View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11319_low_5 (Length: 377)

Name: NF11319_low_5
Description: NF11319
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11319_low_5
NF11319_low_5
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (12-365)||(15229269-15229622)
chr4 (12-365)||(1901657-1902010)
chr4 (12-365)||(15283446-15283799)
chr4 (12-365)||(15389896-15390249)
chr4 (11-374)||(6571252-6571615)
chr4 (11-374)||(34187469-34187832)
chr4 (11-374)||(5007272-5007635)
chr4 (11-374)||(31125027-31125390)
chr4 (12-374)||(24590864-24591226)
chr4 (11-374)||(36343024-36343387)
chr4 (27-374)||(14666433-14666780)
chr4 (11-374)||(39852037-39852400)
chr4 (11-326)||(18799170-18799485)
chr4 (11-374)||(30755153-30755516)
chr4 (11-374)||(33672307-33672670)
chr4 (11-374)||(54834786-54835149)
chr4 (11-374)||(14099940-14100303)
chr4 (11-374)||(14761813-14762176)
chr4 (11-374)||(21971100-21971463)
chr4 (11-374)||(27161825-27162188)
chr4 (11-326)||(40104195-40104510)
chr4 (12-374)||(24114062-24114424)
chr4 (120-374)||(17014551-17014805)
chr4 (297-365)||(24460281-24460349)
chr4 (48-111)||(14731187-14731250)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (12-365)||(19454929-19455281)
chr2 (12-365)||(21701671-21702024)
chr2 (11-374)||(27805087-27805450)
chr2 (11-374)||(27778602-27778965)
chr2 (11-374)||(12588190-12588553)
chr2 (11-374)||(37376541-37376904)
chr2 (11-365)||(9348489-9348843)
chr2 (11-326)||(27818360-27818675)
chr2 (11-374)||(34287734-34288097)
chr2 (11-374)||(34292794-34293157)
chr2 (11-365)||(13935051-13935405)
chr2 (11-374)||(16827836-16828199)
chr2 (11-374)||(16893282-16893645)
chr2 (11-374)||(32051178-32051541)
chr2 (11-374)||(39050320-39050683)
chr2 (11-374)||(40234891-40235254)
chr2 (11-374)||(259251-259614)
chr2 (42-374)||(19414997-19415329)
chr2 (11-374)||(11633683-11634046)
chr2 (11-374)||(12715100-12715463)
chr2 (27-374)||(28883610-28883957)
chr2 (11-374)||(21675680-21676043)
chr2 (12-364)||(23127074-23127426)
chr2 (11-374)||(31877661-31878024)
chr2 (12-364)||(27432952-27433304)
chr2 (12-364)||(12656923-12657275)
chr2 (120-374)||(20839390-20839644)
chr2 (11-374)||(39891454-39891817)
chr2 (43-374)||(34863092-34863423)
chr2 (11-374)||(37949820-37950183)
chr2 (297-365)||(34302968-34303036)
chr2 (43-374)||(37684407-37684738)
chr2 (43-374)||(37699672-37700003)
chr2 (297-365)||(3785162-3785230)
chr2 (297-365)||(27119196-27119264)
chr2 (297-365)||(31890993-31891061)
chr2 (297-365)||(34157518-34157586)
chr2 (11-130)||(11640117-11640236)
chr2 (253-374)||(37926992-37927113)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (12-365)||(16625160-16625513)
chr3 (12-365)||(18531734-18532087)
chr3 (11-374)||(20575397-20575760)
chr3 (12-374)||(8297318-8297680)
chr3 (11-374)||(29663520-29663883)
chr3 (11-374)||(7074557-7074920)
chr3 (27-374)||(18052623-18052970)
chr3 (11-374)||(18226536-18226899)
chr3 (11-374)||(28114504-28114867)
chr3 (11-364)||(20067388-20067741)
chr3 (12-364)||(15891266-15891618)
chr3 (11-374)||(10397478-10397841)
chr3 (12-374)||(22386128-22386490)
chr3 (11-365)||(5607881-5608235)
chr3 (12-334)||(6193661-6193983)
chr3 (11-365)||(11108908-11109262)
chr3 (11-374)||(4345237-4345600)
chr3 (11-374)||(5015057-5015420)
chr3 (11-365)||(5594916-5595270)
chr3 (11-374)||(18290903-18291266)
chr3 (11-374)||(18306204-18306567)
chr3 (12-374)||(15739644-15740006)
chr3 (12-374)||(29147305-29147667)
chr3 (12-374)||(35882112-35882474)
chr3 (12-364)||(4722977-4723329)
chr3 (11-374)||(31963023-31963386)
chr3 (11-374)||(4418264-4418627)
chr3 (11-326)||(18244084-18244399)
chr3 (11-374)||(18275602-18275965)
chr3 (12-374)||(22869406-22869768)
chr3 (12-374)||(22884465-22884827)
chr3 (43-365)||(5468362-5468684)
chr3 (12-374)||(8288021-8288383)
chr3 (11-364)||(32440499-32440852)
chr3 (11-274)||(48467272-48467535)
chr3 (11-374)||(10644415-10644778)
chr3 (11-374)||(17983506-17983869)
chr3 (11-374)||(24329504-24329867)
chr3 (11-374)||(51783368-51783731)
chr3 (27-274)||(4795303-4795550)
chr3 (35-374)||(18331997-18332336)
chr3 (11-374)||(21676038-21676401)
chr3 (11-365)||(8213083-8213437)
chr3 (11-374)||(6541012-6541375)
chr3 (42-374)||(7997938-7998270)
chr3 (11-374)||(47024798-47025161)
chr3 (12-325)||(28022621-28022934)
chr3 (297-365)||(5652860-5652928)
chr3 (297-365)||(4626417-4626485)
chr3 (297-365)||(5713700-5713768)
chr3 (297-365)||(5724610-5724678)
chr3 (297-365)||(5767690-5767758)
chr3 (297-365)||(17993501-17993569)
chr3 (11-124)||(20441462-20441575)
chr3 (253-374)||(28340766-28340887)
chr3 (253-374)||(36995750-36995871)
chr3 (11-124)||(41438588-41438701)
chr3 (48-111)||(7090873-7090936)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (12-365)||(22889863-22890216)
chr5 (16-365)||(25200427-25200776)
chr5 (120-365)||(25264686-25264931)
chr5 (12-364)||(23893600-23893952)
chr5 (11-364)||(15657176-15657529)
chr5 (11-374)||(9318844-9319207)
chr5 (11-374)||(40471955-40472318)
chr5 (11-364)||(41676102-41676455)
chr5 (11-374)||(12133548-12133911)
chr5 (11-374)||(26481784-26482147)
chr5 (12-364)||(11550748-11551100)
chr5 (12-364)||(30936027-30936379)
chr5 (11-363)||(33517749-33518101)
chr5 (11-374)||(3790934-3791297)
chr5 (11-374)||(28650628-28650991)
chr5 (11-374)||(43079645-43080008)
chr5 (12-374)||(33778881-33779243)
chr5 (11-364)||(33293918-33294271)
chr5 (12-364)||(24686573-24686925)
chr5 (12-364)||(24971412-24971764)
chr5 (11-374)||(24682833-24683196)
chr5 (11-374)||(24725360-24725723)
chr5 (12-374)||(23750856-23751218)
chr5 (11-374)||(15757263-15757626)
chr5 (11-374)||(18499136-18499499)
chr5 (12-374)||(22997520-22997882)
chr5 (12-374)||(23716394-23716756)
chr5 (11-374)||(8663881-8664244)
chr5 (11-374)||(13323235-13323598)
chr5 (11-374)||(28958192-28958555)
chr5 (11-374)||(30169862-30170225)
chr5 (11-374)||(37357049-37357412)
chr5 (11-326)||(37669937-37670252)
chr5 (11-374)||(30030808-30031171)
chr5 (11-374)||(30153411-30153774)
chr5 (11-374)||(37756373-37756736)
chr5 (11-364)||(18125811-18126164)
chr5 (11-374)||(6875698-6876061)
chr5 (11-374)||(31824813-31825176)
chr5 (11-374)||(34617911-34618274)
chr5 (12-374)||(31432834-31433196)
chr5 (42-326)||(37769441-37769725)
chr5 (11-374)||(2512444-2512807)
chr5 (297-365)||(13440067-13440135)
chr5 (253-374)||(18373941-18374062)
chr5 (297-365)||(9548116-9548184)
chr5 (297-365)||(11326315-11326383)
chr5 (297-365)||(13184222-13184290)
chr5 (253-374)||(5639422-5639543)
chr5 (253-365)||(32594689-32594801)
chr5 (49-124)||(34467047-34467122)
chr5 (295-364)||(20390438-20390507)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (12-365)||(16042709-16043062)
chr7 (12-365)||(16448402-16448755)
chr7 (11-374)||(5145735-5146098)
chr7 (12-374)||(5129378-5129740)
chr7 (11-374)||(26318264-26318627)
chr7 (11-365)||(26536274-26536628)
chr7 (12-364)||(5160905-5161257)
chr7 (11-326)||(26436642-26436957)
chr7 (12-374)||(10915263-10915625)
chr7 (27-374)||(16501796-16502143)
chr7 (11-374)||(26514166-26514529)
chr7 (11-374)||(31126305-31126668)
chr7 (12-374)||(11423172-11423534)
chr7 (11-374)||(31562785-31563148)
chr7 (12-364)||(2155959-2156311)
chr7 (11-374)||(3446691-3447054)
chr7 (11-374)||(9620036-9620399)
chr7 (27-374)||(16516832-16517179)
chr7 (11-374)||(11442264-11442627)
chr7 (11-374)||(26273489-26273852)
chr7 (11-374)||(16734855-16735218)
chr7 (11-374)||(16749909-16750272)
chr7 (11-374)||(17524917-17525280)
chr7 (11-374)||(17527935-17528298)
chr7 (11-374)||(24590936-24591299)
chr7 (43-374)||(26668309-26668640)
chr7 (297-365)||(2108567-2108635)
chr7 (195-374)||(45388789-45388968)
chr7 (297-365)||(45733973-45734041)
chr7 (11-118)||(18542184-18542291)
chr7 (297-374)||(4201060-4201137)
chr7 (297-358)||(31088033-31088094)
chr7 (49-124)||(800159-800234)
chr7 (253-374)||(4143641-4143762)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (12-365)||(16206549-16206902)
chr1 (12-198)||(20462469-20462655)
chr1 (11-374)||(10964053-10964416)
chr1 (11-374)||(51639601-51639964)
chr1 (11-374)||(28586364-28586727)
chr1 (11-374)||(41791817-41792180)
chr1 (11-374)||(10946462-10946825)
chr1 (303-374)||(20462656-20462727)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (12-365)||(22079379-22079732)
chr8 (12-364)||(16284834-16285186)
chr8 (12-374)||(27607373-27607735)
chr8 (12-374)||(18792092-18792454)
chr8 (11-374)||(19675825-19676188)
chr8 (12-374)||(19206828-19207190)
chr8 (27-374)||(19689498-19689845)
chr8 (11-374)||(9356007-9356370)
chr8 (11-374)||(3327975-3328338)
chr8 (12-374)||(14559009-14559371)
chr8 (12-374)||(2135727-2136089)
chr8 (12-364)||(16278939-16279290)
chr8 (12-374)||(29830707-29831069)
chr8 (11-326)||(12091240-12091555)
chr8 (11-374)||(31355909-31356272)
chr8 (11-374)||(33260107-33260470)
chr8 (11-326)||(28360471-28360786)
chr8 (297-365)||(33245177-33245245)
chr8 (195-374)||(31488341-31488520)
chr8 (297-365)||(19658675-19658743)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (12-365)||(17090907-17091260)
chr6 (12-326)||(27628206-27628520)
chr6 (11-374)||(16675520-16675883)
chr6 (11-374)||(29550856-29551219)
chr6 (11-365)||(3697462-3697816)
chr6 (11-374)||(26776062-26776425)
chr6 (12-374)||(24303070-24303432)
chr6 (12-364)||(22933342-22933694)
chr6 (12-364)||(23855787-23856139)
chr6 (12-364)||(15422779-15423131)
chr6 (12-328)||(27271078-27271394)
chr6 (11-374)||(29502796-29503159)
chr6 (12-374)||(27020520-27020883)
chr6 (11-374)||(27045769-27046132)
chr6 (12-118)||(20162073-20162179)
chr6 (12-118)||(22170652-22170758)
chr6 (12-374)||(24865099-24865461)
chr6 (12-364)||(13297413-13297765)
chr6 (12-364)||(26919762-26920114)
chr6 (12-374)||(16751236-16751598)
chr6 (12-374)||(27288822-27289184)
chr6 (190-374)||(20162176-20162360)
chr6 (190-374)||(22170471-22170655)
chr6 (11-326)||(26114910-26115225)
chr6 (11-374)||(27009111-27009474)
chr6 (11-374)||(30556468-30556831)
chr6 (11-374)||(4759145-4759508)
chr6 (11-326)||(27486510-27486825)
chr6 (11-326)||(28208835-28209150)
chr6 (11-374)||(4526667-4527030)
chr6 (11-365)||(4544236-4544590)
chr6 (11-374)||(16942479-16942842)
chr6 (12-205)||(26990271-26990464)
chr6 (11-326)||(4722634-4722949)
chr6 (11-374)||(29574394-29574757)
chr6 (120-352)||(34913563-34913795)
chr6 (253-374)||(4774506-4774627)
chr6 (297-365)||(8891930-8891998)
chr6 (297-365)||(8903165-8903233)
chr6 (297-365)||(28163166-28163234)
chr6 (297-365)||(33373875-33373943)
[»] scaffold1697 (1 HSPs)
scaffold1697 (11-374)||(949-1312)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (12-374)||(5746-6108)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (267-365)||(46134-46232)
scaffold0124 (12-364)||(31838-32190)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (12-364)||(31142-31494)
scaffold0089 (27-364)||(45504-45841)
scaffold0089 (12-352)||(38600-38940)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (11-326)||(10950-11265)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (27-364)||(28693-29030)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (11-374)||(7399-7762)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (11-326)||(9333-9648)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (11-374)||(13439-13802)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (11-374)||(24710-25073)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (297-365)||(22073-22141)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (297-365)||(119574-119642)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (253-365)||(7707-7819)
scaffold0159 (253-365)||(21260-21372)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (133-326)||(27711-27904)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Original strand, 15229269 - 15229622
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15229269 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 15229368  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15229369 agaatggaaaacttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 15229468  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15229469 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 15229568  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229569 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 15229622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Original strand, 1901657 - 1902010
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1901657 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcataagaaattgaagtttgtaa 1901756  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  1901757 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgccgaaggaactgc 1901856  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1901857 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 1901956  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1901957 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 1902010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15283799 - 15283446
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283799 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggacacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 15283700  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15283699 agaatgggaagcttgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 15283600  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15283599 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggct 15283500  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15283499 gtcggctagggcaagttaatacaactccgcgggaataagcacaaagaaggtctc 15283446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15390249 - 15389896
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15390249 atggacatcaatgcctcttatagctgtctcctagaaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgtaa 15390150  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| ||    
T  15390149 agaatggaaagctcgttacaatccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgc 15390050  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     ||||  ||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| |||||||| ||  ||    
T  15390049 ttttcagggtttgactatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtccaagaaggtcaagct 15389950  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  15389949 accggctggggcaagttaatacaactccttaagaataagcacagagagggtctc 15389896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 6571252 - 6571615
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  6571252 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 6571351  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  6571352 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 6571451  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  6571452 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 6571551  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  6571552 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6571615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34187832 - 34187469
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  34187832 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 34187733  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| ||||    
T  34187732 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagaggggactg 34187633  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  ||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  34187632 cttttcaaggattgactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 34187533  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  34187532 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 34187469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 5007272 - 5007635
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  5007272 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 5007371  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||    
T  5007372 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggggaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactg 5007471  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||| ||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||    
T  5007472 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggaaggtcagac 5007571  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5007572 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5007635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31125390 - 31125027
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  31125390 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 31125291  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  31125290 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31125191  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  31125190 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 31125091  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31125090 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31125027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24591226 - 24590864
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24591226 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24591127  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  24591126 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24591027  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24591026 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24590927  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||| || || || ||||||||  ||||||||    
T  24590926 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtcttggcttctcc 24590864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36343387 - 36343024
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  36343387 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 36343288  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  36343287 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 36343188  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  36343187 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 36343088  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| || || || ||||||||  ||||||||    
T  36343087 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtcttggcttctcc 36343024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 374
Target Start/End: Original strand, 14666433 - 14666780
Alignment:
Q  27 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 126  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  14666433 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtaacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 14666532  T
Q  127 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 226  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  14666533 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 14666632  T
Q  227 tattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaa 325  Q
    | | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||| |||||||     
T  14666633 tgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggatggggcag 14666731  T
Q  326 gttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  14666732 gttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 14666780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 39852037 - 39852400
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  39852037 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 39852136  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || || || |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  39852137 aggaatggaaagcttgttaccgttcacggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 39852236  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  39852237 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 39852336  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39852337 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39852400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18799485 - 18799170
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  18799485 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 18799386  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||  || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  18799385 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgttgtccttttcttgtattgaagcggggtctgctgaagggactg 18799286  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  18799285 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 18799186  T
Q  311 tgccggctggggcaag 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  18799185 tgccggctggggcaag 18799170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 30755153 - 30755516
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30755153 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30755252  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  30755253 aagaatggaaagctcgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30755352  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  30755353 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 30755452  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30755453 tgccggatggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30755516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33672670 - 33672307
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  33672670 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 33672571  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  33672570 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 33672471  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  33672470 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 33672371  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  33672370 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 33672307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 54834786 - 54835149
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  54834786 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 54834885  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  54834886 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 54834985  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||  ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  54834986 ctttccaaggtttgatcattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 54835085  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  54835086 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 54835149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 14099940 - 14100303
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  14099940 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 14100039  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  14100040 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 14100139  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  14100140 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 14100238  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  14100239 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 14100303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14762176 - 14761813
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  14762176 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 14762077  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |  | ||| |||||||||||  | ||||||||  |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  14762076 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagagaaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 14761977  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  14761976 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 14761877  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  14761876 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 14761813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 21971100 - 21971463
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  21971100 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 21971199  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  21971200 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21971299  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  21971300 cgttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 21971398  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  21971399 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21971463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27162188 - 27161825
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  27162188 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27162089  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27162088 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27161989  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  27161988 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 27161890  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27161889 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27161825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40104510 - 40104195
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  40104510 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 40104411  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  40104410 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40104311  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  40104310 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40104211  T
Q  311 tgccggctggggcaag 326  Q
    |||||| |||||||||    
T  40104210 tgccggttggggcaag 40104195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 24114062 - 24114424
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24114062 atggatattaatgcctcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24114161  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||  ||||| || ||    
T  24114162 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgc 24114261  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||| | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24114262 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24114361  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  24114362 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24114424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 374
Target Start/End: Original strand, 17014551 - 17014805
Alignment:
Q  120 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 219  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| ||    
T  17014551 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaag 17014650  T
Q  220 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 319  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  17014651 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 17014750  T
Q  320 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  17014751 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 17014805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24460349 - 24460281
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  24460349 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 24460281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14731250 - 14731187
Alignment:
Q  48 agaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  14731250 agaccatggattcatgacgctggggcagtgacatctactctccatcagaaattgaagtttgtaa 14731187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19455281 - 19454929
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455281 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgttggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 19455182  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19455181 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatcttt-tcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 19455083  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  19455082 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgcttagaaggctgtccaagaaggacaggct 19454983  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19454982 gccggatggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 19454929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21702024 - 21701671
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  21702024 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaattttaagtttgtaa 21701925  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21701924 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagttgtcgtctttctcttgtattgaagctggatctgctgaaggaactgc 21701825  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21701824 ctttcaaggtttgactattgaaggtatggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 21701725  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21701724 gccggccggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 21701671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 27805087 - 27805450
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||    
T  27805087 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccctacatcagaagttgaagttcata 27805186  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27805187 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27805286  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  27805287 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27805386  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27805387 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27805450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 27778602 - 27778965
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  27778602 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 27778701  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27778702 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27778801  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| |||| |||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  27778802 ctttccaaggtttgaccattggaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27778901  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27778902 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27778965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 12588190 - 12588553
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  12588190 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 12588289  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  12588290 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagtcagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12588389  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  12588390 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 12588489  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12588490 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12588553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 37376541 - 37376904
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  37376541 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 37376640  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    || | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  37376641 aaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 37376740  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  37376741 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 37376840  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  37376841 tgccggctggggcaagttagtacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 37376904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9348843 - 9348489
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  9348843 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 9348744  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | ||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  9348743 aggaacggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9348644  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  9348643 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 9348544  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  9348543 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 9348489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 27818360 - 27818675
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  27818360 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 27818459  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27818460 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctcacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27818559  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| |||| |||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  27818560 ctttccaaggtttgaccattggaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27818659  T
Q  311 tgccggctggggcaag 326  Q
    |||||| |||||||||    
T  27818660 tgccggttggggcaag 27818675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 34287734 - 34288097
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||     
T  34287734 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 34287833  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||     
T  34287834 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggacta 34287933  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  34287934 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 34288033  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34288034 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34288097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 34292794 - 34293157
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||     
T  34292794 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 34292893  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||     
T  34292894 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggacta 34292993  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  34292994 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 34293093  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34293094 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34293157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13935405 - 13935051
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  13935405 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 13935306  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  13935305 aggaatggaaagcttgttacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13935206  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  13935205 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 13935106  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  13935105 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 13935051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16828199 - 16827836
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  16828199 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 16828100  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16828099 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16828000  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  16827999 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 16827900  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16827899 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16827836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 16893282 - 16893645
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  16893282 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 16893381  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16893382 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16893481  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  16893482 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 16893581  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16893582 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16893645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 32051178 - 32051541
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  32051178 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 32051277  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  32051278 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 32051377  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  32051378 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 32051477  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  32051478 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 32051541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39050683 - 39050320
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  39050683 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 39050584  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  39050583 aggaatgaaaagcttgttacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 39050484  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||||||||||||| | || |  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  39050483 ctttccaaggtttgactattgaaggtgcagaacctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 39050384  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39050383 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39050320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 40234891 - 40235254
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  40234891 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 40234990  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| || | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  40234991 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40235090  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  40235091 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40235190  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  40235191 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 40235254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 259614 - 259251
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  259614 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 259515  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  259514 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 259415  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  259414 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 259315  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  259314 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 259251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19415329 - 19414997
Alignment:
Q  42 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 141  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  19415329 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 19415230  T
Q  142 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 241  Q
    ||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  19415229 aagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 19415130  T
Q  242 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 340  Q
    | || | |||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||| |    
T  19415129 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtaatacagctctg 19415031  T
Q  341 cgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
     ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  19415030 tgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19414997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11634046 - 11633683
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||  ||    
T  11634046 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccactttacatcagaagttgaagttcata 11633947  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  11633946 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11633847  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  || ||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  11633846 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcctaaaaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 11633747  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  11633746 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 11633683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12715463 - 12715100
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  12715463 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 12715364  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  12715363 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12715264  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  12715263 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 12715164  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12715163 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12715100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 374
Target Start/End: Original strand, 28883610 - 28883957
Alignment:
Q  27 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 126  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  28883610 tcttacagctgtctcttgggtagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 28883709  T
Q  127 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 226  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||||||| |||  | ||    
T  28883710 ttaccattcatggagaggaagcatacctggctagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcctttcaaggattaac 28883809  T
Q  227 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 326  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  28883810 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 28883909  T
Q  327 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  28883910 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 28883957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21676043 - 21675680
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  21676043 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 21675944  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  21675943 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21675844  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || |||||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  21675843 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaagaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 21675745  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    | ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  21675744 ccgccggctggggcaaggtgatacagctctgcgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21675680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23127426 - 23127074
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  23127426 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 23127327  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |  |||||||| ||||| || ||    
T  23127326 aaagtggaaagcttgttaccatacatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcataggggcaggatctgcagaggggaccgc 23127227  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  23127226 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23127127  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||    
T  23127126 gccggctggggcaggttaatacagctttgtgagaacaagcataaggaaggtct 23127074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 31877661 - 31878024
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31877661 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31877760  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  31877761 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 31877860  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  31877861 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 31877960  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    || ||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31877961 tgtcggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31878024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27433304 - 27432952
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||| |||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  27433304 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgagagcggtgacctttactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 27433205  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  27433204 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 27433105  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  27433104 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 27433005  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  27433004 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 27432952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 12656923 - 12657275
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| | || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  12656923 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 12657022  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||| | ||||| || ||    
T  12657023 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctacagaggggaccgc 12657122  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
    ||||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  12657123 ctttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 12657222  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  12657223 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 12657275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 374
Target Start/End: Original strand, 20839390 - 20839644
Alignment:
Q  120 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 219  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| ||    
T  20839390 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaag 20839489  T
Q  220 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 319  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  20839490 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 20839589  T
Q  320 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  20839590 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 20839644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 39891454 - 39891817
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||  | || ||||| ||||| |||||     
T  39891454 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 39891553  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  39891554 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 39891653  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||  |||||| || | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  39891654 ctttccaaggtttgatcattgaaagtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 39891752  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39891753 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39891817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 34863092 - 34863423
Alignment:
Q  43 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 142  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  34863092 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 34863191  T
Q  143 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 242  Q
    |||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||    
T  34863192 agaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagag 34863291  T
Q  243 ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcg 342  Q
       ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |    
T  34863292 tcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtg 34863391  T
Q  343 agaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34863392 agaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34863423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37950183 - 37949820
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  37950183 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 37950084  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  37950083 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37949984  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  | ||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||  ||  | || || || |||||    
T  37949983 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagccggggctgctgtggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaggagggtcagac 37949884  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37949883 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37949820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34303036 - 34302968
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34303036 caagaaggacaggctgccggctggggtaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagagggtctc 34302968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37684738 - 37684407
Alignment:
Q  43 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 142  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  37684738 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 37684639  T
Q  143 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 242  Q
    |||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | |||    
T  37684638 agaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagag 37684539  T
Q  243 -ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 341  Q
     || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  37684538 tctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 37684440  T
Q  342 gagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37684439 gagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37684407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37700003 - 37699672
Alignment:
Q  43 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 142  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  37700003 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 37699904  T
Q  143 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 242  Q
    |||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | |||    
T  37699903 agaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagag 37699804  T
Q  243 -ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 341  Q
     || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  37699803 tctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 37699705  T
Q  342 gagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37699704 gagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37699672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Original strand, 3785162 - 3785230
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  3785162 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 3785230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Original strand, 27119196 - 27119264
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  27119196 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 27119264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31891061 - 31890993
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  31891061 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 31890993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Original strand, 34157518 - 34157586
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  34157518 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 34157586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11640236 - 11640117
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||  ||    
T  11640236 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccactttacatcagaagttgaagttcata 11640137  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttac 130  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  11640136 aggaatggaaagcttgttac 11640117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 374
Target Start/End: Original strand, 37926992 - 37927113
Alignment:
Q  253 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 352  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  37926992 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 37927091  T
Q  353 caaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  37927092 taaagaaggtctcgggttctcc 37927113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16625513 - 16625160
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625513 atggacatcaatgcttcttatagctgtatcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 16625414  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16625413 agaatgggaagcttgttatagtccatggataagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 16625314  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16625313 ctttcaaggtttgactattgaaggtacagagcctaagaaggctggggctgctgtggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggct 16625214  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625213 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16625160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Original strand, 18531734 - 18532087
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18531734 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 18531833  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  18531834 agaatggaaagcttgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctaccgaaggaactgc 18531933  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18531934 ctttcaaggtttgactattgaaggtatggagcctaagaagactggggctgccatggcatctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 18532033  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532034 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 18532087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20575760 - 20575397
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  20575760 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 20575661  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  20575660 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 20575561  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  20575560 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 20575461  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  20575460 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 20575397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 8297318 - 8297680
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  8297318 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 8297417  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  8297418 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 8297517  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  8297518 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 8297616  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  8297617 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 8297680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29663883 - 29663520
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  29663883 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 29663784  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||  ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  29663783 aggaatgaaaagcttgttaccgttcatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29663684  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  29663683 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 29663584  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29663583 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29663520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 7074557 - 7074920
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  7074557 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 7074656  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  7074657 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagtcagctgtcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 7074756  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  7074757 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 7074856  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  7074857 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 7074920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 374
Target Start/End: Original strand, 18052623 - 18052970
Alignment:
Q  27 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 126  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  18052623 tcttacagctgtctcctggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 18052722  T
Q  127 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 226  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  18052723 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 18052822  T
Q  227 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 326  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  18052823 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 18052922  T
Q  327 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18052923 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18052970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 18226536 - 18226899
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  18226536 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 18226635  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  18226636 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 18226735  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  18226736 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 18226835  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  18226836 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 18226899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28114867 - 28114504
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||      
T  28114867 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgag 28114768  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||    
T  28114767 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactg 28114668  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||| ||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  28114667 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 28114568  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28114567 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28114504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 20067388 - 20067741
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  20067388 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 20067487  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  20067488 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 20067587  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  20067588 cttttcaaggtttaactctcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 20067687  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  20067688 tgccggccggggcaagttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 20067741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15891618 - 15891266
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  15891618 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 15891519  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  15891518 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 15891419  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || |||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  15891418 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 15891319  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15891318 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15891266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 10397478 - 10397841
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||     
T  10397478 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 10397577  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  10397578 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10397677  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  10397678 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 10397777  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10397778 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10397841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22386490 - 22386128
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  22386490 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgatgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 22386391  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || ||    
T  22386390 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgc 22386291  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| |||||||||||||| ||  | ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  22386290 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcgatggcttctttaaaggatacacagagagccgtccaagagggtcaagct 22386191  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  22386190 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 22386128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5608235 - 5607881
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  5608235 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5608136  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  5608135 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5608036  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | ||| ||||| ||||||||| | ||| || |||||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  5608035 ctttccaaggtctgaccattgaaggtgcagagtctaaagaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 5607937  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5607936 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5607881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 334
Target Start/End: Original strand, 6193661 - 6193983
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  6193661 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 6193760  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  6193761 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 6193860  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | |||   ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  ||    
T  6193861 ttttcaaggattaactgccgaaggtacggagcccaagagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagct 6193960  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtaca 334  Q
    ||||||||||||| |||| ||||    
T  6193961 gccggctggggcaggttaataca 6193983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11109262 - 11108908
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  11109262 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11109163  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  11109162 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11109063  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  11109062 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 11108963  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  11108962 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 11108908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4345600 - 4345237
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    |||||||||||| || || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  4345600 gatggacatcaacgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4345501  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    ||| |||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  4345500 aagcatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4345401  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  | || ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  4345400 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagacgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4345301  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4345300 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4345237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 5015057 - 5015420
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  5015057 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5015156  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  5015157 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 5015256  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  5015257 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 5015356  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5015357 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5015420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5595270 - 5594916
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  5595270 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5595171  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  5595170 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5595071  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  5595070 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 5594972  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5594971 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5594916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18291266 - 18290903
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18291266 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18291167  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  18291166 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 18291067  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  18291066 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18290967  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18290966 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18290903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18306567 - 18306204
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18306567 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18306468  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  18306467 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 18306368  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  18306367 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18306268  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18306267 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18306204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15740006 - 15739644
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  15740006 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttagggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 15739907  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  15739906 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 15739807  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||| | ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  ||    
T  15739806 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagct 15739707  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  15739706 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 15739644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29147667 - 29147305
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  29147667 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 29147568  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  29147567 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccaactatcatctttctcttgcatagaggcggggtctgcagaggggaccgc 29147468  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||   |    
T  29147467 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagtccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagtt 29147368  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  29147367 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 29147305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 35882112 - 35882474
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  35882112 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 35882211  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  35882212 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 35882311  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || || |  || || | ||| || ||  ||    
T  35882312 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacatagagccgtccgagagggtcaagct 35882411  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  35882412 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 35882474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 4722977 - 4723329
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  4722977 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacatgatgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 4723076  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||  ||||| || ||    
T  4723077 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgc 4723176  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  4723177 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 4723276  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  4723277 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 4723329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31963386 - 31963023
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31963386 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31963287  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||    
T  31963286 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactg 31963187  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  31963186 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 31963088  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31963087 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31963023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 4418264 - 4418627
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  4418264 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 4418363  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  4418364 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4418463  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  4418464 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 4418563  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4418564 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4418627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 18244084 - 18244399
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  18244084 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 18244183  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  ||||||||||| || ||||    
T  18244184 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgctgaagggactg 18244283  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  18244284 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 18244383  T
Q  311 tgccggctggggcaag 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  18244384 tgccggctggggcaag 18244399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18275965 - 18275602
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18275965 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18275866  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  18275865 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 18275766  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  18275765 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18275666  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||| ||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18275665 tgccggctggagcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttagcttctcc 18275602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22869768 - 22869406
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  22869768 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 22869669  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  22869668 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 22869569  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  22869568 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 22869470  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  22869469 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 22869406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22884827 - 22884465
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  22884827 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 22884728  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  22884727 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 22884628  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  22884627 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 22884529  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  22884528 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 22884465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 365
Target Start/End: Original strand, 5468362 - 5468684
Alignment:
Q  43 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 142  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  5468362 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtaaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 5468461  T
Q  143 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 242  Q
    |||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  ||||  |||||||| | |||    
T  5468462 agaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccgttgaaggtgcagag 5468561  T
Q  243 ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcg 342  Q
    |  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |    
T  5468562 cctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctgtg 5468661  T
Q  343 agaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||| ||||  ||||||||||||    
T  5468662 agaacaagcgtaaagaaggtctc 5468684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8288383 - 8288021
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  8288383 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 8288284  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || ||    
T  8288283 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtcggcggaggggaccgc 8288184  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  8288183 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 8288084  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    || |||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  8288083 gctggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 8288021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 32440499 - 32440852
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  32440499 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgtggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 32440598  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || || || ||||| || |    
T  32440599 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaagaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccg 32440698  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  32440699 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 32440798  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  32440799 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 32440852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 48467272 - 48467535
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  48467272 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 48467371  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  48467372 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 48467471  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttcttt 274  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48467472 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctgggactgctatggcttcttt 48467535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 10644415 - 10644778
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  10644415 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagatcgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10644514  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  10644515 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10644614  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  10644615 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 10644713  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10644714 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10644778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17983869 - 17983506
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  17983869 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17983770  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  17983769 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17983670  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  17983669 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 17983571  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  17983570 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17983506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 24329504 - 24329867
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  24329504 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24329603  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  24329604 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24329703  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  24329704 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 24329802  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24329803 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24329867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 51783368 - 51783731
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  51783368 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 51783467  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  51783468 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 51783567  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  51783568 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 51783666  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  51783667 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 51783731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4795550 - 4795303
Alignment:
Q  27 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 126  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  4795550 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 4795451  T
Q  127 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 226  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  4795450 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 4795351  T
Q  227 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttcttt 274  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| |||||||||||    
T  4795350 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttcttt 4795303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 374
Target Start/End: Original strand, 18331997 - 18332336
Alignment:
Q  35 ctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtc 134  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||  |     
T  18331997 ctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggaacagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccatt 18332096  T
Q  135 catggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaag 234  Q
    | |||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | ||||    
T  18332097 cgtggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaag 18332196  T
Q  235 gtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtaca 334  Q
    ||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||| ||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  18332197 gtacggagcccaagagggatggaactgcaatgacttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaataca 18332296  T
Q  335 actccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
     || |  ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18332297 gcttcttgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18332336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 21676038 - 21676401
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  21676038 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 21676137  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| ||  | || ||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  21676138 aagaatggaaaaatcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21676237  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  |    
T  21676238 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 21676337  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  21676338 tgccggttggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21676401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Original strand, 8213083 - 8213437
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  8213083 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 8213182  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  8213183 acgaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 8213282  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| |||||| || | ||||  |||||  ||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  |    
T  8213283 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagcctaagaaagctggagctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 8213382  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  8213383 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 8213437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6541375 - 6541012
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  6541375 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 6541276  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  6541275 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 6541176  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| |||||| || | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||  ||  | |||||||| ||||    
T  6541175 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgttcagagagccatccaagaaggtcaga 6541077  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  6541076 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6541012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 7997938 - 7998270
Alignment:
Q  42 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 141  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  7997938 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 7998037  T
Q  142 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 241  Q
    ||||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  7998038 aagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgcgttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 7998137  T
Q  242 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 340  Q
    | || | |||| ||||| | ||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  7998138 gtctaaggaag-ctggggccgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 7998236  T
Q  341 cgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
     ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  7998237 tgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 7998270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 47024798 - 47025161
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || || || ||||| |||||     
T  47024798 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcaaaagttgaaatttgtg 47024897  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| |||||||    
T  47024898 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaaggaactg 47024997  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| |||||| || | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  47024998 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 47025096  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  47025097 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 47025161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 325
Target Start/End: Original strand, 28022621 - 28022934
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  28022621 atggacattaatgcgtcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 28022720  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| || || |||||| ||| ||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||  |||| |  || |||||||| || |||||    
T  28022721 agaatggaaaactcgttacaatccgtggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaggcagggtctgctgaagggactgc 28022820  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
     || | |||  |||| ||||||| | | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  28022821 tttccaaggtttgaccattgaagatgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 28022919  T
Q  311 tgccggctggggcaa 325  Q
     ||||||||||||||    
T  28022920 cgccggctggggcaa 28022934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Original strand, 5652860 - 5652928
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  5652860 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 5652928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Original strand, 4626417 - 4626485
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  4626417 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 4626485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Original strand, 5713700 - 5713768
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5713700 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5713768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Original strand, 5724610 - 5724678
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5724610 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5724678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5767758 - 5767690
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5767758 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5767690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17993569 - 17993501
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  17993569 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 17993501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 20441462 - 20441575
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    |||||||||| | || || || |||||||| || ||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||     
T  20441462 gatggacatccaagcatcctacagctgtctactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 20441561  T
Q  111 aagaatgggaagct 124  Q
    ||||||||||||||    
T  20441562 aagaatgggaagct 20441575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 374
Target Start/End: Original strand, 28340766 - 28340887
Alignment:
Q  253 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 352  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  28340766 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctgggggaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 28340865  T
Q  353 caaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  28340866 taaagaaggtctcgggttctcc 28340887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36995871 - 36995750
Alignment:
Q  253 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 352  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  36995871 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 36995772  T
Q  353 caaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  36995771 taaagaaggtctcgggttctcc 36995750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 41438588 - 41438701
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    |||||||||| | || || || |||||||| || ||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||     
T  41438588 gatggacatccaagcatcctacagctgtctactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 41438687  T
Q  111 aagaatgggaagct 124  Q
    ||||||||||||||    
T  41438688 aagaatgggaagct 41438701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 7090936 - 7090873
Alignment:
Q  48 agaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7090936 agaccatggattcatgacgctggggcagtgacatctactctccatcagaaattgaagtttgtaa 7090873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Original strand, 22889863 - 22890216
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22889863 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggtgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 22889962  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |    
T  22889963 agaatggaaagcttgttacaatccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagcaggatctgctgaaggaactac 22890062  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22890063 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaagct 22890162  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22890163 gtcggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 22890216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 16 - 365
Target Start/End: Original strand, 25200427 - 25200776
Alignment:
Q  16 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25200427 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaa 25200526  T
Q  116 tgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25200527 tggaaagcttgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgccttt 25200626  T
Q  216 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 315  Q
    | |||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  25200627 caaggtttgactattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccg 25200726  T
Q  316 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25200727 gctggggcaagttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25200776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 120 - 365
Target Start/End: Original strand, 25264686 - 25264931
Alignment:
Q  120 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25264686 aagcttgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaag 25264785  T
Q  220 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 319  Q
    |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  25264786 gtttgactattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccggctg 25264885  T
Q  320 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25264886 gggcaagttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25264931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 23893600 - 23893952
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  23893600 atggacatcaatgcctcttatagctgtctcttaggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgcaa 23893699  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||| ||| ||||| |||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| || ||||| ||    
T  23893700 agagtggaaagctcgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaaggaaccgc 23893799  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||| | |  | |  |||||||||||||||| || || || || | ||| || |||||||| ||  |     
T  23893800 ttttcaaggtttaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggattgagctgctatggcttctttgaaggatgcacatagggccgtccaagaaggtcaagcc 23893899  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  23893900 gccggctggggcagattaatacaactccgtgagaacaagcataaggaaggtct 23893952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15657529 - 15657176
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  15657529 gatggacattaatgcatcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 15657430  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  15657429 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 15657330  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  15657329 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 15657230  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  15657229 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 15657176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 9318844 - 9319207
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  9318844 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 9318943  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  9318944 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9319043  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  9319044 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 9319143  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9319144 tgccggttggggcaaggtggtacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9319207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40472318 - 40471955
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  40472318 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 40472219  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | ||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  40472218 aggaacggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40472119  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  40472118 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggccgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40472019  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  40472018 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 40471955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 41676102 - 41676455
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  41676102 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 41676201  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  41676202 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaagaagcatacttggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 41676301  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| ||||| ||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  41676302 cttttcaaggattaactgttgaatgtacggagtccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 41676401  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  41676402 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 41676455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 12133548 - 12133911
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  12133548 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 12133647  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  12133648 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12133747  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  12133748 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 12133847  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12133848 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12133911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 26481784 - 26482147
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  26481784 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 26481883  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26481884 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26481983  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  26481984 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26482083  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26482084 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26482147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 11550748 - 11551100
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||| ||    
T  11550748 atggatattaatgcctcttacagctgtctcgtggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaagtttgcaa 11550847  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  11550848 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 11550947  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  11550948 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 11551047  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  11551048 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 11551100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 30936027 - 30936379
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  30936027 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 30936126  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  30936127 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 30936226  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  30936227 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 30936326  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  30936327 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 30936379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 363
Target Start/End: Original strand, 33517749 - 33518101
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  33517749 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 33517848  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  33517849 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 33517948  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  33517949 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 33518048  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtc 363  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||    
T  33518049 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtc 33518101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 3790934 - 3791297
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  3790934 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 3791033  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  3791034 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3791133  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||| ||| | ||||  |||||  |||||  ||||||| |||| || ||||| |||| ||||| | | || ||||| |||||    
T  3791134 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggttgctatgacttcattgaaagatgctcggaaggttatccaggaaggtcagac 3791233  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3791234 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3791297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 28650628 - 28650991
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28650628 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28650727  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  28650728 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 28650827  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  28650828 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 28650927  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28650928 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28650991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 43079645 - 43080008
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  43079645 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 43079744  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  43079745 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 43079844  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  43079845 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 43079944  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  43079945 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 43080008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 33778881 - 33779243
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  33778881 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 33778980  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  33778981 aaagtggaaagcttgttactattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 33779080  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  33779081 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 33779180  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  33779181 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 33779243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 33293918 - 33294271
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||| | ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  33293918 gatggacgttaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 33294017  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  33294018 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 33294117  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  33294118 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 33294217  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  33294218 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 33294271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24686925 - 24686573
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24686925 atggatattaatgcctcttacagctgtctcctggggagaccatggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24686826  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  || ||||| ||||| || ||    
T  24686825 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatataagcagggtctgcagaggggaccgc 24686726  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||| | ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24686725 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24686626  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    | |||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24686625 gtcggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24686573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 24971412 - 24971764
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24971412 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24971511  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  24971512 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttttcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24971611  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24971612 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24971711  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24971712 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24971764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 24682833 - 24683196
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  24682833 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24682932  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  24682933 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24683032  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  24683033 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24683132  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24683133 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24683196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 24725360 - 24725723
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  24725360 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24725459  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  24725460 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24725559  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  24725560 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24725659  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24725660 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24725723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23751218 - 23750856
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  23751218 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 23751119  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  23751118 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 23751019  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  23751018 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23750919  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  23750918 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 23750856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15757626 - 15757263
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  15757626 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 15757527  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||    
T  15757526 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactg 15757427  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  15757426 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 15757328  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  15757327 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 15757263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18499499 - 18499136
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18499499 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 18499400  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  18499399 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 18499300  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||  |    
T  18499299 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaagatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 18499200  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  18499199 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 18499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22997882 - 22997520
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  22997882 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 22997783  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  22997782 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 22997683  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | |||   ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  22997682 ttttcaaggattaactgccgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 22997583  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  22997582 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 22997520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23716756 - 23716394
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  23716756 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 23716657  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  23716656 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 23716557  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  |  || | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  23716556 ttttcaaggattagctgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23716457  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  23716456 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 23716394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8664244 - 8663881
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  8664244 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 8664145  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  8664144 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 8664045  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | ||||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  8664044 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ttggggctgctatggcttcattaaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 8663946  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  8663945 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgcgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 8663881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13323598 - 13323235
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||| |     
T  13323598 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 13323499  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  13323498 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13323399  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  13323398 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 13323300  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  13323299 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 13323235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28958555 - 28958192
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28958555 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28958456  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||  |||| |  || |||||||| || ||||    
T  28958455 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaggcagggtctgctgaagggactg 28958356  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  28958355 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 28958256  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28958255 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28958192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 30169862 - 30170225
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30169862 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30169961  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  30169962 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30170061  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  30170062 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 30170161  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  30170162 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgcaaagaaggtctcgggttctcc 30170225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37357412 - 37357049
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  37357412 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37357313  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  37357312 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37357213  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  37357212 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37357113  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37357112 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37357049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37670252 - 37669937
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  37670252 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37670153  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  37670152 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 37670053  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  37670052 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37669953  T
Q  311 tgccggctggggcaag 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  37669952 tgccggctggggcaag 37669937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 30030808 - 30031171
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30030808 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30030907  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  30030908 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30031007  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  30031008 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattaaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 30031106  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30031107 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30031171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 30153411 - 30153774
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30153411 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30153510  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  30153511 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30153610  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  30153611 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 30153709  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30153710 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30153774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 37756373 - 37756736
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  37756373 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37756472  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  37756473 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37756572  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  37756573 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37756672  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37756673 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37756736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18126164 - 18125811
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18126164 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18126065  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||| ||||  ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || |  || || || ||||| || |    
T  18126064 aggaatggaaagcttgttaccattcatggaaaagaggcatacctggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccg 18125965  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | ||||  ||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || || ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  18125964 cttttcagggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaaccgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18125865  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18125864 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18125811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 6875698 - 6876061
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  6875698 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 6875797  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||    
T  6875798 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 6875897  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  6875898 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 6875996  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  6875997 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6876061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31825176 - 31824813
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31825176 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31825077  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  31825076 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31824977  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  31824976 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 31824878  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31824877 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31824813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 34617911 - 34618274
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  34617911 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 34618010  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  34618011 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 34618110  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  34618111 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 34618209  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34618210 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34618274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 31432834 - 31433196
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  31432834 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 31432933  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| | || ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  31432934 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttatcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 31433033  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  31433034 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31433132  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31433133 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31433196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37769725 - 37769441
Alignment:
Q  42 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 141  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  37769725 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 37769626  T
Q  142 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 241  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  37769625 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 37769526  T
Q  242 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 326  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37769525 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 37769441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 2512444 - 2512807
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  2512444 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 2512543  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| || | || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||    
T  2512544 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcacacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 2512643  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  | || ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  2512644 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 2512742  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  2512743 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 2512807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13440135 - 13440067
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13440135 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 13440067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18374062 - 18373941
Alignment:
Q  253 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 352  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  18374062 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 18373963  T
Q  353 caaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  18373962 taaagaaggtctcgggttctcc 18373941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9548184 - 9548116
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  9548184 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 9548116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Original strand, 11326315 - 11326383
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11326315 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 11326383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13184290 - 13184222
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13184290 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 13184222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 374
Target Start/End: Original strand, 5639422 - 5639543
Alignment:
Q  253 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 352  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  5639422 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 5639521  T
Q  353 caaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  5639522 taaagaaggtctcgggttctcc 5639543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32594801 - 32594689
Alignment:
Q  253 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 352  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  32594801 ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 32594702  T
Q  353 caaagaaggtctc 365  Q
     ||||||||||||    
T  32594701 taaagaaggtctc 32594689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 124
Target Start/End: Original strand, 34467047 - 34467122
Alignment:
Q  49 gaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 124  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  34467047 gaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatgggaagct 34467122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20390507 - 20390438
Alignment:
Q  295 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||    
T  20390507 ttcaagaaggaaaagctgaaggctgggggaagttagtacagctgcccgagaacaagcacaaagaaggtct 20390438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Original strand, 16042709 - 16043062
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16042709 atggacatcaacgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcaataacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtga 16042808  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16042809 agaatggaaagctcgttacggtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 16042908  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16042909 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaagactggggctactatggcttcttttaaagatgctcagaaggttgttcaagaaggacaggct 16043008  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16043009 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16043062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16448755 - 16448402
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16448755 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 16448656  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||| |    
T  16448655 agaatggaaagcttgttacggtccatggagaagaagcatatttggttagccagctgtcatctttctctagcattgaatctggatctgctgaagaaactac 16448556  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
    ||| | |||  |||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16448555 cttccaaggtttgactattgaaggtacagagcctaagaaagctggggctgctatggtttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 16448456  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448455 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 16448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5146098 - 5145735
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  5146098 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 5145999  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  5145998 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5145899  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  5145898 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctttggcttcgttgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 5145799  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5145798 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5145735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 5129378 - 5129740
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  5129378 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 5129477  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  5129478 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 5129577  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  5129578 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 5129677  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  5129678 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 5129740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26318627 - 26318264
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  26318627 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 26318528  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26318527 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26318428  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  26318427 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26318328  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26318327 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcggtttctcc 26318264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26536628 - 26536274
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  26536628 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26536529  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26536528 aagaatggaaaactcgttacaatccatggcgaagaagcatacttagtcagccagctgtcgtccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26536429  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  26536428 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 26536329  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26536328 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26536274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 5160905 - 5161257
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  5160905 atggatattaatgcctcttacagctgtctcctggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 5161004  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||  || ||||| ||||| || ||    
T  5161005 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagtagcagggtctgcagaggggaccgc 5161104  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  ||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||  | ||||| || ||  ||    
T  5161105 ttttcaaggattgactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccatccaagagggccaagct 5161204  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  5161205 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 5161257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 26436642 - 26436957
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  26436642 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 26436741  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26436742 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26436841  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  26436842 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26436941  T
Q  311 tgccggctggggcaag 326  Q
    |||||| |||||||||    
T  26436942 tgccggttggggcaag 26436957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10915625 - 10915263
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  10915625 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 10915526  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | |  || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  10915525 aaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggttctgcagaggggaccgc 10915426  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  10915425 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 10915326  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||  ||| |||| || || ||||| ||| | || ||||||||  ||||||||    
T  10915325 gccggctggggcagattaatacagcttcgtgagaacaagtataaggaaggtcttggcttctcc 10915263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16502143 - 16501796
Alignment:
Q  27 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 126  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16502143 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16502044  T
Q  127 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 226  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  16502043 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16501944  T
Q  227 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 326  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  16501943 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 16501844  T
Q  327 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  16501843 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 16501796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 26514166 - 26514529
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  26514166 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26514265  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26514266 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26514365  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  26514366 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 26514465  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26514466 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26514529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 31126305 - 31126668
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||| |     
T  31126305 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 31126404  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  31126405 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31126504  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  31126505 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31126604  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31126605 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31126668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11423534 - 11423172
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  11423534 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 11423435  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  11423434 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 11423335  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||| ||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |     
T  11423334 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacgaagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagcc 11423235  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    || |||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  11423234 gctggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 11423172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31563148 - 31562785
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31563148 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31563049  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  31563048 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 31562949  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  31562948 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31562849  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31562848 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31562785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 2155959 - 2156311
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  2155959 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 2156058  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  2156059 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggtagggtctgcagaggggaccgc 2156158  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||| |  |||| |  ||| ||||  ||||||||||| || || || ||||  || |||||||| || ||  ||    
T  2156159 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacctaagagggatggaactgacatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagct 2156258  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| || || || ||||||||    
T  2156259 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtct 2156311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 3446691 - 3447054
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  3446691 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 3446790  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  3446791 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3446890  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  3446891 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 3446989  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3446990 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3447054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 9620036 - 9620399
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  9620036 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 9620135  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  9620136 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9620235  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  9620236 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 9620334  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9620335 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9620399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16517179 - 16516832
Alignment:
Q  27 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 126  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16517179 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16517080  T
Q  127 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 226  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  16517079 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16516980  T
Q  227 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 326  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||| ||||||||| |    
T  16516979 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccagctggggcagg 16516880  T
Q  327 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||| || | || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  16516879 ttaataaagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 16516832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 11442264 - 11442627
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  11442264 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11442363  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  11442364 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11442463  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| | ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  11442464 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ccggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 11442562  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  11442563 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 11442627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26273852 - 26273489
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  26273852 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26273753  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26273752 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26273653  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  26273652 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 26273554  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26273553 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26273489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16735218 - 16734855
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  16735218 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16735119  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16735118 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16735019  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  16735018 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16734919  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16734918 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16734855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16750272 - 16749909
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  16750272 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16750173  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16750172 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16750073  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  16750072 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16749973  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16749972 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16749909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 17524917 - 17525280
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  17524917 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17525016  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  17525017 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17525116  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  17525117 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 17525216  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  17525217 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17525280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17528298 - 17527935
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  17528298 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17528199  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  17528198 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17528099  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  17528098 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 17527999  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  17527998 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17527935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24591299 - 24590936
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  24591299 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24591200  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  24591199 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24591100  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  24591099 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24591000  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
     ||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24590999 cgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24590936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26668640 - 26668309
Alignment:
Q  43 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 142  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  26668640 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaaaaatggaaaactcgttacaatccatggtga 26668541  T
Q  143 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 242  Q
    |||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | |||    
T  26668540 agaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagag 26668441  T
Q  243 -ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 341  Q
     || | |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  26668440 tctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattaaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 26668342  T
Q  342 gagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26668341 gagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26668309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2108635 - 2108567
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2108635 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 2108567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 45388789 - 45388968
Alignment:
Q  195 tctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctg 294  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||      
T  45388789 tctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagcca 45388888  T
Q  295 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  45388889 ttcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 45388968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Original strand, 45733973 - 45734041
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  45733973 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 45734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 18542184 - 18542291
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18542184 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18542283  T
Q  111 aagaatgg 118  Q
    ||||||||    
T  18542284 aagaatgg 18542291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 374
Target Start/End: Original strand, 4201060 - 4201137
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4201060 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4201137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31088094 - 31088033
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaaga 358  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31088094 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaaga 31088033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 800234 - 800159
Alignment:
Q  49 gaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 124  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  800234 gaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatgggaagct 800159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4143762 - 4143641
Alignment:
Q  253 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 352  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  4143762 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 4143663  T
Q  353 caaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  4143662 taaagaaggtctcgggttctcc 4143641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16206902 - 16206549
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16206902 atggacatcaatgcctattatagctgtctcttgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtga 16206803  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  16206802 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagccggatctgctgaaggaactgc 16206703  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16206702 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaaaaagactggggctactatggcttcttttaaagacgctcagaaggctgttcaggaaggacaggct 16206603  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16206602 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcataaggaaggtctc 16206549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Original strand, 20462469 - 20462655
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20462469 atggatatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccaacaattgaagtttgtaa 20462568  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20462569 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctg 20462655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 10964053 - 10964416
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  10964053 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10964152  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  10964153 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10964252  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  10964253 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 10964351  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10964352 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10964416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 51639601 - 51639964
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||  | || ||||| ||||| |||||     
T  51639601 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 51639700  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  51639701 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 51639800  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  51639801 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 51639899  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  51639900 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 51639964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 28586364 - 28586727
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28586364 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28586463  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  28586464 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 28586563  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  28586564 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 28586663  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28586664 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28586727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 41792180 - 41791817
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  41792180 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 41792081  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||    
T  41792080 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 41791981  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  41791980 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 41791882  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  41791881 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 41791817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 10946462 - 10946825
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  10946462 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10946561  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  10946562 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10946661  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| ||||    
T  10946662 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcaga 10946760  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10946761 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10946825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Original strand, 20462656 - 20462727
Alignment:
Q  303 ggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20462656 ggacaggctgccggatggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctcgggttctcc 20462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22079732 - 22079379
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22079732 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctaggaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccaaaagttaaagtttgtaa 22079633  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| ||    
T  22079632 agaatggaaagctcgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgc 22079533  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     ||||  ||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| | |||||| ||  ||    
T  22079532 ttttcagggtttgactatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtcctagaaggtcaagct 22079433  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  22079432 accggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacagagagggtctc 22079379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 16284834 - 16285186
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  16284834 atggatatcaatgcctcttatatctgtctcttgggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccttgcaccagaagttgaagtttgcaa 16284933  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | |  || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||| ||    
T  16284934 aaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgc 16285033  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||| | |  ||| ||||||||||||||||| || || || ||||  || ||  ||||||| ||  ||    
T  16285034 ttttcaaggtttaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtctaagaaggtcaagct 16285133  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16285134 gccggctggggcaggttaatacaacttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16285186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27607735 - 27607373
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  | ||||| || ||||| |||| ||    
T  27607735 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaa 27607636  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | ||||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  27607635 aaaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 27607536  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| ||| || ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  27607535 ttttcaaggactaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 27607436  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  27607435 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 27607373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 18792092 - 18792454
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  18792092 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 18792191  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  18792192 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 18792291  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  18792292 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 18792391  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18792392 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18792454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 19675825 - 19676188
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  19675825 gatggacattaatgcctcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgctggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 19675924  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  19675925 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagtagggtctgctgaagggactg 19676024  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  19676025 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 19676124  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  19676125 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19676188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19207190 - 19206828
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  19207190 atggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 19207091  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||  |||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  19207090 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 19206991  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     || | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||    
T  19206990 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagact 19206891  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  19206890 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19206828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 374
Target Start/End: Original strand, 19689498 - 19689845
Alignment:
Q  27 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 126  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  19689498 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 19689597  T
Q  127 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 226  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  19689598 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 19689697  T
Q  227 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 326  Q
    | | ||||||||||| |  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  19689698 tgtcgaaggtacggaacctaagagggatggaactgcgatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 19689797  T
Q  327 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  19689798 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 19689845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 9356007 - 9356370
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||||    
T  9356007 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgta 9356106  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  9356107 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9356206  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  9356207 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 9356305  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9356306 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9356370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3328338 - 3327975
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  3328338 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 3328239  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  3328238 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 3328139  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  3328138 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 3328039  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3328038 tgccggctggggcaagatgatacaactctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3327975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 14559009 - 14559371
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||  |    
T  14559009 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcca 14559108  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | |  || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  14559109 aaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttaaccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 14559208  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |   || ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  14559209 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggagggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 14559308  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||| | || ||||||||  ||||||||    
T  14559309 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagtataaggaaggtcttagcttctcc 14559371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2136089 - 2135727
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  2136089 atggatattaatgcctcttacagttgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 2135990  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  2135989 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacccggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 2135890  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  2135889 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 2135790  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  2135789 gccggttggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 2135727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 16278939 - 16279290
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  16278939 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 16279038  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |     
T  16279039 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg- 16279137  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    ||||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  16279138 ctttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 16279236  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16279237 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16279290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 29830707 - 29831069
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  29830707 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 29830806  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||  ||||||| || |||||    
T  29830807 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggcctgctgaagggactgc 29830906  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  29830907 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 29831005  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29831006 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29831069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12091555 - 12091240
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  12091555 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 12091456  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  12091455 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 12091356  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  12091355 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 12091256  T
Q  311 tgccggctggggcaag 326  Q
    | ||||||||||||||    
T  12091255 taccggctggggcaag 12091240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 31355909 - 31356272
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31355909 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31356008  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  31356009 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31356108  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  31356109 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 31356207  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31356208 ctgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31356272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 33260107 - 33260470
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  33260107 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 33260206  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  33260207 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 33260306  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  | || ||||||||| | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  33260307 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 33260406  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  33260407 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 33260470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28360786 - 28360471
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28360786 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28360687  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  28360686 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 28360587  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacgga-gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | || ||| | |||| ||||| | ||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  28360586 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagaggctaaggaag-ctggggccgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 28360488  T
Q  310 ctgccggctggggcaag 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  28360487 ctgccggctggggcaag 28360471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Original strand, 33245177 - 33245245
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33245177 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 33245245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31488520 - 31488341
Alignment:
Q  195 tctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctg 294  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||      
T  31488520 tctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagcca 31488421  T
Q  295 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31488420 ttcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31488341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19658743 - 19658675
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19658743 caagaaggacaagctgctggctggggcaagataatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 19658675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17091260 - 17090907
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  17091260 atggatatcaacgcttcttatagctgtcttctgggaaggccgtggatacatgacgcgggcgcagtaacctccaccctgcaccagaagttaaagtttgtga 17091161  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  ||||||||||| || |||||    
T  17091160 ggaatggaaagctcgtcacagtccatggtgaagaagcatacttagttagccaactgtcatccttctcctgtattgaagcaggatctgctgaagggactgc 17091061  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  |||| |||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17091060 ttttcaaggattgaccattgaaggtacggagcccaagaaggttagggctgctatggcttctttgaaggacgctcagaaggctattcaagaaggacaggct 17090961  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  17090960 gccggttggggtaagttgatacaactctatgagaataaacacaaagaaggtctc 17090907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27628520 - 27628206
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |    
T  27628520 atggatattaatgcttcatacagctgcctcttgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtga 27628421  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  27628420 agaatggaaaactcgttacagtccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 27628321  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     || | |||  |||| ||||||||  ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | |||||||||| ||||||    
T  27628320 tttccaaggtttgaccattgaaggcgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaagaaggtcagact 27628221  T
Q  312 gccggctggggcaag 326  Q
    |||||||||||||||    
T  27628220 gccggctggggcaag 27628206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 16675520 - 16675883
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  16675520 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 16675619  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16675620 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16675719  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  16675720 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 16675819  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16675820 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16675883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 29550856 - 29551219
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  29550856 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 29550955  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  29550956 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 29551055  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  29551056 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 29551155  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  29551156 tgccggctggggcaagttagtacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 29551219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Original strand, 3697462 - 3697816
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | |||||||| ||||| |||||     
T  3697462 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacaccagaagttgaaatttgtg 3697561  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  3697562 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3697661  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  3697662 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 3697761  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  3697762 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 3697816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26776425 - 26776062
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  26776425 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 26776326  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    | |||||  ||||| |||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26776325 aggaatgaaaagctcgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26776226  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  26776225 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26776126  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26776125 tgccggatggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26776062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24303432 - 24303070
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24303432 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24303333  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  24303332 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24303233  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  ||    
T  24303232 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagct 24303133  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  24303132 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24303070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22933694 - 22933342
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| |||| ||    
T  22933694 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaa 22933595  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||| || ||    
T  22933594 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgc 22933495  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  22933494 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 22933395  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22933394 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 22933342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23856139 - 23855787
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| |||| ||    
T  23856139 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaa 23856040  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||| || ||    
T  23856039 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgc 23855940  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  23855939 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23855840  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23855839 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 23855787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15423131 - 15422779
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  15423131 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 15423032  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  15423031 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 15422932  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  ||    
T  15422931 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagct 15422832  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15422831 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15422779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27271394 - 27271078
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || |||||||| || || || ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |    
T  27271394 atggatattaatgcttcatacagttgcctcttgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaaattaaagtttgtga 27271295  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    ||||||| || || || ||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  27271294 agaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 27271195  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     || |  ||  |||| |||||||||   ||||  |||| |  |||  |||| |||||||| |||||||| ||||||| || | |||| ||||| ||||||    
T  27271194 tttccagggtttgaccattgaaggtgtagagcctaagagggatggagctgccatggcttcattaaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 27271095  T
Q  312 gccggctggggcaagtt 328  Q
    ||||| |||||||||||    
T  27271094 gccggttggggcaagtt 27271078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 29502796 - 29503159
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  29502796 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 29502895  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  29502896 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29502995  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  29502996 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 29503094  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29503095 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29503159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 27020520 - 27020883
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  27020520 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 27020619  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  27020620 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 27020719  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||| || | || |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  27020720 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaggagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 27020819  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  27020820 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 27020883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 27045769 - 27046132
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  27045769 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27045868  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27045869 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27045968  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  27045969 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 27046068  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27046069 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27046132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 20162073 - 20162179
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  20162073 atggatatcaatgcttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtga 20162172  T
Q  112 agaatgg 118  Q
    |||||||    
T  20162173 agaatgg 20162179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22170758 - 22170652
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  22170758 atggatatcaatgcttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtga 22170659  T
Q  112 agaatgg 118  Q
    |||||||    
T  22170658 agaatgg 22170652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 24865099 - 24865461
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24865099 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24865198  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  24865199 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagccgggtctgcagaggggaccgc 24865298  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||| |||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24865299 ttttcaaggattaactgtcgaaggaacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24865398  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    | ||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  24865399 gtcggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24865461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13297765 - 13297413
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  13297765 atggacattaacgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgagagcgatgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 13297666  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || ||    
T  13297665 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgc 13297566  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || |||||||| || ||  ||    
T  13297565 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagct 13297466  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  13297465 gccggctggggcaggttaatacagcttcgcgagaacaagcataaggaaggtct 13297413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 26919762 - 26920114
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||| |||| | |||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  26919762 atggatattaatgcctcttacagttgcctcttggggaaaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 26919861  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | ||||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  26919862 aaaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagtcagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 26919961  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  26919962 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 26920061  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  26920062 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 26920114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 16751236 - 16751598
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  16751236 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 16751335  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  16751336 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 16751435  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||| ||| |  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||||| ||||| || ||  ||    
T  16751436 ttttcaaggattaactgtcgaaggtatggaacctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagctgtccaagagggtcaagct 16751535  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  16751536 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 16751598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27289184 - 27288822
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  27289184 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 27289085  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||    
T  27289084 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccaactatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgc 27288985  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||| ||||  || | |  |||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||||||    
T  27288984 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacagagcctaaaagggatggagctgccatggcttctttgaaagatgcgcagagagccgtccaagagggtcagact 27288885  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    || || ||||||||| |  |||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27288884 gctgggtggggcaaggtgatacagctccgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27288822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 374
Target Start/End: Original strand, 20162176 - 20162360
Alignment:
Q  190 atggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||| |||||| | |||| |||||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  20162176 atggatctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaa 20162275  T
Q  290 ggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||  || ||||||||| | ||||||    
T  20162276 ggctgttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctcagattctcc 20162360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22170655 - 22170471
Alignment:
Q  190 atggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||| |||||| | |||| |||||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  22170655 atggatctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaa 22170556  T
Q  290 ggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||  || ||||||||| | ||||||    
T  22170555 ggctgttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctcagattctcc 22170471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26115225 - 26114910
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  26115225 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26115126  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||    
T  26115125 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcaggatctgctgaagggactg 26115026  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  26115025 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 26114927  T
Q  310 ctgccggctggggcaag 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  26114926 ctgccggctggggcaag 26114910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 27009111 - 27009474
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||| |     
T  27009111 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 27009210  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27009211 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27009310  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  27009311 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 27009409  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27009410 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27009474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30556831 - 30556468
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30556831 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30556732  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  30556731 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 30556632  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  30556631 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 30556533  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30556532 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30556468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 4759145 - 4759508
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||| ||||| |||||     
T  4759145 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 4759244  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  4759245 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4759344  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  4759345 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4759444  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4759445 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4759508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 27486510 - 27486825
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  27486510 gatggacattaatgcatcctacagttgcctactgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27486609  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  |||||||| || || ||||    
T  27486610 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgccgaagggactg 27486709  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  27486710 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 27486809  T
Q  311 tgccggctggggcaag 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  27486810 tgccggctggggcaag 27486825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 28208835 - 28209150
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28208835 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28208934  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  28208935 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 28209034  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  28209035 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 28209134  T
Q  311 tgccggctggggcaag 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  28209135 tgccggctggggcaag 28209150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 4526667 - 4527030
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||| ||||| |||||     
T  4526667 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 4526766  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  4526767 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4526866  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||  | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  4526867 ctttccaaggtttgaccattgaaggcgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4526966  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4526967 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4527030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4544590 - 4544236
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  4544590 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4544491  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  4544490 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4544391  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| || |||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  4544390 ctttccaaggtttgaccatcgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 4544292  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4544291 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4544236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16942842 - 16942479
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  16942842 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16942743  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16942742 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16942643  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  ||||  |||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  16942642 ctttccaaggtttgaccgttgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16942543  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16942542 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16942479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 205
Target Start/End: Original strand, 26990271 - 26990464
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  26990271 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 26990370  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgaggg 205  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||    
T  26990371 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggatctgcagaggg 26990464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4722949 - 4722634
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  4722949 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4722850  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  4722849 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4722750  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| || |||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  4722749 ctttccaaggtttgaccatcgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 4722651  T
Q  310 ctgccggctggggcaag 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  4722650 ctgccggctggggcaag 4722634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 29574394 - 29574757
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  29574394 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 29574493  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| | || || |||||  |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  29574494 aagaatggaaaactcgttacaattcacggtgaagaggcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29574593  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  29574594 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 29574692  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29574693 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29574757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 34913795 - 34913563
Alignment:
Q  120 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 219  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| ||    
T  34913795 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaag 34913696  T
Q  220 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 319  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || |||||  | ||  ||||||||||    
T  34913695 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagagtcaagctgccggctg 34913596  T
Q  320 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 352  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| |||||    
T  34913595 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagca 34913563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 374
Target Start/End: Original strand, 4774506 - 4774627
Alignment:
Q  253 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 352  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| |||||    
T  4774506 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagca 4774605  T
Q  353 caaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  4774606 taaagaaggtctcgggttctcc 4774627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8891998 - 8891930
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  8891998 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 8891930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8903233 - 8903165
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  8903233 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 8903165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Original strand, 28163166 - 28163234
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  28163166 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 28163234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33373943 - 33373875
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  33373943 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 33373875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1697 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1697
Description:

Target: scaffold1697; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1312 - 949
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||     
T  1312 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggtgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 1213  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  1212 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatatttggtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 1113  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  ||||  |||| ||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| | | |||| ||||| |||||    
T  1112 ctttccaaggtttgacctttgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaagttattcaggaaggtcagac 1013  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| || || ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  1012 tgccggttggggcaaggtgatacagcttcgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6108 - 5746
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||| ||||| || || || ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  |||    
T  6108 atggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataa 6009  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
     |||||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  6008 ggaatggaaaacttgttaccattcatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 5909  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | ||||| || ||||||    
T  5908 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaagagggtcagact 5809  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5808 gccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 267 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 46232 - 46134
Alignment:
Q  267 gcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46232 gcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 46134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 31838 - 32190
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  31838 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 31937  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  31938 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 32037  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || |||||||| ||  ||    
T  32038 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagaaggtcaagct 32137  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||  ||||| || ||||||||    
T  32138 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagagcaagcataaggaaggtct 32190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 31142 - 31494
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||    
T  31142 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccagaagttgaaatttgcaa 31241  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  31242 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 31341  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  31342 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 31441  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  31442 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 31494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45841 - 45504
Alignment:
Q  27 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 126  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  45841 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtgggaagcttg 45742  T
Q  127 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 226  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| |||  | ||    
T  45741 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 45642  T
Q  227 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 326  Q
    | | |||||||||||||  || | |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  45641 tgtcgaaggtacggagcctaaaagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 45542  T
Q  327 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  45541 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 45504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38940 - 38600
Alignment:
Q  12 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  38940 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 38841  T
Q  112 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 211  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  38840 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 38741  T
Q  212 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 311  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  38740 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 38641  T
Q  312 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 352  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||    
T  38640 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagca 38600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 10950 - 11265
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  10950 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgtgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11049  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||| ||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  11050 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagctagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11149  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  11150 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 11249  T
Q  311 tgccggctggggcaag 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  11250 tgccggctggggcaag 11265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Original strand, 28693 - 29030
Alignment:
Q  27 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 126  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  28693 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacccctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 28792  T
Q  127 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 226  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  28793 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 28892  T
Q  227 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 326  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  28893 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 28992  T
Q  327 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 364  Q
    ||| || | || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  28993 ttaatatagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 29030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 7399 - 7762
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  7399 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 7498  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  7499 aagaatggaaagctcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 7598  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  |||||||||| ||||    
T  7599 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccattcaagaaggtcaga 7697  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  7698 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 7762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 9333 - 9648
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  9333 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 9432  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  9433 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 9532  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  9533 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 9632  T
Q  311 tgccggctggggcaag 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  9633 tgccggctggggcaag 9648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13802 - 13439
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  13802 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 13703  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  13702 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13603  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 309  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  13602 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 13504  T
Q  310 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  13503 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 13439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25073 - 24710
Alignment:
Q  11 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 110  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  25073 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24974  T
Q  111 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 210  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  24973 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 24874  T
Q  211 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  24873 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24774  T
Q  311 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24773 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Original strand, 22073 - 22141
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  22073 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 22141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 119642 - 119574
Alignment:
Q  297 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 365  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  119642 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 119574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 253 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7819 - 7707
Alignment:
Q  253 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 352  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  7819 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 7720  T
Q  353 caaagaaggtctc 365  Q
     ||||||||||||    
T  7719 taaagaaggtctc 7707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 253 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21372 - 21260
Alignment:
Q  253 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 352  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  21372 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 21273  T
Q  353 caaagaaggtctc 365  Q
     ||||||||||||    
T  21272 taaagaaggtctc 21260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Original strand, 27711 - 27904
Alignment:
Q  133 tccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattga 232  Q
    ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  |||| |||||| || ||||| || | |||  ||||  ||||    
T  27711 tccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcaggatttgctgaagggactgctttccaaggtttgaccgttga 27810  T
Q  233 aggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 326  Q
    |||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27811 aggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 27904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University