View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11361_low_2 (Length: 549)

Name: NF11361_low_2
Description: NF11361
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11361_low_2
NF11361_low_2
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (19-539)||(21771968-21772488)
chr7 (19-539)||(21725903-21726423)
chr7 (19-520)||(21714209-21714710)
chr7 (19-539)||(21788236-21788753)
chr7 (19-539)||(21785413-21785933)
chr7 (19-516)||(21681680-21682177)
chr7 (39-522)||(21664122-21664614)
chr7 (78-522)||(21628149-21628596)
chr7 (79-539)||(21652076-21652527)
chr7 (47-539)||(21704650-21705136)
chr7 (19-497)||(21623242-21623720)
chr7 (29-522)||(21807793-21808289)
chr7 (21-539)||(21646750-21647272)
chr7 (47-539)||(21992180-21992681)
chr7 (81-498)||(21764110-21764509)
chr7 (29-539)||(21689420-21689930)
chr7 (78-522)||(15713647-15714085)
chr7 (57-522)||(21745556-21746015)
chr7 (201-539)||(21792018-21792356)
chr7 (39-148)||(21792388-21792497)
chr7 (47-102)||(21656895-21656950)
[»] scaffold0182 (2 HSPs)
scaffold0182 (47-331)||(25588-25872)
scaffold0182 (386-486)||(25370-25470)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (303-375)||(18192138-18192210)
chr1 (219-263)||(18192060-18192104)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 497; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21772488 - 21771968
Alignment:
Q  19 gcccaatgatgacagtcgaggaaattcatcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21772488 gcccaatgatgacagtcgaggaaattcatcatgctttctatcaagccactctcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgat 21772389  T
Q  119 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21772388 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacag 21772289  T
Q  219 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21772288 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagttaaaacatcatcgtca 21772189  T
Q  319 aaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21772188 aaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttattttctatgtattttgctgcccacataagtt 21772089  T
Q  419 tgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttct 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21772088 tgtacttctctgctaatatcagatttgtgttatgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttct 21771989  T
Q  519 gagagactttagcaccctttg 539  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21771988 gagagactttagcaccctttg 21771968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21726423 - 21725903
Alignment:
Q  19 gcccaatgatgacagtcgaggaaattcatcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgat 118  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21726423 gcccaatgatgaccgtcgacgaaattcatcatgctttctatcaatccactctcgtcttcatctgtccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgat 21726324  T
Q  119 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21726323 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccctaatattcatgtgccatggtttattaagatccgctttctccaagatatacag 21726224  T
Q  219 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21726223 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacagcttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcgtcgtca 21726124  T
Q  319 aaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21726123 aaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtgtccggtgttttctatgtattttgctgcccacataagtt 21726024  T
Q  419 tgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttct 518  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21726023 tgtactactctgctaatatcagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttct 21725924  T
Q  519 gagagactttagcaccctttg 539  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21725923 gagagactttagcaccctttg 21725903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21714710 - 21714209
Alignment:
Q  19 gcccaatgatgacagtcgaggaaattcatcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgat 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21714710 gcccaatgatgacaggcgaggaaattcatcatgctttttatcaatccactctggtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgat 21714611  T
Q  119 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||||  ||    
T  21714610 tctccaacaaaagcacatccatcattacaagaacaagttgatcaaccttgatattcatttgccctggttcatcaagcttggctctctccaagatatgaag 21714511  T
Q  219 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  21714510 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgatagcttttcttcaaggctaccaaagccttcaagagaccaactggttgaagctaaaacatcgttgtca 21714411  T
Q  319 aaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21714410 aaatgacccttcagttcatcaatgttatctgcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtgtctggtgttttctatgtattttgctgcccacataagtt 21714311  T
Q  419 tgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttct 518  Q
    ||||||||||| ||    | |||||||  || | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21714310 tgtacttctctcctttcttcagatttggattgtcatgatggataggacctaatgacacaaacttgggtgagtaatgcttctcaaaatttgttctatttct 21714211  T
Q  519 ga 520  Q
    ||    
T  21714210 ga 21714209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21788753 - 21788236
Alignment:
Q  19 gcccaatgatgacagtcgaggaaattcatcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21788753 gcccaatgatgacagtcgaggaaagtcatcatgctttttatcaattcactatcgtt---atctttccacaatagcttgagtactacgtaaggaagttgat 21788657  T
Q  119 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacag 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||     
T  21788656 tctccaacagaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaactttaatattcatgtgcccaggttcatcaagcttggctttctctaagatatacaa 21788557  T
Q  219 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||   |  ||| ||| ||||||||| ||| ||    
T  21788556 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacagcttttcttcgaggcttccaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgcca 21788457  T
Q  319 aaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  21788456 aaatgacccttcagttcatcaatgttatctgcaatctttttgtgcagatcctctggaatgtgtccagtgttttcgatgtattttgctgcccacataagct 21788357  T
Q  419 tgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttct 518  Q
    ||||||||||| ||||  | | ||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21788356 tgtacttctctcctaacttcaaatttgtgttgtcatgatggataggacctaccgacaacaacttgggcgagtaatgcttctcaaagttttttctatttct 21788257  T
Q  519 gagagactttagcaccctttg 539  Q
    |||| ||| |  |||||||||    
T  21788256 gagatactctgccaccctttg 21788236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21785933 - 21785413
Alignment:
Q  19 gcccaatgatgacagtcgaggaaattcatcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgat 118  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21785933 gcccaatgatgacatttgaggaaattcttcatgctttttatcaattcactctcgtcgctatctttccacaatagtttgaggacttcataaggaagttgat 21785834  T
Q  119 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||| || ||||||||||||||||  ||    
T  21785833 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatttgccctggtacatgaagcttggctttctccaagatatgtag 21785734  T
Q  219 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtca 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||   | |||| ||| |||||||||||||  |    
T  21785733 caaagaacatccatccacaaacaacatccacgacagcttttcttcaaggctaccaaagtcttcaagagactggccggttaaagttaaaacatcatcgcta 21785634  T
Q  319 aaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtt 418  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||   ||  | || || | ||||||||| ||||||||||| |    
T  21785633 aaatgacccttcagttcattaatgttatcggcaatctttttgtgtagatcgcgtggattgcggcctatattctcgaggtattttgcggcccacataagct 21785534  T
Q  419 tgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttct 518  Q
    ||||||||||| ||    | |||||||  || | |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21785533 tgtacttctctcctgtcttcagatttggattgtcatgatggataggacctattgacactaacttgggtgagtaatgcttctcaaagtttttcctatttct 21785434  T
Q  519 gagagactttagcaccctttg 539  Q
     ||| ||| | ||||||||||    
T  21785433 tagatactcttgcaccctttg 21785413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 21682177 - 21681680
Alignment:
Q  19 gcccaatgatgacagtcgaggaaattcatcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||| || |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21682177 gcccaatgatgacagtcgaggaaattcgtcataatttttatcaattcactctcattgctatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgat 21682078  T
Q  119 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  | | ||||||||||||||  ||    
T  21682077 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaacattcatgtgccctggttcataaagcatggttttctccaagatatgtag 21681978  T
Q  219 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtca 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||   | |||| ||| ||||||||| |||  |    
T  21681977 caaagaacatccatccacgaacaacatccatgataacttttcttcaaggctatgatagccttcaagagactcgccggttaaagttaaaacatcgtcgcta 21681878  T
Q  319 aaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtt 418  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||  |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  21681877 aaatggcccttcaattcatcaatgttatcagcaatttttttgtatagatccttttgaatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagct 21681778  T
Q  419 tgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctattt 516  Q
    ||||||||||| ||||  | |||| ||| ||   |||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||| || ||| ||| ||||||||    
T  21681777 tgtacttctctcctaactttagatctgtattgccatgatggataggacctattgacacaaacttggggctgtaatgctccttaaattttgttctattt 21681680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 39 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 21664614 - 21664122
Alignment:
Q  39 gaaattcatcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatcc 138  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21664614 gaaattcatgatgctttctatcaatccactcttgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggtagttgattctccaacaaaagcacatcc 21664515  T
Q  139 atcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcg-----ctttc-tccaagatatacagcaaagaacatccat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||| ||||  |    ||     | | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21664514 atcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatatccataggctctgggtcatccatccacgtacaacatccatccaagatataaagcaaagagcatccat 21664415  T
Q  233 ccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaa---acatcatcgtcaaaatgaccctt 329  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||   | |||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  21664414 ccacgaacaatatccacgacagcttttcttcaaggcttccaaagccttcaagagacttgccggttaaagttaaaattacatcatcgtcaaaatgaccctt 21664315  T
Q  330 cagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtacttctct 429  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||  ||   | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21664314 cagttcatcgatgttatcaaaaatctttttgtgtagatcccgtggattgagtcttgtattttcaatgtattttgctgcccacataagcttgtacttccct 21664215  T
Q  430 gctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttctgaga 522  Q
     ||||  | |||| ||| ||   |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21664214 cctaacttcagatctgtattgccatgatggataggacctattgacaggaacttgggtgagtaatacttctcaaagttttttctgtttctgaga 21664122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 78 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 21628596 - 21628149
Alignment:
Q  78 atctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  21628596 atctttccacaatagcttgagtacttcataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaagcttaatatccata 21628497  T
Q  178 tgccatggttcattaagattcg---ctttctccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaa 274  Q
     ||| ||| |||||||    ||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||    
T  21628496 ggccttgggtcattaaacaacgtaactttctccaagatataaagcaaagagcatccatccacgaacaacatccacgacagcttttcttcaaggcatccaa 21628397  T
Q  275 agcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctgg 374  Q
    |||||  ||||||   ||  ||| ||  ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21628396 agccttgaagagagtttcccgttaaatttaaaacatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagttcctctgg 21628297  T
Q  375 aatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgac 474  Q
    |||   |||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||   | ||||||||  |   |||||| |||||||||||||||    
T  21628296 aataagtccaatgttttctatgtattttgatgcccacacaagcttgtacttctctcctatgttcagatttgtactgccatgatggataggacctattgac 21628197  T
Q  475 acacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttctgaga 522  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||| |||||||||||    
T  21628196 acaaacttgggtgagtaatacttcccaaaatcttttttatttctgaga 21628149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 79 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21652527 - 21652076
Alignment:
Q  79 tctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgt 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  21652527 tctttccacaaaagcttgagtacttgataaggaagttgattttccaacaaaagcacatccatcatca---------gttgatcaaccttaatattcatgt 21652437  T
Q  179 gccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcc 278  Q
    ||| || ||||| ||  || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21652436 gccctgcttcatcaacgttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatcaaagcc 21652337  T
Q  279 tgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatg 378  Q
    | ||||||||   |  ||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  21652336 ttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgctaaaatgaccctttagttcgttaattttatcggcaatctttttgtgtcgatcctctagaata 21652237  T
Q  379 tatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacac 478  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||  | | | |||||| || | |||||| |||||||||||||| |||     
T  21652236 aagccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagcttatactcctctcctggtttcatatttgtattgtcatgatggataggacctattgaaacaa 21652137  T
Q  479 acttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttctgagagactttagcaccctttg 539  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  21652136 acttgggggtgtaatgtttctcaaaattgtttctatttctgagatactgtggcaccctttg 21652076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21705136 - 21704650
Alignment:
Q  47 tcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcac 146  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  21705136 tcatgctttttattaatccactctcatcttcatctttccacaaaagcttgagtacttcataaggcagttgattctccaacaaaagcacatcctccctcac 21705037  T
Q  147 aagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccat-ggttcattaagattcgctttctccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacat 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||  | ||| ||| | |       || ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21705036 aagagccagttgatcaaccttaatattcatcggcagtaggtacataatg-------ttatccaagatatggagcaaagaacatccatccatgaacaatat 21704944  T
Q  246 ccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgtta 345  Q
    |||||||| |||||| |||||||    |||||||  ||||||   || ||||  || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21704943 ccacgacagcttttcatcaaggcactcaaagccttgaagagagtttccggttagagttaaaacatcatcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgtta 21704844  T
Q  346 tcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtacttctctgctaatataagatttg 445  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | ||| |||    
T  21704843 tctgcaatctttttgtgtagttcctctggaataagtccggtgttttctatgtattttgctgcccacataagcttgtacttctctcctaacttcagagttg 21704744  T
Q  446 tgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttctgagagactttagcaccctttg 539  Q
      || | |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  21704743 gattgtcatgatggataggacctatcgacactaacttgggtgagtaatgctgctcaaagttttttctacttctgagatactcttgcaccctttg 21704650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 21623720 - 21623242
Alignment:
Q  19 gcccaatgatgacagtcgaggaaattcatcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgat 118  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |   ||||||| || | ||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21623720 gcccaaagatgacagccgaggaaatttttcatggtcattatcaattcattctcgttgttatctttccacaatagcttgagtacttcataaggcagttgat 21623621  T
Q  119 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacag 218  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||| | |||| ||||| |||    
T  21623620 tctccaacaaaaccacatcaatcatcacaagattccgttgatcaagcttaatattcatctgccctggttcatgaagcttggctgtatccatgatatgcag 21623521  T
Q  219 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||  || |||| ||| ||||||||| ||   |    
T  21623520 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacagcttttctttaatgctaccaaagccttcaagagactttccggttaaagttaaaacatcgtcacta 21623421  T
Q  319 aaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||   |||  | || | ||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  21623420 aaatgacccttcagttcatcaatattatcagcaatcttgttgtgcatatccttctgaacttttctggtgtttttgatgtattttgctgcccacataagct 21623321  T
Q  419 tgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgctt 497  Q
    ||||||||||| ||||  | |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21623320 tgtacttctctcctaacttcagatttgtattgccatgatggataggacctattgacaccaacttgggtgagtaatgctt 21623242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 522
Target Start/End: Original strand, 21807793 - 21808289
Alignment:
Q  29 gacagtcgaggaaattcatcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaa 128  Q
    |||||| | |||||||| ||||| ||| ||||||| |||  || |  | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21807793 gacagttggggaaattcctcatgatttttatcaattcaccctcattgttatcttcccacaatagcttaagtactttataaggcagttgattctccaacaa 21807892  T
Q  129 aagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcg---ctttctccaagatatacagcaaagaa 225  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||| |||| ||    |    || ||||||||||||| ||||||||     
T  21807893 aagcacatccgttatcagaagaaccagttgatcaagcttaatatccacatgccctggctcatcaaaccacatgactgtctccaagatataaagcaaagag 21807992  T
Q  226 catccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtcaaaatgac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   | |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  21807993 catccatccacgaacaacatccatgacagcttttcttcaaggctaccaaagccttcaagagactggccggttaaagttaaaacatcgtcgccaaaatgac 21808092  T
Q  326 ccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtactt 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  21808093 ccttcagttcatcgatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctagaataaagccgctgttttctatgtatttcgcagaccacataagcttgtactt 21808192  T
Q  426 ctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttctgaga 522  Q
    |||| ||||  | |||||| | ||   |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  21808193 ctctcctaacttcagatttatatttccatgatggataggacctattgataccaacttgggtgagtaatgcttctcaagatttgttctatttctgaga 21808289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21647272 - 21646750
Alignment:
Q  21 ccaatgatgacagtcgaggaaattcatcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||  ||||| | | ||||||| || | || |  | ||||||| | ||||| |||||||||   ||||| |||||||||    
T  21647272 ccaatgatgacatttgaggaaatttttcatggtatttatcaattcattctcattgttatctttcaataatagtttgagtactatgtaagggagttgattc 21647173  T
Q  121 tccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacagca 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  21647172 tccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagtttatcaaccttaatattcatctgccctggttcatgaagcttggctttctctaagatatgcagca 21647073  T
Q  221 aagaacatcc----atccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgt 316  Q
    ||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||   | |||  ||| |||||| || |||     
T  21647072 aagaacatccatatatccacgaacaatatccacgacaacttttcttcaaggctacggaagcctttaagagacttgccggtcaaagttaaaacgtcgtcgc 21646973  T
Q  317 caaaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataag 416  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    |||   |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21646972 taaaatgacccttcagttcatcaatgttatctacaatctttttgtgtagatccttcttaattcttcccgtgtttttgatgtattttgctgcccacataag 21646873  T
Q  417 tttgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctattt 516  Q
     ||||| |||||| |||   | || ||||  || | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  21646872 cttgtatttctctcctatcttcagctttggattgtcatgatggataggacctattgacaccaacttgggggtgtaatgctcctcaaattttgttctattt 21646773  T
Q  517 ctgagagactttagcaccctttg 539  Q
    |||||| ||| | ||||||||||    
T  21646772 ctgagatactgtggcaccctttg 21646750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21992681 - 21992180
Alignment:
Q  47 tcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcac 146  Q
    ||||||||| ||||||| |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21992681 tcatgctttttatcaattcactctcattgttatctttccacaatagcttgagtactacgtaaggaagttgattctccaacagaagcacatccatcatcac 21992582  T
Q  147 aagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21992581 aagaaccagttgatcaactttaatattcatgtgcccaggttcatcaagcttggctttctctaagatatacaacaaagaacatccatccacgaacaacatc 21992482  T
Q  247 cacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttat 346  Q
    || |||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||  ||  | | ||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21992481 catgacagcttttcttcgaggcttccaaagccttcaagagactttccagctaaagttaaaacatcgtcactaaaatgacccttcagttcatcaatgttat 21992382  T
Q  347 cagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtacttctctgctaatataagatttg- 445  Q
    |   ||||||||||||||||||   |||| |   |||    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  | |||||||     
T  21992381 cgataatctttttgtgtagatcgcatggattaagtcctgcattttcgatgtattttgctgcccacgtaagcttgtacttctctcctaacttcagatttgc 21992282  T
Q  446 ------tgttctg--atgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttctgagagactttagcaccctt 537  Q
          |||  ||  |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |  |||||||    
T  21992281 attgcttgtattgccatgatggataggacctattgacaccaatttgggtgagtagtgcttctcaaagtcttttctatttttgagatactctgccaccctt 21992182  T
Q  538 tg 539  Q
    ||    
T  21992181 tg 21992180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 81 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21764509 - 21764110
Alignment:
Q  81 tttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgc 180  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21764509 tttccacaatagcttgagtacttcgtaaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgaccaaccttaatcttcatgtgc 21764410  T
Q  181 catggttcattaagattcgctttctccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctg 280  Q
    |                  |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21764409 c------------------ctttctccaagagataaagcaaagagcatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagcctt 21764328  T
Q  281 caagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgta 380  Q
    ||||||||  ||  ||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |       
T  21764327 caagagactttccagttaaagttaaaacatcatcgctaaaacgacccttcagttcatcgatgttatcagcaatcttttggtgtagttcctctggattaag 21764228  T
Q  381 tccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacac 480  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||  | |||| ||   | | |||||| ||||||||||||||||   ||    
T  21764227 tgcggtgttttctatgtattctgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacttcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaac 21764128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21689930 - 21689420
Alignment:
Q  29 gacagtcgaggaaattcatcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaa 128  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| ||||||| |||| | ||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21689930 gacactcgaggaaattcgtcgtgctttttatcaattcactcttgttgttatctttccacaatagctcgagtacttcataaggaagttgattctctaacaa 21689831  T
Q  129 aagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacagcaaagaacat 228  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||  |||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  21689830 aagcacatccaccatcacaatagctagttgatcaaccttaatatccataggccctggttcaacaagcctgtctttctccaagatataaagcaaagagcat 21689731  T
Q  229 ccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtcaaaatgaccct 328  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||  ||||||| | |||||   || |||  | | ||||||||| || |||||||||||||    
T  21689730 ccatccaccaacaacatccacgatagcttttcttcaagactatcaaagccttcgagagaatttccggtcaatgttaaaacatcgtcatcaaaatgaccct 21689631  T
Q  329 tcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagat-cctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtacttct 427  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21689630 tcagtttatcaatgttatcaacaatgtttttgtgtagatccctct-gaatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagcttgtacttct 21689532  T
Q  428 ctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttctgagagactt 527  Q
    || ||||  | |||  | | ||   |||||| ||||||||| ||||||   || | || |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||     
T  21689531 ctcctaactttagagatttattgccatgatggataggaccttttgacatcaacctcggggtctaatgcttctcaaatttttctctatttctgagatactc 21689432  T
Q  528 tagcaccctttg 539  Q
    | ||||||||||    
T  21689431 ttgcaccctttg 21689420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 78 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 15714085 - 15713647
Alignment:
Q  78 atctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  15714085 atctttccacaatagcttgagtacttcataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccattatcacaagatccagttgatcaagcttaatatttatg 15713986  T
Q  178 tgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagc 277  Q
     ||| ||   | | || | |    || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |    
T  15713985 ggccctg---cgtgaacaatg---ttatccaagatatgcagcaaagagcatccatccacgaacaacatccatgacagcttttcttctaggctaccaaatc 15713892  T
Q  278 ctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaat 377  Q
    ||  ||| |||  || |||| ||| ||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  15713891 cttgaagtgactttccggttaaagttaaaacatcgtcactaaaatgacacttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgcagttcctctagaat 15713792  T
Q  378 gtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacaca 477  Q
    |  |||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || |  | |||||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||     
T  15713791 gcttccagtgtttttgatgtattttgccgcccacataagcttgtacttctcccctgactttagatttgtattgtcatgatggatagggcctattgaaacc 15713692  T
Q  478 cacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttctgaga 522  Q
     |||| |||| ||||||| ||||| | ||||| || |||||||||    
T  15713691 aacttaggtgcgtaatgcatctcataatttttactttttctgaga 15713647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 21746015 - 21745556
Alignment:
Q  57 tatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagt 156  Q
    ||||||| |||| ||||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | |    
T  21746015 tatcaattcactctcgttgttatcttttcacaatagctagagtacttcataaggcagttgattctccaacaaaagtacatcgatcatcacaagaataact 21745916  T
Q  157 tgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaact 256  Q
     |||||| ||||||||||||||  | ||| | |  ||        || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  21745915 agatcaagcttaatattcatgtctcgtgggtgaacaa------tgttatccaagatatggagcaaagaacatccatctacgaataacatccacgacagct 21745822  T
Q  257 tttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctt 356  Q
    ||||||||||||    |||||||  ||||||   ||  ||| ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21745821 tttcttcaaggcattcaaagccttgaagagaatttccagttaaagttaaaacatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctt 21745722  T
Q  357 tttgtgtagatcctctggaatgtatccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatga 456  Q
    |||||| ||||| | |||| |||  ||  | || || | ||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||    | |||||||  || | ||||    
T  21745721 tttgtgcagatcgtgtggattgtggcctgtattctcgaggtattttgctgcccacataagcttatactcttctcctgtctttagatttggattgtcatga 21745622  T
Q  457 tgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttctgaga 522  Q
    || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  21745621 tggataggacctaatgacaccaacttgggtgagtaatgcttctcaaaatttgttctatttatgaga 21745556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 201 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21792356 - 21792018
Alignment:
Q  201 tttctccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaa 300  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||   | |||| ||    
T  21792356 tttctccaagatatgcaacaaagaacatccatccacgaacaatatccatgacagcttttcttcgaggctaccaaagccgtcaagagacttgcgggttaaa 21792257  T
Q  301 gctaaaacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatg-tatccgttgttttctatgtat 399  Q
    | |||||||||||||  |||| || |||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   ||||| | || ||| ||||  ||||||    
T  21792256 gttaaaacatcatcgctaaaacgatccttcagcgtatcaatgttatcggcaatctttttgtgcagatctttcagaatgctttcagtt-tttttgatgtat 21792158  T
Q  400 tttgctgcccacataagtttgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttct 499  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    |||| |||  |   |||||| || ||||||||||| ||| || | ||   |||||||||||    
T  21792157 tctgctgcccacataagcttgtacttctctcctaactccagatctgtactgccatgatggatgggacctattgatacaaaccttgggatgtaatgcttct 21792058  T
Q  500 caaagttttttctatttctgagagactttagcaccctttg 539  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| ||| |  |||||||||    
T  21792057 caaaattttctctctttctgagatactctgccaccctttg 21792018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21792497 - 21792388
Alignment:
Q  39 gaaattcatcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatcc 138  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21792497 gaaattcgtcatgctttctattaatgcactctggttgtcgtctttccacaatagcttgagtacttcataaggcagttgattctccaacaaaagcacatcc 21792398  T
Q  139 atcatcacaa 148  Q
    ||||||||||    
T  21792397 atcatcacaa 21792388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21656950 - 21656895
Alignment:
Q  47 tcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtact 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21656950 tcatgctttttatcaattcactcttgttgtcatctttccacaatagcttgagtact 21656895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25872 - 25588
Alignment:
Q  47 tcatgctttctatcaatccactgtcgtcttcatctttccacaatagcttgagtacttgataaggaagttgattctccaacaaaagcacatccatcatcac 146  Q
    ||||||||| ||||||| |||| || |  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  25872 tcatgctttgtatcaattcactctcattctcgtttttccacaatagcttgagtacttcataaggaagttgattttccaacaaaaccacatccaccatcac 25773  T
Q  147 aagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatc 246  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| | || ||| | |||| |  | || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25772 aagaaaaagttgatcaaccttaatattcattttccctgggttattacgtctggcattctccaagatatgtagcaaagaacatccatccacgaacaacatc 25673  T
Q  247 cacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcatcgtcaaaatgacccttca 331  Q
     |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  | | ||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  25672 aacgacagcttttcttcaagggtaccaaagccttcaagagactttttagttaaagttaaaacatcctcgctaaaatgacccttca 25588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 386 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 25470 - 25370
Alignment:
Q  386 tgttttctatgtattttgctgcccacataagtttgtacttctctgctaatataagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttggg 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||  | |||||| | || | |||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  25470 tgttttctatgtattctgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacttcagatttttattgtcatgatggataggacctattgacaccaacttggg 25371  T
Q  486 t 486  Q
    |    
T  25370 t 25370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 18192138 - 18192210
Alignment:
Q  303 taaaacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctgga 375  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | || || |||||||| ||||    
T  18192138 taaaacatcgtcggcaaaaagacccttcagttcattaatgttatctgcaatatcttggtatagatcctttgga 18192210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 263
Target Start/End: Original strand, 18192060 - 18192104
Alignment:
Q  219 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttc 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||    
T  18192060 caaagaacatccatccacaaacaacatccatgatagcttttcttc 18192104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University