View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11325_low_2 (Length: 483)

Name: NF11325_low_2
Description: NF11325
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11325_low_2
NF11325_low_2
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (41-473)||(54635027-54635462)
chr3 (20-473)||(45282885-45283344)
chr3 (46-473)||(6716402-6716834)
chr3 (20-461)||(3617363-3617812)
chr3 (20-461)||(25637342-25637792)
chr3 (20-461)||(4600550-4600998)
chr3 (20-461)||(4598329-4598777)
chr3 (20-461)||(10211309-10211757)
chr3 (47-412)||(7779842-7780208)
chr3 (20-461)||(10209089-10209537)
chr3 (45-473)||(800993-801419)
chr3 (20-461)||(10056133-10056581)
chr3 (20-461)||(10058355-10058803)
chr3 (20-461)||(10060577-10061025)
chr3 (20-461)||(10062799-10063247)
chr3 (20-461)||(10065021-10065469)
chr3 (45-473)||(23199976-23200410)
chr3 (92-473)||(23197823-23198211)
chr3 (45-473)||(5257983-5258417)
chr3 (93-473)||(9636010-9636400)
chr3 (45-463)||(5260162-5260586)
chr3 (284-461)||(10067243-10067419)
chr3 (341-473)||(6718586-6718718)
chr3 (93-372)||(19683774-19684054)
chr3 (93-463)||(45095070-45095445)
chr3 (97-375)||(37408458-37408737)
chr3 (93-375)||(7762265-7762548)
chr3 (93-364)||(7764476-7764747)
chr3 (93-463)||(9581188-9581565)
chr3 (20-247)||(10067435-10067668)
chr3 (189-375)||(34491212-34491397)
chr3 (196-375)||(49199457-49199638)
chr3 (208-375)||(4569952-4570120)
chr3 (188-375)||(29196368-29196555)
chr3 (196-375)||(43401789-43401970)
chr3 (228-372)||(39153381-39153526)
chr3 (45-463)||(760752-761173)
chr3 (196-371)||(30236129-30236304)
chr3 (93-375)||(5236343-5236624)
chr3 (93-375)||(29810868-29811150)
chr3 (97-463)||(40735288-40735660)
chr3 (208-375)||(6095600-6095767)
chr3 (208-375)||(40734498-40734665)
chr3 (208-375)||(44331545-44331712)
chr3 (208-375)||(46860474-46860642)
chr3 (219-372)||(22835014-22835167)
chr3 (188-373)||(31314447-31314631)
chr3 (208-375)||(41819523-41819691)
chr3 (200-375)||(43403736-43403913)
chr3 (219-375)||(44700491-44700646)
chr3 (95-371)||(51398818-51399094)
chr3 (208-375)||(54593704-54593871)
chr3 (188-463)||(32744418-32744689)
chr3 (208-458)||(29682269-29682526)
chr3 (226-375)||(53921521-53921671)
chr3 (219-373)||(32891105-32891260)
chr3 (219-356)||(46173377-46173513)
chr3 (208-375)||(29813063-29813230)
chr3 (196-317)||(40913352-40913472)
chr3 (188-372)||(16499033-16499215)
chr3 (188-372)||(9666448-9666632)
chr3 (188-375)||(23391891-23392077)
chr3 (208-315)||(55301972-55302079)
chr3 (258-375)||(51352161-51352278)
chr3 (303-375)||(5433971-5434046)
chr3 (208-372)||(47304254-47304418)
chr3 (188-366)||(23410311-23410487)
chr3 (241-375)||(36018852-36018987)
chr3 (258-370)||(4055813-4055926)
chr3 (219-275)||(27305722-27305777)
chr3 (304-363)||(28253363-28253423)
chr3 (258-317)||(4075520-4075581)
chr3 (93-135)||(9634707-9634750)
chr3 (302-355)||(25517069-25517121)
chr3 (303-355)||(4386875-4386926)
[»] chr1 (71 HSPs)
chr1 (18-473)||(21053860-21054316)
chr1 (45-473)||(40282279-40282711)
chr1 (18-473)||(9987104-9987560)
chr1 (45-463)||(9036329-9036751)
chr1 (45-473)||(20622072-20622504)
chr1 (20-461)||(44203547-44203994)
chr1 (45-473)||(51765290-51765728)
chr1 (48-376)||(13316194-13316521)
chr1 (93-372)||(8550670-8550952)
chr1 (93-473)||(20762567-20762950)
chr1 (115-375)||(3189330-3189590)
chr1 (115-375)||(3198147-3198407)
chr1 (115-375)||(3206986-3207246)
chr1 (93-463)||(3156771-3157147)
chr1 (208-375)||(37168297-37168465)
chr1 (208-375)||(13547090-13547257)
chr1 (196-375)||(42297963-42298143)
chr1 (97-375)||(44455160-44455438)
chr1 (93-375)||(49918350-49918632)
chr1 (208-375)||(13549001-13549168)
chr1 (188-375)||(28265536-28265722)
chr1 (208-375)||(29136247-29136415)
chr1 (208-375)||(47255340-47255508)
chr1 (190-375)||(28220210-28220394)
chr1 (188-372)||(834149-834332)
chr1 (208-375)||(11348698-11348865)
chr1 (208-375)||(7482231-7482399)
chr1 (188-375)||(4552619-4552805)
chr1 (208-375)||(31925708-31925875)
chr1 (93-375)||(31659238-31659520)
chr1 (93-375)||(37503443-37503722)
chr1 (208-375)||(37033072-37033241)
chr1 (208-375)||(47115171-47115340)
chr1 (110-375)||(28223325-28223589)
chr1 (208-375)||(19754494-19754662)
chr1 (93-375)||(37559751-37560037)
chr1 (208-375)||(193611-193778)
chr1 (228-375)||(23555286-23555433)
chr1 (208-375)||(45644355-45644523)
chr1 (188-375)||(50169192-50169378)
chr1 (219-375)||(34603576-34603733)
chr1 (231-375)||(1833522-1833667)
chr1 (188-375)||(50167157-50167343)
chr1 (188-372)||(3847103-3847286)
chr1 (188-372)||(13659318-13659501)
chr1 (188-372)||(46064921-46065104)
chr1 (188-375)||(41360914-41361101)
chr1 (232-370)||(22079322-22079461)
chr1 (258-463)||(196958-197171)
chr1 (228-357)||(15820326-15820455)
chr1 (208-290)||(28242391-28242472)
chr1 (219-375)||(19752685-19752842)
chr1 (228-354)||(927996-928123)
chr1 (188-290)||(36683766-36683866)
chr1 (188-372)||(40122178-40122363)
chr1 (261-375)||(30476499-30476614)
chr1 (302-375)||(37879005-37879079)
chr1 (303-372)||(8871143-8871213)
chr1 (232-375)||(13138000-13138142)
chr1 (208-290)||(37876767-37876848)
chr1 (258-361)||(3460710-3460815)
chr1 (271-370)||(12318585-12318685)
chr1 (289-353)||(48382441-48382505)
chr1 (258-321)||(16455676-16455739)
chr1 (294-357)||(32736952-32737015)
chr1 (294-357)||(35109493-35109556)
chr1 (236-321)||(5459961-5460046)
chr1 (258-361)||(37282741-37282846)
chr1 (258-321)||(6808507-6808571)
chr1 (216-276)||(8871071-8871130)
chr1 (93-132)||(10925464-10925504)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (21-473)||(29720266-29720721)
chr5 (21-473)||(29722426-29722881)
chr5 (18-473)||(29750967-29751426)
chr5 (20-463)||(10593170-10593620)
chr5 (20-473)||(22536104-22536553)
chr5 (20-461)||(25078034-25078483)
chr5 (20-461)||(25136003-25136452)
chr5 (20-461)||(40380006-40380453)
chr5 (20-461)||(40382217-40382664)
chr5 (20-461)||(16544323-16544773)
chr5 (20-461)||(16546545-16546995)
chr5 (45-473)||(9789061-9789490)
chr5 (47-473)||(18441483-18441914)
chr5 (45-473)||(16409377-16409808)
chr5 (47-473)||(26177785-26178213)
chr5 (47-473)||(26170676-26171093)
chr5 (45-473)||(30182484-30182917)
chr5 (93-458)||(25412672-25413042)
chr5 (45-473)||(13342956-13343389)
chr5 (45-473)||(36073882-36074317)
chr5 (110-445)||(13239674-13240016)
chr5 (110-375)||(32636824-32637088)
chr5 (188-356)||(37439161-37439328)
chr5 (208-375)||(213465-213633)
chr5 (208-375)||(40147261-40147428)
chr5 (93-458)||(30682809-30683178)
chr5 (208-375)||(28278316-28278483)
chr5 (110-375)||(42428334-42428598)
chr5 (213-375)||(13488203-13488365)
chr5 (208-375)||(5058047-5058212)
chr5 (188-445)||(16452003-16452266)
chr5 (213-375)||(28750661-28750823)
chr5 (191-375)||(533769-533952)
chr5 (188-463)||(31182878-31183157)
chr5 (231-375)||(13695713-13695859)
chr5 (97-372)||(39468439-39468714)
chr5 (188-458)||(33831590-33831866)
chr5 (185-372)||(8565926-8566111)
chr5 (210-375)||(27637615-27637781)
chr5 (228-375)||(42426255-42426403)
chr5 (188-372)||(3075640-3075823)
chr5 (219-372)||(538028-538181)
chr5 (229-361)||(16640961-16641091)
chr5 (219-372)||(9049354-9049506)
chr5 (208-375)||(27015531-27015690)
chr5 (228-371)||(38747009-38747153)
chr5 (208-285)||(19806454-19806530)
chr5 (219-369)||(316769-316920)
chr5 (215-321)||(42309943-42310048)
chr5 (259-321)||(10054867-10054929)
chr5 (220-321)||(33906042-33906144)
chr5 (232-273)||(4160702-4160743)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (20-473)||(25689857-25690312)
chr8 (20-473)||(3439406-3439860)
chr8 (20-461)||(15290438-15290886)
chr8 (20-461)||(15470807-15471255)
chr8 (20-461)||(42575131-42575578)
chr8 (47-473)||(2627637-2628066)
chr8 (45-473)||(31218152-31218586)
chr8 (45-463)||(34254170-34254591)
chr8 (93-473)||(17982548-17982935)
chr8 (93-463)||(34256393-34256767)
chr8 (46-473)||(19945199-19945633)
chr8 (93-463)||(44303759-44304137)
chr8 (93-375)||(42498193-42498477)
chr8 (93-473)||(1746105-1746491)
chr8 (97-375)||(15212786-15213064)
chr8 (93-375)||(33352150-33352432)
chr8 (208-375)||(42434992-42435159)
chr8 (97-375)||(4731658-4731936)
chr8 (110-375)||(43036423-43036687)
chr8 (208-375)||(4283524-4283691)
chr8 (115-361)||(12702542-12702787)
chr8 (93-375)||(27811278-27811560)
chr8 (208-375)||(18655400-18655567)
chr8 (208-373)||(40321082-40321247)
chr8 (93-369)||(30143346-30143622)
chr8 (188-375)||(3303652-3303838)
chr8 (213-375)||(40221745-40221907)
chr8 (228-375)||(18141821-18141968)
chr8 (234-372)||(40328782-40328922)
chr8 (258-375)||(9765745-9765863)
chr8 (258-375)||(30291606-30291725)
chr8 (196-373)||(10930188-10930365)
chr8 (263-372)||(44353796-44353906)
chr8 (208-372)||(6598975-6599139)
chr8 (208-372)||(6674428-6674592)
chr8 (188-375)||(1292446-1292631)
chr8 (208-371)||(5689275-5689438)
chr8 (208-371)||(11383989-11384152)
chr8 (188-375)||(19491680-19491867)
chr8 (208-375)||(8965692-8965859)
chr8 (188-300)||(4743196-4743306)
chr8 (228-372)||(1345391-1345536)
chr8 (208-357)||(4162516-4162663)
chr8 (45-371)||(41366457-41366778)
chr8 (189-290)||(4733792-4733891)
chr8 (188-321)||(10015136-10015265)
chr8 (213-321)||(18106087-18106191)
chr8 (303-370)||(1822297-1822365)
chr8 (303-370)||(1856742-1856810)
chr8 (219-290)||(8153844-8153914)
chr8 (228-375)||(3772192-3772340)
chr8 (232-321)||(7597669-7597759)
chr8 (228-316)||(3073894-3073981)
chr8 (267-370)||(10240159-10240264)
chr8 (289-371)||(41364927-41365011)
chr8 (303-351)||(6813771-6813818)
chr8 (258-290)||(10929874-10929906)
chr8 (299-370)||(29796413-29796485)
chr8 (116-152)||(32902096-32902132)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (20-463)||(16554781-16555227)
chr6 (20-463)||(16631337-16631783)
chr6 (20-463)||(16653024-16653470)
chr6 (20-473)||(27647765-27648209)
chr6 (20-463)||(16578328-16578774)
chr6 (20-463)||(16616606-16617052)
chr6 (20-461)||(25421219-25421668)
chr6 (20-461)||(6027162-6027608)
chr6 (20-461)||(34166994-34167442)
chr6 (20-461)||(33341909-33342359)
chr6 (45-473)||(3072596-3073026)
chr6 (20-461)||(34164772-34165220)
chr6 (45-473)||(412004-412418)
chr6 (20-395)||(13153893-13154277)
chr6 (44-473)||(6097285-6097707)
chr6 (45-473)||(2171366-2171804)
chr6 (93-463)||(31404561-31404937)
chr6 (45-473)||(30834373-30834809)
chr6 (45-463)||(5413234-5413655)
chr6 (45-463)||(16452167-16452592)
chr6 (115-463)||(5406109-5406461)
chr6 (115-463)||(5410434-5410786)
chr6 (45-304)||(5408909-5409164)
chr6 (110-375)||(33160254-33160521)
chr6 (208-375)||(21588931-21589098)
chr6 (208-375)||(21593664-21593831)
chr6 (199-375)||(3808699-3808877)
chr6 (93-375)||(9182917-9183199)
chr6 (208-372)||(17758026-17758191)
chr6 (228-375)||(2972959-2973107)
chr6 (208-375)||(17762990-17763158)
chr6 (208-375)||(28137409-28137576)
chr6 (188-458)||(16568953-16569208)
chr6 (208-373)||(26830124-26830289)
chr6 (20-123)||(6136109-6136216)
chr6 (208-372)||(5043630-5043795)
chr6 (208-375)||(22424826-22424995)
chr6 (188-372)||(26954268-26954450)
chr6 (231-375)||(3038926-3039071)
chr6 (208-375)||(33211186-33211353)
chr6 (200-341)||(603081-603222)
chr6 (258-375)||(4045423-4045542)
chr6 (208-321)||(26800642-26800755)
chr6 (20-86)||(13159066-13159133)
chr6 (308-463)||(16567111-16567265)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (45-473)||(6266593-6267023)
chr2 (20-461)||(12647192-12647639)
chr2 (20-395)||(13655835-13656220)
chr2 (47-473)||(32289467-32289895)
chr2 (45-473)||(4484167-4484604)
chr2 (45-473)||(30833240-30833677)
chr2 (48-473)||(4502975-4503405)
chr2 (40-473)||(45099650-45100088)
chr2 (45-473)||(36205504-36205936)
chr2 (97-463)||(5723146-5723517)
chr2 (93-463)||(36987961-36988338)
chr2 (93-375)||(6594890-6595175)
chr2 (155-443)||(2334368-2334661)
chr2 (110-375)||(29867869-29868133)
chr2 (208-375)||(45726929-45727096)
chr2 (188-372)||(34139752-34139936)
chr2 (44-375)||(38312240-38312570)
chr2 (93-375)||(17057255-17057537)
chr2 (93-375)||(17085238-17085520)
chr2 (188-357)||(723726-723893)
chr2 (188-372)||(14633807-14633991)
chr2 (188-375)||(11151573-11151759)
chr2 (208-375)||(35446885-35447052)
chr2 (188-375)||(36773562-36773748)
chr2 (228-463)||(42362257-42362500)
chr2 (210-375)||(1631735-1631900)
chr2 (208-370)||(33648176-33648340)
chr2 (188-375)||(36317991-36318177)
chr2 (219-372)||(11690504-11690657)
chr2 (208-375)||(24398055-24398226)
chr2 (219-375)||(26353184-26353340)
chr2 (242-375)||(13121769-13121901)
chr2 (188-375)||(33162432-33162618)
chr2 (258-375)||(7815323-7815441)
chr2 (188-375)||(11067305-11067491)
chr2 (208-321)||(17490149-17490261)
chr2 (213-375)||(42288117-42288278)
chr2 (217-317)||(28671989-28672090)
chr2 (228-321)||(7451173-7451266)
chr2 (208-282)||(39284930-39285003)
chr2 (208-283)||(17450671-17450744)
chr2 (304-371)||(14202501-14202569)
chr2 (258-366)||(24197906-24198015)
chr2 (305-357)||(28770730-28770781)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (20-473)||(20343799-20344254)
chr7 (20-461)||(18388566-18389013)
chr7 (20-461)||(18392002-18392449)
chr7 (20-461)||(6594364-6594811)
chr7 (20-461)||(6592146-6592593)
chr7 (20-461)||(32060128-32060579)
chr7 (143-473)||(24789743-24790075)
chr7 (45-473)||(43503991-43504421)
chr7 (80-473)||(39731271-39731666)
chr7 (20-298)||(1560471-1560757)
chr7 (97-473)||(35853810-35854194)
chr7 (45-473)||(25766796-25767227)
chr7 (45-473)||(48408697-48409136)
chr7 (305-461)||(1562103-1562257)
chr7 (93-463)||(29990960-29991335)
chr7 (93-375)||(23555039-23555323)
chr7 (45-473)||(4178670-4179102)
chr7 (93-445)||(25615785-25616137)
chr7 (110-463)||(19502083-19502443)
chr7 (208-375)||(34310716-34310884)
chr7 (189-375)||(22269973-22270158)
chr7 (97-375)||(27347817-27348095)
chr7 (45-148)||(24790230-24790333)
chr7 (188-375)||(41317416-41317602)
chr7 (190-375)||(14069817-14070001)
chr7 (190-375)||(14379845-14380029)
chr7 (208-375)||(8359316-8359485)
chr7 (93-375)||(18126644-18126928)
chr7 (219-375)||(30024744-30024900)
chr7 (210-375)||(29608737-29608902)
chr7 (95-375)||(48489431-48489711)
chr7 (212-375)||(6431971-6432134)
chr7 (188-372)||(41648993-41649175)
chr7 (228-375)||(48491579-48491727)
chr7 (208-375)||(3258995-3259162)
chr7 (208-321)||(32358055-32358167)
chr7 (208-375)||(48599335-48599502)
chr7 (188-375)||(4253510-4253697)
chr7 (93-375)||(26417316-26417598)
chr7 (196-357)||(2390301-2390461)
chr7 (228-375)||(2360992-2361140)
chr7 (208-375)||(4508707-4508874)
chr7 (228-375)||(8153342-8153490)
chr7 (93-375)||(4586161-4586443)
chr7 (93-375)||(43864244-43864526)
chr7 (258-445)||(47673993-47674189)
chr7 (110-375)||(47676040-47676304)
chr7 (208-375)||(31732970-31733137)
chr7 (188-375)||(36146390-36146576)
chr7 (45-372)||(1113660-1113981)
chr7 (188-463)||(38671204-38671485)
chr7 (228-356)||(23565081-23565210)
chr7 (228-372)||(496003-496148)
chr7 (208-372)||(31105394-31105558)
chr7 (219-375)||(23343975-23344129)
chr7 (208-375)||(4510549-4510716)
chr7 (208-375)||(4512391-4512558)
chr7 (213-370)||(22328395-22328556)
chr7 (219-350)||(2759209-2759339)
chr7 (304-375)||(24525992-24526065)
chr7 (119-375)||(36574434-36574683)
chr7 (196-321)||(6359941-6360065)
chr7 (188-375)||(12097849-12098027)
chr7 (188-290)||(31518988-31519089)
chr7 (208-310)||(18396384-18396486)
chr7 (228-290)||(24525522-24525584)
chr7 (373-473)||(24514934-24515033)
chr7 (266-375)||(31518795-31518905)
chr7 (208-282)||(30814530-30814603)
chr7 (303-356)||(28617182-28617234)
[»] chr4 (71 HSPs)
chr4 (20-461)||(8395519-8395966)
chr4 (20-461)||(8393310-8393757)
chr4 (20-461)||(7124815-7125264)
chr4 (20-461)||(7122596-7123045)
chr4 (20-461)||(5138204-5138653)
chr4 (20-461)||(5135978-5136428)
chr4 (45-473)||(31495143-31495583)
chr4 (45-473)||(13992130-13992559)
chr4 (115-463)||(29999719-30000068)
chr4 (93-445)||(56178522-56178882)
chr4 (93-356)||(5369968-5370232)
chr4 (93-375)||(48143042-48143330)
chr4 (93-375)||(52095248-52095530)
chr4 (196-371)||(2209717-2209894)
chr4 (93-375)||(9927345-9927626)
chr4 (211-375)||(41964415-41964580)
chr4 (208-375)||(46703500-46703669)
chr4 (97-375)||(34570304-34570582)
chr4 (208-357)||(6655975-6656123)
chr4 (110-375)||(12739454-12739718)
chr4 (196-375)||(26364236-26364415)
chr4 (188-373)||(46147373-46147557)
chr4 (188-375)||(47038393-47038577)
chr4 (110-356)||(12743829-12744073)
chr4 (93-375)||(52082549-52082825)
chr4 (228-375)||(8665408-8665556)
chr4 (208-375)||(12073392-12073560)
chr4 (208-375)||(36463390-36463557)
chr4 (208-375)||(40632445-40632612)
chr4 (208-375)||(41639426-41639593)
chr4 (196-375)||(54883020-54883199)
chr4 (189-356)||(12745297-12745462)
chr4 (189-375)||(26175619-26175804)
chr4 (188-375)||(48893620-48893810)
chr4 (188-375)||(6542161-6542349)
chr4 (208-372)||(379383-379548)
chr4 (208-368)||(5207843-5208003)
chr4 (208-375)||(8648139-8648306)
chr4 (208-375)||(36994524-36994691)
chr4 (97-458)||(37740536-37740903)
chr4 (188-375)||(45687164-45687351)
chr4 (219-375)||(37229733-37229890)
chr4 (196-371)||(50262689-50262865)
chr4 (208-321)||(50673848-50673960)
chr4 (228-375)||(54199926-54200074)
chr4 (196-373)||(12119540-12119719)
chr4 (191-375)||(5871820-5872003)
chr4 (219-375)||(27416977-27417133)
chr4 (188-372)||(52467336-52467519)
chr4 (228-375)||(4587958-4588107)
chr4 (97-473)||(5429574-5429957)
chr4 (188-375)||(31474150-31474337)
chr4 (258-356)||(12744097-12744195)
chr4 (258-375)||(12745486-12745604)
chr4 (258-375)||(12747806-12747924)
chr4 (219-375)||(35662441-35662597)
chr4 (213-360)||(26699447-26699596)
chr4 (258-375)||(24969112-24969230)
chr4 (110-290)||(29254580-29254758)
chr4 (232-321)||(33989899-33989989)
chr4 (208-375)||(51337064-51337231)
chr4 (228-301)||(13009464-13009536)
chr4 (303-371)||(48142473-48142542)
chr4 (287-375)||(41639263-41639353)
chr4 (303-361)||(1983252-1983309)
chr4 (196-373)||(21688250-21688428)
chr4 (289-370)||(44967910-44967992)
chr4 (258-372)||(3913451-3913566)
chr4 (306-357)||(5349929-5349980)
chr4 (234-321)||(33089933-33090021)
chr4 (289-375)||(55085445-55085532)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (20-461)||(2410-2857)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (20-463)||(6186-6637)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (38-461)||(3551-3979)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (45-473)||(10998-11435)
scaffold0491 (90-473)||(8616-9009)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (45-473)||(434428-434863)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (45-375)||(11557-11895)
scaffold0286 (425-473)||(22239-22286)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (91-473)||(812-1200)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (38-240)||(1-208)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (97-375)||(114602-114881)
scaffold0016 (294-357)||(102450-102513)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (93-375)||(20301-20583)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (208-375)||(18004-18171)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (208-375)||(7327-7494)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (208-351)||(10515-10656)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (188-372)||(149079-149262)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (263-371)||(80338-80447)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (208-321)||(27442-27556)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 54635462 - 54635027
Alignment:
Q  41 aataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtg--caagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaaca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635462 aataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaaca 54635363  T
Q  139 agtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54635362 agtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 54635263  T
Q  238 actctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatga 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635262 actctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatga 54635163  T
Q  338 acaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactcta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635162 acaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactcta 54635063  T
Q  438 atcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54635062 atcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 54635027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 45283344 - 45282885
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat--gtgcaagcaataatcaacaaaacaccac 117  Q
    |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283344 atcgaaccacaccaatacaa--agaatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaataatcaacaaaacaccac 45283247  T
Q  118 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacc 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||     
T  45283246 ctagatctaatctaggaaactagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcact 45283147  T
Q  216 caattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaa---gggatacaaaaggttacaag 311  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  45283146 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaaggttacaag 45283047  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45283046 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttgcaaggtgtttccc 45282947  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45282946 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 45282885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6716834 - 6716402
Alignment:
Q  46 tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtg--caagcaataatcaac-aaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 142  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716834 tgatgtgtggagcaacggaaagcggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaaccaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 6716735  T
Q  143 agaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 240  Q
     ||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6716734 tgaaactcaaaaatacaatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 6716635  T
Q  241 ctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716634 ctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaaca 6716535  T
Q  341 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716534 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6716435  T
Q  441 aaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6716434 aaagaaccctaaaccctagagttactccctttg 6716402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 3617812 - 3617363
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaag-aataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  3617812 atcgaaccacaccaatacaaataagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 3617713  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  3617712 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 3617613  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3617612 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 3617513  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617512 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 3617413  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 3617363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 25637792 - 25637342
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||  || ||||||||||||    
T  25637792 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtgtattgtgcaagcaggaaacaacaaaacacc 25637693  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca--caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||     
T  25637692 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgg 25637593  T
Q  211 tcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttac 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25637592 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 25637493  T
Q  309 aagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25637492 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 25637395  T
Q  409 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637394 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 25637342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Original strand, 4600550 - 4600998
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| | || ||||||||||||    
T  4600550 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagccagaaacaacaaaacacc 4600649  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||    
T  4600650 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca-aatcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtc 4600748  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaa 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4600749 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaaggttacaa 4600848  T
Q  311 gaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 409  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4600849 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttc 4600946  T
Q  410 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600947 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 4600998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Original strand, 4598329 - 4598777
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| || ||| ||||||||    
T  4598329 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaataaaacacc 4598428  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||    
T  4598429 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtc 4598527  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  4598528 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 4598627  T
Q  311 gaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 409  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  4598628 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacagggtgtttc 4598725  T
Q  410 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598726 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 4598777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 10211757 - 10211309
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaataca-agaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||| || ||||||||||||    
T  10211757 atcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaatcaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacacc 10211658  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| || ||    
T  10211657 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacacaaagagattggtc 10211559  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  10211558 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 10211459  T
Q  311 gaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 409  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10211458 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 10211361  T
Q  410 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211360 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 10211309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 47 - 412
Target Start/End: Original strand, 7779842 - 7780208
Alignment:
Q  47 gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaacaagtgaga 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7779842 gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaa-caaagtgtgtgcaagcaataatcaacaaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaagtgaaa 7779940  T
Q  146 aa-cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctgg 244  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7779941 aaacacaatacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccactttggtccaaacttgacctactctgg 7780040  T
Q  245 aggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaac 343  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  7780041 aggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aac 7780139  T
Q  344 cctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7780140 cctaatttctacccttttcccaatctcacgaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 10209537 - 10209089
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaataca-agaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||| || ||||||||||||    
T  10209537 atcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagtgacggagagtggtaaccaccaatcaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacacc 10209438  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| || ||    
T  10209437 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacacaaagagattggtc 10209339  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaa 310  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  10209338 acccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactacaagaggttacaa 10209239  T
Q  311 gaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 409  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10209238 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttc 10209141  T
Q  410 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209140 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 10209089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 801419 - 800993
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacac--cacctagatctaatctaggaaacaagtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  801419 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaat-aaagtgtgtgcaagcaataatcaacaaaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaagtg 801321  T
Q  143 -agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
     | |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  801320 gaaaaacacaatacacaa------gataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactc 801227  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaa 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  801226 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaa 801127  T
Q  339 caaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactcta 437  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  801126 c-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctcta 801028  T
Q  438 atcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  801027 atcaaag-actctaaaccctagagtttcttcctttg 800993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 10056581 - 10056133
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||| || ||||||| ||||    
T  10056581 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cacc 10056483  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||    
T  10056482 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtc 10056383  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  10056382 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 10056283  T
Q  311 gaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 409  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10056282 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 10056185  T
Q  410 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10056184 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagag 10056133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 10058803 - 10058355
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||| || ||||||| ||||    
T  10058803 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cacc 10058705  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||    
T  10058704 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtc 10058605  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  10058604 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 10058505  T
Q  311 gaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 409  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10058504 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 10058407  T
Q  410 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10058406 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagag 10058355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 10061025 - 10060577
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||| || ||||||| ||||    
T  10061025 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cacc 10060927  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||    
T  10060926 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtc 10060827  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  10060826 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 10060727  T
Q  311 gaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 409  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10060726 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 10060629  T
Q  410 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10060628 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagag 10060577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 10063247 - 10062799
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||| || ||||||| ||||    
T  10063247 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cacc 10063149  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||    
T  10063148 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtc 10063049  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  10063048 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 10062949  T
Q  311 gaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 409  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10062948 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 10062851  T
Q  410 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10062850 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagag 10062799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 10065469 - 10065021
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||| || ||||||| ||||    
T  10065469 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cacc 10065371  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||    
T  10065370 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtc 10065271  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  10065270 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 10065171  T
Q  311 gaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 409  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10065170 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 10065073  T
Q  410 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10065072 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagag 10065021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 23199976 - 23200410
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag-tga 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23199976 atgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgagtgcaagcaataatcaacaataaaacacctagatctaatctaggaaacaaaatga 23200074  T
Q  144 gaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctg 243  Q
     ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23200075 aaaacacaaaccacaagcataagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg 23200173  T
Q  244 gaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaa 341  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  23200174 gaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-a 23200271  T
Q  342 accctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatac 433  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||      ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||    
T  23200272 actctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaac 23200371  T
Q  434 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23200372 tctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttg 23200410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 92 - 473
Target Start/End: Original strand, 23197823 - 23198211
Alignment:
Q  92 gcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag-tgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 190  Q
    |||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23197823 gcaagcaataatcaacaataaaacacatagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaagcacaagataaaaggagagagaagaggaaaa 23197922  T
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23197923 caaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaa 23198021  T
Q  291 agggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagacact 381  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||    
T  23198022 a-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacact 23198119  T
Q  382 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23198120 caatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttg 23198211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 5257983 - 5258417
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  5257983 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 5258081  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5258082 aaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactct 5258178  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  5258179 ggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac- 5258276  T
Q  341 aaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagaga 430  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  5258277 aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5258376  T
Q  431 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5258377 -actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtttctccctttg 5258417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 93 - 473
Target Start/End: Original strand, 9636010 - 9636400
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || ||  ||||| |||||||||||||| ||| | |||   |||    
T  9636010 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaatcacaagcacaagataaaagg-gagagcagagagaaa 9636108  T
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9636109 caaacacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 9636208  T
Q  291 agggatacaaaa-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctc-------accaagaca 379  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||       |||||||||    
T  9636209 a-agatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagaca 9636306  T
Q  380 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9636307 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaaccctaaagtttcttcctttg 9636400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 463
Target Start/End: Original strand, 5260162 - 5260586
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  5260162 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtg 5260260  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  5260261 aaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctacttt 5260357  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  5260358 ggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac- 5260455  T
Q  341 aaccctaatttctaccc--ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagaga 430  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||       ||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  5260456 aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5260555  T
Q  431 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5260556 -actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtt 5260586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 284 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 10067419 - 10067243
Alignment:
Q  284 ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactc 382  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10067419 ttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 10067320  T
Q  383 aatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10067319 aatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagag 10067243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 341 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718586
Alignment:
Q  341 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  441 aaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagagttactccctttg 6718586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 93 - 372
Target Start/End: Original strand, 19683774 - 19684054
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaa-acaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  19683774 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaa 19683871  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  19683872 acaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 19683969  T
Q  290 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19683970 aagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 19684054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 93 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 45095445 - 45095070
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||| | |  ||||||||  ||||| || |||||||||||||||   |||   |||    
T  45095445 caagcaataatcaacaataacagcacatagatctaatctatgaatcaaagagtaaaacacaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaatagag--aaa 45095348  T
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  45095347 caaatacgccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aa 45095250  T
Q  291 agggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacact 381  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||    
T  45095249 agagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 45095151  T
Q  382 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45095150 caatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtt 45095070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37408737 - 37408458
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 193  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| | | ||||| || |||||||||||||||  ||||   ||||||    
T  37408737 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcactaaatcacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaa 37408640  T
Q  194 agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 293  Q
    | ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  37408639 acacaccaa-agattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 37408542  T
Q  294 gatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37408541 gatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 37408458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7762548 - 7762265
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  7762548 caagtaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaa 7762451  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  7762450 acaaacacatcat-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 7762353  T
Q  290 aagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7762352 aagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 7762265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7764747 - 7764476
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  7764747 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatcttggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaggagag--aagagagaa 7764650  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  7764649 acaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 7764552  T
Q  290 aagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttccc 364  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7764551 aagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttccc 7764476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 9581565 - 9581188
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||||| || |||| ||||| ||||| ||||||  ||||   ||    
T  9581565 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaaaataaagggagag--aagagagaa 9581468  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  9581467 acaaacacatcaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 9581370  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacac 380  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||       ||||||||    
T  9581369 aagggatacaaatgggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagacac 9581271  T
Q  381 tcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    ||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  9581270 tcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagtt 9581188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10067668 - 10067435
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--ta-tgtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || || |||||||| || |||| |||||||    
T  10067668 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaac-aaacacc 10067570  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataa--aaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||    
T  10067569 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtc 10067470  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggagg 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067469 acccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34491397 - 34491212
Alignment:
Q  189 aacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 288  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  34491397 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 34491301  T
Q  289 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34491300 aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 375
Target Start/End: Original strand, 49199457 - 49199638
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  49199457 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaga 49199555  T
Q  296 tacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49199556 tacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4569952
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 4570022  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4570021 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 29196368 - 29196555
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29196368 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 29196465  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29196466 -aaagagatacaaatgggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 196 - 375
Target Start/End: Original strand, 43401789 - 43401970
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  43401789 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaga 43401887  T
Q  296 tacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43401888 taaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 228 - 372
Target Start/End: Original strand, 39153381 - 39153526
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||    
T  39153381 aacttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttctta-taaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaaca 39153479  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39153480 agctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 39153526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 761173 - 760752
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||     |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  761173 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaa-aatcaaagtgaactcaagcaataa-caacaatagcagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 761076  T
Q  143 agaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
    | || | ||| || |||| || ||||||||    ||| |||||   ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||    
T  761075 aaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa----gagagaagagagaaacaaacacaccaa-agattgttaacccatttcagtccaa-cttgacctaatc 760982  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaac 339  Q
    ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  760981 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac 760883  T
Q  340 aaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagag 429  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||   ||||||  |||||||||||    
T  760882 aga-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagag 760784  T
Q  430 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  760783 a-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagtt 760752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30236304 - 30236129
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||| | |||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  30236304 acaccaagaaattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaga 30236207  T
Q  296 tacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30236206 tacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Original strand, 5236343 - 5236624
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacac-aatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| | |||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||||||||  |||||    |    
T  5236343 caagcaataatcaacaataagagctcctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggaga--gaagagagga 5236440  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||| || |||  ||||| |||||| |||||| |||||||||| |    
T  5236441 acaaacacaccaa-agattgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttac-a 5236536  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5236537 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5236624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29811150 - 29810868
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || | ||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  29811150 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagatgaa- 29811052  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
     |||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||  || ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  29811051 -caaacacaccaa-agattgttgacccaattcggtttaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 29810956  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  29810955 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacatattttcctaatctcaccaa 29810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 40735660 - 40735288
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaa-tacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 193  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||| | ||||| || |||||||| ||||||   ||| |||  |||    
T  40735660 caataatcaacaataacagcacctagatctaatataggaaccaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaa-ggagagaagagaggaa--caa 40735564  T
Q  194 agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 293  Q
    | ||||||| ||| || | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  40735563 atacaccaa-agattgctgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 40735467  T
Q  294 gatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactca 383  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       |||||||||||    
T  40735466 gatacaaactggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactca 40735368  T
Q  384 atgattctctc-tttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||||| || | ||| |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  40735367 atgattttcacttttccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 40735288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 6095600 - 6095767
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  6095600 tgttcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 6095697  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||| |||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6095698 acaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 6095767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40734665 - 40734498
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  40734665 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgtgtt 40734568  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40734567 acaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44331712 - 44331545
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  44331712 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaatggctt 44331615  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44331614 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 44331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46860642 - 46860474
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  ||||    
T  46860642 tgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgggtt 46860544  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  46860543 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 46860474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 219 - 372
Target Start/End: Original strand, 22835014 - 22835167
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22835014 ttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaatta 22835111  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22835112 gcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 22835167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31314631 - 31314447
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| || || |||||||||| ||||||||| | ||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31314631 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac 31314534  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 373  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31314533 aaaa-agatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819691
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 305  Q
    |||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 41819620  T
Q  306 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41819621 tacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 200 - 375
Target Start/End: Original strand, 43403736 - 43403913
Alignment:
Q  200 caagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggataca 299  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |    
T  43403736 caagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagataaa 43403834  T
Q  300 aaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    | |   |||||||||||| |||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43403835 acatgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaac-aagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43403913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Original strand, 44700491 - 44700646
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44700491 ttcggtccaa-cttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaataggttacaagaaatta 44700587  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44700588 gcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 51399094 - 51398818
Alignment:
Q  95 agcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaac 191  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  |    
T  51399094 agcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--c 51398997  T
Q  192 aaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaa 291  Q
    ||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  51398996 aaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaa 51398900  T
Q  292 gggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 371  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51398899 gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctca 51398818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593704
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 54593774  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  54593773 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaa 54593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Original strand, 32744418 - 32744689
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32744418 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttac 32744515  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaa 384  Q
     |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | ||||||    
T  32744516 -aaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa--ctaatttctacccattttttcaatctca-caaaatactcaa 32744611  T
Q  385 tgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    ||||| || ||   ||| |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  32744612 tgattttcactcaccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 32744689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 29682526 - 29682269
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||     
T  29682526 tgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggtg 29682429  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-t 396  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||      
T  29682428 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttcactca 29682330  T
Q  397 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 458  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29682329 cccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 29682269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 375
Target Start/End: Original strand, 53921521 - 53921671
Alignment:
Q  226 caaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttga 323  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| || |    
T  53921521 caaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-tgatacaaatgagttacaagaaattagctttaa 53921619  T
Q  324 caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  53921620 caagctcacaaacaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 53921671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32891260 - 32891105
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| | |||||||||| || |||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  32891260 ttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaatta 32891163  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 373  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32891162 gcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcacc 32891105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 46173513 - 46173377
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  46173513 ttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaatta 46173416  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 356  Q
    ||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  46173415 gcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29813230 - 29813063
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||||| | ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| ||||  ||||    
T  29813230 tgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatgcaaatgggtt 29813133  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  29813132 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaa 29813063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40913472 - 40913352
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||    
T  40913472 acaccaagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttac-aaagaga 40913375  T
Q  296 tacaaaag-gttacaagaaatta 317  Q
    |||||| | ||||||||||||||    
T  40913374 tacaaatgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16499215 - 16499033
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16499215 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 16499118  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 372  Q
     |||| |||| |||  ||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16499117 -aaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaa--aaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcac 16499033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 9666448 - 9666632
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| |    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9666448 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-ctttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttac 9666545  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    |||  || || ||| | |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9666546 aaagagg-tataaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcac 9666632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 23391891 - 23392077
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23391891 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgc 23391988  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23391989 -aaagtgatacaaatgggttacaagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctactcattttcccaaactcaccaa 23392077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 315
Target Start/End: Original strand, 55301972 - 55302079
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||| | ||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  55301972 tgttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatacaaataggtt 55302070  T
Q  307 acaagaaat 315  Q
    |||||||||    
T  55302071 acaagaaat 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 375
Target Start/End: Original strand, 51352161 - 51352278
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 356  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  51352161 ctctcaaatccactctcaatgagttattacaaa-gaaatacaaatggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccctaacttctatc 51352259  T
Q  357 cttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||||| |||||||||||    
T  51352260 attttcctaatctcaccaa 51352278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434046
Alignment:
Q  303 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaa 5434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 47304418 - 47304254
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggataca-aaaggtt 306  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |  ||||    
T  47304418 tgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-gaagagatacagatgggtt 47304321  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    |||||| |||| |||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  47304320 acaagatattaacttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttctcaatctcac 47304254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 23410311 - 23410487
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||| ||   |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23410311 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccaattcgttccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaagagttcttac 23410408  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaa 366  Q
     |||| ||||||||  ||||| | |||||||||||  ||||| |||||| ||| ||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  23410409 -aaagtgatacaaatgggttatacgaaattagcttaaacaagctcacaaagaataaa-cataatttctacccattttccaa 23410487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018852
Alignment:
Q  241 ctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatga 337  Q
    |||| |||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||    
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaaga 36018890  T
Q  338 acaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  36018889 ac-aaccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaa 36018852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 370
Target Start/End: Original strand, 4055813 - 4055926
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagtt-cttacaaaagggatacaaaag--gttacaagaaattagcttg-acaagttcacaatgaacaaaccctaatttct 353  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||| | | ||||||  ||||||||||    
T  4055813 ctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaa-gagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa--cctaatttct 4055909  T
Q  354 acccttttcccaatctc 370  Q
    |||| ||||||||||||    
T  4055910 acccatttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 275
Target Start/End: Original strand, 27305722 - 27305777
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatca 275  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  27305722 ttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 363
Target Start/End: Original strand, 28253363 - 28253423
Alignment:
Q  304 gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcc 363  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28253363 gttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctaccattttcc 28253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 317
Target Start/End: Original strand, 4075520 - 4075581
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagag-ttcttacaaaagggatacaaa--aggttacaagaaatta 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  4075520 ctctccaatccactatcaaagagtttcttac-aaagtgatacaaaagaggttacaagaaatta 4075581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 135
Target Start/End: Original strand, 9634707 - 9634750
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaa 135  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9634707 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaa 9634750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 355
Target Start/End: Original strand, 25517069 - 25517121
Alignment:
Q  302 aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25517069 aggttataagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaccctaatttctac 25517121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4386926 - 4386875
Alignment:
Q  303 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4386926 ggttacaagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaacctaatttctac 4386875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 21054316 - 21053860
Alignment:
Q  18 aaatcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccac 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054316 aaatcgaaccacaccaatacaagaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaactaagtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccac 21054217  T
Q  118 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcaccca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  21054216 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcaccca 21054117  T
Q  218 attcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaatta 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21054116 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttgcaagaaatta 21054017  T
Q  318 g-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtt 416  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  21054016 gatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttttctctacaaggtgtttcccatgtt 21053917  T
Q  417 ttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21053916 ttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 21053860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 40282711 - 40282279
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaa-caaagtatgtg--caagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282711 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 40282612  T
Q  142 gagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40282611 gagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactc 40282512  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaaca 340  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  40282511 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaact 40282412  T
Q  341 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282411 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 40282312  T
Q  441 aaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40282311 aaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 40282279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 9987560 - 9987104
Alignment:
Q  18 aaatcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccac 117  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987560 aaatcgaaccacaccaatacgaaaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaatcaaagtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccac 9987461  T
Q  118 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaac-aaagacaccaagagagtgttcaccc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9987460 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcaccc 9987361  T
Q  217 aattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaatt 316  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9987360 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaaaggttgcaagaaatt 9987261  T
Q  317 agctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 415  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9987260 agattagacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgt 9987162  T
Q  416 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9987161 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 9987104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 9036751 - 9036329
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat--gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 142  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036751 atgatgtgtggagctaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 9036652  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 240  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9036651 tgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 9036552  T
Q  241 ctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036551 ctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaaca 9036452  T
Q  341 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036451 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 9036352  T
Q  441 aaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9036351 aaagaaccctaaaccctagagtt 9036329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 20622072 - 20622504
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtg--caagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622072 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 20622171  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20622172 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 20622271  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac--aaaagggatacaaaaggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaac 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20622272 ggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac 20622371  T
Q  340 aaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaat 439  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622372 -aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacagtcaatgattttccctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaat 20622470  T
Q  440 caaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20622471 caaagaaccctaaaccctagagttgctccatttg 20622504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 44203994 - 44203547
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  44203994 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 44203895  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  44203894 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 44203795  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44203794 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 44203695  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44203694 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 44203597  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203596 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 44203547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 51765728 - 51765290
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  || ||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51765728 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaattaa-gtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 51765630  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  51765629 aaaagcacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactct 51765531  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaac 339  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |       
T  51765530 ggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggta 51765431  T
Q  340 aaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagat 431  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||      |||||||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||     
T  51765430 caaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaa 51765331  T
Q  432 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  51765330 gctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttg 51765290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 376
Target Start/End: Original strand, 13316194 - 13316521
Alignment:
Q  48 atgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgaga 145  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||  || ||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  13316194 atgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaataa-caaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaa 13316292  T
Q  146 aacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctgga 245  Q
    |||||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  ||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13316293 aacacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaactcactaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgga 13316389  T
Q  246 ggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaac 343  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  13316390 ggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aac 13316487  T
Q  344 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaag 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13316488 cctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 93 - 372
Target Start/End: Original strand, 8550670 - 8550952
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaaga-agaa 188  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||  |||| | |||| ||||    
T  8550670 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaagagagaag-aagagagaa 8550768  T
Q  189 aacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 288  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  8550769 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 8550866  T
Q  289 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8550867 aaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 8550952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 93 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20762950 - 20762567
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||    
T  20762950 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaa----gtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaa 20762857  T
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  20762856 caaacacaccaa-agattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-ga 20762759  T
Q  291 agggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagaca 379  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||       ||||| |    
T  20762758 agagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagata 20762660  T
Q  380 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  20762659 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttg 20762567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3189590 - 3189330
Alignment:
Q  115 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttc 212  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  3189590 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttc 3189494  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  3189493 acccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacagg 3189395  T
Q  312 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3189394 aaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3189330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3198407 - 3198147
Alignment:
Q  115 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttc 212  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  3198407 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttc 3198311  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  3198310 acccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacagg 3198212  T
Q  312 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3198211 aaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3198147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3207246 - 3206986
Alignment:
Q  115 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttc 212  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  3207246 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttc 3207150  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  3207149 acccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacagg 3207051  T
Q  312 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3207050 aaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3206986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 3157147 - 3156771
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| | ||||| || |||||||| |||||  |||||    |    
T  3157147 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggaga--gaagagagga 3157050  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3157049 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtcc-aacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 3156953  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 379  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       |||||||    
T  3156952 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagaca 3156854  T
Q  380 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||||||||| || ||   || ||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  3156853 ctcaatgattttcactcaccagggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 3156771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168297
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 305  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 37168368  T
Q  306 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37168367 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547257
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 13547187  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13547188 acaagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 196 - 375
Target Start/End: Original strand, 42297963 - 42298143
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  42297963 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagaga 42298061  T
Q  296 tacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42298062 tacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 42298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44455438 - 44455160
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 193  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || | || || |||||||| | ||||   ||| |||  |||    
T  44455438 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccaaaagcaaaagataaaggaagagaagagaggaa--caa 44455341  T
Q  194 agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 293  Q
    | ||||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  44455340 acacaccaa-agatcgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-a 44455244  T
Q  294 gatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44455243 gatacaaatgagttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44455160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 49918632 - 49918350
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacac-aatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || ||| ||| ||||| || ||||||||||||||  |||||    |    
T  49918632 caagcaataatcaacaataacagcacctatatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggaga--gaagagagga 49918535  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  49918534 acaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtcc-aacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 49918438  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  49918437 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549168
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 13549098  T
Q  307 acaagaaatta-gcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||| | || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13549099 acatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13549168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 28265536 - 28265722
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28265536 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac 28265633  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  28265634 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaa 28265722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29136415 - 29136247
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||  ||||    
T  29136415 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggtt 29136317  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     ||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29136316 ccaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255508
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 47255438  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47255439 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 375
Target Start/End: Original strand, 28220210 - 28220394
Alignment:
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  28220210 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 28220306  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28220307 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaa 28220394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 834149 - 834332
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  834149 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac 834246  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 372  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  834247 -aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcac 834332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11348865 - 11348698
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  11348865 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-gaaagagatacaaatgggtt 11348768  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11348767 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 11348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 7482231 - 7482399
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 305  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  7482231 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 7482328  T
Q  306 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482329 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 4552619 - 4552805
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4552619 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttac 4552716  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4552717 -aaagggatacaaaggggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 4552805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 31925708 - 31925875
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  31925708 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 31925805  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  31925806 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-atccctaatttctacccatttttccactctcaccaa 31925875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31659520 - 31659238
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| || | || ||||| || | || || |||||||||||||||  |||| |||     
T  31659520 caagcaataatcaacaataacaacaccttgatctaatctaggaatcaaagtaaaaagcacaaaaccataagcaaaagataaaaggagagaaaagaggaat 31659421  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    |  || ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  31659420 a--aacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-a 31659326  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31659325 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-agccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 31659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Original strand, 37503443 - 37503722
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  || |||| || ||||| ||  ||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  37503443 caagcaataatcaacaatatcaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccgcaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa- 37503541  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
     |||| ||||||| ||| |||| ||| | |||| ||||| |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  37503542 -caaacacaccaa-agattgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 37503637  T
Q  290 aagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37503638 aagagatac--aaggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 37503722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 37033072 - 37033241
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 305  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||  | |    
T  37033072 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatgcaaaatggat 37033170  T
Q  306 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37033171 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47115171
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 305  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||  |||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttac-aaagagatacaaaatgggt 47115242  T
Q  306 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47115241 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 375
Target Start/End: Original strand, 28223325 - 28223589
Alignment:
Q  110 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| | ||||| || |||||||| ||||||   ||| | |  |||| ||||||| |||     
T  28223325 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcaaaagataaagggagagaagagaggga--caaacacaccaa-agat 28223421  T
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  28223422 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 28223519  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| || || | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28223520 acaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatc-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28223589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19754662 - 19754494
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  19754662 tgttgacccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatcggtt 19754565  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19754564 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaa 19754494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Original strand, 37559751 - 37560037
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaa-tctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaa 188  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| || ||| |||||        
T  37559751 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaggg-gagagaagagagg 37559849  T
Q  189 aacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct-ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37559850 aacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttac 37559947  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt--gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  37559948 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 37560037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193611
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgagtt 193681  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| | | || |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  193680 acaagaaattagcttcaacaagctaataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 193611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555433
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||| ||  |||    
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaaca 23555383  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23555384 agttcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 23555433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 45644355 - 45644523
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  45644355 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 45644452  T
Q  307 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  45644453 gcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaa 45644523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 50169192 - 50169378
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  50169192 aaacaaacacaccaa-agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttac 50169289  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50169290 -aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 50169378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34603733 - 34603576
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaatt 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||    
T  34603733 ttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttac-aaagagataaaaaatgggttacaagaaatt 34603636  T
Q  317 agctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  34603635 agcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaa 34603576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1833667 - 1833522
Alignment:
Q  231 ttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttgacaag-t 328  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |  || |    
T  1833667 ttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagat 1833569  T
Q  329 tcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1833568 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 1833522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 50167157 - 50167343
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  50167157 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 50167254  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  50167255 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataac-aaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaa 50167343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 3847103 - 3847286
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||||| | |||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3847103 aaacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttac 3847200  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
     |||||||||||||  |||||||| || |||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3847201 -aaagggatacaaatgggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 3847286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 13659318 - 13659501
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13659318 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 13659415  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 372  Q
     |||| |||| |||  ||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13659416 -aaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcac 13659501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 46065104 - 46064921
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  46065104 aaacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttac 46065007  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 372  Q
     |||| |||||| | | ||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  46065006 -aaagagatacacatgagttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaa-cctaatttttatccattttcccaatctcac 46064921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41361101 - 41360914
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||| | ||||||||||  | |||||||| ||| |||||  |||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  41361101 aaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtccaatat-gacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttac 41361003  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41361002 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 232 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  232 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagtt 329  Q
    ||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||| |||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagct 22079362  T
Q  330 cacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 370  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22079361 cacaaagaacaaa-cataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 463
Target Start/End: Original strand, 196958 - 197171
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  196958 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctac 197055  T
Q  356 c-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 445  Q
    |  ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||     
T  197056 caattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag- 197153  T
Q  446 accctaaaccctagagtt 463  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  197154 accctcaaccctaaagtt 197171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15820455 - 15820326
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||    
T  15820455 aacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaaca 15820357  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 357  Q
    || |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  15820356 agctcacaaagaacaaa-cctaatttttaccc 15820326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242391
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaa 28242391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19752842 - 19752685
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||  ||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  19752842 ttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatcggttacaagaaatta 19752745  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||  ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  19752744 gcttcaacaagctcgcaaagaac-aaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaa 19752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 354
Target Start/End: Original strand, 927996 - 928123
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-ca 325  Q
    ||||||||||||  ||| | |||| |||  ||||| |||||||||| || ||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  927996 aacttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaa-gagatccaaaagggttacaagaaattagcttcaaca 928094  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttcta 354  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  928095 agctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36683866 - 36683766
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||   ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36683866 aaacaaacacaccaagaga-tgtttactcagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatcaatgagttcttac 36683769  T
Q  288 aaa 290  Q
    |||    
T  36683768 aaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 40122178 - 40122363
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactat--caaagagttctt 285  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  40122178 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttctt 40122275  T
Q  286 acaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    || |||| |||||||| | |||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  40122276 ac-aaagtgatacaaatgagttataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttcgacccatttttccaatctcac 40122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 375
Target Start/End: Original strand, 30476499 - 30476614
Alignment:
Q  261 tccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-c 357  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||| |||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||      
T  30476499 tccaatccagtatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaac-aaccctaatttctaccta 30476596  T
Q  358 ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30476597 ttttcccaatctcaccaa 30476614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Original strand, 37879005 - 37879079
Alignment:
Q  302 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37879005 aggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 37879079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 372
Target Start/End: Original strand, 8871143 - 8871213
Alignment:
Q  303 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 372  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8871143 ggttacaagaaattagcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttccaaatctcac 8871213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 375
Target Start/End: Original strand, 13138000 - 13138142
Alignment:
Q  232 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagtt 329  Q
    ||||||||||| | |||||| |||  |||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||| |    
T  13138000 tgacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttac-aaagagatgcaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagct 13138098  T
Q  330 cacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||| |||| |  ||||||||||| || |||  ||||||||||||    
T  13138099 cacaaagaacga--cctaatttctatccatttttcaatctcaccaa 13138142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 290
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876848
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaa 37876848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3460815 - 3460710
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||   ||||  |||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  3460815 ctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctac 3460716  T
Q  356 cctttt 361  Q
    ||||||    
T  3460715 cctttt 3460710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 370
Target Start/End: Original strand, 12318585 - 12318685
Alignment:
Q  271 tatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatc 368  Q
    |||||| ||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12318585 tatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaa-cctaatttctacccatttccaaatc 12318683  T
Q  369 tc 370  Q
    ||    
T  12318684 tc 12318685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 48382505 - 48382441
Alignment:
Q  289 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttct 353  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  48382505 aaagtgatacaaataggttacaagaaattaactt-acaagttcacaaagatcaaaccctaatttct 48382441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16455739 - 16455676
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16455739 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-acagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 16455676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32737015 - 32736952
Alignment:
Q  294 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 357  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32737015 gatacaaagaggttacaaaaaattagcttaa-aagttcataaagaacaaaccctaatttctaccc 32736952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 35109556 - 35109493
Alignment:
Q  294 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35109556 gatacaaataggttacaagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaccttaatttctaccc 35109493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5460046 - 5459961
Alignment:
Q  236 ctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 321  Q
    ||||||| || ||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||   ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5460046 ctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaatgagttctttacaaagaaatataaaatgttacaagaaattagctt 5459961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 37282741 - 37282846
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||   |||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  37282741 ctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaattagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttatac 37282840  T
Q  356 cctttt 361  Q
    | ||||    
T  37282841 catttt 37282846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6808571 - 6808507
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 321  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6808571 ctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagctt 6808507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Original strand, 8871071 - 8871130
Alignment:
Q  216 caattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 276  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  8871071 caattcggtccaa-cttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10925504 - 10925464
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctag 132  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10925504 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctag 10925464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29720721 - 29720266
Alignment:
Q  21 tcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtg--caagcaataatcaacaaaacaccacc 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29720721 tcgaaccacaccaatacaagaaatatgttgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtacaagcaataatcaacaaaacaccacc 29720622  T
Q  119 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29720621 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccag 29720522  T
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720521 ttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 29720422  T
Q  319 ctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 417  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29720421 attagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt 29720322  T
Q  418 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29720321 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 29720266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29722881 - 29722426
Alignment:
Q  21 tcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtg--caagcaataatcaacaaaacaccacc 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29722881 tcgaaccacaccaatacaagaaatatggtgtgtggagcaaagtagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtacaagcaataatcaacaaaacaccacc 29722782  T
Q  119 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29722781 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccag 29722682  T
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722681 ttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 29722582  T
Q  319 ctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 417  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29722581 attagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt 29722482  T
Q  418 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29722481 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 29722426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 473
Target Start/End: Original strand, 29750967 - 29751426
Alignment:
Q  18 aaatcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtg--caagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29750967 aaatcgaaccacaccaatacaagaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaatgtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacacc 29751066  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaa-gacaccaagagagtgttcac 214  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  29751067 acctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcac 29751166  T
Q  215 ccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751167 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 29751266  T
Q  315 ttagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccat 413  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29751267 ttagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccat 29751366  T
Q  414 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29751367 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 29751426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 10593620 - 10593170
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  10593620 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 10593521  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10593520 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagtagaaaacaaatacaccaagagattgttca 10593421  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593420 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 10593321  T
Q  313 aattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 412  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593320 aattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 10593221  T
Q  413 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593220 tgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 10593170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 473
Target Start/End: Original strand, 22536104 - 22536553
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaa-caaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacc 118  Q
    |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||    
T  22536104 atcgaaccacaccaatacaa--agaatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaagcaaagtgtatgcaagcaacaatcaacaaaaaac-acc 22536200  T
Q  119 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||     
T  22536201 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacacaatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccag 22536300  T
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536301 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 22536400  T
Q  319 cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  22536401 cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tgcagggtgtttcccatgtttt 22536498  T
Q  419 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22536499 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 22536553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 25078483 - 25078034
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  25078483 atcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 25078384  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  25078383 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 25078284  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25078283 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 25078184  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078183 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 25078084  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078083 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 25078034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 25136452 - 25136003
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  25136452 atcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 25136353  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  25136352 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 25136253  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25136252 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 25136153  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136152 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 25136053  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136052 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 25136003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 40380453 - 40380006
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  40380453 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 40380354  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  40380353 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 40380254  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40380253 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 40380154  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40380153 aaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 40380056  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380055 atgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 40380006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 40382664 - 40382217
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  40382664 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcggcggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 40382565  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  40382564 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 40382465  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40382464 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 40382365  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40382364 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 40382267  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382266 atgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 40382217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 16544773 - 16544323
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| || ||||||||||||    
T  16544773 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacacc 16544674  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa---aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgtt 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || |    
T  16544673 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggt 16544574  T
Q  212 cacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttaca 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  16544573 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttatg 16544474  T
Q  310 agaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 408  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16544473 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgttt 16544376  T
Q  409 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544375 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16544323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 16546995 - 16546545
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||| || ||||||||||||    
T  16546995 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtgataaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacacc 16546896  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa---aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgtt 211  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || |    
T  16546895 acctaaatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggt 16546796  T
Q  212 cacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttaca 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16546795 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttaca 16546696  T
Q  310 agaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 408  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16546695 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcctaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgttt 16546598  T
Q  409 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546597 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16546545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 9789061 - 9789490
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  9789061 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaa-caaagtgtgtgcaagcaaaaatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaagaagtgaa 9789159  T
Q  145 aaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacacc-aagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctg 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9789160 aaacacaatacacaagcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg 9789259  T
Q  244 gaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaa 341  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |    
T  9789260 gaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-a 9789358  T
Q  342 accctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatc 440  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  9789359 accttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatc 9789458  T
Q  441 aaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  9789459 aaag-actctaaaccctagagttactccctttg 9789490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 47 - 473
Target Start/End: Original strand, 18441483 - 18441914
Alignment:
Q  47 gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaa 146  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18441483 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaa-caaagtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaagaagtgaaaa 18441581  T
Q  147 a----cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
    |    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18441582 aaaaacacaatacacaagcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactc 18441681  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaac 339  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  18441682 tagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac 18441781  T
Q  340 aaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaa 438  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||    
T  18441782 -aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaa 18441880  T
Q  439 tcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  18441881 tcaaag-actctaaaccctagagttactccctttg 18441914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16409808 - 16409377
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16409808 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 16409710  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
    | || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16409709 aaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactc 16409610  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaac 339  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  16409609 tggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac 16409510  T
Q  340 aaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaa 438  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||    
T  16409509 -aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaa 16409411  T
Q  439 tcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  16409410 tcaaag-actctaaaccctagagttactccctttg 16409377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26178213 - 26177785
Alignment:
Q  47 gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgag 144  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  26178213 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtgcaagcaataatcaatgataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaa 26178115  T
Q  145 aaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctg 243  Q
    || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26178114 aagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg 26178015  T
Q  244 gaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaa 341  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |    
T  26178014 gaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-a 26177916  T
Q  342 accctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatc 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  26177915 accctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatc 26177817  T
Q  441 aaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  26177816 aaag-actctaaaccctagagttactccctttg 26177785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26171093 - 26170676
Alignment:
Q  47 gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaag-tgag 144  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||     
T  26171093 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaagcactaa-caaagtgtgtgcaagcaataatcgatgataacaacacctagatctaatctaggaatcaaaatgaa 26170995  T
Q  145 aaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctg 243  Q
    || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26170994 aagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg 26170895  T
Q  244 gaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaa 342  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||    
T  26170894 gaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aa 26170806  T
Q  343 ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatca 441  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||||    
T  26170805 tcctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctgtaatca 26170707  T
Q  442 aagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  26170706 aag-actctaaaccctagagttactccctttg 26170676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30182917 - 30182484
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30182917 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatgcaaacaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 30182819  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30182818 aaaagcacaaaacacaagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcatccagttcggtccaaacttgacatactct 30182722  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  30182721 ggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatagaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac- 30182624  T
Q  341 aaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagat 431  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||     
T  30182623 aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttgcaatgtttcccaacccaagaga- 30182525  T
Q  432 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||||    
T  30182524 actctaatcaaag-accctaatccctaaagttgcttcctttg 30182484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 25413042 - 25412672
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||    
T  25413042 caagcaataatcaacaataacagcacctatatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaa 25412945  T
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  25412944 caaacacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aa 25412847  T
Q  291 agggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacact 381  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||    
T  25412846 agagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacact 25412748  T
Q  382 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 458  Q
    |||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412747 caatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 25412672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 13343389 - 13342956
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13343389 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 13343291  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   ||||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13343290 aaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacatcaa-agattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactct 13343194  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  13343193 ggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac- 13343097  T
Q  341 aaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagaga 430  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  13343096 aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 13342997  T
Q  431 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
     |||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  13342996 -actctaatcagag-accctaaaccctaaagttgcttcctttg 13342956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 36073882 - 36074317
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||  || ||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36073882 atgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaataa-caaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 36073980  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36073981 aaaagcacaaatcacaagcaaaacataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcatccagttcggtccaaacttgacctacttt 36074077  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||     
T  36074078 ggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac- 36074174  T
Q  341 aaccctaatttctaccc----ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaaga 428  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  36074175 aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 36074274  T
Q  429 gatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  36074275 ga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttg 36074317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 13240016 - 13239674
Alignment:
Q  110 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| | |     
T  13240016 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaa-at 13239920  T
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  13239919 tgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagtt 13239821  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctcttt 397  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||       ||||||||||||||||| || ||      
T  13239820 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 13239722  T
Q  398 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 445  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13239721 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 13239674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32637088 - 32636824
Alignment:
Q  110 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||  ||||||   ||||||| ||||||| |||     
T  32637088 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagcacaagataaagggag--ggaagagagaaacaaacacaccaa-agat 32636992  T
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  32636991 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 32636894  T
Q  307 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32636893 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 32636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37439328 - 37439161
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37439328 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 37439230  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 356  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37439229 -aaagagatacaaaagagttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213465
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 213535  T
Q  307 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  213534 acaagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147261
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 40147331  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40147330 acaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 458
Target Start/End: Original strand, 30682809 - 30683178
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaa-tacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||| || |||||||||||||||   ||| |||     
T  30682809 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaattcacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaa- 30682907  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagag--ttcttac 287  Q
     |||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  30682908 -caaacacaccaa-agattgttgacc-agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttac 30683003  T
Q  288 aaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caaga 377  Q
     ||||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||    
T  30683004 -aaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaag----aaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaaga 30683098  T
Q  378 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 458  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30683099 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcgcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 30683178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28278483 - 28278316
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  ||||    
T  28278483 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatgggtt 28278386  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28278385 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 375
Target Start/End: Original strand, 42428334 - 42428598
Alignment:
Q  110 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||| || | ||| | ||||| || |||||||| ||||||  ||||||  |||||| |||| || |||     
T  42428334 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaagaag--aacaaacacactaa-agat 42428430  T
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  42428431 tgttgacccagttcggtcc-aacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 42428528  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42428529 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 42428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13488365 - 13488203
Alignment:
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaag 311  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  13488365 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaag 13488268  T
Q  312 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13488267 aaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 13488203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5058047
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  || |    
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggat 5058115  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5058114 acaagaaaatagcttcaacaagctcaca--gaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5058047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 188 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 16452266 - 16452003
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16452266 aaacaaacacaccaagaaa-tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttac 16452169  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc-------accaaga 377  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||       | |||||    
T  16452168 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaa-cttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaaga 16452071  T
Q  378 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaaga 445  Q
    |||||||||||| || |||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16452070 cactcaatgattgtcacttaccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaaga 16452003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 375
Target Start/End: Original strand, 28750661 - 28750823
Alignment:
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaag 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |    
T  28750661 acccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggttacagg 28750758  T
Q  312 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||| |||  |||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28750759 aaattaacttcaacaatttcataaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 28750823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 533952 - 533769
Alignment:
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  533952 caaagacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttac-aa 533856  T
Q  291 agggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || ||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  533855 agagatacaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaag-accaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 533769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31183157 - 31182878
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| | |  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31183157 aaacaaacacaccaa-agaatgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttac 31183060  T
Q  288 aaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagaca 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||  |||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||       |||||||    
T  31183059 -aaagggatacaaatggttacaagaaattaacttaaacaaactcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagaca 31182962  T
Q  380 ctcaatgattctctctttac-aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||||||||| || ||   | ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  31182961 ctcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 31182878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Original strand, 13695713 - 13695859
Alignment:
Q  231 ttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagt 328  Q
    |||||||||| ||||||||||  |   ||||| |||||||||| || ||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||     
T  13695713 ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagc 13695812  T
Q  329 tcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13695813 tcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 372
Target Start/End: Original strand, 39468439 - 39468714
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 193  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || || | ||||||||||| ||||||   ||| |||  |||    
T  39468439 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacgagcacaagataaagggagagaagagaggaa--caa 39468536  T
Q  194 agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 293  Q
    | |||| || ||| |||| ||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  39468537 acacactaa-agattgttgacccagttcagtccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 39468633  T
Q  294 gatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39468634 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 39468714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 33831866 - 33831590
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33831866 aaacaaaaacaccaa-agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac 33831769  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caaga 377  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||        ||||    
T  33831768 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataaga 33831671  T
Q  378 cactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 458  Q
    |||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33831670 cactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 33831590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 372
Target Start/End: Original strand, 8565926 - 8566111
Alignment:
Q  185 agaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttct 284  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| ||| | |||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8565926 agaaaacaaacacaccaagat--tgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttct 8566022  T
Q  285 tacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    ||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  8566023 tac-agagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaagttctacccattttctcaatctcac 8566111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 375
Target Start/End: Original strand, 27637615 - 27637781
Alignment:
Q  210 ttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggtta 307  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||||    
T  27637615 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggtta 27637712  T
Q  308 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27637713 caagaaattagtttaaacaagctcataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 27637781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Original strand, 42426255 - 42426403
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||  |||    
T  42426255 aacttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaaca 42426353  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42426354 atttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 42426403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 3075640 - 3075823
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  ||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  3075640 aaacaaacacaccaagaaa-tgttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaattcttac 3075737  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 372  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||||||||| || | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  3075738 aaaa-agatacaaatgggttacaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttctcaatctcac 3075823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 538181 - 538028
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  538181 ttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaatta 538084  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    ||||  ||||| |||||| || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  538083 gcttcaacaagctcacaaagagc-aaccttaatttctacccattttcccaatctcac 538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 361
Target Start/End: Original strand, 16640961 - 16641091
Alignment:
Q  229 acttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||| |||||  ||||    
T  16640961 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca---agttcttac-aaagagatacaaaagagttatcagaaatcagcttcaacaa 16641056  T
Q  327 gttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 361  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16641057 gctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttt 16641091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 372
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049506
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||  |||  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaatta 9049451  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 372  Q
    ||||  ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9049452 gcttcaacaagctcacaa-aaacaaacactaatttctatcattttcccaaactcac 9049506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27015690 - 27015531
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 307  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||  || | |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || |     
T  27015690 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt- 27015594  T
Q  308 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
          ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27015593 ------attagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 27015531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 38747153 - 38747009
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||  ||||  |||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| | |||||||| || |||||||||||||||||  |||    
T  38747153 aacttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtttttccaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 38747055  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 371  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38747054 agctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 38747009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19806530 - 19806454
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttctt 285  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19806530 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt 19806454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 316920 - 316769
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaatta 317  Q
    ||||||||||   ||||||||||| | |||||| |||  | |||| ||||| |||||| ||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  316920 ttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaaatta 316821  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatct 369  Q
    ||||  ||||| || | | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  316820 gcttcaacaagctctccaagaacaaa-cctaatttctacctttttctcaatct 316769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 321
Target Start/End: Original strand, 42309943 - 42310048
Alignment:
Q  215 ccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 313  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||| |||  ||| | |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  42309943 ccaattcggtc-aaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaa 42310040  T
Q  314 attagctt 321  Q
    ||||||||    
T  42310041 attagctt 42310048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 321
Target Start/End: Original strand, 10054867 - 10054929
Alignment:
Q  259 tctccaatccactatcaaagagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 321  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10054867 tctccaatacactatcaatgagttcattacaaa-gagatacaaaaggttataagaaattagctt 10054929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 321
Target Start/End: Original strand, 33906042 - 33906144
Alignment:
Q  220 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattag 318  Q
    |||||||||  |||||||||||| | | |||| |||  || ||||||| |||||||| ||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33906042 tcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaagttag 33906141  T
Q  319 ctt 321  Q
    |||    
T  33906142 ctt 33906144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4160743 - 4160702
Alignment:
Q  232 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactat 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  4160743 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25690312 - 25689857
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtg--caagcaataatcaacaaaacaccac 117  Q
    |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  25690312 atcgaaccacaccaatacaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaagaatcaacaaaacaccac 25690215  T
Q  118 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaa-gagagtgttcacc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||    
T  25690214 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacacactcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattgttcacc 25690115  T
Q  216 caattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690114 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 25690015  T
Q  316 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690014 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 25689915  T
Q  416 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25689914 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 25689857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3439860 - 3439406
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacct 119  Q
    |||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3439860 atcgaaccacaccaatactaaaaaaatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgtgtgcaagcaacaatcaacaaaacaccacct 3439761  T
Q  120 agatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcacccaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||     
T  3439760 agatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcatccag 3439661  T
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439660 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 3439561  T
Q  319 cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt 418  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439560 cttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctttacaaggtgtttcccatgtttt 3439461  T
Q  419 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439460 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 3439406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 15290886 - 15290438
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||| || |||||| |||||    
T  15290886 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacacc 15290787  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||  ||    
T  15290786 acctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggaca 15290687  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  15290686 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 15290587  T
Q  312 aaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 410  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15290586 aaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcc 15290489  T
Q  411 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290488 catgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 15290438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 15471255 - 15470807
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||| || |||||| |||||    
T  15471255 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacacc 15471156  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||  ||    
T  15471155 acctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggaca 15471056  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  15471055 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 15470956  T
Q  312 aaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 410  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15470955 aaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcc 15470858  T
Q  411 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470857 catgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 15470807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Original strand, 42575131 - 42575578
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaaga-ataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| || ||||||||||||    
T  42575131 atcgaaccacaccaatacaaactataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacacc 42575230  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttcac 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||||    
T  42575231 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaaccaaacacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcac 42575330  T
Q  215 ccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  42575331 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaaga 42575430  T
Q  313 aattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42575431 aattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 42575528  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575529 atgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 42575578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 2628066 - 2627637
Alignment:
Q  47 gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataa-tcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgag 144  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  2628066 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgggtgcaagcaaaaaatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaagtgaa 2627968  T
Q  145 aaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctgg 244  Q
    || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2627967 aagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctgg 2627868  T
Q  245 aggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaa 341  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  2627867 aggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-a 2627769  T
Q  342 accctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  2627768 accctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatc 2627669  T
Q  441 aaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  2627668 aaag-actctaaaccctagagttactccctttg 2627637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 31218586 - 31218152
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||  || ||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31218586 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaataa-caaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtg 31218488  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || ||||| ||| || ||||||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31218487 aaaagcacaaaacataagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 31218391  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  31218390 ggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac- 31218293  T
Q  341 aaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagaga 430  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  31218292 aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 31218193  T
Q  431 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  31218192 -actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttg 31218152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 463
Target Start/End: Original strand, 34254170 - 34254591
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  ||||||  |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  34254170 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagag 34254268  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34254269 aaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 34254365  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
     |||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||     
T  34254366 agaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac- 34254463  T
Q  341 aaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | |||| | |||||||||||| ||    
T  34254464 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtctccaacccaagaga-ac 34254562  T
Q  434 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34254563 tctaatcaaag-accctaaaccctaaagtt 34254591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 93 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17982935 - 17982548
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||    
T  17982935 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaa 17982838  T
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  17982837 caaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaa 17982740  T
Q  291 agggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagaca 379  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||    
T  17982739 agagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagaca 17982641  T
Q  380 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  17982640 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttg 17982548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 93 - 463
Target Start/End: Original strand, 34256393 - 34256767
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||    
T  34256393 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaa 34256490  T
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  34256491 caaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aa 34256588  T
Q  291 agggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacact 381  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||||    
T  34256589 agagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaagacact 34256687  T
Q  382 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||||||| || |    |||||||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34256688 caatgattttcacacaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagata-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtt 34256767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 473
Target Start/End: Original strand, 19945199 - 19945633
Alignment:
Q  46 tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtga 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19945199 tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcgaagtga 19945297  T
Q  144 gaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctg 243  Q
     || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  19945298 aaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctc 19945394  T
Q  244 gaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  19945395 gaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac- 19945492  T
Q  341 aaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagaga 430  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | ||||||||||    
T  19945493 aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccgacccaagaga 19945592  T
Q  431 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
     ||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||||||    
T  19945593 -actctaatcaaag-actctaaaccctaaagttgcttcctttg 19945633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 93 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 44304137 - 44303759
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||    
T  44304137 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaa 44304040  T
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  44304039 caaacacaccaa-agattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctta-aaa 44303942  T
Q  291 agggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc---ttttcccaatctcac-------caagac 378  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||       ||||||    
T  44303941 agagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagac 44303843  T
Q  379 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44303842 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtt 44303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42498477 - 42498193
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||  |||| | ||    
T  42498477 caagcaataattaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagggaa 42498380  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  42498379 acaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 42498282  T
Q  290 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  42498281 aagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 42498193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 473
Target Start/End: Original strand, 1746105 - 1746491
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || | || | |||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||    
T  1746105 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtcaaaagcgcaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaa 1746202  T
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||| |||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||    
T  1746203 caaacacaccaac-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caa 1746299  T
Q  291 agggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagaca 379  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||  |||||||||       |||||||    
T  1746300 agagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttttcaatctcaccaatgaacaagaca 1746398  T
Q  380 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  1746399 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaaccaaagaga-actctaatc-aaggaccctaaaccctaaagttgcttcctttg 1746491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15213064 - 15212786
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 193  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||  | |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  |||    
T  15213064 caataatcaacaataacagcaccttgatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caa 15212967  T
Q  194 agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 293  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||     
T  15212966 acacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttac-aaaga 15212870  T
Q  294 gatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15212869 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 15212786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33352432 - 33352150
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaa-tacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||||    ||| |||     
T  33352432 caagcaataatcaacaataacaacacctaaatctaatctagaaatcaaagtgaaaaacacaaatccacaagcaaaagataaaaggagataagagaggaa- 33352334  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
     |||| ||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  33352333 -caaacacatcaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 33352238  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33352237 aagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 33352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435159
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 42435089  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42435090 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4731936 - 4731658
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 193  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| | ||||| || |||||||| |||||  |||||    |||||    
T  4731936 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggaga--gaagagaggaacaa 4731839  T
Q  194 agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 293  Q
    | ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  4731838 acacaccaa-agattgttgacccaattcggtcc-aacttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 4731742  T
Q  294 gatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4731741 gatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagc-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4731658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43036687 - 43036423
Alignment:
Q  110 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || | ||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  |||| ||||||| |||     
T  43036687 aacaccacctagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaa-agat 43036591  T
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |  ||    
T  43036590 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgaatt 43036493  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43036492 acaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283524
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 4283594  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283593 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 361
Target Start/End: Original strand, 12702542 - 12702787
Alignment:
Q  115 cacctagatctaatctaggaaac--aagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgtt 211  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||  ||||   ||||||| | ||||| ||| ||||    
T  12702542 cacctagatctaatctagaaaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcacaagataaagggagag--aagagagaaacaaacataccaa-agattgtt 12702638  T
Q  212 cacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaa 310  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  12702639 gacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttac-aaagagacacaaaagggttacaa 12702736  T
Q  311 gaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 361  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12702737 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt 12702787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27811560 - 27811278
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||| | ||||| || ||||||||   ||||  |||| |  |    
T  27811560 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagcaagag--aagagggga 27811463  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    | ||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||| |||||||||||||| | |||||||| |    
T  27811462 aaaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttac-a 27811366  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27811365 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18655567 - 18655400
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  18655567 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 18655470  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18655469 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 18655400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40321247 - 40321082
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac-aaaaggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||    
T  40321247 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttac-aaagagatactaatgggtt 40321150  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 373  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40321149 acaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30143622 - 30143346
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || | ||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  30143622 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa- 30143524  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
     |||| ||||||| ||| |||| || || ||| || ||| ||||||||  ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  30143523 -caaacacaccaa-agattgttgactcagttcagttcaa-cttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 30143428  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatct 369  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30143427 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatct 30143346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 3303652 - 3303838
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3303652 aaacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac 3303749  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3303750 -aaagagatacaaatgagttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 3303838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40221907 - 40221745
Alignment:
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaag 311  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  40221907 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaag 40221810  T
Q  312 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40221809 aaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaa 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18141968 - 18141821
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  18141968 aacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 18141870  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18141869 agctcacaaagaacaa--cctaatttctacccattttcacaatctcaccaa 18141821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328782
Alignment:
Q  234 acctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttc 330  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctc 40328824  T
Q  331 acaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40328823 acaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9765863 - 9765745
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  9765863 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctac 9765766  T
Q  356 cc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  9765765 ccattttcccaatctcaccaa 9765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30291725 - 30291606
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  30291725 ctctccaatccactatcaaagaattcttac-aaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctac 30291627  T
Q  356 cc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  30291626 ccattttctcaatctcaccaa 30291606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 373
Target Start/End: Original strand, 10930188 - 10930365
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||    
T  10930188 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttac-aaagaga 10930285  T
Q  296 tacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcacc 373  Q
    || |||  |||||||||||||||||||  || || |||||| || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10930286 tataaatgggttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagagc-aaccctaatttctatccattttcccaatctcacc 10930365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44353906 - 44353796
Alignment:
Q  263 caatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-tt 359  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  44353906 caatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccatt 44353809  T
Q  360 ttcccaatctcac 372  Q
    |||||||||||||    
T  44353808 ttcccaatctcac 44353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6599139 - 6598975
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||  ||||    
T  6599139 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaa-gtatacaaatgggtt 6599042  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6599041 acaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcac 6598975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6674592 - 6674428
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||  ||||    
T  6674592 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaa-gtatacaaatgggtt 6674495  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6674494 acaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcac 6674428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 1292446 - 1292631
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1292446 aaacaaacacaccaagaaa-tgtttgcccagttcggtccaa-cttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttac 1292542  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1292543 -aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 1292631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5689438 - 5689275
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  5689438 tgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 5689341  T
Q  307 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 371  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| | ||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  5689340 acaagaaattagctttgacaagctcacaaagcac-caccttaatttctacccatttttccaatctca 5689275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11384152 - 11383989
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |   ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||| | |||    
T  11384152 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttac-aaagagatacaaatgagtt 11384055  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 371  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11384054 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctca 11383989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 19491680 - 19491867
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||| | ||||||||||  | |||||||| ||| |||||  |||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  19491680 aaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtccaatat-gacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttac 19491778  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19491779 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 19491867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965859
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||   |||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||    
T  8965692 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaa-gagatataaaagggtt 8965789  T
Q  307 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    | ||||||||| ||| | |||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8965790 ataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Original strand, 4743196 - 4743306
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4743196 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 4743293  T
Q  288 aaaagggatacaa 300  Q
    ||| ||| |||||    
T  4743294 aaatgggttacaa 4743306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 372
Target Start/End: Original strand, 1345391 - 1345536
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggataca-aaaggttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |  |||||||||||||||||||  | |    
T  1345391 aacttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttc-aaagagatacatatgggttacaagaaattagcttcaata 1345489  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 372  Q
    |  |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1345490 aactcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttcccaatctcac 1345536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4162663 - 4162516
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| | |||    
T  4162663 tgtttacccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgagtt 4162567  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 357  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  4162566 acaagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaa-cctaacttctaccc 4162516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 371
Target Start/End: Original strand, 41366457 - 41366778
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  41366457 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtaaacacaagcaataa-caacaataacaacacctagatctaatataggaatcaaagtg 41366554  T
Q  143 agaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
    | || ||||| || |||| || |||||||| ||   | ||||| ||||  ||| ||||||| ||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  41366555 aaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaatgg---gagaaga-gaaacaaaacacaccaa-agattgttgtcccagttcggtccaa-cttgacctaatc 41366648  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaac 339  Q
    | | |||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | |||| ||||    
T  41366649 tag-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagggatacaaataggttaaaagaaattagcttaaacaagcttacaaagaac 41366746  T
Q  340 aaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 371  Q
    ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41366747 aaa-cataatttctacccattttctcaatctca 41366778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4733891 - 4733792
Alignment:
Q  189 aacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 288  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4733891 aacaaacacaccaa-agactgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttaca 4733794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10015265 - 10015136
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||||| | || | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||   ||||||||||||||||||| |||||| |      
T  10015265 aaacaaatacaccaagaaa-tgattacccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaatgagttcct-- 10015171  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 321  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10015170 aaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 10015136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 321
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106191
Alignment:
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 311  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaa-cttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaaa--gatacaaatgagttacaag 18106181  T
Q  312 aaattagctt 321  Q
    ||||||||||    
T  18106182 aaattagctt 18106191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1822365 - 1822297
Alignment:
Q  303 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 370  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1822365 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1822297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1856810 - 1856742
Alignment:
Q  303 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 370  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1856810 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1856742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153844
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8153914 ttcggtccaa-cttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaa 8153844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3772340 - 3772192
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||||||||   || || |||  |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||  | |    
T  3772340 aacttgacctactctgagagatagattgatctctccaatccactatcaataaattcttac-aaagatatacaaatgagttacaagaaattagcttaaata 3772242  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  3772241 agctcacaaagaacaaa-cctaatttctatcaattttctcaatctcaccaa 3772192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7597759 - 7597669
Alignment:
Q  232 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt 321  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |  |||||   |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7597759 tgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaaattagctt 7597669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 316
Target Start/End: Original strand, 3073894 - 3073981
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac-aaaaggttacaagaaatt 316  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||  |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  3073894 aacttgacctactatgg-ggagagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaaatgttacaagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10240264 - 10240159
Alignment:
Q  267 ccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttccc 364  Q
    |||||||||| ||||||||   |||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||| | || ||||    
T  10240264 ccactatcaatgagttctttacaaagagatccaacatggttacaagaaattagattcaacaagctcacaaagaacaaacccaaatttctatctttgtccc 10240165  T
Q  365 aatctc 370  Q
    ||||||    
T  10240164 aatctc 10240159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 371
Target Start/End: Original strand, 41364927 - 41365011
Alignment:
Q  289 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctca 371  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41364927 aaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaa-cctaatttctaccaattttcccaatctca 41365011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 351
Target Start/End: Original strand, 6813771 - 6813818
Alignment:
Q  303 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaattt 351  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  6813771 ggttacaagaaattagcttg-caagctcacaaagaacaaaacctaattt 6813818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10929906 - 10929874
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10929906 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 10929874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Original strand, 29796413 - 29796485
Alignment:
Q  299 aaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 370  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | ||||||| | | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  29796413 aaaatgttacaagaaatcagcttcaacaagttctccaagaacaaaccttgatttctactcttttcccaatctc 29796485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 152
Target Start/End: Original strand, 32902096 - 32902132
Alignment:
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaa 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32902096 acctagatctaatctaggaaccaagtgaaaaacacaa 32902132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16555227 - 16554781
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacct 119  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16555227 atcgaaccacaccaatacta-aataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacct 16555129  T
Q  120 agatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcaccc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  16555128 agatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcaccc 16555029  T
Q  217 aattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 315  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555028 agttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 16554929  T
Q  316 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554928 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 16554829  T
Q  416 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554828 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 16554781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16631783 - 16631337
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacct 119  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16631783 atcgaaccacaccaatacta-aataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacct 16631685  T
Q  120 agatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcaccc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  16631684 agatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcaccc 16631585  T
Q  217 aattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 315  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631584 agttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 16631485  T
Q  316 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631484 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 16631385  T
Q  416 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631384 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 16631337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16653470 - 16653024
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacct 119  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16653470 atcgaaccacaccaatacta-aataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacct 16653372  T
Q  120 agatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcaccc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  16653371 agatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcaccc 16653272  T
Q  217 aattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653271 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 16653172  T
Q  316 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653171 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 16653072  T
Q  416 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653071 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 16653024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 27648209 - 27647765
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtg--caagcaataatcaacaaaacaccac 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27648209 atcgaaccacaccaatacaagaat---gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccgaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccac 27648113  T
Q  118 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcaccca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  27648112 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaatacacaa------gataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcaccca 27648019  T
Q  218 attcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaatta 317  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27648018 gttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaatta 27647919  T
Q  318 gcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  27647918 gcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacatggtgtttcccatgttt 27647821  T
Q  418 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647820 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 27647765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Original strand, 16578328 - 16578774
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacct 119  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16578328 atcgaaccacaccaatacta-aataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacct 16578426  T
Q  120 agatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcaccc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  16578427 agatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcaccc 16578526  T
Q  217 aattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578527 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 16578626  T
Q  316 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 415  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16578627 tagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcccatgt 16578726  T
Q  416 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578727 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 16578774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16617052 - 16616606
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacct 119  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16617052 atcgaaccacaccaatacta-aataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacct 16616954  T
Q  120 agatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcaccc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  16616953 agatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcaccc 16616854  T
Q  217 aattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616853 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 16616754  T
Q  316 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 415  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16616753 tagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcccatgt 16616654  T
Q  416 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616653 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 16616606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 25421668 - 25421219
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  25421668 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 25421569  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  25421568 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 25421469  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25421468 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 25421369  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421368 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 25421269  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421268 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 25421219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 6027608 - 6027162
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| || |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  6027608 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagaggggtaaccacctaacaaggtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 6027509  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  6027508 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaatg-gagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 6027410  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6027409 cccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 6027310  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6027309 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 6027212  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027211 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6027162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 34167442 - 34166994
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgt---gcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || |   |||||||| || ||||||||||||    
T  34167442 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaaaaatattgagcaagcaaaaaacaacaaaacacc 34167343  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  34167342 acctagatcaaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 34167243  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34167242 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 34167143  T
Q  312 aaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 410  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34167142 aaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 34167045  T
Q  411 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34167044 catgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagag 34166994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Original strand, 33341909 - 33342359
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  33341909 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 33342008  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa---aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgtt 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  |   || |||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || |    
T  33342009 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggt 33342108  T
Q  212 cacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttaca 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  33342109 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaagaggttaca 33342208  T
Q  310 agaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 408  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33342209 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgttt 33342306  T
Q  409 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342307 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 33342359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 3072596 - 3073026
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaac-accacctagatctaatctaggaaacaagtga 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3072596 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtgcaagcaataatcaacaaaaatagcacatagatctaatctaggaaacaagtga 3072694  T
Q  144 gaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctg 243  Q
     || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3072695 aaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg 3072794  T
Q  244 gaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  3072795 gaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac- 3072893  T
Q  341 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaat 439  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  3072894 aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaat 3072993  T
Q  440 caaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3072994 caaag-actctaaaccctagagtttctccctttg 3073026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 34165220 - 34164772
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||| || ||||||| ||||    
T  34165220 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cacc 34165122  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||    
T  34165121 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtc 34165022  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  34165021 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 34164922  T
Q  311 gaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 409  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34164921 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 34164824  T
Q  410 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34164823 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagag 34164772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 412418 - 412004
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||                |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  412418 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgtgtgc----------------aacagcacctagatctaatctaggtaacaagtgaa 412335  T
Q  145 aaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacacc-aagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctg 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  412334 aaacacaatacacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg 412235  T
Q  244 gaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||     
T  412234 gaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaac- 412136  T
Q  341 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 440  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  412135 aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagaagctctaatc 412036  T
Q  441 aaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  412035 aaag-actctaaaccctagagttactccctttg 412004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13154277 - 13153893
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||| || |||||| |||||    
T  13154277 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacacc 13154178  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || |||    
T  13154177 acctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtca 13154078  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13154077 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 13153978  T
Q  312 aaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 395  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153977 aaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13153893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 44 - 473
Target Start/End: Original strand, 6097285 - 6097707
Alignment:
Q  44 aatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaacaagtg 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6097285 aatgatgtgtggagcaacggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtgcaagctataatcaacaaaaacagcaccttgatctaatctaggtaacaagtg 6097383  T
Q  143 -agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 240  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6097384 gaaaaacacaatacacaatcacaagatacaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 6097483  T
Q  241 ctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaac 339  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  6097484 ctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac 6097573  T
Q  340 aaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaa 438  Q
     || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  6097574 -aatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaaccaaagagatactctaa 6097672  T
Q  439 tcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6097673 tcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 6097707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 2171366 - 2171804
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2171366 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 2171464  T
Q  143 agaaa---cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctac 239  Q
    | |||   || || |||||| |||||||||||||| ||| |||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2171465 aaaaaaaacataaaacacaagcacaagataaaagg-gagagaagagataaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 2171563  T
Q  240 tctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaa 338  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  2171564 tctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaa 2171662  T
Q  339 caaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagag 429  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  2171663 c-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagag 2171761  T
Q  430 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2171762 aaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttg 2171804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 93 - 463
Target Start/End: Original strand, 31404561 - 31404937
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaa-cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    |||| |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||    
T  31404561 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagaggaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaa 31404658  T
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  31404659 caaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aa 31404756  T
Q  291 agggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacact 381  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||    
T  31404757 agagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaagacact 31404855  T
Q  382 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||||||| || ||   |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  31404856 caatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaagaccctaaaccctaaagtt 31404937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 30834373 - 30834809
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||  || ||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  30834373 atgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccaataa-caaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtg 30834471  T
Q  143 agaaa--cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 240  Q
    | |||  |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30834472 aaaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagataaacaaacacaccaa-agattattcacccagttcggtccaaacttgacctact 30834568  T
Q  241 ctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaa 338  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  30834569 ctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaa 30834667  T
Q  339 caaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaaga 428  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   | |||||||| | |||||| |||||||||||    
T  30834668 c-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccgaggtgtttacaatgtttctcaacccaaga 30834766  T
Q  429 gatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  30834767 ga-actctaatcaaag-accataaaccctaaagttgcttcctttg 30834809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 463
Target Start/End: Original strand, 5413234 - 5413655
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  ||||||  |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  5413234 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagag 5413332  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5413333 aaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactct 5413428  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||     
T  5413429 ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac- 5413526  T
Q  341 aaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagata 432  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||| |||||| | ||||||  |||||| ||||| |    
T  5413527 aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaatgtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-a 5413625  T
Q  433 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5413626 ctctaatcaaag-accctaaaccctaaagtt 5413655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 463
Target Start/End: Original strand, 16452167 - 16452592
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||  || ||||||   | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16452167 atgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatacaagcaataatcaacaataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 16452265  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaag-ataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
    | || |||||  ||||| || ||  ||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16452266 aaaagcacaaaccacaagcaaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactc 16452362  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggata-caaaaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaac 339  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16452363 tggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatatgaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac 16452461  T
Q  340 aaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagag 429  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16452462 -aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagag 16452560  T
Q  430 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  16452561 a-actctaatcaaag-accctaaactctaaagtt 16452592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 115 - 463
Target Start/End: Original strand, 5406109 - 5406461
Alignment:
Q  115 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  5406109 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaaacaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttca 5406205  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaaga 312  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  5406206 cccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaaga 5406304  T
Q  313 aattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||    
T  5406305 aattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggt 5406403  T
Q  405 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5406404 gtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtt 5406461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 115 - 463
Target Start/End: Original strand, 5410434 - 5410786
Alignment:
Q  115 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  5410434 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaaacaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttca 5410530  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaaga 312  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  5410531 cccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaaga 5410629  T
Q  313 aattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||    
T  5410630 aattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggt 5410728  T
Q  405 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5410729 gtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtt 5410786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 304
Target Start/End: Original strand, 5408909 - 5409164
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  ||||||  |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  5408909 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagag 5409007  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5409008 aaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactct 5409103  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg 304  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  5409104 ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagg 5409164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 375
Target Start/End: Original strand, 33160254 - 33160521
Alignment:
Q  110 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || ||||||||| | ||| |||||   ||||||| ||||||| |||     
T  33160254 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaag-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-agat 33160351  T
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  33160352 tgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagtt 33160450  T
Q  307 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  33160451 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 33160521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588931
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 21589001  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21589000 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593664
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 21593734  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21593733 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 375
Target Start/End: Original strand, 3808699 - 3808877
Alignment:
Q  199 ccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac 298  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  3808699 ccaagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac 3808797  T
Q  299 aaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3808798 aaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Original strand, 9182917 - 9183199
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| | |     
T  9182917 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggga- 9183015  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
     |||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  9183016 -caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 9183111  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9183112 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 9183199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17758191 - 17758026
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  17758191 tgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 17758093  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17758092 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Original strand, 2972959 - 2973107
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  2972959 aacttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 2973057  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2973058 agctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17763158 - 17762990
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||    
T  17763158 tgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaa-agatacaaatgagtt 17763060  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17763059 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 28137409 - 28137576
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||  ||||    
T  28137409 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggtt 28137506  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28137507 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 28137576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16569208 - 16568953
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16569208 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 16569111  T
Q  288 aaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaat 385  Q
                ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||    
T  16569110 ------------aaaggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaat 16569026  T
Q  386 gattctctctt-tacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 458  Q
    |||| || |||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16569025 gattttcacttacccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 16568953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 373
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830289
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 306  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  26830124 tgttcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatggatt 26830221  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 373  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26830222 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccatttttccaatctcacc 26830289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Original strand, 6136109 - 6136216
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagt---atgtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  6136109 atcgaaccataccaatacaaagaataatgatgtgtggagcaacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 6136208  T
Q  116 acctagat 123  Q
    ||||||||    
T  6136209 acctagat 6136216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043630
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 5043697  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 372  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  5043696 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctactcattttctcaatctcac 5043630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 22424826 - 22424995
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa---gg 304  Q
    |||||||||| | ||||||||   |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||   ||    
T  22424826 tgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaatggg 22424923  T
Q  305 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22424924 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 26954268 - 26954450
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26954268 aaacaaagtcaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 26954365  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 372  Q
     |||| |||||| | | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26954366 -aaagagatacagatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttataccaatttcccaatctcac 26954450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039071
Alignment:
Q  231 ttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 328  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||     
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagc 3039024  T
Q  329 tcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3039025 tcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 33211186 - 33211353
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||| | | |    
T  33211186 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagct 33211283  T
Q  307 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33211284 acaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaac-aaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaa 33211353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 341
Target Start/End: Original strand, 603081 - 603222
Alignment:
Q  200 caagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggataca 299  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  603081 caagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagataca 603178  T
Q  300 aa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaa 341  Q
    ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  603179 aatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 603222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4045542 - 4045423
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  4045542 ctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttctac 4045443  T
Q  356 ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  4045442 cattttcccaatctctccaa 4045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26800755 - 26800642
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 305  Q
    |||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||   ||    
T  26800755 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaattagt 26800658  T
Q  306 tacaagaaattagctt 321  Q
    ||||||||||||||||    
T  26800657 tacaagaaattagctt 26800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13159133 - 13159066
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag 86  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  13159133 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaag 13159066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 308 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16567265 - 16567111
Alignment:
Q  308 caagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct-ttacaaggt 404  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||    ||||||    
T  16567265 caagaaattagcttaaacaagctcacaaaaaacaaaacctaatttctaaccattttcccaatctca---agacactcaatgattttcactcacccaaggt 16567169  T
Q  405 gtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  16567168 gtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagtt 16567111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6267023 - 6266593
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  6267023 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtaagcaaaaatcaacaaaacaacacctagatctaatctaggaaagaagtgaa 6266924  T
Q  145 aaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaa-gacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctg 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6266923 aaacacaatacacaagcacaagataaacggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg 6266824  T
Q  244 gaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaa 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6266823 gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaa 6266724  T
Q  343 ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266723 ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaa 6266624  T
Q  443 agaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6266623 agaaccctaaaccctagagttgctccctttg 6266593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Original strand, 12647192 - 12647639
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  12647192 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 12647291  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  12647292 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 12647391  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12647392 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 12647491  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12647492 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 12647589  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647590 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 12647639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 395
Target Start/End: Original strand, 13655835 - 13656220
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||| || ||||||||||||    
T  13655835 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagtatattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 13655934  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaa-gagagtgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||     
T  13655935 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattgg 13656034  T
Q  211 tcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttaca 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13656035 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttaca 13656134  T
Q  310 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 395  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656135 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13656220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 32289895 - 32289467
Alignment:
Q  47 gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgag 144  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32289895 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaa 32289797  T
Q  145 aaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctg 243  Q
    || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32289796 aagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg 32289697  T
Q  244 gaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaa 341  Q
    |||||||| |||  ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |    
T  32289696 gaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-a 32289598  T
Q  342 accctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatc 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  32289597 accctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttccaaacccaagagaagctctaatc 32289499  T
Q  441 aaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  32289498 aaag-actctaaaccctagagttactccctttg 32289467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 4484167 - 4484604
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4484167 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 4484265  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || || ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4484266 aaaagcaaaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttctgtccaaacttgacctactct 4484364  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  4484365 ggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac- 4484463  T
Q  341 aaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagat 431  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||      |||||||||||||||||  | ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||     
T  4484464 aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 4484563  T
Q  432 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4484564 gctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttg 4484604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30833677 - 30833240
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  |  ||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30833677 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccattaattat-gtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 30833579  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30833578 aaaagcacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactct 30833480  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||     
T  30833479 ggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac- 30833381  T
Q  341 aaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagat 431  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||  | ||   ||| |||||| | ||||||  |||||||||| |     
T  30833380 aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagataa 30833281  T
Q  432 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30833280 gctctaatcaaa-aaccctaaaccctagagttactccctttg 30833240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 473
Target Start/End: Original strand, 4502975 - 4503405
Alignment:
Q  48 atgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgaga 145  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||  || ||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  4502975 atgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaa 4503073  T
Q  146 aacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctgga 245  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4503074 agcacaaaacacaagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgga 4503170  T
Q  246 ggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaac 343  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  4503171 ggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aac 4503267  T
Q  344 cctaatttctacc--cttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatac 433  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||       | ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||    
T  4503268 cctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-ac 4503366  T
Q  434 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||    
T  4503367 tctaatcaaagaa-cctaaaccctaaagttgcttcctttg 4503405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 45100088 - 45099650
Alignment:
Q  40 gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaaca 138  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  ||||||     ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  45100088 gaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatca 45099990  T
Q  139 a-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacct 237  Q
    | |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45099989 aagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 45099893  T
Q  238 actctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaat 335  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  45099892 actctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa 45099795  T
Q  336 gaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaaccca 425  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||    
T  45099794 gaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 45099696  T
Q  426 agagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  45099695 agaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttg 45099650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 36205504 - 36205936
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||     ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36205504 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 36205602  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || || ||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36205603 aaaagcagaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 36205699  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    |||||| || ||| |||||||||||| || |||| ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  36205700 ggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac- 36205796  T
Q  341 aaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagat 431  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||     
T  36205797 aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagaga- 36205895  T
Q  432 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  36205896 actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttg 36205936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 463
Target Start/End: Original strand, 5723146 - 5723517
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagt-gagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaa 194  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||   || || |||||  ||||| || |||||||||||||||   |||   |||||||    
T  5723146 caataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaaaagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaatagag--aaacaaa 5723243  T
Q  195 gacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggg 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  5723244 cacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagag 5723341  T
Q  295 atac-aaaaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaat 385  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||    
T  5723342 atacaaaaaggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaat 5723440  T
Q  386 gattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  5723441 gattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accccaaaccctaaagtt 5723517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 463
Target Start/End: Original strand, 36987961 - 36988338
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  | |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  36987961 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaa 36988058  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  36988059 acaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 36988156  T
Q  290 aagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 379  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||       |||||||    
T  36988157 aagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagaca 36988255  T
Q  380 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  36988256 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttactatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 36988338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Original strand, 6594890 - 6595175
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || ||||||||||| ||| |||||   ||    
T  6594890 caagtaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaagg-gagagaagagagaa 6594988  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  6594989 acaaacacaccaa-agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-a 6595086  T
Q  290 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  6595087 aagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaa 6595175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 2334368 - 2334661
Alignment:
Q  155 cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagttt 254  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2334368 cacaagcacaagataaagggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 2334464  T
Q  255 gtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttc 352  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  2334465 gatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aacccttatttc 2334562  T
Q  353 taccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaa 443  Q
    ||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2334563 tacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaa 2334661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29868133 - 29867869
Alignment:
Q  110 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||  ||||   ||||||| ||| ||| |||     
T  29868133 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaagataaacggagag--aagagagaaacaaacacatcaa-agat 29868037  T
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    | || ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  29868036 tattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 29867939  T
Q  307 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29867938 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29867869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726929
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 45726999  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45726998 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 34139752 - 34139936
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34139752 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 34139849  T
Q  288 aaaagggataca-aaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34139850 aaaagggatacatatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcac 34139936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38312570 - 38312240
Alignment:
Q  44 aatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gt 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  ||||||     ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  38312570 aatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaacacaagcaacaatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagt 38312472  T
Q  142 gagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctact 240  Q
    || || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  |||| ||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| || |    
T  38312471 gaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacatcaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataat 38312376  T
Q  241 ctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaa 338  Q
    |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||    
T  38312375 ctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaa 38312277  T
Q  339 caaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38312276 c-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 38312240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Original strand, 17057255 - 17057537
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  17057255 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaa- 17057353  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
     |||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  17057354 -caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 17057449  T
Q  290 aagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17057450 aagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 17057537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Original strand, 17085238 - 17085520
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  17085238 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaa- 17085336  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
     |||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  17085337 -caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 17085432  T
Q  290 aagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17085433 aagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 17085520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 357
Target Start/End: Original strand, 723726 - 723893
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  723726 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 723823  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 357  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  723824 -aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 723893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 14633807 - 14633991
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14633807 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttac 14633904  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14633905 aaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttaccaatctcac 14633991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 11151573 - 11151759
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11151573 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttac 11151670  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11151671 -aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 11151759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35447052
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 35446982  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  35446983 acaagaaattagattcaacaagatcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaa 35447052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36773748 - 36773562
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36773748 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac 36773651  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  36773650 -aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaa 36773562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362257
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaaca 42362402  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtt 416  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | |||||    
T  42362401 agctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtt 42362303  T
Q  417 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  42362302 tcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 42362257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 375
Target Start/End: Original strand, 1631735 - 1631900
Alignment:
Q  210 ttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttac 308  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  1631735 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 1631832  T
Q  309 aagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1631833 aagatattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 1631900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33648176
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 306  Q
    |||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||||||| ||||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggtt 33648241  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 370  Q
    ||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  33648240 acaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 36317991 - 36318177
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36317991 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 36318088  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36318089 -aaagagatacaaatgggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 36318177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11690657 - 11690504
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| |||||| || | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11690657 ttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaatta 11690560  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11690559 gcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 11690504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24398226 - 24398055
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 306  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||    
T  24398226 tgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggtt 24398127  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24398126 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26353340 - 26353184
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  26353340 ttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaag-atacaaaagtgttacaagaaatta 26353243  T
Q  318 gcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||| | |||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  26353242 gcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaa 26353184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121769
Alignment:
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaaca 340  Q
    |||||||||| |||   ||| |||||||||||||| |||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaa-gagatacaaa-ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaaca 13121804  T
Q  341 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13121803 aaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 33162432 - 33162618
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33162432 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac 33162529  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     | || ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  33162530 -agagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaa 33162618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 375
Target Start/End: Original strand, 7815323 - 7815441
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |   || ||||||||||||||||| ||    
T  7815323 ctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaac 7815421  T
Q  356 ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  7815422 ctttttctcaatctcaccaa 7815441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11067491 - 11067305
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  11067491 aaacaaacacaccaa-agattgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttac 11067394  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  11067393 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtac-aacactaatttctacccatttttccaatttcaccaa 11067305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 321
Target Start/End: Original strand, 17490149 - 17490261
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||    
T  17490149 tgtttacccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaatgagttcttac-aaagagttacaaaagagtt 17490246  T
Q  307 acaagaaattagctt 321  Q
    |||||||||||||||    
T  17490247 acaagaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 375
Target Start/End: Original strand, 42288117 - 42288278
Alignment:
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaag 311  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||  |||||||  ||||||||     
T  42288117 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttac-aaagaaatacaaatgggttacaat 42288213  T
Q  312 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42288214 aaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 42288278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28672090 - 28671989
Alignment:
Q  217 aattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaat 315  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  ||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  28672090 aattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctttgtaaagagatacaaaacggtaacaagaaat 28671991  T
Q  316 ta 317  Q
    ||    
T  28671990 ta 28671989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7451266 - 7451173
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 321  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  7451266 aacttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgaattacaagaaattagctt 7451173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39285003 - 39284930
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagtt 282  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  39285003 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17450744 - 17450671
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttc 283  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17450744 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgt-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc 17450671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 371
Target Start/End: Original strand, 14202501 - 14202569
Alignment:
Q  304 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 371  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14202501 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctca 14202569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24198015 - 24197906
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagtt-cttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttg--acaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 354  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||| |   |||||||| | | ||| ||||  |||||||||    
T  24198015 ctctccaatccattatcaaagagtttcttgcaaa-gagatacaag-ggttacaagaaattagccttcaacaagttctccaagaaaaaactttaatttcta 24197918  T
Q  355 cccttttcccaa 366  Q
    ||||||||||||    
T  24197917 cccttttcccaa 24197906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28770781 - 28770730
Alignment:
Q  305 ttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 357  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28770781 ttacaagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaactctaatttctaccc 28770730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20344254 - 20343799
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacacca--- 116  Q
    |||||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||       
T  20344254 atcgaaccacaccaatgcaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgcaagcaacaatcgacaaaaaaccagca 20344157  T
Q  117 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagagtgttcacc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||    
T  20344156 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 20344057  T
Q  216 caattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 314  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344056 cagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 20343958  T
Q  315 ttagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343957 ttagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 20343858  T
Q  415 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20343857 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 20343799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Original strand, 18388566 - 18389013
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  18388566 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 18388665  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  18388666 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaagagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 18388765  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18388766 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 18388865  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18388866 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 18388963  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388964 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 18389013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Original strand, 18392002 - 18392449
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  18392002 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacagagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 18392101  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  18392102 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 18392201  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18392202 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 18392301  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18392302 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 18392399  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392400 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 18392449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Original strand, 6594364 - 6594811
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  6594364 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 6594463  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  6594464 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 6594563  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6594564 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 6594663  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6594664 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 6594761  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594762 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6594811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Original strand, 6592146 - 6592593
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  6592146 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 6592245  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| |||    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  6592246 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagaaaaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 6592345  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6592346 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 6592445  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6592446 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 6592543  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592544 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6592593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Original strand, 32060128 - 32060579
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  32060128 atcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 32060227  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  32060228 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 32060327  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaa--gggatacaaaaggttaca 309  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  32060328 ccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatacaagaggttaca 32060427  T
Q  310 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060428 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 32060527  T
Q  410 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060528 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 32060579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 143 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 24790075 - 24789743
Alignment:
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa-caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24790075 agaaacacaatgcacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactc 24789976  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaaca 340  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24789975 tggaggagagatagtactctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaaca 24789876  T
Q  341 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 440  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789875 aaccctaatttttacccttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 24789776  T
Q  441 aaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24789775 aaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 24789743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 43503991 - 43504421
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtg--caagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||| ||    
T  43503991 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaa-caaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaaa--cagctagatctaatctaggaatcaaagt 43504087  T
Q  142 gagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
    || || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  43504088 gaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcgatccaaacttgacctacta 43504187  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaa 338  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  43504188 tggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaa 43504287  T
Q  339 caaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactcta 437  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||    
T  43504288 c-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcgatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaagccaagagaagctcta 43504386  T
Q  438 atcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  43504387 atcaaag-actctaaaccctagagtttctccctttg 43504421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 80 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 39731666 - 39731271
Alignment:
Q  80 aacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggaga 177  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  39731666 aacaaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaaggaga 39731567  T
Q  178 gggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  39731566 gggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaat 39731468  T
Q  278 gagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagct-tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39731467 gagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaa 39731369  T
Q  376 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39731368 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttg 39731271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 298
Target Start/End: Original strand, 1560471 - 1560757
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||| || ||||||||||||    
T  1560471 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagtatattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 1560570  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |     
T  1560571 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtt 1560670  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatac 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1560671 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 1560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 97 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 35854194 - 35853810
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaa 194  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || || |||||| |||||||||||||| ||| |||||   |||||||    
T  35854194 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaagcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaa 35854096  T
Q  195 gacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggg 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  35854095 cacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagag 35853997  T
Q  295 atacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaa 384  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||    
T  35853996 atacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaa 35853898  T
Q  385 tgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  35853897 tgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaaccctaaagttgctacctttg 35853810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 25766796 - 25767227
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||  || ||||||  | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  25766796 atgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaataa-caaagtgagcgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtg 25766894  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaa-gataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
    | ||||||||  ||||| || || ||||||||| ||| ||| |   ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25766895 aaaaacacaaatcacaagcaaaaagataaaagg-gagagaatagagaaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactc 25766993  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg--ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaa 338  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25766994 tggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaa 25767092  T
Q  339 caaaccctaatttctacccttttc-ccaatctcac----caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 433  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||     ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | |||||| | |   |||||| ||    
T  25767093 caa-ccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttccca---aagagaaac 25767188  T
Q  434 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25767189 tctaatcaaaga-ccctaaaccctagagttgctccctttg 25767227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 48409136 - 48408697
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  48409136 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtg 48409038  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaa-gataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
    | || |||||  ||||| || || ||||||||| ||| |||||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  48409037 aaaagcacaaatcacaagcaaaaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaacacaccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactc 48408939  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaa 338  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  48408938 tggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaa 48408839  T
Q  339 caaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagag 429  Q
    | |||  |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  48408838 c-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagag 48408740  T
Q  430 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48408739 aaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttg 48408697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 305 - 461
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562257
Alignment:
Q  305 ttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggt 1562200  T
Q  405 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562201 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 1562257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 93 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 29991335 - 29990960
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 190  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||    
T  29991335 caagtaataatcaacaataacaacacctagatctaatataggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaa 29991238  T
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||    
T  29991237 caaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttatta-gaa 29991140  T
Q  291 agggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacact 381  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||    
T  29991139 agagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaagacact 29991041  T
Q  382 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29991040 caatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtt 29990960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23555323 - 23555039
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  23555323 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtaaaaaacacaataccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaa 23555226  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  23555225 acaaacacatcaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 23555128  T
Q  290 aagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  23555127 aagaggtacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaa 23555039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4179102 - 4178670
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||   || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  4179102 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatgtaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 4179004  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | ||||||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||| | || ||| |||||||||||| ||||    
T  4179003 aaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctct 4178907  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||     
T  4178906 ggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaac- 4178810  T
Q  341 aaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagat 431  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||     
T  4178809 aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga- 4178711  T
Q  432 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  4178710 actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttg 4178670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 25616137 - 25615785
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| || |||| |||||||||||  |||| | ||||   ||    
T  25616137 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaagagagaag-aagagagaa 25616039  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25616038 acaaacacaccaa-agattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaa 25615940  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatg 386  Q
    ||  ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  25615939 aa-tgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacactcaatg 25615845  T
Q  387 attctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 445  Q
    ||| |||||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25615844 attttctctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19502443 - 19502083
Alignment:
Q  110 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| || |||| ||||| ||||| ||||||  ||||   ||||||| ||||||| |||     
T  19502443 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaaaataaagggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agat 19502347  T
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  19502346 tgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagtt 19502248  T
Q  307 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctt 396  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| ||     
T  19502247 acaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaac-aaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcactc 19502149  T
Q  397 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  19502148 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 19502083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 34310716 - 34310884
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | |||    
T  34310716 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatgtgtt 34310814  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34310815 acaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22270158 - 22269973
Alignment:
Q  189 aacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 288  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||||     
T  22270158 aacaaacacaccaagaga-tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttac- 22270062  T
Q  289 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22270061 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27348095 - 27347817
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 193  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| || ||||||||  |||||   ||| |||  |||    
T  27348095 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagtgagagaagagaggaa--caa 27347998  T
Q  194 agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 293  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  27347997 acacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 27347901  T
Q  294 gatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27347900 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24790333 - 24790230
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgag 144  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24790333 atgatgtgtggagcaacggaaagtggtaaccaccaaacaaagtgcgtgcaagtaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaggtgag 24790234  T
Q  145 aaac 148  Q
    ||||    
T  24790233 aaac 24790230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 41317416 - 41317602
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41317416 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 41317513  T
Q  288 aaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41317514 -aaagggatacaaatggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 375
Target Start/End: Original strand, 14069817 - 14070001
Alignment:
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14069817 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 14069913  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14069914 aagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14070001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 375
Target Start/End: Original strand, 14379845 - 14380029
Alignment:
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14379845 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 14379941  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14379942 aagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14380029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359485
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 305  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 8359414  T
Q  306 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8359415 tacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaa 8359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18126928 - 18126644
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||  || |    |    
T  18126928 caagcaataatcaagaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaatagagga 18126829  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  18126828 acaaacacaccaa-agattgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttac-a 18126732  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttg-acaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  18126731 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaa 18126644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Original strand, 30024744 - 30024900
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  30024744 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaatta 30024841  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30024842 gcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30024900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29608902 - 29608737
Alignment:
Q  210 ttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttac 308  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||    
T  29608902 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttac 29608805  T
Q  309 aagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29608804 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48489711 - 48489431
Alignment:
Q  95 agcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaac 191  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| || |||   ||| |||  |    
T  48489711 agcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggcgagaagagaggaa--c 48489614  T
Q  192 aaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaa 291  Q
    ||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| || ||||| || | |||    
T  48489613 aaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgc-aaa 48489517  T
Q  292 gggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48489516 gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48489431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431971
Alignment:
Q  212 cacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaa 310  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 6432037  T
Q  311 gaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6432036 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 6431971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 41648993 - 41649175
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41648993 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 41649090  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 372  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  41649091 -aaagggatacaaatgggttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccaatttttccaatctcac 41649175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491579
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttc-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 48491629  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48491628 agttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48491579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3258995
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttac-aaagagatacaaatgagtt 3259065  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3259064 acaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 321
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358167
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 32358152  T
Q  307 acaagaaattagctt 321  Q
    |||||||||||||||    
T  32358153 acaagaaattagctt 32358167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599502
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||| | |||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctctt-ccaaagagatacaaatgagtt 48599432  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48599433 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 4253510 - 4253697
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||  ||||| |||||| |||||| |||||||| |    
T  4253510 aaacaaacacaccaagaaa-tgtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttc 4253607  T
Q  288 aaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  4253608 caaagagatataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26417598 - 26417316
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||| || | ||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  26417598 caagcaataatcaacaataacagcacctagatataatctatgaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa- 26417500  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
     |||| ||||||||| | |||| ||||| || |||||||  ||||||||  |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26417499 -caaacacaccaagaaattgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-a 26417404  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26417403 aagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26417316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2390461 - 2390301
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| ||    
T  2390461 acaccaagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattac-aaagaga 2390364  T
Q  296 tacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 357  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2390363 tacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 2390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Original strand, 2360992 - 2361140
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||   |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||    
T  2360992 aacttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaaca 2361090  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2361091 agctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2361140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4508874
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 4508804  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4508805 acaagaaattagcttcaataagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8153490 - 8153342
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgaca 325  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  8153490 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgaca 8153392  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |  |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8153391 atctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4586443 - 4586161
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  4586443 caagcaataataaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaagggagagaagagaggaa- 4586345  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
     |||| |||| || ||| |||  ||||| ||||||||||  ||||| || | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  4586344 -caaacacacgaa-agattgtcgacccagttcggtccaag-ttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 4586249  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| |||| |||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4586248 aagagataaaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4586161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43864526 - 43864244
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  43864526 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa- 43864428  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
     |||| ||||||    | |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  43864427 -caaacacaccatct-attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttac-a 43864332  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  43864331 aagagatacaaatgggttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaa 43864244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 445
Target Start/End: Original strand, 47673993 - 47674189
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47673993 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctac 47674090  T
Q  356 cc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 445  Q
    || ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47674091 ccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 47674189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 375
Target Start/End: Original strand, 47676040 - 47676304
Alignment:
Q  110 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||| || ||||| | ||||| || |||||||| |||||  |||||    |||||| ||||||| |||     
T  47676040 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaatggaga--gaagagaggaacaaacacaccaa-agat 47676136  T
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| | ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  47676137 tgttgatccagttcggtcc-aacttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 47676234  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47676235 acaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 47676304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 31732970 - 31733137
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  31732970 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 31733067  T
Q  307 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  31733068 acaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaa 31733137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 36146390 - 36146576
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36146390 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttac 36146487  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36146488 -aaagagatacaaatgggttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36146576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1113981 - 1113660
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaag-tg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |  |||||||    |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  1113981 atgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaactaatat-caaagtaaacacaagcaataa-caacaataataacacctagatctaatctaggaatcaaaatg 1113884  T
Q  143 agaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
    | |||||||| || |||| || |||||||| ||||| |     ||||| |||| ||||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||||| |     
T  1113883 aaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagggagaag-----agaaa-caaacacaccaa-agattgttgactcaattcggtc-aaacttgacctaata 1113792  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaac 339  Q
    ||| |||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  1113791 tgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac 1113693  T
Q  340 aaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 372  Q
     |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  1113692 -aaccctaatttctatccattttctcaatctcac 1113660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Original strand, 38671204 - 38671485
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| ||| || ||   |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38671204 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttac 38671301  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caaga 377  Q
     |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||    
T  38671302 -aaagtgatacaaatgtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaaga 38671399  T
Q  378 cactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  38671400 cactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 38671485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 356
Target Start/End: Original strand, 23565081 - 23565210
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||    
T  23565081 aacttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaaca 23565179  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 356  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  23565180 agctcacaaagaacaagacctaatttctacc 23565210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 372
Target Start/End: Original strand, 496003 - 496148
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||||| | | |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||  |||    
T  496003 aacttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaaca 496101  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    || |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  496102 agctcacaaagaac-taccctaatttctacccattttcccaatctcac 496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 372
Target Start/End: Original strand, 31105394 - 31105558
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||| | |||||| ||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  31105394 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggtt 31105491  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31105492 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaatctaatttctacccattttcccaatctcac 31105558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23344129 - 23343975
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||    ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |  |||| ||||| |||||||||||||    
T  23344129 ttcggtccaa-cttgacctactctgg--gagagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaa-gatatactaaagggttacaagaaatta 23344034  T
Q  318 gcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||| | |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23344033 gcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510716
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatgggtt 4510646  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  | ||  |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4510647 acaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaa 4510716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512558
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatgggtt 4512488  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  | ||  |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4512489 acaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaa 4512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 370
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328556
Alignment:
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 311  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||||| | |||||| |||  ||||| |||||||||| || || ||| |   |||| |||||||||| ||||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaag 22328494  T
Q  312 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctc 370  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22328495 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctc 22328556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 2759209 - 2759339
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||    
T  2759209 ttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatgagttacaagaaatta 2759306  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatt 350  Q
    ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2759307 gcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526065
Alignment:
Q  304 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 24526065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 375
Target Start/End: Original strand, 36574434 - 36574683
Alignment:
Q  119 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcaccca 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||  | ||||||||    ||| ||||||  ||||||| ||| ||||| | |||| |||||    
T  36574434 tagatctaatctaggaatcaagtgaaaaacacaaaaccacaagaaaaagataaa----gagagaagaa--aaacaaacacatcaagaaa-tgtttaccca 36574526  T
Q  218 attcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaatt 316  Q
     || |||||||| |||||||||||| | |||  | |||  |||||||| |||||||||| ||||||||   |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  36574527 gtttggtccaaa-ttgacctactctag-ggatggattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaatt 36574624  T
Q  317 agctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||  ||||  |||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  36574625 agcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttcta-cctttccccaatctctccaa 36574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 321
Target Start/End: Original strand, 6359941 - 6360065
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||| | |||| ||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| | |||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||    
T  6359941 acaccaagaaattgttgacccagttcgatccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagaga 6360038  T
Q  296 tacaaa-aggttacaagaaattagctt 321  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||    
T  6360039 tacaaatgggttacaagaaattagctt 6360065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 12097849 - 12098027
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||         
T  12097849 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt----- 12097940  T
Q  288 aaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
       || |||||||| || ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12097941 ---agagatacaaatgggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 12098027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31519089 - 31518988
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggag-gagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttctta 286  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31519089 aaacaaacacaccaagaaa-tgtttatccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttctta 31518992  T
Q  287 caaa 290  Q
    ||||    
T  31518991 caaa 31518988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396384
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 307  Q
    |||| ||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| || |||||   |||| ||||||||| ||||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaaatgtta 18396387  T
Q  308 caa 310  Q
    |||    
T  18396386 caa 18396384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 290
Target Start/End: Original strand, 24525522 - 24525584
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    ||||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24525522 aacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 24525584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 473
Target Start/End: Original strand, 24514934 - 24515033
Alignment:
Q  373 caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctt 471  Q
    ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||    
T  24514934 caagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctt 24515031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518795
Alignment:
Q  266 tccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttgac-aagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttc 362  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| |||||| |  ||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacc-taatttctacctattttc 31518808  T
Q  363 ccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||    
T  31518807 ccaatctcaccaa 31518795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30814603 - 30814530
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagtt 282  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  30814603 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28617234 - 28617182
Alignment:
Q  303 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 356  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28617234 ggttacaagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaacctaatttctacc 28617182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 71)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 8395966 - 8395519
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  8395966 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaaaaaacaacaaaacacc 8395867  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaa-ggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  8395866 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaatggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 8395767  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395766 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 8395667  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8395666 aaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 8395569  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395568 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 8395519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 8393757 - 8393310
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  8393757 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacgaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 8393658  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaa-ggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  8393657 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaatggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 8393558  T
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393557 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 8393458  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8393457 aaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 8393360  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8393359 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccataaaccctagag 8393310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 7125264 - 7124815
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  7125264 atcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 7125165  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  7125164 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttca 7125065  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| |||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  7125064 cccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 7124965  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124964 aaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 7124865  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124864 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 7124815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 7123045 - 7122596
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  7123045 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 7122946  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||    
T  7122945 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagaaattgttca 7122846  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| |||||||    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  7122845 cccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 7122746  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122745 aaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 7122646  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122645 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 7122596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 5138653 - 5138204
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| |  |||||||||| |    
T  5138653 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagagacaacaaaacatc 5138554  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaat-cacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgtt 211  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |  |  |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || |    
T  5138553 ac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggt 5138455  T
Q  212 cacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttaca 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  5138454 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttaca 5138355  T
Q  310 agaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 408  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  5138354 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtattt 5138257  T
Q  409 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138256 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 5138204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 5136428 - 5135978
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag--tat-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| |  |||||||||| |    
T  5136428 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagagacaacaaaacatc 5136329  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaat-cacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgtt 211  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |  |  |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || |    
T  5136328 ac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggt 5136230  T
Q  212 cacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttaca 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  5136229 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttaca 5136130  T
Q  310 agaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 408  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  5136129 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtattt 5136032  T
Q  409 cccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136031 cccatgtttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 5135978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 31495143 - 31495583
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtg--caagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gt 141  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31495143 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccatcaa-caaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaaagt 31495241  T
Q  142 gagaaacacaatacacaatcacaagata--------aaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttg 233  Q
    || || || || |||||| |||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31495242 gaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttg 31495341  T
Q  234 acctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag-cttgacaagttc 330  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||    
T  31495342 acctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttc 31495441  T
Q  331 acaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagag 429  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31495442 acaatgaac-aatcctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagag 31495540  T
Q  430 atactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |  |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  31495541 aagctctaatcaaag-actataaaccctagagttactccctttg 31495583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 13992130 - 13992559
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  13992130 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtg 13992228  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaa-gataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactc 241  Q
    | || |||||  ||||| || || ||||||||| ||| |||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13992229 aaaagcacaaatcacaagcaaaaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactc 13992326  T
Q  242 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaac 339  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  13992327 tggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac--aagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac 13992424  T
Q  340 aaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactct 436  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||    
T  13992425 -aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagagactct 13992523  T
Q  437 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  13992524 aatcaaag-accctaaaccctaaagttgctacctttg 13992559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 115 - 463
Target Start/End: Original strand, 29999719 - 30000068
Alignment:
Q  115 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  ||||| || |||| ||||||||||  ||||   ||||||| |||||||     ||||||    
T  29999719 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaaacacaaaccacaagcaaaagacaaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-----tgttca 29999811  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaaga 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  29999812 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagttacaaga 29999911  T
Q  313 aattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 404  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||| || ||   ||||||    
T  29999912 aattagctttgacatgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcaccaaggt 30000010  T
Q  405 gtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    |||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30000011 gtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtt 30000068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 93 - 445
Target Start/End: Original strand, 56178522 - 56178882
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  56178522 caagcaataataaacaataacaacacctagatctaatctaggaatgaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaa 56178619  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  56178620 acaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 56178717  T
Q  290 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 379  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||    
T  56178718 aagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagaca 56178816  T
Q  380 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 445  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  56178817 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 56178882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 356
Target Start/End: Original strand, 5369968 - 5370232
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  5369968 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagataa 5370065  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||| |||||||||| |    
T  5370066 acaaacacatcaa-agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttac-a 5370163  T
Q  290 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc--ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 356  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5370164 aagagatacaaaagggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 5370232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48143330 - 48143042
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaa----cacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaa 185  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    ||||| | ||||| || |||||||||||||||  ||||     
T  48143330 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaaaggagag--aagag 48143233  T
Q  186 gaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttctt 285  Q
      ||||||| ||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48143232 agaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 48143134  T
Q  286 acaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  48143133 a-tgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 48143042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Original strand, 52095248 - 52095530
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| | || || ||||| || ||||  | |||||||||||||||  ||||   ||    
T  52095248 caagtaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggagtcaaagagaaaagcacaaaaccacaaggaaaagataaaaggagag--aagagagaa 52095345  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  52095346 acaaacacaccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttac-a 52095442  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52095443 aagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 52095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2209894 - 2209717
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  2209894 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaga 2209796  T
Q  296 tacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 371  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2209795 tacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Original strand, 9927345 - 9927626
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaa-tacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  9927345 caagcaataatcaacaataacagcacctagatttaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaa-ggagagaatagaggaa- 9927442  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
     |||| ||||||| ||| |||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  9927443 -caaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 9927538  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9927539 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9927626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964415
Alignment:
Q  211 tcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttac 308  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaaatgggttac 41964483  T
Q  309 aagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41964482 aataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703500
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 305  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 46703571  T
Q  306 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46703570 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Original strand, 34570304 - 34570582
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 193  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||| | ||||| || ||||||||||||||  |||||    |||||    
T  34570304 caataatcaacaataacaacacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggaga--gaagagaggaacaa 34570401  T
Q  194 agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 293  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  34570402 acacaccaa-agattgttgacccagttcgatcc-aacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 34570498  T
Q  294 gatacaa-aaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34570499 gatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 34570582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6655975
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 6656026  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 357  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  6656025 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccc 6655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 375
Target Start/End: Original strand, 12739454 - 12739718
Alignment:
Q  110 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagag 207  Q
    |||| ||||||||||||||| || || | |||||| || ||||| | ||||| || ||||||||||||||  |||||    |||||| ||||||| |||     
T  12739454 aacaacacctagatctaatcaagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggaga--gaagagaggaacaaacacaccaa-agat 12739550  T
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||  ||||    
T  12739551 tgttgacccagttcggtcc-aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatac-aaatagatacaaatgggtt 12739648  T
Q  307 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12739649 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12739718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 196 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26364415 - 26364236
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||    
T  26364415 acaccaagaaattgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttac-aaagaga 26364318  T
Q  296 tacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26364317 tacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 373
Target Start/End: Original strand, 46147373 - 46147557
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46147373 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttac 46147470  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 373  Q
     |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46147471 -aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 47038393 - 47038577
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  47038393 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttac 47038490  T
Q  288 aaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||  |||||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47038491 -aaacagatacaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccaatctcaccaa 47038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 356
Target Start/End: Original strand, 12743829 - 12744073
Alignment:
Q  110 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || ||||||||||||||    ||| |||  |||| ||||||| |||     
T  12743829 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaactacaagcaaaagataaaaggagaaaagagaggaa--caaacacaccaa-agat 12743925  T
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  12743926 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 12744023  T
Q  307 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12744024 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Original strand, 52082549 - 52082825
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagt-gagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||   || || || || || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  52082549 caagcaataatcaacaataacagcacctagatcttatctaggaatcaaaaagaaaagcataaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagataa 52082646  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  |||       |||||||||||| ||||||| |    
T  52082647 acaaacacaccaa-agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttac-a 52082737  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52082738 aagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 52082825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665408
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 8665458  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8665457 agctctcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 8665408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12073560 - 12073392
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||| | ||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  12073560 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 12073462  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12073461 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 36463390 - 36463557
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  36463390 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 36463487  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36463488 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632445
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 40632515  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40632514 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41639593 - 41639426
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||  ||||    
T  41639593 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttac-aaatagatacaaatgggtt 41639496  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41639495 acaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 54883199 - 54883020
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  54883199 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaga 54883102  T
Q  296 tacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54883101 tacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 356
Target Start/End: Original strand, 12745297 - 12745462
Alignment:
Q  189 aacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 288  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  12745297 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 12745393  T
Q  289 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 356  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12745394 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 375
Target Start/End: Original strand, 26175619 - 26175804
Alignment:
Q  189 aacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 288  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26175619 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 26175715  T
Q  289 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26175716 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaa 26175804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 48893620 - 48893810
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48893620 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac 48893717  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttc----acaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48893718 -aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 48893810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 6542161 - 6542349
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6542161 aaacaaacacaccaagaaa-tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac 6542258  T
Q  288 aaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  6542259 -aaagagatacaaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaa 6542349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 379548 - 379383
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  379548 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttac-aaagcgatacaaatgggtt 379450  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  379449 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcac 379383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 368
Target Start/End: Original strand, 5207843 - 5208003
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa-agggatacaaaaggtt 306  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||  ||||    
T  5207843 tgtttacccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaag-ggtt 5207940  T
Q  307 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatc 368  Q
     ||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5207941 gcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8648139
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 8648209  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    | |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  8648208 ataagaaattagcttcaacaaactcacaatgaac-aaccctaatttctatccattttcccattctcaccaa 8648139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36994691 - 36994524
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  36994691 tgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggtt 36994594  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36994593 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 37740903 - 37740536
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 193  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  |||    
T  37740903 caataatcaacaataacagcacctagatctaatgtaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caa 37740806  T
Q  194 agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 293  Q
    | |||| || | | |||| || || |||||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  37740805 acacacaaaaa-attgttgacacagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 37740709  T
Q  294 gatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactca 383  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       |||||||||||    
T  37740708 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactca 37740610  T
Q  384 atgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 458  Q
     ||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37740609 gtgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 37740536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 45687164 - 45687351
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| || | |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45687164 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac 45687261  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||  |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45687262 -aaatagatacaaatgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Original strand, 37229733 - 37229890
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa-agggatacaaaaggttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||     
T  37229733 ttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggttacaacaaattt 37229831  T
Q  318 gcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37229832 gctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Original strand, 50262689 - 50262865
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| || |||   ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||    
T  50262689 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagaga 50262787  T
Q  296 tacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctca 371  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||    
T  50262788 tacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccgtaatttcgatccattttcccaatctca 50262865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 321
Target Start/End: Original strand, 50673848 - 50673960
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  50673848 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 50673945  T
Q  307 acaagaaattagctt 321  Q
    |||||||||||||||    
T  50673946 acaagaaattagctt 50673960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Original strand, 54199926 - 54200074
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  54199926 aacttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 54200024  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54200025 agttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54200074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 196 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12119719 - 12119540
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||| | |||||||| | ||||||||||   ||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||   |||| ||    
T  12119719 acaccaagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagaga 12119621  T
Q  296 tacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcacc 373  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  12119620 tacaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacc 12119540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5872003 - 5871820
Alignment:
Q  191 caaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  5872003 caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgc-aa 5871907  T
Q  291 agggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || |||| |||  |||||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5871906 agtgataaaaatgggttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 5871820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Original strand, 27416977 - 27417133
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  27416977 ttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaatta 27417074  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  27417075 gcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 52467336 - 52467519
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  52467336 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattac 52467433  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 372  Q
     |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  52467434 -aaagtgatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaacctcac 52467519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4588107 - 4587958
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gaca 325  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  4588107 aacttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaaca 4588009  T
Q  326 agttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || | |||| ||||||| | |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  4588008 agcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaa 4587958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 5429957 - 5429574
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 193  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || | ||| || ||||  | |||||||| ||||||   ||| |||  |||    
T  5429957 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagtaaaagataaagggagagaagagaggaa--caa 5429860  T
Q  194 agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 293  Q
    | ||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  5429859 acacatcaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaata 5429763  T
Q  294 gatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac-------caagacactca 383  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||    
T  5429762 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaa-taaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 5429664  T
Q  384 atgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  5429663 atgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacttcctttg 5429574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31474337 - 31474150
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||   |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31474337 aaacaaacacaccaagata-tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttac 31474240  T
Q  288 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
     |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||  ||| || ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31474239 -aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 31474150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 12744097 - 12744195
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12744097 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctac 12744194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 375
Target Start/End: Original strand, 12745486 - 12745604
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12745486 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctac 12745583  T
Q  356 cc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || |||||| |||||| ||||    
T  12745584 ccattttcctaatctcgccaa 12745604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 375
Target Start/End: Original strand, 12747806 - 12747924
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta- 354  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  12747806 ctctccaatccactatcaatgagttcatac-aaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctat 12747903  T
Q  355 cccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  12747904 ccattttcccaatctcaccaa 12747924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35662597 - 35662441
Alignment:
Q  219 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaatta 317  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  35662597 ttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaatta 35662500  T
Q  318 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||||  ||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  35662499 gcttcaacaaactcataaagaac-aaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaa 35662441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 360
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699596
Alignment:
Q  213 acccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 311  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||||||   |||| |||  |||||||||||| ||| || ||||||||   |||| |||||||||| ||||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaag 26699546  T
Q  312 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt 360  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  26699547 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctatacccttt 26699596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24969230 - 24969112
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  24969230 ctctccaatccactatcaattagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctac 24969133  T
Q  356 cc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  24969132 ccatttttccaatctcaccaa 24969112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29254758 - 29254580
Alignment:
Q  110 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| | ||||| || |||||||| ||||||   ||| |  |||||| ||||||| |||     
T  29254758 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaatggagagaatagagg--aacaaacacaccaa-agat 29254662  T
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 290  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29254661 tgttgacccagttcggtcc-aacttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaa 29254580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  232 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt 321  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| || ||||| ||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51337231 - 51337064
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||  |||||| |||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  51337231 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaaagggtt 51337134  T
Q  307 acaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaa-ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    | || |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51337133 ataataaattatctt-aaaagctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 51337064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Original strand, 13009464 - 13009536
Alignment:
Q  228 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 301  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13009464 aacttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaa 13009536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 371
Target Start/End: Original strand, 48142473 - 48142542
Alignment:
Q  303 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctca 371  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  48142473 ggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcatgttcccaatctca 48142542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41639353 - 41639263
Alignment:
Q  287 caaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41639353 caaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1983309 - 1983252
Alignment:
Q  303 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 361  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  1983309 ggttacaagaaattagcttg-caagctcacaaagaacaaaacataatttctatcctttt 1983252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21688428 - 21688250
Alignment:
Q  196 acaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 295  Q
    ||||||||| | |||| || |||||||||| || ||||||||| ||| | |||| | |||  ||||||||| || |||||| |||||||| |  ||| ||    
T  21688428 acaccaagaaattgttgactcaattcggtctaa-cttgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagttctt-ccgaagaga 21688331  T
Q  296 tacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcacc 373  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| ||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  21688330 tacaaatgagttacaaaaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcacc 21688250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 370
Target Start/End: Original strand, 44967910 - 44967992
Alignment:
Q  289 aaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 370  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||| || | | || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44967910 aaagagatacaaatggttacaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttctaccattttcccaatctc 44967992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3913566 - 3913451
Alignment:
Q  258 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||  ||||| |||||||||||||  ||||  |||||| |||| | | |||||||||||    
T  3913566 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagatatacaaatgggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-agctctaatttctac 3913469  T
Q  356 -ccttttcccaatctcac 372  Q
     | |||||||||||||||    
T  3913468 tcattttcccaatctcac 3913451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5349980 - 5349929
Alignment:
Q  306 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 357  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5349980 tacaaggaattagcttcgacaagttcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 5349929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089933
Alignment:
Q  234 acctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt 321  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||   | || ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagctt 33089933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 375
Target Start/End: Original strand, 55085445 - 55085532
Alignment:
Q  289 aaagggatacaaaaggtt-acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  55085445 aaagagatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccttaatttctacctattttccaatctcaccaa 55085532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 461
Target Start/End: Original strand, 2410 - 2857
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  2410 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 2509  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||    
T  2510 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaaaagattgttca 2609  T
Q  214 cccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2610 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 2709  T
Q  312 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2710 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 2807  T
Q  412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2808 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 2857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 6637 - 6186
Alignment:
Q  20 atcgaaccacgccaatacaa-gaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || |||||| |||||    
T  6637 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatatgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaatacacc 6538  T
Q  116 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaa---ggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgtt 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||| |||||| || |    
T  6537 acctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaacaaggagagggaagaagaaaacaataacacaaagagattggt 6438  T
Q  212 cacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttaca 309  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  | |||||    
T  6437 cacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagggcttaca 6338  T
Q  310 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6337 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 6240  T
Q  410 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6239 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 6186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 38 - 461
Target Start/End: Original strand, 3551 - 3979
Alignment:
Q  38 aagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctagga 134  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3551 aagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctagga 3650  T
Q  135 aacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaactt 232  Q
    |||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  3651 aacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaactt 3750  T
Q  233 gacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttc 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3751 gacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttc 3850  T
Q  331 acaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 430  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3851 actatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaga 3948  T
Q  431 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Original strand, 10998 - 11435
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||   | | ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10998 atgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatga-ctaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 11096  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11097 aaaaacacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 11195  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||     
T  11196 ggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaac- 11294  T
Q  341 aaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagat 431  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||  | ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||     
T  11295 aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 11394  T
Q  432 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11395 gctctaatcaaag-accataaaccctagagttactccctttg 11435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 90 - 473
Target Start/End: Original strand, 8616 - 9009
Alignment:
Q  90 gtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaaga 187  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8616 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaagaagagggaagagga 8715  T
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8716 aaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttac 8814  T
Q  288 aaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caaga 377  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||    
T  8815 aaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttataagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaaga 8913  T
Q  378 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    ||||||||| ||  | ||   |||||| ||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8914 cactcaatggtttacactcaccaaggtctttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaagcctagagttactccctttg 9009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 434863 - 434428
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |   ||||| | | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  434863 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccattatt-aaagtgttttcaatcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 434765  T
Q  143 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactct 242  Q
    | || ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||   ||||||| ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  434764 aaaagcacaaaacacaagcacaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-atattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct 434667  T
Q  243 ggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaaca 340  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  434666 ggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac- 434569  T
Q  341 aaccctaatttctaccctttt--cccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagaga 430  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  434568 aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtatttaccatgttttccaacccaagaga 434469  T
Q  431 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  434468 -actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttg 434428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11895 - 11557
Alignment:
Q  45 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtatgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagat-ctaatctaggaa-acaa-g 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  11895 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatactaatctaggaatacaaag 11797  T
Q  141 tg--agaaacacaata---cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgac 235  Q
    ||  | ||| ||||||   ||||| |||||||||||||| ||| |||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11796 tggaaaaaaaacaataaaacacaagcacaagataaaagg-gagagaagagataaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgac 11698  T
Q  236 ctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcaca 333  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11697 ctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcaca 11599  T
Q  334 atgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11598 aagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22286 - 22239
Alignment:
Q  425 aagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22286 aagagaaactctaatcaaaga-ccctaaaccctagagttgctccctttg 22239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 91 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1200 - 812
Alignment:
Q  91 tgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaaga-aga 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||  ||||| || |  ||||||||||||  |||| |||    
T  1200 tgcaagcaataatcaacaataacaccacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaagtataaaaggagag--aagagaga 1103  T
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||      
T  1102 aacaaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt-- 1006  T
Q  288 aaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac------caaga 377  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||      |||||    
T  1005 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaaga 907  T
Q  378 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 473  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  906 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgctgcctttg 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 208 - 1
Alignment:
Q  38 aagaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtat---gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctagga 134  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208 aagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctagga 109  T
Q  135 aacaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaactt 232  Q
    |||||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  108 aacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaactt 9  T
Q  233 gacctact 240  Q
    ||||||||    
T  8 gacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 114881 - 114602
Alignment:
Q  97 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 193  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||| |||  | |||||||||||||||  ||||   ||||||    
T  114881 caataatcaacaataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaacaacaagaaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaa 114784  T
Q  194 agacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 293  Q
      ||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  114783 gcacaccaa-agattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 114686  T
Q  294 gatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  114685 gatacaaaagcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 114602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 102513 - 102450
Alignment:
Q  294 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  102513 gatacaaagaggttacaagaaattatcttaa-aagctcacaaaaaacaaaccctaatttctaccc 102450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Original strand, 20301 - 20583
Alignment:
Q  93 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 189  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  20301 caagcaataattaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa- 20399  T
Q  190 acaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 289  Q
     |||| ||||||| | | |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20400 -caaacacaccaaaa-attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttac-a 20495  T
Q  290 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 375  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  20496 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaa-cctaatttctgctcattttcccaatctcaccaa 20583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18171
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  18004 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttac-aaagagatacaaatgagtt 18101  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  18102 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaa 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7327
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 7397  T
Q  307 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 375  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7396 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaa 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10515
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 306  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaaatggtt 10559  T
Q  307 acaagaaattagcttgaca--agttcacaatgaacaaaccctaattt 351  Q
    |||| ||||||||   |||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  10558 acaataaattagc---acaagagctcacaaagaacaaaccctaattt 10515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 149079 - 149262
Alignment:
Q  188 aaacaaagacaccaagagagtgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  149079 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 149176  T
Q  288 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 372  Q
     |||| |||| |||  ||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  149177 -aaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcac 149262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 371
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80447
Alignment:
Q  263 caatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-tt 359  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatt 80435  T
Q  360 ttcccaatctca 371  Q
    ||||||||||||    
T  80436 ttcccaatctca 80447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 321
Target Start/End: Original strand, 27442 - 27556
Alignment:
Q  208 tgttcacccaattcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 306  Q
    |||| ||| ||||||||||||   ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||  |||| ||   |||| |||||||| | |||    
T  27442 tgtttacctaattcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatgagtt 27541  T
Q  307 acaagaaattagctt 321  Q
    |||||||||||||||    
T  27542 acaagaaattagctt 27556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University