View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11309A_low_42 (Length: 407)

Name: NF11309A_low_42
Description: NF11309A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11309A_low_42
NF11309A_low_42
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (171-394)||(44241355-44241579)
chr1 (171-393)||(29001730-29001953)
chr1 (171-392)||(9869105-9869327)
chr1 (171-394)||(31072316-31072540)
chr1 (169-393)||(4599527-4599753)
chr1 (171-393)||(1174604-1174828)
chr1 (171-393)||(6238654-6238877)
chr1 (171-393)||(39053338-39053561)
chr1 (171-393)||(39059710-39059933)
chr1 (171-393)||(42091895-42092118)
chr1 (171-393)||(45015780-45016003)
chr1 (171-393)||(26621468-26621692)
chr1 (171-393)||(41305514-41305738)
chr1 (171-393)||(44916329-44916560)
chr1 (171-393)||(41297515-41297739)
chr1 (171-388)||(11913262-11913479)
chr1 (202-393)||(27240161-27240354)
chr1 (171-393)||(43686626-43686851)
chr1 (171-393)||(32797735-32797945)
chr1 (171-393)||(41299188-41299412)
chr1 (171-392)||(1115982-1116206)
chr1 (260-393)||(23764521-23764655)
chr1 (235-393)||(5445028-5445186)
chr1 (176-393)||(28413678-28413897)
chr1 (171-250)||(23762336-23762415)
chr1 (176-392)||(39806057-39806274)
chr1 (193-393)||(38672788-38672991)
chr1 (176-393)||(2824824-2825042)
chr1 (180-306)||(47646755-47646883)
chr1 (177-393)||(23251342-23251568)
chr1 (176-283)||(5357752-5357861)
chr1 (176-283)||(45620149-45620258)
chr1 (175-219)||(9316137-9316181)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (171-394)||(2643-2867)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (171-394)||(37026046-37026270)
chr7 (171-393)||(26601911-26602134)
chr7 (171-393)||(15914637-15914860)
chr7 (171-393)||(39432907-39433129)
chr7 (171-393)||(15949158-15949381)
chr7 (171-393)||(3924093-3924316)
chr7 (171-393)||(36875544-36875767)
chr7 (171-393)||(5049912-5050135)
chr7 (171-393)||(14287714-14287937)
chr7 (171-392)||(14298900-14299122)
chr7 (171-393)||(6795437-6795660)
chr7 (171-393)||(23612388-23612611)
chr7 (171-393)||(9642916-9643141)
chr7 (171-393)||(1948633-1948857)
chr7 (171-393)||(6020864-6021088)
chr7 (171-393)||(8185392-8185616)
chr7 (171-393)||(8192952-8193176)
chr7 (171-393)||(48353480-48353704)
chr7 (171-393)||(2446645-2446868)
chr7 (174-394)||(45433583-45433805)
chr7 (171-375)||(21642535-21642740)
chr7 (171-393)||(19089806-19090030)
chr7 (171-393)||(48347096-48347320)
chr7 (171-392)||(33850643-33850865)
chr7 (171-393)||(5056307-5056531)
chr7 (171-393)||(1378946-1379169)
chr7 (171-393)||(8142446-8142669)
chr7 (28-173)||(42422112-42422257)
chr7 (176-393)||(10831130-10831349)
chr7 (176-393)||(11024922-11025141)
chr7 (171-245)||(13774130-13774204)
chr7 (176-393)||(21901193-21901413)
chr7 (342-394)||(1942043-1942095)
chr7 (176-237)||(27954243-27954303)
chr7 (176-219)||(28442628-28442671)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (171-393)||(13671817-13672040)
chr6 (171-390)||(27670096-27670316)
chr6 (171-393)||(31547894-31548117)
chr6 (171-393)||(32328493-32328716)
chr6 (171-393)||(1428423-1428646)
chr6 (171-393)||(34711557-34711780)
chr6 (171-393)||(9864760-9864984)
chr6 (171-393)||(4186684-4186907)
chr6 (171-393)||(11058150-11058373)
chr6 (171-390)||(21262574-21262795)
chr6 (171-393)||(4020235-4020459)
chr6 (171-393)||(4026661-4026885)
chr6 (171-393)||(34655249-34655473)
chr6 (171-393)||(34648798-34649022)
chr6 (171-393)||(4738323-4738547)
chr6 (171-383)||(7069702-7069916)
chr6 (238-394)||(29906888-29907045)
chr6 (238-394)||(30117335-30117492)
chr6 (266-393)||(7062578-7062707)
chr6 (171-314)||(1167480-1167630)
chr6 (176-369)||(10081567-10081762)
chr6 (171-233)||(7062516-7062578)
chr6 (176-312)||(9846601-9846738)
chr6 (171-208)||(29907044-29907081)
chr6 (171-208)||(30117299-30117336)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (171-393)||(22359963-22360186)
chr5 (171-392)||(4973563-4973785)
chr5 (171-393)||(22313829-22314052)
chr5 (171-392)||(5876218-5876440)
chr5 (171-393)||(34357288-34357511)
chr5 (171-393)||(34359079-34359302)
chr5 (171-393)||(2957857-2958081)
chr5 (171-393)||(2966326-2966550)
chr5 (171-393)||(29980458-29980681)
chr5 (171-393)||(30041244-30041467)
chr5 (171-393)||(40958617-40958840)
chr5 (171-393)||(25894649-25894873)
chr5 (171-394)||(2438799-2439022)
chr5 (173-393)||(42150817-42151039)
chr5 (171-393)||(12505765-12505996)
chr5 (171-393)||(29414669-29414892)
chr5 (176-393)||(33794091-33794309)
chr5 (176-393)||(9843348-9843566)
chr5 (176-393)||(2156125-2156341)
chr5 (180-282)||(19853484-19853588)
chr5 (176-283)||(12918955-12919064)
chr5 (176-283)||(30580195-30580304)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (171-393)||(21341882-21342105)
chr2 (171-390)||(2021448-2021668)
chr2 (171-393)||(21331994-21332217)
chr2 (171-393)||(42931372-42931595)
chr2 (171-393)||(16856487-16856709)
chr2 (171-393)||(12950795-12951018)
chr2 (171-393)||(16817330-16817552)
chr2 (171-393)||(36782184-36782408)
chr2 (171-393)||(34834812-34835035)
chr2 (171-393)||(34841256-34841479)
chr2 (171-393)||(29484925-29485149)
chr2 (171-393)||(45011981-45012205)
chr2 (171-394)||(2164026-2164250)
chr2 (171-393)||(15852548-15852772)
chr2 (171-393)||(43267857-43268081)
chr2 (171-393)||(2157611-2157834)
chr2 (171-393)||(13901957-13902180)
chr2 (171-393)||(21067958-21068181)
chr2 (171-320)||(45700644-45700793)
chr2 (176-394)||(41455604-41455823)
chr2 (171-335)||(11909950-11910116)
chr2 (176-335)||(17784443-17784604)
chr2 (180-318)||(13162892-13163032)
chr2 (176-335)||(17789096-17789257)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (171-394)||(16405340-16405568)
chr4 (171-393)||(55462772-55462995)
chr4 (171-393)||(16838359-16838581)
chr4 (171-393)||(27590304-27590527)
chr4 (171-394)||(41372984-41373209)
chr4 (172-393)||(37368315-37368538)
chr4 (171-393)||(13594105-13594330)
chr4 (171-393)||(7780406-7780629)
chr4 (171-393)||(8103880-8104104)
chr4 (171-393)||(30238259-30238482)
chr4 (171-393)||(17456853-17457077)
chr4 (171-388)||(36754791-36755017)
chr4 (171-365)||(30211536-30211731)
chr4 (171-318)||(5660549-5660696)
chr4 (194-394)||(13003809-13004011)
chr4 (176-393)||(2947844-2948062)
chr4 (297-393)||(48914898-48914996)
chr4 (361-393)||(5660743-5660775)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (171-393)||(12768743-12768966)
chr8 (171-393)||(11358193-11358417)
chr8 (171-393)||(7311348-7311571)
chr8 (171-393)||(8013320-8013543)
chr8 (171-393)||(36005482-36005705)
chr8 (171-394)||(36075965-36076189)
chr8 (171-393)||(36425730-36425954)
chr8 (171-393)||(6464576-6464799)
chr8 (171-387)||(15012393-15012610)
chr8 (171-393)||(36021799-36022023)
chr8 (171-393)||(41242116-41242339)
chr8 (171-393)||(1238212-1238436)
chr8 (171-393)||(16710668-16710892)
chr8 (171-314)||(26250591-26250734)
chr8 (171-394)||(31017397-31017608)
chr8 (171-363)||(45068416-45068609)
chr8 (176-393)||(7933931-7934150)
chr8 (340-393)||(14393733-14393786)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (171-393)||(4311486-4311709)
chr3 (171-394)||(10941304-10941528)
chr3 (171-393)||(32746369-32746592)
chr3 (171-393)||(6036265-6036488)
chr3 (171-393)||(24179072-24179296)
chr3 (171-394)||(9570548-9570774)
chr3 (171-393)||(27501967-27502191)
chr3 (171-393)||(13014985-13015208)
chr3 (171-394)||(9577050-9577276)
chr3 (171-393)||(43995068-43995300)
chr3 (171-393)||(25893229-25893458)
chr3 (171-393)||(43931581-43931799)
chr3 (171-394)||(23068462-23068686)
chr3 (267-393)||(41353860-41353987)
chr3 (181-318)||(20651135-20651272)
chr3 (243-393)||(41354142-41354293)
chr3 (176-394)||(4590792-4591012)
chr3 (327-396)||(3577095-3577164)
chr3 (176-394)||(20952759-20952987)
chr3 (176-283)||(4644354-4644463)
chr3 (176-233)||(2785865-2785922)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (171-394)||(49689-49912)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (171-394)||(15169-15393)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (171-393)||(5005-5228)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (171-393)||(3264-3486)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (171-393)||(8881-9105)
scaffold0510 (171-393)||(2560-2784)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (171-312)||(12014-12155)
scaffold0513 (329-393)||(11949-12014)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (287-393)||(99913-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (194-394)||(24268-24470)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 44241579 - 44241355
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44241579 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 44241480  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241479 aatgaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttcatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 44241380  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44241379 aatgatatttggtgtcgaacggtct 44241355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29001953 - 29001730
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  29001953 tattatttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgacc 29001854  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29001853 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 29001754  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29001753 aatgatatttggtgtcgaacggtc 29001730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 171 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9869327 - 9869105
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9869327 tattgtttggacacgaaagatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 9869228  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  9869227 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaattttatcatttgcaacttagtcattaaaacaaactaccaattatcttttaacttag 9869128  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9869127 aatgatatttggtgtcgaacggt 9869105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31072540 - 31072316
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  31072540 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagagtccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 31072441  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31072440 aaggaactctaatcctaacaagtttcatgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttagcttag 31072341  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31072340 aatgatatttggtgtcgaacggtct 31072316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 169 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4599753 - 4599527
Alignment:
Q  169 agtattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4599753 agtattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaa 4599654  T
Q  269 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaact 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4599653 tcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaact 4599554  T
Q  367 tagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4599553 tagaatgatatttggtgtcgaacggtc 4599527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1174828 - 1174604
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1174828 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgctc 1174729  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  1174728 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttcaactta 1174629  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1174628 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 1174604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6238877 - 6238654
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6238877 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6238778  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  6238777 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6238678  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6238677 aatgatatttggtgtcgaacggtc 6238654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 39053338 - 39053561
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39053338 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 39053437  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  39053438 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 39053537  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39053538 aatgatatttggtgtcgaacggtc 39053561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 39059710 - 39059933
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39059710 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 39059809  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  39059810 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 39059909  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39059910 aatgatatttggtgtcgaacggtc 39059933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 42092118 - 42091895
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  42092118 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 42092019  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  42092018 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 42091919  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42091918 aatgatatttggtgtcgaacggtc 42091895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 45016003 - 45015780
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  45016003 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 45015904  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  45015903 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 45015804  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45015803 aatgatatttggtgtcgaacggtc 45015780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26621692 - 26621468
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26621692 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 26621593  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26621592 aaggaaccctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgaaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 26621493  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26621492 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 26621468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 41305514 - 41305738
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  41305514 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttaatc 41305613  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  41305614 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttaaactta 41305713  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41305714 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 41305738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 44916560 - 44916329
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |     
T  44916560 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgtttggtt 44916461  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgc---------aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtt 361  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  44916460 aaggaattctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaacatagttaacttagtttttaaaacaaacaacaaactatcttt 44916361  T
Q  362 taacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44916360 taatttagaatgatatttggtgtcgaatggtc 44916329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 41297739 - 41297515
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  41297739 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgaggatcgatc 41297640  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  41297639 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaactta 41297540  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  41297539 gaatgatatttggagtcgaacggtc 41297515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Original strand, 11913262 - 11913479
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||    
T  11913262 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacatgtgatgcttggtc 11913361  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 367  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||   || |||||||| |||||  |||| ||| |||||    
T  11913362 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattcgcaacttag---tttaaacaaacaaacaatctatcttttaaactt 11913458  T
Q  368 agaatgatatttggtgtcgaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11913459 agaatgatatttggtgtcgaa 11913479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 202 - 393
Target Start/End: Original strand, 27240161 - 27240354
Alignment:
Q  202 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgcc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27240161 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgcc 27240260  T
Q  302 ttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27240261 ttattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttggaatggtatttggtgtcgaacggtc 27240354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 43686851 - 43686626
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||    
T  43686851 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttaaatgagacgctcgatc 43686752  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  43686751 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacagattatctttttaactt 43686652  T
Q  368 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  43686651 ggaatggtatttggtgtcgaacggtc 43686626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32797945 - 32797735
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  32797945 tattgtttggacacgaattgtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 32797846  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaag-tttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||            |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32797845 aaggaactctaatcctaacaagtttttacgccctattactc------------ttgcaacttagtttctaaaacaaacaacaaattatc-tttaacttag 32797759  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32797758 aatgatatttggtgtcgaacggtc 32797735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 41299188 - 41299412
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  41299188 tattgtttggaaaagaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattaggttatatgtgacgcttaatc 41299287  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  41299288 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaataaattatcttttaactta 41299387  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41299388 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 41299412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 171 - 392
Target Start/End: Original strand, 1115982 - 1116206
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggt---gttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1115982 tattgtttggacacaaatggtagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaaggtagaatccatgtatagtcattaggttacgtgtgacgcttg 1116081  T
Q  268 atcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaact 366  Q
    || |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  1116082 attaaggaactctaatcataagaagtttcacaccttattactctcaacttttactcttgcaacttagttact-aaacaaacaacaaattagcttttaact 1116180  T
Q  367 tagaatgatatttggtgtcgaacggt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1116181 tagaatgatatttggtgtcgaacggt 1116206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 260 - 393
Target Start/End: Original strand, 23764521 - 23764655
Alignment:
Q  260 gacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23764521 gacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc 23764620  T
Q  359 gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23764621 gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 23764655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 393
Target Start/End: Original strand, 5445028 - 5445186
Alignment:
Q  235 catgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttag 333  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  5445028 catgtatggtcattaggttatgtgtgaggcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaacttttactcttgcaacttag 5445127  T
Q  334 ttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5445128 ttactaaaacaaacaacaaattatc-tttaacttagaatgatagttggtgtcgaacggtc 5445186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 393
Target Start/End: Original strand, 28413678 - 28413897
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  28413678 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatattggtaaaatgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 28413777  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 372  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28413778 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 28413876  T
Q  373 gatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28413877 gatatttggtgtcgaacggtc 28413897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 250
Target Start/End: Original strand, 23762336 - 23762415
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23762336 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 23762415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39806274 - 39806057
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| ||| |||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  39806274 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctggaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 39806175  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 372  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||||| |||  |  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  39806174 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaatttttactcttgcaacttagtttctaaaacgaacaacaaattatc-tttaacttaaaat 39806077  T
Q  373 gatatttggtgtcgaacggt 392  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  39806076 gatatttggtgtcaaacggt 39806057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 393
Target Start/End: Original strand, 38672788 - 38672991
Alignment:
Q  193 ttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaaca 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || || || ||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||      
T  38672788 ttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattatcaggttatgtttgacgcttaatcaaggaactctaattccaatg 38672887  T
Q  291 agtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaa-cttagaatgatatttggtgtcgaa 388  Q
      ||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  38672888 ttttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaacttagtttctaaaacgaacaacaaattatctttcaaacttagaatgatatttggtgtcgaa 38672986  T
Q  389 cggtc 393  Q
    |||||    
T  38672987 cggtc 38672991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 393
Target Start/End: Original strand, 2824824 - 2825042
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||| ||| ||||  || ||||| ||| || |||||| | ||||||    
T  2824824 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatgggtaaaacgctagaattcatatatgtgattattaggttatgtttgacgcataatcaag 2824923  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 373  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2824924 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaactttcacttttatacttggttactaaaacaaacaacatattatcttttaacttagaatg 2825022  T
Q  374 atatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  2825023 atatttggtgtcgaatggtc 2825042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47646883 - 47646755
Alignment:
Q  180 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc--atgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 277  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  || | |||||||||| |||  |||||  |||| |||| ||||    
T  47646883 gacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaatccgtatatgtgatcattaggttatatgtgattcttggtcaacgaac 47646784  T
Q  278 tctaatactaacaagtttcacgccttatt 306  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  47646783 tctaatcataacaagttttacgccttatt 47646755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23251568 - 23251342
Alignment:
Q  177 ttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat--gatcattagattacgtgtgacgcttgatcaagg 274  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| |||  ||| ||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  23251568 ttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgcgattattaggttatgtttgacgcttaatcaagg 23251469  T
Q  275 aactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtta--tta-----aaacaaac-aacaaattatcgtttaac 365  Q
    ||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||| | |||||||  |||     |||||||| ||||| |  || ||||||    
T  23251468 aactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaacttttattcttgcgaattagttaacttagttacaaacaaacaaacaactactcttttaac 23251370  T
Q  366 ttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  23251369 ttcgaatgatatttggtgtcgaacggtc 23251342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Original strand, 5357752 - 5357861
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  5357752 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatattgggaaaatgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 5357851  T
Q  274 gaactctaat 283  Q
    ||||||||||    
T  5357852 gaactctaat 5357861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Original strand, 45620149 - 45620258
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||    
T  45620149 tttggacacgaataatcttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgaagcttaatcaag 45620248  T
Q  274 gaactctaat 283  Q
    ||||||||||    
T  45620249 gaactctaat 45620258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9316181 - 9316137
Alignment:
Q  175 gtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  9316181 gtttggacacgaatgatgttgttgagcaatatgtgataatatcaa 9316137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2867 - 2643
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2867 tattgtttggatacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctataatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 2768  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2767 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttgcagcttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 2668  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2667 aatgatatttggtgtcgaacggtct 2643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37026270 - 37026046
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37026270 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatcaatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 37026171  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026170 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttacaacttagttagtcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 37026071  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37026070 aatgatatttggtgtcgaacggtct 37026046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26602134 - 26601911
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26602134 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgttcattaggttatgtgtgacgcttgatc 26602035  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602034 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 26601935  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26601934 aatgatatttggtgtcgaacggtc 26601911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15914860 - 15914637
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15914860 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatc 15914761  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914760 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 15914661  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15914660 aatgatatttggtgtcgaacggtc 15914637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 39433129 - 39432907
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39433129 tattgtttggacacgaatggcgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 39433030  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttaga 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39433029 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaactttatcatttgcacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttaga 39432930  T
Q  371 atgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  39432929 atgatatttgttgtcgaacggtc 39432907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15949381 - 15949158
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||    
T  15949381 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatatgcgacgcttgatc 15949282  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949281 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 15949182  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15949181 aatgatatttggtgtcgaacggtc 15949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 3924093 - 3924316
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3924093 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 3924192  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  3924193 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 3924292  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  3924293 aatgatatttggtatcgaacggtc 3924316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 36875767 - 36875544
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36875767 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatatatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 36875668  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36875667 aaggaactccaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 36875568  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36875567 aatgatatttggtgtcgaacggtc 36875544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 5049912 - 5050135
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5049912 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5050011  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  5050012 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttgg 5050111  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5050112 aatgatatttggtgtcgaacggtc 5050135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14287937 - 14287714
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||    
T  14287937 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagggtacgtgcgacgttcgatc 14287838  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14287837 aaggaactctaatcctaacaagatttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 14287738  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14287737 aatgatatttggtgtcgaacggtc 14287714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 171 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14299122 - 14298900
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||    
T  14299122 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagggtacgtgcgacgttcgatc 14299023  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14299022 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 14298923  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggt 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  14298922 aatgatatttggtgtcaaacggt 14298900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6795660 - 6795437
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6795660 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6795561  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  6795560 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6795461  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6795460 aatgatatttggtgtcgaacggtc 6795437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23612611 - 23612388
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23612611 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 23612512  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  23612511 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgtaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 23612412  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  23612411 aatgatatttcgtgtcgaacggtc 23612388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 9642916 - 9643141
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9642916 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9643015  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  9643016 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacatattatctttttaactt 9643115  T
Q  368 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9643116 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 9643141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 1948633 - 1948857
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     
T  1948633 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatctcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatt 1948732  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1948733 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaactttatcttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 1948832  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  1948833 gaatgatatttggtgttgaacggtc 1948857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 6020864 - 6021088
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6020864 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 6020963  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  6020964 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 6021063  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  6021064 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 6021088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 8185392 - 8185616
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8185392 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 8185491  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  8185492 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 8185591  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8185592 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 8185616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 8192952 - 8193176
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8192952 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 8193051  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  8193052 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 8193151  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8193152 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 8193176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 48353480 - 48353704
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48353480 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 48353579  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  48353580 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 48353679  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  48353680 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 48353704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2446868 - 2446645
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2446868 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2446769  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  2446768 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2446669  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  2446668 aatgatatttggtgtcgaatggtc 2446645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 174 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 45433805 - 45433583
Alignment:
Q  174 tgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  45433805 tgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgattaag 45433706  T
Q  274 gaactctaatactaacaag-tttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaa 371  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45433705 gaactctaatcctaacaagtttttacgccttattactctcaacttttactcttgaaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaa 45433606  T
Q  372 tgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  45433605 tgatatttggtgtcgaacggtct 45433583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 171 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21642740 - 21642535
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  21642740 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaatgaaaagctagaatccatgtttgttcattaggttatgtgtgatgcttgatc 21642641  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21642640 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 21642541  T
Q  370 aatgat 375  Q
    ||||||    
T  21642540 aatgat 21642535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19090030 - 19089806
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19090030 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 19089931  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19089930 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 19089831  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19089830 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 19089806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 48347096 - 48347320
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48347096 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 48347195  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  48347196 aaggaactctaatcctaacaagtttcatgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 48347295  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  48347296 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 48347320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 171 - 392
Target Start/End: Original strand, 33850643 - 33850865
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  33850643 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatagtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 33850742  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  33850743 aaggaactctaatcctaacaagtttaacgccttactactctcaacttttactattgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattgacttttaacttag 33850842  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggt 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  33850843 aatgatatttggtgtcaaacggt 33850865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 5056307 - 5056531
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5056307 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5056406  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||     
T  5056407 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatctttttacttg 5056506  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  5056507 aaatgataattggtgtcgaacggtc 5056531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1379169 - 1378946
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1379169 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 1379070  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  1379069 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 1378970  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1378969 aatgatatttggtgtcgaacggtc 1378946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 8142446 - 8142669
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8142446 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 8142545  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| || | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  8142546 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgtaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 8142645  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8142646 aatgatatttggtgtcgaacggtc 8142669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 42422257 - 42422112
Alignment:
Q  28 gagagcatgtagctcttgtgctgctttgaaaatagtccaacatcgggagcttttaaacaatagagaggaagtttatatataaaacacaacgcttatcact 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  42422257 gagagcatgtagctcttgtgctgttgtgaaaatattccaacatcgggagcttttaaacaatagagaggaagtttatatataaaatgcagcgcttatcact 42422158  T
Q  128 ccttggtggtctacaaagtaaatgtcaatcttaaaagttatagtat 173  Q
     ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42422157 tcttagtggcctacaaagcaaatggcaatcttaaaagttatagtat 42422112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 176 - 393
Target Start/End: Original strand, 10831130 - 10831349
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10831130 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaactctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 10831229  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 372  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10831230 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 10831328  T
Q  373 gatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10831329 gatatttggtgtcgaacggtc 10831349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 176 - 393
Target Start/End: Original strand, 11024922 - 11025141
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  11024922 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaactctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 11025021  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 372  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11025022 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 11025120  T
Q  373 gatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11025121 gatatttggtgtcgaacggtc 11025141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 245
Target Start/End: Original strand, 13774130 - 13774204
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatc 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13774130 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatc 13774204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 393
Target Start/End: Original strand, 21901193 - 21901413
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  21901193 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatgtttgacgcttaatcaag 21901292  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaa 371  Q
    ||||||| || |||||   ||| ||||| ||||| ||||||||||  | || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  21901293 gaactctgattctaacgttttt-acgccctattactctcaacttttacttttgaaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttcaacttagaa 21901391  T
Q  372 tgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  21901392 tgatatatggtgtcgaacggtc 21901413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1942095 - 1942043
Alignment:
Q  342 acaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1942095 acaaacaacaaattatcgtttaacttataatgatatttggtgtcgaacggtct 1942043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27954303 - 27954243
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccat 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  27954303 tttggacacgaatgatgttgttgaggaatatgtgataatatc-gagtaaagctagaatccat 27954243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28442671 - 28442628
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaa 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28442671 tttggacacgaatgatgttgttgagcgatatgtgataatatcaa 28442628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 13671817 - 13672040
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13671817 tattgtttggacactaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 13671916  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13671917 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgcattattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaataaacaacaaattatcgtttaacttat 13672016  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13672017 aatgatatttggtgtcgaacggtc 13672040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 171 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27670316 - 27670096
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27670316 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgattattaggttacgtgtgacacttgatc 27670217  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670216 aaggaactctaatcctaacaagtttcacactttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 27670117  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacg 390  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27670116 aatgatatttggtgtcgaacg 27670096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 31548117 - 31547894
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31548117 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 31548018  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  31548017 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaactaag 31547918  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31547917 aatgatatttggtgtcgaacggtc 31547894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 32328493 - 32328716
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  32328493 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttatatgtgacgctcgatc 32328592  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32328593 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 32328692  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  32328693 aatgatatctggtgtcgaacggtc 32328716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 1428423 - 1428646
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1428423 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 1428522  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  1428523 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 1428622  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1428623 aatgatatttggtgtcgaacggtc 1428646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 34711557 - 34711780
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34711557 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34711656  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34711657 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34711756  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34711757 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34711780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 9864760 - 9864984
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9864760 tattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaagttacgtgtgacgcttgatc 9864859  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  9864860 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaactta 9864959  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  9864960 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 9864984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4186907 - 4186684
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4186907 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 4186808  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4186807 aaggaactctaatcctaacaagttctacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 4186708  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  4186707 aattatatttggtgtcgaacggtc 4186684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 11058150 - 11058373
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  11058150 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 11058249  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  11058250 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 11058349  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11058350 aatgatatttggtgtcgaacggtc 11058373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 171 - 390
Target Start/End: Original strand, 21262574 - 21262795
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21262574 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 21262673  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21262674 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 21262773  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21262774 gaatgatatttggtgtcgaacg 21262795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 4020235 - 4020459
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4020235 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4020334  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  4020335 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4020434  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4020435 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 4020459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 4026661 - 4026885
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4026661 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4026760  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  4026761 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4026860  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4026861 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 4026885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 34655473 - 34655249
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34655473 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 34655374  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  34655373 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 34655274  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  34655273 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 34655249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 34649022 - 34648798
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34649022 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 34648923  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | || || ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  34648922 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagatactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 34648823  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  34648822 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 34648798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 4738323 - 4738547
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4738323 tattgtttggactcgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4738422  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  4738423 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4738522  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4738523 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 4738547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 171 - 383
Target Start/End: Original strand, 7069702 - 7069916
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7069702 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 7069801  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  7069802 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 7069901  T
Q  369 gaatgatatttggtg 383  Q
    ||||| |||||||||    
T  7069902 gaatggtatttggtg 7069916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 238 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29907045 - 29906888
Alignment:
Q  238 gtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 336  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  29907045 gtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattagcaatttagtta 29906946  T
Q  337 ttaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29906945 ctaaaacaaacaacaaattatattttaacttagaatgatatttagtgtcgaacggtct 29906888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 238 - 394
Target Start/End: Original strand, 30117335 - 30117492
Alignment:
Q  238 gtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 336  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  30117335 gtatggtccttaggttacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattagcaatttagtta 30117434  T
Q  337 ttaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30117435 ctaaaacaaacaacaaattatattttaacttagaatgatatttagtgtcgaacggtct 30117492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 393
Target Start/End: Original strand, 7062578 - 7062707
Alignment:
Q  266 tgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gttta 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||    
T  7062578 tgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttta 7062677  T
Q  364 acttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7062678 acttggaatggtatttggtgtcgaacggtc 7062707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 314
Target Start/End: Original strand, 1167480 - 1167630
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaaga-------aaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacg 263  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||| |       ||| ||||||||| | ||||||||| || ||| ||||||||    
T  1167480 tattatttggacacgaacgatattgttgagggatacatgataatataaaaaataaaaaaaaaactagaatccgtatatgatcatcaggttatgtgtgacg 1167579  T
Q  264 cttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa 314  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167580 cttgatcaaagaattctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaa 1167630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 369
Target Start/End: Original strand, 10081567 - 10081762
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10081567 tttggacacgaataatcttgttgagcgatatgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 10081666  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc-aactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10081667 gaactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaaattttactcttgcaacttagtttctaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 10081762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 233
Target Start/End: Original strand, 7062516 - 7062578
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7062516 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaat 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9846738 - 9846601
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc--atgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||  || | |||| || || ||| || |||||||| |||||     
T  9846738 tttgaacacgaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcgataaaatgctagaatccgtatatgtgattatcaggttatgtttgacgcttaatcaac 9846639  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc 312  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||    
T  9846638 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattaatctc 9846601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29907081 - 29907044
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29907081 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggacacgt 29907044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 208
Target Start/End: Original strand, 30117299 - 30117336
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30117299 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggacacgt 30117336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22360186 - 22359963
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22360186 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 22360087  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360086 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 22359987  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  22359986 aataatatttggtgtcgaacggtc 22359963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 171 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4973785 - 4973563
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4973785 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattatgttacgtgtgacgcttgatc 4973686  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4973685 aaggaactctgatcctaacaagtttcaccccttattaatctcaattttatcatttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 4973586  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4973585 aatgatatttggtgtcgaacggt 4973563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22314052 - 22313829
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22314052 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtacggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 22313953  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22313952 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaataacaaattatcgtttaacttag 22313853  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22313852 aatgatatttggtgtcgaacggtc 22313829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 171 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5876440 - 5876218
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  5876440 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatc 5876341  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876340 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 5876241  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggt 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  5876240 aatgatatttggtgttgaacggt 5876218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 34357288 - 34357511
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34357288 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34357387  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34357388 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34357487  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34357488 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34357511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 34359079 - 34359302
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34359079 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34359178  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34359179 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34359278  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34359279 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34359302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2958081 - 2957857
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2958081 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 2957982  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  2957981 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 2957882  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  2957881 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 2957857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2966550 - 2966326
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2966550 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 2966451  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  2966450 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 2966351  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  2966350 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 2966326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29980681 - 29980458
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  29980681 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 29980582  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  29980581 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 29980482  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29980481 aatgatatttggtgtcgaacggtc 29980458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 30041244 - 30041467
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  30041244 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 30041343  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  30041344 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 30041443  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30041444 aatgatatttggtgtcgaacggtc 30041467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 40958617 - 40958840
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40958617 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgaggaatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 40958716  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |    
T  40958717 aaggaactctaatcctaacaagtgttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaataaccaattatcttttaacttgg 40958816  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40958817 aatgatatttggtgtcgaacggtc 40958840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 25894649 - 25894873
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25894649 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcgatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 25894748  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  25894749 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 25894848  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  25894849 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 25894873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2439022 - 2438799
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  2439022 tattgtttggacacaaatgatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgcatg-tcattaggttacgtgtgacgcttgatt 2438924  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||     
T  2438923 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcacttttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattttcttttaacttat 2438824  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||    
T  2438823 aatgatttttggtatcggacggtct 2438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 173 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 42151039 - 42150817
Alignment:
Q  173 ttgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaa 272  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  42151039 ttgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgattaa 42150940  T
Q  273 ggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaacttaga 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  42150939 ggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaacttaga 42150840  T
Q  371 atgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  42150839 atgatatttggagtcgaacggtc 42150817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 12505765 - 12505996
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  12505765 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagagaagctagaatccatgtataatcattaggttacgtgggactcttgatc 12505864  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta--tta------aaacaaacaacaaattatcgtt 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||      ||| |||||||||| |||| ||    
T  12505865 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttattattcgcaacatagttaacttagtttctaaataaacaacaaactatcttt 12505964  T
Q  362 taacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  12505965 taacttaaaatggtatttggtgtcgaaaggtc 12505996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 29414669 - 29414892
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29414669 tattgtttgaacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 29414768  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||    ||   | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29414769 aagaaattctaatcctaataagttttacgccctattactctcgactttcaattttatatttgcttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaacttag 29414868  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  29414869 aatgatatttggtgttgaacggtc 29414892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 176 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 33794309 - 33794091
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| |||||     
T  33794309 tttggatacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcagtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaa 33794210  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 372  Q
    |||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33794209 gaactctaattccaacattttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaacttagtttctaaaacatacaacaaattatc-tttaacttagaat 33794112  T
Q  373 gatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  33794111 gatatttggtgtcaaacggtc 33794091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9843566 - 9843348
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  9843566 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 9843467  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 373  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  9843466 gaactctaattccaatgttttt-acgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttagaatg 9843368  T
Q  374 atatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9843367 atatttggtgtcgaacggtc 9843348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 393
Target Start/End: Original strand, 2156125 - 2156341
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  2156125 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacactagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 2156224  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aacttagaat 372  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| |||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2156225 gaactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaactttcacttttacacttggttactaaaaca---aacaaattatcttttaaacttagaat 2156320  T
Q  373 gatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2156321 gatatttggtgtcgaacggtc 2156341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Original strand, 19853484 - 19853588
Alignment:
Q  180 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 277  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  19853484 gacatgaatgatgttgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatgtttgacgcttaatcaacgaac 19853583  T
Q  278 tctaa 282  Q
    |||||    
T  19853584 tctaa 19853588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Original strand, 12918955 - 12919064
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  || | ||||| ||| || |||||||| | ||||    
T  12918955 tttggacacgaatagtcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtggttattaggttatgtttgacgcttaaccaag 12919054  T
Q  274 gaactctaat 283  Q
    ||||||||||    
T  12919055 gaactctaat 12919064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Original strand, 30580195 - 30580304
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| |||||     
T  30580195 tttggacacgaatgatgtcgtcgaccgatacgtgataatatcgataaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaac 30580294  T
Q  274 gaactctaat 283  Q
    ||||||||||    
T  30580295 gaactctaat 30580304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 21341882 - 21342105
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21341882 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 21341981  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21341982 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagtcattaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 21342081  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21342082 aatgatatttggtgtcgaacggtc 21342105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 171 - 390
Target Start/End: Original strand, 2021448 - 2021668
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2021448 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 2021547  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2021548 aaggaactctaatcctaacaagttttacaccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 2021647  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacg 390  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2021648 aatgatatttggtgtcgaacg 2021668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 21331994 - 21332217
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21331994 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 21332093  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  21332094 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgaaatttagtcattaaaacaaacaaccaactatcttttaacttag 21332193  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21332194 aatgatatttggtgtcgaacggtc 21332217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 42931372 - 42931595
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  42931372 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacatttgatc 42931471  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |    
T  42931472 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatctgttaacttgg 42931571  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42931572 aatgatatttggtgtcgaacggtc 42931595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 16856487 - 16856709
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16856487 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 16856586  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16856587 aagaaactctaatcctaacaagtnttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaactttg 16856685  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  16856686 aatgatatttgctgtcgaacggtc 16856709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12951018 - 12950795
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  12951018 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 12950919  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  12950918 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 12950819  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12950818 aatgatatttggtgtcgaacggtc 12950795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 16817330 - 16817552
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16817330 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 16817429  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16817430 aagaaactctaatcctaacaagtgttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaactttg 16817528  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  16817529 aatgatatttgctgtcgaacggtc 16817552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 36782184 - 36782408
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36782184 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 36782283  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  36782284 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 36782383  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  36782384 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 36782408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 34834812 - 34835035
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34834812 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34834911  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34834912 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34835011  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34835012 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34835035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 34841256 - 34841479
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34841256 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34841355  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34841356 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34841455  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34841456 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34841479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29485149 - 29484925
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29485149 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 29485050  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  29485049 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 29484950  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  29484949 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 29484925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 45012205 - 45011981
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45012205 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 45012106  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  45012105 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 45012006  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  45012005 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 45011981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2164250 - 2164026
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2164250 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtataatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2164151  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  2164150 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2164051  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2164050 aatgatatttggtgtcgaacggtct 2164026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15852772 - 15852548
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15852772 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttaagtgtgacgcttgatc 15852673  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  15852672 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 15852573  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15852572 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 15852548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 43268081 - 43267857
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  43268081 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 43267982  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  43267981 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaacttg 43267882  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  43267881 aaatgataattggtgtcgaacggtc 43267857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2157834 - 2157611
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2157834 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2157735  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  2157734 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2157635  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2157634 aatgatatttggtgtcgaacggtc 2157611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 13901957 - 13902180
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13901957 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 13902056  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  13902057 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 13902156  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13902157 aatgatatttggtgtcgaacggtc 13902180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 21067958 - 21068181
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||    
T  21067958 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgatgcctgctc 21068057  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21068058 aaggaactctaatcctaa-aagtttcacaccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaatacaaacaaacaaattatcttttaactta 21068156  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21068157 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 21068181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 171 - 320
Target Start/End: Original strand, 45700644 - 45700793
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  45700644 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccaggtatgatcattaggttatgtgtgacgtttgatc 45700743  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttat 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45700744 aaggaactctaattctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttat 45700793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 176 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41455823 - 41455604
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| | | |||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  41455823 tttggacacgaataatcttgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacggtggaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 41455724  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 373  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41455723 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaatg 41455625  T
Q  374 atatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41455624 atatttggtgtcgaacggtct 41455604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 335
Target Start/End: Original strand, 11909950 - 11910116
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatga--tcattagattacgtgtgacgcttga 268  Q
    |||| |||||||||||||  | |||| ||  |||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||   ||||| |||||  || || ||||||    
T  11909950 tattatttggacacgaataatattgtcgactgatacgtgataatatagattaaaagctagaatccgtatatgtggtcattggattatatgggatgcttga 11910049  T
Q  269 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagtt 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||    
T  11910050 tcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcacttttattcttgcaaattagtt 11910116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 335
Target Start/End: Original strand, 17784443 - 17784604
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||| ||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  17784443 tttggacacgaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaattcatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 17784542  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt 335  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17784543 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattactctcaacttttatctttgcaaattagtt 17784604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13163032 - 13162892
Alignment:
Q  180 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 277  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||  | ||||  |||||||  |||  || ||  |||| |||| ||||    
T  13163032 gacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatattgattaaaagctagaatctgtatatgtgatcattatgttatatgcgattcttggtcaatgaac 13162933  T
Q  278 tctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 318  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13162932 tctaatcctaacaagttttacgccttattactctcaacttt 13162892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 335
Target Start/End: Original strand, 17789096 - 17789257
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||  ||| || |||||||| ||||||    
T  17789096 tttggacaggaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattatgttatgtttgacgcttaatcaag 17789195  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt 335  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17789196 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattactctcaacttttatctttgcaaattagtt 17789257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16405568 - 16405340
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatat----caaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgctt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16405568 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacattataatatatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctt 16405469  T
Q  267 gatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16405468 gatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaac 16405369  T
Q  366 ttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16405368 ttagaacgatatttggtgtcgaacggtct 16405340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 55462772 - 55462995
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55462772 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 55462871  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  55462872 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 55462971  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  55462972 aatgatatttggtgtcgaacggtc 55462995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 16838359 - 16838581
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16838359 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 16838458  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16838459 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaacttag 16838557  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  16838558 aatgatatttggtgtctaacggtc 16838581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27590527 - 27590304
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27590527 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 27590428  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  27590427 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 27590328  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  27590327 aatggtatttggtgtcgaacggtc 27590304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41373209 - 41372984
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41373209 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 41373110  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41373109 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaactta 41373010  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  41373009 gaatgataattggtgtcgaacggtct 41372984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 172 - 393
Target Start/End: Original strand, 37368315 - 37368538
Alignment:
Q  172 attgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatca 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37368315 attgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatca 37368414  T
Q  272 aggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaacttag 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| |    
T  37368415 aggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttgg 37368514  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  37368515 aatggtatttggtgtcgaacggtc 37368538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13594330 - 13594105
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13594330 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 13594231  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  13594230 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacatattatctttttaactt 13594131  T
Q  368 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13594130 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 13594105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7780629 - 7780406
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  7780629 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 7780530  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7780529 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttatcatttgcaatttcgttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaactta 7780431  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  7780430 gaatgatatttagtgtcgaacggtc 7780406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8104104 - 8103880
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8104104 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 8104005  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  8104004 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 8103905  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8103904 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 8103880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30238482 - 30238259
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30238482 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggataaatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 30238383  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  30238382 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 30238283  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30238282 aatgatatttggtgtcgaacggtc 30238259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17457077 - 17456853
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17457077 tattgtttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 17456978  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  17456977 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttgtcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 17456878  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  17456877 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 17456853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Original strand, 36754791 - 36755017
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||     
T  36754791 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggtaatgtgtgacgcttgatt 36754890  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgc---------aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtt 361  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  36754891 aaggaacttcaatcctaataagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaatatagttaacttagttactaaaacaaacaacaaactatcttt 36754990  T
Q  362 taacttagaatgatatttggtgtcgaa 388  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36754991 taatttagaatgatatttggtgtcgaa 36755017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 365
Target Start/End: Original strand, 30211536 - 30211731
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||     
T  30211536 tattttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaagttatgtgtgacgcttgatt 30211635  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 365  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30211636 aaggaactctaatcataacaagtttcatgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaac 30211731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Original strand, 5660549 - 5660696
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  5660549 tattatttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgattatatcaaagaaaagttagaatccgtatatgatcattaggttacatgtgatgcttgatc 5660648  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5660649 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 5660696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 394
Target Start/End: Original strand, 13003809 - 13004011
Alignment:
Q  194 tgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaa 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||      
T  13003809 tgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaagaactctaattccaacgt 13003908  T
Q  292 gtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacg 390  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13003909 tttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaactttgttactaaaacaaacaacaaattgtcttttaacttataatgatatttggtgtcgaaca 13004007  T
Q  391 gtct 394  Q
    ||||    
T  13004008 gtct 13004011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2948062 - 2947844
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  2948062 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 2947963  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 373  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  2947962 gaactctaattccaatgttttt-acgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttagaatg 2947864  T
Q  374 atatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2947863 atatttggtgtcgaacggtc 2947844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 48914996 - 48914898
Alignment:
Q  297 acgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || |||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48914996 acgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttggaatggtatttggtgtcgaacggtc 48914898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 361 - 393
Target Start/End: Original strand, 5660743 - 5660775
Alignment:
Q  361 ttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5660743 ttaacttaaaatgatatttggtgtcgaacggtc 5660775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12768966 - 12768743
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12768966 tattgtttggacacgaatggtcttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtataatcattaggttacgtgtgaagcttgatc 12768867  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12768866 aaagaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttgcaatttagttattaaaacaaacaacgaattatcatttaacttag 12768767  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12768766 aatgatatttggtgtcgaacggtc 12768743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 11358193 - 11358417
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11358193 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 11358292  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  11358293 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 11358392  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  11358393 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 11358417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7311571 - 7311348
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  7311571 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 7311472  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  7311471 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 7311372  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7311371 aatgatatttggtgtcgaacggtc 7311348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 8013320 - 8013543
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8013320 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 8013419  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  8013420 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 8013519  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8013520 aatgatatttggtgtcgaacggtc 8013543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 36005482 - 36005705
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36005482 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36005581  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  36005582 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 36005681  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36005682 aatgatatttggtgtcgaacggtc 36005705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36076189 - 36075965
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36076189 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36076090  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||      
T  36076089 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactattgtttaacttga 36075990  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36075989 aatgatatttggtgtcgaacggtct 36075965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 36425730 - 36425954
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36425730 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 36425829  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  36425830 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 36425929  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  36425930 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 36425954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 6464576 - 6464799
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6464576 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6464675  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  6464676 aaggaactctaatcctaacgagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6464775  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6464776 aatgatatttggtgtcgaacggtc 6464799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15012610 - 15012393
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||     
T  15012610 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatagtcattaggttccgtgtgacgcttgatt 15012511  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15012510 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccctattactctcaacttttactcttgcaacttagtaactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 15012411  T
Q  370 aatgatatttggtgtcga 387  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15012410 aatgatatttggtgtcga 15012393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 36021799 - 36022023
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36021799 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36021898  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||     
T  36021899 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatctttttacttg 36021998  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  36021999 aaatgataattggtgtcgaacggtc 36022023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 41242116 - 41242339
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41242116 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 41242215  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||| ||||||||      
T  41242216 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcatttaacttga 41242315  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  41242316 aaagatatttggtgtcaaacggtc 41242339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1238436 - 1238212
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||    
T  1238436 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatcaggttatttgtgacgcttgatc 1238337  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattg-caacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  | ||  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  1238336 aaggaactctaatcctaacaagttttacgctctattactctcaacttttactttttcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattattttttaactta 1238237  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1238236 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 1238212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 16710668 - 16710892
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16710668 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 16710767  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| || ||||||    
T  16710768 aaggaactctaatcctaacaagttttatgccctattgctctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacatactatctttcaactta 16710867  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  16710868 gaatgatatttggagtcgaacggtc 16710892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 171 - 314
Target Start/End: Original strand, 26250591 - 26250734
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  26250591 tattgtttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctataaaccatgtatggttattagattacgtgtgacgcttgatt 26250690  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa 314  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26250691 aaggaactctaatcctaacaaatttcacgccttattaatctcaa 26250734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31017608 - 31017397
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatg--tatgatcattagattacgtgtgacgcttga 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31017608 tattttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaattagaatccatgtatatggtcattaggttacatgtgacgcttga 31017509  T
Q  269 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactta 368  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||              ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31017508 ttaaagaactctaatcctaactagtttcacgccttattattc--------------gcaactttgttactaaaacaaacaacaaattatcttttaactta 31017423  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  31017422 aaatgatatttggtgtcgaacggtct 31017397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 171 - 363
Target Start/End: Original strand, 45068416 - 45068609
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  45068416 tattgttcggacacgaatggtgttatcgagggttacatgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattaggttacgtgcgacgcttgatt 45068515  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttta 363  Q
    || |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45068516 aaagaactctaatcctaacaaattttacgttttattactctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatctttta 45068609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 393
Target Start/End: Original strand, 7933931 - 7934150
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  7933931 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 7934030  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaa-cttagaat 372  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| |||||||||| |  || |||||||||| ||||||||    
T  7934031 gaactctaattccaa-tgtttttacgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaaccatcaactatcgtttaaccttagaat 7934129  T
Q  373 gatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7934130 gatatttggtgtcgaacggtc 7934150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14393786 - 14393733
Alignment:
Q  340 aaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14393786 aaacaaacaaccaatcaacctttaacttaaaatgatatttggtgtcgaacggtc 14393733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 4311486 - 4311709
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  4311486 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgattgatc 4311585  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4311586 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcatttaacttag 4311685  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  4311686 aatgatatttggtgttgaacggtc 4311709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Original strand, 10941304 - 10941528
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  10941304 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatatatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 10941403  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10941404 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 10941503  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  10941504 aattatattaggtgtcaaacggtct 10941528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32746592 - 32746369
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32746592 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 32746493  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  32746492 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 32746393  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32746392 aatgatatttggtgtcgaacggtc 32746369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6036488 - 6036265
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6036488 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgagtgacgcttgatc 6036389  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  6036388 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcattttcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 6036289  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||| |||||||||||| |||||||    
T  6036288 aattatatttggtgtcaaacggtc 6036265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24179296 - 24179072
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24179296 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 24179197  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  24179196 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 24179097  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  24179096 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 24179072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Original strand, 9570548 - 9570774
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9570548 tattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9570647  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 367  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  9570648 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatctgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaaactt 9570747  T
Q  368 agaatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9570748 agaatgataattggtgtcgaacggtct 9570774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 27501967 - 27502191
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27501967 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 27502066  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  27502067 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 27502166  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  27502167 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 27502191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13015208 - 13014985
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13015208 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 13015109  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  13015108 aagaaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 13015009  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13015008 aatgatatttggtgtcgaacggtc 13014985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Original strand, 9577050 - 9577276
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9577050 tattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9577149  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 367  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  9577150 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatctgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaaactt 9577249  T
Q  368 agaatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9577250 agaataataattggtgtcgaacggtct 9577276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 43995300 - 43995068
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaa-gaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgat 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43995300 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtaataatatcaaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttggt 43995201  T
Q  270 caaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt---------gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgt 360  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |    
T  43995200 taaggaactctaatcctgacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaacatagtcaacttagtttctaaaacaaacaacaaactatctt 43995101  T
Q  361 ttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43995100 ttaacttagaatgatatttgatgtcgaatggtc 43995068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25893458 - 25893229
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25893458 tattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaagttacgtgtgacgcttgatc 25893359  T
Q  271 aagg-----aactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gttta 363  Q
    ||||     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||    
T  25893358 aaggaatttaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattaacttttta 25893259  T
Q  364 acttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25893258 acttagaatggtatttggtgtcgaacggtc 25893229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 43931799 - 43931581
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgt--gtgacgcttga 268  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  43931799 tattgtttgaacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataa-------gaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtatgtgacgcttga 43931707  T
Q  269 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 367  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43931706 ttaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattatccgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaactt 43931607  T
Q  368 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  43931606 agaatggtatttggtgtcggacggtc 43931581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23068686 - 23068462
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  23068686 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaag-tagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgatgctcgatc 23068588  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 367  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  23068587 aaagaactctaatcctaacaagtttc-cgccctattaatttcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacagattatctttttaactt 23068489  T
Q  368 agaatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23068488 agaatgatatttggtgacgaacggtct 23068462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 267 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 41353987 - 41353860
Alignment:
Q  267 gatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41353987 gatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgtcctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaac 41353888  T
Q  366 ttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41353887 ttaaaatgatatttggtgtcgaacggtc 41353860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 181 - 318
Target Start/End: Original strand, 20651135 - 20651272
Alignment:
Q  181 acacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactct 280  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20651135 acacgaatgatattgtcaagggatacgtgataatatcaaagaaaaggtagaatccgtatatgatcattaaattacgtgtgatgcttgatcaaggaactct 20651234  T
Q  281 aatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 318  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20651235 aatcctaacgagtttcacgccttattaatctcaacttt 20651272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 243 - 393
Target Start/End: Original strand, 41354142 - 41354293
Alignment:
Q  243 atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaa 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||||    
T  41354142 atcattaggttacgtgtgacgcttgctcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaa 41354241  T
Q  342 acaaac-aacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354242 acaaacaaacaaattat-tttcaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 41354293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4591012 - 4590792
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  4591012 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 4590913  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaat 372  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||   | || |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  4590912 gaactctaattccaacgttttt-acgccctattactctcaactttaacttttatatttggttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaacttggaat 4590814  T
Q  373 gatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4590813 gataattggtgtcgaacggtct 4590792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 327 - 396
Target Start/End: Original strand, 3577095 - 3577164
Alignment:
Q  327 aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtcttt 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3577095 aacttagttattcaaacaaacaacaaattatcatttaacttagaataatatttggtgtcgaacggtcttt 3577164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 394
Target Start/End: Original strand, 20952759 - 20952987
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||  |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  20952759 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaagcgctagaatccatatatgcgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 20952858  T
Q  274 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt-atcattgcaacttagtta--tta-----aaacaaacaacaaatta-tcgtttaa 364  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||  |||     ||| ||||||  ||||| || |||||    
T  20952859 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttattcttgcaaattagttaacttagttgcaaagaaacaaacaattactcttttaa 20952957  T
Q  365 cttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20952958 cttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 20952987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Original strand, 4644354 - 4644463
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 273  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||  ||| || |||||||| | ||||    
T  4644354 tttggacacgaatagtcttgttgaacgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattatgttatgtttgacgcttaaccaag 4644453  T
Q  274 gaactctaat 283  Q
    ||||||||||    
T  4644454 gaactctaat 4644463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2785922 - 2785865
Alignment:
Q  176 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 233  Q
    ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  2785922 tttggacacaaatgattttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaat 2785865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 49912 - 49689
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||     
T  49912 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccgtgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatg 49813  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49812 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaacttag 49714  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  49713 aatgatatttggtgtcgaacggtct 49689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 171 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15393 - 15169
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  15393 tattgtttggacacgaacggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctggaat 15294  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15293 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttactattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaagttag 15194  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtct 394  Q
    |||||||||| |||||||| |||||    
T  15193 aatgatattttgtgtcgaaaggtct 15169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 5005 - 5228
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5005 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5104  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  5105 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 5204  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 5228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 3264 - 3486
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  3264 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtaattaggttaagtgtgaagcttgatc 3363  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3364 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaacttag 3462  T
Q  370 aatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||| |||||||| ||||    
T  3463 aatgatatttagtgtcgaatggtc 3486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 8881 - 9105
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  8881 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgaggatcgatc 8980  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  8981 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaactta 9080  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  9081 gaatgatatttggagtcgaacggtc 9105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Original strand, 2560 - 2784
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  2560 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattaggttatatgtgacgcttaatc 2659  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2660 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaataaattatcttttaactta 2759  T
Q  369 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2760 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 171 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12155 - 12014
Alignment:
Q  171 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12155 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatttatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 12056  T
Q  271 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12055 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctc 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12014 - 11949
Alignment:
Q  329 cttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 393  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12014 cttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaacttagaatgatatttggagtcgaacggtc 11949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 100020 - 99913
Alignment:
Q  287 aacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtc 385  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100020 aacaagtttcacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtc 99921  T
Q  386 gaacggtc 393  Q
    ||||||||    
T  99920 gaacggtc 99913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 394
Target Start/End: Original strand, 24268 - 24470
Alignment:
Q  194 tgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaa 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||      
T  24268 tgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaagaactctaattccaacgt 24367  T
Q  292 gtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacg 390  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24368 tttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaactttgttactaaaacaaacaacaaattgtcttttaacttataatgatatttggtgtcgaaca 24466  T
Q  391 gtct 394  Q
    ||||    
T  24467 gtct 24470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University