T
Q  344 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattca 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22251548 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattca 22251449  T
Q  444 gctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22251448 gctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccattcaacactcttgttcttctc 22251390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 153 - 476
Target Start/End: Original strand, 16231972 - 16232297
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16231972 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 16232071  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16232072 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 16232171  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  16232172 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 16232271  T
Q  450 aggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    | ||||||| | ||||||||| |||||    
T  16232272 aagtcaccc-acttgattcctaaagct 16232297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 210 - 502
Target Start/End: Original strand, 19299375 - 19299669
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  19299375 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19299474  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299475 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 19299574  T
Q  408 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19299575 ttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 19299669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 153 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 18086999 - 18086690
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18086999 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18086900  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18086899 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18086800  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18086799 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatactaataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 18086700  T
Q  450 aggtcaccca 459  Q
    | ||||||||    
T  18086699 aagtcaccca 18086690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 153 - 450
Target Start/End: Original strand, 23977849 - 23978149
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23977849 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 23977948  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23977949 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 23978048  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  23978049 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacgcccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 23978148  T
Q  450 a 450  Q
    |    
T  23978149 a 23978149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 153 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13620970 - 13620712
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacgt--aattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  13620970 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgcaattt 13620871  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13620870 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 13620771  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  13620770 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt 13620712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 299 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 27654006 - 27653814
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  27654006 cacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 27653908  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27653907 ccctcacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 27653814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 29869911 - 29869627
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  29869911 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacacttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataaga 29869812  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacat-gattatgata 388  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| || || ||||||||||    
T  29869811 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaa-attttaaattgattatgata 29869714  T
Q  389 ataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  29869713 ataactaacccccttaccttagaagaagatcaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 29869627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33314505 - 33314387
Alignment:
Q  42 ttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataacc 141  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33314505 ttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagttaacaataacc 33314406  T
Q  142 acatcaatggaatatgaat 160  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  33314405 acattaatggaatatgaat 33314387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 404
Target Start/End: Original strand, 29665942 - 29666208
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 240  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||| || |||  |||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29665942 acatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatgcatactttgaa 29666041  T
Q  241 ac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaac 338  Q
    ||  ||||||||||||  || ||||| || ||||||||||||  || ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||| |    
T  29666042 acatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatcacc 29666141  T
Q  339 ccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  29666142 ccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccactta 29666208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 299 - 451
Target Start/End: Original strand, 25175792 - 25175945
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaac 397  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  25175792 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa-attatacatgattatggtaatcactaac 25175890  T
Q  398 ccccttacctttgaagatgattat-tcccaacccttgcttcaattcagctcctag 451  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  25175891 ccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctcctag 25175945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 209 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 14626243 - 14625953
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||    
T  14626243 tttcataacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 14626145  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacat--gagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttac 405  Q
    |||||||||||| ||| || | | ||| | | || || || |||||||  |||||  || ||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14626144 agcacgaatttagcaataattatccataatcacaatt-caaacaacatttgagaatttgtaaag--tgaagatgattgtgataataactaacccccttac 14626048  T
Q  406 ctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14626047 ctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctcaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctc 14625953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 299 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16825775 - 16825678
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaac 397  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  16825775 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaac 16825678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1650128 - 1650022
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||| |||||||||||| || ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  1650128 cacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataaagactaacc 1650032  T
Q  399 cccttacctt 408  Q
    ||||||||||    
T  1650031 cccttacctt 1650022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 334 - 502
Target Start/End: Original strand, 15862744 - 15862916
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaaccct 431  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||    
T  15862744 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactct 15862843  T
Q  432 tgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  15862844 tgcttcaattcacctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaactcttgttcttctc 15862916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 334 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 1657738 - 1657566
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaaccct 431  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||    
T  1657738 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactct 1657639  T
Q  432 tgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    || ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  1657638 tgtttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 1657566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 450
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991470
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc-caacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 4991470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 392 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16814930 - 16814837
Alignment:
Q  392 actaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaa 486  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||    
T  16814930 actaaccctcttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattgctaaagc-ttcccttcaa 16814837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 16231849 - 16231901
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  16231849 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 16231901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18381972 - 18381928
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18381972 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatca 18381928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19983591 - 19983547
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19983591 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 19983547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 23977726 - 23977778
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  23977726 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaataacatcttatttctcatcaacaat 23977778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 35015457 - 35015413
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35015457 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 35015413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Original strand, 27740903 - 27741021
Alignment:
Q  138 aaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactt 236  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||  |  || || |||  |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27740903 aaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagcaaaattcaccaattgagcacaatttcataacttgacatttatacatactt 27741002  T
Q  237 tgaaac--gtaatttcacc 253  Q
     |||||  |||||||||||    
T  27741003 cgaaacatgtaatttcacc 27741021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18087122 - 18087070
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  18087122 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaat 18087070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13621093 - 13621041
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  13621093 aacttcattaatttcacaaaaccaccaacaacatcttattgctcatcaacaat 13621041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18629888 - 18629852
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18629888 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 18629852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Original strand, 49232393 - 49232868
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  49232393 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 49232492  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232493 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 49232592  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49232593 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 49232692  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  49232693 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 49232792  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49232793 acccttgcttcaattcagctcataggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 49232868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 1468038 - 1467563
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1468038 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 1467939  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467938 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 1467839  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467838 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 1467739  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  1467738 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 1467639  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1467638 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 1467563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 41 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 12265080 - 12264615
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataac 140  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  || | | |||||||| | |  |||    
T  12265080 tttcacaaaacaac-aacaacatctcatttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaac 12264982  T
Q  141 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa--tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttg 238  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264981 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttg 12264882  T
Q  239 aaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatca 336  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12264881 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatca 12264782  T
Q  337 acccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12264781 acccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcccaacctttgctt 12264682  T
Q  437 caattcagctcctaggtca-cccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12264681 caattcagctcctaggtcaccccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 12264615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 67 - 497
Target Start/End: Original strand, 25058733 - 25059168
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25058733 atttctcatcatcaattcacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcataagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatc 25058832  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  25058833 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 25058932  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 363  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058933 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 25059032  T
Q  364 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaat 462  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||   ||||||||||||||||||| || | |||| |||    
T  25059033 gcaaaaattgtgcatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatttttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaat 25059132  T
Q  463 tgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 497  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  25059133 tgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttc 25059168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 170 - 502
Target Start/End: Original strand, 12811938 - 12812273
Alignment:
Q  170 tttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacatacca 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  12811938 tttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataaattcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacatacca 12812037  T
Q  267 taatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12812038 taatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaatatgagaaaatgca 12812137  T
Q  367 aagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12812138 aagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttaaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgat 12812237  T
Q  467 tcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12812238 tccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 12812273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 33 - 486
Target Start/End: Original strand, 22275168 - 22275626
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttat-ttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagtt 131  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  | || | ||||| ||   || ||||| | || ||| ||||||||    
T  22275168 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagtt 22275267  T
Q  132 gacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatac 230  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22275268 aacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaacatttatac 22275367  T
Q  231 atactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaact 328  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22275368 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 22275467  T
Q  329 gttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||    
T  22275468 gttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccttaac 22275567  T
Q  429 ccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaa 486  Q
      ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275568 ttttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaa 22275626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 33 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 15468637 - 15468162
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttat-ttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagtt 131  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||||||||| |  |||||||||||||| ||  | || | ||||||||   || ||||| | || ||| ||||||||    
T  15468637 ttcacaaatttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagtt 15468538  T
Q  132 gacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatac 230  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15468537 aacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaacatttatac 15468438  T
Q  231 atactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaact 328  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |    
T  15468437 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaatt 15468338  T
Q  329 gttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaac 428  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||     
T  15468337 gttcctcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaat 15468238  T
Q  429 ccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
     |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  15468237 tcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 15468162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 67 - 476
Target Start/End: Original strand, 5228307 - 5228719
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  5228307 atttctcataatcaattcacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacacc 5228406  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatc-aatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  5228407 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatattttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 5228506  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 363  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5228507 ccataatcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa-tgttcatcaacccattttcataacacatgagaaaat 5228605  T
Q  364 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaat 462  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||| ||||||||||||||| || | |||| |||    
T  5228606 gcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctcctaagcttaccccaat 5228705  T
Q  463 tgattcctcaagct 476  Q
    ||||||||||||||    
T  5228706 tgattcctcaagct 5228719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 55 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12902364 - 12902008
Alignment:
Q  55 caacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaat 154  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||| ||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  12902364 caacaacatcttatttctcatcattaatccacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagtatcagttaataataacaacatcaatggaat 12902265  T
Q  155 atgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttca 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12902264 atgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttaatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttca 12902165  T
Q  252 cccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcataca 351  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  12902164 cccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcataca 12902065  T
Q  352 acatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12902064 acatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 12902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 153 - 502
Target Start/End: Original strand, 18911073 - 18911427
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18911073 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18911172  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18911173 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18911272  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18911273 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 18911372  T
Q  450 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  18911373 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 18911427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 243 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18897127 - 18896871
Alignment:
Q  243 gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccat 342  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18897127 gtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccat 18897028  T
Q  343 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattc 442  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  18897027 tttcatacaacatgagaaaatacaaaacttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttggaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 18896928  T
Q  443 agctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 497  Q
    ||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  18896927 agctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttc 18896871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 145 - 450
Target Start/End: Original strand, 54651529 - 54651837
Alignment:
Q  145 tcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacg 243  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  54651529 tcaatggaacatgaattacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgcaaca 54651628  T
Q  244 t--aatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaaccca 341  Q
    |  |||||||| |  || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  54651629 tgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaaccca 54651728  T
Q  342 ttttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaatt 441  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||  || |||  |||||||||||    
T  54651729 ttttcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttcaatt 54651828  T
Q  442 cagctccta 450  Q
     ||||||||    
T  54651829 aagctccta 54651837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 408
Target Start/End: Original strand, 44228979 - 44229323
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  || | | |||||||| | |  ||  || | ||||||| ||||||||||||    
T  44228979 atttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatc 44229078  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    |||||| ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||    
T  44229079 tcattttaacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacata 44229178  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  44229179 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa- 44229277  T
Q  363 tgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    || ||| |||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  44229278 tgaaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 44229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18897273 - 18897139
Alignment:
Q  55 caacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaat 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18897273 caacaacattttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaat 18897174  T
Q  155 atgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa 189  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18897173 atgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaa 18897139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 497
Target Start/End: Original strand, 16821096 - 16821564
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  | || | | ||||||   || |||||   | ||||  ||||     
T  16821096 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttatttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa 16821195  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatca--atttcatcaattaagcataatt-tcataacttaacattt 226  Q
     | ||| | |  |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||  | ||| ||  |  | |||| ||||| |||| |||  ||||| ||||||||||    
T  16821196 ataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattt 16821295  T
Q  227 atacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaaca 325  Q
     |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||| | ||| |  || ||| || ||||||||||||||| |||| |||  |    
T  16821296 ttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggatttgacataa 16821394  T
Q  326 actgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccc 425  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |     
T  16821395 attgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacaca 16821491  T
Q  426 aacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 497  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| | |||||||||| || |||||||    
T  16821492 aactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcttcaagttattcccttcaaaacccttgttc 16821564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 299 - 476
Target Start/End: Original strand, 41270304 - 41270478
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  41270304 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtagatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacc 41270401  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    |||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  41270402 cccttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 41270478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 299 - 476
Target Start/End: Original strand, 55316448 - 55316622
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  55316448 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacc 55316545  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    || ||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  55316546 cctttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 55316622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 307 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15936654 - 15936553
Alignment:
Q  307 gagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 406  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15936654 gagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccatacc 15936555  T
Q  407 tt 408  Q
    ||    
T  15936554 tt 15936553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 307 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15938496 - 15938395
Alignment:
Q  307 gagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 406  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15938496 gagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 15938397  T
Q  407 tt 408  Q
    ||    
T  15938396 tt 15938395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 408
Target Start/End: Original strand, 15615032 - 15615168
Alignment:
Q  269 atcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 368  Q
    |||||||||||| ||| |  || ||| |||||||| |||||||| ||| || ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15615032 atcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 15615131  T
Q  369 gattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
     ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15615132 -at--tacatgattatgataaagactaacccccttacctt 15615168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 502
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492823
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 475  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttacccaaattgattcctcaagc 23492795  T
Q  476 t-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    | ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  23492796 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 23492823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 14842519 - 14842392
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 475  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||||    
T  14842519 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgatccctcaagc 14842420  T
Q  476 t-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    | ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  14842419 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 14842392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 376 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8268683 - 8268609
Alignment:
Q  376 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8268683 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8268609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 376 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8275783 - 8275709
Alignment:
Q  376 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8275783 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8275709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11986361 - 11986174
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||| || |||  ||||  | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  11986361 acatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattcactatttgagcacaatttcataacttgacattaatacatactttaaa 11986262  T
Q  241 ac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||  ||||||||| ||  || ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  11986261 acatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaa 11986174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16934273 - 16934229
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16934273 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctca 16934229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 17956284 - 17956240
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17956284 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 17956240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 18910950 - 18911002
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  18910950 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 18911002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2449208 - 2449111
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  2449208 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 2449111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 13838854 - 13838895
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13838854 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 13838895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 13954880 - 13954738
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaaccct 431  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  13954880 tcaacccattt-catacaattcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 13954782  T
Q  432 tgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 474  Q
     ||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||| |||||    
T  13954781 ggcttcaatttagctcctaagctcacccaattggattcttcaag 13954738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 33369185 - 33369149
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33369185 acaaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaa 33369149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 428
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153316
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaac 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaac 30153316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 81
Target Start/End: Original strand, 1990767 - 1990808
Alignment:
Q  40 atttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1990767 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaa 1990808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 450
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168310
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    ||||||||| ||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctccta 38168310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 474
Target Start/End: Original strand, 45861078 - 45861220
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaaccct 431  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || | ||||||||| |||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  45861078 tcaacccattt-catacaattcatgaaaaattgcaaagaatgaatatgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 45861176  T
Q  432 tgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 474  Q
     ||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||| |||||    
T  45861177 ggcttcaatttagctcctaagctcacccaattggattcttcaag 45861220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Original strand, 39060 - 39535
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39060 aacttcaccaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 39159  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39160 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 39259  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 39359  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  39360 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 39459  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39460 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 39535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 210 - 502
Target Start/End: Original strand, 43137 - 43426
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaaga 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || | ||||||||    
T  43137 ttcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaaga 43235  T
Q  309 gcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    |||||||||| |||  || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  43236 gcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa-at--tacatgtttgtgatagtaactaacccccttacct 43332  T
Q  408 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||| ||||||| |  || ||| |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  43333 ttgaagttgattatccttaatcctagcttcacttcagctcctagatcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 43426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Original strand, 7822685 - 7823160
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7822685 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 7822784  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822785 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 7822884  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822885 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 7822984  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  7822985 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 7823084  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7823085 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 7823160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Original strand, 7829996 - 7830471
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7829996 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 7830095  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830096 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 7830195  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830196 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 7830295  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  7830296 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 7830395  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7830396 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 7830471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Original strand, 27176390 - 27176865
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27176390 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 27176489  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176490 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 27176589  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176590 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 27176689  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  27176690 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 27176789  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27176790 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 27176865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27101936 - 27101461
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27101936 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 27101837  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101836 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 27101737  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101736 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 27101637  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  27101636 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 27101537  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27101536 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 27101461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27109284 - 27108809
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27109284 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 27109185  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109184 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 27109085  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109084 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 27108985  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  27108984 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 27108885  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27108884 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 27108809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 38784028 - 38783553
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38784028 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 38783929  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783928 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 38783829  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783828 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 38783729  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  38783728 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 38783629  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38783628 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 38783553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 15951090 - 15950614
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  15951090 aacttcaccaatttcagaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcag 15950991  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950990 ttaacaataatcacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 15950891  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15950890 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 15950791  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  15950790 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacccaa 15950691  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||    
T  15950690 actcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctatttccttcaaaacccttgttcttctc 15950614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 41 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15760401 - 15759941
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataac 140  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  15760401 tttcacaaaacaac-aacaacatctcatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcattattcactcacaataacatcagttaacaataac 15760303  T
Q  141 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttga 239  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760302 aacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttga 15760203  T
Q  240 aac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaa 337  Q
    |||  ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  15760202 aacatgtaatttcacccacaaacatatcataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaa 15760103  T
Q  338 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| ||||||||    
T  15760102 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttc 15760003  T
Q  438 aattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 497  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  15760002 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttc 15759941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 153 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18980197 - 18979872
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18980197 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18980098  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18980097 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18979998  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18979997 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 18979898  T
Q  450 aggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    | ||||||| | ||||||||| |||||    
T  18979897 aagtcaccc-acttgattcctaaagct 18979872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 153 - 476
Target Start/End: Original strand, 15927648 - 15927973
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15927648 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 15927747  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||    
T  15927748 cacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcata 15927847  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  15927848 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 15927947  T
Q  450 aggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    | ||||||| | ||||||||| |||||    
T  15927948 aagtcaccc-acttgattcctaaagct 15927973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 153 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 14251074 - 14250721
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14251074 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 14250975  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14250974 cacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 14250875  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  14250874 caacatgagaaaatgcaaaaaatgaacatgattacgatgataactaacccccttaccttagaagaagataact-caaactcttgcttcaattcagctcct 14250776  T
Q  450 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  14250775 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 14250721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 153 - 450
Target Start/End: Original strand, 13758450 - 13758750
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13758450 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 13758549  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13758550 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 13758649  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  13758650 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 13758749  T
Q  450 a 450  Q
    |    
T  13758750 a 13758750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 299 - 502
Target Start/End: Original strand, 2437686 - 2437888
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437686 cacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacc 2437784  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2437785 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagctttcccttcaacactcctgttct 2437884  T
Q  499 tctc 502  Q
    ||||    
T  2437885 tctc 2437888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16479075 - 16478786
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || | ||| |||    
T  16479075 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaag 16478977  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    ||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16478976 agcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--aaatgattatgataatcactaacccccttacct 16478880  T
Q  408 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||| ||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  16478879 ttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagctcctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 16478786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 299 - 476
Target Start/End: Original strand, 10989638 - 10989814
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10989638 cacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attatacatgattatgataatcactaacc 10989736  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  10989737 cccatacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattaagctcctatgtcacctcacttgattcctcaagct 10989814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13911156 - 13910855
Alignment:
Q  191 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaag 288  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| | |||||||||||   || ||||| || | |||||||||| ||| |      
T  13911156 ttcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcata-tatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcataca 13911058  T
Q  289 aaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgata 388  Q
    || ||| || |||| |||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13911057 aacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgata 13910959  T
Q  389 ataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaaca 488  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||     
T  13910958 atcaataacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaacc 13910861  T
Q  489 ctcttg 494  Q
    ||||||    
T  13910860 ctcttg 13910855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 48622788 - 48622584
Alignment:
Q  205 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacag 303  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  48622788 ataatttcacaacttaacaattatgcatgctttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacag 48622689  T
Q  304 caagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 403  Q
     ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  48622688 taagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaaccccctt 48622589  T
Q  404 acctt 408  Q
    |||||    
T  48622588 acctt 48622584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 210 - 476
Target Start/End: Original strand, 13572816 - 13573079
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | | |||||||||||   || || || || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  13572816 ttcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 13572915  T
Q  310 cacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 409  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13572916 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctta 13573013  T
Q  410 gaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  13573014 gaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 13573079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10000505 - 10000288
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa--acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  10000505 tcatcaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 10000407  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||| | || || | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |  |||||||||| |    
T  10000406 aaacaacaacataacaagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaagatgcaaaatttgaaattgattatgatga 10000307  T
Q  390 taactaacccccttacctt 408  Q
      || ||||||||||||||    
T  10000306 agacaaacccccttacctt 10000288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 307 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18253862 - 18253761
Alignment:
Q  307 gagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 406  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18253862 gagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 18253763  T
Q  407 tt 408  Q
    ||    
T  18253762 tt 18253761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 328 - 408
Target Start/End: Original strand, 15862177 - 15862257
Alignment:
Q  328 tgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862177 tgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt 15862257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 408
Target Start/End: Original strand, 16418618 - 16418835
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  16418618 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagc 16418717  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| |    
T  16418718 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatga 16418816  T
Q  390 taactaacccccttacctt 408  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  16418817 aaacaaacccccttacctt 16418835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 450
Target Start/End: Original strand, 13321134 - 13321407
Alignment:
Q  191 ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaag 288  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |      
T  13321134 ttcaccaattgagcacaatttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcataca 13321233  T
Q  289 aaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaaagattgtac 376  Q
    || ||| || |||||  |||||||||||||| |||||| | | ||          ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  | || ||    
T  13321234 aacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccacttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaac 13321333  T
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||   |||||| || ||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctccta 13321407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 377 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516719
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctag 451  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14251197 - 14251145
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  14251197 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 14251145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 371045 - 371089
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  371045 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctca 371089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 13758327 - 13758379
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  13758327 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaataacatcttatttctcatcaacaat 13758379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 15927525 - 15927577
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  15927525 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 15927577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 450
Target Start/End: Original strand, 7293289 - 7293406
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaaccct 431  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  7293289 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 7293387  T
Q  432 tgcttcaattcagctccta 450  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  7293388 ggcttcaatttagctccta 7293406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 30262119 - 30262002
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaaccct 431  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  30262119 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 30262021  T
Q  432 tgcttcaattcagctccta 450  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  30262020 ggcttcaatttagctccta 30262002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 111
Target Start/End: Original strand, 15852425 - 15852494
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataatt 111  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  15852425 tttcacaaaacaac-aacaacatctcatttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataatt 15852494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Original strand, 11516520 - 11516617
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  11516520 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 11516617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15441534 - 15441437
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  15441534 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 15441437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 10000631 - 10000583
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10000631 atttttcatcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcact 10000583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Original strand, 16418492 - 16418540
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16418492 atttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcact 16418540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17224227 - 17224183
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17224227 ttcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatca 17224183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18980320 - 18980268
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  18980320 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaat 18980268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14113959 - 14113904
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14113959 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 14113904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14423629 - 14423555
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14423629 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataa-gactaacccccttacctt 14423555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 450
Target Start/End: Original strand, 16212071 - 16212144
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    ||||||||| ||||||||    
T  16212071 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctccta 16212144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1937300 - 1937256
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  1937300 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaataatccatttctca 1937256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 13377495 - 13377535
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13377495 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 13377535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17947873 - 17947837
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17947873 tttcacaaaaccaacaacaacaatttatttcacatca 17947837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 11231637 - 11231162
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11231637 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 11231538  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231537 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 11231438  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231437 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 11231338  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  11231337 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 11231238  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11231237 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 11231162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22513484 - 22513009
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22513484 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 22513385  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513384 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 22513285  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513284 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 22513185  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  22513184 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 22513085  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22513084 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 22513009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 24686080 - 24685605
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24686080 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacctaaatcataattcacttacaatagcatcag 24685981  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685980 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacacatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 24685881  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685880 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 24685781  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  24685780 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 24685681  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24685680 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacacttttgttcttctc 24685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 28776106 - 28775631
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28776106 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 28776007  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28776006 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 28775907  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775906 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 28775807  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  28775806 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 28775707  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28775706 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 28775631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 450
Target Start/End: Original strand, 12728349 - 12728772
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  12728349 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcag 12728448  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12728449 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaataaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttat 12728548  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12728549 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 12728648  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |    
T  12728649 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaa 12728748  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    || |||||||||||| ||||||||    
T  12728749 actcttgcttcaatttagctccta 12728772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 30 - 450
Target Start/End: Original strand, 34824432 - 34824855
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  34824432 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcag 34824531  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34824532 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaataaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttat 34824631  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34824632 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 34824731  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || |    
T  34824732 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaa 34824831  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    || |||||||||||| ||||||||    
T  34824832 actcttgcttcaatttagctccta 34824855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 41 - 502
Target Start/End: Original strand, 16935561 - 16936027
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataac 140  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  16935561 tttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataac 16935660  T
Q  141 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttga 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935661 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttga 16935760  T
Q  240 aac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaa 337  Q
    |||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16935761 aacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaa 16935860  T
Q  338 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||| ||||    
T  16935861 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttc 16935960  T
Q  438 aattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  16935961 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 16936027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 41 - 502
Target Start/End: Original strand, 17006221 - 17006687
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataac 140  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  17006221 tttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataac 17006320  T
Q  141 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttga 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006321 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttga 17006420  T
Q  240 aac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaa 337  Q
    |||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17006421 aacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaa 17006520  T
Q  338 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||| ||||    
T  17006521 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttc 17006620  T
Q  438 aattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  17006621 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 17006687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 55 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23778319 - 23777963
Alignment:
Q  55 caacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaat 154  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23778319 caacaacatcttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaat 23778220  T
Q  155 atgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttca 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23778219 atgaattacatctcatttcaatcaaatcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttca 23778120  T
Q  252 cccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcataca 351  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23778119 tccacaaacataccataatcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcataca 23778020  T
Q  352 acatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23778019 acatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccctttacctt 23777963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 153 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 42178145 - 42177791
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42178145 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 42178046  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42178045 cacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 42177946  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||||| |||    
T  42177945 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagcccct 42177846  T
Q  450 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  42177845 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 42177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 153 - 450
Target Start/End: Original strand, 8943926 - 8944226
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8943926 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 8944025  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8944026 cacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 8944125  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  8944126 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 8944225  T
Q  450 a 450  Q
    |    
T  8944226 a 8944226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 153 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12636044 - 12635744
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12636044 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 12635945  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12635944 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctattttcata 12635845  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  12635844 caacatgaggaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 12635745  T
Q  450 a 450  Q
    |    
T  12635744 a 12635744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 153 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3798779 - 3798482
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3798779 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 3798680  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3798679 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 3798580  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctc 447  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||    
T  3798579 caacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctc 3798482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 153 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12641818 - 12641518
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12641818 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 12641719  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12641718 cagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 12641619  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  12641618 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 12641519  T
Q  450 a 450  Q
    |    
T  12641518 a 12641518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 67 - 361
Target Start/End: Original strand, 21141889 - 21142187
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||  || | | |||||||| | |  ||  || | ||||||| ||||||||||||    
T  21141889 atttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcgtaattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatc 21141988  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    |||||| ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||    
T  21141989 tcattttaacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacata 21142088  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 361  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21142089 ccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 21142187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 299 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19886684 - 19886484
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19886684 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacc 19886586  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||     
T  19886585 cccttacctttgaagttgattatccttaatcctagtttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttct 19886488  T
Q  499 tctc 502  Q
    ||||    
T  19886487 tctc 19886484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 450
Target Start/End: Original strand, 23774257 - 23774516
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23774257 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 23774356  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| || ||||||||||||    
T  23774357 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataa 23774455  T
Q  390 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23774456 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23774516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 5888765 - 5888548
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  5888765 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagc 5888666  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| |    
T  5888665 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatga 5888567  T
Q  390 taactaacccccttacctt 408  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  5888566 aaacaaacccccttacctt 5888548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 377 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24826646 - 24826531
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||     
T  24826646 atgattatgatgatgactaacccctttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc- 24826549  T
Q  477 ttcccttcaacactcttg 494  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  24826548 ttcccttcaaccctcttg 24826531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 450
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213446
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc-caacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 25213446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7507969 - 7507758
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  7507969 tttcataacttattatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaag 7507871  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 395  Q
    |||||||||||| ||| || | ||||          ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||    
T  7507870 agcacgaatttagcaataattattcattcattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagacta 7507771  T
Q  396 acccccttacctt 408  Q
    |||||||||||||    
T  7507770 acccccttacctt 7507758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 22283911 - 22283955
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22283911 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctca 22283955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 42178268 - 42178216
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  42178268 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 42178216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3798902 - 3798850
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  3798902 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaataacatcttatttctcatcaacaat 3798850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12636167 - 12636115
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  12636167 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 12636115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 22274678 - 22274722
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22274678 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 22274722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12641941 - 12641894
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12641941 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatca 12641894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 115
Target Start/End: Original strand, 23774106 - 23774179
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    ||||||||||| || |||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23774106 tttcacaaaacaac-aacaacatctcatttttcatcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcact 23774179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 75
Target Start/End: Original strand, 8943803 - 8943848
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcat 75  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8943803 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcat 8943848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14906410 - 14906313
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  14906410 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 14906313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19689391 - 19689316
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19689391 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 19689316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Original strand, 23820364 - 23820461
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  23820364 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 23820461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 25601982 - 25602023
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25601982 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 25602023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 67958 - 67998
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  67958 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 67998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5888891 - 5888843
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5888891 atttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcact 5888843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17396643 - 17396568
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  17396643 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccccttacctt 17396568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Original strand, 20015304 - 20015401
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  20015304 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgatcatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 20015401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23821886 - 23821846
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23821886 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaa 23821846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23830965 - 23830925
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23830965 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaa 23830925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Original strand, 31266 - 31741
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31266 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 31365  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31366 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 31465  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31466 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 31565  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  31566 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 31665  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31666 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 31741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Original strand, 39603 - 39935
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  39603 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaaattatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcag 39702  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatc-aatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39703 ttaacaataacaacatcaatgaaatatgaataacatctcatttcaaaaaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttat 39802  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39803 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataatcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 39902  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgaga 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39903 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgaga 39935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 271659 - 271184
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  271659 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 271560  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271559 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 271460  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  271459 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 271360  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  271359 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 271260  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  271259 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 271184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Original strand, 644261 - 644736
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  644261 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 644360  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644361 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 644460  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  644461 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 644560  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  644561 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 644660  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  644661 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 644736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Original strand, 829996 - 830471
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  829996 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 830095  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830096 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 830195  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  830196 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 830295  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  830296 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 830395  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  830396 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 830471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22089093 - 22088618
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22089093 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 22088994  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088993 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 22088894  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088893 acatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 22088794  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  22088793 ttgttcaccaacacattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgatgataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 22088694  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22088693 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 22088618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 15319458 - 15318983
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15319458 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 15319359  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15319358 ttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttat 15319259  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319258 acatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 15319159  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  15319158 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 15319059  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15319058 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagcttttccttcaacactcttgttcttctc 15318983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 15499827 - 15499352
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15499827 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 15499728  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15499727 ttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttat 15499628  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499627 acatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 15499528  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  15499527 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 15499428  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15499427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagcttttccttcaacactcttgttcttctc 15499352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22006557 - 22006107
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| ||||||    
T  22006557 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcagtccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaataacatcag 22006458  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006457 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 22006358  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22006357 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 22006258  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |    
T  22006257 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaactcaa 22006158  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  22006157 actcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 22006107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 13662564 - 13662087
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  13662564 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttagttctcatcatcaatccataattatgtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcag 13662465  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662464 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 13662365  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13662364 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 13662265  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |    
T  13662264 ttgtttatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaa 13662165  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    || |||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  13662164 actcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 13662087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 153 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 13721104 - 13720750
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13721104 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 13721005  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13721004 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 13720905  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  13720904 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 13720805  T
Q  450 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  13720804 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 13720750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 67 - 450
Target Start/End: Original strand, 16195224 - 16195611
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||||   | | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16195224 atttctcatcatcaatccataattatatatacctaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatc 16195323  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa--tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacat 262  Q
    |||||||||  | ||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||    
T  16195324 tcatttcaacaacaacatatcaaaatttcataaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacat 16195423  T
Q  263 accataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195424 accataatcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa 16195523  T
Q  363 tgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  16195524 tgcaaaaattgtacatgattatgataataattaacccccttaccttagaagatgattaacccaaactcttgcttcaattcaactccta 16195611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 153 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16873227 - 16872927
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16873227 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 16873128  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16873127 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 16873028  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||| |||||||    
T  16873027 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaatttagctcct 16872928  T
Q  450 a 450  Q
    |    
T  16872927 a 16872927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 6774371 - 6774083
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| |||    
T  6774371 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaag 6774273  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    ||||||||| || ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6774272 agcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattatgataatcactaacccccttacct 6774176  T
Q  408 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  6774175 ttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta-gtcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 6774083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 502
Target Start/End: Original strand, 24549120 - 24549409
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| |||    
T  24549120 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaag 24549218  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    ||||||||| || ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24549219 agcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattatgataatcactaacccccttacct 24549315  T
Q  408 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    | |||| ||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  24549316 tagaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagctcctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 24549409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 299 - 494
Target Start/End: Original strand, 30120951 - 30121144
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  30120951 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagattatacaaaaattacacatgattatgataatcactaacc 30121050  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 494  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  30121051 cccttacctttgaagatgattatctctaacccttacttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 30121144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 210 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21844684 - 21844394
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  21844684 ttcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 21844585  T
Q  310 cacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 409  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21844584 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttaccgtt 21844487  T
Q  410 gaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctt-tcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||| ||||||| |  || ||| ||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  21844486 gaagttgattatccttaatcctagctccacttcagcttctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttccccctccaacactcttgttcttctc 21844394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 210 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21852077 - 21851787
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | |  ||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  21852077 ttcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 21851978  T
Q  310 cacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 409  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21851977 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttt 21851880  T
Q  410 gaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctt-tcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||| ||||||| |  || ||| ||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  21851879 gaagttgattatccttaatcctagctccacttcagcttctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttccccctccaacactcttgttcttctc 21851787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 299 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16674415 - 16674258
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  16674415 cacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacc 16674318  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 459  Q
    |||||||||| ||||| |||||  | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16674317 cccttaccttagaagaagatta-actcaactcttgcttcaattcagctcataagtcaccca 16674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 474
Target Start/End: Original strand, 17345842 - 17345985
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaaccct 431  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||  || ||| ||    
T  17345842 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctaagaagaagattaacccaaactct 17345941  T
Q  432 tgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 474  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||    
T  17345942 tgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaag 17345985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13721227 - 13721175
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  13721227 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 13721175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 3431580 - 3431536
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3431580 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctca 3431536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 17142894 - 17142854
Alignment:
Q  462 ttgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17142894 ttgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 17142854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 16873350 - 16873303
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  16873350 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaataacatcttatttctcatca 16873303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22907204 - 22907087
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaaccct 431  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  22907204 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 22907106  T
Q  432 tgcttcaattcagctccta 450  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  22907105 ggcttcaatttagctccta 22907087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Original strand, 5238380 - 5238477
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  5238380 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 5238477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24661218 - 24661121
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  24661218 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 24661121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24929094 - 24929053
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24929094 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 24929053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Original strand, 43685839 - 43685936
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  43685839 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 43685936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Original strand, 23837156 - 23837200
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  23837156 ttcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatca 23837200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 24717162 - 24717128
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 64  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24717162 aacttcaccaattttacaaaaccaccaacaacaat 24717128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21932680 - 21932205
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  21932680 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcag 21932581  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932580 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 21932481  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932480 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 21932381  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  21932380 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 21932281  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21932280 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 21932205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21938850 - 21938375
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  21938850 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcag 21938751  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938750 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 21938651  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938650 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 21938551  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  21938550 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 21938451  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21938450 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 21938375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22883383 - 22882908
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22883383 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 22883284  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883283 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 22883184  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22883183 acatactttgaaacatgtaatttcatccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacaaatttaacaacaa 22883084  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  22883083 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttatctttgaagttgattatcccta 22882984  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22882983 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgatttcccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 22882908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Original strand, 35581993 - 35582468
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35581993 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 35582092  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582093 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 35582192  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582193 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 35582292  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  35582293 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 35582392  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35582393 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 35582468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 36990069 - 36989594
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36990069 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 36989970  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989969 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 36989870  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36989869 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctagagcacgaatttaacaacaa 36989770  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  36989769 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 36989670  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36989669 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 36989594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 30 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1219819 - 1219396
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  1219819 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcag 1219720  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219719 ttaacaataaccacatcaatgaaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 1219620  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1219619 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 1219520  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || |    
T  1219519 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaa 1219420  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    || |||||||||||| ||||||||    
T  1219419 actcttgcttcaatttagctccta 1219396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 67 - 476
Target Start/End: Original strand, 7425318 - 7425729
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7425318 atttctcatcatcaatccataattaagtatatccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatc 7425417  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  7425418 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 7425517  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 363  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425518 ccataaccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 7425617  T
Q  364 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaatt 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  7425618 gcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-actt 7425716  T
Q  464 gattcctcaagct 476  Q
    ||||||| |||||    
T  7425717 gattcctaaagct 7425729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 153 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 10778146 - 10777794
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10778146 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 10778047  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10778046 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 10777947  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  10777946 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaccccccttacctttgaagatgattatccttaacccttgcttcaattcagctcct 10777847  T
Q  450 aggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  10777846 aggtcaccccacttgattcctcaagcttccccttcaactctcttgttcttctc 10777794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 33 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 17471885 - 17471427
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttat-ttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagtt 131  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  | || |  |||||||   || ||||| | || ||| ||||||||    
T  17471885 ttcaccaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcagtt 17471786  T
Q  132 gacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatac 230  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17471785 aacaataacaacatcaatggaatatgaattacatcttatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcattacttaacatttatac 17471686  T
Q  231 atactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaact 328  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17471685 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaatt 17471586  T
Q  329 gttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||    
T  17471585 gttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaactcaaac 17471486  T
Q  429 ccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaa 486  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17471485 tcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaa 17471427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 67 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 35791361 - 35790947
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||   | | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35791361 atttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatc 35791262  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa--tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacat 262  Q
    |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||    
T  35791261 tcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcactcacaaacat 35791162  T
Q  263 accataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791161 accataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa 35791062  T
Q  363 tgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaa 461  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||    
T  35791061 tgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaa 35790962  T
Q  462 ttgattcctcaagct 476  Q
    |||||||||||||||    
T  35790961 ttgattcctcaagct 35790947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 11212352 - 11211886
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataac 140  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||  || | | |||||||| | |  |||    
T  11212352 tttcacaaaacaac-aacaacatctcatttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataatccacccacaacaacatcagttaatagcaac 11212254  T
Q  141 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttga 239  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||  ||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11212253 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatattaaaattcactacttgagtataatttcataacttaacatttatacacactttga 11212154  T
Q  240 aac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaa 337  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  11212153 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 11212054  T
Q  338 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  11212053 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttc 11211954  T
Q  438 aattcagctcctaggtcacccaaa--ttgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||||||||||| | |||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||    
T  11211953 aattcagctcctagcttaccccaattttgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 11211886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 153 - 502
Target Start/End: Original strand, 23514641 - 23514995
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23514641 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 23514740  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23514741 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 23514840  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  23514841 caacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 23514940  T
Q  450 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
     || | |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  23514941 aagcttaccccaattgattcctcaagttattctcttcaaaacccttgttcttctc 23514995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 299 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18778015 - 18777815
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  18778015 cacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 18777917  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 498  Q
    ||||||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  18777916 cccttacctttgaagttaattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctcaagc-ttcccttcaaccctcttgttct 18777819  T
Q  499 tctc 502  Q
    ||||    
T  18777818 tctc 18777815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 299 - 502
Target Start/End: Original strand, 19500128 - 19500327
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  19500128 cacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 19500226  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 498  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  19500227 cccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta-gtcaccc-acttgattcctcaagc-ttcccttcaactctcttgttct 19500323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 299 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21073618 - 21073418
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21073618 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacc 21073520  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||     
T  21073519 cccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttct 21073422  T
Q  499 tctc 502  Q
    ||||    
T  21073421 tctc 21073418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 299 - 502
Target Start/End: Original strand, 12603 - 12803
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12603 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaa-attacacatgattatgataataactaacc 12701  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  || |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||     
T  12702 cccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttct 12799  T
Q  499 tctc 502  Q
    ||||    
T  12800 tctc 12803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 299 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 22366504 - 22366311
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  22366504 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 22366406  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
T  22366405 cccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcaactcctaggtcaccccacttgattgctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 22366311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 29188397 - 29188116
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| |||    
T  29188397 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaag 29188299  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    ||||||||| || ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29188298 agcacgaatctagcatgaattgttcatcgacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattataataatcactaacccccttacct 29188202  T
Q  408 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 494  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  29188201 ttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 29188116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 450
Target Start/End: Original strand, 23328678 - 23328937
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23328678 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 23328777  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  23328778 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 23328876  T
Q  390 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23328877 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23328937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 210 - 476
Target Start/End: Original strand, 27009981 - 27010244
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | | |||||||||||   |  ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  27009981 ttcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 27010080  T
Q  310 cacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 409  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27010081 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctta 27010178  T
Q  410 gaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  27010179 gaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 27010244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 450
Target Start/End: Original strand, 24616282 - 24616541
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  24616282 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24616381  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  24616382 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 24616480  T
Q  390 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24616481 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24616541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 450
Target Start/End: Original strand, 24712658 - 24712917
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  24712658 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24712757  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  24712758 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 24712856  T
Q  390 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24712857 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24712917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 450
Target Start/End: Original strand, 24745676 - 24745935
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  24745676 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24745775  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  24745776 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 24745874  T
Q  390 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24745875 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24745935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 299 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4200008 - 4199816
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||    
T  4200008 cacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatccctaacc 4199910  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  4199909 cccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 4199816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 299 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 43443418 - 43443261
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  43443418 cacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaatccattttcatataacatgagaatatgcaa---ttacacatgattatgataatcactaacc 43443322  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 459  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443321 cccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 43443261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 299 - 451
Target Start/End: Original strand, 25426857 - 25427009
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  25426857 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 25426955  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattat-tcccaacccttgcttcaattcagctcctag 451  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  25426956 cccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctcctag 25427009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 377 - 502
Target Start/End: Original strand, 11343008 - 11343133
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11343008 atgattatgataaaaactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaacctctgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctcaagct 11343107  T
Q  477 ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11343108 ttcccttcaacactcttgttcttctc 11343133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 377 - 502
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106092
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 16106066  T
Q  477 ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16106067 ttcccttcaacactcttgttcttctc 16106092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 326
Target Start/End: Original strand, 32950762 - 32950950
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacata-tcaatttcatcaattaagcataatttcataactta-acatttatacatactttga 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||||| | || |||| || || |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  32950762 acatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaacaacatagtaaaattcaccatttgagcacaatttcataactttgacctttatacatactttga 32950861  T
Q  240 aac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    |||  ||||||||| ||  || ||||| || |||||||| |||  |||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaa 32950950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Original strand, 23514518 - 23514565
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23514518 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatca 23514565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 9730682 - 9730638
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9730682 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctca 9730638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10778269 - 10778217
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  10778269 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaat 10778217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 115
Target Start/End: Original strand, 23328557 - 23328600
Alignment:
Q  72 tcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23328557 tcatcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 23328600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Original strand, 20623262 - 20623359
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  20623262 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 20623359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21233498 - 21233401
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  21233498 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 21233401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Original strand, 37053037 - 37053134
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  37053037 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 37053134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 24616165 - 24616205
Alignment:
Q  75 tcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24616165 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 24616205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 24712541 - 24712581
Alignment:
Q  75 tcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24712541 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 24712581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 24745559 - 24745599
Alignment:
Q  75 tcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24745559 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 24745599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 25900376 - 25900321
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25900376 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 25900321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Original strand, 16536490 - 16536587
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  16536490 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 16536587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 3673828 - 3673868
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3673828 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 3673868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5451124 - 5451084
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5451124 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 5451084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23234766 - 23234730
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23234766 tttcacaaaaccaacaacaacaatttatttcacatca 23234730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 23493885 - 23493925
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23493885 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 23493925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Original strand, 18168927 - 18169402
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||| |     
T  18168927 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaattcacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagcattat 18169026  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169027 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 18169126  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18169127 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 18169226  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |    
T  18169227 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc-ttgaagaagattaacccta 18169325  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  18169326 attcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 18169402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 67 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15287507 - 15287096
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15287507 atttctcatcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatc 15287408  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  15287407 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 15287308  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 363  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15287307 ccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaat 15287208  T
Q  364 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaatt 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  15287207 gcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-actt 15287109  T
Q  464 gattcctcaagct 476  Q
    ||||||| |||||    
T  15287108 gattcctaaagct 15287096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 67 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 15294616 - 15294221
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15294616 atttctcatcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatc 15294517  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  15294516 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatatatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 15294417  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 363  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15294416 ccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaat 15294317  T
Q  364 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 459  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15294316 gcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccca 15294221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 46 - 408
Target Start/End: Original strand, 19020459 - 19020824
Alignment:
Q  46 caaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacat 145  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  19020459 caaaacaaccaacaacatcttatttctcatcatcaatccacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacat 19020558  T
Q  146 caatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac-- 242  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19020559 caatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatccattaaggataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacat 19020658  T
Q  243 gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccat 342  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  19020659 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 19020758  T
Q  343 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19020759 tttcatacaacatgacaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatggtaactaacccccttacctt 19020824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 153 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7132241 - 7131887
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7132241 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 7132142  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7132141 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 7132042  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7132041 taacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactcttgcttcaattcagctcct 7131942  T
Q  450 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  7131941 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 7131887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 67 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 17145919 - 17145479
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17145919 atttttcatcatcaatccgtaattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatc 17145820  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    |||||||||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  17145819 tcatttcaacaacaacatatcaaaattcactaattgagtataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 17145720  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 363  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17145719 ccataatcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaaaat 17145620  T
Q  364 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaat 462  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| ||| |||||||||||||||| || | |||| |||    
T  17145619 gcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttacttcaattcagctcctaagcttaccccaat 17145520  T
Q  463 tgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  17145519 tgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 17145479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 153 - 450
Target Start/End: Original strand, 20000803 - 20001103
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20000803 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 20000902  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20000903 cacccagaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 20001002  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  20001003 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 20001102  T
Q  450 a 450  Q
    |    
T  20001103 a 20001103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 67 - 420
Target Start/End: Original strand, 18248212 - 18248568
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18248212 atttttcatcatcaatcgataattatgtataccaaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatc 18248311  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    |||||||||  | ||||||| ||  ||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||    
T  18248312 tcatttcaacaacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcatatcttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacata 18248411  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 363  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248412 ccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 18248511  T
Q  364 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta 420  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18248512 gtaaaaattgtacaagattatgataataactaacccccttaccttagatgatgatta 18248568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 193 - 408
Target Start/End: Original strand, 22738390 - 22738607
Alignment:
Q  193 catcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22738390 catcaattaagcataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaa 22738489  T
Q  291 aatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataat 390  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |     
T  22738490 aatagcatcacagcaagaacacgaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaattgattatgatgaa 22738589  T
Q  391 aactaacccccttacctt 408  Q
     || ||||||||||||||    
T  22738590 gacaaacccccttacctt 22738607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 211 - 502
Target Start/End: Original strand, 10644360 - 10644647
Alignment:
Q  211 tcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 309  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||    || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  10644360 tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 10644458  T
Q  310 cacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 409  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10644459 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttt 10644555  T
Q  410 gaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||| ||||||| |  || |||  ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  10644556 gaagttgattatccttaatcctaacttcacttcagctcctagatcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 10644647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 207 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22352184 - 22351915
Alignment:
Q  207 aatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagc 304  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||| || | |    
T  22352184 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaac-agcaacataac 22352086  T
Q  305 aagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 404  Q
    ||||||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22352085 aagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctta 22351986  T
Q  405 cctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    |||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  22351985 ccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 22351915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 450
Target Start/End: Original strand, 26339140 - 26339399
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26339140 tcattaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatagattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 26339239  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  26339240 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 26339338  T
Q  390 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  26339339 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 26339399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 284 - 399
Target Start/End: Original strand, 8378365 - 8378480
Alignment:
Q  284 acaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgatta 383  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8378365 acaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgatta 8378464  T
Q  384 tgataataactaaccc 399  Q
    ||||||||||||||||    
T  8378465 tgataataactaaccc 8378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 299 - 476
Target Start/End: Original strand, 47357883 - 47358057
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  47357883 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaggaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacc 47357979  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    |||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| |||||    
T  47357980 cccttaccttagaagaagatta-acccaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattccttaagct 47358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 286
Target Start/End: Original strand, 8374502 - 8374724
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8374502 atttttcatcatcaatcgataattatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatc 8374601  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa--acgtaatttcacccctaaacata 263  Q
    |||||||||  | ||||||| ||  ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||    
T  8374602 tcatttcaacaacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaagcatgtaatttcacccacaaacata 8374701  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcaca 286  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  8374702 ccataatcatcaattcatgcaca 8374724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 376 - 502
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996572
Alignment:
Q  376 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||    
T  14996444 catgattatgataataactaacccccttaccttaaaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaaacttaccccaattgattcctcaag 14996543  T
Q  475 ct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    || ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  14996544 ctattctcttcaaaacccttgttcttctc 14996572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 408
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795564
Alignment:
Q  333 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9795490 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 9795564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 476
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952183
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 14952183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40885748 - 40885585
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 240  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40885748 acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataatttcataacttgacatttatacatactttgaa 40885649  T
Q  241 -acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacag 303  Q
     | |||||||||||   |||||| | || |||| ||||||| ||| |  || ||||||||||||    
T  40885648 catgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacag 40885585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 114
Target Start/End: Original strand, 22738263 - 22738310
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcac 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22738263 atttctcatcattaatccacaattaagtatacccaagtcataattcac 22738310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 5682827 - 5682783
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5682827 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 5682783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 20000680 - 20000732
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  20000680 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaataacatcttatttctcatcaacaat 20000732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22352308 - 22352260
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22352308 atttctcatcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcact 22352260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25119508 - 25119464
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25119508 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 25119464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 408
Target Start/End: Original strand, 8378486 - 8378524
Alignment:
Q  370 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378486 attgtacatgattatgataataactaatccccttacctt 8378524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16609069 - 16608972
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  16609069 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 16608972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Original strand, 26680493 - 26680590
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  26680493 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 26680590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 34395215 - 34395256
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34395215 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 34395256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7132364 - 7132312
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  7132364 aacttcatcaatttcacacaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 7132312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 115
Target Start/End: Original strand, 26339002 - 26339062
Alignment:
Q  55 caacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26339002 caacaacatttcatttttcatcattaatccataattaagtatacccaagttataattcact 26339062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16327896 - 16327841
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16327896 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 16327841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Original strand, 14901193 - 14901239
Alignment:
Q  36 accaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  14901193 accaattttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaat 14901239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 41166233 - 41166191
Alignment:
Q  35 caccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  41166233 caccaatttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatca 41166191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 15044794 - 15044834
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15044794 tttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaa 15044834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15109630 - 15109590
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15109630 tttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaa 15109590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15851637 - 15851597
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15851637 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaa 15851597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 40905210 - 40905174
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  40905210 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 40905174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 459
Target Start/End: Original strand, 29119 - 29551
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||| |     
T  29119 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatatctcatcatcaatacacaattaagtataaccaaatcataattcactaacaataacataaa 29218  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29219 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttac 29318  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29319 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataacataatcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 29418  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  29419 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatcctta 29518  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 459  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29519 atcctagcttcacttcagctcctaggtcaccca 29551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 502
Target Start/End: Original strand, 29565 - 29626
Alignment:
Q  440 ttcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  29565 ttcagctcctaggtcacccac-ttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 29626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 30 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 154306 - 153829
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| ||    
T  154306 aacttcaccaatttcacaaaaccaccatcaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacccacaatagcataag 154207  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154206 ttaacaataaccacatcaatggaatatgattcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 154107  T
Q  229 acatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  154106 acatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 154007  T
Q  327 ctgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | |    
T  154006 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaa 153907  T
Q  427 acccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  153906 actcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 153829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 299 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 169935 - 169738
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  169935 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attatacatgattatgataatcactaacc 169837  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttc 497  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  169836 cccttacttttgaagatgattatcactaacccttgcttcaattcagctcttatgtcaccccacttgattcctcaagcttcgccttcaactctcttgttc 169738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 304 - 494
Target Start/End: Original strand, 36327 - 36514
Alignment:
Q  304 caagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 403  Q
    |||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36327 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcattaaccccctt 36425  T
Q  404 acctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 494  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  36426 acctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagcttt-ccttcaaccctcttg 36514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 67 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 1837 - 1424
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| | |||||    
T  1837 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaattttatatgatttacatc 1738  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  1737 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 1638  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 363  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1637 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 1538  T
Q  364 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaat 462  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| || | |||| |||    
T  1537 gcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaacccttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaat 1438  T
Q  463 tgattcctcaagct 476  Q
    ||||||||||||||    
T  1437 tgattcctcaagct 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 67 - 486
Target Start/End: Original strand, 2386 - 2810
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2386 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaaccatgattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatc 2485  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  2486 tcatttcaataaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 2585  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 363  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2586 ccataagcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 2685  T
Q  364 gcaaaga-ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaat 462  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  2686 gcaaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaat 2785  T
Q  463 tgattcctcaagct-ttcccttcaa 486  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  2786 tgattcctcaagctattcccttcaa 2810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 67 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 10601 - 10184
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10601 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaagtcatgattccctcacaatagcatcagttaacaacaacaacatcaatggaatatgaattacatc 10502  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  10501 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 10402  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 363  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10401 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 10302  T
Q  364 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaat 462  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |  || |||||||||||||| || ||||||||  ||||||    |||||| || ||||| | || | |||| |||    
T  10301 gcaaaaattgaacatgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgattaaccccaacttaggcttcactttagctcataagcttaccccaat 10202  T
Q  463 tgattcctcaagctttcc 480  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10201 tgattcctcaagctttcc 10184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 153 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 1690 - 1336
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 249  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1690 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 1591  T
Q  250 cacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcata 349  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1590 cacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 1491  T
Q  350 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  1490 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcct 1391  T
Q  450 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  1390 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 67 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7718 - 7279
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || | | |||||||| | || ||  || | ||||||| ||||||||||||    
T  7718 atttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcactcacaacaacatcagttaataacaataaccttaatggaacatgaatcacatc 7619  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    |||||| ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||    
T  7618 tcattttaacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacata 7519  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 363  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7518 ccataatcttcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 7419  T
Q  364 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaatt 463  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  7418 gcaaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaatt 7319  T
Q  464 gattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  7318 gattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 7279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 67 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 34420 - 33980
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| | |  ||| |||| ||||||| |||||||| |||    
T  34420 atttctcatcatcaatccataatttagtatacccaagtcatgattcactcacaatagcatcagttaatagcaacaacattaatggaacatgaatcatatc 34321  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatc-aatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacata 263  Q
    |||||||||  | |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  34320 tcatttcaacaacaacatatccaaattcatcaattaagtataacttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 34221  T
Q  264 ccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34220 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatttttcatcaaccca-tttcatacaacaatgagaaaa 34122  T
Q  363 tgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaa 461  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||| ||||||| || | || | ||    
T  34121 tgcaaaaattgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacgccaa 34022  T
Q  462 ttgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  34021 ttgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 33980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 253278 - 253234
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  253278 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatca 253234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 55 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 270 - 3
Alignment:
Q  55 caacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaat 154  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  270 caacaacatcttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataactacatcaatgtaat 171  T
Q  155 atgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatc-aatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttca 251  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  170 atgaattacatctcatttcaattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttca 71  T
Q  252 cccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaattta 319  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  70 cccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaagagcacgaattta 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 209 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 5329 - 5034
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5329 tttcataacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 5231  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5230 agcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatacaacgtgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaactcccttacct 5131  T
Q  408 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||| ||||||| || || ||||||| ||||    
T  5130 ttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttaaaaacccttgttcttctc 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 299 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21139 - 20937
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139 cacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacc 21041  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 498  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  21040 cccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctttcccttcaaaactcttgttct 20941  T
Q  499 tctc 502  Q
    ||||    
T  20940 tctc 20937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 299 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 14084 - 13883
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14084 cacagcaagagcacga-tttagcaagaattgtgcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacc 13987  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttca 498  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13986 cccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctttcccttcaaaactcttgttct 13887  T
Q  499 tctc 502  Q
    ||||    
T  13886 tctc 13883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 65 - 408
Target Start/End: Original strand, 54408 - 54755
Alignment:
Q  65 ttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcaca 164  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  54408 ttatttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcaca 54507  T
Q  165 tctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacgt--aatttcacccctaaaca 261  Q
    |||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  || ||    
T  54508 tctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatca 54607  T
Q  262 taccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaa 360  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54608 tacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatcaacccattttcatacaacaatgagaa 54707  T
Q  361 aatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    | |||||  |||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  54708 attgcaataattgaacatgattatgatgaagactaaccaccttacctt 54755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 408
Target Start/End: Original strand, 45099 - 45369
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45099 acatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcaaaacttgacatttatacatactttgaa 45198  T
Q  241 ac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaac 338  Q
    ||  ||||||||||||  || ||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45199 acatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcatcaac 45298  T
Q  339 ccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  45299 ccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 45369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Original strand, 45003 - 45052
Alignment:
Q  65 ttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||    
T  45003 ttatttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaagtcatgattcac 45052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 243 - 476
Target Start/End: Original strand, 3895 - 4129
Alignment:
Q  243 gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccat 342  Q
    |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  3895 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 3994  T
Q  343 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattc 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  3995 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatgattaaccctaactcttgcttcaattc 4094  T
Q  443 agctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    ||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  4095 agctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 4129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 10775 - 10570
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775 cacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacc 10676  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgtt 496  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  10675 cccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccacaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgtt 10576  T
Q  497 catctc 502  Q
    | ||||    
T  10575 cttctc 10570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 192 - 459
Target Start/End: Original strand, 6718 - 6986
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  6718 tcattaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataaga 6817  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  6818 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 6916  T
Q  390 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6917 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccca 6986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 115
Target Start/End: Original strand, 6597 - 6640
Alignment:
Q  72 tcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6597 tcatcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 6640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 205 - 408
Target Start/End: Original strand, 54008 - 54212
Alignment:
Q  205 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacag 303  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  54008 ataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacag 54107  T
Q  304 caagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 403  Q
     ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  54108 taagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaaccccctt 54207  T
Q  404 acctt 408  Q
    |||||    
T  54208 acctt 54212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 502
Target Start/End: Original strand, 3101 - 3395
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaaga 308  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||  | | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| | | |  || ||| || ||||||||||    
T  3101 tttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaaga 3200  T
Q  309 gcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3201 gcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacataattatgataataattaacccccttacctt 3299  T
Q  409 tgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
     ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||    
T  3300 agaagaagattaaccgaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 377 - 502
Target Start/End: Original strand, 130880 - 131005
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattatgcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 130979  T
Q  477 ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  130980 ttcccttcaacactcttgttcttctc 131005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 304 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 31693 - 31506
Alignment:
Q  304 caagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 403  Q
    |||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31693 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaaccccctt 31595  T
Q  404 acctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 494  Q
    || ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  31594 acatttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 31506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 299 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 1327 - 1153
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  1327 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacc 1230  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    ||| |||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  1229 cccctacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtca-ccaacttgattcctaaagct 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 299 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 64546 - 64372
Alignment:
Q  299 cacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 398  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  64546 cacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacc 64449  T
Q  399 cccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    |||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  64448 cccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattccttaagct 64372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 307 - 408
Target Start/End: Original strand, 107983 - 108084
Alignment:
Q  307 gagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 406  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  107983 gagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 108082  T
Q  407 tt 408  Q
    ||    
T  108083 tt 108084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 90125 - 90085
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  90125 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 90085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 209 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 13438 - 13169
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||  |||    
T  13438 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaag 13340  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    ||||||||| || ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13339 agcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgaaaa-att--acatgattatgataatcactaacccccttacct 13243  T
Q  408 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccct 482  Q
    |||||| ||||||| |  |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  13242 ttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagttcctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttcccct 13169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 476
Target Start/End: Original strand, 177 - 438
Alignment:
Q  212 cataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagca 311  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||  | | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||||    
T  177 cataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagca 276  T
Q  312 cgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttga 411  Q
    ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  277 cgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgag-caatgcaaa-at--tacatgattttgataataactaacccccttaccttaga 372  T
Q  412 agatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    ||| ||||| ||| ||| || ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  373 agaagattaatccaaactctcgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 30049 - 30090
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30049 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 30090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 205 - 368
Target Start/End: Original strand, 3547 - 3711
Alignment:
Q  205 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacag 303  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||||    
T  3547 ataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacag 3646  T
Q  304 caagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 368  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3647 taagagcactaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaa 3711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 23884 - 23600
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || | | ||||    
T  23884 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaatccatgtataaga 23785  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  | || || | | ||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||| ||||||||    
T  23784 aacaa-caacataaccagagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataa 23686  T
Q  390 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  23685 taactaacccccttaacttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagttcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 23600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 24010 - 23962
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  24010 atttttcatcatcaatccataattaagtacacccaagttataattcact 23962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 377 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17127
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagattattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 17142  T
Q  477 ttcccttcaacactc 491  Q
    |||| ||||||||||    
T  17141 ttcctttcaacactc 17127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 408
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7547
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 289  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  7330 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagc 7429  T
Q  290 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 389  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| |    
T  7430 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatga 7528  T
Q  390 taactaacccccttacctt 408  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  7529 aaacaaacccccttacctt 7547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Original strand, 7204 - 7252
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7204 atttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcact 7252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 209 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 9462 - 9266
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||     
T  9462 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaa 9364  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9363 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacct 9267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 209 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16360 - 16164
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 307  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||   || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||     
T  16360 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaa 16262  T
Q  308 agcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 407  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16261 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacct 16165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 304 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12045
Alignment:
Q  304 caagagcacgaatttaacaacaactgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccct 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12149 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa-tgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct 12051  T
Q  403 tacctt 408  Q
    ||||||    
T  12050 tacctt 12045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 56294 - 56107
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||| || |||  |||| || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  56294 acatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattcaccatttgagcacaatttcataacttgacatttatacatactttaaa 56195  T
Q  241 ac--gtaatttcacccctaaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaa 326  Q
    ||  ||||||||| ||  || ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  56194 acatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaa 56107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 333 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
Q  333 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13342 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 377 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 107980
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 475  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||| | |||||    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| ||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaattccaacttaggcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcacgc 108008  T
Q  476 t-ttcccttcaacactcttgttcatctc 502  Q
    | ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  108007 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 107980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13582 - 13541
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  13582 ttcaccaatttcacaaaaccactaacaacaatccatttctca 13541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 803
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 475  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||    
T  914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccccaactcttgattcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 815  T
Q  476 t-ttcccttcaa 486  Q
    | ||||||||||    
T  814 tattcccttcaa 803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 384 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 154373 - 154282
Alignment:
Q  384 tgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  154373 tgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 154282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 6022 - 5922
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttga-agatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 474  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || | || | |||||||||||||||    
T  6022 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataga-gattaatcctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttactctaattgattcctcaag 5924  T
Q  475 ct 476  Q
    ||    
T  5923 ct 5922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 34450 - 34374
Alignment:
Q  334 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 408  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34450 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgataataactaaccctcttacctt 34374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Original strand, 4899 - 4943
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4899 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatca 4943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6383 - 6339
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6383 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 6339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 31580 - 31536
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31580 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 31536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 41264 - 41308
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41264 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 41308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 77136 - 77092
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  77136 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatca 77092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 1357 - 1398
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1357 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 1398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Original strand, 22833 - 22930
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  22833 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 22930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Original strand, 27088 - 27185
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  27088 catgaaaaattgcaaagaaggaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 27185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1552 - 1455
Alignment:
Q  353 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  1552 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 1455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 162476 - 162435
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  162476 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 162435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 166554 - 166523
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166554 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 166523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 116802 - 116758
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  116802 ttcaccaattttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatca 116758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 2421 - 2461
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2421 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 2461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 64
Target Start/End: Original strand, 171865 - 171896
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  171865 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 171896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 64
Target Start/End: Original strand, 177568 - 177599
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177568 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 177599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 837
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    ||||||||| ||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctccta 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9841
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 450  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    ||||||||| ||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctccta 9841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Original strand, 7372 - 7408
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7372 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 7408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Original strand, 16797 - 16833
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16797 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 16833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2597 - 2557
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2597 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 2557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 377 - 409
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42709
Alignment:
Q  377 atgattatgataataactaacccccttaccttt 409  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttaccttt 42709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Original strand, 1308 - 1344
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1308 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 1344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23949 - 23913
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23949 acaaaaccaacaacaacaatttatttttcatcatcaa 23913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Original strand, 6514 - 6550
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6514 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 6550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Original strand, 271985 - 272025
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctc 73  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  271985 ttcactaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctc 272025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University