View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11356_low_17 (Length: 447)

Name: NF11356_low_17
Description: NF11356
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11356_low_17
NF11356_low_17
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (16-404)||(48809314-48809702)
chr3 (33-419)||(53958777-53959163)
chr3 (16-434)||(36279974-36280395)
chr3 (16-418)||(55389127-55389531)
chr3 (16-425)||(17700572-17700985)
chr3 (16-425)||(48573039-48573454)
chr3 (113-425)||(48574214-48574528)
chr3 (16-247)||(52317146-52317379)
chr3 (112-425)||(52318079-52318386)
chr3 (112-420)||(36279011-36279313)
chr3 (112-419)||(17701682-17701982)
chr3 (112-327)||(55388211-55388430)
chr3 (180-425)||(2591681-2591925)
chr3 (112-434)||(48808411-48808731)
chr3 (222-352)||(53957800-53957930)
chr3 (209-322)||(19115020-19115133)
chr3 (127-319)||(36827231-36827418)
chr3 (231-322)||(19114670-19114760)
chr3 (229-330)||(20464238-20464339)
chr3 (230-327)||(612386-612484)
chr3 (238-304)||(33837338-33837404)
chr3 (282-420)||(34263864-34264002)
chr3 (229-322)||(47117945-47118037)
chr3 (334-419)||(20464129-20464214)
chr3 (230-322)||(47428457-47428549)
chr3 (230-322)||(45600833-45600925)
chr3 (230-308)||(47075245-47075323)
chr3 (252-322)||(49261453-49261523)
chr3 (245-322)||(33427888-33427965)
chr3 (238-303)||(40317946-40318011)
chr3 (368-425)||(47118063-47118120)
chr3 (232-308)||(3693996-3694072)
chr3 (256-304)||(29188271-29188319)
chr3 (360-400)||(45600943-45600983)
chr3 (318-419)||(52317039-52317140)
chr3 (263-326)||(40206055-40206118)
chr3 (161-233)||(40206163-40206237)
chr3 (230-313)||(45599050-45599133)
chr3 (368-425)||(11773063-11773120)
chr3 (370-401)||(33427829-33427860)
chr3 (368-434)||(55388118-55388184)
chr3 (368-425)||(2592019-2592076)
chr3 (229-305)||(30360320-30360395)
chr3 (258-322)||(33428357-33428421)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (16-428)||(7258326-7258740)
chr7 (16-425)||(35727753-35728164)
chr7 (16-434)||(42477426-42477846)
chr7 (33-419)||(44333199-44333585)
chr7 (33-418)||(48788350-48788734)
chr7 (40-425)||(48646103-48646490)
chr7 (113-420)||(10898829-10899137)
chr7 (112-425)||(45584251-45584565)
chr7 (112-425)||(48647197-48647512)
chr7 (112-420)||(7259447-7259748)
chr7 (112-425)||(30924771-30925077)
chr7 (32-275)||(45583798-45584036)
chr7 (163-420)||(35728900-35729150)
chr7 (111-419)||(44334212-44334512)
chr7 (112-348)||(10894474-10894712)
chr7 (200-419)||(48777316-48777536)
chr7 (197-348)||(42478111-42478261)
chr7 (180-425)||(43457511-43457768)
chr7 (112-330)||(12223442-12223653)
chr7 (172-294)||(12221486-12221609)
chr7 (112-330)||(39708278-39708490)
chr7 (116-329)||(7509210-7509426)
chr7 (161-331)||(43461526-43461692)
chr7 (16-110)||(10895317-10895412)
chr7 (116-301)||(19433676-19433860)
chr7 (123-329)||(5929882-5930082)
chr7 (187-324)||(46287219-46287352)
chr7 (123-322)||(34710156-34710349)
chr7 (149-322)||(6680311-6680479)
chr7 (230-312)||(46286690-46286772)
chr7 (180-321)||(24935513-24935657)
chr7 (231-322)||(24934954-24935045)
chr7 (112-224)||(33607271-33607385)
chr7 (123-218)||(32794560-32794657)
chr7 (230-331)||(33607368-33607469)
chr7 (238-419)||(44529088-44529270)
chr7 (188-321)||(2677094-2677232)
chr7 (181-304)||(8047010-8047125)
chr7 (245-330)||(8048653-8048738)
chr7 (180-322)||(34707777-34707911)
chr7 (161-327)||(39824301-39824471)
chr7 (228-327)||(384991-385089)
chr7 (161-328)||(33060972-33061148)
chr7 (258-328)||(24287651-24287721)
chr7 (112-226)||(44529541-44529657)
chr7 (258-322)||(8375505-8375569)
chr7 (238-326)||(32793344-32793432)
chr7 (250-425)||(44530511-44530680)
chr7 (258-329)||(8870149-8870220)
chr7 (260-327)||(22621299-22621366)
chr7 (111-149)||(330077-330115)
chr7 (368-418)||(13578332-13578382)
chr7 (116-224)||(32793423-32793533)
chr7 (283-328)||(25621628-25621673)
chr7 (183-243)||(48249823-48249883)
chr7 (229-308)||(385503-385581)
chr7 (258-329)||(8870909-8870980)
chr7 (285-328)||(30917883-30917926)
chr7 (293-327)||(2677721-2677755)
chr7 (113-154)||(25621469-25621510)
chr7 (372-425)||(46286557-46286610)
chr7 (282-330)||(48249727-48249775)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (16-425)||(28590770-28591183)
chr5 (40-420)||(25590489-25590871)
chr5 (16-399)||(8075492-8075876)
chr5 (16-427)||(32640340-32640754)
chr5 (16-350)||(40611389-40611726)
chr5 (32-420)||(2466447-2466838)
chr5 (16-399)||(14890819-14891190)
chr5 (16-434)||(544693-545113)
chr5 (33-352)||(4593783-4594097)
chr5 (113-419)||(2464729-2465037)
chr5 (112-425)||(40612413-40612728)
chr5 (112-425)||(8074505-8074819)
chr5 (112-419)||(4592921-4593223)
chr5 (115-425)||(545801-546105)
chr5 (113-350)||(14889898-14890137)
chr5 (112-352)||(28589826-28590071)
chr5 (111-419)||(32641496-32641789)
chr5 (113-330)||(9537191-9537403)
chr5 (164-331)||(18004806-18004970)
chr5 (159-328)||(32555323-32555498)
chr5 (163-324)||(34173435-34173611)
chr5 (124-249)||(9537825-9537948)
chr5 (114-224)||(27720714-27720827)
chr5 (229-291)||(2314387-2314449)
chr5 (230-308)||(21069480-21069557)
chr5 (257-327)||(37072730-37072800)
chr5 (229-327)||(578625-578723)
chr5 (238-327)||(19271514-19271604)
chr5 (253-322)||(16611865-16611934)
chr5 (238-327)||(19271660-19271749)
chr5 (180-224)||(21069540-21069584)
chr5 (258-321)||(13651043-13651106)
chr5 (368-434)||(19182995-19183061)
chr5 (112-161)||(19186059-19186108)
chr5 (258-322)||(12445299-12445363)
chr5 (370-410)||(14881016-14881056)
chr5 (369-420)||(18004697-18004748)
chr5 (258-313)||(31946935-31946990)
chr5 (272-330)||(9537945-9538003)
chr5 (180-226)||(30970296-30970342)
chr5 (282-328)||(35538207-35538253)
chr5 (116-157)||(23773301-23773342)
chr5 (260-328)||(19186114-19186181)
chr5 (111-163)||(31946881-31946933)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (16-425)||(35178462-35178873)
chr8 (39-352)||(10406333-10406633)
chr8 (112-420)||(32898199-32898509)
chr8 (112-425)||(35177449-35177762)
chr8 (117-420)||(10407343-10407648)
chr8 (112-420)||(1952739-1953034)
chr8 (113-322)||(28619288-28619498)
chr8 (116-330)||(5737011-5737226)
chr8 (112-322)||(5965176-5965388)
chr8 (124-330)||(5737779-5737977)
chr8 (229-328)||(39138517-39138616)
chr8 (230-330)||(41122616-41122716)
chr8 (238-329)||(41121275-41121366)
chr8 (222-322)||(30134743-30134843)
chr8 (228-328)||(45476415-45476515)
chr8 (105-330)||(32564227-32564463)
chr8 (249-325)||(45476336-45476412)
chr8 (121-224)||(32563828-32563933)
chr8 (250-328)||(33315029-33315107)
chr8 (245-308)||(13144531-13144594)
chr8 (230-308)||(32563767-32563845)
chr8 (258-328)||(41754688-41754758)
chr8 (238-327)||(8569560-8569649)
chr8 (251-328)||(28006471-28006548)
chr8 (251-328)||(28063774-28063851)
chr8 (256-327)||(2552186-2552256)
chr8 (258-325)||(31075173-31075239)
chr8 (159-220)||(41121361-41121423)
chr8 (120-224)||(41122527-41122633)
chr8 (112-153)||(28526301-28526342)
chr8 (111-151)||(28005694-28005734)
chr8 (111-151)||(28062997-28063037)
chr8 (116-159)||(28525120-28525163)
chr8 (258-328)||(9626343-9626413)
chr8 (262-328)||(12637647-12637713)
chr8 (258-328)||(28524929-28524999)
chr8 (286-328)||(36032877-36032919)
chr8 (258-328)||(41754139-41754209)
chr8 (112-153)||(28006330-28006371)
chr8 (112-153)||(28063633-28063674)
chr8 (369-398)||(28619070-28619099)
chr8 (117-154)||(36033037-36033074)
chr8 (369-418)||(45476223-45476272)
chr8 (369-425)||(5965455-5965511)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (16-425)||(31091184-31091596)
chr2 (16-352)||(2911145-2911483)
chr2 (16-336)||(24459111-24459434)
chr2 (16-425)||(39015059-39015471)
chr2 (15-420)||(39999991-40000398)
chr2 (16-240)||(32765938-32766164)
chr2 (112-434)||(32764983-32765306)
chr2 (112-425)||(2910154-2910469)
chr2 (114-425)||(14704060-14704363)
chr2 (112-418)||(24458121-24458429)
chr2 (112-425)||(31090218-31090526)
chr2 (113-396)||(39016149-39016423)
chr2 (180-425)||(17330043-17330299)
chr2 (162-423)||(7073695-7073969)
chr2 (286-425)||(32766168-32766308)
chr2 (230-330)||(43380736-43380836)
chr2 (228-331)||(7412260-7412363)
chr2 (232-313)||(21732281-21732362)
chr2 (232-328)||(21733627-21733723)
chr2 (238-313)||(12010225-12010300)
chr2 (16-80)||(14705032-14705097)
chr2 (230-331)||(43381045-43381146)
chr2 (202-322)||(5914858-5914978)
chr2 (215-327)||(31443084-31443196)
chr2 (229-350)||(39999081-39999197)
chr2 (230-331)||(17466683-17466783)
chr2 (238-331)||(33161936-33162029)
chr2 (247-328)||(34037544-34037625)
chr2 (112-330)||(39256768-39256975)
chr2 (180-268)||(8420749-8420842)
chr2 (215-350)||(33439370-33439504)
chr2 (258-328)||(37607273-37607343)
chr2 (113-220)||(38984747-38984857)
chr2 (239-308)||(11985861-11985930)
chr2 (238-331)||(33163320-33163413)
chr2 (228-327)||(31442503-31442602)
chr2 (258-328)||(14887380-14887450)
chr2 (334-425)||(17466806-17466897)
chr2 (258-328)||(18675255-18675324)
chr2 (112-153)||(18675452-18675493)
chr2 (180-224)||(33162020-33162064)
chr2 (277-328)||(12746102-12746153)
chr2 (221-327)||(12003739-12003845)
chr2 (258-308)||(18676705-18676755)
chr2 (258-328)||(26585247-26585316)
chr2 (161-236)||(31442614-31442691)
chr2 (230-331)||(17466209-17466310)
chr2 (180-240)||(12004781-12004841)
chr2 (238-322)||(12396162-12396246)
chr2 (228-327)||(28864663-28864762)
chr2 (369-425)||(38985002-38985058)
chr2 (181-224)||(43381020-43381062)
chr2 (111-149)||(31442915-31442953)
chr2 (370-419)||(21733785-21733834)
chr2 (370-427)||(34037687-34037744)
chr2 (368-425)||(34582682-34582739)
chr2 (260-328)||(38853926-38853994)
chr2 (260-328)||(38854960-38855028)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (16-420)||(52440217-52440623)
chr1 (32-425)||(9340714-9341094)
chr1 (42-396)||(32664587-32664941)
chr1 (16-425)||(7945231-7945623)
chr1 (112-419)||(32665531-32665833)
chr1 (116-327)||(52439613-52439826)
chr1 (229-425)||(9339700-9339896)
chr1 (112-329)||(6612580-6612799)
chr1 (161-418)||(7944216-7944470)
chr1 (112-330)||(51450169-51450389)
chr1 (180-330)||(22857382-22857533)
chr1 (112-322)||(34088213-34088415)
chr1 (230-330)||(3117818-3117918)
chr1 (180-327)||(11830061-11830212)
chr1 (231-331)||(34085690-34085790)
chr1 (231-330)||(25038050-25038149)
chr1 (118-224)||(25038133-25038240)
chr1 (231-330)||(25043262-25043361)
chr1 (118-224)||(25043345-25043452)
chr1 (208-322)||(5782551-5782665)
chr1 (222-328)||(6613833-6613939)
chr1 (180-308)||(26518280-26518405)
chr1 (189-330)||(51453552-51453688)
chr1 (319-419)||(10333149-10333249)
chr1 (258-324)||(1001326-1001392)
chr1 (258-328)||(8975330-8975400)
chr1 (238-331)||(22856848-22856939)
chr1 (229-308)||(16249834-16249913)
chr1 (258-329)||(44720729-44720800)
chr1 (258-328)||(11060667-11060736)
chr1 (161-218)||(23703948-23704006)
chr1 (245-327)||(39977504-39977586)
chr1 (228-308)||(39726539-39726618)
chr1 (258-325)||(1407802-1407869)
chr1 (258-328)||(534430-534500)
chr1 (251-328)||(50107078-50107155)
chr1 (162-217)||(22856945-22857001)
chr1 (115-212)||(34085794-34085893)
chr1 (337-420)||(10333045-10333128)
chr1 (258-328)||(11059787-11059857)
chr1 (258-308)||(29766114-29766164)
chr1 (369-418)||(5783122-5783171)
chr1 (368-425)||(6613991-6614048)
chr1 (360-425)||(22856734-22856799)
chr1 (258-322)||(44719527-44719591)
chr1 (111-143)||(44720599-44720631)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (32-425)||(47878176-47878553)
chr4 (96-434)||(54574470-54574810)
chr4 (112-425)||(42278103-42278409)
chr4 (82-265)||(42278727-42278912)
chr4 (112-419)||(47874624-47874924)
chr4 (113-330)||(20599647-20599860)
chr4 (116-330)||(4702957-4703171)
chr4 (123-327)||(4701935-4702141)
chr4 (113-233)||(19051113-19051232)
chr4 (264-399)||(50694829-50694964)
chr4 (230-331)||(19050404-19050505)
chr4 (127-223)||(6039377-6039475)
chr4 (250-328)||(6039292-6039370)
chr4 (258-328)||(21621994-21622064)
chr4 (227-325)||(42391757-42391855)
chr4 (233-322)||(26685321-26685410)
chr4 (260-328)||(21623001-21623069)
chr4 (238-330)||(39870536-39870628)
chr4 (245-328)||(26172809-26172892)
chr4 (229-286)||(26170856-26170913)
chr4 (230-307)||(53770944-53771021)
chr4 (161-224)||(19050488-19050552)
chr4 (367-419)||(26172953-26173005)
chr4 (228-327)||(38216618-38216715)
chr4 (281-328)||(31844869-31844916)
chr4 (229-352)||(25810285-25810409)
chr4 (258-328)||(32244445-32244515)
chr4 (260-322)||(48739944-48740006)
chr4 (230-322)||(53770470-53770562)
chr4 (258-308)||(2786414-2786464)
chr4 (180-233)||(42391690-42391743)
chr4 (369-418)||(53771062-53771111)
chr4 (228-308)||(6317878-6317957)
chr4 (334-419)||(19050298-19050383)
chr4 (113-153)||(21622192-21622232)
chr4 (367-419)||(26170700-26170752)
[»] scaffold0767 (3 HSPs)
scaffold0767 (113-308)||(5992-6185)
scaffold0767 (161-327)||(5769-5921)
scaffold0767 (369-418)||(5660-5709)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (121-330)||(31239730-31239941)
chr6 (227-321)||(19600096-19600189)
chr6 (258-328)||(30748161-30748231)
chr6 (258-327)||(29856917-29856986)
chr6 (161-233)||(29845764-29845838)
chr6 (161-233)||(29857029-29857103)
chr6 (369-420)||(30748058-30748109)
chr6 (372-427)||(31219007-31219062)
chr6 (258-308)||(6468733-6468783)
chr6 (229-327)||(12676344-12676442)
chr6 (281-327)||(24621249-24621295)
chr6 (282-318)||(31219106-31219142)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (204-330)||(79242-79368)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (231-304)||(36400-36473)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (368-425)||(116109-116166)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (184-327)||(8672-8819)
[»] scaffold0237 (3 HSPs)
scaffold0237 (258-327)||(3119-3188)
scaffold0237 (161-233)||(1969-2043)
scaffold0237 (161-233)||(3231-3305)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (254-328)||(142413-142486)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 404
Target Start/End: Original strand, 48809314 - 48809702
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacgggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg-a 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48809314 gtatgctcagacctacgggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcaggga 48809413  T
Q  115 cctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaatttgaacaaaagagagaattagatgacatttaggg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48809414 cctaactgatagtaagtatgcacagttagggacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaatttgaacaaaatagagaattagatgacatttaggg 48809513  T
Q  215 atttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcct 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48809514 atttgagatttaagtatttaggaatttgatattcaatttaggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttagtcct 48809613  T
Q  315 tgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacc 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48809614 tctgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagattttttt-acgtcatggactaaagtgataacggaagtgcagagtcagtgacc 48809702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 33 - 419
Target Start/End: Original strand, 53958777 - 53959163
Alignment:
Q  33 ggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcag-gacctaactgatagtaagt 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53958777 ggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaaaagtaatagatgctaatggatctgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaagt 53958876  T
Q  132 atgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggat 231  Q
    ||||||||| ||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  53958877 atgcacagtcagggaccttacaacaagttgtgtttaatggaagattaatttgaacaaaagagagaattagatgacatttaag-atttgagatttaaggat 53958975  T
Q  232 ttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  53958976 ttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcaggggccaaagtgacaattttctactttcactttggtccctgtgacagctcatatgc 53959075  T
Q  332 gccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatc 419  Q
    ||||||||||||||||||| |       ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  53959076 gccacatcatcacttaacaaatttttttaacgtcagagactaaagtgataacggaagtgcagagtcatgaacttatttgtatttaatc 53959163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 434
Target Start/End: Original strand, 36279974 - 36280395
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg- 113  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  36279974 gtatgctcagacctacggggtagagttatgaattattatatgaatataacaataatcaagactaatagatgctaatgaatttgctaattcattgtcaggg 36280073  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36280074 acctaactgatagtaattatgcacagtcagggacctaacattaagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattaaatgacatttag 36280173  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  36280174 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggtttagggactaaagtgaccattttcttctttcattttggtc 36280273  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaa 412  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  |    
T  36280274 cgtgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacatatttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagagtcagagacttatttata 36280373  T
Q  413 tttaatcccgagttagatacct 434  Q
    |||||||| |||| ||| ||||    
T  36280374 tttaatcctgagtcagagacct 36280395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 418
Target Start/End: Original strand, 55389127 - 55389531
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtca-gg 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  55389127 gtatgctcagacctacggaatagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaa-agatgataattgatttgctaattcattgtcatgg 55389225  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55389226 acctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacctaagagtaagttgtgtttaatggaatattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttag 55389325  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55389326 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgattttcggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtc 55389425  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaa 412  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |       ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |    
T  55389426 cctgtgacacctcatatgtgccacatcatcacttaacatattgttgtaacgttggggactaaagtgataacggaagtgtagagtcagggacttaattgta 55389525  T
Q  413 tttaat 418  Q
    ||||||    
T  55389526 tttaat 55389531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17700985 - 17700572
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg- 113  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  17700985 gtatgcttagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgttaatagatttgctaattcattgtcaggg 17700886  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  17700885 acctaactgatagtaagtatgtacagtcagggacctaacagtaagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaatagagaattatatgacatttaa 17700786  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17700785 ggatttgagatttaagaatttaggaatttgatattcaattttggattattgattttttgttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtc 17700686  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacaga-nnnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttga 411  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||        ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  17700685 cctgtgacacctcatatgcggcacatcatcgtttaacagattttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagagtcagggacttatttgt 17700586  T
Q  412 atttaatcccgagt 425  Q
    ||||||||| ||||    
T  17700585 atttaatcctgagt 17700572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48573454 - 48573039
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg- 113  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |     
T  48573454 gtatgcttagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatatatttgctaattcatcgtcatgc 48573355  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgt---gtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||   |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  48573354 acctaactgatagtaagtatgtacagtcagggacctaacagtaagttgttgtgtttaatggaaggttaattttgaataaaagagagaattagatgacatt 48573255  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48573254 tagggatttgagatttaagaatttaggaatttgatattcaattttggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 48573155  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |       ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||    
T  48573154 gtccctgtgacacctcatatgcgcaacatcatcgcttaacaaatttttttaacgtcaaggactaaagtgataacggaagtgcagagtcagaggcttattt 48573055  T
Q  410 gaatttaatcccgagt 425  Q
    | ||||||||| ||||    
T  48573054 gtatttaatcctgagt 48573039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 425
Target Start/End: Original strand, 48574214 - 48574528
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaatt-gtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacattt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  48574214 gacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataggttagtgtttaatggatgattgattttgaacaaaaaagataattatatgacattt 48574313  T
Q  211 agggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttgg 310  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48574314 aaggatttaagatttagggatttagagatttgatattcaatttggggatattgaattttggttcaaggactaaagtgaccattttctactttcactttgg 48574413  T
Q  311 tccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttg 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||       ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48574414 tccctgtgacacctcatatgcgccacatcatcatttaaaagatttttttaacgtcaaggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacttatttg 48574513  T
Q  411 aatttaatcccgagt 425  Q
     ||||||||| ||||    
T  48574514 tatttaatcctgagt 48574528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 52317379 - 52317146
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacgggt-agatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcag-g 113  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  52317379 gtatgctcagacctacgggttagagatatgaattattatgtgaatataacaatactcaagagtaatagatgctaatggatttgctaatttattgtcagag 52317280  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaa-tttgaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52317279 acctaactgattgtaagtatgcacag-cagggacctaacagtaaattgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttag 52317181  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatatt 247  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52317180 ggatatgaaatttaaggatttaggaatttgatatt 52317146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 112 - 425
Target Start/End: Original strand, 52318079 - 52318386
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  52318079 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaaagacctaacaataggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacatt 52318178  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| ||||||| ||||||        ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52318179 taaggatttaagatttagggattt--------gatattcaatttggggatattgttttttggttcatggaccaaagtgaccattttctactttcactttg 52318270  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||       ||||||  |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||    
T  52318271 gaccttgtgacacctcatatgcgtctcatcatcacttaacagatttttttaacgtcagggactaaagtaatatcagaagtgcagagtcagggacttattt 52318370  T
Q  410 gaatttaatcccgagt 425  Q
    | ||||||||| ||||    
T  52318371 gtatttaatcctgagt 52318386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 112 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 36279313 - 36279011
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  36279313 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacttt 36279214  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| ||||||| ||||||        ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36279213 taaggatttaagatttagggattt--------gatattcaatttggggatatttttttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttg 36279122  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||       ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  36279121 gtccctgtgacacctcatatgtgtcacatcatcacttaaaagaattttttaacgtcagggactaaaatgataacggaagtgcagagtcagagacttattt 36279022  T
Q  410 gaatttaatcc 420  Q
    | |||||||||    
T  36279021 gtatttaatcc 36279011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 112 - 419
Target Start/End: Original strand, 17701682 - 17701982
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaatttga--acaaaagagagaattagatgacat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||    
T  17701682 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattaattttataacaaaaaagataattgtatgacat 17701781  T
Q  209 ttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
     || |||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||           |||||||||    
T  17701782 gtaaggatttaagatttaggaattttgggatttgatattcaatttgggaatattgatttttgcttcagggaccaaagtga-----------tttcacttt 17701870  T
Q  309 ggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacaga-nnnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctat 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||        ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  17701871 ggtccctgtgacacctcatatgcgccacatcgtcatttaacagattttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagagtcagggacttat 17701970  T
Q  408 ttgaatttaatc 419  Q
    ||| ||||||||    
T  17701971 ttgtatttaatc 17701982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 112 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 55388430 - 55388211
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagaga--attagatgaca 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||| | |||  |||||||||||    
T  55388430 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcaggaacttaacagtaggttggtgtttaatagaatattgattttgaacaaaaaaaagataattagatgaca 55388331  T
Q  208 tttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactt 307  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55388330 tttaaggatttaagatttaggaatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactt 55388231  T
Q  308 tggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  55388230 tggtccctgtgacacatcat 55388211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2591925 - 2591681
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgata-ttcaatttgggaatattgatttttggttcatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||| |||| ||    
T  2591925 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagagatttgagatttaagaatttaggaatttgagatttcaatttcgagatattgatttttgcttcaggg 2591826  T
Q  279 atcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtg 378  Q
    | ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||       ||| ||  |||||||||||    
T  2591825 accaaagtggcaattttttactttcactttagtccatgtgacacctcatat--gccatatcatcacttaacagaataacttaacatcagggactaaagtg 2591728  T
Q  379 ataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    || | | |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||    
T  2591727 atcatggaagtgcagagtcagagacttgtttgtatttaatcctgagt 2591681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 112 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 48808731 - 48808411
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaaga-gagaattagatgacat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||| |||||   |||||||| |||| || ||||| | || |||||||| | ||    
T  48808731 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcaggaacataacagtaggttggtgttt---ggaagattgattttgagcaaaaaaagataattagataatat 48808635  T
Q  209 ttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808634 ttaaggatttaagatttagggattt--------gatattcaatttgggaatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcacttt 48808543  T
Q  309 ggtccttgtgacacctcatatgcgccacatc------atcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcaggga 402  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |       ||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |    
T  48808542 ggtctctgtgacacctcatatgcgccacatcatcataatcacttaacatatttttttaacatccgggactaaagtgacaacggaagtgcagagttaggaa 48808443  T
Q  403 cctatttgaatttaatcccgagttagatacct 434  Q
    | |||||| ||||||||| |||| ||| ||||    
T  48808442 cttatttgtatttaatcctgagtcagagacct 48808411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 222 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 53957930 - 53957800
Alignment:
Q  222 atttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgaca 321  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  53957930 atttaaggatttagggatttgacattcaatttggggatattgatttttggttcatggactaaagtaatcattttctactttcactttggtccccgtgaca 53957831  T
Q  322 cctcatatgcgccacatcatcacttaacaga 352  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  53957830 cctcatatgtgtcacatcatcacttaacaga 53957800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 322
Target Start/End: Original strand, 19115020 - 19115133
Alignment:
Q  209 ttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||    
T  19115020 ttagggatttgagatttaaggatttggggatatgatattcaaattggggatattgatttttagttcatggactaaagtggttattttctactttcacttt 19115119  T
Q  309 ggtccttgtgacac 322  Q
     |||| ||||||||    
T  19115120 agtccatgtgacac 19115133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 319
Target Start/End: Original strand, 36827231 - 36827418
Alignment:
Q  127 taagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgt-gtttaatggaagatt--aatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagat 223  Q
    |||||||| ||||| ||| || |||||| || |||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||       
T  36827231 taagtatgtacagtcagggacataacaacaagttgttgtttaatgaaagatttgattttgaacaaaagagagaattagttgacatttaaggatttga--- 36827327  T
Q  224 ttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtga 319  Q
         ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||| | | ||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  36827328 -----gatttaggaatttgaaattcaatttggggatattgattttcgattcagggaccaaaataatcattttctattttcactttagtccctgtga 36827418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19114760 - 19114670
Alignment:
Q  231 tttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19114760 tttagggatttgagattcaagttggga-tattgatttttgattcagggattaaagtgaccattttctactttcactttagtccttgtgacac 19114670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20464339 - 20464238
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| ||    
T  20464339 gatttagggatttgaggttcaaattggggatattgatttttgattcatggaccaaagtgaccattttctactttcattttagtctctgtgatacctcgta 20464240  T
Q  329 tg 330  Q
    ||    
T  20464239 tg 20464238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 612484 - 612386
Alignment:
Q  230 atttaggaattt-gatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  612484 atttagggatttagatatttaattttgggatattgatttttggttcatgggttaaattgatcattttctactttcactttagtctctgtgacacctcat 612386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33837404 - 33837338
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttca 304  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33837404 atttgaaattcaatctggggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttca 33837338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 34264002 - 34263864
Alignment:
Q  282 aaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgata 381  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| |       || |||  ||| ||||||||||    
T  34264002 aaagtgaccattttctacttttactttgattcttgtgacatcttatatgcgtcacatcatcccttaacatatttttttaatgtcagggattaaagtgata 34263903  T
Q  382 acgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcc 420  Q
    | | ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  34263902 atggaagtgtagagtcagagacttatttgtatttaatcc 34263864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 322
Target Start/End: Original strand, 47117945 - 47118037
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  47117945 gatttagggattcgagattcaagttggggatattgatttttggttcagggactaaagtgacca-tttctattttcactttagtccttgtgacac 47118037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20464214 - 20464129
Alignment:
Q  334 cacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatc 419  Q
    |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  20464214 cacatcatcacttaacagagttatttaacgtcgtggactaaagtgataacagaagtgcagagtcagggacttctttgtatttaatc 20464129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 322
Target Start/End: Original strand, 47428457 - 47428549
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  47428457 atttagggatttgagattcaagttatgaatattaatttttggttcagggactaaagtgaccatttcctactttcactttagtccatgtgacac 47428549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 322
Target Start/End: Original strand, 45600833 - 45600925
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||| || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  45600833 atttagggatttgaaattcaagttggggatattgatttttggttcaaggactaaactggccattttttactttcactttgatctctgtgacac 45600925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 308
Target Start/End: Original strand, 47075245 - 47075323
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  47075245 atttagggatttaagattcaagttggggatattgatttttggttcagggactaaagtgacaattttctactttaacttt 47075323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 322
Target Start/End: Original strand, 49261453 - 49261523
Alignment:
Q  252 ttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  49261453 ttggggatattgatttttgattcagggattaaagtgaccattttatacttccactttagtctttgtgacac 49261523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33427965 - 33427888
Alignment:
Q  245 attcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33427965 attcaagttggggatattgatttttggttcaggggctaaagtgataattttctactttcactttagtccatgtgacac 33427888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40318011 - 40317946
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttc 303  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40318011 atttgagatttaattttggaatattgatttttgattcagggaccaaagtgactattttctactttc 40317946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 425
Target Start/End: Original strand, 47118063 - 47118120
Alignment:
Q  368 ggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||    
T  47118063 ggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagagacttctttgcatttaatcctgagt 47118120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 308
Target Start/End: Original strand, 3693996 - 3694072
Alignment:
Q  232 ttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3693996 ttagggatttgagattcaatttgaggagattaattttttattcagggatcaaagtgaccattttgtactttcacttt 3694072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Original strand, 29188271 - 29188319
Alignment:
Q  256 gaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttca 304  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29188271 gaatattgattttcggttcagggatcaaagtgacaattttctactttca 29188319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 400
Target Start/End: Original strand, 45600943 - 45600983
Alignment:
Q  360 aacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45600943 aacgtcgtggactaaagtgataacggaagtgcagagtcagg 45600983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 52317140 - 52317039
Alignment:
Q  318 gacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaa 417  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |  ||| |||||| ||||||    
T  52317140 gacacctcatatacaccacatcatcacttaacagatttttttaacgtcatggactaaaatgataacggaggtgcagagttaaagacttatttgtatttaa 52317041  T
Q  418 tc 419  Q
    ||    
T  52317040 tc 52317039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40206118 - 40206055
Alignment:
Q  263 gatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctca 326  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  40206118 gattttcggttcaaggaccaaagtgaccattttatactttcactttagcccttgtgacaactca 40206055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40206237 - 40206163
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagattaa--tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggattt 233  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40206237 gtgtttaatggaagatttaattttgaactaaagaggaaattagatgagatttagagatttgagatttagggattt 40206163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45599133 - 45599050
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 313  Q
    ||||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  45599133 atttagggatttgagtttcaagttaagaatattgatttttggttcaggaactaaagtgaccattttctactttcattttagtcc 45599050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 425
Target Start/End: Original strand, 11773063 - 11773120
Alignment:
Q  368 ggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  11773063 ggactaaagtgataacggaagtgtagagtcagagacttatttgtatttaatcctgagt 11773120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33427860 - 33427829
Alignment:
Q  370 actaaagtgataacgaaagtgcagagtcaggg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33427860 actaaagtgataacgaaagtgcagagtcaggg 33427829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 55388184 - 55388118
Alignment:
Q  368 ggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagttagatacct 434  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||| ||| ||||    
T  55388184 ggactaaagtgataacgggagtgcagagtcagtaacttatttgtatttaatcctgagtcagagacct 55388118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 425
Target Start/End: Original strand, 2592019 - 2592076
Alignment:
Q  368 ggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  2592019 ggactaaagtgataacggaagtattgagtcagggacttatttgtatttaatcctgagt 2592076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 305
Target Start/End: Original strand, 30360320 - 30360395
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcac 305  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  30360320 gatttagtaatttaagattcaatttggga-tattgatttttggttgggaggtcaaagtgacacttttctactttcac 30360395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Original strand, 33428357 - 33428421
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    |||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  33428357 atattgattttttgttgagggactaaagtgaccattttttactttcattttagtctttgtgacac 33428421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7258740 - 7258326
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtca-gg 113  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  7258740 gtatgctcagacctacggggtaaatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgttaatggatttgctaattaattgtcatgg 7258641  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagg 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7258640 acctaacagatagtaagtatgcacagttagggatctaacaataaattgtgtttaatggaagattaatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagg 7258541  T
Q  214 gatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7258540 gatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 7258441  T
Q  314 ttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaat 413  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  7258440 ctgtgacacctcatatgcgctacatcatcacttaacagatttttttaacgtcagggactaaagtgataacagaagtgcagagtcagagacttatttgtat 7258341  T
Q  414 ttaatcccgagttag 428  Q
    ||||||| |||||||    
T  7258340 ttaatcctgagttag 7258326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35728164 - 35727753
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacg-ggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg- 113  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35728164 gtatgctcagacctacgaggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcaggg 35728065  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35728064 acctaactgatagtaagtatgcacagtcagtgatctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttag 35727965  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35727964 ggatttgagatttaggaatttagaaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttaaaggatcaaagtgaccattttctactatcactttggtc 35727865  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaa 412  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||  |    
T  35727864 cctgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagagatttttaacgtc-aggactaaagtgataacggatgtgcagagtcagagacttatttata 35727766  T
Q  413 tttaatcccgagt 425  Q
    |||||||| ||||    
T  35727765 tttaatcctgagt 35727753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 42477846 - 42477426
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg- 113  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  42477846 gtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatagatttgctaattcattgtcaggg 42477747  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42477746 acctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacattaagttgtgcttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttag 42477647  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42477646 ggatttgagatttaagtatttaggaatttgatattcaatatgggaatattagtttttggttcagggaccaaagtgatcattttctactttcactttggtc 42477547  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaa 412  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |    
T  42477546 cctgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacatatttttttaacgtcagggattaaaatgataacggaagtgcagagtca-ggacttatttgta 42477448  T
Q  413 tttaatcccgagttagatacct 434  Q
    |||||||| |||| ||| ||||    
T  42477447 tttaatcctgagtcagagacct 42477426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 33 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 44333585 - 44333199
Alignment:
Q  33 ggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg-acctaactgatagtaagt 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  44333585 ggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcatcgtcagggacctaactgatagtaagt 44333486  T
Q  132 atgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaat-ttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaagga 230  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44333485 atgcacagtcaaggacctaacaataagttgtgtttgttggaagattaatcttgaacaaatgagagaattagttgaaatttagggatttgagatttaagga 44333386  T
Q  231 tttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  44333385 tttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcacgttggtccctgtgacacctcatatg 44333286  T
Q  331 cgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  44333285 cgccacatcatcacttaacagatttttttaacgtcaaggact--agtgataacggaagtgcagagtcagagacttatttgtatttaatc 44333199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 33 - 418
Target Start/End: Original strand, 48788350 - 48788734
Alignment:
Q  33 ggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg-acctaactgatagtaagt 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  48788350 ggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagaataatagatgctaatgtatttgctaattcattgtaagggacctaactgatagtaagt 48788449  T
Q  132 atgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaagga 230  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |    
T  48788450 atgcacagtcagggacctaacaataagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattaaatgaca---agggatttgagatttaagaa 48788546  T
Q  231 tttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48788547 tttaggaatttgatattcaatttgtgaatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 48788646  T
Q  331 cgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaat 418  Q
    |||||||||||||| ||||| |       ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  |||||||    
T  48788647 cgccacatcatcacctaacaaatttttttaacgtcagagactaaagtgataacggaagtgcagagtcagagacttatttatatttaat 48788734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 40 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48646490 - 48646103
Alignment:
Q  40 atatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtca-ggacctaactgatagtaagtatgcaca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48646490 atatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgcttattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcaca 48646391  T
Q  139 gttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaa-tttgaacaaaagagagaatt-agatgacatttagggatttgagatttaaggatttagg 236  Q
    || ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48646390 gtcagggacctaacagtaagttgtatttaatggaagattaattttgaacaaaaaagagaattaagatgacatttagggatttgagatttagggatttagg 48646291  T
Q  237 aatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccac 336  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  48646290 aatttgatattcaatttagaaatattaatttttggttcaagga-caaagtgaccattttttactttcactttggtctctgtgacaccttatatgcgccac 48646192  T
Q  337 atcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    |||||||||||| | |       |||| |   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  48646191 atcatcacttaatatatttttttaacgacagagactaaagtgataacggaagtgtagagtcagggacttatttgtatttaatcctgagt 48646103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 113 - 420
Target Start/End: Original strand, 10898829 - 10899137
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacattta 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10898829 gacctaactgatactaagtatgcatagtcagggacctaacagtaagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaatgagagaattagatgacattta 10898928  T
Q  212 gggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggt 311  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10898929 gggatttgagatgtaagaatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcaaggaccaaagtgaccattttctactttctctttggt 10899028  T
Q  312 ccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttga 411  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||     
T  10899029 ccctgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagatttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagagtcagagacttatttgt 10899128  T
Q  412 atttaatcc 420  Q
    |||||||||    
T  10899129 atttaatcc 10899137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 112 - 425
Target Start/End: Original strand, 45584251 - 45584565
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||||    
T  45584251 ggacttaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttgatgtttaatggaagattgattttgatcaaaaaagataattagatgacatt 45584350  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45584351 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattga-ttttggttcagggaccaaagtgaccattttctacattcactttg 45584449  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||    
T  45584450 gtccttatgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagatttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagagtcattggcttattt 45584549  T
Q  410 gaatttaatcccgagt 425  Q
    | ||||||||| ||||    
T  45584550 gtatttaatcctgagt 45584565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 112 - 425
Target Start/End: Original strand, 48647197 - 48647512
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| |||    
T  48647197 ggacctaactaatagtaagtatgcacaatcaaggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaatagataattagatgatatt 48647296  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48647297 taaggatttaagatttagggatatagggatttggtattcaatttgggcatattgatttttggttcagggacgaaagtgaccattttctactttcactttg 48647396  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||       ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||    
T  48647397 gtccttgtgacacctcatatgtgtcaaatcatcacttaacagatttttttaacgtcagggactaaagtgataacaaaagtgcagagtgagagacttattt 48647496  T
Q  410 gaatttaatcccgagt 425  Q
    | ||||||||| ||||    
T  48647497 gtatttaatcctgagt 48647512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 112 - 420
Target Start/End: Original strand, 7259447 - 7259748
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  7259447 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaataatagattgatgtttaatagaagattgattttgagcaaaaaagataattagaggacatt 7259546  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| ||||||| ||||||        ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7259547 taaggatttaagatttagggattt--------gatattcaatttggggatattaatttttggttcagggaccaaagtgaccattttcta-tttcactttg 7259637  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  7259638 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagatttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgtagagtcagggacttattt 7259737  T
Q  410 gaatttaatcc 420  Q
    | |||||||||    
T  7259738 gtatttaatcc 7259748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 112 - 425
Target Start/End: Original strand, 30924771 - 30925077
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30924771 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacaataggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacatt 30924870  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| ||||||| ||||||        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30924871 taaggatttaagatttagggattt--------gatattcaatttggggatattgatttttggttcatagatcaaagtgaccattttctactttcactttg 30924962  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||   ||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||    
T  30924963 atcactgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacaga-ttttttaacgtcagagactaaagtaataacggaagtgcatagtcagagacttattt 30925061  T
Q  410 gaatttaatcccgagt 425  Q
    | ||||||||| ||||    
T  30925062 gtatttaatcctgagt 30925077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 45584036 - 45583798
Alignment:
Q  32 gggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtc-aggacctaactgatagtaag 130  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45584036 gggtagagatataaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatcgatttgctaattcattgtcaatgacctaactgatagtaag 45583937  T
Q  131 tatgcacagttaggaacctaacaataaatt-gtgtttaatggaagatt-aatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaag 228  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||        |     
T  45583936 tatgcatagtcagggacctaacagtaagttggtgtttaatggaagattgattttgatcaaaaaagataattagatgacattaaaggattt--------aa 45583845  T
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttca 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45583844 gatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttca 45583798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 163 - 420
Target Start/End: Original strand, 35728900 - 35729150
Alignment:
Q  163 gtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatat 261  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||        |||||||||||||||||||    
T  35728900 gtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagatgacatttaaggatttaagatttagggattta--------atattcaatttgggaatat 35728991  T
Q  262 tgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaa 361  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  35728992 tgatttttggttcagggaccaaagtgaccactttctactttcactttggtccatataacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagatttatttaa 35729091  T
Q  362 cgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcc 420  Q
     |||  |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  35729092 tgtcagggactacagtgatagcggaagtgcagagtcagtgacttatttgtatgtaatcc 35729150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 111 - 419
Target Start/End: Original strand, 44334212 - 44334512
Alignment:
Q  111 aggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  ||| ||||||||| || | | |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44334212 aggacctaactgatagtaagtatgcacagtaagga-cctaatagtaggttggtgtttaatgaaataatgattttgaacaaaagagataattagatgacat 44334310  T
Q  209 ttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||| | |||| ||||||| ||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44334311 ttaagaatttaagatttagggattt--------gatattcaatttggggatattgatttttggttcatggaccaaagtgactattttctactttcacttt 44334402  T
Q  309 ggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatt 408  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |       || |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  44334403 ggtccatgtgacatctcatatgtgccacatcatcacttaacata-ttttttaatgtcagggactaaagtgataatggaagtgcagagtcagggacttatt 44334501  T
Q  409 tgaatttaatc 419  Q
    |  ||||||||    
T  44334502 tatatttaatc 44334512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 112 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10894712 - 10894474
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagaga-attagatgacat 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||| ||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  10894712 ggacctaactggtagtaagtatgcacagtcagatacctaacattagattggtgtttaatagaagattgattttgaaaaaaaaaaagatattagatgacat 10894613  T
Q  209 ttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||| | |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10894612 ttaagaatttaagattttcggatttagggatttgatattcaatttggggatat-gatttttggtccagggactaaagtgaccattttctactttcacttt 10894514  T
Q  309 ggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaa 348  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10894513 ggtgcatgtgacacctcgtatgcgccacatcatcacttaa 10894474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 48777536 - 48777316
Alignment:
Q  200 agatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaattt-gggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttcta 298  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  48777536 agatgacatttaaggatttaaaatttagggatttagggatttgaaattcaattttggggatattgatttt-ggttcaggaatcaaagtgaccattttcta 48777438  T
Q  299 ctttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacaga-nnnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtc 397  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |        |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48777437 ttttcactttggtccctgtgacacctcatatgcgtcacatcatcacttaacatatttttttaaacgtcatggactaaagtgataacggaagtgcagagtc 48777338  T
Q  398 agggacctatttgaatttaatc 419  Q
    |||||  |||||| ||||||||    
T  48777337 agggaattatttgtatttaatc 48777316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 348
Target Start/End: Original strand, 42478111 - 42478261
Alignment:
Q  197 attagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttc 296  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42478111 attagatgatatttaaggatttaagatttatgggtttagggatttgatattcaattaggggatattgattttttgttcatggaccaaagtgaccattttc 42478210  T
Q  297 tactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaa 348  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42478211 tactttcactttgatcc-tatgacacctcatatgcgccacatcatcaattaa 42478261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 43457768 - 43457511
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagaga--attagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatg 277  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |    
T  43457768 tttgaacaaaagagagagaattagatgatatttaggggtttgagatttggtgatttaaggatttgagattcaatttagggatattgatttttgg-tcagg 43457670  T
Q  278 gatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgc-----------gccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcg 366  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||       ||||||     
T  43457669 gaccaaagtgaccattttttactttcactttagtctctgtgacacctcatatgccatgtaactgtgtcacatcatcacttaacagaataacttaacgtca 43457570  T
Q  367 tggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  43457569 tgaactaaagtgataacggaagtgcagagtcggggacttatttgtatttaatcctgagt 43457511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 330
Target Start/End: Original strand, 12223442 - 12223653
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  12223442 ggacctaa-tgatagtaagtatgcacattcagggacctaataataagttggtgtttaatggaagattgattttgaactaaagaggtaattagatgacatt 12223540  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||||| ||||| ||||||        || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  12223541 tatggatttgaaatttagggattt--------gagattcaatttggggatattgatttttggttcaaggatcaaagtgacaattttttactttcacttta 12223632  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    || | ||||||| ||||||||    
T  12223633 gttcctgtgacaactcatatg 12223653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 172 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12221609 - 12221486
Alignment:
Q  172 aagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12221609 aagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagagaattgagatttagggatttagaaatttgatattcaatttggggatattgatctttg 12221510  T
Q  271 gttcatggatcaaagtgaccattt 294  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||    
T  12221509 gttcagggaccaaattgaccattt 12221486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 39708490 - 39708278
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39708490 ggaccaaactgatagtaagtatacacagtcagggacctaacagtaagttaatgtttaatggaagatcgattttgaacaaaagagagaattagatgacatt 39708391  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    ||        ||| || | |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||       
T  39708390 ta--------agaatttaagatttagggatttgaaattcaatttgagaatattgatttttggtttagggtccaaagtgaccattttctactttcactaca 39708299  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    |||| |||||||| |||||||    
T  39708298 gtccatgtgacacatcatatg 39708278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Original strand, 7509210 - 7509426
Alignment:
Q  116 ctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   || ||| | ||  ||| | ||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  7509210 ctaactgatagtaagtatgcacagtcaaagacttaagagtacgttgatatttaatggaaggttgattttgaacaagagagtgaattaaatgatatttagg 7509309  T
Q  214 gatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgacca-ttttctactttcactttggtc 312  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  7509310 gatttgagatttaggggtttagggatttgagattcaatttggggatattgatttttggtttagggaccaaagtgactatttttctactttcactttagtc 7509409  T
Q  313 cttgtgacacctcatat 329  Q
    | | |||||| ||||||    
T  7509410 catatgacacatcatat 7509426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 331
Target Start/End: Original strand, 43461526 - 43461692
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaat 259  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||  || ||    
T  43461526 gtgtttaatggatgattgattttgaacgaaa-agagaattagatgaca----ggggtttgagatttagtgatttagggatttgagattcaattgagggat 43461620  T
Q  260 attgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgc 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  43461621 attgatttttggttcagggatcaaagtgaccattttttactttcactttagttcatgtgacacctcatatgc 43461692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 10895317 - 10895412
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtc 110  Q
    |||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10895317 gtatgctcagacctatggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaataaatgctaatggatttgctaattcattgtc 10895412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 301
Target Start/End: Original strand, 19433676 - 19433860
Alignment:
Q  116 ctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaatttgaacaaaagagagaattagatgacatttaggg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  19433676 ctaactgatagtaagtatgcaca-taagggacctaatagtaagttggtgtttaatggaagattgatt-gaacaaaatagataattaaatgacattcaggg 19433773  T
Q  215 atttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactt 301  Q
    |||| ||||||  ||| || || ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||    
T  19433774 atttcagattttgggagttggggattagagattcaatttggggatattgatttttagttcaggaaccaaaatgaccattttctactt 19433860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 329
Target Start/End: Original strand, 5929882 - 5930082
Alignment:
Q  123 atagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaat-tgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttga 220  Q
    |||||||||||||||||||||  |  ||| | ||||| ||||||||||| |||| | |||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5929882 atagtaagtatgcacagttagagatataatagtaaatgtgtgtttaatgaaagactgattttgaatgaaagagagaattaaatgacatttatggatttga 5929981  T
Q  221 gatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgac 320  Q
    ||||||  |||||        || |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||  ||||||    
T  5929982 gatttagagattt--------gagattcaatttgggaatattgatttttgatccagggatcaaagtgatcatttttaactttcactttagtctatgtgac 5930073  T
Q  321 acctcatat 329  Q
    |||||||||    
T  5930074 acctcatat 5930082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 324
Target Start/End: Original strand, 46287219 - 46287352
Alignment:
Q  187 aaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagt 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| || | |||  |||||    
T  46287219 aaaaaagagaattagatgacatttaag-atttgagatttaaggatttagggatttg--attcaatttaggaatattgatttttgatttagggactaaagt 46287315  T
Q  287 gaccattttctactttcactttggtccttgtgacacct 324  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  46287316 gacta-tttctactttcactttggtccctgggacacct 46287352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 322
Target Start/End: Original strand, 34710156 - 34710349
Alignment:
Q  123 atagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttga 220  Q
    |||||||||||| | ||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34710156 atagtaagtatgtatagtcagatacctaacagtaaattgatgtttaatgaaaaattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttaaggatttga 34710255  T
Q  221 gatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgac 320  Q
             |||||||| ||| | |||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||||||| |||  ||||||    
T  34710256 --------aatttaggattttaaaattcaatttgaggatgttgatttttgattcagggatcaaagtaacaattttttactttcactttagtctctgtgac 34710347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 322
Target Start/End: Original strand, 6680311 - 6680479
Alignment:
Q  149 taacaataaatt-gtgtttaatgg-aagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgata 245  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||| |||||| | |    
T  6680311 taacaataagttagtgtttaatgggaagattgattttgaacaaaagagagaattagatgatatttagggatttga--------gatttatgaatttaaaa 6680402  T
Q  246 ttcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  6680403 ttcaatttggggatattgatttttggtttagggactaaaatgactattttctactttcactttagtccctttgacac 6680479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46286772 - 46286690
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  46286772 atttagggatttgaaatttaatttgggaatattgatttttggttcaaggatcaaagtgactattttctactttcattttggtc 46286690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 24935513 - 24935657
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaa----ggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttca 275  Q
    |||||||||||||| |||||| | || |||||||||||  ||||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||    
T  24935513 tttgaacaaaagagggaattaaaagatatttagggattgaagattaaatttgggatttaggaatttgagattcaatttggtgatat-gatttttagttca 24935611  T
Q  276 tggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgaca 321  Q
     |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24935612 gggatcaaagtgacatttttttactttcactttagtccttgtgaca 24935657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24935045 - 24934954
Alignment:
Q  231 tttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  24935045 tttagggatttgagattcaatttaggaatattgattttcggtttagggatcaaagtgaccattttctactttcactttagttcatgtgacac 24934954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 33607271 - 33607385
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaat-tgtgtttaatggaag-attaatttgaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||  |  |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33607271 ggacctaactgatagtaagtatgcaaagtcagggacctaacagtaggtaggtgtttaatggaagaatgattttaaacaaaagagagaattagatgacatt 33607370  T
Q  210 tagggatttgagatt 224  Q
    ||||||||| |||||    
T  33607371 tagggatttaagatt 33607385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 218
Target Start/End: Original strand, 32794560 - 32794657
Alignment:
Q  123 atagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaatt-gtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggattt 218  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  32794560 atagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataagtttgtgtttaatggaaaattgattttgaacaaaagagagcattagatgacattcagggattt 32794657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Original strand, 33607368 - 33607469
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  33607368 atttagggatttaagattcaatttggggatattgatttttggtccaaggaccaaagtgaccaatttttactttcactttagtccatttgacacctcatat 33607467  T
Q  330 gc 331  Q
    ||    
T  33607468 gc 33607469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 44529270 - 44529088
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgattttt----ggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgc 333  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |     
T  44529270 atttgagattcaatttgaggatattgatttttaattggttcaggggtcaaagtgaccatttt-tactttcactttagtccttgtgacacctcatat--gt 44529174  T
Q  334 cacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatc 419  Q
    ||||||||| ||||||| |       ||||||  ||||||||||||||||  |||||  ||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  44529173 cacatcatcgcttaacaaaattatttaacgtcagggactaaagtgataacagaagtgttgagtcggagacttatttgtatttaatc 44529088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2677232 - 2677094
Alignment:
Q  188 aaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaag-----gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatca 282  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||      ||| |||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||| ||| ||    
T  2677232 aaagagggaattagatgagatttagggatttgaggattaaattcgagatctagggatttgagatttaatttagggatattgatttttagttcagggaaca 2677133  T
Q  283 aagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgaca 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2677132 aagtgatcattttctactttcactttagtccatgtgaca 2677094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8047125 - 8047010
Alignment:
Q  181 ttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggat 280  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||        | |||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||    
T  8047125 ttgaacaaaagagataattagatgatatttagtgatttgagatttagggattta--------aaattcaatttggggatattaattgtttgttcaaggat 8047034  T
Q  281 caaagtgaccattttctactttca 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  8047033 caaagtgactattttctactttca 8047010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 330
Target Start/End: Original strand, 8048653 - 8048738
Alignment:
Q  245 attcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  8048653 attcaatttgtggatattaattttcggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttagtccatgtgacacatcatatg 8048738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34707911 - 34707777
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatgga 279  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||        |||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  34707911 tttgaacaaaagagagaattatatgacatttaagaatttgaga--------tttagggatttgaaattcaacttggggatattaatttttggtccatgga 34707820  T
Q  280 tcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
     |||||||  ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||    
T  34707819 acaaagtgttcattttctattttcactttattccctgtgacac 34707777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39824471 - 39824301
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagatt--aatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaa-----ggatttaggaatttgatattcaattt 253  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||  ||||     | ||||| | |||||| |||||||||    
T  39824471 gtgtttaatggaagatttgattttgaacaaaagggtgaattaaatgagatttaaggatttgaggattaaatttagaatttatggatttgaaattcaattt 39824372  T
Q  254 gggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  39824371 gggaatattgatttat---tcaggggctaaagtgaccattttctactttcactttagtccctgtgacacttcat 39824301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 385089 - 384991
Alignment:
Q  228 ggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  385089 ggatttaagaatttgagatttaatttggga-tattgattttcgattcatagatcaaagtgacaattttctactttcactttagtcaacgtgacacctcat 384991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33061148 - 33060972
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagatt--aatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaa-------ggatttaggaatttgatattcaat 251  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||        ||||||||| |||||| |||||||    
T  33061148 gtgtttaatggaagatatgattttgaacaaaagagataattaaataacatttagggatttaagatttactatttatggatttagggatttgagattcaat 33061049  T
Q  252 ttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
     | || | |||||||||| ||| | ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  33061048 ctagggaaattgatttttagtttaaggaccaaagcgacaattttctgctttcattttatttcttgtgacacctcata 33060972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24287721 - 24287651
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24287721 atattcatttttggttcagggactaaagcgaccattttctactttcactttagtccctgtgacacctcata 24287651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44529657 - 44529541
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| |  || ||| | ||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44529657 ggacttaaatgatagtaagtatgcacagtcagggacttaaaatgaagttgatttttaatggatgattgattttgaacaaaagagataattagatgacatt 44529558  T
Q  210 tagggatttgagattta 226  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  44529557 taggggtttaagattta 44529541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Original strand, 8375505 - 8375569
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  8375505 atattgatttttggtttagggactaaagtgaccattttctactttcactttagtctctgtgacac 8375569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32793432 - 32793344
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctca 326  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||| ||||||| |||| ||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32793432 atttgagattcattttagggatattcatttttgattcagggaccaaaatgatcattttttactttcactttagtccatgtgacacctca 32793344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 425
Target Start/End: Original strand, 44530511 - 44530680
Alignment:
Q  250 atttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccacatca-tcacttaa 348  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||     | |||||||  |||||||||  |||||| ||||||||    
T  44530511 atttggggatattaatttttggttcagggactaaagtgaccagtttttactttcactt-----catgtgacatatcatatgcg--acatcaatcacttaa 44530603  T
Q  349 cagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    ||||       |||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| ||||    
T  44530604 cagaataacttaacgccaatgactaaagtgataacggaagtgcagagtcagagacttatttatatttaatcctgagt 44530680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8870220 - 8870149
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  8870220 atatcgatttttagttcagggaccaaagtaatcattttctactttcattttagtctttgtgacacctcatat 8870149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22621366 - 22621299
Alignment:
Q  260 attgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||||||||||||| |   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22621366 attgatttttggtttagataccaaagtgatcattttctactttcactttagtccttgtgacacatcat 22621299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 330115 - 330077
Alignment:
Q  111 aggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacct 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  330115 aggacctaactgatagtaagtatgcacagtcaggaacct 330077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 418
Target Start/End: Original strand, 13578332 - 13578382
Alignment:
Q  368 ggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaat 418  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  13578332 ggactaaagtgataacggaagtgcagagtcagtgacttatttgtatttaat 13578382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32793533 - 32793423
Alignment:
Q  116 ctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||  || ||  ||||| ||| | ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  32793533 ctaactgatagtaagtatgcacaatcagagacttacaaataagttggtatttaatgaaagattgattttgaacaaaatagagaattagaagacattcagg 32793434  T
Q  214 gatttgagatt 224  Q
     ||||||||||    
T  32793433 tatttgagatt 32793423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 328
Target Start/End: Original strand, 25621628 - 25621673
Alignment:
Q  283 aagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  25621628 aagtgaccattttctactttcactttagtccttgttacacttcata 25621673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48249883 - 48249823
Alignment:
Q  183 gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttga 243  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  48249883 gaacaaaagagagagttatatgacatgtaaggatttaagatttagtgatttaggaatttga 48249823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 308
Target Start/End: Original strand, 385503 - 385581
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    |||||| | |||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  385503 gatttaaggatttgagattcaacttggga-tattgactttcggttcagggactaaagtgaccattttctacttgcacttt 385581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 329
Target Start/End: Original strand, 8870909 - 8870980
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||    
T  8870909 atatcgatttttagttcagggaccaaagtaaccattttctactttcattttagtttttgtgacaccacatat 8870980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30917926 - 30917883
Alignment:
Q  285 gtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30917926 gtgacaattttcttctttcactttagtccttgtgacacctcata 30917883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 293 - 327
Target Start/End: Original strand, 2677721 - 2677755
Alignment:
Q  293 tttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2677721 tttctactttcactttagtccttgtgacacctcat 2677755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 154
Target Start/End: Original strand, 25621469 - 25621510
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  25621469 gacctaactgatagtaagtatgcacaatcaagaacctaacaa 25621510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 46286610 - 46286557
Alignment:
Q  372 taaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  46286610 taaagtgataacagaagtgcagagtcagagacttatttgtatttaatcctgagt 46286557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 48249775 - 48249727
Alignment:
Q  282 aaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||    
T  48249775 aaagtgaccattctctacttttactttagttcatgtgacacctcatatg 48249727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 28590770 - 28591183
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcag-g 113  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28590770 gtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagtg 28590869  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28590870 agctaactgatagtaagtatgcacagtcagggac-taacagtaagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaaaagagaattatatgacatttag 28590968  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattga-tttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggt 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28590969 ggatttgagatttaaggatttaagaatttgatattcaatttgggaatattgattttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggt 28591068  T
Q  312 ccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacaga-nnnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttg 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  28591069 ccctgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagattttttgtaacgtcggggactaaagtgataaaggaagtgcagagtcagggatttatttg 28591168  T
Q  411 aatttaatcccgagt 425  Q
     ||||||||| ||||    
T  28591169 tatttaatcctgagt 28591183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 40 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25590871 - 25590489
Alignment:
Q  40 atatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg-acctaactgatagtaagtatgcaca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25590871 atatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagggatctaactgatagtaagtatgcaca 25590772  T
Q  139 gttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttagga 237  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25590771 gttagggacctaacaataagatttgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttatggatttgagatttaaggatttagga 25590672  T
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccaca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25590671 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcagagaccaaagtgaccattttctactttcactttggtccctgtgacacctcatatgcgccaca 25590572  T
Q  338 tcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcc 420  Q
    ||||||||||||| |       ||||||   || ||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  25590571 tcatcacttaacaaaattttttaacgtcagagattaaagtgataacagaagtgcagaatcagagacttatttgtatttaatcc 25590489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 399
Target Start/End: Original strand, 8075492 - 8075876
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcag-g 113  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8075492 gtatgctcagacatacggggtagagatatgaattattatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagtg 8075591  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    || |||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8075592 acttaactgatggttagtatgcacagtcagga-cctaacagtaagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttag 8075690  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8075691 g-atttgagatttagggatataggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcagggaccaaagtgatcattttcgactttcactttggtc 8075789  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcag 399  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8075790 cttgtgacacctcatatgcgtcacatcatcacttaacagattttttaaacgtcagggactaaagtgataacgaaagtgcagaatcag 8075876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 32640754 - 32640340
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttac-gggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg- 113  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32640754 gtatgctcagacctacagggtagagatatgaattattatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcaggg 32640655  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32640654 acataactgatagtaagtatgcacaatcaaggacctaacagtaagttgtgtttaatggaagattaattttgaataaaagagagaattagatgacatttag 32640555  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640554 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaattttggaatattgatttttggttcaaggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtc 32640455  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaa 412  Q
    | |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |       ||||||   |||||||||||||||  ||||  ||||| |||||| |||||| |    
T  32640454 cctgtgacaccttatatgtgtcacatcatcacttaacaaatttttttaacgtcagagactaaagtgataacagaagtttagagttagggacttatttgta 32640355  T
Q  413 tttaatcccgagtta 427  Q
    |||||||| ||||||    
T  32640354 tttaatcctgagtta 32640340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 16 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40611726 - 40611389
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg- 113  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||     
T  40611726 gtatactcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgttaatggatttgccaattcattgtctggg 40611627  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40611626 acctaactgatagtaagtatgtacagtcagggacctaacactaagttgtgtttaatgaaagattaattttgaacaaaagagagaattatatgacatttag 40611527  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40611526 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcagggacccaagtgaccattttctactttcactttggtc 40611427  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaaca 350  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40611426 cctgtgacacctcatatgcgccacatcatcacctaaca 40611389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 32 - 420
Target Start/End: Original strand, 2466447 - 2466838
Alignment:
Q  32 gggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtca-ggacctaactgatagtaag 130  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2466447 gggtagagatatgaattatcatatgaatataacaataatcaacagtaatagatgctaatggattttctaattcattgtcaaggacataactgatagtaag 2466546  T
Q  131 tatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaagg 229  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2466547 tatgcacagtcagagacctaacaataagttgtgtttaatggagatttaattttgaacaaaaaagagaattagatgacatttagggatttgagatttaagg 2466646  T
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2466647 atttaagaatttgatattcaatttgggaatattgaattttggttcagggaccaaaatgactattttctactttcactttggtccatgggacacctcatat 2466746  T
Q  330 gcgccacatcatcacttaacaga-nnnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcc 420  Q
    || || |||||||||||||||||        ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||    
T  2466747 gcaccgcatcatcacttaacagattttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagagttagggacttatttttatttaatcc 2466838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 399
Target Start/End: Original strand, 14890819 - 14891190
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtca-gg 113  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14890819 gtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcaggg 14890918  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaa-tttgaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14890919 acctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacctaacaataagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagaggattagatgacatttag 14891018  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
                   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14891019 ---------------ggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttgattcagggactaaagtgaccattttctactatcactttggtc 14891103  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14891104 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacatatttttttaacgtcagagactaaagtgataacggaagtgtagagtcag 14891190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 545113 - 544693
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg- 113  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||     
T  545113 gtatactcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgttaatagatttgttaattcattgttaggg 545014  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||    
T  545013 acctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataagttgtgtttaatgaaagattaattttgaacaaaagagataattatatgatttttag 544914  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | || |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  544913 g-atttgagatttagggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaacccaaatgactattttctactttcactttgatc 544815  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaa 412  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |       || |||    |||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |||||| |    
T  544814 cctgtgacacctcatatgcgccacataatcacttaacatatttttttaatgtcagaaactaaatttataacggaagtgcagagtcagtgacttatttgta 544715  T
Q  413 tttaatcccgagttagatacct 434  Q
    |||||||| |||| ||| ||||    
T  544714 tttaatcctgagtcagagacct 544693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 33 - 352
Target Start/End: Original strand, 4593783 - 4594097
Alignment:
Q  33 ggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattca-ttgtca-ggacctaactgatagtaag 130  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  4593783 ggtagagatatgaattatcacgtgaatataacaataatcaagagtagtagatgctattggatttgttaattcatttgtcagggatctaactgatagtaag 4593882  T
Q  131 tatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaa-tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaagg 229  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        |    
T  4593883 tatgcacagtcagggacctaacattaagttatgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagataattagatgacatttagggatttga--------g 4593974  T
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4593975 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggactacgatgaccattttctactttcactttggtccctgtgacacctcatat 4594074  T
Q  330 gcgccacatcatcacttaacaga 352  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4594075 gcgccacatcatcacttaacaga 4594097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 113 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 2465037 - 2464729
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaa-tttgaacaaaagagagaattagatgacattt 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2465037 gacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgactttgaacaaaaaagataattagatgacattt 2464938  T
Q  211 agggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttgg 310  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2464937 aaggatttaagatttaaggatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttgg 2464838  T
Q  311 tccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttg 410  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  2464837 tccctgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacaaatttttttaacgtcagagactaaagtgataacgtaagtgcagagttagggacttatttg 2464738  T
Q  411 aatttaatc 419  Q
     ||||||||    
T  2464737 tatttaatc 2464729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 112 - 425
Target Start/End: Original strand, 40612413 - 40612728
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  40612413 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagatgatatt 40612512  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40612513 tagggatttaagatttagggatttagggatttgttattcaatttgggcatattgatttttggttcagggaccaaagtaaccattttctactttcactttg 40612612  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||  | | ||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |    
T  40612613 gtccttgtgacacctcatatgcgccatatcatcacttaacagatttttttaacgtcaggaattaaagtgataacggaagtgcagagtcaggaaaatatct 40612712  T
Q  410 gaatttaatcccgagt 425  Q
    | ||||||||| ||||    
T  40612713 gtatttaatcctgagt 40612728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 112 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 8074819 - 8074505
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| ||  ||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8074819 ggacctaacttatagtaagtatgcacagtcagggagctaacagtaggttggtgtttaatgtaagattgattttgaacagaagagataattagatgacatt 8074720  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    ||  ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8074719 taaagatttaagatttagggatttggggatttgatattcaatttgggcatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttg 8074620  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8074619 gtacctgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaaccga-ttttttaacgtcaggaactaaagtgataacggaagtgcagagtcagggacttattt 8074521  T
Q  410 gaatttaatcccgagt 425  Q
    | ||||||||| ||||    
T  8074520 gtatttaatcctgagt 8074505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 112 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4593223 - 4592921
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4593223 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtatgttggtgtttaatgaaagattgattttgaacaaaagagataattagatgacatt 4593124  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || | |||| ||||||| ||||||      || || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4593123 taagaatttaagatttagggattt------tttattttcaatttgggcatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttg 4593030  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4593029 gtccctgtg-cacctcatatgcgccacatcatcacttaacagatttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagagtcagggacttattt 4592931  T
Q  410 gaatttaatc 419  Q
    | ||||||||    
T  4592930 gtatttaatc 4592921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 115 - 425
Target Start/End: Original strand, 545801 - 546105
Alignment:
Q  115 cctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaatt-gtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  545801 cctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttagtgtttaatggaagattgattcagaacaaaagagataattagatgacatttaa 545900  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
     ||||| ||||||| ||||||        | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  545901 cgatttaagatttagggattt--------gttattcaatttgggcatattgatttttggttcaaggaccaaagtgactattttctactttcactttggtc 545992  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaa 412  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |       ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || |    
T  545993 cttgtgacacctcatatgcgtcatatcatcacttaacaaatttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagagtcaaggacttatctgta 546092  T
Q  413 tttaatcccgagt 425  Q
    |||||||| ||||    
T  546093 tttaatcctgagt 546105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 113 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14890137 - 14889898
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacattt 210  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||    
T  14890137 gaccaaactaatagtaagtatgcacaatcagggacctaacagcagattggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagaaataactagatgacattt 14890038  T
Q  211 agggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttgg 310  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14890037 aaggatttaagatttagggatttagcgaattgatattcaatttgggcatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctacttttactttgg 14889938  T
Q  311 tccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaaca 350  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14889937 tccctatgacacctcatatgcgtcacatcatcacttaaca 14889898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 112 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28590071 - 28589826
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaat---tagatgac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | | |||   || |||||    
T  28590071 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaaaaaaataattacatgac 28589972  T
Q  207 atttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcact 306  Q
    ||||| |||||| || ||||  |||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  28589971 atttaaggatttaaggtttagagatttagtgatttgatattcaattttggtatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctacttttact 28589872  T
Q  307 ttggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacaga 352  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28589871 ttggtccctatgacccctcatatgcgccacatcatcacttaacaga 28589826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 111 - 419
Target Start/End: Original strand, 32641496 - 32641789
Alignment:
Q  111 aggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacat 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  32641496 aggacctaactgataataagtatgcacagttagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacat 32641595  T
Q  209 ttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    |                ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  32641596 t----------------aaggatttagggatttcatattcaatttggggatattgatttttggttgagggatcaaagtaaccattttttactttca-ttt 32641678  T
Q  309 ggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatt 408  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||    
T  32641679 ggtccctgtgatacctcatatgcgccacatcatcacttaacatatttttttaacgtcagggattaaagtgataacggaagtgcagagtcagcaacttatt 32641778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9537403 - 9537191
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatgg-aagattaa-tttgaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||| | ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9537403 gacctaaatgatagtaagtatgcacagtcaaggacctaatagtaagttggtgtttaatgggaagattgactttgaacaaaagagagaattagatgacatt 9537304  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| ||||||| ||||||        || |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  9537303 tatggattttagatttagggattt--------gagattcaatttggggatattgatttttgattcagggatcaaagtgactattttctactttcacttta 9537212  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    |||  |||||||| |||||||    
T  9537211 gtcactgtgacacatcatatg 9537191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18004970 - 18004806
Alignment:
Q  164 tttaatggaagattaat-ttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatatt 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18004970 tttaatggaagattaatattgaacaagagagagaattagataacatttaaggatttgagat----ggatttagggatttgatattcaatttggggatatt 18004875  T
Q  263 gatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgc 331  Q
    || ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||    
T  18004874 gaattttgattcagggaccaaagtgactattttctactttcattttagtctctgtgacacctcacatgc 18004806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 328
Target Start/End: Original strand, 32555323 - 32555498
Alignment:
Q  159 ttgtgtttaatggaagatt--aatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgag-atttaa----ggatttaggaatttgatattcaat 251  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||| | |    
T  32555323 ttgtgtttaatggaagatttgattttgatcaaaagagagaattagatgagatttagggatttgaggattgaattcgggatttaggaatttgagatttagt 32555422  T
Q  252 ttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
     || || |||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32555423 atgagattattgattttcggttca-ggaaccaagtgacaattttctactttcactttagtccatgtgacacctcata 32555498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34173611 - 34173435
Alignment:
Q  163 gtttaatggaagatt--aatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttga-------------gatttaaggatttaggaatttgatatt 247  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||             |||||| ||||||||  |||||| |||    
T  34173611 gtttaatggaagatttgattttgtacaaaagagagaattagatgagattcagggatttgaagattaaattcaggatttagggatttagtgatttgaaatt 34173512  T
Q  248 caatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacct 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  34173511 caatttggggatattgatttttggttcagagaccaaagtgatcattttctactttcagtttagtccctgtgatacct 34173435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 249
Target Start/End: Original strand, 9537825 - 9537948
Alignment:
Q  124 tagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgag 221  Q
    ||||||||||||||||    | |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9537825 tagtaagtatgcacag----ggacctaacattaagttgatgtttaatggaagattgattttgaacaaaggagagaattagataacatttaggaatttgag 9537920  T
Q  222 atttaaggatttaggaatttgatattca 249  Q
    ||||| ||||||||| | |||| |||||    
T  9537921 atttagggatttagggaattgagattca 9537948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27720827 - 27720714
Alignment:
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaa-ttg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacattt 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27720827 acctaactgataataagtatgcacaattagggacctaatagtaaagttgatgtttaatgaaagattgattttgaacaaaagagagaattatatgatattt 27720728  T
Q  211 agggatttgagatt 224  Q
    |||||||| |||||    
T  27720727 agggatttaagatt 27720714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 291
Target Start/End: Original strand, 2314387 - 2314449
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgacca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  2314387 gatttaggaatttgatattcaatttggggatattaaattttggttcagggaccaaagtgacca 2314449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21069557 - 21069480
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21069557 atttagggatttgagattcaagttgagaatattgattttcagttcagggatcaaa-tgaccattttctactttcacttt 21069480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37072800 - 37072730
Alignment:
Q  257 aatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37072800 aatattgattttcggttcagggactaaagtgactattttctactttcattttggtccatgtgacacctcat 37072730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 327
Target Start/End: Original strand, 578625 - 578723
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  578625 gatttagaaatctgagattcaatttagggatattgattttcggttcagggaccaaagtgatcattctttactttcattttagtccatgtcacacctcat 578723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19271604 - 19271514
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttg-gttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  19271604 atttgatatttaatttggggatattgaattttcagttcagggactaaagtgacaattttctactttcactttagtccttctaacacctcat 19271514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16611934 - 16611865
Alignment:
Q  253 tgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  16611934 tggggatattgatttttggttcagggattaaagtgatcattttctacattcactttagtctttctgacac 16611865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 327
Target Start/End: Original strand, 19271660 - 19271749
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||    
T  19271660 atttgaaattcaacttggagatattgattttcggtttagggatcaaaatgatcattttctactttcactttagtccatatgatacctcat 19271749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21069584 - 21069540
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatt 224  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21069584 tttgaagaaaatagagaattagatgacatttagggatttgagatt 21069540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Original strand, 13651043 - 13651106
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgaca 321  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  13651043 atattgattttcggttcagggactaaagtgaccattttttactttcactttagtccctgtgaca 13651106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19183061 - 19182995
Alignment:
Q  368 ggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagttagatacct 434  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||| ||| ||||    
T  19183061 ggactaaagtgataacggaagtgtagagtcaggaacttatttgtatttaatcctgagtcagagacct 19182995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 161
Target Start/End: Original strand, 19186059 - 19186108
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg 161  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  19186059 ggacctaactgatagtaagtatacacagtcagggatctaacaataaattg 19186108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Original strand, 12445299 - 12445363
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12445299 atattgattttttgttcaggtatcgaagtgatcattttctacttttactttagtccatgtgacac 12445363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14881056 - 14881016
Alignment:
Q  370 actaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttg 410  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  14881056 actaaagtgataacggaagtgcagagtcagggacttatttg 14881016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18004748 - 18004697
Alignment:
Q  369 gactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcc 420  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  18004748 gactaaagtgataacggaagtgcagagtcatagacctctttgtatttaatcc 18004697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 313
Target Start/End: Original strand, 31946935 - 31946990
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 313  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31946935 atattgattttcgattcagggaccaaagtgaccattttttactttcactttagtcc 31946990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 330
Target Start/End: Original strand, 9537945 - 9538003
Alignment:
Q  272 ttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || |||||||    
T  9537945 ttcagggaccaaagtgaccattttatactttcactttagtccatgtgaaacatcatatg 9538003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30970342 - 30970296
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagattta 226  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  30970342 tttgaacaaaatagagaattgtatgacatttaggaatttgagattta 30970296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 282 - 328
Target Start/End: Original strand, 35538207 - 35538253
Alignment:
Q  282 aaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35538207 aaagtgataattttctactttcactttagtctttgtgacacctcata 35538253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 23773301 - 23773342
Alignment:
Q  116 ctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataa 157  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23773301 ctaactaatagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataa 23773342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 328
Target Start/End: Original strand, 19186114 - 19186181
Alignment:
Q  260 attgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  19186114 attgatttttgatgca-ggaccaaagtgactattttttactttcacttttgtccctgtgacacgtcata 19186181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 163
Target Start/End: Original strand, 31946881 - 31946933
Alignment:
Q  111 aggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtg 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  31946881 aggacctaactgacagtaagtatacacagtcagggatctaacagtaaattgtg 31946933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 35178462 - 35178873
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg- 113  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35178462 gtatgctcatacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcaggg 35178561  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35178562 acctaattgatagtaaatatgcacagtgagggacctaacggtaagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttag 35178661  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35178662 ggattttagatttaaggatttaagaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcaggggccaaagtgatcattttctagtttcactttggtc 35178761  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaa 412  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |    
T  35178762 cctatgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacaga-ttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagaatcagggacttatttgta 35178860  T
Q  413 tttaatcccgagt 425  Q
    |||||||| ||||    
T  35178861 tttaatcctgagt 35178873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 39 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 10406633 - 10406333
Alignment:
Q  39 tatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtca-ggacctaactgatagtaagtatgcac 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10406633 tatatgaattatcatgttaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcac 10406534  T
Q  138 agttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaa-tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttagg 236  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||    
T  10406533 agtcagggacctaacaataagttgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttag---------------ggatttagg 10406449  T
Q  237 aatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccac 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10406448 aatttgatattcaatttggaaatattgatttttggttcagagaccaaagtgactattttctactatcactttggtccctgtgacacctcatatgcgccac 10406349  T
Q  337 atcatcacttaacaga 352  Q
    ||||||||||||||||    
T  10406348 atcatcacttaacaga 10406333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 112 - 420
Target Start/End: Original strand, 32898199 - 32898509
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaat-ttgaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32898199 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgatattgaacaaaaaagataattagatgacatt 32898298  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32898299 taaggatttaaaatttagggatttagggatttgatattcaatttgaggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttg 32898398  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32898399 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagatttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagagtcagggacttattt 32898498  T
Q  410 gaatttaatcc 420  Q
    | |||||||||    
T  32898499 gtatttaatcc 32898509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 112 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35177762 - 35177449
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||| |||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||    
T  35177762 ggacctaactgatagtaagtatgcatagtcagggacctaacaataggttggtgttta-tagaagattgattttgaacaaaaaagataattaggtgacatt 35177664  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35177663 taaggatttaagatttaggaatttagggatttgatattcaatttggggatactgatttttggttcagggaccaaagtaaccattttctactttcactttg 35177564  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||       ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35177563 gtccttgtgacacat-atatgcgccacatcatcacttaacagattattttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagagtcagggacttattt 35177465  T
Q  410 gaatttaatcccgagt 425  Q
    | ||||||||| ||||    
T  35177464 gtatttaatccggagt 35177449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 117 - 420
Target Start/End: Original strand, 10407343 - 10407648
Alignment:
Q  117 taactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttaggg 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  10407343 taactgatagtaagtatgaacagtcacggacctaacaacaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagatgacatttaagg 10407442  T
Q  215 atttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcct 314  Q
    |||| || |||| |||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10407443 atttaagctttagggatttaacactttgatattcaatttgggcatattgatttttggttcagagactaaagtaaccattttctactttcactttggtcct 10407542  T
Q  315 tgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatt 414  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||  ||    
T  10407543 tatgacacctcatatgcgtcacatcatcacttaacagatttttttaacgtcaggaactaaagtgataacggaagtgcaaagttatggacttatttgtgtt 10407642  T
Q  415 taatcc 420  Q
    ||||||    
T  10407643 taatcc 10407648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 420
Target Start/End: Original strand, 1952739 - 1953034
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgt-gtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1952739 ggacctaactgatagtaaatatgcacagtcag-------acaataggttgttgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagatgacatt 1952831  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| ||||||| ||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1952832 taaggatttaagatttagggattt--------gatattcaatttgggcatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttg 1952923  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| |||||    
T  1952924 gtccctatgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagatttatttaacgtcagagactaaagtgataacggaagtacagagtcatagacttattt 1953023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 322
Target Start/End: Original strand, 28619288 - 28619498
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaatttg-aacaaaagagagaattagatgacattta 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||||    
T  28619288 gacctaaatgatagtaagtatgcacagttagagacctaatagtaagttgtgtttaatgaaagattgatttttaataaaaaagagaattagatgacattta 28619387  T
Q  212 gggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggt 311  Q
    || |||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| ||    
T  28619388 ggaatttgcaatttagggatttagggatttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcatggattaaagtgatcattttctactttcgatttagt 28619487  T
Q  312 ccttgtgacac 322  Q
    || ||||||||    
T  28619488 ccatgtgacac 28619498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 116 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5737226 - 5737011
Alignment:
Q  116 ctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagg 213  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5737226 ctaattgatagtaagta-gtacagtcagggacctaacaataagttggtgtttaatggaagattaattttgaaaaaaagggagaattagatgacatttagg 5737128  T
Q  214 gatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaata-ttgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    ||||| |||||||  |||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  | |||||||||| ||||| |||    
T  5737127 gatttcagatttagagatttaaggatttgagattcaatttggggatatttgatttttggatcagggaccaaagtga-taatttctacttttactttagtc 5737029  T
Q  313 cttgtgacacctcatatg 330  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5737028 cttgtgacacctcatatg 5737011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 112 - 322
Target Start/End: Original strand, 5965176 - 5965388
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  5965176 ggacctaattgatagtaagtatgcacagtcatggacttaacactaagttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagatgacact 5965275  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||     
T  5965276 tagggatttaagatttaggaatttagagatttgaaattcaatttgtggatattgatttttacttcatagaccaaaatgacaattttctactttcacttta 5965375  T
Q  310 gtccttgtgacac 322  Q
     || |||||||||    
T  5965376 ctctttgtgacac 5965388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 330
Target Start/End: Original strand, 5737779 - 5737977
Alignment:
Q  124 tagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgag 221  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  || | ||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  5737779 tagtaagtatgcacaattagaaactaaatagtaagttgatgtttaatggaatattgattttgaacaaaagagataattagatgacatttag--atttgag 5737876  T
Q  222 atttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgaca 321  Q
    ||||| ||||||        || |||||||||||| ||||||||||||| || |  || ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||    
T  5737877 atttagggattt--------gagattcaatttggggatattgatttttgatttagagaccaaagtgaccattttttacttttactttagtccatgtgaca 5737968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 229 - 328
Target Start/End: Original strand, 39138517 - 39138616
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39138517 gatttagggatttgagattcaattcggggatattgattttcggtacaagaatcaaagtgaccattttctactttcactttagtccttgtgacacctcata 39138616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 330
Target Start/End: Original strand, 41122616 - 41122716
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||    
T  41122616 atttaggaatttgagattcaatttggagatattgatttttggttcagggatcaaagtgacgattttctattttcactttagtcaatgtgacacttcatat 41122715  T
Q  330 g 330  Q
    |    
T  41122716 g 41122716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41121366 - 41121275
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  41121366 atttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcaaggaccaaagtgacaattttctactttcactttagcccttgttacacctcatat 41121275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30134843 - 30134743
Alignment:
Q  222 atttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgaca 321  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  30134843 atttaaggatttaaggatttgaaattcaatttgtgaatattgatttttggttaaaggaccaaagtgacaattttctactttcactttagtctctgtgaca 30134744  T
Q  322 c 322  Q
    |    
T  30134743 c 30134743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 328
Target Start/End: Original strand, 45476415 - 45476515
Alignment:
Q  228 ggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  45476415 ggatttagagatttgagatttaatttgggaatattgatttttggttcagggactaaagtgaccattttctacttttactttggtccatatgacacatcat 45476514  T
Q  328 a 328  Q
    |    
T  45476515 a 45476515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Original strand, 32564227 - 32564463
Alignment:
Q  105 attgtcag-gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattag 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||     | || ||||||| ||| | |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  32564227 attgtcagagacctaactgatagtaaatattcacagtccaagatcttacaataagttggtatttaatggaagaatgattttgaacaaaagagagaattag 32564326  T
Q  202 atgacatt--------tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccatt 293  Q
    |||| |||        ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||  | |||  ||| ||| ||||    
T  32564327 atgaaattgaaggatttagcgatttgagatttagggatttaggaatttgagattcaatacggggatattcatttttggtcaagggactaaaatgatcatt 32564426  T
Q  294 ttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  32564427 ttctactatcactttagtccatgtgacacatcatatg 32564463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45476412 - 45476336
Alignment:
Q  249 aatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctc 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45476412 aatttaggaatattgatttttggttcagggaccaaagtgacaattttctactttcactttggtctctgtgacacctc 45476336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32563933 - 32563828
Alignment:
Q  121 tgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaatt-gtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggattt 218  Q
    ||||| |||||||||||| | | | | |||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32563933 tgatattaagtatgcacaatcatggatctaacagtaagttagtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagagaattagatggcatttagggattt 32563834  T
Q  219 gagatt 224  Q
    ||||||    
T  32563833 gagatt 32563828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33315107 - 33315029
Alignment:
Q  250 atttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||| ||||| |||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33315107 atttggggatattaattttcaattcacggaccaaagtgactattttctactttcactttggtccatgtgacacctcata 33315029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13144594 - 13144531
Alignment:
Q  245 attcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13144594 attcaatttggaaatattgattttcgattaagggatcaaagtgacaattttctactttcacttt 13144531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32563845 - 32563767
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32563845 atttagggatttgagattcaatttgagggtattgattattggtttaaggattaaagtgaccattttctactttcgcttt 32563767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Original strand, 41754688 - 41754758
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  41754688 atattgattttcgattcatggaccaaagtgaccattttttactttcactttaatccctgtgacacatcata 41754758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8569649 - 8569560
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  8569649 atttgagattcaatttgtggatattgatttttagttcagggatcaaaatgataattttttcctttcattttagtccatgtgacacctcat 8569560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 328
Target Start/End: Original strand, 28006471 - 28006548
Alignment:
Q  251 tttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| || |||||    
T  28006471 tttggggatattgatttttagttcagtgaccaaagtgaccactttctattttcactttagtccttgtgatacatcata 28006548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 328
Target Start/End: Original strand, 28063774 - 28063851
Alignment:
Q  251 tttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| || |||||    
T  28063774 tttggggatattgatttttagttcagtgaccaaagtgaccactttctattttcactttagtccttgtgatacatcata 28063851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2552256 - 2552186
Alignment:
Q  256 gaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    ||||||||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2552256 gaatattgattttcggttcagaaaccaaagtgacaattttctactttcactttagtcc-tgtgacacctcat 2552186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 31075173 - 31075239
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctc 325  Q
    |||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31075173 atattgattttcagttcagggaccaaagtgaccactttctactttca-tttagtccttgtgacacctc 31075239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41121423 - 41121361
Alignment:
Q  159 ttgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttga 220  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  41121423 ttgtgtttaatgaaagattgattttgaacaaaagagagaattagatggcatttaaagatttga 41121361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Original strand, 41122527 - 41122633
Alignment:
Q  120 ctgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaatt-gtgtttaatggaagatt-aatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||  || |||||||| |||    
T  41122527 ctgatagtaagtatgcacaatcaagggcctaacaataagtttgtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagacgaaattatgtgtcatttaggaatt 41122626  T
Q  218 tgagatt 224  Q
    |||||||    
T  41122627 tgagatt 41122633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 153
Target Start/End: Original strand, 28526301 - 28526342
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28526301 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaaca 28526342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28005734 - 28005694
Alignment:
Q  111 aggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaa 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28005734 aggacctaactgattgtaagtatgcacagttagggacctaa 28005694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28063037 - 28062997
Alignment:
Q  111 aggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaa 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28063037 aggacctaactgattgtaagtatgcacagttagggacctaa 28062997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28525163 - 28525120
Alignment:
Q  116 ctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  28525163 ctaactgatagtaagtatgcacagttagagacctaacaacaaat 28525120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Original strand, 9626343 - 9626413
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||||||  || |||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  9626343 atattaattttcggttcagggattaaagtggtcaatttctactttcactttagttcatgtgacacctcata 9626413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 328
Target Start/End: Original strand, 12637647 - 12637713
Alignment:
Q  262 tgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  12637647 tgattttcagttcagggaccaaagtgatcatattctactttcactttagtccatgtgacacatcata 12637713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28524999 - 28524929
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||| |||||    
T  28524999 atattgattttcggttcacggaccaaaatgacaattttttactttcactttagtccatctgacacttcata 28524929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36032919 - 36032877
Alignment:
Q  286 tgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  36032919 tgacaattttctactttcactttcgtccctgtgacacctcata 36032877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41754209 - 41754139
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||| |||||    
T  41754209 atattgattttcgattcagggaccaaagtgactattttttactttcactttagtccctatgacacgtcata 41754139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 153
Target Start/End: Original strand, 28006330 - 28006371
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  28006330 ggacctaactgatagtaagtatgcacaatcagggacctaaca 28006371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 153
Target Start/End: Original strand, 28063633 - 28063674
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  28063633 ggacctaactgatagtaagtatgcacaatcagggacctaaca 28063674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28619099 - 28619070
Alignment:
Q  369 gactaaagtgataacgaaagtgcagagtca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28619099 gactaaagtgataacgaaagtgcagagtca 28619070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36033074 - 36033037
Alignment:
Q  117 taactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36033074 taactgatagtaagtgtgcacagtcaggaacctaacaa 36033037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 45476272 - 45476223
Alignment:
Q  369 gactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaat 418  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  45476272 gactaaagtgataacagaagtgcagagtcagagacttatttgtatttaat 45476223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 425
Target Start/End: Original strand, 5965455 - 5965511
Alignment:
Q  369 gactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | |||| ||||||||| ||||    
T  5965455 gactaaagtgataacggaagtgcagagtcaaagacttctttgtatttaatcctgagt 5965511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 31091184 - 31091596
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg- 113  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31091184 gtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcaggg 31091283  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  31091284 acctaactgatagtaagtatgcgcagtcagagatctaacagtaagttgtgtttaatgaatgattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttac 31091383  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31091384 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatctcggaatattgatttttggttcaaagaccaaagtgaccattttctactttcactttggtc 31091483  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaa 412  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |       ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  31091484 tctgtgacacctcatatgcaccacatcatcacttaacatatttttttaacgtcagagactaaagtgataacggaagtgcagagtcagggacttatttgta 31091583  T
Q  413 tttaatcccgagt 425  Q
    |||||||| ||||    
T  31091584 tttaatcctgagt 31091596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 352
Target Start/End: Original strand, 2911145 - 2911483
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcag-g 113  Q
    ||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2911145 gtatgttcagacctacggggttgagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagag 2911244  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2911245 acctaactgata-taagtatgcacagtcagagacctaacagtaagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttag 2911343  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  2911344 gaatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttggaaatattgatttttggttaagagaccaaagtgacaattttctactttcactttggtt 2911443  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacaga 352  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2911444 cctatgacacctcatatgcgccatatcatcacttaacaga 2911483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 336
Target Start/End: Original strand, 24459111 - 24459434
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcag-g 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  24459111 gtatgctcagacttacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagaagctggtggatatgctaattcattgtcagag 24459210  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24459211 acctaactgatagtaagtatgcgcagttagggacctaacagtaagttgtgtttaatgaaagattaattttgaacaaaagagataattagacgacatttag 24459310  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24459311 ggatttcagatttaaggatttacgaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcagggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 24459410  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccac 336  Q
    | | ||||||||||||||| ||||    
T  24459411 cctatgacacctcatatgcaccac 24459434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39015471 - 39015059
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacg-ggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg- 113  Q
    |||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  39015471 gtatgctcagacctacatggaagagatatgaattatcatgtgaatataacaacaatcaagagtaatagatgataatggatttgttaattcattgtcaggg 39015372  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaatttgaa-caaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39015371 acctaaccaatagtaggtatgcacagtcactgacctaacaataagttgtgtttaatggaagattaattttaaacaaaagagagaattagatgacatttag 39015272  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39015271 ggatttgagatttagggattttggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcaaggaccaaactgaccattttctactttcactttggtc 39015172  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaa 412  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |       |||||     |||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  39015171 cctgtgacacctcatatgcaccacatcatcacttaacaaatatttttaacgttagaaactaaaatgataatgaaagtgcagagtcaaagacgtatttgta 39015072  T
Q  413 tttaatcccgagt 425  Q
    |||||||| ||||    
T  39015071 tttaatcctgagt 39015059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Original strand, 39999991 - 40000398
Alignment:
Q  15 agtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg 113  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  39999991 agtatgctcagatctacggggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatactaatggattttttaattcattgtcagg 40000090  T
Q  114 -acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacattta 211  Q
     |||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||| | || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40000091 gacctaactcatagtaagtatacatagtcagggaccgatcagtaagttgtgtttaatgaaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacactta 40000190  T
Q  212 gggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggt 311  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40000191 tggatttgagatttaaggatttagaaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcaaggaccaaagtgatcattttctactttcactttggt 40000290  T
Q  312 ccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttga 411  Q
    || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||       ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||     
T  40000291 ccctctgacacctcatatgcacca-atcatcacttaacagattttcttaacgtcagggaataaagtgataacggaagtgcagggttagagacttatttgt 40000389  T
Q  412 atttaatcc 420  Q
    |||||||||    
T  40000390 atttaatcc 40000398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 240
Target Start/End: Original strand, 32765938 - 32766164
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacgggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtca-gga 114  Q
    |||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32765938 gtatactcagacctgcgggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatcgatttgctaattcattgtcaggga 32766037  T
Q  115 cctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaa-tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32766038 cctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacaataagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagaaaattaaatgacatttagg 32766137  T
Q  214 gatttgagatttaaggatttaggaatt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  32766138 gatttgagatttaaggatttaggaatt 32766164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 112 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 32765306 - 32764983
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32765306 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttgctgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacatt 32765207  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  32765206 taaggatttaaaatttagggatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagggaccaaagcgaccattttctactttcacttta 32765107  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32765106 gtccctatgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacata-ttttttaacgtcagggattaaagtgataacggaagtgcagagtcagggacttattt 32765008  T
Q  410 gaatttaatcccgagttagatacct 434  Q
    | ||||||||| |||| ||| ||||    
T  32765007 gtatttaatcctgagtcagagacct 32764983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 112 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2910469 - 2910154
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||| ||||||||| |||||| |||| |||||||  ||| || |||||||||||    
T  2910469 ggacctaactgatattaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatgtaagattgattttgaacaaacaagataactagatgacatt 2910370  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  2910369 taaggatttgaaatttacggatttagggattcgatattcaatttggggatattgatttttggttcatggaccaaagtgatcattttcgactttcattttg 2910270  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||  |||||||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||    
T  2910269 gtccttgtgatacctcatatgcgccacatcatcacttaacagatttttttaacgtcagggactaaagtgacaaaggaagtgcagagtcagagacttattt 2910170  T
Q  410 gaatttaatcccgagt 425  Q
    | ||||||||||||||    
T  2910169 gtatttaatcccgagt 2910154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 114 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14704363 - 14704060
Alignment:
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacattta 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||    
T  14704363 acctaactgatagtaagtatgcacagtagggaac-taacaataggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaatataattagatgacattta 14704265  T
Q  212 gggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggt 311  Q
     |||||| ||||||| ||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14704264 aggatttaagatttagggattt--------gatattcaatttggggatattgatttttggttcatggaccaaagtgactattttctactttcactttggt 14704173  T
Q  312 ccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttga 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||     
T  14704172 ccctgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacata-ttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagagtgagggacttatttgt 14704074  T
Q  412 atttaatcccgagt 425  Q
    ||||||||| ||||    
T  14704073 atttaatcctgagt 14704060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 112 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 24458429 - 24458121
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24458429 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtaagagacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacatt 24458330  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24458329 taaggatttaaaatttagggatttagggatctgatattcaatttgaggatattgatttttgattgagggaccaaagtgaccattttctactttcactttg 24458230  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||       |||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||    
T  24458229 gtccctgtgacacctcatatgcgccacattatcacttaatagatttttttaacgttagagactaaagtgataacgaaagtgtagagtcagaaacttattt 24458130  T
Q  410 gaatttaat 418  Q
    | |||||||    
T  24458129 gtatttaat 24458121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 112 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31090526 - 31090218
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  31090526 ggacctaaatgatagtaagtatgcacagtcaggaacctaatagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagggataattagatgacatt 31090427  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| |  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31090426 tatggatttaaattttagggatttaaggatttgatattcaatttggggatattaatttttggttcagggaccaaagcggccattttctactttcactttg 31090327  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||| ||||       ||||||| ||| ||||||||||||| |       ||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  31090326 gtccctgtg-------atatgcgtcacctcatcacttaacatatttttttaacgtcagggactaaaatcataacggaagtgcagagtcagagacttattt 31090234  T
Q  410 gaatttaatcccgagt 425  Q
      ||||||||| ||||    
T  31090233 atatttaatcctgagt 31090218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 113 - 396
Target Start/End: Original strand, 39016149 - 39016423
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaatttgaacaaaagagagaattagatgacattta 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||  ||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39016149 gacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaac--taggttggtgtttaatggaagattgttttgaacaaaatagataattagatgacattta 39016246  T
Q  212 gggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggt 311  Q
     |||||| ||||||| ||||||         |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39016247 aggatttaagatttagggatttc--------atattcaatttgggcatattgatttttggttcagggaccaaagtgacaattttctactttcactttggt 39016338  T
Q  312 ccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagt 396  Q
    || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |       ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39016339 ccatgtgacacctcatatgcgtaatatcatcacttaacatatttttttaacgtcagagactaaagtgataacggaagtgcagagt 39016423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 425
Target Start/End: Original strand, 17330043 - 17330299
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatgga 279  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||    
T  17330043 tttgaacaaaagagagaattatatgacattcaggggtttgaaatttagggatttaatgatttgagattcaatttagggatattgattttgggttcaggga 17330142  T
Q  280 tcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata-----------tgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtg 368  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||           || | |||||||||||||||||||       |||||| ||    
T  17330143 ccaaagtgaccattttttactttcactttagtctctgtgacacctcatatgtcatatcactgtgtcacatcatcacttaacagaataacttaacgtcatg 17330242  T
Q  369 gactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  17330243 gactaaagtgataacggaaatgcagagtcagagacttatttgtatttaatcctgagt 17330299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 162 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 7073969 - 7073695
Alignment:
Q  162 tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaata 260  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  7073969 tgtttaatggatgattgattttgaacgaaagagagaattagatgatatttagggatttgagatatagtgatttaaggatttgagattcaatttaggaata 7073870  T
Q  261 ttg-atttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgc-----------gccacatcatcacttaa 348  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| || |||| |||| |||| |||||||||| ||||||           | |||||||||||||||    
T  7073869 ttgaatttttggttcagggaccaaagtgatcattttttattttcgctttagtccctgtgacacctaatatgccatgtaactgtgtcacatcatcacttaa 7073770  T
Q  349 cagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccga 423  Q
    ||||       ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  7073769 cagaataacttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagaatcagagacttatttgtatttaatcccga 7073695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 286 - 425
Target Start/End: Original strand, 32766168 - 32766308
Alignment:
Q  286 tgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacaga-nnnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  |||||||||||||||||    
T  32766168 tgaccattttctactttcactttggtctctgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagattttttttaacgtcaaggactaaagtgataacg 32766267  T
Q  385 aaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  32766268 gaagtgcagagtcagggacttatttgtatttaatcctgagt 32766308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 230 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43380836 - 43380736
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  43380836 atttaggaatttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttagttcatgtgacacctcatat 43380737  T
Q  330 g 330  Q
    |    
T  43380736 g 43380736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7412363 - 7412260
Alignment:
Q  228 ggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7412363 ggatttagggatttgagattcaatttagggatattgttttttggttgagggaacaaagtgaccattttctattttcactttagtccttgtgacacatcat 7412264  T
Q  328 atgc 331  Q
    ||||    
T  7412263 atgc 7412260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21732362 - 21732281
Alignment:
Q  232 ttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 313  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21732362 ttagggatttgagattcaatttggggatattaatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttagtcc 21732281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 328
Target Start/End: Original strand, 21733627 - 21733723
Alignment:
Q  232 ttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||| |||||    
T  21733627 ttagggatttgagattcaatttgggaatattgattttcggttcagagaccaaagtgaccattttttactttcactttagtcatcgtgacacttcata 21733723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12010300 - 12010225
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12010300 atttgatattcaatttggggatattgatttttggttcatataccaaaatgaccattttctactttcactttagtcc 12010225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Original strand, 14705032 - 14705097
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaat 80  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14705032 gtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaat 14705097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Original strand, 43381045 - 43381146
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||| ||| |||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43381045 atttagggatttgagattcaatttagggatattgattttgtgttcagggaccaaaatgactattttctatttttactttagtccttgtgacacctcatat 43381144  T
Q  330 gc 331  Q
    ||    
T  43381145 gc 43381146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 322
Target Start/End: Original strand, 5914858 - 5914978
Alignment:
Q  202 atgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactt 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||    
T  5914858 atgacatttaggaatttgagatttagggatttagagattttagattcaagctggggatattgatttttggttcagggactaaagtgacaattttttactt 5914957  T
Q  302 tcactttggtccttgtgacac 322  Q
    ||| ||| |||  ||||||||    
T  5914958 tcattttagtctctgtgacac 5914978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 327
Target Start/End: Original strand, 31443084 - 31443196
Alignment:
Q  215 atttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcct 314  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| | | |||| |||| |||||||||||||||||| |||      
T  31443084 atttgggatatagggatttaggaatttgagatttaatttggagatattgattttcggttcaggaaccaaaatgacaattttctactttcactttagtcac 31443183  T
Q  315 tgtgacacctcat 327  Q
    |||||||||||||    
T  31443184 tgtgacacctcat 31443196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39999197 - 39999081
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||| |||||  |    
T  39999197 gatttagggatttgatattcaattgg---atattgattttttgttcagggatcaaagtgacaattttctactttcactctgatccctatgatacctc--a 39999103  T
Q  329 tgcgccacatcatcacttaaca 350  Q
    || | |||||||||||||||||    
T  39999102 tgtgtcacatcatcacttaaca 39999081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Original strand, 17466683 - 17466783
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  17466683 atttagggatttgaaatttaatttagggatattaatttttggtt-agggatcaaattgaccattttttactttcactttagtgcgtgtgacacctcatat 17466781  T
Q  330 gc 331  Q
    ||    
T  17466782 gc 17466783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33162029 - 33161936
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgc 331  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33162029 atttgagattcgatttggggatatcgatttttggttcagggactaaagtgatgattttctactttcattttagtctttgtgacacctcatatgc 33161936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 328
Target Start/End: Original strand, 34037544 - 34037625
Alignment:
Q  247 tcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||    
T  34037544 tcaatttgaggatattgatttttggttcaggaatcaaagtgactattttctactgtcactttagtctgtgtgacacctcata 34037625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 330
Target Start/End: Original strand, 39256768 - 39256975
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaa-tttgaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||| ||| ||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |       
T  39256768 ggacctaactaatagtaagtatgcacaatcagcgacctaacagtaagttggtttttaatggaagattgactttgaacaaaagagagaattagatgtc--- 39256864  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttca--tggatcaaagtgaccattttctactttcactt 307  Q
                || |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||   | | |||||||||||||||||| |||||| |    
T  39256865 ------------atataaggatttagggatttgagattcaattggggaatattaatttttggttcaggagaaccaaagtgaccattttctaatttcacat 39256952  T
Q  308 tggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    | || | | |||||| |||||||    
T  39256953 tagttcatatgacacatcatatg 39256975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 268
Target Start/End: Original strand, 8420749 - 8420842
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttga-gatttaa----ggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttt 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8420749 tttgaacaaaagagggaattagatgaaatttagggattttatgattaaattcgggatttaggaatttgagattcaatttcggaatattgatttt 8420842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33439504 - 33439370
Alignment:
Q  215 atttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcct 314  Q
    ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||     
T  33439504 atttgggatttagggatgtagggatttgacattcaatttgg-aatattgattttcagttcaggaatctaagagaccattttctactttaactttagtcca 33439406  T
Q  315 tgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaaca 350  Q
    | ||| |||||||   |||||| |||||| ||||||    
T  33439405 tatgatacctcatgcacgccacctcatcagttaaca 33439370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37607343 - 37607273
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37607343 atattgatttttggttcagagaccaaagtgactattttctacgttcactttagtccttgtgacatctcata 37607273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 220
Target Start/End: Original strand, 38984747 - 38984857
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaatt-gtgtttaatg-gaaga-ttaatttgaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |   | |||||||||| || ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38984747 gacctaactgataataagtatgcacaatcaaagatctaacaataagttggtgtttaatgaaaagatttattttgaacaaaagagagaattagatgacatt 38984846  T
Q  210 tagggatttga 220  Q
    || ||||||||    
T  38984847 tacggatttga 38984857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11985930 - 11985861
Alignment:
Q  239 tttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11985930 tttgagattcaatttggaaatattaattttcggttcagggatcaaagtgacttttttctactttcacttt 11985861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 331
Target Start/End: Original strand, 33163320 - 33163413
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgc 331  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||   ||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  33163320 atttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcagggaccaaaacaacatttttctactttgactttggtgcctgtgacaccttatatgc 33163413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31442602 - 31442503
Alignment:
Q  228 ggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31442602 ggatatagggatttgagattcaatttagggatattgattttcggttcagggaccaatgtgttcatttttgactttcactttagtccttatgacacctcat 31442503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Original strand, 14887380 - 14887450
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14887380 atattgatttttaattcagggaccatattgaccattttctactttcactttagtccctgtgacacctcata 14887450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 425
Target Start/End: Original strand, 17466806 - 17466897
Alignment:
Q  334 cacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    |||||||||||||||||||       |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||    
T  17466806 cacatcatcacttaacagaattatttaacgtcttagactaaagtgataacggaagtgcagagtcagagacttctttgtatttaatcctgagt 17466897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18675324 - 18675255
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  18675324 atattaatttttgattcaaggatcaaagtgacaattttctactttgactttagtcc-tgtgacacctcata 18675255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18675493 - 18675452
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18675493 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcaggaacctaaca 18675452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33162064 - 33162020
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatt 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33162064 tttgaacaaaagagataattagatgacatttaaggatttgagatt 33162020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 328
Target Start/End: Original strand, 12746102 - 12746153
Alignment:
Q  277 ggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12746102 ggatcaaaatgatcattttctactttcactttagtccctgtgacacctcata 12746153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12003845 - 12003739
Alignment:
Q  221 gatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgac 320  Q
    |||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |  || |||| | || |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  12003845 gatttaggaatttagagatttgatattcaatttggggatattggttttcggttgagagaccaaaattactattttctattttcactttagtccctgtgac 12003746  T
Q  321 acctcat 327  Q
    | |||||    
T  12003745 atctcat 12003739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Original strand, 18676705 - 18676755
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18676705 atattgattttttgttcagggaccaaagtgaccattttctactttcgcttt 18676755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26585316 - 26585247
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26585316 atatttattttcggttcagggaccaaagtgaccattt-ctattttcactttagtccctgtgacacctcata 26585247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31442691 - 31442614
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagatt--aatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttagg 236  Q
    ||||||||||||| |||  | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31442691 gtgtttaatggaaaatttgattttaaacaaaagaggaaattagatgagatttagggatttgagatttaggaatttagg 31442614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17466310 - 17466209
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||  ||||| |||||| ||| | | | |||||||| ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  17466310 atttagaaatttaaaattcaaattggagatattaatttttagtttaggaaccaaagtgatcattttctacttttactttaatccatgtgacacctcatat 17466211  T
Q  330 gc 331  Q
    ||    
T  17466210 gc 17466209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Original strand, 12004781 - 12004841
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatt 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  12004781 tttgaacaaaagagataattagatgagatttatgaatttgatatttagggattaaggaatt 12004841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12396246 - 12396162
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    |||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| |  ||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  12396246 atttgagattctaattggggatattgatttttggtttagtgactaaagtgactattttctactttcattttagtccatgtgacac 12396162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 327
Target Start/End: Original strand, 28864663 - 28864762
Alignment:
Q  228 ggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatc-aaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctca 326  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||   ||| |||| | ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  28864663 ggatttagggatttgaaattcaacttgggaatattgattttcaattc-tggaactaaaatgatcattttctattttcactttagtccatatgacacctca 28864761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 425
Target Start/End: Original strand, 38985002 - 38985058
Alignment:
Q  369 gactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||    
T  38985002 gactaaagtgataacggaagtgcagagtcaaggacttctttgtatttaattccgagt 38985058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 224
Target Start/End: Original strand, 43381020 - 43381062
Alignment:
Q  181 ttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatt 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43381020 ttgaacaaaagagaga-ttagatgtcatttagggatttgagatt 43381062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 149
Target Start/End: Original strand, 31442915 - 31442953
Alignment:
Q  111 aggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacct 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31442915 aggacctaactgatagtaagtaagcacagttagggacct 31442953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 419
Target Start/End: Original strand, 21733785 - 21733834
Alignment:
Q  370 actaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatc 419  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  21733785 actaaagtgatgacggaagtgcagagtcagagacttatttgtatttaatc 21733834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 427
Target Start/End: Original strand, 34037687 - 34037744
Alignment:
Q  370 actaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagtta 427  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  34037687 actaaagtgataacagaagtgcagagtcatagacttatttgtatttaatcctgagtta 34037744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 425
Target Start/End: Original strand, 34582682 - 34582739
Alignment:
Q  368 ggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  34582682 ggactaaagtgataacggaagtgcacattcagggactactttgtatttaatcccgagt 34582739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 38853994 - 38853926
Alignment:
Q  260 attgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||| | ||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  38853994 attgattttcggttcaaggaccaaggcgactattatctactttcaatttagtccctgtgacacctcata 38853926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 38855028 - 38854960
Alignment:
Q  260 attgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  38855028 attgattttcggttcaaggaccaaggtgactattatctactttcaatttagcccctgtgacacctcata 38854960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 420
Target Start/End: Original strand, 52440217 - 52440623
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtca-gg 113  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52440217 gtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagaagctaatggatttgctaattcattgtcaagg 52440316  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaatttgaa-caaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  52440317 acctaactgatagtaagtatgcgcagttggggacctaacactaagttgtgtttaatgaaagattaattttaaacaaaagagagaattagatgacatttag 52440416  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  52440417 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatacttatttttggttcagggaccaaagtgactattttctactttcactttggcc 52440516  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaa 412  Q
    | |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |       ||||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||  |    
T  52440517 cctgtgacacctcagatgcactacatcatcacttaacacatttttttaacgtc-aagactaaagtgataatggaagtgcagagtcagagacttatttata 52440615  T
Q  413 tttaatcc 420  Q
    ||||||||    
T  52440616 tttaatcc 52440623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 32 - 425
Target Start/End: Original strand, 9340714 - 9341094
Alignment:
Q  32 gggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtca-ggacctaactgatagtaag 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9340714 gggtagagatatgaattatcatgtgaatataagaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagggacctaactgatagtaag 9340813  T
Q  131 tatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaa-tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaagg 229  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||               ||    
T  9340814 tatgcacagtcagggacctaacagtaagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagaaaattagatgacatttag---------------gg 9340898  T
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9340899 atttaggaatttgatattcattttgggaatattgaattttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtccctgtgacacctcatat 9340998  T
Q  330 gcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    ||||||||||||||||||| |||       ||||||   |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  9340999 gcgccacatcatcacttaatagatttttttaacgtcagagactaaagtgataacagaagtgcaaagtcagagacttatttgtatttaatcctgagt 9341094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 42 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 32664941 - 32664587
Alignment:
Q  42 atgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg-acctaactgatagtaagtatgcacagt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  32664941 atgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttcctaattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacaat 32664842  T
Q  141 taggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaatttgaa-caaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaat 239  Q
     ||| |||||||| |||   |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32664841 cagggacctaacagtaagccgtgtttaatgaaagattaattttaaacaaaagagagaattaaatcagatttagggatttgagatttaaggatttaggaat 32664742  T
Q  240 ttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccacatc 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32664741 ttgatattcaatttgggaatattgatttttgattca-agaccaaagtgactattttctactttcattttggtccctttgacacctcatatgcgccacatc 32664643  T
Q  340 atcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagt 396  Q
    ||||||||||| |       ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32664642 atcacttaaca-attttcttaacgtcaaggactaaagtgataacggaagtgcagagt 32664587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 7945231 - 7945623
Alignment:
Q  16 gtatgctcagacttacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtca-gg 113  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7945231 gtatgctcagacttacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttcctaattcattgtcaggg 7945330  T
Q  114 acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaa-tttgaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7945331 acctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacaataagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattatatgacatttag 7945430  T
Q  213 ggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 312  Q
    ||||||||||||||||                    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7945431 ggatttgagatttaag--------------------aatttgggaatattgatttttggtttagggaccaaagtgaccattttctactttcactttgatc 7945510  T
Q  313 cttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaa 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |       ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| |    
T  7945511 cttgtgacacctcatatgtgccacatcatcacttagcatatttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcatagtcagagacttatttgta 7945610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 419
Target Start/End: Original strand, 32665531 - 32665833
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||  ||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32665531 ggacctaactgatagtaagtgtgtgcagtcagggacctaacagtaggttggtgttgaatagaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacatt 32665630  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttg-gttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    || |||||| ||||||| ||||||        ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32665631 taaggatttaagatttagggattt--------gatattcaatttggggatattgatttttgtgttcagggaccaaagtgaccattttctactttcacttt 32665722  T
Q  309 ggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  32665723 ggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagatttttgtaacgccagggactaaagtgataacggaagtgcagagtcaaagacttatt 32665822  T
Q  409 tgaatttaatc 419  Q
    || ||||||||    
T  32665823 tgtatttaatc 32665833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 116 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 52439826 - 52439613
Alignment:
Q  116 ctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagg 213  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  52439826 ctaattgatagtaagtatgcgcagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacatttaag 52439727  T
Q  214 gatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 313  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52439726 gatttaaaatttagggatttaggaatttgatattcaatttgaggatattgatttttggtttagggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 52439627  T
Q  314 ttgtgacacctcat 327  Q
    ||||||||| ||||    
T  52439626 ttgtgacacatcat 52439613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 229 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9339896 - 9339700
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9339896 gatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagagaccaaagtgaccattttctactttcactttggtccctgtgacatctcata 9339797  T
Q  329 tgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||       ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  9339796 tgcgccacatcatcacttaacagatttttttaacgtcagggactaaagtgataacggaagtgcagagtcggggatttatttgtatttaatcctgagt 9339700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 112 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6612799 - 6612580
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaatttgaa-caaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  6612799 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaaagatcaaacagtaagttggtgtttaatggaagattgattttaaacaaaaaagagaattagatgacatt 6612700  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||| | |||     
T  6612699 tagggatttgagatttaggaatttagggatttgagattcaatttggggatattgatttttggttcaaggacaaaagtgatcattttctactttgaattta 6612600  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatat 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  6612599 gtccctgtgacacctcatat 6612580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 161 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7944470 - 7944216
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgag-atttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaa 258  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||    | |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7944470 gtgtttaatggaagattgattttgaataaaaaagataattagatgacat----gcatttaaggatttaag-atttagggatttgatattcaatttgggga 7944376  T
Q  259 tattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnn 358  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |          
T  7944375 tattgatttttggtccagggaccaaagtgataattttctactttcactttggtctatgtgacacctcatatgcgccatattatcacttaacatatttttt 7944276  T
Q  359 naacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaat 418  Q
     |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  7944275 taacgttagggactaaattgataacgaaagtgcagagtcaaggacttatttgtatttaat 7944216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 112 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 51450389 - 51450169
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| | ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  51450389 ggacctaactgatagtaagtatgcacactaagagacctaatagtaagttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagatgacact 51450290  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || ||||||||||||||   |||| |  |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||     
T  51450289 tacggatttgagatttagaaattttgagatttgagattcaagttggggatatttatttttggttcatggactatagtgatcattttctactttcagttta 51450190  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  51450189 gtccctgtgacacctcatatg 51450169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 180 - 330
Target Start/End: Original strand, 22857382 - 22857533
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaagg-atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatgg 278  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  22857382 tttgaacaaaaaggaaaattagatgatatttagggatttgagattttagggatttaaggatttgagattcaatttgggtatattgatttttggttcagtt 22857481  T
Q  279 atcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22857482 ttcaaagtgactagtttctactttcactttagtccatgtgacacctcatatg 22857533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 322
Target Start/End: Original strand, 34088213 - 34088415
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| ||| ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  34088213 ggacctaactgatagtaagtatgcacagtcag--atctaacagtaagttaatgtttagtggaagattaattttgaacaaaagagagaattagataacatt 34088310  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    ||  |||||||        |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||||     
T  34088311 taatgatttga--------gatttagggatttgaaattcaatttggggatattgaatttttgttcagggaccaaagtgacacatttctactttcacttta 34088402  T
Q  310 gtccttgtgacac 322  Q
    |||| | ||||||    
T  34088403 gtccctatgacac 34088415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3117918 - 3117818
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3117918 atttagggatttgatattcaatttggggatattaatttttggttcaaggactaaaatgatcattttctactttcactttagtcattgtgacacctcatat 3117819  T
Q  330 g 330  Q
    |    
T  3117818 g 3117818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11830212 - 11830061
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaagg----atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttca 275  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| ||      ||||| |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||     
T  11830212 tttgaacagaagagataattagatgagatttagggatttatgattaaattcaaaatttaagaatttgagattcaattttaggatattgatttttggttct 11830113  T
Q  276 tggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  11830112 aggatcaaaatgaccattttctactttcactttaatccatgtgacacctcat 11830061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34085790 - 34085690
Alignment:
Q  231 tttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| | || ||| |||||||    
T  34085790 tttaggaatttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcaagcatcaaagtgatcattttctactttcattttagtccctatgtcacatcatatg 34085691  T
Q  331 c 331  Q
    |    
T  34085690 c 34085690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25038149 - 25038050
Alignment:
Q  231 tttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  25038149 tttagggatttgagattcaatttagggatattgatttttggttcagggaccaaagtgataattttctactttcactttagttcatgtgacacctcatatg 25038050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25038240 - 25038133
Alignment:
Q  118 aactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaat-ttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||   |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  25038240 aactgatagtaagtatgcacagtaagggacctaacaataagttggtgttaatggaagattgttcttgaacaaaagaaagaattatatgacttttagggat 25038141  T
Q  217 ttgagatt 224  Q
    ||||||||    
T  25038140 ttgagatt 25038133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25043361 - 25043262
Alignment:
Q  231 tttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  25043361 tttagggatttgagattcaatttagggatattgatttttggttcagggaccaaagtgataattttctactttcactttagttcatgtgacacctcatatg 25043262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25043452 - 25043345
Alignment:
Q  118 aactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaat-ttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||   |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  25043452 aactgatagtaagtatgcacagtaagggacctaacaataagttggtgttaatggaagattgttcttgaacaaaagaaagaattatatgacttttagggat 25043353  T
Q  217 ttgagatt 224  Q
    ||||||||    
T  25043352 ttgagatt 25043345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5782665 - 5782551
Alignment:
Q  208 tttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactt 307  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  5782665 tttagggatttgtgatttaaggatttaggaatgtgagattgatattggggatattgatttttggtttagggattaaagtgacaattttttagtttcactt 5782566  T
Q  308 tggtccttgtgacac 322  Q
    | |||| ||||||||    
T  5782565 tagtccatgtgacac 5782551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 328
Target Start/End: Original strand, 6613833 - 6613939
Alignment:
Q  222 atttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgaca 321  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||| ||||||||||||| |||| ||||| |    
T  6613833 atttaaggatttagggatttgagattcaatttggggatattgatttttggttcagggaacaaagtaataatttcctactttcactttagtccctgtgaaa 6613932  T
Q  322 cctcata 328  Q
    || ||||    
T  6613933 ccccata 6613939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26518405 - 26518280
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatgga 279  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |   ||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||  ||    
T  26518405 tttgaacaaaagagggaattagatgagatttagggattaaa---ttcgggatttaggaatttgagattcaatttggagatattggttttcggttcagaga 26518309  T
Q  280 tcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26518308 ccaaagtgaccattttctaccttcacttt 26518280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 330
Target Start/End: Original strand, 51453552 - 51453688
Alignment:
Q  189 aagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtga 288  Q
    |||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  51453552 aagagataattatacgatatttaaggatttgagatttaaggatttagggatttgaaattcaatttgcggatattgatttatgattcagggatcaaagtga 51453651  T
Q  289 ccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    |     |||| ||| ||||| |||| |||||||| |||||||    
T  51453652 c-----tctatttttactttagtccatgtgacacatcatatg 51453688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 419
Target Start/End: Original strand, 10333149 - 10333249
Alignment:
Q  319 acacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  10333149 acacctcatatgcgccacatcatcacttaacagatttttttaacgctagagactaaagtgataacggaagtgcagagtcagagacttatttgtatttaat 10333248  T
Q  419 c 419  Q
    |    
T  10333249 c 10333249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1001392 - 1001326
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacct 324  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1001392 atattgattttcggttcaaggatcaaagtaactattttctactttcactttagtccatgtgacacct 1001326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8975400 - 8975330
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  8975400 atattgatttttggtttcgggaccaaagtgaccattttctactttcactttagtccctgtgacatctcata 8975330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22856939 - 22856848
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgc 331  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  22856939 atttgagattcaatttgaggatattgaattttggttcaggaactaaagtgatcattttctactttcactttagtc--tgtgacacctcatatgc 22856848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16249913 - 16249834
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16249913 gatttagggatttaagattcaatttagggatattgattttcggttcagggactaaaatgaccattttctactttcacttt 16249834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 329
Target Start/End: Original strand, 44720729 - 44720800
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  44720729 atattgattttcggttcaagaaccaaagtgacaattttctactttcactttagtcagtgtgacacctcatat 44720800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Original strand, 11060667 - 11060736
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  11060667 atattgattttctgttcagggatcaaagtgacaattttctactttcactttagtcattgtga-acctcata 11060736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23704006 - 23703948
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggattt 218  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23704006 gtgtttaatggaaaattaattttgaacaaaagagataattagatgacatttagagattt 23703948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39977586 - 39977504
Alignment:
Q  245 attcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  39977586 attcaatttgaggatattgatttttggttcagagaccaaagttatcattttctacatctactttagtccttgtgacacctcat 39977504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 308
Target Start/End: Original strand, 39726539 - 39726618
Alignment:
Q  228 ggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39726539 ggatttagggatttggaattcaatttggtgatattgatttttggttcagggct-aaaatgactattttctactttcacttt 39726618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1407869 - 1407802
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctc 325  Q
    ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  1407869 atattaattttcggttcaaggaccaaagtgataattttctactttcactttagtccatgtgacacctc 1407802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Original strand, 534430 - 534500
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  534430 atattgattttcgattcgtggatcaaagtgatcattttttactttcactttagtccccgtgacacgtcata 534500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 328
Target Start/End: Original strand, 50107078 - 50107155
Alignment:
Q  251 tttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  50107078 tttggggatattaattttcggttaaaggaccaaagtgaccatgtcctactttcacgttagtccatgtgacacctcata 50107155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22857001 - 22856945
Alignment:
Q  162 tgtttaatggaagattaatttg-aacaaaagagagaattagatgacatttagggatt 217  Q
    ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22857001 tgtttaatgaaagattgatttttaacaaaagagagaattagatgacattcagggatt 22856945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34085893 - 34085794
Alignment:
Q  115 cctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgt-gtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttag 212  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | | |  ||||| ||| |||| | |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34085893 cctaactgatagtaaatatgcatagtcaaggatataacagtaagttgttgattaaaggaagattgattttgaacaaaagaaagaattagatgacatttag 34085794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 10333128 - 10333045
Alignment:
Q  337 atcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcc 420  Q
    ||||||||||||||||       ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||    
T  10333128 atcatcacttaacagatttttttaacgtcaaggactaaaatgataacggaagtgcagagtaagggacttatttatatttaatcc 10333045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11059857 - 11059787
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  11059857 atattaattttcggttgagggatcaaagtgacaattttttacctccactttagtccctgtgacacctcata 11059787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29766164 - 29766114
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29766164 atattgattttttgttcagggaccaaagtgacaattttctattttcacttt 29766114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 418
Target Start/End: Original strand, 5783122 - 5783171
Alignment:
Q  369 gactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaat 418  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  5783122 gactaaagtgataacggaagtgcagagtcatggacttctttgtatttaat 5783171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 425
Target Start/End: Original strand, 6613991 - 6614048
Alignment:
Q  368 ggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  6613991 ggactaaaatgataactgaagtgcagagtcagagacttatttgtatttaatcctgagt 6614048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22856799 - 22856734
Alignment:
Q  360 aacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||| ||||||||| ||||    
T  22856799 aacgtcggagactaaagtgataacggaagtgcagagttagagacttctttgtatttaatcctgagt 22856734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44719591 - 44719527
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    |||||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||||||||    
T  44719591 atattgattttcagttcagggagcaaagtgacaattttctactttcattttagttcatgtgacac 44719527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 143
Target Start/End: Original strand, 44720599 - 44720631
Alignment:
Q  111 aggacctaactgatagtaagtatgcacagttag 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44720599 aggacctaactgatagtaagtatacacagttag 44720631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 425
Target Start/End: Original strand, 47878176 - 47878553
Alignment:
Q  32 gggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg-acctaactgatagtaag 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||          
T  47878176 gggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaataaatgccaatagatttgctaattcattgtctgggaactaacttat------ 47878269  T
Q  131 tatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaagg 229  Q
                || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  47878270 ------------gggacctaatagtaagttgtgtttaatggaagattaattttgagcaaaagagagaattagatgagatttagggatttgtgatttaaga 47878357  T
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  47878358 atttaggaatttgatattcaattttggaatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtccctatgacacctcatat 47878457  T
Q  330 gcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    ||||||||||||| |||||||||       |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  47878458 gcgccacatcatcgcttaacagattttattaacgtcatggactaaagtgataacggaagtgtagagtcagggacttatttgtatttaatccagagt 47878553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 96 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 54574810 - 54574470
Alignment:
Q  96 tgctaattcattgtcagg-acctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagag 193  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  54574810 tgctaattcattgttagggacctaactgatagtaagtatgcacagttagggacctaacagtaagttgtgtttaatggaagattaattttgaactaaagag 54574711  T
Q  194 agaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccatt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  54574710 agaattagatgacatttagggatttgagatttaaggagttaggaatttgatattcaatttgagaattttgatttttggttcggggatcaaagtgatcatt 54574611  T
Q  294 ttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcag 393  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||        ||| ||  | | ||||||||||||| ||||||||    
T  54574610 ttctactttcacttcggtccccgtgacacctcatatgcgtcatatcatcacctaacagttttttttaacatcaggaattaaagtgataacggaagtgcag 54574511  T
Q  394 agtcagggacctatttgaatttaatcccgagttagatacct 434  Q
    ||| | | || |||||| ||||||||| |||| ||| ||||    
T  54574510 agttaagaacttatttgtatttaatcctgagtcagagacct 54574470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 112 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42278409 - 42278103
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||| |    
T  42278409 ggacctaactgatagtaaatatgcttagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagatttattttgaacaaaaaagata-ttagatgacagt 42278311  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| ||||||| ||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42278310 taaggatttaagatttagggattt--------gatattcaatttggggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctagtttcactttg 42278219  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  42278218 gtccctgtgacacctcatatgcaccacatcatcacttaacagatttttttaacgtcagggattaaagtgataacggaagtgcagagtcaggaacttattt 42278119  T
Q  410 gaatttaatcccgagt 425  Q
    | ||||||||||||||    
T  42278118 gtatttaatcccgagt 42278103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Original strand, 42278727 - 42278912
Alignment:
Q  82 gatgctaatggatttgctaattcattgtcag-gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaat 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  42278727 gatgctaatagatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaagtatgcacagccagagacctaacagtaagtcgtgtttaatggaagattaat 42278826  T
Q  181 tt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgat 265  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42278827 tttgaacaaaagagagaattatatgacatttagggatttgagatttaaggatttagaaatttgatattcaatttgggaatattgat 42278912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 112 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 47874924 - 47874624
Alignment:
Q  112 ggacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaaga-gagaattagatgacatt 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || ||||| ||||||||    
T  47874924 ggacccaactgatagtaagtatgttcagtcagggacctaacagtaggttgtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaaagataattatatgacatt 47874825  T
Q  210 tagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttg 309  Q
    || |||||| ||||||| ||||||        |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47874824 taaggatttaagatttagggattt--------gatattcaattttgggatattgatttttggttcaaggaccaaagtgaccattttatactttcactttg 47874733  T
Q  310 gtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctattt 409  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |       ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  47874732 gtccctgtgacacatcatatgcgccacctcatcatttaacatatttttttaacatc-aggactaaagtgataacggaagtgcagaatcagggacttattt 47874634  T
Q  410 gaatttaatc 419  Q
    | ||||||||    
T  47874633 gtatttaatc 47874624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 330
Target Start/End: Original strand, 20599647 - 20599860
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaaccta--acaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacat 208  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20599647 gacccaactgataataagtatgcacagttagggacctataacagtaagttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagagaattagatgacat 20599746  T
Q  209 ttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    |||| |||||| ||||        ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20599747 ttagagatttgcgatt--------taggaatttgagattcaatttgggaatattaatttttggttcagggaccaaagtgaccattttttactttcatttt 20599838  T
Q  309 ggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  20599839 agtccctgtgacacctcatatg 20599860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 330
Target Start/End: Original strand, 4702957 - 4703171
Alignment:
Q  116 ctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagg 213  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| ||| |  ||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  4702957 ctaattgataataagtatacacagtcagggatataacagtaagttgatgtttaatggaagattgattttgaacaaaagaga--attaaatgacatttagg 4703054  T
Q  214 gatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 313  Q
    |||||||||||||  |||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  4703055 gatttgagatttagtgattcagagatttgagattcaatttggggatattgatttttgggtcagggaccaaagtgacaattttatactttcactttagtcc 4703154  T
Q  314 ttgtgacacctcatatg 330  Q
     | ||||| ||||||||    
T  4703155 atatgacatctcatatg 4703171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4702141 - 4701935
Alignment:
Q  123 atagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaat-tgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttga 220  Q
    ||||||| |||| | ||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4702141 atagtaaatatgtatagtcaggaatctaacagtaagtgtgtgtttaatggaagattgtttttgaacaaaatagagaattaaatgacatgtagggatttga 4702042  T
Q  221 gatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgac 320  Q
    ||| || ||||||||  |||||| |||||||||  | ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4702041 gatctagggatttagagatttgagattcaattttaggatattgacttttgtttcagggaccaaagtgactattttctactttcactttagtccatgtgac 4701942  T
Q  321 acctcat 327  Q
    || ||||    
T  4701941 acttcat 4701935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 233
Target Start/End: Original strand, 19051113 - 19051232
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacattta 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19051113 gacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacctaacaataagttga--ttaatggaagattgattttgaacaaaagagcgaactagatgacattta 19051210  T
Q  212 gggatttgagatttaaggattt 233  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  19051211 gagatttgagatttagggattt 19051232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 264 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 50694964 - 50694829
Alignment:
Q  264 atttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatgcgccacatcatcacttaacagannnnnnnaacg 363  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||    
T  50694964 atttttgattcagggattaaagtgacaattttctactttcattttgatccctgtgacacctcatatgcgacacatcatcacttaacagaattttttaacg 50694865  T
Q  364 tcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcag 399  Q
    ||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  50694864 tcagggactaaagagataacggaagtgcagaatcag 50694829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19050505 - 19050404
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatat 329  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19050505 atttagggatttgagattcaatttagggatattgatttttgcttcaaggaccaaagtgatcattttatactttcactttagtccatgtgacacctcatat 19050406  T
Q  330 gc 331  Q
    ||    
T  19050405 gc 19050404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6039475 - 6039377
Alignment:
Q  127 taagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagat 223  Q
    |||| ||||||| ||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6039475 taagcatgcacaattagagacctaacagtaagttgatgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagagaattatatgacatttagggatttgagat 6039377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6039370 - 6039292
Alignment:
Q  250 atttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||    
T  6039370 atttggggatattaattttcggttcagggagcaaagtgaccattttctacactcactttggtccctatgacacctcata 6039292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21622064 - 21621994
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  21622064 atattggtttttggttcaggaatcaaagtgaccattttatactttcactttagtgcttgtgacacatcata 21621994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 325
Target Start/End: Original strand, 42391757 - 42391855
Alignment:
Q  227 aggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctc 325  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||   ||||  |||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42391757 aggatttagggatttgagactcaatttgaagatatgaatttttagttcagggactaaagtgaccattttctactttcactttagtccatgtgacacctc 42391855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 322
Target Start/End: Original strand, 26685321 - 26685410
Alignment:
Q  233 taggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    |||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  26685321 tagggatttgagattcaagttatgaatattgatttttggttcagggattaaactgactattttctactttcattttagtccctgtgacac 26685410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 328
Target Start/End: Original strand, 21623001 - 21623069
Alignment:
Q  260 attgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  21623001 attgattttcggttcatagagcaaagtgaccattttctactttcattttagtctctgtgacacctcata 21623069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 330
Target Start/End: Original strand, 39870536 - 39870628
Alignment:
Q  238 atttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||  |||  ||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39870536 atttgaaattcaatttggagattttgatttttggttcggggacgaaagtgacatttttctactctcactttattccttgtgacacctcatatg 39870628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 26172809 - 26172892
Alignment:
Q  245 attcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| | |  |||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26172809 attcaattttggaatattgatttttgattcaggaactaaagtgattattttctactgtcactttagtcattgtgacacctcata 26172892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26170913 - 26170856
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagt 286  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26170913 gatttagggatttcaaattcaatttgggaatattgattttcggttcagggatcaaagt 26170856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Original strand, 53770944 - 53771021
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactt 307  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  53770944 atttagggatttgagattcaagttggggatattgatttttggttcggagactaaagtgacaattttctactttcactt 53771021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19050552 - 19050488
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatt 224  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19050552 gtgtttaatggaaaattgattttgaacaaaaaagagatttagatggcatttagggatttgagatt 19050488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 419
Target Start/End: Original strand, 26172953 - 26173005
Alignment:
Q  367 tggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatc 419  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  26172953 tggactaaagtgataacggaagtgcagagtcagagacttatttgtatttaatc 26173005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 38216715 - 38216618
Alignment:
Q  228 ggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | | |||| | | ||||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  38216715 ggatttagggatttgatattcaattttgggatattgattatcgattcaggaaccaaagggaccattt--tactttcactttagtccatgtaacacctcat 38216618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 328
Target Start/End: Original strand, 31844869 - 31844916
Alignment:
Q  281 caaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31844869 caaagtgaccattttttactttcactttagtccttgtgacacgtcata 31844916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 352
Target Start/End: Original strand, 25810285 - 25810409
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaa--tattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctca 326  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||  ||||||||||  |||||  || |||| |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25810285 gatttagggatttaagattcaacttgggaagatattgattttcagttcaaagaccaaa-tgactattttatactttcactttagtccatgtgacacctca 25810383  T
Q  327 tatgcgccacatcatcacttaacaga 352  Q
    |   || |||||||||| ||||||||    
T  25810384 tgcacgtcacatcatcagttaacaga 25810409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32244515 - 32244445
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  32244515 atattgattttcggtgcagagatcaaagtgaccattttttactttcactttagtctctgtgacaccccata 32244445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 322
Target Start/End: Original strand, 48739944 - 48740006
Alignment:
Q  260 attgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  48739944 attgatttttggttcagggactaaagtgactattttttactttcactttagtctttgtgacac 48740006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 53770562 - 53770470
Alignment:
Q  230 atttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacac 322  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| || || |  ||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||    
T  53770562 atttagggatttgatattcaagttggggatattgatttctgctttagtgactaaagtgaccattttctattttcattttagtctctgtgacac 53770470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2786464 - 2786414
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2786464 atattgattttcggttcagagaccaaagtgaccattttctacttttacttt 2786414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Original strand, 42391690 - 42391743
Alignment:
Q  180 tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggattt 233  Q
    |||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42391690 tttgaacaaaagagtgaatcatatgagatttacggatttgagatttagggattt 42391743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 418
Target Start/End: Original strand, 53771062 - 53771111
Alignment:
Q  369 gactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaat 418  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||    
T  53771062 gactaaagtgataacggaagtgcagagtcaggggcttctttgtatttaat 53771111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6317957 - 6317878
Alignment:
Q  228 ggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||   ||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  6317957 ggatttagagatttgatattcaatatgaagatattgattttcggttaatggaacaacgtga-cattttctacttttacttt 6317878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19050383 - 19050298
Alignment:
Q  334 cacatcatcacttaacagannnnnnnaacgtcgtggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatc 419  Q
    ||||||||||||||| |||       |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||| ||||||||    
T  19050383 cacatcatcacttaatagaattatttaacgtcggagactaaagtgataacggaagtgcagagtccgagacttctttgtatttaatc 19050298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21622232 - 21622192
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  21622232 gacctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaaca 21622192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 367 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 26170752 - 26170700
Alignment:
Q  367 tggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatc 419  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  26170752 tggactaaagtgataatggaagtgcagagtaaggaacttatttgtatttaatc 26170700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 5992 - 6185
Alignment:
Q  113 gacctaactgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacattt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5992 gacctaactgatagtaagtatgcacag----ggacctaacagtaagttggtgtttaattgaagattgattttgaacaaaagagataattatatgacattt 6087  T
Q  211 agggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6088 agggatttgagatttagggatttaggaatttgagattatatttggggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttttactttcacttt 6185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5921 - 5769
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaat 259  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||               |||||||| ||||| |||||| ||| |||||| | ||    
T  5921 gtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagagaattagatgaca---------------tttaaggaattagggatttgagatttaatttgaggat 5837  T
Q  260 attgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  5836 attgatttttggttcagggatcaaagtgaccactttttactttcactttagtctatgtgacacctcat 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5709 - 5660
Alignment:
Q  369 gactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaat 418  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| |||||||    
T  5709 gactaaagtgataacggaagtgtagagtcagggacttctttgtatttaat 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 330
Target Start/End: Original strand, 31239730 - 31239941
Alignment:
Q  121 tgatagtaagtatgcacagttaggaacctaacaataaattgt-gtttaatggaagattaattt-gaacaaaagagagaattagatgacatttagggattt 218  Q
    |||||||||||||||||||| |   | |||||| ||| |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  31239730 tgatagtaagtatgcacagtcacagatctaacagtaagttgttgtttaatgaaaaattaattttgaacaaaagagagaattagacgatatttaaggattt 31239829  T
Q  219 gagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtg 318  Q
    |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31239830 gagatttagggatttaaggatttgagattcaatttggggatattgatttttggttcaagaacaaaagtgaccattttctactttgactttagttcatgtg 31239929  T
Q  319 acacctcatatg 330  Q
    |||||| |||||    
T  31239930 acaccttatatg 31239941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 321
Target Start/End: Original strand, 19600096 - 19600189
Alignment:
Q  227 aggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgaca 321  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | || | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19600096 aggatttaggaatctgagattcaatttagggatattaattttcgattta-ggaccaaagtgaccattttctactttcactttagtccctgtgaca 19600189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30748231 - 30748161
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  30748231 atattgatttttgattcagggaccaaattgaccattttttactttcactttagtccctgtgacacgtcata 30748161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29856986 - 29856917
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    ||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  29856986 atattgattttcgattcagagaccaaaatgaccattttctacttccactttaatccttgtgacacctcat 29856917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29845838 - 29845764
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagatt--aatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggattt 233  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  29845838 gtgtttaatggaaaatttgattttgaacaaaagagataattaaatgagatttagagatttgtgatttagggattt 29845764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29857103 - 29857029
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagatt--aatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggattt 233  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  29857103 gtgtttaatggaaaatttgattttgaacaaaagagataattaaatgagatttagagatttgtgatttagggattt 29857029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 30748109 - 30748058
Alignment:
Q  369 gactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcc 420  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| |||||||||    
T  30748109 gactaaagtgataacgaaagtgtagagtcagagacttgtttgtatttaatcc 30748058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31219062 - 31219007
Alignment:
Q  372 taaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagtta 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||    
T  31219062 taaagtgataacggaagtgcagagtcaggaacttctttgtatttaatcctgagtta 31219007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Original strand, 6468733 - 6468783
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcacttt 308  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6468733 atattgatttttggttcaagaaccaaattgatcattttctactttcacttt 6468783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 327
Target Start/End: Original strand, 12676344 - 12676442
Alignment:
Q  229 gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||| | |||  |||||||| |||||||| ||| |||||  ||| | |||||||||||    
T  12676344 gatttagggatttgagattcaatttgtgtatattaattttcggtttagggactaaagtgacaattttctaatttaactttaatccctatgacacctcat 12676442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24621295 - 24621249
Alignment:
Q  281 caaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  24621295 caaagtgatcattttctactttcattttagtccttgtaacacctcat 24621249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 318
Target Start/End: Original strand, 31219106 - 31219142
Alignment:
Q  282 aaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31219106 aaagtgaccattttctactttcactttagtccatgtg 31219142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 204 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 79368 - 79242
Alignment:
Q  204 gacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttc 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  79368 gacatttaggtatttgagatttaaggatttaggaattcgagattcaatttaggcatattgattttttattcagggaccaaagtgatcattttcttctttc 79269  T
Q  304 actttggtccttgtgacacctcatatg 330  Q
    | ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  79268 attttagtccctgtgagacctcatatg 79242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Original strand, 36400 - 36473
Alignment:
Q  231 tttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttca 304  Q
    |||||| ||||||  ||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400 tttagggatttgagtttcaattttaggatattgattttcggttcagggatcaaagtgaccattttctactttca 36473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 116166 - 116109
Alignment:
Q  368 ggactaaagtgataacgaaagtgcagagtcagggacctatttgaatttaatcccgagt 425  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  116166 ggactaaagtgataacggaagtgcatagtcagggacttatttgtatttaatcctgagt 116109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8819 - 8672
Alignment:
Q  184 aacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaa-----ggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatgg 278  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||     | ||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||  |    
T  8819 aacaaaaaagagaatcagatgaaatttagagatttgaggattaaatttagaatttagggatttgagatttaagttggggatattgatttttggttca-cg 8721  T
Q  279 atcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    || ||||||| |||| | ||||| ||||||  ||| |||||||||||||    
T  8720 attaaagtgaacattctttacttccactttattccatgtgacacctcat 8672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3188 - 3119
Alignment:
Q  258 atattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 327  Q
    ||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  3188 atattgattttcgattcagagaccaaaatgaccattttctacttccactttaatccttgtgacacctcat 3119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2043 - 1969
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagatt--aatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggattt 233  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  2043 gtgtttaatggaaaatttgattttgaacaaaagagataattaaatgagatttagagatttgtgatttagggattt 1969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3305 - 3231
Alignment:
Q  161 gtgtttaatggaagatt--aatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggattt 233  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  3305 gtgtttaatggaaaatttgattttgaacaaaagagataattaaatgagatttagagatttgtgatttagggattt 3231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 142486 - 142413
Alignment:
Q  254 gggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcata 328  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  142486 gggaatattaattttttgttcaaggattaaaatgacaattttcta-tttcattttagtctttgtgacacctcata 142413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University