View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1135_low_17 (Length: 302)

Name: NF1135_low_17
Description: NF1135
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1135_low_17
NF1135_low_17
[»] chr6 (78 HSPs)
chr6 (1-273)||(34963341-34963613)
chr6 (1-273)||(30676632-30676904)
chr6 (1-273)||(18334514-18334780)
chr6 (1-273)||(19858841-19859107)
chr6 (1-273)||(24422521-24422787)
chr6 (1-273)||(33861768-33862034)
chr6 (1-273)||(33864252-33864518)
chr6 (4-273)||(12742291-12742554)
chr6 (1-273)||(2291102-2291368)
chr6 (1-273)||(8055003-8055269)
chr6 (1-273)||(19005020-19005286)
chr6 (1-273)||(26924562-26924828)
chr6 (1-273)||(1540833-1541099)
chr6 (1-237)||(22782231-22782467)
chr6 (27-273)||(1595523-1595763)
chr6 (1-236)||(25688507-25688742)
chr6 (1-237)||(25656633-25656869)
chr6 (49-237)||(25754813-25755001)
chr6 (49-273)||(20556864-20557080)
chr6 (62-225)||(18456735-18456898)
chr6 (71-237)||(3852009-3852175)
chr6 (66-237)||(16448513-16448685)
chr6 (89-225)||(18461895-18462031)
chr6 (62-273)||(19847932-19848145)
chr6 (79-273)||(18409782-18409975)
chr6 (79-273)||(25629310-25629499)
chr6 (82-243)||(29060541-29060703)
chr6 (119-273)||(20593750-20593899)
chr6 (96-273)||(17287768-17287940)
chr6 (79-264)||(20360915-20361095)
chr6 (79-267)||(16496227-16496410)
chr6 (119-273)||(19303536-19303684)
chr6 (79-229)||(25644335-25644487)
chr6 (79-225)||(18821801-18821946)
chr6 (132-273)||(20076677-20076812)
chr6 (96-273)||(22780199-22780371)
chr6 (1-273)||(23992398-23992663)
chr6 (1-74)||(18913994-18914067)
chr6 (139-264)||(20638298-20638418)
chr6 (5-74)||(18937252-18937321)
chr6 (73-229)||(20109153-20109312)
chr6 (1-77)||(12942365-12942441)
chr6 (73-269)||(8227460-8227651)
chr6 (183-273)||(25714394-25714478)
chr6 (83-264)||(23019394-23019567)
chr6 (1-58)||(31630569-31630626)
chr6 (1-77)||(15875470-15875546)
chr6 (1-77)||(28289257-28289333)
chr6 (146-273)||(25603406-25603535)
chr6 (146-273)||(25611744-25611873)
chr6 (183-243)||(27333277-27333338)
chr6 (183-243)||(27394017-27394078)
chr6 (64-227)||(28496414-28496575)
chr6 (64-227)||(29808825-29808986)
chr6 (83-229)||(9098473-9098620)
chr6 (197-266)||(22080799-22080862)
chr6 (192-265)||(16965378-16965451)
chr6 (1-42)||(19847890-19847931)
chr6 (1-45)||(17377770-17377814)
chr6 (130-229)||(19668386-19668488)
chr6 (145-267)||(35245569-35245684)
chr6 (62-243)||(1561304-1561483)
chr6 (192-261)||(16929658-16929727)
chr6 (62-114)||(18696617-18696670)
chr6 (191-264)||(19652184-19652248)
chr6 (183-273)||(4185880-4185962)
chr6 (191-225)||(11185524-11185558)
chr6 (183-267)||(22831486-22831565)
chr6 (192-273)||(4738626-4738698)
chr6 (191-267)||(16920698-16920768)
chr6 (62-114)||(23076862-23076915)
chr6 (239-271)||(31155504-31155536)
chr6 (183-223)||(33443068-33443108)
chr6 (1-32)||(1598266-1598297)
chr6 (116-217)||(15041542-15041644)
chr6 (62-114)||(18706435-18706488)
chr6 (62-114)||(18896253-18896306)
chr6 (62-114)||(35008280-35008333)
[»] chr3 (94 HSPs)
chr3 (1-273)||(13543993-13544265)
chr3 (1-273)||(12567528-12567800)
chr3 (1-273)||(34159300-34159566)
chr3 (1-273)||(55476465-55476731)
chr3 (1-273)||(16454203-16454469)
chr3 (1-273)||(17463152-17463418)
chr3 (1-273)||(45606829-45607095)
chr3 (1-273)||(13154177-13154444)
chr3 (1-273)||(7781269-7781535)
chr3 (1-273)||(28848533-28848799)
chr3 (1-273)||(6469056-6469322)
chr3 (1-273)||(8899068-8899334)
chr3 (1-237)||(10247645-10247881)
chr3 (1-237)||(16282733-16282969)
chr3 (1-273)||(38961813-38962079)
chr3 (1-237)||(9707529-9707765)
chr3 (1-273)||(13151712-13151979)
chr3 (1-237)||(41123894-41124127)
chr3 (38-273)||(17446614-17446842)
chr3 (1-273)||(8499492-8499760)
chr3 (1-273)||(15412403-15412671)
chr3 (79-237)||(29172583-29172741)
chr3 (49-233)||(50242830-50243014)
chr3 (62-237)||(17672630-17672805)
chr3 (62-225)||(53070636-53070799)
chr3 (62-273)||(12119707-12119913)
chr3 (1-273)||(27165224-27165492)
chr3 (49-225)||(43550448-43550625)
chr3 (110-237)||(15977519-15977646)
chr3 (1-273)||(53301426-53301695)
chr3 (130-273)||(55500916-55501053)
chr3 (79-273)||(14972831-14973020)
chr3 (79-273)||(40213676-40213864)
chr3 (79-273)||(17487833-17488022)
chr3 (79-273)||(17499315-17499504)
chr3 (123-237)||(36166602-36166715)
chr3 (123-231)||(21618459-21618566)
chr3 (79-273)||(25476340-25476529)
chr3 (79-273)||(26686864-26687053)
chr3 (79-226)||(42386428-42386576)
chr3 (79-273)||(43840909-43841098)
chr3 (1-273)||(46822236-46822501)
chr3 (116-267)||(12399192-12399338)
chr3 (79-273)||(13442251-13442440)
chr3 (79-273)||(23083316-23083505)
chr3 (138-237)||(10556989-10557088)
chr3 (79-264)||(20698391-20698570)
chr3 (130-243)||(18438535-18438649)
chr3 (79-230)||(14576788-14576939)
chr3 (73-269)||(24340672-24340863)
chr3 (142-237)||(44494813-44494908)
chr3 (79-273)||(24153164-24153352)
chr3 (116-230)||(14572603-14572717)
chr3 (143-237)||(17737240-17737337)
chr3 (79-273)||(11424718-11424903)
chr3 (116-268)||(30029816-30029968)
chr3 (73-225)||(52523676-52523831)
chr3 (1-77)||(15977697-15977773)
chr3 (1-77)||(54520986-54521062)
chr3 (130-264)||(12511037-12511172)
chr3 (73-226)||(23274705-23274859)
chr3 (1-76)||(29544764-29544839)
chr3 (73-269)||(37642214-37642405)
chr3 (83-266)||(15470911-15471085)
chr3 (73-266)||(16097315-16097499)
chr3 (73-163)||(2051148-2051238)
chr3 (1-59)||(12305327-12305385)
chr3 (83-264)||(14234473-14234648)
chr3 (1-77)||(11913972-11914050)
chr3 (73-266)||(16103767-16103950)
chr3 (188-273)||(45577947-45578026)
chr3 (1-58)||(10557091-10557148)
chr3 (73-266)||(12174212-12174393)
chr3 (73-170)||(22147474-22147571)
chr3 (62-125)||(17248224-17248287)
chr3 (183-237)||(28194697-28194752)
chr3 (119-240)||(32307681-32307802)
chr3 (73-243)||(13210280-13210447)
chr3 (62-225)||(37251105-37251270)
chr3 (81-225)||(43925977-43926123)
chr3 (183-266)||(49668135-49668210)
chr3 (183-266)||(9512907-9512982)
chr3 (183-266)||(9520882-9520957)
chr3 (79-225)||(22110307-22110454)
chr3 (1-36)||(17444738-17444773)
chr3 (183-244)||(14665397-14665458)
chr3 (32-65)||(15977667-15977700)
chr3 (62-114)||(23318653-23318706)
chr3 (183-223)||(13919350-13919390)
chr3 (183-237)||(856143-856197)
chr3 (186-240)||(3389999-3390053)
chr3 (186-244)||(14668553-14668611)
chr3 (183-237)||(23077537-23077591)
chr3 (183-240)||(1644733-1644790)
[»] chr2 (73 HSPs)
chr2 (1-273)||(32214843-32215115)
chr2 (1-273)||(23130836-23131102)
chr2 (1-273)||(23133303-23133569)
chr2 (1-273)||(34402444-34402710)
chr2 (1-273)||(18808917-18809183)
chr2 (1-273)||(23709454-23709720)
chr2 (1-273)||(23711935-23712201)
chr2 (1-273)||(39682287-39682553)
chr2 (1-273)||(24898117-24898384)
chr2 (1-273)||(24900600-24900867)
chr2 (1-273)||(24903077-24903344)
chr2 (1-273)||(24905554-24905821)
chr2 (1-273)||(24908029-24908296)
chr2 (1-237)||(6725999-6726235)
chr2 (1-237)||(21154982-21155218)
chr2 (1-273)||(571371-571637)
chr2 (1-273)||(23135564-23135830)
chr2 (1-273)||(26505353-26505619)
chr2 (1-273)||(26507831-26508097)
chr2 (1-273)||(28577073-28577339)
chr2 (1-273)||(24367748-24368014)
chr2 (1-273)||(32039420-32039686)
chr2 (1-237)||(22105416-22105653)
chr2 (9-273)||(45029784-45030042)
chr2 (1-237)||(38967378-38967614)
chr2 (71-237)||(43137303-43137469)
chr2 (62-273)||(24529511-24529717)
chr2 (1-156)||(24642776-24642933)
chr2 (79-243)||(22337116-22337281)
chr2 (79-243)||(23060514-23060679)
chr2 (79-243)||(23076443-23076608)
chr2 (1-273)||(25616156-25616421)
chr2 (67-269)||(19671811-19672007)
chr2 (79-273)||(22731189-22731378)
chr2 (79-273)||(22738135-22738323)
chr2 (79-267)||(23285848-23286027)
chr2 (163-237)||(24643034-24643108)
chr2 (145-267)||(38136-38252)
chr2 (79-237)||(298769-298929)
chr2 (79-273)||(23660000-23660188)
chr2 (79-267)||(23654341-23654524)
chr2 (73-264)||(23708568-23708752)
chr2 (1-77)||(20261383-20261459)
chr2 (62-225)||(7670-7835)
chr2 (183-267)||(23040249-23040327)
chr2 (183-264)||(7679567-7679647)
chr2 (116-267)||(23103389-23103533)
chr2 (183-266)||(22134266-22134346)
chr2 (49-118)||(22173799-22173868)
chr2 (1-77)||(23707244-23707322)
chr2 (1-77)||(24918197-24918275)
chr2 (83-230)||(28405990-28406137)
chr2 (130-269)||(20309089-20309221)
chr2 (62-163)||(23791357-23791458)
chr2 (62-225)||(23207296-23207461)
chr2 (183-243)||(8946658-8946718)
chr2 (73-149)||(22459511-22459587)
chr2 (1-77)||(10684685-10684763)
chr2 (1-77)||(24671082-24671160)
chr2 (62-163)||(24697543-24697644)
chr2 (83-266)||(25175837-25176010)
chr2 (79-225)||(20520148-20520295)
chr2 (1-77)||(24681501-24681579)
chr2 (191-229)||(18786971-18787009)
chr2 (64-264)||(23071892-23072084)
chr2 (90-225)||(32451894-32452031)
chr2 (1-42)||(24529469-24529510)
chr2 (62-151)||(22413073-22413161)
chr2 (183-223)||(23287384-23287424)
chr2 (183-223)||(26392403-26392443)
chr2 (81-114)||(25109019-25109052)
chr2 (89-157)||(23004838-23004905)
chr2 (62-102)||(29601478-29601518)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (1-273)||(22001727-22001993)
chr8 (1-273)||(1484376-1484642)
chr8 (1-273)||(5853214-5853480)
chr8 (1-273)||(20403201-20403467)
chr8 (1-273)||(4483255-4483520)
chr8 (1-273)||(14409366-14409632)
chr8 (1-273)||(4542295-4542561)
chr8 (1-273)||(15203153-15203419)
chr8 (1-273)||(20046117-20046383)
chr8 (1-239)||(16413238-16413476)
chr8 (1-241)||(45290616-45290857)
chr8 (1-273)||(19896239-19896509)
chr8 (1-273)||(14823748-14824015)
chr8 (1-237)||(19936925-19937164)
chr8 (62-273)||(41598162-41598367)
chr8 (1-228)||(15070571-15070800)
chr8 (62-273)||(26223890-26224098)
chr8 (67-225)||(19801370-19801527)
chr8 (49-237)||(25484245-25484426)
chr8 (1-128)||(24485966-24486093)
chr8 (79-243)||(16092297-16092462)
chr8 (1-118)||(32810054-32810171)
chr8 (79-273)||(28648999-28649192)
chr8 (79-243)||(6759259-6759421)
chr8 (79-273)||(18818364-18818553)
chr8 (92-273)||(7372755-7372931)
chr8 (79-273)||(22875042-22875230)
chr8 (1-273)||(32121703-32121968)
chr8 (123-237)||(26225292-26225405)
chr8 (79-243)||(20536209-20536374)
chr8 (79-264)||(21918955-21919135)
chr8 (1-273)||(18677987-18678252)
chr8 (96-273)||(21923900-21924072)
chr8 (132-273)||(23406356-23406492)
chr8 (123-273)||(26219691-26219834)
chr8 (116-273)||(23648524-23648682)
chr8 (79-243)||(22626737-22626901)
chr8 (73-269)||(13597566-13597757)
chr8 (73-269)||(13508034-13508225)
chr8 (79-273)||(18879191-18879375)
chr8 (73-269)||(17612059-17612250)
chr8 (79-267)||(31971240-31971421)
chr8 (83-264)||(38855212-38855386)
chr8 (73-225)||(20498581-20498734)
chr8 (83-235)||(21285606-21285758)
chr8 (83-264)||(6520354-6520528)
chr8 (1-58)||(38550033-38550090)
chr8 (145-267)||(45131019-45131134)
chr8 (64-267)||(5866217-5866412)
chr8 (62-225)||(37116366-37116532)
chr8 (145-267)||(16199666-16199782)
chr8 (64-264)||(17140902-17141094)
chr8 (64-243)||(21490996-21491173)
chr8 (1-77)||(1326959-1327041)
chr8 (62-163)||(17439443-17439544)
chr8 (64-264)||(21249370-21249563)
chr8 (64-264)||(21255208-21255401)
chr8 (130-268)||(21389458-21389589)
chr8 (130-268)||(21778784-21778915)
chr8 (62-163)||(17266930-17267031)
chr8 (83-266)||(23760805-23760978)
chr8 (1-58)||(27472339-27472395)
chr8 (66-229)||(983347-983512)
chr8 (1-45)||(16401952-16401996)
chr8 (1-58)||(20982649-20982710)
chr8 (130-268)||(21395988-21396119)
chr8 (130-268)||(21790481-21790612)
chr8 (191-266)||(26355766-26355832)
chr8 (83-230)||(21673718-21673864)
chr8 (62-114)||(37515835-37515888)
chr8 (63-114)||(14103163-14103215)
chr8 (80-163)||(22364745-22364826)
chr8 (32-77)||(35026849-35026894)
[»] chr7 (86 HSPs)
chr7 (1-273)||(14949044-14949310)
chr7 (1-273)||(456295-456561)
chr7 (1-273)||(15376635-15376901)
chr7 (1-273)||(16232494-16232760)
chr7 (1-273)||(20385045-20385311)
chr7 (1-273)||(21189517-21189783)
chr7 (1-273)||(32125465-32125731)
chr7 (1-273)||(41522891-41523157)
chr7 (1-273)||(41525353-41525619)
chr7 (1-237)||(11393209-11393445)
chr7 (1-275)||(18430684-18430952)
chr7 (1-273)||(16410033-16410299)
chr7 (1-273)||(18640246-18640512)
chr7 (1-273)||(27216834-27217100)
chr7 (1-273)||(24702212-24702478)
chr7 (1-273)||(11972470-11972736)
chr7 (1-273)||(24704662-24704925)
chr7 (1-278)||(16213653-16213924)
chr7 (92-273)||(24275139-24275320)
chr7 (1-273)||(26355903-26356182)
chr7 (1-273)||(26358355-26358634)
chr7 (1-273)||(13869320-13869588)
chr7 (62-273)||(44116483-44116688)
chr7 (71-237)||(3386337-3386503)
chr7 (49-225)||(13647344-13647521)
chr7 (62-237)||(17061898-17062073)
chr7 (69-237)||(38898366-38898535)
chr7 (67-273)||(20110530-20110720)
chr7 (62-225)||(12756654-12756817)
chr7 (1-148)||(15081869-15082019)
chr7 (122-237)||(48273396-48273512)
chr7 (115-237)||(13831377-13831499)
chr7 (79-237)||(3564319-3564478)
chr7 (1-96)||(13841157-13841252)
chr7 (79-264)||(12698817-12698998)
chr7 (79-273)||(18456368-18456556)
chr7 (79-273)||(9509166-9509355)
chr7 (73-267)||(26211978-26212168)
chr7 (79-243)||(38227482-38227646)
chr7 (1-77)||(14269984-14270060)
chr7 (73-229)||(2280068-2280225)
chr7 (1-77)||(8468804-8468880)
chr7 (123-273)||(15144037-15144177)
chr7 (1-90)||(18627717-18627806)
chr7 (130-264)||(10589025-10589154)
chr7 (83-264)||(67731-67904)
chr7 (1-77)||(11303411-11303487)
chr7 (1-77)||(16108611-16108687)
chr7 (73-269)||(19486693-19486884)
chr7 (219-273)||(16213599-16213653)
chr7 (83-230)||(18005660-18005806)
chr7 (123-243)||(22072914-22073036)
chr7 (64-264)||(34200772-34200964)
chr7 (83-229)||(16056343-16056488)
chr7 (83-264)||(47831793-47831968)
chr7 (1-77)||(8940336-8940414)
chr7 (62-264)||(16495388-16495581)
chr7 (1-77)||(38898150-38898228)
chr7 (186-267)||(15211433-15211515)
chr7 (145-267)||(16386268-16386386)
chr7 (1-77)||(23664875-23664951)
chr7 (83-266)||(811091-811265)
chr7 (62-229)||(1867932-1868101)
chr7 (73-222)||(12255740-12255892)
chr7 (73-157)||(15113031-15113114)
chr7 (83-229)||(16219677-16219823)
chr7 (79-267)||(40443374-40443555)
chr7 (183-264)||(28505357-28505433)
chr7 (1-77)||(29796772-29796850)
chr7 (1-77)||(29800591-29800669)
chr7 (191-266)||(44014165-44014231)
chr7 (73-269)||(10063772-10063958)
chr7 (1-58)||(45847683-45847739)
chr7 (73-157)||(15116568-15116651)
chr7 (62-163)||(20220127-20220225)
chr7 (62-243)||(15754828-15755007)
chr7 (183-237)||(18154901-18154955)
chr7 (191-267)||(11996095-11996165)
chr7 (139-237)||(14932749-14932848)
chr7 (139-237)||(15356184-15356283)
chr7 (139-237)||(15360298-15360397)
chr7 (194-267)||(27847901-27847968)
chr7 (198-229)||(14044761-14044792)
chr7 (198-229)||(14354791-14354822)
chr7 (186-244)||(2832504-2832562)
chr7 (62-163)||(15008436-15008536)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (1-273)||(39363358-39363624)
chr5 (1-273)||(264690-264956)
chr5 (1-273)||(20908986-20909252)
chr5 (1-273)||(42245287-42245553)
chr5 (4-273)||(10732865-10733128)
chr5 (1-273)||(29345954-29346220)
chr5 (1-273)||(29348427-29348693)
chr5 (1-273)||(29350900-29351166)
chr5 (1-273)||(39245110-39245376)
chr5 (1-273)||(32027367-32027633)
chr5 (1-237)||(29329938-29330171)
chr5 (4-237)||(20917877-20918106)
chr5 (1-237)||(38619438-38619676)
chr5 (1-237)||(23064515-23064753)
chr5 (67-273)||(11581187-11581387)
chr5 (62-273)||(20901991-20902198)
chr5 (62-273)||(2154596-2154802)
chr5 (62-237)||(36154766-36154938)
chr5 (66-237)||(18319020-18319192)
chr5 (67-237)||(24067111-24067282)
chr5 (74-273)||(10775670-10775864)
chr5 (62-237)||(31061072-31061248)
chr5 (79-273)||(23390451-23390640)
chr5 (79-243)||(1096468-1096633)
chr5 (79-273)||(9077929-9078118)
chr5 (79-243)||(25421533-25421698)
chr5 (79-267)||(21729019-21729202)
chr5 (79-267)||(21808344-21808527)
chr5 (137-273)||(21997547-21997678)
chr5 (119-273)||(24529197-24529346)
chr5 (1-273)||(17517086-17517351)
chr5 (79-243)||(24493570-24493734)
chr5 (79-267)||(8286797-8286981)
chr5 (79-224)||(25431414-25431560)
chr5 (79-267)||(22075001-22075185)
chr5 (123-273)||(22412161-22412305)
chr5 (79-243)||(13025312-13025476)
chr5 (79-243)||(13095496-13095660)
chr5 (79-225)||(22144068-22144215)
chr5 (73-266)||(21565529-21565713)
chr5 (123-186)||(20766119-20766181)
chr5 (73-269)||(40725834-40726025)
chr5 (83-243)||(21329457-21329617)
chr5 (83-243)||(21502116-21502276)
chr5 (63-225)||(20026879-20027043)
chr5 (145-267)||(21292992-21293107)
chr5 (1-77)||(9776522-9776598)
chr5 (1-77)||(37804825-37804901)
chr5 (83-266)||(22959495-22959666)
chr5 (83-264)||(26011995-26012168)
chr5 (96-241)||(37723906-37724050)
chr5 (67-225)||(22178162-22178323)
chr5 (183-264)||(19660894-19660970)
chr5 (182-237)||(20806845-20806900)
chr5 (73-266)||(19668882-19669066)
chr5 (1-42)||(20901949-20901990)
chr5 (146-234)||(18418590-18418678)
chr5 (183-264)||(36314563-36314639)
chr5 (5-42)||(2154558-2154595)
chr5 (186-237)||(26704078-26704129)
chr5 (186-237)||(26973811-26973862)
chr5 (183-225)||(26740705-26740747)
chr5 (183-228)||(26732892-26732937)
chr5 (62-107)||(36314685-36314730)
[»] chr4 (71 HSPs)
chr4 (1-273)||(19618094-19618366)
chr4 (1-273)||(15118274-15118540)
chr4 (1-273)||(44615262-44615528)
chr4 (1-273)||(12229-12495)
chr4 (1-273)||(18239341-18239607)
chr4 (1-273)||(50222261-50222527)
chr4 (1-273)||(52312484-52312750)
chr4 (1-273)||(14970629-14970901)
chr4 (1-237)||(18215196-18215432)
chr4 (1-273)||(1837431-1837697)
chr4 (1-241)||(15355246-15355487)
chr4 (1-273)||(44773005-44773275)
chr4 (1-237)||(3515011-3515247)
chr4 (1-237)||(19242703-19242940)
chr4 (49-237)||(23803235-23803423)
chr4 (49-237)||(51463838-51464026)
chr4 (26-273)||(7641139-7641370)
chr4 (62-237)||(44102218-44102393)
chr4 (49-237)||(12610954-12611135)
chr4 (73-273)||(44928873-44929068)
chr4 (62-269)||(15402684-15402886)
chr4 (62-267)||(15367673-15367873)
chr4 (62-269)||(15371183-15371385)
chr4 (62-225)||(21815568-21815731)
chr4 (62-243)||(15373484-15373666)
chr4 (62-269)||(15369999-15370200)
chr4 (67-267)||(16223515-16223710)
chr4 (67-237)||(20149833-20150004)
chr4 (123-237)||(54798753-54798868)
chr4 (123-237)||(14280320-14280434)
chr4 (79-237)||(14038655-14038814)
chr4 (79-236)||(16377478-16377634)
chr4 (79-267)||(12902740-12902923)
chr4 (79-243)||(7088878-7089043)
chr4 (79-243)||(7798775-7798940)
chr4 (79-242)||(22636437-22636601)
chr4 (132-273)||(52873375-52873511)
chr4 (79-243)||(7893704-7893869)
chr4 (62-225)||(22353852-22354016)
chr4 (123-237)||(8574868-8574981)
chr4 (79-243)||(16270191-16270355)
chr4 (79-273)||(44052806-44052995)
chr4 (1-78)||(52873100-52873177)
chr4 (1-77)||(15496993-15497069)
chr4 (57-225)||(13783-13953)
chr4 (79-243)||(6899892-6900056)
chr4 (81-243)||(16239927-16240089)
chr4 (73-229)||(43198502-43198661)
chr4 (79-239)||(23374314-23374475)
chr4 (73-229)||(52243143-52243302)
chr4 (1-77)||(15534345-15534421)
chr4 (1-77)||(36038034-36038110)
chr4 (1-77)||(49547696-49547772)
chr4 (1-58)||(362268-362325)
chr4 (159-243)||(3096294-3096379)
chr4 (1-77)||(14048741-14048817)
chr4 (1-77)||(14746539-14746617)
chr4 (191-264)||(39706356-39706423)
chr4 (81-170)||(15464888-15464977)
chr4 (79-225)||(46640411-46640558)
chr4 (62-229)||(12288147-12288316)
chr4 (62-225)||(53082089-53082254)
chr4 (73-264)||(15551803-15551985)
chr4 (26-77)||(19857608-19857659)
chr4 (145-267)||(14053323-14053439)
chr4 (183-267)||(17046470-17046549)
chr4 (119-230)||(12774021-12774132)
chr4 (183-266)||(8846343-8846418)
chr4 (73-152)||(8846465-8846543)
chr4 (145-225)||(6190481-6190563)
chr4 (183-223)||(17333298-17333338)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-273)||(20721-20987)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-273)||(37795-38061)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-273)||(136654-136920)
scaffold0028 (1-273)||(139123-139389)
scaffold0028 (1-273)||(144061-144327)
scaffold0028 (1-273)||(134185-134451)
scaffold0028 (1-273)||(141592-141858)
scaffold0028 (119-266)||(132645-132784)
scaffold0028 (83-226)||(62216-62355)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-273)||(94385-94651)
scaffold0023 (1-239)||(17362-17600)
scaffold0023 (82-237)||(44458-44614)
scaffold0023 (83-264)||(100363-100534)
scaffold0023 (83-266)||(40135-40308)
scaffold0023 (183-264)||(119861-119937)
scaffold0023 (191-230)||(101513-101552)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (1-273)||(13988840-13989106)
chr1 (1-273)||(16361885-16362158)
chr1 (1-273)||(21923213-21923479)
chr1 (1-272)||(21840736-21841007)
chr1 (1-273)||(21475009-21475275)
chr1 (1-273)||(29776662-29776928)
chr1 (1-237)||(29298141-29298376)
chr1 (1-273)||(31612287-31612553)
chr1 (1-273)||(23593656-23593923)
chr1 (1-273)||(22122989-22123256)
chr1 (1-237)||(16275285-16275522)
chr1 (1-237)||(15859930-15860167)
chr1 (62-273)||(13212844-13213050)
chr1 (62-237)||(21707171-21707346)
chr1 (62-237)||(21711713-21711888)
chr1 (62-273)||(21346935-21347141)
chr1 (49-225)||(45574812-45574989)
chr1 (62-237)||(21342100-21342276)
chr1 (67-237)||(40389158-40389329)
chr1 (73-273)||(432986-433178)
chr1 (79-273)||(50210168-50210361)
chr1 (79-267)||(27250684-27250867)
chr1 (119-273)||(34509757-34509906)
chr1 (183-273)||(20454613-20454703)
chr1 (79-268)||(22468651-22468841)
chr1 (79-273)||(22532246-22532435)
chr1 (116-273)||(20135158-20135316)
chr1 (56-225)||(21896187-21896358)
chr1 (73-225)||(21861519-21861672)
chr1 (143-267)||(20847173-20847292)
chr1 (79-267)||(21026663-21026846)
chr1 (62-225)||(35261018-35261180)
chr1 (1-56)||(22050811-22050866)
chr1 (73-266)||(33680994-33681178)
chr1 (73-229)||(16758664-16758822)
chr1 (83-229)||(22237642-22237788)
chr1 (25-77)||(43543215-43543267)
chr1 (62-264)||(14295493-14295686)
chr1 (119-240)||(21754049-21754170)
chr1 (83-264)||(22921830-22922001)
chr1 (1-45)||(27161561-27161605)
chr1 (73-228)||(20918620-20918772)
chr1 (79-225)||(50614071-50614219)
chr1 (79-225)||(50621899-50622047)
chr1 (79-225)||(41049991-41050138)
chr1 (67-163)||(50686695-50686791)
chr1 (169-271)||(21161698-21161792)
chr1 (186-237)||(21714549-21714600)
chr1 (191-229)||(52928038-52928076)
chr1 (191-266)||(20248266-20248332)
chr1 (183-267)||(38801447-38801525)
chr1 (79-168)||(22354527-22354616)
chr1 (73-157)||(12271642-12271725)
chr1 (62-113)||(16368224-16368276)
chr1 (54-163)||(22130840-22130946)
chr1 (62-163)||(51130646-51130743)
chr1 (186-244)||(24783155-24783213)
chr1 (199-242)||(21533948-21533989)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-272)||(10742-11013)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-272)||(9211-9482)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-273)||(13366-13632)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (1-273)||(13921-14187)
scaffold0230 (1-32)||(23453-23484)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-273)||(501052-501324)
scaffold0001 (62-273)||(85562-85768)
scaffold0001 (73-230)||(160698-160854)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-273)||(40374-40640)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-273)||(11256-11529)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (24-273)||(12194-12443)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-278)||(4663-4934)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (61-273)||(158432-158638)
scaffold0003 (79-229)||(339905-340053)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (49-237)||(110-298)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (49-237)||(82076-82264)
scaffold0037 (73-229)||(22620-22776)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (62-273)||(29905-30111)
scaffold0149 (1-42)||(30112-30153)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (62-237)||(9753-9929)
scaffold0145 (79-243)||(32943-33107)
scaffold0145 (79-243)||(38762-38926)
scaffold0145 (1-40)||(9932-9971)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (62-237)||(16788-16963)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (49-273)||(12038-12250)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (49-237)||(1250-1439)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (62-225)||(79267-79430)
scaffold0056 (79-264)||(17170-17356)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (62-237)||(4301-4476)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (62-233)||(2111-2283)
scaffold0247 (73-269)||(17976-18167)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (73-225)||(20373-20524)
scaffold0031 (79-273)||(128728-128916)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (74-273)||(4188-4382)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-273)||(38578-38846)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (70-237)||(161080-161248)
scaffold0007 (62-162)||(164573-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (79-273)||(22860-23048)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-118)||(6070-6187)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (79-273)||(3106-3294)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (123-237)||(44706-44821)
scaffold0122 (79-237)||(26020-26179)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (123-237)||(116434-116547)
scaffold0022 (1-77)||(53794-53872)
scaffold0022 (62-225)||(128907-129072)
scaffold0022 (62-113)||(78453-78505)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (79-243)||(16555-16720)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (79-273)||(3141-3334)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (79-230)||(4522-4673)
scaffold0228 (79-230)||(12104-12255)
scaffold0228 (79-230)||(22056-22207)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (79-273)||(13188-13377)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (79-273)||(1828-2017)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (79-273)||(51890-52079)
scaffold0011 (79-267)||(167934-168116)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (79-267)||(1004-1186)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (79-235)||(39486-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (79-235)||(75170-75326)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (79-267)||(4832-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (79-273)||(3447-3636)
scaffold0292 (79-273)||(320-508)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (79-273)||(32913-33100)
scaffold0120 (79-273)||(45905-46092)
scaffold0120 (80-273)||(16090-16278)
scaffold0120 (182-273)||(17388-17473)
[»] scaffold0046 (6 HSPs)
scaffold0046 (130-267)||(28397-28529)
scaffold0046 (64-264)||(11278-11470)
scaffold0046 (64-267)||(1980-2175)
scaffold0046 (191-264)||(4538-4605)
scaffold0046 (59-114)||(26013-26069)
scaffold0046 (59-114)||(16853-16909)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (79-273)||(8488-8673)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (79-236)||(25904-26061)
scaffold0026 (79-243)||(39859-40023)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (130-273)||(8456-8594)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (73-229)||(8481-8640)
scaffold0621 (83-266)||(6519-6695)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (79-243)||(6076-6244)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (79-226)||(24257-24406)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (79-179)||(3485-3585)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (94-267)||(1935-2103)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (73-269)||(11445-11636)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (72-229)||(27697-27855)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (73-269)||(38205-38396)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-72)||(27958-28029)
scaffold0114 (145-267)||(15485-15601)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (79-273)||(39890-40078)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (57-225)||(53481-53651)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (58-225)||(12587-12755)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (84-157)||(13092-13165)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (72-225)||(13147-13302)
scaffold0357 (72-229)||(16048-16206)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (79-267)||(32050-32230)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (73-229)||(10491-10647)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (154-243)||(4713-4803)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (83-266)||(19251-19424)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (65-237)||(15668-15838)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (1-77)||(35987-36064)
scaffold0100 (183-266)||(23942-24017)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (73-170)||(225482-225578)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (83-230)||(129919-130066)
scaffold0010 (79-225)||(60670-60818)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (1-77)||(1592-1668)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (5-77)||(10813-10885)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (165-225)||(11982-12042)
scaffold0503 (71-135)||(12039-12103)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (145-267)||(13480-13596)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-77)||(3187-3263)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (73-266)||(45742-45926)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (145-237)||(11464-11557)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (96-225)||(174785-174913)
scaffold0021 (183-273)||(121743-121827)
scaffold0021 (79-155)||(124675-124751)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (83-264)||(6083-6258)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (79-179)||(13158-13258)
scaffold0175 (188-273)||(250-329)
scaffold0175 (191-264)||(34109-34176)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (83-264)||(118-290)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-77)||(646-724)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (1-77)||(4225-4303)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (1-77)||(1248-1326)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (94-264)||(10395-10558)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-77)||(6858-6936)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (1-77)||(15084-15162)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (62-264)||(1011-1204)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (1-77)||(15194-15272)
scaffold0106 (183-273)||(15298-15382)
scaffold0106 (183-267)||(1272-1351)
scaffold0106 (191-267)||(7249-7319)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (191-264)||(1102-1169)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (62-241)||(6220-6400)
scaffold0420 (198-241)||(13813-13854)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (191-264)||(6597-6664)
scaffold0333 (191-264)||(13977-14044)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (83-230)||(5657-5803)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (191-264)||(15845-15912)
scaffold0020 (186-237)||(178901-178952)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (79-164)||(27911-27996)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (62-229)||(25121-25289)
scaffold0123 (62-163)||(620-720)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (130-267)||(20893-21026)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (83-229)||(32551-32696)
scaffold0034 (79-225)||(51839-51985)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (83-264)||(14658-14829)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (83-170)||(8090-8176)
scaffold0556 (64-230)||(6826-6990)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (183-273)||(4893-4977)
scaffold0395 (79-168)||(918-1006)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (62-229)||(8011-8180)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (62-163)||(97089-97190)
scaffold0006 (62-163)||(106367-106468)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (123-266)||(2805-2940)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (191-235)||(1091-1135)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (191-266)||(2713-2779)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (79-221)||(38339-38483)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (73-163)||(8008-8098)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (130-267)||(16265-16395)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (67-152)||(18180-18265)
scaffold0138 (83-229)||(12954-13100)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (65-266)||(12750-12946)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (119-266)||(32085-32224)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (143-225)||(1051-1134)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (83-229)||(10542-10688)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (79-225)||(267679-267826)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (186-237)||(23846-23897)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (192-266)||(28839-28904)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (191-237)||(36457-36503)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (94-223)||(4545-4675)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (183-267)||(51565-51644)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (79-163)||(1753-1835)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (191-267)||(5196-5266)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (198-270)||(1124-1190)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (62-163)||(88-189)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (59-112)||(57948-58002)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (191-264)||(46981-47048)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (94-179)||(6676-6761)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (63-114)||(10603-10655)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (63-114)||(600-652)
[»] scaffold1792 (1 HSPs)
scaffold1792 (1-32)||(416-447)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (139-237)||(29561-29660)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (186-267)||(193039-193115)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (83-163)||(2179-2257)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (183-223)||(206584-206624)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 78)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34963613 - 34963341
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34963613 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 34963514  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963513 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 34963414  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963413 actaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 34963341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 30676632 - 30676904
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30676632 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 30676731  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30676732 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 30676831  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676832 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 30676904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 18334514 - 18334780
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334514 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 18334613  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334614 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 18334713  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  18334714 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 18334780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 19858841 - 19859107
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19858841 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 19858940  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858941 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 19859040  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19859041 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggactatataag 19859107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24422787 - 24422521
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24422787 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24422688  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422687 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24422588  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24422587 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24422521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33862034 - 33861768
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33862034 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 33861935  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861934 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 33861835  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  33861834 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 33861768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33864518 - 33864252
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33864518 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 33864419  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864418 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 33864319  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  33864318 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 33864252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12742554 - 12742291
Alignment:
Q  4 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12742554 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 12742455  T
Q  104 atgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 203  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742454 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 12742355  T
Q  204 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  12742354 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 12742291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 2291102 - 2291368
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291102 atattgtccatgactgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 2291201  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291202 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 2291301  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  2291302 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 2291368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8055269 - 8055003
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8055269 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 8055170  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8055169 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttattta 8055070  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  8055069 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 8055003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19005286 - 19005020
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19005286 atattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 19005187  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005186 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 19005087  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19005086 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 19005020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 26924562 - 26924828
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924562 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 26924661  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26924662 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattta 26924761  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26924762 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 26924828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 1540833 - 1541099
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1540833 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcat 1540932  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540933 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 1541032  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  1541033 actaagctgcatgagtcgatctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 1541099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22782467 - 22782231
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22782467 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 22782368  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22782367 tacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 22782268  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782267 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595523
Alignment:
Q  27 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattga 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattga 1595664  T
Q  127 gacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1595663 gacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 1595564  T
Q  227 tgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  1595563 tgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 1595523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25688742 - 25688507
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||    
T  25688742 atattgtccatgattgaggaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtat 25688643  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25688642 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttattta 25688543  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25688542 actaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25656869 - 25656633
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  25656869 atattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtat 25656770  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25656769 tagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttattta 25656670  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656669 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25656633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754813
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 273
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557080
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgat 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||     
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaa------gatgatgaa 20557055  T
Q  249 gttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20557056 gttccaaattattggattatataag 20557080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 71 - 237
Target Start/End: Original strand, 3852009 - 3852175
Alignment:
Q  71 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3852009 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttt 3852108  T
Q  171 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852109 tgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 237
Target Start/End: Original strand, 16448513 - 16448685
Alignment:
Q  66 aatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448513 aatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgc 16448612  T
Q  165 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16448613 tgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 16448685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 89 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461895
Alignment:
Q  89 ttgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgc 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgc 18461932  T
Q  189 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461931 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 19847932 - 19848145
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || || |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||     
T  19847932 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtg 19848031  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaatta 259  Q
     |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19848032 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaatta 19848131  T
Q  260 ttggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||    
T  19848132 ttggactatttaag 19848145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409975
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||| ||||  ||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg--tttccaaattattggattatataag 18409975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629499
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 25629499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060541
Alignment:
Q  82 gatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-t 180  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  181 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatg 29060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593750
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  20593899 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattc 20593800  T
Q  218 ggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20593799 ggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 20593750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 273
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287940
Alignment:
Q  96 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 194  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  195 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 17287940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361095
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaa------aatgatgatgttccaaattattgga 20361095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496227
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 16496227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 273
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303684
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19303634  T
Q  218 ggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||| |||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19303635 ggtctaagatgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 19303684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  179 g-ttgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 177  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataat-gtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  178 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076677
Alignment:
Q  132 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  231 taagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
     ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20076713 gaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 20076677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 273
Target Start/End: Original strand, 22780199 - 22780371
Alignment:
Q  96 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 194  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||  ||||||    
T  22780199 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgt 22780298  T
Q  195 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22780299 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 22780371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23992663 - 23992398
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat---gatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatg 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||   ||| | ||| ||||  ||       | ||| ||    
T  23992663 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgatgattgaataa-gatgtgatacattg-------tttatgtg 23992572  T
Q  98 cattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtta 196  Q
    |||||| |||  |||   |||||| || |||   |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| ||||||    
T  23992571 cattacttgagatattattgaatatttaaga---tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtta 23992475  T
Q  197 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992474 tttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaag 23992398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18914067 - 18913994
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18914067 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Original strand, 20638298 - 20638418
Alignment:
Q  139 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||        
T  20638298 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaa---- 20638393  T
Q  238 ttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  20638394 --gatgatgatgttccaaattattgga 20638418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18937321 - 18937252
Alignment:
Q  5 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18937321 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20109312 - 20109153
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataat--tgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| | ||| || |||    
T  20109312 ttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttt 20109214  T
Q  171 tgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    || ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109213 tgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12942441 - 12942365
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  12942441 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 12942365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 8227460 - 8227651
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  8227460 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 8227558  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
     ||||||  |  ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  8227559 catactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgt------tgatgttccaaattattggactatt 8227651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714394
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 25714394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23019567 - 23019394
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||    
T  23019567 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgctt 23019470  T
Q  182 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  23019469 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatga--aa------gatgatgatgttccaaattattgga 23019394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 31630569 - 31630626
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630569 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15875546 - 15875470
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15875546 atattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 15875470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 28289257 - 28289333
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||||||    
T  28289257 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttata 28289333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 273
Target Start/End: Original strand, 25603406 - 25603535
Alignment:
Q  146 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-ttaagatgttgatg 243  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||  | || ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  25603406 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25603505  T
Q  244 atgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25603506 ttgatgttccaaattattggactatttaag 25603535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 273
Target Start/End: Original strand, 25611744 - 25611873
Alignment:
Q  146 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-ttaagatgttgatg 243  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||  | || ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  25611744 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25611843  T
Q  244 atgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611844 ttgatgttccaaattattggactatttaag 25611873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333338
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394078
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27394078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 28496414 - 28496575
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  28496414 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 28496509  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496510 gatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 29808825 - 29808986
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  29808825 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 29808920  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808921 gatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Original strand, 9098473 - 9098620
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgt- 180  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||    ||| || ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||   | ||||| ||||||      
T  9098473 atataattatatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcc 9098570  T
Q  181 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098571 tttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 266
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080862
Alignment:
Q  197 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaa------gatgatgatgttccaaattattggact 22080862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 265
Target Start/End: Original strand, 16965378 - 16965451
Alignment:
Q  192 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggac 265  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16965378 tgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgttccaaattattggac 16965451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 19847890 - 19847931
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847890 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 19847931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 17377770 - 17377814
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 45  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377770 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19668488 - 19668386
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | ||||| | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668488 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T
Q  226 ttga 229  Q
    ||||    
T  19668389 ttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35245684 - 35245569
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||      |||    
T  35245684 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gat 35245594  T
Q  243 gatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35245593 gatgatgttccaaattattggacta 35245569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1561483 - 1561304
Alignment:
Q  62 atttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  1561483 atttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatc 1561388  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    ||| || ||| | |||||   | | ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  1561387 atgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 1561304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 261
Target Start/End: Original strand, 16929658 - 16929727
Alignment:
Q  192 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattatt 261  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16929658 tgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgttccaaattatt 16929727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18696670 - 18696617
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18696670 atttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 18696617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19652248 - 19652184
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  19652248 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattgga 19652184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 273
Target Start/End: Original strand, 4185880 - 4185962
Alignment:
Q  183 tgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4185880 tgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat---------gatgacgatgttccaaattattggactatttaag 4185962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185524
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831486
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      | || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct------actatgttgaagatgatgatgttccaaattattggacta 22831486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 273
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738698
Alignment:
Q  192 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat---------gatgacgatgttccaaattattggactatttaag 4738698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 267
Target Start/End: Original strand, 16920698 - 16920768
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||      ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16920698 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattgttggacta 16920768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23076915 - 23076862
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23076915 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 23076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 271
Target Start/End: Original strand, 31155504 - 31155536
Alignment:
Q  239 tgatgatgatgttccaaattattggactattta 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31155504 tgatgatgatgttccaaattattggactattta 31155536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 1598297 - 1598266
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598297 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Original strand, 15041542 - 15041644
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||  | || | || |||||||||||||||| |||||||    
T  15041542 tgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatga 15041641  T
Q  215 gtc 217  Q
    |||    
T  15041642 gtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18706488 - 18706435
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18706488 atttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatat 18706435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Original strand, 18896253 - 18896306
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18896253 atttaatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatat 18896306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 35008333 - 35008280
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35008333 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatat 35008280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 94)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13544265 - 13543993
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13544265 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 13544166  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13544165 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttattta 13544066  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544065 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaag 13543993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12567800 - 12567528
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12567800 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 12567701  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12567700 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttattta 12567601  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567600 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgtttatgatgttccaaattattggactatttaag 12567528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34159566 - 34159300
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159566 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 34159467  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159466 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 34159367  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  34159366 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 34159300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 55476731 - 55476465
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476731 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 55476632  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476631 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 55476532  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  55476531 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 55476465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 16454203 - 16454469
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454203 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 16454302  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454303 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 16454402  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  16454403 actaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 16454469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17463418 - 17463152
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17463418 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 17463319  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463318 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 17463219  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  17463218 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 17463152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 45606829 - 45607095
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45606829 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 45606928  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606929 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 45607028  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  45607029 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 45607095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 13154177 - 13154444
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154177 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 13154276  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154277 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 13154376  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13154377 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 13154444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 7781269 - 7781535
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7781269 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 7781368  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781369 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 7781468  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  7781469 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 7781535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 28848533 - 28848799
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28848533 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcat 28848632  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848633 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 28848732  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  28848733 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 28848799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 6469056 - 6469322
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6469056 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 6469155  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469156 tacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 6469255  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  6469256 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 6469322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8899334 - 8899068
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8899334 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 8899235  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899234 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 8899135  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  8899134 actaagctgcatgagtcggtctaaattgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 8899068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 10247645 - 10247881
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10247645 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 10247744  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10247745 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttattta 10247844  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10247845 actaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 10247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 16282733 - 16282969
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16282733 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 16282832  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282833 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 16282932  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282933 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16282969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 38961813 - 38962079
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38961813 atattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 38961912  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961913 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 38962012  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  38962013 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------aatgatgaagttccaaattattggattatataag 38962079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 9707529 - 9707765
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9707529 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 9707628  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9707629 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 9707728  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707729 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 13151712 - 13151979
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151712 atattgtccatgcctgatgaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 13151811  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151812 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 13151911  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13151912 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 13151979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41124127 - 41123894
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41124127 atattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 41124028  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  41124027 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttattta 41123931  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123930 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41123894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 38 - 273
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446842
Alignment:
Q  38 tgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  138 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaa---- 17446808  T
Q  238 ttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  17446809 --gatgatgaagttccaaattattggattatataag 17446842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8499760 - 8499492
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8499760 atattgtccatgattaatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgca 8499661  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    |||  |  ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  8499660 ttaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatt 8499561  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  8499560 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 8499492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15412671 - 15412403
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  15412671 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgca 15412572  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    | |  |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  15412571 tcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatt 15412472  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15412471 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 15412403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 79 - 237
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172741
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  179 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172683 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29172741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242830
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672630
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17672630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119913
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 12119806  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||    
T  12119807 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattat 12119900  T
Q  261 tggactatttaag 273  Q
    |||| ||| ||||    
T  12119901 tggattatataag 12119913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27165492 - 27165224
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27165492 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgca 27165393  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttat 197  Q
     ||| | |||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||||| | | |||||| |||||||    
T  27165392 atacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttat 27165294  T
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  27165293 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 27165224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 225
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550625
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 110 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977519
Alignment:
Q  110 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  210 catgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatg 15977519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 53301426 - 53301695
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |    
T  53301426 atattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgta 53301525  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgtta 196  Q
     ||| |||||||||| |||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  53301526 atacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgtta 53301624  T
Q  197 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  53301625 tttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 53301695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500916
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  230 ttaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  55500953 ttaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 55500916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972831
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 14972831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213864
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| || |||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  179 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 40213864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487833
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 17487833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499315
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 17499315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36166715 - 36166602
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166715 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 36166617  T
Q  223 aagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  36166616 aagttgattaagatg 36166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21618566 - 21618459
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618566 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 21618468  T
Q  223 aagttgatt 231  Q
    |||||||||    
T  21618467 aagttgatt 21618459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476529
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  179 -gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 25476529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26687053 - 26686864
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||   ||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687053 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26686954  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26686953 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaa------gatgatgatgttccaaattattggactatataag 26686864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42386576 - 42386428
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42386576 tgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatact 42386477  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386476 gcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43841098 - 43840909
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841098 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 43840999  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43840998 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaa------gataatgatgttccaaattattggattatataag 43840909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46822501 - 46822236
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| | ||| ||||  || |       ||| |||||    
T  46822501 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaataa-gatgtgatacattgtt-------tatgtgcat 46822410  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||| |||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||    
T  46822409 tacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattt 46822310  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822309 aactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaag 46822236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 116 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12399338 - 12399192
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399338 tgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 12399239  T
Q  215 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399238 gtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 12399192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442251
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 13442251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083505
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||  ||| || |  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 23083505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10556989
Alignment:
Q  138 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 20698391 - 20698570
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20698391 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatact 20698489  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  20698490 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 20698570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438535
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 18438550  T
Q  229 attaagatgttgatg 243  Q
    || |||||| |||||    
T  18438549 atgaagatgatgatg 18438535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576939
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 24340672 - 24340863
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  24340672 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtg 24340770  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
     ||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  24340771 catactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaattattggactatt 24340863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494813
Alignment:
Q  142 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 44494813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153352
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||  |||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 24153262  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
       | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24153352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14572717 - 14572603
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||| || ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572717 tgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 14572619  T
Q  215 gtcggtctaagttgat 230  Q
    ||||||||||||||||    
T  14572618 gtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737240
Alignment:
Q  143 atttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424903
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 11424903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30029968 - 30029816
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| | || |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  30029968 tgaatatttaagacgttgt-gaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T
Q  215 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 268  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029869 gtcagtctaagttgaatgagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 30029816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 52523676 - 52523831
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||  ||| |||    
T  52523676 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactg-ttt 52523774  T
Q  171 tgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || ||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523775 tgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15977773 - 15977697
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15977773 atattgtccatgattgataaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttata 15977697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 54521062 - 54520986
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  54521062 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 54520986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511037
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  229 attaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12511072 attaagatgttgataatgatgttccaaattattgga 12511037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23274859 - 23274705
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  23274859 ttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttg 23274761  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
     ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274760 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 29544764 - 29544839
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttat 76  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  29544764 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 37642214 - 37642405
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  37642214 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 37642312  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
     ||||||  | |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  37642313 catactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaattattggactatt 37642405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15471085 - 15470911
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  15471085 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 15470988  T
Q  182 gtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  15470987 atgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------agatgatgatgttccaaattattggact 15470911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16097499 - 16097315
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| | ||| || ||| |    
T  16097499 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-g 16097402  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     ||| ||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097401 catattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 16097315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Original strand, 2051148 - 2051238
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  2051148 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 12305385 - 12305327
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 59  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305385 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 12305327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14234648 - 14234473
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  14234648 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 14234551  T
Q  182 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  14234550 atgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 14234473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 11913972 - 11914050
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11913972 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 11914050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16103950 - 16103767
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  16103950 ttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 16103854  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     ||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103853 catactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 16103767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 273
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578026
Alignment:
Q  188 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 45578026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 10557148 - 10557091
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557148 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 266
Target Start/End: Original strand, 12174212 - 12174393
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||  ||||||   ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  12174212 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 12174306  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174307 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 12174393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 170
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147571
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 125
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattg 125  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194697
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28194697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307681
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 216  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  217 cggtctaagttgattaagatgttg 240  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  32307704 cggtctaagttgatgatgatgttg 32307681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 243
Target Start/End: Original strand, 13210280 - 13210447
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || || ||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  13210280 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttaag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-g 13210374  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
     ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  13210375 catactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 13210447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 37251105 - 37251270
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37251105 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37251202  T
Q  161 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  ||| |||| |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251203 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43925977
Alignment:
Q  81 tgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | ||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctg-ttttatgtact 43926026  T
Q  179 g-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926025 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Original strand, 49668135 - 49668210
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668135 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc---------taagatgatgatgatgatgttccaaattattggact 49668210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9512982 - 9512907
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512982 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc---------taagatgatgatgatgatgttccaaattattggact 9512907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9520957 - 9520882
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520957 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc---------taagatgatgatgatgatgttccaaattattggact 9520882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 22110307 - 22110454
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 176  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||    |||||| | |||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||    
T  22110307 tgtgatataaatgtatacgcattacatgaattctatatga--tgttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgta 22110403  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110404 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 17444738 - 17444773
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444738 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665397
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 244  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14665397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15977700 - 15977667
Alignment:
Q  32 tatatatgatgttttaagatgttgattattattt 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977700 tatatatgatgttttaagatgttgattattattt 15977667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Original strand, 23318653 - 23318706
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23318653 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 23318706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 856197 - 856143
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  856197 tgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 856143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Original strand, 3389999 - 3390053
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  3389999 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 3390053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14668611 - 14668553
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 244  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14668611 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14668553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 237
Target Start/End: Original strand, 23077537 - 23077591
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  23077537 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 23077591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Original strand, 1644733 - 1644790
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1644733 tgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatgttg 1644790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 73)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 32214843 - 32215115
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32214843 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 32214942  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32214943 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttattta 32215042  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215043 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 32215115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23131102 - 23130836
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131102 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 23131003  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131002 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 23130903  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23130902 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 23130836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23133569 - 23133303
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133569 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 23133470  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133469 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 23133370  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23133369 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 23133303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 34402444 - 34402710
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402444 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 34402543  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402544 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 34402643  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  34402644 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 34402710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18809183 - 18808917
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18809183 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 18809084  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809083 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 18808984  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  18808983 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 18808917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 23709454 - 23709720
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23709454 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 23709553  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709554 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 23709653  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23709654 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 23709720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 23711935 - 23712201
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23711935 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 23712034  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712035 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 23712134  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23712135 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 23712201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39682553 - 39682287
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39682553 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 39682454  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682453 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 39682354  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  39682353 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 39682287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 24898117 - 24898384
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898117 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24898216  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898217 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24898316  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24898317 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24898384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 24900600 - 24900867
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900600 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24900699  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900700 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24900799  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24900800 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24900867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 24903077 - 24903344
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903077 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24903176  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903177 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24903276  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24903277 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24903344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 24905554 - 24905821
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905554 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24905653  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905654 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24905753  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24905754 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24905821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 24908029 - 24908296
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908029 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 24908128  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908129 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24908228  T
Q  201 act-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24908229 actaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24908296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6726235 - 6725999
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6726235 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 6726136  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726135 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 6726036  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726035 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6725999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 21154982 - 21155218
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21154982 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 21155081  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155082 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 21155181  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155182 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21155218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 571637 - 571371
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  571637 atattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 571538  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571537 tacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 571438  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  571437 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 571371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23135830 - 23135564
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23135830 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcat 23135731  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135730 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 23135631  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23135630 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 23135564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26505619 - 26505353
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505619 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 26505520  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26505519 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 26505420  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26505419 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 26505353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26508097 - 26507831
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508097 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 26507998  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26507997 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 26507898  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26507897 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 26507831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28577339 - 28577073
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28577339 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 28577240  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28577239 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttattta 28577140  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  28577139 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 28577073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24368014 - 24367748
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24368014 atattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24367915  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367914 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24367815  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24367814 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------aatgatgaagttccaaattattggattatataag 24367748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 32039420 - 32039686
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32039420 atattgtccatgatcgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 32039519  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32039520 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttattta 32039619  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  32039620 actaagctgcatgagccggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 32039686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22105653 - 22105416
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22105653 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 22105554  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  22105553 tacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttattt 22105454  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105453 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22105416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45030042
Alignment:
Q  9 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaa 45029883  T
Q  109 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45029884 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagct 45029983  T
Q  209 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  45029984 gcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 45030042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38967614 - 38967378
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38967614 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcat 38967516  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  38967515 taattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttattt 38967416  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967415 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38967378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 71 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43137469 - 43137303
Alignment:
Q  71 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43137469 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 43137370  T
Q  171 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137369 tgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 43137303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 24529511 - 24529717
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24529511 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtc 24529610  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||    
T  24529611 atgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattat 24529704  T
Q  261 tggactatttaag 273  Q
    |||| ||| ||||    
T  24529705 tggattatataag 24529717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 24642776 - 24642933
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24642776 atattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 24642875  T
Q  99 attacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642876 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337116
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22337116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060514
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23060514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076443
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatg 23076443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25616421 - 25616156
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| | ||| ||||  ||||       ||| |||||    
T  25616421 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaataa-gatgtgatacattgat-------tatgtgcat 25616330  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||| |||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||| ||||    
T  25616329 tacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaattt 25616230  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616229 aactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttaataatgatgttccaaattattggactatttaag 25616156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19672007 - 19671811
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  19672007 atgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 19671909  T
Q  167 tttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     ||||| ||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||      ||||||||||||||||||||    
T  19671908 -ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaattattgga 19671816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731378
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 22731378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738323
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  179 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 22738323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285848
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||  | || |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatact 23285932  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 23285848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 237
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643108
Alignment:
Q  163 gctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24643108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38252
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatg 38228  T
Q  244 atgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  38229 atgatgttccaaattattggacta 38252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 237
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298929
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  179 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 298929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660000
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatact 23660090  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 23660000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654524
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 23654524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 23708568 - 23708752
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| |    
T  23708568 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-g 23708666  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     ||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  23708667 catactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aa------gatgatgatgttccaaattattgga 23708752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20261459 - 20261383
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  20261459 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 20261383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 7670 - 7835
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  7670 atttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 7769  T
Q  161 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7770 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 267
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040327
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 23040327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7679647 - 7679567
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg--gatgatgttccaaattattgga 7679567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 267
Target Start/End: Original strand, 23103389 - 23103533
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23103389 tgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatga 23103486  T
Q  215 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||| || | ||      ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23103487 gtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaaatattggacta 23103533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134346
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtcta---tgatgatgatgatgatgatgatgttccaaattattggact 22134346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 118
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtga 118  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 23707244 - 23707322
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23707244 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 23707322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24918275 - 24918197
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24918275 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 24918197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28406137 - 28405990
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||   ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  28406137 atataattgtatatacattttatgaattaa--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcct 28406040  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28406039 atgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20309221 - 20309089
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20309221 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 20309125  T
Q  228 gattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
    | | ||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309124 gttgaa------gatgatgatgttccaaattattggactatt 20309089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791357
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatc 23791360  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  23791359 atg 23791357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23207461 - 23207296
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23207461 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttat-aat-gttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatc 23207364  T
Q  161 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  ||| |||| |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207363 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8946718 - 8946658
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8946718 tgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8946658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 10684685 - 10684763
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  10684685 atattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 10684763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24671160 - 24671082
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  24671160 atattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 24671082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 24697543 - 24697644
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  24697543 attttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaa-gtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  24697642 atg 24697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25176010 - 25175837
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  25176010 atataattatatatacgttatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 25175914  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175913 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 25175837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 20520148 - 20520295
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||    
T  20520148 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgta 20520244  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520245 ctgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24681579 - 24681501
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| || |||| |||||||||||    
T  24681579 atattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgtttaagttgatgttgatcatcatttgatgttgttata 24681501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 229
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Original strand, 23071892 - 23072084
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||| ||| ||  ||| ||||||||||| ||||    
T  23071892 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgctgatttatattcgatattattatatcat 23071987  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    | || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||      |||||||||||||||||||||    
T  23071988 gatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattat 23072080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Original strand, 32451894 - 32452031
Alignment:
Q  90 tgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttg 187  Q
    |||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||  | |||||    
T  32451894 tgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttg 32451992  T
Q  188 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451993 ctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 24529469 - 24529510
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24529469 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtgtatatgatg 24529510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 151
Target Start/End: Original strand, 22413073 - 22413161
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatat 151  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22413073 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatat 22413161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 25109052 - 25109019
Alignment:
Q  81 tgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25109052 tgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 25109019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23004905 - 23004838
Alignment:
Q  89 ttgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 157  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23004905 ttgtatatgcattatgtggattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattat 23004838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcatta 102  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22001993 - 22001727
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001993 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 22001894  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001893 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 22001794  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  22001793 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 22001727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1484642 - 1484376
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1484642 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 1484543  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484542 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 1484443  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  1484442 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 1484376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 5853214 - 5853480
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5853214 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 5853313  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853314 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 5853413  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  5853414 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 5853480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20403467 - 20403201
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20403467 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 20403368  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403367 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 20403268  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20403267 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 20403201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4483520 - 4483255
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483520 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 4483421  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4483420 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-tta 4483322  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  4483321 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 4483255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 14409366 - 14409632
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14409366 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 14409465  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14409466 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 14409565  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  14409566 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 14409632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 4542295 - 4542561
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542295 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 4542394  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4542395 tacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttattta 4542494  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  4542495 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 4542561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 15203153 - 15203419
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203153 atattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 15203252  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203253 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 15203352  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15203353 actaagctgcatgagtcgctctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 15203419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 20046117 - 20046383
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20046117 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 20046216  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046217 tacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 20046316  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20046317 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 20046383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 16413238 - 16413476
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16413238 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 16413337  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16413338 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 16413437  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413438 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 16413476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 45290616 - 45290857
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45290616 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcat 45290715  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45290716 taattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttattt 45290815  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290816 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 45290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19896509 - 19896239
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttt-aagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19896509 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 19896410  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta---ttatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19896409 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgtta 19896310  T
Q  197 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19896309 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 19896239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14824015 - 14823748
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgc 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14824015 atattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 14823916  T
Q  99 attacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14823915 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatt 14823816  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  14823815 taactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 14823748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 19936925 - 19937164
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  19936925 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgc 19937024  T
Q  99 attacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 197  Q
    |||   |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19937025 attgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttat 19937124  T
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19937125 ttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598162
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattatt 261  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattatt 41598174  T
Q  262 ggactatttaag 273  Q
    ||| ||| ||||    
T  41598173 ggattatataag 41598162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15070800 - 15070571
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  15070800 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgca 15070701  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    | |  |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  15070700 tcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatt 15070601  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070600 taactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223890
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26223999  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattatt 261  Q
    |||| |||||||||| || | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26223998 tgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgat---gatgttccaaattatt 26223902  T
Q  262 ggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||    
T  26223901 ggactatttaag 26223890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Original strand, 19801370 - 19801527
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg 166  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19801370 atgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg 19801469  T
Q  167 tttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801470 -ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484426
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatg 25484426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 24485966 - 24486093
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24485966 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24486065  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgaga 128  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24486066 tacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092462
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| | ||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16092462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 32810171 - 32810054
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32810171 atattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 32810072  T
Q  101 tacatgaattatatgtga 118  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  32810071 tacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649192
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| ||||||||   || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg--tttccaaattattggattatataag 28649192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759259
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||  ||||||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6759259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 18818364 - 18818553
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818364 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18818463  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18818464 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 18818553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7372931 - 7372755
Alignment:
Q  92 tatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg 190  Q
    |||| ||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  7372931 tataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 7372832  T
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7372831 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 7372755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875042
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22875132  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggactatataag 22875042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32121968 - 32121703
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| | ||| ||||  || |       ||| |||||    
T  32121968 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaataa-gatgtgatacattgtt-------tatgtgcat 32121877  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||| |||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||    
T  32121876 tacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattt 32121777  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121776 aactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaag 32121703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 26225292 - 26225405
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225292 ttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 26225390  T
Q  223 aagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  26225391 aagttgattaagatg 26225405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536209
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20536209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 21918955 - 21919135
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattat-atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 177  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  || || |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918955 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 21919053  T
Q  178 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  21919054 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 21919135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 18677987 - 18678252
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| | ||| ||||  || |       ||| |||||    
T  18677987 atattatccatgattgatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaataa-gatgtgatacattgtt-------tatgtgcat 18678078  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||| |||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||    
T  18678079 tacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattt 18678178  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18678179 aactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaag 18678252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 273
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924072
Alignment:
Q  96 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 194  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  195 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatgtaag 21924072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406356
Alignment:
Q  132 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23406393  T
Q  231 taagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
     ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23406392 gaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 23406356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26219834 - 26219691
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219834 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 26219736  T
Q  223 aagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||      ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  26219735 aagttgatta------tgatgatgaagttccaaagtattggattatataag 26219691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23648682 - 23648524
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||| || ||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||  | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  23648682 tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatga 23648583  T
Q  215 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23648582 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatataag 23648524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626737
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22626803  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22626737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 13597566 - 13597757
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  13597566 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttg 13597664  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
     || ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||      ||| |||||||||||||||||||||    
T  13597665 cattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgacgttccaaattattggactatt 13597757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 13508034 - 13508225
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  13508034 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtg 13508132  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
     ||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||      ||| |||||||||||||||||||||    
T  13508133 catattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgacgttccaaattattggactatt 13508225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879375
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 18879375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612250
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 17612157  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
     ||||||  | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaattattggactatt 17612250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31971421 - 31971240
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31971421 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 31971324  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971323 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 31971240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855386
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 38855386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20498734 - 20498581
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||     
T  20498734 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-atttta 20498636  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
     ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498635 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21285758 - 21285606
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||  |    
T  21285758 atataattgtatatacattacatgaactatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcct 21285661  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 235  Q
     ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21285660 atgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6520528 - 6520354
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  6520528 atataattgtatatacattacatgaattat--gttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6520432  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  6520431 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 6520354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 38550033 - 38550090
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550033 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131134
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||      ||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatg 45131110  T
Q  244 atgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45131111 atgatgttccaaattattggacta 45131134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 5866217 - 5866412
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  5866217 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 5866312  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||      |||||||||||||||||||||    
T  5866313 gatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattat 5866405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116366
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T
Q  161 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  ||| |||| | |||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116433 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199782
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||      |||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gat 16199757  T
Q  243 gatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16199758 gatgatgttccaaattattggacta 16199782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17141094 - 17140902
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||| ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  17141094 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgatgatttacattcgatattattatgtcat 17140999  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    | ||  || | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||    
T  17140998 gatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattat 17140906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21491173 - 21490996
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || ||||  |||||||||| ||||    
T  21491173 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcat 21491078  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21491077 gatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21490996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 1326959 - 1327041
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttata------tgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1326959 atattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgagatgttgattattatttgatgttgttata 1327041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 17439443 - 17439544
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  17439443 atttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17439541  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  17439542 atg 17439544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21249563 - 21249370
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  21249563 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 21249468  T
Q  163 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtt--atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaatta 259  Q
    | ||  || | |||||| || ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||    
T  21249467 gatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaatta 21249375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21255401 - 21255208
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  21255401 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 21255306  T
Q  163 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtt--atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaatta 259  Q
    | ||  || | |||||| || ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||    
T  21255305 gatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaatta 21255213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 268
Target Start/End: Original strand, 21389458 - 21389589
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21389554  T
Q  228 gattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 268  Q
    | | ||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389555 gttgaa------gatgatgatgttccaaattattggactat 21389589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 268
Target Start/End: Original strand, 21778784 - 21778915
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21778784 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21778880  T
Q  228 gattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 268  Q
    | | ||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778881 gttgaa------gatgatgatgttccaaattattggactat 21778915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 17266930 - 17267031
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  17266930 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  17267029 atg 17267031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Original strand, 23760805 - 23760978
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||| |||  ||||| |||| ||||| || |||   ||||||  |    
T  23760805 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttac-atactgcct 23760901  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  23760902 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------agatgatgatgttccaaattattggact 23760978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 27472339 - 27472395
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472339 atattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 983347 - 983512
Alignment:
Q  66 aatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 164  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||    ||| || |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||     
T  983347 aatgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatga 983444  T
Q  165 tgtt-tttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
      || |||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983445 acttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 16401952 - 16401996
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 45  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16401952 atattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttt 16401996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 20982649 - 20982710
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgt----tatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20982649 atattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagatgttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 268
Target Start/End: Original strand, 21395988 - 21396119
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21396084  T
Q  228 gattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 268  Q
    | | ||      ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21396085 gttgaa------gatgatgatgttccacattattggactat 21396119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 268
Target Start/End: Original strand, 21790481 - 21790612
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21790577  T
Q  228 gattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 268  Q
    | | ||      ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21790578 gttgaa------gatgatgatgttccacattattggactat 21790612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 266
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355832
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 26355832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21673864 - 21673718
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||  |    
T  21673864 atataattgtatatacattaaataaattatat-tga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 21673768  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
     ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21673767 atgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 37515888 - 37515835
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37515888 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 37515835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Original strand, 14103163 - 14103215
Alignment:
Q  63 tttaatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14103163 tttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatat 14103215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22364826 - 22364745
Alignment:
Q  80 gtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| || | ||||||||| |||| |||||    
T  22364826 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatcatg 22364745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 77
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026894
Alignment:
Q  32 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttata 35026894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 86)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 14949044 - 14949310
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949044 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 14949143  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949144 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 14949243  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  14949244 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 14949310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 456561 - 456295
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  456561 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 456462  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456461 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 456362  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  456361 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 456295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 15376635 - 15376901
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15376635 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 15376734  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376735 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 15376834  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15376835 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 15376901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16232760 - 16232494
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16232760 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 16232661  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232660 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 16232561  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  16232560 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 16232494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 20385045 - 20385311
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20385045 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 20385144  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385145 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 20385244  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20385245 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 20385311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 21189517 - 21189783
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21189517 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 21189616  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189617 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 21189716  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  21189717 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 21189783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32125731 - 32125465
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32125731 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 32125632  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125631 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 32125532  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  32125531 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 32125465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41523157 - 41522891
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41523157 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 41523058  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523057 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 41522958  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  41522957 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 41522891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41525619 - 41525353
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41525619 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 41525520  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525519 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 41525420  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  41525419 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 41525353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 11393209 - 11393445
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11393209 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 11393308  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393309 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 11393408  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393409 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11393445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18430952 - 18430684
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430952 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 18430853  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430852 tacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttattta 18430753  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagtg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18430752 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataagtg 18430684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16410299 - 16410033
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16410299 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtat 16410200  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410199 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 16410100  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  16410099 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 16410033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18640512 - 18640246
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18640512 atattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 18640413  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640412 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 18640313  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  18640312 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaaggtccaaattattggactatataag 18640246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27217100 - 27216834
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27217100 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 27217001  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217000 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 27216901  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  27216900 actaagctgcatgagttggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 27216834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24702478 - 24702212
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24702478 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24702379  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702378 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24702279  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24702278 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24702212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11972736 - 11972470
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11972736 atattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 11972637  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972636 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 11972537  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  11972536 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 11972470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24704925 - 24704662
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24704925 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 24704826  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704825 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 24704729  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24704728 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24704662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16213924 - 16213653
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16213924 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcat 16213825  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16213824 tacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 16213725  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagtgatg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16213724 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataagagatg 16213653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 92 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275139
Alignment:
Q  92 tatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  192 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgttccaaattattggactatttaag 24275139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 26355903 - 26356182
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgc 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26355903 atattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 26356002  T
Q  99 attacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-----------tgttgtgttg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           ||||||||||    
T  26356003 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttg 26356102  T
Q  188 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26356103 ttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 26356182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 26358355 - 26358634
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgc 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26358355 atattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 26358454  T
Q  99 attacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-----------tgttgtgttg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           ||||||||||    
T  26358455 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttg 26358554  T
Q  188 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26358555 ttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 26358634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13869588 - 13869320
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  13869588 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgca 13869489  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    | |  |  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  13869488 tcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatt 13869389  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13869388 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 13869320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116483
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattatt 261  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattatt 44116495  T
Q  262 ggactatttaag 273  Q
    ||| ||| ||||    
T  44116494 ggattatataag 44116483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 71 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3386503 - 3386337
Alignment:
Q  71 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3386503 tgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttt 3386404  T
Q  171 tgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386403 tgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3386337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647344
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062073
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061998 tgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17062073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 38898366 - 38898535
Alignment:
Q  69 gttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898366 gttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 38898465  T
Q  168 ttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38898466 ttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20110720 - 20110530
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110720 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctg 20110621  T
Q  167 tttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    ||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| |    
T  20110620 tttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggatt 20110537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756817
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 12756753  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756754 tgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 15081869 - 15082019
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15081869 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 15081968  T
Q  99 attacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttga 148  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15081969 attaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273396
Alignment:
Q  122 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  221 ctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatg 48273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831377
Alignment:
Q  115 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  215 gtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatg 13831377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 237
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564478
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13841252 - 13841157
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatat 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13841252 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698817
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 177  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  178 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 12698817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456556
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 18456466  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 18456556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509166
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 9509166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26211978
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaaga-----atgatgatgttccaaattattggacta 26211978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227482
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| | |||||  |||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 38227548  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatg 38227482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 14269984 - 14270060
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14269984 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 14270060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 2280068 - 2280225
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2280068 ttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttg 2280166  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     ||||||  | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280167 catactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 8468880 - 8468804
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8468880 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttata 8468804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144177
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 15144136  T
Q  223 aagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||          ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15144137 aagttga----------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 15144177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18627806 - 18627717
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataatt 90  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  18627806 atattttccgtgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589025
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T
Q  229 attaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
       ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  10589054 tcgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 10589025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 67904 - 67731
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||   ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  67904 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat--attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 67809  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  67808 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 67731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11303487 - 11303411
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  11303487 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 11303411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 16108611 - 16108687
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  16108611 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttata 16108687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 19486693 - 19486884
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  19486693 ttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 19486791  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
     ||||||  | |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  19486792 catactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaattattggactatt 19486884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16213653 - 16213599
Alignment:
Q  219 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213653 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 16213599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005660
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||||| ||    
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072914
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  221 ctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatg 22072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34200964 - 34200772
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  34200964 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 34200869  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||    
T  34200868 gatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattat 34200776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16056488 - 16056343
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| ||| |    
T  16056488 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtct 16056392  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16056391 atgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 47831968 - 47831793
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || | | | ||||||| |    
T  47831968 atataattgtatatacattatatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtct 47831871  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  47831870 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 47831793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 8940414 - 8940336
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8940414 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 8940336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16495581 - 16495388
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  16495581 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 16495486  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaatta 259  Q
    || || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||||||||    
T  16495485 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaatta 16495393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 38898150 - 38898228
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  38898150 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 38898228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15211515 - 15211433
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-ttaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15211515 tgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgttccaaattattggacta 15211433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Original strand, 16386268 - 16386386
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 242  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      |||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gat 16386361  T
Q  243 gatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16386362 gatgatgttccaaattattggacta 16386386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 23664875 - 23664951
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  23664875 atattgtcaatgattgatgaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 23664951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Original strand, 811091 - 811265
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||  ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  811091 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 811188  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  811189 atgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 811265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 1867932 - 1868101
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||| | ||||| |||||||| |||| ||    
T  1867932 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatc 1868029  T
Q  161 at--gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    ||  |||| |||| |||||||  | ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868030 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 222
Target Start/End: Original strand, 12255740 - 12255892
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg-ctgttttt 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||| || || ||||||||||| |||| |||||  |   |||    
T  12255740 ttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgattt 12255839  T
Q  172 gtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    | ||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255840 gcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Original strand, 16219677 - 16219823
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  || ||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  16219677 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 16219774  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16219775 atgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 40443555 - 40443374
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  40443555 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttact 40443459  T
Q  179 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||      ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40443458 gcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatattccaaattattggacta 40443374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 28505357 - 28505433
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  28505357 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 28505433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29796850 - 29796772
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  29796850 atattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 29796772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29800669 - 29800591
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  29800669 atattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 29800591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014165
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 44014165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 10063772 - 10063958
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  10063772 ttataatgtgatataattgtatatg--tt---tgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatg-ttgtg 10063865  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
     |||| |  | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||| |||      |||||||||||||||||||||||||    
T  10063866 cataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgt------tgatgttccaaattattggactatt 10063958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 45847683 - 45847739
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45847683 atattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220225
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Original strand, 15754828 - 15755007
Alignment:
Q  62 atttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  15754828 atttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatc 15754923  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    ||| || ||| | |||||   | | ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  15754924 atgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 237
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154955
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 18154955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 267
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996165
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 11996165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 14932749 - 14932848
Alignment:
Q  139 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14932749 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 15356184 - 15356283
Alignment:
Q  139 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15356184 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 15360298 - 15360397
Alignment:
Q  139 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15360298 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 267
Target Start/End: Original strand, 27847901 - 27847968
Alignment:
Q  194 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847901 ttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 27847968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14044792 - 14044761
Alignment:
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044792 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14354822 - 14354791
Alignment:
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354822 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 244
Target Start/End: Original strand, 2832504 - 2832562
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 244  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  2832504 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 2832562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008536
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||  |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  15008534 atg 15008536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39363624 - 39363358
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363624 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 39363525  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363524 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 39363425  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  39363424 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 39363358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 264690 - 264956
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  264690 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 264789  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264790 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 264889  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  264890 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 264956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20909252 - 20908986
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909252 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 20909153  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20909152 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttattta 20909053  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20909052 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 20908986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 42245287 - 42245553
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245287 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 42245386  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245387 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 42245486  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  42245487 actaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 42245553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Original strand, 10732865 - 10733128
Alignment:
Q  4 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10732865 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattac 10732964  T
Q  104 atgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 203  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732965 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 10733064  T
Q  204 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  10733065 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 10733128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29346220 - 29345954
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29346220 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29346121  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29346120 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttattta 29346021  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  29346020 actaagctgtatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 29345954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29348693 - 29348427
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29348693 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29348594  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29348593 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttattta 29348494  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  29348493 actaagctgtatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 29348427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29351166 - 29350900
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29351166 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29351067  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29351066 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttattta 29350967  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  29350966 actaagctgtatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 29350900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39245376 - 39245110
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39245376 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcat 39245277  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245276 tacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 39245177  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  39245176 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 39245110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32027633 - 32027367
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32027633 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 32027534  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32027533 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttattta 32027434  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  32027433 actaagttgtatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 32027367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29330171 - 29329938
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29330171 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatg---attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29330075  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330074 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 29329975  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329974 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 20917877 - 20918106
Alignment:
Q  4 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  20917877 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttac 20917976  T
Q  104 atgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 203  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917977 ttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgact----ttttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 20918072  T
Q  204 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918073 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38619676 - 38619438
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  38619676 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgca 38619577  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    | |  |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  38619576 tcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatt 38619477  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619476 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38619438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23064753 - 23064515
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  23064753 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgca 23064654  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 198  Q
    | |  |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  23064653 tcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatt 23064554  T
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064553 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23064515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 67 - 273
Target Start/End: Original strand, 11581187 - 11581387
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11581187 atgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttg 11581286  T
Q  167 tttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| |    
T  11581287 tttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggatt 11581380  T
Q  267 atttaag 273  Q
    || ||||    
T  11581381 atataag 11581387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 20901991 - 20902198
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20901991 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 20902090  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatgatgatgttccaaatta 259  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||| |||||||||||    
T  20902091 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaa------gatgatgaagttccaaatta 20902184  T
Q  260 ttggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||    
T  20902185 ttggactatttaag 20902198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 2154596 - 2154802
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2154596 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtc 2154695  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||    
T  2154696 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattat 2154789  T
Q  261 tggactatttaag 273  Q
    |||| ||| ||||    
T  2154790 tggattatataag 2154802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154938
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36154938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 237
Target Start/End: Original strand, 18319020 - 18319192
Alignment:
Q  66 aatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319020 aatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgc 18319119  T
Q  165 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18319120 tgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 18319192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067111
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  166 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatg 24067111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 273
Target Start/End: Original strand, 10775670 - 10775864
Alignment:
Q  74 tatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10775670 tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggtttta 10775769  T
Q  173 tatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaa 272  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  10775770 tatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataa 10775863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061072
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 31061149  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061148 atgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31061072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390640
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 23390640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096468
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatg 1096468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077929
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 9077929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421533
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25421533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729202
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 21729202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808527
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 21808527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 273
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997678
Alignment:
Q  137 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa-- 21997644  T
Q  236 tgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
        ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21997645 ----gatgatgatgttccaaattattggattatataag 21997678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529197
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 217  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  218 ggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||| ||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 24529197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 17517086 - 17517351
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| | ||| ||||  || |       ||| |||||    
T  17517086 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaataa-gatgtgatacattgtt-------tatgtgcat 17517177  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||| |||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| ||||||||     
T  17517178 tacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatta 17517277  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17517278 aactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgtttcaaattattggactatttaag 17517351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493570
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| ||||| || |||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 24493570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286981
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatac 177  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  || | ||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  178 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattactggacta 8286981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431414
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 224  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075001
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaaga-----atgatgatgttccaaattattggacta 22075001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22412305 - 22412161
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22412305 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtc 22412207  T
Q  222 taagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  22412206 taagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 22412161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025312
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| | |||||  |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13025378  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13025312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095496
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| | |||||  |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13095562  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13095496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 22144117  T
Q  179 -gttgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
       | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21565713 - 21565529
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  21565713 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg 21565615  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565614 -atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 21565529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 186
Target Start/End: Original strand, 20766119 - 20766181
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtt 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766119 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40726025 - 40725834
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  40726025 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ctttg 40725927  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
     ||||||  |  ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  40725926 catactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaattattggactatt 40725834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 21329457 - 21329617
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||| ||| |||||| |||| | ||| || ||| | ||||||  |    
T  21329457 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcct 21329554  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21329555 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 21329617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 21502116 - 21502276
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  || ||| | || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||  |    
T  21502116 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcct 21502213  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
     |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21502214 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 21502276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 225
Target Start/End: Original strand, 20026879 - 20027043
Alignment:
Q  63 tttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20026879 tttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatca 20026976  T
Q  162 tg--ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||  ||||||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026977 tgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293107
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||      ||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaa------gatg 21293083  T
Q  244 atgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21293084 atgatgttccaaattattggacta 21293107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 9776598 - 9776522
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  9776598 atattgtcaatgattggtgaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 9776522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 37804825 - 37804901
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  37804825 atattgtcaatgattaatgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttata 37804901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Original strand, 22959495 - 22959666
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  22959495 atataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 22959589  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959590 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 22959666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Original strand, 26011995 - 26012168
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  26011995 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcct 26012092  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  26012093 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aa------gatgatgatgttccaaattattgga 26012168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723906
Alignment:
Q  96 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgt-tg 193  Q
    |||||||| ||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||  | ||||||||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  194 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgttga 37723906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Original strand, 22178162 - 22178323
Alignment:
Q  67 atgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--g 163  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||  |    
T  22178162 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgag 22178260  T
Q  164 ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||| |||| |||||||  | ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178261 ctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660970
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 19660970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 237
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806900
Alignment:
Q  182 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 20806900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19669066 - 19668882
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || |||| | ||| || |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||| ||| | || ||| |    
T  19669066 ttataatgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgattt-g 19668972  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668971 catactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagtt------gatgatgatgatgatgttccaaattattggact 19668882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 20901949 - 20901990
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901949 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 20901990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  146 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttattt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314563
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 36314563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 42
Target Start/End: Original strand, 2154558 - 2154595
Alignment:
Q  5 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154558 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 2154595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704078
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26704078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973811
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26973811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 225
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 36314730 - 36314685
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatga 107  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36314730 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatga 36314685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 71)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 19618094 - 19618366
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19618094 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 19618193  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19618194 tacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 19618293  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19618294 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgttccaaactattggactatttaag 19618366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 15118274 - 15118540
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15118274 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 15118373  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118374 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 15118473  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15118474 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 15118540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44615528 - 44615262
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615528 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 44615429  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615428 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 44615329  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  44615328 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 44615262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 12229 - 12495
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12229 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 12328  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12329 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 12428  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  12429 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 12495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 18239341 - 18239607
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18239341 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcat 18239440  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18239441 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttattta 18239540  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  18239541 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 18239607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 50222261 - 50222527
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222261 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcat 50222360  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50222361 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttattta 50222460  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  50222461 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 50222527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 52312750 - 52312484
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52312750 atattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 52312651  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312650 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 52312551  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  52312550 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 52312484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 14970629 - 14970901
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  14970629 atattgttcataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtat 14970728  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  14970729 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttattta 14970828  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970829 actaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 14970901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 18215196 - 18215432
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18215196 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 18215295  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18215296 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 18215395  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215396 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 1837431 - 1837697
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1837431 atattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcat 1837530  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837531 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 1837630  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  1837631 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 1837697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 15355246 - 15355487
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15355246 atattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 15355345  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15355346 taattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttattt 15355445  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355446 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 15355487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 44773005 - 44773275
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat----gatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatat 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44773005 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 44773104  T
Q  97 gcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 196  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773105 gcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 44773204  T
Q  197 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  44773205 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 44773275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3515247 - 3515011
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3515247 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 3515148  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3515147 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtttttta 3515048  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515047 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3515011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19242940 - 19242703
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  19242940 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgca 19242841  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19242840 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttattt 19242741  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242740 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19242703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803423
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23803423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464026
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 51464026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 7641139 - 7641370
Alignment:
Q  26 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattg 125  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7641139 tatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattg 7641238  T
Q  126 agacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641239 agacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt----------ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7641328  T
Q  226 ttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  7641329 ttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 7641370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102218
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 44102294  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102293 tgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610954
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttt-------tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12610954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 73 - 273
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929068
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactattta 271  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatata 44929066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 62 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402684
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15402787  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||      |||||||||||||||    
T  15402786 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgtt------gatgttccaaattat 15402693  T
Q  261 tggactatt 269  Q
    |||||||||    
T  15402692 tggactatt 15402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367673
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15367774  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||      |||||||||||||||    
T  15367773 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgtt------gatgttccaaattat 15367680  T
Q  261 tggacta 267  Q
    |||||||    
T  15367679 tggacta 15367673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 62 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371183
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15371286  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||      |||||||||||||||    
T  15371285 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgtt------gatgttccaaattat 15371192  T
Q  261 tggactatt 269  Q
    |||||||||    
T  15371191 tggactatt 15371183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtca 21815667  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815668 tgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373484
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15373567  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15373566 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15369999
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15370102  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||      |||||||||||||||    
T  15370101 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgtt------gatgttccaaattat 15370008  T
Q  261 tggactatt 269  Q
    |||||||||    
T  15370007 tggactatt 15369999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16223710 - 16223515
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16223710 atgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgct 16223611  T
Q  166 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggac 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  16223610 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgtt------gatgttccaaattattggac 16223517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149833
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  166 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 20149833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 54798753 - 54798868
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54798753 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtc 54798852  T
Q  222 taagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  54798853 taagttgattaagatg 54798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280320
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  223 aagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagatg 14280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038655
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| |||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 236
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377634
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 236  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902740
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 12902740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088878
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7088878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7798940 - 7798775
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798940 tgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7798841  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7798840 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7798775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636437
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 242  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 273
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873511
Alignment:
Q  132 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  231 taagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
     ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52873475 gaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 52873511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893704
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7893704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22354016 - 22353852
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  22354016 atttattgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtca 22353917  T
Q  162 tgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || ||||  |  |  |||  | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22353916 tgttgttgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 8574868 - 8574981
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574868 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 8574966  T
Q  223 aagttgattaagatg 237  Q
    ||||| |||||||||    
T  8574967 aagttaattaagatg 8574981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270355
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 16270355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052806
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 44052806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 52873100 - 52873177
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatac 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52873100 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatac 52873177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 15496993 - 15497069
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15496993 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 15497069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 13783 - 13953
Alignment:
Q  57 ttattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 155  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  13783 ttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtt 13882  T
Q  156 atgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || ||||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883 atatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899892
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| | |||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatact 6899958  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6899892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 243
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240089
Alignment:
Q  81 tgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 179  Q
    |||||||||  ||| |||||||| | || ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  180 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
     | | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 16240089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 43198502 - 43198661
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg-ctgttttt 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||||  |  ||||    
T  43198502 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgtttt 43198601  T
Q  172 gtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    | ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198602 gcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 239
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374475
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 239  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatgtt 23374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 52243143 - 52243302
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||  |||  ||    
T  52243143 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactg-att 52243241  T
Q  171 tgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    || ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243242 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15534421 - 15534345
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  15534421 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 15534345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 36038110 - 36038034
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  36038110 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 36038034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 49547696 - 49547772
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  49547696 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttata 49547772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 362325 - 362268
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362325 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096294
Alignment:
Q  159 tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 3096294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14048817 - 14048741
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  14048817 atattgtcaatgattgatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 14048741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 14746539 - 14746617
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14746539 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 14746617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706423
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 39706423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 170
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  81 tgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 46640411 - 46640558
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    |||||| ||| |||| || ||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||    
T  46640411 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatata 46640507  T
Q  177 ctgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640508 ctgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 12288147 - 12288316
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||    ||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  12288147 atttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 12288244  T
Q  161 atg--ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |||  ||| ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288245 atgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 53082089 - 53082254
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  53082089 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 53082186  T
Q  161 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082187 atgaactg-ttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15551985 - 15551803
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || | || ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  15551985 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggatt-g 15551891  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  15551890 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 15551803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857608
Alignment:
Q  26 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 19857608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053439
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || || || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||      |||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaa------gat 14053414  T
Q  243 gatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14053415 gatgatgttccaaattattggacta 14053439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046470
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 17046470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774021
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 216  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  217 cggtctaagttgat 230  Q
    ||||||||||||||    
T  12774034 cggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846343
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 8846343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8846543 - 8846465
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 152  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  8846543 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 8846465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190481
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || |||  | |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17333338 - 17333298
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333338 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20987 - 20721
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20987 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 20888  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20887 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 20788  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20787 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 20721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38061 - 37795
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38061 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 37962  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37961 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 37862  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  37861 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 37795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 136920 - 136654
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136920 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 136821  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136820 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 136721  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  136720 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 136654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 139389 - 139123
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139389 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 139290  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139289 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 139190  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  139189 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 139123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 144327 - 144061
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144327 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 144228  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144227 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 144128  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  144127 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 144061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 134451 - 134185
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134451 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 134352  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134351 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 134252  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  134251 actaagctgcatgagtcggtctatgttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 134185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 141858 - 141592
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141858 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 141759  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141758 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 141659  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  141658 actaagctacatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 141592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132645
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 216  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || | ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  217 cggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    |||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  132685 cggtc---------taagatgatgatgatgatgttccaaattattggact 132645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 62355 - 62216
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||   |||||| |||||||||||  |||| |||||||  ||||||  |    
T  62355 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcct 62262  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62261 atgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 94651 - 94385
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  94651 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 94552  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94551 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 94452  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  94451 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 94385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 17362 - 17600
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17362 atattgttcatgattgatgaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcat 17461  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17462 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttattta 17561  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17562 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44458
Alignment:
Q  82 gatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgt 180  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  181 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100363
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  || |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattgga 100363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40308
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||  |    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  182 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 40308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119861
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 119861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 101552 - 101513
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  101552 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 101513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13989106 - 13988840
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13989106 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 13989007  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989006 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 13988907  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13988906 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 13988840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16362158 - 16361885
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  16362158 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgca 16362059  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16362058 ttacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttattt 16361959  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361958 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 16361885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 21923213 - 21923479
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21923213 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 21923312  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923313 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 21923412  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  21923413 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 21923479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21841007 - 21840736
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21841007 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 21840908  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21840907 tacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 21840808  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaa 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21840807 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataacaatgttccaaattattggactatttaa 21840736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 21475009 - 21475275
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21475009 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 21475108  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475109 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 21475208  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  21475209 actaagctgcatgagttggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 21475275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29776928 - 29776662
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29776928 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 29776829  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776828 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 29776729  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  29776728 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 29776662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29298376 - 29298141
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29298376 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcat 29298277  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298276 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 29298178  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298177 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29298141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31612553 - 31612287
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31612553 atattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 31612454  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31612453 tacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattta 31612354  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  31612353 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 31612287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 23593656 - 23593923
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23593656 atattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgca 23593755  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593756 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 23593855  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23593856 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 23593923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 22122989 - 22123256
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22122989 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 22123088  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctg-ttgttattt 199  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22123089 tacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctattt 22123188  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  22123189 aactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 22123256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 16275285 - 16275522
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16275285 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcat 16275384  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||    
T  16275385 taattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttattt 16275484  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16275485 aactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 16275522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 15859930 - 15860167
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15859930 atattgtccatggttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcat 15860029  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    |   |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15860030 tgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttattt 15860129  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15860130 aactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 15860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213050
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 13212943  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  13212944 atgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattat 13213037  T
Q  261 tggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||    
T  13213038 tggactatttaag 13213050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707171
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21707247  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707246 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21707171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711713
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21711789  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711788 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346935
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21347042  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||    
T  21347041 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattat 21346948  T
Q  261 tggactatttaag 273  Q
    |||| ||| ||||    
T  21346947 tggattatataag 21346935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 225
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574989
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342100
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21342177  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342176 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21342100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389158
Alignment:
Q  67 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  166 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatg 40389158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 433178 - 432986
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  433178 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttg 433079  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactattta 271  Q
    |||||||  ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  433078 tatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatata 432988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210361
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  || | ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg--tttccaaattattggattatataag 50210361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250867
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 27250867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509757
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 217  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  218 ggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||| ||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 34509757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 273
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454703
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgttccaaattattggactatttaag 20454703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 268
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468841
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||  |||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatct 22468750  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactat 268  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22468751 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgttccaaatttttggactat 22468841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532246
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||   |||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 22532246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20135316 - 20135158
Alignment:
Q  116 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 214  Q
    |||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||  | || |||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  20135316 tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T
Q  215 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20135216 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatataag 20135158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 225
Target Start/End: Original strand, 21896187 - 21896358
Alignment:
Q  56 attattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 154  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  21896187 attatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgt 21896286  T
Q  155 tatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896287 tatatcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 21861519 - 21861672
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21861519 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttg 21861617  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
     ||||||  | |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861618 catactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 267
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847292
Alignment:
Q  143 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 241  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------ga 20847266  T
Q  242 tgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20847267 tgatgatgttccaaattattggacta 20847292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026663
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt------gttgacgatgatgatgttccaaattattggacta 21026663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261180
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||| | ||||||  | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261115 atgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 22050811 - 22050866
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050811 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33681178 - 33680994
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  33681178 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 33681081  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  33681080 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga---------agatgatgatgttccaaattattggact 33680994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || |||||||  ||| |||||||||| |||| |||||  |||  ||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtt 16758725  T
Q  171 tgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    || ||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758724 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237642
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||| ||  |    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcataatgcct 22237691  T
Q  182 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543215
Alignment:
Q  25 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 43543215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 264
Target Start/End: Original strand, 14295493 - 14295686
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  14295493 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 14295588  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaatta 259  Q
    || || ||| | |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||      ||||||||||||||||||||    
T  14295589 tgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaa------gatgatgatgttccaaatta 14295681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754049
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 216  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  217 cggtctaagttgattaagatgttg 240  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  21754072 cggtctaagttgatgatgatgttg 21754049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Original strand, 22921830 - 22922001
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  22921830 atataattgtatatacattatatgaatttt--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 22921926  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22921927 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc---------taagatgatgatgatgatgttccaaattattgga 22922001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 27161561 - 27161605
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161561 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20918772 - 20918620
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  20918772 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 20918678  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
     ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918677 catactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 50614071 - 50614219
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||    
T  50614071 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgta 50614168  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614169 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 50621899 - 50622047
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||    
T  50621899 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgta 50621996  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621997 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 41049991 - 41050138
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||   | |||| |||||    
T  41049991 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatac 41050088  T
Q  178 tg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||  | |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050089 tgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50686791 - 50686695
Alignment:
Q  67 atgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||    
T  50686791 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatg 50686695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21161792 - 21161698
Alignment:
Q  169 tttgtatactgttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21161792 tttgcatactgttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgat---------gatgatgatgttccaaattattggacta 21161702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714549
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 21714549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 229
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20248332 - 20248266
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248332 ttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 20248266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 267
Target Start/End: Original strand, 38801447 - 38801525
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801447 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 38801525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 168
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 168  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| | | ||||| || |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 113
Target Start/End: Original strand, 16368224 - 16368276
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattata 113  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16368224 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 16368276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Original strand, 22130840 - 22130946
Alignment:
Q  54 tgattattatttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 152  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||    
T  22130840 tgattatgatttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatatt 22130935  T
Q  153 attatgtcatg 163  Q
    ||||| |||||    
T  22130936 attatatcatg 22130946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 51130743 - 51130646
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  51130743 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatca 51130648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 244
Target Start/End: Original strand, 24783155 - 24783213
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 244  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||    
T  24783155 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatga 24783213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 242
Target Start/End: Original strand, 21533948 - 21533989
Alignment:
Q  199 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  21533948 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg--taagatgttgat 21533989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11013 - 10742
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11013 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 10914  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10913 tacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 10814  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaa 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10813 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataacaatgttccaaattattggactatttaa 10742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9482 - 9211
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9482 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 9383  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9382 tacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttattta 9283  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaa 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9282 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataacgatgttccaaattattggactatttaa 9211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13632 - 13366
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13632 atattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcat 13533  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13532 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 13433  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13432 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 13366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14187 - 13921
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14187 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 14088  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14087 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 13988  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13987 tctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 13921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 23453 - 23484
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23453 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 501324 - 501052
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  501324 atattgttcatgattgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 501225  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  501224 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttattta 501125  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  501124 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgttccaaattattggactatttaag 501052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85768
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 85661  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||| ||||||||||||    
T  85662 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaa------gatgatgaagttccaaattat 85755  T
Q  261 tggactatttaag 273  Q
    |||| ||| ||||    
T  85756 tggattatataag 85768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 160854 - 160698
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||| || |||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| |    
T  160854 ttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttga-tatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-g 160758  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
     ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160757 catactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40640 - 40374
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40640 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 40541  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40540 tacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 40441  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  40440 actaagctgcacgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 40374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11529 - 11256
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11529 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgca 11430  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11429 ttacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 11330  T
Q  200 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11329 aactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatgataatgttccaaattattggactatttaag 11256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 273
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12443
Alignment:
Q  24 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataat 12293  T
Q  124 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12294 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtcta 12393  T
Q  224 agttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12394 agttgattaagatgttgatgatgatgtaccaaattattggactatttaag 12443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4934 - 4663
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4934 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcat 4835  T
Q  101 tacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4834 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 4735  T
Q  201 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagtgatg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  4734 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatta------ggatgatgaggttccaaattattggattatataagagatg 4663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 61 - 273
Target Start/End: Original strand, 158432 - 158638
Alignment:
Q  61 tatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158432 tatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 158531  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||    
T  158532 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattat 158625  T
Q  261 tggactatttaag 273  Q
    |||| ||| ||||    
T  158626 tggattatataag 158638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340053
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 340002  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |  | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 110
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82076
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatg 82076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 22620 - 22776
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  22620 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 22717  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22718 catactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30111 - 29905
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtca 30012  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt-gattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||      |||||||| ||||||||||||    
T  30011 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttcaattaa------gatgatgaagttccaaattat 29918  T
Q  261 tggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||    
T  29917 tggactatttaag 29905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 30153 - 30112
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 30112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9929 - 9753
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9929 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 9830  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9829 attctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32943
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 32943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38762
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38828  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatg 38762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 9971 - 9932
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 40  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9971 atattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16788
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12038
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  149 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgat 248  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||     
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaa 12063  T
Q  249 gttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||    
T  12062 gttccaaattattggattatataag 12038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1439
Alignment:
Q  49 gatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 147  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  148 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17356
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt--gtata 176  Q
    |||||||||||  || | ||||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  177 ctgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg--tttccaaattattgga 17356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4301
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 233
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2283
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtc 2210  T
Q  161 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2211 atgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaa 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 17976 - 18167
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  17976 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtg 18074  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
     ||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  18075 cataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaattattggactatt 18167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 20373 - 20524
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20373 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttg 20471  T
Q  173 tatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20472 tatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128728
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| | |||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  179 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
     || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 128728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4382 - 4188
Alignment:
Q  74 tatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4382 tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttg 4283  T
Q  173 tatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaa 272  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  4282 tatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataa 4189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 38578 - 38846
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  38578 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgca 38677  T
Q  100 ttacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttat 197  Q
     ||| |||||||||| | |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| |||||||    
T  38678 atacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttat 38776  T
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  38777 ttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaa------gatgatgaggttccaaattattggattatataag 38846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Original strand, 161080 - 161248
Alignment:
Q  70 ttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  161080 ttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtt 161179  T
Q  169 tttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  161180 tttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatg 161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 164672  T
Q  161 at 162  Q
    ||    
T  164673 at 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22860
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  179 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 22860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6187 - 6070
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  6187 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcat 6088  T
Q  101 tacatgaattatatgtga 118  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  6087 tacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3294
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 3204  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 3294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Original strand, 44706 - 44821
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44706 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 44805  T
Q  222 taagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  44806 taagttgattaagatg 44821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 237
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26179
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  || | ||||||| ||||||||   || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 116547 - 116434
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116547 ttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 116449  T
Q  223 aagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  116448 aagttgattaagatg 116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 53794 - 53872
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  53794 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttata 53872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 128907 - 129072
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  128907 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T
Q  161 atg-ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  |  |||| | |||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129006 atgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 78505 - 78453
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattata 113  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  78505 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 78453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16720
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 16720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3334
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  || | ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg--tttccaaattattggattatataag 3334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4522
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12104
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22056
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13188
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 13188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1828
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 1828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 52079 - 51890
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52079 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 51980  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  51979 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 51890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Original strand, 167934 - 168116
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  167934 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatact 168032  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  168033 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 168116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Original strand, 1004 - 1186
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1004 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatact 1102  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1103 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39486
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 39544  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 235  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 235
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75326
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 235  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4832
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 4832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3447
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 3447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 320
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||   ||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaa------gatgatgatgttccaaattattagactatataag 320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33100
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||  ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33010  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 33100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45905
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||  ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 45995  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 45905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16090
Alignment:
Q  80 gtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 179  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||   || ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  180 t-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
      | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 16090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 273
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17473
Alignment:
Q  182 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 17473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 6)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28397
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  229 attaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    || ||      ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28429 atgaa------gatgatgatgttccaaactattggacta 28397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11470 - 11278
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  11470 ttaatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 11375  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||    
T  11374 gatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattat 11282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2175 - 1980
Alignment:
Q  64 ttaatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  2175 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 2080  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattat 260  Q
    | || ||| | ||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||    
T  2079 gatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattat 1987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4538
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 114
Target Start/End: Original strand, 26013 - 26069
Alignment:
Q  59 attatttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26013 attatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 26069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 114
Target Start/End: Original strand, 16853 - 16909
Alignment:
Q  59 attatttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16853 attagttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 16909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8673
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8488 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atact 8586  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8587 gcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 8673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25904
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 25963  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 236  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagat 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39859
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 39925  T
Q  179 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8456
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8594 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 8495  T
Q  229 attaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    || ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8494 atgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 8456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8640 - 8481
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataat--tgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8640 ttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8541  T
Q  171 tgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540 -gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6519
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt------gatgatgatgatgatgttccaaattattggact 6519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6244
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  179 g----ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
         |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 177  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  178 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 226  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 179
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3585
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  179 g 179  Q
    |    
T  3585 g 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1935
Alignment:
Q  94 tatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 192  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  | ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  193 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 1935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11636 - 11445
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  11636 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 11538  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
     ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  11537 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaattattggactatt 11445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 27697 - 27855
Alignment:
Q  72 gttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  27697 gttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctg-tttt 27795  T
Q  172 gtatact-gttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    | |||||   | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27796 gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 38205 - 38396
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  38205 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 38303  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatt 269  Q
     ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  38304 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgt------tgatgttccaaattattggactatt 38396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 28029 - 27958
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttg 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28029 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15601
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||      ||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaa------gatg 15577  T
Q  244 atgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15578 atgatgttccaaattattggacta 15601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39890
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||    |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 39980  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 39890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 53481 - 53651
Alignment:
Q  57 ttattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 155  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  53481 ttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtt 53580  T
Q  156 atgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || ||||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53581 atatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12755 - 12587
Alignment:
Q  58 tattatttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 156  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  12755 tattatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 12657  T
Q  157 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    | |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12656 tatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  84 tataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 157  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13302 - 13147
Alignment:
Q  72 gttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaat-aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  13302 gttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttt 13204  T
Q  171 tgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    || ||||||  | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13203 tgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 16048 - 16206
Alignment:
Q  72 gttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  16048 gttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttg-tttt 16146  T
Q  172 gtatact-gttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    | |||||   | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16147 gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 32230 - 32050
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || ||||    
T  32230 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttact 32134  T
Q  179 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32133 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 32050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 10491 - 10647
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  10491 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttg 10588  T
Q  173 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10589 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4713
Alignment:
Q  154 ttatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19251
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 19251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15838 - 15668
Alignment:
Q  65 taatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| |||||    
T  15838 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatg 15743  T
Q  164 ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
     ||  |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15742 atg-gtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatg 15668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 35987 - 36064
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaa-gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  35987 atattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttgatgttcttata 36064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Original strand, 23942 - 24017
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  23942 tgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga---------agatgatgatgttccaaattattggact 24017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 225578 - 225482
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  225578 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129919
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  182 gtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 60670 - 60818
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtata 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||    
T  60670 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatcatgagctg-ttttgtata 60767  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60768 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 1668 - 1592
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  1668 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 1592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Original strand, 10813 - 10885
Alignment:
Q  5 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10813 tgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttgagtattatttgatgttgttata 10885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  165 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 12103 - 12039
Alignment:
Q  71 tgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12103 tgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13480
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 243  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      | ||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gttg 13504  T
Q  244 atgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13503 atgatgttccaaattattggacta 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 3263 - 3187
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  3263 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 3187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 266
Target Start/End: Original strand, 45742 - 45926
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  45742 ttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-g 45839  T
Q  173 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
     ||||||  | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45840 catactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 45926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 237
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11557
Alignment:
Q  145 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174785
Alignment:
Q  96 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-g 193  Q
    |||||||| ||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  194 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121743
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 121743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 155  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Original strand, 6083 - 6258
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||  ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  6083 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6180  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  6181 atgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 6258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13258 - 13158
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13258 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13159  T
Q  179 g 179  Q
    |    
T  13158 g 13158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 250
Alignment:
Q  188 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaa------gataatgatgttccaaattattggattatataag 250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34176 - 34109
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  34176 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 34109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 118
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||  |    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 193  T
Q  182 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattgga 118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 724 - 646
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  724 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 4225 - 4303
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4225 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 4303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 1248 - 1326
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  1248 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 1326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 264
Target Start/End: Original strand, 10395 - 10558
Alignment:
Q  94 tatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 192  Q
    |||||||||| ||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  10395 tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 10491  T
Q  193 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  10492 tgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 10558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 6858 - 6936
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6858 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttata 6936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15162 - 15084
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15162 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 15084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 264
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1204
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  1011 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 1106  T
Q  162 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaatta 259  Q
    || || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||||||||    
T  1107 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaatta 1199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 15194 - 15272
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttaatgttgttata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15194 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 15272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 273
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15382
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaa------gatgatgaagttccaaattattggattatataag 15382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1351 - 1272
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 1272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7249
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattggacta 7249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1169
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6400
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatc 6318  T
Q  161 at--gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 241  Q
    ||  |||| |||| |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  6319 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttga 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 241
Target Start/End: Original strand, 13813 - 13854
Alignment:
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  13813 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttga 13854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6597
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 6597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13977
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 13977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5657
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  |    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15912
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgatgttccaaattattgga 15912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178901
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 178901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 164  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25121
Alignment:
Q  62 atttaatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 161  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||  |||| |||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatca 25192  T
Q  162 t--gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |  |||| |||| |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191 tgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 620
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  720 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 623  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  622 atg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21026 - 20893
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  21026 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtc 20927  T
Q  228 gattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    | | |||||||      |||||||||||||||||||||||    
T  20926 gttgaagatgt------tgatgttccaaattattggacta 20893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32696 - 32551
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||  |    
T  32696 atatagttgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcct 32600  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 51839 - 51985
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 177  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  51839 tgtgatataat-gtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgc 51936  T
Q  178 tg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    ||  | || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51937 tgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Original strand, 14658 - 14829
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||  |    
T  14658 atataatagtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcct 14754  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  14755 atgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattgga 14829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8176 - 8090
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8176 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6990 - 6826
Alignment:
Q  64 ttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 162  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||    
T  6990 ttaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcat 6895  T
Q  163 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 230  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6894 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 273
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4977
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaa------gatgatgatgttccaaattattggattatataag 4977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 168
Target Start/End: Original strand, 918 - 1006
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 168  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8180
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    ||| || |||||||| ||| |||||||||| |||| ||    
T  8011 atttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatg--ttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatc 8108  T
Q  161 atg--ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
    |||  ||| ||| ||||||||  | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8109 atgaactggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97089
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  97091 atg 97089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106367
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  106369 atg 106367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 266
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2940
Alignment:
Q  123 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  221 ctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    |         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2904 c---------taagatgatgatgatgatgttccaaattattggact 2940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1091
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 266
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2779
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 2779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38339
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtata 176  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||| |||| ||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatata 38386  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 221  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38385 ctgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Original strand, 8008 - 8098
Alignment:
Q  73 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  8008 ttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16395 - 16265
Alignment:
Q  130 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 227  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16395 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16299  T
Q  228 gattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    | | ||      |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16298 gttgaa------gatgatgatgttccaaattattagacta 16265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 18180 - 18265
Alignment:
Q  67 atgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 152  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18180 atgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13100 - 12954
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||  |    
T  13100 atataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcct 13003  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13002 atgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12946 - 12750
Alignment:
Q  65 taatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  12946 taatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 12848  T
Q  164 ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattatt 261  Q
     || ||| | ||| ||  | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||| | ||||||||||||||||| |||    
T  12847 atgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagtt------gatgattatgatgatgttccaaatgatt 12755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32085
Alignment:
Q  119 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 216  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  217 cggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    |||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125 cggtc---------taagatgatgatgatgatgttccaaattattggact 32085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1051
Alignment:
Q  143 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10688 - 10542
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 181  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |  |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  10688 atataattgtatatacattacatgaattatgttcga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 10591  T
Q  182 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 229  Q
     ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10590 atgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 267826 - 267679
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||    
T  267826 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatata 267730  T
Q  177 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 225  Q
    |||  | ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267729 ctgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23846
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 23846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 266
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28904
Alignment:
Q  192 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact 266  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga---------tgatgatgatgttccaaattattggact 28904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36457
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 36457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  94 tatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 192  Q
    |||||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||| ||||||  | || || ||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  193 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 51644 - 51565
Alignment:
Q  183 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  51644 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------aatgatgatgttccaaattattggacta 51565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Original strand, 1753 - 1835
Alignment:
Q  79 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  1753 tgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 1835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 267
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5266
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||      |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgacgttccaaattattggacta 5266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 270
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1190
Alignment:
Q  198 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactattt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  1124 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg------atgatgttccaaattattggactattt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 88
Alignment:
Q  62 atttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 160  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  189 atttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatc 91  T
Q  161 atg 163  Q
    |||    
T  90 atg 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 58002 - 57948
Alignment:
Q  59 attatttaatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattat 112  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  58002 attatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattat 57948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 47048 - 46981
Alignment:
Q  191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgga 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  47048 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaa------gatgatgatgttccaaattattgga 46981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6676
Alignment:
Q  94 tatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 179  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactg 6676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10655 - 10603
Alignment:
Q  63 tttaatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10655 tttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatat 10603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Original strand, 600 - 652
Alignment:
Q  63 tttaatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 114  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  600 tttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatat 652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 447 - 416
Alignment:
Q  1 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  447 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29660 - 29561
Alignment:
Q  139 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29660 ttgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 267
Target Start/End: Original strand, 193039 - 193115
Alignment:
Q  186 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta 267  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||    
T  193039 tgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgt------tgatgttccaaattattggacta 193115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Original strand, 2179 - 2257
Alignment:
Q  83 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 163  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  |   ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  2179 atataattgtatatacattatatgaattat--gctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Original strand, 206584 - 206624
Alignment:
Q  183 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206584 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University