View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11279_high_43 (Length: 242)

Name: NF11279_high_43
Description: NF11279
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11279_high_43
NF11279_high_43
[»] chr7 (132 HSPs)
chr7 (3-225)||(32160621-32160843)
chr7 (1-225)||(708972-709196)
chr7 (1-225)||(16462447-16462671)
chr7 (1-220)||(58835-59054)
chr7 (1-225)||(16550421-16550645)
chr7 (1-225)||(16615017-16615241)
chr7 (1-225)||(18456065-18456289)
chr7 (2-220)||(47094496-47094714)
chr7 (1-225)||(47975328-47975552)
chr7 (1-220)||(8756813-8757032)
chr7 (2-225)||(13647653-13647876)
chr7 (2-218)||(36685667-36685884)
chr7 (1-213)||(14415901-14416113)
chr7 (1-225)||(48812249-48812473)
chr7 (1-220)||(40555160-40555379)
chr7 (2-220)||(4325472-4325690)
chr7 (1-194)||(15213941-15214134)
chr7 (1-220)||(13408188-13408407)
chr7 (1-216)||(13745193-13745408)
chr7 (1-220)||(17070710-17070929)
chr7 (2-216)||(12465678-12465892)
chr7 (2-216)||(46386505-46386719)
chr7 (1-225)||(14191505-14191727)
chr7 (1-218)||(30820673-30820890)
chr7 (1-220)||(12755123-12755342)
chr7 (1-220)||(13699306-13699525)
chr7 (1-216)||(33001334-33001549)
chr7 (1-225)||(14188711-14188933)
chr7 (1-161)||(29052572-29052732)
chr7 (1-220)||(832440-832659)
chr7 (1-220)||(1197620-1197839)
chr7 (2-216)||(12371695-12371909)
chr7 (2-216)||(44374366-44374580)
chr7 (2-216)||(44383231-44383445)
chr7 (1-194)||(32771770-32771963)
chr7 (1-225)||(34957582-34957806)
chr7 (1-193)||(48743746-48743938)
chr7 (1-220)||(37727344-37727563)
chr7 (2-216)||(8851577-8851791)
chr7 (2-216)||(11066888-11067102)
chr7 (1-225)||(38828472-38828696)
chr7 (1-220)||(11661521-11661740)
chr7 (1-218)||(17505421-17505638)
chr7 (1-218)||(17547576-17547793)
chr7 (1-214)||(19282514-19282727)
chr7 (1-225)||(29004233-29004457)
chr7 (1-208)||(15167403-15167610)
chr7 (2-216)||(13147890-13148104)
chr7 (1-217)||(14422204-14422420)
chr7 (5-220)||(18607703-18607918)
chr7 (2-225)||(16998837-16999066)
chr7 (9-212)||(32434014-32434217)
chr7 (1-208)||(10896411-10896618)
chr7 (2-181)||(12323348-12323527)
chr7 (1-220)||(18872576-18872795)
chr7 (2-216)||(14258772-14258986)
chr7 (2-216)||(20585776-20585986)
chr7 (4-220)||(16008794-16009010)
chr7 (2-216)||(32301602-32301816)
chr7 (1-186)||(13864812-13864997)
chr7 (56-216)||(13745672-13745832)
chr7 (1-216)||(147838-148053)
chr7 (14-216)||(12127593-12127796)
chr7 (1-220)||(14566418-14566637)
chr7 (1-216)||(14928749-14928964)
chr7 (1-216)||(15352215-15352430)
chr7 (1-212)||(14153389-14153599)
chr7 (1-216)||(16580080-16580295)
chr7 (79-216)||(13894515-13894652)
chr7 (59-216)||(16460407-16460564)
chr7 (50-210)||(15119761-15119921)
chr7 (1-216)||(39292154-39292368)
chr7 (2-216)||(18875264-18875478)
chr7 (2-208)||(20619714-20619920)
chr7 (23-216)||(16585390-16585583)
chr7 (1-216)||(21538606-21538820)
chr7 (1-216)||(25941858-25942072)
chr7 (1-216)||(48213362-48213576)
chr7 (1-135)||(15720250-15720384)
chr7 (77-194)||(13918260-13918377)
chr7 (1-216)||(43277160-43277376)
chr7 (84-194)||(25926993-25927103)
chr7 (92-225)||(14273759-14273892)
chr7 (1-212)||(14161272-14161482)
chr7 (1-216)||(15576248-15576462)
chr7 (1-216)||(24270399-24270613)
chr7 (1-216)||(3287417-3287625)
chr7 (3-216)||(20252761-20252973)
chr7 (1-216)||(4691313-4691527)
chr7 (1-211)||(3192710-3192920)
chr7 (1-215)||(18080135-18080348)
chr7 (3-210)||(9743500-9743706)
chr7 (1-225)||(46580341-46580551)
chr7 (1-172)||(15978473-15978644)
chr7 (1-99)||(1856817-1856915)
chr7 (1-99)||(13917990-13918088)
chr7 (1-212)||(8514163-8514373)
chr7 (1-99)||(25926717-25926815)
chr7 (1-99)||(23664540-23664638)
chr7 (1-76)||(11309869-11309944)
chr7 (84-146)||(1857092-1857154)
chr7 (1-99)||(11303724-11303822)
chr7 (93-211)||(28719885-28720003)
chr7 (1-99)||(29800906-29801004)
chr7 (1-99)||(29797087-29797185)
chr7 (115-216)||(20487863-20487964)
chr7 (1-77)||(13897805-13897881)
chr7 (19-99)||(16108294-16108374)
chr7 (1-132)||(46473562-46473693)
chr7 (56-214)||(8564063-8564220)
chr7 (1-99)||(24702705-24702803)
chr7 (1-99)||(24705152-24705250)
chr7 (1-99)||(32125967-32126065)
chr7 (1-99)||(41523394-41523492)
chr7 (1-99)||(41525856-41525954)
chr7 (2-64)||(44190667-44190729)
chr7 (1-99)||(18431188-18431286)
chr7 (61-194)||(3136737-3136869)
chr7 (1-159)||(12191802-12191960)
chr7 (33-99)||(14948742-14948808)
chr7 (1-139)||(37538905-37539043)
chr7 (16-117)||(16065966-16066067)
chr7 (167-216)||(21675491-21675540)
chr7 (156-216)||(15720196-15720256)
chr7 (1-47)||(15376301-15376347)
chr7 (1-47)||(20384711-20384757)
chr7 (155-194)||(1858644-1858683)
chr7 (1-44)||(14105884-14105927)
chr7 (1-64)||(39431645-39431707)
chr7 (1-47)||(16233049-16233095)
chr7 (1-83)||(21660570-21660652)
chr7 (1-47)||(27217389-27217435)
[»] chr2 (87 HSPs)
chr2 (1-222)||(25183601-25183822)
chr2 (1-225)||(18358386-18358610)
chr2 (1-225)||(21081388-21081612)
chr2 (1-216)||(24273676-24273891)
chr2 (1-223)||(26903571-26903793)
chr2 (1-225)||(27472664-27472888)
chr2 (2-220)||(24883802-24884020)
chr2 (1-225)||(41301390-41301614)
chr2 (1-220)||(10039551-10039770)
chr2 (1-216)||(43707702-43707916)
chr2 (2-216)||(9975349-9975563)
chr2 (2-216)||(24781258-24781472)
chr2 (1-219)||(31520534-31520752)
chr2 (4-220)||(23338820-23339036)
chr2 (2-216)||(5031548-5031762)
chr2 (2-216)||(36839591-36839805)
chr2 (2-194)||(18388715-18388907)
chr2 (1-225)||(21915033-21915257)
chr2 (1-225)||(22173445-22173669)
chr2 (1-225)||(34858802-34859026)
chr2 (1-225)||(34873864-34874088)
chr2 (2-216)||(17306907-17307121)
chr2 (1-216)||(23969040-23969255)
chr2 (2-212)||(27484888-27485098)
chr2 (1-210)||(20915531-20915740)
chr2 (2-216)||(24515606-24515820)
chr2 (1-218)||(20590739-20590956)
chr2 (8-216)||(23068874-23069082)
chr2 (1-220)||(21073144-21073363)
chr2 (2-216)||(19201618-19201833)
chr2 (2-216)||(28652920-28653134)
chr2 (1-220)||(9242176-9242395)
chr2 (1-220)||(19662072-19662291)
chr2 (1-211)||(21368532-21368742)
chr2 (1-208)||(6482946-6483154)
chr2 (1-208)||(6486413-6486621)
chr2 (1-216)||(28349328-28349552)
chr2 (1-216)||(9785002-9785217)
chr2 (1-220)||(6260795-6261014)
chr2 (1-216)||(25587104-25587318)
chr2 (1-212)||(22690105-22690315)
chr2 (1-212)||(22694701-22694911)
chr2 (1-213)||(21335870-21336081)
chr2 (18-216)||(29113782-29113979)
chr2 (2-220)||(2524165-2524365)
chr2 (1-216)||(21316079-21316293)
chr2 (84-194)||(31345385-31345495)
chr2 (3-216)||(22686260-22686472)
chr2 (1-216)||(28345493-28345707)
chr2 (3-216)||(1384105-1384317)
chr2 (1-216)||(22332138-22332351)
chr2 (4-215)||(23609898-23610108)
chr2 (1-99)||(31345656-31345754)
chr2 (1-140)||(23778712-23778852)
chr2 (1-99)||(20261696-20261794)
chr2 (1-99)||(10684350-10684448)
chr2 (115-220)||(30643812-30643917)
chr2 (130-220)||(22501284-22501374)
chr2 (130-220)||(22509218-22509308)
chr2 (1-99)||(38967956-38968054)
chr2 (2-96)||(40911863-40911957)
chr2 (1-80)||(22255768-22255847)
chr2 (1-99)||(24897783-24897881)
chr2 (1-99)||(24900266-24900364)
chr2 (1-99)||(24902743-24902841)
chr2 (1-99)||(24905220-24905318)
chr2 (1-99)||(24907695-24907793)
chr2 (3-178)||(22786717-22786891)
chr2 (1-99)||(23136056-23136154)
chr2 (33-137)||(20272855-20272959)
chr2 (2-61)||(22501375-22501434)
chr2 (2-61)||(22509309-22509368)
chr2 (1-140)||(36734902-36735041)
chr2 (107-214)||(24841375-24841481)
chr2 (2-60)||(7186942-7187000)
chr2 (1-47)||(18809471-18809517)
chr2 (1-47)||(28577627-28577673)
chr2 (56-136)||(24302220-24302300)
chr2 (181-225)||(34492089-34492133)
chr2 (61-184)||(24281124-24281246)
chr2 (1-47)||(571926-571972)
chr2 (1-47)||(23711601-23711647)
chr2 (1-47)||(26505907-26505953)
chr2 (1-47)||(26508385-26508431)
chr2 (1-47)||(27920352-27920398)
chr2 (1-47)||(32039086-32039132)
chr2 (1-47)||(39682842-39682888)
[»] chr4 (82 HSPs)
chr4 (1-225)||(10694664-10694888)
chr4 (1-225)||(10908430-10908654)
chr4 (1-225)||(15008377-15008601)
chr4 (1-220)||(9638423-9638642)
chr4 (4-225)||(40619941-40620162)
chr4 (2-223)||(15990452-15990673)
chr4 (1-216)||(3337519-3337734)
chr4 (1-225)||(630320-630544)
chr4 (2-220)||(15447834-15448052)
chr4 (2-225)||(12611262-12611485)
chr4 (2-216)||(19609744-19609958)
chr4 (2-216)||(25091073-25091287)
chr4 (2-216)||(53630891-53631105)
chr4 (1-220)||(10704914-10705133)
chr4 (1-220)||(10918684-10918903)
chr4 (1-216)||(35660266-35660481)
chr4 (1-220)||(56115253-56115472)
chr4 (2-225)||(23802882-23803105)
chr4 (1-220)||(33849158-33849377)
chr4 (2-216)||(10356854-10357068)
chr4 (2-216)||(37019089-37019303)
chr4 (1-210)||(9923622-9923831)
chr4 (1-225)||(10056883-10057107)
chr4 (1-220)||(24046951-24047170)
chr4 (2-216)||(42875219-42875433)
chr4 (1-210)||(11479028-11479237)
chr4 (1-216)||(16997950-16998160)
chr4 (1-220)||(18212982-18213201)
chr4 (2-225)||(51463485-51463708)
chr4 (2-216)||(14549046-14549260)
chr4 (1-218)||(16277744-16277961)
chr4 (1-220)||(33186317-33186536)
chr4 (1-216)||(33243713-33243928)
chr4 (2-211)||(15114648-15114856)
chr4 (1-218)||(53387354-53387571)
chr4 (1-225)||(28385654-28385878)
chr4 (2-168)||(15011931-15012097)
chr4 (1-216)||(19435114-19435330)
chr4 (2-216)||(11425375-11425579)
chr4 (1-216)||(14630246-14630461)
chr4 (1-216)||(19566336-19566550)
chr4 (1-215)||(10237915-10238128)
chr4 (1-212)||(15344301-15344510)
chr4 (1-216)||(25513163-25513377)
chr4 (1-212)||(40229727-40229938)
chr4 (86-225)||(15883917-15884056)
chr4 (1-211)||(15214462-15214672)
chr4 (2-216)||(26445305-26445518)
chr4 (1-212)||(44024021-44024231)
chr4 (2-216)||(2425039-2425252)
chr4 (1-194)||(3485353-3485543)
chr4 (4-194)||(16026349-16026538)
chr4 (1-212)||(45314754-45314964)
chr4 (1-212)||(46740623-46740833)
chr4 (1-124)||(55582703-55582826)
chr4 (1-107)||(22725502-22725608)
chr4 (1-99)||(15534658-15534756)
chr4 (3-210)||(20595850-20596056)
chr4 (1-99)||(14049054-14049152)
chr4 (1-123)||(18108295-18108417)
chr4 (144-219)||(9871126-9871201)
chr4 (1-191)||(13046062-13046251)
chr4 (1-91)||(14185427-14185517)
chr4 (1-99)||(36038347-36038445)
chr4 (75-216)||(14508182-14508322)
chr4 (138-220)||(43251116-43251199)
chr4 (1-99)||(12033361-12033459)
chr4 (1-99)||(44615765-44615863)
chr4 (1-99)||(49547361-49547459)
chr4 (135-216)||(13036328-13036409)
chr4 (75-209)||(12622799-12622932)
chr4 (1-99)||(30147392-30147490)
chr4 (1-99)||(50221927-50222025)
chr4 (1-99)||(19243177-19243275)
chr4 (2-135)||(19081759-19081892)
chr4 (33-99)||(29267830-29267896)
chr4 (167-216)||(26922254-26922303)
chr4 (1-137)||(54364107-54364243)
chr4 (1-47)||(15117940-15117986)
chr4 (1-140)||(17376083-17376222)
chr4 (1-43)||(7640774-7640816)
chr4 (167-216)||(55582624-55582673)
[»] chr6 (95 HSPs)
chr6 (1-225)||(15173872-15174096)
chr6 (1-220)||(18658622-18658841)
chr6 (1-220)||(611156-611375)
chr6 (1-216)||(28947764-28947979)
chr6 (1-218)||(27851421-27851638)
chr6 (2-216)||(19655647-19655861)
chr6 (1-206)||(8767680-8767885)
chr6 (1-220)||(19825906-19826125)
chr6 (1-218)||(20733864-20734080)
chr6 (2-216)||(7827392-7827606)
chr6 (2-216)||(17318540-17318754)
chr6 (2-220)||(25619375-25619593)
chr6 (1-225)||(19443697-19443921)
chr6 (1-220)||(15817175-15817394)
chr6 (2-225)||(20556511-20556734)
chr6 (2-216)||(18702984-18703198)
chr6 (2-216)||(18708919-18709133)
chr6 (2-194)||(15891129-15891321)
chr6 (2-220)||(14979040-14979258)
chr6 (1-220)||(29847920-29848141)
chr6 (1-206)||(8759934-8760138)
chr6 (1-216)||(25601694-25601909)
chr6 (1-225)||(13764764-13764981)
chr6 (1-178)||(1254215-1254392)
chr6 (1-194)||(18928165-18928358)
chr6 (1-212)||(20182988-20183198)
chr6 (1-212)||(22152793-22153003)
chr6 (1-192)||(25347570-25347761)
chr6 (3-218)||(34296688-34296903)
chr6 (2-216)||(23150685-23150898)
chr6 (1-225)||(16133087-16133311)
chr6 (1-225)||(23956273-23956497)
chr6 (2-216)||(31734128-31734340)
chr6 (1-212)||(5834152-5834362)
chr6 (1-212)||(20177170-20177380)
chr6 (2-216)||(27125894-27126109)
chr6 (2-216)||(15705029-15705243)
chr6 (2-216)||(19773127-19773341)
chr6 (1-171)||(23655804-23655974)
chr6 (1-212)||(22158611-22158821)
chr6 (1-216)||(23491588-23491803)
chr6 (1-216)||(23497186-23497401)
chr6 (10-216)||(27317981-27318187)
chr6 (1-216)||(25921150-25921364)
chr6 (2-220)||(4477074-4477292)
chr6 (1-169)||(755-923)
chr6 (1-216)||(18455489-18455703)
chr6 (1-192)||(23838443-23838634)
chr6 (1-166)||(25807602-25807767)
chr6 (8-216)||(22556669-22556877)
chr6 (1-216)||(18585040-18585253)
chr6 (1-216)||(32259268-32259481)
chr6 (85-194)||(23415153-23415262)
chr6 (77-194)||(27556911-27557028)
chr6 (1-216)||(13285129-13285343)
chr6 (1-212)||(20411089-20411299)
chr6 (1-140)||(29044806-29044945)
chr6 (1-216)||(18398339-18398553)
chr6 (1-139)||(34141042-34141180)
chr6 (1-139)||(34153658-34153796)
chr6 (1-211)||(17857109-17857319)
chr6 (2-109)||(22806276-22806383)
chr6 (1-99)||(23415441-23415539)
chr6 (2-100)||(27330390-27330488)
chr6 (2-100)||(27391130-27391228)
chr6 (1-154)||(31022114-31022267)
chr6 (1-99)||(12942666-12942764)
chr6 (8-210)||(15938650-15938851)
chr6 (1-99)||(27557199-27557297)
chr6 (1-99)||(28288924-28289022)
chr6 (1-90)||(7430069-7430158)
chr6 (1-90)||(14594042-14594131)
chr6 (1-140)||(35057000-35057139)
chr6 (33-99)||(15892028-15892094)
chr6 (1-99)||(19858510-19858608)
chr6 (1-99)||(33862270-33862368)
chr6 (1-194)||(23221308-23221500)
chr6 (3-99)||(17883087-17883183)
chr6 (3-210)||(22523388-22523594)
chr6 (1-99)||(1540499-1540597)
chr6 (1-63)||(19234658-19234720)
chr6 (3-211)||(31161878-31162085)
chr6 (1-99)||(12742794-12742892)
chr6 (160-225)||(25752961-25753026)
chr6 (160-225)||(25755131-25755196)
chr6 (136-211)||(16135519-16135594)
chr6 (1-47)||(18334180-18334226)
chr6 (1-47)||(24423075-24423121)
chr6 (172-216)||(19234617-19234661)
chr6 (8-140)||(31163462-31163594)
chr6 (2-140)||(3007530-3007668)
chr6 (1-47)||(8055558-8055604)
chr6 (1-47)||(26924035-26924081)
chr6 (1-47)||(33864806-33864852)
chr6 (167-216)||(29044682-29044731)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (1-225)||(17011137-17011361)
chr5 (1-225)||(263268-263492)
chr5 (1-225)||(29448249-29448473)
chr5 (1-225)||(18418823-18419047)
chr5 (1-220)||(24277023-24277242)
chr5 (1-220)||(24384971-24385190)
chr5 (1-215)||(27868992-27869206)
chr5 (3-220)||(17812812-17813029)
chr5 (1-218)||(36460388-36460605)
chr5 (1-216)||(32607742-32607957)
chr5 (1-220)||(22412422-22412641)
chr5 (1-218)||(21557461-21557679)
chr5 (1-225)||(6766072-6766296)
chr5 (2-220)||(17875415-17875633)
chr5 (12-216)||(20565974-20566178)
chr5 (1-225)||(30138581-30138804)
chr5 (1-218)||(21554796-21555013)
chr5 (1-216)||(21399421-21399635)
chr5 (2-218)||(31456216-31456432)
chr5 (2-216)||(19921054-19921267)
chr5 (1-210)||(26761827-26762036)
chr5 (2-210)||(33895300-33895508)
chr5 (1-210)||(8833624-8833824)
chr5 (1-225)||(33472981-33473205)
chr5 (1-220)||(22758307-22758527)
chr5 (1-208)||(22336748-22336955)
chr5 (1-213)||(41876010-41876222)
chr5 (1-208)||(22340286-22340493)
chr5 (1-220)||(28370673-28370892)
chr5 (1-220)||(38145155-38145374)
chr5 (1-212)||(20198003-20198216)
chr5 (1-208)||(19511614-19511822)
chr5 (1-225)||(42960788-42961012)
chr5 (1-216)||(16062906-16063120)
chr5 (25-208)||(22750372-22750555)
chr5 (1-216)||(36509201-36509409)
chr5 (1-135)||(40917390-40917524)
chr5 (1-220)||(37598534-37598753)
chr5 (1-212)||(8504286-8504496)
chr5 (2-216)||(18744070-18744283)
chr5 (1-216)||(16605021-16605235)
chr5 (8-214)||(14026232-14026437)
chr5 (1-216)||(1627798-1628012)
chr5 (50-216)||(22111020-22111185)
chr5 (1-212)||(23199809-23200017)
chr5 (1-107)||(24617340-24617446)
chr5 (1-107)||(24713571-24713677)
chr5 (1-107)||(24746599-24746705)
chr5 (1-99)||(37804490-37804588)
chr5 (1-107)||(24668614-24668720)
chr5 (1-107)||(24738383-24738489)
chr5 (1-107)||(24751152-24751258)
chr5 (1-185)||(28901372-28901555)
chr5 (1-185)||(28937767-28937950)
chr5 (1-90)||(43243075-43243164)
chr5 (1-80)||(17909023-17909102)
chr5 (142-220)||(12122080-12122158)
chr5 (72-212)||(26749538-26749677)
chr5 (80-216)||(30611973-30612108)
chr5 (80-216)||(30613933-30614068)
chr5 (1-99)||(10732528-10732626)
chr5 (1-99)||(29351402-29351500)
chr5 (1-207)||(31478801-31479005)
chr5 (2-99)||(29346456-29346553)
chr5 (2-99)||(29348929-29349026)
chr5 (3-99)||(42244955-42245051)
chr5 (1-47)||(20909540-20909586)
chr5 (1-43)||(23065046-23065088)
chr5 (9-77)||(7528421-7528489)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (1-225)||(4441-4669)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (1-225)||(4441-4669)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (1-225)||(5869-6093)
[»] chr3 (133 HSPs)
chr3 (2-220)||(14641968-14642186)
chr3 (1-225)||(16979321-16979545)
chr3 (1-222)||(6805378-6805599)
chr3 (1-225)||(2248387-2248611)
chr3 (1-220)||(3394419-3394638)
chr3 (1-220)||(6158813-6159032)
chr3 (1-220)||(10833756-10833975)
chr3 (1-216)||(11192501-11192715)
chr3 (2-220)||(10563125-10563343)
chr3 (2-220)||(12275965-12276183)
chr3 (2-216)||(40807416-40807630)
chr3 (2-216)||(40812253-40812467)
chr3 (1-225)||(8928082-8928306)
chr3 (1-225)||(24152861-24153085)
chr3 (2-216)||(5206072-5206286)
chr3 (17-223)||(13029709-13029915)
chr3 (2-216)||(14441588-14441802)
chr3 (1-214)||(50351417-50351630)
chr3 (1-220)||(179124-179343)
chr3 (17-223)||(13026117-13026323)
chr3 (2-216)||(54875901-54876115)
chr3 (8-225)||(43550101-43550318)
chr3 (8-225)||(50243144-50243361)
chr3 (3-220)||(37038234-37038452)
chr3 (1-225)||(35961304-35961528)
chr3 (1-220)||(1988649-1988868)
chr3 (1-220)||(6819525-6819744)
chr3 (1-220)||(10989221-10989439)
chr3 (2-225)||(16643416-16643639)
chr3 (2-216)||(17685261-17685475)
chr3 (1-194)||(11913163-11913356)
chr3 (1-220)||(13522827-13523047)
chr3 (1-220)||(42324638-42324857)
chr3 (2-216)||(2841881-2842094)
chr3 (2-216)||(14508268-14508481)
chr3 (2-216)||(17693488-17693702)
chr3 (1-218)||(31224370-31224588)
chr3 (2-216)||(35064999-35065212)
chr3 (3-216)||(17519292-17519505)
chr3 (3-216)||(17534154-17534367)
chr3 (1-218)||(55292058-55292275)
chr3 (2-194)||(17670127-17670319)
chr3 (32-216)||(44273894-44274078)
chr3 (18-216)||(17538527-17538725)
chr3 (2-212)||(50348444-50348654)
chr3 (1-218)||(10554685-10554902)
chr3 (3-220)||(14966418-14966635)
chr3 (3-220)||(18367177-18367394)
chr3 (1-210)||(33564555-33564764)
chr3 (2-187)||(43889217-43889402)
chr3 (2-210)||(17044392-17044600)
chr3 (1-217)||(18889783-18889999)
chr3 (2-216)||(35354019-35354236)
chr3 (2-216)||(15931925-15932139)
chr3 (1-194)||(53646477-53646670)
chr3 (1-216)||(13519702-13519918)
chr3 (20-192)||(17513024-17513196)
chr3 (1-193)||(18893067-18893259)
chr3 (1-208)||(20248401-20248608)
chr3 (1-206)||(19443941-19444146)
chr3 (1-225)||(41938-42162)
chr3 (1-208)||(38311420-38311628)
chr3 (1-212)||(43928775-43928986)
chr3 (2-216)||(12511268-12511482)
chr3 (2-216)||(22307001-22307215)
chr3 (7-216)||(12470222-12470431)
chr3 (1-220)||(9533545-9533764)
chr3 (1-216)||(10541875-10542090)
chr3 (1-216)||(14519683-14519897)
chr3 (1-220)||(14763378-14763597)
chr3 (1-220)||(23371124-23371343)
chr3 (1-213)||(3803258-3803470)
chr3 (2-216)||(18699891-18700105)
chr3 (2-216)||(49900148-49900370)
chr3 (1-216)||(6156126-6156340)
chr3 (1-216)||(14671244-14671459)
chr3 (2-216)||(41172788-41173003)
chr3 (1-216)||(50755799-50756013)
chr3 (1-216)||(9511583-9511797)
chr3 (1-216)||(9519558-9519772)
chr3 (1-225)||(16324958-16325182)
chr3 (1-216)||(14152816-14153031)
chr3 (1-220)||(51300811-51301030)
chr3 (1-216)||(54330723-54330937)
chr3 (1-216)||(24546257-24546475)
chr3 (23-172)||(14567651-14567800)
chr3 (2-131)||(17046631-17046760)
chr3 (50-194)||(5223572-5223716)
chr3 (84-194)||(15465343-15465453)
chr3 (1-215)||(15565935-15566148)
chr3 (84-194)||(26055128-26055238)
chr3 (2-127)||(5215156-5215281)
chr3 (1-215)||(25104620-25104832)
chr3 (1-212)||(17207766-17207975)
chr3 (8-216)||(12952462-12952669)
chr3 (1-140)||(17938022-17938161)
chr3 (58-225)||(22652243-22652409)
chr3 (1-111)||(51603017-51603127)
chr3 (1-140)||(18739391-18739530)
chr3 (1-99)||(15465631-15465729)
chr3 (1-114)||(19568828-19568941)
chr3 (1-99)||(5223860-5223958)
chr3 (1-107)||(46723043-46723149)
chr3 (118-225)||(52989492-52989599)
chr3 (117-216)||(11258887-11258986)
chr3 (1-99)||(26054852-26054950)
chr3 (1-99)||(12305599-12305697)
chr3 (118-216)||(14682743-14682841)
chr3 (1-90)||(14647520-14647609)
chr3 (2-99)||(22764048-22764145)
chr3 (1-121)||(8631257-8631377)
chr3 (3-99)||(29544431-29544527)
chr3 (1-89)||(54521309-54521397)
chr3 (5-91)||(36528062-36528148)
chr3 (2-82)||(11258984-11259064)
chr3 (1-75)||(13436799-13436873)
chr3 (156-216)||(19568940-19569000)
chr3 (1-140)||(8023718-8023857)
chr3 (15-90)||(11986837-11986912)
chr3 (1-91)||(3264727-3264817)
chr3 (1-99)||(28848209-28848307)
chr3 (1-99)||(15978009-15978107)
chr3 (1-140)||(6002443-6002582)
chr3 (1-99)||(7780934-7781032)
chr3 (3-89)||(16453869-16453955)
chr3 (2-99)||(10247312-10247409)
chr3 (163-217)||(18893009-18893063)
chr3 (1-47)||(34159854-34159900)
chr3 (1-140)||(40039761-40039900)
chr3 (1-47)||(17463706-17463752)
chr3 (1-43)||(55477023-55477065)
chr3 (168-216)||(17046582-17046630)
chr3 (129-216)||(42353218-42353306)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (1-221)||(3359-3579)
scaffold0338 (1-44)||(11-54)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (1-225)||(21492-21716)
scaffold0026 (1-206)||(123977-124182)
scaffold0026 (6-216)||(146152-146362)
scaffold0026 (1-220)||(110903-111122)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (1-225)||(46198142-46198366)
chr1 (1-223)||(50000886-50001109)
chr1 (1-225)||(29764051-29764279)
chr1 (2-216)||(21239713-21239927)
chr1 (1-220)||(44822539-44822758)
chr1 (1-220)||(8276409-8276628)
chr1 (1-220)||(16401084-16401303)
chr1 (1-225)||(2332627-2332851)
chr1 (1-225)||(20031307-20031531)
chr1 (1-220)||(21180742-21180961)
chr1 (2-216)||(41227122-41227336)
chr1 (2-216)||(16058732-16058946)
chr1 (2-216)||(41225869-41226083)
chr1 (2-216)||(42912470-42912684)
chr1 (1-220)||(24815269-24815488)
chr1 (1-220)||(28312764-28312983)
chr1 (1-216)||(51323695-51323910)
chr1 (1-219)||(22130482-22130700)
chr1 (1-219)||(38057068-38057286)
chr1 (2-194)||(22350030-22350222)
chr1 (2-216)||(20588099-20588313)
chr1 (2-216)||(20592637-20592851)
chr1 (2-216)||(21046467-21046681)
chr1 (1-216)||(12710308-12710523)
chr1 (2-216)||(4596263-4596477)
chr1 (2-216)||(19676131-19676345)
chr1 (1-220)||(296771-296990)
chr1 (1-216)||(7792269-7792484)
chr1 (2-225)||(13881034-13881257)
chr1 (1-216)||(7052472-7052688)
chr1 (1-192)||(23194968-23195159)
chr1 (7-216)||(51082636-51082845)
chr1 (1-217)||(20437644-20437860)
chr1 (2-216)||(20634052-20634267)
chr1 (1-216)||(14238029-14238244)
chr1 (1-216)||(22823824-22824038)
chr1 (1-216)||(38887504-38887720)
chr1 (1-216)||(45496365-45496581)
chr1 (1-225)||(45574469-45574682)
chr1 (1-208)||(16372178-16372386)
chr1 (1-216)||(50544272-50544486)
chr1 (1-212)||(14792979-14793189)
chr1 (1-216)||(39060516-39060731)
chr1 (2-213)||(24720112-24720322)
chr1 (1-212)||(1643020-1643228)
chr1 (1-216)||(17902179-17902393)
chr1 (57-220)||(294452-294624)
chr1 (2-216)||(18121025-18121238)
chr1 (1-194)||(44891890-44892082)
chr1 (1-140)||(6833710-6833849)
chr1 (1-139)||(9784760-9784898)
chr1 (1-95)||(21659685-21659779)
chr1 (1-91)||(10812786-10812876)
chr1 (1-185)||(16655819-16656002)
chr1 (1-99)||(29535528-29535626)
chr1 (1-99)||(13227340-13227438)
chr1 (2-99)||(16362395-16362492)
chr1 (1-99)||(21841243-21841341)
chr1 (1-99)||(21922879-21922977)
chr1 (1-99)||(41372948-41373046)
chr1 (2-89)||(23593322-23593409)
chr1 (1-47)||(13989394-13989440)
[»] chr8 (95 HSPs)
chr8 (1-225)||(23478491-23478715)
chr8 (1-225)||(26454122-26454346)
chr8 (1-218)||(41680551-41680768)
chr8 (1-220)||(364204-364423)
chr8 (1-220)||(39694945-39695164)
chr8 (1-225)||(17460704-17460928)
chr8 (1-225)||(19882379-19882603)
chr8 (1-220)||(15635597-15635816)
chr8 (1-194)||(38185503-38185696)
chr8 (1-225)||(25483891-25484115)
chr8 (1-220)||(44432277-44432497)
chr8 (1-220)||(44522843-44523062)
chr8 (2-216)||(5760953-5761167)
chr8 (1-213)||(18024112-18024324)
chr8 (1-225)||(19880239-19880463)
chr8 (1-220)||(17795648-17795867)
chr8 (2-216)||(6102171-6102385)
chr8 (2-216)||(19140185-19140399)
chr8 (2-216)||(20178939-20179153)
chr8 (2-220)||(20454655-20454873)
chr8 (2-220)||(20455412-20455630)
chr8 (2-220)||(20460390-20460608)
chr8 (2-214)||(21861038-21861250)
chr8 (1-225)||(22237671-22237895)
chr8 (50-215)||(32950022-32950187)
chr8 (1-209)||(18833898-18834106)
chr8 (49-216)||(361677-361844)
chr8 (1-192)||(39363968-39364159)
chr8 (2-216)||(39936429-39936642)
chr8 (2-194)||(42266013-42266202)
chr8 (2-216)||(42818325-42818539)
chr8 (1-194)||(6573474-6573666)
chr8 (20-225)||(19808033-19808238)
chr8 (1-218)||(42559945-42560161)
chr8 (1-220)||(21579624-21579843)
chr8 (1-220)||(27941306-27941525)
chr8 (1-210)||(22207693-22207902)
chr8 (32-225)||(11775133-11775326)
chr8 (2-215)||(21326356-21326569)
chr8 (2-215)||(21321758-21321971)
chr8 (2-194)||(5082630-5082822)
chr8 (1-216)||(20084055-20084270)
chr8 (1-208)||(44476851-44477059)
chr8 (1-208)||(44480113-44480321)
chr8 (2-216)||(17437736-17437950)
chr8 (2-163)||(23660688-23660849)
chr8 (1-186)||(29763286-29763471)
chr8 (1-208)||(8728354-8728561)
chr8 (5-216)||(22483167-22483377)
chr8 (1-212)||(22258721-22258931)
chr8 (1-213)||(20517535-20517746)
chr8 (1-216)||(22344462-22344676)
chr8 (1-216)||(22356122-22356336)
chr8 (10-216)||(18816886-18817093)
chr8 (1-216)||(4381210-4381424)
chr8 (1-212)||(23670073-23670283)
chr8 (1-212)||(38988890-38989100)
chr8 (1-212)||(39019987-39020197)
chr8 (1-194)||(14397521-14397714)
chr8 (1-178)||(23914381-23914558)
chr8 (2-194)||(36732942-36733133)
chr8 (9-216)||(17978842-17979048)
chr8 (1-216)||(36305079-36305293)
chr8 (1-208)||(36405477-36405683)
chr8 (1-214)||(24907198-24907409)
chr8 (3-211)||(17501350-17501558)
chr8 (40-216)||(18815279-18815454)
chr8 (1-99)||(16198371-16198469)
chr8 (1-216)||(21513741-21513954)
chr8 (1-216)||(22474172-22474386)
chr8 (115-225)||(8414241-8414351)
chr8 (2-140)||(21399206-21399344)
chr8 (2-140)||(21793699-21793837)
chr8 (23-216)||(18118603-18118796)
chr8 (19-214)||(25757575-25757769)
chr8 (1-99)||(14397328-14397426)
chr8 (1-99)||(18677652-18677750)
chr8 (19-133)||(24624171-24624285)
chr8 (19-214)||(25295555-25295749)
chr8 (1-99)||(4541961-4542059)
chr8 (1-99)||(24485631-24485729)
chr8 (1-140)||(19331994-19332131)
chr8 (2-89)||(22002239-22002326)
chr8 (130-216)||(21345945-21346031)
chr8 (1-194)||(24238858-24239050)
chr8 (1-216)||(22313251-22313466)
chr8 (9-140)||(21495115-21495246)
chr8 (1-47)||(1484930-1484976)
chr8 (1-47)||(20045783-20045829)
chr8 (1-71)||(45290135-45290205)
chr8 (167-216)||(5080429-5080478)
chr8 (59-214)||(45559644-45559798)
chr8 (1-47)||(5852880-5852926)
chr8 (1-75)||(8414166-8414240)
chr8 (1-47)||(14409032-14409078)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (1-225)||(70245-70469)
scaffold0057 (2-113)||(71934-72045)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (1-225)||(22186-22410)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (1-220)||(19061-19280)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (1-216)||(28785-29000)
scaffold0180 (1-75)||(9996-10070)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (1-220)||(8480-8699)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-219)||(15990-16208)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (1-225)||(10631-10856)
scaffold0462 (1-212)||(744-953)
scaffold0462 (1-212)||(6250-6459)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-225)||(11108-11332)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (2-216)||(15004-15218)
scaffold0061 (2-216)||(24062-24276)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (2-220)||(77103-77321)
scaffold0001 (1-225)||(152627-152851)
scaffold0001 (1-225)||(176203-176427)
scaffold0001 (1-225)||(168850-169074)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-225)||(11924-12148)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (1-214)||(7973-8186)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (2-216)||(78484-78698)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (1-220)||(7300-7519)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (1-216)||(1505-1720)
scaffold0334 (1-151)||(1-151)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (1-220)||(13362-13581)
scaffold0220 (4-220)||(16180-16396)
scaffold0220 (1-186)||(8686-8871)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-216)||(21153-21368)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (2-216)||(5131-5345)
scaffold0737 (1-218)||(6094-6312)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (2-220)||(8473-8691)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-214)||(21677-21890)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (1-194)||(26368-26561)
scaffold0104 (1-194)||(27750-27943)
scaffold0104 (1-216)||(7639-7854)
scaffold0104 (1-216)||(14270-14485)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (2-194)||(35989-36181)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-173)||(29614-29786)
scaffold0034 (2-216)||(120330-120544)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (2-225)||(12380-12603)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (1-216)||(7553-7768)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (1-216)||(9475-9690)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (1-220)||(6215-6434)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (1-220)||(5833-6052)
scaffold0108 (1-216)||(7200-7413)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (2-216)||(7803-8017)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-194)||(159367-159560)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (1-225)||(404-628)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (1-220)||(3122-3341)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (1-220)||(9373-9592)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-220)||(51374-51593)
scaffold0042 (1-113)||(67191-67303)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-220)||(105328-105547)
scaffold0023 (1-220)||(162700-162919)
scaffold0023 (1-47)||(94939-94985)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (2-220)||(433-650)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (2-216)||(885-1099)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (2-216)||(22209-22423)
scaffold0080 (5-225)||(29143-29363)
scaffold0080 (5-225)||(34608-34828)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (1-220)||(2755-2973)
scaffold0109 (1-216)||(394-609)
scaffold0109 (1-194)||(5697-5890)
[»] scaffold0077 (5 HSPs)
scaffold0077 (1-220)||(22985-23204)
scaffold0077 (1-206)||(17674-17879)
scaffold0077 (2-181)||(33794-33973)
scaffold0077 (1-169)||(22596-22765)
scaffold0077 (75-206)||(23381-23512)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (1-212)||(67518-67729)
scaffold0032 (19-216)||(62405-62602)
scaffold0032 (1-211)||(116822-117032)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (1-179)||(23621-23799)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (2-216)||(58168-58382)
scaffold0064 (1-99)||(68438-68536)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (1-194)||(439-632)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (1-210)||(10864-11073)
scaffold0371 (77-172)||(17223-17318)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (3-216)||(39519-39732)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (1-194)||(64486-64679)
scaffold0051 (84-194)||(31392-31502)
scaffold0051 (1-99)||(31680-31778)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (4-216)||(402-614)
scaffold0083 (4-216)||(5706-5918)
scaffold0083 (4-91)||(1480-1567)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (1-216)||(10346-10562)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (1-220)||(665-884)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (2-216)||(21072-21286)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (2-220)||(138191-138409)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (2-225)||(1527-1750)
scaffold0125 (1-216)||(27720-27935)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (2-181)||(106621-106800)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (2-225)||(82398-82620)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (2-216)||(1327-1541)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (2-216)||(13083-13297)
scaffold0452 (1-211)||(8067-8277)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (2-216)||(1984-2198)
scaffold0241 (2-132)||(5413-5543)
scaffold0241 (124-216)||(5137-5229)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (2-216)||(143033-143247)
scaffold0020 (2-178)||(169415-169591)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (1-210)||(5084-5293)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (1-218)||(6443-6660)
scaffold0123 (49-216)||(16358-16524)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (2-208)||(7006-7213)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (1-216)||(585-800)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (8-210)||(1130-1332)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (2-216)||(12954-13168)
scaffold0111 (149-216)||(19368-19435)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (2-216)||(126168-126382)
scaffold0011 (1-212)||(32878-33088)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (13-194)||(12776-12957)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (24-180)||(11101-11257)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (1-165)||(4568-4732)
scaffold0153 (1-74)||(11679-11752)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (1-216)||(5743-5958)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (2-216)||(6933-7147)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (1-194)||(7417-7610)
scaffold0546 (1-90)||(10334-10423)
scaffold0546 (164-216)||(11215-11267)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (2-178)||(1112-1288)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (2-216)||(11579-11793)
scaffold0439 (1-216)||(3839-4055)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (33-194)||(8752-8913)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (32-216)||(7937-8121)
scaffold0529 (70-184)||(8152-8266)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (2-194)||(21510-21702)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (1-220)||(2144-2363)
[»] scaffold0019 (4 HSPs)
scaffold0019 (1-220)||(133581-133800)
scaffold0019 (1-220)||(133166-133385)
scaffold0019 (33-216)||(29578-29761)
scaffold0019 (1-71)||(33803-33873)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (2-216)||(625-839)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (1-216)||(1131-1346)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (1-216)||(3690-3905)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-216)||(186922-187137)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (1-216)||(30032-30247)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (85-224)||(33330-33469)
scaffold0138 (1-99)||(33648-33746)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (1-187)||(168887-169073)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (61-216)||(22478-22633)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-212)||(66449-66660)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (68-216)||(9711-9858)
scaffold0134 (1-47)||(38350-38396)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-212)||(65398-65608)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-216)||(25936-26150)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-216)||(18585-18799)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (77-194)||(19945-20062)
scaffold0293 (1-99)||(19676-19774)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (1-212)||(8244-8455)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (2-137)||(1-136)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (1-215)||(10132-10335)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (1-216)||(7272-7485)
scaffold0230 (1-99)||(14424-14522)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (1-212)||(62143-62353)
scaffold0063 (1-48)||(39326-39373)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (1-211)||(767-977)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (77-219)||(21058-21200)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-216)||(34685-34895)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (1-212)||(110-320)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-212)||(18071-18281)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (1-212)||(56401-56611)
[»] scaffold0825 (2 HSPs)
scaffold0825 (7-123)||(1057-1173)
scaffold0825 (141-220)||(1372-1451)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-216)||(18543-18758)
[»] scaffold0117 (4 HSPs)
scaffold0117 (1-112)||(21285-21396)
scaffold0117 (84-194)||(39521-39631)
scaffold0117 (53-99)||(39809-39855)
scaffold0117 (1-58)||(42271-42328)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (1-211)||(7931-8141)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (1-186)||(11635-11820)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (84-194)||(17842-17952)
scaffold0200 (1-99)||(18130-18228)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (1-140)||(8037-8176)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (1-124)||(2470-2593)
scaffold0256 (122-216)||(3059-3153)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (2-211)||(11625-11833)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (1-105)||(767-871)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (1-212)||(11764-11974)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (8-121)||(2403-2516)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (2-211)||(2198-2406)
scaffold0409 (2-186)||(10453-10637)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-186)||(13189-13378)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (1-118)||(7794-7911)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-100)||(24480-24579)
scaffold0162 (167-212)||(24586-24631)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (1-99)||(8495-8593)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-99)||(3500-3598)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (1-186)||(32694-32878)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (4-216)||(35937-36148)
[»] scaffold0369 (2 HSPs)
scaffold0369 (1-89)||(16405-16493)
scaffold0369 (142-216)||(16528-16602)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (23-210)||(880-1066)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (1-78)||(100-177)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-99)||(53-152)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-99)||(21225-21323)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (127-208)||(2377-2458)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-99)||(11766-11864)
[»] scaffold0956 (1 HSPs)
scaffold0956 (2-64)||(2341-2403)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-99)||(6423-6521)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (2-64)||(174566-174628)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (9-162)||(20499-20652)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-99)||(9718-9816)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (1-75)||(9601-9675)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (154-214)||(2362-2422)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (73-140)||(40902-40969)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (20-103)||(6892-6975)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (9-140)||(17160-17291)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (56-99)||(134687-134730)
scaffold0028 (56-99)||(137156-137199)
scaffold0028 (56-99)||(139625-139668)
scaffold0028 (56-99)||(142094-142137)
scaffold0028 (56-99)||(144563-144606)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-59)||(13909-13967)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-59)||(40916-40974)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (164-216)||(1-53)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (9-77)||(35055-35123)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 132)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 32160621 - 32160843
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160621 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 32160720  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  32160721 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 32160820  T
Q  203 aacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32160821 aacctatgttgtgagttggtcct 32160843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 708972 - 709196
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  708972 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 709071  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  709072 attcagcttaactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtat 709171  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  709172 ttaacctatgttgtgagttggtcct 709196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16462671 - 16462447
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16462671 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 16462572  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||    
T  16462571 attcagcatagctgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgattaacagtat 16462472  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16462471 ttaacctatgttgtgagttggtcct 16462447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 58835 - 59054
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58835 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 58934  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  58935 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtat 59034  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  59035 ttaacctatgttgtgagttg 59054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16550421 - 16550645
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16550421 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 16550520  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||    
T  16550521 attgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtat 16550620  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  16550621 ttaacctatgttgtgagttgttcct 16550645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16615241 - 16615017
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16615241 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 16615142  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||    
T  16615141 attgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtat 16615042  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  16615041 ttaacctatgttgtgagttgttcct 16615017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18456065 - 18456289
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18456065 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 18456164  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  18456165 attcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 18456264  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18456265 ttaacccatgttgtgagttgatcct 18456289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 47094714 - 47094496
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47094714 gttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 47094615  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  47094614 ttcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagtagtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatt 47094515  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47094514 taacctatgttgtgagttg 47094496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 47975328 - 47975552
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47975328 tgttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatgtttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 47975427  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  47975428 attcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 47975527  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  47975528 ttaacctatgttgtgagttcgtcct 47975552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 8756813 - 8757032
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8756813 tgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 8756912  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  8756913 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 8757012  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  8757013 ttaacccatgttgtgagttg 8757032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13647876 - 13647653
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13647876 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 13647777  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  13647776 ttcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatt 13647677  T
Q  202 taacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||    
T  13647676 taacccatgttgtgagttgatcct 13647653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 36685667 - 36685884
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36685667 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 36685766  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatga-tat 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||    
T  36685767 ttcagcgtaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgttttaagagtat 36685866  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    |||||| |||||||||||    
T  36685867 ttaacccatgttgtgagt 36685884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 14415901 - 14416113
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14415901 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtgtttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 14416000  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  14416001 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 14416100  T
Q  201 ttaacctatgttg 213  Q
    |||||||||||||    
T  14416101 ttaacctatgttg 14416113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48812473 - 48812249
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48812473 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactgcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 48812374  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||   |||    
T  48812373 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 48812274  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48812273 ttaacctatgttgtgagttggtcct 48812249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 40555160 - 40555379
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40555160 tgttaactttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttgatttttgagatatgatgtaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaa 40555259  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  40555260 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtat 40555359  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  40555360 ttaacccatattgtgagttg 40555379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4325690 - 4325472
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4325690 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttaatgaaatcttatgaaaa 4325591  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  4325590 ttcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgcgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 4325491  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||| | |||||||||||||    
T  4325490 taatccatgttgtgagttg 4325472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15214134 - 15213941
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15214134 tgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 15214035  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15214034 attcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaa 15213941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13408407 - 13408188
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13408407 tgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaattctccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 13408308  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||    
T  13408307 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttttttaagagtat 13408208  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  13408207 ttaacccatgttgtgagttg 13408188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 13745193 - 13745408
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13745193 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 13745292  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||    
T  13745293 attcagcataaccgtttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttcagagtat 13745392  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  13745393 ttaacctatgttgtga 13745408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 17070710 - 17070929
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17070710 tgttagctttccaatgactttgttttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttattgaaatcttatgaaa 17070809  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  17070810 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaattctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 17070909  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  17070910 ttaacctatgttgtaagttg 17070929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 12465678 - 12465892
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12465678 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 12465777  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||    
T  12465778 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgacttcaattaggatgtttaagagtatt 12465877  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| ||||||||||    
T  12465878 taacttatgttgtga 12465892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 46386505 - 46386719
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46386505 gttagctttccagtggctttggtttgaagtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 46386604  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  46386605 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactatggtgtttaagagtatt 46386704  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  46386705 taacctatgttgtga 46386719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 14191505 - 14191727
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14191505 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaa 14191602  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  14191603 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtat 14191702  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14191703 ttaacctatgttgtgagttggtcct 14191727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 30820673 - 30820890
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30820673 tgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaataatttttggtttttaagatatgataaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaa 30820772  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  30820773 attcagcataaccgtttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 30820872  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    |||||| |||||||||||    
T  30820873 ttaacccatgttgtgagt 30820890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 12755123 - 12755342
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12755123 tgttagatttccaatggctttggtttgactagaaaatgagttttagattttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaatcttatgaaa 12755222  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  12755223 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 12755322  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  12755323 ttgacccatgttgtgagttg 12755342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 13699306 - 13699525
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13699306 tgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttaggaaa 13699405  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  13699406 attcagtataaccatttctaagttaatctgaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtat 13699505  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  13699506 ttaacccatgttgtgagttg 13699525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33001549 - 33001334
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33001549 tgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 33001450  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  33001449 attcagtatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagaat 33001350  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  33001349 ttaacctatgttgtga 33001334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 14188711 - 14188933
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14188711 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtctttgtgaaatattatgaaa 14188808  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  14188809 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtat 14188908  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14188909 ttaacctatgttgtgagttggtcct 14188933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 29052572 - 29052732
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29052572 tgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 29052671  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29052672 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 29052732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 832440 - 832659
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  832440 tgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 832539  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||    
T  832540 attcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagtat 832639  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  832640 ttaacccatgttgtgagttg 832659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 1197620 - 1197839
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1197620 tgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 1197719  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||    
T  1197720 attcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagtat 1197819  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  1197820 ttaacccatgttgtgagttg 1197839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12371909 - 12371695
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12371909 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgcgatatggtaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 12371810  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   ||||    
T  12371809 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatt 12371710  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  12371709 taacctatgttgtga 12371695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44374580 - 44374366
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44374580 gttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 44374481  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  44374480 ttcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatt 44374381  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  44374380 taacctatgttgtga 44374366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44383445 - 44383231
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383445 gttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 44383346  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  44383345 ttcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatt 44383246  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  44383245 taacctatgttgtga 44383231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 32771963 - 32771770
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  32771963 tgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaataatccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 32771864  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32771863 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaa 32771770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34957806 - 34957582
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34957806 tgttagctttcaaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagatatgattaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 34957707  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  34957706 attcagcataaccatttctaaggtaatccaaaacttatgggataattccaaggatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 34957607  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  34957606 ttaacccatgttatgagttgatcct 34957582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48743938 - 48743746
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||    
T  48743938 tgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagaacttagtgaaatcttataaaa 48743839  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttta 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48743838 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagatgtactatgagttcaattaaggtgttta 48743746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 37727344 - 37727563
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37727344 tgttagctttccagtggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 37727443  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | |    
T  37727444 atttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccatcaaaactagaagtactatgagttcaatcaaggtgtttaagagttt 37727543  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37727544 ttaacctatgttgtgagttg 37727563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 8851577 - 8851791
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8851577 gttaggtttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttctggagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 8851676  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  8851677 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagattatt 8851776  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||| ||||    
T  8851777 taacctatgtggtga 8851791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11067102 - 11066888
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11067102 gttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 11067003  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||   ||||    
T  11067002 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaactagggtgtttaagagtatt 11066903  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| ||||||||||    
T  11066902 taacttatgttgtga 11066888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38828696 - 38828472
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  38828696 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 38828597  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  38828596 attcagcacaactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 38828497  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||    
T  38828496 ttaacccacgttgtgagttgatcct 38828472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11661740 - 11661521
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11661740 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttattttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 11661641  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||    
T  11661640 attcaacacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaatgtgtttaagagtat 11661541  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  11661540 ttaacccatgttgtgagttg 11661521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 17505421 - 17505638
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17505421 tgttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaa 17505520  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||    
T  17505521 attcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtat 17505620  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  17505621 ttaacccatgttatgagt 17505638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17547793 - 17547576
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17547793 tgttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaa 17547694  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||    
T  17547693 attcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtat 17547594  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  17547593 ttaacccatgttatgagt 17547576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19282727 - 19282514
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19282727 tgttagctttttagtggctttgagttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 19282628  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  19282627 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 19282528  T
Q  201 ttaacctatgttgt 214  Q
    ||||||||||||||    
T  19282527 ttaacctatgttgt 19282514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29004457 - 29004233
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29004457 tgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaagggaggtcctagtgaaatcttatgaaa 29004358  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  29004357 atttagcataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 29004258  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  29004257 ttaacccatgttgtgagttgatcct 29004233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15167610 - 15167403
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15167610 tgttagctttctaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 15167511  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  15167510 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 15167411  T
Q  201 ttaaccta 208  Q
    ||||||||    
T  15167410 ttaaccta 15167403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 13147890 - 13148104
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13147890 gttagctttccattggatttggtttgacgtgaaaatcattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 13147989  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||   ||||    
T  13147990 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactacaagtattatgagatcaactagggtgtttaagagtatt 13148089  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  13148090 taacctatgttgtga 13148104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14422420 - 14422204
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14422420 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaa 14422321  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    ||    
T  14422320 attcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagcat 14422221  T
Q  201 ttaacctatgttgtgag 217  Q
    |||||| ||||||||||    
T  14422220 ttaacccatgttgtgag 14422204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18607918 - 18607703
Alignment:
Q  5 agctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18607918 agctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttaaggaaatcttatgaaaattc 18607819  T
Q  105 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaa 204  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  18607818 agcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 18607719  T
Q  205 cctatgttgtgagttg 220  Q
    || |||||||||||||    
T  18607718 cccatgttgtgagttg 18607703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16999066 - 16998837
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16999066 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagagatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaa 16998967  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagt------actatgagttcaattaaggtgtttaat 195  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||      || |||||||||||||||||||||||     
T  16998966 ttcagtataaccttttctatgttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatcaccatgagttcaattaaggtgtttaag 16998867  T
Q  196 gatatttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16998866 agtatttaacccatgttgtgagttgatcct 16998837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 32434014 - 32434217
Alignment:
Q  9 ttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 108  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32434014 ttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 32434113  T
Q  109 taaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaaccta 208  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||| |||    
T  32434114 taaccgtttctaaattaatccaaaacttaatgaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaatcta 32434213  T
Q  209 tgtt 212  Q
    ||||    
T  32434214 tgtt 32434217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 10896411 - 10896618
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10896411 tgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaa 10896510  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||    
T  10896511 attcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaagctgtttaagagtat 10896610  T
Q  201 ttaaccta 208  Q
    ||||||||    
T  10896611 ttaaccta 10896618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Original strand, 12323348 - 12323527
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12323348 gttagctttccgggggctttggtttgacgtgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatacttgaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 12323447  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12323448 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaa 12323527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18872795 - 18872576
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  18872795 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 18872696  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  18872695 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 18872596  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  18872595 ttaacccatgttgtgagttg 18872576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14258986 - 14258772
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14258986 gttagctttccagtggctttgctttgacatgaaaatgaactttggttcttgagatatgatgaaaggactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 14258887  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  14258886 ttcagcataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 14258787  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| | ||||||||    
T  14258786 taacatttgttgtga 14258772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20585986 - 20585776
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  20585986 gttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgaggtatgatgaaaatactccaaggaggt----gtgaaatcttatgaaaa 20585891  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  20585890 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 20585791  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| ||||||||||    
T  20585790 taacttatgttgtga 20585776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16009010 - 16008794
Alignment:
Q  4 tagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16009010 tagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaatt 16008911  T
Q  104 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattta 203  Q
    ||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  16008910 cagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattta 16008811  T
Q  204 acctatgttgtgagttg 220  Q
    ||| |||||||||||||    
T  16008810 acccatgttgtgagttg 16008794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32301816 - 32301602
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  32301816 gttagttttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaattttatgaaaa 32301717  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  32301716 tacagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 32301617  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| | ||||||||    
T  32301616 taacatgtgttgtga 32301602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 13864812 - 13864997
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13864812 tgttagctttccaatggatttgggttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgaggaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaa 13864911  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 186  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13864912 attcagtacaaccttttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaagtagaagtactatgagttcaattaag 13864997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 13745672 - 13745832
Alignment:
Q  56 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 155  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13745672 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacct 13745771  T
Q  156 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  13745772 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13745832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 148053 - 147838
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  148053 tgttagctttacaatggctttggtttgactctaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 147954  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  147953 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 147854  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||| |||||||||    
T  147853 ttaacccatgttgtga 147838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 12127593 - 12127796
Alignment:
Q  14 gtggctttggtttgactagaaaatgattttt-ggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 112  Q
    |||||||  |||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12127593 gtggcttctgtttgacgtgaaaatgattttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcagggaggtattagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 12127692  T
Q  113 catttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgtt 212  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||    
T  12127693 cgtttctaagttaatccaaaagttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 12127792  T
Q  213 gtga 216  Q
    ||||    
T  12127793 gtga 12127796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14566637 - 14566418
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  14566637 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 14566538  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||   |||    
T  14566537 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtat 14566438  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  14566437 ttaacccatgttgtgagttg 14566418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 14928749 - 14928964
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  14928749 tgttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaa 14928848  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||   |||    
T  14928849 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaaaagtat 14928948  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
     |||||||||||||||    
T  14928949 ctaacctatgttgtga 14928964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 15352215 - 15352430
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  15352215 tgttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaa 15352314  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||   |||    
T  15352315 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaatgtgtttaaaagtat 15352414  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
     |||||||||||||||    
T  15352415 ctaacctatgttgtga 15352430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14153389 - 14153599
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14153389 tgttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaataatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 14153488  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  14153489 attcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 14153587  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  14153588 ttaacctatgtt 14153599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16580295 - 16580080
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||| |||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16580295 tgttagcttttcagtggcgttagtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaa 16580196  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||    
T  16580195 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtat 16580096  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| | ||||||||    
T  16580095 ttaacatgtgttgtga 16580080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13894652 - 13894515
Alignment:
Q  79 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13894652 gtcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 13894553  T
Q  179 caattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  13894552 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13894515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 216
Target Start/End: Original strand, 16460407 - 16460564
Alignment:
Q  59 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaa 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16460407 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaa 16460506  T
Q  159 aactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||    
T  16460507 aactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatattatttaacatgtgttgtga 16460564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 15119761 - 15119921
Alignment:
Q  50 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15119761 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 15119860  T
Q  150 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  15119861 aaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 15119921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 39292154 - 39292368
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39292154 tgttagctttccattgactttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 39292253  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||| ||| | ||  ||||||||||||  |  |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  39292254 attccgcataactatttttaaatcaactcaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 39292352  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  39292353 ttaacctatgttgtga 39292368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 18875264 - 18875478
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18875264 gttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaa 18875363  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  |   |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  18875364 ttccgcataactatttctaggtcaatccaaaacttgtggattgtctccaaacctcaaaactagaagtaacaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 18875463  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  18875464 taacctatgttgtga 18875478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20619920 - 20619714
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||    
T  20619920 gttagctttccagtagcttcggtgtgacgtgaaaaagatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaataaaattttatgaaaa 20619821  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||   ||||    
T  20619820 ttcagcataaccgtttctaagttaatccataacttatggaataattccaaaactcaaaattagaagtattaggattttaattaaggggtttaagagtatt 20619721  T
Q  202 taaccta 208  Q
    |||||||    
T  20619720 taaccta 20619714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 16585390 - 16585583
Alignment:
Q  23 gtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaag 122  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16585390 gtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 16585489  T
Q  123 ttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||||||| | ||||||||    
T  16585490 ttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 16585583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21538606 - 21538820
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21538606 tgttagttttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 21538705  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  |  |||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  21538706 attccgcataatcatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtat 21538804  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  21538805 ttaacctatgttgtga 21538820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25942072 - 25941858
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25942072 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 25941973  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| |||| |  ||||||| || || ||||| |||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  25941972 attctgcatgataatttctaggtcaacccaaatcttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 25941874  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  25941873 ttaacctatgttgtga 25941858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 48213362 - 48213576
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48213362 tgttagatttccattcgctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 48213461  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| || | |||||||||||  |   ||||||| ||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  48213462 attccgcataactatttttaagtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatat 48213560  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  48213561 ttaacctatgttgtga 48213576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15720384 - 15720250
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15720384 tgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaggtatgataaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaa 15720285  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaact 135  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15720284 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 13918260 - 13918377
Alignment:
Q  77 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13918260 aggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgag 13918359  T
Q  177 ttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13918360 ttcaattaaggtgtttaa 13918377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 43277160 - 43277376
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttat-gaa 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||    
T  43277160 tgttagctttcaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatcaaa 43277259  T
Q  100 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || ||  ||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||    
T  43277260 aattccgcataactatttctaggtcaactcaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagta 43277359  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||| ||||||||||    
T  43277360 tttaacatatgttgtga 43277376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 194
Target Start/End: Original strand, 25926993 - 25927103
Alignment:
Q  84 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25926993 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 25927092  T
Q  184 aaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||    
T  25927093 aaggtgtttaa 25927103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14273892 - 14273759
Alignment:
Q  92 cttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14273892 cttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtt 14273793  T
Q  192 taatgatatttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14273792 taagagtatttaacccatgttgtgagttgatcct 14273759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14161272 - 14161482
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14161272 tgttagatttccattggctttggtttgacttgaaaatcatttttggtttttgaggtttgataaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaa 14161371  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  14161372 attctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattat 14161470  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  14161471 ttaacctatgtt 14161482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 15576248 - 15576462
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  15576248 tgttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggtttttgagttatcataaaaatgctccaagaaggttttagtgaaattttatgaaa 15576347  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |   ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15576348 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tctactatgagttcaattaaggtgtttaagggtat 15576446  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  15576447 ttaacttatgttgtga 15576462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 24270399 - 24270613
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24270399 tgttagctttcaaatggaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaa 24270498  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| || | |||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||| | ||||||||||||||||||||||   |||    
T  24270499 attccgcataactatttttaagtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattgtgagttcaattaaggtgtttaagagtat 24270597  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  24270598 ttaacctatgttgtga 24270613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3287625 - 3287417
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3287625 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaa 3287526  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||||       ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||  ||||    
T  3287525 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaac-------ctagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagaatat 3287433  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  3287432 ttaacgtatgttgtga 3287417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 20252761 - 20252973
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  20252761 ttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtaaaattttacgaaaat 20252860  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||  |   ||||||| ||||| ||    |||||||||||||||||||| |||||||   |||||    
T  20252861 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtattt 20252959  T
Q  203 aacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||    
T  20252960 aacctatgttgtga 20252973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 4691313 - 4691527
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4691313 tgttagatttccagtggagtcggtttgacttgaaaataatttttggtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 4691412  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| |||||  | |  |||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  4691413 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtat 4691511  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||| |||||||||    
T  4691512 ttaaccaatgttgtga 4691527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 3192710 - 3192920
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3192710 tgttagttttgcagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 3192809  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||  ||||||| |||||||||| || ||||||||||||   |  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||   |||    
T  3192810 attgtgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgatttgtttctaaacttcaaaactagaagtattatgagtttaattaagaggtttaagagtat 3192909  T
Q  201 ttaacctatgt 211  Q
    |||||||||||    
T  3192910 ttaacctatgt 3192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18080135 - 18080348
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18080135 tgttagctttacagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgacttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatttaatgaaa 18080234  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |  |||||||| |  ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||| | | |||    
T  18080235 attccgcataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttagaaacttg-tgtactatgaattcgattaaggtgtttcagggtat 18080333  T
Q  201 ttaacctatgttgtg 215  Q
    ||||  |||||||||    
T  18080334 ttaagttatgttgtg 18080348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Original strand, 9743500 - 9743706
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9743500 ttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgattttgtctttttaagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 9743599  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    || ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    
T  9743600 tcggcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggcgtttaagcgtattt 9743698  T
Q  203 aacctatg 210  Q
    ||||||||    
T  9743699 aacctatg 9743706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 46580341 - 46580551
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  46580341 tgttagttttccaatgactttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagttcttactgaaattttatgaaa 46580440  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggg-ataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||             ||||  |  ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||    
T  46580441 attcagcata-------------taat--attactgatgggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagta 46580525  T
Q  200 tttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  46580526 tttaacctatgttatgagttgatcct 46580551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 15978473 - 15978644
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  || |||  ||||||||    
T  15978473 tgttagctttccactgactttggcttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtctcggtaaaactttatgaaa 15978572  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacta 172  Q
    |||  ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15978573 atttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtacta 15978644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 1856817 - 1856915
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1856817 tgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 13917990 - 13918088
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13917990 tgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgattattggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 13918088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 8514163 - 8514373
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8514163 tgttagatttcgagttgctttggtttgacttgaaaaagaattttgggttttgaattatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttgtgaaa 8514262  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |  |||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  8514263 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttaaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 8514361  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||| ||||||    
T  8514362 ttaacatatgtt 8514373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 25926717 - 25926815
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25926717 tgttagctttctagtggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 25926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 23664540 - 23664638
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23664540 tgttagctttctaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23664638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 11309944 - 11309869
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaagg 76  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11309944 tgttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaataccccaagg 11309869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 146
Target Start/End: Original strand, 1857092 - 1857154
Alignment:
Q  84 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857092 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11303822 - 11303724
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11303822 tgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaattgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 11303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28720003 - 28719885
Alignment:
Q  93 ttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  28720003 ttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagtactaggagtttaattaagaggttt 28719904  T
Q  193 aatgatatttaacctatgt 211  Q
    ||   ||||||||||||||    
T  28719903 aaaagtatttaacctatgt 28719885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29801004 - 29800906
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  29801004 tgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29797185 - 29797087
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  29797185 tgttagctttccaatggctctaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29797087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20487964 - 20487863
Alignment:
Q  115 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||   |||||||| | ||||||    
T  20487964 tttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactaggagtactaggtgtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgt 20487865  T
Q  215 ga 216  Q
    ||    
T  20487864 ga 20487863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 13897881 - 13897805
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaagga 77  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13897881 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattattagtttttgagatatgatgaaaatactccaagga 13897805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 16108294 - 16108374
Alignment:
Q  19 tttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16108294 tttggtttggcttgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16108374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 46473693 - 46473562
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||    || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||    
T  46473693 tgttagctttccaatagttttggtttgactagaaaatgaattttacatttggaggtatgatgaaaatactccaagcgggtcttagtaaaactttatgaaa 46473594  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaa 132  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  46473593 attcagcataattattcctaagttaaaccaaa 46473562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 8564063 - 8564220
Alignment:
Q  56 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 155  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||  |  ||||||||      
T  8564063 tatgatgaaaatactccaagtgggtcttggtaaaactttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaacccaaagctaatggtttgtttccaaactc 8564162  T
Q  156 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgt 214  Q
    ||||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  8564163 caaaaattg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 8564220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24702803 - 24702705
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24702803 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24702705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24705250 - 24705152
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24705250 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24705152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32126065 - 32125967
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32126065 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 32125967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41523492 - 41523394
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41523492 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41525954 - 41525856
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41525954 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41525856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 44190667 - 44190729
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaa 64  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44190667 gttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 44190729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18431286 - 18431188
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |  | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18431286 tgttatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttaggtgttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 18431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3136869 - 3136737
Alignment:
Q  61 tgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||  |||| |||| || |||||||||||||  |  |||||||| ||||||    
T  3136869 tgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttaagaaaattaagcataactgtttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacatcaaaa 3136770  T
Q  161 ctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    || | ||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  3136769 cttg-agtactaagagtttaattaggatgtttaa 3136737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12191960 - 12191802
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||| ||  ||| |||||||| ||||||| |   ||| ||| ||||    
T  12191960 tgttaactttccattggctttggtttgacttgaaaatattttgtggattttgagttatcatataaacactccaagtaggtcttggaagaattttacgaaa 12191861  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaa 159  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  | |||||| ||| ||  |||||||| |||||    
T  12191860 attcagcataaccacttctaaattaactcgaaacttttggtatgtttccaaacttcaaa 12191802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 14948742 - 14948808
Alignment:
Q  33 aaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14948742 aaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37539043 - 37538905
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||| |||  |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||| | ||    
T  37539043 tgttagctttccaatgtctttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttattatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaa 37538944  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatg 139  Q
    | |  ||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||    
T  37538943 acttggcataactatttccaagtcaacacaaaacttatg 37538905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16066067 - 16065966
Alignment:
Q  16 ggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccat 115  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |  |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||| ||    
T  16066067 ggctttggtttgactttaaaataatttttagattttgtgttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggtgcaattttacaaaaattcagcataactat 16065968  T
Q  116 tt 117  Q
    ||    
T  16065967 tt 16065966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 216
Target Start/End: Original strand, 21675491 - 21675540
Alignment:
Q  167 gtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21675491 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21675540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15720256 - 15720196
Alignment:
Q  156 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  15720256 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 15720196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 15376301 - 15376347
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15376301 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 15376347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 20384711 - 20384757
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20384711 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 20384757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 194
Target Start/End: Original strand, 1858644 - 1858683
Alignment:
Q  155 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1858644 tcaaaactagaagttctacgagttcaattaaggtgtttaa 1858683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 14105884 - 14105927
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgattttt 44  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14105884 tgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgattttt 14105927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 39431645 - 39431707
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaa 64  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39431645 tgttaacttttcagtgactttggcttgacttggaaatgatttttggt-tttgagatatgatgaa 39431707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 16233095 - 16233049
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||    
T  16233095 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggt 16233049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 21660652 - 21660570
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 83  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  21660652 tgttatctttccaatggcgttggtttgacatgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtctt 21660570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 27217435 - 27217389
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27217435 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 27217389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 87)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25183822 - 25183601
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25183822 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 25183723  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  25183722 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 25183623  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25183622 ttaacctatgttgtgagttggt 25183601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18358386 - 18358610
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18358386 tgttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgttttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 18358485  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  18358486 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 18358585  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||    
T  18358586 ttaacctatgttatgagttgatcct 18358610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 21081388 - 21081612
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21081388 tgttagctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 21081487  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  21081488 atttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtat 21081587  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21081588 ttaacctatgttgtgagttggtcct 21081612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 24273676 - 24273891
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24273676 tgttagctttccaatgactttggtttgacctgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 24273775  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  24273776 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtat 24273875  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  24273876 ttaacctatgttgtga 24273891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26903793 - 26903571
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26903793 tgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 26903694  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  26903693 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtat 26903594  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtc 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  26903593 ttaacctatattgtgagttggtc 26903571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27472888 - 27472664
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27472888 tgttagctttccagtgaaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 27472789  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  27472788 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 27472689  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  27472688 ttaacttatgttatgagttgatcct 27472664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24884020 - 24883802
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24884020 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 24883921  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  24883920 ttcagtataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 24883821  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  24883820 taacccatgtagtgagttg 24883802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 41301390 - 41301614
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41301390 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaagtgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 41301489  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  41301490 attcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 41301589  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  41301590 ttaacccatgttgtgagttgatcct 41301614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 10039551 - 10039770
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10039551 tgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 10039650  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  10039651 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 10039750  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | ||| |||||||||    
T  10039751 ttaatccatgatgtgagttg 10039770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 43707702 - 43707916
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43707702 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 43707801  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||    
T  43707802 attcagcataacc-gttctaagttaatctaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagattat 43707900  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  43707901 ttaacctatgttgtga 43707916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9975563 - 9975349
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9975563 gttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 9975464  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  9975463 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 9975364  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  9975363 taacctatgttgtga 9975349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 24781258 - 24781472
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24781258 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaa 24781357  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||    
T  24781358 ttcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagaatatt 24781457  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  24781458 taacctatgttgtga 24781472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31520752 - 31520534
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31520752 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaatcttatgaaa 31520653  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  31520652 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactgaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 31520553  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagtt 219  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  31520552 ttaactcatgttgtgagtt 31520534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 23338820 - 23339036
Alignment:
Q  4 tagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23338820 tagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 23338919  T
Q  104 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattta 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||    
T  23338920 cagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtattta 23339019  T
Q  204 acctatgttgtgagttg 220  Q
    | | |||||||||||||    
T  23339020 atccatgttgtgagttg 23339036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 5031548 - 5031762
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5031548 gttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 5031647  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||   ||||    
T  5031648 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactaggctgtttaagagtatt 5031747  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| ||||||||||    
T  5031748 taacatatgttgtga 5031762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36839805 - 36839591
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36839805 gttagttttccagtggatttggttttacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 36839706  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  36839705 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 36839606  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  36839605 taacctatgttgtga 36839591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 18388715 - 18388907
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18388715 gttagctttccagtgactttggtttgacttaaaaatgatttatggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctttggaaaa 18388814  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388815 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 18388907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21915257 - 21915033
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||| | ||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21915257 tgttagatttccaatggctttggtttggcgtgaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 21915158  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  21915157 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 21915058  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21915057 ttaacctatgttgtgagttggtcct 21915033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 22173445 - 22173669
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22173445 tgttagctttccaatgggtttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 22173544  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  22173545 atttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaccctcaaaactcaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 22173644  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  22173645 ttaacccatgttgtgagttgatcct 22173669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 34858802 - 34859026
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  34858802 tgttagctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaa 34858901  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  34858902 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtat 34859001  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||    
T  34859002 ttaacctatgttatgagttgatcct 34859026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 34873864 - 34874088
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  34873864 tgttagctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaa 34873963  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  34873964 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtat 34874063  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||    
T  34874064 ttaacctatgttatgagttgatcct 34874088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17307121 - 17306907
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17307121 gttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17307022  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgat-at 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  17307021 ttcagcataaccgtttcttagttaatccaaaacttaaggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaa-gatcat 17306923  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17306922 ttaacatatgttgtga 17306907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23969040 - 23969255
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23969040 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatacgatgaaaataattaatggaggtcttagtgaaattttatgaaa 23969139  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||    
T  23969140 attcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 23969239  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  23969240 ttaacctatgttgtga 23969255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 27484888 - 27485098
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27484888 gttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaagtaggtcttagtggaattttatgaaaa 27484987  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  27484988 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 27485087  T
Q  202 taacctatgtt 212  Q
    |||| ||||||    
T  27485088 taacatatgtt 27485098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20915740 - 20915531
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  20915740 tgttagttttccaattgctttggtttgacttgaaaatgattcttattttttgagatatgatgaaaatactccaatgatatcttagtgaaatcttatgaaa 20915641  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  20915640 attcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagctgtttaagagtat 20915541  T
Q  201 ttaacctatg 210  Q
    ||||||||||    
T  20915540 ttaacctatg 20915531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24515820 - 24515606
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515820 gttagctttccagtgtctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttctttagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 24515721  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  24515720 ttcagtataatcgtttctacgttaatccaaaacttaaggaataaattcaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 24515621  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    ||| |||||||||||    
T  24515620 taatctatgttgtga 24515606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20590739 - 20590956
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20590739 tgttatctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaa 20590838  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||    
T  20590839 attcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttaagggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtat 20590938  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  20590939 ttaacccatgttatgagt 20590956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Original strand, 23068874 - 23069082
Alignment:
Q  8 tttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 107  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23068874 tttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 23068973  T
Q  108 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacct 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||||||| |    
T  23068974 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactataagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatttaacat 23069073  T
Q  208 atgttgtga 216  Q
     ||||||||    
T  23069074 gtgttgtga 23069082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21073144 - 21073363
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21073144 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaa 21073243  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |   |||    
T  21073244 attcagcacaaccatttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaatactcaaaactagaagcaatatgagttcaattaaggtatttcagagtat 21073343  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  21073344 ttaacccatgttgtgagttg 21073363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 19201618 - 19201833
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaa-tactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19201618 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatatgtggttcttgagatatgatgaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 19201717  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||    
T  19201718 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatttaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 19201817  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  19201818 ttaacctatgtggtga 19201833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 28652920 - 28653134
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28652920 gttagattttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatggaaa 28653019  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  28653020 ttcagcataaccgtttttaggttaatccgaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 28653119  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| ||| ||||||    
T  28653120 taacatatcttgtga 28653134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9242395 - 9242176
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  9242395 tgttagcttcccaatggctttggtttgactttaaagtgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagatcttagggaaatcttatgaaa 9242296  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||   |||    
T  9242295 attcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaactaaggtgtttaagagtat 9242196  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  9242195 ttaacccatgttgtgagttg 9242176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19662072 - 19662291
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  19662072 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 19662171  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  19662172 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 19662271  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  19662272 ttaacccatgttgtgagttg 19662291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21368742 - 21368532
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21368742 tgttagctttccggtggatttggtttggcttgaaaatgagttttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 21368643  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||   |||    
T  21368642 attcaacataaccgtttctaagttaatccaaaaattatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaaataagaggtttaagagtat 21368543  T
Q  201 ttaacctatgt 211  Q
    |||||||||||    
T  21368542 ttaacctatgt 21368532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6483154 - 6482946
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |   || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6483154 tgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 6483055  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  6483054 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagta 6482955  T
Q  200 tttaaccta 208  Q
    |||||||||    
T  6482954 tttaaccta 6482946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6486621 - 6486413
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |   || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6486621 tgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 6486522  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  6486521 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagta 6486422  T
Q  200 tttaaccta 208  Q
    |||||||||    
T  6486421 tttaaccta 6486413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28349552 - 28349328
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28349552 tgttagctttgcaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttcgtgaaatcttatgaaa 28349453  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggat---------aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 191  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28349452 attcagctcaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 28349353  T
Q  192 taatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||   ||||||| | |||||||||    
T  28349352 taagagtatttaatccatgttgtga 28349328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9785217 - 9785002
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9785217 tgttagctttcaagtggcgttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 9785118  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||   |||    
T  9785117 attcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaaggggtttaacagtat 9785018  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| | ||||||||    
T  9785017 ttaacatgtgttgtga 9785002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 6260795 - 6261014
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  6260795 tgttaactttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 6260894  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||   |||    
T  6260895 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaaatattacgagtgaaattaaggtgtttaagagtat 6260994  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  6260995 ttaacccatgttgtgagttg 6261014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 25587104 - 25587318
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25587104 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 25587203  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||  |||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||  | ||    
T  25587204 attccacataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaagatgtttaagaaaat 25587302  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  25587303 ttaacctatgttgtga 25587318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22690315 - 22690105
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22690315 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22690216  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| |||||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  22690215 attccacataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtat 22690117  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  22690116 ttaacctatgtt 22690105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22694911 - 22694701
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22694911 tgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22694812  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||  |||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| |||||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  22694811 attccacataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtat 22694713  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  22694712 ttaacctatgtt 22694701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 21335870 - 21336081
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21335870 tgttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaagttttatgaaa 21335969  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||  |||||  |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  21335970 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaagctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtat 21336068  T
Q  201 ttaacctatgttg 213  Q
    |||||||||||||    
T  21336069 ttaacctatgttg 21336081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29113979 - 29113782
Alignment:
Q  18 ctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||     
T  29113979 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattc 29113880  T
Q  118 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||| || |||||||||||||  |  |||||||| |||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  29113879 ctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 29113782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 2524165 - 2524365
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||                |||||||||    
T  2524165 gttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagg----------------ttatgaaaa 2524248  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaa-gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||   |||    
T  2524249 ttcagcataacc---tctaaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaatcaaggtatttaagagtat 2524345  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2524346 ttaacctatgttgtgagttg 2524365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21316079 - 21316293
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||  |||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21316079 tgttagctttccagtgtccttcgtttgacgtgaaaataatatttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 21316178  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  21316179 attccgcttaactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 21316277  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  21316278 ttaacctatgttgtga 21316293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31345495 - 31345385
Alignment:
Q  84 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31345495 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttataggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 31345396  T
Q  184 aaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||    
T  31345395 aaggtgtttaa 31345385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22686472 - 22686260
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22686472 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaatatgatttttggtttttgaggtatgatgaaaacactctaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 22686373  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    || ||| ||| |||||||| | || |||||||||||||  |   || |||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  22686372 tccgcacaactatttctaattcaacccaaaacttatggattgtctcgaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 22686274  T
Q  203 aacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||    
T  22686273 aacctatgttgtga 22686260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 28345493 - 28345707
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  28345493 tgttagctttccagtggctttgattttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttacgaaa 28345592  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat-tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    |||| ||||||| |||||||||  || | ||||||||||| ||  | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  28345593 attccgcataactatttctaagccaaccaaaaacttatgg-atcgtctccaaacttcaaaacttgt-gtactatgagttcatttaaggtgtttaatagta 28345690  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
     |||| |||||||||||    
T  28345691 cttaatctatgttgtga 28345707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 1384105 - 1384317
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1384105 ttagctttccagtggctttggattgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaat 1384204  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    ||  |||||| |||||||||| ||  |||||||||||   |   ||||||| ||||| || |  |||| |||||||| |||||||||||||    |||||    
T  1384205 tccacataactatttctaagtcaactcaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtaccatgagttctattaaggtgtttacgagtattt 1384303  T
Q  203 aacctatgttgtga 216  Q
    |||||||| |||||    
T  1384304 aacctatgctgtga 1384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22332351 - 22332138
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  22332351 tgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatggcgaaaacactccaatgaggtcttggtg-aattttatgaaa 22332253  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  22332252 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaaattg-tgtactatgagttcaattaaggtgttcaagagtat 22332154  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  22332153 ttaacctatgttgtga 22332138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23610108 - 23609898
Alignment:
Q  4 tagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 103  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23610108 tagctttccagtgtatttagtttgacttgaaaatgatttacgatttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttagtgaaattttatgcaaatt 23610009  T
Q  104 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattta 203  Q
    | ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  23610008 ctgcataactatttctaagtcaacccaaaacctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 23609910  T
Q  204 acctatgttgtg 215  Q
    ||||||||||||    
T  23609909 acctatgttgtg 23609898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31345754 - 31345656
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  31345754 tgttagcttttcagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaatttttatgaa 31345656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 23778712 - 23778852
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatg-aa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | ||    
T  23778712 tgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggttttagtgaaattttacgaaa 23778811  T
Q  100 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||    
T  23778812 aattccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatgg 23778852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20261794 - 20261696
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20261794 tgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 20261696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 10684350 - 10684448
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10684350 tgttagctttccaatggctttagttttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 10684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 220
Target Start/End: Original strand, 30643812 - 30643917
Alignment:
Q  115 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgt 214  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  30643812 tttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 30643911  T
Q  215 gagttg 220  Q
    ||||||    
T  30643912 gagttg 30643917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22501374 - 22501284
Alignment:
Q  130 aaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||    
T  22501374 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttg 22501284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22509308 - 22509218
Alignment:
Q  130 aaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||    
T  22509308 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttg 22509218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 38968054 - 38967956
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38968054 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttttgtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 38967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 40911957 - 40911863
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttat 96  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40911957 gttagctttccagtagctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatcttat 40911863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22255847 - 22255768
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 80  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22255847 tgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggt 22255768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 24897783 - 24897881
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24897783 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24897881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 24900266 - 24900364
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24900266 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24900364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 24902743 - 24902841
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24902743 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24902841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 24905220 - 24905318
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24905220 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24905318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 24907695 - 24907793
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24907695 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24907793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 22786717 - 22786891
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| |  |||||||||||| | || ||| ||||| | ||||| || || | || |||||||    
T  22786717 ttagctttccaatggctttagtttgacttaaaaatgttttttagattttgagatatgagggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttgtgaaaat 22786816  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 178  Q
    |  |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22786817 tt-gcataaccgtttctaactcaatccaaaacctatggaacgtttccaaacctcaaaactagaagtattaggagtt 22786891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23136154 - 23136056
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23136154 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23136056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20272959 - 20272855
Alignment:
Q  33 aaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaa 132  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  20272959 aaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttggtaaatttttaccaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaa 20272860  T
Q  133 actta 137  Q
    |||||    
T  20272859 actta 20272855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22501434 - 22501375
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||    
T  22501434 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22501375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22509368 - 22509309
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||    
T  22509368 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22509309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 36734902 - 36735041
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||| | ||    
T  36734902 tgttagatttccaatggctttggtttgacttgaaaatgttttgtgggttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaa 36735001  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    | |   |||||| ||||| |||| || | |||||||||||    
T  36735002 acttgacataactatttccaagtcaacctaaaacttatgg 36735041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24841481 - 24841375
Alignment:
Q  107 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacc 206  Q
    |||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |  ||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||    
T  24841481 cataactatttccaagtcaacccaaaacttatgggttgtttccaaactccaaaacttgt-gtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacc 24841383  T
Q  207 tatgttgt 214  Q
    ||||||||    
T  24841382 tatgttgt 24841375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 7187000 - 7186942
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatga 60  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7187000 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatga 7186942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 18809517 - 18809471
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18809517 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 18809471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 28577673 - 28577627
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28577673 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 28577627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24302300 - 24302220
Alignment:
Q  56 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaactt 136  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  || |||  || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||    
T  24302300 tatgatgaaaatactacaagtaggtcttgatgcaattgtacgaaaattcagcataactatttttaagtgaacccaaaactt 24302220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 225
Target Start/End: Original strand, 34492089 - 34492133
Alignment:
Q  181 attaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34492089 attaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcct 34492133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24281246 - 24281124
Alignment:
Q  61 tgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaa 160  Q
    |||||||||| |||| |||||||  || ||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||  |||||  || | |||||||||||||    
T  24281246 tgaaaatactacaagtaggtcttgttgcaattttacgaaaatttagcataactatttttaagtgaacccaaaagctatggtttagtcccaaacctcaaaa 24281147  T
Q  161 ctagaagtactatgagttcaatta 184  Q
    || | ||||||| ||||| |||||    
T  24281146 cttg-agtactaagagtttaatta 24281124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 571972 - 571926
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||    
T  571972 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggt 571926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 23711601 - 23711647
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23711601 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 23711647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 26505953 - 26505907
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26505953 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 26505907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 26508431 - 26508385
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26508431 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 26508385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 27920352 - 27920398
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27920352 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 27920398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 32039086 - 32039132
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32039086 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 32039132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 39682888 - 39682842
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||    
T  39682888 tgttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggt 39682842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 82)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 10694664 - 10694888
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10694664 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 10694763  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  10694764 attcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattat 10694863  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10694864 ttaacctatgttgtgagttggtcct 10694888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 10908430 - 10908654
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908430 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 10908529  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  10908530 attcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattat 10908629  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10908630 ttaacctatgttgtgagttggtcct 10908654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15008601 - 15008377
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15008601 tgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 15008502  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  15008501 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattcgaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 15008402  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  15008401 ttaacctatgttgtaagttggtcct 15008377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9638642 - 9638423
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9638642 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 9638543  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  9638542 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 9638443  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  9638442 ttaatctatgttgtgagttg 9638423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40620162 - 40619941
Alignment:
Q  4 tagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40620162 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 40620063  T
Q  104 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||      
T  40620062 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaatctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtattat 40619963  T
Q  204 acctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40619962 acctatgttgtgagttggtcct 40619941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15990673 - 15990452
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15990673 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 15990574  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||    
T  15990573 ttcagcacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagattatt 15990474  T
Q  202 taacctatgttgtgagttggtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15990473 taacctatgttgtgagttggtc 15990452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3337734 - 3337519
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3337734 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttcaatatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 3337635  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  3337634 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 3337535  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  3337534 ttaacctatgttgtga 3337519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 630320 - 630544
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  630320 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 630419  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  630420 attcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 630519  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  630520 ttaacccatgttgtgagttgatcct 630544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 15447834 - 15448052
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447834 gttagctttctattggctttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 15447933  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  15447934 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactggaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 15448033  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  15448034 taacccatgttctgagttg 15448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12611485 - 12611262
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611485 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaacgaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 12611386  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  12611385 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 12611286  T
Q  202 taacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||    
T  12611285 taacccatgttgtgagttgatcct 12611262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19609958 - 19609744
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609958 gttacctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 19609859  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||   ||||    
T  19609858 ttcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaaggtataattccaaacctcaaaactagaagtactatcagttcaactagggtgtttaagagtatt 19609759  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  19609758 taacctatgttgtga 19609744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25091287 - 25091073
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25091287 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 25091188  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  25091187 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcgaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 25091088  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    ||||| |||||||||    
T  25091087 taaccaatgttgtga 25091073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 53630891 - 53631105
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53630891 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 53630990  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  53630991 ttcggcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 53631090  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  53631091 taacctatgttgtga 53631105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10705133 - 10704914
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10705133 tgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 10705034  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  10705033 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 10704934  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  10704933 ttaacccatgttgtgagttg 10704914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10918903 - 10918684
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10918903 tgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 10918804  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  10918803 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 10918704  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  10918703 ttaacccatgttgtgagttg 10918684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35660481 - 35660266
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35660481 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 35660382  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||   |||    
T  35660381 attcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataatctcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaagagtat 35660282  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  35660281 ttaacctatgttgtga 35660266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 56115253 - 56115472
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56115253 tgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 56115352  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||    
T  56115353 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaagcagaagtactatgagttctattaaggtgtttaagagtat 56115452  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  56115453 ttaatccatgttgtgagttg 56115472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 23802882 - 23803105
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23802882 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 23802981  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  23802982 tttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 23803081  T
Q  202 taacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  23803082 taacccatgttatgagttgatcct 23803105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33849377 - 33849158
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33849377 tgttagctttccaatggctttggtttgaatcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 33849278  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  33849277 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtat 33849178  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  33849177 ttaatccatgttgtgagttg 33849158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 10356854 - 10357068
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10356854 gttagctttccagtggctttggtgtgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 10356953  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  10356954 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 10357053  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  10357054 taacctatgttgtga 10357068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37019303 - 37019089
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37019303 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 37019204  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||    
T  37019203 ttcagcataatcgtttataagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgggttcaactaaggtgtttaagagtatt 37019104  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||| |||||    
T  37019103 taacctatgctgtga 37019089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9923831 - 9923622
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9923831 tgttagctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 9923732  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |    
T  9923731 attcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaatagtgt 9923632  T
Q  201 ttaacctatg 210  Q
    ||||||||||    
T  9923631 ttaacctatg 9923622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10057107 - 10056883
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10057107 tgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 10057008  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||   |||    
T  10057007 attcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaatctagaagtaccaggagttcaattaaggtgtttaagagtat 10056908  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  10056907 ttaacatatgttatgagttgatcct 10056883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24046951 - 24047170
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||    
T  24046951 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatggaaatactctaggtaggtcttagtgaaaccttatgaaa 24047050  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  24047051 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 24047150  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  24047151 ttaacccatgttgtgagttg 24047170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42875433 - 42875219
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42875433 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 42875334  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    ||||    
T  42875333 ttcagcgtaactgtttctaagttaatccaaaacttaatgaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaggagtatt 42875234  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  42875233 taacctatgttgtga 42875219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 11479028 - 11479237
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11479028 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaa 11479127  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||    
T  11479128 attcagcctaacagtttccaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagattat 11479227  T
Q  201 ttaacctatg 210  Q
    ||||||||||    
T  11479228 ttaacctatg 11479237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16998160 - 16997950
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998160 tgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 16998061  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     |||||||||||||| || || |||||||||   |||    
T  16998060 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaa-----aagtactatgagttgaactagggtgtttaagagtat 16997966  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  16997965 ttaacctatgttgtga 16997950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18213201 - 18212982
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18213201 tgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaa 18213102  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  18213101 attcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 18213002  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  18213001 ttaacccatgttgtgagttg 18212982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 51463485 - 51463708
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463485 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtctaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 51463584  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  51463585 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatgcgataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggcgtttaagagtatt 51463684  T
Q  202 taacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||    
T  51463685 taacccatgttgtgagttgatcct 51463708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14549260 - 14549046
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14549260 gttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaagtactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 14549161  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  14549160 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaagactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 14549061  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    || ||||||||||||    
T  14549060 tagcctatgttgtga 14549046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 16277744 - 16277961
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16277744 tgttagctttccaacggctttggtttgactcgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggttttactgaaatcttatgaaa 16277843  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||    
T  16277844 attcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtat 16277943  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  16277944 ttaacccatgttatgagt 16277961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33186536 - 33186317
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33186536 tgttagctttccagtggctttggtttgactcgaaaataatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaa 33186437  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |    
T  33186436 atttagtataacattttctaagttagtccaaaacttatggaataactccaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgt 33186337  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33186336 ttaacctatgttgtgagttg 33186317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 33243713 - 33243928
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33243713 tgttagctttccaatgattttgatttgacttgaaaataatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaaggggtcttagtgaaatcttatgaaa 33243812  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||   ||     
T  33243813 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattgaggtgtttaagagtag 33243912  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
     |||||||||||||||    
T  33243913 ctaacctatgttgtga 33243928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15114856 - 15114648
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15114856 gttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaaat-ttatgaaaa 15114758  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  15114757 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggagtttaagagtatt 15114658  T
Q  202 taacctatgt 211  Q
    ||||||||||    
T  15114657 taacctatgt 15114648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 53387354 - 53387571
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53387354 tgttagctttccaatggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaa 53387453  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||    
T  53387454 attcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaattagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtat 53387553  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  53387554 ttaacccatgttatgagt 53387571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28385878 - 28385654
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| |  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28385878 tgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaa 28385779  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||    
T  28385778 attcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 28385679  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  28385678 ttaacccaagttgtgagttggtcct 28385654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 15011931 - 15012097
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15011931 gttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 15012030  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagt 168  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15012031 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 15012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 19435114 - 19435330
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  19435114 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattatatgaaa 19435213  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||   ||    
T  19435214 attcagcataaccgtttctaagtcagtctaaaatttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagta 19435313  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  19435314 tttaacctatgttgtga 19435330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11425579 - 11425375
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          |    
T  11425579 gttagctttccagtagctttggttttacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaa----------a 11425490  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||||    
T  11425489 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattagggtgtttaagagtatt 11425390  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  11425389 taacctatgttgtga 11425375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14630461 - 14630246
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14630461 tgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 14630362  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    | || ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  14630361 aatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtat 14630262  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  14630261 ttaacctatgttgtga 14630246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 19566336 - 19566550
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  19566336 tgttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaattttgtgaaa 19566435  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  19566436 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 19566534  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  19566535 ttaacctatgttgtga 19566550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10237915 - 10238128
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10237915 tgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 10238014  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||   |||    
T  10238015 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttaaattaatgtgtttaagagtat 10238113  T
Q  201 ttaacctatgttgtg 215  Q
    |||| ||| ||||||    
T  10238114 ttaagctacgttgtg 10238128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15344510 - 15344301
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15344510 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 15344411  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||||  |   ||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  15344410 attccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtctccaaa-ttcaaagct-tatgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 15344313  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  15344312 ttaacctatgtt 15344301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25513377 - 25513163
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25513377 tgttagctttccattgactttggttcgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 25513278  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
     ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |   | ||||||||||| || |  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  25513277 gttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgggttgtcttcaaacctcaaagcttg-tgtactacgagttcaattacggtgtttaagaatat 25513179  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  25513178 ttaacctatgttgtga 25513163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40229938 - 40229727
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt-agtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40229938 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttaagtgaaattttatgaa 40229839  T
Q  100 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||| ||||||  ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||| |||||   ||    
T  40229838 aattctgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtatttaagagta 40229740  T
Q  200 tttaacctatgtt 212  Q
    |||||||||||||    
T  40229739 tttaacctatgtt 40229727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 225
Target Start/End: Original strand, 15883917 - 15884056
Alignment:
Q  86 tgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 185  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15883917 tgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttgatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 15884016  T
Q  186 ggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15884017 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcct 15884056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 15214462 - 15214672
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||| | ||||| || || | ||||||||    
T  15214462 tgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaa 15214561  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||   |||    
T  15214562 attcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatatttccaaacctcgaaactggaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtat 15214661  T
Q  201 ttaacctatgt 211  Q
    |||||||||||    
T  15214662 ttaacctatgt 15214672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26445518 - 26445305
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26445518 gttagctttccagtagctttggtttgaattgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaa 26445419  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||  | ||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  26445418 tttcggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatt 26445320  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  26445319 taacctatgttgtga 26445305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 44024021 - 44024231
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44024021 tgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtttctgagttattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 44024120  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  44024121 attccgcataactgtttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 44024219  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  44024220 ttaacctatgtt 44024231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 2425039 - 2425252
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2425039 gttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaactactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaat 2425138  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||  |||||  | |  | ||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  2425139 ttccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaaggttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 2425237  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  2425238 taacctatgttgtga 2425252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3485543 - 3485353
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  |||    
T  3485543 tgttagttttctagtggcgtcagtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaattgtta--aaa 3485446  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3485445 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcc-aaccccaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaa 3485353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Original strand, 16026349 - 16026538
Alignment:
Q  4 tagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16026349 tagctttccagtggcttcagtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 16026448  T
Q  104 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |   | ||||| |||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16026449 ccgcataagtatttctaagttaacccaaaacttatggattgtctacaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaa 16026538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 45314754 - 45314964
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45314754 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgagtctggtttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 45314853  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| |||  |   ||||||| ||||| || |  | | ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  45314854 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttgtggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 45314952  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  45314953 ttaacctatgtt 45314964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46740833 - 46740623
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || |||||    
T  46740833 tgttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgataaaaatactccaaagacgtcttagtgaaattttgtgaaa 46740734  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  46740733 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtat 46740635  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  46740634 ttaacctatgtt 46740623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 55582826 - 55582703
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  55582826 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 55582727  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagtt 124  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  55582726 attccgcataactatttctaagtt 55582703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 22725502 - 22725608
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22725502 tgttagctttccaaaggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttactgaaatcttatgaaa 22725601  T
Q  101 attcagc 107  Q
    |||||||    
T  22725602 attcagc 22725608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15534756 - 15534658
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15534756 tgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15534658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Original strand, 20595850 - 20596056
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  20595850 ttagctttctaatggctttggtttgacatgaaaataatttttagattttgagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaat 20595949  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    |||||||||  |||| ||||| || || ||||||||||  | || ||||||||||||||| | |||  || ||||||||||| | |||||||   |||||    
T  20595950 tcagcataattatttgtaagtcaaccccaaacttatggtttgatgccaaacctcaaaacttg-agttataggagttcaattatgatgtttaagagtattt 20596048  T
Q  203 aacctatg 210  Q
    ||||||||    
T  20596049 aacctatg 20596056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14049152 - 14049054
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14049152 tgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatcataaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14049054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 18108295 - 18108417
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18108295 tgttagatttccagtggtgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 18108394  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagt 123  Q
    ||||||||||||  |||||||||    
T  18108395 attcagcataactgtttctaagt 18108417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 9871126 - 9871201
Alignment:
Q  144 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagtt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  9871126 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 9871201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 13046062 - 13046251
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||    
T  13046062 tgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttatatttttatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttacgaaa 13046161  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 191  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||  |  |||||| |||||||| | | ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  13046162 attcaacataaccatttctaaatcaacccaaaagttatggtttgtttccaatcctcaaaaattg-agtactaggagtttaattagggtgtt 13046251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 14185517 - 14185427
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14185517 tgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagcgaaat 14185427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 36038445 - 36038347
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  36038445 tgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgataaaaatactcaaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 36038347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14508322 - 14508182
Alignment:
Q  75 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||    
T  14508322 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttg-tgtactatg 14508224  T
Q  175 agttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14508223 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14508182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 43251116 - 43251199
Alignment:
Q  138 tgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatga-tatttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | |||||||||||||    
T  43251116 tgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaatccatgttgtgagttg 43251199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 12033361 - 12033459
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12033361 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12033459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 44615863 - 44615765
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44615863 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 44615765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 49547361 - 49547459
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  49547361 tgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 49547459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 216
Target Start/End: Original strand, 13036328 - 13036409
Alignment:
Q  135 ttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||| ||||||    
T  13036328 ttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatattgtga 13036409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12622932 - 12622799
Alignment:
Q  75 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||    
T  12622932 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatg 12622834  T
Q  175 agttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctat 209  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  12622833 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctat 12622799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 30147490 - 30147392
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  30147490 tgttagctttccaatggctttggttttacttaaaaatgatttttaacttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 30147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 50221927 - 50222025
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  50221927 tgttggctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 50222025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19243275 - 19243177
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttg-actagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | || || |||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19243275 tgttagctttccaatggctttggtttggagta-aatatgatttttggtttaggtgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19243177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 19081759 - 19081892
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||   ||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||| ||| |||||    
T  19081759 gttatctttccactggattttgtttgacatcaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacacttcaaggagatcttggtaaaattttacgaaaa 19081858  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaact 135  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  19081859 ttcagcataaccgtttccaagtcaacccaaaact 19081892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29267896 - 29267830
Alignment:
Q  33 aaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  29267896 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctcagtgaatttttatgaa 29267830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 216
Target Start/End: Original strand, 26922254 - 26922303
Alignment:
Q  167 gtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  26922254 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 26922303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 54364107 - 54364243
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| ||  ||| |||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| | ||||| ||| | ||    
T  54364107 tgttagatttccaatgaatttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacactccaagtgggtcttggagaaattttaagtaa 54364206  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaactta 137  Q
    | | |||||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  54364207 acttagcataactatttccaagtcaacccaaaactta 54364243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 15117940 - 15117986
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15117940 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 15117986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 17376083 - 17376222
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||| | || ||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||   ||||| ||| | ||    
T  17376083 tgttagctttccaatggatttaggtttacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaaggaa 17376182  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    | | |||||||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  17376183 acttagcataactatttccaagtcaacccaaaacttatgg 17376222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 7640774 - 7640816
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttt 43  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  7640774 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttt 7640816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 55582673 - 55582624
Alignment:
Q  167 gtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  55582673 gtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaatctatgttgtga 55582624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 95)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 15173872 - 15174096
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15173872 tgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaa 15173971  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||    
T  15173972 attcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaattgtttaagggtat 15174071  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15174072 ttaacctatgttgtgagttggtcct 15174096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18658841 - 18658622
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18658841 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaaatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 18658742  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  18658741 attcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 18658642  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  18658641 ttaacccatgttgtgagttg 18658622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 611375 - 611156
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  611375 tgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 611276  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  611275 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 611176  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  611175 ttaacccatgttgtgagttg 611156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28947979 - 28947764
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947979 tgttagctttccaatgactttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 28947880  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  28947879 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtat 28947780  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  28947779 ttaacctatgttgtga 28947764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27851638 - 27851421
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27851638 tgttagctttccaatggatttggtttcacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27851539  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  27851538 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 27851439  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27851438 ttaacctatgttgtgagt 27851421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 19655647 - 19655861
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655647 gttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 19655746  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  19655747 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 19655846  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  19655847 taacctatgttgtga 19655861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 8767680 - 8767885
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8767680 tgttagctttccaatggctttggtttgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaagtactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 8767779  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  8767780 attcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatat 8767879  T
Q  201 ttaacc 206  Q
    ||||||    
T  8767880 ttaacc 8767885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19825906 - 19826125
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19825906 tgttagctttccaatgaatttgttttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaa 19826005  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  19826006 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatcggataattccaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 19826105  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  19826106 ttaaattatgttgtgagttg 19826125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20733864 - 20734080
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20733864 tgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatct-atgaaa 20733962  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  20733963 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 20734062  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20734063 ttaacctatgttgtgagt 20734080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7827606 - 7827392
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7827606 gttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 7827507  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  7827506 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 7827407  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  7827406 taacctatgttgtga 7827392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 17318540 - 17318754
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318540 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17318639  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  17318640 ttcagcataaccgtttctaaggtaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 17318739  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  17318740 taacctatgttgtga 17318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 25619375 - 25619593
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25619375 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 25619474  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||    
T  25619475 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 25619574  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  25619575 taacccatgttgtgagttg 25619593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 19443697 - 19443921
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19443697 tgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatactccacgtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 19443796  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  19443797 attcagcataaccatttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccagaactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 19443896  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  19443897 ttaacccatgttgtgagttgatcct 19443921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 15817175 - 15817394
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15817175 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgataatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaa 15817274  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||   |||    
T  15817275 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtattatgaggtcaattaagttgtttaagattat 15817374  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15817375 ttaacccatgttgtgagttg 15817394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 20556511 - 20556734
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20556511 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 20556610  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||   ||||    
T  20556611 ttcagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgttaaagagtatt 20556710  T
Q  202 taacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||    
T  20556711 taacccatgttgtgagttgatcct 20556734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18703198 - 18702984
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18703198 gttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaa 18703099  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||    
T  18703098 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatt 18702999  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  18702998 taacctatgttgtga 18702984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18709133 - 18708919
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18709133 gttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaa 18709034  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  18709033 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 18708934  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  18708933 taacctatgttgtga 18708919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 15891129 - 15891321
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15891129 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 15891228  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15891229 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctaaaaactagaagtactatgatttcaattagggtgtttaa 15891321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 14979040 - 14979258
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14979040 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttggtgaaatcttaggaaaa 14979139  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  14979140 ttcagtataaccttttctaatttaatccaaaacttatagaataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 14979239  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  14979240 taacccatgttgtgagttg 14979258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 29847920 - 29848141
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29847920 tgttagctttccaatgaatttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaatcttatgaaa 29848019  T
Q  101 a--ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgat 198  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  29848020 aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 29848119  T
Q  199 atttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  29848120 atttaatccatgttgtgagttg 29848141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 8759934 - 8760138
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8759934 tgttagctttccaatggctgtggattgacatgaaaataatttt-ggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 8760032  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  8760033 attcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatat 8760132  T
Q  201 ttaacc 206  Q
    ||||||    
T  8760133 ttaacc 8760138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 25601694 - 25601909
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25601694 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgcgttatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaa 25601793  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||   |||    
T  25601794 attcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaataagagtttaattaaggggtttaagagtat 25601893  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  25601894 ttaacctatgtggtga 25601909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13764981 - 13764764
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||       || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13764981 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttg-------agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaaatattatgaaa 13764889  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   |||    
T  13764888 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgttttagagtat 13764789  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13764788 ttaacctatgttgtgagttggtcct 13764764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1254392 - 1254215
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1254392 tgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 1254293  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 178  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1254292 attcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 1254215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18928358 - 18928165
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18928358 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 18928259  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18928258 attcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattcaaaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaa 18928165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20183198 - 20182988
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20183198 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 20183099  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  20183098 atttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtat 20183000  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||| ||||    
T  20182999 ttaacctttgtt 20182988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22152793 - 22153003
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22152793 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 22152892  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  22152893 atttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtat 22152991  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||| ||||    
T  22152992 ttaacctttgtt 22153003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25347761 - 25347570
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  25347761 tgttagctttccaatggcgttggtttaacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaa 25347662  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25347661 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgttt 25347570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 34296688 - 34296903
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    ||||||| |||  |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34296688 ttagcttcccaaaggctttggcttcacttgaaaatgatttttggtttttgggatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 34296787  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||   ||| |    
T  34296788 tcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaaggactatgagtttaattagggtgtttaagagtatgt 34296887  T
Q  203 aacctatgttgtgagt 218  Q
    ||| ||||||||||||    
T  34296888 aacttatgttgtgagt 34296903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 23150685 - 23150898
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23150685 gttagcttttcaatggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 23150784  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||    
T  23150785 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatt 23150883  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  23150884 taacctatgttgtga 23150898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16133087 - 16133311
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  16133087 tgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaattcataggaaa 16133186  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  16133187 attcagcataaccatttccaagttaatcggaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 16133286  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  16133287 ttaacccatgttgtgagttgatcct 16133311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23956497 - 23956273
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| |  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23956497 tgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 23956398  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||   |||    
T  23956397 attcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtat 23956298  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  23956297 ttaacctaagttgtgagttggtcct 23956273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31734340 - 31734128
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31734340 gttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatattagattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 31734241  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||   ||||    
T  31734240 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtac--tgagttcaactagggtgtttaagagtatt 31734143  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  31734142 taacctatgttgtga 31734128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 5834152 - 5834362
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5834152 tgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatattatgaaa 5834251  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||   |||    
T  5834252 attcagcataaccgtttctaag-taatccaaaacatagggaataattctaaatctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagtat 5834350  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  5834351 ttaacctatgtt 5834362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20177380 - 20177170
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20177380 tgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaa 20177281  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||   |||    
T  20177280 attcagcataaccgtttctaag-caatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactataagtactaggagttcaattaaggtgtctaagagtat 20177182  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  20177181 ttaacctatgtt 20177170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 27125894 - 27126109
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgattttt-ggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27125894 gttagctttccagtggcttttgtttgaggtgaaaatgattttttggttcttgagatacgatgaaaatactttaaaaaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27125993  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||    
T  27125994 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaagaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 27126093  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  27126094 ttaacctatgttgtga 27126109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 15705029 - 15705243
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15705029 gttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacctcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 15705128  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  15705129 ttcagcataactgtttcttagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 15705228  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| | ||||||||    
T  15705229 taacatgtgttgtga 15705243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 19773127 - 19773341
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19773127 gttagttttccagtggtttttgtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 19773226  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    || ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  19773227 tttagcataactgtttttaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 19773326  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| | ||||||||    
T  19773327 taacatgtgttgtga 19773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23655974 - 23655804
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23655974 tgttagctttccagtggctttggtttgccttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaa 23655875  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtact 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23655874 attcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtact 23655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22158611 - 22158821
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22158611 tgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaa 22158710  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||   |||    
T  22158711 attcagcataaccgtttctaag-aaatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactaaaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagtat 22158809  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  22158810 ttaacctatgtt 22158821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23491588 - 23491803
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23491588 tgttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 23491687  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||    
T  23491688 attcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 23491787  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
     |||| ||||||||||    
T  23491788 ctaacatatgttgtga 23491803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23497186 - 23497401
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23497186 tgttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 23497285  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||    
T  23497286 attcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 23497385  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
     |||| ||||||||||    
T  23497386 ctaacatatgttgtga 23497401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Original strand, 27317981 - 27318187
Alignment:
Q  10 tccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcat 109  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27317981 tccagtggctttgatttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcat 27318080  T
Q  110 aaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctat 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||     
T  27318081 aaccgtttctaagttaattcaaaactagaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatatggtgtttaagagtatttaacctac 27318180  T
Q  210 gttgtga 216  Q
    |||||||    
T  27318181 gttgtga 27318187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25921364 - 25921150
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25921364 tgttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 25921265  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||   |   ||||||| |||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  25921264 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 25921166  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  25921165 ttaacctatgttgtga 25921150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4477292 - 4477074
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  4477292 gttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttatgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaa 4477193  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||    
T  4477192 ttcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatt 4477093  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  4477092 taacccatgttgtgagttg 4477074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 923 - 755
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  923 tgttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 824  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagta 169  Q
    |||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  823 attcagtataattgtttctaagttaatctaaaatttatggaataattccaaagctcaaaactagaagta 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 18455489 - 18455703
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18455489 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggttttagtgaaattttatgaaa 18455588  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||   |||    
T  18455589 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgta-tactatgagttcaattaaggtctttaagagtat 18455687  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  18455688 ttaacctatgttgtga 18455703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23838634 - 23838443
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||    
T  23838634 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtatgtcttagggaaatcttaagaaa 23838535  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 192  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23838534 attcagcacaaccattaccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgttt 23838443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25807767 - 25807602
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| |  |||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25807767 tgttagctttccaatgactctggtttgtcgtgaaaattatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 25807668  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaa 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25807667 attcagcaaaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaa 25807602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22556877 - 22556669
Alignment:
Q  8 tttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 107  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  22556877 tttctagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaacatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattttgc 22556778  T
Q  108 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacct 207  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||   ||||||||||    
T  22556777 ataaccatttctaggtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacatcaaaactagaagtactaggagtttcattaaggggtttaagagtatttaacct 22556678  T
Q  208 atgttgtga 216  Q
    || ||||||    
T  22556677 attttgtga 22556669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18585253 - 18585040
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18585253 tgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 18585154  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||  |  ||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||   |||    
T  18585153 attccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttat-ggattgtctcaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtat 18585056  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||| |||||||    
T  18585055 ttaacctaagttgtga 18585040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32259481 - 32259268
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32259481 tgttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 32259382  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| || || || |  ||||||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  32259381 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttc-aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtat 32259284  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  32259283 ttaacctatgttgtga 32259268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23415262 - 23415153
Alignment:
Q  85 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23415262 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatta 23415163  T
Q  185 aggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||    
T  23415162 aggtgtttaa 23415153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27557028 - 27556911
Alignment:
Q  77 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  27557028 aggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagttctatgag 27556929  T
Q  177 ttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27556928 ttcaattaaggtgtttaa 27556911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13285343 - 13285129
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13285343 tgttagctttctagtggctttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 13285244  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||  || |||||||||||||  |   ||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  13285243 attccgcataactatttctaagccaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcatttaaggtgtttaagagtat 13285145  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||| ||||||    
T  13285144 ttaacctatattgtga 13285129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 20411089 - 20411299
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20411089 tgttagcattccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgaggtatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 20411188  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||| |||||||||||||||| |||||||   |||    
T  20411189 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtaatatgagttcaattaagttgtttaagagtat 20411287  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  20411288 ttaacctatgtt 20411299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29044945 - 29044806
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29044945 tgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaatgttatgaaa 29044846  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  29044845 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 29044806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18398553 - 18398339
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18398553 tgttagctttctattggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaattttacgaaa 18398454  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |  |   ||||||| |||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||   |||    
T  18398453 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaaacttg-tgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtat 18398355  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  18398354 ttaacttatgttgtga 18398339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 34141042 - 34141180
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  34141042 tgttagctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaa 34141141  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatg 139  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  34141142 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 34141180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 34153658 - 34153796
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  34153658 tgttagctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaa 34153757  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatg 139  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  34153758 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 34153796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 17857109 - 17857319
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17857109 tgttagatttccaatggctttggtatgacttgaaaatgatttttagattttgggttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 17857208  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| | ||||| |||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| ||||||| ||||||| || || || |||||||  ||||||   |||    
T  17857209 attccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaacgagaagtattaggaatttaattaagaggtttaagagtat 17857308  T
Q  201 ttaacctatgt 211  Q
    |||||||||||    
T  17857309 ttaacctatgt 17857319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22806383 - 22806276
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22806383 gttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 22806284  T
Q  102 ttcagcat 109  Q
    ||||||||    
T  22806283 ttcagcat 22806276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23415539 - 23415441
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23415539 tgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttgttgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23415441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 27330390 - 27330488
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27330390 gttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27330488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 27391130 - 27391228
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27391130 gttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 31022114 - 31022267
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| |  |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31022114 tgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 31022213  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacc 154  Q
    |||||  | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31022214 attcactaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacc 31022267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12942764 - 12942666
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12942764 tgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12942666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Original strand, 15938650 - 15938851
Alignment:
Q  8 tttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||    
T  15938650 tttccaatggctttggtttgacttgaaaattatttttatcttttgagttatgatgaaaatactctaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaatttagc 15938749  T
Q  108 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacct 207  Q
    ||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |  |||||||  |||||| | | |||  || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15938750 ataactatttttaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaaattcaaaaattg-agtgttaggagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacct 15938848  T
Q  208 atg 210  Q
    |||    
T  15938849 atg 15938851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27557297 - 27557199
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  27557297 tgttagctttccggtggatttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaatttttatgaa 27557199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 28288924 - 28289022
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28288924 tgttagctttccaatggctttggttggactcgaaaatgagttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28289022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7430158 - 7430069
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7430158 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 7430069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 14594042 - 14594131
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 90  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14594042 tgttagctttccgatggctttggtttgatttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 14594131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35057139 - 35057000
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||| | ||    
T  35057139 tgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgttttatggattttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaa 35057040  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    | |  ||||||| ||||| |||| || | |||||||||||    
T  35057039 acttggcataactatttccaagtcaaccaaaaacttatgg 35057000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 15892028 - 15892094
Alignment:
Q  33 aaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15892028 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaa 15892094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 19858510 - 19858608
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||    
T  19858510 tgttagctttctagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaaggagatcttagtgaatttttatgaa 19858608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33862368 - 33862270
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33862368 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33862270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23221500 - 23221308
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||| |  ||||||||| |||  ||||||||    
T  23221500 tgttagctttccaatttttttggtttgacttgaaaatgatatttagatttggagttatgatgaaaatactccatgtgggtcttagtaaaactttatgaaa 23221401  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||   || |||||||||  |||| |||||||  |  |||||||| |||||| | | |||| || ||||| ||||||| |||||||    
T  23221400 attcagcataatttttcctaagttaaatcaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagatgtttaa 23221308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 17883087 - 17883183
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |   ||  ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17883087 ttagctttccaatggctttggtttggcgttaatttgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 17883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Original strand, 22523388 - 22523594
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||  || ||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  22523388 ttagctttctaatggctttgttttggcttaaagatgatttttaggttttgagttatggtgaaaatactaaaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaat 22523487  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||| || ||||||  |  |  |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| | | |||||||   |||||    
T  22523488 tcagcataactatttttaagtgaacccataagttatggtttggtcgcaaacctcaaaacttg-agtactaggagtttaataaggatgtttaagagtattt 22523586  T
Q  203 aacctatg 210  Q
    ||||||||    
T  22523587 aacctatg 22523594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 1540499 - 1540597
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1540499 tgttagctttccaatggctttggtgtggcataaaaatgagttttggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1540597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19234720 - 19234658
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatga 63  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19234720 tgttagattttcattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 19234658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 31161878 - 31162085
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||   |||||||||||| |  |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||| | ||||    
T  31161878 ttagcattccaatgactttgatttgacatcaaaatgatttttagattttgagttatgttgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaagtaaat 31161977  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    | ||||| || ||||| |||| || |||||||||||||  |  |||||||  |||||||| | |||| || ||||| ||||| | |||||||   |||||    
T  31161978 ttagcatgactatttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaatttcaaaacttg-agtattaagagtttaattatgatgtttaaaagtattt 31162076  T
Q  203 aacctatgt 211  Q
    |||||||||    
T  31162077 aacctatgt 31162085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12742892 - 12742794
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttg-actagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || | || ||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12742892 tgttagctttccaatggctttagtgtggagta-aaattgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25753026 - 25752961
Alignment:
Q  160 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  25753026 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatcct 25752961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25755196 - 25755131
Alignment:
Q  160 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  25755196 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatcct 25755131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16135594 - 16135519
Alignment:
Q  136 tatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgt 211  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||   ||||||||||||||    
T  16135594 tatggaatatttccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 16135519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 18334180 - 18334226
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18334180 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 18334226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 24423121 - 24423075
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24423121 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 24423075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19234661 - 19234617
Alignment:
Q  172 atgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19234661 atgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 19234617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31163594 - 31163462
Alignment:
Q  8 tttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 107  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||   ||||| |||   ||| | |||    
T  31163594 tttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttgaggaaattttaaagaaacttagc 31163495  T
Q  108 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    ||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  31163494 ataactatttccaagtcattccaatacttatgg 31163462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 3007530 - 3007668
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |  |||| |||   |||    
T  3007530 gttatcttttcaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttgggaaaattttaaagaaa 3007629  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
     | |||||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  3007630 cttagcataactatttccaagtcattccaatacttatgg 3007668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 8055604 - 8055558
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||    
T  8055604 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggt 8055558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 26924035 - 26924081
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26924035 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 26924081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 33864852 - 33864806
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33864852 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 33864806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29044731 - 29044682
Alignment:
Q  167 gtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  29044731 gtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatataacctatgttgtga 29044682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17011361 - 17011137
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17011361 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttcagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 17011262  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  17011261 atttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacttcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 17011162  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17011161 ttaacctatgttgtgagttggtcct 17011137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 263492 - 263268
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  263492 tgttagctttccgatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 263393  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  263392 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 263293  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  263292 ttaacctatgttgtgagttggtcct 263268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29448473 - 29448249
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29448473 tgttagctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 29448374  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||    
T  29448373 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtagtatgagttcaattaagatgtttaagagtat 29448274  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||    
T  29448273 ttaacctatgttatgagttgatcct 29448249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18419047 - 18418823
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18419047 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 18418948  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||    
T  18418947 attcagcataatcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtat 18418848  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18418847 ttaacccatgttgtgagttgatcct 18418823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24277023 - 24277242
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24277023 tgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 24277122  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  24277123 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 24277222  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  24277223 ttaacccatgttgtgagttg 24277242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24385190 - 24384971
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24385190 tgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 24385091  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  24385090 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 24384991  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  24384990 ttaacccatgttgtgagttg 24384971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 27868992 - 27869206
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27868992 tgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27869091  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   |||    
T  27869092 attcagcacaaacatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtat 27869191  T
Q  201 ttaacctatgttgtg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  27869192 ttaacctatgttgtg 27869206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17813029 - 17812812
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17813029 ttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 17812930  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  17812929 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtattt 17812830  T
Q  203 aacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17812829 aacccatgttgtgagttg 17812812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36460605 - 36460388
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36460605 tgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 36460506  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  36460505 attcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 36460406  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
     |||| ||||||||||||    
T  36460405 gtaacttatgttgtgagt 36460388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 32607742 - 32607957
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32607742 tgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaa 32607841  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||    
T  32607842 attcagcataaccgtttctaagctaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtat 32607941  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  32607942 ttaacctatgttgtga 32607957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22412641 - 22412422
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22412641 tgttagctttccaatgactttattttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 22412542  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |    
T  22412541 gttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgt 22412442  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22412441 ttaacctatgttgtgagttg 22412422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 21557461 - 21557679
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21557461 tgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttggcttttaagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaatcttacgaaa 21557560  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatga-ta 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  21557561 attcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaaagagta 21557660  T
Q  200 tttaacctatgttgtgagt 218  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  21557661 tttaaactatgttgtgagt 21557679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6766296 - 6766072
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  6766296 tgttagctttccaatgacttttgtttgacttaaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtaaaattttatgaaa 6766197  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  6766196 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 6766097  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||    
T  6766096 ttaacctatgttatgagttgatcct 6766072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17875633 - 17875415
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17875633 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17875534  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  17875533 ttcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 17875434  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||  | ||||||||||    
T  17875433 taacccctattgtgagttg 17875415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20566178 - 20565974
Alignment:
Q  12 cagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataa 111  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20566178 cagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataa 20566079  T
Q  112 ccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgt 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  20566078 ccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaattactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 20565979  T
Q  212 tgtga 216  Q
    |||||    
T  20565978 tgtga 20565974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 30138581 - 30138804
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  30138581 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaac-cttatgaaa 30138679  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  30138680 attcagcataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 30138779  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  30138780 ttaacccatgttgtgagttgatcct 30138804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 21554796 - 21555013
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21554796 tgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttaggaaa 21554894  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatga-ta 199  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  21554895 attcagtctaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaaagagta 21554994  T
Q  200 tttaacctatgttgtgagt 218  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  21554995 tttaacccatgttgtgagt 21555013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21399421 - 21399635
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21399421 tgttagctttccaatgactttggtttgactt-aaaatgattttcagtttttgagatatgataaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaa 21399519  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  21399520 atttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 21399619  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||| ||||||    
T  21399620 ttaacctattttgtga 21399635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31456432 - 31456216
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  31456432 gttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgggaaaa 31456333  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||    
T  31456332 ttaagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaaaaattccaaccctcaaaactagaaatactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatt 31456233  T
Q  202 taacctatgttgtgagt 218  Q
    ||||| || ||||||||    
T  31456232 taacccatattgtgagt 31456216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19921267 - 19921054
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19921267 gttagctttccagtgg-tttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaaatcttagtgaaatcttatgaaaa 19921169  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  19921168 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 19921069  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| ||||||||||    
T  19921068 taacatatgttgtga 19921054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26762036 - 26761827
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  26762036 tgttagctttccagtggctttggttttacttgaaactgatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaac 26761937  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||    
T  26761936 attcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 26761837  T
Q  201 ttaacctatg 210  Q
    ||||||||||    
T  26761836 ttaacctatg 26761827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 33895300 - 33895508
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33895300 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgtgaaaa 33895399  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  33895400 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 33895499  T
Q  202 taacctatg 210  Q
    |||||||||    
T  33895500 taacctatg 33895508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 8833624 - 8833824
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8833624 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttt--------gagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 8833715  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||   |||    
T  8833716 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc-attaagttgtttaagagtat 8833814  T
Q  201 ttaacctatg 210  Q
    ||||||||||    
T  8833815 ttaacctatg 8833824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 33472981 - 33473205
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| |  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33472981 tgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 33473080  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||   |||    
T  33473081 attcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtat 33473180  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  33473181 ttaacctaagttgtgagttggtcct 33473205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 22758307 - 22758527
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttg-agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  22758307 tgttagctttccaatggctttagcttgacttgaaaatgatttttggtttttttagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaa 22758406  T
Q  100 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||    
T  22758407 aattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagcactatgagttcaattaaggtgtttacgagta 22758506  T
Q  200 tttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  22758507 tttaatccatgttgtgagttg 22758527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22336955 - 22336748
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22336955 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaa 22336856  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||   |||    
T  22336855 attcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtat 22336756  T
Q  201 ttaaccta 208  Q
    ||||||||    
T  22336755 ttaaccta 22336748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 41876010 - 41876222
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| || || ||||||| |  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41876010 tgttagatttccaatgactctggtttggcatgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 41876109  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  41876110 attcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtat 41876209  T
Q  201 ttaacctatgttg 213  Q
    |||||||||||||    
T  41876210 ttaacctatgttg 41876222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22340493 - 22340286
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22340493 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaagagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaa 22340394  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||   |||    
T  22340393 attcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttataggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtat 22340294  T
Q  201 ttaaccta 208  Q
    ||||||||    
T  22340293 ttaaccta 22340286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 28370673 - 28370892
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  28370673 tgttagctttccagtggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 28370772  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||   |||    
T  28370773 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtat 28370872  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  28370873 ttaacccatgttgtgagttg 28370892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 38145155 - 38145374
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  38145155 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 38145254  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||   |||    
T  38145255 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatacgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 38145354  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  38145355 ttaacccatgttgtgagttg 38145374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 20198003 - 20198216
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttg--agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 98  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20198003 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttttagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatga 20198102  T
Q  99 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgat 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||   |    
T  20198103 aaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactaggagtttaattaaggggtataagagt 20198202  T
Q  199 atttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||||    
T  20198203 atttaacctatgtt 20198216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19511822 - 19511614
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |   || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19511822 tgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtggaatcttatgaaa 19511723  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  19511722 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagcattatgaattcaattaaggtgtttaagagta 19511623  T
Q  200 tttaaccta 208  Q
    |||||||||    
T  19511622 tttaaccta 19511614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42961012 - 42960788
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||    
T  42961012 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatggtttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttcgggaaattttatgaaa 42960913  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||    
T  42960912 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgcttaagagtat 42960813  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  42960812 ttaacccatgttgtgagttgatcct 42960788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16063120 - 16062906
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16063120 tgttagctttacagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 16063021  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |  |   || |||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  16063020 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 16062922  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  16062921 ttaacctatgttgtga 16062906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22750555 - 22750372
Alignment:
Q  25 ttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtt 124  Q
    |||||| |||||| | |||| || |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22750555 ttgacttgaaaataacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtt 22750456  T
Q  125 aatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaaccta 208  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  22750455 aatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22750372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 36509201 - 36509409
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36509201 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaa--------ggtttttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 36509292  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||   ||    
T  36509293 attcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagta 36509392  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  36509393 tttaacctatgttgtga 36509409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 40917390 - 40917524
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40917390 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactcaaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 40917489  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaact 135  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40917490 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 37598534 - 37598753
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  37598534 tgttagatttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 37598633  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||   |||    
T  37598634 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggacaattccaaggctcaaaactagaattaatatgagtgcaattaaggtttttaagagtat 37598733  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  37598734 ttaacccatgttgtgagttg 37598753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 8504286 - 8504496
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8504286 tgttagctttcctgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 8504385  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   | ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  8504386 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttcaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagattat 8504484  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  8504485 ttaacctatgtt 8504496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18744283 - 18744070
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18744283 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaaaa 18744184  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  18744183 ttccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 18744085  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  18744084 taacctatgttgtga 18744070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16605021 - 16605235
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  16605021 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatggtttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaagtttatgaaa 16605120  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||| ||||||||   |||    
T  16605121 attccgcataactatttataagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaagtgtttaagagtat 16605219  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  16605220 ttaacctatgttgtga 16605235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Original strand, 14026232 - 14026437
Alignment:
Q  8 tttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  14026232 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatcccgc 14026331  T
Q  108 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacct 207  Q
     |||| |||||||||| || ||||||| |||||  |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||    
T  14026332 ctaactatttctaagtcaacccaaaacatatggattgtctccaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaacct 14026430  T
Q  208 atgttgt 214  Q
    |||||||    
T  14026431 atgttgt 14026437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 1627798 - 1628012
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1627798 tgttatctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaacttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttaatgaaattttatgaaa 1627897  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||||   |||    
T  1627898 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaacgtgtttaagagtat 1627996  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  1627997 ttaacctatgttgtga 1628012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22111185 - 22111020
Alignment:
Q  50 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |||    
T  22111185 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctcc 22111086  T
Q  150 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  22111085 aaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttctattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22111020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 23199809 - 23200017
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23199809 tgttagctttcccatggctttggtttgacttgaaaat---ttttggtttctgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 23199905  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatga-ta 199  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||  ||||| || |  ||||||||||||||||||| |||||| | || ||    
T  23199906 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttgaagagta 23200004  T
Q  200 tttaacctatgtt 212  Q
    |||||||||||||    
T  23200005 tttaacctatgtt 23200017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 24617340 - 24617446
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24617340 tgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaa 24617439  T
Q  101 attcagc 107  Q
    |||||||    
T  24617440 attcagc 24617446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 24713571 - 24713677
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24713571 tgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaa 24713670  T
Q  101 attcagc 107  Q
    |||||||    
T  24713671 attcagc 24713677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 24746599 - 24746705
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24746599 tgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaa 24746698  T
Q  101 attcagc 107  Q
    |||||||    
T  24746699 attcagc 24746705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 37804490 - 37804588
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37804490 tgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 37804588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 24668614 - 24668720
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24668614 tgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaa 24668713  T
Q  101 attcagc 107  Q
    |||||||    
T  24668714 attcagc 24668720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 24738383 - 24738489
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24738383 tgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaa 24738482  T
Q  101 attcagc 107  Q
    |||||||    
T  24738483 attcagc 24738489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 24751152 - 24751258
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24751152 tgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaa 24751251  T
Q  101 attcagc 107  Q
    |||||||    
T  24751252 attcagc 24751258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28901555 - 28901372
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||| | || |||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||| || || ||| ||||| | ||||| || || | ||||||||    
T  28901555 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaa 28901456  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 185  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  28901455 att-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaa 28901372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28937950 - 28937767
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||| | || |||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||| || || ||| ||||| | ||||| || || | ||||||||    
T  28937950 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaa 28937851  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 185  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  28937850 att-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaa 28937767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 43243075 - 43243164
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 90  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43243075 tgttagctttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 43243164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17909102 - 17909023
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 80  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17909102 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggt 17909023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 220
Target Start/End: Original strand, 12122080 - 12122158
Alignment:
Q  142 ataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  12122080 ataattctaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttg 12122158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26749677 - 26749538
Alignment:
Q  72 caaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtact 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||| ||||||  |   ||||||| ||||| ||    |||||    
T  26749677 caaggaggtcttagcgaaattttatgaaaattccgcataactatttataggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagctttt-gtact 26749579  T
Q  172 atgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgtt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  26749578 atgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26749538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30612108 - 30611973
Alignment:
Q  80 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 179  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||  |   ||||||  |||||||| |  ||||||||||||     
T  30612108 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttgtaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaaacttgt-gtactatgagttg 30612010  T
Q  180 aattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30612009 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 30611973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30614068 - 30613933
Alignment:
Q  80 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |  |||  ||||| || |  ||||||||||||     
T  30614068 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctttaaaattcaaagcttg-tgtactatgagttg 30613970  T
Q  180 aattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30613969 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 30613933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 10732528 - 10732626
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  10732528 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 10732626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29351500 - 29351402
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| | ||| |||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  29351500 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29351402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31479005 - 31478801
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||  ||||  |||||| |  |||||  ||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  31479005 tgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttagattttgatttatgatgaaaatactaca-gtaggtcttggtgaaattttacgaaa 31478907  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||  |||||  |  ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||   |||    
T  31478906 attcagcataaccatttttaagtgaactcaaaagctatggtttggttccaaaactcaaaacttg-agtactaggagtttaattatgatgtttaagagtat 31478808  T
Q  201 ttaacct 207  Q
    |||||||    
T  31478807 ttaacct 31478801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29346553 - 29346456
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| | ||| |||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  29346553 gttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29346456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29349026 - 29348929
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| | ||| |||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  29349026 gttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29348929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 42244955 - 42245051
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  42244955 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 42245051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 20909586 - 20909540
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20909586 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 20909540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 23065088 - 23065046
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttt 43  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  23065088 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttt 23065046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 7528489 - 7528421
Alignment:
Q  9 ttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaagga 77  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| || ||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  7528489 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaagga 7528421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4669 - 4441
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4669 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 4570  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcca----aacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatg 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4569 attcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 4470  T
Q  197 atatttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4469 gtatttaacctatgttgtgagttggtcct 4441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4669 - 4441
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4669 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 4570  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcca----aacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatg 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4569 attcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 4470  T
Q  197 atatttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4469 gtatttaacctatgttgtgagttggtcct 4441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6093 - 5869
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6093 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 5994  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||    
T  5993 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 5894  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  5893 ttaacatatgttgtgagttggtcct 5869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 133)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 14641968 - 14642186
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14641968 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 14642067  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  14642068 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 14642167  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14642168 taacctatgttgtgagttg 14642186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16979545 - 16979321
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16979545 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttataaaa 16979446  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  16979445 attcagcatgaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 16979346  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16979345 ttaacctatgttgtgagttggtcct 16979321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 6805378 - 6805599
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6805378 tgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgatttctggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcctagtgaaatcttatgaaa 6805477  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  6805478 attcagcataactgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtat 6805577  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6805578 ttaacctatgttgtgagttggt 6805599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 2248387 - 2248611
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2248387 tgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 2248486  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  2248487 attcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 2248586  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  2248587 ttaacccatgttgtgagttgatcct 2248611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 3394419 - 3394638
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394419 tgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 3394518  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  3394519 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtat 3394618  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  3394619 ttaacccatgttgtgagttg 3394638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6159032 - 6158813
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6159032 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatgtttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 6158933  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  6158932 attcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 6158833  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6158832 ttaacctatgttgtgagttg 6158813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 10833756 - 10833975
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10833756 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 10833855  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  10833856 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 10833955  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  10833956 ttaacccatgttgtgagttg 10833975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11192715 - 11192501
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11192715 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttttt-tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttatgaaa 11192617  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  11192616 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 11192517  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  11192516 ttaacctatgttgtga 11192501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10563343 - 10563125
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10563343 gttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaacatactcaaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 10563244  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  10563243 ttcagtataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 10563144  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10563143 taacctatgttgtgagttg 10563125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12276183 - 12275965
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12276183 gttagctttccaatgactttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 12276084  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||    
T  12276083 ttcagcataaccatttctaagttaagccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtt 12275984  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  12275983 taacccatgttgtgagttg 12275965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40807630 - 40807416
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40807630 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 40807531  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  40807530 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 40807431  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  40807430 taacctatgttgtga 40807416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40812467 - 40812253
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40812467 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 40812368  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  40812367 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 40812268  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||| ||||    
T  40812267 taacctatgtggtga 40812253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 8928082 - 8928306
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8928082 tgttagatttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 8928181  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  8928182 attcagcataaccatttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 8928281  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  8928282 ttaacccatgttgtgagttgatcct 8928306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 24152861 - 24153085
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24152861 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 24152960  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||     
T  24152961 attcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtctaagagtac 24153060  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  24153061 ttaacccatgttgtgagttgatcct 24153085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 5206072 - 5206286
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5206072 gttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 5206171  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  5206172 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattatggtgtttaagattatt 5206271  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  5206272 taacctatgttgtga 5206286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 13029709 - 13029915
Alignment:
Q  17 gctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatt 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13029709 gctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatt 13029808  T
Q  117 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  13029809 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13029908  T
Q  217 gttggtc 223  Q
    |||||||    
T  13029909 gttggtc 13029915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14441802 - 14441588
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14441802 gttagttttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 14441703  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  14441702 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 14441603  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  14441602 taacctatgttgtga 14441588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 50351417 - 50351630
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50351417 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 50351516  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  50351517 attcagcataaccatttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtat 50351616  T
Q  201 ttaacctatgttgt 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  50351617 ttaacatatgttgt 50351630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 179124 - 179343
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  179124 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaataccccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 179223  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  179224 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttgaattaaggtgtttaacagtat 179323  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  179324 ttaatccatgttgtgagttg 179343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 13026117 - 13026323
Alignment:
Q  17 gctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatt 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13026117 gctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatt 13026216  T
Q  117 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  13026217 tctaagttaatccaaaaattatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13026316  T
Q  217 gttggtc 223  Q
    |||||||    
T  13026317 gttggtc 13026323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 54875901 - 54876115
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54875901 gttagctttccagtggagttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaa 54876000  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  54876001 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 54876100  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  54876101 taacctatgttgtga 54876115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 43550101 - 43550318
Alignment:
Q  8 tttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43550101 tttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagc 43550200  T
Q  108 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacct 207  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  43550201 ataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccc 43550300  T
Q  208 atgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  43550301 atgttgtgagttgatcct 43550318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50243361 - 50243144
Alignment:
Q  8 tttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 107  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50243361 tttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagc 50243262  T
Q  108 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacct 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  50243261 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccc 50243162  T
Q  208 atgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  50243161 atgttgtgagttgatcct 50243144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37038452 - 37038234
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaa-tactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37038452 ttagcttttcaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaaatactccagagaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 37038353  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||    
T  37038352 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatt 37038253  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  37038252 taacctatgttttgagttg 37038234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 35961304 - 35961528
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35961304 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 35961403  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  35961404 aattagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 35961503  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35961504 ttaacctatgttgtgagttggtcct 35961528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 1988649 - 1988868
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1988649 tgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgcaattttatgaaa 1988748  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||   | |    
T  1988749 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataactactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgt 1988848  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  1988849 ttaaccaatgttgtgagttg 1988868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6819744 - 6819525
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6819744 tgttagctttccaatgactttggtttgacatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 6819645  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  6819644 attaaggataaccgtttctaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaagctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 6819545  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  6819544 ttaatctatgttgtgggttg 6819525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 10989221 - 10989439
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989221 tgttagctttccaatggctttggtctgacatgaaaataatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 10989319  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  10989320 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 10989419  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  10989420 ttaatccatgttgtgagttg 10989439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16643639 - 16643416
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16643639 gttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttatagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 16643540  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  16643539 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 16643440  T
Q  202 taacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||    
T  16643439 taatccatgttgtgagttgatcct 16643416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 17685261 - 17685475
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17685261 gttagctttccagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17685360  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||   ||||    
T  17685361 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgaattcaattagggtgtttaagagtatt 17685460  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    ||| |||| ||||||    
T  17685461 taatctatcttgtga 17685475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11913356 - 11913163
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11913356 tgttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaa 11913257  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11913256 attcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaa 11913163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 13522827 - 13523047
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13522827 tgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgagaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 13522926  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatcc-aaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  13522927 attcagcataatcatttctaagttaatccaaaaacttatgcgataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 13523026  T
Q  200 tttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  13523027 tttaacccatgttgtgagttg 13523047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 42324638 - 42324857
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  42324638 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatataatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaa 42324737  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  42324738 attcagtataaccatttctaagttagtcaaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 42324837  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  42324838 ttaacccatgttgtgagttg 42324857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 2841881 - 2842094
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2841881 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 2841980  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  2841981 ttcagcataacc-gttccaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 2842079  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  2842080 taacctatgttgtga 2842094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14508481 - 14508268
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14508481 gttagctttcctatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 14508382  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  14508381 ttcagcataaccgttt-taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 14508283  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  14508282 taacctatgttgtga 14508268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17693702 - 17693488
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||   |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17693702 gttagttttccaatggctttggtttgatgtgaaagttatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17693603  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  17693602 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatt 17693503  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  17693502 taacctatgttgtga 17693488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 31224370 - 31224588
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31224370 tgttagctttctagtggtattggtttcacttgaaaatgatttttggtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 31224469  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatga-ta 199  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||    
T  31224470 tttcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgttttaagagta 31224569  T
Q  200 tttaacctatgttgtgagt 218  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  31224570 tttaacccatgctgtgagt 31224588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 35064999 - 35065212
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35064999 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcccatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 35065098  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  35065099 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatt-caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 35065197  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  35065198 taacctatgttgtga 35065212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 17519292 - 17519505
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17519292 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 17519391  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||    
T  17519392 tcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtattt 17519491  T
Q  203 aacctatgttgtga 216  Q
    ||| ||||||||||    
T  17519492 aacatatgttgtga 17519505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 17534154 - 17534367
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17534154 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 17534253  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||    
T  17534254 tcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtattt 17534353  T
Q  203 aacctatgttgtga 216  Q
    ||| ||||||||||    
T  17534354 aacatatgttgtga 17534367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 55292058 - 55292275
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55292058 tgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaa 55292157  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  55292158 attcagcataaccctttttaagttaacccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaaaagtat 55292257  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  55292258 ttaacccatgttatgagt 55292275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 17670127 - 17670319
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17670127 gttagcttttcagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17670226  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17670227 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttcaattagggtgtttaa 17670319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44274078 - 44273894
Alignment:
Q  32 gaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44274078 gaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaa 44273979  T
Q  132 aacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  44273978 aacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgtga 44273894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17538725 - 17538527
Alignment:
Q  18 ctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 117  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17538725 ctttggtttgacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacctttt 17538626  T
Q  118 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17538625 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17538527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 50348444 - 50348654
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  50348444 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaatcttatgaaaa 50348543  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||   ||||    
T  50348544 ttcagtataaccatttctaagttaatccaaaactcatgggataattccaaacctcaaaactataagtactaggggtttaattaaggggtttaagagtatt 50348643  T
Q  202 taacctatgtt 212  Q
    |||||||||||    
T  50348644 taacctatgtt 50348654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10554902 - 10554685
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10554902 tgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 10554803  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||    
T  10554802 attcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtat 10554703  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  10554702 ttaacccatgttatgagt 10554685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14966635 - 14966418
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14966635 ttagcttttcaatgacattggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaat 14966536  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||    
T  14966535 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattctaaacctaaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtattt 14966436  T
Q  203 aacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||||||| |||||||    
T  14966435 aacctatgttatgagttg 14966418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 18367177 - 18367394
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18367177 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatatttcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaat 18367276  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  18367277 tcagtataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaagctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18367376  T
Q  203 aacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| |||||||||||||    
T  18367377 aacccatgttgtgagttg 18367394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33564764 - 33564555
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33564764 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 33564665  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||    
T  33564664 attcagcctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataattccaatcctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 33564565  T
Q  201 ttaacctatg 210  Q
    ||||||||||    
T  33564564 ttaacctatg 33564555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 43889217 - 43889402
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  43889217 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 43889316  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagg 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43889317 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagg 43889402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17044600 - 17044392
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17044600 gttagatttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 17044501  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   ||||    
T  17044500 ttcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaaatactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatt 17044401  T
Q  202 taacctatg 210  Q
    |||||||||    
T  17044400 taacctatg 17044392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18889999 - 18889783
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18889999 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatgtttgagttatgatggaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 18889900  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  18889899 attccgcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatagttccaaggctcaaatctagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 18889800  T
Q  201 ttaacctatgttgtgag 217  Q
    |||||| ||||||||||    
T  18889799 ttaacccatgttgtgag 18889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35354236 - 35354019
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgat---ttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35354236 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagatcttagtgaaatcttatga 35354137  T
Q  99 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||   |    
T  35354136 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactgggagtttaattaaggggtttaagagt 35354037  T
Q  199 atttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35354036 atttaacctatgttgtga 35354019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 15931925 - 15932139
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15931925 gttagctttccagtggccttggtttgatgtgcaaatgattttgggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 15932024  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  15932025 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 15932124  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    | | |||||||||||    
T  15932125 tcatctatgttgtga 15932139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 53646477 - 53646670
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  53646477 tgttagatttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttgttttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 53646576  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  53646577 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaa 53646670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13519918 - 13519702
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| | || |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13519918 tgttagctttctattgactttcgtttgacttgaaattgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 13519819  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||   ||    
T  13519818 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttgattaagggggtttaagagta 13519719  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  13519718 tttaacctatgttgtga 13519702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17513196 - 17513024
Alignment:
Q  20 ttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttct 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17513196 ttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttct 17513097  T
Q  120 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 192  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17513096 aagttaatccaaaacttattgaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgttt 17513024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18893259 - 18893067
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18893259 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 18893160  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttta 193  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18893159 attcagcagaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactacaagtaatatgagtttaattaaggtgttta 18893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 20248401 - 20248608
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20248401 tgttagttttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 20248500  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  20248501 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaaaagtat 20248600  T
Q  201 ttaaccta 208  Q
    ||||||||    
T  20248601 ttaaccta 20248608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19444146 - 19443941
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  19444146 tgttagcttcccaatggctttggtttgacatgaaagtgatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttattaaaattttatgaaa 19444047  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  19444046 attcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagaatat 19443947  T
Q  201 ttaacc 206  Q
    ||||||    
T  19443946 ttaacc 19443941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42162 - 41938
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| |  |||||| |||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42162 tgttagctttccaatgactctggtttggcatgaaaataatttttagtttaagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 42063  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||    
T  42062 attcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 41963  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  41962 ttaacctaagttgtgagttggtcct 41938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 38311420 - 38311628
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38311420 tgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 38311519  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc-aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||    
T  38311520 attcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagta 38311619  T
Q  200 tttaaccta 208  Q
    |||||||||    
T  38311620 tttaaccta 38311628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43928986 - 43928775
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   |||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43928986 tgttagctttccaatggctttgatttgatctgaaaataatttttaatttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 43928887  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  43928886 attcagcataatcatttctaagttgatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtat 43928787  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||| ||||||    
T  43928786 ttaacatatgtt 43928775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12511482 - 12511268
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12511482 gttagatttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 12511383  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  12511382 ttcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 12511283  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| | ||||||||    
T  12511282 taacatgtgttgtga 12511268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 22307001 - 22307215
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22307001 gttatctttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttgattattgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttactgaaatcctatgaaaa 22307100  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  22307101 ttcagcataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 22307200  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| ||||||||||    
T  22307201 taacttatgttgtga 22307215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12470431 - 12470222
Alignment:
Q  7 ctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 106  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12470431 ctttctagtggctttgatttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 12470332  T
Q  107 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacc 206  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||||||     
T  12470331 cataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaaca 12470232  T
Q  207 tatgttgtga 216  Q
    | ||||||||    
T  12470231 tgtgttgtga 12470222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9533764 - 9533545
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  9533764 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 9533665  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  9533664 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 9533565  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  9533564 ttaacccatgttgtgagttg 9533545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 10541875 - 10542090
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10541875 tgttatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatcatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 10541974  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||    
T  10541975 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtat 10542074  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| | ||||||||    
T  10542075 ttaacatgtgttgtga 10542090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14519897 - 14519683
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14519897 tgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 14519798  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  14519797 attctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 14519699  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  14519698 ttaacctatgttgtga 14519683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 14763378 - 14763597
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  14763378 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 14763477  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  14763478 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 14763577  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  14763578 ttaacccatgttgtgagttg 14763597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 23371124 - 23371343
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  23371124 tgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 23371223  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  23371224 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 23371323  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  23371324 ttaacccatgttgtgagttg 23371343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3803470 - 3803258
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| |  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3803470 tgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 3803371  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  3803370 attcagcaaaaccgtttctaagttaatcaaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtat 3803271  T
Q  201 ttaacctatgttg 213  Q
    |||||||||||||    
T  3803270 ttaacctatgttg 3803258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 18699891 - 18700105
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18699891 gttagatttccagtggctttaatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 18699990  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||  |||||   ||||    
T  18699991 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttggaataattccaaacctcaaaactagaagtgctaggagtttagttaagggatttaagagtatt 18700090  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| | ||||||||    
T  18700091 taacatgtgttgtga 18700105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49900370 - 49900148
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49900370 gttagcttttcagtggatttggtttgacgtgaaaatggtttttggttattgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 49900271  T
Q  102 ttcagcataacc--------atttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttta 193  Q
    ||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  49900270 ttcagcataaccgtttctaagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactagaagtttaattaaggatttta 49900171  T
Q  194 atgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |   |||||||||||||| ||||    
T  49900170 agagtatttaacctatgtggtga 49900148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6156340 - 6156126
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6156340 tgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 6156241  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  6156240 atttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 6156142  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  6156141 ttaacctatgttgtga 6156126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14671459 - 14671244
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14671459 tgttagctttccagtggtgtcgatttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 14671360  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||    
T  14671359 attcagcataactgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtat 14671260  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| | ||||||||    
T  14671259 ttaacatgtgttgtga 14671244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 41172788 - 41173003
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41172788 gttagctttccagcggctttcgtttgacgtgaaaacaattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 41172887  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||   |||    
T  41172888 ttcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtat 41172987  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  41172988 ttaacctatgttgtga 41173003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 50755799 - 50756013
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50755799 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggtggtcttagtgaaattttatgaaa 50755898  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  50755899 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 50755997  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  50755998 ttaacctatgttgtga 50756013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 9511583 - 9511797
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9511583 tgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 9511682  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat-tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||  | ||||||| |||||||| |  |||||||||| | |||||||||| ||||   ||    
T  9511683 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg-atcgtctccaaacttcaaaacttgt-gtactatgagattaattaaggtgcttaagagta 9511780  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  9511781 tttaacctatgttgtga 9511797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 9519558 - 9519772
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9519558 tgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 9519657  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat-tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||  | ||||||| |||||||| |  |||||||||| | |||||||||| ||||   ||    
T  9519658 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg-atcgtctccaaacttcaaaacttgt-gtactatgagattaattaaggtgcttaagagta 9519755  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  9519756 tttaacctatgttgtga 9519772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16324958 - 16325182
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16324958 tgttatctttccaatggatttggtttggcgtgaaaatgatttatggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 16325057  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||    
T  16325058 atttagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatcggataatttcaaggctaaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttatgaatat 16325157  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||    
T  16325158 ttatcctaagttgtgagttggtcct 16325182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 14152816 - 14153031
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  14152816 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaaagaattttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaacttttatgaaa 14152915  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||    
T  14152916 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 14153015  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  14153016 ttaacctatgttgtga 14153031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51301030 - 51300811
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  51301030 tgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 51300931  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||   |||    
T  51300930 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtat 51300831  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  51300830 ttaacccatgttgtgagttg 51300811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 54330723 - 54330937
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54330723 tgttagctttccagtggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 54330822  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  54330823 attccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 54330921  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  54330922 ttaacctatgttgtga 54330937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24546475 - 24546257
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||      
T  24546475 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 24546376  T
Q  99 --aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatg 196  Q
      |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||  |   ||||||| ||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||      
T  24546375 ttaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 24546277  T
Q  197 atatttaacctatgttgtga 216  Q
     |||||||||||||||||||    
T  24546276 gtatttaacctatgttgtga 24546257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Original strand, 14567651 - 14567800
Alignment:
Q  23 gtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaag 122  Q
    |||||| | ||||||||  ||| || |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14567651 gtttgaattgaaaatgacatttagtttttgatttatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 14567750  T
Q  123 ttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacta 172  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14567751 ttaatccaaaacttatgaaataattccaaacctcaaaactagaagtacta 14567800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17046760 - 17046631
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17046760 gttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 17046661  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaa 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17046660 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaa 17046631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5223716 - 5223572
Alignment:
Q  50 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 149  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5223716 ttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgggataatacc 5223617  T
Q  150 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5223616 aaccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaa 5223572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15465453 - 15465343
Alignment:
Q  84 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15465453 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 15465354  T
Q  184 aaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||    
T  15465353 aaggtgtttaa 15465343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15566148 - 15565935
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15566148 tgttagctttccagtggcatcagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaattttatgaaa 15566049  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  15566048 atttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-ctatttactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 15565950  T
Q  201 ttaacctatgttgtg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  15565949 ttaacctatgttgtg 15565935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 194
Target Start/End: Original strand, 26055128 - 26055238
Alignment:
Q  84 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26055128 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 26055227  T
Q  184 aaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||    
T  26055228 aaggtgtttaa 26055238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5215281 - 5215156
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5215281 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaa 5215182  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaat 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  5215181 ttcagcataaccgtttctaagttaat 5215156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 25104620 - 25104832
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  25104620 tgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaa-tgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttacgaaa 25104718  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||  |  |||||||| |||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  25104719 attccgcataactatttccaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactatcagttcaattaaggtgtttaagagtat 25104817  T
Q  201 ttaacctatgttgtg 215  Q
    ||||| |||||||||    
T  25104818 ttaacttatgttgtg 25104832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17207975 - 17207766
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17207975 tgttagctttccagtggctttggttttaattgcaaatgaattttggt-tttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatgttatgaaa 17207877  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||   |||    
T  17207876 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttattgattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaaataaggtgtttaagagtat 17207778  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  17207777 ttaacctatgtt 17207766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12952669 - 12952462
Alignment:
Q  8 tttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||    
T  12952669 tttccattggctttggtttgacttgaaactgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaatcccgc 12952570  T
Q  108 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacct 207  Q
    ||||| ||||| |||| || ||||||||||| |  |   ||||||| ||||| || |  || ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  12952569 ataactatttcaaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaatcttg-tgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 12952471  T
Q  208 atgttgtga 216  Q
    |||||||||    
T  12952470 atgttgtga 12952462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17938161 - 17938022
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17938161 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttacgaaa 17938062  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||    
T  17938061 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatgg 17938022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22652409 - 22652243
Alignment:
Q  58 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| |||    
T  22652409 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttca 22652310  T
Q  158 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    || || |  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22652309 aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcct 22652243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 51603017 - 51603127
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51603017 tgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 51603116  T
Q  101 attcagcataa 111  Q
    |||||| ||||    
T  51603117 attcagtataa 51603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18739530 - 18739391
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18739530 tgttagctttccaatggctttggtttcactttaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaa 18739431  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||    
T  18739430 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatgg 18739391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15465729 - 15465631
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15465729 tgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15465631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 19568828 - 19568941
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  19568828 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcttagtgaaatcttagcaaa 19568927  T
Q  101 attcagcataacca 114  Q
    |||||| |||||||    
T  19568928 attcagtataacca 19568941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5223958 - 5223860
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5223958 tgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgcgatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 5223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 46723043 - 46723149
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  46723043 tgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactaaaatcttatgaaa 46723142  T
Q  101 attcagc 107  Q
    |||||||    
T  46723143 attcagc 46723149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 225
Target Start/End: Original strand, 52989492 - 52989599
Alignment:
Q  118 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  52989492 ctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgag 52989591  T
Q  218 ttggtcct 225  Q
    ||| ||||    
T  52989592 ttgatcct 52989599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11258986 - 11258887
Alignment:
Q  117 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11258986 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11258887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 26054852 - 26054950
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26054852 tgttagctttccagtggcttcggttttacatgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 26054950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12305697 - 12305599
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12305697 tgttagctttccaatgactttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12305599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14682841 - 14682743
Alignment:
Q  118 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||||||| | ||||||||    
T  14682841 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 14682743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 14647520 - 14647609
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 90  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14647520 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 14647609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 22764048 - 22764145
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||    
T  22764048 gttagcttttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaatttttatgaa 22764145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 8631377 - 8631257
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  8631377 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgttgaaaacactccaaggagatcttattgaaattttacgaaa 8631278  T
Q  101 attcagcataaccatttctaa 121  Q
    |||| | ||||| | ||||||    
T  8631277 attccgtataactaattctaa 8631257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 29544431 - 29544527
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  29544431 ttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaatttttatgaa 29544527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 54521397 - 54521309
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 89  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521397 tgttagctttccaatggctttaattttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 54521309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 36528148 - 36528062
Alignment:
Q  5 agctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36528148 agctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgattcttggtgtttgatttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaat 36528062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11259064 - 11258984
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11259064 gttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 11258984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 13436873 - 13436799
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaag 75  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13436873 tgttagctttccaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaag 13436799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Original strand, 19568940 - 19569000
Alignment:
Q  156 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19568940 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19569000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8023857 - 8023718
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||||| | |  |||||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||| ||| | | ||||    
T  8023857 tgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtaggttttggtgcaatttaacgaaa 8023758  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  8023757 atttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatgg 8023718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 11986837 - 11986912
Alignment:
Q  15 tggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 90  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11986837 tggctttggtttgacttgaaaatgatctttagtttttgagttatgatgaaaatactacaagggggtcttagtgaaa 11986912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 3264727 - 3264817
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 91  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3264727 tgttagcttcccagtggccatggtttgacgtgaaaatgatttttgatgtttgatttgtgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaat 3264817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 28848209 - 28848307
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28848209 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28848307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15978107 - 15978009
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  | |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15978107 tgttagctttccaatggctttggtggggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15978009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6002582 - 6002443
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||| |||   ||    
T  6002582 tgttatctttccaatggcgttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttggggaaattttaaagaa 6002483  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    ||| |||||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  6002482 atttagcataactatttccaagtcattccaatacttatgg 6002443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 7780934 - 7781032
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| || |||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7780934 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttctggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 7781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 89
Target Start/End: Original strand, 16453869 - 16453955
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 89  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16453869 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaa 16453955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 10247312 - 10247409
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | || | |||| | ||| |||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  10247312 gttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgtgttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 10247409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18893063 - 18893009
Alignment:
Q  163 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgag 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  18893063 agaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgag 18893009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 34159900 - 34159854
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34159900 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 34159854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 40039761 - 40039900
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||   ||||| ||| | ||    
T  40039761 tgttatcttttcaatggatttggtttgacttgaaaatattttatggattttgagttatgatgaaaacacttcaagagggtcttgaagaaattttaaggaa 40039860  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    | | |||||||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  40039861 acttagcataactatttccaagtcaacccaaaacttatgg 40039900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 17463752 - 17463706
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17463752 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 17463706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 55477065 - 55477023
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttt 43  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  55477065 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttt 55477023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17046630 - 17046582
Alignment:
Q  168 tactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17046630 tactattagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17046582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 216
Target Start/End: Original strand, 42353218 - 42353306
Alignment:
Q  129 caaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||| || ||||||   |||||||| ||||||||||    
T  42353218 caaaacttagggaataattctaaacctcaaaacaaaaagtattaggagtttaattaagggagtttaagagtatttaacgtatgttgtga 42353306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 3359 - 3579
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3359 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttctgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaa 3458  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3459 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtat 3558  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttgg 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3559 ttaacctatgttgtgagttgg 3579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 54 - 11
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgattttt 44  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttt 11  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21716 - 21492
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21716 tgttagctttccagtggctttggtttaacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 21617  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  21616 atccagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 21517  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  21516 ttcacctatgttgtgagttggtcct 21492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 123977 - 124182
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||||  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  123977 tgttagcattccaatggctttgaattgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaatgaggtgttagtgaaatcttatgaaa 124076  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  124077 attcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatat 124176  T
Q  201 ttaacc 206  Q
    ||||||    
T  124177 ttaacc 124182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 146362 - 146152
Alignment:
Q  6 gctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  146362 gctttccagtggctttggtttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattca 146263  T
Q  106 gcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaac 205  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||     
T  146262 gaataacagtttctaagttaatccaaaacatatgtaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaat 146163  T
Q  206 ctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||    
T  146162 ctatgttgtga 146152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 111122 - 110903
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  111122 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 111023  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  111022 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 110923  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  110922 ttaacccatgttgtgagttg 110903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 46198142 - 46198366
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46198142 tgttagctttccggtgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttaatgaaatcttatgaaa 46198241  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  46198242 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 46198341  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  46198342 ttaacctatattgtgagttggtcct 46198366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 50001109 - 50000886
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50001109 tgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 50001010  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatcc-aaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  50001009 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaaacttatgagataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 50000910  T
Q  200 tttaacctatgttgtgagttggtc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  50000909 tttaacctatgttgtgagttggtc 50000886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 29764051 - 29764279
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29764051 tgttagctttccagtggatttggtttaacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 29764150  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcca----aacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatg 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29764151 attcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 29764250  T
Q  197 atatttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29764251 gtatttaacctatgttgtgagttggtcct 29764279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 21239713 - 21239927
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239713 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 21239812  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  21239813 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatttt 21239912  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  21239913 taacctatgttgtga 21239927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 44822539 - 44822758
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44822539 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 44822638  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||    
T  44822639 attcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataattccaaacctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggggtttaagagtat 44822738  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44822739 ttaacctatgttgtgagttg 44822758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 8276409 - 8276628
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8276409 tgttagctttccaatggctttggtttggcttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaa 8276508  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||   |||    
T  8276509 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagtactataggttcaattaaggcgtttaagagtat 8276608  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8276609 ttaacctatgttgtgagttg 8276628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16401303 - 16401084
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401303 tgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgacttttagtgtttgagatatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 16401204  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16401203 attcagcaaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtat 16401104  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  16401103 ttaacccatgttttgagttg 16401084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 2332627 - 2332851
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  2332627 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 2332726  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  2332727 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 2332826  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  2332827 ttaacccatgttgtgagttgatcct 2332851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 20031307 - 20031531
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20031307 tgttagctttccaatgtttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaatggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 20031406  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  20031407 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaggagtat 20031506  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  20031507 ttaacccatgttgtgagttgatcct 20031531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21180742 - 21180961
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21180742 tgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 21180841  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  21180842 tttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaattcttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 21180941  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  21180942 ttaacccatgttgtgagttg 21180961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 41227122 - 41227336
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41227122 gttagctttccagtggctttggtttgacgcgaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 41227221  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   ||||    
T  41227222 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatt 41227321  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  41227322 taacctatgttgtga 41227336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 16058732 - 16058946
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16058732 gttagctttccagtggctttgatttgacgagaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaa 16058831  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  16058832 ttcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagattatt 16058931  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    ||| |||||||||||    
T  16058932 taagctatgttgtga 16058946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 41225869 - 41226083
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41225869 gttagctttccagtggctttggattgacgagaaaatgatttttagttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 41225968  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   ||||    
T  41225969 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatt 41226068  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  41226069 taacctatgttgtga 41226083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42912684 - 42912470
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42912684 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 42912585  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||||    
T  42912584 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtatt 42912485  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||  ||||||||||    
T  42912484 taatatatgttgtga 42912470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24815269 - 24815488
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24815269 tgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 24815368  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  24815369 attcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattctaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 24815468  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  24815469 ttaacccatgttgtgagttg 24815488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28312983 - 28312764
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28312983 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 28312884  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  28312883 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 28312784  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  28312783 ttaacccatgttgtgagttg 28312764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51323910 - 51323695
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51323910 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 51323811  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  51323810 attccgcataactatttctaagtcaattcaaaacttatggaataactccaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 51323711  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  51323710 ttaacatatgttgtga 51323695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 22130482 - 22130700
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22130482 tgttagctttccaatggaattggtttgatttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 22130581  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  22130582 attcagcataatcttttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 22130681  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagtt 219  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  22130682 ttaacccatgttgtgagtt 22130700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 38057068 - 38057286
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38057068 tgttagctttctagtggctttcgtttaacttgcaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagggggtattagtgaaatcttatgaaa 38057167  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  38057168 attcagtataaccatttctaagttaatacaaaacttatgggattattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtat 38057267  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagtt 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38057268 ttaacctatgttgtgagtt 38057286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22350222 - 22350030
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22350222 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatcatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 22350123  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22350122 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaa 22350030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20588313 - 20588099
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  20588313 gttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaa 20588214  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  20588213 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 20588114  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  20588113 taacctatgttgtga 20588099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20592851 - 20592637
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  20592851 gttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaa 20592752  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  20592751 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 20592652  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  20592651 taacctatgttgtga 20592637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 21046467 - 21046681
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21046467 gttaggtttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaataatccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaa 21046566  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||    
T  21046567 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgggttcaattagggtgtttaagtgtatt 21046666  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  21046667 taacctatgttgtga 21046681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12710523 - 12710308
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12710523 tgttagctttccagtggcgttggtttgacttacaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaaa 12710424  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  12710423 attcagcataaccgtttctaagtcaatccgaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 12710324  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  12710323 ttaacctatgttgtga 12710308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 4596263 - 4596477
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4596263 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 4596362  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| || |||| ||||   ||||    
T  4596363 ttcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtaatataggttcaactagggtgcttaagagtatt 4596462  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  4596463 taacctatgttgtga 4596477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19676345 - 19676131
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19676345 gttagctttccagtggttttagttggacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 19676246  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  19676245 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 19676146  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||  ||||||||||    
T  19676145 taatatatgttgtga 19676131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 296990 - 296771
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  296990 tgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttgatttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaa 296891  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||    
T  296890 attcagcacaaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttacgagtat 296791  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  296790 ttaatccatgttgtgagttg 296771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 7792269 - 7792484
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7792269 tgttagatttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 7792368  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    ||    
T  7792369 attcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatgtgagttcaattaaggtgtttaagagcat 7792468  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||| |||||||||    
T  7792469 ttaacccatgttgtga 7792484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 13881034 - 13881257
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13881034 gttagctttacagtggttttggtttgacttggaaatgatttttagtttttgtgatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 13881133  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  13881134 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactaaaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 13881233  T
Q  202 taacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||    
T  13881234 taacccatgttgtgagttgatcct 13881257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 7052472 - 7052688
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7052472 tgttaactttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtattagtgaaattttatgaaa 7052571  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaatgata 199  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||   ||    
T  7052572 attctgcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagta 7052671  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  7052672 tttaacctatgttgtga 7052688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 23194968 - 23195159
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23194968 tgttagctttccaatgactttggtttaacttgaaaatgacttttagtgtttgagttatgataaaaatactcctaagaggtcttagtgaaatcttatgaaa 23195067  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 192  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23195068 attcagcataaccctttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgttt 23195159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51082845 - 51082636
Alignment:
Q  7 ctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 106  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  51082845 ctttccagtggcgtaggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttaagaaaattcag 51082746  T
Q  107 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacc 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||| |||||    
T  51082745 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacc 51082646  T
Q  207 tatgttgtga 216  Q
    ||||||||||    
T  51082645 tatgttgtga 51082636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 20437644 - 20437860
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20437644 tgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaa 20437743  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  20437744 attcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggcttaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 20437843  T
Q  201 ttaacctatgttgtgag 217  Q
    |||||| ||||||||||    
T  20437844 ttaacccatgttgtgag 20437860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 20634052 - 20634267
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20634052 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 20634151  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag-gtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||   |||    
T  20634152 ttcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaacttggagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagagggtttaagagtat 20634251  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  20634252 ttaacctatgttgtga 20634267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 14238029 - 14238244
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14238029 tgttagcttttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 14238128  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||    
T  14238129 attcagcataactgtttctgagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 14238228  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
     |||||||||||||||    
T  14238229 ctaacctatgttgtga 14238244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22823824 - 22824038
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22823824 tgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 22823923  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  22823924 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattat 22824022  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  22824023 ttaacctatgttgtga 22824038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 38887504 - 38887720
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38887504 tgttagctttcgaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttgatttttgaggtatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 38887603  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||   ||    
T  38887604 attcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattacaaaactcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagta 38887703  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  38887704 tttaacctatgttgtga 38887720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45496581 - 45496365
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| | || |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45496581 tgttagctttctaatgactttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 45496482  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-tttaatgata 199  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||   ||    
T  45496481 actcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaataatttcaaacctccaaactagaagtactctgagtttaattaaggggatttaagagta 45496382  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  45496381 tttaacctatgttgtga 45496365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 45574469 - 45574682
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||             
T  45574469 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaat--------- 45574559  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
      ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||    
T  45574560 --tcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttaagcgtat 45574657  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  45574658 ttaacccatgttgtgagttgatcct 45574682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16372386 - 16372178
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16372386 tgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaa 16372287  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct-caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||   ||    
T  16372286 attcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctacaaaaataaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagta 16372187  T
Q  200 tttaaccta 208  Q
    |||||||||    
T  16372186 tttaaccta 16372178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50544486 - 50544272
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  50544486 tgttagctttcgggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaa 50544387  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  50544386 attcggcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 50544288  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  50544287 ttaacctatgttgtga 50544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14792979 - 14793189
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14792979 tgttagctttccagtgactttggttggacttgaaaatgatttttggttttagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 14793078  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||  ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  14793079 atttcgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 14793177  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  14793178 ttaacctatgtt 14793189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39060731 - 39060516
Alignment:
Q  1 tgttagctttcca-gtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39060731 tgttagctttccaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaa 39060632  T
Q  100 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||  | ||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   || ||||  |||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  39060631 aatttcgtataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaactccaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagta 39060533  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  39060532 tttaacctatgttgtga 39060516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 24720112 - 24720322
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24720112 gttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatacttcatggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 24720211  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  | |||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  24720212 ttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcagttaaggtgtttaagagtatt 24720310  T
Q  202 taacctatgttg 213  Q
    ||||||||||||    
T  24720311 taacctatgttg 24720322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1643228 - 1643020
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1643228 tgttaactttccaatggctttagtttgacttgaa--tgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 1643131  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  1643130 attccgcataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 1643032  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  1643031 ttaacctatgtt 1643020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 17902179 - 17902393
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  17902179 tgttagctttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggttttcaagttatgatgaaaatactccaaggtggtcttgatgaaattttatgaaa 17902278  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  ||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  17902279 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagc-atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 17902377  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  17902378 ttaacctatgttgtga 17902393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 294624 - 294452
Alignment:
Q  57 atgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggat---------aatt 147  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  294624 atgatggaaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataatt 294525  T
Q  148 ccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  294524 ccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttg 294452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18121238 - 18121025
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18121238 gttagctttctagtggatttggttggacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 18121139  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||  ||||||  ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| |  |  | ||||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  18121138 tttcgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgcactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatt 18121040  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  18121039 taacctatgttgtga 18121025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44892082 - 44891890
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44892082 tgttagatttcccgtggctttggtttgccttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 44891983  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||| ||||||  |   ||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44891982 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaatcttgta-tactatgagtacaattaaggtgtttaa 44891890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6833849 - 6833710
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6833849 tgttagatttctggtggatttggttttaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 6833750  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    |||  | ||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  6833749 atttcgaataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 6833710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 9784760 - 9784898
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||    
T  9784760 tgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttggtgaaattttataaaa 9784859  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatg 139  Q
    ||||  |||||| || || |||| || ||||||||||||    
T  9784860 attccacataactatctccaagtcaacccaaaacttatg 9784898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 21659779 - 21659685
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctta 95  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21659779 tgttagctttccaatggcttcggtttggcatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctta 21659685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 10812786 - 10812876
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 91  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10812786 tgttagctttccagtgcctttggtttgacttagaaatgatttttggtctttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaat 10812876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16656002 - 16655819
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||| | || |||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||| || || ||| ||||| | ||||| || || | ||||||||    
T  16656002 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaa 16655903  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 185  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  16655902 att-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaa 16655819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29535626 - 29535528
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29535626 tgttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 29535528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13227438 - 13227340
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13227438 tgttagctttccaatgactttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 13227340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16362492 - 16362395
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16362492 gttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16362395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21841341 - 21841243
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21841341 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21841243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 21922879 - 21922977
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21922879 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21922977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41373046 - 41372948
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41373046 tgttagatttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41372948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Original strand, 23593322 - 23593409
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttg-actagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 89  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23593322 gttatctttccaatggctttggtttggagta-aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaattactccaaggaggtcttagtgaa 23593409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 13989440 - 13989394
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13989440 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 13989394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 95)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23478715 - 23478491
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478715 tgttacctttccagtggcttgggtttgacttgaaaatgatttttagtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 23478616  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||    
T  23478615 atgcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttcatagtat 23478516  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  23478515 ttaacatatgttgtgagttggtcct 23478491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26454346 - 26454122
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26454346 tgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 26454247  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  26454246 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 26454147  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  26454146 ttaacctatgttgtaagttggtcct 26454122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 41680551 - 41680768
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680551 tgttagctttccaatggctttggattgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 41680650  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  41680651 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 41680750  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41680751 ttaacctatgttgtgagt 41680768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 364423 - 364204
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  364423 tgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 364324  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  364323 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattat 364224  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  364223 ttaatccatgttgtgagttg 364204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 39694945 - 39695164
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39694945 tgttagctttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 39695044  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |    
T  39695045 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgt 39695144  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39695145 ttaacctatgttgtgagttg 39695164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 17460704 - 17460928
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17460704 tgttagtttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 17460803  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  17460804 attcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 17460903  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  17460904 ttaacctatgttgtgagttgatcct 17460928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19882603 - 19882379
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19882603 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 19882504  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  19882503 attcagcataactgtttctaagttaatcccaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagggtat 19882404  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19882403 ttaacctatgttgtgagttggtcct 19882379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 15635597 - 15635816
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15635597 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggcttttgagatataatgaagatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 15635696  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  15635697 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatcctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 15635796  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15635797 ttaacccatgttgtgagttg 15635816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 38185503 - 38185696
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38185503 tgttagctttccaatgactttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 38185602  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38185603 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaa 38185696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 25483891 - 25484115
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25483891 tgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 25483990  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  25483991 attcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 25484090  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  25484091 ttaacccatgttgtgagttgatcct 25484115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44432497 - 44432277
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgattttt-ggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  44432497 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaa 44432398  T
Q  100 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  44432397 aattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 44432298  T
Q  200 tttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  44432297 tttaatccatgttgtgagttg 44432277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 44522843 - 44523062
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44522843 tgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctcatgaaa 44522942  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  44522943 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtat 44523042  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  44523043 ttaatccatgttgtgagttg 44523062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5761167 - 5760953
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5761167 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 5761068  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  5761067 ttcagcataactgtttctaggttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 5760968  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  5760967 taacctatgttgtga 5760953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 18024112 - 18024324
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024112 tgttagctttccaatagctttgatttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 18024211  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  18024212 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggcatagttccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 18024311  T
Q  201 ttaacctatgttg 213  Q
    |||||||||||||    
T  18024312 ttaacctatgttg 18024324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19880463 - 19880239
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||    |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19880463 tgttagcttttcaatggctttggtttggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 19880364  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  19880363 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattggataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 19880264  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  19880263 ttaacctatgttgtaagttggtcct 19880239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17795867 - 17795648
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795867 tgttagctttccaatggcttgggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 17795768  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  17795767 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacaagtat 17795668  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  17795667 ttaatccatgttgtgagttg 17795648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 6102171 - 6102385
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6102171 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgcaaatggtttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 6102270  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||   ||||    
T  6102271 ttcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatatttaagagtatt 6102370  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  6102371 taacctatgttgtga 6102385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19140399 - 19140185
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19140399 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgtgatatgatgcaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 19140300  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  19140299 ttcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaacagtatt 19140200  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  19140199 taacctatgttgtga 19140185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 20178939 - 20179153
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20178939 gttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 20179038  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  20179039 ttcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatt 20179138  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  20179139 taacctatgttgtga 20179153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20454873 - 20454655
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20454873 gttagctttccattggctttcatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaa 20454774  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  20454773 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaacccacaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 20454674  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  20454673 taacccatgttgtgagttg 20454655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20455630 - 20455412
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20455630 gttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaa 20455531  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||    
T  20455530 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatt 20455431  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  20455430 taacccatgttgtgagttg 20455412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20460608 - 20460390
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20460608 gttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaa 20460509  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||    
T  20460508 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatt 20460409  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  20460408 taacccatgttgtgagttg 20460390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 21861038 - 21861250
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21861038 gttagctttctaaaggcttttgtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgctgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 21861137  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  21861138 ttcagcataaccgtttctaagtttatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 21861237  T
Q  202 taacctatgttgt 214  Q
    ||||| |||||||    
T  21861238 taacccatgttgt 21861250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 22237671 - 22237895
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22237671 tgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagagaaatcttaggaaa 22237770  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||   |||    
T  22237771 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattatgttgtttaagagtat 22237870  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||    
T  22237871 ttaacctatgttatgagttgatcct 22237895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32950187 - 32950022
Alignment:
Q  50 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32950187 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 32950088  T
Q  150 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtg 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  32950087 aaagctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtg 32950022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18834106 - 18833898
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18834106 tgttagcttttcagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 18834007  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||    
T  18834006 attcagcataatcgtttctaagttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 18833907  T
Q  201 ttaacctat 209  Q
    |||||||||    
T  18833906 ttaacctat 18833898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 361677 - 361844
Alignment:
Q  49 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  361677 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 361776  T
Q  149 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  361777 caaagctcaaaactaggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 361844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39364159 - 39363968
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  39364159 tgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcgtaggaaa 39364060  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39364059 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgttt 39363968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 39936429 - 39936642
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39936429 gttagctttccggtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 39936528  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||    
T  39936529 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatt 39936627  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  39936628 taacctatgttgtga 39936642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 42266013 - 42266202
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  42266013 gttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctt---aaaa 42266109  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266110 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaagcttatggaataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 42266202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 42818325 - 42818539
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42818325 gttagatttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttaagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaa 42818424  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  42818425 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 42818524  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    ||| ||||| |||||    
T  42818525 taatctatggtgtga 42818539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 6573474 - 6573666
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6573474 tgttagctttccggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgat-tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 6573572  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  6573573 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaggtactaggggttcaattaagttgtttaa 6573666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 19808033 - 19808238
Alignment:
Q  20 ttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttct 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19808033 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatcctctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 19808132  T
Q  120 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagtt 219  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  19808133 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 19808232  T
Q  220 ggtcct 225  Q
    | ||||    
T  19808233 gatcct 19808238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 42559945 - 42560161
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42559945 tgttagcttttcaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 42560044  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  42560045 attcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaagctc-aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 42560143  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
     |||| ||||||||||||    
T  42560144 gtaacttatgttgtgagt 42560161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21579624 - 21579843
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21579624 tgttagatttctagtggctttggtttgactcgaatatgatttttagtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 21579723  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   | |    
T  21579724 atttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaattagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgt 21579823  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21579824 ttaacctatgttgtgagttg 21579843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 27941306 - 27941525
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27941306 tgttagctttccaatggcttcggtgtgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagggaaatcttatgaaa 27941405  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  27941406 attcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaatagtat 27941505  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  27941506 ttaacccatgttgtgagttg 27941525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22207902 - 22207693
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22207902 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttgggttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 22207803  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||   |||    
T  22207802 attcagcataactgtttctaaattaatccaaaacttatggaataattccaaacctgaaaactagaagtatcaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 22207703  T
Q  201 ttaacctatg 210  Q
    ||||||||||    
T  22207702 ttaacctatg 22207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11775326 - 11775133
Alignment:
Q  32 gaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaa 131  Q
    |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11775326 gaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaa 11775227  T
Q  132 aacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11775226 aacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtcct 11775133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 21326356 - 21326569
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21326356 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtgaaatcttatgaaaa 21326455  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| || |||||| |||||||||||||| | ||||||   ||||    
T  21326456 ttcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattaaaagtacaatgagttcaattaaagagtttaagagtatt 21326555  T
Q  202 taacctatgttgtg 215  Q
    ||||||||||||||    
T  21326556 taacctatgttgtg 21326569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 21321758 - 21321971
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  21321758 gttagctttccaatggcttagatttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtaaaatcttatgaaaa 21321857  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||    
T  21321858 ttcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattataagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatt 21321957  T
Q  202 taacctatgttgtg 215  Q
    ||||||||||||||    
T  21321958 taacctatgttgtg 21321971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 5082630 - 5082822
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  5082630 gttagctttccagtggttttggtttaacatgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctgagtgaaattttatgaaaa 5082729  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  5082730 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaa 5082822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20084055 - 20084270
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20084055 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 20084154  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgat-a 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |  | | ||| |    
T  20084155 attcagcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagagaataattccaaacctcaaa-ctagaagtactaggagtttaattaagggggcttaagatta 20084253  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  20084254 tttaacctatgttgtga 20084270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44477059 - 44476851
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |   || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44477059 tgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 44476960  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  44476959 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagta 44476860  T
Q  200 tttaaccta 208  Q
    |||||||||    
T  44476859 tttaaccta 44476851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44480321 - 44480113
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |   || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44480321 tgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 44480222  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  44480221 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagta 44480122  T
Q  200 tttaaccta 208  Q
    |||||||||    
T  44480121 tttaaccta 44480113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 17437736 - 17437950
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17437736 gttagctttccagtggctttggtttgacgtaaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaa 17437835  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || || || |||||||| ||||||   ||||    
T  17437836 ttcagcacaaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataattccaaatctcaaaactagaaataataggattttaattaaggagtttaagagtatt 17437935  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||| ||||    
T  17437936 taacctatgtggtga 17437950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23660849 - 23660688
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23660849 gttagctttacagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 23660750  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaacta 163  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23660749 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaacta 23660688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 29763286 - 29763471
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29763286 tgttagctttctagtgtctttggtttgactcgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 29763385  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 186  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29763386 atttagaataatcatttctaagttaatccgaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaag 29763471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 8728354 - 8728561
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8728354 tgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgaattttagtttaggagttatgatgaaaatactacaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 8728453  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc-aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||    
T  8728454 attcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagta 8728552  T
Q  200 tttaaccta 208  Q
    |||||||||    
T  8728553 tttaaccta 8728561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22483377 - 22483167
Alignment:
Q  5 agctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22483377 agctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 22483278  T
Q  105 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaa 204  Q
     ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  22483277 cgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 22483179  T
Q  205 cctatgttgtga 216  Q
    | ||||||||||    
T  22483178 cttatgttgtga 22483167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22258721 - 22258931
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22258721 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22258820  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  22258821 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 22258919  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    |||| |||||||    
T  22258920 ttaaactatgtt 22258931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 20517535 - 20517746
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20517535 tgttagttttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 20517634  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat-tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||  | ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  20517635 attccgcataactgtttctaagtcaacccaaaacttatgg-atcgtctccaaacttcaaaacttgt-gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 20517732  T
Q  200 tttaacctatgttg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  20517733 tttaacctatgttg 20517746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22344676 - 22344462
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22344676 tgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22344577  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   || |||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||   |||    
T  22344576 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtat 22344478  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  22344477 ttaacctatgttgtga 22344462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22356336 - 22356122
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22356336 tgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22356237  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   || |||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||   |||    
T  22356236 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtat 22356138  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  22356137 ttaacctatgttgtga 22356122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Original strand, 18816886 - 18817093
Alignment:
Q  10 tccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttg--gtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18816886 tccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgc 18816985  T
Q  108 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacct 207  Q
    ||||  |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  18816986 ataattatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacatcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 18817084  T
Q  208 atgttgtga 216  Q
    |||||||||    
T  18817085 atgttgtga 18817093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 4381210 - 4381424
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4381210 tgttagctttctagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttacgataaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 4381309  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||   |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  4381310 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 4381408  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  4381409 ttaacctatgttgtga 4381424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23670283 - 23670073
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  23670283 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttattaaa 23670184  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||   |   ||||||| |||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  23670183 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtatccaaacttcaaagattg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 23670085  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  23670084 ttaacctatgtt 23670073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38989100 - 38988890
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38989100 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 38989001  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  | || ||| |||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  38989000 attccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtat 38988902  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  38988901 ttaacctatgtt 38988890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39020197 - 39019987
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39020197 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 39020098  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  | || ||| |||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  39020097 attccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtat 39019999  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  39019998 ttaacctatgtt 39019987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 14397521 - 14397714
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| | || | |||||||||||  |||||||||| | |   ||||| |||| | ||| |||| || | |||||  |||||||||||||||||    
T  14397521 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaa 14397620  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14397621 attcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaa 14397714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23914558 - 23914381
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| |   || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  23914558 tgttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcctattgaaattttatgaaa 23914459  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 178  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23914458 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaagtagaagtactaggagtt 23914381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 36732942 - 36733133
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  36732942 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttggtgaaattttatgaaaa 36733041  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  36733042 ttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcaattaaggtatttaa 36733133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 17978842 - 17979048
Alignment:
Q  9 ttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  17978842 ttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgagttatgatgaaaatatttcaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgga 17978941  T
Q  109 taaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaaccta 208  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| |||||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17978942 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaaccta 17979040  T
Q  209 tgttgtga 216  Q
    ||||||||    
T  17979041 tgttgtga 17979048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36305293 - 36305079
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36305293 tgttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatggtttttgctttttgagttatgataaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaa 36305194  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||  ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||  |   ||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||   |||    
T  36305193 atttcgcataactatttctaagtaaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagtccaattaagatgtttaagagtat 36305095  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  36305094 ttaacctatgttgtga 36305079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 36405477 - 36405683
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36405477 tgttagctttcccgtggctttgaattgatttgaaaatgatttttgttttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 36405576  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||   |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  36405577 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaatgtgtttaatagtat 36405675  T
Q  201 ttaaccta 208  Q
    ||||||||    
T  36405676 ttaaccta 36405683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24907409 - 24907198
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  24907409 tgttagctttctagtggctttggtttgactttaaaatgatttttgatttttgagttatgacgaaaatactctaaggaggtttgagtgaaattttatgaaa 24907310  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||  || | ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  24907309 attccgcataactaattctaagtcaacccaaaacttat-ggattgtttccaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaagttgtttaagaatat 24907212  T
Q  201 ttaacctatgttgt 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  24907211 ttaacctatattgt 24907198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17501558 - 17501350
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||||||| |  |||||||||||||| || ||| ||||| | ||||| || || | |||||||||     
T  17501558 ttagctttccaatggcttgggtttaacttaaaaatgatttttagattttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaaa 17501459  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||   |||||    
T  17501458 ttagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtattt 17501359  T
Q  203 aacctatgt 211  Q
    |||||||||    
T  17501358 aacctatgt 17501350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 216
Target Start/End: Original strand, 18815279 - 18815454
Alignment:
Q  40 tttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatg 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  18815279 tttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 18815378  T
Q  140 ggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |  |   ||||||| |||||  | |  ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  18815379 gattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18815454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16198469 - 16198371
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16198469 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgattaaaatactccacggaggtcttagtgaaattttatgaa 16198371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21513954 - 21513741
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21513954 tgttagcattctagtggctttggtttggcttgaaaatgatttttgggttttgagatatgatcaaaatactccaa-gaggtcttagtgaaattttatgaaa 21513856  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||| ||||||  |   ||||||| ||||| ||    | ||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  21513855 attctgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 21513757  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  21513756 ttaacatattttgtga 21513741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22474386 - 22474172
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22474386 tgttagctttcccatggctttagtttgacttgaaaacgatttttggtttttgaattatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22474287  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    | ||  |||||  ||||||| || || |||||| ||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  22474286 actccacataattatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtat 22474188  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  22474187 ttaacctatgttgtga 22474172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 225
Target Start/End: Original strand, 8414241 - 8414351
Alignment:
Q  115 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  8414241 tttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgt 8414340  T
Q  215 gagttggtcct 225  Q
    |||||||||||    
T  8414341 gagttggtcct 8414351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21399344 - 21399206
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21399344 gttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaa 21399245  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    ||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  21399244 ttctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 21399206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21793837 - 21793699
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21793837 gttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaa 21793738  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    ||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  21793737 ttctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 21793699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 18118603 - 18118796
Alignment:
Q  23 gtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaag 122  Q
    ||||||||  |||||||||||| |  ||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||| || || | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18118603 gtttgacttaaaaatgatttttagattttgagataagatggaattacaccaagtaggtcttggtaaatttttacgaaaattcagcctaaccgtttctaag 18118702  T
Q  123 ttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacta-tgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    | ||||||||||||||||  |  | |||||| |||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  18118703 tcaatccaaaacttatggtttgttcccaaacttcaaaacttg-agtattagggagttcaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtga 18118796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25757769 - 25757575
Alignment:
Q  19 tttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttc 118  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||  |||||||||||||||||||  ||| |    
T  25757769 tttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaactttatgaaaattcagcataattattcc 25757670  T
Q  119 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgt 214  Q
    |||||||| |||||  ||||||  |  |||||||| |||||| | | |||| || ||||| |||||||  ||||||   |||||||||||||||||    
T  25757669 taagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgt 25757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 14397328 - 14397426
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||    |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14397328 tgttagctttccaatggctttggtatggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaa 14397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 18677652 - 18677750
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18677652 tgttacctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18677750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24624285 - 24624171
Alignment:
Q  19 tttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttc 118  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  24624285 tttggtttgacttaaaaattatttttagattttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtctttgtgcaattttacgaaaattcaacataactatttc 24624186  T
Q  119 taagttaatccaaaa 133  Q
    ||||| || ||||||    
T  24624185 taagtgaacccaaaa 24624171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25295749 - 25295555
Alignment:
Q  19 tttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttc 118  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||  | |||||||||||||||||  ||| |    
T  25295749 tttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaacttcatgaaaattcagcataattattcc 25295650  T
Q  119 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgt 214  Q
    |||||||| |||||  ||||||  |  |||||||| |||||| | | |||| || ||||| |||||||  ||||||   |||||||||||||||||    
T  25295649 taagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgt 25295555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 4541961 - 4542059
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4541961 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 4542059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 24485631 - 24485729
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24485631 tgttagctttccaatggctttggcttggcgtgaaaatgacttttggtttaggagttatgattaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24485729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 19331994 - 19332131
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| || | | ||| |||||||| ||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||||    
T  19331994 tgttagctttgcaatagtttttgtttgacttgaaaatgatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagt-aaaactt-tgaaa 19332091  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    ||| |||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  19332092 atttagcataaatattcctaagttaaaccaaatcttatgg 19332131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22002326 - 22002239
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 89  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||||| | ||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22002326 gttagctttccaatggctttggtttgacgtaaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaa 22002239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 216
Target Start/End: Original strand, 21345945 - 21346031
Alignment:
Q  130 aaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||||||| | ||||||||    
T  21345945 aaaacttagggaataattccaaatctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 21346031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24239050 - 24238858
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||| ||| |||  |||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||   ||||| ||| | ||    
T  24239050 tgttagctttccaatggatttagtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttataatgaaaacactccaagagggtcttgaagaaattttaaggaa 24238951  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    | | |||||||  ||||| |||| || ||||||||||| |  |  |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24238950 acttagcataattatttccaagtcaacccaaaacttatcgtttgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaatgtgtttaa 24238858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22313466 - 22313251
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||| ||| ||   |||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||| | ||||| ||| | ||    
T  22313466 tgttagctttccaatggttccggtttgacttgaaaatgttttgtgaattttgagttatgatgaaaacactgcaagtgggtcttggagaaattttaaggaa 22313367  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    | | |||||||| ||||  |||| || ||||||| |||||  |  |||||||| ||||||     |||| || || || ||||||||||||||||| |||    
T  22313366 acttagcataactattttcaagtcaacccaaaacctatggtttgtttccaaacatcaaaatctttagtattaggatttaaattaaggtgtttaatggtat 22313267  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    || |||||||||||||    
T  22313266 ttgacctatgttgtga 22313251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 140
Target Start/End: Original strand, 21495115 - 21495246
Alignment:
Q  9 ttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 108  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| || ||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||  ||| |||||||| |||    
T  21495115 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgca 21495214  T
Q  109 taaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
     ||   ||||||||| || ||||| |||||||    
T  21495215 caattgtttctaagtcaacccaaaccttatgg 21495246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 1484976 - 1484930
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1484976 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 1484930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 20045783 - 20045829
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20045783 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 20045829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 45290135 - 45290205
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactc 71  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| | |  ||| ||||||||||||||||    
T  45290135 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttgttttaggagttatgatgaaaatactc 45290205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5080478 - 5080429
Alignment:
Q  167 gtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  5080478 gtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 5080429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 214
Target Start/End: Original strand, 45559644 - 45559798
Alignment:
Q  59 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaa 158  Q
    ||||||||||||||||    |||||||| |||  ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||| ||||    
T  45559644 gatgaaaatactccaaatgagtcttagtaaaactttatgaaaattcaacataattattcctaagttaaaccaaaccttatggtttgtttccaaacttcaa 45559743  T
Q  159 aactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgt 214  Q
    || | | |||| || || || |||||||  ||||||   |||||||||||||||||    
T  45559744 aatttg-agtattaggattttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgt 45559798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 5852880 - 5852926
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5852880 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 5852926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 8414166 - 8414240
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaag 75  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| |  |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  8414166 tgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaag 8414240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 14409032 - 14409078
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14409032 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 14409078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 70245 - 70469
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70245 tgttagctttccagtggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 70344  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  70345 attcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgagataattccaaaactcaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtat 70444  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  70445 ttaacctatgttatgagttggtcct 70469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 72045 - 71934
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  72045 gttagctttccaattgctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 71946  T
Q  102 ttcagcataacc 113  Q
    ||||| ||||||    
T  71945 ttcaggataacc 71934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 22186 - 22410
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22186 tgttaactttccagtggattttgtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgacatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaag 22285  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  22286 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 22385  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22386 ttaacctatgttgtgagttggtcct 22410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19061 - 19280
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19061 tgttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagatcttagtgaaatcttatgaaa 19160  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  19161 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 19260  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  19261 ttaacccatgttgtgagttg 19280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 28785 - 29000
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28785 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 28884  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  28885 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtat 28984  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  28985 ttaacctatgttgtga 29000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 10070 - 9996
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaag 75  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10070 tgttagctttccaatgattttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaag 9996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8699 - 8480
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8699 tgttagctttccagtggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtgtttgatatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtgaaatcttatgaaa 8600  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  8599 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactacaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtat 8500  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8499 ttaacctatgttgtgagttg 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16208 - 15990
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16208 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 16109  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  16108 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactataagttcaattaaggtgtttaatagtat 16009  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagtt 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16008 ttaacctatgttgtgagtt 15990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10856 - 10631
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10856 tgttagcttttcagtagctttggtttcacttgaaaattatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagaggacttagtgaaatcttatgaaa 10757  T
Q  101 attcagcataaccattt-ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  10756 attcagcataaccattttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 10657  T
Q  200 tttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10656 tttaacctatgttgtgagttggtcct 10631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 953 - 744
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  953 tgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgaggtcttagtgaaattttatgaaa 855  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||||||   |||    
T  854 attccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagtat 756  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  755 ttaacctatgtt 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6459 - 6250
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6459 tgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgaggtcttagtgaaattttatgaaa 6361  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||||||   |||    
T  6360 attccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagtat 6262  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  6261 ttaacctatgtt 6250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11332 - 11108
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11332 tgttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 11233  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  11232 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 11133  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11132 ttaacctatgttgtgagttggtcct 11108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 15004 - 15218
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15004 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 15103  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  15104 ttcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 15203  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  15204 taacctatgttgtga 15218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 24062 - 24276
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24062 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 24161  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  24162 ttcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 24261  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  24262 taacctatgttgtga 24276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 77321 - 77103
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77321 gttagctttccagtggctttgatttgacgtggaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 77222  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||    
T  77221 ttcagcataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacaatgagttcaattaaggtgtttaagattatt 77122  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  77121 taacctatgttgtgagttg 77103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 152627 - 152851
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  152627 tgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatatttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 152726  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  152727 attcagcaaaactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 152826  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||| | ||||||| ||||| ||||    
T  152827 ttaatccatgttgtaagttgatcct 152851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 176427 - 176203
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||  |||||| || |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  176427 tgttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 176328  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||    
T  176327 attcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 176228  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  176227 ttaacctaagttgtgagttggtcct 176203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 169074 - 168850
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||  |||||| || |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  169074 tgttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 168975  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||   |||    
T  168974 attcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggagtttaagagtat 168875  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  168874 ttaacctaagttgtgagttggtcct 168850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 11924 - 12148
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11924 tgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgaattattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 12023  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  12024 atttagcataactgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtaa 12123  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  12124 ttaacctatgttgtgagtttgtcct 12148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 7973 - 8186
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7973 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 8072  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatga-ta 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  8073 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt-atgatta 8171  T
Q  200 tttaacctatgttgt 214  Q
    ||||||| |||||||    
T  8172 tttaacccatgttgt 8186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 78698 - 78484
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  78698 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaa 78599  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||    
T  78598 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgttaaagagtatt 78499  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  78498 taacctatgttgtga 78484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7519 - 7300
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7519 tgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 7420  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  7419 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 7320  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | ||| |||||||||    
T  7319 ttaatccatgatgtgagttg 7300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1720 - 1505
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1720 tgttagctttacaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 1621  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  1620 attcggcataaccaattctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaacaagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 1521  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  1520 ttaacctatgttgtga 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 151 - 1
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  151 tgttatctttccaatggctttggtttaactggaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 52  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 151  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51 attcggcataaccaattctatgttaatccaaaacttatgggataattccaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13581 - 13362
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13581 tgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 13482  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  13481 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtat 13382  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13381 ttaacctatgttgtgagttg 13362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16396 - 16180
Alignment:
Q  4 tagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 103  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16396 tagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgcgatatgatgaaaatactttaaggaggtcttagtgaaatcttatgaatatt 16297  T
Q  104 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattta 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||    
T  16296 cagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataattctcaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatgaaggtgtttaagagtattta 16197  T
Q  204 acctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  16196 acctatgttgtgagttg 16180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8871 - 8686
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8871 tgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaa 8772  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8771 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 8686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21368 - 21153
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21368 tgttagctttccaatggctttggtttgacttggaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaagaaa 21269  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  21268 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattttaattctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 21169  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  21168 ttaacctatgttgtga 21153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 5131 - 5345
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5131 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgtttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 5230  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  5231 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 5330  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    ||| |||||||||||    
T  5331 taaactatgttgtga 5345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 6094 - 6312
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6094 tgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgaaatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttataaaa 6193  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatga-ta 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||    
T  6194 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagatcaaaactagaagtactatgagttcaattagggttttttaagagta 6293  T
Q  200 tttaacctatgttgtgagt 218  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  6294 tttaacttatgttgtgagt 6312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8691 - 8473
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8691 gttagctttccagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtgttagtgaaattttatgaaaa 8592  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  8591 ttcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatt 8492  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||| | |||||||||||||    
T  8491 taatccatgttgtgagttg 8473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21890 - 21677
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21890 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 21791  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||    
T  21790 attcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtttttaagagtat 21691  T
Q  201 ttaacctatgttgt 214  Q
    |||||| |||||||    
T  21690 ttaacccatgttgt 21677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26561 - 26368
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26561 tgttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 26462  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26461 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaa 26368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27943 - 27750
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27943 tgttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27844  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27843 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaa 27750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7854 - 7639
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  7854 tgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaa 7755  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||   |||    
T  7754 attcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtat 7655  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  7654 ttaacctatgttgtga 7639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14485 - 14270
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  14485 tgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaa 14386  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||   |||    
T  14385 attcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtat 14286  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  14285 ttaacctatgttgtga 14270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 35989 - 36181
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35989 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttctggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttaggaaaa 36088  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36089 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 36181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 29614 - 29786
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29614 tgttagatttccagtggctttgatttgacttgaaaatcatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 29713  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29714 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactat 29786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 120544 - 120330
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  120544 gttagctttccagtggctttagtttgacgcgaaaatgatttttttttcttgagatatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 120445  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  120444 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatt 120345  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| | ||||||||    
T  120344 taacatgtgttgtga 120330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12603 - 12380
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12603 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 12504  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||    
T  12503 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatt 12404  T
Q  202 taacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||| || |||||||||| ||||    
T  12403 taacccattttgtgagttgatcct 12380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7768 - 7553
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7768 tgttagctttccaatggttttgatttgacttgaaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtcaaatcttatgaaa 7669  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  7668 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttattagtat 7569  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  7568 ttaacctatgttgtga 7553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9690 - 9475
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9690 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 9591  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  9590 attaagcataactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattat 9491  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  9490 ttaacctatgttgtga 9475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6434 - 6215
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6434 tgttagctttgcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaaaactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 6335  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |    
T  6334 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagttt 6235  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  6234 ttaatccatgttgtgagttg 6215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6052 - 5833
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6052 tgttagctttccattggatttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 5953  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5952 attcagcataaccgtttcaaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtat 5853  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5852 ttaacctatgttgtgagttg 5833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 7200 - 7413
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7200 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataattttttgt-tttaagttatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 7298  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||  |   ||||||  |||||  | |  |||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  7299 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaagtttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtat 7397  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  7398 ttaacctatgttgtga 7413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 7803 - 8017
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7803 gttagctttctagtggctttggttttacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 7902  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  7903 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacttcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 8002  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  8003 taacctatgttgtga 8017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 159367 - 159560
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  159367 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 159466  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  159467 attcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattcaaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgattaa 159560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 628 - 404
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  628 tgttagctttctaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagtgaaatcttgtgaaa 529  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  528 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagcat 429  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||    
T  428 ttaacccgtgttgtgagttgatcct 404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3341 - 3122
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3341 tgttagctttccaatgacttttgtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 3242  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  3241 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtat 3142  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||| ||||||    
T  3141 ttaacccatgttgcgagttg 3122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 9373 - 9592
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  9373 tgttagctttccaatggctttggtttgactggaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgata 9472  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  9473 attcagcacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtacaattaaggtgtttaagagtat 9572  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  9573 ttaacccatgttgtgagttg 9592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51593 - 51374
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51593 tgttagctttccagtggatttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatcaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 51494  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||    
T  51493 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttaaaataaggtgtttaagagtat 51394  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  51393 ttaatcaatgttgtgagttg 51374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 67303 - 67191
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  67303 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 67204  T
Q  101 attcagcataacc 113  Q
    |||||||||||||    
T  67203 attcagcataacc 67191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 105547 - 105328
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  105547 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtctaagtgaaattttatgaaa 105448  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||    
T  105447 attcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtat 105348  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  105347 ttaacccatgttgtgagttg 105328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 162919 - 162700
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  162919 tgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaa 162820  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  162819 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacatatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 162720  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  162719 ttaattcatgttgtgagttg 162700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 94985 - 94939
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  94985 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 94939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 650 - 433
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  650 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttttttagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 551  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||    
T  550 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-ttaagagtatt 452  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  451 taacccatgttgtgagttg 433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 885 - 1099
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  885 gttagatttccagtggctttggattgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 984  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  985 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 1084  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  1085 taacctatgttgtga 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 22209 - 22423
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22209 gttagctttccagtggctttggtttcacgtgaaaattatttttggttattgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 22308  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  22309 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 22408  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  22409 taacctatgttgtga 22423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29363 - 29143
Alignment:
Q  5 agctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 104  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29363 agctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 29264  T
Q  105 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaa 204  Q
    ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  29263 agcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 29164  T
Q  205 cctatgttgtgagttggtcct 225  Q
     | ||||||||||||| ||||    
T  29163 gccatgttgtgagttgatcct 29143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34828 - 34608
Alignment:
Q  5 agctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 104  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34828 agctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 34729  T
Q  105 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaa 204  Q
    ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  34728 agcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 34629  T
Q  205 cctatgttgtgagttggtcct 225  Q
     | ||||||||||||| ||||    
T  34628 gccatgttgtgagttgatcct 34608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2973 - 2755
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973 tgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 2874  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  2873 attcagcataaccgtttctaagttaatcc-aagcttatgggataattccaaagctcaaaactagaaatactacgagttcaattaaggtgtttaagagtat 2775  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  2774 ttaatccatgttgtgagttg 2755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 394 - 609
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |  ||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  394 tgttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaaagtattttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 493  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||    
T  494 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactcgaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 593  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
     |||||||||||||||    
T  594 ctaacctatgttgtga 609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 5697 - 5890
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5697 tgttagattttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 5796  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5797 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaa 5890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 5)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23204 - 22985
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  23204 tgttagctttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 23105  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  23104 attcagcacatccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 23005  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  23004 ttaatccatgttgtgagttg 22985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 17674 - 17879
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||    
T  17674 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctagggatgtcttagtgaaaccttatgaaa 17773  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  17774 attcagcacagccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagaatat 17873  T
Q  201 ttaacc 206  Q
    ||||||    
T  17874 ttaacc 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33973 - 33794
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33973 gttagcattccagtagcttcggtttgacgtgaaaataaattttggttctcgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaa 33874  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33873 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaa 33794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 22596 - 22765
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaagg-aggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||    
T  22596 tgttagcattccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctaggggaggtcttagtgaaaccttatgaa 22695  T
Q  100 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagta 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22696 aattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagta 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Original strand, 23381 - 23512
Alignment:
Q  75 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  23381 ggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatg 23480  T
Q  175 agttcaattaaggtgtttaatgatatttaacc 206  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23481 agttcaattaaggtgtttaagaatatttaacc 23512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 67729 - 67518
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  67729 tgttagctttcctatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 67630  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||    
T  67629 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaatctgaaaactagaagtactaggatttcaattaaggtgtttaagaatat 67530  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  67529 ttaacctatgtt 67518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 62405 - 62602
Alignment:
Q  19 tttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttc 118  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  62405 tttgttttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttc 62504  T
Q  119 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatga-tatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| || ||||||||| |||  |   ||||||| || || |  |  |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  62505 taagtcaaaccaaaacttgtggattgtctccaaacttctaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttagggagtatttaacctatgttgtga 62602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 116822 - 117032
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  116822 tgttagctttgcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgaggaaaccattccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 116921  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||   ||||| |||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| ||||||| ||||||| || ||||| || ||||  ||||||   |||    
T  116922 attctatataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaaccagaagtattaggagtttaagtaagaggtttaagagtat 117021  T
Q  201 ttaacctatgt 211  Q
    | |||||||||    
T  117022 taaacctatgt 117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 23621 - 23799
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23621 tgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 23720  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 179  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23721 attcagcataagcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 58382 - 58168
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  58382 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatctgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaa 58283  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  58282 ttcagcataagcgtttctaagttaatccaaaacataaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 58183  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||| ||||||||    
T  58182 taacctgtgttgtga 58168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 68536 - 68438
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  68536 tgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttatcttttgagatatgatggaaatactccaagttggtcttagtgaatttttatgaa 68438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 632 - 439
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  632 tgttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaa 533  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  532 attcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactttgagttcaattagggtgtttaa 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 10864 - 11073
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10864 tgttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 10963  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||    
T  10964 attcagaataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 11063  T
Q  201 ttaacctatg 210  Q
    ||||||||||    
T  11064 ttaacctatg 11073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17318 - 17223
Alignment:
Q  77 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17318 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattttaaatctcaaaactagaagtacta 17223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39732 - 39519
Alignment:
Q  3 ttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39732 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagggcttagtgaaatcttatgaaaat 39633  T
Q  103 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattt 202  Q
    |||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||    
T  39632 tcaggataatcgtttctatgttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaattaggatgtttaagagtattt 39533  T
Q  203 aacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||    
T  39532 aacctatgttgtga 39519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 64486 - 64679
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  64486 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaa 64585  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  64586 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttgtggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaa 64679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31502 - 31392
Alignment:
Q  84 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31502 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaatccttaaaactagaagttctatgagttcaatt 31403  T
Q  184 aaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||    
T  31402 aaggtgtttaa 31392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31778 - 31680
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||| ||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31778 tgttagatttccggtggctttgggtttacatgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 402 - 614
Alignment:
Q  4 tagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 103  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  402 tagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatt 501  T
Q  104 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattta 203  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  502 cagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaattta 601  T
Q  204 acctatgttgtga 216  Q
    | |||||||||||    
T  602 atctatgttgtga 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 5706 - 5918
Alignment:
Q  4 tagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 103  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5706 tagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatt 5805  T
Q  104 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattta 203  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  5806 cagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaattta 5905  T
Q  204 acctatgttgtga 216  Q
    | |||||||||||    
T  5906 atctatgttgtga 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 1567 - 1480
Alignment:
Q  4 tagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 91  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1567 tagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 10346 - 10562
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10346 tgttagctttccagtagctttggtttaacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 10445  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatga-ta 199  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||| ||    
T  10446 attcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttatgagta 10545  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||| |||||||    
T  10546 tttaacctacgttgtga 10562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 884 - 665
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||| | | || ||||||||||||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  884 tgttagcttacgaatgactttggtttgacttgaaactgatatttcgtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 785  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  784 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattat 685  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  684 ttaacccatgttatgagttg 665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21286 - 21072
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  21286 gttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaa 21187  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  21186 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatagtatt 21087  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| | ||||||||    
T  21086 taacatgtgttgtga 21072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 138409 - 138191
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  138409 gttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttcgtgaaaccttatgaaaa 138310  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  138309 ttcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgtgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatt 138210  T
Q  202 taacctatgttgtgagttg 220  Q
    ||| | |||||||||||||    
T  138209 taatccatgttgtgagttg 138191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 1527 - 1750
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaa-tgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1527 gttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 1626  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||    
T  1627 attcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacccccaaaactagaagtactatgagttcaattaaggt-tttaagattat 1725  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  1726 ttaacccatgttgtgagttgatcct 1750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27935 - 27720
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27935 tgttagctttccagtggctttagtttgaattgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaataattccaggaggtcttactgaaattttatgaaa 27836  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  27835 attcagcaaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtat 27736  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    |||| |||||||||||    
T  27735 ttaatctatgttgtga 27720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Original strand, 106621 - 106800
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106621 gttagctttccagtgaaattggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 106720  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106721 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 106800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 82620 - 82398
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82620 gttagctttccaattgttttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 82521  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||    
T  82520 ttcagcataaccgtttctaagttaattcaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtg-ttaagagtatt 82422  T
Q  202 taacctatgttgtgagttggtcct 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||    
T  82421 taacccatgttgtgagttgatcct 82398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1541 - 1327
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1541 gttagctttccagtgactttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgggatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 1442  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  1441 tttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 1342  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||| ||||    
T  1341 taacctatgtggtga 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 13083 - 13297
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13083 gttagctttccagtggctttggtgtgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 13182  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  13183 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 13282  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| | ||||||||    
T  13283 taacatgtgttgtga 13297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 8067 - 8277
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||||  |||||||| ||| |  || ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| || || | ||||||||    
T  8067 tgttagccttcctatggatttggtttgacttaaaaatgatgtttagatttagagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaa 8166  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||   |||    
T  8167 attcagcataaccgtttctaactcaatccaaaacttatggaatatttccaaaactcaaaactagaaatactaggagtttaattaagaggtttaagagtat 8266  T
Q  201 ttaacctatgt 211  Q
    ||||| |||||    
T  8267 ttaacgtatgt 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2198 - 1984
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2198 gttagctttccagtgactttagtttgacgtgaaaataatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 2099  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| | ||||    
T  2098 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcatacctcaaaactagaagtattatgagttctattagggtatttaagggtatt 1999  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  1998 taacctatgttgtga 1984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5413
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543 gttagctttccactgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 5444  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaa 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5443 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5229 - 5137
Alignment:
Q  124 taatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  5229 taatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 5137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 143247 - 143033
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  143247 gttagctttccagtggttttagtttgacatgaaaagaatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 143148  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  143147 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 143048  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||| ||||    
T  143047 taacctatgtggtga 143033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 169415 - 169591
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  169415 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 169514  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  169515 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 169591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 5084 - 5293
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5084 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatgaaa 5183  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||   |||    
T  5184 attcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagttctaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 5283  T
Q  201 ttaacctatg 210  Q
    ||||||||||    
T  5284 ttaacctatg 5293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6660 - 6443
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| | |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6660 tgttagctttccaatgacttcggtttgaattgaaaattagttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 6561  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |    
T  6560 attcagtataatcatttataagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtgt 6461  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagt 218  Q
    |||||||||||| |||||    
T  6460 ttaacctatgttatgagt 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16358
Alignment:
Q  49 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||    
T  16524 tttgagttatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattttctc 16425  T
Q  149 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  16424 caaacttcaaagat-catgtactatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 16358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 7006 - 7213
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggcttt-ggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  7006 gttagctttccagtggcttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatattatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaa 7105  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||    
T  7106 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 7205  T
Q  201 ttaaccta 208  Q
    ||||||||    
T  7206 ttaaccta 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 800 - 585
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  800 tgttagcttttccgtggcttttgtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 701  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  |||||||| || ||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||   |||    
T  700 attcagcataactgtttctaaggtagtccaatatttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtccaactagggtgtttaagagtat 601  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  600 ttaacctatgttgtga 585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1332 - 1130
Alignment:
Q  8 tttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1332 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggatatcttagtgaaattttatgaaaattcagc 1233  T
Q  108 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacct 207  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||   ||||||||||    
T  1232 ctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaagatggttaagagtatttaacct 1133  T
Q  208 atg 210  Q
    |||    
T  1132 atg 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 12954 - 13168
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12954 gttagatttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 13053  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||   ||||    
T  13054 ttcagcacaaccatttttaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 13153  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||    
T  13154 taacctatgttgtga 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 19368 - 19435
Alignment:
Q  149 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19368 caaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 126382 - 126168
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  126382 gttagctttccagttgctttggtttaacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 126283  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  126282 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 126183  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| | ||||||||    
T  126182 taacatgtgttgtga 126168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33088 - 32878
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33088 tgttagatttcttgtggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 32989  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| |||||||  ||| || || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  32988 attccgcataactttttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 32890  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  32889 ttaacctatgtt 32878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12957 - 12776
Alignment:
Q  13 agtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 112  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12957 agtggctttggttttacttgaaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataac 12858  T
Q  113 catttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857 cttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaatccataaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 12776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11257 - 11101
Alignment:
Q  24 tttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagt 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11257 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagt 11158  T
Q  124 taatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11157 taatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4732 - 4568
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4732 tgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 4633  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactaga 165  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  4632 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactaga 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11752 - 11679
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaa 74  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11752 tgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 11679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 5743 - 5958
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5743 tgttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 5842  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||    
T  5843 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtat 5942  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| | ||||||||    
T  5943 ttaacatgtgttgtga 5958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7147 - 6933
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7147 gttagctctccagtggctttggtttgacgtaaaaatgatttttggttcttgatatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 7048  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  7047 ttcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatt 6948  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||| | ||||||||    
T  6947 taacatgtgttgtga 6933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7610 - 7417
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7610 tgttagattttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 7511  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7510 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaa 7417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 10334 - 10423
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 90  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10334 tgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11267 - 11215
Alignment:
Q  164 gaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  11267 gaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 11215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 1112 - 1288
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1112 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 1211  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1212 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11793 - 11579
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11793 gttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttattatcaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaa 11694  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||   ||||    
T  11693 ttcagcacagccgtttctaagttaatccaaaacctagggaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattacggtgtttaagagtatt 11594  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    | |||||||||||||    
T  11593 tgacctatgttgtga 11579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4055 - 3839
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  4055 tgttagctttccagtggctctggtttgacttgaaaatgacttttggtatttgagatatgatgaaaatactccatggagatcttagtgaaattttatgaaa 3956  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatga-ta 199  Q
    ||| ||  ||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||   || ||    
T  3955 atttagtttaacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagta 3856  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  3855 tttaacctatgttgtga 3839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 194
Target Start/End: Original strand, 8752 - 8913
Alignment:
Q  33 aaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaa 132  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8752 aaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 8851  T
Q  133 acttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8852 acttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaa 8913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8121 - 7937
Alignment:
Q  32 gaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaa 131  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  8121 gaaaatgatttttgactcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaa 8022  T
Q  132 aacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8021 aacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 7937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 184
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8266
Alignment:
Q  70 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||     
T  8152 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtt 8251  T
Q  170 ctatgagttcaatta 184  Q
    |||||||||||||||    
T  8252 ctatgagttcaatta 8266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21702 - 21510
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  21702 gttagatttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaattttatgaaaa 21603  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  21602 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggggtttaa 21510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 2144 - 2363
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  2144 tgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 2243  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  2244 attcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 2343  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  2344 ttaacccatgttgtgagttg 2363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 133581 - 133800
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| || |  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  133581 tgttagctttccaatggctttagtttgactttaaaatgattttttgtttaggagttatgttgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaa 133680  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  133681 tttcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 133780  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  133781 ttaacccatgttgtgagttg 133800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 133385 - 133166
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  133385 tgttagcttttcaatggctttggtttgacttttaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagggaaatcttatgaaa 133286  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||   |||    
T  133285 attcagcacaaccattttcaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagaggtttaagtgtat 133186  T
Q  201 ttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  133185 ttaactcatgttgtgagttg 133166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29761 - 29578
Alignment:
Q  33 aaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaa 132  Q
    ||||||||||||||| |   || ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29761 aaaatgatttttggtttagtagttatgatgaaaatactacaaggaatacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 29662  T
Q  133 acttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  29661 acttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaagagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 29578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 33873 - 33803
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactc 71  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  33873 tgttagatttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactc 33803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 839 - 625
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  839 gttagcttttcagttgctttggtttgacgtgaaaatgaattttggttctcgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 740  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||   ||||    
T  739 ttcaacataaccgtttctaagttaattcaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactagggggtttaagagtatt 640  T
Q  202 taacctatgttgtga 216  Q
    |||||||| ||||||    
T  639 taacctattttgtga 625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1346 - 1131
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1346 tgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 1247  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    | || ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  1246 aatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtat 1147  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  1146 ttaacctatgttgtga 1131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3905 - 3690
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| | |  | |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3905 tgttagctttccattagagtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 3806  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||  ||||    
T  3805 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaggactaggagtttaattaaggggtttaacaatat 3706  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| | ||||||||    
T  3705 ttaacatgtgttgtga 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 186922 - 187137
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  186922 tgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 187021  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    | || ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  187022 aatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtat 187121  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  187122 ttaacctatgttgtga 187137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30247 - 30032
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  30247 tgttagctttccagtgtcgtaggtttgactagaaaatgatttttgatttaggagttatgatgaaaatactacaaggagtacttagtgaaattttatgaaa 30148  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||   |||    
T  30147 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggaaataattccaaacctcaagactagaagtaataggagtttaattaaggtgtttaagagtat 30048  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
     |||| ||||||||||    
T  30047 ctaacttatgttgtga 30032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33469 - 33330
Alignment:
Q  85 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 184  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33469 gtgaaatcttatgaaaattcagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagcactatgagttcaatta 33370  T
Q  185 aggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagttggtcc 224  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  33369 aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcc 33330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33746 - 33648
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  33746 tgttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgagttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccgaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 169073 - 168887
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  169073 tgttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 168974  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagg 187  Q
    ||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  168973 atttagtataacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctctaaactggaagtactaggagtttaattaagg 168887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22633 - 22478
Alignment:
Q  61 tgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22633 tgaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaa 22534  T
Q  161 ctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  22533 ctagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 22478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 66449 - 66660
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  66449 tgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 66548  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||    
T  66549 attccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaagcttcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgcttaagagtat 66648  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  66649 ttaacctatgtt 66660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Original strand, 9711 - 9858
Alignment:
Q  68 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9711 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 9810  T
Q  168 tactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  9811 tactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatattgtga 9858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 38396 - 38350
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggt 47  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38396 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 38350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 65398 - 65608
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  65398 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaaggagttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 65497  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||   |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  65498 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 65596  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  65597 ttaacctatgtt 65608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26150 - 25936
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26150 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttagtttttgagctatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 26051  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat-tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||| || ||||  | | ||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  26050 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaactgat-ggatcgtcttcaatcttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 25953  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  25952 tttaacctatgttgtga 25936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18799 - 18585
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| | || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18799 tgttagctttccagtgactttggtttgacttgataatggtttttgtttttcgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttagagaaatcttatgaaa 18700  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  18699 attctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 18601  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  18600 ttaacatatgttgtga 18585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 19945 - 20062
Alignment:
Q  77 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19945 aggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgag 20044  T
Q  177 ttcaattaaggtgtttaa 194  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20045 ttcaattaaggtgtttaa 20062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 19676 - 19774
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19676 tgttagctttccattggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8455 - 8244
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgttt-gagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8455 tgttagctttccagtggctttgaattgacttgaaaatgatttttggttttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaa 8356  T
Q  100 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgata 199  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  8355 aattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagta 8257  T
Q  200 tttaacctatgtt 212  Q
    |||||||||||||    
T  8256 tttaacctatgtt 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 136 - 1
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  136 gttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 37  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaactta 137  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10335 - 10132
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  10335 tgttagatttcaagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtg-aattttatgaaa 10237  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    | || ||          |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |   |||    
T  10236 agtccgc----------ctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttgagagtat 10147  T
Q  201 ttaacctatgttgtg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  10146 ttaacctatgttgtg 10132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 7272 - 7485
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7272 tgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaagtttatgaaa 7371  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||  |  ||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||   |||    
T  7372 attccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttat-ggattgtctcaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtat 7469  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||| |||||||    
T  7470 ttaacctaagttgtga 7485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14522 - 14424
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttg-actagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || | || ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14522 tgttagctttccaatggctttagtgtggagta-aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 62353 - 62143
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  62353 tgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 62254  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| | ||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  62253 attccgcataactacttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtat 62155  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  62154 ttaacctatgtt 62143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 39326 - 39373
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtg 48  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39326 tgttagctttccaatggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtg 39373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 767 - 977
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||| | ||||| || || | ||||||||    
T  767 tgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaa 866  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||   |||    
T  867 attcagcataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatatttccaaacctcgaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtat 966  T
Q  201 ttaacctatgt 211  Q
    |||||||||||    
T  967 ttaacctatgt 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21200 - 21058
Alignment:
Q  77 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 176  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21200 aggtctcagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 21101  T
Q  177 ttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagtt 219  Q
    |||||||||||  |||||    |||||||||||||||||||||    
T  21100 ttcaattaagggttttaagagcatttaacctatgttgtgagtt 21058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34895 - 34685
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34895 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 34796  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    || | ||||||| |||||||    || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  34795 ataccgcataactatttcta----aacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 34701  T
Q  201 ttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  34700 ttaacctatgttgtga 34685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 320 - 110
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  320 tgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactgtaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 221  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||  ||||||| ||||||| || || | |||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  220 atttcgcataactatttctaggtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 122  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  121 ttaacctatgtt 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 18071 - 18281
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18071 tgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatcatgttttgtttttgagttatgatgaaaatactccaagcaggtcttagtgaaattttatgaaa 18170  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  18171 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 18269  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  18270 ttaacctatgtt 18281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 56611 - 56401
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  56611 tgttagctttccattggttttggtttaacttgcaaatgatttttggttttggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaa 56512  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  56511 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 56413  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  56412 ttaacctatgtt 56401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Original strand, 1057 - 1173
Alignment:
Q  7 ctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1057 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 1156  T
Q  107 cataaccatttctaagt 123  Q
    || ||||||||||||||    
T  1157 cacaaccatttctaagt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Original strand, 1372 - 1451
Alignment:
Q  141 gataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtgagttg 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  1372 gataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttg 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 18543 - 18758
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18543 tgttagctttacagtggcgtcggtttgactcgaatataatttttggtttttgatttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 18642  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatga-ta 199  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| || ||| |    |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  18643 attcggcataactatttctaagtcaaaccaaaacttatggattgtctccaaacttc-aaagtctgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaaagagta 18741  T
Q  200 tttaacctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  18742 tttaacctatgttgtga 18758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21396 - 21285
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21396 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 21297  T
Q  101 attcagcataac 112  Q
    ||||||||||||    
T  21296 attcagcataac 21285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39631 - 39521
Alignment:
Q  84 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 183  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  39631 agtgaaatcttaagaaaattcaggataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaatttctatgagttcaatt 39532  T
Q  184 aaggtgtttaa 194  Q
    |||||||||||    
T  39531 aaggtgtttaa 39521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 39855 - 39809
Alignment:
Q  53 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39855 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaacttttatgaa 39809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 42328 - 42271
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatat 58  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42328 tgttatctatccagtggctttggtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatat 42271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8141 - 7931
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |  |||||||||||||| || ||| ||||| | ||||| || || | ||||||||    
T  8141 tgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttgtagattttgagatatgatggaattaccccaagaaagtcttggtaaatttttatgaaa 8042  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |  ||||    
T  8041 attcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttgagaatat 7942  T
Q  201 ttaacctatgt 211  Q
    |||||||||||    
T  7941 ttaacctatgt 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 11635 - 11820
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  11635 tgttagctttccagtggatttggtttaatttgaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaaggcggtcttggtaaaattttatgaaa 11734  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 186  Q
    |||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11735 atttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaag 11820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17842
Alignment:
Q  84 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17952 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactataagttctatgagttcaatt 17853  T
Q  184 aaggtgtttaa 194  Q
    ||| |||||||    
T  17852 aagatgtttaa 17842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18228 - 18130
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18228 tgttagctttccagtggcttttgtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 8037 - 8176
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8037 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgaagaaaataccacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 8136  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||    
T  8137 attccgcataactatttcttagtcaacccaaaacttatgg 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 2470 - 2593
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2470 tgttagctttccagttgctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaa 2569  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagtt 124  Q
    |||||||||||   ||||||||||    
T  2570 attcagcataattgtttctaagtt 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3153
Alignment:
Q  122 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  3059 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 211
Target Start/End: Original strand, 11625 - 11833
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||| || || ||  ||||| ||||||| || || | ||||| |||    
T  11625 gttagctttccaatgggtttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaacccaagcaggtcttggtaaatttttatggaaa 11724  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||  ||    
T  11725 ttcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaa-gagttt 11823  T
Q  202 taacctatgt 211  Q
    ||||||||||    
T  11824 taacctatgt 11833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 871 - 767
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  871 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaa 772  T
Q  101 attca 105  Q
    |||||    
T  771 attca 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 11764 - 11974
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11764 tgttagatttccagtggctttggttttggttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaagggggtcttagtgaaattttatgaaa 11863  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatat 200  Q
    |||   |||||| ||||||| || || | |||||||||||  |   ||||||| ||||| || |  ||| ||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  11864 atttcacataactatttctaggtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgcttaagagtat 11962  T
Q  201 ttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||    
T  11963 ttaacctatgtt 11974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2516 - 2403
Alignment:
Q  8 tttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2516 tttccaatggctttggttagacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactacaaagaggtcttagtgaagttttatgaaaattcagc 2417  T
Q  108 ataaccatttctaa 121  Q
    |||||| |||||||    
T  2416 ataaccgtttctaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 211
Target Start/End: Original strand, 2198 - 2406
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||| | |  ||||||||||| || || ||| ||||| ||||||| || || | ||||| |||    
T  2198 gttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaa 2297  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatt 201  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||  |||||| ||  ||    
T  2298 ttcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaagaggtttaa-gagttt 2396  T
Q  202 taacctatgt 211  Q
    ||||||||||    
T  2397 taacctatgt 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 10453 - 10637
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 101  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||| | |  ||||||||||| || || ||| ||||| ||||||| || || | ||||| |||    
T  10453 gttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaa 10552  T
Q  102 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 186  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  10553 ttcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaag 10637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 13189 - 13378
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttgg----tgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttat 96  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |    ||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  13189 tgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatatttaggttgtgagtgagttatgatgaaaacactcgaaggaggtcttggtgaaattttat 13288  T
Q  97 gaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 186  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |  | |||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  13289 gaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttcccaaacttcaaaactataagtattacgagtttaattaag 13378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 7794 - 7911
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7794 tgttagctttccagtggctttggtttgaattaaaaatgatttttggtttgagagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaa 7893  T
Q  101 attcagcataaccatttc 118  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  7894 attccgcataactatttc 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 24480 - 24579
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24480 tgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 212
Target Start/End: Original strand, 24586 - 24631
Alignment:
Q  167 gtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgtt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  24586 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8593 - 8495
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8593 tgttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3598 - 3500
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3598 tgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgacgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32878 - 32694
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||| |||||||||| || ||| ||||| | |||||  | || | ||||||||    
T  32878 tgttatctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttctagatttttagatatgatggaattaccccaagcaagtcttgataaatttttatgaaa 32779  T
Q  101 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 186  Q
    ||| ||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32778 att-agcataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaag 32694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 35937 - 36148
Alignment:
Q  4 tagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 103  Q
    |||||||||| || |||  |||| ||| ||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  35937 tagctttccaatgacttcagttttacttgaaaatgattttttgctttttagttatgatgaaaatactcaaaggatgtcttagtgaaattttataaaaatt 36036  T
Q  104 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatattta 203  Q
    | ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||   |   ||||||| ||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||    
T  36037 ccgcataactatttctaagtcaactcaaaacttatgtattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtattta 36135  T
Q  204 acctatgttgtga 216  Q
    |||||||||||||    
T  36136 acctatgttgtga 36148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 16405 - 16493
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 89  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16405 tgttagatttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaa 16493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 16528 - 16602
Alignment:
Q  142 ataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  16528 ataattcaaaacctcaaaactataagtactaggaatttaattaagggttttaaaaatatttaacctatgttgtga 16602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1066 - 880
Alignment:
Q  23 gtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaag 122  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||  |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  1066 gtttgacttgaaaatgatttttatattttaagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttaggaaaactttacaaaaattcagcataaccatttcttag 967  T
Q  123 ttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatg 210  Q
    | || ||||| |||||||  |  ||||||||  |||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  966 tcaacccaaagcttatggtttgtttccaaactccaaaactt-atgtactttgagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacctatg 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 100 - 177
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggag 78  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggag 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 152 - 53
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgac-tagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  152 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21323 - 21225
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21323 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 208
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2458
Alignment:
Q  127 tccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaaccta 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||||||||||    
T  2377 tccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaccta 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11864 - 11766
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggttt-gactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || || || |||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11864 tgttagctttccaatggctttggtttagagta-aacatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 11766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0956 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0956
Description:

Target: scaffold0956; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 2341 - 2403
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaa 64  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2341 gttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 6521 - 6423
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  6521 tgttagctttccagtggcgtcggtgtgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgcaaatactcaaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 174566 - 174628
Alignment:
Q  2 gttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaa 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  174566 gttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaa 174628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 20499 - 20652
Alignment:
Q  9 ttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 108  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| | ||||| ||| | ||| | ||||    
T  20499 ttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgacggaaatactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaaacttagca 20598  T
Q  109 taaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaact 162  Q
    |||| ||||| |||| || || ||||||||||  |  |||||||| ||||||||    
T  20599 taactatttccaagtcaacccgaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaact 20652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 9816 - 9718
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttg-actagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| || |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9816 tgttagctttccaatggctttggtttggagta-aaaattatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 9675 - 9601
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaag 75  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  9675 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaag 9601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2422 - 2362
Alignment:
Q  154 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||    
T  2422 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgt 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 140
Target Start/End: Original strand, 40902 - 40969
Alignment:
Q  73 aaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  | || |||||||||||||    
T  40902 aaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatatcaaaccaaaacttatgg 40969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Original strand, 6892 - 6975
Alignment:
Q  20 ttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 103  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| ||| | |||| ||| |||||||    
T  6892 ttggtttgacttgaaaataatgttttgtgtttgagttataaagaaaatactctaaggaggttttaataaaattttacgaaaatt 6975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17291 - 17160
Alignment:
Q  9 ttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 108  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| || ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||| | |||  ||| |||||||| |||    
T  17291 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaagaaggttttaataaaactttacgaaaattccgca 17192  T
Q  109 taaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 140  Q
     ||   ||||||||| || ||||| |||||||    
T  17191 caattgtttctaagtcaacccaaaccttatgg 17160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 134730 - 134687
Alignment:
Q  56 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  134730 tatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 134687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 137199 - 137156
Alignment:
Q  56 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  137199 tatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 137156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 139668 - 139625
Alignment:
Q  56 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  139668 tatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 139625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 142137 - 142094
Alignment:
Q  56 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  142137 tatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 142094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 144606 - 144563
Alignment:
Q  56 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  144606 tatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 144563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 13967 - 13909
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatg 59  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13967 tgttagctttccagtggaatcggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgagttatg 13909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 40974 - 40916
Alignment:
Q  1 tgttagctttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatg 59  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  40974 tgttagctttacagtggcatcggtttgacttgaaaatgattttcggtttttgagttatg 40916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 216
Target Start/End: Original strand, 1 - 53
Alignment:
Q  164 gaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatgatatttaacctatgttgtga 216  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  1 gaagtgctatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Original strand, 35055 - 35123
Alignment:
Q  9 ttccagtggctttggtttgactagaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaagga 77  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| || ||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  35055 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatattttgtttttgagttatgaagaaaatactctaagga 35123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University