View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1134_low_2 (Length: 583)

Name: NF1134_low_2
Description: NF1134
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1134_low_2
NF1134_low_2
[»] chr7 (146 HSPs)
chr7 (3-583)||(18164418-18164999)
chr7 (3-583)||(9510757-9511337)
chr7 (3-583)||(40523106-40523687)
chr7 (3-553)||(12703184-12703734)
chr7 (3-576)||(49051151-49051724)
chr7 (3-583)||(60421-61003)
chr7 (3-583)||(14337150-14337731)
chr7 (3-583)||(14330566-14331147)
chr7 (3-583)||(18175884-18176465)
chr7 (3-583)||(18182556-18183137)
chr7 (3-570)||(11365976-11366548)
chr7 (3-583)||(14655161-14655743)
chr7 (3-583)||(44786219-44786801)
chr7 (3-583)||(44792860-44793442)
chr7 (3-581)||(15162567-15163147)
chr7 (3-583)||(16407039-16407621)
chr7 (3-583)||(15155914-15156496)
chr7 (3-582)||(13684241-13684822)
chr7 (3-583)||(20702736-20703316)
chr7 (3-582)||(13690872-13691437)
chr7 (3-583)||(32767455-32768035)
chr7 (3-556)||(13569656-13570227)
chr7 (1-234)||(20205-20439)
chr7 (3-571)||(1347273-1347856)
chr7 (3-189)||(15021887-15022073)
chr7 (3-234)||(9409709-9409942)
chr7 (1-225)||(11232402-11232626)
chr7 (3-189)||(21440-21626)
chr7 (3-189)||(8202236-8202422)
chr7 (1-225)||(11239089-11239313)
chr7 (3-234)||(6017283-6017517)
chr7 (4-234)||(18531010-18531241)
chr7 (3-232)||(7535947-7536177)
chr7 (1-232)||(4318655-4318887)
chr7 (1-232)||(14958932-14959158)
chr7 (1-232)||(11262097-11262323)
chr7 (1-232)||(12692264-12692490)
chr7 (1-232)||(26419768-26419994)
chr7 (1-232)||(11548377-11548604)
chr7 (1-232)||(11554973-11555200)
chr7 (3-189)||(8705762-8705949)
chr7 (22-234)||(32658-32874)
chr7 (22-234)||(12705000-12705216)
chr7 (3-189)||(18553684-18553871)
chr7 (3-189)||(23520115-23520302)
chr7 (22-234)||(71108-71324)
chr7 (22-234)||(75217-75433)
chr7 (22-234)||(12718217-12718433)
chr7 (22-234)||(16113790-16114006)
chr7 (22-234)||(16116943-16117159)
chr7 (405-583)||(21865-22043)
chr7 (405-583)||(8201819-8201997)
chr7 (22-234)||(12723128-12723344)
chr7 (22-234)||(18282915-18283131)
chr7 (22-234)||(18278952-18279168)
chr7 (405-583)||(15022312-15022491)
chr7 (22-220)||(15083720-15083912)
chr7 (22-220)||(18556780-18556973)
chr7 (3-140)||(8712433-8712571)
chr7 (22-220)||(13148964-13149155)
chr7 (22-165)||(1859245-1859381)
chr7 (22-198)||(15728133-15728302)
chr7 (22-220)||(39721790-39721982)
chr7 (22-165)||(45170451-45170588)
chr7 (22-149)||(14216733-14216854)
chr7 (1-94)||(14952993-14953086)
chr7 (22-122)||(18425209-18425307)
chr7 (22-122)||(26291921-26292019)
chr7 (1-94)||(44408554-44408647)
chr7 (22-165)||(8917236-8917372)
chr7 (22-117)||(12714437-12714530)
chr7 (3-117)||(10869232-10869347)
chr7 (3-117)||(10875312-10875427)
chr7 (22-117)||(7519531-7519622)
chr7 (1-86)||(15380586-15380671)
chr7 (380-561)||(23519721-23519902)
chr7 (22-220)||(25927607-25927798)
chr7 (22-149)||(16724806-16724927)
chr7 (22-149)||(17701820-17701941)
chr7 (3-117)||(18585497-18585612)
chr7 (22-198)||(13461569-13461738)
chr7 (25-120)||(2530616-2530708)
chr7 (378-561)||(10875684-10875866)
chr7 (22-93)||(13918981-13919052)
chr7 (397-556)||(18531419-18531578)
chr7 (22-220)||(9593156-9593345)
chr7 (22-220)||(16457463-16457652)
chr7 (405-582)||(18585046-18585223)
chr7 (22-117)||(16907675-16907768)
chr7 (412-583)||(4318290-4318461)
chr7 (22-93)||(16275324-16275395)
chr7 (26-220)||(6801026-6801211)
chr7 (22-146)||(14932954-14933071)
chr7 (22-146)||(15356389-15356506)
chr7 (22-146)||(15360503-15360620)
chr7 (405-582)||(18553278-18553455)
chr7 (96-232)||(14953061-14953192)
chr7 (22-90)||(35151449-35151517)
chr7 (96-232)||(44408448-44408579)
chr7 (378-561)||(10869604-10869786)
chr7 (406-582)||(8706179-8706355)
chr7 (406-582)||(8719595-8719771)
chr7 (412-556)||(11262518-11262662)
chr7 (412-556)||(12692685-12692829)
chr7 (412-556)||(14953387-14953531)
chr7 (72-234)||(26291996-26292162)
chr7 (412-494)||(26420189-26420271)
chr7 (99-234)||(16907576-16907718)
chr7 (412-556)||(14959353-14959497)
chr7 (3-63)||(20871301-20871361)
chr7 (412-556)||(25038982-25039126)
chr7 (99-189)||(10869301-10869392)
chr7 (99-189)||(10875381-10875472)
chr7 (412-583)||(14148759-14148930)
chr7 (99-189)||(18585452-18585543)
chr7 (12-148)||(2832636-2832763)
chr7 (72-233)||(18425284-18425448)
chr7 (412-494)||(44408171-44408253)
chr7 (26-189)||(16583070-16583224)
chr7 (22-94)||(20578-20649)
chr7 (402-582)||(9410124-9410304)
chr7 (99-234)||(12714487-12714629)
chr7 (22-91)||(12317935-12318006)
chr7 (510-583)||(33395-33468)
chr7 (12-189)||(14152140-14152310)
chr7 (510-574)||(70519-70583)
chr7 (510-574)||(74628-74692)
chr7 (412-556)||(11554635-11554778)
chr7 (519-583)||(12704403-12704467)
chr7 (424-571)||(11232041-11232187)
chr7 (424-571)||(11238728-11238874)
chr7 (536-583)||(12703132-12703179)
chr7 (22-91)||(9751984-9752055)
chr7 (405-556)||(6016943-6017094)
chr7 (416-556)||(11548039-11548178)
chr7 (39-91)||(13635696-13635747)
chr7 (22-91)||(15605497-15605569)
chr7 (99-220)||(2530496-2530614)
chr7 (240-307)||(4318566-4318633)
chr7 (405-490)||(19936-20021)
chr7 (136-189)||(8719312-8719365)
chr7 (99-220)||(13918884-13919002)
chr7 (194-232)||(14148524-14148562)
chr7 (68-117)||(26292016-26292063)
chr7 (99-144)||(8712502-8712547)
chr7 (240-307)||(14148584-14148654)
[»] chr2 (100 HSPs)
chr2 (3-583)||(22320731-22321312)
chr2 (3-583)||(22326884-22327465)
chr2 (3-583)||(26877313-26877893)
chr2 (3-583)||(27617077-27617657)
chr2 (3-583)||(24913709-24914292)
chr2 (3-583)||(29233309-29233890)
chr2 (3-583)||(29346608-29347189)
chr2 (3-571)||(27599043-27599613)
chr2 (3-571)||(23170817-23171387)
chr2 (3-571)||(23582074-23582644)
chr2 (3-571)||(1842862-1843432)
chr2 (3-583)||(16928135-16928717)
chr2 (3-583)||(16996829-16997411)
chr2 (3-583)||(17003462-17004044)
chr2 (3-583)||(10873317-10873900)
chr2 (3-583)||(12828851-12829431)
chr2 (3-583)||(37318040-37318636)
chr2 (116-583)||(10866263-10866733)
chr2 (3-583)||(41610373-41610971)
chr2 (3-494)||(24714476-24714984)
chr2 (6-583)||(41604476-41605071)
chr2 (3-583)||(13970114-13970711)
chr2 (3-494)||(45057259-45057767)
chr2 (3-189)||(9340041-9340227)
chr2 (3-189)||(9488675-9488861)
chr2 (3-189)||(9607936-9608122)
chr2 (3-189)||(16922290-16922476)
chr2 (3-189)||(19490086-19490272)
chr2 (3-189)||(27215824-27216010)
chr2 (3-189)||(28432074-28432260)
chr2 (3-189)||(13306751-13306937)
chr2 (3-189)||(16985702-16985888)
chr2 (3-213)||(10865952-10866162)
chr2 (3-234)||(30971091-30971325)
chr2 (1-232)||(11677209-11677441)
chr2 (3-232)||(21147404-21147631)
chr2 (1-232)||(24641075-24641307)
chr2 (3-232)||(24502881-24503105)
chr2 (3-189)||(27369069-27369256)
chr2 (3-189)||(44381353-44381540)
chr2 (405-583)||(27216249-27216427)
chr2 (22-234)||(10101994-10102210)
chr2 (22-234)||(12901857-12902073)
chr2 (22-234)||(24628820-24629036)
chr2 (22-234)||(24648904-24649120)
chr2 (22-234)||(27601341-27601557)
chr2 (380-582)||(19489670-19489872)
chr2 (22-234)||(27379773-27379989)
chr2 (22-234)||(27383819-27384035)
chr2 (3-189)||(27375579-27375766)
chr2 (405-583)||(13306334-13306512)
chr2 (405-583)||(16922715-16922893)
chr2 (405-583)||(16986127-16986305)
chr2 (405-583)||(28431657-28431835)
chr2 (3-189)||(44388023-44388210)
chr2 (405-583)||(9340466-9340644)
chr2 (405-583)||(9489100-9489278)
chr2 (405-583)||(9608361-9608539)
chr2 (22-220)||(19928607-19928798)
chr2 (22-220)||(30345381-30345573)
chr2 (22-220)||(18855564-18855755)
chr2 (94-234)||(24872519-24872660)
chr2 (94-234)||(24880404-24880545)
chr2 (23-165)||(41666759-41666895)
chr2 (22-220)||(60626-60817)
chr2 (22-165)||(31344686-31344823)
chr2 (22-198)||(23186885-23187053)
chr2 (22-198)||(23598148-23598316)
chr2 (3-117)||(24872609-24872725)
chr2 (3-117)||(24880494-24880610)
chr2 (22-122)||(26124993-26125090)
chr2 (1-93)||(27195513-27195605)
chr2 (22-93)||(1282937-1283008)
chr2 (22-93)||(41531491-41531562)
chr2 (378-561)||(44380960-44381142)
chr2 (378-561)||(44387630-44387812)
chr2 (412-556)||(21147061-21147205)
chr2 (22-220)||(22461295-22461484)
chr2 (412-558)||(24640730-24640876)
chr2 (412-556)||(21139043-21139187)
chr2 (412-575)||(27197075-27197238)
chr2 (378-582)||(27369458-27369662)
chr2 (378-582)||(27375968-27376172)
chr2 (412-494)||(24503300-24503382)
chr2 (96-165)||(27195581-27195650)
chr2 (3-57)||(30657567-30657621)
chr2 (22-189)||(24735202-24735362)
chr2 (510-583)||(10101390-10101463)
chr2 (405-556)||(30970751-30970902)
chr2 (449-556)||(19645749-19645856)
chr2 (449-556)||(24880064-24880171)
chr2 (99-165)||(1282987-1283050)
chr2 (519-556)||(24872179-24872216)
chr2 (99-165)||(41531449-41531512)
chr2 (240-307)||(24640983-24641053)
chr2 (405-494)||(24872241-24872330)
chr2 (22-67)||(22134501-22134546)
chr2 (22-50)||(19691914-19691942)
chr2 (519-583)||(24715009-24715073)
chr2 (519-583)||(45057170-45057234)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (3-583)||(17669315-17669896)
chr8 (3-583)||(17675967-17676548)
chr8 (3-583)||(21915315-21915895)
chr8 (3-583)||(5534184-5534765)
chr8 (3-583)||(22083610-22084192)
chr8 (3-583)||(20019685-20020266)
chr8 (3-583)||(20013609-20014189)
chr8 (3-583)||(8354508-8355092)
chr8 (3-583)||(19111006-19111587)
chr8 (3-583)||(19117297-19117878)
chr8 (3-583)||(19496168-19496751)
chr8 (1-583)||(22123130-22123714)
chr8 (3-583)||(22115465-22116048)
chr8 (3-583)||(22047724-22048307)
chr8 (3-560)||(22124296-22124856)
chr8 (3-583)||(18865109-18865692)
chr8 (3-583)||(16882917-16883498)
chr8 (3-583)||(29122866-29123446)
chr8 (3-444)||(19498216-19498660)
chr8 (99-583)||(18854810-18855297)
chr8 (3-494)||(23845595-23846104)
chr8 (3-494)||(20023762-20024270)
chr8 (3-189)||(28454529-28454715)
chr8 (1-232)||(19905258-19905490)
chr8 (3-234)||(26935288-26935522)
chr8 (3-556)||(3216025-3216595)
chr8 (1-232)||(20527218-20527444)
chr8 (22-234)||(22111480-22111696)
chr8 (22-234)||(43251360-43251576)
chr8 (405-583)||(28454942-28455120)
chr8 (22-234)||(21972922-21973138)
chr8 (22-234)||(21977013-21977229)
chr8 (22-220)||(15531698-15531890)
chr8 (3-189)||(18065097-18065285)
chr8 (22-220)||(24445611-24445803)
chr8 (22-220)||(23847120-23847311)
chr8 (22-220)||(15538257-15538449)
chr8 (22-165)||(21410474-21410611)
chr8 (22-165)||(21804966-21805103)
chr8 (22-165)||(18863090-18863227)
chr8 (22-165)||(21828459-21828596)
chr8 (22-165)||(30940522-30940659)
chr8 (3-117)||(18854741-18854855)
chr8 (22-220)||(17828687-17828879)
chr8 (22-149)||(32598487-32598608)
chr8 (22-149)||(32605019-32605140)
chr8 (25-165)||(17055539-17055673)
chr8 (22-165)||(30308913-30309049)
chr8 (22-220)||(22044694-22044884)
chr8 (22-220)||(16231581-16231770)
chr8 (22-198)||(14398236-14398405)
chr8 (22-198)||(21386882-21387051)
chr8 (1-80)||(20705896-20705975)
chr8 (22-220)||(23833983-23834172)
chr8 (22-93)||(15440394-15440465)
chr8 (412-556)||(20527639-20527783)
chr8 (378-582)||(18065487-18065691)
chr8 (21-93)||(19278748-19278822)
chr8 (101-234)||(19278628-19278767)
chr8 (412-575)||(19905687-19905849)
chr8 (405-556)||(26934948-26935099)
chr8 (240-307)||(19905512-19905582)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (5-583)||(9561-10140)
[»] chr5 (124 HSPs)
chr5 (3-583)||(27663534-27664115)
chr5 (3-583)||(41097967-41098548)
chr5 (3-583)||(27670174-27670754)
chr5 (3-583)||(41769022-41769603)
chr5 (3-583)||(41775596-41776177)
chr5 (3-583)||(22264724-22265306)
chr5 (3-583)||(17706675-17707255)
chr5 (3-583)||(34294297-34294878)
chr5 (3-583)||(24471992-24472572)
chr5 (3-583)||(27608519-27609100)
chr5 (3-583)||(27615125-27615706)
chr5 (3-583)||(23583918-23584501)
chr5 (3-583)||(22062626-22063208)
chr5 (99-583)||(23609778-23610263)
chr5 (99-583)||(23841174-23841659)
chr5 (1-583)||(37286525-37287109)
chr5 (1-583)||(37293228-37293812)
chr5 (1-571)||(19991661-19992232)
chr5 (3-583)||(41294179-41294760)
chr5 (3-583)||(15001423-15002006)
chr5 (3-571)||(22327920-22328489)
chr5 (3-583)||(40706901-40707482)
chr5 (3-583)||(40713543-40714124)
chr5 (3-560)||(37543819-37544379)
chr5 (3-583)||(14994780-14995363)
chr5 (3-583)||(33725637-33726220)
chr5 (3-582)||(18038413-18038994)
chr5 (3-583)||(27516531-27517112)
chr5 (3-583)||(27523168-27523749)
chr5 (3-583)||(1692181-1692763)
chr5 (3-583)||(27687073-27687655)
chr5 (3-583)||(23249718-23250301)
chr5 (3-583)||(22132777-22133359)
chr5 (3-583)||(22139469-22140051)
chr5 (1-454)||(22341476-22341930)
chr5 (3-583)||(25406204-25406786)
chr5 (3-583)||(22587875-22588455)
chr5 (3-574)||(29477708-29478280)
chr5 (3-583)||(17283847-17284427)
chr5 (3-307)||(29471379-29471685)
chr5 (3-492)||(24020048-24020552)
chr5 (3-494)||(19768112-19768620)
chr5 (3-494)||(19774708-19775216)
chr5 (3-189)||(16354603-16354789)
chr5 (3-189)||(16361262-16361448)
chr5 (3-189)||(34564596-34564782)
chr5 (3-189)||(34571251-34571437)
chr5 (3-189)||(25106542-25106728)
chr5 (3-189)||(25165635-25165821)
chr5 (3-234)||(22343259-22343493)
chr5 (3-234)||(22352659-22352893)
chr5 (3-234)||(22326038-22326271)
chr5 (3-189)||(22410751-22410937)
chr5 (1-494)||(15441788-15442300)
chr5 (1-232)||(14359931-14360163)
chr5 (1-232)||(21295374-21295600)
chr5 (1-232)||(25534757-25534983)
chr5 (1-232)||(24554300-24554529)
chr5 (5-189)||(20775648-20775833)
chr5 (1-232)||(23337402-23337634)
chr5 (3-189)||(21667958-21668145)
chr5 (22-234)||(15237176-15237392)
chr5 (22-234)||(19473059-19473275)
chr5 (3-189)||(22258633-22258820)
chr5 (3-189)||(29316185-29316372)
chr5 (22-234)||(20295396-20295612)
chr5 (405-583)||(25106967-25107145)
chr5 (405-583)||(25166060-25166238)
chr5 (405-583)||(16355028-16355206)
chr5 (405-583)||(16361687-16361865)
chr5 (405-583)||(34565021-34565199)
chr5 (405-583)||(34571676-34571854)
chr5 (22-233)||(10752739-10752954)
chr5 (22-220)||(40723977-40724173)
chr5 (22-220)||(33409037-33409229)
chr5 (3-104)||(27680912-27681013)
chr5 (22-220)||(11230670-11230862)
chr5 (22-149)||(11220272-11220393)
chr5 (22-202)||(17730531-17730704)
chr5 (22-149)||(11224858-11224979)
chr5 (22-149)||(11226691-11226812)
chr5 (22-149)||(11228681-11228802)
chr5 (12-165)||(21885349-21885495)
chr5 (412-574)||(29471113-29471275)
chr5 (22-220)||(16673962-16674153)
chr5 (22-220)||(21340872-21341063)
chr5 (22-198)||(25229534-25229703)
chr5 (22-198)||(25293690-25293859)
chr5 (22-165)||(4036027-4036164)
chr5 (22-122)||(20911394-20911491)
chr5 (3-93)||(23609709-23609799)
chr5 (3-93)||(23841105-23841195)
chr5 (12-149)||(26172264-26172394)
chr5 (22-220)||(18355766-18355958)
chr5 (411-561)||(20776077-20776227)
chr5 (22-220)||(26742852-26743041)
chr5 (22-220)||(42805231-42805420)
chr5 (450-571)||(22334574-22334695)
chr5 (378-582)||(21667552-21667756)
chr5 (405-561)||(22258240-22258395)
chr5 (405-561)||(22410365-22410521)
chr5 (378-582)||(29316574-29316778)
chr5 (22-220)||(18774014-18774203)
chr5 (22-220)||(18783857-18784046)
chr5 (22-220)||(20232362-20232551)
chr5 (412-556)||(21295035-21295179)
chr5 (412-556)||(25535178-25535322)
chr5 (22-220)||(26666236-26666425)
chr5 (22-220)||(26937833-26938022)
chr5 (412-582)||(23337034-23337204)
chr5 (412-583)||(14359564-14359735)
chr5 (22-165)||(24533208-24533342)
chr5 (412-494)||(24554724-24554805)
chr5 (22-94)||(24767786-24767857)
chr5 (22-91)||(23535791-23535859)
chr5 (405-556)||(22325698-22325849)
chr5 (510-583)||(15236525-15236598)
chr5 (449-556)||(25808258-25808365)
chr5 (405-554)||(22343680-22343829)
chr5 (99-220)||(20911275-20911393)
chr5 (22-52)||(17410279-17410309)
chr5 (405-494)||(22353080-22353169)
chr5 (519-583)||(19768645-19768709)
chr5 (519-583)||(19775241-19775305)
[»] chr4 (125 HSPs)
chr4 (3-583)||(19780035-19780615)
chr4 (3-583)||(23953927-23954508)
chr4 (3-583)||(23960589-23961170)
chr4 (3-583)||(15361911-15362493)
chr4 (3-583)||(22194398-22194980)
chr4 (3-583)||(36884480-36885062)
chr4 (3-583)||(4771876-4772457)
chr4 (3-583)||(16231587-16232169)
chr4 (3-583)||(8048241-8048822)
chr4 (3-583)||(8054854-8055435)
chr4 (3-578)||(15148236-15148811)
chr4 (3-583)||(15383239-15383819)
chr4 (3-583)||(12474798-12475380)
chr4 (3-583)||(18024173-18024755)
chr4 (1-571)||(14298585-14299157)
chr4 (3-583)||(12481428-12482010)
chr4 (3-583)||(14268203-14268781)
chr4 (3-583)||(18070947-18071529)
chr4 (3-583)||(18295404-18295986)
chr4 (3-583)||(6873121-6873704)
chr4 (99-571)||(14305209-14305683)
chr4 (3-583)||(40477928-40478508)
chr4 (3-583)||(51493563-51494143)
chr4 (3-583)||(26284653-26285235)
chr4 (89-583)||(20115007-20115503)
chr4 (3-531)||(386129-386657)
chr4 (1-583)||(15321839-15322436)
chr4 (1-583)||(7900916-7901514)
chr4 (3-494)||(23081352-23081860)
chr4 (3-583)||(16956395-16956993)
chr4 (3-234)||(27709509-27709740)
chr4 (3-234)||(9272267-9272498)
chr4 (3-494)||(19941988-19942496)
chr4 (3-189)||(8384592-8384778)
chr4 (3-189)||(14073588-14073774)
chr4 (3-189)||(15256366-15256552)
chr4 (3-189)||(17090140-17090326)
chr4 (3-189)||(29041061-29041247)
chr4 (3-189)||(8391247-8391433)
chr4 (3-189)||(17808171-17808357)
chr4 (3-203)||(40453699-40453899)
chr4 (3-234)||(53433137-53433371)
chr4 (197-583)||(40471449-40471835)
chr4 (1-232)||(12521844-12522076)
chr4 (22-234)||(14757763-14757984)
chr4 (378-583)||(17962070-17962275)
chr4 (22-234)||(4561675-4561882)
chr4 (22-234)||(5757280-5757487)
chr4 (1-232)||(23838202-23838428)
chr4 (1-232)||(41385856-41386082)
chr4 (1-232)||(14678732-14678957)
chr4 (1-189)||(55795214-55795403)
chr4 (3-189)||(12349726-12349913)
chr4 (22-234)||(9556079-9556295)
chr4 (22-234)||(17809823-17810039)
chr4 (22-234)||(33741929-33742145)
chr4 (3-189)||(12300050-12300237)
chr4 (1-232)||(14684940-14685165)
chr4 (405-583)||(17089723-17089901)
chr4 (3-189)||(17962486-17962673)
chr4 (405-583)||(8385017-8385195)
chr4 (405-583)||(8391672-8391850)
chr4 (405-583)||(14074013-14074191)
chr4 (405-583)||(15256791-15256969)
chr4 (405-583)||(17808596-17808774)
chr4 (405-583)||(29040644-29040822)
chr4 (22-233)||(15224591-15224805)
chr4 (22-220)||(12487234-12487427)
chr4 (22-198)||(14708762-14708932)
chr4 (22-220)||(45937958-45938149)
chr4 (22-220)||(2014588-2014779)
chr4 (22-165)||(14954612-14954749)
chr4 (23-220)||(19757706-19757896)
chr4 (23-220)||(19781910-19782100)
chr4 (22-220)||(26243770-26243961)
chr4 (1-93)||(14305662-14305754)
chr4 (22-198)||(18602859-18603028)
chr4 (1-93)||(35170416-35170508)
chr4 (22-198)||(42997578-42997748)
chr4 (22-220)||(9530244-9530435)
chr4 (22-121)||(23139081-23139177)
chr4 (96-232)||(35170484-35170621)
chr4 (1-93)||(35613728-35613820)
chr4 (21-220)||(16243505-16243697)
chr4 (22-198)||(3412607-3412776)
chr4 (22-198)||(18609431-18609600)
chr4 (22-219)||(18236701-18236891)
chr4 (96-221)||(35613796-35613921)
chr4 (424-583)||(9271849-9272008)
chr4 (22-93)||(25689418-25689489)
chr4 (22-165)||(18222539-18222673)
chr4 (24-120)||(27533528-27533621)
chr4 (12-93)||(28569646-28569726)
chr4 (24-220)||(1951867-1952054)
chr4 (378-582)||(12349320-12349524)
chr4 (22-93)||(10712404-10712475)
chr4 (22-93)||(10926174-10926245)
chr4 (378-561)||(12299665-12299848)
chr4 (125-234)||(20682038-20682147)
chr4 (412-556)||(23838623-23838767)
chr4 (22-198)||(18228982-18229148)
chr4 (411-582)||(55795647-55795817)
chr4 (412-558)||(35614129-35614275)
chr4 (240-583)||(30234923-30235267)
chr4 (430-583)||(35170836-35170989)
chr4 (412-556)||(14679152-14679296)
chr4 (22-198)||(17152615-17152781)
chr4 (412-494)||(12522274-12522356)
chr4 (412-494)||(14685360-14685442)
chr4 (412-556)||(41385517-41385661)
chr4 (510-583)||(17810560-17810633)
chr4 (1-50)||(21339968-21340017)
chr4 (3-52)||(30235277-30235326)
chr4 (22-90)||(36134176-36134246)
chr4 (22-91)||(20157680-20157751)
chr4 (510-583)||(14757167-14757240)
chr4 (22-91)||(22634626-22634697)
chr4 (74-220)||(27533602-27533742)
chr4 (405-556)||(53433560-53433711)
chr4 (241-307)||(27709764-27709830)
chr4 (3-41)||(13020537-13020575)
chr4 (99-165)||(10712454-10712517)
chr4 (99-165)||(10926224-10926287)
chr4 (99-165)||(25689468-25689531)
chr4 (241-307)||(9272125-9272191)
[»] chr3 (191 HSPs)
chr3 (3-583)||(37615173-37615753)
chr3 (5-583)||(26794139-26794718)
chr3 (3-583)||(31422297-31422878)
chr3 (3-583)||(5106628-5107209)
chr3 (3-583)||(6598499-6599080)
chr3 (3-583)||(6605179-6605760)
chr3 (3-583)||(10153479-10154060)
chr3 (3-583)||(16758315-16758896)
chr3 (3-582)||(53380097-53380676)
chr3 (3-582)||(53386749-53387328)
chr3 (3-583)||(26889236-26889817)
chr3 (3-583)||(16747583-16748164)
chr3 (3-583)||(16623799-16624380)
chr3 (3-583)||(10846028-10846609)
chr3 (99-583)||(26788549-26789034)
chr3 (3-583)||(417780-418362)
chr3 (3-583)||(14672944-14673526)
chr3 (1-583)||(5221183-5221766)
chr3 (3-583)||(20057147-20057730)
chr3 (3-583)||(20063785-20064368)
chr3 (3-583)||(13250499-13251081)
chr3 (3-583)||(13257145-13257727)
chr3 (3-583)||(10003416-10003999)
chr3 (3-583)||(10010063-10010646)
chr3 (3-583)||(10910678-10911261)
chr3 (3-583)||(10904006-10904589)
chr3 (3-583)||(3690399-3690981)
chr3 (3-583)||(16489414-16489990)
chr3 (3-583)||(15726676-15727256)
chr3 (34-583)||(15692022-15692571)
chr3 (3-307)||(23704787-23705092)
chr3 (3-307)||(23723243-23723548)
chr3 (3-307)||(23741699-23742004)
chr3 (3-307)||(41201817-41202122)
chr3 (3-582)||(15991849-15992442)
chr3 (3-583)||(17710336-17710932)
chr3 (3-583)||(10236138-10236733)
chr3 (3-583)||(15825430-15826025)
chr3 (1-583)||(5149712-5150309)
chr3 (3-572)||(13315943-13316525)
chr3 (5-583)||(4710067-4710660)
chr3 (7-307)||(19808796-19809111)
chr3 (3-583)||(410495-411092)
chr3 (3-583)||(1145296-1145893)
chr3 (3-490)||(15404330-15404836)
chr3 (3-494)||(8720989-8721497)
chr3 (3-494)||(9072876-9073384)
chr3 (3-307)||(15343625-15343946)
chr3 (3-307)||(15350269-15350590)
chr3 (99-531)||(22643113-22643560)
chr3 (3-234)||(15367040-15367271)
chr3 (1-583)||(41092091-41092687)
chr3 (3-189)||(16633610-16633796)
chr3 (3-189)||(16640220-16640406)
chr3 (3-189)||(43160885-43161071)
chr3 (3-189)||(43167122-43167308)
chr3 (3-189)||(1333221-1333407)
chr3 (3-189)||(48423127-48423313)
chr3 (3-234)||(30777335-30777567)
chr3 (3-189)||(48429905-48430091)
chr3 (3-304)||(13320737-13321053)
chr3 (3-234)||(12891166-12891400)
chr3 (3-234)||(17253168-17253402)
chr3 (3-189)||(15584872-15585058)
chr3 (3-189)||(15591530-15591716)
chr3 (1-232)||(7985467-7985699)
chr3 (1-186)||(6608238-6608424)
chr3 (1-232)||(10325613-10325844)
chr3 (2-232)||(16332934-16333165)
chr3 (1-232)||(55148747-55148973)
chr3 (1-232)||(24187546-24187772)
chr3 (2-232)||(20722771-20722996)
chr3 (3-189)||(5200994-5201181)
chr3 (3-189)||(5426864-5427051)
chr3 (3-189)||(12482196-12482383)
chr3 (22-234)||(7109248-7109464)
chr3 (22-234)||(7113183-7113399)
chr3 (22-234)||(27409985-27410201)
chr3 (22-234)||(55022417-55022633)
chr3 (12-234)||(30065490-30065716)
chr3 (22-234)||(4107740-4107956)
chr3 (22-234)||(4111592-4111808)
chr3 (22-234)||(11069620-11069836)
chr3 (22-234)||(11165870-11166086)
chr3 (1-232)||(839015-839242)
chr3 (3-189)||(5420457-5420644)
chr3 (22-234)||(14498877-14499093)
chr3 (22-234)||(15616926-15617142)
chr3 (22-234)||(22321216-22321432)
chr3 (22-234)||(22336271-22336487)
chr3 (22-234)||(28949274-28949490)
chr3 (405-583)||(16634035-16634213)
chr3 (405-583)||(16640645-16640823)
chr3 (405-583)||(43161310-43161488)
chr3 (405-583)||(43167547-43167725)
chr3 (405-583)||(48423552-48423730)
chr3 (405-583)||(48430330-48430508)
chr3 (22-233)||(16750684-16750898)
chr3 (405-583)||(1332805-1332982)
chr3 (3-117)||(15360482-15360596)
chr3 (99-490)||(15397739-15398149)
chr3 (22-220)||(38814193-38814385)
chr3 (3-117)||(15337224-15337338)
chr3 (412-583)||(41201542-41201713)
chr3 (99-490)||(15360551-15360961)
chr3 (1-114)||(28368673-28368787)
chr3 (1-114)||(28376491-28376605)
chr3 (1-114)||(28384313-28384427)
chr3 (22-220)||(1598584-1598776)
chr3 (22-220)||(3833483-3833675)
chr3 (22-165)||(15964496-15964633)
chr3 (22-165)||(15968420-15968557)
chr3 (22-165)||(15972344-15972481)
chr3 (22-220)||(15942009-15942201)
chr3 (3-117)||(15398104-15398218)
chr3 (413-583)||(23704513-23704683)
chr3 (413-583)||(23722969-23723139)
chr3 (413-583)||(23741425-23741595)
chr3 (22-220)||(5222874-5223065)
chr3 (1-93)||(22643539-22643631)
chr3 (3-93)||(26789013-26789103)
chr3 (22-198)||(16696594-16696763)
chr3 (22-122)||(19775119-19775217)
chr3 (22-120)||(15464651-15464746)
chr3 (99-234)||(15337293-15337428)
chr3 (3-86)||(29695943-29696026)
chr3 (22-198)||(16809009-16809176)
chr3 (22-120)||(12339252-12339347)
chr3 (22-117)||(4589378-4589470)
chr3 (22-93)||(37440123-37440194)
chr3 (22-220)||(17241783-17241972)
chr3 (22-117)||(8489652-8489744)
chr3 (378-582)||(12482585-12482789)
chr3 (378-561)||(5426469-5426652)
chr3 (411-561)||(6608669-6608819)
chr3 (411-561)||(15584486-15584636)
chr3 (411-561)||(15591144-15591294)
chr3 (35-198)||(16798182-16798336)
chr3 (412-556)||(24187967-24188111)
chr3 (412-583)||(839436-839607)
chr3 (378-561)||(5420071-5420254)
chr3 (397-583)||(19809204-19809390)
chr3 (378-582)||(5201380-5201584)
chr3 (111-232)||(28351277-28351398)
chr3 (22-91)||(15482474-15482542)
chr3 (72-220)||(11300871-11301017)
chr3 (412-556)||(55149168-55149312)
chr3 (412-583)||(7985897-7986067)
chr3 (412-558)||(16333363-16333509)
chr3 (72-233)||(19775194-19775358)
chr3 (412-494)||(20723191-20723273)
chr3 (12-94)||(31097779-31097860)
chr3 (99-233)||(4589289-4589420)
chr3 (73-165)||(11854328-11854417)
chr3 (510-583)||(30066237-30066310)
chr3 (510-574)||(11165283-11165347)
chr3 (519-583)||(14499625-14499689)
chr3 (405-556)||(17252828-17252979)
chr3 (68-220)||(12339322-12339467)
chr3 (405-556)||(13321155-13321306)
chr3 (411-490)||(15337623-15337702)
chr3 (68-220)||(15464721-15464866)
chr3 (22-189)||(20461647-20461807)
chr3 (22-91)||(7793586-7793657)
chr3 (412-494)||(28350995-28351077)
chr3 (22-91)||(327401-327472)
chr3 (510-583)||(11070359-11070432)
chr3 (22-91)||(14668359-14668430)
chr3 (3-51)||(4290931-4290979)
chr3 (405-556)||(12891589-12891740)
chr3 (241-494)||(30777057-30777311)
chr3 (241-307)||(15337452-15337518)
chr3 (22-67)||(14665203-14665247)
chr3 (71-121)||(11854266-11854313)
chr3 (22-91)||(2898058-2898130)
chr3 (412-494)||(10326043-10326125)
chr3 (449-583)||(4290999-4291133)
chr3 (22-67)||(14572386-14572431)
chr3 (405-494)||(15343439-15343528)
chr3 (405-494)||(15350082-15350171)
chr3 (99-165)||(37440081-37440144)
chr3 (22-65)||(14577112-14577155)
chr3 (3-38)||(15711579-15711614)
chr3 (241-307)||(15366950-15367016)
chr3 (22-68)||(49668364-49668410)
chr3 (22-67)||(9512707-9512752)
chr3 (22-67)||(9520682-9520727)
chr3 (519-556)||(15397674-15397711)
chr3 (519-556)||(15404265-15404302)
chr3 (22-67)||(16103567-16103612)
chr3 (240-307)||(7985721-7985791)
[»] chr1 (77 HSPs)
chr1 (3-583)||(20215673-20216253)
chr1 (3-583)||(44844627-44845210)
chr1 (3-583)||(51328423-51329005)
chr1 (3-583)||(51335057-51335639)
chr1 (3-583)||(47658993-47659578)
chr1 (3-583)||(16345519-16346101)
chr1 (3-583)||(41348595-41349178)
chr1 (3-583)||(41356032-41356615)
chr1 (3-583)||(16352167-16352750)
chr1 (3-582)||(18599851-18600432)
chr1 (3-583)||(41478321-41478904)
chr1 (3-303)||(21828493-21828793)
chr1 (3-583)||(21806945-21807542)
chr1 (3-583)||(33385968-33386565)
chr1 (3-494)||(21835130-21835638)
chr1 (3-307)||(33392889-33393210)
chr1 (3-189)||(43078198-43078384)
chr1 (3-189)||(46157482-46157668)
chr1 (1-582)||(19104513-19105113)
chr1 (2-232)||(19111171-19111402)
chr1 (3-234)||(50887864-50888098)
chr1 (1-232)||(20525328-20525560)
chr1 (1-234)||(8304903-8305138)
chr1 (1-232)||(23762980-23763206)
chr1 (3-189)||(27898811-27898998)
chr1 (3-189)||(43063428-43063615)
chr1 (3-189)||(44755872-44756059)
chr1 (3-189)||(49334339-49334526)
chr1 (22-234)||(1010272-1010488)
chr1 (22-234)||(52639090-52639306)
chr1 (3-189)||(18626436-18626623)
chr1 (137-303)||(21844140-21844306)
chr1 (3-188)||(33384837-33385023)
chr1 (22-234)||(21406905-21407120)
chr1 (405-583)||(46157065-46157243)
chr1 (22-234)||(16375798-16376015)
chr1 (405-583)||(43078623-43078801)
chr1 (22-220)||(1925519-1925711)
chr1 (22-220)||(20924533-20924725)
chr1 (412-583)||(21828904-21829075)
chr1 (22-122)||(41388478-41388576)
chr1 (424-583)||(21844429-21844588)
chr1 (21-122)||(20229466-20229565)
chr1 (22-220)||(20137893-20138083)
chr1 (22-121)||(39244380-39244476)
chr1 (22-121)||(39247935-39248031)
chr1 (22-120)||(33797068-33797163)
chr1 (22-220)||(19211678-19211867)
chr1 (3-76)||(21844067-21844140)
chr1 (378-582)||(27898405-27898609)
chr1 (378-582)||(43063022-43063226)
chr1 (378-582)||(44756261-44756465)
chr1 (378-582)||(49334728-49334932)
chr1 (405-583)||(19111593-19111771)
chr1 (380-561)||(18626042-18626222)
chr1 (406-583)||(19063704-19063881)
chr1 (412-556)||(23763401-23763545)
chr1 (22-93)||(46975300-46975371)
chr1 (22-220)||(12646681-12646870)
chr1 (412-582)||(20524961-20525131)
chr1 (378-560)||(33394003-33394185)
chr1 (94-233)||(39244237-39244382)
chr1 (94-233)||(39247792-39247937)
chr1 (22-94)||(18882201-18882273)
chr1 (412-556)||(21437984-21438128)
chr1 (72-233)||(41388337-41388501)
chr1 (22-91)||(36819536-36819604)
chr1 (72-225)||(20229333-20229489)
chr1 (128-232)||(21437686-21437789)
chr1 (22-189)||(21312927-21313087)
chr1 (22-91)||(21172811-21172882)
chr1 (510-583)||(1011011-1011084)
chr1 (22-91)||(16080645-16080711)
chr1 (99-220)||(46975350-46975468)
chr1 (405-556)||(8305319-8305470)
chr1 (405-556)||(50887524-50887675)
chr1 (405-583)||(33392612-33392791)
[»] scaffold0044 (6 HSPs)
scaffold0044 (3-583)||(30306-30888)
scaffold0044 (3-583)||(72643-73224)
scaffold0044 (3-583)||(7840-8420)
scaffold0044 (22-165)||(62069-62207)
scaffold0044 (22-189)||(18999-19156)
scaffold0044 (22-189)||(12715-12872)
[»] chr6 (138 HSPs)
chr6 (3-583)||(6980440-6981020)
chr6 (3-583)||(20649538-20650117)
chr6 (3-583)||(12762483-12763063)
chr6 (3-583)||(2869880-2870462)
chr6 (3-583)||(2876495-2877077)
chr6 (3-583)||(30597006-30597579)
chr6 (3-583)||(20060429-20061011)
chr6 (3-583)||(8796971-8797552)
chr6 (3-575)||(27327809-27328383)
chr6 (3-575)||(27388549-27389123)
chr6 (3-583)||(20801537-20802117)
chr6 (1-571)||(30694140-30694712)
chr6 (3-583)||(27430028-27430610)
chr6 (99-583)||(4233243-4233729)
chr6 (1-583)||(26130245-26130830)
chr6 (3-560)||(28287135-28287694)
chr6 (3-583)||(28258199-28258781)
chr6 (3-583)||(28264823-28265405)
chr6 (3-583)||(28336948-28337530)
chr6 (3-583)||(28343572-28344154)
chr6 (3-558)||(25110605-25111177)
chr6 (3-558)||(25117208-25117780)
chr6 (1-583)||(1544788-1545385)
chr6 (1-583)||(3708227-3708825)
chr6 (1-583)||(1538689-1539286)
chr6 (185-583)||(14059361-14059761)
chr6 (3-234)||(24291156-24291387)
chr6 (3-234)||(31317196-31317427)
chr6 (3-234)||(24315184-24315415)
chr6 (3-234)||(4167687-4167920)
chr6 (3-234)||(4208367-4208600)
chr6 (3-189)||(8228646-8228832)
chr6 (3-189)||(18930835-18931021)
chr6 (3-189)||(29587841-29588027)
chr6 (3-189)||(29593982-29594168)
chr6 (3-189)||(30638291-30638477)
chr6 (10-307)||(17037355-17037666)
chr6 (3-234)||(34832418-34832652)
chr6 (1-232)||(19808288-19808520)
chr6 (1-490)||(25928057-25928565)
chr6 (3-186)||(28314333-28314516)
chr6 (3-186)||(27185472-27185655)
chr6 (3-186)||(27207308-27207491)
chr6 (3-186)||(27241737-27241920)
chr6 (3-186)||(27263585-27263768)
chr6 (1-232)||(22758613-22758844)
chr6 (1-232)||(34370086-34370318)
chr6 (1-232)||(34298734-34298960)
chr6 (3-237)||(20176704-20176941)
chr6 (340-583)||(18194269-18194513)
chr6 (3-237)||(5834591-5834828)
chr6 (3-237)||(22159050-22159287)
chr6 (3-189)||(32565394-32565581)
chr6 (22-234)||(11566411-11566627)
chr6 (22-234)||(12619183-12619399)
chr6 (22-234)||(19870139-19870355)
chr6 (22-234)||(23394617-23394833)
chr6 (3-189)||(16552172-16552359)
chr6 (3-189)||(16576594-16576781)
chr6 (3-189)||(16618599-16618786)
chr6 (3-189)||(16628728-16628915)
chr6 (3-189)||(17017074-17017261)
chr6 (22-234)||(8243382-8243598)
chr6 (22-234)||(23989469-23989685)
chr6 (22-220)||(16759818-16760011)
chr6 (405-583)||(8229071-8229249)
chr6 (405-583)||(18931260-18931438)
chr6 (405-583)||(29593565-29593743)
chr6 (22-234)||(22862495-22862711)
chr6 (405-583)||(29587424-29587602)
chr6 (412-582)||(17031061-17031231)
chr6 (405-583)||(30637875-30638052)
chr6 (3-123)||(14098365-14098485)
chr6 (22-233)||(31478326-31478541)
chr6 (3-104)||(14053784-14053885)
chr6 (22-220)||(5616920-5617112)
chr6 (22-165)||(22948632-22948769)
chr6 (22-165)||(22952588-22952725)
chr6 (22-220)||(23414454-23414646)
chr6 (22-165)||(23871076-23871213)
chr6 (22-165)||(23875032-23875169)
chr6 (22-149)||(25135847-25135969)
chr6 (22-198)||(1587859-1588028)
chr6 (22-220)||(27416292-27416483)
chr6 (3-93)||(4233708-4233798)
chr6 (22-122)||(1644059-1644157)
chr6 (23-198)||(9482421-9482588)
chr6 (22-122)||(14471762-14471860)
chr6 (22-122)||(16623903-16624001)
chr6 (72-234)||(14098461-14098624)
chr6 (22-220)||(12496118-12496309)
chr6 (22-198)||(20803682-20803851)
chr6 (22-149)||(27556212-27556333)
chr6 (22-220)||(16741017-16741206)
chr6 (22-198)||(21702096-21702265)
chr6 (22-220)||(12706499-12706689)
chr6 (416-583)||(17037080-17037247)
chr6 (412-583)||(16372049-16372220)
chr6 (22-220)||(19662580-19662769)
chr6 (378-582)||(32564988-32565192)
chr6 (378-561)||(17016689-17016872)
chr6 (22-93)||(18917895-18917966)
chr6 (125-307)||(25595374-25595571)
chr6 (22-220)||(2685424-2685613)
chr6 (436-561)||(28314786-28314911)
chr6 (378-582)||(16551766-16551970)
chr6 (378-582)||(16576983-16577187)
chr6 (378-582)||(16618193-16618397)
chr6 (378-582)||(16628322-16628526)
chr6 (412-583)||(22331630-22331801)
chr6 (430-561)||(27185918-27186049)
chr6 (430-561)||(27207754-27207885)
chr6 (430-561)||(27241343-27241474)
chr6 (430-561)||(27263191-27263322)
chr6 (72-233)||(1644134-1644298)
chr6 (430-583)||(19808735-19808888)
chr6 (412-556)||(34369745-34369889)
chr6 (22-189)||(27325765-27325922)
chr6 (412-494)||(34298457-34298539)
chr6 (405-583)||(34832838-34833016)
chr6 (72-165)||(14471837-14471924)
chr6 (417-583)||(25595097-25595264)
chr6 (22-91)||(22430255-22430326)
chr6 (412-494)||(22759043-22759124)
chr6 (397-490)||(4168101-4168194)
chr6 (397-490)||(4208781-4208874)
chr6 (22-189)||(17803996-17804156)
chr6 (125-233)||(16624025-16624142)
chr6 (402-583)||(14098807-14098988)
chr6 (99-234)||(18917775-18917916)
chr6 (449-583)||(31316837-31316971)
chr6 (411-583)||(24314824-24314996)
chr6 (519-582)||(4168222-4168285)
chr6 (519-582)||(4208902-4208965)
chr6 (411-494)||(24290885-24290968)
chr6 (519-556)||(23277050-23277087)
chr6 (240-307)||(16371873-16371943)
chr6 (240-307)||(22758866-22758936)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (3-583)||(67289-67869)
scaffold0028 (3-583)||(6770-7365)
scaffold0028 (1-583)||(56808-57405)
scaffold0028 (3-494)||(13295-13801)
scaffold0028 (1-583)||(41301-41898)
scaffold0028 (3-494)||(22823-23329)
scaffold0028 (22-234)||(59060-59276)
scaffold0028 (22-67)||(132483-132528)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (3-583)||(59205-59787)
scaffold0061 (22-234)||(67642-67858)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (3-583)||(138846-139428)
[»] scaffold0052 (5 HSPs)
scaffold0052 (3-583)||(797-1380)
scaffold0052 (3-189)||(10117-10303)
scaffold0052 (3-189)||(56539-56725)
scaffold0052 (405-583)||(10542-10720)
scaffold0052 (405-583)||(56964-57142)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (3-583)||(56753-57335)
scaffold0003 (22-220)||(70878-71069)
scaffold0003 (22-220)||(139521-139712)
scaffold0003 (22-148)||(100881-100998)
[»] scaffold0029 (5 HSPs)
scaffold0029 (1-572)||(105634-106214)
scaffold0029 (1-572)||(125869-126448)
scaffold0029 (22-233)||(80091-80305)
scaffold0029 (12-234)||(61951-62174)
scaffold0029 (22-234)||(65867-66081)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (3-583)||(37820-38403)
scaffold0141 (22-149)||(14548-14669)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (3-583)||(76409-76992)
[»] scaffold0109 (9 HSPs)
scaffold0109 (1-574)||(26404-26994)
scaffold0109 (22-165)||(38978-39116)
scaffold0109 (69-490)||(43145-43581)
scaffold0109 (3-123)||(43022-43144)
scaffold0109 (22-149)||(6770-6890)
scaffold0109 (22-120)||(36451-36546)
scaffold0109 (22-165)||(11461-11599)
scaffold0109 (99-220)||(36330-36449)
scaffold0109 (69-123)||(43117-43172)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (3-571)||(306877-307445)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (3-583)||(12210-12805)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (3-583)||(77980-78575)
scaffold0004 (412-556)||(58190-58334)
scaffold0004 (99-232)||(60878-61006)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (3-326)||(9618-9955)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (3-583)||(73760-74357)
scaffold0009 (12-91)||(228598-228676)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-494)||(19411-19921)
[»] scaffold0744 (2 HSPs)
scaffold0744 (3-234)||(3782-4013)
scaffold0744 (241-297)||(3702-3758)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (3-189)||(38462-38648)
scaffold0140 (405-583)||(38887-39065)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (3-189)||(25128-25314)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (3-490)||(14831-15334)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (4-234)||(8963-9194)
scaffold0216 (510-556)||(8649-8695)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (3-186)||(32473-32656)
scaffold0144 (430-583)||(32057-32209)
[»] scaffold0013 (5 HSPs)
scaffold0013 (1-232)||(9101-9332)
scaffold0013 (22-80)||(73818-73876)
scaffold0013 (22-91)||(2899-2967)
scaffold0013 (412-556)||(9530-9674)
scaffold0013 (22-75)||(81468-81520)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (22-234)||(4214-4426)
scaffold0525 (510-583)||(3621-3694)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-232)||(241826-242052)
scaffold0010 (412-556)||(242247-242391)
scaffold0010 (22-220)||(23027-23216)
[»] scaffold0259 (2 HSPs)
scaffold0259 (1-232)||(9937-10169)
scaffold0259 (412-583)||(10367-10538)
[»] scaffold0242 (3 HSPs)
scaffold0242 (3-232)||(19346-19570)
scaffold0242 (3-144)||(25493-25634)
scaffold0242 (68-232)||(25585-25744)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (428-583)||(109069-109224)
[»] scaffold0233 (2 HSPs)
scaffold0233 (1-232)||(14651-14878)
scaffold0233 (412-583)||(14285-14456)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (3-189)||(4230-4417)
scaffold0126 (378-582)||(3824-4028)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (22-234)||(5440-5656)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (22-234)||(11971-12187)
scaffold0349 (519-583)||(12719-12783)
[»] scaffold0553 (2 HSPs)
scaffold0553 (3-189)||(8556-8743)
scaffold0553 (378-582)||(8945-9149)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (3-189)||(21971-22158)
scaffold0133 (378-561)||(22360-22543)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (24-234)||(1-215)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (1-232)||(25087-25313)
scaffold0256 (424-494)||(24809-24879)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (3-141)||(1-139)
scaffold0231 (99-144)||(25-70)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (22-220)||(33050-33243)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (22-220)||(9230-9421)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (22-220)||(9712-9904)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (22-165)||(16823-16961)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (22-198)||(15145-15315)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (22-165)||(36531-36668)
scaffold0031 (22-189)||(53364-53524)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (22-220)||(189767-189959)
scaffold0012 (22-220)||(25075-25265)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (12-165)||(9136-9282)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (12-165)||(77331-77477)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (22-220)||(6490-6681)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (22-220)||(36117-36307)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (12-165)||(1676-1822)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (1-93)||(1121-1213)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (20-165)||(8306-8445)
scaffold0111 (20-122)||(15426-15525)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (22-198)||(20592-20761)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (22-220)||(18164-18355)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (22-198)||(6128-6297)
scaffold0130 (22-93)||(8225-8296)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (22-149)||(6417-6537)
scaffold0546 (22-165)||(1708-1846)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-87)||(14757-14843)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (22-220)||(63664-63855)
[»] scaffold0229 (2 HSPs)
scaffold0229 (3-93)||(11988-12079)
scaffold0229 (96-220)||(11891-12012)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (22-122)||(208073-208170)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (22-198)||(177-346)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (22-145)||(29362-29477)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (22-93)||(2-73)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (22-93)||(9401-9472)
[»] scaffold0560 (2 HSPs)
scaffold0560 (397-556)||(5570-5729)
scaffold0560 (115-234)||(5907-6026)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (125-556)||(3-448)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (412-556)||(29979-30123)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (22-198)||(16488-16654)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (12-93)||(11510-11591)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (22-94)||(9889-9960)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (30-93)||(30725-30788)
scaffold0051 (417-556)||(36903-37041)
scaffold0051 (99-220)||(30767-30885)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (72-233)||(80871-81026)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (22-91)||(18859-18927)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (12-220)||(173093-173292)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (12-93)||(28867-28947)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (22-94)||(10283-10354)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (25-220)||(20122-20307)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (518-583)||(3005-3070)
[»] scaffold0156 (3 HSPs)
scaffold0156 (126-232)||(2699-2804)
scaffold0156 (519-583)||(3069-3133)
scaffold0156 (10-53)||(2651-2694)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (22-189)||(66562-66722)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (144-232)||(6522-6610)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (22-55)||(5-38)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (22-67)||(3397-3442)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 522; Significance: 0; HSPs: 146)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 18164999 - 18164418
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18164999 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 18164900  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18164899 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 18164800  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18164799 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 18164700  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  18164699 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 18164600  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18164599 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 18164500  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18164499 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 18164418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 9511337 - 9510757
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9511337 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 9511238  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9511237 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 9511139  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9511138 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 9511039  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  9511038 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 9510939  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9510938 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 9510839  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9510838 agctcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 9510757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 40523687 - 40523106
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40523687 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 40523588  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40523587 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctctgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 40523488  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40523487 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaagtaacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 40523388  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  40523387 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgagtatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 40523288  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40523287 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 40523188  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40523187 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 40523106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12703734 - 12703184
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12703734 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 12703635  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12703634 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 12703536  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12703535 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaggatgatatcattat 12703436  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  12703435 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 12703336  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12703335 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 12703236  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgag 553  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12703235 agctcttcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgag 12703184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 576
Target Start/End: Original strand, 49051151 - 49051724
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49051151 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 49051250  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49051251 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 49051349  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49051350 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 49051449  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  49051450 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattattattaatataacttaaacaa 49051549  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |    
T  49051550 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacactcaggaa 49051649  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaag 576  Q
    | | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49051650 actacattctggttgtactcgtgaggcgagagttcttactcgccgtggcgagtaccactcaactcccaaactaag 49051724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 61003 - 60421
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61003 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 60904  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  60903 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 60804  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  60803 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcattat 60704  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  60703 atcaatagcacataaattgcattattatcacatcttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttaaccaattaatattaatataacttaaaca 60604  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60603 actctacagtctgcattaaacaacatcgctaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacacaaac 60504  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  60503 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagctcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggtcgttc 60421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 14337150 - 14337731
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14337150 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 14337249  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14337250 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaatat 14337348  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14337349 gcatccaataacttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 14337448  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-aca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||| |||| ||  |||| ||| || |||||||  || ||||| ||     
T  14337449 atcaatagcacataaattgtatcattatcaactcttcatatcttgcataaatatacattacattaactcatgttcaatcaatattatcatgacttagact 14337548  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14337549 actctacggactgcatttaacaacatcactaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacactgatcgcacaaacacacaaac 14337648  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14337649 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 14337731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 14330566 - 14331147
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330566 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 14330665  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14330666 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaatat 14330764  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14330765 gcatccaataacttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 14330864  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-aca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||| |||| ||  |||| ||| || |||||||  || ||||| ||     
T  14330865 atcaatagcacataaattgtatcattatcaactcttcatatcttgcataaatatacattacattaactcatgttcaatcaatattatcatgacttagact 14330964  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14330965 actctacggactgcatttaacaacatcactaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacactgatcgcacaaacacacaaac 14331064  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14331065 aagttcatcctagttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 14331147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 18175884 - 18176465
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18175884 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 18175983  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18175984 cggaggacaaagctcctaataattgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 18176083  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  18176084 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 18176183  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    |||||  |||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  18176184 atcaattgcacataa-ttgcatcattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatattcaattaatatcaacataacttaaaca 18176282  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |    
T  18176283 actctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcactcttaatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaactcacaagc 18176382  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    || | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18176383 aactacatcctggctgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccgtggcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 18176465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 18182556 - 18183137
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182556 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 18182655  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  18182656 cggaggacaaagctcctaataattgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaataaaacatcgtaatcaacatatcaacat 18182755  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  18182756 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 18182855  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  18182856 atcaatagcacataa-ttgcatcattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatattcaattaatatcaacataacttaaaca 18182954  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |    
T  18182955 actctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcactcttaatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaactcacaagc 18183054  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    || | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18183055 aactacatcctggctgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccgtggcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 18183137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 570
Target Start/End: Original strand, 11365976 - 11366548
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11365976 gacaatgctcttagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 11366075  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac---aaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| || ||||||    
T  11366076 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacacaaaaacatcgtaatcaacatatcaa 11366175  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11366176 catgcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacgagatgatatca 11366274  T
Q  299 ctatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta 397  Q
     |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    ||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||||| | | |||||||| || ||||||||    
T  11366275 ttatatcaatagcacataaattgcatcattatcaagctttcgtatcttgcatgagaatacaatacattagttcatgtccaattaatatcaacataactta 11366374  T
Q  398 -acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacat 496  Q
      ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366375 gccaactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttattaccagttgggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacat 11366474  T
Q  497 aaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaa 570  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11366475 aaacaacttcatcctggctgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaa 11366548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 14655743 - 14655161
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14655743 gacaatgctcttagactccttaaatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgttcggaggacaaagctcctatataacgtg 14655644  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  14655643 cggaggacaaagctcctagtaatcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 14655545  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  14655544 tgcatccaataatttggagctaaaccttatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcatta 14655445  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  14655444 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatattcaattaatatcaatataacttaaac 14655345  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  14655344 aactctacaggctgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaag 14655245  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14655244 caactacatcctggctatgctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 14655161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 44786801 - 44786219
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44786801 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 44786702  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  44786701 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 44786603  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  44786602 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 44786503  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-ac 399  Q
    |||||| ||||| ||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  44786502 tatcaatagcacgtaaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacgatacattaattcatattcaattaatatcaatataacctagac 44786403  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |      
T  44786402 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagctaggggttcactcttgatcaacaggtgcgacacagatcgcacagacactcagg 44786303  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44786302 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 44786219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 44793442 - 44792860
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44793442 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 44793343  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  44793342 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 44793244  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  44793243 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 44793144  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-ac 399  Q
    |||||| ||||| ||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  44793143 tatcaatagcacgtaaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacgatacattaattcatattcaattaatatcaatataacctagac 44793044  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |      
T  44793043 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagctaggggttcactcttgatcaacaggtgcgacacagatcgcacagacactcagg 44792944  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44792943 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 44792860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 15163147 - 15162567
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15163147 gacaatgctcttagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 15163048  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  15163047 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 15162948  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  15162947 tgcatccaataatttggagct-aacttcatcacaaacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacaaaatgatatcatt 15162849  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| |||  |||| |   |  | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| ||    
T  15162848 atatcaatagcttataaatatcaggaatatca-accttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaa 15162750  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15162749 caactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactaggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaa 15162650  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgt 581  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  15162649 gcaagtacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgt 15162567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16407621 - 16407039
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16407621 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16407522  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaa-caaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  16407521 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaataaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 16407422  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16407421 tgcatccaataatttggagct-aacttcatcataaacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacaagatgatatcatt 16407323  T
Q  301 atatca-aagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    || |||  |||  |||| |   |  | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| ||    
T  16407322 atgtcattagcttataaatatcaggaatatca-accttcgtatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaa 16407224  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16407223 caactctacagactgcattaaacgtcaacattaggtcttaataccaactaggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaa 16407124  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  16407123 gcaagtacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaacgttgttc 16407039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 15156496 - 15155914
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15156496 gacaatgctcttagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 15156397  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  15156396 cggaggacaaagcttctattattcatggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 15156297  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  15156296 tgcatccaataatttggagct-aacttcatcacaaacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacaaaatgatatcatt 15156198  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| | |  |||| |   |  | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| ||    
T  15156197 atatcaataacttataaatatcaggaatatca-accttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaa 15156099  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15156098 caactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactacgggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaa 15155999  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  15155998 gcaagtacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 15155914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 3 - 582
Target Start/End: Original strand, 13684241 - 13684822
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13684241 gacaatgctcttagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatgttttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 13684340  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  13684341 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttgtgaacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 13684440  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcact 300  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  13684441 tgcatccattaaattggagct-aacttcatcataaacttatgcacttagttaaataacggaagcaacataaacaggtcacataaacaaaatgatatcatt 13684539  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| |||  |||| |   |  | ||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| ||    
T  13684540 atatcaatagcttataaatatcaggaatatca-accttcatttcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaa 13684638  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13684639 caactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactaggggttcgctcttgatcagcacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaa 13684738  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  13684739 gcaagtacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgtt 13684822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 20703316 - 20702736
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20703316 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 20703217  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  20703216 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 20703117  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20703116 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 20703017  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  |  |||||    || ||  |||||      
T  20703016 tatcaacagcaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgcttaattaacgacaacatgtcttaaag 20702919  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
     || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  20702918 gctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 20702819  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |  |  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  20702818 atctaaattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 20702736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 582
Target Start/End: Original strand, 13690872 - 13691437
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13690872 gacaatgctcttagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaatgtg 13690971  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  13690972 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 13691071  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcact 300  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  13691072 tgcatccattaaattggagct-aacttcatcataaacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacaaaatgatatcatt 13691170  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaac 399  Q
    ||||||| |||  |||| |   |  | ||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  |||               |||    
T  13691171 atatcaatagcttataaatatcaggaatatca-accttcatttcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccattta---------------aac 13691254  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  13691255 aactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactaggggttcgctcttgatcagcacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaag 13691354  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  13691355 caagtacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgtt 13691437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 32767455 - 32768035
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32767455 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 32767554  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  32767555 cggaggacaaaactcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 32767654  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  32767655 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 32767754  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  |  |||||    || ||  ||||       
T  32767755 tatcaacagcaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgcttaattaacgacaacatgtcttagag 32767852  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
     || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  32767853 gctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 32767952  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |  |  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  32767953 atctaaattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 32768035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 556
Target Start/End: Original strand, 13569656 - 13570227
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13569656 gacaatgctcttagactccttttatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaaaaatcgtg 13569755  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  13569756 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatacatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcgacat 13569855  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatatac---------ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  13569856 gcatccaaaaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatatatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 13569955  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcatta-tcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaat 383  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||| | | | |  ||| || ||| ||| | | | ||| ||  || | ||||||| ||||      
T  13569956 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatatcataaattaaactttcataacttacaccattgtgcaacacgttaat-catattctattata 13570054  T
Q  384 attaaaataacttaa-caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacaga 482  Q
    |  || ||| ||||| || || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13570055 aacaacatatcttaaacagctttacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcaattagggattcactcttgatcaaaacgtgcgacacaga 13570154  T
Q  483 tcgcacaa-acacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    |||||||| || |||||   | |  |  ||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13570155 tcgcacaacactcataac--actcaaagctggaggtgctcgcgaggcgagagttcttgctcgccatggcgagtac 13570227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20439 - 20205
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20439 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 20340  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||    
T  20339 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatca 20241  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20240 acatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 20205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 571
Target Start/End: Original strand, 1347273 - 1347856
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1347273 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 1347372  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  1347373 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatgaactcttaacaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 1347471  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacct--------------atgcacttagttaaataacggaag---cagcataaacaggtcacata 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |              ||||||||||||||||||| | ||   |||||||| || || |||||    
T  1347472 tgcatccaataatttggagctaaatgtcatcttattcattacatacaatcatcatgcacttagttaaataacagcagcaacagcataatcaagttacata 1347571  T
Q  285 acaagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaat 383  Q
    |||  ||||||||| |||||||| ||||  | ||||| ||||| || | | |||| |||||| ||| | |  |||||||||||  |||| ||| ||||||    
T  1347572 acagaatgatatcattatatcaatagcaattcatttgcatcataatta-aacttcatatcttacacaattgcacaatacaata-atcatgttcaattaat 1347669  T
Q  384 attaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
       || ||  |||||   || |||||  ||||||| ||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  1347670 tacaacatgtcttaaaggctttacagattgcattagacttcatcattaggtttcgttaccaattaggggttcactcttggtcaaaacgtgcgacacagat 1347769  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    |||||  ||||  ||  || | ||| ||||    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1347770 cgcac-tacactcaacaaactacattctgggctaactcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaa 1347856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 15021887 - 15022073
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15021887 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 15021986  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15021987 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 15022073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Original strand, 9409709 - 9409942
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc-tataaaacgt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||    
T  9409709 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtacggaggacaaagctccaaataaatcgt 9409808  T
Q  102 gcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9409809 gcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaagactaagctcaatgaaatgctaatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaac 9409908  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9409909 atgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 9409942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11232626 - 11232402
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232626 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 11232527  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||  | | |||||    
T  11232526 tgcggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaa 11232428  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11232427 catgcatccaataatttggagctaaa 11232402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 21440 - 21626
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21440 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 21539  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21540 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacagatgaacaaaacatcataatc 21626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8202422 - 8202236
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8202422 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 8202323  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8202322 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacagatgaacaaaacatcataatc 8202236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11239313 - 11239089
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11239313 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 11239214  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaa 199  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||  | | |||||    
T  11239213 tgtggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaa 11239115  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11239114 catgcatccaataatttggagctaaa 11239089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6017517 - 6017283
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6017517 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcg 6017418  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||    
T  6017417 tgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatca 6017319  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6017318 acatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 6017283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 18531010 - 18531241
Alignment:
Q  4 acaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18531010 acaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaatcgtg 18531109  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || ||||||| || ||||||      
T  18531110 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgagaactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcaacatatcaatg 18531208  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18531209 agcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 18531241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 7535947 - 7536177
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacgt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7535947 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtatcaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcgt 7536046  T
Q  102 gcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||| |||||| || ||||||| || ||||||     
T  7536047 gcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatgaactcttatcaacaaatcaccgtaatcaacatatcaat 7536145  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7536146 aagcatccaataatttggagctaaacgtcatc 7536177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4318887 - 4318655
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4318887 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 4318788  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  |||||| || | |||||  | |||||    
T  4318787 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttaacaacaaatcaccataatcatcatatca 4318689  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4318688 atatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 4318655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 14958932 - 14959158
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  14958932 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 14959031  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  14959032 tgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 14959125  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14959126 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 14959158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 11262097 - 11262323
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  11262097 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtatcaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 11262196  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  11262197 tgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 11262290  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11262291 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 11262323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12692264 - 12692490
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  12692264 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 12692363  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||||  | ||||||    
T  12692364 tgcagaggacaaagctccta----tcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaatcatcgtaatcatcatatcaa 12692457  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12692458 tatgcatccaataatttggagctagacgtcatc 12692490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 26419768 - 26419994
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||    
T  26419768 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaaactcctaataatcg 26419867  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    || |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  26419868 tgtggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggacgc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 26419961  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26419962 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 26419994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11548604 - 11548377
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcctataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |    
T  11548604 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatc 11548505  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | |||||    
T  11548504 gtgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctactgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcttcatatca 11548411  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11548410 atatgcatccaacaatttggagctaaacgtcatc 11548377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11555200 - 11554973
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcctataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |    
T  11555200 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatc 11555101  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | |||||    
T  11555100 gtgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctactgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcttcatatca 11555007  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11555006 atatgcatccaacaatttggagctaaacgtcatc 11554973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 8705762 - 8705949
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  8705762 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 8705861  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  8705862 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 8705949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 32658 - 32874
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32658 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 32755  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  32756 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 32852  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  32853 atttggagctaaacgtcatcat 32874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12705216 - 12705000
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12705216 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 12705119  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  12705118 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 12705022  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  12705021 atttggagctaaacgtcatcat 12705000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18553871 - 18553684
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  18553871 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 18553772  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||    
T  18553771 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatgtactcttaacaacaaaacatcgtaatc 18553684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23520302 - 23520115
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  23520302 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 23520203  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  23520202 cggaggacaaagatcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 23520115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 71324 - 71108
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  71324 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaggctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 71227  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  71226 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 71130  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  71129 atttggagctaaacgtcatcat 71108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 75433 - 75217
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  75433 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaggctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 75336  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  75335 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 75239  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  75238 atttggagctaaacgtcatcat 75217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 12718217 - 12718433
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718217 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 12718314  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  12718315 ---tcgtggtgaggacaaaactcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 12718411  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  12718412 atttggagctaaacgtcatcat 12718433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 16113790 - 16114006
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16113790 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 16113887  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16113888 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 16113984  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    | |||||||||||| |||||||    
T  16113985 acttggagctaaacgtcatcat 16114006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 16116943 - 16117159
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16116943 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 16117040  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16117041 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 16117137  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    | |||||||||||| |||||||    
T  16117138 acttggagctaaacgtcatcat 16117159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 21865 - 22043
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21865 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 21964  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  21965 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 22043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 8201997 - 8201819
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8201997 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 8201898  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  8201897 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 8201819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 12723128 - 12723344
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723128 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 12723225  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         ||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  12723226 ---tcatggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcagcatatcatcatgcatccaata 12723322  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  12723323 atttggagctaaacgtcatcat 12723344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 18282915 - 18283131
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18282915 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 18283012  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| ||||||| |||||    
T  18283013 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcattcaata 18283109  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  18283110 atttggagttaaacgtcatcat 18283131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 18278952 - 18279168
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18278952 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaaactcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 18279049  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| ||||||| |||||    
T  18279050 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcattcaata 18279146  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  18279147 atttggagttaaacgtcatcat 18279168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 15022312 - 15022491
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaa-cacataaacaag 503  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15022312 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggatcaaaaagtgcgacacagatcgcacaaaacacataatcaag 15022411  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  15022412 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagctcttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 15022491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 15083720 - 15083912
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  15083720 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 15083816  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  15083817 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 15083911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 18556780 - 18556973
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18556780 ttatatgcatgtggtaccaatctttatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 18556876  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |  ||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  18556877 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggacgctaaacaacaaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttgga 18556972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 8712433 - 8712571
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  8712433 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 8712532  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaa 140  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  8712533 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaa 8712571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 13148964 - 13149155
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||     
T  13148964 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctccta- 13149059  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  13149060 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 13149154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1859381 - 1859245
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  1859381 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat----cgtgcggaggacaaagctcctaa 1859286  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1859285 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 1859245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 15728133 - 15728302
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  15728133 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctccta- 15728229  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  15728230 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatca 15728302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 39721790 - 39721982
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  39721790 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggagaacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 39721886  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  39721887 ---tcgtagtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcattgactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 39721981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45170588 - 45170451
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  45170588 ttatatgcttgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 45170492  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45170491 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 45170451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 14216733 - 14216854
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  14216733 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctccta- 14216829  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       || |||||||||| |||||||||||    
T  14216830 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga 14216854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 14952993 - 14953086
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14952993 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctat 14953086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 18425209 - 18425307
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18425209 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 18425306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 26291921 - 26292019
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26291921 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 26292018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 44408647 - 44408554
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44408647 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctat 44408554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 8917236 - 8917372
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||     
T  8917236 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgtggaggactaagctccta- 8917331  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8917332 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 8917372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 117
Target Start/End: Original strand, 12714437 - 12714530
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12714437 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctc 12714530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 10869232 - 10869347
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacgt 101  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10869232 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaaacgt 10869331  T
Q  102 gcggaggacaaagctc 117  Q
    |  |||||| ||||||    
T  10869332 ggtgaggactaagctc 10869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 10875312 - 10875427
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacgt 101  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10875312 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaaacgt 10875411  T
Q  102 gcggaggacaaagctc 117  Q
    |  |||||| ||||||    
T  10875412 ggtgaggactaagctc 10875427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 7519622 - 7519531
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  7519622 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat----cgtgcggaggacaaagctc 7519531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 15380586 - 15380671
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15380586 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaa 15380671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 380 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 23519902 - 23519721
Alignment:
Q  380 taatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacac 479  Q
    |||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23519902 taatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgacac 23519803  T
Q  480 agatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23519802 agatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagtcctcactcgccatggcgagtaccactc 23519721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25927798 - 25927607
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||||||||||    
T  25927798 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagcttct---aatcgtgtggaggacaaagctcctaa 25927702  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  25927701 ---tcatggtgaggac-aagctcaatga-atgctaatgcatgaactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 25927608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16724927 - 16724806
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||| |||||||     
T  16724927 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--gaaaacctgtggaggacaaggctccta- 16724831  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       || |||||||||| |||||||||||    
T  16724830 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga 16724806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 17701941 - 17701820
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||| |||||||     
T  17701941 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--gaaaacctgtggaggacaaggctccta- 17701845  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       || |||||||||| |||||||||||    
T  17701844 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga 17701820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18585612 - 18585497
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacgt 101  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18585612 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaaacgt 18585513  T
Q  102 gcggaggacaaagctc 117  Q
    |  |||||| ||||||    
T  18585512 ggtgaggactaagctc 18585497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 13461569 - 13461738
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||     
T  13461569 ttatatgcatgtggtacaaaacgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgtggaggacaaagctccta- 13461664  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       ||  ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |  || |||||| || | ||||| ||||||||    
T  13461665 ---tcaaggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactctaatcaacaaatcaccttaatcaacttatca 13461738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2530708 - 2530616
Alignment:
Q  25 tatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctccta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  2530708 tatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgtggaggacaaagctccta 2530616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 378 - 561
Target Start/End: Original strand, 10875684 - 10875866
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10875684 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatccttaggtttcattaccagttaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgac 10875783  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10875784 acagatcgcacaaccac-tcaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactc 10875866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 13919052 - 13918981
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13919052 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 13918981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 397 - 556
Target Start/End: Original strand, 18531419 - 18531578
Alignment:
Q  397 aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacat 496  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||      
T  18531419 aacaactttacagactgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcatgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactc 18531518  T
Q  497 aaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||   | | ||  ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18531519 aaggcactccaatctggaagtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtac 18531578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 9593156 - 9593345
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |     
T  9593156 ttatatgcatgtggtaccaatcatcatcata-gtattaatatactttaatcgttgggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccga- 9593249  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  9593250 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 9593344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16457652 - 16457463
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||    
T  16457652 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgcggaggtcaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccgaa 16457558  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  16457557 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatgggctc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 16457464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 405 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 18585223 - 18585046
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||| |    
T  18585223 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgacacagatcgcacaaccactcaaacaact 18585124  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
     ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||    
T  18585123 acattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatgttgtt 18585046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16907768 - 16907675
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  16907768 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtatttatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtggtgaggacaaagctc 16907675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 412 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 4318461 - 4318290
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||  ||   | | ||| ||    
T  4318461 tgcattaaacatcatcaataggtctcattaccaattagggattcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcgcaaacactcaagacactccattct 4318362  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||  |||||||    
T  4318361 ggaagtgctcgcgaggcgagagttcctactcgccatggcgagtaccagtcaattcccaaactagtgttgttc 4318290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 16275324 - 16275395
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16275324 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcagaggacaaagctccta 16275395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Original strand, 6801026 - 6801211
Alignment:
Q  26 atgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatatt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | || ||||||||||||||| ||        
T  6801026 atgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat----catgtggaggacaaagctccgaa---- 6801116  T
Q  126 cgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  | |  ||||||||||| ||||| ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  6801117 catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactta-aacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggag 6801211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14933071 - 14932954
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcg-tcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctccta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||    
T  14933071 ttatatgcatgtggtaccaatctctcatcata-gtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctccta 14932976  T
Q  121 atattcgtggtgaggactaagctcaa 146  Q
        ||||||||||||| ||||||||    
T  14932975 ----tcgtggtgaggacaaagctcaa 14932954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15356506 - 15356389
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcg-tcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctccta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||    
T  15356506 ttatatgcatgtggtaccaatctctcatcata-gtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctccta 15356411  T
Q  121 atattcgtggtgaggactaagctcaa 146  Q
        ||||||||||||| ||||||||    
T  15356410 ----tcgtggtgaggacaaagctcaa 15356389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15360620 - 15360503
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcg-tcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctccta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||    
T  15360620 ttatatgcatgtggtaccaatctctcatcata-gtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctccta 15360525  T
Q  121 atattcgtggtgaggactaagctcaa 146  Q
        ||||||||||||| ||||||||    
T  15360524 ----tcgtggtgaggacaaagctcaa 15360503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 405 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 18553455 - 18553278
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||  |    
T  18553455 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgacacagatcgcacaaccactcaaacagct 18553356  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
     ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||    
T  18553355 acattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatgttgtt 18553278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 14953061 - 14953192
Alignment:
Q  96 aaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | |    
T  14953061 aaacgtgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcat 14953154  T
Q  195 atcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14953155 atcaatatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 14953192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 90
Target Start/End: Original strand, 35151449 - 35151517
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctc 90  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151449 ttatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctc 35151517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44408579 - 44408448
Alignment:
Q  96 aaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | |    
T  44408579 aaacgtgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcat 44408486  T
Q  195 atcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44408485 atcaatatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 44408448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 378 - 561
Target Start/End: Original strand, 10869604 - 10869786
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10869604 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcattaagtttcattaccagttaggggttcattcttgatcaaaaggtgcgac 10869703  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||  | ||| |||    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10869704 acagatcgcacaaccac-tcaacatctacattctgtacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactc 10869786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 406 - 582
Target Start/End: Original strand, 8706179 - 8706355
Alignment:
Q  406 acagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagtt 505  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||  |     
T  8706179 acagactgcattaaacgttatcataaggtttctttaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgacacagatcgcacaaccactcaaacagcta 8706278  T
Q  506 catcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||    
T  8706279 cattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatgttgtt 8706355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 406 - 582
Target Start/End: Original strand, 8719595 - 8719771
Alignment:
Q  406 acagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagtt 505  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||  |     
T  8719595 acagactgcattaaacgttatcataaggtttctttaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgacacagatcgcacaaccactcaaacagcta 8719694  T
Q  506 catcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||    
T  8719695 cattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatgttgtt 8719771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 11262518 - 11262662
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  11262518 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaatgcactccaatct 11262617  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11262618 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 11262662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 12692685 - 12692829
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  | | ||  ||    
T  12692685 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattagggattcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaaacactccaatct 12692784  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  12692785 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 12692829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 14953387 - 14953531
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  |||| | | ||  ||    
T  14953387 tgcattaaacatcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtacgacacagatcgcacaaacactcaaaccactccaatct 14953486  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14953487 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 14953531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Original strand, 26291996 - 26292162
Alignment:
Q  72 cgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||     
T  26291996 cgtgcggaggacaaagctccta---atcgtgcggaggacaaagctcctaaaa--cgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcattgactcttaa 26292090  T
Q  172 gaaca---------aaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
     ||||         || |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26292091 caacaagacatcgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 26292162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 412 - 494
Target Start/End: Original strand, 26420189 - 26420271
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26420189 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacac 26420271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16907718 - 16907576
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         ||||||||||    
T  16907718 cgtgcggaggacaaagctcctaaaa--cgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatc 16907621  T
Q  190 gacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16907620 aacatatcatcatgcatccaataatttggagctaaacatcatcat 16907576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 14959353 - 14959497
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||  | | ||  ||    
T  14959353 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcataaacactcaaaacactccaatct 14959452  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    |   || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14959453 gaaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 14959497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20871361 - 20871301
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20871361 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatat 20871301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 25039126 - 25038982
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||  | | ||  ||    
T  25039126 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcacacaaacactcaaagcactccaatct 25039027  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  25039026 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcaccatggcgagtac 25038982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Original strand, 10869301 - 10869392
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatatt-cgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  10869301 cgtgcggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 10869392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Original strand, 10875381 - 10875472
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatatt-cgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  10875381 cgtgcggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 10875472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 583
Target Start/End: Original strand, 14148759 - 14148930
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  14148759 tgcattaaacatcgtcattaggtctcattaccaattagggatccactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaggcactccaatct 14148858  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||  || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| |||||||    
T  14148859 ggaagtgctcgcgaggcgggagttcctactcgccatggcgagtaccagtcaatttccaaactaatgttgttc 14148930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18585543 - 18585452
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatatt-cgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  18585543 cgtgcggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 18585452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2832763 - 2832636
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggaca 111  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||    
T  2832763 cttagacactctttatgcatgtggtaccaatcttcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaggctcctat----cgtgtggaggaca 2832669  T
Q  112 aagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatg 148  Q
    | ||||| |    ||||||||||||| ||||||||||    
T  2832668 aggctccga----tcgtggtgaggacaaagctcaatg 2832636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 233
Target Start/End: Original strand, 18425284 - 18425448
Alignment:
Q  72 cgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||     
T  18425284 cgtgcggaggacaaagctccta---atcgtgcggaggacaaagctcctaaa---cgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaa 18425377  T
Q  172 gaaca---------aaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatca 233  Q
     ||||         || |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18425378 caacaagacaccataatcatcgtaatcaacatattatcatgcatccaataatttggagctaaacgtcatca 18425448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 412 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 44408253 - 44408171
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  44408253 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcacacaaacac 44408171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Original strand, 16583070 - 16583224
Alignment:
Q  26 atgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatatt 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    ||||  |||||||||||||   | | |    
T  16583070 atgcatgtggtaccaattgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctccgat----cgtggtgaggacaaagctc---aaaat 16583161  T
Q  126 cgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  16583162 cgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatc 16583224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20649 - 20578
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat 94  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20649 ttatatgcatttggtaccaatcatcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat 20578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 402 - 582
Target Start/End: Original strand, 9410124 - 9410304
Alignment:
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacaca-taaac 500  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  9410124 ctctacagactgcatttaacgtcatcattaggtctcattaccataagggggttcactcttggtccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactctaggc 9410223  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    |   | | |||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||    
T  9410224 atactaa-cctggaattgctcgcgaggcgagaatccttactcgccatggcgagtaccaaacaattcccaaactaaagttgtt 9410304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 234
Target Start/End: Original strand, 12714487 - 12714629
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         ||||||||||    
T  12714487 cgtgcggaggacaaagctcctaaaa--cgtgcggaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatc 12714584  T
Q  190 gacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12714585 aacatatcatcatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 12714629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Original strand, 12317935 - 12318006
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  12317935 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-agtattaatatactttaagcatcgtggggaggacaaagctcc 12318006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 510 - 583
Target Start/End: Original strand, 33395 - 33468
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  33395 ctggatgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 33468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14152310 - 14152140
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggagg 108  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||    |||  ||||    
T  14152310 cttagaccttttatatgcatgtggtaccaattgtcatcat-agtattaatatactttaagcatcgtggggaggacaaagctccaata----gtggtgagg 14152216  T
Q  109 acaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||     | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  14152215 acaaagctc----aaatcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatc 14152140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 510 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 70583 - 70519
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaacta 574  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  70583 ctggatgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaacta 70519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 510 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 74692 - 74628
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaacta 574  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  74692 ctggatgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaacta 74628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11554778 - 11554635
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  11554778 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaatttggg-ttcactcttaatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaatgcactccaatct 11554680  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11554679 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 11554635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 519 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 12704467 - 12704403
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  12704467 ctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 12704403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 11232187 - 11232041
Alignment:
Q  424 catcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgc 523  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||  ||  || | ||| | ||     |||||    
T  11232187 catcattaggtttcgttaccaattaggggttcactcttggtcaaaacgtgcgacacagatcgcacta-cactcaacaaactacattcagggctagctcgc 11232089  T
Q  524 gaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11232088 gaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaa 11232041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 11238874 - 11238728
Alignment:
Q  424 catcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgc 523  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||  ||  || | |||  |||     |||||    
T  11238874 catcattaggtttcgttaccaattaggggttcactcttggtcaaaacgtgcgacacagatcgcacta-cactcaacaaactacattttgggctagctcgc 11238776  T
Q  524 gaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11238775 gaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaa 11238728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 536 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 12703179 - 12703132
Alignment:
Q  536 cttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12703179 cttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 12703132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 9752055 - 9751984
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  9752055 ttatatgcatgtggtatcaatcgtcatcat-agtattaatatactttaagcatcgtggggaggacaaagctcc 9751984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 6017094 - 6016943
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca-ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaag 503  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||   |     
T  6017094 tacagactgcattaaacgtcatcatt-ggtctcaattaccataagggggttctctcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacac 6016996  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    | || |||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6016995 tccaacctggaagtgctcgcgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 6016943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 416 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11548178 - 11548039
Alignment:
Q  416 ttaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggtt 515  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||||      
T  11548178 ttaaacgtcatcattaggtttcattaccaatttggg-ttcactcttaatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaatgcactccaatctggaa 11548080  T
Q  516 gtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11548079 gtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 11548039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 13635747 - 13635696
Alignment:
Q  39 caatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13635747 caatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtggggaggacaaagctcc 13635696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15605569 - 15605497
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaat-cgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  15605569 ttatatgcatgtggtaccaatacgtcatcat-agtattaatatactttaagcatcgtggggaggacaaagctcc 15605497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2530614 - 2530496
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  2530614 cgtgcggaggacaaagctcctaa---acgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcgacttatc 2530520  T
Q  198 a-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    |   || |||||||||||||||||    
T  2530519 acttatacatccaataatttggag 2530496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4318633 - 4318566
Alignment:
Q  240 tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatatcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4318633 tatgcacttagttaaataacagtagcatcatagtcaagtcacataacaggatgatatcattatatcaa 4318566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 20021 - 19936
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttagg-ggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaa 490  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  20021 tacagactgcattaaacgtcatcactaggtctcattatca-taaggaggttcgctctagatccaaacgtgcgacacagatcgcacaa 19936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 189
Target Start/End: Original strand, 8719312 - 8719365
Alignment:
Q  136 actaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  8719312 actaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 8719365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13919002 - 13918884
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| |||||||    
T  13919002 cgtgcggaggacaaagctcctaa---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatc 13918908  T
Q  198 a-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    |   || |||||||||||||||||    
T  13918907 acttatacatccaataatttggag 13918884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 232
Target Start/End: Original strand, 14148524 - 14148562
Alignment:
Q  194 tatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14148524 tatcaatatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 14148562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 117
Target Start/End: Original strand, 26292016 - 26292063
Alignment:
Q  68 taatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  26292016 taatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtggtgaggacaaagctc 26292063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 144
Target Start/End: Original strand, 8712502 - 8712547
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  8712502 cgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtgcggaggacaaagctc 8712547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 307
Target Start/End: Original strand, 14148584 - 14148654
Alignment:
Q  240 tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaa---gatgatatcactatatcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||| |||||   |||||||||| ||||||||    
T  14148584 tatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaagtcacacaacaacaggatgatatcattatatcaa 14148654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 522; Significance: 0; HSPs: 100)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 22321312 - 22320731
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321312 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22321213  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22321212 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 22321113  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22321112 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 22321013  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  22321012 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 22320913  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22320912 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 22320813  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22320812 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 22320731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 22327465 - 22326884
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22327465 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22327366  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22327365 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 22327266  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22327265 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 22327166  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  22327165 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 22327066  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22327065 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 22326966  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22326965 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 22326884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 26877893 - 26877313
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26877893 gacaattctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacatg 26877794  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26877793 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaaactcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatc-acttatcaacat 26877695  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  26877694 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatgtcattat 26877595  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  26877594 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 26877495  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26877494 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 26877395  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26877394 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 26877313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 27617077 - 27617657
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27617077 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27617176  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27617177 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 27617275  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27617276 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcaacataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 27617375  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  27617376 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattattattaatataacttaaacaa 27617475  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |    
T  27617476 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacactcaggaa 27617575  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27617576 actacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccgtggcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 27617657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 24914292 - 24913709
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24914292 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 24914193  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24914192 cggaggacaaaactcctaatcatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 24914093  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24914092 gcatccaataatttggagctaaacttcatcgtataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 24913993  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||| ||| |||    
T  24913992 tatcaatagcacatcaattgcatcataatcaaactttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaacatatcttaaac 24913893  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24913892 aactctacagactgcatttaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacacacaag 24913793  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  24913792 caacttcattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccacggcgagtaccactcaactcccaaactagtgttgttc 24913709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 29233309 - 29233890
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29233309 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatataatttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 29233408  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  29233409 cggaggacaaagctcctaataatcgcggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 29233508  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  29233509 gcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 29233607  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa-ca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||||| ||    
T  29233608 atcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacactagttcatgttcaattaatatcaacataacttaacca 29233707  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |    
T  29233708 actctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcacccttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaactcacaagc 29233807  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29233808 aactacatcctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgtcgtggcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 29233890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 29346608 - 29347189
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346608 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatataatttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 29346707  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  29346708 cggaggacaaagctcctaataatcgcggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 29346807  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  29346808 gcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 29346906  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa-ca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||||| ||    
T  29346907 atcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacactagttcatgttcaattaatatcaacataacttaacca 29347006  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |    
T  29347007 actctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcacccttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaactcacaagc 29347106  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29347107 aactacatcctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgtcgtggcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 29347189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 571
Target Start/End: Original strand, 27599043 - 27599613
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27599043 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27599142  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27599143 cggaggacaaagctcctaatattcatggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 27599242  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||    
T  27599243 gcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacgagttgatatcatta 27599341  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||| || ||||||| |||    
T  27599342 tatcaatagcacataaattgcatcattatcaagctttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccaattaatatcaacataacttaaac 27599441  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27599442 aactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttattactagttaggggttcactctagatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacacacaag 27599541  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27599542 caactgcatcctggctgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaa 27599613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 571
Target Start/End: Original strand, 23170817 - 23171387
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23170817 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 23170916  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  23170917 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatggacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 23171016  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||    
T  23171017 gcatccagtaatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacagaagcagcataaacaactcacataacaaaatgatatcattat 23171116  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| |||  |||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  23171117 atcaatagcttataaattgcatcattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaacataacttaaaca 23171216  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  23171217 actctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 23171316  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23171317 aactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaa 23171387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 571
Target Start/End: Original strand, 23582074 - 23582644
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23582074 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 23582173  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  23582174 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatggacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 23582273  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||    
T  23582274 gcatccagtaatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacagaagcagcataaacaactcacataacaaaatgatatcattat 23582373  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| |||  |||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  23582374 atcaatagcttataaattgcatcattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaacataacttaaaca 23582473  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  23582474 actctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 23582573  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23582574 aactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaa 23582644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 571
Target Start/End: Original strand, 1842862 - 1843432
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1842862 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaatgtg 1842961  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1842962 cggaggacaaagctcctaatattcgtggcgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 1843061  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  1843062 gcatccaataatttggagct-aacttcatcatatatttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacgagatgatatcatta 1843160  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||| || ||||||| |||    
T  1843161 tatcaatagcacataaattgcatcattatcaagttttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccaattaatatcaacataacttaaac 1843260  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||     
T  1843261 aactctacagactgcattaaacgttatcattaggtcttattactagttaggggttcactctagatcaacacgtgcgacacagatcgcaccaacacacaag 1843360  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1843361 caactgcatcctggttgtgctcgcgaagcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaa 1843432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 16928135 - 16928717
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16928135 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 16928234  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  16928235 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 16928333  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  16928334 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 16928433  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-ac 399  Q
    |||||| ||||| ||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  16928434 tatcaatagcacgtaaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacgatacattaattcatattcaattaatatcaatataacctagac 16928533  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |      
T  16928534 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagctaggggttcactcttgatcaacaggtgcgacacagatcgcacagacactcagg 16928633  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16928634 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 16928717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 16996829 - 16997411
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16996829 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 16996928  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  16996929 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 16997027  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  16997028 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 16997127  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-ac 399  Q
    |||||| ||||| ||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  16997128 tatcaatagcacgtaaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacgatacattaattcatattcaattaatatcaatataacctagac 16997227  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |      
T  16997228 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagctaggggttcactcttgatcaacaggtgcgacacagatcgcacagacactcagg 16997327  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16997328 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 16997411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 17003462 - 17004044
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17003462 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 17003561  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  17003562 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 17003660  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  17003661 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 17003760  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-ac 399  Q
    |||||| ||||| ||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  17003761 tatcaatagcacgtaaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacgatacattaattcatattcaattaatatcaatataacctagac 17003860  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |      
T  17003861 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagctaggggttcactcttgatcaacaggtgcgacacagatcgcacagacactcagg 17003960  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17003961 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 17004044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 10873317 - 10873900
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873317 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 10873416  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  | | |||||||    
T  10873417 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacagaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 10873515  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||    
T  10873516 tgcatccaataatttggagctaaacattatcatatacatatgcacttagttaaataacagaagcagcataaacaagtcacacagcaagatgatatcatta 10873615  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata-acttaa- 398  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  |||||     
T  10873616 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatactcaattaatatcaatatagtcttaag 10873715  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  10873716 caactctacaggctgcagtaaacatcatcactaggtctcaatgccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcgcaaacactcaa 10873815  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  10873816 gcaactaccttctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 10873900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 12828851 - 12829431
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12828851 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattagtatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 12828950  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  12828951 cggaggacaaaactcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 12829050  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  12829051 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 12829150  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    ||| || ||||  | ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  || |||||    || ||  |||||      
T  12829151 tataaatagcaactcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgctcaattaacgacaacatgtcttaaag 12829248  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
     || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  12829249 gctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttaattaccaattaggggttcactcttgatcaacatgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 12829348  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  12829349 aactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 12829431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 37318040 - 37318636
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37318040 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcaaaagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcatg 37318139  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||| || |||||||||    
T  37318140 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcatatgcacaaatcaccgtaatcaacatatcaacat 37318239  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatc--------------atatac-ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||              |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  37318240 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcgtttcatcatgtatatatacactatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataaca 37318339  T
Q  288 agatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatatt 386  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| || | |  ||| |||||| ||  | | ||||||||| ||  ||||| || ||||||||     
T  37318340 ggatgatatcattatatcaatagcacatcaattgtatcataattaaactttcatatcttacataattgtacaatacatta-atcatactcaattaatatc 37318438  T
Q  387 aaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcg 485  Q
    || ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  37318439 aacatatcttaaacagctttacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattatcataagggggttcactcttgatccaaacatgcgacacagatcg 37318538  T
Q  486 cacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||  ||   | | ||  ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||    
T  37318539 cacaaacactcaagacactccaagctggaagtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccaaacaattcccaaactaaagttgttc 37318636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 116 - 583
Target Start/End: Original strand, 10866263 - 10866733
Alignment:
Q  116 tcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactta-tcaacatgcatccaataat 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  10866263 tcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacagaaca-cgtaatcatcgtaatcaacatgcatccaataat 10866361  T
Q  215 ttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatatcaa-agcaca 313  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10866362 ttggagctaaacattatcatatacatatgcacttagttaaataacagaagcagcataaacaagtcacacagcaagatgatatcattatatcaatagcaca 10866461  T
Q  314 taatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata-acttaa-caactctacagtc 411  Q
    ||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||||| ||||||||||| |    
T  10866462 taaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatactcaattaatatcaatatagtcttaagcaactctacaggc 10866561  T
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  || ||| | | | ||    
T  10866562 tgcagtaaacatcatcactaggtctcaatgccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcgcaaacactcaagcaactaccttct 10866661  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  10866662 ggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 10866733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 41610971 - 41610373
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||    
T  41610971 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagcttctaataatcgtg 41610872  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41610871 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgttatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 41610772  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  41610771 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatatatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 41610672  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||| || | |  | | |||||| ||  ||| ||||||||| ||  ||||| || || ||||    
T  41610671 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatatcataattaaacttccatatcttacataaatgtacaatacatta-atcatactcaatcaata 41610573  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  41610572 tcaacatatcttaaacagctttacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacagat 41610473  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  | |  |    |  ||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  41610472 cgcacaaacactcataacacacaaggctggaggtgctcgcgaggcgagagttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 41610373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Original strand, 24714476 - 24714984
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  24714476 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 24714575  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24714576 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 24714675  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  24714676 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 24714775  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  24714776 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 24714874  T
Q  385 ttaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatc 484  Q
    | || ||| |||||  |  |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||    
T  24714875 tcaacatatcttaaacagcctacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaatc 24714974  T
Q  485 gcacaaacac 494  Q
    ||||||||||    
T  24714975 gcacaaacac 24714984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 41605071 - 41604476
Alignment:
Q  6 aatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcgg 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  41605071 aatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtgcgg 41604972  T
Q  106 aggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgca 205  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41604971 aggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgttatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacatgca 41604872  T
Q  206 tccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaa 288  Q
    ||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||| ||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||     
T  41604871 tccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatatatacaatgcagttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataacag 41604772  T
Q  289 gatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatatta 387  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||| || | |  | | |||||| ||  ||| ||||||||| ||  ||||| || || ||||| |    
T  41604771 gatgatatcattatatcaatagcacatcaattatatcataattaaacttccatatcttacataaatgtacaatacatta-atcatactcaatcaatatca 41604673  T
Q  388 aaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgc 486  Q
    | ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41604672 acatatcttaaacagctttacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgc 41604573  T
Q  487 acaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||  | |  |    |  ||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  41604572 acaaacactcataacacacaaggctggaggtgctcgcgaggcgagagttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 41604476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 13970711 - 13970114
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  13970711 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 13970612  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13970611 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 13970512  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  13970511 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 13970412  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  13970411 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 13970313  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  13970312 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 13970214  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  | |  | |  |  ||||  || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  13970213 cgcacaaacactcataacactcaaggctggaggtgctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 13970114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 45057767 - 45057259
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  45057767 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 45057668  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  45057667 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggaatcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 45057568  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  45057567 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 45057468  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  45057467 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 45057369  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||  ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  45057368 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacatcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 45057270  T
Q  484 cgcacaaacac 494  Q
    |||||||||||    
T  45057269 cgcacaaacac 45057259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 9340041 - 9340227
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340041 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 9340140  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9340141 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 9340227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 9488675 - 9488861
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9488675 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 9488774  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9488775 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 9488861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 9607936 - 9608122
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9607936 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 9608035  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9608036 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 9608122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 16922290 - 16922476
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16922290 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16922389  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16922390 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 16922476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19490272 - 19490086
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19490272 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 19490173  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19490172 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 19490086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 27215824 - 27216010
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27215824 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27215923  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27215924 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 27216010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28432260 - 28432074
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28432260 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 28432161  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28432160 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 28432074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13306937 - 13306751
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13306937 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 13306838  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13306837 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacagaacatcataatc 13306751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 16985702 - 16985888
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16985702 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16985801  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16985802 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacagaacatcataatc 16985888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 10865952 - 10866162
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10865952 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 10866051  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  | | |||||||    
T  10866052 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgttatgcatggacacttatgaacagaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 10866150  T
Q  202 tgcatccaataa 213  Q
    ||||||||||||    
T  10866151 tgcatccaataa 10866162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30971325 - 30971091
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30971325 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcg 30971226  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||    
T  30971225 tgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatca 30971127  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30971126 acatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 30971091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 11677209 - 11677441
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11677209 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 11677308  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| ||| |||| |  | |||||    
T  11677309 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcattgtaaccatcatatca 11677407  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11677408 atgtgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 11677441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21147631 - 21147404
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacgt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21147631 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcgt 21147532  T
Q  102 gcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || ||||||| || ||||||     
T  21147531 gcggaggacaaag---ctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcaacatatcaat 21147436  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21147435 aagcatccaataatttggagctaaacgtcatc 21147404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24641307 - 24641075
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24641307 gcgataatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggagaacaaagctcctaataaatc 24641208  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||| |||||| || ||||||| || |||||    
T  24641207 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatgcactcttatcaacaaatcaccgtaatcaacatatca 24641109  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24641108 ataaacatccaataatttggagctaaacgtcatc 24641075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 24502881 - 24503105
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  24502881 gacaatgctcttagactccttatatgcatatggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 24502980  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||    |||||| |    
T  24502981 cggaggacaaagctccta----tcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcattatatcaata 24503074  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24503075 tgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 24503105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 27369069 - 27369256
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  27369069 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 27369168  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  27369169 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 27369256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44381540 - 44381353
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  44381540 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 44381441  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  44381440 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 44381353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 27216249 - 27216427
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27216249 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 27216348  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27216349 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggtcgttc 27216427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10102210 - 10101994
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10102210 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 10102113  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  10102112 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 10102016  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  10102015 atttggagctaaacgtcatcat 10101994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12902073 - 12901857
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902073 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 12901976  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  12901975 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 12901879  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  12901878 atttggagctaaacgtcatcat 12901857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24629036 - 24628820
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24629036 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 24628939  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  24628938 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 24628842  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  24628841 atttggagctaaacgtcatcat 24628820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 24648904 - 24649120
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24648904 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 24649001  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  24649002 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 24649098  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  24649099 atttggagctaaacgtcatcat 24649120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 27601341 - 27601557
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601341 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 27601438  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27601439 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 27601535  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  27601536 atttggagctaaacgtcatcat 27601557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 380 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 19489872 - 19489670
Alignment:
Q  380 taatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacac 479  Q
    |||||| || |||||| || | || ||||| ||||||| ||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19489872 taatatcaacataactcaatagctttacagactgcattgaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgacac 19489773  T
Q  480 agatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggtt 579  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19489772 ggatcgcaaaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaagctt 19489673  T
Q  580 gtt 582  Q
    |||    
T  19489672 gtt 19489670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27379989 - 27379773
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379989 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcaaaagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 27379892  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27379891 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 27379795  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  27379794 atttggagctaaacgtcatcat 27379773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27384035 - 27383819
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27384035 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcaaaagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 27383938  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27383937 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 27383841  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  27383840 atttggagctaaacgtcatcat 27383819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 27375579 - 27375766
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  27375579 gacaatgctcctagaatccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 27375678  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  27375679 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggttaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 27375766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 13306512 - 13306334
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13306512 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 13306413  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  13306412 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 13306334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 16922715 - 16922893
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16922715 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 16922814  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16922815 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 16922893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 16986127 - 16986305
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16986127 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 16986226  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16986227 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 16986305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 28431835 - 28431657
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28431835 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 28431736  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  28431735 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 28431657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44388210 - 44388023
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||    
T  44388210 gacaatgctcctagacttcgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggataaagctcctaataatcgtg 44388111  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  44388110 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgttatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 44388023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 9340466 - 9340644
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9340466 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 9340565  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  9340566 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 9340644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 9489100 - 9489278
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9489100 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 9489199  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  9489200 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 9489278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 9608361 - 9608539
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9608361 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 9608460  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  9608461 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 9608539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19928798 - 19928607
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||     
T  19928798 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctccta- 19928703  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  19928702 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttgga 19928608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30345573 - 30345381
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  30345573 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 30345477  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  30345476 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 30345382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18855755 - 18855564
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18855755 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaagacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 18855659  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  18855658 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 18855565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24872660 - 24872519
Alignment:
Q  94 taaaacgtgcggaggacaaagctcctaatat-tcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcga 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||||| |    
T  24872660 taaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcattgtaatcaa 24872562  T
Q  192 cttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24872561 catatcaacatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 24872519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24880545 - 24880404
Alignment:
Q  94 taaaacgtgcggaggacaaagctcctaatat-tcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcga 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||||| |    
T  24880545 taaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcattgtaatcaa 24880447  T
Q  192 cttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24880446 catatcaacatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 24880404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Original strand, 41666759 - 41666895
Alignment:
Q  23 tatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  41666759 tatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa- 41666854  T
Q  123 attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
      || |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  41666855 --tcatggtgaggacaaaactcaatga-atgctaatgcatggac 41666895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 60626 - 60817
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||     
T  60626 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaa-ttccta- 60721  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  60722 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatcacttatgcttccaataatttgga 60816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 31344686 - 31344823
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||| ||||    
T  31344686 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagcttct---aatcgtgcggaggacaaagcttctaa 31344782  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31344783 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 31344823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 23186885 - 23187053
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||     
T  23186885 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggacgacaaagctcct---caacgtgtggaggacaaagctccta- 23186980  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  23186981 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatca 23187053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 23598148 - 23598316
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||     
T  23598148 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggacgacaaagctcct---caacgtgtggaggacaaagctccta- 23598243  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  23598244 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatctacttatca 23598316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24872725 - 24872609
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24872725 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcg 24872626  T
Q  101 tgcggaggacaaagctc 117  Q
    ||  |||||| ||||||    
T  24872625 tggtgaggactaagctc 24872609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24880610 - 24880494
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24880610 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcg 24880511  T
Q  101 tgcggaggacaaagctc 117  Q
    ||  |||||| ||||||    
T  24880510 tggtgaggactaagctc 24880494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 26124993 - 26125090
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  26124993 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcacaagtattaatatactttcgtcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 26125089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 27195513 - 27195605
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27195513 gcgacattgctcttagactccttatatgcttgtggtaccaatcgtcatcataggtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctccta 27195605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 1282937 - 1283008
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1282937 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 1283008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 41531562 - 41531491
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531562 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 41531491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 378 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 44381142 - 44380960
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44381142 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcattaggtttcattaccagttaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgac 44381043  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  44381042 acagatcacacaaccac-tcaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactc 44380960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 44387812 - 44387630
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44387812 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcattaggtttcattactagttaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgac 44387713  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  44387712 acagatcacacaaccac-tcaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactc 44387630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21147205 - 21147061
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  21147205 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaatgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaggcactccaatct 21147106  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21147105 ggaagtgctcgcgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 21147061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22461484 - 22461295
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    |||| ||||||||||||||| ||    
T  22461484 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-agttttaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcatat----cgtgtggaggacaaagctccgaa 22461390  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  | |  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  22461389 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactta-aacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 22461296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 24640876 - 24640730
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  24640876 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaactaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaatgcactccaatct 24640777  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtacca 558  Q
    ||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24640776 ggaggtgctcgcgaggcgagagttcctactcgccatggcgagtacca 24640730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21139187 - 21139043
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  21139187 tgcattaaatgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaggcactccaatct 21139088  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21139087 ggaagtgctcgcgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 21139043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 412 - 575
Target Start/End: Original strand, 27197075 - 27197238
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  27197075 tgcattaaacatcgtcattaggtctcattaccaattagggattcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacactccaatct 27197174  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaa 575  Q
    ||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||    
T  27197175 ggaagtgctcgcgaggcgagagttcctactcgccatggcgagtaccagtcaatttccaaactaa 27197238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Original strand, 27369458 - 27369662
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  27369458 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaactaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 27369557  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | | | || |   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  27369558 acagatcgcacaaccactcaaacagctacgttctagacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 27369657  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  27369658 ttgtt 27369662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Original strand, 27375968 - 27376172
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  27375968 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaactaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 27376067  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||| ||||| |||  |||||  | | | || |   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  27376068 acagatctcacaaccactcaaacagctacgttctagacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 27376167  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  27376168 ttgtt 27376172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 494
Target Start/End: Original strand, 24503300 - 24503382
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24503300 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcgctcctgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacac 24503382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 165
Target Start/End: Original strand, 27195581 - 27195650
Alignment:
Q  96 aaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27195581 aaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggac 27195650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 30657621 - 30657567
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30657621 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtat 30657567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 24735202 - 24735362
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    || ||||  |||||||||||||     
T  24735202 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-agtattaatatactttaagcatcgtggggaggacaaagctcc----aatcgtggtgaggacaaagctc- 24735295  T
Q  119 taatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
        | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  24735296 ---aaatcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatc 24735362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 510 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 10101463 - 10101390
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  10101463 ctggatgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 10101390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 30970902 - 30970751
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca-ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaag 503  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||   |     
T  30970902 tacagactgcattaaacgtcatcatt-ggtctcaattaccataagggggttctctcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacac 30970804  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    | || |||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30970803 tccaacctggaagtgctcgcgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 30970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 19645856 - 19645749
Alignment:
Q  449 ggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatg 548  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | || |||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19645856 ggggttctctcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaggcactccaacctggaagtgctcgcgaggcgagaattcttactcgccatg 19645757  T
Q  549 gcgagtac 556  Q
    ||||||||    
T  19645756 gcgagtac 19645749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 24880171 - 24880064
Alignment:
Q  449 ggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatg 548  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||   | |  |  ||||   | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24880171 ggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacactcaaagctggaaatgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatg 24880072  T
Q  549 gcgagtac 556  Q
    ||||||||    
T  24880071 gcgagtac 24880064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 165
Target Start/End: Original strand, 1282987 - 1283050
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1282987 cgtgcggaggacaaagctcctaa---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 1283050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 24872216 - 24872179
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24872216 ctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtac 24872179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41531512 - 41531449
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41531512 cgtgcggaggacaaagctcctaa---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 41531449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24641053 - 24640983
Alignment:
Q  240 tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaa---gatgatatcactatatcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||    
T  24641053 tatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaggtcacacaacaacaggatgatatcaatatatcaa 24640983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24872330 - 24872241
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca-ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||    
T  24872330 tacagactgcattaaacgtcatcatt-ggtctcaattaccataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacatagatcgcacaaacac 24872241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22134546 - 22134501
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  22134546 ttatatgcatgtggtaccaatcaacgtaataagtattaatatactt 22134501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 19691942 - 19691914
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691942 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatca 19691914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 583
Target Start/End: Original strand, 24715009 - 24715073
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  24715009 ctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 24715073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 45057234 - 45057170
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  45057234 ctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 45057170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 518; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 518; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 17669896 - 17669315
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669896 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 17669797  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17669796 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 17669697  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17669696 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 17669597  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  17669596 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgagtatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 17669497  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17669496 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 17669397  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17669396 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 17669315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 17676548 - 17675967
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17676548 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 17676449  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17676448 cggaggacaaaactcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 17676349  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17676348 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 17676249  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  17676248 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgagtatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 17676149  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17676148 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 17676049  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17676048 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 17675967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 21915895 - 21915315
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915895 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 21915796  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21915795 cggaggacaaagctcctaatattcatggtgaggactaagctcaatggtatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 21915697  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21915696 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 21915597  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  21915596 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 21915497  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21915496 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattatcagttgggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 21915397  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21915396 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaaggttgttc 21915315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 5534765 - 5534184
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5534765 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 5534666  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5534665 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagttcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaatatcgtaatcaacttatcaacat 5534566  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  5534565 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagtttaataacggaagcagcataaataggtcacataacaagatgatatcattat 5534466  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  5534465 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatatgatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 5534366  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5534365 ctctacagtctgcattaaacgacatcattaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacgagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 5534266  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5534265 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaaggttgttc 5534184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 22083610 - 22084192
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22083610 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22083709  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22083710 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 22083809  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  22083810 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcattat 22083909  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  22083910 atcaatagcacataaattgcattattatcacatcttctcattttgcatgaatatacaataccatagttcttatccaattaatattaatataacttaaaca 22084009  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22084010 actctacagtctgcattaaacaacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatc 22084109  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22084110 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagctcttactcgccatggcgagtacccctcaactcccaaactaaggttgttc 22084192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 20020266 - 20019685
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20020266 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 20020167  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20020166 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 20020068  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20020067 gcatccaataacttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 20019968  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-aca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||| |||| ||  |||| ||| || |||||||  || ||||| ||     
T  20019967 atcaatagcacataaattgtatcattatcaactcttcatatcttgcataaatatacattacattaactcatgttcaatcaatattatcatgacttagact 20019868  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20019867 actctacggactgcatttaacaacatcactaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacactgatcgcacaaacacacaaac 20019768  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20019767 aagttcatcctggttgtactcgcaaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 20019685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 20014189 - 20013609
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20014189 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 20014090  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20014089 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 20013991  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20013990 gcatccaataacttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 20013891  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-aca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||| |||| ||  |||| ||| || |||||||  || ||||| ||     
T  20013890 atcaatagcacataaattgtatcattatcaactcttcatatcttgcataaatatacattacattaactcatgttcaatcaatattatcatgacttagact 20013791  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  20013790 actctacggactgcatttaacaacatcactaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacactgatcgcac-aacacacaaac 20013692  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20013691 aagttcatcctggttgtactcgcaaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 20013609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 8355092 - 8354508
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8355092 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtgccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 8354993  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  8354992 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacagaacatcgtaatcaacatatcaacat 8354893  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa-caagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  8354892 gcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaataacgaaagcagcataaacaagtcacataatcaagatgatatcatta 8354793  T
Q  302 tatcaa-agcacat-aatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataa-cttaa 398  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |  |||| ||| ||| ||||||||||| |||| || ||    
T  8354792 tatcaatagcacataaaattgcatctttatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatgccttagtccatgttcaattaatattaacataacctaaa 8354693  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  8354692 caactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaactcacaa 8354593  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8354592 gcaactacatcctggctgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccgtggcgaataccactcaactcccaaactaagcttgttc 8354508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 19111006 - 19111587
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19111006 gacaatgctcctagactctt-atatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 19111104  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  19111105 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 19111203  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  19111204 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 19111303  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-ac 399  Q
    |||||| ||||| ||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  19111304 tatcaatagcacgtaaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacgatacattaattcatattcaattaatatcaatataacctagac 19111403  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |      
T  19111404 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagctaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacagacactcagg 19111503  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19111504 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 19111587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 19117297 - 19117878
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19117297 gacaatgctcctagactctt-atatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 19117395  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  19117396 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 19117494  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  19117495 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 19117594  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-ac 399  Q
    |||||| ||||| ||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  19117595 tatcaatagcacgtaaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacgatacattaattcatattcaattaatatcaatataacctagac 19117694  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |      
T  19117695 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagctaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacagacactcagg 19117794  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19117795 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 19117878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 19496168 - 19496751
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19496168 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 19496267  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  19496268 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 19496366  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||    
T  19496367 tgcatccaataatttgaagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacagaagcagcataaacaagtcacacagcaagatgatatcatta 19496466  T
Q  302 tatca-aagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata-actt-aa 398  Q
    |||||  ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||| ||    
T  19496467 tatcattagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatactcaattaatatcaatatagtcttaaa 19496566  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  19496567 caactctacaggctgcagtaaacatcatcactaggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactcaa 19496666  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  19496667 gcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 19496751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 22123714 - 22123130
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22123714 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcctgcggaggacaaagctcctataaaacg 22123615  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  22123614 tgcggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactgagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaaacatcgtaatcaacatatcaa 22123515  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22123514 catgcatccaataatttggagct-aacttcatcataaacttatgcacttagttaaataacgggagcagcataaacaggtcacataaacaaaatgatatca 22123416  T
Q  299 ctatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt- 396  Q
     |||||||| |||  |||| |   |  | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| || |||||||     
T  22123415 ttatatcaatagcttataaatatcaggaatatca-accttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataactta 22123317  T
Q  397 aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacat 496  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  22123316 aacaactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactaggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactc 22123217  T
Q  497 aaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  22123216 aaacaagtacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggagagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 22123130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 22116048 - 22115465
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22116048 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22115949  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  22115948 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggaccaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatggacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 22115849  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  22115848 tgcatccagtaatttggagctaaacttaatcatatacttatgcacttagttaaataagggaagcagcataaacaagtcacataacaaaatgatatcatta 22115749  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| |||  |||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||    
T  22115748 tatcaatagcttataaattgcatcattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaacataacttaaac 22115649  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  |||    
T  22115648 aactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcac-tacactcaaa 22115550  T
Q  500 c-aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    | || | ||| ||||     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  22115549 caaactacattctgggctagctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 22115465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 22047724 - 22048307
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047724 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22047823  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  | | |||||||    
T  22047824 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacagaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 22047922  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||    
T  22047923 tgcatccaataatttggagctaaacattatcatatacatatgcacttagttaaataacagaagcagcataaacaagtcacacagcaagatgatatcatta 22048022  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata-actt-aa 398  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||| ||    
T  22048023 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatactcaattaatatcaatatagtcttaaa 22048122  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  22048123 caactctacaggctgcagtaaacatcatcactaggcctcaatgccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactcaa 22048222  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  22048223 gcaactaccttctggttatactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 22048307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 3 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 22124856 - 22124296
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22124856 gacaatgctcctagactccttatatgcacgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcatgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22124757  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  22124756 cggaggacaaatctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatggacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 22124657  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  22124656 tgcatccagtaatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaaaatgatatcatta 22124557  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| |||  |||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||    
T  22124556 tatcaatagcttataaattgcatcattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatcttcaattaatatcaacataacttaaac 22124457  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||  |||    
T  22124456 aactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcgctcttaatcaacacgtgcgacacagatcgcac-tacactcaaa 22124358  T
Q  500 c-aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccact 560  Q
    | || | ||| || |     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22124357 caaactacattctaggctagctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccact 22124296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 18865109 - 18865692
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18865109 gacaatgctcttagactccttatgtgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaacgtg 18865208  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  18865209 cgaaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 18865308  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  18865309 gcatccaataatttggagctaaacttgatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 18865408  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   || ||  ||||| |    
T  18865409 tatcaatagcaaatcatttgcatcataattaaactttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatgacaacatgtcttaaaa 18865508  T
Q  401 -actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
      || |||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||  ||     
T  18865509 ggctttacagattacattaaacgtcatcactaggtttcattaccaattaggggttccctctcgatcagcacgggcgacacagaacgcacaaacactcaag 18865608  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  18865609 caactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 18865692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16883498 - 16882917
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883498 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16883399  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  16883398 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 16883299  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16883298 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 16883199  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  || |||||    || ||  ||||| |    
T  16883198 tatcaatagcaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgctcaattaacgacaacatgtcttaaaa 16883101  T
Q  401 -actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
      || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  16883100 ggctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaag 16883001  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||    
T  16883000 caactacattctggttgtgctcgcgaggcgaaagttcttactcgccatggcgagtaccgctcatctcccaaactagtgttgttc 16882917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 29122866 - 29123446
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29122866 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctactataaaacgtg 29122965  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||||| || |||||||||    
T  29122966 cggaggacaaagctcctaataaatgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacactgtaatcaacatatcaacat 29123065  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  29123066 gcatccaataatttggagctaaactttatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 29123165  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  |  |||||    || ||  |||||      
T  29123166 tatcaacagcaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgcttaattaacgacaacatgtcttaaag 29123263  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
     || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  29123264 gctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 29123363  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |  |  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||    
T  29123364 atctaaattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatcttccaaactagtgttgttc 29123446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 3 - 444
Target Start/End: Original strand, 19498216 - 19498660
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498216 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 19498315  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  19498316 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 19498414  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||    
T  19498415 tgcatccaataatttgaagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacagaagcagcataaacaagtcacacagcaagatgatatcatta 19498514  T
Q  302 tatca-aagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata-actt-aa 398  Q
    |||||  ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||| ||    
T  19498515 tatcattagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatactcaattaatatcaatatagtcttaaa 19498614  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattacca 444  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  19498615 caactctacaggctgcagtaaacatcatcactaggtctcaatacca 19498660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 99 - 583
Target Start/End: Original strand, 18854810 - 18855297
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18854810 cgtgcggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatca 18854909  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18854910 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatc 18855009  T
Q  298 actatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt 396  Q
    | |||||||| |||| || ||||  ||||| || | |  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   || ||  |||    
T  18855010 attatatcaatagcaaatcattttcatcataattaaactttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatgacaacatgtctt 18855109  T
Q  397 aaca-actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacaca 495  Q
    || |  || |||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||     
T  18855110 aaaaggctttacagattacattaaacgtcatcactaggtttcattaccaattaggggttccctctcgatcagcacgggcgacacagatcgcacaaacact 18855209  T
Q  496 taaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||    
T  18855210 caagcaactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccacactagtgttgttc 18855297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23846104 - 23845595
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  23846104 gacaatgctcatagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 23846005  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23846004 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 23845905  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  23845904 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatatatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 23845805  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||| || | |  | | |||||| ||  ||| ||||||||| ||  ||||| || || ||||    
T  23845804 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatatcataattaaacttccatatcttacataaatgtacaatacatta-atcatactcaatcaata 23845706  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  23845705 tcaacatatcttaaacagctttacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacagat 23845606  T
Q  484 cgcacaaacac 494  Q
    |||||||||||    
T  23845605 cgcacaaacac 23845595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20024270 - 20023762
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  20024270 gacaatgctcttagactccttatatgaatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 20024171  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20024170 cggaggacaaaactcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 20024071  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| || ||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  20024070 gcatccaacaacttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 20023971  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  20023970 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 20023872  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||    
T  20023871 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacaccaat 20023773  T
Q  484 cgcacaaacac 494  Q
    |||||||||||    
T  20023772 cgcacaaacac 20023762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 28454529 - 28454715
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28454529 gacaatgctcttagacttcttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 28454628  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28454629 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 28454715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 19905258 - 19905490
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19905258 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 19905357  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||||  | |||||    
T  19905358 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcatcatatca 19905456  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19905457 atatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 19905490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26935522 - 26935288
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26935522 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcg 26935423  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||    
T  26935422 tgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatca 26935324  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26935323 acatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 26935288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 556
Target Start/End: Original strand, 3216025 - 3216595
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaat-cgtgcggaggacaaagctccta-taaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  3216025 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataagtcg 3216124  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatat-tcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| ||  |||||| || |||||    
T  3216125 tgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcactgtaatcaacatatca 3216223  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatatacc-----tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||       |||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||||||    
T  3216224 acatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatatagacattatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaagtcacataa 3216323  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| |||| || | ||| ||||| || | |  ||| |||||| ||  | | ||||||||  || | |||  || |||||||    
T  3216324 caggatgatatcattatatcaatagcaaatcaattgcatcataattaaactttcatatcttacataattgtacaatactttaat-catgctcaattaata 3216422  T
Q  385 ttaaaataacttaa-caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca-ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacaga 482  Q
    | || ||| ||||| || || ||||| |||  ||||||| ||||| | ||||||| ||||||    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||    
T  3216423 tcaatatatcttaaacagctttacagactgtcttaaacgtcatcatt-ggtctcaattaccataagggggttctctcttgatccaaacgtgcgacacaga 3216521  T
Q  483 tcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||||||||||||  ||   | | || |||||  || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3216522 tcgcacaaacactcaagacactccaacctggaagtgctcgcgagacgagaattcttactcgccatggcgagtac 3216595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 20527218 - 20527444
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  20527218 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 20527317  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  20527318 tgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 20527411  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20527412 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 20527444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 22111480 - 22111696
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111480 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 22111577  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22111578 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 22111674  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  22111675 atttggagctaaacgtcatcat 22111696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 43251360 - 43251576
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251360 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 43251457  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  43251458 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 43251554  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  43251555 atttggagctaaacgtcatcat 43251576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 28454942 - 28455120
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28454942 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataagcaagt 28455041  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  28455042 tcatcctggttgtactcccgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactgagcttgttc 28455120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21973138 - 21972922
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973138 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaataaacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 21973041  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         ||||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  21973040 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgcaatcaacatatcatcatgcatccaata 21972944  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  21972943 atttggagctaaacatcatcat 21972922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21977229 - 21977013
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21977229 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 21977132  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         ||||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  21977131 ---tcgtggtgaggacaaaactcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgcaatcaacatatcatcatgcatccaata 21977035  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  21977034 atttggagctaaacgtcatcat 21977013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 15531698 - 15531890
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  15531698 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 15531794  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  15531795 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttgga 15531889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 18065097 - 18065285
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  18065097 gacaatgctcctagactccgtacatgcatgtggtaccaatcgtcatcataaatataaatatactttaatcgtgcggaggacaaatctcctaataatcgtg 18065196  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacat-atgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || | |||||||||||||||    
T  18065197 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaataaccaaaacatcgtaatc 18065285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24445803 - 24445611
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  24445803 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 24445707  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||||||||||||||    
T  24445706 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaatttatcacatatacatccaataatttgga 24445612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23847311 - 23847120
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||     
T  23847311 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctccta- 23847216  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  23847215 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttgga 23847121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 15538257 - 15538449
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  15538257 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 15538353  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||| ||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  15538354 ---ttgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaatatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttgga 15538448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 21410474 - 21410611
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21410474 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 21410570  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21410571 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 21410611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 21804966 - 21805103
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21804966 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 21805062  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21805063 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 21805103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18863227 - 18863090
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  18863227 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 18863131  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18863130 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 18863090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21828596 - 21828459
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  21828596 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 21828500  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21828499 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 21828459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30940659 - 30940522
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  30940659 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 30940563  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30940562 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 30940522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 18854741 - 18854855
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18854741 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaacgtg 18854840  T
Q  103 cggaggacaaagctc 117  Q
      |||||| ||||||    
T  18854841 gtgaggactaagctc 18854855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17828879 - 17828687
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  17828879 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcattgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 17828783  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| || ||||| | || ||||||||||||||||    
T  17828782 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgttaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacctatcacatatacatccaataatttgga 17828688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 32598487 - 32598608
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  32598487 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctccta- 32598583  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       || |||||||||| |||||||||||    
T  32598584 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga 32598608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 32605019 - 32605140
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  32605019 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctccta- 32605115  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       || |||||||||| |||||||||||    
T  32605116 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga 32605140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17055673 - 17055539
Alignment:
Q  25 tatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||       
T  17055673 tatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa--- 17055580  T
Q  125 tcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17055579 tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 17055539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30309049 - 30308913
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||     
T  30309049 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgtggaggacaaagctccta- 30308954  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30308953 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 30308913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 22044694 - 22044884
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |     
T  22044694 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccga- 22044788  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  22044789 ---tcgtggtgacgacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 22044883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16231770 - 16231581
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |     
T  16231770 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccga- 16231677  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  16231676 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 16231582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14398405 - 14398236
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||    
T  14398405 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcatatgtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgtggaggacaaagctcctaa 14398309  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  14398308 ---tcttgttgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatca 14398236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 21386882 - 21387051
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | ||||||||||||    
T  21386882 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcattgtgcggaggacaaagttcct---aaacgtgcggatggcaaagctcctaa 21386978  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  21386979 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatca 21387051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20705975 - 20705896
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggag 80  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20705975 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggag 20705896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 23833983 - 23834172
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |     
T  23833983 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccga- 23834076  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  23834077 ---tcatggtgaggaaaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 23834171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 15440394 - 15440465
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15440394 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctccta 15440465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 20527639 - 20527783
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  | | ||  ||    
T  20527639 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaagcactccaatct 20527738  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  20527739 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 20527783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Original strand, 18065487 - 18065691
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || | ||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  18065487 attaatatcaacatatcttaatagcttttcagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 18065586  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| |||    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  18065587 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctgaacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 18065686  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  18065687 ttgtt 18065691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 19278822 - 19278748
Alignment:
Q  21 tttatatgcat-gtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcg-tgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19278822 tttatatgcattgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgttgcggaggacaaagctccta 19278748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19278767 - 19278628
Alignment:
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcga 191  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| |    
T  19278767 tgcggaggacaaagctcctaat---cgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaa 19278671  T
Q  192 cttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19278670 catatcatcatgcattcaataatttggagctaaacgtcatcat 19278628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 575
Target Start/End: Original strand, 19905687 - 19905849
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  19905687 tgcattaaacatcgtcattaggtctcattaccaattagggattcactcttgatcaa-atgtgcgacacagattgcacaaacactcaagacactccaatct 19905785  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaa 575  Q
    ||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||    
T  19905786 ggaagtgctcgcgaggcgagagttcctactcgccatggcgagtaccagtcaatttccaaactaa 19905849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 26935099 - 26934948
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca-ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaag 503  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||   |     
T  26935099 tacagactgcattaaacgtcatcatt-ggtctcaattaccataagggggttctctcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacac 26935001  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    | || |||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26935000 tccaacctggaagtgctcgcgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 26934948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 307
Target Start/End: Original strand, 19905512 - 19905582
Alignment:
Q  240 tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaa---gatgatatcactatatcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||| |||||   |||||||||| ||||||||    
T  19905512 tatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaagtcacacaacaacaggatgatatcattatatcaa 19905582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 516; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 516; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 10140 - 9561
Alignment:
Q  5 caatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcg 104  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10140 caatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcg 10041  T
Q  105 gaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10040 gaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacatgc 9941  T
Q  205 atccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9940 atccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattatat 9841  T
Q  305 caaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaact 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9840 caaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaact 9741  T
Q  404 ctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaag 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9740 ctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaacaag 9641  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9640 ttcatcctggttgtactcgcgaggtgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 9561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 514; Significance: 0; HSPs: 124)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 27664115 - 27663534
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27664115 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcgaaggacaaagctcctataaaacgtg 27664016  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27664015 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 27663916  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27663915 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 27663816  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  27663815 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 27663716  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27663715 ctctacagtctgcattaaatgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 27663616  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27663615 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 27663534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 41098548 - 41097967
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41098548 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 41098449  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41098448 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 41098349  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41098348 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 41098249  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  41098248 atcaaggcacataatttgtatcatcatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 41098149  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41098148 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 41098049  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41098048 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 41097967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 27670754 - 27670174
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670754 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27670655  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27670654 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 27670556  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27670555 gcatccaataacttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 27670456  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  27670455 atcaaagcatataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 27670356  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27670355 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 27670256  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27670255 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 27670174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 41769022 - 41769603
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41769022 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 41769121  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41769122 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 41769221  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  41769222 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaaggtgatatcattat 41769321  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  41769322 atcaaagcacataatttgtatcattatcacattttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 41769421  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41769422 ctctacagtctgcattaaacgacatcactatgtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 41769521  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41769522 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 41769603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 41775596 - 41776177
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41775596 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 41775695  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41775696 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 41775795  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  41775796 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaaggtgatatcattat 41775895  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  41775896 atcaaagcacataatttgtatcattatcacattttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 41775995  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41775996 ctctacagtctgcattaaacgacatcactatgtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 41776095  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41776096 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 41776177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 22264724 - 22265306
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22264724 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22264823  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22264824 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtagtcaacttatcaacat 22264923  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgata-tcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22264924 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatattcatta 22265023  T
Q  302 tatcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  22265024 tatcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatactaatataacttaaaca 22265123  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22265124 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaac 22265223  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22265224 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 22265306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 17707255 - 17706675
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17707255 gacaatgctcctagactccttatatgcaagtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 17707156  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17707155 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 17707057  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17707056 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 17706957  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataact-taacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  17706956 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataactcaaacaa 17706857  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17706856 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 17706757  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17706756 agttcatcctggttgtgctcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 17706675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 34294878 - 34294297
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34294878 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaaactcctataaaacgtg 34294779  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34294778 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 34294679  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34294678 gtatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 34294579  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  34294578 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 34294479  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34294478 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 34294379  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34294378 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccacggcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 34294297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 24472572 - 24471992
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24472572 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcttataaaacgtg 24472473  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24472472 cggaggacaa-gctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 24472374  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24472373 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 24472274  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  24472273 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 24472174  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24472173 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 24472074  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  24472073 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 24471992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 27608519 - 27609100
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608519 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27608618  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27608619 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 27608717  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27608718 gcatccaataacttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 27608817  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-aca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||| |||| ||  |||| ||| || |||||||  || ||||| ||     
T  27608818 atcaatagcacataaattgtatcattatcaactcttcatatcttgcataaatatacattacattaactcatgttcaatcaatattatcatgacttagact 27608917  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27608918 actctacagactgcatttaacaacatcactaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacacaaac 27609017  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27609018 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaattaaggttgttc 27609100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 27615125 - 27615706
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27615125 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaaactcctataaaacgtg 27615224  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27615225 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 27615323  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27615324 gcatccaataacttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 27615423  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-aca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||| |||| ||  |||| ||| || |||||||  || ||||| ||     
T  27615424 atcaatagcacataaattgtatcattatcaactcttcatatcttgcataaatatacattacattaactcatgttcaatcaatattatcatgacttagact 27615523  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27615524 actctacagactgcatttaacaacatcactaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacacaaac 27615623  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27615624 aagttcatcctggttttactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaattaaggttgttc 27615706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 23583918 - 23584501
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23583918 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 23584017  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23584018 tggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 23584117  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23584118 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 23584217  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttc-ttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||| | | ||||||  | |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||  || |||| |||    
T  23584218 atcaatagcacataaattgtatcataaacaaatcttcataaccttgcataattatacattacattagctcatgttcaattaatattatcatgacttaaac 23584317  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23584318 aactctacagactgcatctaaccacatcactaggtctcattaccagttaggggatcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacaaaaa 23584417  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23584418 caatttcgttctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccgtggcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 23584501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 22063208 - 22062626
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22063208 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22063109  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactta-tcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  22063108 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 22063010  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  22063009 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 22062910  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa-c 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  22062909 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatattcaattaatatcaatataacttaaac 22062810  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22062809 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaa 22062710  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22062709 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 22062626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 583
Target Start/End: Original strand, 23609778 - 23610263
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23609778 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatca 23609877  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23609878 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatca 23609977  T
Q  299 ctatatcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-a 397  Q
     ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  23609978 ttatatcaaagcacctgatttgtatctttatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaacagttcatattcaattaatattaatataacttaa 23610077  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23610078 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcatcaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 23610177  T
Q  498 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23610178 aacaattccattctggttgtgctcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 23610263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 583
Target Start/End: Original strand, 23841174 - 23841659
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23841174 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatca 23841273  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841274 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatca 23841373  T
Q  299 ctatatcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-a 397  Q
     ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  23841374 ttatatcaaagcacctgatttgtatctttatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaacagttcatattcaattaatattaatataacttaa 23841473  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841474 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcatcaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 23841573  T
Q  498 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23841574 aacaattccattctggttgtgctcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 23841659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 37287109 - 37286525
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37287109 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 37287010  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37287009 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaac 37286910  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |     
T  37286909 atgcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacgagatgatattat 37286811  T
Q  300 tatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-a 397  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | | |||||||| || ||||||| |    
T  37286810 tatatcaatagcacataaattgcatcattatcaaactttcatatcttgcatgaatatataatacattagttcatgtccaattaatatcaacataacttaa 37286711  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  37286710 acaactatacagactgcattaaacgtcatcattaggcctcaataccaattaggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactca 37286611  T
Q  498 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  37286610 agcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 37286525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 37293812 - 37293228
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37293812 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 37293713  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37293712 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaac 37293613  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |     
T  37293612 atgcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacgagatgatattat 37293514  T
Q  300 tatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-a 397  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | | |||||||| || ||||||| |    
T  37293513 tatatcaatagcacataaattgcatcattatcaaactttcatatcttgcatgaatatataatacattagttcatgtccaattaatatcaacataacttaa 37293414  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  37293413 acaactatacagactgcattaaacgtcatcattaggcctcaataccaattaggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactca 37293314  T
Q  498 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  37293313 agcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 37293228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 19991661 - 19992232
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19991661 gcgacaatgctcttagactctt-atatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 19991759  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19991760 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggcgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaac 19991859  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  19991860 atgcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacgagatgatatcat 19991958  T
Q  300 tatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-a 397  Q
    |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||| || ||||||| |    
T  19991959 tatatcaatagcatataaattgcatcattatcaagctttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccaattaatatcaacataacttaa 19992058  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  19992059 acaactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttattactagttaggggttcactctagatcaacacgtgcgacacagatcgcaccaacacaca 19992158  T
Q  498 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    | ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19992159 agcaactgcatcctggctgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaa 19992232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 41294760 - 41294179
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41294760 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 41294661  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| || |||||||||    
T  41294660 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgga-aaaacatcgtaatcaacatatcaacat 41294562  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  41294561 gcatccagtaatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaaaatgatatcattat 41294462  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| |||  |||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  41294461 atcaatagcttataaattgcatcattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaacataacttaaaca 41294362  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  41294361 actctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 41294262  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    || | ||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  41294261 aactacattcaagttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactagtgttgttc 41294179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 15002006 - 15001423
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15002006 gacaatgctcttagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacgaagctcctataaaacgtg 15001907  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  15001906 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 15001807  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  15001806 tgcatccaataatttggagct-aacttcatcataaacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacaaaatgatatcatt 15001708  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| ||    
T  15001707 atatcaatagcacataaattgcatcattatcaagtttccatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaa 15001608  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  15001607 caactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaatactcaa 15001508  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  15001507 gcaagttcattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 15001423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 22328489 - 22327920
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22328489 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22328390  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22328389 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 22328290  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  22328289 gcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacgagatgatatcatta 22328191  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||  ||| || ||||||| |||    
T  22328190 tatcaatagcacataaattgcatcattatcaagctttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccaatt-gtatcaacataacttaaac 22328092  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |     
T  22328091 aactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttattagtagttaggggttcactctagatcaacacgtgcgactcagatcgcacaaacacaccag 22327992  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    ||| | |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22327991 caactgcatcctggctgtgctcgcgaggcgaaagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaa 22327920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 40706901 - 40707482
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40706901 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 40707000  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  40707001 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 40707099  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  40707100 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 40707199  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataa-cttaac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||| || |||    
T  40707200 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattaattcatattcaattaatatcaatataacctaaac 40707299  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |     
T  40707300 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacagacac-tcag 40707398  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40707399 gaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 40707482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 40713543 - 40714124
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40713543 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 40713642  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  40713643 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 40713741  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  40713742 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 40713841  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataa-cttaac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||| || |||    
T  40713842 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattaattcatattcaattaatatcaatataacctaaac 40713941  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |     
T  40713942 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacagacac-tcag 40714040  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40714041 gaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 40714124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 560
Target Start/End: Original strand, 37543819 - 37544379
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37543819 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 37543918  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  37543919 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 37544017  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||    
T  37544018 tgcatccaataatttggagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacagaagcagcataaacaagtcacacagcaagatgatatcatta 37544117  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata-actt-aa 398  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| || |||  ||| ||    
T  37544118 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcgtatcttgcatgaatatacaatacattagatcatactcaattaatatcaatatagtcttaaa 37544217  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  37544218 caactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactcaa 37544317  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccact 560  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37544318 gcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacact 37544379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 14995363 - 14994780
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14995363 gacaatgctcttagactccctacatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacgaaggtcctataaaacgtg 14995264  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  14995263 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 14995164  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||      
T  14995163 tgcatccaataatttggagct-aacatcatcataaacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacaaaatgatatcata 14995065  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | | | ||||||||| |||||||||||| | |||||||| | |  ||||||| || ||||||| ||    
T  14995064 atatcaatagcacataaattgcatcattatcaagtttccatatcttgcatgaatatacaatagattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaa 14994965  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  14994964 caactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactaggggttcacttttgatcaacacgtgggacacagatcgcacaaacactcaa 14994865  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  14994864 gcaagttcattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 14994780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 33725637 - 33726220
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33725637 gacaatgctcctagactccatatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 33725736  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33725737 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgttatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 33725836  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  33725837 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacagatcacataaacaaaatgatatcatta 33725936  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||||  | ||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  33725937 tatcaatagcacataaattacatcattatcaagttttcatatcttgcatgaatgtacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaac 33726036  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||     
T  33726037 aactctacaggctgcattaaacgtctccactaggtctcaacaccgcttaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaccactcaag 33726136  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  33726137 caactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 33726220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 18038994 - 18038413
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18038994 gacaatgctcttagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcatataaaacgtg 18038895  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  18038894 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 18038795  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  18038794 tgcatccaataatttggagct-aacttcatcataaacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacaaaatgatatcatt 18038696  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| |||  |||| |   |  | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| ||    
T  18038695 atatcaatagcttataaatatcaggaatatca-accttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaa 18038597  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18038596 caactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactaggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaa 18038497  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  18038496 gcaagtacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaaagttgtt 18038413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 27516531 - 27517112
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27516531 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccagtcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27516630  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  27516631 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 27516729  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  27516730 tgcatccaataatttggagctaaactctatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 27516829  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataa-cttaac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| || |||| || |||    
T  27516830 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattaactcatattcaattaatatcaatataacctaaac 27516929  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |      
T  27516930 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactagatctcattaccagttaggggttcactctagatcaacaagtgcgacacagatcgcacagacactcagg 27517029  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  27517030 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagcaccactcaactccc-aactaagcttgttc 27517112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 27523168 - 27523749
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27523168 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccagtcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27523267  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  27523268 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 27523366  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  27523367 tgcatccaataatttggagctaaactctatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 27523466  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataa-cttaac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| || |||| || |||    
T  27523467 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattaactcatattcaattaatatcaatataacctaaac 27523566  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |      
T  27523567 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactagatctcattaccagttaggggttcactctagatcaacaagtgcgacacagatcgcacagacactcagg 27523666  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  27523667 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagcaccactcaactccc-aactaagcttgttc 27523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1692763 - 1692181
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1692763 gacaatgctcttagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 1692664  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  1692663 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactaagctcaataagatgctatgcatggacacttatgaacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 1692564  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcact 300  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  1692563 tgcatccattaaattggagct-aacttcatcataaacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacaaaatgatatcatt 1692465  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| |||  |||| |   |  | ||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| ||    
T  1692464 atatcaatagcttataaatatcaggaatatca-accttcatttcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaa 1692366  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1692365 caactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactaggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaa 1692266  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  1692265 gcaagtacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 1692181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 27687655 - 27687073
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27687655 gacaatgctcttagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggatgacaaagctcctataaaacgtg 27687556  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  27687555 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 27687456  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcact 300  Q
     ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |    
T  27687455 cgcatccattaaattggagct-aacttcatcataaacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacaaaataatatcatt 27687357  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| |||  |||| |   |  | ||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| ||    
T  27687356 atatcaatagcttataaatatcaggaatatca-accttcatttcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaa 27687258  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27687257 caactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactaggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaa 27687158  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  27687157 gcaagtacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttgctcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 27687073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 23249718 - 23250301
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23249718 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 23249817  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23249818 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 23249916  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23249917 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 23250016  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacga--atatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  |  ||||||| |||| ||| |||| ||| || ||||| |  || |||| ||    
T  23250017 atcaatagcacataaattgtatcattatcaactcttcatatcttgcataaatatatacattacattagctcatgttcaatcaatatcatcatgacttaaa 23250116  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    | ||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||  |     
T  23250117 ctactctacaaactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaatcgcacgaacactcac 23250216  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |  | |  |  ||||  || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  23250217 aacactcaaggctggaggtgctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 23250301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 22132777 - 22133359
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132777 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22132876  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  22132877 cgaaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaatatatcaacat 22132976  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22132977 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 22133076  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  || ||||||   || ||  ||||| |    
T  22133077 tatcaatagcaaatcatttgcatcataattaaactttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgctcaattaatgacaacatgtcttaaaa 22133175  T
Q  401 -actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
      || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  22133176 ggctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaag 22133275  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  22133276 caactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 22133359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 22139469 - 22140051
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22139469 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22139568  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  22139569 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatagactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 22139668  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22139669 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaatcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 22139768  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  || ||||||   ||  |  ||||| |    
T  22139769 tatcaatagcaaatcatttgcatcataattaaactttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgctcaattaatgacaacgtgtcttaaaa 22139867  T
Q  401 -actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
      || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  22139868 ggctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaag 22139967  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  22139968 caactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 22140051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 22341930 - 22341476
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341930 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 22341831  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22341830 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactatgctcaatgagatgctatgcatgggcacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaac 22341731  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcac 299  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  22341730 atgcatcaaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacgagatgatatcat 22341632  T
Q  300 tatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-a 397  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||  ||| || ||||||| |    
T  22341631 tatatcaatagcacataaattgcatcattatcaagctttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccaatt-gtatcaacataacttaa 22341533  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggtt 454  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  22341532 acaactctacatactgcattaaacgtcatcattaggtcttattactagttaggggtt 22341476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 25406204 - 25406786
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25406204 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaaactcctataaaacgtg 25406303  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  25406304 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 25406403  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  25406404 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccacatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 25406503  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || |  |||||||| ||  ||||  || |||||    || ||  ||||| |    
T  25406504 tatcaatagcaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgcacaatacatta-atcatgctcaattaacgacaacatgtcttaaaa 25406601  T
Q  401 a--ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    |  || |||||  || |||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25406602 aggctttacagattgaattaaacgtcatcattaagtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaa 25406701  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  25406702 gcaactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 25406786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 22587875 - 22588455
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22587875 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22587974  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  22587975 cggaggacaaagctcctaataaacatggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 22588074  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22588075 gcatccaataatttggagataaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 22588174  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    || ||| |||| || ||||| ||||| || | | |||| |||| | || || | |||||||| ||   ||||  || |||||    || ||  |||||      
T  22588175 taccaatagcaaatcatttgcatcataatta-accttcatatcctacatgattgtacaatac-atgaatcatgctcaattaacgacaacatgtcttaaag 22588272  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
     || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  22588273 gctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 22588372  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    || | ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  22588373 aactacattctggttgtgcttgcgaggcgagagttcttactcgccttggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 22588455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 3 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 29478280 - 29477708
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478280 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 29478181  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaa-tcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||  ||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  29478180 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgttatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaattcaacatatcaaca 29478081  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcact 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  29478080 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatt 29477981  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaac 399  Q
    ||||||| |||  || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  |  |||||    || ||  |||||     
T  29477980 atatcaacagccaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgcttaattaacgacaacatgtcttaaa 29477883  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
      || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  29477882 ggctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaag 29477783  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaacta 574  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29477782 catctaaattctagttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaacta 29477708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 17283847 - 17284427
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17283847 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataaatattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 17283946  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  17283947 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatacatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 17284046  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  17284047 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 17284146  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||   |||  || |||||    || ||  |||||      
T  17284147 tatcaacagcaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-accatgctcaattaacgacaacatgtcttaaag 17284244  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
     || |||||   |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || |    
T  17284245 gctttacagatcgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgggacacagatcgcacaaacactcaagc 17284344  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |  |  ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||    
T  17284345 atctaaattatggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatcttccaaactagtgttgttc 17284427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29471685 - 29471379
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29471685 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 29471586  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaa-tcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  29471585 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaattcaacatatcaaca 29471486  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcact 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  29471485 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatt 29471386  T
Q  301 atatcaa 307  Q
    |||||||    
T  29471385 atatcaa 29471379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 492
Target Start/End: Original strand, 24020048 - 24020552
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24020048 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatattttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgta 24020147  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  24020148 cggagtacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgttatgcatggattcttatgaacaaatcatcgtaatcaacatatcaacat 24020247  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaa 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||       ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||     
T  24020248 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcatttcatcatataaagtacactatgcacttagttaaataacagcagcagcataaacaagtcacataacag 24020347  T
Q  289 gatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatatta 387  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||  | | |  ||| |||||| ||  | |  | |||||| ||  |||||||| |||||||  |    
T  24020348 gatgatatcattatatcaatagcacatcaattgtatcatagttaaactttcatatcttacataattgcaaaatacatta-atcatattcaattaatacca 24020446  T
Q  388 aaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgc 486  Q
    | ||| ||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  24020447 acatatcttaaacaactttacaggcagcattaaacgtcatcattaggtctcattaacataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgc 24020546  T
Q  487 acaaac 492  Q
    ||||||    
T  24020547 acaaac 24020552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Original strand, 19768112 - 19768620
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  19768112 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 19768211  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  19768212 cggaggacaaagctcctaataatcgtgcggaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcatcat 19768311  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  19768312 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 19768411  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  19768412 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 19768510  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  19768511 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 19768609  T
Q  484 cgcacaaacac 494  Q
    |||||||||||    
T  19768610 cgcacaaacac 19768620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Original strand, 19774708 - 19775216
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  19774708 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 19774807  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  19774808 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaagactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcatcat 19774907  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  19774908 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 19775007  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  19775008 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 19775106  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  19775107 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 19775205  T
Q  484 cgcacaaacac 494  Q
    |||||||||||    
T  19775206 cgcacaaacac 19775216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 16354603 - 16354789
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354603 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16354702  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16354703 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 16354789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 16361262 - 16361448
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361262 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16361361  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16361362 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 16361448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 34564596 - 34564782
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34564596 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 34564695  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34564696 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 34564782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 34571251 - 34571437
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34571251 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 34571350  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34571351 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 34571437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 25106542 - 25106728
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25106542 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 25106641  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25106642 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacagatgaacaaaacatcataatc 25106728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 25165635 - 25165821
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25165635 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 25165734  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25165735 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacagatgaacaaaacatcataatc 25165821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Original strand, 22343259 - 22343493
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaat-cgtgcggaggacaaagctccta-taaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22343259 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcg 22343358  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatat-tcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  22343359 tgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaa 22343458  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22343459 catgcatctaataatttggagctaaacgtcatcat 22343493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Original strand, 22352659 - 22352893
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaat-cgtgcggaggacaaagctccta-taaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  22352659 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcagaggacaaagctcctaataaatcg 22352758  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatat-tcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  22352759 tgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaagactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaa 22352858  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22352859 catgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 22352893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22326271 - 22326038
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacgt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  22326271 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcttaataaatcgt 22326172  T
Q  102 gcggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  22326171 gcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaa 22326073  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22326072 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 22326038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22410937 - 22410751
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22410937 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22410838  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  22410837 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 22410751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15442300 - 15441788
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15442300 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 15442201  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||  ||  ||||||  | |||||    
T  15442200 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaattcactgtaatcatcatatca 15442102  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaac---------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacata 284  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||       |||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||| |    
T  15442101 atatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcttattcatcatatatagacattatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaagtcacaca 15442002  T
Q  285 acaa---gatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatc-ttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgat 379  Q
    ||||   |||||||||| ||||||||  |||  | | | | ||||| || |  || ||| |||||| ||  ||| || |||||| || |||||  || ||    
T  15442001 acaacaggatgatatcattatatcaattgcaattcaatagcatcataat-atttcattcatatcttaca-taatgtataatacattaattcatgctcaat 15441904  T
Q  380 taatattaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgaca 478  Q
    |||||| || ||| ||| |||  || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15441903 taatatcaacatatcttaaacggctttacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccataaagggattcactcttgatcaaaacgtgcgaca 15441804  T
Q  479 cagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||||||||||||||    
T  15441803 cagatcgcacaaacac 15441788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14360163 - 14359931
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  14360163 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaaactcataataaatc 14360064  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||||  | |||||    
T  14360063 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaaccaccgtaatcatcatatca 14359965  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14359964 atatgcatccaatagtttggagctaaacgtcatc 14359931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21295600 - 21295374
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  21295600 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 21295501  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  21295500 tgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 21295407  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21295406 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 21295374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 25534757 - 25534983
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  25534757 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 25534856  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  25534857 tgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 25534950  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25534951 tatgcatccaataatttggagttaaacgtcatc 25534983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 24554300 - 24554529
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctata---aa 97  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   ||    
T  24554300 gcgacaatgctcttagattccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaaaaataa 24554399  T
Q  98 acgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttat 196  Q
     ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | |||    
T  24554400 tcgtgcggaggacaaagctccta----tcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatat 24554493  T
Q  197 caacatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24554494 caatatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 24554529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Original strand, 20775648 - 20775833
Alignment:
Q  5 caatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcg 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||    
T  20775648 caatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtgcg 20775747  T
Q  105 gaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  20775748 gaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 20775833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23337634 - 23337402
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23337634 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaaacgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 23337535  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| ||  ||||||  | |||||    
T  23337534 gtgcggagtacaaagctcctaataatcgcggtgaggactgagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcactgtaatcatcatatca 23337436  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23337435 atatgcatccaataatttggagccaaacgtcatc 23337402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21668145 - 21667958
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  21668145 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 21668046  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  21668045 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 21667958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15237392 - 15237176
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15237392 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 15237295  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  15237294 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 15237198  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  15237197 atttggagctaaacgtcatcat 15237176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19473275 - 19473059
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19473275 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 19473178  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  19473177 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 19473081  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  19473080 atttggagctaaacgtcatcat 19473059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22258820 - 22258633
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  22258820 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttattcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 22258721  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  22258720 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 22258633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 29316185 - 29316372
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||    
T  29316185 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataattgtg 29316284  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  29316285 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 29316372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 20295396 - 20295612
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20295396 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgaggaggacaaagctcctaa 20295493  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  20295494 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 20295590  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  20295591 atttggagctaaacgtcatcat 20295612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 25106967 - 25107145
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25106967 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 25107066  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  25107067 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 25107145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 25166060 - 25166238
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25166060 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 25166159  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  25166160 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 25166238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 16355028 - 16355206
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16355028 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 16355127  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16355128 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 16355206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 16361687 - 16361865
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16361687 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 16361786  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16361787 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 16361865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 34565021 - 34565199
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34565021 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 34565120  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  34565121 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 34565199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 34571676 - 34571854
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34571676 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 34571775  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  34571776 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 34571854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 10752739 - 10752954
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752739 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatattttcatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 10752836  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  10752837 ---tcgtggtgaggacaaagcccaatgaaatgttatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatattatcatgcatccaata 10752933  T
Q  213 atttggagctaaacttcatca 233  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  10752934 atttggagctaaacgtcatca 10752954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40724173 - 40723977
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40724173 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagct--tctaaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 40724076  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  40724075 taatcgtggtgaagacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 40723978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 33409037 - 33409229
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  33409037 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaaactcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 33409133  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| | ||| |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  33409134 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttgatcaacttatcacatatacatccaataatttgga 33409228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27681013 - 27680912
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27681013 gacaatgctcttagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27680914  T
Q  103 cg 104  Q
    ||    
T  27680913 cg 27680912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 11230670 - 11230862
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  11230670 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 11230766  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| | ||| ||||| ||||  ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  11230767 ---tcgtggtcaggacaaagctcaatga-atgttaatgcatggactc-tatcaacaagacattttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 11230861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 11220272 - 11220393
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  11220272 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 11220368  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       ||||||| ||||| |||||||||||    
T  11220369 ---tcgtggtcaggacaaagctcaatga 11220393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17730704 - 17730531
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  17730704 ttatatgcatgtggtaccaaacgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctccta- 17730608  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  17730607 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatcaacat 17730531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 11224858 - 11224979
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  11224858 ttatatgcatgtggtaccaattgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 11224954  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       ||||||| ||||| |||||||||||    
T  11224955 ---tcgtggtcaggacaaagctcaatga 11224979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 11226691 - 11226812
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||    
T  11226691 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcttaa 11226787  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       ||||||| ||||| |||||||||||    
T  11226788 ---tcgtggtcaggacaaagctcaatga 11226812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 11228681 - 11228802
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  11228681 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 11228777  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       | ||||| ||||| |||||||||||    
T  11228778 ---ttgtggtcaggacaaagctcaatga 11228802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21885495 - 21885349
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggaca 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21885495 cttagactctt-atatgcatgtggtaccaatcgttatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggaca 21885400  T
Q  112 aagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    ||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21885399 aagctcctaa---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 21885349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 412 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 29471275 - 29471113
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||  |  || ||    
T  29471275 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagcatctaaattct 29471176  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaacta 574  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  29471175 agttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatcttccaaacta 29471113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 16673962 - 16674153
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||     
T  16673962 ttatatgtatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcagaggacaaagctccta- 16674057  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||  ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  16674058 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacattttaatcaacttatcacatatacatccaataatttgga 16674152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21341063 - 21340872
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||     
T  21341063 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaaagtgcggaggacaaagctccta- 21340968  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||| ||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  21340967 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaatatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 21340873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25229703 - 25229534
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  25229703 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctccta- 25229607  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  25229606 ---tcatagtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatca 25229534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25293859 - 25293690
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  25293859 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctccta- 25293763  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  25293762 ---tcatagtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatca 25293690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 4036027 - 4036164
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  4036027 ttatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctccta- 4036123  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4036124 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 4036164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20911491 - 20911394
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  20911491 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 20911395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Original strand, 23609709 - 23609799
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23609709 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 23609799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Original strand, 23841105 - 23841195
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841105 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 23841195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 149
Target Start/End: Original strand, 26172264 - 26172394
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggaca 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  26172264 cttagactctt-atatgcatgtggtaccaatcgttatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacagagctcct---aaacgtgcggaggaca 26172359  T
Q  112 aagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
    ||||||||||   || |||||||||| |||||||||||    
T  26172360 aagctcctaa---tcatggtgaggacaaagctcaatga 26172394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 18355766 - 18355958
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  18355766 ttatatgcatgtggtaccaatcttcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 18355862  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  18355863 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggcctc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 18355957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 411 - 561
Target Start/End: Original strand, 20776077 - 20776227
Alignment:
Q  411 ctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcc 510  Q
    ||||||||||||  |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||| |    
T  20776077 ctgcattaaacgttatcattaggttgcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgacacagatcgcacaaacacacaaaaagctacattc 20776176  T
Q  511 tggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    |||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20776177 tggacttgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactc 20776227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26743041 - 26742852
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |     
T  26743041 ttatatgcatgtggtatcaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccga- 26742948  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  26742947 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 26742853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 42805231 - 42805420
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |     
T  42805231 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcatt-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccga- 42805324  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  42805325 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 42805419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 450 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 22334695 - 22334574
Alignment:
Q  450 gggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatgg 549  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | ||| | |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22334695 gggttcactctagatcaacacgtgcgactcagatcgcacaaacacaccagcaactgcatcctggctgtgctcgcgaggcgatagttcttactcgccatgg 22334596  T
Q  550 cgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  22334595 cgagtaccactcaactcccaaa 22334574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 21667756 - 21667552
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  21667756 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 21667657  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  21667656 acagatcgcacaatcactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 21667557  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  21667556 ttgtt 21667552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 405 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 22258395 - 22258240
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||  |    
T  22258395 tacagactgcattaaacgttatcattaggtttcattaccagttagggattcactcttgatcaaaaggtgcgacacagatcgcacaaccac-tcaacagct 22258297  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
     ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22258296 acattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactc 22258240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 405 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 22410521 - 22410365
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||| |  |    
T  22410521 tacagactgcattaaacgttatcataaggtctcattaccaattacgggttcactcttgatcaaaaggtgcgacacagatcgcacaaccactcaaaaagct 22410422  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
     ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22410421 acattctggacttgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactc 22410365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Original strand, 29316574 - 29316778
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  29316574 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 29316673  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  29316674 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 29316773  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  29316774 ttgtt 29316778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 18774014 - 18774203
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| | ||||||||||||| |     
T  18774014 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtgaaggacaaagctccga- 18774107  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  18774108 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacgaaacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 18774202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 18783857 - 18784046
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |     
T  18783857 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccga- 18783950  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  18783951 ---tcatggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacgaaacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 18784045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 20232362 - 20232551
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||    
T  20232362 ttatatgcatgtgataccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccgaa 20232456  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  | |  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  20232457 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactta-aacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 20232550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21295179 - 21295035
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  | | ||  ||    
T  21295179 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaagcactccaatct 21295080  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21295079 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 21295035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 25535178 - 25535322
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  | | ||  ||    
T  25535178 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaagcactccaatct 25535277  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25535278 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 25535322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26666425 - 26666236
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||||| ||    
T  26666425 ttatatgcatgtagtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggataaagctccgaa 26666331  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  | |  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  26666330 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactta-aacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 26666237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26938022 - 26937833
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||||| ||    
T  26938022 ttatatgcatgtagtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggataaagctccgaa 26937928  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  | |  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  26937927 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactta-aacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 26937834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 412 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 23337204 - 23337034
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |   | | ||  ||    
T  23337204 tgcattaaacatcatcattaggtctcattaccaactaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactccaggcaatccaatct 23337105  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    ||  || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||||    
T  23337104 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtaccattcaatttccaaactaaagttgtt 23337034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 14359735 - 14359564
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  | ||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  14359735 tgcattaaacatcgtcattaggtctcattaccaaatagggattcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacactccaatct 14359636  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | | |||||| || |||||||    
T  14359635 ggaagtgctcgcgaggcgagagttcctactcgccatggcgagtaccagtcaaattccaaaccaatgttgttc 14359564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24533342 - 24533208
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    |||  ||||||||||||||| ||    
T  24533342 ttatatgcatgtggtatcaatcgtcatcata-gtattaatatattttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtatggaggacaaagctccaaa 24533248  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24533247 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 24533208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 412 - 494
Target Start/End: Original strand, 24554724 - 24554805
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24554724 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaa-acgtgcgacacagatcgcacaaacac 24554805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24767857 - 24767786
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat 94  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24767857 ttatatgcatgtggtatcaatcttcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat 24767786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23535859 - 23535791
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23535859 ttatatgcatgtggtatcaatcgtgatcata-gtattaatatactttaatcgtggggaggacgaagctcc 23535791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22325849 - 22325698
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca-ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaag 503  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||   |     
T  22325849 tacagactgcattaaacgtcatcatt-ggtctcaattaccataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacac 22325751  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    | || |||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22325750 tccaacctggaagtgctcgcgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 22325698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 15236598 - 15236525
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||    
T  15236598 ctggatgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatcttccaaactagtgttgttc 15236525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 25808365 - 25808258
Alignment:
Q  449 ggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatg 548  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | |  | |  |  ||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25808365 ggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcataacactcaaggctggaggtgctcgcgaggcgagagttcttgctcgccatg 25808266  T
Q  549 gcgagtac 556  Q
    ||||||||    
T  25808265 gcgagtac 25808258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 554
Target Start/End: Original strand, 22343680 - 22343829
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca-ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaag 503  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||   |     
T  22343680 tacagactgcattaaacgtcatcatt-ggtctcaattaccataagggggttctctcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacac 22343778  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagt 554  Q
    | || |||||  || ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  22343779 tccaacctggaagtgctcgcgatgcgagaattcttactcgccatggcgagt 22343829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20911393 - 20911275
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| |||||||    
T  20911393 cgtgcggaggacaaagctcctaa---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatc 20911299  T
Q  198 a-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    |   || |||||||||||||||||    
T  20911298 acttatacatccaataatttggag 20911275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 52
Target Start/End: Original strand, 17410279 - 17410309
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410279 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata 17410309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 494
Target Start/End: Original strand, 22353080 - 22353169
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca-ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  22353080 tacagactgcattaaacgtcatcatt-ggtctcaattaccataagggggttctctcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacac 22353169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 583
Target Start/End: Original strand, 19768645 - 19768709
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  19768645 ctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 19768709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 583
Target Start/End: Original strand, 19775241 - 19775305
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  19775241 ctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 19775305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 510; Significance: 0; HSPs: 125)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 19780615 - 19780035
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19780615 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 19780516  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19780515 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 19780416  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19780415 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttag-taaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 19780317  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  19780316 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcctatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 19780217  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19780216 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 19780117  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19780116 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 19780035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 23953927 - 23954508
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23953927 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 23954026  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23954027 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 23954126  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23954127 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 23954226  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23954227 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 23954326  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23954327 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 23954426  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23954427 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagataacttactcgccatggcaagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 23954508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 23960589 - 23961170
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23960589 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 23960688  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23960689 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 23960788  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23960789 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 23960888  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23960889 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 23960988  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23960989 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 23961088  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23961089 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagataacttactcgccatggcaagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 23961170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 15361911 - 15362493
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15361911 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 15362010  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15362011 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 15362110  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  15362111 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcattat 15362210  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  15362211 atcaatagcacataaattgcattattatcacatcttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttatccaattaatattaatataacttaaaca 15362310  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15362311 actctacagtctgcattaaacaacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaagcacataatc 15362410  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15362411 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagctcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggtcgttc 15362493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 22194398 - 22194980
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22194398 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 22194497  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22194498 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 22194597  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  22194598 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcattat 22194697  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  22194698 atcaatagcacataaattgcattattatcacatcttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttatccaattaatattaatataacttaaaca 22194797  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22194798 actctacagtctgcattaaacaacatccctaggtctcattaccagctaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacaaaatc 22194897  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22194898 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagctcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggtcgttc 22194980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 36885062 - 36884480
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36885062 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 36884963  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36884962 cggaggacaacgctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 36884863  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  36884862 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcattat 36884763  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| | ||||||| ||||    
T  36884762 atcaatagcacataaattgcattattatcacatcttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttaaccaattaatattgatataacttaaaca 36884663  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36884662 actctacagtctgcattaaacaacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatc 36884563  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36884562 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagctcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggtcgttc 36884480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 4771876 - 4772457
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4771876 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 4771975  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4771976 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 4772074  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4772075 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 4772174  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-aca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||| |||| ||| |||| ||| || |||||||  || ||||| ||     
T  4772175 atcaatagcacataaattgtatcattatcaactcttcatatcttgcataaatatacattacattagctcatgttcaatcaatattatcatgacttagact 4772274  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4772275 actctacagattgcatttaacaacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacatagcc 4772374  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4772375 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 4772457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16232169 - 16231587
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232169 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16232070  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16232069 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 16231970  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  16231969 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcattat 16231870  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  16231869 atcaatagcacataaattgcattattatcacatcttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttatccaattaatattaatataacttaaaca 16231770  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16231769 actctacagtctgtattaaacaacatcactaggtctcattaccagataggggtttactcttgatcaactagtgcgacacagatcgcacaaacacataatc 16231670  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16231669 aagttcatcctggctatactcgcgaggcgagagctcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggtcgttc 16231587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 8048822 - 8048241
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8048822 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 8048723  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8048722 cggaggacaaggctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 8048624  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8048623 gcatccaataacttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 8048524  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-aca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||| |||| ||  |||| ||| || |||||||  || ||||| ||     
T  8048523 atcaatagcacataaattgtatcattatcaactcttcatatcttgcataaatatacattacattaactcatgttcaatcaatattatcatgacttagact 8048424  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8048423 actctacagactgcatttaacaacatcactaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacactgatcgcacaaacacacaaac 8048324  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8048323 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 8048241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 8055435 - 8054854
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055435 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 8055336  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8055335 cggaggacaaggctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 8055237  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8055236 gcatccaataacttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 8055137  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-aca 400  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||| |||| ||  |||| ||| || |||||||  || ||||| ||     
T  8055136 atcaataacacataaattgtatcattatcaactcttcatatcttgcataaatatacattacattaactcatgttcaatcaatattatcatgacttagact 8055037  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8055036 actctacagactgcatttaacaacatcactaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacactgatcgcacaaacacacaaac 8054937  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8054936 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 8054854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 578
Target Start/End: Original strand, 15148236 - 15148811
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148236 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 15148335  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15148336 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 15148435  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  15148436 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcattat 15148535  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaacaa 401  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  15148536 atcaatagcacataaattgcattattatca-accttcatatcttgcatgattatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaatataacttaacaa 15148634  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15148635 ctctaccgactgcattaaacttcatcaataggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatca 15148734  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15148735 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagctcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggt 15148811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 15383819 - 15383239
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383819 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 15383720  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  15383719 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcatggacacataacaacaaaaca-cgtaatcaacgtatcaacat 15383621  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  15383620 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcattat 15383521  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  15383520 atcaatagcacataaattgcattattatcacatcttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttatccaattaatattaatataacttaaaca 15383421  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15383420 actctacagtctgtatt-aacaacatcactaggtctcattaccagataggggttcactcttgatcaactagtgcgacacagatcgcacaaacacataatc 15383322  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15383321 aagttcatcctggctgtactcgcgaggcgagagctcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggtcgttc 15383239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 12474798 - 12475380
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474798 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 12474897  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactta-tcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  12474898 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 12474996  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  12474997 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 12475096  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa-c 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||| |    
T  12475097 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttaaccaattaatattaatataacttaaac 12475196  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12475197 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaa 12475296  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  12475297 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 12475380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 18024755 - 18024173
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024755 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 18024656  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactta-tcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||  ||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  18024655 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgtatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 18024557  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  18024556 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 18024457  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa-c 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  18024456 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattaattcatattcaattaatatcaatataacttaaac 18024357  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18024356 aactctacaggctgcattaaacgtcatctctaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaa 18024257  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18024256 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatcgcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 18024173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 14299157 - 14298585
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299157 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 14299058  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14299057 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggcgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaac 14298958  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  14298957 atgcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacgagatgatatcat 14298859  T
Q  300 tatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-a 397  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||| || ||||||| |    
T  14298858 tatatcaatagcacataaattgcatcattatcaagttttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccaattaatatcaacataacttaa 14298759  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  14298758 acaactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttattactagttaggggttcactctagatcaacacgtgcgacacagatcgcaccaacacaca 14298659  T
Q  498 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    | ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14298658 agcaactgcatcctggctgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaa 14298585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 12481428 - 12482010
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481428 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 12481527  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  12481528 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 12481626  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  12481627 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 12481726  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-ac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||    
T  12481727 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttaaccaattaatattaatataacttanac 12481826  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttg--atcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  12481827 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgnnatca--cagtgcgacacagatcgcataaacacata 12481924  T
Q  498 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  12481925 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 12482010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 14268781 - 14268203
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14268781 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 14268682  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14268681 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 14268582  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  14268581 gcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaa-atgatatcattat 14268484  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    | ||| ||||| ||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  14268483 accaatagcacttaa-ttacatcattatca-aacttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaacataacttaaaca 14268386  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  || |    
T  14268385 actctacagactgcatttaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcactcttaatcaacatgcgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 14268286  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    || | |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14268285 aactacatcctggctgtgctcgcgaggcgaaagttcttactcgccgtggcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 14268203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 18070947 - 18071529
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18070947 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 18071046  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  18071047 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 18071145  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  18071146 tgcatccaataatttggagctaaaccttatcataaacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcatta 18071245  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |  || |||||||| || ||||||| |||    
T  18071246 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaatcttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcttgctcaattaatatcaatataacttaaac 18071345  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  18071346 aactctacaggctgcattaaacgtcaccactaggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaactcgtgcgacacagatcgcacaaacactcaag 18071445  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  18071446 caactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactaatgttgttc 18071529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 18295404 - 18295986
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18295404 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 18295503  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  18295504 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 18295602  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||    
T  18295603 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatggtattatta 18295702  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataa-cttaac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||| || |||    
T  18295703 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattaattcatattcaattaatatcaatataacctaaac 18295802  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |      
T  18295803 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacagacactcagg 18295902  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18295903 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 18295986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 6873704 - 6873121
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6873704 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaacgtg 6873605  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  6873604 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 6873505  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  6873504 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 6873405  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   || ||  ||||| |    
T  6873404 tatcaatagcaaatcatttgcatcataattaaactttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatgacaacatgtcttaaaa 6873305  T
Q  401 -actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
      || |||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || | |||||||||| |||||||||||  ||     
T  6873304 ggctttacagattacattaaacgtcatcactaggtttcattaccaattaggggttccctcttgatcagcacgggcgacacagaacgcacaaacactcaag 6873205  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  6873204 caactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 6873121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 99 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 14305683 - 14305209
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14305683 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggcgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatca 14305584  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14305583 acatgcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacgagatgatatc 14305485  T
Q  298 actatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt 396  Q
    | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||| || |||||||    
T  14305484 attatatcaatagcacataaattgcatcattatcaagttttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccaattaatatcaacataactt 14305385  T
Q  397 -aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacaca 495  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  14305384 aaacaactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttattactagttaggggttcactctagatcaacacgtgcgacacatatcgcaccaacaca 14305285  T
Q  496 taaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
     || ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14305284 caagcaactgcatcctggctgtgctcgcgaggcgagagttcttacttgccatggcgagtaccactcaactcccaaa 14305209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 40477928 - 40478508
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40477928 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaaactcctataaaacgtg 40478027  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  40478028 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 40478127  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  40478128 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcaacataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 40478227  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || ||||||||||| ||  ||||  |  |||||    || ||  |||||      
T  40478228 tatcaacagcaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattatacaatacatta-atcatgcttaattaacgacaacatgtcttaaag 40478325  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
     || ||||   ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  40478326 gctttacaaattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 40478425  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |  |  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  40478426 atctaaattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 40478508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 51494143 - 51493563
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51494143 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 51494044  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||  || |||||  ||    
T  51494043 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaataaacatatca--at 51493946  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  51493945 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 51493846  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    ||| || |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  || |||||    || ||  ||||| |    
T  51493845 tattaatagcaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgctcaattaacgacaacatgtcttaaaa 51493748  T
Q  401 a--ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    |  || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  51493747 aggctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaa 51493648  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  51493647 gcaactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 51493563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 26285235 - 26284653
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26285235 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcctcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 26285136  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaa-tcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  26285135 cggaggacaaggctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaattcaacatatcaaca 26285036  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcac-ataacaagatgatatcac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  26285035 tgcatccaataatttggagctagacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacaataacaagatgatatcat 26284936  T
Q  300 tatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa 398  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  |  |||||    || ||  |||||    
T  26284935 tatatcaacagcaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgcttaattaacgacaacatgtcttaa 26284838  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
       || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  26284837 aggctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaa 26284738  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||  |  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  26284737 gcatctaaattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 26284653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 89 - 583
Target Start/End: Original strand, 20115007 - 20115503
Alignment:
Q  89 tcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20115007 tcctataaaacgtgcggaggacaaaactcctattattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaaacatcgtaa 20115106  T
Q  188 tcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aac 286  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20115107 tcaacatatcaacatgcatccaataatttggagct-aacttcatcataaacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaac 20115205  T
Q  287 aagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatat 385  Q
    || ||||||||| |||||||| |||  |||| |   |  | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  |||||||    
T  20115206 aaaatgatatcattatatcaacagcttataaatatcaggaatatca-accttcgtatcttgcacgaatatacaatacattagttcatgtccatttaatat 20115304  T
Q  386 taaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatc 484  Q
     || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  20115305 caacataacttaaacaactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactaggggttcgctcttgatcaacacgtccgacacagatc 20115404  T
Q  485 gcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  20115405 gcacaaacactcaagcaagtacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaaagttgttc 20115503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 386657 - 386129
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  386657 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacatg 386558  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  386557 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 386458  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  386457 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 386358  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  || |||||    || ||  |||||      
T  386357 tatcaatagcaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgctcaattaacgacaacatgtcttaaag 386260  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
     || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |    
T  386259 gctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacatatcgcacaaacactcaagc 386160  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgag 531  Q
    |  | ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  386159 atctacattctggttgtgctcgggaggcgag 386129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 15322436 - 15321839
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15322436 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaacg 15322337  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||  | | |||||    
T  15322336 tgcggaggacaaagctcgtaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaataaaaca-cgtaatcatcgtaatcaa 15322238  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatac--------------ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |               |||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  15322237 catgcatccaataatttggagctaaacgtcatcttattcattacacataatcattatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 15322138  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  || ||||||     
T  15322137 caggatgatatcattatatcaatagcaaatcatttgcatcataattaaactttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgctcaattaatg 15322039  T
Q  385 ttaaaataacttaaca-actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
      || ||  ||||| |  || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15322038 acaacatgtcttaaaaggctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactattgatcaacacgtgcgacacagat 15321939  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||| ||||||  || ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  15321938 cgcataaacactcaagcaattacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactagtgttgttc 15321839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 7901514 - 7900916
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7901514 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcctaataaacg 7901415  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaa 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||  | | |||||    
T  7901414 tgcagagaacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcatcataatcaa 7901316  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacct--------------atgcacttagttaaataa---cggaagcagcataaacaggtcaca 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |              ||||||||||||||||||   | | |||||||||| || ||||||    
T  7901315 catgcatccaataatttggagctaaacgtcatcttattcattacacataatcatcatgcacttagttaaataacagcagcagcagcataatcaagtcaca 7901216  T
Q  283 taacaagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgatta 381  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || | | |||| || ||| ||| | | ||||||||||||  ||||  || ||||    
T  7901215 taacatgatgatatcattatatcaatagcaaattatttgcatcataatta-aacttcataccttacacaattgtacaatacaata-atcatgctcaatta 7901118  T
Q  382 atattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacag 481  Q
    ||   || ||  |||||   || |||||  ||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7901117 atgacaacatgtcttaaaggctttacagattgcattagacttcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacag 7901018  T
Q  482 atcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgt 581  Q
    |||||||||||||  || ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||    
T  7901017 atcgcacaaacactcaagcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgt 7900918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Original strand, 23081352 - 23081860
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  23081352 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 23081451  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23081452 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 23081551  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  23081552 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 23081651  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  23081652 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 23081750  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  23081751 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 23081849  T
Q  484 cgcacaaacac 494  Q
    |||||||||||    
T  23081850 cgcacaaacac 23081860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16956993 - 16956395
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||    
T  16956993 gacaatgctcttagacactttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggaaaaaactcctaataatcgtg 16956894  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  16956893 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacataacatcgtaatcaacatatcaacat 16956794  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  16956793 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatatatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 16956694  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| |  | | |||| || | |  | | |||||| ||  ||| ||||||||| ||  ||||| || || ||||    
T  16956693 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaactatgtcataattaaacttccatatcttacataaatgtacaatacatta-atcatactcaatcaata 16956595  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  16956594 tcaacatatcttaaacagctttacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacagat 16956495  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  | |  | |  |  ||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  16956494 cgcacaaacactcacaacactcaaggctggaggtgctcgcgaggcgagagttcttgctcgccatggcgagtacgaaacaattcccaaactaaagttgttc 16956395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Original strand, 27709509 - 27709740
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  27709509 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 27709608  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27709609 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 27709708  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27709709 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcat 27709740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9272498 - 9272267
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9272498 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaattgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 9272399  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || |||| || || |||||||||    
T  9272398 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtattcaacatatcaacat 9272299  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9272298 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 9272267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 19942496 - 19941988
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  19942496 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 19942397  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    | ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19942396 cagaggacaaagctcataataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 19942297  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  19942296 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 19942197  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  19942196 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 19942098  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  19942097 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 19941999  T
Q  484 cgcacaaacac 494  Q
    ||||| |||||    
T  19941998 cgcacgaacac 19941988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 8384592 - 8384778
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8384592 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 8384691  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8384692 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 8384778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 14073588 - 14073774
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14073588 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 14073687  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14073688 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 14073774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 15256366 - 15256552
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15256366 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 15256465  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15256466 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 15256552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17090326 - 17090140
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17090326 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 17090227  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17090226 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 17090140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29041247 - 29041061
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29041247 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 29041148  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29041147 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 29041061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 8391247 - 8391433
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8391247 gacaatgctcctagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 8391346  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8391347 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 8391433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 17808171 - 17808357
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17808171 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttcaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 17808270  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17808271 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacagatgaacaaaacatcataatc 17808357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 40453699 - 40453899
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40453699 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaaactcctataaaacgtg 40453798  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  40453799 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 40453898  T
Q  203 g 203  Q
    |    
T  40453899 g 40453899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Original strand, 53433137 - 53433371
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  53433137 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcg 53433236  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||    
T  53433237 tgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatca 53433335  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53433336 acatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 53433371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 197 - 583
Target Start/End: Original strand, 40471449 - 40471835
Alignment:
Q  197 caacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgata 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40471449 caacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcaacataaacaagtcacataacaagatgata 40471548  T
Q  296 tcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataac 394  Q
    ||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || ||||||||||| ||  ||||  |  |||||    || ||  |    
T  40471549 tcattatatcaacagcaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattatacaatacatta-atcatgcttaattaacgacaacatgtc 40471646  T
Q  395 ttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||   || ||||   ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40471647 ttaaaggctttacaaattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacac 40471746  T
Q  495 ataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
      || ||  |  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  40471747 tcaagcatctaaattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 40471835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12521844 - 12522076
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12521844 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 12521943  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||||  | |||||    
T  12521944 atgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactgagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcatcatatca 12522042  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12522043 atatgcatccaataatttggagccaaacgtcatc 12522076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14757984 - 14757763
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14757984 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtgcggaggacaaagctcctaa 14757885  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  14757884 ttttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 14757785  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  14757784 atttggagctaaacgtcatcat 14757763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 378 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 17962275 - 17962070
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17962275 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 17962176  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17962175 acagatcgcataaacacataaacgagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaagg 17962076  T
Q  578 ttgttc 583  Q
    ||||||    
T  17962075 ttgttc 17962070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4561882 - 4561675
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561882 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 4561785  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagc 221  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4561784 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcatcatgcatccaataatttggagc 4561688  T
Q  222 taaacttcatcat 234  Q
    ||||| |||||||    
T  4561687 taaacgtcatcat 4561675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5757487 - 5757280
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757487 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 5757390  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagc 221  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5757389 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcatcatgcatccaataatttggagc 5757293  T
Q  222 taaacttcatcat 234  Q
    ||||| |||||||    
T  5757292 taaacgtcatcat 5757280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 23838202 - 23838428
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  23838202 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaaatatcg 23838301  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||  | ||||||    
T  23838302 tgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagttcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacgtcgtaatcatcatatcaa 23838395  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23838396 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 23838428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41386082 - 41385856
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  41386082 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 41385983  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    |||||| |||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  41385982 tgcggaagacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 41385889  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41385888 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 41385856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 14678732 - 14678957
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||    
T  14678732 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaatgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 14678831  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||  | ||||||    
T  14678832 tgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tat-cacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 14678924  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14678925 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 14678957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 55795214 - 55795403
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  55795214 gcgacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 55795313  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  55795314 tgcggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 55795403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12349913 - 12349726
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  12349913 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 12349814  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  12349813 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 12349726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 9556079 - 9556295
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556079 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 9556176  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  9556177 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 9556273  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  9556274 atttggagctaaacgtcatcat 9556295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 17809823 - 17810039
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17809823 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 17809920  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  17809921 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 17810017  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  17810018 atttggagctaaacgtcatcat 17810039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 33741929 - 33742145
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33741929 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 33742026  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  33742027 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 33742123  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  33742124 atttggagctaaacgtcatcat 33742145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12300237 - 12300050
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  12300237 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttagtcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 12300138  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  12300137 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 12300050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 14684940 - 14685165
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  14684940 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtacaaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 14685039  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    | ||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||  | ||| ||    
T  14685040 tacggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tat-cacaaaacatcgtaatcatcatattaa 14685132  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14685133 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 14685165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 17089901 - 17089723
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17089901 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 17089802  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17089801 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactccactcacaaactaagcttgttc 17089723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17962673 - 17962486
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  17962673 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 17962574  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||||||| |||||    
T  17962573 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggattcttaacaacaaaacatcttaatc 17962486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 8385017 - 8385195
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8385017 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 8385116  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  8385117 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 8385195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 8391672 - 8391850
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8391672 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 8391771  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  8391772 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 8391850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 14074013 - 14074191
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14074013 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 14074112  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  14074113 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 14074191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 15256791 - 15256969
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15256791 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 15256890  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  15256891 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 15256969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 17808596 - 17808774
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17808596 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 17808695  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  17808696 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 17808774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 29040822 - 29040644
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29040822 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 29040723  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  29040722 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 29040644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 15224591 - 15224805
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  15224591 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 15224687  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
        |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  15224688 ---acgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatattatcatgcatccaata 15224784  T
Q  213 atttggagctaaacttcatca 233  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  15224785 atttggagctaaacgtcatca 15224805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 12487234 - 12487427
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487234 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 12487331  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  12487332 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 12487426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14708932 - 14708762
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14708932 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 14708835  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  14708834 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatca 14708762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 45937958 - 45938149
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  45937958 ttatatgcatgtggtaccaatcgttatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 45938054  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggag 220  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   | |||||||||||||||||    
T  45938055 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacattacatccaataatttggag 45938149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 2014588 - 2014779
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||     
T  2014588 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctccta- 2014683  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  2014684 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 2014778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14954749 - 14954612
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  14954749 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 14954653  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14954652 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 14954612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19757896 - 19757706
Alignment:
Q  23 tatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||        
T  19757896 tatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcc---- 19757804  T
Q  123 attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    | || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  19757803 aatcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttggag 19757706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Original strand, 19781910 - 19782100
Alignment:
Q  23 tatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||        
T  19781910 tatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcc---- 19782002  T
Q  123 attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    | || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  19782003 aatcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttggag 19782100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26243961 - 26243770
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26243961 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctc---ttaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 26243865  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  26243864 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 26243771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 14305754 - 14305662
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14305754 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 14305662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18603028 - 18602859
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||     
T  18603028 ttatatgcatgtggtaccaaacgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaatctccta- 18602932  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  18602931 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcgacttatca 18602859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 35170416 - 35170508
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35170416 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctccta 35170508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42997748 - 42997578
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42997748 ttatatgcacgtgataccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 42997651  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  42997650 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatca 42997578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 9530244 - 9530435
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||     
T  9530244 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgtggaggacaaagatcct---aaacgtgcggaggacaaagctccta- 9530339  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||   ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  9530340 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac-tttaacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 9530434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Original strand, 23139081 - 23139177
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  23139081 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 23139177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 35170484 - 35170621
Alignment:
Q  96 aaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||||  | |    
T  35170484 aaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcatcat 35170583  T
Q  195 atcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35170584 atcaatatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 35170621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 35613728 - 35613820
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35613728 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatataatttaaacgtgcggaggacaaagctccta 35613820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16243697 - 16243505
Alignment:
Q  21 tttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctccta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  16243697 tttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcgtaagtattaatataatttcatcgtgcagaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggactaagctccta 16243601  T
Q  121 atattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgg 218  Q
        || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   || |||||||||||||||    
T  16243600 ----tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgg 16243507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 3412607 - 3412776
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||     
T  3412607 ttatatgcatgtgctaccaaacgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacatgtggaggacaaagctccta- 3412703  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  3412704 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatca 3412776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18609600 - 18609431
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||     
T  18609600 ttatatgcatgtggtactaaacgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctctta- 18609504  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  18609503 ---tcatggtaaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcgacttatca 18609431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Original strand, 18236701 - 18236891
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||     
T  18236701 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcgtcataattattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagatcct---aaacgtgtggaggacaaagctccta- 18236796  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  18236797 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaatcaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 18236891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 221
Target Start/End: Original strand, 35613796 - 35613921
Alignment:
Q  96 aaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||  | |    
T  35613796 aaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatacatggactcttatcaacaaaacatcgtaatcatcat 35613894  T
Q  195 atcaacatgcatccaataatttggagc 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35613895 atcaatatgcatccaataatttggagc 35613921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 424 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 9272008 - 9271849
Alignment:
Q  424 catcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagtt-catcctggttgtactcg 522  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||  ||||||  | ||| |||||  ||||||    
T  9272008 catcactaggtttcattaccaattagaggttcactcttgatcaatacgtgcgacacagatcgcacta-cactcaaacaacctacattctggtcatactcg 9271910  T
Q  523 cgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  9271909 cgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaatcccaaactaaagttgttc 9271849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 25689418 - 25689489
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689418 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 25689489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18222673 - 18222539
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |     
T  18222673 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccga- 18222580  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18222579 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 18222539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 120
Target Start/End: Original strand, 27533528 - 27533621
Alignment:
Q  24 atatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctccta 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  27533528 atatgcatgtggtaccaatcgttatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacatgcggaggacaaagctccta 27533621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28569726 - 28569646
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28569726 cttagactctt-atatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctccta 28569646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1952054 - 1951867
Alignment:
Q  24 atatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |       
T  1952054 atatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccga--- 1951963  T
Q  124 ttcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttggag 220  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  1951962 -tcgtggtcaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatgaactc-tatcaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggag 1951867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 12349524 - 12349320
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  12349524 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 12349425  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  12349424 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 12349325  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  12349324 ttgtt 12349320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 10712404 - 10712475
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10712404 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctccta 10712475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 10926174 - 10926245
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10926174 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctccta 10926245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 12299848 - 12299665
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12299848 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaaataggggttcactcttgatcaaaaggtgcgac 12299749  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12299748 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactc 12299665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 234
Target Start/End: Original strand, 20682038 - 20682147
Alignment:
Q  125 tcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20682038 tcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaatatgcatccaataatttggagcta 20682136  T
Q  224 aacttcatcat 234  Q
    ||| |||||||    
T  20682137 aacgtcatcat 20682147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 23838623 - 23838767
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  | | ||  ||    
T  23838623 tgcattaaatgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaagcactccaatct 23838722  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23838723 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 23838767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18229148 - 18228982
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||| ||||||||||||||| |     
T  18229148 ttatatgcatatggtaccaattgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgcggaagacaaagctcctat----tgtgtggaggacaaagctccga- 18229055  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18229054 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatca 18228982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 411 - 582
Target Start/End: Original strand, 55795647 - 55795817
Alignment:
Q  411 ctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcc 510  Q
    ||||||||||||  |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||   | ||| |    
T  55795647 ctgcattaaacgttatcattgggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgacacagatcgcacaaccac-tcaactgctacattc 55795745  T
Q  511 tggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    |||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||    
T  55795746 tggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatgttgtt 55795817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 412 - 558
Target Start/End: Original strand, 35614129 - 35614275
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  35614129 tgcattaaacatcatcattaggtctcattaccaactaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaggcactccaatct 35614228  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtacca 558  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  35614229 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtacca 35614275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 30235267 - 30234923
Alignment:
Q  240 tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttc 338  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| || | ||| ||||| || | |  |||    
T  30235267 tatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaagtcacataacataatgatatcattatatcaatagcaaatcaattgcatcataattaaactttc 30235168  T
Q  339 ttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa-caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctc 437  Q
     |||||| ||  | | ||||||||| || | |||  || |||||||| || ||| ||||| || || ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||    
T  30235167 atatcttacataattgtacaatacattaat-catgctcaattaatatcaacatatcttaaacagctttacagactgcattaaacgtcgtcattaggtctc 30235069  T
Q  438 attaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtcct 537  Q
    |||||||    |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||       | | || |||||  || |||||||||||||  | ||    
T  30235068 attaccataagggggttcactcttgatctgaacgtgcgacacagatcgcacaaacactccttatactccaacctggaagtgctcgcgaggcgaggattct 30234969  T
Q  538 tactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||    
T  30234968 tactcgccatggcgagtaccaaacaattcccaaactaaagttgttc 30234923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 430 - 583
Target Start/End: Original strand, 35170836 - 35170989
Alignment:
Q  430 taggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcg 529  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||||  || |||||||| ||    
T  35170836 taggtctcattaccaattagggattcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaggcactccaatctggaagtgctcgcgagacg 35170935  T
Q  530 agagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| |||||||    
T  35170936 agagttcctactcgccatggcgagtaccagtcaatttccaaactaatgttgttc 35170989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 14679152 - 14679296
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  | |  |  ||    
T  14679152 tgcattaatcgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaagcactctaatct 14679251  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14679252 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 14679296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17152781 - 17152615
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    |||| |||| |||||||||| |     
T  17152781 ttatatgcatgtagtaccaatcgtcatcgta-gtattaatatactttaatcgtgtggagaacaaagctcctat----cgtgtggagcacaaagctccga- 17152688  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17152687 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taaaaacaaaacatcttaatcaacttatca 17152615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 412 - 494
Target Start/End: Original strand, 12522274 - 12522356
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12522274 tgcattaaacatcatcattaggtctcattaccaactaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacac 12522356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 412 - 494
Target Start/End: Original strand, 14685360 - 14685442
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14685360 tgcattaatcgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacac 14685442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 41385661 - 41385517
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||   | | ||  ||    
T  41385661 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaatcaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaagcactcaatgcactccaatct 41385562  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41385561 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 41385517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 510 - 583
Target Start/End: Original strand, 17810560 - 17810633
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  17810560 ctggatgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 17810633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 21340017 - 21339968
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatca 50  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21340017 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatca 21339968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 30235326 - 30235277
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata 52  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30235326 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata 30235277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 36134246 - 36134176
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctc 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  36134246 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-agtattaatatactttaagcatcgtggggaggacaaagctc 36134176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 20157751 - 20157680
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt---aatcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||    
T  20157751 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-agtattaatatactttcagcatcgtggggaggacaaagctcc 20157680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 14757240 - 14757167
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  14757240 ctggatgtgctcgcaaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 14757167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22634697 - 22634626
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt-ta--atcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  22634697 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatca-aagtattaatatacttatagcatcgtggggaggacaaagctcc 22634626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Original strand, 27533602 - 27533742
Alignment:
Q  74 tgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatg 172  Q
    |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||     
T  27533602 tgcggaggacaaagctcctatt----gtgcggaggacaaagctcctaa---acgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatc 27533693  T
Q  173 aacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    |||||| || ||||||| || |||||   || |||||||||||||||||    
T  27533694 aacaaatcaccgtaatcaacgtatcacttatacatccaataatttggag 27533742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 556
Target Start/End: Original strand, 53433560 - 53433711
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca-ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaag 503  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||   |     
T  53433560 tacagactgcattaaacgtcatcatt-ggtctcaattaccataagggggttctctcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacac 53433658  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    | || |||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53433659 tccaacctggaagtgctcgcgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 53433711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 307
Target Start/End: Original strand, 27709764 - 27709830
Alignment:
Q  241 atgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatatcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27709764 atgcacttagttaaataacagcaacagcataatcaagtcacataacaggatgatatcattatatcaa 27709830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 13020575 - 13020537
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaa 41  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13020575 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaa 13020537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 165
Target Start/End: Original strand, 10712454 - 10712517
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10712454 cgtgcggaggacaaagctcctaa---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 10712517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 165
Target Start/End: Original strand, 10926224 - 10926287
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10926224 cgtgcggaggacaaagctcctaa---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 10926287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 165
Target Start/End: Original strand, 25689468 - 25689531
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25689468 cgtgcggaggacaaagctcctaa---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 25689531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9272191 - 9272125
Alignment:
Q  241 atgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatatcaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||  || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  9272191 atgcacttagttaaacaacagcagcagcatagtcaagtcacataacaggatgatttcattatatcaa 9272125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 510; Significance: 0; HSPs: 191)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 37615173 - 37615753
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37615173 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacatg 37615272  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37615273 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 37615372  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37615373 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 37615472  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  37615473 atc-aagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 37615571  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37615572 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 37615671  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37615672 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 37615753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 26794718 - 26794139
Alignment:
Q  5 caatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcg 104  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794718 caatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcg 26794619  T
Q  105 gaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26794618 gaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacaaatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacatgc 26794519  T
Q  205 atccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26794518 atccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaaccggtcacataacaagatgatatcattatat 26794419  T
Q  305 caaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaact 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26794418 caaagcacataatttgtatcattatcacattttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaact 26794319  T
Q  404 ctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaag 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26794318 ctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaacaag 26794219  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26794218 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 26794139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 31422878 - 31422297
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422878 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 31422779  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31422778 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 31422679  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31422678 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 31422579  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  31422578 atcaaggcacatcatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 31422479  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31422478 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 31422379  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  31422378 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 31422297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 5107209 - 5106628
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5107209 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 5107110  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5107109 cggaggacaaagctcctaatattcgttgtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 5107010  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  5107009 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacatatgcacttagttaaataacgaaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 5106910  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  5106909 atcaaagcacataacttgtatcattaacacatcttcttatcttgcatgaatatacaatataatagttcatattcaattgatattaatataacttaaacaa 5106810  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5106809 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcactaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 5106710  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  5106709 agttcatcctagttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactcatctcccaaactaaggttgttc 5106628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 6598499 - 6599080
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6598499 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctataaaacgtg 6598598  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6598599 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacacatgaacgaaacaacgtaatcgacttatcaacat 6598698  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6598699 gcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaataacgaaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 6598798  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  6598799 atcaaagtacataatttgtatcattaacacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattgatattaatataacttaaacaa 6598898  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6598899 ctttacagtctgcatttaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttaatcaacaagtgcgacacagattgcacaaacacataaaca 6598998  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  6598999 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactcatctcccaaactaaggttgttc 6599080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 6605179 - 6605760
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6605179 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctataaaacgtg 6605278  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6605279 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacacatgaacgaaacaacgtaatcgacttatcaacat 6605378  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6605379 gcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaataacgaaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 6605478  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  6605479 atcaaagtacataatttgtatcattaacacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattgatattaatataacttaaacaa 6605578  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6605579 ctttacagtctgcatttaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttaatcaacaagtgcgacacagattgcacaaacacataaaca 6605678  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  6605679 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactcatctcccaaactaaggttgttc 6605760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 10154060 - 10153479
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10154060 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 10153961  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10153960 cggaggacaaagctcctaatattcatggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 10153861  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  10153860 gcatccaataatttggagctaaacttcatcttatacttatgcacttagttaaataacaaaagcagcgtaaacaagtcacataacaagatgatatcattat 10153761  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  10153760 atcaaaacacataatttgcatcattaacacatcttcttatcttgcatgaatatacaatataatagttcatattcaattgatattaatataacttaaacaa 10153661  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10153660 ctctacagtctgcattaaatgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacacaaaca 10153561  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10153560 agttcatcctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccgtggcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 10153479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16758896 - 16758315
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758896 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16758797  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16758796 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatgaacacgtatgaacaaaacaacctaatcgacttatcaacat 16758697  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  16758696 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacgaaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 16758597  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataac-ttaacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  16758596 atcaaagcacataatttgtatcattaacacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattgatattaatataactttaacaa 16758497  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758496 ctctacagtctgcgttaaacggcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttaatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 16758397  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  16758396 agttcgtcctggttgtactcgcgaggcgagagcactcactcgccatggcgagtgacactcttctcccaaactaaggttgttc 16758315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 53380676 - 53380097
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53380676 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 53380577  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53380576 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 53380477  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53380476 gcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 53380377  T
Q  303 atc-aaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  53380376 atcaaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaattcaatagttcatattcaattaatattaatatgacttaaaca 53380277  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  53380276 actctacagtctgcattaaatgacatttataggtctcattataagtta-gggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaa-acacaaac 53380179  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  53380178 aagttcattctgattgtacccgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactcaacttccaaactaaggttgtt 53380097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 53387328 - 53386749
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387328 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 53387229  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53387228 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaacat 53387129  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53387128 gcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 53387029  T
Q  303 atc-aaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  53387028 atcaaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaattcaatagttcatattcaattaatattaatatgacttaaaca 53386929  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  53386928 actctacagtctgcattaaatgacatttataggtctcattataagtta-gggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaa-acacaaac 53386831  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  53386830 aagttcattctgattgtacccgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactcaacttccaaactaaggttgtt 53386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 26889236 - 26889817
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26889236 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctataaaacgtg 26889335  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26889336 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 26889434  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26889435 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataagcaggtcacataacaagatgatatcattat 26889534  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  26889535 atcaatagcacataaattgcattattatcacatcttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttaaccaattaatattaatataacttaaaca 26889634  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26889635 actctacagtctgcattaaacaacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatc 26889734  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26889735 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagctcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggtcgttc 26889817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16748164 - 16747583
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16748164 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaatgtg 16748065  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16748064 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaaactcaatgatatgctatgcatggacacgtatgaacaaaacagcctaatcgacttatcaacat 16747965  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  16747964 gcatccaataatttagagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacgaaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 16747865  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataac-ttaacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  16747864 atcaaagcacataatttgtatcattaacacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattgatattaatataactttaacaa 16747765  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747764 ctctacaatctgcgttaaacagcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttaatctacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 16747665  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  16747664 agttcgtcctggttgtactcgcgaggcgagagcactcactcgccatggcgagtgacactcttctcccaaactaaggttgttc 16747583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16624380 - 16623799
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16624380 gacaatgctcttagactccttacatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaggctcctataaaacatg 16624281  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16624280 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacacatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 16624181  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16624180 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 16624081  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-acaa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  16624080 atcaaagcacataatttgcatcattatcacatcttcttattttgcatgaatatacaatacaatagttcttattcaatcaatattaatataacttagacaa 16623981  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16623980 ctctacaggctgcattaaacgtcaccactaggtctcaataccaattaggggttcactcttggtcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagca 16623881  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16623880 actacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 16623799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 10846609 - 10846028
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10846609 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaattgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 10846510  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||    
T  10846509 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacattgtaataaacttatcaatat 10846410  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10846409 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacgaaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 10846310  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||| || | |||| ||| |||| ||| ||||||||||  || |||| ||||    
T  10846309 atcaatagcacataaattgtatcattatcaattcttcatatcttgcataaatgtatattacattagctcatgttcaattaatattatcatgacttaaaca 10846210  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10846209 actctacagactgcatttaacgacatcactaggtctcattactagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcac-aacacacaaac 10846111  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10846110 aagttcattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaattaaggttgttc 10846028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 26789034 - 26788549
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26789034 cgtgcggaggacaaagctcctaatatacgtggtgagaactaagctcaataatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatca 26788935  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26788934 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacagaagcagcataaaccggtcacataacaagatgatatca 26788835  T
Q  299 ctatatcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-a 397  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  26788834 ttatatcaaagcacataatttgtatcattatcacattttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaa 26788735  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26788734 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacata 26788635  T
Q  498 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26788634 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 26788549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 417780 - 418362
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417780 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 417879  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactta-tcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  417880 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 417978  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  417979 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 418078  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa-c 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||| |    
T  418079 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttaaccaattaatattaatataacttaaac 418178  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  418179 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaa 418278  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  418279 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 418362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 14673526 - 14672944
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14673526 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 14673427  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactta-tcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||  ||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  14673426 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgtatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 14673328  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  14673327 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 14673228  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa-c 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  14673227 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattaattcatattcaattaatatcaatataacttaaac 14673128  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14673127 aactctacaggctgcattaaacgtcatctctaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaa 14673028  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14673027 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatcgcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 14672944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Original strand, 5221183 - 5221766
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5221183 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 5221282  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  5221283 tgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacataacaac 5221382  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcact 300  Q
    |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  5221383 atgtgtccaataatttggag-ttaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatt 5221481  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa- 398  Q
    ||||||| ||||||||| | | || ||| ||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |||||||||     
T  5221482 atatcaatagcacataaatggcattattttcaaactttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaacataacttaac 5221581  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5221582 caactctacagactgcatttaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaa 5221681  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5221682 gcaactatatcctggctgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccgtgtcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 5221766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 20057730 - 20057147
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057730 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 20057631  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  20057630 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 20057532  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  20057531 tgcatccaataatttggagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcatta 20057432  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt--aa 398  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||| || |||| ||  ||    
T  20057431 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgctcaattaatatcaatataatttaaaa 20057332  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  20057331 caactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcaataccaattaggggttcactcctgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactcaa 20057232  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  20057231 gcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 20057147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 20064368 - 20063785
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20064368 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 20064269  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  20064268 cagaggacaaagctcctcatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 20064170  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  20064169 tgcatccaataatttggagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcatta 20064070  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt--aa 398  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||| || |||| ||  ||    
T  20064069 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgctcaattaatatcaatataatttaaaa 20063970  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  20063969 caactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcaataccaattaggggttcactcctgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactcaa 20063870  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  20063869 gcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 20063785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 13250499 - 13251081
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250499 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 13250598  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  13250599 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 13250697  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  13250698 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 13250797  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataa-cttaac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| || |||| || |||    
T  13250798 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattaactcatattcaattaatatcaatataacctaaac 13250897  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |      
T  13250898 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacgagtgcgacacagatcgcacagacactcagg 13250997  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  13250998 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagcaccactcaacttccaaactaagcttgttc 13251081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 13257145 - 13257727
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13257145 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 13257244  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  13257245 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 13257343  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  13257344 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 13257443  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataa-cttaac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| || |||| || |||    
T  13257444 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattaactcatattcaattaatatcaatataacctaaac 13257543  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |      
T  13257544 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacgagtgcgacacagatcgcacagacactcagg 13257643  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  13257644 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagcaccactcaacttccaaactaagcttgttc 13257727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 10003416 - 10003999
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10003416 gacaatgctcctagactccatatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 10003515  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10003516 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgttatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 10003615  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  10003616 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacagatcacataaacaaaatgatatcatta 10003715  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||||  | ||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  10003716 tatcaatagcacataaattacatcattatcaagttttcatatcttgcatgaatgtacaataccttagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaac 10003815  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||     
T  10003816 aactctacaggctgcattaaacgtctccactaggtctcaacaccacttaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaccactcaag 10003915  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  10003916 caactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgaagttgttc 10003999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 10010063 - 10010646
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10010063 gacaatgctcctagactccatatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 10010162  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10010163 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgttatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 10010262  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  10010263 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacagatcacataaacaaaatgatatcatta 10010362  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||||  | ||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  10010363 tatcaatagcacataaattacatcattatcaagttttcatatcttgcatgaatgtacaataccttagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaac 10010462  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||     
T  10010463 aactctacaggctgcattaaacgtctccactaggtctcaacaccacttaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaccactcaag 10010562  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  10010563 caactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgaagttgttc 10010646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 10910678 - 10911261
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10910678 gacaatgttcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaccgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 10910777  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10910778 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgttatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 10910877  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  10910878 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacagatcacataaacaaaatgatatcatta 10910977  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||||  | ||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  10910978 tatcaatagcacataaattacatcattatcaagttttcatatcttgcatgaatgtacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaac 10911077  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||     
T  10911078 aactctacaggctgcattaaacgtctccactaggtctcaacaccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactcaag 10911177  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  10911178 caactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 10911261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 10904006 - 10904589
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10904006 gacaatgttcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaccgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 10904105  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10904106 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgttatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 10904205  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  10904206 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacagatcacataaacaaaatgatatcatta 10904305  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||||  | ||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  10904306 tatcaatagcacataaattacatcattatcaagttttcatatcttgcatgaatgtacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaac 10904405  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||     
T  10904406 aactctacaggctgcattaaacgtctccactaggtctcaacaccaattaggggttcactcatgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactcaag 10904505  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  10904506 caactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 10904589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 3690399 - 3690981
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690399 gacaatgctcttagacttcttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 3690498  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  3690499 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 3690597  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||    
T  3690598 tgcatccaataatttggagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaaatctcatatcaagatgatatcatta 3690697  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||  |||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| |  || || ||||| || ||||||| |||    
T  3690698 tatcaatagcacataaattgcatttttatcaaaccttcatatcttgcatgcatatacaatacattagttcttgctcaatgaatatcaatataacttaaac 3690797  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||     
T  3690798 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcaatcccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactcaag 3690897  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  3690898 caactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 3690981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16489990 - 16489414
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16489990 gacaatgctcttagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16489891  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||    
T  16489890 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggacta-----aatgagatgctatgcatggacacttatgacaaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 16489796  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  16489795 gcatccaataatttggagct-aacttcatcataaacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacaaaatgatatcatta 16489697  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| | |  |||  |  ||  | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  16489696 tatcaacaacttatatatattaggaatatca-accttcatatcttgcacgaatatacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaac 16489598  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  16489597 aactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactaggggttcactcttgatcagcacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaag 16489498  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  16489497 caagtacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccgtggcgagtaccactcatctcccaaactaaagttgttc 16489414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 15727256 - 15726676
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15727256 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaattgtgcggaggacaaagctcctataaaatgtg 15727157  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  15727156 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatgtcaacat 15727057  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15727056 gcatacaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 15726957  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| | || || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  |  |||||    || ||  |||||      
T  15726956 tatcaacaacaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgcttaattaacgacaacatgtcttaaag 15726859  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
     || |||||  ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  15726858 gctttacagattgcattaaacgtcataattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 15726759  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |  |  || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||    
T  15726758 atctaaattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccacttatctcccaaactagtgttgttc 15726676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 15692571 - 15692022
Alignment:
Q  34 ggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtga 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15692571 ggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaacgtggtga 15692472  T
Q  134 ggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatca 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15692471 ggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatgtcaacatgcatacaataatttggagctaaacttcatca 15692372  T
Q  234 tatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatca 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || |    
T  15692371 tataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattatatcaacagcaaatcatttgcatcataatta 15692272  T
Q  332 catcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcacta 431  Q
     |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  |  |||||    || ||  |||||   || |||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  15692271 -actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgcttaattaacgacaacatgtcttaaaggctttacagattgcattaaacgtcatcatta 15692174  T
Q  432 ggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgag 531  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||  |  || | |||| | || ||||||||||    
T  15692173 ggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagcatctaaattcaggttatgcttgcgaggcgag 15692074  T
Q  532 agtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  15692073 agttcttactcgccatggagagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 15692022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23705092 - 23704787
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23705092 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 23704993  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  23704992 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 23704893  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  23704892 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 23704793  T
Q  302 tatcaa 307  Q
    ||||||    
T  23704792 tatcaa 23704787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23723548 - 23723243
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23723548 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 23723449  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  23723448 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 23723349  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  23723348 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 23723249  T
Q  302 tatcaa 307  Q
    ||||||    
T  23723248 tatcaa 23723243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23742004 - 23741699
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23742004 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 23741905  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  23741904 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 23741805  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  23741804 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 23741705  T
Q  302 tatcaa 307  Q
    ||||||    
T  23741704 tatcaa 23741699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41202122 - 41201817
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41202122 gacaatgctcttaaactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 41202023  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  41202022 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 41201923  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  41201922 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 41201823  T
Q  302 tatcaa 307  Q
    ||||||    
T  41201822 tatcaa 41201817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 15992442 - 15991849
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15992442 gacaatgcacttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 15992343  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  15992342 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaaactcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaacat 15992243  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||      ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15992242 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcagttcatcatataaatacactatgcacttagttaaataacagcagcagcataaacaagtcacataacagg 15992143  T
Q  290 atgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaa 388  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||  | | | |||| |||||| ||  | |  |||||||| ||  ||||| || |||||||| ||    
T  15992142 atgatatcattatatcaatagcacatcaattgtatcatagttaaaccttcatatcttacataattgcacaatacatta-atcatactcaattaatatcaa 15992044  T
Q  389 aataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgca 487  Q
     ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15992043 catatcttaaacagctttacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattatcataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgca 15991944  T
Q  488 caaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    ||||||   ||   | |  |  ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||    
T  15991943 caaacattcaagacactcaaagctggaagtgctcgcgaggcgagaatccttactcgccatggcgagtaccaaacaattcccaaactaaagttgtt 15991849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 17710932 - 17710336
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17710932 gacaatgctcttagacactttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 17710833  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  17710832 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatggaatgctatgcatggactcatatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaacat 17710733  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatc--------------atatac-ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||              |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  17710732 gcatccaataatttggagctaaatgtcatcatttcatcatgtatatatacactatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaggtcacataaca 17710633  T
Q  288 agatgatatcactatatca-aagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatatt 386  Q
     |||||||||| ||||| |  ||||||| | ||||||||| || | |  ||| |||||| ||  | | ||| ||||| ||  ||||| || ||||||||     
T  17710632 ggatgatatcattatattattagcacatcaattgtatcataattaaactttcatatcttacataattgtaccatacatta-atcatactcaattaatatc 17710534  T
Q  387 aaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttagggg-ttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatc 484  Q
    || ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  17710533 aacatatcttaaacaactttacagactgcattaaacgtcatcaataggtctcattatca-taaggggtttcactcttgatccaaacatgcgacacagatc 17710435  T
Q  485 gcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||  ||   | |  |  ||||  || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  17710434 gcacaaacactcaagacactcaaatctggaagtgctcgcgaggcgagagttcttacttgccttggcgagtaccattcaattcccaaactaaagttgttc 17710336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 10236733 - 10236138
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10236733 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 10236634  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  10236633 cgcaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaacat 10236534  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||      | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10236533 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcagttcatcatataaatacaccatgcacttagttaaataacagcagcagcataaacaagtcacataacagg 10236434  T
Q  290 atgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatatt-- 386  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| || | |  ||| |||||| ||  | |  |||||||| ||   |||| || ||||| |||      
T  10236433 atgatatcattatatcaatagcacatcaattgtatcataattaaactttcatatcttacataattgcacaatacatta-accatactcaattaa-attcc 10236336  T
Q  387 aaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcg 485  Q
    || ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  10236335 aacatatcttaaacagctttacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattatcataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcg 10236236  T
Q  486 cacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||  ||   | |  |  ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||| |||||||    
T  10236235 cacaaacactcaagacactcaaagctggaagtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccaaacatttcccaaactaaagttgttc 10236138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 15825430 - 15826025
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15825430 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcatgtggaggacaaagctcctataaatcgtg 15825529  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  15825530 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaacat 15825629  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||      ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15825630 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcatttcatcatataaatacactatgcacttagttaaataacagcagcagcataaacaagtcacataacagg 15825729  T
Q  290 atgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgatt-aatatta 387  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||  | | | |||| |||||| |   | |  |||||||| ||   |||| || ||| ||| | |    
T  15825730 atgatatcattatatcaatagcacatcaattatatcatagttaaaccttcatatcttacttaattgcacaatacatta-accatactcaattaaatttca 15825828  T
Q  388 aaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgc 486  Q
    | ||| ||| |||| |  ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  15825829 acatatcttaaacagccttacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattatcataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgc 15825928  T
Q  487 acaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||  ||   | |  |  ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||    
T  15825929 acaaacactcaagacactcaaaactggaagtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccaaacaattcccaaactaaagttgttc 15826025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 5150309 - 5149712
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5150309 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaacg 5150210  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactta-tcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||| | || ||||    
T  5150209 tgcggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcgtcgtaatcaa 5150111  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacct--------------atgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |              ||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||| ||    
T  5150110 catgcatccaataatttggagctaaacgtcatcttattcattacacataatcattatgcacttagttaaataacagcagcagcataattaagtcacacaa 5150011  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
     | |||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| ||  | |  |||||||| ||  ||||  || | ||||     
T  5150010 taggatgatatcattatatcaatagcaaatcatttgcatcataattaaactttcatatcttacataattgaacaatacatta-atcatgctcaaataatg 5149912  T
Q  385 ttaaaataacttaaca-actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
      || ||  ||||| |  || |||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5149911 acaacatgtcttaaaaggctttacagattgcattaaacgtcatcattatgtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagat 5149812  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  || ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  5149811 cgcacaaacactcaagcaactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 5149712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 13316525 - 13315943
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316525 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 13316426  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13316425 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 13316326  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatc-------------atatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaag 289  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||             ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| || |||| |||||| |    
T  13316325 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcattcatcgtataaatatacc-atgcacttagtcaaataacagcagcagcataatcaagtcatataacagg 13316227  T
Q  290 atgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgatt-aatatta 387  Q
    || |||||| |||||||| ||||  | ||||| ||||| | || | |||| |||| | ||    |  ||| |||| ||  ||| | || ||| ||||| |    
T  13316226 ataatatcattatatcaatagcaattcatttgcatcataaccaaaccttcatatcatacatatttgcacattacatta-atcaaactcaattaaatatca 13316128  T
Q  388 aaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgca 487  Q
      ||| || ||||  ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  13316127 tcatatctgaacagttctacagactgcatttaacgtcatcattaggtttcattaccataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgca 13316028  T
Q  488 caaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaac 572  Q
    |||||||  ||   | |  |  ||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13316027 caaacactcaagacactcaaagctggaagtgctcgcgaggcgagagttattactcgccatggcgagtaccactcaaatcccaaac 13315943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 583
Target Start/End: Original strand, 4710067 - 4710660
Alignment:
Q  5 caatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||     
T  4710067 caatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaaactcctaataatcgtgca 4710166  T
Q  105 gaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgc 204  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4710167 gaggacaaagctcctaataaacgtggtgaagactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacatgc 4710266  T
Q  205 atccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaca 287  Q
    |||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | |||||||||||||||||||   || ||||||| || |||||||||||    
T  4710267 atccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatatatacaatgcacttagttaaataac---agtagcataatcaagtcacataaca 4710363  T
Q  288 agatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatatt 386  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||| || | |  ||| |||||| ||  ||| ||||||||| ||  ||||| ||||| |||||     
T  4710364 ggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatatcataattaaactttcatatcttacataaatgtacaatacatta-atcatagtcgatcaatatc 4710462  T
Q  387 aaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcg 485  Q
    || ||| ||| |||| || |||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  4710463 aacatatcttaaacagctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacatatcg 4710562  T
Q  486 cacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||  |||  | |  |  ||||  |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  4710563 cacaaacactcaaaatactcaaagctggaggagctcgcgaggcgagagtcctcactcgccatggcgagtaccactcaaatcccaaactaaagttgttc 4710660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Original strand, 19808796 - 19809111
Alignment:
Q  7 atgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcgga 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808796 atgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagcattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcgga 19808895  T
Q  107 ggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcat 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19808896 ggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcgacatatcaacatgcat 19808995  T
Q  207 ccaataatttggagctaaacttcatcat------atac---------ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagat 291  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||      ||||          ||||||||||||| |||||| | |||||||||| || ||||||||||| |||    
T  19808996 tcaataatttggagctaaactttatcatttcatcatactcatatacaatatgcacttagttcaataacagcagcagcataatcaagtcacataacatgat 19809095  T
Q  292 gatatcactatatcaa 307  Q
    ||||||| ||||||||    
T  19809096 gatatcattatatcaa 19809111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 411092 - 410495
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  411092 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 410993  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  410992 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 410893  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| || ||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  410892 gcatccaacaacttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 410793  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  410792 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 410694  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  410693 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 410595  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  | |  | |  |  ||||  || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  410594 cgcacaaacactcacaacactcaaggctggaggtgctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 410495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1145893 - 1145296
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  1145893 gacaatgctcttaaactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 1145794  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1145793 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 1145694  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  1145693 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 1145594  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  1145593 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 1145495  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  1145494 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 1145396  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  | |  | |  |  ||||  || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  1145395 cgcacaaacactcacaacactcaaggctggaggtgctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 1145296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15404836 - 15404330
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15404836 gacaatgctcttagactccttatattcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaaaaatcgtg 15404737  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  15404736 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcgacat 15404637  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  15404636 gcatccaaaaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatatatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 15404537  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcat-tatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaat 383  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||  || | |  ||| || ||| ||| | | | ||| ||  ||  |||||||| ||||      
T  15404536 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatatcataaattaaactttcataacttacaccattgtgcaacacgtta-atcatattccattata 15404438  T
Q  384 attaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacaga 482  Q
    |  || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15404437 aacaacatatcttaaacagctttacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacaga 15404338  T
Q  483 tcgcacaa 490  Q
    ||||||||    
T  15404337 tcgcacaa 15404330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 8721497 - 8720989
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||    
T  8721497 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctaataatcgtg 8721398  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8721397 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 8721298  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  8721297 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 8721198  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  8721197 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 8721099  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  8721098 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 8721000  T
Q  484 cgcacaaacac 494  Q
    ||||| |||||    
T  8720999 cgcacgaacac 8720989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 9073384 - 9072876
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||    
T  9073384 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctaataatcgtg 9073285  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9073284 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 9073185  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  9073184 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 9073085  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  9073084 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 9072986  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  9072985 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 9072887  T
Q  484 cgcacaaacac 494  Q
    ||||| |||||    
T  9072886 cgcacgaacac 9072876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15343946 - 15343625
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||    
T  15343946 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcatgcagaggacaaagctcctaataatcgtg 15343847  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15343846 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 15343747  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  15343746 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 15343647  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa 307  Q
    || |||||||||| ||||||||    
T  15343646 caggatgatatcattatatcaa 15343625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15350590 - 15350269
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  15350590 gacaatgctattagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 15350491  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  15350490 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaaaaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 15350391  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  15350390 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 15350291  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa 307  Q
    || |||||||||| ||||||||    
T  15350290 caggatgatatcattatatcaa 15350269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 99 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22643560 - 22643113
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22643560 cgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcgtatgaacaaaacatcgtaatcaacatatca 22643461  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaa-------acttca------tcatatac-ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacata 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       | ||||      ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  22643460 acatgcatccaataatttggagctaacttcatcatttcatcatactcatatacaatatgcacttagttaaataacagaagcagcataaacaaatcacata 22643361  T
Q  285 acaagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaat 383  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||| | ||| || || |||| |  | | |||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  22643360 acaggatgatatcattatatcaatagcacatcaattgcattataatcaaacttgcatatcttgcataattatacaatacattagttcatgttcaattaat 22643261  T
Q  384 attaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    || || ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||   ||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||    
T  22643260 atcaacatatcttaacaactctacagactgcatttaacgtcatcattaggtctcaataccaagcaggggttcactatcgatcaaaacgtgcgacatagat 22643161  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgag 531  Q
    |||||||||||  || ||| | |||  ||||||| |||||||||||||    
T  22643160 cgcacaaacactcaagcaactacattatggttgtgctcgcgaggcgag 22643113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15367271 - 15367040
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  15367271 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtactaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 15367172  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  15367171 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaaaatcgtaatcaacatatcaacat 15367072  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  15367071 gcatcctacaatttggagctaaacgtcatcat 15367040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 41092687 - 41092091
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  41092687 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcctaataaacg 41092588  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaa 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||  | | |||||    
T  41092587 tgcggaggacaaggctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaa 41092489  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacct--------------atgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |              ||||||||||||||||||| | |||||||||| || || ||||||    
T  41092488 catgcatccaataatttggagctaaacgtcatcttattcattacacacaatcatcatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagttacataa 41092389  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatat--acaatacaatagttcatattcgattaa 382  Q
    ||  ||| ||||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || | | |||| |||||| ||| ||| |  |||||||||||  |||| ||| |||||    
T  41092388 cagaatgctatcattatatcaatagcaaatcatttgcatcataatta-aacttcatatcttacac-aatttgcacaatacaata-atcatgttcaattaa 41092292  T
Q  383 tattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacaga 482  Q
    |   || ||  |||||   || |||||  ||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  41092291 tgacaacatgtcttaaaggctttacagattgcattagacttcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttggtcaaaacgtgcaacacaga 41092192  T
Q  483 tcgcacaaacacataaac-aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgt 581  Q
    ||||||  ||||  |||| || | ||| ||||     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  41092191 tcgcac-tacactcaaacaaactacattctgggctagctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgt 41092093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 16633610 - 16633796
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16633610 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16633709  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16633710 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 16633796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 16640220 - 16640406
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16640220 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16640319  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16640320 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 16640406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 43160885 - 43161071
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43160885 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 43160984  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43160985 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 43161071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 43167122 - 43167308
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43167122 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 43167221  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43167222 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 43167308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1333407 - 1333221
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1333407 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 1333308  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1333307 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgttatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 1333221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 48423127 - 48423313
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48423127 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 48423226  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48423227 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacagatgaacaaaacatcataatc 48423313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30777567 - 30777335
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  30777567 gacaatgctcttagacactttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 30777468  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaa-tcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  30777467 cggaggacaaagcttctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactctcatgaacaaaacatcgtaattcaacatatcaaca 30777368  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  30777367 tgcatccaacaacttggagctaaacgtcatcat 30777335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 48429905 - 48430091
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48429905 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 48430004  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48430005 cggaggacaaagctcctaatttccgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacagatgaacaaaacatcataatc 48430091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 304
Target Start/End: Original strand, 13320737 - 13321053
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||   |    
T  13320737 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataagttg 13320836  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  13320837 tgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaa 13320935  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||       |||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||||    
T  13320936 catgcatccaataatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatatagacattatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaagtcacataac 13321035  T
Q  287 aagatgatatcactatat 304  Q
    | |||||||||| |||||    
T  13321036 aggatgatatcaatatat 13321053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Original strand, 12891166 - 12891400
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12891166 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcg 12891265  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||    
T  12891266 tgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatca 12891364  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12891365 acatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 12891400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17253402 - 17253168
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17253402 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcg 17253303  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||    
T  17253302 tgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatca 17253204  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17253203 acatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 17253168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15585058 - 15584872
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15585058 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 15584959  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  15584958 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 15584872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15591716 - 15591530
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15591716 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 15591617  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  15591616 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 15591530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 7985467 - 7985699
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  7985467 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcaaaagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 7985566  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||  || |||||||  | |||||    
T  7985567 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaattcaccgtaatcatcatatca 7985665  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7985666 acatgcacccaataatttggagctaaacgtcatc 7985699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 6608238 - 6608424
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6608238 gcgacaatgctcctagactccatatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctataaaacg 6608337  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaata-ttcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgta 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   ||||||||||||||    
T  6608338 tgcggaggacaaagctcctaatatttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactctttataacaaaacatcgta 6608424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10325613 - 10325844
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  10325613 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 10325712  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || | ||| ||||||| |||||||||  | |||||    
T  10325713 gtgtggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaaactcaatga-atgctaatgcatgaactc-tatcaacaaaaaatcgtaatcatcatatca 10325810  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10325811 ataagcatccaataatttggagctaaacgtcatc 10325844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 16332934 - 16333165
Alignment:
Q  2 cgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  16332934 cgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatca 16333033  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||  || |||||||  | ||||||    
T  16333034 tgcggaggacaaaactcctgataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaattcaccgtaatcatcatatcaa 16333132  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16333133 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 16333165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 55148747 - 55148973
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  55148747 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatatggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 55148846  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  55148847 tgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 55148940  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55148941 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 55148973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 24187546 - 24187772
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  || ||    
T  24187546 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtgttaatatactttaaacttgcggaggacaaagctcctaataatcg 24187645  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  24187646 tgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 24187739  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24187740 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 24187772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 20722771 - 20722996
Alignment:
Q  2 cgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgt 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  || |||    
T  20722771 cgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaatgtgtggaggacaaagctcctaataatcgt 20722870  T
Q  102 gcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    |||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||     
T  20722871 gcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaat 20722964  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20722965 atgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 20722996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 5200994 - 5201181
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  5200994 gacaatgctcctagactctgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaacatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 5201093  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  5201094 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 5201181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5427051 - 5426864
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  5427051 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 5426952  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  5426951 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 5426864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 12482196 - 12482383
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  12482196 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 12482295  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  12482296 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 12482383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 7109248 - 7109464
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109248 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 7109345  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  7109346 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 7109442  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  7109443 atttggagctaaacgtcatcat 7109464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 7113183 - 7113399
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113183 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 7113280  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  7113281 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 7113377  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  7113378 atttggagctaaacgtcatcat 7113399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27410201 - 27409985
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27410201 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 27410104  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27410103 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 27410007  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  27410006 atttggagctaaacgtcatcat 27409985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 55022417 - 55022633
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022417 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 55022514  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  55022515 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 55022611  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  55022612 atttggagctaaacgtcatcat 55022633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 30065490 - 30065716
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggaca 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  30065490 cttagacactttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaaactcc--taaaacgtgcggaggaca 30065587  T
Q  112 aagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaaca---------aaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||         || |||||||||| || ||||| |||    
T  30065588 aagctcctaa---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaagacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcat 30065684  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30065685 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 30065716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4107956 - 4107740
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4107956 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 4107859  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  4107858 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaatatatcatcatgcatccaata 4107762  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  4107761 atttggagctaaacgtcatcat 4107740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4111808 - 4111592
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111808 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 4111711  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  4111710 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaatatatcatcatgcatccaata 4111614  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  4111613 atttggagctaaacgtcatcat 4111592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 11069620 - 11069836
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11069620 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataggtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 11069717  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  11069718 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 11069814  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  11069815 atttggagctaaacgtcatcat 11069836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11166086 - 11165870
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11166086 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggatgacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 11165989  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  11165988 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 11165892  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  11165891 atttggagctaaacgtcatcat 11165870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 839015 - 839242
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  839015 gcgacaatgctcttagaattcttatatgcatgtggtatcaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 839114  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    | ||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||||  | ||||||    
T  839115 tacggaggacaaaactccta----tcgtggtgaggactaagctcaatgag-tgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcatcatatcaa 839209  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  839210 tgtgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 839242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5420644 - 5420457
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  5420644 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 5420545  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattc-gtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  5420544 cggaggacaaagctcctaataaaatgtggtgaggactaagctcaatgatatgatatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 5420457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 14498877 - 14499093
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14498877 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaatgtgcggaggacaaagctcctaa 14498974  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  14498975 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcataatcaacatatcatcatgcatccaata 14499071  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  14499072 atttggagctaaacgtcatcat 14499093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 15616926 - 15617142
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15616926 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaccgtgcggaggacaaagctcctaa 15617023  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  15617024 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 15617120  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||  |||||||    
T  15617121 atttggagctaaatgtcatcat 15617142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 22321216 - 22321432
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  22321216 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatatttttatcgtgcggaggacaaagctcc--caaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 22321313  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22321314 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 22321410  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  22321411 atttggagctaaacgtcatcat 22321432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 22336271 - 22336487
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  22336271 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatatttttatcgtgcggaggacaaagctcc--caaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 22336368  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22336369 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 22336465  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  22336466 atttggagctaaacgtcatcat 22336487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 28949274 - 28949490
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949274 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttttcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 28949371  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  28949372 ---tcatggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 28949468  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  28949469 atttggagctaaacgtcatcat 28949490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 16634035 - 16634213
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16634035 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 16634134  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16634135 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 16634213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 16640645 - 16640823
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16640645 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 16640744  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16640745 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 16640823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 43161310 - 43161488
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43161310 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 43161409  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  43161410 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 43161488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 43167547 - 43167725
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43167547 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 43167646  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  43167647 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 43167725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 48423552 - 48423730
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48423552 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataagcaagt 48423651  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  48423652 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactgagcttgttc 48423730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 48430330 - 48430508
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48430330 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataagcaagt 48430429  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  48430430 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactgagcttgttc 48430508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16750898 - 16750684
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  16750898 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 16750802  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
        |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  16750801 ---acgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatattatcatgcatccaata 16750705  T
Q  213 atttggagctaaacttcatca 233  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  16750704 atttggagctaaacgtcatca 16750684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1332982 - 1332805
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1332982 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagcgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 1332883  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  1332882 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcac-aactaagcttgttc 1332805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 15360482 - 15360596
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15360482 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaaaaatcgtg 15360581  T
Q  103 cggaggacaaagctc 117  Q
    |||||||||||||||    
T  15360582 cggaggacaaagctc 15360596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15398149 - 15397739
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||     
T  15398149 cgtgcggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcg 15398050  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcac 281  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||    
T  15398049 acatgcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatatatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcac 15397950  T
Q  282 ataacaagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcat-tatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgat 379  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||  || | |  ||| || ||| ||| | | | ||| ||  ||  |||||||| ||    
T  15397949 ataacaggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatatcataaattaaactttcataacttacaccattgtgcaacacgtta-atcatattccat 15397851  T
Q  380 taatattaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgaca 478  Q
    ||  |  || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15397850 tataaacaacatatcttaaacagctttacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgaca 15397751  T
Q  479 cagatcgcacaa 490  Q
    |||||| |||||    
T  15397750 cagatcccacaa 15397739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 38814193 - 38814385
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  38814193 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcatgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 38814289  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  38814290 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttgga 38814384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 15337224 - 15337338
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  15337224 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaaactcctaaaaatcgtg 15337323  T
Q  103 cggaggacaaagctc 117  Q
    |||||||||||||||    
T  15337324 cggaggacaaagctc 15337338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 41201713 - 41201542
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||  |  || ||    
T  41201713 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagcatctaaattct 41201614  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  41201613 ggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 41201542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 490
Target Start/End: Original strand, 15360551 - 15360961
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||     
T  15360551 cgtgcggaggacaaagctcctaaaaatcgtgcggaggacaaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcg 15360650  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcac 281  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||    
T  15360651 acatgcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatatatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcac 15360750  T
Q  282 ataacaagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcat-tatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgat 379  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||  || | |  ||| || ||| ||| | | | ||| ||  ||  |||||||| ||    
T  15360751 ataacaggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatatcataaattaaactttcataacttacaccattgtgcaacacgtta-atcatattccat 15360849  T
Q  380 taatattaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgaca 478  Q
    ||  |  || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15360850 tataaacaacatatcttaaacagctttacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgaca 15360949  T
Q  479 cagatcgcacaa 490  Q
    ||||||||||||    
T  15360950 cagatcgcacaa 15360961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 28368787 - 28368673
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28368787 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 28368688  T
Q  100 gtgcggaggacaaag 114  Q
    |||||||||||||||    
T  28368687 gtgcggaggacaaag 28368673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 28376605 - 28376491
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28376605 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 28376506  T
Q  100 gtgcggaggacaaag 114  Q
    |||||||||||||||    
T  28376505 gtgcggaggacaaag 28376491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 28384427 - 28384313
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28384427 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 28384328  T
Q  100 gtgcggaggacaaag 114  Q
    |||||||||||||||    
T  28384327 gtgcggaggacaaag 28384313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1598776 - 1598584
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1598776 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgaggaggacaaagctcctaa 1598680  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| | ||  || |||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  1598679 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-acgctaatgcatggactc-taacaataaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttgga 1598585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 3833483 - 3833675
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  3833483 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 3833579  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| || ||||| | || ||||||||||||||||    
T  3833580 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgttaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacctatcacatatacatccaataatttgga 3833674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 15964496 - 15964633
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  15964496 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 15964592  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15964593 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 15964633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 15968420 - 15968557
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  15968420 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 15968516  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15968517 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 15968557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 15972344 - 15972481
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  15972344 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 15972440  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15972441 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 15972481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15942201 - 15942009
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  15942201 ttatatgcatgtggtaccaatctttatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 15942105  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || | ||  | ||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15942104 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatgaactc-taacagcaaaacaacttaatcaacttatcacacatacatccaataatttgga 15942010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15398218 - 15398104
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15398218 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaattgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaacgtg 15398119  T
Q  103 cggaggacaaagctc 117  Q
      |||||| ||||||    
T  15398118 gtgaggactaagctc 15398104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 413 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 23704683 - 23704513
Alignment:
Q  413 gcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctg 512  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||  |  || |||    
T  23704683 gcattaaacgtcatcattaggtttcattactaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagcatctaaattctg 23704584  T
Q  513 gttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||    
T  23704583 gttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatcttccaaactagtgttgttc 23704513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 413 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 23723139 - 23722969
Alignment:
Q  413 gcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctg 512  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||  |  || |||    
T  23723139 gcattaaacgtcatcattaggtttcattactaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagcatctaaattctg 23723040  T
Q  513 gttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||    
T  23723039 gttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatcttccaaactagtgttgttc 23722969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 413 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 23741595 - 23741425
Alignment:
Q  413 gcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctg 512  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||  |  || |||    
T  23741595 gcattaaacgtcatcattaggtttcattactaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagcatctaaattctg 23741496  T
Q  513 gttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||    
T  23741495 gttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatcttccaaactagtgttgttc 23741425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 5222874 - 5223065
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  5222874 ttatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcctat----cgtgcggaggacaaagctcctaa 5222969  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  5222970 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 5223064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22643631 - 22643539
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22643631 gcgacaatgctcttagactccttatacgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 22643539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26789103 - 26789013
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789103 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 26789013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 16696594 - 16696763
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  16696594 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgtggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 16696690  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
        | |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16696691 ---acatggtgaggacaaaggtcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatca 16696763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 19775119 - 19775217
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775119 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcattgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 19775216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 120
Target Start/End: Original strand, 15464651 - 15464746
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctccta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||    
T  15464651 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctccta 15464746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 234
Target Start/End: Original strand, 15337293 - 15337428
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||     
T  15337293 cgtgcggaggacaaaactcctaaaaatcgtgcggaggacaaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcg 15337392  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  15337393 acatgcatccaacaatttggagctaaatgtcatcat 15337428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 29696026 - 29695943
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29696026 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaa 29695943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16809176 - 16809009
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||     
T  16809176 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgtggaggacaaagctccta- 16809082  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  16809081 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatca 16809009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 120
Target Start/End: Original strand, 12339252 - 12339347
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctccta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||    
T  12339252 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctgct---aatcgtgcggaggacaaagctccta 12339347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4589470 - 4589378
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||    
T  4589470 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtggggaggacaaagctc 4589378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 37440194 - 37440123
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440194 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 37440123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 17241783 - 17241972
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||    
T  17241783 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccgaa 17241877  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  | |  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  17241878 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactta-aacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 17241971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 8489744 - 8489652
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctc 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  8489744 ttatatgcatgtggtatcaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctc 8489652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Original strand, 12482585 - 12482789
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  12482585 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 12482684  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  12482685 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 12482784  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  12482785 ttgtt 12482789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 5426652 - 5426469
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5426652 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgac 5426553  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | | | || |   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5426552 acagatcgcacaaccacccaaacagctacgttctagacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactc 5426469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 411 - 561
Target Start/End: Original strand, 6608669 - 6608819
Alignment:
Q  411 ctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcc 510  Q
    ||||||||||||  |||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||| |||  | | ||| |    
T  6608669 ctgcattaaacgttatctttaggtttcattaccaactaggggttcactcttgatcgaaaggtgcgacacggatcgcacaaacacacaaaacactacattc 6608768  T
Q  511 tggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608769 tggacttgctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 6608819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 411 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 15584636 - 15584486
Alignment:
Q  411 ctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcc 510  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||  |||||  | ||| |    
T  15584636 ctgcattaaacgttatcataaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgacacagatcgcaccaccactcaaacagctacattc 15584537  T
Q  511 tggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    |||   | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15584536 tggacttgctcgcgaggcgagggttcttactcgccatggcgagtaccactc 15584486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 411 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 15591294 - 15591144
Alignment:
Q  411 ctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcc 510  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||  |||||  | ||| |    
T  15591294 ctgcattaaacgttatcataaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgacacagatcgcaccaccactcaaacagctacattc 15591195  T
Q  511 tggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    |||   | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15591194 tggacttgctcgcgaggcgagggttcttactcgccatggcgagtaccactc 15591144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16798336 - 16798182
Alignment:
Q  35 gtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgag 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||    || |||||||    
T  16798336 gtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgtggaggacaaagctccta----tcatggtgag 16798245  T
Q  135 gactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  16798244 gacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatca 16798182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 24187967 - 24188111
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  | | ||  ||    
T  24187967 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaagcactccaatct 24188066  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24188067 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 24188111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 583
Target Start/End: Original strand, 839436 - 839607
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  839436 tgcattaaacgtcatcataaggtctcattaccacttaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaatacactccaatct 839535  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||  || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | | || |||||| |||||| |||||||    
T  839536 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagttcaagtcaactccccaactaatgttgttc 839607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 378 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 5420254 - 5420071
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5420254 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcattatgtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgac 5420155  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | | | || |   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5420154 acagatcgcacaaccacccaaacagctacgttctagacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactc 5420071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 583
Target Start/End: Original strand, 19809204 - 19809390
Alignment:
Q  397 aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacat 496  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||      
T  19809204 aacagctctacagactgcatttaacgtcatcattaggtctcattatcataaaggggttcactcttgatccaaatgtgcgacacagatcgcacaaacactc 19809303  T
Q  497 aaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||   | |  |  ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||    
T  19809304 aagacactcaaagctggaagtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccaaacaattcccaaactaaagttgttc 19809390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Original strand, 5201380 - 5201584
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| |||| |||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  5201380 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgctttaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 5201479  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  5201480 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggtgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 5201579  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  5201580 ttgtt 5201584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28351398 - 28351277
Alignment:
Q  111 aaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatcca 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||  || |||||||  | |||||| |||||||||    
T  28351398 aaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaattcaccgtaatcatcatatcaatatgcatcca 28351300  T
Q  210 ataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  28351299 ataatttggagctaaacgtcatc 28351277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Original strand, 15482474 - 15482542
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15482474 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtggggaggacaaagctcc 15482542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11301017 - 11300871
Alignment:
Q  72 cgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacata 170  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | ||    
T  11301017 cgtgcggaggacaaagctccta---atcgtgcggaggacaaaactcctaataatcgtggtgaggactaagctcagtga-atgctaatgcatggactctta 11300922  T
Q  171 tgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    | ||||| ||| | ||||| ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  11300921 tcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggag 11300871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 55149168 - 55149312
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  | |  |  ||    
T  55149168 tgcattacacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaagcactcaaatct 55149267  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  55149268 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 55149312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 583
Target Start/End: Original strand, 7985897 - 7986067
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  7985897 tgcattaaacgtcatcattaggtctcattacca-taaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaatgcactccaatct 7985995  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  7985996 gaaaatgctcgcgaggcgagagtacctactcgccatggcgagttcaagccaactcccaaactaatgttgttc 7986067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 412 - 558
Target Start/End: Original strand, 16333363 - 16333509
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  16333363 tgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccataaagggattcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaatgcactccaatct 16333462  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtacca 558  Q
    ||  || ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  16333463 ggaagtgctcgcgaggcgagggttcctactcgccatggcgagtacca 16333509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 233
Target Start/End: Original strand, 19775194 - 19775358
Alignment:
Q  72 cgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||     
T  19775194 cgtgcggaggacaaagctccta---atcgtgcggaggacaaagcttctaaa---cgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaa 19775287  T
Q  172 gaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatca 233  Q
     |||||||         |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19775288 caacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatattatcatgcatccaataatttggagctaaacgtcatca 19775358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 412 - 494
Target Start/End: Original strand, 20723191 - 20723273
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  20723191 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacatgcgacacagatcgcacaaacac 20723273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 31097860 - 31097779
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat 94  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31097860 cttagacactctttatgcatgtggtaccaatcttcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat 31097779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4589420 - 4589289
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaaca-tcgtaatcgacttat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||  | |||    
T  4589420 cgtgcggaggacaaagctcctaat---cgtggggaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacaatcgtattcatcatat 4589326  T
Q  197 caacatgcatccaataatttggagctaaacttcatca 233  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4589325 caatatgcatccaataatttggagctaaacgtcatca 4589289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 165
Target Start/End: Original strand, 11854328 - 11854417
Alignment:
Q  73 gtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11854328 gtgcggaggacaaagctccta---aacgtgcggaggataaagctgctaatcgtcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggac 11854417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 510 - 583
Target Start/End: Original strand, 30066237 - 30066310
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  30066237 ctggatgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 30066310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 510 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 11165347 - 11165283
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaacta 574  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11165347 ctggatgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaacta 11165283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 519 - 583
Target Start/End: Original strand, 14499625 - 14499689
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  14499625 ctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 14499689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 17252979 - 17252828
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca-ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaag 503  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||   |     
T  17252979 tacagactgcattaaacgtcatcatt-ggtctcaattaccataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacac 17252881  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    | || |||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17252880 tccaacctggaagtgctcgcgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 17252828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Original strand, 12339322 - 12339467
Alignment:
Q  68 taatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggaca 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |     
T  12339322 taatcgtgcggaggacaaagctcctat----cgtgcggaggacaaagctcctaa---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggcct 12339413  T
Q  167 catatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  12339414 c-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggag 12339467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 556
Target Start/End: Original strand, 13321155 - 13321306
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||  |    | |    
T  13321155 tacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacatatcgcacaagcactcattacact 13321254  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||| | ||   || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13321255 tcaacttgaaagtgctcgcgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 13321306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 411 - 490
Target Start/End: Original strand, 15337623 - 15337702
Alignment:
Q  411 ctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaa 490  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  15337623 ctgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcaattaggggttcactcttgatgaaaacgtgcgacacagatcgcacaa 15337702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Original strand, 15464721 - 15464866
Alignment:
Q  68 taatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggaca 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||   || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  15464721 taatcgtgcggaggacaaagctcctat----cgtgcggaggacaaaactcctaa---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggact 15464812  T
Q  167 catatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  15464813 c-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggag 15464866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20461807 - 20461647
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcc 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    || ||||  |||||||||||||     
T  20461807 ttatatgcatgtggtatcaatcgtcatcat-agtattaatatactttacgcatcgtggggaggacaaagctcc----aatcgtggtgaggacaaagctc- 20461714  T
Q  119 taatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
        | |||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20461713 ---aaatcgtggcgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatc 20461647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7793657 - 7793586
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  7793657 ttatatgcatgtggtaccaatcgttatcat-agtattaatatactttaagcatcgtggggaggacaaagctcc 7793586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 412 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 28351077 - 28350995
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||   |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  28351077 tgcattaaacgtcatcattagatctcattaccataaagggattcactcttgattaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacac 28350995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 327472 - 327401
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt-ta--atcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  327472 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatca-aagtattaatatacttatagcatcgtggggaggacaaagctcc 327401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 583
Target Start/End: Original strand, 11070359 - 11070432
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||    
T  11070359 ctggatgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatcttccaaactagtgttgttc 11070432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Original strand, 14668359 - 14668430
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt-ta--atcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  14668359 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatca-aagtattaatatacttatagcatcgtggggaggacaaagctcc 14668430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Original strand, 4290931 - 4290979
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat 51  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4290931 gacaatgctcttagacactttatatgcatgtggtgccaatcgtcatcat 4290979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 556
Target Start/End: Original strand, 12891589 - 12891740
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca-ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaag 503  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||   |     
T  12891589 tacagactgcattaaacgtcatcatt-ggtctcaattaccataagggggttctctcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacac 12891687  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    | || |||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12891688 tccaacctggaagtgctcgcgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 12891740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 30777311 - 30777057
Alignment:
Q  241 atgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttct 339  Q
    |||||||| |||||||||| | || ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |  | | |||| || | |  | |     
T  30777311 atgcacttggttaaataacagcagaagcataatcaagtcacataacaggatgatatcattatatcaatagcacatcaactatgtcataattaaacttcca 30777212  T
Q  340 tatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa-caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca 438  Q
    |||||| ||  ||| ||||||||| || | |||| || || ||||| || ||| | ||| || || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |    
T  30777211 tatcttacataaatgtacaatacattaat-catactcaatcaatatcaacatatcctaaacagctttacagactgcatttaacgtcatcattaggtctta 30777113  T
Q  439 ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||| ||    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30777112 ttatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacac 30777057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 307
Target Start/End: Original strand, 15337452 - 15337518
Alignment:
Q  241 atgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatatcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15337452 atgcacttagttaaataacagcagtagcataatcaagtcacataacaggatgatatcattatatcaa 15337518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Original strand, 14665203 - 14665247
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14665203 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatca-aagtattaatatactt 14665247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Original strand, 11854266 - 11854313
Alignment:
Q  71 tcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  11854266 tcgtgcggaggacaaagctccta---aacgtgcggaggacaaagctcctaa 11854313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 2898130 - 2898058
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaat-cgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  2898130 ttatatgcatgtggtaccaatacttcatcat-agtattaatatactttaagcatcgtggggaggacaaagctcc 2898058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 494
Target Start/End: Original strand, 10326043 - 10326125
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttga-tcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10326043 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaataaggg-ttcgctcttgaatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacac 10326125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 583
Target Start/End: Original strand, 4290999 - 4291133
Alignment:
Q  449 ggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatg 548  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | |  | |  |   |||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4290999 ggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcataacactcaaggttggaggtgctcgcgaggcgagagttcttgctcgccatg 4291098  T
Q  549 gcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||  | | |||||||| || |||||||    
T  4291099 gcgagtaccaaacaattcccaaacaaaagttgttc 4291133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Original strand, 14572386 - 14572431
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt 67  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  14572386 ttatatgcatgtggtaccaatcatcgtaataagtattaatatactt 14572431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15343528 - 15343439
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  15343528 tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaatcgcacaaacac 15343439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15350171 - 15350082
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  15350171 tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaatcgcacaaacac 15350082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37440144 - 37440081
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37440144 cgtgcggaggacaaagctcctaa---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 37440081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14577155 - 14577112
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatac 65  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  14577155 ttatatgcatgtggtaccaatcatcgtaataagtattaatatac 14577112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 15711614 - 15711579
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtac 38  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15711614 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtac 15711579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15367016 - 15366950
Alignment:
Q  241 atgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatatcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | | || ||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  15367016 atgcacttagttaaataacagcaacatcataatcaagtcacataacaggatgatatcattaaatcaa 15366950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 49668410 - 49668364
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt 68  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  49668410 ttatatgcatgtggtaccaatcaacgtaataagtattaatatacttt 49668364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Original strand, 9512707 - 9512752
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  9512707 ttatatgcatgtggtaccaatcaacgtaataagtattaatatactt 9512752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Original strand, 9520682 - 9520727
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  9520682 ttatatgcatgtggtaccaatcaacgtaataagtattaatatactt 9520727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 15397711 - 15397674
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15397711 ctcgcgaggcgagagttcttgctcgccatggcgagtac 15397674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 15404302 - 15404265
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15404302 ctcgcgaggcgagagttcttgctcgccatggcgagtac 15404265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Original strand, 16103567 - 16103612
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  16103567 ttatatgcatgtggtaccaatcaacgtaataagtattaatatactt 16103612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 307
Target Start/End: Original strand, 7985721 - 7985791
Alignment:
Q  240 tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaa---gatgatatcactatatcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||| |||||   |||||||||| ||||||||    
T  7985721 tatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaagtcacacaacaacaggatgatatcattatatcaa 7985791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 510; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 20216253 - 20215673
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20216253 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 20216154  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20216153 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 20216055  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20216054 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 20215955  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  20215954 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 20215855  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20215854 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttgggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 20215755  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20215754 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaaggttgttc 20215673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 44845210 - 44844627
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44845210 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctgtaaaacgtg 44845111  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44845110 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcacggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 44845011  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  44845010 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatagacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcattat 44844911  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  44844910 atcaatagcacataaattgcattattatcacatcttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttatccaattaatattaatataacttaaaca 44844811  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44844810 actctacagtctgcattaaacaacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatc 44844711  T
Q  501 aagttcatcct-ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44844710 aagttcatcctgggttgtactcgcgaggcgagagctcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggtcgttc 44844627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 51329005 - 51328423
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51329005 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 51328906  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  51328905 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 51328807  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  51328806 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 51328707  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataa-cttaac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||| || |||    
T  51328706 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattaattcatattcaattaatatcaatataacctaaac 51328607  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |      
T  51328606 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacagacactcagg 51328507  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51328506 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttacttgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 51328423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 51335639 - 51335057
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51335639 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 51335540  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  51335539 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcaacgtaatcaaca 51335441  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  51335440 tgcatccaataatttggagctaaactttatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatattatta 51335341  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataa-cttaac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||| || |||    
T  51335340 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattaattcatattcaattaatatcaatataacctaaac 51335241  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |      
T  51335240 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacagacactcagg 51335141  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     || | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51335140 aaactacaatctggttgtactcgcgaggcgagagttcttacttgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaagcttgttc 51335057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 47658993 - 47659578
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47658993 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 47659092  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47659093 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgttatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 47659192  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  47659193 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacagatcacataaacaaaatgatatcatta 47659292  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata-actt--a 397  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | |||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  |||  |    
T  47659293 tatcaatagcacataaattgcatcattatcaagttttcacatcttgcatgaatatacaatacattagttcatactcaattaatatcaatatagtctttaa 47659392  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  47659393 acaactctacaggctgcagtaaacatcatcactaggtctcaatgctaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactca 47659492  T
Q  498 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    | ||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  47659493 agcaactaccttctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 47659578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16346101 - 16345519
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16346101 gacaatgctcttagacttcttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16346002  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  16346001 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 16345903  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||  ||    
T  16345902 tgcatccaataatttggagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaaatctcatatcaagatgatatcttta 16345803  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |  || || ||||| || ||||||| |||    
T  16345802 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcttgctcaatgaatatcaatataacttaaac 16345703  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||     
T  16345702 aactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactcaag 16345603  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  16345602 caactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 16345519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 41349178 - 41348595
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41349178 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 41349079  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  41349078 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 41348980  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||    
T  41348979 tgcatccaataatttggagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacagaagcagcataaacaagtcacacagcaagatgatatcatta 41348880  T
Q  302 tatca-aagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata-actt-aa 398  Q
    |||||  ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||| ||    
T  41348879 tatcattagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatactcaattaatatcaatatagtcttaaa 41348780  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  41348779 caactctacaggctgcagtaaacatcatcactaggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactcaa 41348680  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  41348679 gcaactacattctggttgtactcgtgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 41348595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 41356615 - 41356032
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41356615 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 41356516  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  41356515 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 41356417  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||    
T  41356416 tgcatccaataatttgaagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacagaagcagcataaacaagtcacacagcaagatgatatcatta 41356317  T
Q  302 tatca-aagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata-actt-aa 398  Q
    |||||  ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||| ||    
T  41356316 tatcattagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatactcaattaatatcaatatagtcttaaa 41356217  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  41356216 caactctacaggctgcagtaaacatcatcactaggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactcaa 41356117  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  41356116 gcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 41356032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16352750 - 16352167
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352750 gacaatgctcttagacttcttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 16352651  T
Q  103 cggaggacaaagctcct-aatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactta-tcaac 200  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | || |||||    
T  16352650 cggaggacaaagctccttaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaac 16352552  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcact 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||  |    
T  16352551 atgcatccaataatttggagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaaatctcatatcaagatgatatcttt 16352452  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa- 398  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |  || || ||||| || |||||||||     
T  16352451 atatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcttgctcaatgaatatcaatataacttaaa 16352352  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  16352351 caactctacaggctgcattaaacgtcatcactaggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactcaa 16352252  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  16352251 gcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 16352167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 18600432 - 18599851
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18600432 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 18600333  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  18600332 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 18600233  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |    
T  18600232 tgcatccaataatttggagct-aacttcatcataaacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacagatcacataaacaaaatgatatcatt 18600134  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| |||  |||| |   |  | ||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| || ||||||| ||    
T  18600133 atatcaatagcttataaatatcaggaatatca-accttcatttcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccatttaatatcaacataacttaaa 18600035  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||    
T  18600034 caactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactgggggttcgctcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacattcaa 18599935  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  18599934 gcaagtacattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaaagttgtt 18599851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 41478904 - 41478321
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41478904 gacaatgctcttagactccctatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 41478805  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  41478804 cggaggacaaagctcctattattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaaacatcgtaatcaacatatcaaca 41478705  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |    
T  41478704 tgcatccaataatttggagct-aacttcatcataaacttatgcacttagttaaataacgaaagcagcataaacagatcacataaacaaggtgatatcatt 41478606  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
     |||||| |||  |||| |   |  | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| || ||||||| ||    
T  41478605 ttatcaatagcttataaatatcaggaatatca-accttcgtatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcatttaatatcaacataacttaaa 41478507  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  41478506 caactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaataccaactaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaa 41478407  T
Q  499 acaagttca-tcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  41478406 gcaattacattcttggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 41478321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 303
Target Start/End: Original strand, 21828493 - 21828793
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828493 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 21828592  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||  ||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  21828593 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgttatgcatggactcttaacaacaaaacgccgtaatcaacatatcaacat 21828692  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  21828693 gcatccaataatttggagctaaaattcatcatatacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 21828792  T
Q  303 a 303  Q
    |    
T  21828793 a 21828793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 21807542 - 21806945
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  21807542 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 21807443  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21807442 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 21807343  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  21807342 gcatccaacaatttggagctaaacatcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 21807243  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||| ||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  21807242 caggatgatatcattatatcaatagcgcatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 21807144  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  21807143 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 21807045  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  | |  | |  |  ||||  || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  21807044 cgcacaaacactcataacactcaaggctggaggtgctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 21806945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 33386565 - 33385968
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  33386565 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 33386466  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33386465 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 33386366  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  33386365 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 33386266  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || |||     
T  33386265 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaatc 33386167  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  33386166 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 33386068  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  | |  | |  |  ||||  || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  33386067 cgcacaaacactcacaacactcaaggctggaggtgctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 33385968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Original strand, 21835130 - 21835638
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  21835130 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 21835229  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21835230 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 21835329  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  21835330 gcatccaacaatttggagctaaacatcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 21835429  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||| ||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  21835430 caggatgatatcattatatcaatagcgcatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 21835528  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  21835529 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 21835627  T
Q  484 cgcacaaacac 494  Q
    |||||||||||    
T  21835628 cgcacaaacac 21835638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33393210 - 33392889
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  33393210 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 33393111  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33393110 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 33393011  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  33393010 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 33392911  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa 307  Q
    || |||||||||| ||||||||    
T  33392910 caggatgatatcattatatcaa 33392889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 43078198 - 43078384
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078198 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 43078297  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43078298 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 43078384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46157668 - 46157482
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46157668 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 46157569  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46157568 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 46157482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 582
Target Start/End: Original strand, 19104513 - 19105113
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta-taaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  19104513 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 19104612  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||| || |||||||  | |||||    
T  19104613 gtgcggaggacaaagctcctaataaccgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcatcatatca 19104711  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacct--------------atgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacata 284  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |              ||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||| |    
T  19104712 atatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcttattcattatgtatagacattatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaagtcacaca 19104811  T
Q  285 acaa---gatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatc-ttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgat 379  Q
    ||||   |||||||||| ||||||||  |||  | | | | ||||| || |  || ||| || ||| ||  ||| || |||||| || |||||  || ||    
T  19104812 acaacatgatgatatcattatatcaattgcaattcaatagcatcataat-atttcattcataccttaca-taatgtataatacattaattcatgctcaat 19104909  T
Q  380 taatattaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgaca 478  Q
    |||||| || ||| ||| |||  || ||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  19104910 taatatcaacatatcttaaacggctttacagactgcattaaacatcattattaggtctcattaccaattaggggttcacttttgatcaaaacgtgcgaca 19105009  T
Q  479 cagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggt 578  Q
    ||||||||||||||||  ||   | | ||  ||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||    
T  19105010 cagatcgcacaaacactcaaggcactccaatctggaagtgctcgcgaggcgagagttcctactcgccatggcgagtaccagtcaatttccaaactaatgt 19105109  T
Q  579 tgtt 582  Q
    ||||    
T  19105110 tgtt 19105113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 19111171 - 19111402
Alignment:
Q  2 cgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19111171 cgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcg 19111270  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||||  | ||||||    
T  19111271 tgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcatcatatcaa 19111369  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19111370 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 19111402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 50888098 - 50887864
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  50888098 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcg 50887999  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||    
T  50887998 tgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatca 50887900  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50887899 acatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 50887864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20525560 - 20525328
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20525560 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 20525461  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||  |||||||||   |||||  | |||||    
T  20525460 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactattaacaacaaaacacaataatcatcatatca 20525362  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20525361 atatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 20525328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 8304903 - 8305138
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  8304903 gcgacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaaactcctaataaatc 8305002  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || ||||||| || ||||    
T  8305003 gtgcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcaacatatc 8305101  T
Q  198 aacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8305102 aatatgcatccaataatttggacctaaacgtcatcat 8305138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 23762980 - 23763206
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  23762980 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 23763079  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  23763080 tgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 23763173  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23763174 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 23763206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27898998 - 27898811
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  27898998 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 27898899  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  27898898 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 27898811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43063615 - 43063428
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  43063615 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 43063516  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  43063515 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 43063428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 44755872 - 44756059
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  44755872 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 44755971  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  44755972 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 44756059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 49334339 - 49334526
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  49334339 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 49334438  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  49334439 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 49334526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 1010272 - 1010488
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010272 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 1010369  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  1010370 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 1010466  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  1010467 atttggagctaaacgtcatcat 1010488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 52639090 - 52639306
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639090 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 52639187  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  52639188 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 52639284  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  52639285 atttggagctaaacgtcatcat 52639306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18626623 - 18626436
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  18626623 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcatgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 18626524  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  18626523 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 18626436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 137 - 303
Target Start/End: Original strand, 21844140 - 21844306
Alignment:
Q  137 ctaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatat 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844140 ctaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacgccgtaatcaacatatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatat 21844239  T
Q  237 acctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactata 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21844240 acatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattata 21844306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Original strand, 33384837 - 33385023
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||    
T  33384837 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggataaagctcctaataatcgtg 33384936  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaat 188  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  33384937 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaat 33385023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 21406905 - 21407120
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  21406905 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 21407001  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  21407002 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 21407098  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  21407099 atttggagctaaacgtcatcat 21407120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 46157243 - 46157065
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46157243 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 46157144  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  46157143 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 46157065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16376015 - 16375798
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376015 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 16375918  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagat-gctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaat 211  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  16375917 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatagctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaat 16375821  T
Q  212 aatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  16375820 aatttggagctaaacgtcatcat 16375798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 43078623 - 43078801
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43078623 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 43078722  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  43078723 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 43078801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1925711 - 1925519
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  1925711 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 1925615  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  1925614 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 1925520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20924725 - 20924533
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  20924725 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 20924629  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  20924628 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 20924534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 412 - 583
Target Start/End: Original strand, 21828904 - 21829075
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||| ||    
T  21828904 tgcattaaacatcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaactcgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagcaactacattct 21829003  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  21829004 agttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccaaggcgagtaccactcaactcccaaactagtgttgttc 21829075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41388576 - 41388478
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41388576 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 41388479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 583
Target Start/End: Original strand, 21844429 - 21844588
Alignment:
Q  424 catcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgc 523  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||| |||||||| |||||    
T  21844429 catcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaactcgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagcaactacattctggttgtgctcgc 21844528  T
Q  524 gaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  21844529 gaggcgagagttcttactcaccaaggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 21844588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20229565 - 20229466
Alignment:
Q  21 tttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctccta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20229565 tttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattgatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctccta 20229468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 20137893 - 20138083
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||     
T  20137893 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgtggaggacaaagctccta- 20137988  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  20137989 ---tcatggtgagg-caaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 20138082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 39244476 - 39244380
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  39244476 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 39244380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 39248031 - 39247935
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  39248031 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 39247935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 120
Target Start/End: Original strand, 33797068 - 33797163
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctccta 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  33797068 ttatatgcatgtggtaccaatcttcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctccta 33797163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 19211678 - 19211867
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |     
T  19211678 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccga- 19211771  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  19211772 ---tcatggtgaggacatagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacgaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 19211866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 76
Target Start/End: Original strand, 21844067 - 21844140
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgc 76  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844067 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgc 21844140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 27898609 - 27898405
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  27898609 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 27898510  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  27898509 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 27898410  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  27898409 ttgtt 27898405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 43063226 - 43063022
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  43063226 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 43063127  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  43063126 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 43063027  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  43063026 ttgtt 43063022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Original strand, 44756261 - 44756465
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  44756261 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 44756360  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  44756361 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 44756460  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  44756461 ttgtt 44756465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Original strand, 49334728 - 49334932
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  49334728 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 49334827  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  49334828 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 49334927  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  49334928 ttgtt 49334932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 19111593 - 19111771
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | |    
T  19111593 tacagactgcattaaacatcattattaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaggcact 19111692  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||  ||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |   ||||||||| |||||||    
T  19111693 ccaatctggaagtgctcgcgaggcgagagttcctactcgccatggcgagtaccagtcaatatccaaactaatgttgttc 19111771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 380 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 18626222 - 18626042
Alignment:
Q  380 taatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacac 479  Q
    |||||| || ||||||||| | || |||||  ||| |||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18626222 taatatcaacataacttaatagctttacagattgctttaaacgttatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgacac 18626123  T
Q  480 agatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||||||||| ||| | ||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18626122 agatcgcacaaccac-tcaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactc 18626042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 406 - 583
Target Start/End: Original strand, 19063704 - 19063881
Alignment:
Q  406 acagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagtt 505  Q
    |||| |||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | |     
T  19063704 acagactgcattaaacatcattattaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaggcactc 19063803  T
Q  506 catcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||  ||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |   ||||||||| |||||||    
T  19063804 caatctggaagtgctcgcgaggcgagagttcctactcgccatggcgagtaccagtcaatatccaaactaatgttgttc 19063881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 23763401 - 23763545
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  | | ||  ||    
T  23763401 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaagcactccaatct 23763500  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23763501 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 23763545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 46975300 - 46975371
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46975300 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtatgaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctccta 46975371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 12646681 - 12646870
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||    
T  12646681 ttatatgcatgtggttccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggaaaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccgaa 12646775  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  | |  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  12646776 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactta-aacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 12646869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 20525131 - 20524961
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||   |    
T  20525131 tgcattaaacatcatcattaggtctcattaccaattagggattcacttttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaggcactccaattt 20525032  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    ||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  20525031 ggaagtgctcgcgaggcgagagttcctactcgccatggcgagtaccaatcaacttccaaactaatgttgtt 20524961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 378 - 560
Target Start/End: Original strand, 33394003 - 33394185
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  33394003 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaactaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 33394102  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccact 560  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| | ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  33394103 acagatcgcacaaccactcaaacaactacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtgccact 33394185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39244382 - 39244237
Alignment:
Q  94 taaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||    
T  39244382 taaaacgtgcggaggacaaagctcctaat---cgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcg 39244286  T
Q  185 taatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatca 233  Q
    ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39244285 taatcaacatattatcatgcatccaataatttggagctaaacgtcatca 39244237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39247937 - 39247792
Alignment:
Q  94 taaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||    
T  39247937 taaaacgtgcggaggacaaagctcctaat---cgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcg 39247841  T
Q  185 taatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatca 233  Q
    ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39247840 taatcaacatattatcatgcatccaataatttggagctaaacgtcatca 39247792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 94
Target Start/End: Original strand, 18882201 - 18882273
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18882201 ttatatgcatgtagtaccaatcgtcatcaaaagtattaatacactttcatcgtgcggaggacaaagctcctat 18882273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 21437984 - 21438128
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  | | ||  ||    
T  21437984 tgcattaaacttcatcattaggtttcattaccaaataggggttcactcttgatcaaaatgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaaacactccaatct 21438083  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21438084 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 21438128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41388501 - 41388337
Alignment:
Q  72 cgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||     
T  41388501 cgtgcggaggacaaagctccta---atcgtgcggatgacaaagctcctaaa---cgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaa 41388408  T
Q  172 gaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatca 233  Q
     |||||||         |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41388407 caacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatattatcatgcatccaataatttggagctaaacgtcatca 41388337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 36819604 - 36819536
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36819604 ttatatgcatgtggtatcaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtggggaggacaaagctcc 36819536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20229489 - 20229333
Alignment:
Q  72 cgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | ||     
T  20229489 cgtgcggaggacaaagctccta---atcgtgcggaggacaaagctcctaaa---cgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctaagcatggactcttaa 20229396  T
Q  172 gaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaa 225  Q
     |||||||         |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20229395 caacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatattatcatgcatccaataatttggagctaaa 20229333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 232
Target Start/End: Original strand, 21437686 - 21437789
Alignment:
Q  128 tggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaac 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21437686 tggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaatcatcgtaatcatcatatcaatatgcatccaataatttggagctaaac 21437783  T
Q  227 ttcatc 232  Q
     |||||    
T  21437784 gtcatc 21437789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 21312927 - 21313087
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    || ||||  |||||||||||||     
T  21312927 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-agtattaatatactttaagcatcgtggggaggacaaagctcc----aatcgtggtgaggacaaagctc- 21313020  T
Q  119 taatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
        | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  21313021 ---aaatcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatc 21313087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Original strand, 21172811 - 21172882
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  21172811 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-agtattaatatactttaagcatcgtggggaggacaaagctcc 21172882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 510 - 583
Target Start/End: Original strand, 1011011 - 1011084
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  1011011 ctggatgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 1011084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16080711 - 16080645
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16080711 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-agtattaatatacttt-atcgtg-ggaggacaaagctcc 16080645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 220
Target Start/End: Original strand, 46975350 - 46975468
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  46975350 cgtgcggaggacaaagctcctaa---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatc 46975444  T
Q  198 a-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    | | || |||||||||||||||||    
T  46975445 acatatacatccaataatttggag 46975468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 556
Target Start/End: Original strand, 8305319 - 8305470
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca-ag 503  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| | |||| |     
T  8305319 tacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccttaagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaagcac-tcaacacac 8305417  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    |  | |||||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  8305418 tctaacctggaagtgctcgcgaggcaagaattcttactcgccatggcgagtac 8305470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 50887675 - 50887524
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca-ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaag 503  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||   |     
T  50887675 tacagactgcattaaacgtcatcatt-ggtctcaattaccataagggggttctctcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacac 50887577  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    | || |||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  50887576 tccaacctggaagtgctcgcgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 50887524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 33392791 - 33392612
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagt-taggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaag 503  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||   | ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  | |  |     
T  33392791 tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataatgggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaatcgcacaaacactcacaacac 33392692  T
Q  504 ttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |  |  ||||  || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  33392691 tcaaggctggaggtgctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 33392612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 507; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 30306 - 30888
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30306 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 30405  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30406 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtgatcaacttatcaacat 30505  T
Q  203 gcatccaataa-tttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30506 gcatccaataattttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcatta 30605  T
Q  302 tatcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  30606 tatcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgagtatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaaca 30705  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30706 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaac 30805  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30806 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 30888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 73224 - 72643
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73224 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 73125  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  73124 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 73025  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  73024 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatgattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 72925  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  72924 atcaaagcacataatttgtatcattatcacattttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcgattgatattaatataacttaaacaa 72825  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  72824 ctctacaatctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 72725  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  72724 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 72643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 7840 - 8420
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7840 gacaatgctcttagacttcttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 7939  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  7940 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 8039  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  8040 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatataatta 8139  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  || |||||    || ||  |||||      
T  8140 tatcaacagcaaatcatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgctcaattaacgacaacatgtcttaaag 8237  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
     || | ||    ||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || |    
T  8238 gctttgcaaatcgcattaaacgttatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagattgcacaaacactcaagc 8337  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |  |  || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  8338 atctaaattctggttgtgctcgtgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 8420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 62069 - 62207
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  62069 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctcctaa 62166  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  62167 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 62207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 18999 - 19156
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    || ||||  |||||||||||||        
T  18999 ttatatgcatgtggtaccaatcatcatcata-gtattaatatactttaatcgtggggaggacaaagctcc----aatcgtggtgaggacaaagctc---- 19089  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  19090 aaatcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatc 19156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 12715 - 12872
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    || ||||  |||||||||||||        
T  12715 ttatatgcatgtggtaccaatcatcatcata-gtattaatatactttaatcgtggggaggacaaaactcc----aatcgtggtgaggacaaagctc---- 12805  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  12806 aaatcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatc 12872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 502; Significance: 0; HSPs: 138)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 6980440 - 6981020
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6980440 gacaatgctcctagactcctcatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 6980539  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6980540 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 6980638  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  6980639 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaataggtcacataacaagatgatatcattat 6980738  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  6980739 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 6980838  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6980839 ctctacagtctgcattaaacaacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactctcgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 6980938  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6980939 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 6981020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 20650117 - 20649538
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20650117 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 20650018  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20650017 cggaggacaaaactcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-acttatcaacat 20649919  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20649918 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataattatgcacttagttaaataatggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcgttat 20649819  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactta-acaa 401  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  20649818 atc-aagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatgcaatagttcatattcaattaatattaatataacttagacaa 20649720  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20649719 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 20649620  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20649619 aattcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 20649538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 12762483 - 12763063
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12762483 gacaatgctcctagactccttttatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaa-cgtg 12762581  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12762582 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 12762681  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12762682 gcatccaataatttggagctagacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacagaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 12762781  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  12762782 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatctccttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 12762881  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12762882 ctctacagtctgcattaaacgacatcaccaggtctcattaccagctaggggttcactcttaatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 12762981  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  12762982 agttcatcctggttgtactcgtgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtacctctcaactcccaaactaagcttgttc 12763063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 2870462 - 2869880
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870462 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 2870363  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  2870362 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaatat 2870263  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2870262 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 2870163  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||  || |||| ||||    
T  2870162 atcaatagcacataaattgtatcattatcaaatcttcatatcttgcataaatgtacattacattagctcatgttcaattaatattatcatgacttaaaca 2870063  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870062 actctacagactgcatttaacgacatcactaggtctcattactagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 2869963  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2869962 aagttcattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaaggttgttc 2869880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 2877077 - 2876495
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2877077 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 2876978  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  2876977 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatcaatat 2876878  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2876877 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 2876778  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||  || |||| ||||    
T  2876777 atcaatagcacataaattgtatcattatcaaatcttcatatcttgcataaatgtacattacattagctcatgttcaattaatattatcatgacttaaaca 2876678  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2876677 actctacagactgcatttaacgacatcactaggtctcattactagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 2876578  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2876577 aagttcattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcccaaactaaggttgttc 2876495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 30597006 - 30597579
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597006 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 30597105  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30597106 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacaca--------aaacatcgtaatcaacttatcgacat 30597197  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30597198 gcatccaataatttggagcttaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 30597297  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  30597298 atcaaagcacataatttgtatctttatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaacagttcatattcaattaatattaatataacttaaacaa 30597397  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597398 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcatcaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 30597497  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    | | |||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30597498 attccatattggttgtgctcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaaccaaggttgttc 30597579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 20060429 - 20061011
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060429 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 20060528  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20060529 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 20060628  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  20060629 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcattat 20060728  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  20060729 atcaatagcacataaattgcattattatcacatcttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttatccaattaatattaatataacttaaaca 20060828  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20060829 actctacagtctgcattaaacaacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatc 20060928  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20060929 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagctcttactcgccttggcgagcaccactcaactcccaaactaaggtcgttc 20061011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 8796971 - 8797552
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8796971 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 8797070  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8797071 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 8797170  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||    
T  8797171 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacgaaagcagcataaacaaatcatataacaagatgatatcattat 8797270  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  8797271 atcaaagcacataatttgcatcattaacacatcttcttatcttgcatgaatatacaatataatagttcatattccattgatattaatataacttaaacaa 8797370  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8797371 ctctacagtctgcatttaacgacgtttctaggtctcattaccaattagaggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacgcacaaaca 8797470  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  8797471 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 8797552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27328383 - 27327809
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27328383 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaatgtg 27328284  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  27328283 cggaggacaaaactcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcagcatatcaacat 27328184  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  27328183 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 27328084  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| |||||| || ||| |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  27328083 atcaatagcacacaaattgcatcattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaacataacttaaaca 27327984  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  27327983 agtctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcactcttggtcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 27327884  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaa 575  Q
    || | ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27327883 aactacattctgattgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaa 27327809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27389123 - 27388549
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27389123 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaatgtg 27389024  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  27389023 cggaggacaaaactcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcagcatatcaacat 27388924  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  27388923 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 27388824  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| |||||| || ||| |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  27388823 atcaatagcacacaaattgcatcattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaacataacttaaaca 27388724  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  27388723 agtctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcaataccaattaggggttcactcttggtcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 27388624  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaa 575  Q
    || | ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27388623 aactacattctgattgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaa 27388549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 20801537 - 20802117
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801537 gacaatgctcttagactcattatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 20801636  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20801637 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatggacaaaacttcgtaatc-acttatcaacat 20801735  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20801736 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacgaaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcattat 20801835  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    |||||  |||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  20801836 atcaatggcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattaattcatattcaattaatatcaatataacttgaaca 20801935  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  || |    
T  20801936 actctacaggctgcattaaacgtcaccactaggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaactcgtgcgacacagatcgcac-aacactcaagc 20802034  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  20802035 aactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactaatgttgttc 20802117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 30694140 - 30694712
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30694140 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 30694239  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||    
T  30694240 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagattctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtagtcaacatatcaac 30694339  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  30694340 atgcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacgagatgatatcat 30694438  T
Q  300 tatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-a 397  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||| || ||||||| |    
T  30694439 tatatcaatagcacataaattgcatcattatcaagctttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccaattaatatcaacataacttaa 30694538  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  30694539 acaactctacagactgcattaaacgtcatcattagatcttattactagttaggggttcaccctagatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacacaca 30694638  T
Q  498 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    | ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30694639 agcaactgcatcctggctgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaa 30694712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 27430610 - 27430028
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27430610 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27430511  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  27430510 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 27430412  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  27430411 tgcatccaataatttggagctaaaccttatcataaacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcatta 27430312  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |  || |||||||| || ||||||| |||    
T  27430311 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaatcttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcttgctcaattaatatcaatataacttaaac 27430212  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  27430211 aactctacaggctgcattaaacgtcaccactaggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaactcgtgcgacacagatcgcacaaacactcaag 27430112  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  27430111 caactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactaatgttgttc 27430028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 4233729 - 4233243
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4233729 cgtgcggaggacaaagctcctaatatttgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcaacttatca 4233630  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4233629 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatca 4233530  T
Q  299 ctatatca-aagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt- 396  Q
     |||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||  || ||||     
T  4233529 ttatatcactagcacataaattgtatcattatcaaatcttcatatcttgcataaatatacattacattaactcatgttcaattaatattatcatgactta 4233430  T
Q  397 aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacat 496  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4233429 aacaactctacagactgcatttaacaacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacac 4233330  T
Q  497 aaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4233329 aaacaagttcattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatgacgagtaccactcaactcccaaaataaggttgttc 4233243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Original strand, 26130245 - 26130830
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26130245 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 26130344  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26130345 tgcgggggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaac 26130444  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacat-aacaagatgatatcac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |     
T  26130445 atgcatccaataatttggagct-aacttcatcatatacttatacacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaacgagatgatattat 26130543  T
Q  300 tatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-a 397  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||| || ||||||| |    
T  26130544 tatatcaatagcacataaattgcatcattatcaagctttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgtccaattaatatcaacataacttaa 26130643  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | | ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |    
T  26130644 acaactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtcttaatgccaattaggggttcgctcttgatccacacgtgcgacacagatcgtacaaacactca 26130743  T
Q  498 aac-aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| || | ||||||||     |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  26130744 aacaaactacatcctgggctagctcgcgagacgaaagttctcactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 26130830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 560
Target Start/End: Original strand, 28287135 - 28287694
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28287135 gacaatgctcctagactccatatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 28287234  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaac- 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | ||||||     
T  28287235 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgtaatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 28287333  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  28287334 atgcgtccaataatttggagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcatt 28287433  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||| |   |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |  || ||||||||| |  |||||| ||    
T  28287434 atatcaatagcacataaattgcattattattaacccttcatatcttgcatgaatatacaatataatagttcttgctcaattaatatttatgtaacttaaa 28287533  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||    
T  28287534 caactctacaggctgcattaaacgtcatctttaggtttcattaccaactaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcac-aacactcaa 28287632  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccact 560  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28287633 gcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacact 28287694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 28258781 - 28258199
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258781 gacaatgctcctagactccatatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 28258682  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaac- 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | ||||||     
T  28258681 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaagactaagctcaatgatatgtaatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 28258583  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  28258582 atgcgtccaataatttggagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcatt 28258483  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||| |   |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |  || ||||||||| |  |||||| ||    
T  28258482 atatcaatagcacataaattgcattattattaacccttcatatcttgcatgaatatacaatataatagttcttgctcaattaatatttatgtaacttaaa 28258383  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||    
T  28258382 caactctacaggctgcattaaacgtcatctttaggtttcattaccaactaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcac-aacactcaa 28258284  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  28258283 gcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 28258199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 28265405 - 28264823
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28265405 gacaatgctcctagactccatatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 28265306  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaac- 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | ||||||     
T  28265305 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaagactaagctcaatgatatgtaatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 28265207  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  28265206 atgcgtccaataatttggagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcatt 28265107  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||| |   |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |  || ||||||||| |  |||||| ||    
T  28265106 atatcaatagcacataaattgcattattattaacccttcatatcttgcatgaatatacaatataatagttcttgctcaattaatatttatgtaacttaaa 28265007  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||    
T  28265006 caactctacaggctgcattaaacgtcatctttaggtttcattaccaactaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcac-aacactcaa 28264908  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  28264907 gcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 28264823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 28337530 - 28336948
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28337530 gacaatgctcctagactccatatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 28337431  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaac- 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | ||||||     
T  28337430 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaagactaagctcaatgatatgtaatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 28337332  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  28337331 atgcgtccaataatttggagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcatt 28337232  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||| |   |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |  || ||||||||| |  |||||| ||    
T  28337231 atatcaatagcacataaattgcattattattaacccttcatatcttgcatgaatatacaatataatagttcttgctcaattaatatttatgtaacttaaa 28337132  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||    
T  28337131 caactctacaggctgcattaaacgtcatctttaggtttcattaccaactaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcac-aacactcaa 28337033  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  28337032 gcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 28336948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 28344154 - 28343572
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28344154 gacaatgctcctagactccatatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 28344055  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaac- 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | ||||||     
T  28344054 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaagactaagctcaatgatatgtaatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 28343956  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  28343955 atgcgtccaataatttggagctaaaccttatcatatacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcatt 28343856  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aa 398  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||| |   |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |  || ||||||||| |  |||||| ||    
T  28343855 atatcaatagcacataaattgcattattattaacccttcatatcttgcatgaatatacaatataatagttcttgctcaattaatatttatgtaacttaaa 28343756  T
Q  399 caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataa 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||    
T  28343755 caactctacaggctgcattaaacgtcatctttaggtttcattaccaactaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcac-aacactcaa 28343657  T
Q  499 acaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  28343656 gcaactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 28343572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 558
Target Start/End: Original strand, 25110605 - 25111177
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25110605 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtattaatatactttaatcatgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 25110704  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  25110705 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaaacttaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcatcatatcaacat 25110804  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcat------atac---------ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaca 287  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  25110805 gcatctaataatttggagctaaacttcatcatttcatcatactcatatacaatatgcacttagttaaataacggcagcagcataaataagtcacataaca 25110904  T
Q  288 agatgatatcactatatca-aagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatatt 386  Q
     |||||| ||| |||||||  ||||||  | ||| ||||| || | |  ||| |||||||||  | | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||     
T  25110905 ggatgatgtcattatatcattagcacaacaattgcatcataattaaactttcatatcttgcataattgtacaatacattagttcatgttcaattaatatc 25111004  T
Q  387 aaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcg 485  Q
    || ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  25111005 aacatatcttaaacagctttacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccataatggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcg 25111104  T
Q  486 cacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtacca 558  Q
    |||||||||  ||   | |  |  ||||  || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25111105 cacaaacactcaagacactcaaagctggaagtgctcgcgaggcgagagttcttactagccatggcgagtacca 25111177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 558
Target Start/End: Original strand, 25117208 - 25117780
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25117208 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtattaatatactttaatcatgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 25117307  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  25117308 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaaacttaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcatcatatcaacat 25117407  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcat------atac---------ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataaca 287  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  25117408 gcatctaataatttggagctaaacttcatcatttcatcatactcatatacaatatgcacttagttaaataacggcagcagcataaataagtcacataaca 25117507  T
Q  288 agatgatatcactatatca-aagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatatt 386  Q
     |||||| ||| |||||||  ||||||  | ||| ||||| || | |  ||| |||||||||  | | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||     
T  25117508 ggatgatgtcattatatcattagcacaacaattgcatcataattaaactttcatatcttgcataattgtacaatacattagttcatgttcaattaatatc 25117607  T
Q  387 aaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcg 485  Q
    || ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  25117608 aacatatcttaaacagctttacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccataatggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcg 25117707  T
Q  486 cacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtacca 558  Q
    |||||||||  ||   | |  |  ||||  || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25117708 cacaaacactcaagacactcaaagctggaagtgctcgcgaggcgagagttcttactagccatggcgagtacca 25117780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1545385 - 1544788
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1545385 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttattcgtgcggaggacaaagctcctaataaacg 1545286  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||  | | |||||    
T  1545285 tgcggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaa 1545187  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatac--------------ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |               |||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  1545186 catgcatccaataatttggagctaaacgtcatcttattcattacacataatcattatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 1545087  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  || ||||||     
T  1545086 caggatgatatcattatatcaatagcaaatcatttgcatcataattaaactttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgctcaattaatg 1544988  T
Q  385 ttaaaataacttaaca-actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
      || ||  ||||| |  || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1544987 acaacatgtcttaaaaggctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacaccgat 1544888  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  ||  || | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  1544887 cgcacaaacactcaagaaactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactagtgttgttc 1544788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 3708825 - 3708227
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3708825 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccgataaatcg 3708726  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| || ||||||     
T  3708725 tgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaat 3708626  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcat------atac---------ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||||          |||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  3708625 atgcatccaataatttggagctaaacatcatcatttcatcatacacatatacattatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 3708526  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||| || | |  ||| |||||| ||  | | ||||||||| ||  ||||| || |||||||    
T  3708525 caggatgatatcattatatcaatagcacatcagttatatcataattaaactttcatatcttacataattgtacaatacatta-atcatactcaattaata 3708427  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  3708426 tcaacatatcttaaacagctttacagactgcagtaaacgtcatcattaggtctcattaccataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagat 3708327  T
Q  484 cgcacaaacac-ataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    |||||||||||  ||  ||   | | |||||   | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||    
T  3708326 cgcacaaacactctaggcacact-aacctggagttgctcacgaggcgagaatccttactcgccatggcgagtaccaaacaattcccaaactaaagttgtt 3708228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1539286 - 1538689
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  1539286 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttattcgtgcggaggacaaaactcctaataaacg 1539187  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||  ||||||||| |||||||  | | |||||    
T  1539186 tgcggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcctggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaa 1539088  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatac--------------ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |               |||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  1539087 catgcatccaataatttggagctaaacgtcatcttattcattacacattatcattatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 1538988  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  || ||||||     
T  1538987 caggatgatatcattatatcaatagcaaatcatttgcatcataattaaactttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgctcaattaatg 1538889  T
Q  385 ttaaaataacttaaca-actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
      || ||  ||||| |  || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1538888 acaacatgtcttaaaaggctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacaccgat 1538789  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  ||  || | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  1538788 cgcacaaacactcaagaaactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactagtgttgttc 1538689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 185 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 14059761 - 14059361
Alignment:
Q  185 taatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacata 284  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  14059761 taatcaacatatcaacatgcatccaataatttggagctaaactttaccatatacttatgcacttagttaaataacgaaagcagcataagcaagtcacata 14059662  T
Q  285 acaagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaat 383  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| || |||| ||| |||| ||| ||||||    
T  14059661 acaagatgatatcattatatcaatagcacataaattgtatcattatcaaatcttcatatcttgcataaatattcattacattagctcatgttcaattaat 14059562  T
Q  384 attaaaataacttaa-caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacaga 482  Q
    ||||  |   || || ||||| ||||| ||| | | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14059561 attatcagggctcaaacaactatacagactgtacttaacaacatcactaggtctcaataccagttagcggttcactcttgattaacaagtgcgacacaga 14059462  T
Q  483 tcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  14059461 tcgcacaaacacataaacaatctcattctggttgtactcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaacttccaaactaagcttgtt 14059362  T
Q  583 c 583  Q
    |    
T  14059361 c 14059361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24291387 - 24291156
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  24291387 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 24291288  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24291287 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 24291188  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24291187 gcatccaacaatttggagctaaacatcatcat 24291156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31317427 - 31317196
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  31317427 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 31317328  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31317327 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 31317228  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31317227 gcatccaacaatttggagctaaacatcatcat 31317196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24315415 - 24315184
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  24315415 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 24315316  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24315315 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgttatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 24315216  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24315215 gcatccaacaatttggagctaaacatcatcat 24315184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Original strand, 4167687 - 4167920
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacgt 101  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4167687 gacaatgctcttagaatccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcctaataaatcgt 4167786  T
Q  102 gcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4167787 gcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctaatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaac 4167886  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4167887 atgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 4167920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Original strand, 4208367 - 4208600
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacgt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4208367 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcctaataaatcgt 4208466  T
Q  102 gcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4208467 gcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctaatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaac 4208566  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4208567 atgcatctaataatttggagctaaacgtcatcat 4208600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 8228646 - 8228832
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8228646 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 8228745  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8228746 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 8228832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 18930835 - 18931021
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18930835 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 18930934  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18930935 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 18931021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29588027 - 29587841
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29588027 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 29587928  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29587927 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 29587841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29594168 - 29593982
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29594168 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 29594069  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29594068 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 29593982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30638477 - 30638291
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30638477 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 30638378  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30638377 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacagatgaacaaaacatcataatc 30638291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17037666 - 17037355
Alignment:
Q  10 ctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17037666 ctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaacgtgcggagga 17037567  T
Q  110 caaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatcca 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||  | ||||||  ||||||||    
T  17037566 caaagctcctaataattgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttatcaacaaaacaccgtaatcatcatatcaatgtgcatcca 17037467  T
Q  210 ataatttggagctaaac---------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgata 295  Q
    |||||||||||||||||         ||||||||| |       |||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  17037466 ataatttggagctaaacgtcatctttttcatcatacatagacattatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataacaggatgata 17037367  T
Q  296 tcactatatcaa 307  Q
    ||| ||||||||    
T  17037366 tcattatatcaa 17037355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Original strand, 34832418 - 34832652
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacgt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  34832418 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaattgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcgt 34832517  T
Q  102 gcggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  34832518 gcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagcttaatgaaatgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaa 34832617  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34832618 catgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 34832652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 19808288 - 19808520
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19808288 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 19808387  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||||  | |||||    
T  19808388 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcatcatatca 19808486  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19808487 atatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 19808520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 25928057 - 25928565
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta-taaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  25928057 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 25928156  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||| || |||||||  | |||||    
T  25928157 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcatcatatca 25928255  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaac---------ttcatcatatacc-----tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacata 284  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||       |||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||| |    
T  25928256 atatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcttattcatcatatatagacattatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaagtcacaca 25928355  T
Q  285 acaa---gatgatatcactatatcaaa-gcacataatttgtatcattatcacatc-ttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgat 379  Q
    ||||   |||||||||| ||||||||  |||  | | | | ||||| || |  || ||| |||||| ||  ||| || |||||| || |||||  || ||    
T  25928356 acaacaggatgatatcattatatcaattgcaattcaatagcatcataat-atttcattcatatcttacat-aatgtataatacattaattcatgctcaat 25928453  T
Q  380 taatattaaaataacttaa-caactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgaca 478  Q
    |||||| || ||| ||||| |  || |||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  25928454 taatatcaacatatcttaaacggctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccatttagggtttcactcttgatcaaaacgtgcgaca 25928553  T
Q  479 cagatcgcacaa 490  Q
    || |||||||||    
T  25928554 catatcgcacaa 25928565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 28314333 - 28314516
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314333 gacaatgctcctagactccatatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 28314432  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgta 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  28314433 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgta 28314516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 27185472 - 27185655
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185472 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27185571  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgta 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||    
T  27185572 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactctcaacaacaaaacatcgta 27185655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 27207308 - 27207491
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27207308 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27207407  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgta 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||    
T  27207408 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactctcaacaacaaaacatcgta 27207491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27241920 - 27241737
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27241920 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27241821  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgta 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||    
T  27241820 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactctcaacaacaaaacatcgta 27241737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27263768 - 27263585
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27263768 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 27263669  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgta 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||    
T  27263668 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactctcaacaacaaaacatcgta 27263585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22758613 - 22758844
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22758613 gcgacaattctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaa-cgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 22758711  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || ||||||| || |||||    
T  22758712 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcaacatatca 22758810  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22758811 ataagcatccaataatttggagctaaacgtcatc 22758844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34370318 - 34370086
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34370318 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaacaatcgtcatcataagtattaatatacttaaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 34370219  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||||  | |||||    
T  34370218 gtgcggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcatcatatca 34370120  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34370119 atatgcatccaataatttgaagctaaacgtcatc 34370086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34298960 - 34298734
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  34298960 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 34298861  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  34298860 tgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 34298767  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34298766 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 34298734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 237
Target Start/End: Original strand, 20176704 - 20176941
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-aagtattaatatactttaat-cgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20176704 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcattaagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctataattcg 20176803  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| |||||| ||||||| ||  |||||    
T  20176804 tgcggaggacaaagctcctaaaaatcttggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttaacaacaaaaacaccgtaatcaacacatcaa 20176903  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatata 237  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  20176904 cgtgcatccaataatttggagataaccgtcatcatata 20176941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 340 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 18194513 - 18194269
Alignment:
Q  340 tatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaacaa-ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18194513 tatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaacataacctaaaaaactctacagactgcattaaacgtcatcattaggtctca 18194414  T
Q  439 ttaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtcctt 538  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  18194413 ataccaattaggggttcactcttaatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaactcacaagcaactacatcctggctgtgctcgcgaggcgagagttctt 18194314  T
Q  539 actcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18194313 actcgccgtggcgagtaccactcaactcccaaactaagcttgttc 18194269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5834828 - 5834591
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-aagtattaatatactttaat-cgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5834828 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcattaagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctataattcg 5834729  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  ||| |||||| ||||||| ||  |||||    
T  5834728 tgcggaggacaaagctcctaaaaatcatggtgaggactaagctcaatgagatactatgcatggactcttaacaacaaaaacaccgtaatcaacacatcaa 5834629  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatata 237  Q
      ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  5834628 agtgcatccaataatttggagataaccgtcatcatata 5834591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22159287 - 22159050
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-aagtattaatatactttaat-cgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22159287 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcattaagtattaatatactttaaaacgtgcggaggacaaagctcctataattcg 22159188  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaac-aaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  ||| |||||| ||||||| ||  |||||    
T  22159187 tgcggaggacaaagctcctaaaaatcttggtgaggactaagctcaatgagattctatgcatggactcttaacaacaaaaacaccgtaatcaacacatcaa 22159088  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatata 237  Q
      ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  22159087 tgtgcatccaataatttggagttaaccgtcatcatata 22159050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32565581 - 32565394
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  32565581 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 32565482  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  32565481 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 32565394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 11566411 - 11566627
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566411 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 11566508  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  11566509 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 11566605  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  11566606 atttggagctaaacgtcatcat 11566627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12619399 - 12619183
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12619399 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 12619302  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  12619301 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 12619205  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  12619204 atttggagctaaacgtcatcat 12619183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 19870139 - 19870355
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870139 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 19870236  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  19870237 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccataatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 19870333  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  19870334 atttggagctaaacgtcatcat 19870355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 23394617 - 23394833
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23394617 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 23394714  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  23394715 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 23394811  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  23394812 atttggagctaaacgtcatcat 23394833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16552359 - 16552172
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  16552359 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 16552260  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||    
T  16552259 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacattgtaatc 16552172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 16576594 - 16576781
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  16576594 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 16576693  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||    
T  16576694 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacattgtaatc 16576781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16618786 - 16618599
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  16618786 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 16618687  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||    
T  16618686 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacattgtaatc 16618599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16628915 - 16628728
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  16628915 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 16628816  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||    
T  16628815 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacattgtaatc 16628728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17017261 - 17017074
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  17017261 gacaatgctcctagactccatatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttagtcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 17017162  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  17017161 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 17017074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 8243382 - 8243598
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8243382 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--tgaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 8243479  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  8243480 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 8243576  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  8243577 atttggagctaaacgtcatcat 8243598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 23989469 - 23989685
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989469 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 23989566  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaaca---------aaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||         || |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  23989567 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaccaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 23989663  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  23989664 atttggagctaaacgtcatcat 23989685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 16759818 - 16760011
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  16759818 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 16759914  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttggag 220  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  16759915 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacttatcacttatacatccaataatttggag 16760011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 8229071 - 8229249
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8229071 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 8229170  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  8229171 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagaaccactcaactcacaaactaagcttgttc 8229249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 18931260 - 18931438
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18931260 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 18931359  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  18931360 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 18931438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 29593743 - 29593565
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29593743 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 29593644  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  29593643 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 29593565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 22862495 - 22862711
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22862495 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 22862592  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22862593 ---tcgtggtgaggacaaaactcaatgaaatgttatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 22862689  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  22862690 atttggagctaaacgtcatcat 22862711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 29587602 - 29587424
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29587602 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattacgaattaggggttcactctggaccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 29587503  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  29587502 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 29587424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 412 - 582
Target Start/End: Original strand, 17031061 - 17031231
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||| ||    
T  17031061 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaatacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagcaactacattct 17031160  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  17031161 gtttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaattcccaaactaatgttgtt 17031231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 30638052 - 30637875
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  30638052 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctgggccaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacatactcaagt 30637953  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  30637952 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcac-aactaagcttgttc 30637875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 14098365 - 14098485
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  14098365 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcagaagtataaatatactttaatcgtgaggaggacaaagctcctaataaacgtg 14098464  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14098465 cggaggacaaagctcctaata 14098485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31478541 - 31478326
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31478541 ttatatgcatttggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcagaggacaaagctcc--taaaacgtgcgaaggacaaagctcctaa 31478444  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
        |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  31478443 ---acgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatattatcatgcatccaata 31478347  T
Q  213 atttggagctaaacttcatca 233  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  31478346 atttgaagctaaacgtcatca 31478326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14053885 - 14053784
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14053885 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 14053786  T
Q  103 cg 104  Q
    ||    
T  14053785 cg 14053784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5617112 - 5616920
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  5617112 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctccta- 5617016  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  5617015 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 5616921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 22948632 - 22948769
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  22948632 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 22948728  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22948729 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 22948769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 22952588 - 22952725
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  22952588 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 22952684  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22952685 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 22952725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 23414454 - 23414646
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  23414454 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 23414550  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  23414551 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 23414645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 23871076 - 23871213
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  23871076 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 23871172  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23871173 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 23871213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 23875032 - 23875169
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  23875032 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 23875128  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23875129 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 23875169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25135969 - 25135847
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25135969 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaatcgtgcggaggacaaagctcctaa 25135872  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       || |||||||||| |||||||||||    
T  25135871 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga 25135847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1588028 - 1587859
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  1588028 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctccta- 1587932  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  1587931 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatca 1587859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27416483 - 27416292
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  27416483 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaaactcctat----cgtgcggaggacaaagctcctaa 27416388  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  27416387 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 27416293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 4233798 - 4233708
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4233798 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 4233708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 1644059 - 1644157
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644059 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 1644156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9482588 - 9482421
Alignment:
Q  23 tatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||      
T  9482588 tatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggagaaagctccta-- 9482494  T
Q  123 attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
      || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9482493 --tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatca 9482421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 14471762 - 14471860
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14471762 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 14471859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 16623903 - 16624001
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16623903 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 16624000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Original strand, 14098461 - 14098624
Alignment:
Q  72 cgtgcggaggacaaagctccta-taaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacata 170  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  14098461 cgtgcggaggacaaagctcctaataaatcgtgcagaggacaaagctcttaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactctta 14098560  T
Q  171 tgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
      ||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14098561 acaacaaaaca-cgtaatcaccgtaatcaacatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 14098624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 12496118 - 12496309
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  12496118 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcgaaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 12496214  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||| ||   || ||||||||||||||||    
T  12496215 ----catggtgaggacaaagctcagtga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttaacacttatacatccaataatttgga 12496308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20803851 - 20803682
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||     
T  20803851 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcatgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtagaggacaaagctccta- 20803755  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| |  |||||||||||||    
T  20803754 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacacctcaatcgacttatca 20803682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 27556212 - 27556333
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||    
T  27556212 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta---atcatgtggaggacaaagctcctaa 27556308  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       || |||||||||| |||||||||||    
T  27556309 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga 27556333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 16741017 - 16741206
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |     
T  16741017 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccga- 16741110  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  16741111 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 16741205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 21702096 - 21702265
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||     
T  21702096 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaatctctta- 21702192  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  | ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  21702193 ---tcatggtaaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggattc-taacaacaaaacaccttaatcgacttatca 21702265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 12706499 - 12706689
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||        
T  12706499 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctc---- 12706590  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
    |  |||||| ||||||  |||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  12706591 tgatcgtggcgaggacagagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 12706688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 416 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 17037247 - 17037080
Alignment:
Q  416 ttaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagtt-catcctggt 514  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||  | ||| ||||     
T  17037247 ttaaacgtcatcattaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaa-cactcaaacaacctacattctgga 17037149  T
Q  515 tgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  17037148 tgtgctcgcgaggcgagagttctcactcgtcatggcaagtaccacttaattcccaaactaatgttgttc 17037080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 412 - 583
Target Start/End: Original strand, 16372049 - 16372220
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  16372049 tgcattaaacatcatcattaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaatgcactccaatct 16372148  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| |||||||    
T  16372149 ggaagtgctcgcgaggcgagagttcctactcgccatggcgagtaccagtcaatttccaaactaatgttgttc 16372220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 19662580 - 19662769
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||    
T  19662580 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccgaa 19662674  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  | |  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  19662675 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactta-aacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 19662768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 32565192 - 32564988
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  32565192 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 32565093  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  32565092 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 32564993  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  32564992 ttgtt 32564988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 17016872 - 17016689
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17016872 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaaataggggttcactcttgatcaaaaggtgcgac 17016773  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17016772 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactc 17016689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18917966 - 18917895
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18917966 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctccta 18917895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25595571 - 25595374
Alignment:
Q  125 tcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25595571 tcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaacatgcatccaataatttggagcta 25595473  T
Q  224 aac--------ttcatcatata-------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatatcaa 307  Q
    |||        |||||||||||         |||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25595472 aacgtcatcatttcatcatatatataggcattatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaagtcacataacaggatgatatcattatatcaa 25595374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2685613 - 2685424
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||    
T  2685613 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccgaa 2685519  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||  | |  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  2685518 ----catggtgaggacaaaggtcaatga-atgctaatgcatggactta-aacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 2685425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 436 - 561
Target Start/End: Original strand, 28314786 - 28314911
Alignment:
Q  436 tcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtc 535  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||| ||||   | ||||||||||||||||     
T  28314786 tcattaccaactaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgacacagatcgcacaaacacacaaaacactacattctggacttgctcgcgaggcgagagtt 28314885  T
Q  536 cttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28314886 cttactcgccatggcgagtaccactc 28314911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 16551970 - 16551766
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  16551970 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaagtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 16551871  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| | | || |||||| |    
T  16551870 acagatcgcacaaccacttaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtgccactcaaattcccaactaatg 16551771  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  16551770 ttgtt 16551766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Original strand, 16576983 - 16577187
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  16576983 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaagtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 16577082  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| | | || |||||| |    
T  16577083 acagatcgcacaaccacttaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtgccactcaaattcccaactaatg 16577182  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  16577183 ttgtt 16577187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 16618397 - 16618193
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  16618397 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaagtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 16618298  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| | | || |||||| |    
T  16618297 acagatcgcacaaccacttaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtgccactcaaattcccaactaatg 16618198  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  16618197 ttgtt 16618193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 16628526 - 16628322
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  16628526 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaagtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 16628427  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| | | || |||||| |    
T  16628426 acagatcgcacaaccacttaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtgccactcaaattcccaactaatg 16628327  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  16628326 ttgtt 16628322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 583
Target Start/End: Original strand, 22331630 - 22331801
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  22331630 tgcattaaacatcgtcattaggtctcattaccaattagggattcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacactccaatct 22331729  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| |||||||    
T  22331730 ggaagtgctcgcgaggcgagagttcctactcgccatggcgagtaccagtcaatttccaaactaacgttgttc 22331801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 430 - 561
Target Start/End: Original strand, 27185918 - 27186049
Alignment:
Q  430 taggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcg 529  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||  | | ||| ||||   | |||||||||||    
T  27185918 taggtttcattaccaaccaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgacacagatcgcgcaaacacacaaaacactacattctggacttgctcgcgaggcg 27186017  T
Q  530 agagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27186018 agagttcttactcgccatggcgagtaccactc 27186049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 430 - 561
Target Start/End: Original strand, 27207754 - 27207885
Alignment:
Q  430 taggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcg 529  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||  | | ||| ||||   | |||||||||||    
T  27207754 taggtttcattaccaaccaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgacacagatcgcgcaaacacacaaaacactacattctggacttgctcgcgaggcg 27207853  T
Q  530 agagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27207854 agagttcttactcgccatggcgagtaccactc 27207885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 430 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 27241474 - 27241343
Alignment:
Q  430 taggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcg 529  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||  | | ||| ||||   | |||||||||||    
T  27241474 taggtttcattaccaaccaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgacacagatcgcgcaaacacacaaaacactacattctggacttgctcgcgaggcg 27241375  T
Q  530 agagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27241374 agagttcttactcgccatggcgagtaccactc 27241343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 430 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 27263322 - 27263191
Alignment:
Q  430 taggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcg 529  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||  | | ||| ||||   | |||||||||||    
T  27263322 taggtttcattaccaaccaggggttcactcttgatcaaaaggtgcgacacagatcgcgcaaacacacaaaacactacattctggacttgctcgcgaggcg 27263223  T
Q  530 agagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27263222 agagttcttactcgccatggcgagtaccactc 27263191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 233
Target Start/End: Original strand, 1644134 - 1644298
Alignment:
Q  72 cgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||     
T  1644134 cgtgcggaggacaaagctccta---atcgtgcggaggacaaagctcctaaa---cgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaa 1644227  T
Q  172 gaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatca 233  Q
     |||||||         |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1644228 caacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatattatcatgcatccaataatttggagctaaacgtcatca 1644298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 430 - 583
Target Start/End: Original strand, 19808735 - 19808888
Alignment:
Q  430 taggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcg 529  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||||  || |||| ||||||    
T  19808735 taggtctcattaccaattagggattcactcttgatcaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacactcaagacactccaatctggaagtgctcgtgaggcg 19808834  T
Q  530 agagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| || | | |||||| || |||||||    
T  19808835 agagttcctactcgccatggcgagtaccagtcaaattccaaaccaatgttgttc 19808888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 34369889 - 34369745
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  34369889 tgcattaaacatcatcattaggtctcattaccaattagggattcactcttgatcaaaacgtgtgacacagatcgcacaaacactcaaggcactccaatct 34369790  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34369789 ggaagtgctcgcgaggcgagagtacatactcgccatggcgagtac 34369745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27325922 - 27325765
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    ||||  |||||||||||||        
T  27325922 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggagaacaaagctccgat----cgtggtgaggacaaagctc---- 27325832  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  27325831 aaatcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatc 27325765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 412 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 34298539 - 34298457
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  34298539 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacaaatcgcacaaacac 34298457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 34832838 - 34833016
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||||||| |||  ||   | |    
T  34832838 tacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattatcataagggggttcactcttgatccaaacgtacgaaacagatcgcacaagcactcaagacact 34832937  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     ||  ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||    
T  34832938 ccaatctggaagtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatagcgagtaccacacaattcccaaactaaagttgttc 34833016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 165
Target Start/End: Original strand, 14471837 - 14471924
Alignment:
Q  72 cgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14471837 cgtgcggaggacaaagctccta---atcgtgcggaggacaaagctcctaaa---cgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcatggac 14471924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 417 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 25595264 - 25595097
Alignment:
Q  417 taaacgacatcactaggtctcattaccagttagggg---ttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctgg 513  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |    | | || |||||    
T  25595264 taaacgtcatcattaggtctcattacc--ttagggggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaagcactcattacactccaacctgg 25595167  T
Q  514 ttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
      || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||| |||||||    
T  25595166 aagtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtacccaacaattcccaaactaaagttgttc 25595097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22430326 - 22430255
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  22430326 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-agtattaatatactttaagcatcgtggggaggacaaagctcc 22430255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 412 - 494
Target Start/End: Original strand, 22759043 - 22759124
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  22759043 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattagggtttcactcttgatcaa-acgtgcgatacagatcgcacaaacac 22759124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 397 - 490
Target Start/End: Original strand, 4168101 - 4168194
Alignment:
Q  397 aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaa 490  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  4168101 aacagctctacagactgcatttaacgtcatcattaggtctcattaccataagggggttcactcttgatcgaaacgtgcgacacagatcgcacaa 4168194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 397 - 490
Target Start/End: Original strand, 4208781 - 4208874
Alignment:
Q  397 aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaa 490  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  4208781 aacagctctacagactgcatttaacgtcatcattaggtctcattaccataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaa 4208874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 17803996 - 17804156
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt-ta--atcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    || ||||  |||||||||||||     
T  17803996 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatca-aagtattaatatacttatagcatcgtggggaggacaaagctcc----aatcgtggtgaggacaaagctc- 17804089  T
Q  119 taatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
        | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  17804090 ---aaatcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatc 17804156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Original strand, 16624025 - 16624142
Alignment:
Q  125 tcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaaca---------tcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatt 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||         |||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  16624025 tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatattatcatgcatccaataatt 16624124  T
Q  216 tggagctaaacttcatca 233  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  16624125 tggagctaaacgtcatca 16624142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 402 - 583
Target Start/End: Original strand, 14098807 - 14098988
Alignment:
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttagggg--ttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||  ||     
T  14098807 ctctacagactgcatttaacgtcatcattaggtttcattacca-taaggggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcac-aacactcaag 14098904  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
      |    | |||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||    
T  14098905 gcacactaacctggaattgctcgcgaggcgagaatccttactcgccatggcgagtaccaaacaattcccaaactaaagttgttc 14098988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18917916 - 18917775
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaaca---------tcgtaat 188  Q
    |||||||||||||||||||||||    | |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||| ||         |||||||    
T  18917916 cgtgcggaggacaaagctcctaaa---catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcatcgtaat 18917821  T
Q  189 cgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18917820 caacatatcatcatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 18917775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 31316971 - 31316837
Alignment:
Q  449 ggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatg 548  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |||  | |  |  ||||  || ||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  31316971 ggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaatcgcacaaacactcaaaacactcaaggctggaggtgctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatg 31316872  T
Q  549 gcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  31316871 gcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 31316837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 24314996 - 24314824
Alignment:
Q  411 ctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcc 510  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |||  | |  |  |    
T  24314996 ctgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaatcgcacaaacactcaaaacactcaaggc 24314897  T
Q  511 tggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||  || ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  24314896 tggaggtgctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggtgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 24314824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 582
Target Start/End: Original strand, 4168222 - 4168285
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  | | ||||||||||| ||||||    
T  4168222 ctcgcgaggcgagaatccttaatcgccatggcgattaccaaacaattcccaaactaaagttgtt 4168285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 582
Target Start/End: Original strand, 4208902 - 4208965
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgtt 582  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  | | ||||||||||| ||||||    
T  4208902 ctcgcgaggcgagaatccttaatcgccatggcgattaccaaacaattcccaaactaaagttgtt 4208965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24290968 - 24290885
Alignment:
Q  411 ctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  24290968 ctgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaatcgcacaaacac 24290885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 23277087 - 23277050
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23277087 ctcgcgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 23277050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 307
Target Start/End: Original strand, 16371873 - 16371943
Alignment:
Q  240 tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaa---gatgatatcactatatcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||| |||||   |||||||||| ||||||||    
T  16371873 tatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaagtcacacaacaacaggatgatatcattatatcaa 16371943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 307
Target Start/End: Original strand, 22758866 - 22758936
Alignment:
Q  240 tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaa---gatgatatcactatatcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||| |||||   |||||||||| ||||||||    
T  22758866 tatgcacttagttaaataacagcagcagcatagtcaagtcacacaacaacaggatgatatcaatatatcaa 22758936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 498; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 67289 - 67869
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67289 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 67388  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  67389 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatga-caaaacatcgtaatcaacttatcaacat 67487  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  67488 gcatccaataatttggagctaaacttcgtcatataattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcattat 67587  T
Q  303 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||    
T  67588 atcaaagcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcatgaatatacaatacaatagttcatattcagttaatattaatataacttaaacaa 67687  T
Q  402 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  67688 ctctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcataaacacataaaca 67787  T
Q  502 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  67788 agttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactaatgttgttc 67869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 6770 - 7365
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6770 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaggctcctataaatcgtg 6869  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  6870 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgttatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaacat 6969  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||      ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6970 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcatttcatcatataaatacactatgcacttagttaaataacagcagcagcataaacaagtcacataacaag 7069  T
Q  290 atgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgatt-aatatta 387  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||  | | | |||| |||||| ||  | |  |||||||| ||  ||||| || ||| ||| | |    
T  7070 atgatatcattatatcaatagcacatcaattgtatcatagttaaaccttcatatcttacataattgcacaatacatta-atcatactcaattaaatttca 7168  T
Q  388 aaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgc 486  Q
    | ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||    
T  7169 acatatcttaaacagctttacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattatcataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacatatcgc 7268  T
Q  487 acaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||  ||   | |  |  ||||  || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||    
T  7269 acaaacactcaagacactcaaagctggaagtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccgtggcgagtaccaaacaattcccaaactaaagttgttc 7365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Original strand, 56808 - 57405
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  56808 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaaca 56907  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||  | | |||||    
T  56908 tgcggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaa 57006  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatac--------------ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |               |||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  57007 catgcatccaataatttggagttaaacgtcatcttattcgttacacataatcattatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 57106  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| | |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  || ||||||     
T  57107 caggatgatatcattgtatcaatagcaaatcatttgcatcataattaaactttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgctcaattaatg 57205  T
Q  385 ttaaaataacttaaca-actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
      || ||  ||||| |  || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  57206 acaacatgtcttaaaaggctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaccacgtgcgacacagat 57305  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  || ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  57306 cgcacaaacactcaagcaactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactagtgttgttc 57405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Original strand, 13295 - 13801
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  13295 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcagaggacaaggctcctataaatcgtg 13394  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  13395 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaacat 13494  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||      ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13495 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcatttcatcatataaatacactatgcacttagttaaataacagcagcagcataaacaagtcacataacagg 13594  T
Q  290 atgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgatt-aatatta 387  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||  | | | |||| |||||| ||  | |  |||||||| ||  ||||| || ||| ||| | |    
T  13595 atgatatcattatatcaatagcacatcaattgtatcatagttaaaccttcatatcttacataattgcacaatacatta-atcatactcaattaaatttga 13693  T
Q  388 aaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgc 486  Q
    | ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  13694 acatatcttaaacagctttacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattatcataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgc 13793  T
Q  487 acaaacac 494  Q
    ||||||||    
T  13794 acaaacac 13801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Original strand, 41301 - 41898
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  41301 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaaca 41400  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc-gacttatcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  ||||||||| |||||||   || |||||    
T  41401 tgcggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactctaaacaacaaaaca-cgtaatcatcctaatcaa 41499  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatac--------------ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |               |||||||||||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||    
T  41500 catgcatccaataatttggagttaaacgtcatcttattcgttacacataatcattatgcacttagttaaataacagcagcaacataatcaagtcacataa 41599  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| | |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  || ||||||     
T  41600 caggatgatatcattgtatcaatagcaaatcatttgcatcataattaaactttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgctcaattaatg 41698  T
Q  385 ttaaaataacttaaca-actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
      || ||  ||||| |  || |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41699 acaacatgtcttaaaaggctttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagat 41798  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  || ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  41799 cgcacaaacactcaagcaactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaaatcccaaactagtgttgttc 41898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 494
Target Start/End: Original strand, 22823 - 23329
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  22823 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataaatattaatatactttaatcgtgcagaggacaaggctcctataaatcgtg 22922  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| || ||||||| || |||||||||    
T  22923 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatggacaaatcaccgtaatcaacatatcaacat 23022  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||      ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23023 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcatttcatcatataaatacactatgcacttagttaaataacagcagcagcataaacaagtcacataacagg 23122  T
Q  290 atgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgatt-aatatta 387  Q
    | |||| || |||||||| | ||||| | |||||||||  | | | |||| |||||| ||  | |  |||||||| ||  ||||| || ||| ||| | |    
T  23123 aggataacattatatcaataacacatcaattgtatcatagttaaaccttcatatcttacataattgcacaatacatta-atcatactcaattaaatttca 23221  T
Q  388 aaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgc 486  Q
    | ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  23222 acatatcttaaacagctttacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattatcataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgc 23321  T
Q  487 acaaacac 494  Q
    ||||||||    
T  23322 acaaacac 23329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 59276 - 59060
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  59276 ttatatgcatgtgataccaatcgtcatcataagtattaatatatttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 59179  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  59178 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaaagctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 59082  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  59081 atttggagctaaacgtcatcat 59060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Original strand, 132483 - 132528
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  132483 ttatatgcatgtggtaccaatcaacgtaataagtattaatatactt 132528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 59787 - 59205
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59787 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 59688  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  59687 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcatggacacataggaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 59588  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||    
T  59587 gcatccaataatttggagttaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatctttat 59488  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  59487 atcaatagcacataaattgcattattatcacatcttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttaaccaattaatattaatataacttaaaca 59388  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59387 actctacagtctgcattaaacaacaacactaggtctcattaccagttaggggttcactcttaatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 59288  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  59287 aagctcatcctggttgtactcgtgaggcgagagcacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggtcgttc 59205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 67858 - 67642
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  67858 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 67761  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  67760 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 67664  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  67663 atttggagctaaacgtcatcat 67642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 138846 - 139428
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138846 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 138945  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  138946 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggacaaagctcaatgatatgctatgcatggacacataggaacaaaacaacgtaatcgacttatcaacat 139045  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||    
T  139046 gcatccaataatttggagttaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaacaacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatctttat 139145  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aaca 400  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  139146 atcaatagcacataaattgcattattatcacatcttctcattttgcatgaatatacaatacaatagttcttaaccaattaatattaatataacttaaaca 139245  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139246 actctacagtctgcattaaacaacaacactaggtctcattaccagttaggggttcactcttaatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 139345  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  139346 aagctcatcctggttgtactcgtgaggcgagagcacttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggtcgttc 139428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1380 - 797
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1380 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 1281  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1280 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 1181  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  1180 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacttatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatgtcattat 1081  T
Q  303 atcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa--c 399  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||| |||||       
T  1080 atcaatagcacataaattgcatcataatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaacatatcttaaaca 981  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  980 aactctacagactgcatttaacgacatcaccaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaag 881  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  880 caacttcatcctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccacggcgagtaccactcaactcccaaactagtgttgttc 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 10117 - 10303
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10117 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 10216  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10217 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacagatgaacaaaacatcataatc 10303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 56539 - 56725
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56539 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 56638  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  56639 cggaggacaaaactcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacagatgaacaaaacatcataatc 56725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10720
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10542 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacacaaacaagt 10641  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  10642 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 10720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 56964 - 57142
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56964 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacacaaacaagt 57063  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  57064 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 57142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 56753 - 57335
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56753 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 56852  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  56853 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacaaaaca-cgtaatcatcgtaatcaaca 56951  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  56952 tgcatccaataatttggagctaaaccttatcataaacatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacatatcaagatgatatcatta 57051  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aac 399  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |  || |||||||| || ||||||| |||    
T  57052 tatcaatagcacataaattgcattattatcaaatcttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcttgctcaattaatatcaatataacttaaac 57151  T
Q  400 aactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  57152 aactctacaggctgcattaaacgtcaccactaggtctcaataccaattaggggttcactcttgatcaactcgtgcgacacagatcgcacaaacactcaag 57251  T
Q  500 caagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  57252 caactacattctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactaatgttgttc 57335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 70878 - 71069
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  70878 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaaactcctat----cgtgcggaggacaaagctcctaa 70973  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  70974 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 71068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 139521 - 139712
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  139521 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagcacct---aaacgtgcggaggacaaagctccaaa 139617  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  139618 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 139711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Original strand, 100881 - 100998
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |     
T  100881 ttatatgcatgtggtaccaatcatcataata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccga- 100974  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatg 148  Q
       ||||||||||||| ||||||||||    
T  100975 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatg 100998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 106214 - 105634
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106214 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtagttccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 106115  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  106114 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaac 106015  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcat------catatac-ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  106014 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatactcatatacaatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacaaaacaggatga 105915  T
Q  294 tatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata 392  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | ||| ||||| |||| |  ||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  105914 tatcattatatcaatagcacatcaattggatcataatcaaactttcatatcttgcataattatacaatacattagttcatgttcaattaatattaacata 105815  T
Q  393 actt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaa 491  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  105814 tcttaaacaactctacagactgcatttaacgtcatcattaagtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaa 105715  T
Q  492 cacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaac 572  Q
    |||  ||   | | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  105714 cactcaagtcactacattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaac 105634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 126448 - 125869
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126448 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgcggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 126349  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  126348 tgcggaggacaaagctcctaataat-gtggtaaggactaagctcaatgagatgctatgcatggtctcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaac 126250  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttca------tcatatac-ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  126249 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatactcatatacaatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacaaaacaggatga 126150  T
Q  294 tatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata 392  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | ||| ||||| |||| |  ||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |||    
T  126149 tatcattatatcaatagcacatcaattggatcataatcaaactttcatatcttgcataattatacaatacattagttcatgttcaattaatatcaacata 126050  T
Q  393 actt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaa 491  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  126049 tcttaaacaactctacagactgcatttaacgtcatcattaagtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaa 125950  T
Q  492 cacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaac 572  Q
    |||  ||   | | ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  125949 cactcaagtcactacattctggttgtgctcgcgaggcgaaagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaac 125869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 80091 - 80305
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  80091 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 80187  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
        |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  80188 ---acgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatattatcatgcatccaata 80284  T
Q  213 atttggagctaaacttcatca 233  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  80285 atttggagctaaacgtcatca 80305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 62174 - 61951
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggaca 111  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || | |||||||||||    
T  62174 cttagacacttt-tatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatataatttaatcgtgcggaggacaatgctcct---aatcatgcggaggaca 62079  T
Q  112 aagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaaca---------aaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||         || |||||||||| || ||||| ||    
T  62078 aagctcctaa---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatca 61984  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  61983 tgcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 61951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 66081 - 65867
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  66081 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcgggagacaatgctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 65985  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaaca---------aaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaat 211  Q
       | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||         || |||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  65984 ---ttgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaat 65890  T
Q  212 aatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  65889 aatttggagctaaacgtcatcat 65867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 37820 - 38403
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37820 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 37919  T
Q  103 cgga-ggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  | | ||||||    
T  37920 cggagggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacagaaca-cgtaatcatcgtaatcaac 38018  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcact 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| |    
T  38019 atgcatccaataatttggagctaaacattatcatatacatatgcacttagttaaataacagaagcagcat-aacaagtcacacagcaagatgatatcatt 38117  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata-actt-a 397  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||| |    
T  38118 atatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatactcaattaatatcaatatagtcttaa 38217  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    |||||||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  38218 acaactctactggctgcagtaaacatcatcactaggtctcaatgccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactca 38317  T
Q  498 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    | ||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  38318 agcaactaccttctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 38403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14669 - 14548
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  14669 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 14573  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       ||||||||||||| |||||||||||    
T  14572 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga 14548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 76992 - 76409
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76992 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 76893  T
Q  103 cgga-ggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgac-ttatcaac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  | | ||||||    
T  76892 cggagggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacttatgaacagaaca-cgtaatcatcgtaatcaac 76794  T
Q  201 atgcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcact 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| |    
T  76793 atgcatccaataatttggagctaaacattatcatatacatatgcacttagttaaataacagaagcagcat-aacaagtcacacagcaagatgatatcatt 76695  T
Q  301 atatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaata-actt-a 397  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||| |    
T  76694 atatcaatagcacataaattgcattattatcaaaccttcatatcttgcatgaatatacaatacattagttcatactcaattaatatcaatatagtcttaa 76595  T
Q  398 acaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacata 497  Q
    |||||||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  76594 acaactctactggctgcagtaaacatcatcactaggtctcaatgccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacactca 76495  T
Q  498 aacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    | ||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||    
T  76494 agcaactaccttctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagtaacactaatctcccaaactgatgttgttc 76409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 9)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 574
Target Start/End: Original strand, 26404 - 26994
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26404 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgttatcataaatattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 26503  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactta-tcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||  | || ||||    
T  26504 tgcggaggacaaagctcctaaaaatcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggaatcttatgaacaaaacatcgtagtcatcatattcaa 26603  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaac---------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26604 catgcatccaataatttggagctaaacgtcatcttattcatcatatatagacattatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataa 26703  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | ||| ||||| |||| |   || |||||||||  | ||||||||||| |||||| | ||| |||||||    
T  26704 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattgcatcataatcaaactgtcatatcttgcataattatacaatacattagttcgtgttcaattaata 26803  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26804 tcaatatatcttaaacaactctacagactgcatttaacgtcatcattaagtctcattaccaaataggggttcactctggatcaacacgtgcgacacagat 26903  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaacta 574  Q
    |||||||||||  || ||| | ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26904 cgcacaaacactcaagcaactacattcaggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaacta 26994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39116 - 38978
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39116 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 39019  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39018 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 38978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 490
Target Start/End: Original strand, 43145 - 43581
Alignment:
Q  69 aatcgtgcggaggacaaagctccta-taaaacgtgcggaggacaaagctcctaatat-tcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggac 165  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43145 aatcgtgcagaggacaaagctcctaataaatcgtgcagaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggac 43243  T
Q  166 acatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatc------------atataccta-tgcacttagtt 252  Q
     | |||||||||  || ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||            ||| || || |||||||||||    
T  43244 tcttatgaacaat-caccgtgatcaacatatcaacatgcttccaataatttggagctaaacgtcatcatttcatcatgtatagacatattgcacttagtt 43342  T
Q  253 aaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacga 351  Q
    ||||||| | |||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || | ||| ||||| || | |  ||| |||||| ||  |    
T  43343 aaataacagtagcagcatagtcaagtcacataacaggatgatatcattatatcaatagcaaatcaattgcatcataattaaactttcatatcttacataa 43442  T
Q  352 atatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttagg 450  Q
     | ||||||||| ||  |||| ||| |||||||| || |||  || |||| || ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||    ||    
T  43443 ttgtacaatacatta-atcatgttcaattaatatcaacatattttaaacagctttacagactgcattagacgtcatcattaggtctcaataccataaggg 43541  T
Q  451 ggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaa 490  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  43542 ggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgcacaa 43581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 43022 - 43144
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttt-aatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43022 gacaatgctcttagactcgttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaaacgttcggaggacaaagctcctaataaatcg 43121  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaata 123  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  43122 tgcagaggacaaagctcctaata 43144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 6770 - 6890
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||     
T  6770 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctc---tgaaacgtgtggaggacaaagctccta- 6865  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       || |||||||||| |||||||||||    
T  6866 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga 6890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 36546 - 36451
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctccta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  36546 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcagaggacaaagctccta 36451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11599 - 11461
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11599 ttatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtattaatatactttaatcctgcggaggataaaactcc--taaaacgtgtggaggacaaagctcctaa 11502  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11501 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 11461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36449 - 36330
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || ||||||| || ||||    
T  36449 cgtgcggaggacaaagctcctaa---acgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcaacatatc 36354  T
Q  198 a-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    |   || |||||||||||||||||    
T  36353 acttatacatccaataatttggag 36330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 123
Target Start/End: Original strand, 43117 - 43172
Alignment:
Q  69 aatcgtgcggaggacaaagctccta-taaaacgtgcggaggacaaagctcctaata 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43117 aatcgtgcagaggacaaagctcctaataaatcgtgcagaggacaaagctcctaata 43172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 571
Target Start/End: Original strand, 306877 - 307445
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  306877 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 306976  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  306977 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcaacatatcaacat 307076  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatatacc-tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcacta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  307077 gcatccaataatttggagctaaacttcatcatataccatatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaagtcacataacaagatgatatcatta 307176  T
Q  302 tatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaaca 400  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || | |  ||| |||||| || || | ||||||||| ||  ||||  |  |||||    || ||  |||||      
T  307177 tatcaacagcaaattatttgcatcataatta-actttcatatcttacatgattgtacaatacatta-atcatgcttaattaacgacaacatgtcttaaag 307274  T
Q  401 actctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaac 500  Q
     || |||||  ||||||||||| |||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  307275 gctttacagattgcattaaacgtcatcatcaagtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaacacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaagc 307374  T
Q  501 aagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaa 571  Q
    |  |  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  307375 atctaaattctggttgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaa 307445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 12210 - 12805
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12210 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 12309  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  12310 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaacat 12409  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||      ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12410 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcatttcatcatataaatacactatgcacttagttaaataacagcagcagcataaacaagtcacataacagg 12509  T
Q  290 atgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgatt-aatatta 387  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  | | | |||| |||||| ||  | |  |||||||| ||   |||| || ||| ||| | |    
T  12510 atgatatcattatatcaatagcacatcatttgtatcatagttaaaccttcatatcttacataattgcacaatacatta-accatactcaattaaatttca 12608  T
Q  388 aaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgc 486  Q
    | ||| ||| |||| |  ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||     
T  12609 acatatcttaaacagccttacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattatcataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatcgt 12708  T
Q  487 acaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||  ||   | |  |  || |  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||    
T  12709 acaaacactcaagacactcaaaacttgaagtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccaaacaattcccaaactaaagttgttc 12805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 77980 - 78575
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  77980 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 78079  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  78080 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaacat 78179  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcat------------atac-ctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaag 289  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||            ||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||||||| |    
T  78180 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcatttcatcgtatgaatacaatatgcacttagttaaataacaacagcagcataatcaagtcacataacagg 78279  T
Q  290 atgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgatt-aatatta 387  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||| ||||| || | | |||| |||||| ||  | |  |||||||| ||   |||| || ||| ||| | |    
T  78280 atgatatcattatatcaatagcacatcaattgcatcataattaaaccttcatatcttacataattgcacaatacatta-aacatactcaattaaatttca 78378  T
Q  388 aaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgc 486  Q
    | ||| ||| ||||  | | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||    
T  78379 acatatcttaaacagttttgcagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccataagggggttcactcttggtccaaacgtgcgacacagatcgc 78478  T
Q  487 acaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||| |||  ||   | |  |  ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||| |||||||    
T  78479 acaagcactcaagacactcaaagctggaagtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccaaacatttcccaaactaaagttgttc 78575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 58334 - 58190
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  | | ||  ||    
T  58334 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaagcactccaatct 58235  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  58234 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 58190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 61006 - 60878
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||    
T  61006 cgtgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatc 60913  T
Q  198 aacatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  60912 aatatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 60878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 326
Target Start/End: Original strand, 9618 - 9955
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9618 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaattgtgcggaggacaaagctcctataaatcgtg 9717  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  9718 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgttatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaacat 9817  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||      ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || || |    
T  9818 gcatccaataatttggagctaaacgtcatcatttcatcatataaatacactatgcactaagttaaataacagcagcagcataaacaagtcacgtagcagg 9917  T
Q  290 atgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcat 326  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  9918 atgatatcattatatcaatagcacatcaattgtatcat 9955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Original strand, 73760 - 74357
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  73760 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 73859  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  73860 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 73959  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata---------cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||          | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  73960 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcatttcatcatatataaatacatacaatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacataa 74059  T
Q  286 caagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaata 384  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| | || | |||| || | |  | | |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| || || ||||    
T  74060 caggatgatatcattatatcaatagcacatcaattatttcataattaaacttccatatcttacataaatatacaatacctta-atcatactcaatcaata 74158  T
Q  385 ttaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagat 483  Q
    | || ||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  74159 tcaacatatcttaaacagct-tacagactgcatttaacgtcatcattaggtcttattatcataagggggttcgctcttgatcaaaacgtgcgacacaaat 74257  T
Q  484 cgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||  | |  | |  |  ||||  || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||    
T  74258 cgcacaaacactcataacactcaaggctggaggtgctcgcgaggcgagggttcttgctcgccatggcgagtactaaacaattcccaaactaaagttgttc 74357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 228676 - 228598
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  228676 cttagacactctttatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtagaggacaaagctcc 228598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 19921 - 19411
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19921 gcgacaatgcttttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 19822  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactta-tca 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||  | || |||    
T  19821 gtgcggaggataaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcatatcaacacaacaccgtaatcatcgtattca 19722  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaac---------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacata 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||       |||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||    
T  19721 acatgcatccaataatttggagctaaacgtcatcttattcatcatatatagacattatgcacttagttaaataacagcagcagcataatcaagtcacata 19622  T
Q  285 acaagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaat 383  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||| || | ||| ||||| || | |  ||| |||||| ||  | | ||||||||| ||  ||||  || ||||||    
T  19621 acaggatgatatcattatatcaatagcaaatcaattgcatcataattaaactttcatatcttacataattgtacaatacatta-atcatgctcaattaat 19523  T
Q  384 attaaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacaga 482  Q
       || |   ||| |||   | |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  19522 gacaacacgtcttaaacggttttacagattgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaatacgtgcgacgcaga 19423  T
Q  483 tcgcacaaacac 494  Q
    ||||||||||||    
T  19422 tcgcacaaacac 19411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0744
Description:

Target: scaffold0744; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4013 - 3782
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||    
T  4013 gacaatgctcttagacactttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtacggaggacaaagctcctaataatcgtg 3914  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacat 202  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3913 cggaggacaaagctcctaataaatgtggtgaggactaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttatgaacaaaacatcgtaatcaacatatcaacat 3814  T
Q  203 gcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3813 gcatccaacaatttggagctaaacgtcatcat 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3758 - 3702
Alignment:
Q  241 atgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatc 297  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||| || |||||||||    
T  3758 atgcacttagttaaacaacagcagcagcataatcaagtcacatagcaggatgatatc 3702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 38462 - 38648
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38462 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 38561  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38562 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcataatc 38648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 583
Target Start/End: Original strand, 38887 - 39065
Alignment:
Q  405 tacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagt 504  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38887 tacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactctggactaaaaagtgcgacacagatcgcacaaacacataatcaagt 38986  T
Q  505 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  38987 tcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtacttactcgccatggcgagcaccactcaactcacaaactaagcttgttc 39065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 163; Significance: 9e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 25128 - 25314
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25128 gacaatgctcctagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 25227  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25228 cggaggacaaagctcctaattttcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggacacagatgaacaaaacatcataatc 25314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15334 - 14831
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacgt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15334 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatcgt 15235  T
Q  102 gcggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | |||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  15234 gcggaggacaaagctcctaataaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatgaactcttatgaacaaatcaccataatcaacatatcaa 15136  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaac--------ttcatcatata-----cctatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataac 286  Q
     ||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||       ||||||| |||||||||||| | |||| ||||  || ||||||||||    
T  15135 tatgcatccaataatttggagctaaacatcatcatttcatcatatatagacattatgcacatagttaaataacagcagcaacatagtcaagtcacataac 15036  T
Q  287 aagatgatatcactatatcaa-agcacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatat 385  Q
    | |||||||||| |||||||| |||| || | ||| ||||| || | || ||| |||||| ||  | | ||||||||  ||  || |  || ||||||||    
T  15035 aggatgatatcattatatcaatagcaaatcaattgcatcataattaaattttcatatcttacataattgtacaatacttta-atcttgctcaattaatat 14937  T
Q  386 taaaataactt-aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatc 484  Q
     || ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  14936 caacatatcttaaacagctttacagactgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacagatc 14837  T
Q  485 gcacaa 490  Q
    ||||||    
T  14836 gcacaa 14831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 153; Significance: 8e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9194 - 8963
Alignment:
Q  4 acaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9194 acaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataaatcgtg 9095  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || ||||||| || ||||||      
T  9094 cggaggacaaagctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcaacatatcaatg 8996  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatcat 234  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8995 agcatccaataatttggagctaaacgtcatcat 8963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 8695 - 8649
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8695 ctggtagtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtac 8649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32656 - 32473
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32656 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 32557  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgta 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  32556 cggaggacaaaactcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgta 32473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 430 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 32209 - 32057
Alignment:
Q  430 taggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcg 529  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||   | |||||||||||    
T  32209 taggtttcattaccaattaggggtccactcttgatcaaatggtgcgacacagatcgcacaaacacacaaa-aactacattctggacttgctcgcgaggcg 32111  T
Q  530 agagtccttactcgccatggcgagtaccactcca-ctcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  32110 agagttcttactcgccatggcaagtaccactcaatctccc-aactaaggttgttc 32057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 5)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 9101 - 9332
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9101 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 9200  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | |||||    
T  9201 gtgcggaggacaaagctcctattaatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatca 9298  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | | ||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  9299 ataagcatctaataatttggatctaaacgtcatc 9332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 73876 - 73818
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggag 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73876 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggag 73818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 2967 - 2899
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2967 ttatatgcatgtggtatcaatcgtcatcataa-tattaatatactttaatcgtggggaggacaaagctcc 2899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 9530 - 9674
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  9530 tgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccataaagggattcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaatgcactccaatct 9629  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  9630 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 9674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 81520 - 81468
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtg 75  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  81520 ttatatgcatgtggtaccaatcttcatcat-agtattaatatactttaatcgtg 81468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4426 - 4214
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcct-a 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4426 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 4329  T
Q  121 atattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactta-tcaacatgcatccaataatttgga 219  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  4328 aaaatcgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttatcaacaaaacaccgtaatcatcgtattcaacatgcatccaataatttgga 4229  T
Q  220 gctaaacttcatcat 234  Q
    ||||||| |||||||    
T  4228 gctaaacgtcatcat 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 3694 - 3621
Alignment:
Q  510 ctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||    
T  3694 ctggatgtgctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctccctaactagtgttgttc 3621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 241826 - 242052
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  241826 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 241925  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  241926 tgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaa 242019  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  242020 tatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 242052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 242247 - 242391
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  | | ||  ||    
T  242247 tgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaagcactccaatct 242346  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  242347 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 242391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 23027 - 23216
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| |     
T  23027 ttatatgcatgtggtgccaatcgtcatcata-gaattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctac----cgtgtggaggacaaagctccga- 23120  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  23121 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 23215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 9937 - 10169
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct-ataaaac 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9937 gcgaaaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataaatc 10036  T
Q  100 gtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||  || |||||||  | |||||    
T  10037 gtgcggaggacaaagctcgtaataatcgtcgtgaagactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaattcaccgtaatcatcatatca 10135  T
Q  199 acatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10136 atatgcatccaataatttggagataaacgtcatc 10169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 412 - 583
Target Start/End: Original strand, 10367 - 10538
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  10367 tgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccataaagggactcactcttgatcaaaacgtgtgacacagatcgcacaaacactcaatgcactccaatct 10466  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||  || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |  | |||||| |||||| |||||||    
T  10467 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagttcaagccaactccccaactaatgttgttc 10538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 19346 - 19570
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||    
T  19346 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaatgctcctaataatcgtg 19445  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaaca 201  Q
    ||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | |||||| |    
T  19446 cggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaata 19539  T
Q  202 tgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19540 tgcatccaataatttggagctaaacatcatc 19570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Original strand, 25493 - 25634
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  25493 gacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 25592  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctc 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  25593 cggaggacaaagctcctaataatcgtgcggaggacaaagctc 25634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Original strand, 25585 - 25744
Alignment:
Q  68 taatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggaca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  25585 taatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtgcggaggacaaagctccta----tcatggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggact 25679  T
Q  167 catatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    | ||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25680 c-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcaaaatgcatccaataatttggagctaaacatcatc 25744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 428 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 109224 - 109069
Alignment:
Q  428 actaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgagg 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  109224 actaggtctcattaccagttaggggttcactcttgattaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaatctcattctggttgtactcgcgagg 109125  T
Q  528 cgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  109124 tgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaactcccaaactaaggttgttc 109069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14878 - 14651
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  14878 gcgacaatgctcttagacttcttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctcctaataatcg 14779  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||||  | ||||||    
T  14778 tgcggatgacaaagctccta----tcgtggtaaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcatcatatcaa 14684  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14683 tgtgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 14651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 14456 - 14285
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  14456 tgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccaattaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaatgcactccaatct 14357  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||  || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |  | |||||| |||||| |||||||    
T  14356 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagttcaagccaactccccaactaatgttgttc 14285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4417 - 4230
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  4417 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 4318  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  4317 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 4230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 4028 - 3824
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  4028 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 3929  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  3928 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 3829  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  3828 ttgtt 3824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5656 - 5440
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5656 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 5559  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  5558 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 5462  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  5461 atttggagctaaacgtcatcat 5440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 11971 - 12187
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11971 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 12068  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaata 212  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  12069 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaata 12165  T
Q  213 atttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  12166 atttggagctaaacgtcatcat 12187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 519 - 583
Target Start/End: Original strand, 12719 - 12783
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  12719 ctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcatctcccaaactagtgttgttc 12783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 8556 - 8743
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  8556 gacaatgctcctagactccgtatatgcatgaggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 8655  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  8656 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 8743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 582
Target Start/End: Original strand, 8945 - 9149
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  8945 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaattaggggttcactcctgatcaaaaggtgcgac 9044  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaagg 577  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  9045 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactcaaattcccaactaatg 9144  T
Q  578 ttgtt 582  Q
    |||||    
T  9145 ttgtt 9149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 21971 - 22158
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  21971 gacaatgctcctagactccatatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtataaatatactttagtcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 22070  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaat-attcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  22071 cggaggacaaagctcctaataaaacgtggtgaggactaagctcaatgatatgctatgcatggactcttaacaacaaaacatcgtaatc 22158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 378 - 561
Target Start/End: Original strand, 22360 - 22543
Alignment:
Q  378 attaatattaaaataacttaacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgac 477  Q
    |||||||| || ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||  ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22360 attaatatcaacatatcttaatagctttacagactgcattaaacgttatcataaggtttcattaccaaataggggttcactcttgatcaaaaggtgcgac 22459  T
Q  478 acagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactc 561  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  | ||| ||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22460 acagatcgcacaaccactcaaacagctacattctggacttgctcgcgaggcgagagttctcactcgccatggcgagtaccactc 22543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 1 - 215
Alignment:
Q  24 atatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||      
T  1 atatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa-- 96  T
Q  124 ttcgtggtgaggactaagctcaatgagatgctatgcatggacacatatgaacaaaa---------catcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataat 214  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||         |||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  97 -tcgtggtgaggacaaagctcaatgaaatgctatgcatggactcttaacaacaaaacaccgtaatcatcgtaatcaacatatcatcatgcatccaataat 195  T
Q  215 ttggagctaaacttcatcat 234  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  196 ttggagctaaacgtcatcat 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25313 - 25087
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||    
T  25313 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcttcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaatctcctaataatcg 25214  T
Q  101 tgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa 199  Q
    || ||||||||||||| |||    || |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||  | ||||||    
T  25213 tgtggaggacaaagcttcta----tcatggtgaggactaagctcaatga-acgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacattgtaatcatcatatcaa 25120  T
Q  200 catgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25119 tgtgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 25087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 424 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24879 - 24809
Alignment:
Q  424 catcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacac 494  Q
    ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24879 catcattaggtttcgttgccaattaggggttcactcttgatcaacacatgcgacacagatcgcacaaacac 24809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 139 - 1
Alignment:
Q  3 gacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtg 102  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  139 gacaatgctctttatctccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtg 40  T
Q  103 cggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaag 141  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39 cggaggacaaagctcctaataaacgtggtgaggactaag 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 70 - 25
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  70 cgtgcggaggacaaagctcctaataatcgtgcggaggacaaagctc 25  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33243 - 33050
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33243 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttttatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 33146  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  33145 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 33051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 9230 - 9421
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||     
T  9230 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctccta- 9325  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  9326 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttgga 9420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 9712 - 9904
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  9712 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 9808  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  9809 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 9903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16961 - 16823
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16961 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaaactcctaa 16864  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16863 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 16823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 15145 - 15315
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15145 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaacatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 15242  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  15243 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatca 15315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36668 - 36531
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  36668 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 36572  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36571 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 36531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 53364 - 53524
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatacttta---atcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    || ||||  |||||||||||||     
T  53364 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-agtattaatatactttaagcatcgtggggaggacaaagctcc----aatcgtggtgaggacaaagctc- 53457  T
Q  119 taatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
        | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  53458 ---aaatcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatc 53524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 189959 - 189767
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  189959 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctcctaa 189863  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  189862 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 189768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25265 - 25075
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||     
T  25265 ttatatgcatgtggtaccaatcttcatcata-gtattaatatactttaatcgtgctgaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctccta- 25171  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       |||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  25170 ---tcgtggtgagaacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgga 25076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 9136 - 9282
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggaca 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9136 cttagactctt-atatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaaaatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggaca 9231  T
Q  112 aagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9232 aagctcctaa---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 9282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 77477 - 77331
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggaca 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  77477 cttagactctt-atatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggaca 77382  T
Q  112 aagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    ||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  77381 aagctcctaa---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 77331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 6490 - 6681
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||     
T  6490 ttatatgcatgtggtaccaattgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctccta- 6585  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaa-catgcatccaataatttgga 219  Q
       ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| |||| |||||| ||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||    
T  6586 ---tcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacagaacatcttaatcaacttttcaattatacatccaataatttgga 6680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 36117 - 36307
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  36117 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcctaa 36213  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggag 220  Q
        | ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||   | |||||||||||||||||    
T  36214 ----catggcgaggacaaagctcaatga-atgctaatgtatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatcactttacatccaataatttggag 36307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 1676 - 1822
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggaca 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  1676 cttagactctt-atatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaggctcct---aaacgtgcggaggaca 1771  T
Q  112 aagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    ||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1772 aagctcctaa---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 1822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 1121 - 1213
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1121 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctccta 1213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Original strand, 8306 - 8445
Alignment:
Q  20 ctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcct 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  8306 ctttatatgcatgtgctatcaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcct 8402  T
Q  120 aatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
    ||   || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8403 aa---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 8445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Original strand, 15426 - 15525
Alignment:
Q  20 ctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcct 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  15426 ctttatatgcatgtgctatcaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgtgcggaggacaaagctcct 15522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20761 - 20592
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||    
T  20761 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgtggaggacaaagctcctaa 20665  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  20664 ---tcatggtgatgacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaacttatca 20592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 18164 - 18355
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||     
T  18164 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggaaaaagctact---aaacgtgcggaggacaaagctccta- 18259  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||  |||||||   || ||||||||||||||||    
T  18260 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tagcaacaaaacatcttaatcagcttatcactaatacatccaataatttgga 18354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6297 - 6128
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||     
T  6297 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc--taaaacttgtagaggacaaagctccta- 6201  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  6200 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcaacttatca 6128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 8296 - 8225
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 6537 - 6417
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||     
T  6537 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctc---tgaaacgtgtggaggacaaagctccta- 6442  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatga 149  Q
       || |||||||||| |||||||||||    
T  6441 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga 6417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Original strand, 1708 - 1846
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1708 ttatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtattaatatactttaatcctgcggaggataaaactcc--taaaacgtgtggaggacaaagctcctaa 1805  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggac 165  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1806 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggac 1846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 14757 - 14843
Alignment:
Q  1 gcgacaatgctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaag 87  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14757 gcgacaatgctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaag 14843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 63664 - 63855
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||     
T  63664 ttatatgcatgtggtaccaatcatcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggaaaaagctcct---aaatgtgcggaggacaaagctccta- 63759  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttgga 219  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||  ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  63760 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatgaacttatcatttatacatccaataatttgga 63854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12079 - 11988
Alignment:
Q  3 gacaatgctc-ttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12079 gacaatgctccttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaaacgtgcggaggacaaagctccta 11988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12012 - 11891
Alignment:
Q  96 aaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgactt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||    
T  12012 aaacgtgcggaggacaaagctcctaa---tcgtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcaactt 11918  T
Q  195 atca-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    ||||   || |||||||||||||||||    
T  11917 atcacttatacatccaataatttggag 11891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 208170 - 208073
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||    
T  208170 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctcct---aaacgcgcggaggacaaagctcttaa 208074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 177 - 346
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||     
T  177 ttatatgcatgtggtaccaaacgtcatcataaatattaatatactttaatcgagtggaggacaaagctcc--taaaacgtgtggaggacaaagctacta- 273  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
       || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  274 ---tcatggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacaccttaatcgacttatca 346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Original strand, 29362 - 29477
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||     
T  29362 ttatatgcatgtggtaccaatcttcatcata-gtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcct---aatcgtgcggaggacaaagctccta- 29456  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctca 145  Q
       ||||||||||||| |||||||    
T  29457 ---tcgtggtgaggacaaagctca 29477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 73 - 2
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 9401 - 9472
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9401 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 9472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 397 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5729 - 5570
Alignment:
Q  397 aacaactctacagtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacat 496  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||      
T  5729 aacaactttacagactgcattaaacgtcatcattaggtttcattaccaattaggggttcactcatgatcaaaacgtgcgacgcagatcgcacaaacactc 5630  T
Q  497 aaacaagttcatcctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||   | | ||  ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5629 aaggcactccaatctggtagtgctcgtgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtac 5570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6026 - 5907
Alignment:
Q  115 ctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataa 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||| || ||||||| || ||||||   |||||||||||    
T  6026 ctcctaataatcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatcaacaaatcaccgtaatcaacatatcaatgagcatccaataa 5928  T
Q  214 tttggagctaaacttcatcat 234  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  5927 tttggagctaaacgtcatcat 5907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 556
Target Start/End: Original strand, 3 - 448
Alignment:
Q  125 tcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagcta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3 tcgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactcttatgaacaaatcaccgtaatcaacatatcaacatgcatccaataatttggagcta 101  T
Q  224 aac--------ttcatcatatacc-----tatgcacttagttaaataacggaagcagcataaacaggtcacataacaagatgatatcactatatcaa-ag 309  Q
    |||        |||||||||||       |||||||||||||||||||| | |||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  102 aacgtcatcatttcatcatataaaaacaatatgcacttagttaaataacagcagcaacatagtcaagtcacataacagaatgatatcattatatcaatag 201  T
Q  310 cacataatttgtatcattatcacatcttcttatcttgcacgaatatacaatacaatagttcatattcgattaatattaaaataacttaa-caactctaca 408  Q
     | || | ||| ||||| || | |  ||| |||||| ||  | | ||||||||  || | | |  || |||||||| || ||| ||||| || || ||||    
T  202 aaaatcaattgcatcataattaaactttcatatcttacataattgtacaatactttaatcc-tgctcaattaatatcaacatatcttaaacagctttaca 300  T
Q  409 gtctgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcat 508  Q
      |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||  |    | | ||     
T  301 aactgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccataagggggttcactcttgatccaaacgtgcgacacaaatcgcacaagcactcattacactccaa 400  T
Q  509 cctggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    |||||  || |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  401 cctggaagtgctcgtgaggcgagaattcttactcgccatggcgagtac 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 30123 - 29979
Alignment:
Q  412 tgcattaaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcct 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||    
T  30123 tgcattaaacgtcatcattaggtctcattaccatttaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaatgcactccaatct 30024  T
Q  512 ggttgtactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    ||  || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30023 ggaagtgctcgcgaggcgagagtatctactcgccatggcgagtac 29979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 16488 - 16654
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||    
T  16488 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-agtattaatatactgtaatcgtgtggaggaaaaagctcctat----cgtgtggaggacaaagctccgaa 16582  T
Q  122 tattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca 198  Q
        | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16583 ----catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-taacaacaaaacatcttaatcaacttatca 16654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 93
Target Start/End: Original strand, 11510 - 11591
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11510 cttagacactctttatgcatgtggtaccaatcttcatcataagtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctccta 11591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 9960 - 9889
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9960 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat 9889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 30725 - 30788
Alignment:
Q  30 atgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30725 atgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttcatcgtgcggaggacaaagctccta 30788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 417 - 556
Target Start/End: Original strand, 36903 - 37041
Alignment:
Q  417 taaacgacatcactaggtctcattaccagttaggggttcactcttgatcaacaagtgcgacacagatcgcacaaacacataaacaagttcatcctggttg 516  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||   | | ||  ||||  |    
T  36903 taaacgtcatctttaggtctcattacca-ttaggggttcactcttgatcaaaacgtgcgacacagatcgcacaaacactcaaggcactccaatctggaag 37001  T
Q  517 tactcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtac 556  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  37002 tgctcgcgaggcgagagttcctactcgccaaggcgagtac 37041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 220
Target Start/End: Original strand, 30767 - 30885
Alignment:
Q  99 cgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  30767 cgtgcggaggacaaagctcctaa-at--gtggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaagacaccttaatcgacttatc 30861  T
Q  198 a-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    |   || |||||||||||||||||    
T  30862 acttatacatccaataatttggag 30885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 81026 - 80871
Alignment:
Q  72 cgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacata 170  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||    
T  81026 cgtgcggaggacaaagctccta---atcgtgcggaggacaaagctcctaat---catggtgaggacaaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-ta 80935  T
Q  171 tgaacaaaaca-tcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatca 233  Q
    | ||||||||| ||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  80934 tcaacaaaacaatcgtattcatcatatcaatatgcatccaataatttggagctaaacgtcatca 80871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18927 - 18859
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcc 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18927 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtggggaggacaaagctcc 18859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 173093 - 173292
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggaca 111  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    ||||  |||||||    
T  173093 cttagacactctttatgcatgtggtaccaatcgtcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtgcaggacaaagctccgat----cgtggtgaggaca 173187  T
Q  112 aagctcctaatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatcca 209  Q
     |||||     | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||    
T  173188 tagctc----aaatcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatcca 173281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 93
Target Start/End: Original strand, 28867 - 28947
Alignment:
Q  12 cttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctccta 93  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28867 cttagacactctttatgcatgtggtaccaatcttcatcata-gtattaatatactttaatcgtgcagaggacaaagctccta 28947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 10354 - 10283
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctat 94  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10354 ttatatgcatgtggtatcaatcttcatcata-gtattaatatactttaatcgtgtggaggacaaagctcctat 10283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20307 - 20122
Alignment:
Q  25 tatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactttaatcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcctaatat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    ||||  |||||||||||||     |     
T  20307 tatgcatgtggtaccaatcgtcatcat-agtattaatatactttaatcgtg-tgaggacaaagctccgat----cgtggtgaggacaaagctc----aaa 20218  T
Q  125 tcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatca-acatgcatccaataatttggag 220  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  20217 tcgtggtgaggacaaagcttaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggag 20122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 518 - 583
Target Start/End: Original strand, 3005 - 3070
Alignment:
Q  518 actcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  3005 actcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcgagtaccactcaattcccaaactaacgttgttc 3070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 232
Target Start/End: Original strand, 2699 - 2804
Alignment:
Q  126 cgtggtgaggactaagctcaatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  2699 cgtggtgaggactaagctcaatga-atgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcgtaatcatcatatcgatatgcatccaataatttggagccaa 2796  T
Q  225 acttcatc 232  Q
    || |||||    
T  2797 acgtcatc 2804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 519 - 583
Target Start/End: Original strand, 3069 - 3133
Alignment:
Q  519 ctcgcgaggcgagagtccttactcgccatggcgagtaccactccactcccaaactaaggttgttc 583  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  3069 ctcgcgaggcgagagttcttactcgccatggcaagtaccaaacaattcccaaactaaggttgttc 3133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 2651 - 2694
Alignment:
Q  10 ctcttagactctttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataa 53  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2651 ctcttagactccttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataa 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 66722 - 66562
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt-ta--atcgtgcggaggacaaagctcctataaaacgtgcggaggacaaagctcc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    || ||||  |||||||||||||     
T  66722 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatca-aagtattaatatacttatagcatcgtggggaggacaaagctcc----aatcgtggtgaggacaaagctc- 66629  T
Q  119 taatattcgtggtgaggactaagctcaatgagatgct-atgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatc 189  Q
        | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  66628 ---aaatcgtggtgaggacaaagctcaatg-tatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacatcttaatc 66562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 6522 - 6610
Alignment:
Q  144 caatgagatgcta-tgcatggacacatatgaacaaaacatcgtaatcgacttatcaacatgcatccaataatttggagctaaacttcatc 232  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6522 caatgaaatgctaatgcatggactc-tatcaacaaaacgtcgtaatcatcatatcaatatgcatccaataatttggagctaaacgtcatc 6610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 55
Target Start/End: Original strand, 5 - 38
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagt 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagt 38  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 3442 - 3397
Alignment:
Q  22 ttatatgcatgtggtaccaatcgtcatcataagtattaatatactt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  3442 ttatatgcatgtggtaccaatcaacgtaataagtattaatatactt 3397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University