View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11280A_low_310 (Length: 228)

Name: NF11280A_low_310
Description: NF11280A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11280A_low_310
NF11280A_low_310
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (7-228)||(821196-821415)
chr4 (8-228)||(44054777-44054997)
chr4 (8-228)||(45460040-45460259)
chr4 (8-228)||(33739120-33739339)
chr4 (18-228)||(25120215-25120425)
chr4 (78-228)||(5683906-5684056)
chr4 (8-222)||(15273736-15273949)
chr4 (8-228)||(16521643-16521863)
chr4 (78-222)||(18247155-18247299)
chr4 (8-228)||(44345683-44345902)
chr4 (13-228)||(21960657-21960871)
chr4 (8-228)||(30233626-30233846)
chr4 (63-214)||(7133479-7133631)
chr4 (76-223)||(9294491-9294638)
chr4 (8-228)||(12900853-12901075)
chr4 (8-221)||(19698447-19698657)
chr4 (8-221)||(19709032-19709242)
chr4 (74-222)||(26679002-26679152)
chr4 (113-223)||(15212413-15212523)
chr4 (78-214)||(18167766-18167903)
chr4 (13-228)||(23271015-23271227)
chr4 (8-228)||(54119356-54119575)
chr4 (74-222)||(22355604-22355754)
chr4 (125-228)||(10643042-10643145)
chr4 (8-228)||(18294100-18294322)
chr4 (78-228)||(14995050-14995202)
chr4 (13-213)||(55377673-55377873)
chr4 (86-228)||(13245305-13245447)
chr4 (82-209)||(18251103-18251232)
chr4 (113-222)||(15212311-15212419)
chr4 (63-228)||(19999380-19999547)
chr4 (130-222)||(15288106-15288198)
chr4 (130-222)||(15295216-15295308)
chr4 (16-154)||(53705902-53706039)
chr4 (8-152)||(8873631-8873774)
chr4 (29-142)||(19019506-19019617)
chr4 (86-154)||(53908963-53909031)
chr4 (17-176)||(13810709-13810870)
chr4 (125-228)||(18495604-18495709)
chr4 (74-228)||(10487524-10487682)
chr4 (74-228)||(16329069-16329227)
chr4 (113-172)||(15212552-15212611)
chr4 (187-228)||(7133711-7133752)
chr4 (187-228)||(8373208-8373249)
chr4 (187-228)||(14950873-14950914)
chr4 (187-228)||(18167645-18167686)
chr4 (125-228)||(34394052-34394156)
chr4 (129-223)||(8373321-8373415)
chr4 (86-151)||(110391-110456)
chr4 (187-228)||(9294378-9294419)
chr4 (192-228)||(110335-110371)
chr4 (177-228)||(5684153-5684205)
chr4 (177-228)||(18294418-18294470)
chr4 (189-228)||(8044114-8044153)
chr4 (125-228)||(15273958-15274063)
chr4 (189-228)||(34393909-34393948)
chr4 (189-228)||(53706054-53706093)
chr4 (186-228)||(15212197-15212239)
chr4 (186-228)||(15288271-15288313)
chr4 (186-228)||(15295381-15295423)
chr4 (63-146)||(18109838-18109923)
chr4 (186-228)||(18247041-18247083)
chr4 (187-228)||(22355826-22355867)
chr4 (187-228)||(26678888-26678929)
chr4 (195-228)||(47356181-47356214)
chr4 (195-223)||(15212605-15212633)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (10-228)||(22407286-22407504)
chr1 (13-228)||(49966503-49966717)
chr1 (15-228)||(18506210-18506422)
chr1 (8-222)||(20826206-20826419)
chr1 (42-228)||(44036024-44036209)
chr1 (13-228)||(21717057-21717271)
chr1 (15-228)||(35053694-35053909)
chr1 (78-228)||(15862592-15862742)
chr1 (78-228)||(22353129-22353279)
chr1 (13-228)||(2422065-2422280)
chr1 (8-228)||(5675690-5675910)
chr1 (8-228)||(27330861-27331079)
chr1 (8-228)||(41210900-41211119)
chr1 (8-228)||(35523508-35523730)
chr1 (78-228)||(22250113-22250262)
chr1 (8-228)||(51657400-51657623)
chr1 (95-221)||(41218316-41218442)
chr1 (63-228)||(17147634-17147801)
chr1 (76-223)||(20956127-20956278)
chr1 (123-228)||(21858410-21858515)
chr1 (122-228)||(45050536-45050642)
chr1 (8-228)||(9785340-9785550)
chr1 (112-216)||(20894886-20894991)
chr1 (82-228)||(22365609-22365757)
chr1 (86-154)||(37845654-37845722)
chr1 (74-151)||(51451544-51451623)
chr1 (190-228)||(20526972-20527010)
chr1 (127-228)||(7641803-7641904)
chr1 (125-228)||(20826428-20826533)
chr1 (190-228)||(20444600-20444638)
chr1 (190-228)||(20530365-20530403)
chr1 (86-156)||(20930380-20930450)
chr1 (190-228)||(37845737-37845775)
chr1 (186-228)||(41393304-41393346)
chr1 (86-154)||(20444653-20444721)
chr1 (86-154)||(20527025-20527092)
chr1 (86-154)||(20530418-20530486)
chr1 (155-228)||(17003674-17003747)
chr1 (195-228)||(18060885-18060918)
chr1 (195-228)||(22352982-22353015)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (13-224)||(25121403-25121614)
chr8 (16-227)||(22322525-22322736)
chr8 (18-228)||(29759148-29759358)
chr8 (8-228)||(19994234-19994453)
chr8 (86-228)||(41245520-41245662)
chr8 (8-228)||(20480526-20480748)
chr8 (8-228)||(37610224-37610443)
chr8 (76-222)||(24107629-24107775)
chr8 (82-222)||(28836562-28836704)
chr8 (8-221)||(18611377-18611587)
chr8 (81-228)||(21680060-21680209)
chr8 (83-222)||(22908532-22908673)
chr8 (30-228)||(20648541-20648741)
chr8 (78-228)||(22007638-22007787)
chr8 (82-221)||(24930160-24930302)
chr8 (63-228)||(20655158-20655326)
chr8 (8-228)||(21696419-21696639)
chr8 (125-228)||(43374782-43374885)
chr8 (74-228)||(13663635-13663791)
chr8 (63-228)||(24386843-24387011)
chr8 (74-228)||(24718564-24718719)
chr8 (78-228)||(13722174-13722326)
chr8 (63-228)||(16874074-16874241)
chr8 (81-228)||(16417118-16417266)
chr8 (16-228)||(20568356-20568568)
chr8 (16-228)||(20574549-20574761)
chr8 (8-228)||(3432661-3432878)
chr8 (63-228)||(38532516-38532685)
chr8 (78-228)||(17730612-17730766)
chr8 (129-222)||(6775326-6775420)
chr8 (76-198)||(28556874-28556998)
chr8 (13-228)||(16042123-16042338)
chr8 (8-222)||(16040335-16040549)
chr8 (122-228)||(24548075-24548181)
chr8 (8-155)||(16406149-16406295)
chr8 (74-228)||(5237049-5237207)
chr8 (74-228)||(24662391-24662549)
chr8 (177-223)||(17151399-17151445)
chr8 (187-228)||(13722433-13722474)
chr8 (187-228)||(13722581-13722622)
chr8 (187-228)||(13722729-13722770)
chr8 (187-228)||(13722877-13722918)
chr8 (187-228)||(13723025-13723066)
chr8 (187-228)||(24107848-24107889)
chr8 (187-228)||(24930375-24930416)
chr8 (128-228)||(270586-270687)
chr8 (128-228)||(645233-645334)
chr8 (128-228)||(830968-831069)
chr8 (187-228)||(16040621-16040662)
chr8 (85-154)||(16194917-16194986)
chr8 (190-227)||(16195001-16195038)
chr8 (191-228)||(17151521-17151558)
chr8 (186-228)||(6775492-6775534)
chr8 (187-221)||(18618028-18618062)
chr8 (46-162)||(22144136-22144250)
chr8 (186-228)||(22908745-22908787)
chr8 (186-228)||(28836448-28836490)
chr8 (155-228)||(272435-272508)
chr8 (155-228)||(643341-643414)
chr8 (155-228)||(829147-829220)
chr8 (195-228)||(224430-224463)
chr8 (195-228)||(700843-700876)
chr8 (195-228)||(738053-738086)
chr8 (195-228)||(861948-861981)
chr8 (195-228)||(13663905-13663938)
chr8 (195-228)||(13723180-13723213)
chr8 (74-228)||(43684508-43684666)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (10-228)||(32897584-32897802)
chr6 (18-228)||(19984298-19984508)
chr6 (15-227)||(25645918-25646129)
chr6 (8-222)||(16230555-16230768)
chr6 (13-223)||(18824637-18824847)
chr6 (12-228)||(18431494-18431708)
chr6 (8-228)||(18776069-18776291)
chr6 (78-222)||(25174527-25174671)
chr6 (13-223)||(4989869-4990079)
chr6 (78-218)||(27655147-27655287)
chr6 (76-223)||(18840555-18840702)
chr6 (78-217)||(33315628-33315767)
chr6 (8-228)||(16105420-16105638)
chr6 (63-214)||(18004002-18004154)
chr6 (16-228)||(18569447-18569660)
chr6 (13-214)||(15736160-15736362)
chr6 (82-222)||(13622160-13622302)
chr6 (13-228)||(35016770-35016984)
chr6 (31-228)||(16084942-16085136)
chr6 (113-223)||(18824841-18824951)
chr6 (113-223)||(18840696-18840806)
chr6 (30-222)||(16826872-16827065)
chr6 (8-222)||(18582151-18582367)
chr6 (15-228)||(25745422-25745635)
chr6 (82-214)||(14627658-14627791)
chr6 (30-221)||(19628302-19628490)
chr6 (16-228)||(22431109-22431320)
chr6 (30-228)||(23152120-23152318)
chr6 (63-228)||(18087846-18088015)
chr6 (129-228)||(1658915-1659014)
chr6 (130-222)||(19609350-19609442)
chr6 (63-228)||(23976428-23976595)
chr6 (8-228)||(25368428-25368651)
chr6 (63-172)||(26088782-26088893)
chr6 (122-228)||(1651148-1651254)
chr6 (81-219)||(22867026-22867166)
chr6 (129-207)||(21776791-21776870)
chr6 (36-174)||(18397842-18397982)
chr6 (30-128)||(13015910-13016006)
chr6 (78-136)||(25903975-25904033)
chr6 (143-213)||(16301107-16301178)
chr6 (187-228)||(16827138-16827179)
chr6 (187-228)||(4989756-4989797)
chr6 (187-228)||(18825023-18825064)
chr6 (184-228)||(15736440-15736484)
chr6 (76-221)||(28195924-28196074)
chr6 (125-228)||(16230441-16230546)
chr6 (192-227)||(16239227-16239262)
chr6 (186-228)||(14627871-14627913)
chr6 (186-228)||(18004234-18004276)
chr6 (187-221)||(18843083-18843117)
chr6 (186-228)||(25174413-25174455)
chr6 (186-228)||(27655348-27655390)
chr6 (177-221)||(15861597-15861642)
chr6 (148-227)||(13016008-13016088)
chr6 (155-228)||(10487736-10487809)
chr6 (155-228)||(16377518-16377591)
chr6 (155-228)||(16384842-16384915)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (11-228)||(71539-71756)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (16-227)||(256001-256211)
scaffold0011 (16-227)||(262607-262817)
scaffold0011 (86-223)||(124454-124591)
scaffold0011 (86-228)||(75855-75997)
scaffold0011 (86-153)||(193515-193582)
scaffold0011 (189-228)||(193469-193508)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (16-228)||(6453-6664)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (12-228)||(44864101-44864316)
chr7 (8-227)||(12753740-12753958)
chr7 (20-228)||(125684-125892)
chr7 (8-228)||(47288633-47288852)
chr7 (8-222)||(14252277-14252491)
chr7 (78-228)||(15851184-15851334)
chr7 (8-228)||(3893951-3894173)
chr7 (10-228)||(12544801-12545018)
chr7 (8-228)||(369745-369965)
chr7 (53-228)||(11286071-11286247)
chr7 (30-228)||(15823514-15823712)
chr7 (10-228)||(45453346-45453562)
chr7 (78-222)||(16417436-16417580)
chr7 (53-228)||(26071396-26071572)
chr7 (53-228)||(26095183-26095359)
chr7 (8-225)||(112381-112600)
chr7 (8-222)||(32495532-32495747)
chr7 (78-214)||(15952144-15952280)
chr7 (13-228)||(13867163-13867380)
chr7 (74-222)||(13912155-13912305)
chr7 (83-222)||(7291825-7291966)
chr7 (8-228)||(142486-142708)
chr7 (78-223)||(11515198-11515345)
chr7 (8-222)||(2027529-2027742)
chr7 (76-223)||(7285361-7285510)
chr7 (125-228)||(36051521-36051624)
chr7 (16-228)||(39047785-39047997)
chr7 (63-228)||(13757436-13757603)
chr7 (76-228)||(12249263-12249418)
chr7 (8-228)||(13273611-13273833)
chr7 (63-228)||(18981044-18981213)
chr7 (76-228)||(49048942-49049098)
chr7 (8-228)||(15629639-15629860)
chr7 (81-228)||(16571246-16571395)
chr7 (81-228)||(16594267-16594416)
chr7 (123-228)||(1937973-1938077)
chr7 (8-228)||(10861927-10862149)
chr7 (129-214)||(16480034-16480120)
chr7 (113-212)||(7285504-7285603)
chr7 (86-154)||(11582027-11582095)
chr7 (74-228)||(15442707-15442865)
chr7 (74-151)||(30263272-30263351)
chr7 (177-223)||(11515092-11515138)
chr7 (187-228)||(32495819-32495860)
chr7 (86-154)||(16210691-16210759)
chr7 (63-126)||(3048688-3048751)
chr7 (189-228)||(11582109-11582148)
chr7 (95-146)||(13038299-13038350)
chr7 (189-228)||(13038373-13038412)
chr7 (189-228)||(16210637-16210676)
chr7 (63-146)||(2191684-2191769)
chr7 (186-228)||(7291711-7291753)
chr7 (186-228)||(15952360-15952402)
chr7 (186-228)||(16417322-16417364)
chr7 (186-228)||(16480200-16480242)
chr7 (186-228)||(26010455-26010497)
chr7 (86-146)||(3058966-3059026)
chr7 (8-116)||(35093783-35093890)
chr7 (192-223)||(3058910-3058941)
chr7 (189-228)||(15926222-15926261)
chr7 (186-228)||(2027415-2027457)
chr7 (155-228)||(7821778-7821851)
chr7 (155-228)||(7829089-7829162)
chr7 (155-228)||(27102783-27102856)
chr7 (155-228)||(27110131-27110204)
chr7 (155-228)||(27175470-27175543)
chr7 (155-228)||(38784875-38784948)
chr7 (187-228)||(13912378-13912419)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (8-228)||(25809-26029)
scaffold0037 (13-228)||(70486-70701)
scaffold0037 (81-221)||(93560-93701)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (8-228)||(21393046-21393265)
chr5 (8-222)||(9731762-9731975)
chr5 (13-228)||(1169602-1169816)
chr5 (30-215)||(23510859-23511044)
chr5 (78-223)||(10779344-10779489)
chr5 (78-222)||(11318-11462)
chr5 (16-227)||(28258460-28258669)
chr5 (78-228)||(16535163-16535313)
chr5 (8-228)||(20710994-20711214)
chr5 (78-222)||(29191785-29191929)
chr5 (13-222)||(11582846-11583055)
chr5 (8-228)||(17472823-17473043)
chr5 (8-228)||(24184295-24184516)
chr5 (76-223)||(110145-110292)
chr5 (8-228)||(4864125-4864343)
chr5 (74-222)||(1220890-1221040)
chr5 (74-222)||(4201124-4201274)
chr5 (81-228)||(19404439-19404588)
chr5 (30-222)||(27184830-27185023)
chr5 (13-222)||(23513767-23513977)
chr5 (78-222)||(18779155-18779301)
chr5 (82-222)||(25425589-25425732)
chr5 (10-228)||(21652485-21652705)
chr5 (63-226)||(21649689-21649855)
chr5 (83-224)||(11338021-11338165)
chr5 (78-222)||(22367647-22367793)
chr5 (78-223)||(11341605-11341749)
chr5 (78-228)||(22884454-22884603)
chr5 (78-223)||(25901488-25901635)
chr5 (8-228)||(23453809-23454032)
chr5 (8-228)||(23465314-23465537)
chr5 (130-222)||(7424648-7424740)
chr5 (129-219)||(19498764-19498855)
chr5 (8-228)||(24474444-24474654)
chr5 (74-228)||(21234670-21234828)
chr5 (125-228)||(11341492-11341597)
chr5 (13-151)||(23505663-23505802)
chr5 (74-151)||(20615547-20615626)
chr5 (187-228)||(110364-110405)
chr5 (187-228)||(1169923-1169964)
chr5 (125-228)||(25425475-25425580)
chr5 (187-228)||(27185095-27185136)
chr5 (74-151)||(37051919-37051998)
chr5 (125-228)||(9731984-9732089)
chr5 (82-146)||(35792275-35792341)
chr5 (186-228)||(11204-11246)
chr5 (186-228)||(1221112-1221154)
chr5 (186-228)||(7424533-7424575)
chr5 (186-228)||(10779560-10779602)
chr5 (186-228)||(11582732-11582774)
chr5 (186-228)||(18779374-18779416)
chr5 (186-228)||(22367865-22367907)
chr5 (189-228)||(11212986-11213025)
chr5 (189-228)||(23513654-23513693)
chr5 (189-228)||(29192004-29192043)
chr5 (186-228)||(21074870-21074912)
chr5 (155-228)||(21933512-21933585)
chr5 (155-228)||(21939682-21939755)
chr5 (155-228)||(35581107-35581180)
chr5 (155-228)||(37010516-37010589)
chr5 (187-228)||(4201347-4201388)
chr5 (199-228)||(25192390-25192419)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (9-228)||(16183094-16183312)
chr3 (8-222)||(18909656-18909869)
chr3 (8-222)||(53769627-53769840)
chr3 (8-228)||(50113218-50113435)
chr3 (8-228)||(6147927-6148144)
chr3 (78-222)||(22274011-22274155)
chr3 (78-222)||(2450374-2450518)
chr3 (8-215)||(13837733-13837938)
chr3 (8-228)||(17099570-17099789)
chr3 (13-228)||(22145362-22145577)
chr3 (74-218)||(17957375-17957520)
chr3 (8-228)||(318695-318916)
chr3 (85-225)||(47786041-47786183)
chr3 (16-228)||(12350934-12351147)
chr3 (78-223)||(49231180-49231326)
chr3 (8-228)||(15469552-15469771)
chr3 (78-214)||(16819882-16820019)
chr3 (8-228)||(35122542-35122763)
chr3 (86-228)||(13816368-13816511)
chr3 (8-222)||(7852777-7852993)
chr3 (10-228)||(53899605-53899825)
chr3 (30-223)||(51159475-51159669)
chr3 (9-228)||(11198653-11198874)
chr3 (13-228)||(12562563-12562780)
chr3 (76-228)||(11062184-11062339)
chr3 (63-226)||(23491363-23491530)
chr3 (86-228)||(19571932-19572074)
chr3 (13-158)||(54423001-54423145)
chr3 (8-228)||(14297354-14297574)
chr3 (8-228)||(14302981-14303201)
chr3 (8-224)||(8630706-8630920)
chr3 (86-228)||(15860308-15860450)
chr3 (81-228)||(40938587-40938736)
chr3 (81-228)||(14294285-14294434)
chr3 (81-228)||(14299912-14300061)
chr3 (89-228)||(17937352-17937492)
chr3 (86-222)||(33340812-33340949)
chr3 (78-228)||(25057702-25057856)
chr3 (8-217)||(17138342-17138553)
chr3 (8-146)||(17523552-17523690)
chr3 (122-228)||(15574896-15575002)
chr3 (122-228)||(15613915-15614021)
chr3 (13-228)||(19945482-19945700)
chr3 (76-228)||(39654769-39654925)
chr3 (63-126)||(38167007-38167070)
chr3 (186-228)||(33340698-33340740)
chr3 (85-154)||(12031164-12031233)
chr3 (187-228)||(16819761-16819802)
chr3 (125-176)||(14522487-14522538)
chr3 (189-228)||(51159742-51159781)
chr3 (191-228)||(2048916-2048953)
chr3 (85-154)||(2048969-2049038)
chr3 (125-213)||(10737388-10737476)
chr3 (8-121)||(16260149-16260261)
chr3 (86-154)||(19230968-19231036)
chr3 (125-228)||(18909542-18909647)
chr3 (125-228)||(53769513-53769618)
chr3 (186-228)||(2450590-2450632)
chr3 (190-224)||(19230919-19230953)
chr3 (186-228)||(22273897-22273939)
chr3 (191-227)||(12031249-12031285)
chr3 (125-228)||(17957533-17957638)
chr3 (155-228)||(1468885-1468958)
chr3 (186-228)||(7852663-7852705)
chr3 (155-228)||(44228282-44228354)
chr3 (195-228)||(8269673-8269706)
chr3 (195-228)||(8276784-8276817)
chr3 (187-228)||(11883518-11883559)
[»] chr2 (55 HSPs)
chr2 (18-228)||(22273741-22273951)
chr2 (18-228)||(22282974-22283184)
chr2 (8-222)||(21275503-21275716)
chr2 (8-222)||(12643001-12643214)
chr2 (8-222)||(42179342-42179555)
chr2 (78-222)||(19887825-19887969)
chr2 (8-228)||(36891794-36892014)
chr2 (78-222)||(21140843-21140987)
chr2 (53-228)||(27260417-27260592)
chr2 (63-222)||(3800036-3800195)
chr2 (89-225)||(16900224-16900361)
chr2 (89-225)||(16993615-16993752)
chr2 (16-228)||(6878299-6878513)
chr2 (8-228)||(4449312-4449534)
chr2 (76-198)||(25211866-25211988)
chr2 (16-228)||(8942502-8942715)
chr2 (16-228)||(12637255-12637468)
chr2 (89-228)||(22581094-22581236)
chr2 (13-203)||(270035-270226)
chr2 (78-223)||(34823165-34823309)
chr2 (78-223)||(12727126-12727270)
chr2 (125-228)||(8886996-8887099)
chr2 (63-228)||(24572526-24572694)
chr2 (8-228)||(28972896-28973118)
chr2 (63-228)||(9653983-9654139)
chr2 (125-228)||(7320345-7320450)
chr2 (125-228)||(22862343-22862446)
chr2 (86-153)||(20628580-20628647)
chr2 (74-228)||(20013976-20014131)
chr2 (74-228)||(14907583-14907741)
chr2 (74-228)||(23819033-23819191)
chr2 (185-227)||(25877210-25877252)
chr2 (187-228)||(25600817-25600858)
chr2 (127-228)||(12726907-12727010)
chr2 (148-224)||(22691175-22691252)
chr2 (148-224)||(22695822-22695899)
chr2 (8-228)||(22787108-22787330)
chr2 (187-228)||(24827831-24827872)
chr2 (86-154)||(461646-461714)
chr2 (125-228)||(12643223-12643328)
chr2 (189-228)||(20628662-20628701)
chr2 (186-228)||(19888041-19888083)
chr2 (186-228)||(21140729-21140771)
chr2 (186-228)||(21275788-21275830)
chr2 (160-228)||(721338-721407)
chr2 (177-222)||(3800257-3800302)
chr2 (187-228)||(34823052-34823093)
chr2 (192-225)||(43644243-43644276)
chr2 (125-223)||(12727020-12727118)
chr2 (86-154)||(43644158-43644226)
chr2 (155-228)||(11232484-11232557)
chr2 (155-228)||(22514331-22514404)
chr2 (155-228)||(28776932-28777005)
chr2 (187-228)||(5889559-5889600)
chr2 (125-228)||(24088566-24088671)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (53-228)||(7651-7827)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (18-228)||(32287-32496)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (18-228)||(40348-40557)
scaffold0078 (74-222)||(38372-38522)
scaffold0078 (186-228)||(38594-38636)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (8-222)||(14842-15055)
scaffold0251 (125-228)||(15064-15169)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (8-228)||(137897-138116)
scaffold0021 (8-228)||(87296-87504)
scaffold0021 (13-228)||(10523-10740)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (8-228)||(1925-2144)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (8-228)||(12826-13045)
scaffold0359 (8-228)||(182-400)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (78-228)||(1368-1518)
scaffold0383 (15-228)||(6088-6303)
scaffold0383 (187-228)||(1221-1262)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (57-228)||(2925-3097)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (37-228)||(6404-6594)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (8-228)||(44656-44875)
scaffold0034 (8-223)||(39178-39392)
scaffold0034 (113-228)||(39069-39184)
scaffold0034 (82-228)||(78409-78558)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (74-228)||(20446-20600)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (15-228)||(3480-3695)
scaffold0447 (15-69)||(8256-8309)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (8-228)||(95326-95545)
scaffold0044 (187-228)||(95178-95219)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (8-223)||(129353-129568)
scaffold0028 (86-222)||(89938-90075)
scaffold0028 (187-228)||(129240-129281)
scaffold0028 (186-228)||(90147-90189)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (78-222)||(6148-6292)
scaffold0003 (86-154)||(216932-217000)
scaffold0003 (186-228)||(6034-6076)
scaffold0003 (191-228)||(217016-217053)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (78-222)||(155402-155546)
scaffold0023 (186-228)||(155618-155660)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (63-222)||(1507-1666)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (10-228)||(46983-47201)
scaffold0068 (10-228)||(60431-60649)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (53-228)||(3517-3692)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (13-228)||(13283-13498)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (13-228)||(28889-29104)
scaffold0116 (189-228)||(28741-28780)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (16-228)||(43051-43262)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (8-228)||(237039-237261)
scaffold0009 (187-228)||(270979-271020)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (63-218)||(2162-2319)
scaffold0597 (187-228)||(2395-2436)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (17-228)||(113652-113862)
scaffold0022 (8-220)||(108526-108739)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (9-221)||(17485-17697)
scaffold0244 (8-221)||(23903-24116)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (52-228)||(7781-7958)
scaffold0195 (52-228)||(13170-13347)
scaffold0195 (125-228)||(20248-20351)
scaffold0195 (125-228)||(18164-18267)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (8-228)||(13056-13275)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (8-224)||(145538-145757)
scaffold0025 (177-228)||(145387-145438)
scaffold0025 (85-156)||(147698-147769)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (8-228)||(52361-52579)
scaffold0018 (8-228)||(56313-56531)
[»] scaffold0269 (3 HSPs)
scaffold0269 (82-222)||(935-1077)
scaffold0269 (82-222)||(15191-15333)
scaffold0269 (8-117)||(12021-12129)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (8-228)||(18510-18735)
scaffold0234 (177-228)||(18831-18882)
[»] scaffold1734 (2 HSPs)
scaffold1734 (82-228)||(196-345)
scaffold1734 (189-228)||(47-86)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (78-222)||(17618-17764)
scaffold0315 (187-228)||(17504-17545)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (11-228)||(766-984)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (63-228)||(54487-54653)
scaffold0032 (186-228)||(109344-109386)
scaffold0032 (82-135)||(14590-14645)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (82-222)||(2740-2882)
scaffold0761 (191-228)||(2958-2995)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (78-228)||(27879-28028)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (29-228)||(23930-24128)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (8-228)||(145783-146005)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (86-228)||(5770-5914)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (63-228)||(11062-11230)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (8-156)||(18263-18410)
scaffold0120 (147-228)||(30045-30127)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (27-228)||(21516-21696)
scaffold0008 (95-156)||(129390-129451)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (95-228)||(8290-8424)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (125-222)||(1575-1672)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (8-228)||(2540-2762)
[»] scaffold0138 (5 HSPs)
scaffold0138 (8-215)||(14350-14556)
scaffold0138 (189-228)||(28355-28394)
scaffold0138 (189-228)||(40351-40390)
scaffold0138 (187-228)||(28504-28545)
scaffold0138 (187-228)||(40500-40541)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (125-228)||(248741-248844)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (8-142)||(53462-53593)
scaffold0066 (187-228)||(53162-53203)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (76-228)||(6750-6906)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (76-228)||(2286-2442)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (134-228)||(59580-59675)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (129-228)||(32440-32541)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (153-228)||(14537-14613)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (162-222)||(41677-41737)
scaffold0132 (187-228)||(41564-41605)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (82-228)||(318-467)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (86-153)||(2085-2152)
scaffold1140 (189-228)||(2039-2078)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (52-119)||(1817-1884)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (74-228)||(2723-2881)
scaffold0124 (160-228)||(22940-23008)
[»] scaffold0750 (2 HSPs)
scaffold0750 (14-174)||(5515-5676)
scaffold0750 (160-228)||(6577-6645)
[»] scaffold0692 (2 HSPs)
scaffold0692 (16-127)||(505-615)
scaffold0692 (148-228)||(618-699)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (189-228)||(6415-6454)
scaffold0218 (86-154)||(6332-6400)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (86-156)||(7890-7960)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (74-228)||(21502-21660)
scaffold0141 (74-228)||(25757-25915)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (97-154)||(40502-40559)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (192-228)||(4698-4734)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (186-228)||(17353-17395)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (82-137)||(330964-331021)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (194-227)||(413-446)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (95-156)||(4788-4849)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (86-154)||(27696-27763)
scaffold0162 (192-228)||(27781-27817)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (189-228)||(34427-34466)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (155-228)||(38140-38213)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 821196 - 821415
Alignment:
Q  7 cgccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  821196 cgccagttgccacttgatacggttt--ggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgaccaagtgaagttg 821293  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  821294 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtga 821393  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  821394 tagttgatgttgaatgacattg 821415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44054997 - 44054777
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44054997 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttat 44054898  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||| ||    
T  44054897 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcacgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaagctaaatgtaat 44054798  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44054797 agttgatgttgaatgacattg 44054777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 45460040 - 45460259
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45460040 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 45460138  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  45460139 atgattaaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgagat 45460238  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  45460239 agttaatgttgaatgacattg 45460259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33739339 - 33739120
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||   ||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  33739339 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatattt-cttgaaccaattgtattaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 33739241  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33739240 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaagctatatgtgat 33739141  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33739140 agttgatgttgaatgacattg 33739120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Original strand, 25120215 - 25120425
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25120215 acttgatatgggttttgatcggcgatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaatgaat 25120314  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25120315 gattataatggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 25120413  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  25120414 tgaatgacattg 25120425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 5683906 - 5684056
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5683906 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 5684005  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5684006 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 5684056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 15273736 - 15273949
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  15273736 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 15273834  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15273835 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 15273934  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  15273935 agttgatgttgaatg 15273949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16521863 - 16521643
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16521863 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 16521765  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16521764 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 16521665  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16521664 tagttgatgttgaatgacattg 16521643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18247299 - 18247155
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18247299 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 18247200  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18247199 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 18247155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44345902 - 44345683
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  44345902 gccggtggccccttgatatggtttttggtcgaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 44345804  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44345803 atgaatgaatgattgttttggatatgttgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgttgaaactatatgtgat 44345704  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44345703 agttgatgttgaatgacattg 44345683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 21960657 - 21960871
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||    |  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21960657 ttgccacttgacatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgatctatcatgactatttttatatgactaagtgaagttgtatgaa 21960755  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21960756 tgaatgattgtattggatacgatgtttatcttgagatgtgtatgctaccttacttagaatgtatggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaatagttg 21960855  T
Q  213 atgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| ||||||||||    
T  21960856 atgttaaatgacattg 21960871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 30233626 - 30233846
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||    
T  30233626 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtggttactcttatatgactaagtaaatttg 30233723  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||| |    
T  30233724 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaatggcgaaactatatgag 30233823  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  30233824 atagttaatgttgaatgacattg 30233846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Original strand, 7133479 - 7133631
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 161  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  7133479 cttacgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatc 7133578  T
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7133579 ttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 7133631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9294638 - 9294491
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  9294638 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 9294539  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9294538 aggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatga 9294491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 12900853 - 12901075
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||| | |||||||  |||| | ||||| ||| |||||||||    
T  12900853 gccgtttgccacttgacacggattttggtcggaaatgttt-cttgagcaaattgtcttatgatttgttgtgaccattcatgtatgactaattgaagttgt 12900951  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12900952 ataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 12901051  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  12901052 gatagttgatgtttaatgatattg 12901075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 19698447 - 19698657
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19698447 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 19698544  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 205  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698545 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 19698641  T
Q  206 atagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  19698642 atagttgatgttgaat 19698657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 19709032 - 19709242
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19709032 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 19709129  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 205  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19709130 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 19709226  T
Q  206 atagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  19709227 atagttgatgttgaat 19709242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26679152 - 26679002
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26679152 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 26679053  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26679052 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 26679002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15212523 - 15212413
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212523 tgaatgattgtattagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 15212424  T
Q  213 atgttgaatga 223  Q
    |||||||||||    
T  15212423 atgttgaatga 15212413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18167903 - 18167766
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18167903 gattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgagtgattgtattggatatgatgtttatcaagagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaa 18167804  T
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18167803 ggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18167766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 23271015 - 23271227
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23271015 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtt--cttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaa 23271111  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    || ||||| ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23271112 tggatgatcgtattggatatgatggttgtcatgagatatgtatgctatcttacttggaatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagtt 23271210  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||| || ||||||    
T  23271211 gatgttggataacattg 23271227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 54119356 - 54119575
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||| |  | ||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  54119356 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatattt-cttgagccaattatcttgtgagttatggtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 54119454  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  54119455 atgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcttgagatgtgtaagctatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatatgtga 54119553  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  54119554 tagttgatgtggaatgacattg 54119575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 22355604 - 22355754
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  22355604 ttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaa 22355703  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22355704 tgtaaggaatgcttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 22355754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10643145 - 10643042
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10643145 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtggaactatatgtgatagttgatgttgaataac 10643046  T
Q  225 attg 228  Q
    ||||    
T  10643045 attg 10643042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 18294100 - 18294322
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||    
T  18294100 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtataactaagtgaagttgt 18294198  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattg--gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||| ||||| ||||   ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18294199 atgaatgagtgattatatttttgatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatgcttgaaatcgtgaaactatatgt 18294298  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  18294299 gatatttgatgttgaatgacattg 18294322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14995202 - 14995050
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |  |||||||| |||| |    
T  14995202 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatat 14995103  T
Q  175 aaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14995102 -gagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 14995050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 55377673 - 55377873
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |     
T  55377673 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttaagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtaaaat 55377771  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  55377772 tgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagataagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatacgtgatagtt 55377871  T
Q  212 ga 213  Q
    ||    
T  55377872 ga 55377873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13245447 - 13245305
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||    
T  13245447 ttatataactaagtgaaaatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgt-aagaaatgtt 13245349  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13245348 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattg 13245305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 18251103 - 18251232
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18251103 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggaaatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaagga 18251202  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    ||  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18251203 atgtttgaatagtgaaattatatgtgatag 18251232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15212419 - 15212311
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15212419 tgaatgattgtaatagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctaaga-acttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttg 15212321  T
Q  213 atgttgaatg 222  Q
    ||||||||||    
T  15212320 atgttgaatg 15212311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19999547 - 19999380
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 161  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||    
T  19999547 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctc 19999448  T
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||| |||| |  |||||  ||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  19999447 ttacttggaatat-gagaattgtttggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattg 19999380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Original strand, 15288106 - 15288198
Alignment:
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15288106 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatttgatagttgatgtttaatg 15288198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Original strand, 15295216 - 15295308
Alignment:
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15295216 tatgatgtatatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 15295308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 154
Target Start/End: Original strand, 53705902 - 53706039
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53705902 ccacttgatatggtttttagtcggaaatgttt-ctcgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 53706000  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53706001 atgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53706039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Original strand, 8873631 - 8873774
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||| || ||| |||| |||  |||||| | ||||||||||| |    
T  8873631 gccggtggccagttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaacggtggtgactatgtttatataactaagtgaagttat 8873729  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8873730 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtg 8873774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19019617 - 19019506
Alignment:
Q  29 tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 128  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  19019617 ttttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttga 19019520  T
Q  129 atatgatgtttatc 142  Q
    || |||||||||||    
T  19019519 atgtgatgtttatc 19019506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 53908963 - 53909031
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53908963 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53909031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 13810709 - 13810870
Alignment:
Q  17 cacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| || | || ||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13810709 cacttgatacggtatt--gtcggaaatggttcttttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatggatga 13810806  T
Q  116 atgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | | |||||||||||||||    
T  13810807 atgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttcttttacttagaatgtaa 13810870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 18495604 - 18495709
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||  ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18495604 ttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgctctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactatatgagatagttgttgttgaatg 18495703  T
Q  223 acattg 228  Q
    ||||||    
T  18495704 acattg 18495709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10487682 - 10487524
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  10487682 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 10487583  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  10487582 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 10487524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 16329069 - 16329227
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  16329069 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 16329168  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  16329169 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 16329227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15212611 - 15212552
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  15212611 tgaatgattgtatgggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaat 15212552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 7133711 - 7133752
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7133711 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 7133752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8373249 - 8373208
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373249 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 8373208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14950914 - 14950873
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14950914 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 14950873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18167686 - 18167645
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18167686 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 18167645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34394156 - 34394052
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || | |  |||||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34394156 ttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 34394058  T
Q  223 acattg 228  Q
    ||||||    
T  34394057 acattg 34394052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8373415 - 8373321
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || | || |||||||| |||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373415 atatgatatttatcatgagatgttgttttctctcttacttggaatatga-gaatgctggaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 8373321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 110456 - 110391
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  110456 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgt 110391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9294419 - 9294378
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9294419 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 9294378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 110371 - 110335
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110371 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 110335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Original strand, 5684153 - 5684205
Alignment:
Q  177 agaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5684153 agaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 5684205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Original strand, 18294418 - 18294470
Alignment:
Q  177 agaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18294418 agaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 18294470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8044153 - 8044114
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8044153 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 8044114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 15273958 - 15274063
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15273958 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 15274056  T
Q  222 gacattg 228  Q
    |||||||    
T  15274057 gacattg 15274063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34393948 - 34393909
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34393948 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 34393909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 53706054 - 53706093
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53706054 tggtgaaactatatgtgatagttggtgttgaatgacattg 53706093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15212239 - 15212197
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15212239 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 15212197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 15288271 - 15288313
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15288271 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 15288313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 15295381 - 15295423
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15295381 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 15295423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 18109838 - 18109923
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatga 146  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  18109838 cttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttataatga 18109923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18247083 - 18247041
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18247083 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 18247041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 22355826 - 22355867
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22355826 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 22355867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26678929 - 26678888
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  26678929 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 26678888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47356214 - 47356181
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47356214 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 47356181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15212633 - 15212605
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212633 aactatatgtgatagttgatgttgaatga 15212605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 22407286 - 22407504
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22407286 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttatat 22407385  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22407386 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaaactaaatgtaatag 22407485  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22407486 ttgatgttgaatgacattg 22407504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49966717 - 49966503
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49966717 ttgccacttgatacggtttttggtgcaaaatgttttcttgagtcaattaccttgtgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 49966618  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49966617 tga-tgattgtatttgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaatagttg 49966519  T
Q  213 atgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  49966518 atgttgaatgacattg 49966503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18506422 - 18506210
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18506422 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaatggtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatg 18506324  T
Q  115 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18506323 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18506224  T
Q  215 gttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||    
T  18506223 gttgaatgacattg 18506210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 20826206 - 20826419
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  20826206 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 20826304  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20826305 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 20826404  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  20826405 agttgatgttgaatg 20826419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 228
Target Start/End: Original strand, 44036024 - 44036209
Alignment:
Q  42 atgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttat 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036024 atgttttcttgagtcaattaccttagaaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttat 44036123  T
Q  142 catgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036124 catgagatgtgtatgctatcttac-tagaatataaggaat-gttgaattggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 44036209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21717271 - 21717057
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21717271 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtttt-ttgagcgaattgtcttatgaattattgtgaatattcttatatgacgaagtgaagttgtatgaa 21717174  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||    
T  21717173 tgaatgattgtattggacatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatgttgaaactatatgatatagtt 21717074  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  21717073 gatgttgaatgacattg 21717057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35053909 - 35053694
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35053909 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatg 35053811  T
Q  115 aatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35053810 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaattatatgtgatagtt 35053711  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||| ||||||    
T  35053710 gatgttgaataacattg 35053694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 15862592 - 15862742
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15862592 gattattcttgcatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatttttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 15862691  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862692 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 15862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22353279 - 22353129
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22353279 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 22353180  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22353179 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatattg 22353129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 2422065 - 2422280
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2422065 ttgccacttgacacggtctttggtcgcaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttctgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgac 2422163  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2422164 tgaatgattgtattgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttactcaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagtt 2422263  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  2422264 gatgttgaatgacattg 2422280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 5675690 - 5675910
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  5675690 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 5675788  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5675789 atgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttaccttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 5675888  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  5675889 tagttgatgttgaataacattg 5675910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 27330861 - 27331079
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27330861 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattacattataaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttg 27330958  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  27330959 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgcta--ttgattagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgag 27331056  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  27331057 atagttaatgttgaatgacattg 27331079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41211119 - 41210900
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  | || |||| || ||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  41211119 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtttt-ttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgattatgtttatataactaagtgaagttgt 41211021  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  41211020 atgaaggaatgattgttttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttgggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtga 41210922  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  41210921 tagttggcgttgaatgacattg 41210900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 35523508 - 35523730
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  35523508 gccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgttt-cttgagccaatttacttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 35523606  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||     
T  35523607 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaaatggtgaaaccatatga 35523706  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||  ||||||||  ||||||||    
T  35523707 gataaatgatgttgggtgacattg 35523730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 22250113 - 22250262
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  22250113 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 22250211  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22250212 gaatgcttgaattggtg-aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattg 22250262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 51657400 - 51657623
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaat-gttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||   || ||||||||  ||||||| |  | |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  51657400 gccggttgccacttggtacggtatt--gtcggaaatagttcatttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttg 51657497  T
Q  107 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatat 202  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||    
T  51657498 tatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtcgtatgttctcttacttagaatgtaaccaatgcttgaaatggtgaaaatatat 51657597  T
Q  203 gtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    | | | ||||||||||||||||||||    
T  51657598 gaggtggttgatgttgaatgacattg 51657623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41218442 - 41218316
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtga 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  41218442 taagtgaagttgtatgtatgaatgattgtattggatatgattttgatcatgagaggtgtaggctatcttacctagtatgtaaggaatgcttgaatggtga 41218343  T
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41218342 aactatatgtgattgttgatgtagaat 41218316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17147801 - 17147634
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17147801 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 17147702  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147701 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 17147634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 20956127 - 20956278
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  20956127 gtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaat 20956226  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    || |  |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20956227 gtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatga 20956278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21858515 - 21858410
Alignment:
Q  123 tattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858515 tattggatatgatgtttagcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgttagaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 21858417  T
Q  222 gacattg 228  Q
    |||||||    
T  21858416 gacattg 21858410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45050642 - 45050536
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45050642 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 45050544  T
Q  221 tgacattg 228  Q
    ||||||||    
T  45050543 tgacattg 45050536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 9785340 - 9785550
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||   ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||| ||||||    
T  9785340 gccggtggccacttgatatggtttttggtaaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgtagttgt 9785438  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||          ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9785439 atgaatgaatgat----------atgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtga 9785528  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  9785529 tagttgatgttgaataacattg 9785550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 216
Target Start/End: Original strand, 20894886 - 20894991
Alignment:
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagt 210  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||  |||  ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20894886 atgaatgattgtgtttgatatgatatttatcatgagatgtgtaagctaccttacttaaaatgtaagaaatgtttgaattcgtgaaactatatgtgatagt 20894985  T
Q  211 tgatgt 216  Q
    ||||||    
T  20894986 tgatgt 20894991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22365757 - 22365609
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |  |||||||| |||| |  ||    
T  22365757 attcttgtattactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatat-gag 22365659  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22365658 aatgcttgaattggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 22365609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 37845654 - 37845722
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37845654 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 37845722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 51451623 - 51451544
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51451623 ttgtgattattcttgtatgaccaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 51451544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20527010 - 20526972
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527010 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 20526972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Original strand, 7641803 - 7641904
Alignment:
Q  127 ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtat-gctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7641803 ggatgtgatgattatcatgagatgtattttgctatcttacttggaatgtga-gaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataac 7641900  T
Q  225 attg 228  Q
    ||||    
T  7641901 attg 7641904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 20826428 - 20826533
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20826428 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 20826526  T
Q  222 gacattg 228  Q
    |||||||    
T  20826527 gacattg 20826533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20444638 - 20444600
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20444638 ggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattg 20444600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20530403 - 20530365
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20530403 ggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattg 20530365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20930450 - 20930380
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20930450 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatggttatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 20930380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 228
Target Start/End: Original strand, 37845737 - 37845775
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37845737 ggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 37845775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41393346 - 41393304
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41393346 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 41393304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20444721 - 20444653
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20444721 ttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20444653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20527092 - 20527025
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20527092 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt-agtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20527025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20530486 - 20530418
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20530486 ttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20530418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17003747 - 17003674
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  17003747 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 17003674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Original strand, 18060885 - 18060918
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18060885 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 18060918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22353015 - 22352982
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22353015 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 22352982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25121614 - 25121403
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25121614 ttgccacttgatacggtttttggtcaaaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtataaa 25121515  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25121514 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgcatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtaaaactatatgtgatagttg 25121415  T
Q  213 atgttgaatgac 224  Q
    ||||||||||||    
T  25121414 atgttgaatgac 25121403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Original strand, 22322525 - 22322736
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22322525 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 22322624  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22322625 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagaggtgtatgctatcttacctagtatgtaaggaatgcttgaatggtgaaaccacatgtgatagttgatg 22322724  T
Q  216 ttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||    
T  22322725 ttgaatgacatt 22322736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29759358 - 29759148
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29759358 acttgatatgggttttgatcggagatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 29759259  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29759258 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatataaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 29759160  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  29759159 tgaatgacattg 29759148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 19994234 - 19994453
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  19994234 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaatcaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 19994332  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19994333 atgaatgaatgattgttttgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 19994432  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19994433 agttgatgttgaatgacattg 19994453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41245662 - 41245520
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  41245662 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatataaagaatgctt 41245563  T
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41245562 gaatggtaaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 41245520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20480748 - 20480526
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  20480748 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaactgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 20480650  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| | |||||| |||||||    
T  20480649 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatttgtgaaattatatgt 20480550  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  20480549 gatagttgatgttgaataacattg 20480526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37610443 - 37610224
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37610443 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcgtatatgactaagtgaagttgt 37610346  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  37610345 atgaatgaataattgtgttagatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatcggtgaatctatatgtga 37610246  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  37610245 tagttgatgttgaataacattg 37610224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 222
Target Start/End: Original strand, 24107629 - 24107775
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107629 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 24107728  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107729 aggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 24107775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28836704 - 28836562
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28836704 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagga 28836605  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28836604 atgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 28836562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18611587 - 18611377
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  18611587 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 18611490  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 205  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18611489 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 18611393  T
Q  206 atagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  18611392 atagttgatgttgaat 18611377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21680209 - 21680060
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  21680209 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatg-ttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaga 21680111  T
Q  179 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680110 aatgcttgaaatggtgaaaatatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 21680060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Original strand, 22908532 - 22908673
Alignment:
Q  83 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22908532 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaattattgtattttggatatgatttttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaa 22908631  T
Q  181 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22908632 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatggtgaatg 22908673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Original strand, 20648541 - 20648741
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttg 127  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||  |||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||     
T  20648541 ttttggccggaaatgttt-cttgagccgattggcttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattttt 20648639  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20648640 gatatgatgtttatcatgagttgggtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaagcatatgtgataattgatgttggatgacat 20648739  T
Q  227 tg 228  Q
    ||    
T  20648740 tg 20648741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 22007638 - 22007787
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |    
T  22007638 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttaacatgagatgtgtatgctatcttacttggaatat-ga 22007736  T
Q  178 gaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22007737 gaatgcttgaataggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 22007787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Original strand, 24930160 - 24930302
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24930160 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 24930259  T
Q  180 atacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930260 atccttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 24930302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Original strand, 20655158 - 20655326
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  20655158 cttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttttataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagttgggtatggtat 20655257  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20655258 cttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaacgatatgtgataattgatgttggatgacattg 20655326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21696639 - 21696419
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || ||||||||  ||||||  |  | |||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  21696639 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttaagtcaattgtcttatgt-tcatcgtgactattcttacatggctaagtgaagttgt 21696543  T
Q  108 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||      
T  21696542 atgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatataa 21696443  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  21696442 ggtagttgatgttgaatgacattg 21696419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 43374782 - 43374885
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43374782 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 43374881  T
Q  225 attg 228  Q
    ||||    
T  43374882 attg 43374885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 13663635 - 13663791
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  13663635 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaa 13663734  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13663735 tgtgagaaatgcttgaattggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 13663791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Original strand, 24386843 - 24387011
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  24386843 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatgataattatcatgagaagtgtatgctat 24386942  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24386943 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaattggtgaatccatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 24387011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 24718564 - 24718719
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | |||||||| ||||    
T  24718564 ttgtgattatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaat 24718663  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
     |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24718664 at-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 24718719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 13722174 - 13722326
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||     
T  13722174 gattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtg 13722273  T
Q  176 aagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |  ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722274 agaaatgcttgaattagtg-aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 13722326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Original strand, 16874074 - 16874241
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16874074 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 16874173  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16874174 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 16874241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16417266 - 16417118
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  16417266 tattcttatatgactaagtgaaattgtatgattgaatgattgtatgagatatgatgcttatcgtgagatgtgcatgctaccttacttaggatgtaagaaa 16417167  T
Q  181 tacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16417166 tgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaataacattg 16417118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 20568356 - 20568568
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20568356 ccacttgacacggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 20568454  T
Q  116 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    || |||||||  |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||  |  |||||||| |||| ||| ||||||  |    
T  20568455 ataattgtatgattaatatgatg-atatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtgagacatgttgaaatggtgagactacatgagatagtaaa 20568553  T
Q  214 tgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||    
T  20568554 tgttgaatgacattg 20568568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 20574549 - 20574761
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20574549 ccacttgacacggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 20574647  T
Q  116 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    || |||||||  |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||  |  |||||||| |||| ||| ||||||  |    
T  20574648 ataattgtatgattaatatgatg-atatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtgagacatgttgaaatggtgagactacatgagatagtaaa 20574746  T
Q  214 tgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||    
T  20574747 tgttgaatgacattg 20574761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 3432661 - 3432878
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||  |||    
T  3432661 gccgtttgccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaa--tgt 3432757  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |  | |||||| |||| |  ||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  3432758 atgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctattacttggaatat-gagaatgcttgaattggtg-aactatatgtg 3432855  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3432856 atagttgatgttgaatgacattg 3432878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38532685 - 38532516
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgcta 159  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |     
T  38532685 cttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttc 38532586  T
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||| |||||||  ||| |||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38532585 tcttacttataatgtaataaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattg 38532516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 17730612 - 17730766
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  17730612 gattattcttctatgattgagtgaatttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgt 17730711  T
Q  175 aaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||  |||  ||| ||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17730712 aagaaatgtttgaaatagtaaaactgtatgagatagttgatgttgaatgacattg 17730766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 222
Target Start/End: Original strand, 6775326 - 6775420
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6775326 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 6775420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28556998 - 28556874
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28556998 gtgactattcttatatgactaa-tgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgatgtttattatgagatgtgtatgatatcttacttagaatg 28556900  T
Q  174 taaagaatacttg-aatggtgaaact 198  Q
    |||  ||| |||| ||||||||||||    
T  28556899 taagaaatgcttgaaatggtgaaact 28556874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 16042123 - 16042338
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16042123 ttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-cttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 16042220  T
Q  113 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 208  Q
    ||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | | || |||||| |||| | |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16042221 tgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaatatga--aatgcttgaattggtgaaactatatgtgata 16042318  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  16042319 gttgatgttgaataacattg 16042338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 16040335 - 16040549
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  16040335 gccgtttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-cttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 16040432  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 203  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | | || |||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  16040433 atgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaatatga--aatgcttgaattggtgaaactatatg 16040530  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16040531 tgatagttgatgttgaatg 16040549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24548181 - 24548075
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24548181 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 24548083  T
Q  221 tgacattg 228  Q
    ||||||||    
T  24548082 tgacattg 24548075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 16406149 - 16406295
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||  | || |||| |  |||| |||  || ||||| |||||||||||||    
T  16406149 gccggtggccacatgatatggtttttggtcgaaaacgttt-cttgaaccaattgtcctaagaattgaggtgactatgtttgtatgactaagtgaagttgt 16406247  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtat 155  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16406248 atgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtat 16406295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5237207 - 5237049
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  5237207 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 5237108  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  5237107 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 5237049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 24662391 - 24662549
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  24662391 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 24662490  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  24662491 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 24662549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 17151399 - 17151445
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151399 agaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 17151445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 13722433 - 13722474
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722433 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 13722474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 13722581 - 13722622
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722581 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 13722622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 13722729 - 13722770
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722729 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 13722770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 13722877 - 13722918
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722877 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 13722918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 13723025 - 13723066
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13723025 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 13723066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 24107848 - 24107889
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107848 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 24107889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 24930375 - 24930416
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930375 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 24930416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 270687 - 270586
Alignment:
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  270687 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 270588  T
Q  227 tg 228  Q
    ||    
T  270587 tg 270586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 645233 - 645334
Alignment:
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  645233 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 645332  T
Q  227 tg 228  Q
    ||    
T  645333 tg 645334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 830968 - 831069
Alignment:
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  830968 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 831067  T
Q  227 tg 228  Q
    ||    
T  831068 tg 831069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 16040621 - 16040662
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16040621 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 16040662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 16194917 - 16194986
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16194917 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 16194986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 227
Target Start/End: Original strand, 16195001 - 16195038
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195001 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 16195038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 228
Target Start/End: Original strand, 17151521 - 17151558
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151521 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 17151558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 6775492 - 6775534
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6775492 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 6775534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18618062 - 18618028
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618062 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18618028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22144250 - 22144136
Alignment:
Q  46 tttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatca 143  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22144250 tttcttgagtcatttgtcttatgatttatggtgaatattcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttggatatgatgtttatca 22144155  T
Q  144 tgaaatgtgtatgctatct 162  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  22144154 tgagatatgtatgctatct 22144136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 22908745 - 22908787
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22908745 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 22908787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28836490 - 28836448
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28836490 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 28836448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 272435 - 272508
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  272435 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 272508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 643414 - 643341
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  643414 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 643341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 829220 - 829147
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  829220 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 829147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Original strand, 224430 - 224463
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  224430 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 224463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Original strand, 700843 - 700876
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  700843 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 700876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Original strand, 738053 - 738086
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  738053 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 738086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Original strand, 861948 - 861981
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  861948 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 861981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Original strand, 13663905 - 13663938
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13663905 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 13663938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Original strand, 13723180 - 13723213
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13723180 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 13723213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43684666 - 43684508
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  43684666 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaggttgcatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 43684567  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  43684566 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 43684508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32897802 - 32897584
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32897802 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttatat 32897703  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||| |||     
T  32897702 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgtttgaatggtgaaactaaatgtaataa 32897603  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32897602 ttgatgttgaatgacattg 32897584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Original strand, 19984298 - 19984508
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19984298 acttgatatgggttttgatcggagatgttttcttgagtaaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 19984397  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19984398 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 19984496  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  19984497 tgaatgacattg 19984508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 25645918 - 25646129
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||| |||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  25645918 gccacttgatatggtgtttggtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatcttactaagtgaagttgtatgaatg 25646016  T
Q  115 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25646017 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgataattgat 25646116  T
Q  215 gttgaatgacatt 227  Q
    |||||||||||||    
T  25646117 gttgaatgacatt 25646129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16230768 - 16230555
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16230768 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 16230670  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16230669 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 16230570  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  16230569 agttgatgttgaatg 16230555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 18824637 - 18824847
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  18824637 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctattgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 18824735  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824736 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 18824835  T
Q  212 gatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||||    
T  18824836 gatgttgaatga 18824847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18431708 - 18431494
Alignment:
Q  12 gttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  18431708 gttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatcactaagtgaggttgtatga 18431610  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    | ||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431609 aagaatgattgcattaaatatgatgtt-atcatgagatgtgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 18431511  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  18431510 gatgttgaatgacattg 18431494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18776291 - 18776069
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  18776291 gccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttttatgactaagtgaagttgt 18776193  T
Q  108 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18776192 atgaatgaatgattgtattctggatatgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 18776093  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  18776092 gatagttgatgttgaataacattg 18776069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25174671 - 25174527
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  25174671 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 25174572  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174571 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 25174527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4990079 - 4989869
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  4990079 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttga 4989981  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4989980 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 4989881  T
Q  212 gatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||||    
T  4989880 gatgttgaatga 4989869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 218
Target Start/End: Original strand, 27655147 - 27655287
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27655147 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 27655246  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27655247 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 27655287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 18840555 - 18840702
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840555 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 18840654  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840655 aggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 18840702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 217
Target Start/End: Original strand, 33315628 - 33315767
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33315628 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 33315727  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 217  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33315728 gaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtt 33315767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16105638 - 16105420
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16105638 gccgtttgccacttgatatggattt-ggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgttttatgagttattgtgatcatttttatatgactaagtgaagttgt 16105541  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    | |||   | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16105540 acgaaaagaagattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaat 16105441  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16105440 agttgatgttgaatgacattg 16105420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Original strand, 18004002 - 18004154
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 161  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  18004002 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatc 18004101  T
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004102 ttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18004154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18569660 - 18569447
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18569660 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatcttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatga 18569563  T
Q  116 atgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18569562 atgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattagtgaaactatatgtgatagttg 18569463  T
Q  213 atgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||| ||||||    
T  18569462 atgttgaataacattg 18569447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 15736160 - 15736362
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  15736160 ttgccacttgatacggcttttagtcggaaatgtttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtaaagttgtatgaa 15736259  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15736260 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtaaaactatatgtgatagtt 15736359  T
Q  212 gat 214  Q
    |||    
T  15736360 gat 15736362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Original strand, 13622160 - 13622302
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13622160 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgactgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagga 13622259  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13622260 atgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 13622302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 35016770 - 35016984
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| || |||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35016770 ttgccacatgatttggatttttgttggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 35016868  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |||| |  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35016869 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgttatcttacttggaatat-gagaatgcttgaaatggttaaactatatgtgatagtt 35016967  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  35016968 gatgttgaatgacattg 35016984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16085136 - 16084942
Alignment:
Q  31 tttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggat 130  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  16085136 tttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgttttatgagttcttgtgatcatttttatatgactaagt--agttgtatgaatagaagattgtattggat 16085040  T
Q  131 atgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16085039 atgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaagggtgaaactatatgtaatagttgatgttgaatgacattg 16084942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 18824841 - 18824951
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824841 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 18824940  T
Q  213 atgttgaatga 223  Q
    |||||||||||    
T  18824941 atgttgaatga 18824951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 18840696 - 18840806
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840696 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 18840795  T
Q  213 atgttgaatga 223  Q
    |||||||||||    
T  18840796 atgttgaatga 18840806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Original strand, 16826872 - 16827065
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 127  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  16826872 tttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttg 16826970  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16826971 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 16827065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18582367 - 18582151
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  18582367 gccgtttgccacttgatatggtttttg-tcggaaaagtttcttttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatg 18582269  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgt 204  Q
    | |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18582268 tgtgaatgaatggttatatgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgt 18582169  T
Q  205 gatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18582168 gatagttgatgttgaatg 18582151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Original strand, 25745422 - 25745635
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||| |||||| |||| ||   |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25745422 gccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaatggtggtgactacgtttatataactaagtgaagttgtatgaacg 25745520  T
Q  115 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||   ||| |||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  25745521 aatgattgtgtaggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaattagtaaaactatatgtgatagttga 25745620  T
Q  214 tgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||    
T  25745621 tgttgaatgacattg 25745635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Original strand, 14627658 - 14627791
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  14627658 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtattggatatgacgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaagaaa 14627757  T
Q  181 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627758 tgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 14627791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19628490 - 19628302
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 127  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    ||||| ||||| ||||  |    
T  19628490 tttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttg 19628396  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19628395 aatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 19628302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22431320 - 22431109
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22431320 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgtggagactatttttatatgactaagtgaagttgtatgattga 22431223  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  22431222 atgattgtatggggtatgatgcttatcataagatgcgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatatgaaagttgat 22431123  T
Q  215 gttgaatgacattg 228  Q
    || |||| ||||||    
T  22431122 gtagaataacattg 22431109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23152318 - 23152120
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 129  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23152318 tttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgattaagttaagttgtatgaatgaatgattgtgttgga 23152220  T
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    || ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||  |||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23152219 taagatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacctaggatgtaagaaatgtttgaattggtggagctatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 23152120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Original strand, 18087846 - 18088015
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||    
T  18087846 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgccat 18087945  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18087946 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattg 18088015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 228
Target Start/End: Original strand, 1658915 - 1659014
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1658915 atatgatgtttatcatgagatgtgtatggtatcttacttagaatgcaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 1659014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19609442 - 19609350
Alignment:
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19609442 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 19609350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23976595 - 23976428
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 161  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||    
T  23976595 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctc 23976496  T
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||| |||| |  |||||  ||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  23976495 ttacttggaatat-gagaattgtttggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattg 23976428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 25368428 - 25368651
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||   ||||||||||   ||||||| |  | |||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  25368428 gccgtttgccacttgatacggtattta-tcggaaatgttcctttgagtcaatcgacttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttgt 25368526  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| || || |  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  25368527 atgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgtgatgttgtatgctctcttacttaaaaggtgagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 25368626  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||    
T  25368627 aggtagtttatgttgaatgatattg 25368651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26088893 - 26088782
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  26088893 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 26088794  T
Q  161 cttacttagaat 172  Q
    ||||||| ||||    
T  26088793 cttacttggaat 26088782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Original strand, 1651148 - 1651254
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1651148 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 1651246  T
Q  221 tgacattg 228  Q
    ||||||||    
T  1651247 tgacattg 1651254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22867166 - 22867026
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||  |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||    
T  22867166 tatttttatatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatgttggatataatgaatatcatgagatgtgcatgttctcttatttagaacgtaaag 22867067  T
Q  179 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttga 219  Q
    |||  ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  22867066 aatgtttgaatgatgaaactatatgagatagtaaatgttga 22867026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Original strand, 21776791 - 21776870
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21776791 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 21776870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18397982 - 18397842
Alignment:
Q  36 tcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatat 132  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||   | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  18397982 tcggaaatggtttctttaagtcaattgtcttatgaagtatcgtgagtattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtatgattgatat 18397883  T
Q  133 gatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18397882 gatg-atatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgt 18397842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 13015910 - 13016006
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 128  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  |||||  ||||||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015910 ttttggtcggaaatgttt-cttaaaccaattgtcttatgaattgttatgat-attcctatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 13016006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25904033 - 25903975
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 136  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25904033 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatg 25903975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 213
Target Start/End: Original strand, 16301107 - 16301178
Alignment:
Q  143 atgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16301107 atgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagttga 16301178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 16827138 - 16827179
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16827138 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 16827179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4989797 - 4989756
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4989797 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggatgacattg 4989756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 18825023 - 18825064
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18825023 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattg 18825064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 228
Target Start/End: Original strand, 15736440 - 15736484
Alignment:
Q  184 ttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15736440 ttgaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 15736484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Original strand, 28195924 - 28196074
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||  | ||||||| |||||||||||||||   || |||||| | |||||||||| ||    
T  28195924 gtgactattcttatatgactaagtgaggttgtatgaataattgattatatattggacatgatgtttatcatgggttgttgtatgatctcttacttaggat 28196023  T
Q  173 gtaaagaatacttg--aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||  ||| ||||  |||||| ||||||||||   ||||||| |||||||    
T  28196024 gtaagaaatgcttgaaaatggtaaaactatatgaagtagttgaggttgaat 28196074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16230546 - 16230441
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16230546 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 16230448  T
Q  222 gacattg 228  Q
    |||||||    
T  16230447 gacattg 16230441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16239262 - 16239227
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239262 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 16239227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 14627871 - 14627913
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14627871 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 14627913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 18004234 - 18004276
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18004234 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 18004276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Original strand, 18843083 - 18843117
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18843083 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18843117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25174455 - 25174413
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25174455 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 25174413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 27655348 - 27655390
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27655348 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 27655390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15861642 - 15861597
Alignment:
Q  177 agaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861642 agaatgcttgaactggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 15861597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 227
Target Start/End: Original strand, 13016008 - 13016088
Alignment:
Q  148 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||    
T  13016008 atgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaaccacatgtggtaattgatgttgagtgacatt 13016088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10487809 - 10487736
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  10487809 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 10487736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 16377518 - 16377591
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16377518 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 16377591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 16384842 - 16384915
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16384842 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 16384915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 71539 - 71756
Alignment:
Q  11 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatg 110  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  71539 ggttgccacttgatacaggttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatgattgttattattcttatatgactaagttaagttatatg 71638  T
Q  111 aatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  71639 aatgaatgattgtattggatataatgtttatcatgagatgtgtacgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaaactaaatgtaatagt 71738  T
Q  211 tgatgttgaatgacattg 228  Q
    | ||||||||||||||||    
T  71739 tcatgttgaatgacattg 71756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Original strand, 256001 - 256211
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  256001 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatga 256099  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  256100 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgaag 256199  T
Q  216 ttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||    
T  256200 ttgaatgacatt 256211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Original strand, 262607 - 262817
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  262607 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaatagtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatga 262705  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  262706 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgaag 262805  T
Q  216 ttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||    
T  262806 ttgaatgacatt 262817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 223
Target Start/End: Original strand, 124454 - 124591
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||   ||    
T  124454 ttatataactaagtgaagatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagattggtatgctatcttacttagaatgt-aagaaatgtt 124552  T
Q  186 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124553 gaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 124591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 75855 - 75997
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | |||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||   ||    
T  75855 ttatataactaagtgcagatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagatatgtatgtaatcttacttagaatgt-aagaaatgtt 75953  T
Q  186 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  75954 gaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattg 75997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 193582 - 193515
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 153  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  193582 ttatataactaattgaagttgtatgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgt 193515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 193508 - 193469
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  193508 tggtgaaacgatatgtggtagttgatgttgaatgacattg 193469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 6453 - 6664
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6453 ccacttgatatggtttttggtcggaaatggtt-cttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatga 6551  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6552 atgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 6651  T
Q  216 ttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||    
T  6652 ttgaatgacattg 6664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44864316 - 44864101
Alignment:
Q  12 gttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44864316 gttgccacttggtatgatttttggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatgactaagtgacgttgtatga 44864218  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44864217 aagaatgattgtatgcgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatacttgaatggtgaaagtatatgtgatagtt 44864118  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  44864117 gatgttgaatgacattg 44864101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12753958 - 12753740
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12753958 gccgtttgccacttgatatgatttt-ggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttatgatttgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgt 12753861  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12753860 atgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttagaatgtaaataatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 12753761  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12753760 tagttgatgttgaatgacatt 12753740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 125892 - 125684
Alignment:
Q  20 ttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga 119  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  125892 ttgatatgggttttgatcggagatgttttattgagtcaattacctcatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatga 125793  T
Q  120 ttgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 218  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  125792 ttgtatttgatatgatgttaatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttg 125694  T
Q  219 aatgacattg 228  Q
    ||||||||||    
T  125693 aatgacattg 125684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47288852 - 47288633
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   ||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  47288852 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgtttt-ttgaaccaattgttttaagaattgtggtgaccatttttatataaataagtgaagttgt 47288754  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47288753 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttataatgtaaggaatgcttgaatggtgaaaccatatgtgat 47288654  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  47288653 agttgatgttgaatgacattg 47288633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 14252277 - 14252491
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||||||||||    
T  14252277 gccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatatttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgt 14252376  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14252377 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 14252476  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  14252477 agttgatgttgaatg 14252491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15851334 - 15851184
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15851334 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 15851235  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15851234 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 15851184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3894173 - 3893951
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3894173 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 3894075  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3894074 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtacgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaagtggtgaaactatatgt 3893975  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  3893974 gatagttgatgttgaataacattg 3893951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 12544801 - 12545018
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12544801 cggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaggtgaagttgtat 12544899  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgata 208  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  12544900 tattgaatgattgtatcggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgctatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatttgata 12544998  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12544999 gttgatgttgaatgacattg 12545018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 369965 - 369745
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  369965 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 369867  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  369866 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 369767  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  369766 tagttgatgttaaaggacattg 369745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11286247 - 11286071
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11286247 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtg 11286148  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11286147 tatgttatcttacttagaatataaggaatgattgaaatggtgaaactatatgagatagttgatgttgaatgacattg 11286071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Original strand, 15823514 - 15823712
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||   || ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  15823514 ttttggtcggaaatgttttcttgagctaattgttttgtgaattgttgtgactattcttgtatgactaagtgaagtcgtatgagtgaatgattgtataaga 15823613  T
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15823614 tatgatgtttctcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattg 15823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 45453346 - 45453562
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45453346 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaa---tgttcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgaccattcttatatgactaagtaaagttgtat 45453442  T
Q  110 gaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgata 208  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||| |||    
T  45453443 gaatgagtgattatatttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatattatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatgggaaaattatatgtaata 45453542  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45453543 gttgatgttgaatgacattg 45453562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16417580 - 16417436
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16417580 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaag 16417481  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16417480 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 16417436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Original strand, 26071396 - 26071572
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26071396 agtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtg 26071495  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26071496 tatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattg 26071572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Original strand, 26095183 - 26095359
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26095183 agtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtg 26095282  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26095283 tatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattg 26095359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 112381 - 112600
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  112381 gccggtggccacttgatatggtttttgttcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 112479  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgt 204  Q
    | ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  112480 acgaatgaatggttgtattttggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgatttggtgaaactatatgt 112579  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  112580 gatagttgatgttgaatgaca 112600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 32495532 - 32495747
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32495532 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagcaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgt 32495630  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32495631 atgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtg 32495730  T
Q  206 atagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  32495731 atagttgatgttgaatg 32495747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Original strand, 15952144 - 15952280
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  15952144 gattattcttgtatgactaagcgaagttgtatgaatgaatgtttgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaag 15952243  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15952244 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 15952280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 13867163 - 13867380
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||| || | || || |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  13867163 ttgccgcttgatatgatttttggccggaaatgattcttttaagccaattgtcttatgaattatcgtgattattcttatatgaccaa-tgaagttgtatga 13867261  T
Q  112 atgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13867262 atgaatgattgttttttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgcaatcttacttagaatgtaaggaattcttgaatgatgaaactatatgtgatag 13867361  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  13867362 ttgatgttggataacattg 13867380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 13912155 - 13912305
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13912155 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 13912254  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13912255 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 13912305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7291966 - 7291825
Alignment:
Q  83 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7291966 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaa 7291867  T
Q  181 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7291866 tgcttgaatggtgaaactatatgtgttagttgatgttgaatg 7291825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 142708 - 142486
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||  |  || | ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  142708 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaactgaggttactattcttgtatgactaagtgaagttgt 142610  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 204  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||  |||||| |||||||||||||||    
T  142609 atgaatggatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgggtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgt 142510  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  142509 gatagttgatgttgaataacattg 142486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11515345 - 11515198
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  11515345 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 11515246  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515245 aggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 11515198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2027742 - 2027529
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  2027742 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcaaaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 2027644  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||||||||||||    
T  2027643 atgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtatactattttacttagaatgt-aagaaatgttgagttggtgaaactatatgtga 2027545  T
Q  207 tagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||    
T  2027544 tagttgatgttgaatg 2027529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 7285361 - 7285510
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7285361 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcttgagatatgtatgctatcttacttagaatg 7285460  T
Q  174 taaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285461 taaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 7285510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36051624 - 36051521
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051624 ttggatatgatgtttatcatgagatatatatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 36051525  T
Q  225 attg 228  Q
    ||||    
T  36051524 attg 36051521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 39047785 - 39047997
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| |  |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39047785 ccacttgatacaatttttagtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgcggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 39047883  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39047884 atgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctattatacttataaagtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgat 39047983  T
Q  215 gttgaatgacattg 228  Q
    |||||||| |||||    
T  39047984 gttgaatggcattg 39047997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13757603 - 13757436
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13757603 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 13757504  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13757503 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 13757436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 228
Target Start/End: Original strand, 12249263 - 12249418
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12249263 gtgactattctcatatgactaactaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcataagatgtgtatgttatcttacttaggatg 12249362  T
Q  174 taaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||  ||| |||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12249363 taagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattg 12249418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13273833 - 13273611
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||   ||| ||||||   |||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13273833 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcgaaaatgttcctttgtgtcaatctgcttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtaaagttgt 13273736  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  13273735 atgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 13273636  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
     | ||||||||||||||| ||||||    
T  13273635 agttagttgatgttgaattacattg 13273611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Original strand, 18981044 - 18981213
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||    
T  18981044 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgccat 18981143  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18981144 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattg 18981213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 228
Target Start/End: Original strand, 49048942 - 49049098
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  49048942 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaat 49049041  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||  ||| |||| |||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  49049042 gtaagaaatgcttgaaatggtaaaactgtatgaggtagttgatgttgaatgacattg 49049098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15629860 - 15629639
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||    ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15629860 gccgtttgccacttgatacggtat--ggtcggaaatgttcctttgagtcaaccgacttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagtggt 15629763  T
Q  108 atgaatgaatgat-tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| |||| | ||||||||||     
T  15629762 atgaatgaatgatatatgttgaatataatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatgataaaactatatga 15629663  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15629662 gatagttgatgttgaatgacattg 15629639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 16571246 - 16571395
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  16571246 tattcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgt-aag 16571344  T
Q  179 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16571345 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattg 16571395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16594416 - 16594267
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  16594416 tattcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgt-aag 16594318  T
Q  179 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16594317 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattg 16594267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 228
Target Start/End: Original strand, 1937973 - 1938077
Alignment:
Q  123 tattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937973 tattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaat-gttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 1938070  T
Q  222 gacattg 228  Q
    |||||||    
T  1938071 gacattg 1938077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 10861927 - 10862149
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  10861927 gccgtttgccacttgatacggtacttg-tcggaaatgttcctttgagtcaattatcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgt 10862025  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
     |||||||||| || ||||  | ||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  10862026 gtgaatgaatggttatattttgaatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatg 10862125  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
      |||||||||||||||||| ||||    
T  10862126 -aatagttgatgttgaatgatattg 10862149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 214
Target Start/End: Original strand, 16480034 - 16480120
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16480034 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgctcgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 16480120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Original strand, 7285504 - 7285603
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7285504 tgaatgattgtattgaatatgatgtt-atcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagtt 7285602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 11582027 - 11582095
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11582027 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattggatataatgtttatcatgaaatgtgta 11582095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 15442707 - 15442865
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  15442707 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 15442806  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  15442807 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 15442865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 151
Target Start/End: Original strand, 30263272 - 30263351
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30263272 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 30263351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11515138 - 11515092
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515138 agaatccttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 11515092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 32495819 - 32495860
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32495819 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 32495860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16210759 - 16210691
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16210759 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatatttatcatgagatgtgta 16210691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3048751 - 3048688
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 126  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3048751 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatt 3048688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 11582109 - 11582148
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582109 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 11582148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 13038299 - 13038350
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatga 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  13038299 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtttatcatga 13038350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 13038373 - 13038412
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13038373 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 13038412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16210676 - 16210637
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16210676 tggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 16210637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 2191684 - 2191769
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatga 146  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  2191684 cttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttattatga 2191769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7291753 - 7291711
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7291753 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 7291711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 15952360 - 15952402
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15952360 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 15952402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16417364 - 16417322
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16417364 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 16417322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 16480200 - 16480242
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16480200 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 16480242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 26010455 - 26010497
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26010455 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 26010497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3059026 - 3058966
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatga 146  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||||||||    
T  3059026 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatga 3058966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 35093890 - 35093783
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  35093890 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 35093792  T
Q  108 atgaatgaa 116  Q
    |||||||||    
T  35093791 atgaatgaa 35093783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3058941 - 3058910
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058941 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 3058910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15926261 - 15926222
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15926261 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 15926222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2027457 - 2027415
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  2027457 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttcaatgacattg 2027415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7821851 - 7821778
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  7821851 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 7821778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7829162 - 7829089
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  7829162 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 7829089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 27102783 - 27102856
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  27102783 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 27102856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 27110131 - 27110204
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  27110131 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 27110204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27175543 - 27175470
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  27175543 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 27175470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 38784875 - 38784948
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  38784875 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 38784948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 13912378 - 13912419
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  13912378 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 13912419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 25809 - 26029
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25809 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgatgttgt 25907  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgat-gtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25908 atgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgaga 26007  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  26008 tagttaatgttgaatgacattg 26029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 70486 - 70701
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  70486 ttgccacttgacacggtttttggtcgagaatgtat-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 70584  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  70585 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtacactatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 70684  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  70685 gatgttgaatgacattg 70701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 93701 - 93560
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  93701 tattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaa 93602  T
Q  181 tacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  93601 tgcttgaattggtgaaactatatgtgataattgatgttgaat 93560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21393265 - 21393046
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||| |||||    
T  21393265 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaattgttt-cttgagtcaattgtcttatgaattattgtgactattcttataagactaagtgacgttgt 21393167  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21393166 atgaaagaatgattgtatgagatatgttgtttatcatgaaatgtgtatgcgatcttacttagaatgtaaggagtacttgaatggtgaaactatatgtgat 21393067  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21393066 agttgatgttgaatgacattg 21393046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 9731762 - 9731975
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  9731762 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 9731860  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9731861 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 9731960  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  9731961 agttgatgttgaatg 9731975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 1169602 - 1169816
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1169602 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgatttgttatgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 1169700  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169701 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgtcatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 1169800  T
Q  213 atgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  1169801 atgttgaatgacattg 1169816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23511044 - 23510859
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 129  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23511044 ttttgatcggagaggttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattgga 23510945  T
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23510944 tatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatattac-tagaatgtaaggaatgtttgaatcggtgaaactaaatgtgatagttgatg 23510859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Original strand, 10779344 - 10779489
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10779344 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 10779443  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10779444 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 10779489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11462 - 11318
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11462 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 11363  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11362 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 11318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28258669 - 28258460
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||   |||| ||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28258669 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtattataaactgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 28258572  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258571 atgattgtgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttgagatgtaaggaatgattgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 28258472  T
Q  216 ttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||    
T  28258471 ttgaatgacatt 28258460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16535313 - 16535163
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16535313 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 16535214  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16535213 aaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 16535163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20711214 - 20710994
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  20711214 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgcccattcttatatgactaagtgaagttgt 20711116  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20711115 atgattgaatgattgtgttggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgtg 20711017  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  20711016 ataattgatgttgaatgacattg 20710994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 29191785 - 29191929
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  29191785 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 29191884  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29191885 gaacgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 29191929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11583055 - 11582846
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  11583055 ttgccacttgatacggtttttgtt-ggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 11582957  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582956 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 11582857  T
Q  212 gatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||    
T  11582856 gatgttgaatg 11582846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 17472823 - 17473043
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||| ||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  17472823 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaagtgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgt 17472921  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  17472922 atgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtga 17473021  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17473022 tagttgatgttgaatgacattg 17473043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 24184295 - 24184516
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  24184295 gccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgctt-cttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 24184392  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||     
T  24184393 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatga 24184492  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    
T  24184493 gataaatgatgttgaatgacattg 24184516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 110145 - 110292
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  110145 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgatcgtattggatatgatgtttaccatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 110244  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  110245 aggaatgcttgaatggtgaaactgtatgtgatagttgatgttgaatga 110292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4864343 - 4864125
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||  |||| | ||||| |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  4864343 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtt--cttgaaccaattgtcttaaggatggtggtgactatg-ttatataactaagtgaagttgt 4864247  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  4864246 atgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtga 4864147  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4864146 tagttgatgttgaatgacattg 4864125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 1220890 - 1221040
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1220890 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 1220989  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220990 tgtaaggaatgcttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1221040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 4201124 - 4201274
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4201124 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 4201223  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4201224 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 4201274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19404588 - 19404439
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  19404588 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatg-ttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaga 19404490  T
Q  179 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19404489 aatgcttgaaatggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 19404439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Original strand, 27184830 - 27185023
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 127  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  27184830 tttttgtcggaaatgttt-ctttagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttg 27184928  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184929 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 27185023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23513977 - 23513767
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||| | |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23513977 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttgtgagttgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 23513879  T
Q  113 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagt 210  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23513878 tgagtgattatactttggatatgatgtttaccatgagatatgtgtgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagt 23513779  T
Q  211 tgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||    
T  23513778 tgatgttgaatg 23513767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 18779155 - 18779301
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18779155 gattactcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgta 18779254  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18779255 aggaatggttgaatggtgaaactatatgtggaagttgatgttgaatg 18779301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25425732 - 25425589
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25425732 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaagg 25425633  T
Q  179 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425632 aatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 25425589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 21652485 - 21652705
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||| |||| || |||  |||| |||||| | |||  ||||||||||    
T  21652485 cggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttc-cttgaaccaattatcttaagaattgtggtggctatttttatataactaaaagaagttgtat 21652583  T
Q  110 gaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  21652584 gaatgaatgattgtagtttgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactatacgtga 21652683  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  21652684 tagttaatgttgaatgacattg 21652705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21649855 - 21649689
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  21649855 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 21649756  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21649755 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 21649689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 11338021 - 11338165
Alignment:
Q  83 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  11338021 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgattgattgtagtttggatatgatgtttatcataaaatgtgtatgctatcttacttagaaggtaagaaa 11338120  T
Q  181 tacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    | |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11338121 tgcttgaaatggtgcaactatatgagatagttaatgttgaatgac 11338165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 22367647 - 22367793
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  22367647 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 22367746  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367747 aggaatgtttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 22367793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11341749 - 11341605
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  11341749 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 11341651  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11341650 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 11341605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 22884454 - 22884603
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |  |    
T  22884454 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttggaatat-ga 22884552  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22884553 gaatgcttgaattggtg-aactatatgtgacagttgatgttgaataacattg 22884603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Original strand, 25901488 - 25901635
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| |    
T  25901488 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatat 25901587  T
Q  175 aaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25901588 ga-gaatccttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 25901635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23454032 - 23453809
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttg--agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagtt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||  |||||||   ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23454032 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggtt-cttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattcttatatgactaagtgaagtt 23453936  T
Q  106 gtatgaatgaatgatt--gtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactata 201  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||  |||  ||| |||||| ||||||||    
T  23453935 gtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactata 23453836  T
Q  202 tgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    || | |||||||| |||||||||||||    
T  23453835 tgaggtagttgattttgaatgacattg 23453809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23465537 - 23465314
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttg--agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagtt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||  |||||||   ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23465537 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggtt-cttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattcttatatgactaagtgaagtt 23465441  T
Q  106 gtatgaatgaatgatt--gtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactata 201  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||  |||  ||| |||||| ||||||||    
T  23465440 gtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactata 23465341  T
Q  202 tgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    || | |||||||| |||||||||||||    
T  23465340 tgaggtagttgattttgaatgacattg 23465314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7424740 - 7424648
Alignment:
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7424740 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 7424648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19498855 - 19498764
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttga 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19498855 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgacagttgatgttga 19498764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24474654 - 24474444
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||   ||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  24474654 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtattaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 24474556  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||          ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24474555 atgaatgaatgat----------atgatatttatcattagatgtatatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtga 24474466  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  24474465 tagttgttgttgaataacattg 24474444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 21234670 - 21234828
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  21234670 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 21234769  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  21234770 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 21234828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11341597 - 11341492
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11341597 ttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatg 11341498  T
Q  223 acattg 228  Q
    ||||||    
T  11341497 acattg 11341492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23505802 - 23505663
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23505802 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 23505704  T
Q  113 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    ||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23505703 tgagtaattatattttggatatgatgattatcatgagatgt 23505663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20615626 - 20615547
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20615626 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttctcatgagatgt 20615547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 110364 - 110405
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  110364 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggatgacattg 110405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 1169923 - 1169964
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169923 aatggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacattg 1169964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25425580 - 25425475
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |  | || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25425580 ttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatg 25425481  T
Q  223 acattg 228  Q
    ||||||    
T  25425480 acattg 25425475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 27185095 - 27185136
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27185095 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 27185136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37051998 - 37051919
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  37051998 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatatttctcatgagatgt 37051919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 9731984 - 9732089
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9731984 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 9732082  T
Q  222 gacattg 228  Q
    |||||||    
T  9732083 gacattg 9732089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 35792275 - 35792341
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatga 146  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  35792275 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatga 35792341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11246 - 11204
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11246 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 11204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 1221112 - 1221154
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1221112 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 1221154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7424575 - 7424533
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7424575 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 7424533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 10779560 - 10779602
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10779560 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 10779602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11582774 - 11582732
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11582774 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 11582732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 18779374 - 18779416
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18779374 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 18779416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 22367865 - 22367907
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22367865 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 22367907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 11212986 - 11213025
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11212986 tggtgaaactatatgcgataattgatgttgaatgacattg 11213025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23513693 - 23513654
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23513693 tggtaaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattg 23513654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 29192004 - 29192043
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29192004 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 29192043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 21074870 - 21074912
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  21074870 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaacgacattg 21074912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 21933512 - 21933585
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  21933512 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 21933585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 21939682 - 21939755
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  21939682 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 21939755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35581180 - 35581107
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  35581180 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 35581107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 37010516 - 37010589
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  37010516 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 37010589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 4201347 - 4201388
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  4201347 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 4201388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 199 - 228
Target Start/End: Original strand, 25192390 - 25192419
Alignment:
Q  199 atatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25192390 atatgtgatagttgatgttgaatgacattg 25192419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 16183094 - 16183312
Alignment:
Q  9 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | ||||||||||||||    
T  16183094 ccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgta 16183192  T
Q  109 tgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgata 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16183193 tgaatgaatgattgttttggatatgatgtatatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgatgaaactatatgtgata 16183292  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16183293 gttgatgttgaatgacattg 16183312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18909869 - 18909656
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  18909869 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 18909771  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18909770 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 18909671  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  18909670 agttgatgttgaatg 18909656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 53769840 - 53769627
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  53769840 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 53769742  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53769741 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 53769642  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  53769641 agttgatgttgaatg 53769627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 50113218 - 50113435
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||  |||||| | |||||||||||||    
T  50113218 gccgtttgccacttgacacg--ttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatgtttatataactaagtgaagttgt 50113314  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50113315 atgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatataaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 50113414  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  50113415 agttgatgttgaatgacattg 50113435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 6147927 - 6148144
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| | |||||||  |   |||||||| |||||||||| ||    
T  6147927 gccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttgtcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgacca---ttatatgaataagtgaagtggt 6148023  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6148024 atgatttaatgattgtattggatatgatgtctatcatgaagtgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatacttgaatggtgaaactatatatgat 6148123  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6148124 agttgatgttgaatgacattg 6148144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22274155 - 22274011
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22274155 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 22274056  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274055 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 22274011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 2450374 - 2450518
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  2450374 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgggtatgctatcttacttagaatgtaag 2450473  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450474 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 2450518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13837938 - 13837733
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13837938 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtt--cttgagtcaattgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 13837841  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13837840 atgaatgaatgtttgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 13837741  T
Q  208 agttgatg 215  Q
    ||||||||    
T  13837740 agttgatg 13837733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17099789 - 17099570
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17099789 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttataaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttg 17099692  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  17099691 tatgaatgaatgattgtattggatatgatg-ttatcatgtaatgtgtatgcaatcttgcttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgag 17099593  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  17099592 atagttaatgttgaatgacattg 17099570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 22145362 - 22145577
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattctt-atatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||  ||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  22145362 ttgccacttgacatagttcttggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttatgaattgtcgtgaccattttttatatgactaagttaagttgtatga 22145460  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22145461 atgaatgattgtattggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttaagatgtaaggaatgcttggatgatgaaactatatgtgatagtt 22145560  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||| ||||||    
T  22145561 gatgttgaataacattg 22145577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 218
Target Start/End: Original strand, 17957375 - 17957520
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17957375 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatg 17957474  T
Q  174 taaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 218  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17957475 taaggaatgcttgaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 17957520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 318695 - 318916
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||  |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  318695 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 318793  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg- 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||     
T  318794 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatcagatgtgtatgctatcttacttaaggtgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 318893  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  318894 atagttgatgttgaatgacattg 318916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 225
Target Start/End: Original strand, 47786041 - 47786183
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaa-agaatac 183  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  47786041 cttatattactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagacgtgtatgctatcttacttagaatgtaagagaatgc 47786140  T
Q  184 ttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 225  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47786141 ttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 47786183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 12350934 - 12351147
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttgg-tcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12350934 ccactcgatatggtttttgggtcggatatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgtagagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattg 12351032  T
Q  115 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12351033 aatgattgtataaaatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttga 12351132  T
Q  214 tgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||| ||||||    
T  12351133 tgtggaataacattg 12351147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 49231326 - 49231180
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  49231326 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgttatatgttatcttacttagaatgtaa 49231227  T
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  49231226 ggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgattatgaatga 49231180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 15469552 - 15469771
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||| ||| |  ||||||  |||| | ||||| |||||||||||||    
T  15469552 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcctgtatgactaagtgaagttgt 15469650  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15469651 atgaatgaaagattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtga 15469749  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15469750 tagttgatgttgaatgacattg 15469771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16820019 - 16819882
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16820019 gattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaa 16819920  T
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819919 ggaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 16819882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35122763 - 35122542
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  35122763 gccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaatcgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaaattgt 35122666  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    || |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||     
T  35122665 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatggttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatga 35122566  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    
T  35122565 gataaatgatgttgaatgacattg 35122542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13816511 - 13816368
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  13816511 ttatataagtaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 13816412  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13816411 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 13816368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7852993 - 7852777
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | | || ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  7852993 gccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgcgactatccttatatgactaagtgaagatg 7852895  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgt 204  Q
    | |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7852894 tgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctattttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgt 7852795  T
Q  205 gatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7852794 gatagttgatgttgaatg 7852777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 53899605 - 53899825
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  53899605 cggttgccacttgatatggttttggatcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtat 53899703  T
Q  110 gaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt-gaatggtgaaactatatgtga 206  Q
     |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  53899704 aaatgaatacttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttggaatggtgaaaccatatgaga 53899803  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||  ||||||||||||| ||||    
T  53899804 taaatgatgttgaatgatattg 53899825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Original strand, 51159475 - 51159669
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 127  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||  |    
T  51159475 tttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgactatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaaagagtaattatattttg 51159573  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51159574 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatatgatagttgatgttgaatga 51159669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 11198653 - 11198874
Alignment:
Q  9 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||  |||| || |  | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11198653 ccggttgccacttgatacggtttttagtcagaaatgttc-cttaagtcaattgtcttaagatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaggttgta 11198751  T
Q  109 tgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||  ||| |||||| |||||||||| |    
T  11198752 tgaatgaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactatatgag 11198851  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  11198852 atagttaatgttgaatgacattg 11198874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 12562563 - 12562780
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| |     | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12562563 ttgccacttggtacggtttttgggcggaaatgttc-cttgagtcaattgtcttacgttctatcgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 12562661  T
Q  113 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||| | |||    
T  12562662 tgaatgattgtatgttggatatgatatttatcttgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaaggaatgcttgaattggtaaaactatatgaggtag 12562761  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12562762 ttgatgttgaatgacattg 12562780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 228
Target Start/End: Original strand, 11062184 - 11062339
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11062184 gtgactattctcatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattatggatataatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatg 11062283  T
Q  174 taaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||  ||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11062284 taagaaatgcttgaaatggtaaggctatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 11062339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23491530 - 23491363
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  23491530 cttatgaattgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 23491431  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacat 226  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23491430 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacat 23491363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 19571932 - 19572074
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  19571932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 19572031  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19572032 gaattggtgaaactatatgtg-tagttgatgttgaatgacattg 19572074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 54423145 - 54423001
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  54423145 ttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatga 54423048  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgct 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  54423047 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgct 54423001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14297574 - 14297354
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  | |||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14297574 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgactaa-tgaagttgt 14297477  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||| |    
T  14297476 atgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgattgaaatggtgaaaccatatgag 14297377  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  14297376 ataaatgatgttgaatgacattg 14297354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14303201 - 14302981
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  | |||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14303201 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgactaa-tgaagttgt 14303104  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||| |    
T  14303103 atgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgattgaaatggtgaaaccatatgag 14303004  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  14303003 ataaatgatgttgaatgacattg 14302981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8630920 - 8630706
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||  |||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8630920 gccgtttgccacttgacacggtctttggttgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 8630822  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| |  |  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8630821 atgaatgaatgattgtttgaggcatgat-attatcatgagatgtgtatgctatcttgttcggaatgtaaggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgat 8630723  T
Q  208 agttgatgttgaatgac 224  Q
    | |||| ||||||||||    
T  8630722 aattgacgttgaatgac 8630706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 15860308 - 15860450
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||    
T  15860308 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcataagatgtgtatgctatcttacttagaatgt-aagaaatgtt 15860406  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15860407 gaattggtgaagctatatgtgatagttgatgttggatgacattg 15860450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40938736 - 40938587
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  40938736 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtatgttggatatagtgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttataatgtaaag 40938637  T
Q  179 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  40938636 aatgcttgaatggtgaaactatatgagatagtaaatgttgaatgacattg 40938587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14294434 - 14294285
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  14294434 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgt-aag 14294336  T
Q  179 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14294335 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattg 14294285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14300061 - 14299912
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  14300061 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgt-aag 14299963  T
Q  179 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14299962 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattg 14299912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17937492 - 17937352
Alignment:
Q  89 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 187  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| || | |    
T  17937492 tatgactaagtgaagatgtatgaatgaatgattgtattggatacgatgtttatcatattatgtgtatgctatcttacataggatgtaagaaatgctagta 17937393  T
Q  188 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17937392 ttggtgaaagtatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 17937352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33340949 - 33340812
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  33340949 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 33340850  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  33340849 gaattggtgaaactatatgatgtggttgatgttgaatg 33340812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25057856 - 25057702
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||    
T  25057856 gattattcttgtatgactaagggaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgataagtgtatgctatcttacttaagatgta 25057757  T
Q  176 aagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattg 228  Q
    ||||||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25057756 aagaatgtttgaatttgcgaaactatatgtgatagttgatgattggatgacattg 25057702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17138553 - 17138342
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17138553 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcttttgagccaattgacttatgaattatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttat 17138456  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |  ||| || ||| | |||||||||| ||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  17138455 atgaatgaatgattatatgttggaaatgatgtttatcaagtgatgttgcatgttctcttacttaggatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 17138356  T
Q  204 tgatagttgatgtt 217  Q
     | |||||| ||||    
T  17138355 aggtagttgttgtt 17138342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 17523552 - 17523690
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  17523552 gccgtttgccacttgatatggtttttggtcggaaatg-cttcttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgactaa-tgacgttgc 17523649  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatga 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17523650 atgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatga 17523690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15575002 - 15574896
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15575002 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 15574904  T
Q  221 tgacattg 228  Q
    ||||||||    
T  15574903 tgacattg 15574896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15614021 - 15613915
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15614021 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 15613923  T
Q  221 tgacattg 228  Q
    ||||||||    
T  15613922 tgacattg 15613915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19945700 - 19945482
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  19945700 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 19945602  T
Q  112 atgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||| || |||  | ||||||||||||||||||| || | || | |  | |||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19945601 atgaatggttatatgtttgatatgatgtttatcatgagatatcgttttccctattacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgat 19945503  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  19945502 agttgatgttgaataacattg 19945482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39654925 - 39654769
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||  ||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||   |||||||||||||    
T  39654925 gtgactattcttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatatttgtcataagatgttgtatgtcctcttacttagaat 39654826  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    || |  |||||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  39654825 gtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttaatgttgaatgatattg 39654769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 38167070 - 38167007
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 126  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167070 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 38167007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33340740 - 33340698
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33340740 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 33340698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 12031164 - 12031233
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12031164 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 12031233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16819802 - 16819761
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819802 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 16819761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 176
Target Start/End: Original strand, 14522487 - 14522538
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14522487 ttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaa 14522538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 51159742 - 51159781
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51159742 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 51159781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2048953 - 2048916
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2048953 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 2048916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2049038 - 2048969
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2049038 cttatataactaagtaaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 2048969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10737476 - 10737388
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || | |  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10737476 ttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttggagtat-gagaatgcctgaaatggtgaaactatatgtgatagttga 10737388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16260261 - 16260149
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||   ||||  |||| |||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16260261 gccgtttgccaattgacacggtctttggtcgaaaatgttt-cttgaactaattgtcttacgaattgtggtgactattcttgtatgactaagtgaagttgt 16260163  T
Q  108 atgaatgaatgatt 121  Q
    |||||||| |||||    
T  16260162 atgaatgagtgatt 16260149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19231036 - 19230968
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  19231036 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 19230968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18909647 - 18909542
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18909647 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 18909549  T
Q  222 gacattg 228  Q
    |||||||    
T  18909548 gacattg 18909542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 53769618 - 53769513
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  53769618 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 53769520  T
Q  222 gacattg 228  Q
    |||||||    
T  53769519 gacattg 53769513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 2450590 - 2450632
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2450590 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 2450632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19230953 - 19230919
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230953 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 19230919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22273939 - 22273897
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22273939 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 22273897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 227
Target Start/End: Original strand, 12031249 - 12031285
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12031249 gtgaaacgatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 12031285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 17957533 - 17957638
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17957533 ttggatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 17957631  T
Q  222 gacattg 228  Q
    | |||||    
T  17957632 gtcattg 17957638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 1468885 - 1468958
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  1468885 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 1468958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7852705 - 7852663
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7852705 gaatagtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 7852663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44228354 - 44228282
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44228354 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaatcggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattg 44228282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Original strand, 8269673 - 8269706
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8269673 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 8269706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Original strand, 8276784 - 8276817
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8276784 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 8276817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 11883518 - 11883559
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11883518 aatggtaaaactatatgagatagttgatgttgaatgatattg 11883559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 55)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22273951 - 22273741
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22273951 acttgatatgggttttgataggagatgttttattgagtcaattacctaatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 22273852  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22273851 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgattgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgt 22273753  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  22273752 tgaatgacattg 22273741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22283184 - 22282974
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22283184 acttgatatgggttttgattggagatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 22283085  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22283084 gattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgt 22282986  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  22282985 tgaatgacattg 22282974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 21275503 - 21275716
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  21275503 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 21275601  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21275602 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 21275701  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  21275702 agttgatgttgaatg 21275716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 12643001 - 12643214
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  12643001 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 12643099  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12643100 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 12643199  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  12643200 agttgatgttgaatg 12643214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 42179342 - 42179555
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||| ||||||    
T  42179342 gccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatgtttt-ttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtggagttgt 42179440  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42179441 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 42179540  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  42179541 agttgatgttgaatg 42179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 19887825 - 19887969
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19887825 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 19887924  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887925 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 19887969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 36891794 - 36892014
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  36891794 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattattgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgt 36891892  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36891893 atgattgaaagattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgtg 36891991  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  36891992 atagtcgatgttgaatgacattg 36892014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21140987 - 21140843
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  21140987 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaag 21140888  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21140887 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 21140843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27260592 - 27260417
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27260592 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaacgattttattggatatgatgtttatcatgagaggtg 27260493  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260492 tatgctatcatac-tagaatgcaagggatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 27260417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 3800036 - 3800195
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 162  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3800036 cttatgaattttggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatct 3800135  T
Q  163 tacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3800136 tacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 3800195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16900361 - 16900224
Alignment:
Q  89 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  16900361 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa 16900262  T
Q  188 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16900261 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaatgaca 16900224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16993752 - 16993615
Alignment:
Q  89 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  16993752 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa 16993653  T
Q  188 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16993652 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaatgaca 16993615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6878513 - 6878299
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| || ||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||    
T  6878513 ccacttgatatggtttttggtcggaaatattt-cttgagccaattgtcttatgaattgtggtgaccattcttatataactaagtgaagttgtgtgaacga 6878415  T
Q  116 atgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    || ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6878414 ataattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgttgaaactatatgtgatagttg 6878315  T
Q  213 atgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||| ||||||    
T  6878314 atgttgaataacattg 6878299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 4449312 - 4449534
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| | |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  4449312 gccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgttt-cttgggccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 4449410  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||| |     
T  4449411 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaaccatagga 4449510  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    
T  4449511 gataaatgatgttgaatgacattg 4449534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25211988 - 25211866
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25211988 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 25211889  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaact 198  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  25211888 aggaatgcttgaatggtgaaact 25211866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8942715 - 8942502
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8942715 ccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatga 8942617  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8942616 atgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatat-gagaattgtttggaatggtgaaactatatgtgatagttg 8942518  T
Q  213 atgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||| ||||||    
T  8942517 atgttgaataacattg 8942502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 12637255 - 12637468
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12637255 ccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggttaagtgaagttgtatgaatga 12637353  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  12637354 atgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatat-gagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttg 12637452  T
Q  213 atgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  12637453 atgttgaatgacattg 12637468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Original strand, 22581094 - 22581236
Alignment:
Q  89 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||    
T  22581094 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttg 22581193  T
Q  187 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    || |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22581194 aattggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattg 22581236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 270226 - 270035
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || ||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  270226 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccagttgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaa 270129  T
Q  113 tgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  270128 tgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagagtgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatg 270035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34823309 - 34823165
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  34823309 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 34823211  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34823210 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 34823165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12727270 - 12727126
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  12727270 gattattcttgtatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 12727172  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12727171 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 12727126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8887099 - 8886996
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8887099 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaaaatgtaagaaata-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 8887001  T
Q  224 cattg 228  Q
    |||||    
T  8887000 cattg 8886996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Original strand, 24572526 - 24572694
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| || |||||| ||||||||| | |    
T  24572526 cttatgattgattgagaatattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattatatgttggatatgatgcttgtcatgagatgtgtatgttct 24572625  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||| | ||||  ||| |||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  24572626 cttacttagaatgtgaggaatgtttgaaatggtaaaactatatgaggtagtagatgtcgaatgacattg 24572694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28973118 - 28972896
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||  |  |  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28973118 gccgtttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgggttttatcgtgatcatttttatatgactaagtgaagttgt 28973020  T
Q  108 atgaatgaatg----attgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatat 202  Q
    ||||| |||||    | |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||| ||||||| |    
T  28973019 atgaacgaatggccaaatgt--tggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgtgatcttacctaggatgtaaggaatgcttaaatggtaaaactatgt 28972922  T
Q  203 gtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    | | |  |||||||||||||||||||    
T  28972921 gaggtgtttgatgttgaatgacattg 28972896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Original strand, 9653983 - 9654139
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 162  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||          ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  9653983 cttatgaattgttgtgaccattcttgtataactatgtgaagttgtatgaatgaatgat----------atgatatttatcatgagatgtatatgctatct 9654072  T
Q  163 tacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9654073 tacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 9654139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7320450 - 7320345
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7320450 ttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatg 7320351  T
Q  223 acattg 228  Q
    ||||||    
T  7320350 acattg 7320345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22862446 - 22862343
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22862446 ttggatatgatatttatcatgatatatgtatgttatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatttgtgatagttgatattgaatga 22862348  T
Q  224 cattg 228  Q
     ||||    
T  22862347 aattg 22862343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Original strand, 20628580 - 20628647
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 153  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20628580 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaataattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgt 20628647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20014131 - 20013976
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| | | |  | |||||| |||    
T  20014131 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt-ttttccctattacttggaa 20014033  T
Q  172 tgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    | |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  20014032 tat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 20013976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 14907583 - 14907741
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  14907583 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 14907682  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  14907683 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 14907741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23819191 - 23819033
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  23819191 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 23819092  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  23819091 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 23819033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Original strand, 25877210 - 25877252
Alignment:
Q  185 tgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25877210 tgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 25877252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25600858 - 25600817
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25600858 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 25600817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12727010 - 12726907
Alignment:
Q  127 ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12727010 ggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgac 12726911  T
Q  225 attg 228  Q
    ||||    
T  12726910 attg 12726907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Original strand, 22691175 - 22691252
Alignment:
Q  148 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22691175 atgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgac 22691252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Original strand, 22695822 - 22695899
Alignment:
Q  148 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22695822 atgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgac 22695899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 22787108 - 22787330
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    | |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  22787108 gccgtttgccagttgatacggtaattg-tcggaaatgttc-cttgagtcaattgtcttatgatctatcgtgactattcttatatgactaaatgaagatgt 22787205  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
     |||||||||  || ||  ||| ||||||| |||||||| | ||| |||||| | ||||| ||||||||| |  |||||||| ||| || |||| |||||    
T  22787206 gtgaatgaattgttatatgttgaatatgatatttatcataagatgttgtatgttctcttaattagaatgtgagaaatacttgaaattgtaaaaccatatg 22787305  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
     | ||||||||||||||||| ||||    
T  22787306 aggtagttgatgttgaatgatattg 22787330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 24827831 - 24827872
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24827831 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 24827872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 461714 - 461646
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  461714 ttatataactaaatgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 461646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 12643223 - 12643328
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12643223 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 12643321  T
Q  222 gacattg 228  Q
    |||||||    
T  12643322 gacattg 12643328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 20628662 - 20628701
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20628662 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattg 20628701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 19888041 - 19888083
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19888041 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 19888083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21140771 - 21140729
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21140771 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 21140729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 21275788 - 21275830
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21275788 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 21275830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 721407 - 721338
Alignment:
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  721407 tcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattg 721338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 3800257 - 3800302
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3800257 agaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 3800302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34823093 - 34823052
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34823093 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 34823052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Original strand, 43644243 - 43644276
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43644243 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 43644276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12727118 - 12727020
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12727118 ttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgag-ctatatgtgatagttgatgttgaatg 12727021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 43644158 - 43644226
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43644158 ttatataactaagtgtagttgtatgaatgaatggttatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 43644226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 11232484 - 11232557
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  11232484 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 11232557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 22514331 - 22514404
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  22514331 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 22514404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 28776932 - 28777005
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  28776932 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 28777005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 5889559 - 5889600
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  5889559 aatggtgaaactatacggtatagttgatgttgaatgacattg 5889600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 24088566 - 24088671
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtg-tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||   ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24088566 ttggatatgatatttatcataagatgtggtatgtcctcttacttagaatgtgagaaatacttgaagtggtaagactatatgaggtagttgatgttaaatg 24088665  T
Q  223 acattg 228  Q
    | ||||    
T  24088666 atattg 24088671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7827 - 7651
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7827 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtg 7728  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7727 tatgctatcttacttagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgagatagtttatgttgaatgacattg 7651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Original strand, 32287 - 32496
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  32287 acttgatatgggttttaatcggagatgttttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaat 32386  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32387 gattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaat-gttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgt 32484  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  32485 tgaatgacattg 32496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40557 - 40348
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40557 acttgatatgggttttaatcggagatgttttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaat 40458  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40457 gattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaat-gttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgt 40360  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  40359 tgaatgacattg 40348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 38372 - 38522
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38372 ttgtgattattcttgtatgactaattgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 38471  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38472 tgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgttagttgatgttgaatg 38522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 38594 - 38636
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38594 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 38636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 14842 - 15055
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  14842 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 14940  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14941 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 15040  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  15041 agttgatgttgaatg 15055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 15064 - 15169
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15064 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 15162  T
Q  222 gacattg 228  Q
    |||||||    
T  15163 gacattg 15169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 137897 - 138116
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  137897 gccggtggcaactcgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaatggtggtgagtaatcttatatgactaagtgaagttgt 137995  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  137996 atgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagaagtgtatgctatcttac-taaaatgtaatgaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 138094  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  138095 tagttgatgttgaatgacattg 138116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 87504 - 87296
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||            |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  87504 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatg-tttcttgagccaatt------------gttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgt 87418  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  87417 atgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgaga 87318  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  87317 tagttaatgttgaatgacattg 87296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10740 - 10523
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| |  |  | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10740 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttaggttttatcgtgattatttttatatgactaagtgaagttgtataaa 10642  T
Q  113 tgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtg-tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
     ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||  |||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  10641 cgaatggttgtatgttggatatgacgtttatcatagaatgtggtatgtgctcttacttagaatgtaaggaatgattgaatggtaaaactatgtgaggtag 10542  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  10541 ttgatattgaatgacattg 10523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 1925 - 2144
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  1925 gccgtttgccacttgacacggttttcggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 2023  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  2024 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgataaaactatatgtgat 2123  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2124 agttgatgttgaatgacattg 2144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 12826 - 13045
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  12826 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttaaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 12924  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12925 atgaatgaataattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttataatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 13024  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13025 agttgatgttgaatgacattg 13045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 400 - 182
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || || |||||  ||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  400 gccggtggccacttgatatggtttttggacggaaatgtttt-ttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatgtgactaagtgaatttgt 302  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  301 atgattgaatgattgtataggatatgatgcttatcatgagaggtgtatgctaccttac-tagaatgtaatgaatgttgaaatggtgaaactatatgtgat 203  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  202 agttgatgttgaatgacattg 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1518 - 1368
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1518 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 1419  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1418 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 1368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6303 - 6088
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  6303 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaata 6205  T
Q  115 aatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6204 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 6105  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||| ||||||    
T  6104 gatgttgaataacattg 6088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1221
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 1221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 57 - 228
Target Start/End: Original strand, 2925 - 3097
Alignment:
Q  57 aattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  2925 aattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgtttgtattggatatgatgtgtatcatgagatgcgtatg 3024  T
Q  157 ctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3025 ctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaaatggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattg 3097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6594 - 6404
Alignment:
Q  37 cggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 136  Q
    ||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594 cggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 6496  T
Q  137 tttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6495 tttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaataatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 6404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44875 - 44656
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||   |||||||| || | || ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  44875 gccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgttttatgaattgtggagactatgcttgtatgactaagtgaagttgt 44778  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44777 atgaatgaatgattgtatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 44678  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  44677 tagttgatgttgaatgatattg 44656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39392 - 39178
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||   |||||||| || | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39392 gccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgt 39295  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39294 atgaatgaatgattgtatttggttatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 39195  T
Q  207 tagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  39194 tagttgatgttgaatga 39178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39184 - 39069
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39184 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 39085  T
Q  213 atgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  39084 atgttgaatgacattg 39069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 78558 - 78409
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||| || | |  | |||||| |||| | | |    
T  78558 attcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgattatcatgagatgttgttttccctattacttggaatatga-g 78460  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  78459 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattg 78409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 20446 - 20600
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20446 ttgtgattattcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatg 20545  T
Q  174 taaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||  || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20546 taagaaaaaataaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 20600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3695 - 3480
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  3695 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaata 3597  T
Q  115 aatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3596 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 3497  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||| ||||||    
T  3496 gatgttgaataacattg 3480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8309 - 8256
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatga 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  8309 gccacttgatatggtttttggtcggaaatg-tttcttgagccaattgtcttatga 8256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 95545 - 95326
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  95545 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 95447  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  95446 atgaatgaatgattgtattggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcctacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 95347  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  95346 agttgatgttgaatgacattg 95326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 95219 - 95178
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  95219 aatggtgaaactatatgtgaaagttgatgttaaatgacattg 95178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 129568 - 129353
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  129568 gccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatg 129470  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  129469 tgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtctgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 129370  T
Q  207 tagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  129369 tagttgatgttgaatga 129353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 222
Target Start/End: Original strand, 89938 - 90075
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  89938 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 90037  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  90038 gaattggtgaaactatatgatgtggttgatgttgaatg 90075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 129281 - 129240
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129281 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 129240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 90147 - 90189
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  90147 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 90189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6292 - 6148
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6292 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaag 6193  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 6148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 216932 - 217000
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  216932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagggatatgatgtctatcatgagatgtgta 217000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6076 - 6034
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6076 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 6034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 228
Target Start/End: Original strand, 217016 - 217053
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  217016 gtgaaactatatgtgatagttgattttgaatgacattg 217053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 155402 - 155546
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||     
T  155402 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagttatgtatgatatcttacttagaatgtaag 155501  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155502 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 155546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 155618 - 155660
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  155618 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 155660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 1507 - 1666
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 162  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  1507 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctaact 1606  T
Q  163 tacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1607 tacttataatgtaaggaatggttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47201 - 46983
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47201 cggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgttta-ttgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtat 47103  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47102 gaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgcgata 47003  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47002 gttgatgttgaatgacattg 46983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 60649 - 60431
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  60649 cggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgttta-ttgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtat 60551  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  60550 gaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgcgata 60451  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  60450 gttgatgttgaatgacattg 60431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3692 - 3517
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3692 agtcaattaccttttgaattgttgtgactactcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtg 3593  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| |||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3592 tatgatatcttac-tataatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgctgaatgacattg 3517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 13283 - 13498
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13283 ttgccacttgacatggtgtttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 13381  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13382 tgaatgattgtatgggatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactaaatgtgatagtt 13481  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  13482 gatgtggaataacattg 13498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29104 - 28889
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29104 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 29006  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29005 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgctattttacttggaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatctgtgatagtt 28906  T
Q  212 gatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  28905 gatgttgaatgacattg 28889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28780 - 28741
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28780 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 28741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 43051 - 43262
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43051 ccacttgatatgatttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 43149  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43150 atgattgtattaaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaatcatatgtgatagttgatg 43249  T
Q  216 ttgaatgacattg 228  Q
    || ||||||||||    
T  43250 tttaatgacattg 43262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 237261 - 237039
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| ||| || | |||||||||||||    
T  237261 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcgtaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaatcgtggtgaccatttttacataactaagtgaagttgt 237163  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  237162 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 237063  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  237062 gatagttgatgttgaataacattg 237039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 271020 - 270979
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  271020 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 270979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 218
Target Start/End: Original strand, 2162 - 2319
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2162 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgaaatatgtatgctat 2261  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 218  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 cttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 2319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 2395 - 2436
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2395 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 2436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 113652 - 113862
Alignment:
Q  17 cacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaa 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||  ||||||| |  | |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  113652 cacttgataaggtttttggtcggaagtgttc-cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactactcttatatgactaagggaagttgtatgaatgaa 113750  T
Q  117 tgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  113751 tgattgtattgaatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgcttgaaacggtgaaactacatgtgatagttgatg 113849  T
Q  216 ttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||    
T  113850 ttgaatgacattg 113862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 108739 - 108526
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  108739 gccgtttgccacttgatatggtatt--gtcggaaatgtttctttgagtcaattggcttatgattcatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttgt 108642  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||| || | |||||||||      
T  108641 atgaatgaatgattatatgttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtgagaaatgcttgaagtgataaaactatataa 108542  T
Q  205 gatagttgatgttgaa 220  Q
    | ||||||||||||||    
T  108541 ggtagttgatgttgaa 108526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 17485 - 17697
Alignment:
Q  9 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 108  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17485 ccggtagcaacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcct-gaaccaattgtctttcgaattatggtgactattcttatatggctaagtgaagttgta 17583  T
Q  109 tgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17584 tgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgat 17683  T
Q  208 agttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||||    
T  17684 agttgatgttgaat 17697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 23903 - 24116
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | |||| |||| |||||||  |||||||||||||    
T  23903 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcct-gaaccaattgtctttcgaattatggtgactatttttatatggctaagtgaagttgt 24001  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24002 atgaatgaataattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 24101  T
Q  207 tagttgatgttgaat 221  Q
    || ||||| ||||||    
T  24102 taattgatattgaat 24116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 7781 - 7958
Alignment:
Q  52 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7781 gagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgt 7880  T
Q  152 gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  7881 gtatgatatcctacttagaatgtaaggaatgcatgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattg 7958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 13170 - 13347
Alignment:
Q  52 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13170 gagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgt 13269  T
Q  152 gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13270 gtatgatatcctacttagaatgtaaggaatgcatgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattg 13347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20351 - 20248
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 20253  T
Q  224 cattg 228  Q
    |||||    
T  20252 cattg 20248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18267 - 18164
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18267 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacctagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 18169  T
Q  224 cattg 228  Q
    |||||    
T  18168 cattg 18164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13275 - 13056
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  13275 gccggtggccacttgatatggtttttagtcgaaaatgttt-ctcgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatggctaagtgaatttgt 13178  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13177 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacctaggatgtaggaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 13078  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  13077 taattgatgttgaatgacattg 13056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 145757 - 145538
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| || ||||| |||||||||||||    
T  145757 gccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattattgtatgactaagtgaagttgt 145659  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactata-tg 203  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||| ||||||||||||| ||    
T  145658 atgaatgaatgattttattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatattg 145559  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  145558 tgatagttgatgttaaatgac 145538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 145438 - 145387
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  145438 agaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattg 145387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 147769 - 147698
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  147769 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 147698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 52361 - 52579
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  | |||||||| |    
T  52361 gccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttat 52458  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  52459 atgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactgtatgtga 52557  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  52558 tagttgatgttgaatgacattg 52579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 56313 - 56531
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  | |||||||| |    
T  56313 gccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttat 56410  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  56411 atgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactgtatgtga 56509  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  56510 tagttgatgttgaatgacattg 56531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1077 - 935
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1077 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 978  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  977 atgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15333 - 15191
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  15333 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttattttacttagaatgtaagga 15234  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233 atgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 15191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12129 - 12021
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  12129 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttcagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 12031  T
Q  108 atgaatgaat 117  Q
    ||||||||||    
T  12030 atgaatgaat 12021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 18510 - 18735
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgatta-ttcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18510 gccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccaattcttgtatgactaagtgaagttg 18608  T
Q  107 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatc-ttacttagaatgtaaagaatacttgaatgg-tgaaactata- 201  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||||||     
T  18609 tatgaatgaatgattatattttggatatgatatttatcgtgagatgtgtatgctatctttacttaggatgtaagaaatgtttgaatggatgaaactatat 18708  T
Q  202 tgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18709 tgtgatagttgatgttgaatgacattg 18735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Original strand, 18831 - 18882
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18831 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattg 18882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 345 - 196
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  345 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 246  T
Q  180 atacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  245 atccttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 86 - 47
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  86 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17618
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  17764 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagactgta 17665  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17664 aggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 17618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17545 - 17504
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17545 aatggtgaaactatatatgatagttgatgttgaatgacattg 17504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 984 - 766
Alignment:
Q  11 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||| |  | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  984 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgtt--cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatacgactaagtgaagttgtatg 887  T
Q  111 aatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||  | ||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||  ||| |||| |||||| |||||||||| |||    
T  886 aatgaatgattgtatggtgggtatgatgaatgtcacgagatgtgtatgttctcttacttagactgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgagat 787  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  786 agttaatgttgaatgacattg 766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54653 - 54487
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  54653 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttctcaggagatgtgtatgctat 54554  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54553 cttac-tagaatgtaaggaat-gttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 54487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 109344 - 109386
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  109344 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 109386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Original strand, 14590 - 14645
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgat 135  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  14590 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttggatatgat 14645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Original strand, 2740 - 2882
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2740 attcttgtatgactaagtggagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatttttaccatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 2839  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2840 atgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 2882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 228
Target Start/End: Original strand, 2958 - 2995
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2958 gtgaaactaaatgtgatagtttatgttgaatgacattg 2995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28028 - 27879
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |  |    
T  28028 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtaggctatcttacttggaatat-ga 27930  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27929 gaatgcttgaattggtg-aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattg 27879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24128 - 23930
Alignment:
Q  29 tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||| || || | || ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24128 tttttggtcggaaatgtt--cttgagccaattgtcttatggattgtggagactattcttgtataactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattga 24031  T
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24030 atatgatgttcatcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtactggtgaaattgtatgttatagttgatgttgaatgacatt 23931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 146005 - 145783
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttgg-tcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  || |||||||||| ||||||     | |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  146005 gccgtttgccacttgatacggtttttgggtcgaaaacgttc-ctcgagtcaattatcttatgttctatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttg 145907  T
Q  107 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 203  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  145906 tataaatgaatgattgtatgttggatatgatgattatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaattcttgaattggtaaaactatatg 145807  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
     |||||| |||| ||||||||||||    
T  145806 agatagtggatg-tgaatgacattg 145783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 5770 - 5914
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||   ||    
T  5770 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgataattatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaaggttt 5869  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattg 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5870 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattg 5914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Original strand, 11062 - 11230
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||||    
T  11062 cttatgaattgttgtgacaattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatggtaattatcatgagaagtgtatgctat 11161  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||   |||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11162 cttacttgagatgtaaggaatgtttgaattggtgaatctatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 11230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18410 - 18263
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18410 gccgtttgccacttgatatggattttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttatgcctattcttatatgactaactgaagttgt 18312  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18311 atgattgaatgattgatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30127 - 30045
Alignment:
Q  147 aatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30127 aatgtgtatgctatcttacttaggatgcaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 30045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21696 - 21516
Alignment:
Q  27 ggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 126  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696 ggttttgggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgatttgtcgtgcccattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 21598  T
Q  127 ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    ||||||||||                    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21597 ggatatgatg--------------------ctatcttacttagaatgtaaggaatgctttaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 21518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 156
Target Start/End: Original strand, 129390 - 129451
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  129390 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 129451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8424 - 8290
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||  ||||| |||||    
T  8424 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggataagatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacctaggatgtaagatatgtttgaattggtg 8325  T
Q  194 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8324 aaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 8290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 222
Target Start/End: Original strand, 1575 - 1672
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1575 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttgcatagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 2540 - 2762
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||||   |||||||||  |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2540 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcctttgagtcaatcggcttatgaattatcatgactattcttatatgactaagtgaagttgt 2637  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||  ||| |||||  | ||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||    
T  2638 atgagtgaatgattatatgttggacatgatgtttatcatgggatgttgtattttctctaacttagaatgtaaaaaatgtttgaaatggtaaaactatatg 2737  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
     | ||||||||||||||||||||||    
T  2738 aggtagttgatgttgaatgacattg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 14350 - 14556
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||  | || |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||| ||    
T  14350 gccggtagccacttgacatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagtggt 14448  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  14449 atgaatggatgattgttttggatatgatatttatcatgggatgtgtatgttatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatatgtga 14547  T
Q  207 tagttgatg 215  Q
    |||||||||    
T  14548 tagttgatg 14556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28394 - 28355
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28394 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 28355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40390 - 40351
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40390 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 40351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28545 - 28504
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28545 aatggtgaaattatatgtgataattgatgttgaatgacattg 28504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40541 - 40500
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40541 aatggtgaaattatatgtgatatttgattttgaatgacattg 40500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 248741 - 248844
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  248741 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatttgtgatagttgatgttgaatga 248839  T
Q  224 cattg 228  Q
    |||||    
T  248840 cattg 248844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 53593 - 53462
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  53593 gccgtttgccacttgacacggtttt-ggtcggaaatgttt-cttaagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 53496  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 142  Q
    |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  53495 atgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 53462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 53203 - 53162
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  53203 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattg 53162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6906 - 6750
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||     
T  6906 gtgactattcatatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaac 6807  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||  ||| |||| |||| | | |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6806 gtaagaaatgcttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattg 6750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2442 - 2286
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||     
T  2442 gtgactattcatatatgactaagagaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaac 2343  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||  ||| |||| |||| | | |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2342 gtaagaaatgcttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattg 2286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 59675 - 59580
Alignment:
Q  134 atgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  59675 atgtttatcatgagatgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaaatggtgaaactatataagataattgatgttgaatgacattg 59580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32541 - 32440
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32541 atatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacat 32442  T
Q  227 tg 228  Q
    ||    
T  32441 tg 32440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14613 - 14537
Alignment:
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14613 tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 14537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41737 - 41677
Alignment:
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41737 ttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 41677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41605 - 41564
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41605 aatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatgacattg 41564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 467 - 318
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||| |||| || |    | |||||| |||| |   |    
T  467 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatttgattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttcctattacttggaatatgg-g 369  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  368 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2152 - 2085
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 153  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2152 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattgcatatgatgtttatcatgagatgtgt 2085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 2039
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2078 tggtgaaaccatatgtgatagttgatgttgaataacattg 2039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 119
Target Start/End: Original strand, 1817 - 1884
Alignment:
Q  52 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1817 gagtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgtatga 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 2723 - 2881
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttaga 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || || |||  |||||||||| ||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |     
T  2723 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtggttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggg 2822  T
Q  171 atgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    || | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2823 atatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 2881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Original strand, 22940 - 23008
Alignment:
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  22940 tcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatg-tgaatgacattg 23008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 5515 - 5676
Alignment:
Q  14 tgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||| |  |  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5515 tgccacttgatacagtttttggtcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttaggttttatcgcgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaac 5613  T
Q  114 gaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    |||||| | ||  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||    
T  5614 gaatgactatatgttggatgtgatg-ttatcatggaatgttgtatgtgctcttacttagaatgt 5676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Original strand, 6577 - 6645
Alignment:
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  6577 tcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatg-tgaatgacattg 6645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Original strand, 505 - 615
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||| || |||||  |||| | || ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  505 ccacttgatatcgttttaggtcggaaatgctt-cttaagccaattgtcttagggattgttgtgaatattcttatatgactaaacgaagttgtatgaatga 603  T
Q  116 atgattgtattg 127  Q
    ||||||||||||    
T  604 atgattgtattg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 618 - 699
Alignment:
Q  148 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  618 atgagtatactatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttaacgttgaatgacattg 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 6415 - 6454
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6415 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 6454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6400
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtt-tatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6332 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattat-gtggatatgatgttctatcatgagatgtgta 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7960 - 7890
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7960 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21660 - 21502
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  21660 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgacatgttgtttttccctattacttgg 21561  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  21560 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 21502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25915 - 25757
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  25915 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 25816  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  25815 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattg 25757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40559 - 40502
Alignment:
Q  97 agtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40559 agtggagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtatatcatgaaatgtgta 40502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4734 - 4698
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4734 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 4698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 17353 - 17395
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17353 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattg 17395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 330964 - 331021
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgt 137  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  330964 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattttggatatgatgt 331021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 413
Alignment:
Q  194 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  446 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 156
Target Start/End: Original strand, 4788 - 4849
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  4788 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagaaatgatgtctatcatgagatgtgtatg 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 27696 - 27763
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27696 ttatataactaagtgcagttgtatgaatgaatgattat-gtggatatgatgtctatcatgagatgtgta 27763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Original strand, 27781 - 27817
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27781 tgaaactatatgtgaaagttgatgttgaatgacattg 27817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34466 - 34427
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34466 tggtgaaactatatgtgatagttaatgttgaataacattg 34427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38213 - 38140
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  38213 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattg 38140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University