View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11280A_low_89 (Length: 321)

Name: NF11280A_low_89
Description: NF11280A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11280A_low_89
NF11280A_low_89
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (75-262)||(21652690-21652877)
chr5 (73-258)||(11582564-11582749)
chr5 (73-262)||(21392874-21393063)
chr5 (73-255)||(1169947-1170129)
chr5 (73-262)||(20710823-20711011)
chr5 (73-262)||(28258286-28258476)
chr5 (75-258)||(17473177-17473360)
chr5 (73-258)||(1221137-1221319)
chr5 (73-258)||(22367890-22368072)
chr5 (73-258)||(7424367-7424550)
chr5 (73-258)||(11341326-11341509)
chr5 (73-258)||(21074895-21075077)
chr5 (73-258)||(4201371-4201554)
chr5 (72-255)||(24184498-24184681)
chr5 (73-258)||(23513486-23513671)
chr5 (73-258)||(25192402-25192586)
chr5 (73-254)||(11044-11221)
chr5 (73-255)||(9732072-9732252)
chr5 (73-255)||(16534999-16535180)
chr5 (73-258)||(22884586-22884771)
chr5 (73-254)||(29192026-29192203)
chr5 (73-258)||(110388-110572)
chr5 (73-258)||(10779585-10779767)
chr5 (73-258)||(43445158-43445342)
chr5 (73-258)||(21234811-21234994)
chr5 (73-254)||(4863961-4864142)
chr5 (73-258)||(18779399-18779583)
chr5 (73-258)||(23327643-23327824)
chr5 (73-258)||(24595191-24595372)
chr5 (73-258)||(25425312-25425492)
chr5 (82-255)||(20615305-20615476)
chr5 (73-255)||(21649523-21649704)
chr5 (73-255)||(37051677-37051857)
chr5 (86-262)||(23510676-23510849)
chr5 (79-255)||(35792544-35792719)
chr5 (84-258)||(19498490-19498659)
chr5 (73-258)||(21933568-21933748)
chr5 (73-258)||(21939738-21939918)
chr5 (73-258)||(35580944-35581124)
chr5 (73-258)||(37010572-37010752)
chr5 (73-260)||(19404268-19404456)
chr5 (73-255)||(27185119-27185301)
chr5 (75-262)||(11338154-11338341)
chr5 (73-260)||(23453638-23453826)
chr5 (73-260)||(23465143-23465331)
chr5 (73-255)||(25901731-25901911)
chr5 (73-250)||(11213008-11213183)
chr5 (91-255)||(27008705-27008867)
chr5 (98-174)||(24474367-24474443)
chr5 (157-230)||(7727296-7727369)
chr5 (160-255)||(3672685-3672780)
chr5 (23-73)||(2030712-2030762)
chr5 (73-122)||(1169799-1169848)
chr5 (73-122)||(17473026-17473075)
chr5 (157-230)||(23492722-23492794)
chr5 (157-218)||(32967547-32967608)
chr5 (23-71)||(34938324-34938372)
chr5 (158-218)||(37189501-37189561)
chr5 (75-122)||(43445013-43445060)
chr5 (201-255)||(24470996-24471049)
chr5 (157-229)||(431149-431221)
chr5 (23-71)||(25003750-25003798)
chr5 (158-218)||(28888649-28888709)
chr5 (23-71)||(29191427-29191475)
chr5 (160-255)||(5452190-5452285)
chr5 (160-229)||(21615735-21615804)
chr5 (160-229)||(24226842-24226911)
chr5 (23-71)||(23112311-23112359)
chr5 (160-218)||(19860967-19861025)
chr5 (85-122)||(35792419-35792456)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (73-262)||(18431322-18431511)
chr6 (73-262)||(18004259-18004448)
chr6 (73-262)||(25646113-25646302)
chr6 (73-258)||(35016967-35017152)
chr6 (73-262)||(15736467-15736656)
chr6 (73-258)||(18569280-18569464)
chr6 (73-258)||(27655373-27655555)
chr6 (73-255)||(31627134-31627316)
chr6 (73-255)||(32897419-32897601)
chr6 (73-258)||(16827162-16827346)
chr6 (78-258)||(18088003-18088182)
chr6 (76-254)||(11214836-11215014)
chr6 (73-255)||(16230278-16230458)
chr6 (73-258)||(23976263-23976445)
chr6 (73-258)||(33315868-33316050)
chr6 (73-255)||(16105254-16105437)
chr6 (73-258)||(4989591-4989773)
chr6 (73-254)||(25174253-25174430)
chr6 (75-262)||(13622401-13622589)
chr6 (73-258)||(16239057-16239243)
chr6 (73-258)||(1658997-1659182)
chr6 (73-258)||(10487573-10487753)
chr6 (73-258)||(16377574-16377754)
chr6 (73-258)||(16384898-16385078)
chr6 (73-255)||(23151956-23152137)
chr6 (73-258)||(14627896-14628079)
chr6 (73-255)||(18775907-18776086)
chr6 (73-255)||(19984491-19984671)
chr6 (106-255)||(18128981-18129129)
chr6 (79-258)||(17343578-17343754)
chr6 (85-255)||(15861425-15861593)
chr6 (73-262)||(13016072-13016260)
chr6 (73-258)||(16557302-16557483)
chr6 (73-258)||(16650532-16650713)
chr6 (73-258)||(29870761-29870943)
chr6 (73-255)||(26088532-26088712)
chr6 (75-255)||(18397622-18397803)
chr6 (73-254)||(18825047-18825225)
chr6 (73-254)||(18843107-18843286)
chr6 (79-255)||(23993858-23994032)
chr6 (73-258)||(1651237-1651420)
chr6 (73-255)||(22430944-22431126)
chr6 (87-255)||(1554536-1554703)
chr6 (73-217)||(25745618-25745763)
chr6 (137-258)||(19609191-19609310)
chr6 (73-258)||(22226927-22227111)
chr6 (152-255)||(16084112-16084215)
chr6 (152-260)||(28196147-28196255)
chr6 (89-255)||(22866864-22867031)
chr6 (157-255)||(25368728-25368827)
chr6 (64-122)||(1554817-1554875)
chr6 (157-255)||(15738945-15739043)
chr6 (12-73)||(1554886-1554947)
chr6 (73-149)||(16084882-16084959)
chr6 (23-71)||(221995-222043)
chr6 (197-255)||(18741146-18741203)
chr6 (157-218)||(16889122-16889183)
chr6 (157-230)||(33323532-33323605)
chr6 (157-230)||(35137326-35137399)
chr6 (23-71)||(14627293-14627341)
chr6 (23-71)||(27739885-27739933)
chr6 (23-71)||(35010557-35010605)
chr6 (160-216)||(22846867-22846923)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (73-306)||(821398-821646)
chr4 (73-262)||(33738948-33739137)
chr4 (73-255)||(12901058-12901240)
chr4 (73-255)||(44054612-44054794)
chr4 (73-255)||(53909056-53909238)
chr4 (76-258)||(53706079-53706261)
chr4 (73-262)||(44345510-44345700)
chr4 (73-255)||(16521479-16521660)
chr4 (73-258)||(19999215-19999397)
chr4 (73-262)||(7133735-7133924)
chr4 (75-262)||(45460244-45460432)
chr4 (73-255)||(8873780-8873961)
chr4 (73-258)||(10642874-10643059)
chr4 (73-258)||(18167481-18167662)
chr4 (73-258)||(15288296-15288479)
chr4 (73-255)||(110171-110352)
chr4 (73-255)||(15274046-15274226)
chr4 (73-255)||(21960854-21961036)
chr4 (73-258)||(9294212-9294395)
chr4 (73-258)||(10487358-10487541)
chr4 (73-258)||(22355850-22356033)
chr4 (73-258)||(26338173-26338354)
chr4 (73-258)||(13245139-13245322)
chr4 (73-258)||(15295406-15295589)
chr4 (73-258)||(16329210-16329393)
chr4 (73-254)||(18246881-18247058)
chr4 (73-258)||(47356013-47356198)
chr4 (73-258)||(14950707-14950890)
chr4 (73-257)||(8373042-8373225)
chr4 (73-254)||(14994888-14995067)
chr4 (73-255)||(25120408-25120589)
chr4 (104-258)||(54119579-54119732)
chr4 (75-241)||(30233831-30233998)
chr4 (73-255)||(34393744-34393926)
chr4 (73-255)||(5684188-5684370)
chr4 (12-122)||(19019390-19019500)
chr4 (12-122)||(8373431-8373541)
chr4 (73-255)||(15212032-15212214)
chr4 (76-260)||(18495695-18495880)
chr4 (79-255)||(13049455-13049630)
chr4 (73-258)||(26678732-26678905)
chr4 (73-206)||(23271210-23271342)
chr4 (152-260)||(13810995-13811103)
chr4 (187-262)||(13751694-13751769)
chr4 (157-255)||(43282757-43282855)
chr4 (157-255)||(52266840-52266938)
chr4 (73-205)||(18294453-18294580)
chr4 (73-182)||(8044021-8044131)
chr4 (23-80)||(8043951-8044008)
chr4 (68-122)||(18294300-18294354)
chr4 (73-122)||(5684039-5684088)
chr4 (157-230)||(15852696-15852769)
chr4 (165-255)||(15043631-15043721)
chr4 (165-255)||(15110703-15110793)
chr4 (75-121)||(47356297-47356343)
chr4 (23-73)||(55377977-55378027)
chr4 (157-218)||(27959759-27959820)
chr4 (157-218)||(34197544-34197605)
chr4 (73-122)||(34394020-34394069)
chr4 (157-210)||(37958436-37958489)
chr4 (157-218)||(41167314-41167375)
chr4 (25-73)||(22737482-22737530)
chr4 (85-122)||(18110001-18110038)
chr4 (160-229)||(41257728-41257797)
chr4 (23-71)||(14910972-14911020)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (73-262)||(22407487-22407676)
chr1 (73-262)||(49966331-49966520)
chr1 (73-255)||(2422263-2422445)
chr1 (73-258)||(18506043-18506227)
chr1 (77-258)||(41210732-41210913)
chr1 (72-255)||(35523712-35523894)
chr1 (73-255)||(20826516-20826696)
chr1 (73-255)||(44036192-44036373)
chr1 (73-258)||(15862725-15862908)
chr1 (73-258)||(22034535-22034716)
chr1 (73-258)||(22250245-22250430)
chr1 (73-255)||(37845758-37845939)
chr1 (79-258)||(20894991-20895169)
chr1 (73-255)||(21858246-21858427)
chr1 (73-258)||(22352814-22352999)
chr1 (73-258)||(22365441-22365626)
chr1 (73-258)||(17147468-17147651)
chr1 (73-258)||(7641887-7642068)
chr1 (68-249)||(20444442-20444622)
chr1 (68-249)||(20530207-20530387)
chr1 (73-258)||(21651229-21651412)
chr1 (73-255)||(5675893-5676074)
chr1 (73-258)||(18060901-18061085)
chr1 (73-258)||(51451299-51451482)
chr1 (73-255)||(21716895-21717074)
chr1 (73-255)||(35053532-35053711)
chr1 (73-258)||(17003511-17003691)
chr1 (12-122)||(20253246-20253356)
chr1 (73-255)||(20526808-20526989)
chr1 (73-258)||(45050370-45050553)
chr1 (79-258)||(22226667-22226846)
chr1 (73-258)||(22029383-22029565)
chr1 (91-255)||(41218143-41218307)
chr1 (91-255)||(20930163-20930327)
chr1 (73-258)||(41393138-41393321)
chr1 (98-255)||(9785551-9785707)
chr1 (87-255)||(18602351-18602518)
chr1 (87-255)||(5073608-5073775)
chr1 (73-262)||(51657606-51657805)
chr1 (87-220)||(20121965-20122098)
chr1 (73-143)||(22031008-22031078)
chr1 (157-230)||(38034997-38035070)
chr1 (160-255)||(22836628-22836723)
chr1 (157-255)||(27673543-27673641)
chr1 (157-230)||(36357713-36357786)
chr1 (23-71)||(32650486-32650534)
chr1 (157-232)||(20956341-20956416)
chr1 (157-218)||(19601911-19601972)
chr1 (73-122)||(22353097-22353146)
chr1 (160-229)||(37235336-37235405)
chr1 (160-218)||(5471758-5471816)
chr1 (161-229)||(8539328-8539396)
chr1 (161-229)||(8604567-8604635)
[»] chr8 (77 HSPs)
chr8 (73-258)||(24718702-24718887)
chr8 (73-262)||(25121227-25121416)
chr8 (73-258)||(6775517-6775701)
chr8 (73-262)||(41245348-41245537)
chr8 (73-262)||(19994436-19994626)
chr8 (73-258)||(3432861-3433044)
chr8 (73-261)||(22908770-22908956)
chr8 (73-258)||(43374868-43375051)
chr8 (73-258)||(224446-224631)
chr8 (73-258)||(700859-701044)
chr8 (73-258)||(738069-738254)
chr8 (73-258)||(861964-862149)
chr8 (73-258)||(13663921-13664105)
chr8 (73-258)||(13723196-13723380)
chr8 (73-255)||(20648724-20648906)
chr8 (73-262)||(22322720-22322909)
chr8 (73-258)||(5236883-5237066)
chr8 (73-258)||(16874224-16874407)
chr8 (73-258)||(24662532-24662715)
chr8 (73-258)||(43684342-43684525)
chr8 (73-255)||(24930399-24930582)
chr8 (73-255)||(20655309-20655491)
chr8 (73-255)||(24386994-24387175)
chr8 (73-258)||(272491-272671)
chr8 (73-258)||(643178-643358)
chr8 (73-258)||(828984-829164)
chr8 (73-262)||(16416945-16417135)
chr8 (73-258)||(22089730-22089911)
chr8 (73-254)||(24107872-24108050)
chr8 (73-255)||(37610059-37610241)
chr8 (73-258)||(15320346-15320527)
chr8 (73-258)||(15500715-15500896)
chr8 (73-255)||(29758984-29759165)
chr8 (73-253)||(16195022-16195202)
chr8 (75-255)||(20568553-20568734)
chr8 (75-255)||(20574746-20574927)
chr8 (73-258)||(24547909-24548092)
chr8 (98-255)||(270429-270585)
chr8 (98-255)||(645335-645491)
chr8 (98-255)||(831070-831226)
chr8 (98-258)||(22007788-22007948)
chr8 (73-255)||(21696253-21696436)
chr8 (73-260)||(21679889-21680077)
chr8 (12-122)||(17151225-17151335)
chr8 (73-260)||(17730749-17730936)
chr8 (75-255)||(28543628-28543806)
chr8 (73-188)||(28836353-28836465)
chr8 (73-255)||(20480365-20480543)
chr8 (87-255)||(16675624-16675791)
chr8 (24-122)||(18618138-18618238)
chr8 (91-255)||(21853199-21853361)
chr8 (156-255)||(37605685-37605783)
chr8 (91-255)||(21845794-21845956)
chr8 (157-255)||(18768135-18768233)
chr8 (73-175)||(16040645-16040748)
chr8 (73-175)||(16042321-16042424)
chr8 (189-255)||(16203739-16203804)
chr8 (73-260)||(38532336-38532533)
chr8 (157-230)||(39448198-39448271)
chr8 (23-73)||(41508302-41508352)
chr8 (157-218)||(21199547-21199608)
chr8 (157-218)||(31195658-31195719)
chr8 (75-122)||(224301-224348)
chr8 (75-122)||(700714-700761)
chr8 (75-122)||(737924-737971)
chr8 (75-122)||(861819-861866)
chr8 (73-122)||(13663774-13663823)
chr8 (73-122)||(13722309-13722358)
chr8 (73-122)||(13722457-13722506)
chr8 (73-122)||(13722605-13722654)
chr8 (73-122)||(13722753-13722802)
chr8 (73-122)||(13722901-13722950)
chr8 (73-122)||(13723049-13723098)
chr8 (160-218)||(23148624-23148682)
chr8 (157-218)||(21192120-21192181)
chr8 (157-255)||(22737250-22737349)
chr8 (160-218)||(23835950-23836008)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (73-262)||(13867363-13867552)
chr7 (73-261)||(44863930-44864118)
chr7 (73-255)||(45453545-45453728)
chr7 (73-262)||(7291540-7291728)
chr7 (73-262)||(12545001-12545190)
chr7 (73-262)||(47288461-47288650)
chr7 (75-262)||(26071557-26071743)
chr7 (75-262)||(26095344-26095530)
chr7 (73-255)||(369580-369762)
chr7 (73-254)||(15952385-15952563)
chr7 (73-262)||(15823695-15823888)
chr7 (73-262)||(142313-142503)
chr7 (78-258)||(18981201-18981379)
chr7 (75-258)||(2191987-2192169)
chr7 (73-255)||(2027250-2027432)
chr7 (73-255)||(3058741-3058922)
chr7 (73-254)||(16417162-16417339)
chr7 (73-258)||(13757270-13757453)
chr7 (73-258)||(15442848-15443031)
chr7 (73-258)||(16210471-16210654)
chr7 (73-256)||(13038395-13038576)
chr7 (73-255)||(32495843-32496025)
chr7 (73-255)||(112586-112767)
chr7 (73-255)||(11582131-11582311)
chr7 (73-255)||(11285904-11286088)
chr7 (73-258)||(36051355-36051538)
chr7 (73-255)||(13912402-13912582)
chr7 (73-258)||(15525772-15525957)
chr7 (73-258)||(27102839-27103019)
chr7 (73-258)||(27110187-27110367)
chr7 (73-258)||(27175307-27175487)
chr7 (73-258)||(38784931-38785111)
chr7 (73-258)||(16480225-16480408)
chr7 (73-255)||(1938060-1938240)
chr7 (73-255)||(125520-125701)
chr7 (73-258)||(7821615-7821795)
chr7 (73-258)||(7828926-7829106)
chr7 (73-255)||(12753575-12753756)
chr7 (73-255)||(12249401-12249584)
chr7 (73-258)||(15926058-15926239)
chr7 (79-255)||(42057458-42057632)
chr7 (73-255)||(11514816-11514996)
chr7 (73-255)||(30263413-30263593)
chr7 (73-258)||(26010480-26010663)
chr7 (73-255)||(3893789-3893968)
chr7 (77-258)||(18255113-18255295)
chr7 (87-255)||(15761672-15761839)
chr7 (78-255)||(13571525-13571701)
chr7 (75-260)||(16571380-16571568)
chr7 (75-260)||(16594094-16594282)
chr7 (116-258)||(2436315-2436456)
chr7 (114-255)||(25293608-25293747)
chr7 (80-258)||(10988303-10988479)
chr7 (152-260)||(13273431-13273539)
chr7 (152-260)||(15629459-15629567)
chr7 (64-122)||(15761500-15761558)
chr7 (73-135)||(39047980-39048042)
chr7 (12-73)||(15761428-15761489)
chr7 (152-260)||(49049169-49049277)
chr7 (31-80)||(7285717-7285766)
chr7 (23-80)||(47482182-47482239)
chr7 (25-73)||(14252581-14252629)
chr7 (73-111)||(15851163-15851201)
chr7 (160-229)||(9058007-9058076)
chr7 (160-254)||(10862231-10862326)
chr7 (73-116)||(15629613-15629656)
chr7 (161-218)||(15913817-15913874)
chr7 (73-111)||(13273590-13273628)
chr7 (157-195)||(13376423-13376461)
chr7 (85-122)||(2191847-2191884)
[»] chr3 (90 HSPs)
chr3 (73-261)||(6148127-6148315)
chr3 (73-258)||(13816200-13816385)
chr3 (73-258)||(19572057-19572242)
chr3 (73-262)||(16183295-16183489)
chr3 (73-258)||(15860433-15860617)
chr3 (73-258)||(16819597-16819778)
chr3 (73-258)||(18909378-18909559)
chr3 (73-255)||(22145560-22145740)
chr3 (75-262)||(17099397-17099585)
chr3 (73-262)||(50113418-50113602)
chr3 (72-255)||(35122377-35122560)
chr3 (73-258)||(8269689-8269870)
chr3 (73-258)||(8276800-8276981)
chr3 (77-255)||(8630538-8630715)
chr3 (73-255)||(17957621-17957802)
chr3 (73-254)||(22273737-22273914)
chr3 (73-255)||(33340534-33340715)
chr3 (73-255)||(53769350-53769530)
chr3 (73-258)||(49230901-49231086)
chr3 (73-255)||(51159764-51159945)
chr3 (79-258)||(27839394-27839573)
chr3 (73-255)||(318899-319081)
chr3 (73-255)||(2048751-2048933)
chr3 (73-254)||(2450615-2450791)
chr3 (73-255)||(7852499-7852680)
chr3 (73-255)||(19230751-19230932)
chr3 (82-262)||(25057531-25057710)
chr3 (73-258)||(1468941-1469121)
chr3 (73-255)||(17913537-17913717)
chr3 (73-258)||(30152023-30152204)
chr3 (75-255)||(16259732-16259911)
chr3 (73-255)||(19945317-19945499)
chr3 (75-260)||(14294114-14294300)
chr3 (75-255)||(14522594-14522775)
chr3 (73-254)||(15469754-15469931)
chr3 (73-258)||(16745457-16745639)
chr3 (72-255)||(14297188-14297372)
chr3 (72-255)||(14302815-14302999)
chr3 (72-255)||(53899807-53899989)
chr3 (75-260)||(11198859-11199045)
chr3 (75-260)||(14299741-14299927)
chr3 (124-262)||(30205137-30205274)
chr3 (73-258)||(44228115-44228299)
chr3 (73-258)||(15574730-15574913)
chr3 (73-258)||(15613749-15613932)
chr3 (78-250)||(23491202-23491373)
chr3 (73-255)||(11062322-11062504)
chr3 (73-258)||(12265776-12265960)
chr3 (75-262)||(17523699-17523884)
chr3 (73-255)||(12351130-12351312)
chr3 (75-255)||(40938421-40938602)
chr3 (73-218)||(47786169-47786314)
chr3 (73-255)||(5227406-5227584)
chr3 (115-255)||(10737247-10737386)
chr3 (160-258)||(14846034-14846131)
chr3 (79-255)||(45859709-45859884)
chr3 (87-255)||(55315085-55315252)
chr3 (73-252)||(12562763-12562944)
chr3 (77-258)||(15939748-15939930)
chr3 (74-195)||(16935168-16935286)
chr3 (159-258)||(8305693-8305790)
chr3 (160-258)||(18905171-18905267)
chr3 (87-255)||(41268931-41269098)
chr3 (118-255)||(13976964-13977101)
chr3 (73-167)||(12031269-12031364)
chr3 (64-122)||(9303744-9303802)
chr3 (118-255)||(13956132-13956269)
chr3 (159-255)||(17138157-17138253)
chr3 (163-255)||(12951743-12951835)
chr3 (158-218)||(15874893-15874953)
chr3 (23-73)||(9303679-9303729)
chr3 (158-218)||(11330382-11330442)
chr3 (23-71)||(18892826-18892874)
chr3 (160-255)||(15516426-15516521)
chr3 (23-80)||(18738667-18738723)
chr3 (160-229)||(38812367-38812436)
chr3 (157-229)||(12490105-12490177)
chr3 (212-260)||(14287780-14287828)
chr3 (73-109)||(17937333-17937369)
chr3 (23-71)||(18889599-18889647)
chr3 (23-71)||(23174546-23174594)
chr3 (167-255)||(39654607-39654695)
chr3 (165-255)||(11883645-11883735)
chr3 (73-135)||(18897983-18898045)
chr3 (225-258)||(11813553-11813586)
chr3 (23-71)||(54039827-54039875)
chr3 (157-218)||(14060614-14060675)
chr3 (85-122)||(16260014-16260051)
chr3 (158-230)||(55442145-55442218)
chr3 (227-255)||(47786311-47786339)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (73-255)||(8125-8307)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (73-262)||(6232-6421)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (73-262)||(15152-15338)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (73-258)||(28574-28758)
scaffold0116 (73-122)||(28857-28906)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (77-252)||(686-861)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (77-262)||(256199-256384)
scaffold0011 (77-247)||(262805-262975)
scaffold0011 (73-258)||(124579-124762)
scaffold0011 (73-258)||(193303-193486)
scaffold0011 (73-258)||(75980-76163)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (73-262)||(95006-95195)
scaffold0044 (91-255)||(66745-66907)
scaffold0044 (73-122)||(95294-95343)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (73-258)||(78241-78426)
scaffold0034 (73-255)||(38903-39086)
scaffold0034 (73-232)||(44513-44673)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (73-258)||(109369-109553)
scaffold0032 (98-255)||(54330-54486)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (73-262)||(38619-38807)
scaffold0078 (73-255)||(40184-40365)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (75-262)||(26014-26200)
scaffold0037 (73-262)||(70684-70873)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (73-262)||(2127-2317)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (73-262)||(6647-6837)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (73-255)||(21351-21533)
scaffold0008 (91-255)||(129504-129668)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (73-262)||(13028-13217)
scaffold0359 (73-111)||(161-199)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (74-262)||(36891998-36892185)
chr2 (73-258)||(5889583-5889765)
chr2 (73-258)||(34822886-34823069)
chr2 (73-258)||(3800399-3800581)
chr2 (73-258)||(21275813-21275995)
chr2 (73-255)||(25600652-25600834)
chr2 (73-258)||(12726741-12726924)
chr2 (75-256)||(24966987-24967168)
chr2 (72-255)||(4449516-4449698)
chr2 (73-258)||(8942334-8942519)
chr2 (73-255)||(8886832-8887013)
chr2 (73-254)||(19888066-19888243)
chr2 (73-254)||(21140569-21140746)
chr2 (73-258)||(461426-461609)
chr2 (73-255)||(12643311-12643491)
chr2 (73-255)||(22862179-22862360)
chr2 (73-258)||(14907724-14907907)
chr2 (73-258)||(20013810-20013993)
chr2 (73-258)||(23818867-23819050)
chr2 (73-254)||(43644262-43644442)
chr2 (73-258)||(12637451-12637633)
chr2 (73-255)||(22273577-22273758)
chr2 (73-236)||(25877236-25877399)
chr2 (73-258)||(11232540-11232720)
chr2 (73-258)||(22514387-22514567)
chr2 (73-258)||(23773225-23773406)
chr2 (73-258)||(24686955-24687136)
chr2 (73-254)||(24827855-24828034)
chr2 (73-255)||(15632088-15632269)
chr2 (73-258)||(28776988-28777168)
chr2 (73-258)||(20628684-20628864)
chr2 (73-255)||(22282810-22282991)
chr2 (73-260)||(7320174-7320362)
chr2 (73-255)||(6878134-6878316)
chr2 (152-262)||(22691316-22691426)
chr2 (152-262)||(22695963-22696073)
chr2 (114-255)||(27260274-27260415)
chr2 (73-255)||(22581219-22581402)
chr2 (74-260)||(24572678-24572865)
chr2 (73-260)||(28972727-28972913)
chr2 (152-255)||(269878-269981)
chr2 (98-255)||(9654140-9654296)
chr2 (87-255)||(17397894-17398061)
chr2 (160-255)||(721162-721257)
chr2 (157-230)||(23822894-23822967)
chr2 (157-230)||(23824838-23824911)
chr2 (157-230)||(23831973-23832046)
chr2 (157-255)||(22787408-22787506)
chr2 (157-218)||(19670515-19670576)
chr2 (79-172)||(22693040-22693133)
chr2 (79-172)||(22697687-22697780)
chr2 (25-73)||(42179645-42179693)
chr2 (208-258)||(22692978-22693028)
chr2 (208-258)||(22697625-22697675)
chr2 (160-218)||(24088752-24088810)
chr2 (157-230)||(4663-4735)
chr2 (157-230)||(24295958-24296031)
chr2 (157-218)||(19658678-19658739)
chr2 (23-73)||(32464816-32464866)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (73-254)||(155643-155821)
scaffold0023 (73-258)||(733-914)
scaffold0023 (116-258)||(35023-35163)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (75-262)||(87127-87311)
scaffold0021 (73-262)||(138099-138286)
scaffold0021 (73-261)||(10351-10540)
scaffold0021 (207-262)||(77069-77124)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (75-255)||(71741-71921)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (73-262)||(14364-14554)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (73-258)||(18865-19050)
scaffold0234 (73-122)||(18718-18767)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (73-262)||(32268-32457)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (73-258)||(90172-90353)
scaffold0028 (73-258)||(129075-129257)
scaffold0028 (157-218)||(78410-78471)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (73-255)||(1057-1238)
scaffold0383 (73-255)||(5926-6105)
scaffold0383 (73-122)||(1336-1385)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (73-255)||(8771-8953)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (73-258)||(4530-4715)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (73-258)||(2864-3045)
scaffold0124 (79-255)||(22997-23168)
scaffold0124 (23-71)||(36556-36604)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (73-258)||(27800-27983)
scaffold0162 (23-80)||(9337-9394)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (57-255)||(40291-40489)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (73-255)||(17340-17521)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (73-255)||(145223-145404)
scaffold0025 (73-255)||(147482-147664)
scaffold0025 (73-122)||(145502-145551)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (75-258)||(2980-3163)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (73-255)||(7941-8123)
scaffold0195 (73-255)||(13330-13512)
scaffold0195 (73-255)||(18000-18181)
scaffold0195 (73-255)||(20084-20265)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (73-254)||(5874-6051)
scaffold0003 (73-255)||(217036-217218)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (73-258)||(1873-2056)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (73-257)||(69456-69640)
scaffold0031 (78-255)||(30768-30946)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (73-248)||(2419-2593)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (73-255)||(12891-13073)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (73-258)||(244-429)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (73-255)||(32479-32660)
scaffold0184 (151-262)||(34037-34147)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (73-258)||(30041-30222)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (73-255)||(52562-52743)
scaffold0018 (73-255)||(56514-56695)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (73-258)||(6437-6620)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (73-258)||(25591-25774)
scaffold0141 (73-258)||(21336-21519)
[»] scaffold0138 (8 HSPs)
scaffold0138 (86-258)||(14565-14735)
scaffold0138 (73-182)||(28261-28372)
scaffold0138 (73-182)||(40257-40368)
scaffold0138 (23-80)||(28191-28248)
scaffold0138 (23-80)||(40187-40244)
scaffold0138 (157-218)||(23801-23862)
scaffold0138 (73-122)||(28472-28521)
scaffold0138 (68-122)||(40468-40522)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (73-258)||(37977-38157)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (73-255)||(248827-249008)
scaffold0012 (23-71)||(223334-223382)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (78-247)||(5902-6069)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (75-255)||(7485-7666)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (76-255)||(1916-2095)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (73-255)||(41399-41581)
scaffold0132 (23-80)||(12675-12732)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (73-255)||(154-335)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (73-255)||(11213-11394)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (73-255)||(3352-3534)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (73-255)||(3318-3497)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (73-255)||(27714-27896)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (73-255)||(46819-47000)
scaffold0068 (73-255)||(60267-60448)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (79-258)||(106689-106867)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (79-258)||(16132-16311)
scaffold0396 (73-252)||(13481-13660)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (79-258)||(6441-6620)
scaffold0022 (157-230)||(106297-106370)
scaffold0022 (152-255)||(108343-108446)
scaffold0022 (73-111)||(113845-113883)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (73-255)||(270813-270996)
scaffold0009 (73-255)||(236874-237056)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (79-258)||(51719-51897)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (73-255)||(11323-11504)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (73-182)||(20583-20692)
scaffold0039 (228-258)||(20686-20716)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (107-254)||(4823-4970)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (91-255)||(7673-7837)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (73-258)||(17378-17561)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (130-247)||(58899-59016)
scaffold0051 (87-134)||(59375-59422)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (79-255)||(6634-6805)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (91-255)||(4902-5067)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (27-122)||(53279-53376)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (79-258)||(1078-1263)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (145-255)||(771-880)
scaffold0269 (145-255)||(15027-15136)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (73-260)||(6570-6767)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (73-192)||(29942-30062)
scaffold0120 (186-262)||(27260-27336)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (151-258)||(9291-9397)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (73-242)||(5700-5866)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (172-258)||(14987-15073)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (128-255)||(4092-4218)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (128-255)||(48932-49058)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (141-255)||(4534-4648)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (79-260)||(145616-145794)
[»] scaffold0150 (4 HSPs)
scaffold0150 (157-255)||(20391-20489)
scaffold0150 (157-255)||(27220-27318)
scaffold0150 (73-128)||(20527-20583)
scaffold0150 (73-128)||(27356-27412)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (164-255)||(197482-197572)
[»] scaffold0244 (4 HSPs)
scaffold0244 (73-182)||(17687-17797)
scaffold0244 (23-80)||(24229-24286)
scaffold0244 (73-182)||(24106-24216)
scaffold0244 (27-80)||(17814-17867)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (114-250)||(4469-4603)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (75-182)||(34334-34442)
scaffold0125 (23-80)||(34264-34321)
[»] scaffold0808 (2 HSPs)
scaffold0808 (157-260)||(2839-2942)
scaffold0808 (73-111)||(2745-2783)
[»] scaffold0092 (2 HSPs)
scaffold0092 (157-252)||(2114-2209)
scaffold0092 (73-116)||(2260-2303)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (157-230)||(4728-4801)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (73-122)||(23898-23947)
scaffold0158 (23-71)||(23741-23789)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (157-230)||(7041-7114)
[»] scaffold1734 (2 HSPs)
scaffold1734 (73-122)||(164-213)
scaffold1734 (73-135)||(1-64)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (158-255)||(7290-7387)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (157-230)||(71655-71728)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (157-229)||(3667-3739)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (219-258)||(991-1030)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (160-255)||(6021-6116)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (23-73)||(2039-2089)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (75-117)||(3082-3124)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (157-218)||(4759-4820)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (157-229)||(117977-118049)
scaffold0016 (23-70)||(167476-167523)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (157-207)||(12936-12986)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (23-71)||(1394-1442)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (158-217)||(78206-78265)
[»] scaffold1752 (1 HSPs)
scaffold1752 (73-111)||(429-467)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (160-218)||(34203-34261)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (79-143)||(2696-2761)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 75 - 262
Target Start/End: Original strand, 21652690 - 21652877
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21652690 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgaacatgttttcttgataatgcaaat 21652789  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21652790 gttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 21652877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11582749 - 11582564
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11582749 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 11582650  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582649 atgttgtggagataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 11582564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21393063 - 21392874
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21393063 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 21392964  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21392963 atgttgtggagataatcaatataattgggttttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatggagtccttgtac 21392874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 1169947 - 1170129
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  1169947 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 1170046  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1170047 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattttggattgttgtcgcgttatcgagtc 1170129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20711011 - 20710823
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||| |    
T  20711011 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcga 20710913  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20710912 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 20710823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28258476 - 28258286
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacatt-gttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28258476 tgatgttgaatgacatttgttgattaatgataatcatgattgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 28258377  T
Q  171 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28258376 aa-tgttgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtcgtcgcattatcgagtccttgtac 28258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 258
Target Start/End: Original strand, 17473177 - 17473360
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17473177 atgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtataagcatgttttcttgataatgcaaat 17473276  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17473277 gttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 17473360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 1221137 - 1221319
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  1221137 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 1221233  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1221234 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaagttgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 1221319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 22367890 - 22368072
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  22367890 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 22367986  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22367987 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22368072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7424550 - 7424367
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  7424550 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 7424452  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7424451 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 7424367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11341509 - 11341326
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11341509 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc-a 11341411  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11341410 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattattgagtcctt 11341326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 21074895 - 21075077
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21074895 tgatgttgaacgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 21074992  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21074993 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 21075077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 4201371 - 4201554
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  4201371 tgatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 4201469  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4201470 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 4201554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 255
Target Start/End: Original strand, 24184498 - 24184681
Alignment:
Q  72 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  24184498 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattccatgatttggttgtgtatggacatgttttcttgataatgca 24184597  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24184598 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgtattgttgtcgcattatcgagtc 24184681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23513671 - 23513486
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  23513671 tgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgattactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgca 23513572  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23513571 a-tgttgtggatataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 23513486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 25192402 - 25192586
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25192402 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 25192501  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25192502 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgttgtcgcattatcgagtcctt 25192586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11221 - 11044
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  11221 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 11125  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11124 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 11044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 9732072 - 9732252
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |    
T  9732072 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-a 9732170  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9732171 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 9732252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16535180 - 16534999
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16535180 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttgattgtatatgggcatgttttcttgataatgcaa 16535081  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16535080 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcaagtc 16534999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 22884586 - 22884771
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22884586 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 22884685  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22884686 a-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22884771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Original strand, 29192026 - 29192203
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  29192026 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 29192122  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29192123 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 29192203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 110388 - 110572
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  110388 tgatgttggatgacattgttgattattaataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 110486  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  110487 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctgtatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 110572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 10779585 - 10779767
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  10779585 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatattatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 10779681  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10779682 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttatcatatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 10779767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 43445158 - 43445342
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43445158 tgatgttgaatatcattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatga-ttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 43445256  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43445257 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 43445342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 21234811 - 21234994
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21234811 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 21234909  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21234910 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 21234994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4864142 - 4863961
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4864142 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 4864043  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4864042 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattattgagt 4863961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 18779399 - 18779583
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  18779399 tgatgttgaatgacattgttgattatcgataatcatgattgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataatgc- 18779497  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18779498 aatgttgtggagataatcaatataattggttgtcgtcatatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18779583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23327824 - 23327643
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||  ||||||||||||||||||| |    
T  23327824 tgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtggacatgttttcttgataatgc-a 23327728  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23327727 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 23327643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24595372 - 24595191
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  24595372 tgattttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 24595276  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24595275 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 24595191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25425492 - 25425312
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||||||||| |    
T  25425492 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatgc-a 25425397  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25425396 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 25425312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20615476 - 20615305
Alignment:
Q  82 atgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgg 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20615476 atgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtgg 20615378  T
Q  182 aaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20615377 agataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20615305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21649704 - 21649523
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21649704 tgatgttgaatgacatcgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaa 21649605  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21649604 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttatcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 21649523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37051857 - 37051677
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  37051857 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattacgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 37051759  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37051758 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37051677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23510849 - 23510676
Alignment:
Q  86 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| |||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  23510849 cattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgcatgtgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagat 23510753  T
Q  186 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23510752 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtagaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 23510676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Original strand, 35792544 - 35792719
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 178  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35792544 tgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaaatgatg 35792643  T
Q  179 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35792644 tggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 35792719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19498659 - 19498490
Alignment:
Q  84 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  19498659 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatgc-aatgttgtggag 19498564  T
Q  184 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19498563 atgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 19498490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 21933568 - 21933748
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21933568 tgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 21933664  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21933665 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 21933748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 21939738 - 21939918
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21939738 tgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 21939834  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21939835 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 21939918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35581124 - 35580944
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  35581124 tgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 35581028  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35581027 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 35580944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 37010572 - 37010752
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  37010572 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgacgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 37010668  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37010669 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 37010752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19404456 - 19404268
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  19404456 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 19404357  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    ||||| ||||| || | ||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19404356 aatgtggtggagatgaacaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgt 19404268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 27185119 - 27185301
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  27185119 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgaagatgaatgctatgatttaattgtgtatagacatgttttcttgataatgca 27185218  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27185219 aatgttgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggtgagaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 27185301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 262
Target Start/End: Original strand, 11338154 - 11338341
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||| ||  ||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11338154 atgttgaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttatgatttgattatgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 11338253  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||||||| || |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11338254 tgttgtggagatgatcaatatatatggaa-ttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgtac 11338341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23453826 - 23453638
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  23453826 tgattttgaatgacattgttggtttttgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 23453727  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23453726 aatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtccttgt 23453638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23465331 - 23465143
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  23465331 tgattttgaatgacattgttggtttttgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 23465232  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23465231 aatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtccttgt 23465143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 25901731 - 25901911
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||  |||||| |    
T  25901731 tgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttagtaatgc-a 25901829  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25901830 atgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 25901911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 250
Target Start/End: Original strand, 11213008 - 11213183
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || ||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  11213008 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatctaattgtgtgcgggcatgttttcttgataatgcaa 11213107  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 250  Q
    ||| ||| |  || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11213108 atgatgttgtgatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtgttgaaaattgt-gattg-tgtcgcattatc 11213183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27008867 - 27008705
Alignment:
Q  91 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 190  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| |||  ||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  27008867 ttgattgttgataatcaaattgttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtatatgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtggtggagataatca 27008769  T
Q  191 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27008768 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 27008705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24474443 - 24474367
Alignment:
Q  98 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24474443 ttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaat 24474367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7727369 - 7727296
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  7727369 tttcttgataatgcaaatgttatggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 7727296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3672780 - 3672685
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || | |||||||||||||||    
T  3672780 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatacttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgatgtgatatcgcattatcgagtc 3672685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 2030762 - 2030712
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat 73  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2030762 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatat 2030712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Original strand, 1169799 - 1169848
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1169799 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 1169848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Original strand, 17473026 - 17473075
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17473026 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 17473075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23492794 - 23492722
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23492794 tttcttgataatg-aaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23492722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 32967547 - 32967608
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  32967547 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 32967608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 34938372 - 34938324
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34938372 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatat 34938324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Original strand, 37189501 - 37189561
Alignment:
Q  158 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  37189501 ttcttgatgatgcaaatgttgtggaaatgatcaatatatttggaggttgtcctttatattg 37189561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 122
Target Start/End: Original strand, 43445013 - 43445060
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43445013 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 43445060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24471049 - 24470996
Alignment:
Q  201 atgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24471049 atgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 24470996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 431221 - 431149
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| | |||||  |||||||||    
T  431221 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttgtattgttgtgaaaatt 431149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25003798 - 25003750
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25003798 ggtgaatccatatacattgtttgttatgatatggtgggtgaatatatat 25003750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28888709 - 28888649
Alignment:
Q  158 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  28888709 ttcttgataatgcaaatgtagtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 28888649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 29191427 - 29191475
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29191427 ggtgaatccatatatattgtttattatgatatggtgggtgaatatatat 29191475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 255
Target Start/End: Original strand, 5452190 - 5452285
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||||| |||| |||| || ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  5452190 cttggtaatgcaattgttctggagatgatcaatatgtttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 5452285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21615804 - 21615735
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  21615804 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 21615735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 24226842 - 24226911
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  24226842 cttgataatgcaattgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtcgtgaaaatt 24226911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 23112311 - 23112359
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23112311 ggtgaatacatctacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatat 23112359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19861025 - 19860967
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19861025 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19860967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 122
Target Start/End: Original strand, 35792419 - 35792456
Alignment:
Q  85 acattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35792419 acattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 35792456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18431511 - 18431322
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18431511 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 18431412  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431411 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 18431322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 18004259 - 18004448
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  18004259 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 18004358  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004359 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 18004448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 25646113 - 25646302
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25646113 tgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgtttccttgataatgcaa 25646212  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25646213 atgttgtggagataatcaataaaattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcaagtccttgtac 25646302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 35016967 - 35017152
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35016967 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 35017066  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35017067 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 35017152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 15736467 - 15736656
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15736467 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 15736566  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15736567 atgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggtcgcattatcgagtccgtgtac 15736656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18569464 - 18569280
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18569464 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 18569365  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18569364 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 18569280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 27655373 - 27655555
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27655373 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 27655470  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27655471 -tgttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 27655555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31627316 - 31627134
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  31627316 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtggtgatgaatactatgatttgtttgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 31627217  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31627216 atgttgtggagatgatcaatataattggggattgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattggtgtcgcattatcgagtc 31627134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32897601 - 32897419
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  32897601 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgtgatgatgaataccatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgtaa 32897502  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32897501 atgttgtggagatgatcaataaaattgagagttgtcctatatattgtggtgaaaattgggaattgttgtcgcattatcgagtc 32897419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 16827162 - 16827346
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  16827162 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatacaa 16827261  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16827262 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 16827346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 258
Target Start/End: Original strand, 18088003 - 18088182
Alignment:
Q  78 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18088003 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgtt 18088101  T
Q  178 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18088102 gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgttgcattatcgagtcctt 18088182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11215014 - 11214836
Alignment:
Q  76 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  11215014 tgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa-t 11214916  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11214915 gttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatagagt 11214836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16230458 - 16230278
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |    
T  16230458 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-a 16230360  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16230359 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 16230278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23976445 - 23976263
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||    
T  23976445 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgctgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgtttgcttgataatgcaa 23976348  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23976347 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgccgcattatcgagtcctt 23976263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 33315868 - 33316050
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  33315868 tgatgttgcatgacatggttgattattgataatcatgtggatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 33315965  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33315966 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 33316050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16105437 - 16105254
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16105437 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgattgatgtgtggtgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 16105338  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16105337 aatgatgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttgtcgcgttatcgagtc 16105254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4989773 - 4989591
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  4989773 tgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 4989676  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4989675 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgttaattgttgtcgcattatcgagtcctt 4989591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25174430 - 25174253
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  25174430 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 25174334  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25174333 atgttgtggagataatcaatataattgagtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 25174253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 262
Target Start/End: Original strand, 13622401 - 13622589
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgtttt-cttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  13622401 atgttgaatgatgttgttgattagtaataatcatgataatgtgtggtgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgtttttcttgataatgcaaa 13622500  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  13622501 tgttgtggagataatcaatataattgggagttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggttgcattatcgagtccgtgtac 13622589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16239243 - 16239057
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  16239243 tgatgttgaatgacattattgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatacgatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgca 16239144  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga-ttgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16239143 a-tgttgtggagataatcaatataatttggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggatttgttgtcgcattatcgagtcctt 16239057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 1658997 - 1659182
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1658997 tgatgttgaataacattgttgattattgatgaccatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 1659096  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1659097 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcacattatcgagtcctt 1659182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10487753 - 10487573
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  10487753 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 10487657  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10487656 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 10487573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 16377574 - 16377754
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  16377574 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 16377670  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16377671 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 16377754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 16384898 - 16385078
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  16384898 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 16384994  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16384995 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 16385078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23152137 - 23151956
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23152137 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgaggatgaatactatgattcaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgcaa 23152038  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23152037 atgatgtggagatgaacagtataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattattgtcgcattatcgagtc 23151956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 14627896 - 14628079
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||  || ||| ||||| |||||||| |||| |||||| |    
T  14627896 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgttatgatgtaattgtgtatgggcatgtttccttggtaatgc-a 14627994  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14627995 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtcctt 14628079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18776086 - 18775907
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  18776086 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 18775989  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18775988 atgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18775907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 19984491 - 19984671
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19984491 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaa 19984590  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  19984591 atgatgtggaaatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgaattatctagtc 19984671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18129129 - 18128981
Alignment:
Q  106 catgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||    
T  18129129 catgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgtttccttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgtt 18129030  T
Q  206 gtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18129029 gtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18128981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Original strand, 17343578 - 17343754
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 178  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17343578 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgtttgcttgataatgcaa-tgttg 17343674  T
Q  179 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17343675 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgtattgttgtcgcattatcgagtcctt 17343754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15861593 - 15861425
Alignment:
Q  85 acattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 183  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  15861593 acattgttgattgttgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgagcatgtttccttgataatgcaa-tgttgtggag 15861495  T
Q  184 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15861494 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-aaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 15861425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 13016072 - 13016260
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13016072 tgatgttgagtgacatttgttgatt-ttgagaatcatgttgacatgagatgatgaatactatgaattaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 13016170  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13016171 a-tgttgtggaggtaatcaatataattggatatagacctatatattgaggtgaaaattatggattgtagtcgcattatcgagtccttgtac 13016260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 16557302 - 16557483
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  16557302 tgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 16557398  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16557399 atgttgtggagataatcaatatacttgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcctt 16557483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 16650532 - 16650713
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  16650532 tgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 16650628  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16650629 atgttgtggagataatcaatatacttgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcctt 16650713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 29870761 - 29870943
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  29870761 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 29870857  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29870858 atgttgtggagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 29870943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26088712 - 26088532
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||| ||||||| |||||| |    
T  26088712 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgctttcttggtaatgc-a 26088614  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||| |||||||||||||    
T  26088613 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgttgcattatcgagtc 26088532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18397803 - 18397622
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| || ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  18397803 atgttgaatgacattgttgagtattgatgatcatattgatgtggtgatgatgagtattatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgaaaa 18397704  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18397703 tgttgtggggataatcaatataattgggagttgccctatatattgtggtgaaaattgtagattgttgtcgcattatcgagtc 18397622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Original strand, 18825047 - 18825225
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  18825047 tgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatg-tttcttgataatgc-a 18825144  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    ||| |||||| || |  ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18825145 atgatgtggagatgaataatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgttgtcgcattatcgagt 18825225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Original strand, 18843107 - 18843286
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18843107 tgatgttgaataaaattgttgatttttgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc-a 18843205  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    ||| |||||| || | || ||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  18843206 atgatgtggagatgaacattataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgtcgtcgcattatcgagt 18843286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23994032 - 23993858
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 178  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23994032 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttg 23993934  T
Q  179 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23993933 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 23993858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 1651237 - 1651420
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  || ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |    
T  1651237 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatataattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-a 1651335  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1651336 atgttgtggagatgatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 1651420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22431126 - 22430944
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  22431126 tgatgtagaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgca 22431027  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22431026 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtttaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22430944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1554703 - 1554536
Alignment:
Q  87 attgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  1554703 attgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgatgcggagat 1554604  T
Q  186 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1554603 gaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 1554536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 217
Target Start/End: Original strand, 25745618 - 25745763
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  25745618 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 25745717  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatatt 217  Q
    |||| |||| | || | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25745718 aatgatgtgtagatgaacaatataattgggtgttgtcctatttatt 25745763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19609310 - 19609191
Alignment:
Q  137 ttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 236  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||    
T  19609310 ttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaatt 19609213  T
Q  237 gttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19609212 gttgtcgcattatcgagtcctt 19609191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 22226927 - 22227111
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||| |||| ||| ||||||| || ||   |||||| |||| ||||||||    
T  22226927 tgatgttggatgacattgttgattactgataaatatgttgacgtgtgatgatgagtactttgatttatttgtgtgtggatatgtttccttggtaatgcaa 22227026  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22227027 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattttcgagtcctt 22227111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16084215 - 16084112
Alignment:
Q  152 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16084215 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttttcgcattatcg 16084116  T
Q  252 agtc 255  Q
    ||||    
T  16084115 agtc 16084112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 260
Target Start/End: Original strand, 28196147 - 28196255
Alignment:
Q  152 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 251  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28196147 catgatttcttgataatgcaattggtgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggagtgttgtcgcattatcg 28196246  T
Q  252 agtccttgt 260  Q
    |||| ||||    
T  28196247 agtctttgt 28196255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22867031 - 22866864
Alignment:
Q  89 tgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 187  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||  ||| | ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22867031 tgttgatttttgataatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatcatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatga 22866932  T
Q  188 tcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||    
T  22866931 tcaatttatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatttcgcattattgagtc 22866864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Original strand, 25368728 - 25368827
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa-ttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  25368728 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatttgtggagtgatgtcgcattatcgagtc 25368827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1554875 - 1554817
Alignment:
Q  64 atatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1554875 atatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 1554817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15739043 - 15738945
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  15739043 tttcttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtaaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 15738945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 1554947 - 1554886
Alignment:
Q  12 gtgattatttgggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat 73  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1554947 gtgatgattttggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatat 1554886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16084959 - 16084882
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| || ||| ||| |||||    
T  16084959 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgattgatgtgtggtgatgaatactacgatttaattgtgtatg 16084882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 222043 - 221995
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  222043 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatat 221995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18741203 - 18741146
Alignment:
Q  197 ttggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18741203 ttgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18741146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 16889122 - 16889183
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16889122 tttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 16889183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33323605 - 33323532
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  33323605 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 33323532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 35137326 - 35137399
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  35137326 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 35137399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 14627293 - 14627341
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627293 ggtgaatccatatatattgtttattatgatatggtgggtgaatatatat 14627341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 27739933 - 27739885
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27739933 ggtgaatccatatacattgtttattataatatggtgggtgaatatatat 27739885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 35010557 - 35010605
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35010557 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgagtgaatatatat 35010605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22846923 - 22846867
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat 216  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  22846923 cttgataattcaattgttgtggagataatcaatatatttggaagttatcctttatat 22846867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 73 - 306
Target Start/End: Original strand, 821398 - 821646
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  821398 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 821497  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgg---------------attgttgtcgcattatcgagtcct 257  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||    
T  821498 atgttgtgaagataatcaatataattggatgttgtcgtatatattgaggtgaaaattgtggaggtgaaaattatgaattgttgtcgcattatcgagtcct 821597  T
Q  258 tgtacgagtcctttattatannnnnnnggtaattcaatagccttattat 306  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  821598 tgtacgagtcctttattatctttttttggtaattcaatagccttattat 821646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33739137 - 33738948
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  33739137 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgaaggtgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 33739038  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33739037 atgttttggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 33738948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 12901058 - 12901240
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12901058 tgatgtttaatgatattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatgctatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 12901157  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901158 atgatgtggagatgatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 12901240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44054794 - 44054612
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44054794 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 44054695  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44054694 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgggaattgttgtcgcattatcgagtc 44054612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 53909056 - 53909238
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  53909056 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 53909155  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909156 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctgtatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 53909238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 53706079 - 53706261
Alignment:
Q  76 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53706079 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatg 53706178  T
Q  176 ttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  53706179 ttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattattattgcattatcgagtcctt 53706261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44345700 - 44345510
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  44345700 tgatgttgaatgacattgttgattattaataatcatgttaatgtggtgaagatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgatttcttgataatgca 44345601  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44345600 aatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcccatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 44345510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16521660 - 16521479
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16521660 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatagtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 16521561  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16521560 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16521479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19999397 - 19999215
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||    
T  19999397 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgtttgcttgataatgcaa 19999300  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19999299 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 19999215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 7133735 - 7133924
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  7133735 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgcgatggtgaatactatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 7133834  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7133835 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaaatgttgtcgcattatcgagtccttgtac 7133924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 262
Target Start/End: Original strand, 45460244 - 45460432
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  45460244 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatcttatgatttaattgtgtacggacatgttttcttgataatgcaaa 45460343  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45460344 tgttgtagagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgaattgtcgtcgcattattgagtccttgtac 45460432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 8873780 - 8873961
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8873780 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 8873879  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    || ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8873880 attttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 8873961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10643059 - 10642874
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10643059 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 10642960  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10642959 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 10642874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18167662 - 18167481
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  18167662 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 18167566  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18167565 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18167481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 15288296 - 15288479
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15288296 tgatgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 15288394  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15288395 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agtttgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15288479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 110352 - 110171
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  110352 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaa 110253  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  110252 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 110171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 15274046 - 15274226
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |    
T  15274046 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-a 15274144  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15274145 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 15274226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 21960854 - 21961036
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21960854 tgatgttaaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtggtgatgaatactatgatttatttgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 21960953  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || |||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21960954 atgatgtggagatgatcaatataatcaagagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgttgcattatcgagtc 21961036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9294395 - 9294212
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9294395 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc-a 9294297  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9294296 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 9294212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10487541 - 10487358
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10487541 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc-a 10487443  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10487442 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 10487358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 22355850 - 22356033
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22355850 tgatgttgaatgacattgttgaatattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 22355948  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22355949 atgttgtggagataaccaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaactgttgtcgcattatcgagtcctt 22356033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26338354 - 26338173
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  26338354 tgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 26338258  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26338257 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 26338173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13245322 - 13245139
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  13245322 tgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatgttgatttgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 13245224  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13245223 atg-tgtggagataatcaatataattgggtttcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13245139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 15295406 - 15295589
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  15295406 tgatgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgataggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgagaatgc-a 15295504  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15295505 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agtttgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15295589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 16329210 - 16329393
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16329210 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 16329308  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16329309 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 16329393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18247058 - 18246881
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  18247058 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 18246962  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  || |||||||||||||||||    
T  18246961 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgattttttgtcgcattatcgagt 18246881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47356198 - 47356013
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  47356198 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggaatgttttcttgataatgca 47356099  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47356098 a-taatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 47356013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14950890 - 14950707
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  14950890 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattttgtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 14950792  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14950791 atattgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 14950707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8373225 - 8373042
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8373225 tgatgttgaatgacattgttggttattgataatcatgttgcggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttctcttgataatgcaa 8373126  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 257  Q
    ||| |||| | || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8373125 atgatgtgaagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcct 8373042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14995067 - 14994888
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  14995067 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 14994970  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14994969 a-tgttgtggagataatctatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 14994888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 25120408 - 25120589
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25120408 tgatgttgaatgacattgacgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaa 25120507  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25120508 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 25120589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 104 - 258
Target Start/End: Original strand, 54119579 - 54119732
Alignment:
Q  104 atcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatg 203  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  54119579 atcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtg 54119677  T
Q  204 ttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54119678 ttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 54119732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 241
Target Start/End: Original strand, 30233831 - 30233998
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||  ||| | ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30233831 atgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgttgatgtggtgatgatgaatcttataatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 30233930  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgt 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30233931 tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatcgaggtgaaaattgtggattgttgt 30233998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34393926 - 34393744
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||    
T  34393926 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataaagca 34393827  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34393826 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 34393744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 5684188 - 5684370
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5684188 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 5684287  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5684288 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggacaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5684370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19019500 - 19019390
Alignment:
Q  12 gtgattatttgggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19019500 gtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 19019401  T
Q  112 aatgtgtgatg 122  Q
     |||| |||||    
T  19019400 gatgtatgatg 19019390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8373541 - 8373431
Alignment:
Q  12 gtgattatttgggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 111  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373541 gtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatattatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 8373442  T
Q  112 aatgtgtgatg 122  Q
     |||| |||||    
T  8373441 gatgtatgatg 8373431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15212214 - 15212032
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15212214 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgttatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgca 15212115  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15212114 aatgatgtgaagatgaacaatataatcggatgttgtcctatatattgtggataaaattgt-aattgttgtcgcattatcgagtc 15212032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Original strand, 18495695 - 18495880
Alignment:
Q  76 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18495695 tgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgggtatggacatgttttcttgataatgcaaat 18495794  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    |||||| | || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  18495795 gttgtgaagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggaaagatgtcgcattatcgagtctttgt 18495880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Original strand, 13049455 - 13049630
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 177  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13049455 tgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtt 13049553  T
Q  178 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13049554 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13049630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26678905 - 26678732
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||| | | ||| ||||| ||||||          ||||||    
T  26678905 tgatgttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatatcatgattaaattgtgtatgggcatgt----------atgcaa 26678816  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26678815 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 26678732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Original strand, 23271210 - 23271342
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||| |||||| |    
T  23271210 tgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttgttgtgcgatgatgaatactacgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgttaatgc-a 23271308  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttg 206  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||    
T  23271309 atgttgtgaagataattaatataattgaatgttg 23271342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 260
Target Start/End: Original strand, 13810995 - 13811103
Alignment:
Q  152 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 251  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  13810995 catgatttcttgataatggaattgttgtggaaataatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtaatgtcgcattatcg 13811094  T
Q  252 agtccttgt 260  Q
    |||| ||||    
T  13811095 agtctttgt 13811103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 262
Target Start/End: Original strand, 13751694 - 13751769
Alignment:
Q  187 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13751694 atcaatataattgggagttgtgttatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 13751769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Original strand, 43282757 - 43282855
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  43282757 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 43282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Original strand, 52266840 - 52266938
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  52266840 tttcttgataatgcaattgttgtagagatgatcaatatatttggaagttatcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 52266938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 205
Target Start/End: Original strand, 18294453 - 18294580
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||      |||||| |||||  ||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  18294453 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtg-----gtgatgatgaatgttatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 18294547  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgtt 205  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||    
T  18294548 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgtt 18294580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8044131 - 8044021
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  8044131 tgatgttgaataacattgttgattgtttatgatcatgttgaggtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 8044032  T
Q  172 aatgttgtgga 182  Q
    |||| ||||||    
T  8044031 aatgatgtgga 8044021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 8044008 - 8043951
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 80  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8044008 ggtgaatccatatacattgtttattatgatgtggtgggtgaatatatatatgatgttg 8043951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 122
Target Start/End: Original strand, 18294300 - 18294354
Alignment:
Q  68 atatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18294300 atatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18294354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Original strand, 5684039 - 5684088
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5684039 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatttttatgtgtgatg 5684088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 15852696 - 15852769
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15852696 tttcttgataatgcaaatgttgtagagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 15852769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15043721 - 15043631
Alignment:
Q  165 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  15043721 taatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 15043631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 255
Target Start/End: Original strand, 15110703 - 15110793
Alignment:
Q  165 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  15110703 taatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 15110793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 47356343 - 47356297
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  47356343 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgat 47356297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Original strand, 55377977 - 55378027
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat 73  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55377977 ggtggatccatatacattatttattatgatatggtgggtgaatatatatat 55378027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27959820 - 27959759
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27959820 tttcttgataatgcaaacgtagtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 27959759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 34197544 - 34197605
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  34197544 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaccaatatatttggaagttgtcctttatattg 34197605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 34394069 - 34394020
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  34394069 tgattttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 34394020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Original strand, 37958436 - 37958489
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  37958436 tttcttgataatgcaaatgttgtagagatgatcaatatatttggaagttgtcct 37958489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 41167314 - 41167375
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||||| | |||||||    
T  41167314 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcatttatattg 41167375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22737530 - 22737482
Alignment:
Q  25 tgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat 73  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22737530 tgaaaccatatacgttgtttattatgatatggtgggtgaatatatatat 22737482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 122
Target Start/End: Original strand, 18110001 - 18110038
Alignment:
Q  85 acattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18110001 acattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18110038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 41257728 - 41257797
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    ||||||||||||| ||| || || || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||    
T  41257728 cttgataatgcaattgtggttgagatgatcaatataattggaagttatcctttatattgttgtgaaaatt 41257797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 14911020 - 14910972
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14911020 ggtgtatcgatatacattgtttattatgatttggtgggtgaatatatat 14910972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 22407487 - 22407676
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22407487 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtatgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 22407586  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22407587 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatccagtccttgtac 22407676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 49966520 - 49966331
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  49966520 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtttatggacatgttttcttgataatgcaa 49966421  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49966420 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 49966331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 2422263 - 2422445
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2422263 tgatgttgaatgacattgtcgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 2422362  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2422363 atgtggtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaagttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 2422445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18506227 - 18506043
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||| ||||||||||||||| |    
T  18506227 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttacttgtgtgtgggcat-ttttcttgataatgcta 18506129  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18506128 atgttgcggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18506043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 77 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41210913 - 41210732
Alignment:
Q  77 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 176  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41210913 gttgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggccatgttttcttgataatgcaaatgt 41210814  T
Q  177 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41210813 tgtggagataatcaatataattaggtgttgtcctatatattaaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 41210732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 255
Target Start/End: Original strand, 35523712 - 35523894
Alignment:
Q  72 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35523712 atgatgttgggtgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgcgtatggacatgttttcttgataatgca 35523810  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35523811 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 35523894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 20826516 - 20826696
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |    
T  20826516 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-a 20826614  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20826615 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 20826696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 44036192 - 44036373
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44036192 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgcaa 44036291  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44036292 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatacattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 44036373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 15862725 - 15862908
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  15862725 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtgtgggcatgtttccttgataatgc-a 15862823  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15862824 atgttgtggagatattcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 15862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22034716 - 22034535
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  22034716 tgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 22034620  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22034619 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22034535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 22250245 - 22250430
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22250245 tgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatttaattgtgtatgaacatgttttcttgataatgca 22250344  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22250345 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtagtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 22250430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 37845758 - 37845939
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37845758 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaa 37845857  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37845858 atgatgtggaggtaaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37845939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Original strand, 20894991 - 20895169
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20894991 tgaatgatattgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgatgatgaatactattatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttg 20895089  T
Q  179 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20895090 tggagataatcaatataattgtgtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtggcattatcgagtcctt 20895169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21858427 - 21858246
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21858427 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaa 21858328  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21858327 atgatgtggaggtaaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 21858246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22352999 - 22352814
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22352999 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtaatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 22352900  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22352899 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgttgtttgttgtcgcattatcgagtcctt 22352814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22365626 - 22365441
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22365626 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgataatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgaacatgttttcttgataatgca 22365527  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22365526 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgtattgttgtcgcattatcgagtcctt 22365441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17147651 - 17147468
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||| |    
T  17147651 tgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgc-a 17147553  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17147552 atg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 17147468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 7641887 - 7642068
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || | |||||||||||||||| | |    
T  7641887 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggtatgttttcttgataatac-a 7641983  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7641984 atgttgtggagatcatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 7642068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20444622 - 20444442
Alignment:
Q  68 atatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20444622 atatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataa 20444523  T
Q  168 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 249  Q
    |||||||  |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  20444522 tgcaaatcatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattat-gattgttgtcgcattat 20444442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20530387 - 20530207
Alignment:
Q  68 atatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20530387 atatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataa 20530288  T
Q  168 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 249  Q
    |||||||  |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  20530287 tgcaaatcatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattat-gattgttgtcgcattat 20530207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 21651229 - 21651412
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |    
T  21651229 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgcatgggcatgttgtcttgataatgc-a 21651327  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21651328 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcctt 21651412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 5675893 - 5676074
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |||  |||   |||||||||||||||||||||    
T  5675893 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgaaggtggatactatgaattgattgtatatagacatgttttcttgataatgcaa 5675992  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5675993 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5676074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 18060901 - 18061085
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||     
T  18060901 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgtttccttggtaatgc- 18060999  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18061000 aatgttgtggatataatcaatataattgggtgtagtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18061085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 51451482 - 51451299
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||| |||  |||| ||||||| |||||||||||| |    
T  51451482 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatgctatgatttaattgtttatgggcatgttctcttgataatgc-a 51451384  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51451383 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 51451299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21717074 - 21716895
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  21717074 tgatgttgaatgacattgttgatt---gataatcatgttgatatgtgatgatgaattctatgatttggttgtgtatggacatgtttttttgataatgcaa 21716978  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21716977 atgttgtggagatgagcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 21716895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35053711 - 35053532
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  35053711 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 35053614  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35053613 atgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattattgagtc 35053532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17003691 - 17003511
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17003691 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgggatgatgaattctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 17003595  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17003594 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 17003511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20253356 - 20253246
Alignment:
Q  12 gtgattatttgggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20253356 gtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 20253257  T
Q  112 aatgtgtgatg 122  Q
     |||| |||||    
T  20253256 gatgtatgatg 20253246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20526989 - 20526808
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||| |||||||||||| ||    
T  20526989 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgtcttcttgataatgtaa 20526890  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||  |||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20526889 atcatgtggagatgaacaatataactgggtggtgtcctatatattgtggagaaagttgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20526808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45050553 - 45050370
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |    
T  45050553 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-a 45050455  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45050454 atgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 45050370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22226846 - 22226667
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 177  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  22226846 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 22226748  T
Q  178 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22226747 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22226667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22029565 - 22029383
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  22029565 tgatgttgaatgacattgttgactattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 22029469  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22029468 atgttgtggagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22029383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41218307 - 41218143
Alignment:
Q  91 ttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 189  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |    
T  41218307 ttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaattctatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaaataatgtggagatgaac 41218208  T
Q  190 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41218207 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 41218143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20930327 - 20930163
Alignment:
Q  91 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 189  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |    
T  20930327 ttgattgttgataatcatgttgatgtgcggtgatgaatactatgattttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaac 20930228  T
Q  190 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20930227 aatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20930163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41393321 - 41393138
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||  ||  || || |   ||||||| |||||||||||||    
T  41393321 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatgtaactgtgtgtagacatgtttccttgataatgcaa 41393222  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41393221 -tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatactgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 41393138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Original strand, 9785551 - 9785707
Alignment:
Q  98 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 197  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||    
T  9785551 ttgataatcatgttgatgtgcgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgtgcatgctttcttgataatgcaaatgatgtggagaggaacaatataat 9785650  T
Q  198 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9785651 tgagtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 9785707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Original strand, 18602351 - 18602518
Alignment:
Q  87 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 185  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  18602351 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 18602449  T
Q  186 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18602450 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 18602518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Original strand, 5073608 - 5073775
Alignment:
Q  87 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 185  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  5073608 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 5073706  T
Q  186 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  5073707 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattggtgtcgcattatcgagtc 5073775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 51657606 - 51657805
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||         | ||||| ||  ||| |||||  |||| |||| |    
T  51657606 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttaattgaattatgatttgattgtgtatggacatgatttcat 51657705  T
Q  163 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| ||||||    
T  51657706 gataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgttgcattatcgagtctttgtac 51657805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 220
Target Start/End: Original strand, 20121965 - 20122098
Alignment:
Q  87 attgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 185  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  || |||||||  ||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  20121965 attgttgattgttgataatcaagttgttggtgtgatgaggaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 20122063  T
Q  186 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20122064 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgag 20122098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 143
Target Start/End: Original strand, 22031008 - 22031078
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  22031008 tgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgaggaatactatgatttatttg 22031078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 38034997 - 38035070
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  38034997 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 38035070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 255
Target Start/End: Original strand, 22836628 - 22836723
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||   || |||||||||||||||||    
T  22836628 cttggtaatgcaattgttgtggaaatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattatgaggtgatgtcgcattatcgagtc 22836723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27673641 - 27673543
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  27673641 tttcttgataatacaattgttttggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtggtgtcgcattatcgagtc 27673543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 36357713 - 36357786
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  36357713 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 36357786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 32650534 - 32650486
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650534 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatat 32650486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 232
Target Start/End: Original strand, 20956341 - 20956416
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  20956341 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtg 20956416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19601972 - 19601911
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19601972 tttcttgacaatgcaaatgttgtggagatcatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19601911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22353146 - 22353097
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22353146 tgatgttgaatgatattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 22353097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 37235336 - 37235405
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||||||    
T  37235336 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttaaattgttgtgaaaatt 37235405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 218
Target Start/End: Original strand, 5471758 - 5471816
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5471758 cttgataatgcaattgtggtggaggtgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 5471816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 8539328 - 8539396
Alignment:
Q  161 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||  |||||||||    
T  8539328 ttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttatcatttatattgtcgtgaaaatt 8539396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 8604567 - 8604635
Alignment:
Q  161 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||  |||||||||    
T  8604567 ttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttatcatttatattgtcgtgaaaatt 8604635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 77)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 24718702 - 24718887
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24718702 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 24718801  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24718802 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcacattatcgagtcctt 24718887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25121416 - 25121227
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25121416 tgatgttgaatgaccttgttgattattgataattatgttaatgtgtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 25121317  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25121316 atgttgtggagataatcaatataattggaagttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtccttgtac 25121227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 6775517 - 6775701
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  6775517 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 6775615  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6775616 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgttgcattatcgagtcctt 6775701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41245537 - 41245348
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  41245537 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgaagaagaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 41245438  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41245437 atgttatggagataatcaatataattgggagtagtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 41245348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 19994436 - 19994626
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19994436 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgta 19994535  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||   |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19994536 aatgaaatggagataatcaatatagttgtgtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtccttgtac 19994626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 3432861 - 3433044
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3432861 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 3432959  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3432960 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 3433044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 261
Target Start/End: Original strand, 22908770 - 22908956
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  22908770 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttg--tatgggcatgttttcttgataatgca 22908867  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 261  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22908868 aatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtccttgta 22908956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 43374868 - 43375051
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  43374868 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 43374966  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43374967 atg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 43375051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 224446 - 224631
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  224446 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 224545  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  224546 a-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 224631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 700859 - 701044
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  700859 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 700958  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  700959 a-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 701044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 738069 - 738254
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  738069 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 738168  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  738169 a-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 738254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 861964 - 862149
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  861964 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 862063  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  862064 a-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 862149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 13663921 - 13664105
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13663921 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 13664019  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13664020 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13664105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 13723196 - 13723380
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13723196 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 13723294  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13723295 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13723380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 20648724 - 20648906
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20648724 tgatgttggatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatgggtatgttttcttgataatgcaa 20648823  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20648824 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttgttctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 20648906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 22322720 - 22322909
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgtt-gattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22322720 tgatgttgaatgacattttttgattattgataatcatgttgatgtgagatgatgaatactatgaattaattgtgtatgggcatgttttcttaataatgca 22322819  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22322820 a-tgttgtggaggtaatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattatggattattgtcgcattatcaagtccttgtac 22322909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5237066 - 5236883
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  5237066 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 5236968  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5236967 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 5236883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 16874224 - 16874407
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  16874224 tgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgcaa 16874323  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16874324 -tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 16874407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 24662532 - 24662715
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24662532 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 24662630  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24662631 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 24662715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43684525 - 43684342
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  43684525 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 43684427  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43684426 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 43684342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 24930399 - 24930582
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  24930399 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtagggacatgtttccttgataatgca 24930498  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930499 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 24930582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 20655309 - 20655491
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  20655309 tgatgttggatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 20655408  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20655409 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 20655491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 24386994 - 24387175
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||| |||    
T  24386994 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatacaa 24387093  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24387094 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 24387175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 272491 - 272671
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  272491 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 272587  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  272588 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 272671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 643358 - 643178
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  643358 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 643262  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  643261 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 643178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 829164 - 828984
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  829164 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 829068  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  829067 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 828984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16417135 - 16416945
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |  ||  ||||||||||||||||||||    
T  16417135 tgatgtggaataacattgttgagtattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgcgtggacatgttttcttgataatgca 16417036  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  16417035 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggataattgtcacattatcgagtctttgtac 16416945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 22089730 - 22089911
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  22089730 tgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 22089826  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22089827 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22089911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Original strand, 24107872 - 24108050
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| |    
T  24107872 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtacgggcatgttttcttgataatgc-a 24107970  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24107971 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgg--tgttgtcgcattatcgagt 24108050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37610241 - 37610059
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  37610241 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatattttcttgataatgca 37610142  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37610141 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37610059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 15320346 - 15320527
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  15320346 tgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 15320442  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15320443 atgttgtggagataatcaatacaattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15320527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 15500715 - 15500896
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  15500715 tgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 15500811  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15500812 atgttgtggagataatcaatacaattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15500896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29759165 - 29758984
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  29759165 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgcaa 29759066  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | ||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29759065 atgatgtggagatgaacaacataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 29758984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 253
Target Start/End: Original strand, 16195022 - 16195202
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat-ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||  ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  16195022 tgatgttgaatgacattattgattattgataatcatattgatgtgtgatgatgaatactatgatttaaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 16195121  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgag 253  Q
    |||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16195122 aatgatgtagagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgag 16195202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 75 - 255
Target Start/End: Original strand, 20568553 - 20568734
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| |  ||||| ||  ||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  20568553 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatatggtgatgatgagtgttatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatgcaaa 20568652  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20568653 tgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 20568734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 75 - 255
Target Start/End: Original strand, 20574746 - 20574927
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| |  ||||| ||  ||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  20574746 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatatggtgatgatgagtgttatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatgcaaa 20574845  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20574846 tgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 20574927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24548092 - 24547909
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |    
T  24548092 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-a 24547994  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24547993 atgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 24547909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 270585 - 270429
Alignment:
Q  98 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 197  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  270585 ttgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtagagatgaacaatataat 270486  T
Q  198 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  270485 tgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 270429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Original strand, 645335 - 645491
Alignment:
Q  98 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 197  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  645335 ttgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgttgagatgaacaatataat 645434  T
Q  198 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  645435 tgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 645491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Original strand, 831070 - 831226
Alignment:
Q  98 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 197  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  831070 ttgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtagagatgaacaatataat 831169  T
Q  198 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  831170 tgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 831226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 258
Target Start/End: Original strand, 22007788 - 22007948
Alignment:
Q  98 ttgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataa 196  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  22007788 ttgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaattctatgatttaattgtgtatgggaatgttttcttgataatgcaa-tgttgtgaagataatcaatataa 22007886  T
Q  197 ttggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22007887 ttgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 22007948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21696436 - 21696253
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||  |||||  ||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21696436 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgcgataatgaatcttatgatttgtttgtgtatgggcatattttcttgataatgca 21696337  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21696336 aatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaatactgtggattgatgttgcattatcgagtc 21696253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21680077 - 21679889
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||| |||||||||||||    
T  21680077 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgtcgatgttgtgataatgaatcttatgatttcattgtgtatggacatgttctcttgataatgca 21679978  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    ||||| ||||| || | ||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21679977 aatgtggtggagatgaacaatatatttggaagttgtcatctatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgt 21679889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Original strand, 17151225 - 17151335
Alignment:
Q  12 gtgattatttgggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151225 gtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatattgtggttgaatatatatattatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 17151324  T
Q  112 aatgtgtgatg 122  Q
     |||| |||||    
T  17151325 gatgtatgatg 17151335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Original strand, 17730749 - 17730936
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||| |||||||    
T  17730749 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgttaatgca 17730848  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  17730849 aatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtgg-gaaaattgtggggtgatgtcgcattatcgagtctttgt 17730936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28543806 - 28543628
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |  |||||| ||| || ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28543806 atgttgaataacattgttgattattgatgatcatgat--ttggtgatgatgagtattatgatttgattgtgtatgaacatgttttcttgataatgcaaat 28543709  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28543708 gttgtggagatgatcaatatatgtggaagttgtcctctatattgtggtgataattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 28543628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28836465 - 28836353
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  28836465 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 28836369  T
Q  173 atgttgtggaaataat 188  Q
    |||||||||| |||||    
T  28836368 atgttgtggagataat 28836353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20480543 - 20480365
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || |||||  ||||| ||| ||| ||||   ||||||||||| |||||||||    
T  20480543 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgttatgatttaattgtgtatagacatgttttctttataatgcaa 20480446  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20480445 atgttgtggagatgaacaatataattaggtgttgtcctatatattgtggtgaaaa-tgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20480365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Original strand, 16675624 - 16675791
Alignment:
Q  87 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 185  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  16675624 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 16675722  T
Q  186 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16675723 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 16675791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18618238 - 18618138
Alignment:
Q  24 gtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat--gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18618238 gtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgat 18618139  T
Q  122 g 122  Q
    |    
T  18618138 g 18618138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Original strand, 21853199 - 21853361
Alignment:
Q  91 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 190  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  21853199 ttgattgttgataatcaatttgttgtgtgatgatggatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatca 21853297  T
Q  191 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  21853298 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgctgtcgcattatcgagtc 21853361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37605783 - 37605685
Alignment:
Q  156 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37605783 ttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37605685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Original strand, 21845794 - 21845956
Alignment:
Q  91 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 190  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||    
T  21845794 ttgattgttgataatcaatttgttgtgtgatgatggatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtgttgataatca 21845892  T
Q  191 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21845893 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 21845956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Original strand, 18768135 - 18768233
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  18768135 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgataaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 18768233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Original strand, 16040645 - 16040748
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  16040645 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgagaatgca 16040744  T
Q  172 aatg 175  Q
    ||||    
T  16040745 aatg 16040748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Original strand, 16042321 - 16042424
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  16042321 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgagaatgca 16042420  T
Q  172 aatg 175  Q
    ||||    
T  16042421 aatg 16042424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 255
Target Start/End: Original strand, 16203739 - 16203804
Alignment:
Q  189 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16203739 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16203804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38532533 - 38532336
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||         ||||| | ||  ||| |||||   ||| ||||||    
T  38532533 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatttgaactataacttgattgtgtatggatatgatttctt 38532434  T
Q  163 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    ||||||  || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  38532433 gataatataattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtagaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtctttgt 38532336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 39448198 - 39448271
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  39448198 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataatttgaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 39448271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Original strand, 41508302 - 41508352
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat 73  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41508302 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatat 41508352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 21199547 - 21199608
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21199547 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 21199608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 31195658 - 31195719
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31195658 tttcttgataatgcaaatgttgcggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 31195719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 122
Target Start/End: Original strand, 224301 - 224348
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  224301 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 224348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 122
Target Start/End: Original strand, 700714 - 700761
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  700714 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 700761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 122
Target Start/End: Original strand, 737924 - 737971
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  737924 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 737971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 122
Target Start/End: Original strand, 861819 - 861866
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  861819 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 861866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Original strand, 13663774 - 13663823
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13663774 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13663823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Original strand, 13722309 - 13722358
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722309 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Original strand, 13722457 - 13722506
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722457 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Original strand, 13722605 - 13722654
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722605 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Original strand, 13722753 - 13722802
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722753 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Original strand, 13722901 - 13722950
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722901 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Original strand, 13723049 - 13723098
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13723049 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13723098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23148682 - 23148624
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23148682 cttgataatgcaaatgttgttgaggtgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 23148624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 21192120 - 21192181
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  21192120 tttcttgataatacaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcatttatattg 21192181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Original strand, 22737250 - 22737349
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga-ttgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||| |||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||    
T  22737250 tttcttggtaatgcatttgtggtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatatggtggtgaaaattgttgaggtgatgtcacattatcgagtc 22737349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23836008 - 23835950
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  23836008 cttgataatgcaattgttgaggaaatgatcaatatatttggaagttttcctttatattg 23835950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 13867363 - 13867552
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13867363 tgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 13867462  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13867463 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgttctatatattgaagtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 13867552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 73 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44864118 - 44863930
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44864118 tgatgttgaatgacattgttgatcattgataatcatgctaatgtgtgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 44864019  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 261  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44864018 atgctgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 44863930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 45453545 - 45453728
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45453545 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 45453644  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataatt-ggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45453645 atgatgtggagatgaacaatataattgggaagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 45453728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7291728 - 7291540
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7291728 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 7291629  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7291628 atgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 7291540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 12545001 - 12545190
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||| ||    
T  12545001 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatggaa 12545100  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12545101 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatttaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 12545190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 47288650 - 47288461
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  47288650 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 47288551  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47288550 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatattttgaggtgaaaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttgtac 47288461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 262
Target Start/End: Original strand, 26071557 - 26071743
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26071557 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaat 26071655  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26071656 gttgtggagataatcaatataattgggcgtggtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26071743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 262
Target Start/End: Original strand, 26095344 - 26095530
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26095344 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaat 26095442  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26095443 gttgtggagataatcaatataattgggcgtggtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 369762 - 369580
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  369762 tgatgttaaaggacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 369663  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369662 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 369580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Original strand, 15952385 - 15952563
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15952385 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 15952482  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15952483 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 15952563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 15823695 - 15823888
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaata----ctatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 168  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  15823695 tgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatatgtgatggtgaatatatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataat 15823794  T
Q  169 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15823795 gcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctttatattgaggtgaagattgttaattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 15823888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 142503 - 142313
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  142503 tgatgttgaataacattgttgattattgatgattatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 142404  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142403 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 142313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 258
Target Start/End: Original strand, 18981201 - 18981379
Alignment:
Q  78 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18981201 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtatgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgtt 18981299  T
Q  178 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18981300 gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18981379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 258
Target Start/End: Original strand, 2191987 - 2192169
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2191987 atgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttatttttgtatgggcatgttttcttgataatgcaaat 2192086  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2192087 gttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgctgtcgcattatcgagtcctt 2192169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2027432 - 2027250
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  2027432 tgatgttcaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcgtgttttcttgataatgcaa 2027333  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2027332 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaatttgtgattgttgtcgcattatcgagtc 2027250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3058922 - 3058741
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3058922 tgatgttgaatgatactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgcaa 3058823  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3058822 atgatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 3058741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16417339 - 16417162
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  16417339 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 16417243  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16417242 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 16417162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13757453 - 13757270
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  13757453 tgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgcaa 13757354  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13757353 -tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13757270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 15442848 - 15443031
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15442848 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 15442946  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15442947 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 15443031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16210654 - 16210471
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  16210654 tgatgttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgttggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 16210556  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16210555 atg-tgtggagataatcaatataattaggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 16210471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 256
Target Start/End: Original strand, 13038395 - 13038576
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  13038395 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 13038493  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 256  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13038494 atg-tgtggagataatcaatataatcgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattattgagtcc 13038576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 32495843 - 32496025
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  32495843 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 32495942  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32495943 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 32496025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 112586 - 112767
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  112586 tgatgttgaatgacactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataaagcaa 112685  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  112686 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgatgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 11582131 - 11582311
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  11582131 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtggtgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 11582229  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11582230 atg-tgtggagataatcaatataattgagtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcacattatcgagtc 11582311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11286088 - 11285904
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtg--atggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  11286088 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgc 11285989  T
Q  171 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11285988 aaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttctcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 11285904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36051538 - 36051355
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||| |||||||||    
T  36051538 tgatgttgaatgacattgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttacttaataatgcaa 36051439  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051438 -tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtagaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 36051355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 13912402 - 13912582
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  13912402 tgatgttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaaatgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttggtaatgc-a 13912500  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13912501 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13912582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 15525772 - 15525957
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15525772 tgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattatgtgaatgatgaatactatgatctatttgtgtgtgtgcatgttttcttgataatgca 15525871  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15525872 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaatcgttgtcgcattatcgagtcctt 15525957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 27102839 - 27103019
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27102839 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 27102935  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27102936 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 27103019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 27110187 - 27110367
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27110187 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 27110283  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27110284 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 27110367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27175487 - 27175307
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27175487 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 27175391  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27175390 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 27175307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 38784931 - 38785111
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  38784931 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 38785027  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38785028 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 38785111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 16480225 - 16480408
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  || |||  |||| |||||||| |||| |||||| |    
T  16480225 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatgtaattgtatatgggcatgtttccttggtaatgc-a 16480323  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16480324 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtcctt 16480408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 1938060 - 1938240
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1938060 tgatgttgaatgacattgttgattattgataataatgttgatgtgtaatgatgaatattatgatttaattatgaatgagcatgttttcttgataatgcaa 1938159  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  1938160 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaat--tgaattgttgtcgcattatcgagtc 1938240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 125701 - 125520
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  125701 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaatcgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaa 125602  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    | | |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  125601 aggatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 125520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7821795 - 7821615
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7821795 tgatgttgagtgacattgttgattattgatatt-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 7821699  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7821698 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 7821615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7829106 - 7828926
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7829106 tgatgttgagtgacattgttgattattgatatt-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 7829010  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7829009 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 7828926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12753756 - 12753575
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| | || |||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  12753756 tgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgtgtggagatgagtactataatttgtttgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 12753657  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12753656 atgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgtggtg-aaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 12753575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 12249401 - 12249584
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  12249401 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 12249500  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12249501 aatgttgtggagatgatcaatatatttggtagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 12249584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15926239 - 15926058
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||    
T  15926239 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttt-cttgataatgca 15926144  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15926143 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15926058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Original strand, 42057458 - 42057632
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 178  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42057458 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttg 42057556  T
Q  179 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42057557 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 42057632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11514996 - 11514816
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |    
T  11514996 tgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-a 11514898  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11514897 atgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 11514816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 30263413 - 30263593
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |    
T  30263413 tgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-a 30263511  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30263512 atgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 30263593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 26010480 - 26010663
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||  ||  || || ||  ||||||| |||||||||||||    
T  26010480 tgatgttgaatgacattgtggattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctttgatgtaactgtgtgtggacatgtttccttgataatgcaa 26010579  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26010580 -tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 26010663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3893968 - 3893789
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||    
T  3893968 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgtaa 3893871  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3893870 atgttgtggagatgaacaatataaatgggtgttgtcatatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 3893789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 258
Target Start/End: Original strand, 18255113 - 18255295
Alignment:
Q  77 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgtttt-cttgataatgcaaat 174  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||  |||||| || |||||||||| |  ||||||  | || ||||||||| |||||||||| || |    
T  18255113 gttgaatgtctttgttgattgttgataatcaagttatggtgtgaatgatgaatactataatctatttgtatgtgggcatgttttgcttgataatgtaa-t 18255211  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18255212 gttgtggggataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 18255295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Original strand, 15761672 - 15761839
Alignment:
Q  87 attgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  15761672 attgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgatgaggagat 15761771  T
Q  186 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15761772 gaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 15761839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13571701 - 13571525
Alignment:
Q  78 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 176  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| |||    
T  13571701 ttgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtttgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgt 13571603  T
Q  177 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13571602 tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcttatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13571525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Original strand, 16571380 - 16571568
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16571380 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 16571479  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    |||||| || || ||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  16571480 tgttgttgagatgatcaatatatatatgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtctcattatcgagtctttgt 16571568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16594282 - 16594094
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16594282 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 16594183  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    |||||| || || ||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  16594182 tgttgttgagatgatcaatatatatatgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtctcattatcgagtctttgt 16594094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2436456 - 2436315
Alignment:
Q  116 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2436456 tgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtgtggacatttttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 2436358  T
Q  216 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2436357 ttgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 2436315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 255
Target Start/End: Original strand, 25293608 - 25293747
Alignment:
Q  114 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 213  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25293608 tgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtgaagataatcaatataattgggtgttgtcctata 25293706  T
Q  214 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25293707 tattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 25293747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10988479 - 10988303
Alignment:
Q  80 gaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 178  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  10988479 gaatgatattattgattgttgataatcaagttgttggtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttc-cttggtaatgcaa-tgttg 10988382  T
Q  179 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10988381 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtcctt 10988303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13273539 - 13273431
Alignment:
Q  152 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 251  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |  |||||||||||||    
T  13273539 catgatttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaagttgtgaagtaatgtcgcattatcg 13273440  T
Q  252 agtccttgt 260  Q
    |||| ||||    
T  13273439 agtctttgt 13273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15629567 - 15629459
Alignment:
Q  152 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 251  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  15629567 catgatttcttgataatacaattgttgtggaaatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgacgtcgcattatcg 15629468  T
Q  252 agtccttgt 260  Q
    |||| ||||    
T  15629467 agtctttgt 15629459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 15761500 - 15761558
Alignment:
Q  64 atatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15761500 atatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 15761558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 39047980 - 39048042
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39047980 tgatgttgaatggcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatga 39048042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Original strand, 15761428 - 15761489
Alignment:
Q  12 gtgattatttgggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat 73  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15761428 gtgatgattttggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatat 15761489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 260
Target Start/End: Original strand, 49049169 - 49049277
Alignment:
Q  152 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 251  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  49049169 catgatttcttgataatgcaattgtggtggagatgatcaacatatttgaaagttgtcctttatattgtggtggaaattgtgagttgatgtcgcattatcg 49049268  T
Q  252 agtccttgt 260  Q
    |||| ||||    
T  49049269 agtctttgt 49049277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 7285717 - 7285766
Alignment:
Q  31 catatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 80  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285717 catatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 7285766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Original strand, 47482182 - 47482239
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 80  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47482182 ggtgaatccatatatattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatgttgttg 47482239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 73
Target Start/End: Original strand, 14252581 - 14252629
Alignment:
Q  25 tgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat 73  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14252581 tgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatat 14252629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 15851201 - 15851163
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15851201 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 15851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 9058007 - 9058076
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  9058007 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 9058076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 254
Target Start/End: Original strand, 10862231 - 10862326
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt-gtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || |||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||   || ||||||||||||||||    
T  10862231 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatgtatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatttgtgaggtgatgtcgcattatcgagt 10862326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15629656 - 15629613
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15629656 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 15629613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 15913817 - 15913874
Alignment:
Q  161 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  15913817 ttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcatttatattg 15913874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 13273628 - 13273590
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13273628 tgatgttgaattacattgttgattattgatgatcatgtt 13273590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13376461 - 13376423
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatata 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13376461 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatata 13376423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 122
Target Start/End: Original strand, 2191847 - 2191884
Alignment:
Q  85 acattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2191847 acattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 2191884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 90)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 73 - 261
Target Start/End: Original strand, 6148127 - 6148315
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||    
T  6148127 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtaatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcttgttttcttgataatgtaa 6148226  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6148227 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctacatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 6148315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13816385 - 13816200
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | | ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  13816385 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatgctatgattcaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 13816286  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13816285 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgagaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13816200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 19572057 - 19572242
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | | ||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  19572057 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgattcaattgtgtgtggccatgttttcttgataatgcaa 19572156  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19572157 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcacattatcgagtcctt 19572242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 16183295 - 16183489
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16183295 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgacaatgca 16183394  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatat----attgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16183395 aatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgattgaggtgtaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 16183489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 15860433 - 15860617
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  15860433 tgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgataaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgcaa 15860532  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860533 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 15860617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16819778 - 16819597
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  16819778 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 16819682  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16819681 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 16819597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18909559 - 18909378
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || | |||||||||||||||||| |    
T  18909559 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgtggatgttttcttgataatgc-a 18909463  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18909462 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18909378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 22145560 - 22145740
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22145560 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaatggtgtaggggcatgttttcttgataatgcaa 22145659  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22145660 a-gttgtggagataatcaatataattgggtg-tgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttatcgcattatcgagtc 22145740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17099585 - 17099397
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| | ||  |||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17099585 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttataatttgattgtttatggacatgttttcttgataatgcaaa 17099486  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17099485 tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgctgacgcattatcgagtccttgtac 17099397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 50113418 - 50113602
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  50113418 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgagtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 50113517  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50113518 atgttgtggaggtaatcaatataat----tgttgtcctatatattgaggtg-aaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttgtac 50113602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35122560 - 35122377
Alignment:
Q  72 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  35122560 atgatgttgaatgacattgttgattattgacaatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatgatttggttgtgtatggacatgttttcttgataatgca 35122461  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35122460 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattatgaattgttgtcgcattatcgagtc 35122377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 8269689 - 8269870
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  8269689 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 8269785  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8269786 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8269870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 8276800 - 8276981
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  8276800 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 8276896  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8276897 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8276981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8630715 - 8630538
Alignment:
Q  77 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 176  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  8630715 gttgaatgactttgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatgtgcatgtcttcttgataatgcaaatga 8630616  T
Q  177 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8630615 tgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 8630538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 17957621 - 17957802
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  17957621 tgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 17957720  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17957721 atgatgtggacatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 17957802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22273914 - 22273737
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  22273914 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 22273818  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22273817 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 22273737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33340715 - 33340534
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  33340715 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaa 33340616  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33340615 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 33340534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 53769530 - 53769350
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |    
T  53769530 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-a 53769432  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53769431 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 53769350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 49231086 - 49230901
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  49231086 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 49230987  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49230986 a-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagattgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 49230901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 51159764 - 51159945
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  51159764 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 51159863  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51159864 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattggtgtcgcattatcgagtc 51159945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27839573 - 27839394
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 177  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  27839573 tgaatgataatgttgattgttgatgatcatgttaatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa-tgat 27839475  T
Q  178 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27839474 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 27839394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 318899 - 319081
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  318899 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgttatgatttaatcgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 318998  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  318999 aatgatgtggaaatgaacaatataattgggtgttatcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 319081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2048933 - 2048751
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2048933 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 2048834  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2048833 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 2048751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Original strand, 2450615 - 2450791
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  2450615 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgg-gaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 2450710  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2450711 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 2450791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7852680 - 7852499
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||    
T  7852680 tgatgttgaatgacattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatgaggaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgtaa 7852581  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7852580 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 7852499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19230932 - 19230751
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  19230932 tgatgttgaatgacgttgttgattattgataattatgttgatgtgtgataatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgcaa 19230833  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19230832 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 19230751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25057710 - 25057531
Alignment:
Q  82 atgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25057710 atgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtag 25057611  T
Q  182 aaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25057610 agatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 25057531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 1468941 - 1469121
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  1468941 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 1469037  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1469038 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 1469121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 17913537 - 17913717
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  17913537 tgatgttgaatggcattgttgattattgataagcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 17913636  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17913637 atgttgtggagatgaacaatataattggatgtcgtcctatatattgtgttgacaattgt-gattg-tgtcgcattatctagtc 17913717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30152204 - 30152023
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  30152204 tgatgttggatgacattgttgattattgattaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 30152108  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30152107 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 30152023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16259911 - 16259732
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  16259911 atgttgaatgatgttgttgattattgattatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaaat 16259812  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16259811 gatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16259732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19945499 - 19945317
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19945499 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgatatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgca 19945400  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19945399 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 19945317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14294300 - 14294114
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14294300 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 14294201  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14294200 tgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctgtatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgt 14294114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 75 - 255
Target Start/End: Original strand, 14522594 - 14522775
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| || ||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14522594 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgagtattatgatttgattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaa 14522693  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14522694 tgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 14522775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Original strand, 15469754 - 15469931
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||| || ||||||||||| |    
T  15469754 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatg-ttccttgataatgc-a 15469851  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15469852 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-aaattgt-gattattgtcgcattatcgagt 15469931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 16745457 - 16745639
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  16745457 tgatgttgcatgac-ttgttgattattgttaatcatgttgaagtgtgttggtgaatactatgatttaattgtgtttgggcatgttttcttgataatgc-a 16745554  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16745555 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gatggttgtcgcattatcgagtcctt 16745639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14297372 - 14297188
Alignment:
Q  72 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| || ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  14297372 atgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattgatgtggtgataatgagtattatgatttgattgagtatggacatgttttcttgataatgc 14297273  T
Q  171 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14297272 aaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtc 14297188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14302999 - 14302815
Alignment:
Q  72 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| || ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  14302999 atgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattgatgtggtgataatgagtattatgatttgattgagtatggacatgttttcttgataatgc 14302900  T
Q  171 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14302899 aaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtc 14302815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 255
Target Start/End: Original strand, 53899807 - 53899989
Alignment:
Q  72 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  53899807 atgatgttgaatgatattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgtatatggacatgttttcttgataatgca 53899905  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  53899906 aatgtggtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatataatgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtc 53899989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Original strand, 11198859 - 11199045
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11198859 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 11198958  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  11198959 tgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcaagtctttgt 11199045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14299927 - 14299741
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14299927 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 14299828  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14299827 tgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctgtatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgt 14299741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 124 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30205274 - 30205137
Alignment:
Q  124 tgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 223  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  30205274 tgaatactatgaattaattgtgtatgtgcatgttttcttgataaagcaaa-gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtccaatatattcaggtg 30205176  T
Q  224 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30205175 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 30205137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44228299 - 44228115
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| | | ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  44228299 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaatcgtgtatgggcatgtttccttggtaatgca 44228200  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44228199 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 44228115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15574913 - 15574730
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |    
T  15574913 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-a 15574815  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15574814 atgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 15574730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15613932 - 15613749
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |    
T  15613932 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-a 15613834  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15613833 atgttgtggagatgattaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 15613749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23491373 - 23491202
Alignment:
Q  78 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  23491373 ttgaatgacatcgttgattattgataatcacgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgat 23491274  T
Q  178 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 250  Q
    ||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23491273 gtggagatgaacaatataattgggtgttttcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 23491202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 11062322 - 11062504
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  11062322 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgtttt-ttgataatgca 11062420  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11062421 aatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtc 11062504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 12265776 - 12265960
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  | ||  ||||||| |||| ||||||||    
T  12265776 tgatgttagatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgataaatactatgatttatttgtctgtggacatgtttccttggtaatgcaa 12265875  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12265876 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 12265960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 262
Target Start/End: Original strand, 17523699 - 17523884
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  |  |||||| ||| || ||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||    
T  17523699 atgttgaatgacattattgattattgatgatcatgat--ttggtgatgatgagtagtatgaattaattgtgtatggacatgatttcttgataatgcacat 17523796  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17523797 gttgcggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattggggtgaaaaccgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 17523884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 12351130 - 12351312
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||  |  ||||||||||||||||||||    
T  12351130 tgatgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgttgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgcggacatgttttcttgataatgca 12351229  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12351230 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgaattatcgagtc 12351312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40938602 - 40938421
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40938602 atgttgaatgacattgttgattgttgatgatcaagttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 40938503  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  40938502 tgttatggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtaaattggtgtcgcattatcgagtc 40938421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Original strand, 47786169 - 47786314
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||| ||||||||||||| ||    
T  47786169 tgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatgaaa 47786268  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47786269 atgtggtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattg 47786314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5227584 - 5227406
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||| |||||||  |   | | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5227584 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtaatgatgaatacatt---tgaattgtatatgagcatgttttcttgataatgcaa 5227488  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5227487 atgatgtggagattaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5227406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10737386 - 10737247
Alignment:
Q  115 gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatat 214  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  10737386 gtgtcatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtgaagatgaacaatacaattgggtgttgtcctatat 10737287  T
Q  215 attgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10737286 attgtggagaaaattgt-tattgttgtcgcattatcgagtc 10737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 258
Target Start/End: Original strand, 14846034 - 14846131
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14846034 cttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 14846131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 45859884 - 45859709
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 177  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  45859884 tgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtt 45859786  T
Q  178 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45859785 gtgaagataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 45859709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 55315252 - 55315085
Alignment:
Q  87 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 185  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  55315252 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 55315154  T
Q  186 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  55315153 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 55315085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 252
Target Start/End: Original strand, 12562763 - 12562944
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  12562763 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtacggacatgttttcttgataatgca 12562862  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa-ttgtggattgttgtcgcattatcga 252  Q
    | ||||||||| || ||||||||| |||||  || |||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  12562863 attgttgtggagatgatcaatatatttggaatttttcctctatattgtggtgaaaatttgtgaagtgttgtcgcattatcga 12562944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 258
Target Start/End: Original strand, 15939748 - 15939930
Alignment:
Q  77 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgtttt-cttgataatgcaaat 174  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| ||||||||| ||| |    
T  15939748 gttgaatgactttgttgattgttgataatcaagttatggtgtgaatgatgaatactatgatctatttgtatgtgggcatgttttgcttgataattcaa-t 15939846  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15939847 gttatggggataatcaatataattgggtgttgtcatatacattgaggttgaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtcctt 15939930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 195
Target Start/End: Original strand, 16935168 - 16935286
Alignment:
Q  74 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||    
T  16935168 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aa 16935264  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatata 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  16935265 tgttgtggagataatcaatata 16935286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 258
Target Start/End: Original strand, 8305693 - 8305790
Alignment:
Q  159 tcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8305693 tcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8305790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 258
Target Start/End: Original strand, 18905171 - 18905267
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18905171 cttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgt-gattgttttcgcattattgagtcctt 18905267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41269098 - 41268931
Alignment:
Q  87 attgttgattattgataatcatgttaa-tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 185  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| |||  || || || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  41269098 attgttgattgttgataatcaagttgtctgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggtatgttctcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 41269000  T
Q  186 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  41268999 aatcaatataattgggtgttgtcctatgtattgagttg-agattgagaaatgttgtcgcattatcgagtc 41268931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 255
Target Start/End: Original strand, 13976964 - 13977101
Alignment:
Q  118 tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat- 216  Q
    ||||| |||||||||||| |||  || || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13976964 tgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatata 13977062  T
Q  217 -tgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
     |||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13977063 ttgagttgaca-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13977101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 167
Target Start/End: Original strand, 12031269 - 12031364
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataa 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||| | ||| || ||||||||||||||    
T  12031269 tgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaaattgtgaatgggcgtgttttcttgataa 12031364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 9303744 - 9303802
Alignment:
Q  64 atatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9303744 atatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 9303802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 255
Target Start/End: Original strand, 13956132 - 13956269
Alignment:
Q  118 tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat- 216  Q
    ||||| |||||||||||| |||  || || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  13956132 tgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaaaataattgggtgttgtcctatatata 13956230  T
Q  217 -tgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
     |||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13956231 ttgagttgaca-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13956269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17138253 - 17138157
Alignment:
Q  159 tcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  17138253 tcttgataattcaattgttgtggagatgatcaatatagttgggagttgtcctttatattgaggtgaaaattgtaaagtgatgtcgcattatcgagtc 17138157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12951835 - 12951743
Alignment:
Q  163 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  12951835 gataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgagatgatgtcgcattatcgagtc 12951743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15874953 - 15874893
Alignment:
Q  158 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15874953 ttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 15874893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Original strand, 9303679 - 9303729
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat 73  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303679 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatat 9303729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Original strand, 11330382 - 11330442
Alignment:
Q  158 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11330382 ttcttgataatgcaaatgtggtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 11330442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18892874 - 18892826
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18892874 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatat 18892826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15516521 - 15516426
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||    
T  15516521 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattttgagttgatgtcgcattatcaagtc 15516426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 18738723 - 18738667
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 80  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18738723 ggtgaatccatatactttg-ttattataatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 18738667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 38812367 - 38812436
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  38812367 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 38812436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 229
Target Start/End: Original strand, 12490105 - 12490177
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  12490105 tttcttgataatgaaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 12490177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14287828 - 14287780
Alignment:
Q  212 tatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14287828 tatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgt 14287780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 17937369 - 17937333
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17937369 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 17937333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18889647 - 18889599
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18889647 ggtgaatccatatacattgtttattatgatacggtgggtgaatatatat 18889599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23174594 - 23174546
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23174594 ggtgaatccatatactttgtttattatgatatggtgggtgaatatatat 23174546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39654695 - 39654607
Alignment:
Q  167 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  39654695 atgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgttgcattatcgagtc 39654607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 255
Target Start/End: Original strand, 11883645 - 11883735
Alignment:
Q  165 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| ||| ||||   || |||||||||||||||||    
T  11883645 taatgctaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtggaaagtgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 11883735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 18897983 - 18898045
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 135  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  18897983 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatacgttgatgtgggatgatgaatactatga 18898045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11813586 - 11813553
Alignment:
Q  225 aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11813586 aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 11813553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 54039827 - 54039875
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  54039827 ggtgaatccatatacattgtttattatgatagggtgtgtgaatatatat 54039875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 14060614 - 14060675
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  14060614 tttcttgataatgcaaatattgtggggatgatcaatatagtttgaagttgtcctttatattg 14060675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16260051 - 16260014
Alignment:
Q  85 acattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16260051 acattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 16260014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 55442145 - 55442218
Alignment:
Q  158 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattgg-atgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  55442145 ttcttaataatgcgaatgttgtggagatgatcaatataattggaaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 55442218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 255
Target Start/End: Original strand, 47786311 - 47786339
Alignment:
Q  227 attgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47786311 attgtggattgttgtcgcattatcgagtc 47786339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8307 - 8125
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8307 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 8208  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8207 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgttctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6421 - 6232
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  6421 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 6322  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6321 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 6232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 15152 - 15338
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15152 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 15249  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15250 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 15338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28758 - 28574
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  28758 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 28659  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28658 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 28574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28906 - 28857
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28906 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 28857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 77 - 252
Target Start/End: Original strand, 686 - 861
Alignment:
Q  77 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  686 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgtaaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgatttcttgataatgcaaatgt 785  T
Q  177 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 252  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  786 tgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 77 - 262
Target Start/End: Original strand, 256199 - 256384
Alignment:
Q  77 gttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatg 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  256199 gttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatgagcatgttttcttgataatg-aaatg 256297  T
Q  176 ttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256298 ttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 256384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 77 - 247
Target Start/End: Original strand, 262805 - 262975
Alignment:
Q  77 gttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatg 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  262805 gttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc-aatg 262903  T
Q  176 ttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 247  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  262904 ttgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 262975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 124579 - 124762
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  124579 tgatgttgaatgattttgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgatgaatactatgatttaattgggtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 124678  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  124679 -tgt-gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcacattatcgagtcctt 124762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 193486 - 193303
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| ||||||||    
T  193486 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtgtgttgaagaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgttaatgcaa 193387  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193386 -tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 193303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 75980 - 76163
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  75980 tgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgaagaatactatgatttaattgagtgtggacatgttttcttgataatgcaa 76079  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76080 -tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcatcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 76163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 95195 - 95006
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  95195 tgatgttaaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaactgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 95096  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95095 atgttgtggagataatcaatataattgagtgttgttctatatattaaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 95006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Original strand, 66745 - 66907
Alignment:
Q  91 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 190  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  66745 ttgattgttgataatcaaattgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatca 66843  T
Q  191 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  66844 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 66907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 95343 - 95294
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  95343 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 95294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 78426 - 78241
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  78426 tgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatagtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 78327  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78326 atgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 78241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39086 - 38903
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  39086 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgca 38987  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38986 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttgttgcattatcgagtc 38903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44673 - 44513
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  44673 tgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatcctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgca 44574  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 232  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44573 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtg 44513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 109369 - 109553
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  109369 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 109467  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109468 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 109553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 54486 - 54330
Alignment:
Q  98 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  54486 ttgataatcatgttaatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgtgcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataat 54387  T
Q  198 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54386 tgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 54330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 38619 - 38807
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38619 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 38718  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38719 atgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 38807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40365 - 40184
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  40365 tgatgttgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgcaa 40266  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40265 atgatgtggagatgaacaatataattggctgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 40184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 262
Target Start/End: Original strand, 26014 - 26200
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||   ||||||||||||||||||||| |    
T  26014 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatctgtgtatagacatgttttcttgataatgcaa-t 26112  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113 gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatttaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 70684 - 70873
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||    
T  70684 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgatttcttgataattcaa 70783  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70784 atgttgtggagatgattaatataaatgggtgttatcctatatattgaggagaaacttgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 70873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 2127 - 2317
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  2127 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctataatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgca 2226  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2227 aatgatgtggagataatcaatataagtgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 6647 - 6837
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  6647 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatggatgctatgatttaattgtgtataggcatgttttcttgataatgca 6746  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6747 aatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtagcattatcgagtccttgtac 6837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21533 - 21351
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21533 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatgtgcatgttttcttgataatgcaa 21434  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21433 atgttgtggagatgatcaatataattcggtgttgtcctatatactgaagtgaaaattgtggtttgttgtcgtattatcgagtc 21351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Original strand, 129504 - 129668
Alignment:
Q  91 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 189  Q
    |||||| ||||||| |||||| || || | ||  ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | |    
T  129504 ttgattgttgataaccatgttgatatgcggtgacgaatactatgattttaattgtgtatgggcatgttttgttgataatgcaaatgatgtggagatgaac 129603  T
Q  190 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129604 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 129668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 13028 - 13217
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||| |||||||    
T  13028 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgacaatgcaa 13127  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13128 atgttgttgagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattatggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 13217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 199 - 161
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  199 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 262
Target Start/End: Original strand, 36891998 - 36892185
Alignment:
Q  74 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  36891998 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgaaaa 36892096  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36892097 tgttgtggagataatcaatataattgggagttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 36892185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 5889583 - 5889765
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  5889583 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 5889679  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5889680 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 5889765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34823069 - 34822886
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  34823069 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 34822971  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34822970 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 34822886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 3800399 - 3800581
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  3800399 tgatgttgcatgacatggttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 3800496  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3800497 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 3800581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 21275813 - 21275995
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  21275813 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 21275909  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21275910 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 21275995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25600834 - 25600652
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  25600834 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 25600735  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25600734 atgttgcggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtaaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 25600652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12726924 - 12726741
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  12726924 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactaagatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 12726826  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12726825 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 12726741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24967168 - 24966987
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24967168 atgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgataacgtgtggtgatgaatactatgatttattcgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaat 24967069  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24967068 gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggtcgcattatcgagtcc 24966987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 255
Target Start/End: Original strand, 4449516 - 4449698
Alignment:
Q  72 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  4449516 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgtgtatggacatgttttcttgataatgca 4449614  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4449615 aatgttgcgaaaatgatcaatataattggaagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 4449698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8942519 - 8942334
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8942519 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgagcatgttttcttgataatgca 8942420  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8942419 a-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8942334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8887013 - 8886832
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8887013 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaa 8886914  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8886913 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttatcgcattatcgagtc 8886832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Original strand, 19888066 - 19888243
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  19888066 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 19888162  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19888163 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 19888243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21140746 - 21140569
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||||||||| |    
T  21140746 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatgc-a 21140651  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21140650 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 21140569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 461609 - 461426
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  461609 tgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 461511  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  461510 atg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 461426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 12643311 - 12643491
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||| |||||| |    
T  12643311 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtggccatgttttcttggtaatgc-a 12643409  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12643410 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 12643491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22862360 - 22862179
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22862360 tgatattgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgcaa 22862261  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22862260 atgatgtggagataaacaatataattgagtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22862179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 14907724 - 14907907
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14907724 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 14907822  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14907823 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 14907907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20013993 - 20013810
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20013993 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 20013895  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20013894 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 20013810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23819050 - 23818867
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  23819050 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 23818952  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23818951 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 23818867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Original strand, 43644262 - 43644442
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43644262 tgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaa 43644361  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43644362 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagt 43644442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 12637451 - 12637633
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  12637451 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 12637547  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12637548 atgttgtggagataatcaatataatggtggtgttatcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 12637633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22273758 - 22273577
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22273758 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgtgcatgttttcttgataatgcga 22273659  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22273658 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22273577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 236
Target Start/End: Original strand, 25877236 - 25877399
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  25877236 tgatgttgaatgacattcgttgattattgataatcatgttgatgtgtgataatgaatactatgaattaattgtgtatggccatgttttcttgataatgca 25877335  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 236  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25877336 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 25877399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 11232540 - 11232720
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  11232540 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 11232636  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11232637 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 11232720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 22514387 - 22514567
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  22514387 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 22514483  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22514484 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 22514567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23773406 - 23773225
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  23773406 tgatgttgaatgacattgttgattatttataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 23773310  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23773309 atgttgtcgagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 23773225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 24686955 - 24687136
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||| |    
T  24686955 tgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgta--ggcatgttttcttgataatgc-a 24687051  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24687052 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 24687136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Original strand, 24827855 - 24828034
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  24827855 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 24827952  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24827953 a-tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtggattgttgtcgcattatcgagt 24828034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15632269 - 15632088
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  15632269 tgatgttgaatgatgtcgttgattattgataatcatgttaatgtgggatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 15632170  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
     || |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15632169 ttgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtgttgagaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 15632088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 28776988 - 28777168
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  28776988 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaattctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 28777084  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28777085 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 28777168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 20628684 - 20628864
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  20628684 tgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatg---atgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 20628780  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20628781 -tgt-gtggagataatcaatataattgggtatcgtcctatatattgaggttgaaatagtggattgttgtcacattatcgagtcctt 20628864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22282991 - 22282810
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22282991 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataaagcaa 22282892  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||| | || |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22282891 atgatgtggagatgaacaatataattaggtgctgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22282810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7320362 - 7320174
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7320362 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattttgtatggacatgttttcttgataatgca 7320263  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7320262 aatgttgtggagattatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattggtgtcgcattatcgagtctttgt 7320174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6878316 - 6878134
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgt-gatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| |||||| ||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  6878316 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgtggcgatgatgaatgctatgatttaattatgtatggacatgttttcttgataatgca 6878217  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    || | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6878216 aaggatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgtggtcgcattatcgagtc 6878134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 262
Target Start/End: Original strand, 22691316 - 22691426
Alignment:
Q  152 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22691316 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaactgtggattgttgtcgcattatcg 22691415  T
Q  252 agtccttgtac 262  Q
    |||| ||||||    
T  22691416 agtctttgtac 22691426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 262
Target Start/End: Original strand, 22695963 - 22696073
Alignment:
Q  152 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22695963 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaactgtggattgttgtcgcattatcg 22696062  T
Q  252 agtccttgtac 262  Q
    |||| ||||||    
T  22696063 agtctttgtac 22696073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27260415 - 27260274
Alignment:
Q  114 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 213  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  27260415 tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtatatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatggtcaatataattgggagttgtcctata 27260316  T
Q  214 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260315 tattatggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 27260274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 22581219 - 22581402
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   |||||  ||||| ||  ||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22581219 tgatgttgaatgacattgttgattgttgatgatcatgttgatgttgtgagaatgaatcttatgatttgattatgtatggacatgttttcttgataatgca 22581318  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22581319 aacgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 22581402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 24572678 - 24572865
Alignment:
Q  74 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||  | ||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  24572678 gatgtcgaatgacattgttgatttttgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttgtgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 24572777  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    |||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  24572778 atgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgttatcgcattatcgagtctttgt 24572865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28972913 - 28972727
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||| |||  |||||||    
T  28972913 tgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcatgtcgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttt-cttagtaatgca 28972815  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    ||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28972814 aatgt-gtggagatgatcaatatatatggatgttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattggtgtcgcattatcgagtctttgt 28972727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 269981 - 269878
Alignment:
Q  152 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  269981 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgtggtcgcattatcg 269882  T
Q  252 agtc 255  Q
    ||||    
T  269881 agtc 269878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Original strand, 9654140 - 9654296
Alignment:
Q  98 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 197  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  9654140 ttgataatcatgttgttatgtgatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgttaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataat 9654239  T
Q  198 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9654240 tgggtgttgctctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 9654296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Original strand, 17397894 - 17398061
Alignment:
Q  87 attgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 185  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  |  ||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| |||||| || ||    
T  17397894 attgttgattgttgataatcaagttgtttctgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgttgagat 17397992  T
Q  186 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17397993 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 17398061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 721257 - 721162
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  721257 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgtagtgatgtcgcattatcgagtc 721162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 23822894 - 23822967
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23822894 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23822967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 23824838 - 23824911
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23824838 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23824911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 23831973 - 23832046
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23831973 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23832046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Original strand, 22787408 - 22787506
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22787408 tttcttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagtcgtcctctatattgtggtgaagactgtgagttgatgtcgcattatcgagtc 22787506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 19670515 - 19670576
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19670515 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19670576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22693133 - 22693040
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| ||||||||    
T  22693133 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa 22693040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22697780 - 22697687
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| ||||||||    
T  22697780 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa 22697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 73
Target Start/End: Original strand, 42179645 - 42179693
Alignment:
Q  25 tgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat 73  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42179645 tgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatat 42179693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22693028 - 22692978
Alignment:
Q  208 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22693028 cctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 22692978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22697675 - 22697625
Alignment:
Q  208 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22697675 cctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 22697625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 218
Target Start/End: Original strand, 24088752 - 24088810
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24088752 cttggtaatgcaattgttgtggagataatcaatataattggaagttgtcctttatattg 24088810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 4663 - 4735
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  4663 tttcttgataatgcaa-tgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 4735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 24295958 - 24296031
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  24295958 tttcttgataatgcaaatgttttggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 24296031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19658739 - 19658678
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||| |||||||| |||||||    
T  19658739 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaacatatctggaagttgtcctttatattg 19658678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 32464866 - 32464816
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat 73  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32464866 ggtgaatccatatatgttgtttattatgatatggtggatgaatatatatat 32464816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Original strand, 155643 - 155821
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  155643 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 155740  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155741 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 155821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 733 - 914
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  733 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 829  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  830 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35163 - 35023
Alignment:
Q  116 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 215  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35163 tgtgatgatgaaaactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 35065  T
Q  216 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35064 ttgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 35023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 75 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 87311 - 87127
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||  |||||| |    
T  87311 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactacgatttatttgtgtatggacatgttttcttga--atgcaa-t 87215  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87214 gttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 87127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 138099 - 138286
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||| | |    
T  138099 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatac-a 138197  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  138198 atgttgtggagataatcaatataattaggtgttgtcctatatattgaagtg-aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccctgtac 138286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10540 - 10351
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  ||||  ||  ||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  10540 tgatattgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgatatggtgataatgaatcttatgctttgattgtgtatggatatgttttcttgataatgca 10441  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 261  Q
    ||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10440 aatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtctttgta 10351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 77124 - 77069
Alignment:
Q  207 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77124 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 77069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 75 - 255
Target Start/End: Original strand, 71741 - 71921
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71741 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgcgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 71840  T
Q  175 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  71841 gttgtggagatgatcaatataattgggagttatcctatatattgtggtgaaaattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 71921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14554 - 14364
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttga-ttattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||| |||||||||||||||    
T  14554 tgatgttgaatgacattgttgaattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatagacatgatttcttgataatgca 14455  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14454 aatattgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggagaaaattgtgaattgttgtcgcattgtcgagtccttgtac 14364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 18865 - 19050
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18865 tgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtaattgtgaatactatgatttatttgtgcatgtgcatgttttcttgataatgcaa 18964  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18965 atgatgtggacatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 19050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Original strand, 18718 - 18767
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18718 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32457 - 32268
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  32457 tgatgttgaatgacattgtcgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatgtacatgttttcttgataatgcaa 32358  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32357 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 32268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 90172 - 90353
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  90172 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 90270  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  90271 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtgga---ttgtcgcattatcgagtcctt 90353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 129257 - 129075
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  129257 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggcatgatggtgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 129160  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  129159 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgagattgttaattgttgtcgcattatcgagtcctt 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 78471 - 78410
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  78471 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 78410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1238 - 1057
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1238 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 1139  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1138 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 1057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6105 - 5926
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  6105 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 6008  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6007 atgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattg-agattgttgtcgcattatcgagtc 5926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1336
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1385 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8953 - 8771
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  8953 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgaacatgatgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 8854  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8853 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 8771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4715 - 4530
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  4715 tgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgct 4616  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4615 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 4530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 2864 - 3045
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  2864 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 2960  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2961 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Original strand, 22997 - 23168
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22997 tgaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataaagcaaatgatg 23091  T
Q  179 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23092 tggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 23168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 36556 - 36604
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36556 ggtgtatcgatatacattgtttattatgatttggtgggtgaatatatat 36604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 27800 - 27983
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  27800 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 27898  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27899 atg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcccattatcgagtcctt 27983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Original strand, 9337 - 9394
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 80  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9337 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 9394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40489 - 40291
Alignment:
Q  57 tgggtgaatatatatatgat-gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 155  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  40489 tgggtgaaactatatgtgatagttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatg 40390  T
Q  156 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40389 ttttcttgataatgcaaatgttgtgtagatgaacaatataattgggttttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17521 - 17340
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17521 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgagttgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 17422  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17421 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattg-ggattgttgtcgcattatcgagtc 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 145404 - 145223
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||     
T  145404 tgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttatgtatgggcatgttttcttaataatgcat 145305  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  145304 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 145223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 147664 - 147482
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat-ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  ||| | ||  |||||||||||||||||||||    
T  147664 tgatgttgaaggatcttattgattgttgataatcatgttgatgtgtggtgatgaatactatgatttaaattgtgaattggcatgttttcttgataatgca 147565  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
     ||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  147564 tatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttttcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 147482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 145551 - 145502
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  145551 tgatgttaaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 145502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 258
Target Start/End: Original strand, 2980 - 3163
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||     
T  2980 atgttgaatgacattgttgattgttcataatcaagttaatgtgtgaatggtaaatactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa- 3078  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3079 tgttgtggagataatcaatataattgagtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 3163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 7941 - 8123
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  7941 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 8040  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8041 atgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtc 8123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 13330 - 13512
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  13330 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 13429  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13430 atgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtc 13512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18181 - 18000
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  18181 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatcttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtggatgtgcttgttttcttgataatgcaa 18082  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18081 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20265 - 20084
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  20265 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatcttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtggatgtgcttgttttcttgataatgcaa 20166  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20165 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6051 - 5874
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  6051 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 5955  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5954 atgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 5874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 217036 - 217218
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  217036 tgattttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 217135  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  217136 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattat-gattgttgtcgcattatcgagtc 217218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2056 - 1873
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  2056 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgaagaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 1957  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1956 -tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 1873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 69640 - 69456
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  69640 tgatgttgaatgacattgttgattattgattatcatgatgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 69541  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 257  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  69540 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggttaaaattgtgaattgttgtcgcactatcgagtcct 69456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30946 - 30768
Alignment:
Q  78 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30946 ttgaatgacattgttgattattgatgatcttgttcatgtggtgataatgaatgttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgt 30847  T
Q  177 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30846 tgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 30768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 248
Target Start/End: Original strand, 2419 - 2593
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  2419 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtgatggtgaatactatgatttaaatgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 2518  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 248  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2519 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13073 - 12891
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  13073 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgaggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 12974  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12973 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 12891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 429 - 244
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || | |||||||||||||||||      
T  429 tgatgttgaatgacattattgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggtatgttttcttgataatgtt 330  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  329 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 32479 - 32660
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  32479 tgatgttgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgcaa 32578  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32579 atgatgtggagatgaacaatataattggctgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 32660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34147 - 34037
Alignment:
Q  151 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34147 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 34049  T
Q  251 gagtccttgtac 262  Q
    ||||||||||||    
T  34048 gagtccttgtac 34037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30222 - 30041
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  30222 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 30126  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30125 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 30041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 52562 - 52743
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  52562 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcga 52661  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  52662 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcacattatcgagtc 52743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 56514 - 56695
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  56514 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcga 56613  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  56614 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcacattatcgagtc 56695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 6437 - 6620
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  6437 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 6535  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6536 atg-tgtggagataatcaatataattgggcgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattattgtcgcattatcgagtcctt 6620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25774 - 25591
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25774 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 25676  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25675 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgacatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 25591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21519 - 21336
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21519 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 21421  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21420 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgacatggt-gattgttatcgcattatcgagtcctt 21336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 8)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 258
Target Start/End: Original strand, 14565 - 14735
Alignment:
Q  86 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14565 cattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttt-cttgataatgcaa-tgttgtggagat 14662  T
Q  186 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14663 aatcaatataattaggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggatttttgtcgcattatcgagtcctt 14735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28372 - 28261
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgt-tttcttgataatgc 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||| || |||||||||||    
T  28372 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgtattgcttgataatgc 28273  T
Q  171 aaatgttgtgga 182  Q
    ||||| ||||||    
T  28272 aaatgatgtgga 28261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40368 - 40257
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgt-tttcttgataatgc 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||| || |||||||||||    
T  40368 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgtattgcttgataatgc 40269  T
Q  171 aaatgttgtgga 182  Q
    ||||| ||||||    
T  40268 aaatgatgtgga 40257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 28248 - 28191
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 80  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28248 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatgttgttg 28191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 40244 - 40187
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 80  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40244 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatgttgttg 40187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 23801 - 23862
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23801 tttcttgataatgcaaatgttatggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 23862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28521 - 28472
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  28521 tgatgttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 28472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 40522 - 40468
Alignment:
Q  68 atatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  40522 atatttgattttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 40468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38157 - 37977
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  38157 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa 38061  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38060 -tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 37977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 248827 - 249008
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||     
T  248827 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcag 248926  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  248927 atgatgtgggaatgaacaatataattgggtgttgtcttatatattgtggagaaaattgt-gatttttgttgcattatcgagtc 249008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 223334 - 223382
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  223334 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatat 223382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 247
Target Start/End: Original strand, 5902 - 6069
Alignment:
Q  78 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |||| |    
T  5902 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatgataaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatg-t 5999  T
Q  178 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6000 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatt 6069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7666 - 7485
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||  ||| | |||  ||||||||||||||||||||||    
T  7666 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtggtgatgatgaatcttatgatttgattgtgcatggacatgttttcttgataatgcaaa 7567  T
Q  174 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7566 tgttttggagatgatcaatataattgggagtggtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 7485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2095
Alignment:
Q  76 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatg 175  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1916 tgttgagtgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatg 2015  T
Q  176 ttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| || || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2016 ttgtcgagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatagagtc 2095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41581 - 41399
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  41581 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgagtgctatgacttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 41482  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41481 aatgatgtggagattaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 41399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12732 - 12675
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 80  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12732 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 12675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 335 - 154
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  335 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtcgatgtgtgatggtggatactatgatttaattatgtatggacatattttcttgataatgcaa 236  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  235 atgatgtggagatgaacaatataactgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 11213 - 11394
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11213 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgtgtaatgttgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaa 11312  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11313 atgatgtggagatgaacaatataattgggtcttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gatttttgtcgcattatcgagtc 11394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3534 - 3352
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||  ||| |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  3534 tgatgctgaatgacattgttgattatcgataatcatgttgatgtgtgatgaggaatgctatgaattgattgtgtatggacatattttcttgataatgcaa 3435  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  3434 atgttgtggatatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattttgtattgttgttgcattatcgagtc 3352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3497 - 3318
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  3497 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 3400  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3399 atgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattg-agattgttgtcgcattatcgagtc 3318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27896 - 27714
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  27896 tgatgttgaatgacattgttgatttttgataaataagttattttgtgaatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 27797  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27796 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 27714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 47000 - 46819
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  47000 tgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttcataatgca 46901  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46900 aatgatgtggagatgaacaatat-attgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 60448 - 60267
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  60448 tgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttcataatgca 60349  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  60348 aatgatgtggagatgaacaatat-attgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 60267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 106867 - 106689
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 178  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  106867 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttg 106769  T
Q  179 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  106768 tggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaactgtggatttttgtcgcattatcgagtcctt 106689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16311 - 16132
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 177  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  16311 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 16213  T
Q  178 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16212 gtgaagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 16132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 252
Target Start/End: Original strand, 13481 - 13660
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  ||| ||||||||||||||||    
T  13481 tgatgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgggtgtggacatattttcttgataatgca 13580  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 252  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13581 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcga 13660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Original strand, 6441 - 6620
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 177  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6441 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactttgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttgataatgcaa-tgtt 6539  T
Q  178 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6540 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgaattgttgtcgcattattgagtcctt 6620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 106297 - 106370
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  106297 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 106370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 108446 - 108343
Alignment:
Q  152 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 251  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| |||| || ||||||||| || ||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||   || |||||||||||||    
T  108446 catgatttcttaataatgcaattgttctggagatgatcaatatatttagaaattgtcctttatattgtggtggaaattgtgaggtgatgtcgcattatcg 108347  T
Q  252 agtc 255  Q
    ||||    
T  108346 agtc 108343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 111
Target Start/End: Original strand, 113845 - 113883
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  113845 tgatgttgaatgacattgttgataattgataatcatgtt 113883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 270996 - 270813
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  270996 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatactatggttttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 270897  T
Q  171 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||||| | |||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  270896 aaatgatatggagatgaacaatataattgggttttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 270813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 237056 - 236874
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgt-gatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| |||||| ||| ||  |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  237056 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgtggagatgatgaatgctatgatttaattatgtatggacatattttcttgataatgca 236957  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    || | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  236956 aaagatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtggaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 236874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 51897 - 51719
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 178  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  51897 tgaatgatattgttgattgttgataaccaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttg 51799  T
Q  179 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  51798 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgaattgttgtcgcattattgattcctt 51719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 11323 - 11504
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||  | || |||||||| |||||||||||||    
T  11323 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtgatgatgaatactatgatttaattgtatgtgggcatgtttccttgataatgcaa 11422  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11423 atgatgtggagattaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 11504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 20583 - 20692
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20583 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 20682  T
Q  173 atgttgtgga 182  Q
     |||||||||    
T  20683 gtgttgtgga 20692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 258
Target Start/End: Original strand, 20686 - 20716
Alignment:
Q  228 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20686 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 20716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4970 - 4823
Alignment:
Q  107 atgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttg 206  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  4970 atgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgcgtgtgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttg 4871  T
Q  207 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  4870 tcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgtgttatcgagt 4823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7837 - 7673
Alignment:
Q  91 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 189  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |    
T  7837 ttgattgttgataatcatgttgttgtgtggtgatgaatactatgattttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaac 7738  T
Q  190 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7737 tatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgtattatcgagtc 7673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 17378 - 17561
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||  ||  || || |   ||||||| |||||||||||||    
T  17378 tgatgttgaatgacattgttgattactgataatcgtgttgatgtgtgatgatgaatgctgtgatgtaactgtgtgtagacatgtttccttgataatgcaa 17477  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
     ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17478 -tgttgtggagatgatcaatatcattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 17561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 59016 - 58899
Alignment:
Q  130 ctatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  59016 ctatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgcggagatgatcaatataattgggtgtcgtcttatatattgaggtgaaaatt 58917  T
Q  230 gtggattgttgtcgcatt 247  Q
    ||||||||||||||||||    
T  58916 gtggattgttgtcgcatt 58899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 59422 - 59375
Alignment:
Q  87 attgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatg 134  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  59422 attgatgattattgatgatcatgatgatgtgtgatggtgaatactatg 59375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Original strand, 6634 - 6805
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  6634 tgaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcatgataatgcaaattttg 6728  T
Q  179 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6729 tggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 6805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Original strand, 4902 - 5067
Alignment:
Q  91 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat--ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 188  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |     
T  4902 ttgattgttgataatcatgttgatgtgcggtgatgaatactatgatttttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaa 5001  T
Q  189 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  5002 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattattgtcgcattgtcgagtc 5067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 53376 - 53279
Alignment:
Q  27 aatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat--gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  53376 aatccatatacattctttattatgatatggtgggtgaatatatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 53279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1263
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 177  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  1078 tgaatgataatgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 1176  T
Q  178 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag-gtga-----aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1177 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagattgagattgaaattgtgaattgtggtcgcattatcgagtcctt 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 880 - 771
Alignment:
Q  145 gtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgc 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  880 gtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgc 782  T
Q  245 attatcgagtc 255  Q
    |||||||||||    
T  781 attatcgagtc 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15136 - 15027
Alignment:
Q  145 gtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgc 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  15136 gtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgc 15038  T
Q  245 attatcgagtc 255  Q
    |||||||||||    
T  15037 attatcgagtc 15027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6767 - 6570
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||   ||||         | ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||    
T  6767 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataaggaatcttaattgaattatgatttgattgtgtatggacatgttttctt 6668  T
Q  163 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6667 gataattcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtctttgt 6570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30062 - 29942
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttga-ttattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||  ||||||||||    
T  30062 tgatgttgaatgacattgttgaattattggtaatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgattttatgataatgca 29963  T
Q  172 aatgttgtggaaataatcaat 192  Q
    ||||||||||| || ||||||    
T  29962 aatgttgtggagatgatcaat 29942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27336 - 27260
Alignment:
Q  186 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 262  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336 aatcaatataattgggttttgtcctatatattgaggagaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 27260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 258
Target Start/End: Original strand, 9291 - 9397
Alignment:
Q  151 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 250  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9291 gcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgctgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtagcattatc 9389  T
Q  251 gagtcctt 258  Q
    ||||||||    
T  9390 gagtcctt 9397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5866 - 5700
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 172  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |    
T  5866 tgattttgtatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 5770  T
Q  173 atgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtc 242  Q
    ||||||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  5769 atgttgttgagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtc 5700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15073 - 14987
Alignment:
Q  172 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaagttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 14987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 255
Target Start/End: Original strand, 4092 - 4218
Alignment:
Q  128 tactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa 227  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  4092 tactatgatttaattgtgtatgcgcatgttttcttggtaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgttgtcatatatattgaggagaaaa 4191  T
Q  228 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4192 ttgt-gattcttgtcgcattatcgagtc 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 255
Target Start/End: Original strand, 48932 - 49058
Alignment:
Q  128 tactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa 227  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  48932 tactatgatttaattgtgtatgcgcatgttttcttggtaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgttgtcatatatattgaggagaaaa 49031  T
Q  228 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49032 ttgt-gattcttgtcgcattatcgagtc 49058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4648 - 4534
Alignment:
Q  141 ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttg 240  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4648 ttgcgtatggacatattttattgatgatgcaaatgttgtggagatgatcaaaataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttg 4549  T
Q  241 tcgcattatcgagtc 255  Q
    || ||||||||||||    
T  4548 tcacattatcgagtc 4534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 145794 - 145616
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  145794 tgaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgctaatgttg 145700  T
Q  179 tggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 260  Q
    |||| || ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||    
T  145699 tggagatgatcaatatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatcgtgaattgatgtcgcattatcaagtctttgt 145616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20489 - 20391
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  20489 tttcttgataatgcaattgttgtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgagttgatgtcgcattatcgagtc 20391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27318 - 27220
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  27318 tttcttgataatgcaattgttgtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgagttgatgtcgcattatcgagtc 27220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20527
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  20583 tgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgatgtgatagtgaat 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27412 - 27356
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  27412 tgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgatgtgatagtgaat 27356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Original strand, 197482 - 197572
Alignment:
Q  164 ataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  197482 ataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 197572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 17687 - 17797
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  17687 tgatgttgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 17786  T
Q  172 aatgttgtgga 182  Q
    |||| ||||||    
T  17787 aatgatgtgga 17797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Original strand, 24229 - 24286
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 80  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24229 ggtgaatccatatacattgtttattatgatgtggtgggtgaatatatatatgatgttg 24286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 24106 - 24216
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 171  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  24106 tgatattgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgttatgatttaattgtgtatggacatattttcttgataatgca 24205  T
Q  172 aatgttgtgga 182  Q
    |||| ||||||    
T  24206 aatgatgtgga 24216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 80
Target Start/End: Original strand, 17814 - 17867
Alignment:
Q  27 aatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 80  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17814 aatccatatacattgtttattacgatgtggtgggtgaatatatatatgatgttg 17867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4603 - 4469
Alignment:
Q  114 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 213  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4603 tgtgtgatgataaatactgtgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctata 4505  T
Q  214 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 250  Q
    |||||| ||  | |||| | |||||||||||||||||    
T  4504 tattga-gtcgagattgagaattgttgtcgcattatc 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 34442 - 34334
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 173  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  34442 atgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatacaaa 34343  T
Q  174 tgttgtgga 182  Q
    || ||||||    
T  34342 tgatgtgga 34334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 34321 - 34264
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatatgatgttg 80  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34321 ggtgaatccatatacattggttattatgatgtggtgggtgaatatatatatgatgttg 34264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 260
Target Start/End: Original strand, 2839 - 2942
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 256  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||     
T  2839 tttcttgataataaaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtct 2938  T
Q  257 ttgt 260  Q
    ||||    
T  2939 ttgt 2942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 111
Target Start/End: Original strand, 2745 - 2783
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2745 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgtt 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2209 - 2114
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 252  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2209 tttcttaataataaaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcga 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2303 - 2260
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  2303 tgatgttgaatgacattgttgattatagatgatcatgttgatgt 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 4728 - 4801
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  4728 tttcttgataatgctaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 4801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23947 - 23898
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23947 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtatgatg 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23789 - 23741
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23789 ggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatat 23741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 7041 - 7114
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  7041 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataatttgaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 7114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 164
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  213 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 64 - 1
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatga 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  64 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7387 - 7290
Alignment:
Q  158 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||||| || |||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  7387 ttcttgataatgtaattgttgtagaggtgatcaatatatttggatgttgtcctttatattgttgtggaaattgtggggtgatgtcgcattatcgagtc 7290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 71655 - 71728
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  71655 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatataattggaaggtgtcctttatattgttgtgaaaattg 71728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 229
Target Start/End: Original strand, 3667 - 3739
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  3667 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 3739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1030 - 991
Alignment:
Q  219 aggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1030 aggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 255
Target Start/End: Original strand, 6021 - 6116
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  6021 cttgataatgaaattgttgtggagattatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgttgcattatcgagtc 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 2089 - 2039
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatatat 73  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2089 ggtgaatccatatatattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatat 2039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 117
Target Start/End: Original strand, 3082 - 3124
Alignment:
Q  75 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3082 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtg 3124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4820 - 4759
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  4820 tttcttgagaatgcagatgttgtggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 4759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 229
Target Start/End: Original strand, 117977 - 118049
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  117977 tttcttaataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 118049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 70
Target Start/End: Original strand, 167476 - 167523
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatata 70  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  167476 ggtgaatccatatacattgtttattatgataaggtgggtgaatatata 167523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12986 - 12936
Alignment:
Q  157 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgt 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  12986 tttcttgataatgctaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgt 12936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 1442 - 1394
Alignment:
Q  23 ggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaatatatat 71  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1442 ggtgtatcgatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatat 1394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 217
Target Start/End: Original strand, 78206 - 78265
Alignment:
Q  158 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatatt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  78206 ttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaggctgtcctttatatt 78265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1752 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1752
Description:

Target: scaffold1752; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 467 - 429
Alignment:
Q  73 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  467 tgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgtt 429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34261 - 34203
Alignment:
Q  160 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  34261 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 34203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2761 - 2696
Alignment:
Q  79 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttg 143  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2761 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttg 2696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University