View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11365_high_4 (Length: 316)

Name: NF11365_high_4
Description: NF11365
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11365_high_4
NF11365_high_4
[»] chr3 (110 HSPs)
chr3 (1-316)||(25191359-25191674)
chr3 (9-304)||(22063-22357)
chr3 (9-301)||(35033136-35033428)
chr3 (9-304)||(5168822-5169117)
chr3 (9-301)||(47233596-47233888)
chr3 (9-303)||(52138790-52139084)
chr3 (9-303)||(28245427-28245721)
chr3 (30-304)||(53519603-53519865)
chr3 (9-304)||(54279010-54279304)
chr3 (20-304)||(51447714-51447991)
chr3 (52-304)||(48508268-48508520)
chr3 (22-301)||(38850123-38850403)
chr3 (18-304)||(43694768-43695048)
chr3 (136-304)||(12096702-12096870)
chr3 (19-302)||(54128378-54128662)
chr3 (173-304)||(53262295-53262426)
chr3 (9-202)||(33272122-33272318)
chr3 (9-301)||(45289091-45289385)
chr3 (9-167)||(38060421-38060579)
chr3 (26-266)||(48953454-48953697)
chr3 (157-304)||(52156081-52156228)
chr3 (19-303)||(19676079-19676362)
chr3 (29-301)||(54424959-54425244)
chr3 (188-304)||(311306-311422)
chr3 (173-301)||(49042090-49042219)
chr3 (9-193)||(45728137-45728324)
chr3 (163-301)||(38060858-38060996)
chr3 (21-224)||(3186771-3186973)
chr3 (35-266)||(39235154-39235384)
chr3 (197-304)||(47555329-47555436)
chr3 (194-304)||(2133609-2133719)
chr3 (23-304)||(42510013-42510292)
chr3 (174-304)||(49503565-49503695)
chr3 (19-302)||(50960636-50960915)
chr3 (180-301)||(48712075-48712196)
chr3 (173-301)||(15296061-15296189)
chr3 (202-301)||(40106620-40106719)
chr3 (9-301)||(54364976-54365268)
chr3 (219-301)||(31566161-31566243)
chr3 (9-299)||(39600683-39600973)
chr3 (219-304)||(40273202-40273287)
chr3 (19-301)||(48734147-48734417)
chr3 (212-304)||(7895877-7895969)
chr3 (21-237)||(38430850-38431066)
chr3 (21-300)||(26490317-26490596)
chr3 (220-302)||(31454224-31454306)
chr3 (17-291)||(19757898-19758158)
chr3 (187-304)||(29601060-29601177)
chr3 (217-302)||(45486848-45486933)
chr3 (213-304)||(48532151-48532243)
chr3 (213-304)||(52927845-52927936)
chr3 (216-298)||(32170602-32170684)
chr3 (202-304)||(39208791-39208893)
chr3 (178-301)||(54422837-54422966)
chr3 (19-88)||(27917570-27917639)
chr3 (21-89)||(49503766-49503834)
chr3 (187-301)||(36304134-36304248)
chr3 (17-291)||(19736995-19737255)
chr3 (211-304)||(45374474-45374567)
chr3 (8-127)||(21200539-21200656)
chr3 (236-304)||(45834597-45834665)
chr3 (9-88)||(3987037-3987116)
chr3 (230-301)||(7278675-7278746)
chr3 (202-301)||(14415260-14415358)
chr3 (217-304)||(20208196-20208283)
chr3 (22-299)||(30294125-30294403)
chr3 (206-301)||(30797822-30797917)
chr3 (212-303)||(33271908-33271999)
chr3 (9-96)||(36820166-36820253)
chr3 (23-222)||(52678929-52679124)
chr3 (103-224)||(19162664-19162785)
chr3 (233-298)||(41529975-41530040)
chr3 (189-262)||(41842562-41842635)
chr3 (173-298)||(49841770-49841895)
chr3 (224-304)||(27893294-27893374)
chr3 (44-88)||(38181042-38181086)
chr3 (226-301)||(24778609-24778684)
chr3 (202-301)||(40991614-40991713)
chr3 (223-302)||(46148232-46148311)
chr3 (246-300)||(21862742-21862796)
chr3 (212-290)||(24541343-24541421)
chr3 (203-301)||(31337560-31337658)
chr3 (189-291)||(40116348-40116450)
chr3 (20-126)||(41842686-41842792)
chr3 (188-301)||(11284157-11284270)
chr3 (173-266)||(17022707-17022800)
chr3 (253-302)||(39512777-39512826)
chr3 (248-304)||(344769-344825)
chr3 (220-304)||(3987535-3987619)
chr3 (248-304)||(31146928-31146984)
chr3 (218-278)||(37351606-37351666)
chr3 (187-243)||(37779045-37779101)
chr3 (19-87)||(44134044-44134112)
chr3 (228-299)||(659734-659805)
chr3 (228-303)||(31260965-31261039)
chr3 (202-301)||(42026536-42026635)
chr3 (249-304)||(50249607-50249662)
chr3 (19-88)||(31453151-31453221)
chr3 (248-302)||(37083291-37083345)
chr3 (228-298)||(46367390-46367460)
chr3 (225-303)||(50631879-50631957)
chr3 (23-60)||(31454467-31454504)
chr3 (248-301)||(52882662-52882715)
chr3 (9-61)||(344951-345003)
chr3 (20-88)||(11581445-11581513)
chr3 (228-304)||(30332557-30332633)
chr3 (220-304)||(31452958-31453042)
chr3 (173-237)||(40116532-40116596)
chr3 (222-302)||(40672366-40672446)
chr3 (191-235)||(44571599-44571643)
[»] chr7 (132 HSPs)
chr7 (9-304)||(43281664-43281959)
chr7 (9-304)||(29650374-29650669)
chr7 (9-304)||(12841272-12841567)
chr7 (9-304)||(45836479-45836772)
chr7 (9-304)||(11593950-11594245)
chr7 (9-303)||(37617934-37618229)
chr7 (9-301)||(34869410-34869702)
chr7 (9-304)||(39906369-39906662)
chr7 (10-304)||(2885719-2886013)
chr7 (9-299)||(46355858-46356148)
chr7 (9-303)||(49029266-49029559)
chr7 (9-294)||(35906208-35906493)
chr7 (20-304)||(31682599-31682883)
chr7 (9-304)||(44855171-44855464)
chr7 (9-304)||(33349803-33350098)
chr7 (9-304)||(6374858-6375153)
chr7 (9-304)||(38606994-38607277)
chr7 (31-304)||(36652004-36652277)
chr7 (9-300)||(35558994-35559286)
chr7 (22-304)||(22349623-22349905)
chr7 (10-304)||(43491299-43491593)
chr7 (9-242)||(13859067-13859300)
chr7 (58-304)||(32631615-32631849)
chr7 (9-224)||(31005213-31005428)
chr7 (18-304)||(36869234-36869527)
chr7 (77-304)||(24598185-24598411)
chr7 (29-304)||(15682184-15682459)
chr7 (9-167)||(33072942-33073100)
chr7 (136-301)||(40979928-40980093)
chr7 (136-304)||(38900074-38900241)
chr7 (73-302)||(7273154-7273383)
chr7 (176-302)||(27648937-27649063)
chr7 (92-299)||(31681022-31681226)
chr7 (162-301)||(48919255-48919394)
chr7 (164-302)||(21078062-21078200)
chr7 (10-242)||(23404409-23404640)
chr7 (9-301)||(36136754-36137046)
chr7 (141-304)||(9210701-9210864)
chr7 (206-304)||(28208325-28208423)
chr7 (9-123)||(46014359-46014472)
chr7 (191-300)||(34035155-34035264)
chr7 (22-298)||(28627936-28628212)
chr7 (195-302)||(33073105-33073212)
chr7 (187-304)||(36101774-36101891)
chr7 (10-126)||(7273030-7273146)
chr7 (142-298)||(45601599-45601755)
chr7 (187-304)||(27893560-27893677)
chr7 (202-301)||(33732017-33732114)
chr7 (173-309)||(44951309-44951445)
chr7 (173-300)||(14057632-14057759)
chr7 (173-300)||(14367660-14367787)
chr7 (228-299)||(24777170-24777241)
chr7 (223-302)||(31869101-31869180)
chr7 (191-304)||(42969870-42969983)
chr7 (173-304)||(42187595-42187726)
chr7 (194-302)||(47652722-47652830)
chr7 (139-302)||(1011167-1011329)
chr7 (22-304)||(12966025-12966301)
chr7 (141-258)||(35922376-35922492)
chr7 (9-61)||(32630584-32630636)
chr7 (182-301)||(8519046-8519165)
chr7 (213-300)||(24177628-24177714)
chr7 (20-304)||(26741891-26742177)
chr7 (9-84)||(36514424-36514499)
chr7 (181-301)||(40415169-40415295)
chr7 (246-304)||(31005432-31005490)
chr7 (10-96)||(40169640-40169726)
chr7 (163-300)||(34745891-34746028)
chr7 (9-258)||(47848664-47848912)
chr7 (176-303)||(28355322-28355450)
chr7 (248-304)||(29318792-29318848)
chr7 (182-261)||(8492276-8492355)
chr7 (173-264)||(36239833-36239924)
chr7 (173-304)||(38135210-38135341)
chr7 (237-304)||(40630652-40630719)
chr7 (9-88)||(43282398-43282477)
chr7 (228-302)||(7220965-7221039)
chr7 (217-303)||(25891086-25891172)
chr7 (9-87)||(27021906-27021984)
chr7 (187-301)||(37976403-37976517)
chr7 (9-126)||(19262609-19262725)
chr7 (216-301)||(20158671-20158756)
chr7 (187-304)||(33103094-33103211)
chr7 (197-298)||(47852265-47852366)
chr7 (239-299)||(6263479-6263539)
chr7 (9-85)||(7189442-7189518)
chr7 (220-304)||(14593953-14594037)
chr7 (220-304)||(16013476-16013560)
chr7 (248-304)||(28708610-28708666)
chr7 (248-304)||(29312218-29312274)
chr7 (231-303)||(31840442-31840514)
chr7 (139-242)||(1531420-1531523)
chr7 (26-89)||(14593772-14593835)
chr7 (187-301)||(28541943-28542058)
chr7 (206-301)||(30814125-30814220)
chr7 (190-261)||(31859046-31859117)
chr7 (220-302)||(19119423-19119505)
chr7 (246-304)||(30144982-30145040)
chr7 (248-305)||(5418303-5418360)
chr7 (219-304)||(33281087-33281171)
chr7 (19-96)||(42187470-42187547)
chr7 (9-62)||(45558352-45558405)
chr7 (220-301)||(45558531-45558611)
chr7 (9-126)||(48736074-48736191)
chr7 (232-304)||(1523856-1523928)
chr7 (248-304)||(20525049-20525105)
chr7 (173-264)||(44401164-44401253)
chr7 (26-89)||(16013295-16013358)
chr7 (71-130)||(33139206-33139265)
chr7 (202-301)||(34341395-34341494)
chr7 (205-276)||(34926547-34926618)
chr7 (9-87)||(5335910-5335988)
chr7 (256-302)||(21244282-21244328)
chr7 (173-255)||(21517426-21517508)
chr7 (9-126)||(25579252-25579370)
chr7 (216-266)||(26332908-26332958)
chr7 (230-308)||(28021146-28021224)
chr7 (218-304)||(48515370-48515456)
chr7 (223-304)||(4604751-4604832)
chr7 (20-89)||(30200175-30200244)
chr7 (227-300)||(34029677-34029750)
chr7 (19-84)||(38920794-38920859)
chr7 (228-301)||(40138948-40139021)
chr7 (201-298)||(40149016-40149112)
chr7 (246-303)||(41483714-41483771)
chr7 (20-88)||(18605359-18605427)
chr7 (20-88)||(18637563-18637631)
chr7 (20-88)||(18650997-18651065)
chr7 (21-89)||(36101977-36102045)
chr7 (220-301)||(38921086-38921169)
chr7 (248-304)||(47700053-47700108)
chr7 (232-304)||(48735898-48735970)
[»] chr1 (137 HSPs)
chr1 (9-304)||(4001452-4001747)
chr1 (9-303)||(696259-696554)
chr1 (9-304)||(1210735-1211030)
chr1 (9-304)||(30202127-30202422)
chr1 (9-303)||(34792347-34792641)
chr1 (9-304)||(22090086-22090381)
chr1 (9-301)||(49347393-49347685)
chr1 (9-304)||(8671908-8672203)
chr1 (9-304)||(38807668-38807963)
chr1 (9-304)||(15085924-15086207)
chr1 (9-303)||(9592724-9593018)
chr1 (9-304)||(4029112-4029407)
chr1 (37-304)||(25979228-25979495)
chr1 (9-304)||(51602046-51602341)
chr1 (9-304)||(32082753-32083037)
chr1 (9-277)||(8391762-8392030)
chr1 (9-302)||(51440764-51441057)
chr1 (101-304)||(37311752-37311955)
chr1 (9-300)||(43240380-43240671)
chr1 (9-258)||(32230997-32231246)
chr1 (134-301)||(52921195-52921362)
chr1 (82-304)||(39318193-39318413)
chr1 (139-303)||(4415469-4415633)
chr1 (20-303)||(32404525-32404807)
chr1 (8-298)||(39140509-39140794)
chr1 (49-300)||(52561590-52561841)
chr1 (183-301)||(46423216-46423331)
chr1 (173-302)||(32079176-32079303)
chr1 (183-304)||(4707218-4707338)
chr1 (9-266)||(9509308-9509565)
chr1 (9-299)||(37462878-37463165)
chr1 (9-301)||(2544589-2544875)
chr1 (181-304)||(10200303-10200426)
chr1 (173-304)||(41560383-41560514)
chr1 (191-304)||(24020264-24020377)
chr1 (187-303)||(43375596-43375712)
chr1 (19-304)||(48431396-48431688)
chr1 (212-303)||(44941774-44941865)
chr1 (233-303)||(3777258-3777328)
chr1 (211-301)||(21769711-21769801)
chr1 (173-262)||(16142019-16142108)
chr1 (211-304)||(28090691-28090784)
chr1 (212-301)||(42337749-42337838)
chr1 (176-304)||(19936617-19936745)
chr1 (212-304)||(44751677-44751769)
chr1 (21-304)||(27847797-27848085)
chr1 (228-303)||(29577461-29577536)
chr1 (173-303)||(52532614-52532744)
chr1 (186-303)||(6025772-6025889)
chr1 (228-301)||(28533676-28533749)
chr1 (200-301)||(40568410-40568511)
chr1 (9-301)||(18469082-18469374)
chr1 (173-300)||(29128937-29129065)
chr1 (216-302)||(8796406-8796492)
chr1 (9-263)||(9599432-9599686)
chr1 (202-304)||(34444539-34444641)
chr1 (223-304)||(51584948-51585029)
chr1 (9-301)||(36339804-36340095)
chr1 (173-304)||(3818853-3818984)
chr1 (216-303)||(50846759-50846846)
chr1 (202-304)||(6084158-6084260)
chr1 (215-300)||(22175341-22175426)
chr1 (216-301)||(25715326-25715411)
chr1 (203-304)||(31274398-31274499)
chr1 (173-302)||(36623884-36624012)
chr1 (218-303)||(38869081-38869166)
chr1 (9-89)||(1661420-1661500)
chr1 (228-304)||(5113952-5114028)
chr1 (188-298)||(15438800-15438906)
chr1 (229-301)||(38877343-38877415)
chr1 (248-304)||(43481795-43481851)
chr1 (216-304)||(50636278-50636366)
chr1 (249-304)||(37430417-37430472)
chr1 (174-253)||(44905404-44905483)
chr1 (213-299)||(1290033-1290119)
chr1 (246-304)||(4318842-4318900)
chr1 (76-262)||(27520246-27520428)
chr1 (246-304)||(41165509-41165567)
chr1 (187-304)||(5338881-5338998)
chr1 (173-242)||(7762496-7762565)
chr1 (187-264)||(48865744-48865821)
chr1 (216-301)||(50257767-50257852)
chr1 (228-304)||(1704836-1704912)
chr1 (228-304)||(10569068-10569144)
chr1 (192-296)||(19908040-19908144)
chr1 (216-284)||(29808053-29808121)
chr1 (22-126)||(35828725-35828829)
chr1 (144-304)||(52832170-52832330)
chr1 (249-304)||(2914120-2914175)
chr1 (181-304)||(11941577-11941700)
chr1 (9-96)||(40416361-40416448)
chr1 (9-88)||(43423709-43423788)
chr1 (139-237)||(8628150-8628248)
chr1 (219-305)||(16272818-16272903)
chr1 (254-304)||(38758017-38758067)
chr1 (217-303)||(45510831-45510917)
chr1 (19-88)||(18793201-18793270)
chr1 (216-297)||(27072491-27072572)
chr1 (232-301)||(33560858-33560927)
chr1 (248-300)||(4590533-4590585)
chr1 (248-304)||(7133299-7133355)
chr1 (204-304)||(12930308-12930408)
chr1 (9-89)||(13827929-13828009)
chr1 (223-299)||(15437130-15437206)
chr1 (248-304)||(26299297-26299353)
chr1 (228-304)||(32111986-32112062)
chr1 (249-301)||(43898439-43898491)
chr1 (214-290)||(48801625-48801700)
chr1 (220-303)||(14224286-14224368)
chr1 (21-88)||(27637846-27637913)
chr1 (218-289)||(30445304-30445375)
chr1 (202-301)||(35828562-35828661)
chr1 (216-307)||(52633166-52633257)
chr1 (249-304)||(52814291-52814346)
chr1 (173-266)||(8676897-8676993)
chr1 (228-298)||(16943364-16943434)
chr1 (220-278)||(28528556-28528614)
chr1 (187-297)||(29577147-29577256)
chr1 (19-85)||(37263331-37263397)
chr1 (19-88)||(52073675-52073745)
chr1 (20-89)||(10272260-10272329)
chr1 (173-258)||(11331247-11331332)
chr1 (173-258)||(11489268-11489353)
chr1 (271-304)||(22930645-22930678)
chr1 (219-284)||(26113456-26113521)
chr1 (248-305)||(42539208-42539265)
chr1 (247-300)||(44008806-44008859)
chr1 (216-301)||(50806864-50806949)
chr1 (19-87)||(4380013-4380081)
chr1 (22-126)||(5338727-5338831)
chr1 (250-302)||(8194721-8194773)
chr1 (253-301)||(12231592-12231640)
chr1 (17-125)||(13827746-13827854)
chr1 (9-85)||(51812515-51812591)
chr1 (187-235)||(51812677-51812725)
chr1 (248-300)||(52292268-52292320)
chr1 (189-261)||(52900682-52900754)
[»] chr2 (114 HSPs)
chr2 (9-304)||(38429874-38430168)
chr2 (9-304)||(12734689-12734985)
chr2 (9-304)||(25834671-25834963)
chr2 (9-304)||(3866062-3866357)
chr2 (20-304)||(41197224-41197509)
chr2 (18-304)||(45367622-45367908)
chr2 (9-305)||(2610578-2610874)
chr2 (9-301)||(11992108-11992400)
chr2 (19-301)||(41763043-41763324)
chr2 (9-301)||(38452686-38452977)
chr2 (9-300)||(3243654-3243945)
chr2 (9-308)||(36183441-36183740)
chr2 (9-299)||(8180770-8181060)
chr2 (9-304)||(4807586-4807880)
chr2 (40-304)||(451645-451909)
chr2 (9-301)||(18424378-18424669)
chr2 (73-304)||(7326157-7326388)
chr2 (76-304)||(39029638-39029872)
chr2 (90-302)||(28508749-28508961)
chr2 (26-302)||(24583630-24583907)
chr2 (35-275)||(23997630-23997858)
chr2 (136-304)||(35643065-35643233)
chr2 (133-301)||(31959635-31959803)
chr2 (177-304)||(30306190-30306317)
chr2 (199-304)||(3635320-3635425)
chr2 (190-304)||(227360-227474)
chr2 (139-300)||(45543074-45543234)
chr2 (40-304)||(6237750-6238014)
chr2 (19-304)||(12141544-12141829)
chr2 (187-304)||(9496034-9496151)
chr2 (173-301)||(9996623-9996754)
chr2 (17-95)||(16097192-16097270)
chr2 (180-304)||(38328367-38328489)
chr2 (9-301)||(38434941-38435234)
chr2 (173-304)||(12882042-12882173)
chr2 (9-304)||(43751944-43752239)
chr2 (223-304)||(15025698-15025779)
chr2 (143-304)||(43573127-43573287)
chr2 (187-298)||(19336896-19337007)
chr2 (176-302)||(30743686-30743812)
chr2 (19-300)||(18958907-18959192)
chr2 (17-89)||(43238305-43238377)
chr2 (213-304)||(9531597-9531688)
chr2 (17-304)||(44437718-44438005)
chr2 (217-303)||(12520060-12520146)
chr2 (228-301)||(12474927-12475000)
chr2 (231-304)||(17670680-17670753)
chr2 (217-302)||(19863432-19863517)
chr2 (217-302)||(19867764-19867849)
chr2 (217-302)||(19872665-19872750)
chr2 (147-304)||(33287549-33287706)
chr2 (174-304)||(35755242-35755376)
chr2 (147-299)||(13149460-13149612)
chr2 (204-300)||(39709202-39709298)
chr2 (173-285)||(41545559-41545671)
chr2 (173-304)||(8197538-8197669)
chr2 (173-304)||(8202298-8202429)
chr2 (230-304)||(43832309-43832383)
chr2 (163-304)||(12489799-12489940)
chr2 (228-301)||(17429259-17429332)
chr2 (231-304)||(17626284-17626357)
chr2 (187-298)||(45077895-45078008)
chr2 (180-304)||(6219126-6219250)
chr2 (176-301)||(11412865-11412992)
chr2 (220-266)||(19334187-19334233)
chr2 (19-304)||(9556366-9556650)
chr2 (223-304)||(15015149-15015230)
chr2 (216-297)||(33504421-33504502)
chr2 (218-299)||(34931631-34931712)
chr2 (216-304)||(3481351-3481439)
chr2 (214-302)||(13443907-13443995)
chr2 (187-263)||(36650610-36650686)
chr2 (224-304)||(42543440-42543520)
chr2 (9-56)||(227312-227359)
chr2 (9-88)||(4598775-4598854)
chr2 (221-304)||(42549834-42549917)
chr2 (230-304)||(25384680-25384754)
chr2 (239-301)||(36993755-36993816)
chr2 (223-300)||(624687-624764)
chr2 (225-294)||(4598569-4598638)
chr2 (220-301)||(5758995-5759076)
chr2 (255-304)||(8560803-8560852)
chr2 (248-301)||(10516749-10516802)
chr2 (248-301)||(16521007-16521060)
chr2 (203-308)||(17581643-17581748)
chr2 (220-304)||(12470894-12470978)
chr2 (248-304)||(15775842-15775898)
chr2 (20-88)||(23714474-23714542)
chr2 (20-88)||(24102146-24102214)
chr2 (218-302)||(28960210-28960294)
chr2 (186-302)||(32402667-32402783)
chr2 (228-304)||(33393319-33393394)
chr2 (145-306)||(37470124-37470289)
chr2 (203-298)||(186135-186230)
chr2 (9-126)||(3481134-3481248)
chr2 (249-304)||(14444899-14444954)
chr2 (227-300)||(887065-887139)
chr2 (187-225)||(4682253-4682291)
chr2 (229-303)||(14197205-14197279)
chr2 (220-301)||(33594272-33594354)
chr2 (187-241)||(36616856-36616910)
chr2 (11-89)||(38860165-38860243)
chr2 (9-62)||(11412711-11412764)
chr2 (271-304)||(14530532-14530565)
chr2 (228-277)||(19224990-19225039)
chr2 (248-301)||(32706472-32706525)
chr2 (248-297)||(45482989-45483038)
chr2 (235-299)||(522445-522509)
chr2 (22-62)||(786833-786873)
chr2 (206-278)||(3720438-3720510)
chr2 (19-83)||(6218967-6219031)
chr2 (234-278)||(9078792-9078836)
chr2 (9-89)||(9578915-9578995)
chr2 (32-88)||(41858744-41858800)
[»] chr4 (155 HSPs)
chr4 (9-301)||(27450180-27450471)
chr4 (9-304)||(436219-436514)
chr4 (9-304)||(52569512-52569807)
chr4 (9-301)||(31959814-31960106)
chr4 (9-304)||(48174090-48174385)
chr4 (9-301)||(48622543-48622835)
chr4 (9-303)||(33190846-33191140)
chr4 (38-302)||(32479057-32479321)
chr4 (9-302)||(56375280-56375573)
chr4 (9-304)||(4440843-4441138)
chr4 (9-304)||(33227199-33227494)
chr4 (23-302)||(1777016-1777295)
chr4 (9-304)||(43433914-43434209)
chr4 (11-304)||(53707786-53708079)
chr4 (9-304)||(37797842-37798136)
chr4 (9-302)||(27983190-27983476)
chr4 (9-304)||(39100533-39100827)
chr4 (9-301)||(23906297-23906587)
chr4 (43-304)||(8286455-8286724)
chr4 (9-300)||(26037506-26037797)
chr4 (9-304)||(46582823-46583116)
chr4 (10-294)||(39708424-39708708)
chr4 (9-306)||(28236173-28236469)
chr4 (11-298)||(20192025-20192311)
chr4 (19-266)||(37773486-37773733)
chr4 (9-303)||(47265193-47265494)
chr4 (147-304)||(21528416-21528573)
chr4 (27-275)||(50286970-50287217)
chr4 (114-304)||(21236953-21237143)
chr4 (147-304)||(6957726-6957883)
chr4 (18-298)||(1793459-1793741)
chr4 (147-304)||(12494791-12494948)
chr4 (137-301)||(51811280-51811442)
chr4 (10-254)||(20591353-20591591)
chr4 (19-302)||(51421730-51422013)
chr4 (147-296)||(7947065-7947214)
chr4 (103-251)||(50679588-50679736)
chr4 (30-284)||(20601669-20601917)
chr4 (10-237)||(41009414-41009641)
chr4 (137-300)||(4548140-4548303)
chr4 (17-304)||(45204837-45205131)
chr4 (53-304)||(20821001-20821255)
chr4 (191-304)||(19154860-19154973)
chr4 (196-304)||(19969358-19969466)
chr4 (25-258)||(16002933-16003165)
chr4 (139-304)||(35690391-35690556)
chr4 (187-304)||(55007914-55008031)
chr4 (173-301)||(28550455-28550583)
chr4 (173-304)||(31043226-31043357)
chr4 (77-302)||(28351617-28351842)
chr4 (213-304)||(883357-883448)
chr4 (10-304)||(1211389-1211683)
chr4 (173-304)||(31961263-31961394)
chr4 (219-304)||(19061932-19062017)
chr4 (226-302)||(49939733-49939809)
chr4 (140-226)||(50862764-50862851)
chr4 (141-300)||(53518325-53518483)
chr4 (202-304)||(2589255-2589357)
chr4 (9-63)||(12494740-12494794)
chr4 (187-304)||(25574992-25575109)
chr4 (187-304)||(56225236-56225353)
chr4 (216-304)||(13805262-13805350)
chr4 (176-304)||(31459151-31459279)
chr4 (192-304)||(34208266-34208378)
chr4 (216-303)||(12443292-12443379)
chr4 (225-304)||(32633403-32633482)
chr4 (9-96)||(41192826-41192913)
chr4 (237-304)||(50238612-50238679)
chr4 (237-304)||(50238698-50238765)
chr4 (220-298)||(13262413-13262491)
chr4 (163-305)||(26024846-26024988)
chr4 (20-89)||(35555859-35555928)
chr4 (173-298)||(37042667-37042792)
chr4 (220-305)||(50869876-50869961)
chr4 (216-304)||(6958236-6958323)
chr4 (224-304)||(7066496-7066575)
chr4 (248-304)||(30634103-30634159)
chr4 (216-304)||(51438642-51438730)
chr4 (187-299)||(55388213-55388325)
chr4 (173-304)||(37488245-37488376)
chr4 (9-96)||(44047553-44047640)
chr4 (249-304)||(45209202-45209257)
chr4 (230-301)||(47372915-47372986)
chr4 (9-88)||(54470197-54470276)
chr4 (202-304)||(5306479-5306581)
chr4 (21-87)||(31459032-31459098)
chr4 (19-301)||(46372024-46372306)
chr4 (142-304)||(53540413-53540575)
chr4 (251-304)||(46153940-46153993)
chr4 (248-304)||(1328611-1328667)
chr4 (216-304)||(29399001-29399089)
chr4 (220-304)||(35622673-35622757)
chr4 (249-301)||(38017319-38017371)
chr4 (220-304)||(42285700-42285784)
chr4 (222-302)||(44360289-44360369)
chr4 (253-305)||(56130404-56130456)
chr4 (187-302)||(41192229-41192344)
chr4 (249-304)||(44719358-44719413)
chr4 (143-230)||(55809061-55809148)
chr4 (19-85)||(2588991-2589056)
chr4 (248-302)||(15665330-15665384)
chr4 (26-88)||(26356626-26356688)
chr4 (200-242)||(41729509-41729551)
chr4 (29-119)||(42285882-42285972)
chr4 (150-304)||(42293262-42293416)
chr4 (218-304)||(54935348-54935434)
chr4 (223-300)||(3979124-3979201)
chr4 (202-299)||(22873601-22873698)
chr4 (220-301)||(31897428-31897509)
chr4 (248-304)||(4879106-4879162)
chr4 (248-304)||(15661869-15661925)
chr4 (216-304)||(20105515-20105603)
chr4 (19-87)||(30621418-30621486)
chr4 (228-304)||(32339768-32339844)
chr4 (202-294)||(34233031-34233123)
chr4 (173-237)||(41009283-41009347)
chr4 (20-88)||(42639233-42639301)
chr4 (249-301)||(49738550-49738602)
chr4 (248-296)||(50862860-50862908)
chr4 (216-299)||(1095642-1095725)
chr4 (249-300)||(4136744-4136795)
chr4 (228-299)||(34585691-34585762)
chr4 (218-301)||(36799657-36799740)
chr4 (9-88)||(44360077-44360155)
chr4 (9-88)||(51252674-51252753)
chr4 (19-89)||(10209034-10209104)
chr4 (19-89)||(17900480-17900550)
chr4 (9-87)||(33709914-33709992)
chr4 (181-263)||(36198977-36199059)
chr4 (26-123)||(50680746-50680844)
chr4 (248-302)||(50967027-50967081)
chr4 (19-85)||(55768717-55768783)
chr4 (19-85)||(55832973-55833039)
chr4 (271-304)||(3601416-3601449)
chr4 (228-301)||(8284348-8284421)
chr4 (220-304)||(10209237-10209319)
chr4 (220-304)||(10775468-10775550)
chr4 (189-242)||(26510558-26510611)
chr4 (9-126)||(28497480-28497596)
chr4 (9-62)||(36557268-36557321)
chr4 (19-96)||(49738809-49738886)
chr4 (248-304)||(7544528-7544584)
chr4 (249-301)||(28348287-28348339)
chr4 (187-263)||(28486089-28486165)
chr4 (173-261)||(30621241-30621329)
chr4 (238-302)||(30662042-30662106)
chr4 (220-304)||(35555647-35555731)
chr4 (220-304)||(36556757-36556841)
chr4 (228-304)||(40932921-40932997)
chr4 (220-304)||(45184130-45184214)
chr4 (21-85)||(45423617-45423681)
chr4 (249-301)||(46236719-46236771)
chr4 (249-301)||(50471757-50471809)
chr4 (216-304)||(54963648-54963735)
chr4 (187-283)||(55579200-55579295)
[»] chr8 (111 HSPs)
chr8 (9-304)||(42854001-42854296)
chr8 (9-304)||(36545139-36545434)
chr8 (9-304)||(11523720-11524016)
chr8 (9-304)||(40813314-40813609)
chr8 (9-303)||(36565239-36565533)
chr8 (21-298)||(12491141-12491418)
chr8 (93-304)||(42469724-42469935)
chr8 (9-298)||(8932692-8932982)
chr8 (9-300)||(36394949-36395242)
chr8 (9-302)||(18125163-18125454)
chr8 (17-253)||(39946855-39947091)
chr8 (50-304)||(21121177-21121430)
chr8 (9-284)||(2796547-2796818)
chr8 (146-304)||(14742079-14742234)
chr8 (39-258)||(26904950-26905168)
chr8 (120-304)||(2027631-2027815)
chr8 (34-304)||(37077768-37078034)
chr8 (9-301)||(8879446-8879732)
chr8 (77-297)||(12025847-12026058)
chr8 (9-301)||(45419227-45419517)
chr8 (180-304)||(15215409-15215533)
chr8 (173-302)||(25473402-25473531)
chr8 (189-301)||(44529395-44529507)
chr8 (9-181)||(18751996-18752167)
chr8 (192-304)||(44047529-44047641)
chr8 (173-300)||(25288918-25289045)
chr8 (173-300)||(25300253-25300380)
chr8 (187-304)||(490503-490620)
chr8 (173-301)||(29520803-29520931)
chr8 (142-304)||(35643605-35643765)
chr8 (173-302)||(45041315-45041443)
chr8 (173-304)||(30559847-30559983)
chr8 (28-304)||(32930970-32931245)
chr8 (21-107)||(12796894-12796980)
chr8 (142-301)||(2216411-2216568)
chr8 (22-112)||(6510617-6510707)
chr8 (249-303)||(39967497-39967551)
chr8 (9-302)||(39953263-39953556)
chr8 (187-304)||(42584527-42584643)
chr8 (22-266)||(43904700-43904947)
chr8 (228-304)||(27556299-27556375)
chr8 (223-307)||(30689939-30690023)
chr8 (173-301)||(35914601-35914729)
chr8 (216-304)||(41031417-41031505)
chr8 (216-304)||(41031523-41031611)
chr8 (212-304)||(8255528-8255622)
chr8 (141-304)||(28169514-28169676)
chr8 (229-303)||(1928585-1928659)
chr8 (229-303)||(10668495-10668569)
chr8 (187-304)||(21425214-21425331)
chr8 (202-303)||(23492217-23492318)
chr8 (222-307)||(36042401-36042486)
chr8 (173-300)||(14459049-14459177)
chr8 (191-304)||(31715992-31716107)
chr8 (9-304)||(32043580-32043872)
chr8 (228-304)||(32276894-32276970)
chr8 (228-304)||(32569707-32569783)
chr8 (216-300)||(36143538-36143622)
chr8 (220-303)||(30812814-30812897)
chr8 (218-300)||(18473973-18474055)
chr8 (220-304)||(7531641-7531725)
chr8 (249-301)||(12611727-12611779)
chr8 (249-297)||(26055651-26055699)
chr8 (239-303)||(35323993-35324057)
chr8 (148-300)||(35362651-35362803)
chr8 (184-304)||(41444336-41444456)
chr8 (223-303)||(43733410-43733490)
chr8 (202-298)||(44699649-44699745)
chr8 (17-96)||(2776434-2776513)
chr8 (216-303)||(10824187-10824274)
chr8 (220-295)||(16351578-16351653)
chr8 (9-60)||(25985509-25985560)
chr8 (186-301)||(26363655-26363768)
chr8 (202-305)||(30198262-30198365)
chr8 (254-304)||(1064955-1065005)
chr8 (19-61)||(25985839-25985881)
chr8 (219-297)||(39702154-39702232)
chr8 (222-305)||(41212064-41212149)
chr8 (206-299)||(2518400-2518493)
chr8 (19-96)||(9695631-9695708)
chr8 (251-304)||(16921451-16921504)
chr8 (228-301)||(35646930-35647003)
chr8 (21-126)||(36143367-36143472)
chr8 (220-305)||(38901815-38901900)
chr8 (23-75)||(7103274-7103326)
chr8 (260-304)||(32978115-32978159)
chr8 (188-299)||(16917352-16917462)
chr8 (173-224)||(25439479-25439530)
chr8 (148-275)||(38391919-38392046)
chr8 (248-303)||(39651026-39651081)
chr8 (228-298)||(1313773-1313843)
chr8 (249-303)||(11129951-11130004)
chr8 (187-266)||(12966347-12966428)
chr8 (19-61)||(13986494-13986536)
chr8 (202-304)||(14903744-14903846)
chr8 (206-284)||(16035744-16035822)
chr8 (191-300)||(36069774-36069883)
chr8 (19-80)||(41444547-41444608)
chr8 (250-302)||(4558207-4558259)
chr8 (173-301)||(4955345-4955473)
chr8 (248-304)||(12985919-12985975)
chr8 (249-301)||(16971772-16971824)
chr8 (218-266)||(30456329-30456377)
chr8 (25-61)||(30456452-30456488)
chr8 (142-266)||(30783077-30783201)
chr8 (252-304)||(35085134-35085186)
chr8 (248-304)||(40982893-40982949)
chr8 (217-305)||(42493426-42493514)
chr8 (21-89)||(44681251-44681319)
chr8 (142-237)||(45512558-45512654)
chr8 (19-87)||(45512709-45512777)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (9-304)||(5258145-5258440)
chr6 (9-304)||(28085366-28085661)
chr6 (17-298)||(30031254-30031535)
chr6 (9-304)||(32755911-32756206)
chr6 (9-266)||(21351872-21352129)
chr6 (20-301)||(35043441-35043722)
chr6 (9-300)||(608147-608442)
chr6 (9-261)||(5631812-5632064)
chr6 (9-301)||(9706766-9707052)
chr6 (9-304)||(20427633-20427928)
chr6 (10-304)||(12890575-12890860)
chr6 (17-304)||(14030805-14031080)
chr6 (30-303)||(30679417-30679680)
chr6 (9-167)||(10099993-10100151)
chr6 (142-304)||(34143762-34143924)
chr6 (142-304)||(34156378-34156540)
chr6 (21-258)||(33496963-33497198)
chr6 (182-304)||(3206456-3206578)
chr6 (19-302)||(9593709-9593988)
chr6 (192-304)||(31819004-31819116)
chr6 (190-301)||(34934830-34934941)
chr6 (84-262)||(5080905-5081083)
chr6 (73-196)||(7133800-7133923)
chr6 (73-196)||(7136723-7136846)
chr6 (25-301)||(2689646-2689915)
chr6 (141-301)||(5095956-5096116)
chr6 (220-304)||(30789071-30789155)
chr6 (19-232)||(28026896-28027108)
chr6 (173-304)||(10098893-10099022)
chr6 (142-304)||(34502-34664)
chr6 (216-304)||(4245869-4245957)
chr6 (181-303)||(5897619-5897741)
chr6 (173-301)||(31818685-31818813)
chr6 (173-266)||(24665965-24666058)
chr6 (139-266)||(6055806-6055933)
chr6 (180-299)||(7492550-7492669)
chr6 (215-301)||(12119642-12119729)
chr6 (228-301)||(1615223-1615296)
chr6 (27-96)||(24665818-24665887)
chr6 (216-304)||(579615-579703)
chr6 (9-89)||(33084048-33084128)
chr6 (230-302)||(12133901-12133973)
chr6 (228-303)||(9109507-9109582)
chr6 (202-304)||(6293389-6293491)
chr6 (187-260)||(14389202-14389275)
chr6 (229-298)||(21886314-21886383)
chr6 (248-301)||(33730194-33730247)
chr6 (224-304)||(38976-39056)
chr6 (142-302)||(8364679-8364839)
chr6 (20-87)||(2079341-2079408)
chr6 (17-52)||(5080853-5080888)
chr6 (250-309)||(6906819-6906878)
chr6 (228-298)||(21089606-21089676)
chr6 (271-304)||(3127273-3127306)
chr6 (271-304)||(4878294-4878327)
chr6 (19-60)||(6641650-6641691)
chr6 (22-82)||(8364575-8364635)
chr6 (204-304)||(9568884-9568983)
chr6 (21-89)||(14389380-14389447)
chr6 (248-304)||(30642998-30643054)
[»] chr5 (104 HSPs)
chr5 (9-294)||(38684957-38685242)
chr5 (9-301)||(3301834-3302126)
chr5 (9-304)||(4496374-4496669)
chr5 (9-301)||(16347380-16347670)
chr5 (9-304)||(12492381-12492679)
chr5 (9-304)||(28976856-28977151)
chr5 (9-302)||(1287578-1287871)
chr5 (9-302)||(24178500-24178793)
chr5 (9-304)||(14665704-14665997)
chr5 (22-300)||(20456776-20457054)
chr5 (29-304)||(10639314-10639587)
chr5 (9-299)||(2075475-2075766)
chr5 (19-304)||(1275264-1275549)
chr5 (108-303)||(13561384-13561579)
chr5 (77-304)||(2915493-2915719)
chr5 (9-303)||(34273017-34273297)
chr5 (114-304)||(14911267-14911457)
chr5 (150-304)||(29816513-29816667)
chr5 (11-304)||(26884686-26884979)
chr5 (163-301)||(16913882-16914021)
chr5 (192-302)||(5558314-5558424)
chr5 (180-304)||(2393038-2393161)
chr5 (9-254)||(14749297-14749542)
chr5 (199-304)||(30213755-30213860)
chr5 (139-302)||(28002-28165)
chr5 (59-297)||(38501422-38501660)
chr5 (10-261)||(36215489-36215730)
chr5 (173-304)||(28276392-28276523)
chr5 (211-302)||(18855799-18855890)
chr5 (181-304)||(39040918-39041041)
chr5 (182-304)||(418031-418153)
chr5 (202-304)||(32442123-32442224)
chr5 (19-92)||(31636129-31636202)
chr5 (9-270)||(32516546-32516806)
chr5 (19-89)||(33667216-33667286)
chr5 (187-301)||(43557833-43557947)
chr5 (230-303)||(408492-408565)
chr5 (187-304)||(14667939-14668056)
chr5 (173-289)||(9235201-9235316)
chr5 (220-299)||(3442873-3442952)
chr5 (173-303)||(11675683-11675814)
chr5 (182-301)||(31220546-31220664)
chr5 (216-298)||(7640510-7640592)
chr5 (202-304)||(20367076-20367178)
chr5 (9-126)||(79503-79620)
chr5 (181-302)||(2090575-2090696)
chr5 (193-302)||(36551320-36551429)
chr5 (190-255)||(42504293-42504358)
chr5 (26-301)||(1525651-1525923)
chr5 (216-304)||(6859578-6859666)
chr5 (142-302)||(7678601-7678760)
chr5 (228-304)||(28411885-28411961)
chr5 (8-127)||(42199277-42199394)
chr5 (248-304)||(42576239-42576295)
chr5 (229-296)||(2713146-2713213)
chr5 (202-297)||(8081967-8082059)
chr5 (223-298)||(11002424-11002499)
chr5 (216-302)||(2645187-2645273)
chr5 (10-88)||(10082952-10083030)
chr5 (18-96)||(15168791-15168869)
chr5 (228-302)||(38132545-38132619)
chr5 (224-301)||(9121078-9121155)
chr5 (9-62)||(14667753-14667806)
chr5 (20-89)||(28676596-28676665)
chr5 (187-284)||(30588615-30588712)
chr5 (216-304)||(21193649-21193737)
chr5 (23-87)||(37065533-37065597)
chr5 (220-303)||(5860035-5860118)
chr5 (21-303)||(7359259-7359539)
chr5 (228-303)||(32366187-32366262)
chr5 (173-239)||(2552936-2553002)
chr5 (19-89)||(2712944-2713014)
chr5 (239-301)||(9234106-9234168)
chr5 (187-237)||(17340500-17340550)
chr5 (19-96)||(18351112-18351190)
chr5 (176-304)||(14725675-14725803)
chr5 (202-307)||(23980127-23980232)
chr5 (248-301)||(27386569-27386622)
chr5 (227-304)||(27800036-27800113)
chr5 (229-302)||(42272687-42272760)
chr5 (202-266)||(18350937-18351001)
chr5 (26-86)||(21952364-21952424)
chr5 (228-304)||(41200343-41200419)
chr5 (216-303)||(9400708-9400795)
chr5 (221-296)||(28985285-28985360)
chr5 (187-302)||(38684648-38684763)
chr5 (202-277)||(41808105-41808180)
chr5 (182-304)||(41894229-41894358)
chr5 (173-263)||(6889147-6889237)
chr5 (248-301)||(3000968-3001021)
chr5 (243-304)||(4653476-4653537)
chr5 (253-302)||(5303681-5303730)
chr5 (19-88)||(6888993-6889062)
chr5 (228-303)||(9917458-9917530)
chr5 (187-300)||(12576861-12576974)
chr5 (228-301)||(28186782-28186855)
chr5 (176-225)||(36200886-36200935)
chr5 (253-301)||(7367172-7367220)
chr5 (188-292)||(15588399-15588503)
chr5 (249-305)||(36123178-36123234)
chr5 (220-303)||(37065677-37065761)
chr5 (248-284)||(39322096-39322132)
chr5 (142-242)||(43035104-43035204)
chr5 (22-126)||(43475243-43475347)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (9-304)||(945-1240)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (9-304)||(31458-31753)
scaffold0018 (19-89)||(44080-44150)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (9-301)||(82711-83000)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (133-301)||(16692-16860)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (33-304)||(86606-86877)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (89-304)||(4706-4921)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (19-304)||(4277-4553)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (147-304)||(25529-25686)
scaffold0157 (9-63)||(25683-25737)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (61-304)||(11546-11787)
scaffold0113 (17-87)||(11810-11880)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (173-302)||(485-614)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (173-304)||(14737-14868)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (211-304)||(28886-28979)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (142-304)||(58223-58385)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (159-299)||(7580-7720)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (173-304)||(1519-1647)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (173-300)||(160325-160452)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (213-299)||(16438-16524)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (216-302)||(6771-6857)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (251-304)||(19149-19202)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (181-237)||(39481-39537)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 110)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 25191359 - 25191674
Alignment:
Q  1 acatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191359 acatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaaattggaagaaaatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccg 25191458  T
Q  101 ttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191459 ttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 25191558  T
Q  201 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25191559 caatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttg 25191658  T
Q  301 ttgtcgtctttgtcac 316  Q
    | || |||||||||||    
T  25191659 tcgttgtctttgtcac 25191674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 22063 - 22357
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22063 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 22161  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||| |||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22162 agagtagattaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 22261  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22262 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 22357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 35033136 - 35033428
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35033136 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccattgtaaga 35033235  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35033236 agagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 35033335  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35033336 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttgttgt 35033428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 5168822 - 5169117
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5168822 agagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 5168921  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5168922 agagtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagt 5169021  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5169022 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 5169117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 47233888 - 47233596
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  47233888 agagagaatggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 47233789  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  47233788 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaat 47233689  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47233688 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 47233596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 52138790 - 52139084
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  52138790 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaaga 52138889  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||  |||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52138890 agaatagattaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 52138989  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  52138990 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 52139084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 28245427 - 28245721
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  28245427 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaaga 28245526  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28245527 agagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagt 28245626  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    | ||||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  28245627 tggatccaaatttggtgtataatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgagataaggcttgattgctgttgttg 28245721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 53519603 - 53519865
Alignment:
Q  30 tatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  53519603 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggag 53519702  T
Q  130 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 229  Q
    |  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||            | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  53519703 agtcatgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccatt------------aaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttg 53519790  T
Q  230 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53519791 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgt 53519865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 54279010 - 54279304
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  54279010 agagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaa 54279109  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54279110 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 54279209  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||  ||||||| ||||||||||    
T  54279210 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcaatgtagccgatcccacttaataagataagacttggtt-ttgttgttgt 54279304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 51447991 - 51447714
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  51447991 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatca 51447892  T
Q  120 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 219  Q
    ||||||| |||  || ||||||||||       |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51447891 aatggaggagagtcaagttaaaagag-------aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 51447799  T
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
     |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51447798 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51447714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 304
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508520
Alignment:
Q  52 aatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 151  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  152 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 251  Q
    ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  252 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48508520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 301
Target Start/End: Original strand, 38850123 - 38850403
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||   ||| |||||||||| ||||| ||    
T  38850123 gtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaagaagagtagatcgaa 38850222  T
Q  122 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgagttagatccaaata 220  Q
    ||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  || |||||     
T  38850223 tggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatgaattgaattcaaatt 38850322  T
Q  221 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||  ||| |||||||||||    
T  38850323 tggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgttgt 38850403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43695048 - 43694768
Alignment:
Q  18 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||  ||||    
T  43695048 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagat 43694949  T
Q  118 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 217  Q
    |||||| ||  |||    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  43694948 caaatgaag--gaa----gttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaa 43694855  T
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |   ||||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| || | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  43694854 actaggtttatgatagaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataaagctgggttgttgttgttgt 43694768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 136 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12096870 - 12096702
Alignment:
Q  136 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  12096870 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 12096771  T
Q  236 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12096770 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12096702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Original strand, 54128378 - 54128662
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||| |||||| ||||||   |  ||| | |||| |||||    
T  54128378 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatc 54128477  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt-gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 217  Q
    | ||||||   |  ||| |  ||||||||||||||||| |||  ||||| |||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  54128478 agatggaggttagtcagatcgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaa 54128577  T
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54128578 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 54128662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262426
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccac 53262394  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53262395 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 53262426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33272318 - 33272122
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctata----gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgt 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||| |||| ||    
T  33272318 agagagagtgggggtagcacctatatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggt 33272220  T
Q  105 aagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 202  Q
    |||||| | | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33272219 aagaagtgtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 45289385 - 45289091
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaa 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||||| ||  ||||||   || ||||    
T  45289385 agagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaa 45289286  T
Q  107 gaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 206  Q
    |||||| |||||| |||||| | |   || ||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  45289285 gaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaagatctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatga 45289186  T
Q  207 gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45289185 gttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45289091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 38060421 - 38060579
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  38060421 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaaga 38060520  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 167  Q
    |||| |||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  38060521 agagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaac 38060579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  26 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa-gacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||   || |||||||||| |||||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  125 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaaga---tttagaggtcaatgagttagatccaaatat 221  Q
    || |||  | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  |||||| ||||| ||||||   | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcatta-aaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatat 48953499  T
Q  222 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    | ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  48953498 gatttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 52156228 - 52156081
Alignment:
Q  157 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 256  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  52156228 actaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatcc 52156129  T
Q  257 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  52156128 atgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 52156081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19676362 - 19676079
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||| | || |||  |||||||||||    
T  19676362 ggggtagcacctatagtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatc 19676263  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    | || ||| |||  ||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19676262 agatagaggagagtcagatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaa 19676164  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||| | | ||||||| || |||| | | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19676163 tatgctgtatgatagagcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgttg 19676079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 54425244 - 54424959
Alignment:
Q  29 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaag-------agaagatcaaa 121  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| ||       || |||||| |    
T  54425244 ctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtagggagaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcaga 54425145  T
Q  122 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 221  Q
    ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  54425144 tggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagagggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatat 54425045  T
Q  222 ggtttttgatagaacactatgacat------catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| || || |||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  54425044 ggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgaccccacttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54424959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 188 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 311422 - 311306
Alignment:
Q  188 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 287  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  311422 aagatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 311323  T
Q  288 ttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||    
T  311322 ttggttgttgttgttgt 311306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 49042090 - 49042219
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt-tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 271  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |    
T  49042090 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 49042189  T
Q  272 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49042190 cttggtgagataaggcttggttgttgttgt 49042219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 45728137 - 45728324
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag-aagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||    
T  45728137 agagagagtgggggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaag 45728236  T
Q  108 aagag--aagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatt 193  Q
    |||||   | ||||||||||| |||  || |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  45728237 aagagtatatatcaaatggaggagagtcatgttaaaagagatagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 301
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060996
Alignment:
Q  163 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 262  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtag 38060957  T
Q  263 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  38060958 ccgaccccacttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 3186771 - 3186973
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 120  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||   ||||||  | ||||||||| |  ||||||     
T  3186771 ggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaataggct-agatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcag 3186869  T
Q  121 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 220  Q
    || ||||| |  ||||| ||||||||| ||| || | |||||||||| ||  || ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3186870 attgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaatacctaagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaata 3186969  T
Q  221 tggt 224  Q
    ||||    
T  3186970 tggt 3186973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 266
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235384
Alignment:
Q  35 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 134  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||| |||||| | |  ||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  135 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 234  Q
    | | |||||||||||||||||| | || ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||  ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  235 acactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    ||| |||| | | | |||||||||||||||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga 39235384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555329
Alignment:
Q  197 aggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 296  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  297 gttgttgt 304  Q
    ||||||||    
T  47555336 gttgttgt 47555329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 194 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2133719 - 2133609
Alignment:
Q  194 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 293  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  2133719 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggcttggtt 2133620  T
Q  294 gttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||    
T  2133619 gttgttgttgt 2133609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42510292 - 42510013
Alignment:
Q  23 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||  |||||  |||||   || ||||| |||| |||||| ||    
T  42510292 tagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagat 42510195  T
Q  123 ggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg 222  Q
    |||| | |  ||| | |  ||||| | ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| || | |||||||    
T  42510194 ggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatg 42510095  T
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||| | || || |||||| ||||||||||||    
T  42510094 gtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgttgttgt 42510013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 49503695 - 49503565
Alignment:
Q  174 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaact 273  Q
    |||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| || | |||| | | ||||||||||||||||||| || |||    
T  49503695 agaaactattaggaaagatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccctact 49503596  T
Q  274 tagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49503595 tagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 49503565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 50960915 - 50960636
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||     ||   || | |||||||| |||||    
T  50960915 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc----tatgttgtagaaagaagagtagatc 50960820  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    | |||||| |||  | | |  ||||||| ||||||||| |||  ||||   |  ||||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  50960819 agatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaa 50960720  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||| | | ||||| || ||||   | ||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  50960719 tatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgctgtt 50960636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 48712196 - 48712075
Alignment:
Q  180 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 279  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||     
T  48712196 cattaggaaagatttagatattgatgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtgg 48712097  T
Q  280 gataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48712096 gataatgcttggttgttgttgt 48712075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 15296061 - 15296189
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||  ||||||||| ||||   | ||||||||||||| ||||| || ||    
T  15296061 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccac 15296160  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15296161 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15296189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106620
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 54365268 - 54364976
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga--agacccgtagataccgttgtaa 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||  | ||| |||||| |  || |||    
T  54365268 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataa 54365170  T
Q  107 gaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 206  Q
    | |||| |||||||||| || | |  |||   |  ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || ||| | ||||     
T  54365169 ggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgt 54365070  T
Q  207 gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  54365069 gttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccga-ccacactagtgggataaggcttggctgttgttgt 54364976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31566243 - 31566161
Alignment:
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31566243 tatggtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31566161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39600973 - 39600683
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||| | || |  ||     
T  39600973 agagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtggttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgagg 39600874  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||| || ||| | |  ||| ||  |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  39600873 agagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagt 39600774  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    | ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||||| || || | || |||| ||| |||||  ||||||| |||||    
T  39600773 tggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaaccaaccccactttgtgggataagacttggtttttgtt 39600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 40273287 - 40273202
Alignment:
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || | |||||||||||||||||    
T  40273287 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgttgt 40273202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 48734417 - 48734147
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | |||||  | || ||| |||||| |||||    
T  48734417 ggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatc 48734318  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    | |||||||  |   || | |||||||||||||||||  ||            ||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||    
T  48734317 agatggagattagttagatcaaaagaggtagaggaaggcct------------tgaaaaactattagagaagatttaaaggtcaacgagttgggtccaaa 48734230  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
     ||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  48734229 catggtttatgatagaacattatggcgtaagttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 48734147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895877
Alignment:
Q  212 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 7895877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 38430850 - 38431066
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |   || | |||||||||||| |||| | ||||   || ||| |||||| ||||||     
T  38430850 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcag 38430949  T
Q  121 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 220  Q
    |||||| |||  ||  | ||||||||||||||||||  ||  ||||| |   ||||||| |||    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38430950 atggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaaactattgtggaaggtttagaggttaatgagttggatccaaata 38431049  T
Q  221 tggtttttgatagaaca 237  Q
    |||||| ||||||||||    
T  38431050 tggtttatgatagaaca 38431066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 26490317 - 26490596
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| | ||||||  | |||   || ||| |||||| ||||||     
T  26490317 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcag 26490416  T
Q  121 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 220  Q
    || ||| |||| ||  ||| | |||| || ||||||  ||  ||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||     
T  26490417 atagaggagaatcatattagatgaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatg 26490516  T
Q  221 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    || |||   |||||| | |||| | | ||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||| |||||||||    
T  26490517 tgatttcatatagaatattatggcgtaatttgatccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31454306 - 31454224
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31454306 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31454224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 19757898 - 19758158
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||   |||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||    
T  19757898 tgggggcagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtaga 19757997  T
Q  117 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 216  Q
    ||| |||||| |||   || | |||| ||||||||||||| |||            || |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||      
T  19757998 tcagatggaggagagttagatcaaaa-aggtagaggaagaccta------------gaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctc 19758084  T
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 291  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19758085 aatatggtttatgatagaacattatggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19758158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 29601060 - 29601177
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||  |    
T  29601060 aaagatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggatacgg 29601159  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  29601160 cttggttcttgttgttgt 29601177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45486933 - 45486848
Alignment:
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45486933 aatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 45486848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 304
Target Start/End: Original strand, 48532151 - 48532243
Alignment:
Q  213 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca-tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48532151 tccaaattttgtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48532243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927845
Alignment:
Q  213 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||  || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgatgttgt 52927845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 298
Target Start/End: Original strand, 32170602 - 32170684
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32170602 aaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208893
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || || | |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttgt 39208890  T
Q  302 tgt 304  Q
    |||    
T  39208891 tgt 39208893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 54422966 - 54422837
Alignment:
Q  178 accattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat------catttgatccatgtagccgatccaa 271  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| || || |    
T  54422966 accattaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgacccca 54422867  T
Q  272 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  54422866 cttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54422837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Original strand, 27917570 - 27917639
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  27917570 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagac 27917639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 49503834 - 49503766
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  49503834 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 49503766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 301
Target Start/End: Original strand, 36304134 - 36304248
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||| | ||||| || |    
T  36304134 aaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactcaatgtgacaagg 36304233  T
Q  287 cttggttgttgttgt 301  Q
    || ||||||||||||    
T  36304234 ctcggttgttgttgt 36304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 19736995 - 19737255
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||   |||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||    
T  19736995 tgggggcagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtaga 19737094  T
Q  117 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 216  Q
    ||| |||||| |||   || | |||| |||| |||||||| |||            || |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||      
T  19737095 tcagatggaggagagttagatcaaaa-aggttgaggaagaccta------------gaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctc 19737181  T
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 291  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||  || ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19737182 aatatggtttatgataaaacattatggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19737255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45374567 - 45374474
Alignment:
Q  211 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| | | |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45374567 gatccaactatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45374474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Original strand, 21200539 - 21200656
Alignment:
Q  8 cagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | |  |||||    
T  21200539 cagagagaattggggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaag 21200636  T
Q  108 aagagaagatcaaatggaga 127  Q
     |||| |||||| |||||||    
T  21200637 gagagtagatcacatggaga 21200656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834597
Alignment:
Q  236 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45834597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 3987037 - 3987116
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||    
T  3987037 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 3987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 301
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278746
Alignment:
Q  230 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgt 7278746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415260
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Original strand, 20208196 - 20208283
Alignment:
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||  |||||||||    
T  20208196 aatatggcatttgatagaactttatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataacgcttggttaatgttgttgt 20208283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30294403 - 30294125
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacat---gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||   |||||||||||||  |||||| ||   |||||||||| | ||     
T  30294403 gtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccgtaagaagagtaaatt 30294304  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    | ||  || |||  | ||| |||||||||||||||||| |||  | ||| ||  || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  30294303 agattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaatgagttggatctaag 30294204  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||  ||||| || ||||| || | |  |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  30294203 tatgatttatgataaaacactatggca--atttgttctatgtaaccaaccttacttagtgggataaaacttggttgttgtt 30294125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797822
Alignment:
Q  206 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 30797822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271908
Alignment:
Q  212 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||| |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgttgttg 33271908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 36820253 - 36820166
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 96  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36820253 agagagagttggggtagcacctatattagcaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagacccatagat 36820166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 52679124 - 52678929
Alignment:
Q  23 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgtt-gtaagaagagaagatcaaa 121  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||||||| |  |||||  |    
T  52679124 tagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgtagat---gttggtaagaaaaatagatcgga 52679028  T
Q  122 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 221  Q
    ||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  52679027 tggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaac--taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgaattcaaatat 52678930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19162785 - 19162664
Alignment:
Q  103 gtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 202  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||  ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| | ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  19162785 gtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaagagttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagatta 19162686  T
Q  203 atgagttagatccaaatatggt 224  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||    
T  19162685 atgagttggatgcaagtatggt 19162664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530040
Alignment:
Q  233 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41842635 - 41842562
Alignment:
Q  189 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 262  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  41842635 agatctagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtag 41842562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 49841770 - 49841895
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || ||    
T  49841770 gagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccac 49841869  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
     ||| | | ||| |||||||||||||    
T  49841870 atagcgaggtaaggcttggttgttgt 49841895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Original strand, 27893294 - 27893374
Alignment:
Q  224 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| || ||||||    
T  27893294 tttttgaaagaacactatggcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctttgttgatgctgttgt 27893374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 38181086 - 38181042
Alignment:
Q  44 tggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38181086 tggtagaaattagacttagatgatttagacatgttgagagaagac 38181042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24778684 - 24778609
Alignment:
Q  226 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  24778684 tttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 24778609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 301
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991713
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgttgt 40991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 302
Target Start/End: Original strand, 46148232 - 46148311
Alignment:
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  46148232 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgtt 46148311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21862796 - 21862742
Alignment:
Q  246 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21862796 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgttg 21862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541343
Alignment:
Q  212 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 290  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttg 24541343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31337658 - 31337560
Alignment:
Q  203 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || || |||| |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  31337658 atgagttggatagaaatatggtatttgatagaacattatgacattgtttgatctatttaaccgacctcacttagtggtataaagcttggttgttgttgt 31337560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40116450 - 40116348
Alignment:
Q  189 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 288  Q
    |||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||| |   ||||||| ||||| |||    
T  40116450 agatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataaggct 40116351  T
Q  289 tgg 291  Q
    |||    
T  40116350 tgg 40116348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 41842792 - 41842686
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||| |  |||||||||||||| | |||||| | || ||||  |||| ||||||    
T  41842792 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagtaatgagagtagatca 41842693  T
Q  120 aatggag 126  Q
    |||||||    
T  41842692 aatggag 41842686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 301
Target Start/End: Original strand, 11284157 - 11284270
Alignment:
Q  188 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 287  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | |||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||    
T  11284157 aagatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgcatcgtttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataaggc 11284256  T
Q  288 ttggttgttgttgt 301  Q
    ||| ||||||||||    
T  11284257 ttgcttgttgttgt 11284270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17022800 - 17022707
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||| | ||||   |||||| || |||||||||||    
T  17022800 gagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcatttaattcatgtagccga 17022707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 302
Target Start/End: Original strand, 39512777 - 39512826
Alignment:
Q  253 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39512777 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 39512826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 344825 - 344769
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  344825 atttcatcgatgtagccgacccaacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 344769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Original strand, 3987535 - 3987619
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |  |||||| |||||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  3987535 atggtttttgataggacactatggcgttgtttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttgt 3987619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Original strand, 31146928 - 31146984
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  31146928 atttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 31146984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 278
Target Start/End: Original strand, 37351606 - 37351666
Alignment:
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 278  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  37351606 atatggtttttgttagaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 37351666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 37779045 - 37779101
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 243  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  37779045 aaagatttagagattaatgagctagatccgaatatggtttatgatagaacattatga 37779101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 44134112 - 44134044
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 87  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||    
T  44134112 ggggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 299
Target Start/End: Original strand, 659734 - 659805
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    |||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  659734 tgatagaacattatggcagtgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgtt 659805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31261039 - 31260965
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  31261039 tgatagaacactgtgacatcatttgattcatg-cgccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgtttttgttg 31260965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42026635 - 42026536
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||| ||| ||||||| || || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  42026635 aatgagttagatagaaatatggtatatgatagaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataagacttggttcttgttgt 42026536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 304
Target Start/End: Original strand, 50249607 - 50249662
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  50249607 tttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggatacggcttggttgttgttgttgt 50249662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 31453221 - 31453151
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||    
T  31453221 ggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37083345 - 37083291
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37083345 atttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 37083291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 46367460 - 46367390
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  46367460 tgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaagcttggttgttgt 46367390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 50631957 - 50631879
Alignment:
Q  225 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||| |||| |||| | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  50631957 ttttgatagaacattatgccattgtttgattcatgcagccaaccccacttagtgggataaagattggttgttgttgttg 50631879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 31454504 - 31454467
Alignment:
Q  23 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 60  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31454504 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 31454467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 52882715 - 52882662
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  52882715 atttgatccatgtagccaaccccacttagtgggagaaggcttggttgttgttgt 52882662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 345003 - 344951
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 61  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  345003 agagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaataggctta 344951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Original strand, 11581445 - 11581513
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||    
T  11581445 gggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagac 11581513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30332633 - 30332557
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||| | || || ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  30332633 tgatagaacattatggcataatttgatccaggcagcctaccccacctagtgggatacggcttggttgttgttgttgt 30332557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31453042 - 31452958
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||| | || |||||| | || |||||| |||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  31453042 atggtttttgacataatactatggcgtcgtttgattcatgtagcagaccccacttagtggaataaggcttggttgttgtttttgt 31452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40116596 - 40116532
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 237  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||    
T  40116596 gagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaaca 40116532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40672446 - 40672366
Alignment:
Q  222 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  40672446 ggtttttgataggtcattatggcataatttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataaggcttggttatagttgtt 40672366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Original strand, 44571599 - 44571643
Alignment:
Q  191 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 235  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44571599 atttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 44571643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 132)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 43281664 - 43281959
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43281664 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 43281763  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43281764 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 43281863  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  43281864 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttgt 43281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 29650374 - 29650669
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29650374 agagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 29650473  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29650474 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 29650573  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29650574 ttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29650669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12841567 - 12841272
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12841567 agagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 12841468  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12841467 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 12841368  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |  |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12841367 tgtatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12841272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45836772 - 45836479
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45836772 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 45836673  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||   ||||||   |||||||||| ||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45836672 agagtagatcaaatggaggagagttaggttat--gaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 45836575  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  45836574 tggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 45836479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 11593950 - 11594245
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  11593950 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaaga 11594049  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11594050 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 11594149  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11594150 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 11594245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 37617934 - 37618229
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37617934 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaag 37618033  T
Q  108 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37618034 aagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataag 37618133  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    || ||||||||| |||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37618134 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 37618229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 34869410 - 34869702
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  34869410 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaaga 34869509  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||| ||||| | |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34869510 agagtagatccaatggtggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 34869609  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34869610 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 34869702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39906662 - 39906369
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||    
T  39906662 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaaga 39906563  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  39906562 agagtagatcaaatggaggagt--caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgact 39906465  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39906464 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 39906369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2886013 - 2885719
Alignment:
Q  10 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  2886013 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaa 2885914  T
Q  110 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 209  Q
    ||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2885913 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagtt 2885814  T
Q  210 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2885813 ggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2885719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 46356148 - 46355858
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||   || ||||||    
T  46356148 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaaga 46356049  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  46356048 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 46355949  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46355948 tggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgccatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 49029266 - 49029559
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  49029266 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 49029365  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
     ||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49029366 cgaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 49029465  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  49029466 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatacggc-tggttgttgttgttg 49029559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35906493 - 35906208
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35906493 agagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 35906394  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| | |||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35906393 agagtatatcatatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagt 35906294  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 294  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  35906293 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 35906208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31682883 - 31682599
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  31682883 gggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatca 31682784  T
Q  120 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 219  Q
    ||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  31682783 aatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccatat 31682684  T
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
     |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31682683 ttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31682599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44855464 - 44855171
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  44855464 agagagagtggggatagtacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataaga 44855365  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44855364 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 44855265  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||||| ||||  ||||||||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44855264 tggatccaaatttggtttatgat--aacactatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44855171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33350098 - 33349803
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33350098 agagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 33349999  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33349998 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagt 33349899  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | |  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33349898 tggatccaaatttggtgtatagtagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 33349803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 6374858 - 6375153
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||    
T  6374858 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagaccagtagatgctgtggtaaga 6374957  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    || | |||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  6374958 agggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcagtgagt 6375057  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  6375058 tggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtcgttgt 6375153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 38606994 - 38607277
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38606994 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 38607093  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||| |||||| ||||||||| ||||||            ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38607094 agagtagatcaaatggaggagagtcacgttagaagagggagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 38607181  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  38607182 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttgt 38607277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 304
Target Start/End: Original strand, 36652004 - 36652277
Alignment:
Q  31 atagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| | |    
T  36652004 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggata 36652103  T
Q  131 accaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 230  Q
      || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| |||| | |||    
T  36652104 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatga 36652203  T
Q  231 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  36652204 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgctgttgttgt 36652277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35559286 - 35558994
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacct-atagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||  ||| |||||    
T  35559286 agagagagtgggggtagcaccttatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaag 35559187  T
Q  108 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35559186 aagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 35559087  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    || ||||||||| | |||| || ||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |  | |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  35559086 ttggatccaaatttagtttatggtagaacattatagcatcatttgatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgttg 35558994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 304
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349905
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  |  | | |||||||||| ||||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  122 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 221  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  222 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 22349905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 43491299 - 43491593
Alignment:
Q  10 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 109  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43491299 gagagagtaggggtaacacctatagtataaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaa 43491398  T
Q  110 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 209  Q
    |||  ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  43491399 gagttgatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagtt 43491498  T
Q  210 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43491499 ggatccaaatatgatttatgatagaacactatgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43491593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13859300 - 13859067
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  13859300 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaaga 13859201  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13859200 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagt 13859101  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 242  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13859100 tggatccaaatttggtttatgatagaacactatg 13859067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 304
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631849
Alignment:
Q  58 cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaa 157  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||     
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  158 ctaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca 257  Q
    ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  32631715 ctaagaaaac------------cattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  258 tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32631803 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32631849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Original strand, 31005213 - 31005428
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31005213 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 31005312  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  31005313 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagt 31005412  T
Q  209 tagatccaaatatggt 224  Q
    | ||||||||| ||||    
T  31005413 tggatccaaatttggt 31005428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 36869527 - 36869234
Alignment:
Q  18 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||| ||||    
T  36869527 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagat 36869428  T
Q  118 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 217  Q
    ||||||||| |||  || |||| || ||||||||||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  36869427 caaatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaa 36869328  T
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc-------catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || || ||| ||||||||||||||| | ||||||||||       ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  36869327 atttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 36869234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 77 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598185
Alignment:
Q  77 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 176  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  177 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |  | |||     
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccga-ctcatttaa 24598213  T
Q  277 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||    
T  24598212 tgggataagacttggttgttgttgttgt 24598185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 304
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682459
Alignment:
Q  29 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  129 gaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttttt 228  Q
     |  || || ||||||||| ||| || | ||| |||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  229 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaagcttggtagttgttgttgt 15682459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 33072942 - 33073100
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  33072942 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaaga 33073041  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 167  Q
    |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  33073042 agagtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 33073100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979928
Alignment:
Q  136 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  236 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40979928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 304
Target Start/End: Original strand, 38900074 - 38900241
Alignment:
Q  136 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||    
T  38900074 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgattgaa 38900173  T
Q  236 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38900174 cactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38900241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 302
Target Start/End: Original strand, 7273154 - 7273383
Alignment:
Q  73 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 172  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | |||| ||||   |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||      
T  7273154 catgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactataa 7273253  T
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||    
T  7273254 gagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccac 7273353  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7273354 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 7273383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 176 - 302
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649063
Alignment:
Q  176 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T
Q  276 gtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27649037 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 27649063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681022
Alignment:
Q  92 tagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaaga 191  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||  |||  ||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||   || |||||||||||||||| ||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  192 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 291  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttgg 31681030  T
Q  292 ttgttgtt 299  Q
    ||||||||    
T  31681029 ttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Original strand, 48919255 - 48919394
Alignment:
Q  162 gaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 261  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||    
T  48919255 gaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttgatccatgta 48919354  T
Q  262 gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  48919355 gtcgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 48919394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 302
Target Start/End: Original strand, 21078062 - 21078200
Alignment:
Q  164 aaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 263  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  21078062 aaaccgttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagc 21078161  T
Q  264 cgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||    | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21078162 cgacttcatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 23404409 - 23404640
Alignment:
Q  10 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 109  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | || | ||||||||  |||||| |||||||  |||  ||||||    
T  23404409 gagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagttgggagaaaataggcttaga-cagtttggcatgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaa 23404507  T
Q  110 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 209  Q
    ||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||  ||   ||||||||||| ||   ||||| || ||||||||||    
T  23404508 gagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtt 23404607  T
Q  210 agatccaaatatggtttttgatagaacactatg 242  Q
     |||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  23404608 tgatccaaatatggtgtatgatagaacattatg 23404640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 36136754 - 36137046
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||| | ||| ||||||||| |||  |||||   || ||| ||    
T  36136754 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacga 36136853  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||| |||||| |||  ||| | | |||| ||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| |    
T  36136854 agagcagatcagatggaggagagtcagatcagaagaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaat 36136953  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||    | |||||||  || || ||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36136954 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatagggtaatttgatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36137046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210701
Alignment:
Q  141 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 240  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||  |||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  241 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || | | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgttgt 9210701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208325
Alignment:
Q  206 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28208325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 46014472 - 46014359
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||    
T  46014472 agagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg-gttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcctaaga 46014374  T
Q  109 agagaagatcaaatg 123  Q
    |||| ||||||||||    
T  46014373 agagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035155
Alignment:
Q  191 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 290  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  291 gttgttgttg 300  Q
    ||||||||||    
T  34035164 gttgttgttg 34035155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28628212 - 28627936
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 121  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||||| || ||| | |||||| |||||| ||| ||||||   || ||||| |||| |||||  |    
T  28628212 gtagcacctagagtagaaatgatggtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccga 28628113  T
Q  122 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 221  Q
    ||||| | |  ||  | | |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |    
T  28628112 tggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgt 28628013  T
Q  222 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  28628012 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 302
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073212
Alignment:
Q  195 agaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  295 ttgttgtt 302  Q
    || |||||    
T  33073205 ttattgtt 33073212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 36101891 - 36101774
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || || |||||||| ||||| |    
T  36101891 aaagatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataagg 36101792  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36101791 cttggttgttgttgttgt 36101774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Original strand, 7273030 - 7273146
Alignment:
Q  10 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 109  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||| |||  ||| |||    
T  7273030 gagagaacgggagtatcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaa 7273129  T
Q  110 gagaagatcaaatggag 126  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  7273130 gagtagatcagatggag 7273146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 298
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601755
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  242 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    |   | |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgt 45601755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27893677 - 27893560
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||||||||| | |||||| | || | ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  27893677 aaagatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataagg 27893578  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27893577 cttggttgttgttgttgt 27893560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 301
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732114
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 309
Target Start/End: Original strand, 44951309 - 44951445
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||| | |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    ||    
T  44951309 gagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgacaatac 44951408  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtct 309  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  44951409 ttagtggtataaggtttggttgttgttgttgtagtct 44951445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Original strand, 14057632 - 14057759
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14057632 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14057731  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14057732 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Original strand, 14367660 - 14367787
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14367660 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14367759  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14367760 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 299
Target Start/End: Original strand, 24777170 - 24777241
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24777170 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgtt 24777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31869180 - 31869101
Alignment:
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31869180 gtttttgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31869101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 304
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969983
Alignment:
Q  191 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 290  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||   || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||     
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttt 42969969  T
Q  291 gttgttgttgttgt 304  Q
    ||| ||| ||||||    
T  42969970 gttattgatgttgt 42969983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Original strand, 42187595 - 42187726
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact-atgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 271  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||| || |    
T  42187595 gagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 42187693  T
Q  272 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  42187694 cttagtgggataaggctttgttgttgttgttgt 42187726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 302
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652830
Alignment:
Q  194 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 293  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | | ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  294 gttgttgtt 302  Q
    |||||||||    
T  47652822 gttgttgtt 47652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 1011167 - 1011329
Alignment:
Q  139 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 238  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||  ||  ||||||  ||||| ||| ||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||     
T  1011167 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgagagaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatccaa-tatggtttaggatagaacat 1011265  T
Q  239 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1011266 tatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 1011329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 304
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966301
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 121  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||  ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||| |||||||     
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaag 12966124  T
Q  122 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 221  Q
    || |||  |     || |||  |  |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||| || |||  ||||||    
T  12966125 tgaagacta-----gtcaaatcac-tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatat 12966218  T
Q  222 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||| | ||||| | || |||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12966219 ggtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12966301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 258
Target Start/End: Original strand, 35922376 - 35922492
Alignment:
Q  141 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 240  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||    
T  35922376 aagaggtagaggaagacttaaaaaaaac-tttgagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacatta 35922474  T
Q  241 tgacatcatttgatccat 258  Q
    |||| | |||||||||||    
T  35922475 tgacctaatttgatccat 35922492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Original strand, 32630584 - 32630636
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 61  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32630584 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8519165 - 8519046
Alignment:
Q  182 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 281  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |  | || |||||||| ||    
T  8519165 ttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttagtgaga 8519066  T
Q  282 taatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  8519065 taaggctcgattgttgttgt 8519046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24177714 - 24177628
Alignment:
Q  213 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  24177714 tccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatt-gatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgttg 24177628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26742177 - 26741891
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || |||  ||||||||||| | ||||  |||||   || ||||| |||| ||||||    
T  26742177 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagagaaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatca 26742078  T
Q  120 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga--aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 217  Q
     || ||||| |  ||| | |  ||||| |||||||||  ||  ||||| ||   |||  ||| ||||| ||| |||| ||  | |||||||| || | ||    
T  26742077 gatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaactattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaa 26741978  T
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| || |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  26741977 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtgcaaaaatgcttggttgttgttgttgt 26741891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 36514499 - 36514424
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga 84  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  36514499 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagaga 36514424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 301
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415295
Alignment:
Q  181 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcc------aactt 274  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||  | | ||||||||||||||||||| ||       ||||    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttatactt 40415268  T
Q  275 agtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40415269 agtgggataaggcttggttgttgttgt 40415295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Original strand, 31005432 - 31005490
Alignment:
Q  246 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31005432 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31005490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 96
Target Start/End: Original strand, 40169640 - 40169726
Alignment:
Q  10 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 96  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||||| ||||| |||||||    
T  40169640 gagagaattggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagat 40169726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 300
Target Start/End: Original strand, 34745891 - 34746028
Alignment:
Q  163 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 262  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||| || || | |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| ||||| | |  |||||| |||||||    
T  34745891 aaaaccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtag 34745990  T
Q  263 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34745991 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 34746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 47848664 - 47848912
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||  ||| || | ||  ||||     
T  47848664 agagagagttggggtagcgcctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaagg 47848763  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||| |||||| | |  | | | |  ||||| |||||||||||||  ||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||| | | | ||||||     
T  47848764 agagtagatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactattggaaa-gatttggggattaatgagc 47848862  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 258  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||    
T  47848863 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtttaatttgatccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 303
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355450
Alignment:
Q  176 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag-ccgatccaactt 274  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |   |||||||||| |||| | || || ||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  275 agtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgttg 28355450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29318848 - 29318792
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29318848 atttgatccatgtagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29318792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8492355 - 8492276
Alignment:
Q  182 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 261  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||    
T  8492355 ttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgta 8492276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36239924 - 36239833
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 264  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  36239924 gagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38135341 - 38135210
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||| || |||||||| | |||| | | ||||||||||| |||| || || ||    
T  38135341 gagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatctagctgaccccac 38135242  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || ||| || || ||||||||||| |||||||    
T  38135241 ttggtgggacaaggcttggttgttattgttgt 38135210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 304
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630719
Alignment:
Q  237 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 40630719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 43282398 - 43282477
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||    
T  43282398 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagac 43282477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 302
Target Start/End: Original strand, 7220965 - 7221039
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  7220965 tgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggtgtaaggcttggttgttgttgtt 7221039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 303
Target Start/End: Original strand, 25891086 - 25891172
Alignment:
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  25891086 aatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgttg 25891172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27021984 - 27021906
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 87  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  27021984 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 301
Target Start/End: Original strand, 37976403 - 37976517
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||| ||||||||||||| | ||  |||||   ||||| |    
T  37976403 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaattagatccatgtagccaaccccgcttagcaagataagg 37976502  T
Q  287 cttggttgttgttgt 301  Q
     ||||||||||||||    
T  37976503 tttggttgttgttgt 37976517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19262725 - 19262609
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| || |||   ||||||||||||||||| ||||||   || ||||||    
T  19262725 agagagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaaga 19262627  T
Q  109 agagaagatcaaatggag 126  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  19262626 agagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20158756 - 20158671
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |  | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20158756 aaatattgtttaagatagaacactatcaagtaatttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 20158671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 33103094 - 33103211
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |    
T  33103094 aaagacttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataagg 33103193  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||| || |||||||||    
T  33103194 cttggctgatgttgttgt 33103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 298
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852366
Alignment:
Q  197 aggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 296  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||| ||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttggctgtt 47852364  T
Q  297 gt 298  Q
    ||    
T  47852365 gt 47852366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 299
Target Start/End: Original strand, 6263479 - 6263539
Alignment:
Q  239 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6263479 tatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 6263539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7189518 - 7189442
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 85  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||| | |||||||||||||    
T  7189518 agagagagttggggtcgcacctatagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaa 7189442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Original strand, 14593953 - 14594037
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14593953 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14594037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Original strand, 16013476 - 16013560
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16013476 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 16013560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Original strand, 28708610 - 28708666
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28708610 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgttgt 28708666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Original strand, 29312218 - 29312274
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29312218 atttgatccatgaagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29312274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 303
Target Start/End: Original strand, 31840442 - 31840514
Alignment:
Q  231 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||||||| | || |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31840442 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagcctaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31840514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1531523 - 1531420
Alignment:
Q  139 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 238  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |  |||  ||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||     
T  1531523 aaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagcaaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggtttgggatagaacat 1531424  T
Q  239 tatg 242  Q
    ||||    
T  1531423 tatg 1531420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 89
Target Start/End: Original strand, 14593772 - 14593835
Alignment:
Q  26 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  14593772 cacctatagtagaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 14593835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28542058 - 28541943
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataat 285  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||  || |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||| |||||||||  || |||||||  |||||     
T  28542058 aaagatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccccacttagttggataag 28541959  T
Q  286 gcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||    
T  28541958 gcttggttgttgttgt 28541943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814125
Alignment:
Q  206 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | ||||||| ||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaagaggcttggtagttgttgt 30814125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 261
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  190 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 261  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19119505 - 19119423
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || ||||||||||||    
T  19119505 atggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaaaatttgttgttgttgtt 19119423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Original strand, 30144982 - 30145040
Alignment:
Q  246 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  30144982 tcatttgatccatgcagccaatcccacttagtgtgataaggcttggttgctgtttttgt 30145040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Original strand, 5418303 - 5418360
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 305  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5418303 atttgatccatgtagtcgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 5418360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 304
Target Start/End: Original strand, 33281087 - 33281171
Alignment:
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33281087 tatggtttcagatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccggacca-cttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 33281171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 42187470 - 42187547
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 96  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| || ||||||    
T  42187470 ggggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcctgtagat 42187547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Original strand, 45558352 - 45558405
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 62  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45558352 agagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttag 45558405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 301
Target Start/End: Original strand, 45558531 - 45558611
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || ||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  45558531 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagttgaccccgcttagtg-gataaggtttggttgttgttgt 45558611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 48736191 - 48736074
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||   ||||||||| ||||||| || |||   || || ||     
T  48736191 agagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttagg 48736092  T
Q  109 agagaagatcaaatggag 126  Q
    |||| |||||||||||||    
T  48736091 agagtagatcaaatggag 48736074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 304
Target Start/End: Original strand, 1523856 - 1523928
Alignment:
Q  232 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  1523856 agaacactatgacgtaatttgattcatgtagccaacctcacttagggagataaggcttggttgttgttgttgt 1523928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20525105 - 20525049
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||    
T  20525105 atttgatccatgtagccgaccccacttagcgggataaggctcggttgttgttgttgt 20525049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44401253 - 44401164
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 264  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | || ||||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  44401253 gagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtta--tcaaaatatgttttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 89
Target Start/End: Original strand, 16013295 - 16013358
Alignment:
Q  26 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  16013295 cacctatagtacaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 16013358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 130
Target Start/End: Original strand, 33139206 - 33139265
Alignment:
Q  71 gacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | | || ||||||||||    
T  33139206 gacatgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaaga 33139265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341395
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||| | |||||||||| || | ||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgttgt 34341395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926547
Alignment:
Q  205 gagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 276  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||   ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttag 34926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 5335910 - 5335988
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 87  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||||||    
T  5335910 agagagagttggggtagcatctatagtaggaaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaaga 5335988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21244328 - 21244282
Alignment:
Q  256 catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21244328 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21244282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21517508 - 21517426
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 255  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  21517508 gagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaatttgatc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25579370 - 25579252
Alignment:
Q  9 agagagaatgggg-gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  |||| |||||||| ||||| || ||| |  |||||||||||||||  |||||| | || |||||    
T  25579370 agagagagtggggagtagcacccatagcagaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattctgtggtaag 25579271  T
Q  108 aagagaagatcaaatggag 126  Q
    ||||| |||| | ||||||    
T  25579270 aagagtagattagatggag 25579252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26332958 - 26332908
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  26332958 aaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatccatgtagccga 26332908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 308
Target Start/End: Original strand, 28021146 - 28021224
Alignment:
Q  230 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtc 308  Q
    |||||||| |||||  || ||||| |||||||||| |  | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28021146 atagaacattatgaggtcgtttgacccatgtagcctactccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttgtcgtc 28021224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 304
Target Start/End: Original strand, 48515370 - 48515456
Alignment:
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | | |||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  48515370 atatggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgggataaggctcggtggttattgttgt 48515456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 304
Target Start/End: Original strand, 4604751 - 4604832
Alignment:
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| |||||||||| |||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  4604751 gtttatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagacttggttcttgttgttgt 4604832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 30200244 - 30200175
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||| | |||||| | ||||||||    
T  30200244 gggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagacc 30200175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34029750 - 34029677
Alignment:
Q  227 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || ||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  34029750 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataaggcttggttgttgttg 34029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 38920794 - 38920859
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  || ||| | ||||||||||||    
T  38920794 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagaga 38920859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40139021 - 40138948
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||| |||| ||||    
T  40139021 tgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgcgataagacttggctgttattgt 40138948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40149112 - 40149016
Alignment:
Q  201 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    ||||||||| || | |||||||||| | ||||||||| |||| |   |||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40149112 caatgagttggaccaaaatatggttat-gatagaacattatggcgcaatttgatctatgtagccgaatccacttagtgggataaggcttggttgttgt 40149016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 303
Target Start/End: Original strand, 41483714 - 41483771
Alignment:
Q  246 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  41483714 tcatatgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgttg 41483771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605359
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18605359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637631
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18637631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651065
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18651065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 36102045 - 36101977
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  36102045 ggtagcacctataatagaaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacc 36101977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38921169 - 38921086
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag--ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||  |||| || |||||| | || || ||||||||||||||||    
T  38921169 atggtttttgatagaaggctatggcgtcatttgattcatgtaggaccgaccccacttagggggaaaaggcttggttgttgttgt 38921086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47700108 - 47700053
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  47700108 atttgatccatgtagccgaccca-cttggtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 47700053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48735970 - 48735898
Alignment:
Q  232 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| |||||| | || |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  48735970 agaatactatggcgtcgtttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttgt 48735898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 137)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4001747 - 4001452
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4001747 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaaga 4001648  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4001647 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagt 4001548  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4001547 tggatccaaatatggtttttgatagaaccctatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 4001452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 696259 - 696554
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  696259 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 696358  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696359 agagtagatcatatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 696458  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacacta-tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  696459 ttgatccaaatatggtttttgatagaacactattggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 696554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 1210735 - 1211030
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1210735 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 1210834  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1210835 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 1210934  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1210935 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1211030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30202422 - 30202127
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30202422 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 30202323  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30202322 agagtagatcaaatggacgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 30202223  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30202222 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30202127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34792641 - 34792347
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34792641 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 34792542  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34792541 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 34792442  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  34792441 tggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 34792347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 22090086 - 22090381
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22090086 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaaga 22090185  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    | || ||||||||||||| |||  || |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22090186 aaagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 22090285  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22090286 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 22090381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 49347685 - 49347393
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  49347685 agagagagtaggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 49347586  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49347585 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 49347486  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49347485 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 8671908 - 8672203
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8671908 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaaga 8672007  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8672008 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 8672107  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  8672108 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 8672203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38807963 - 38807668
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  38807963 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaaga 38807864  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||| || |||||| |||  ||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38807863 agagtagaccagatggaggagagtcagatcaaaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagt 38807764  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38807763 tggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38807668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 15085924 - 15086207
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15085924 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 15086023  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||            ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15086024 agagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagt 15086111  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15086112 tggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 15086207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 9592724 - 9593018
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9592724 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 9592823  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9592824 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagt 9592923  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||  |||| |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9592924 tagatttaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 9593018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029407
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 4029407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979228
Alignment:
Q  37 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 136  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||| |||  ||||    
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  137 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 236  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 25979296  T
Q  237 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25979295 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25979228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 51602046 - 51602341
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  51602046 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaaga 51602145  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  51602146 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagt 51602245  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51602246 tggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51602341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32083037 - 32082753
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  32083037 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaaga 32082938  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32082937 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaac------------cattagaaaagatttagaggtcaatgagt 32082850  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca-tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||| ||| ||||||||||    
T  32082849 tggattcaaatatggtttttgatagaacactacggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttagtttttgttgttgt 32082753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 8391762 - 8392030
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8391762 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaaga 8391861  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||||||| || |||  || |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8391862 agagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaaaggaggtatatgaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagt 8391961  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 277  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  8391962 tggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagt 8392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 51441057 - 51440764
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  51441057 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaaga 51440958  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||| ||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51440957 agagtagagcaaatggaggagagtcaagttaaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagt 51440858  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||| | | ||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  51440857 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 51440764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37311955 - 37311752
Alignment:
Q  101 ttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37311955 ttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 37311856  T
Q  201 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  37311855 caatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 37311756  T
Q  301 ttgt 304  Q
    ||||    
T  37311755 ttgt 37311752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43240671 - 43240380
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||   || ||||||    
T  43240671 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaaga 43240572  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||   | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  43240571 agagtagatcaaatggaggagagttaagttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagt 43240472  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  43240471 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32231246 - 32230997
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||    
T  32231246 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataaga 32231147  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32231146 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 32231047  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 258  Q
    | ||||||||  |||| | |||||||||||||||   | |||||||||||    
T  32231046 tggatccaaagttggtctatgatagaacactatggtgtaatttgatccat 32230997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 301
Target Start/End: Original strand, 52921195 - 52921362
Alignment:
Q  134 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  52921195 aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatag 52921294  T
Q  234 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  52921295 aacactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52921362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 304
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318413
Alignment:
Q  82 agaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 181  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||| |||  | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  182 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 281  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtggga 39318390  T
Q  282 taatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||| ||||| |||||||||||||    
T  39318391 taaggcttgtttgttgttgttgt 39318413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 303
Target Start/End: Original strand, 4415469 - 4415633
Alignment:
Q  139 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 238  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||     
T  4415469 aaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgattttttatagaacat 4415568  T
Q  239 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||  | ||  |||||||||||||||||    
T  4415569 tatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtggaaaaagacttggttgttgttgttg 4415633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32404807 - 32404525
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 119  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||  |    
T  32404807 gggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaa 32404708  T
Q  120 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 219  Q
     |||||| | |  ||  | | |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  32404707 gatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaac 32404608  T
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  32404607 atggtttatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc-tggttgttgttgttg 32404525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 298
Target Start/End: Original strand, 39140509 - 39140794
Alignment:
Q  8 cagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||| || ||| | |||||||||||||||||  || ||   || ||| |    
T  39140509 cagagagagttggcgtagcacctatagtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtacg 39140608  T
Q  108 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    ||||| |||||| |||||  |||  ||| ||| ||||||||||||||   |||| |||   ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  39140609 aagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaagttat--gagaaactattaggaaaaatttagaggttaattag 39140703  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  39140704 ttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  49 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 148  Q
    |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||   |  ||| |||||| |||||| |||||| |||   || ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  149 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 248  Q
    ||||||||  ||  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||| |   |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423216
Alignment:
Q  183 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaac---atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  283 aatgcttggttgttgttgt 301  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgt 46423216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32079303 - 32079176
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||| |||||||||| || ||    
T  32079303 gagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccac 32079206  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32079205 ttggtgggataaggcttggttgttgttgtt 32079176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707218
Alignment:
Q  183 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 282  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  283 aatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgttgttgt 4707218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 9509308 - 9509565
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||| || |  | |||       
T  9509308 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtactt 9509407  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||| |||||| |||  ||  ||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||| ||   |||||||    
T  9509408 agagtagatcagatggaggagagtcatattagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagt 9509507  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| | | ||| |||||||||||||||    
T  9509508 tagagccaaatatggtttatgattgaacattatggcgtaattcgatccatgtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37463165 - 37462878
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| || ||| | |   || |||| ||||  |||||| |||| ||| ||    
T  37463165 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacga 37463069  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa-gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    |||| |||||| |||||| |||  | | | |||| |||||||||||  | |||  ||||| ||  ||||||| || || || ||||||||||| ||||||    
T  37463068 agagtagatcagatggaggagagtcggatcaaaaagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgag 37462969  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    || |||| ||||||||||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37462968 tttgatc-aaatatggtttatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 37462878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 2544589 - 2544875
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| |  | |||||     
T  2544589 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaagg 2544688  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||| |||||| | |  ||    |  ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||     ||||||| ||  |||||||||    
T  2544689 agagtagatcagatggaggatagtca-aacactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat-----aagatttggaaatcaatgagt 2544782  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | || | ||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  2544783 tggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgt 2544875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10200426 - 10200303
Alignment:
Q  181 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 280  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||   | ||||||||||||||||||| |  ||||| || |    
T  10200426 attagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttaatggg 10200327  T
Q  281 ataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10200326 ataatgcttggttgttgttgttgt 10200303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Original strand, 41560383 - 41560514
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||| | | |||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||    
T  41560383 gagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 41560482  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41560483 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41560514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020264
Alignment:
Q  191 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||| ||| ||||| |||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  291 gttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||    
T  24020277 gttgttgttgttgt 24020264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43375712 - 43375596
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  43375712 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttagtgggataaag 43375613  T
Q  287 cttggttgttgttgttg 303  Q
     ||||||||||||||||    
T  43375612 attggttgttgttgttg 43375596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48431688 - 48431396
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||   || ||||  ||||  ||||    
T  48431688 ggggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatc 48431589  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtc-------aatgagttag 211  Q
    | |||||| | |  | | ||| |||||||||||||||| | || ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||| |        |||||||| |    
T  48431588 agatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgg 48431489  T
Q  212 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  48431488 atccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 48431396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941774
Alignment:
Q  212 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44941774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777258
Alignment:
Q  233 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgttgttg 3777258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769711
Alignment:
Q  211 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgt 21769711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16142108 - 16142019
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  16142108 gagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28090784 - 28090691
Alignment:
Q  211 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  28090784 gatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 28090691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 301
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337838
Alignment:
Q  212 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42337838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 304
Target Start/End: Original strand, 19936617 - 19936745
Alignment:
Q  176 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 275  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || | | | |||||||||||||||||||  |  ||||    
T  19936617 aaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactccgctta 19936716  T
Q  276 gtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  19936717 gtgggataagacttgattgttgttgttgt 19936745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 304
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751769
Alignment:
Q  212 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44751769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27848085 - 27847797
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 120  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||| | |||| |||||||||||| |||||| | || ||| |||||| | ||||     
T  27848085 ggtagcacctgtggtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcag 27847986  T
Q  121 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaacc-atttgagaaaccattagaaaagat----ttagaggtcaatgagttagatcc 215  Q
    |||||| |||  ||| | | |||||||||||||||| ||  |||||   ||  ||||||| | ||  ||||||    |||||||| |||||||| | |      
T  27847985 atggaggagagtcagctcagaagaggtagaggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttg 27847886  T
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| | | |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  27847885 aaatatggtttatgatggaacattatgccgtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataaggcttggtcattgttgttgt 27847797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Original strand, 29577461 - 29577536
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29577461 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29577536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 52532744 - 52532614
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| || ||    
T  52532744 gagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccac 52532645  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  52532644 ttagtgggaaaaggcttggttgttgtggttg 52532614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 303
Target Start/End: Original strand, 6025772 - 6025889
Alignment:
Q  186 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 285  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  6025772 aaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataat 6025871  T
Q  286 gcttggttgttgttgttg 303  Q
     |||||||||| ||||||    
T  6025872 acttggttgtttttgttg 6025889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Original strand, 28533676 - 28533749
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  28533676 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28533749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568410
Alignment:
Q  200 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40568412  T
Q  300 gt 301  Q
    ||    
T  40568411 gt 40568410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18469374 - 18469082
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||| ||||||||  ||||||   || ||| ||    
T  18469374 agagagagttggggtaacacctatagtagagaagatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacga 18469275  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| | |||| ||||||||||  | | | |||||||||||| |||||  ||  ||||  ||  |||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18469274 agagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaaagaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagt 18469175  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||   | ||||| | ||||||| ||| || |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  18469174 tggatacaaatatagtttatgatcgaacattatggtgtaatttggttcatgtagacgaccccacttagtgggataatgctttgatgttgttgt 18469082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Original strand, 29128937 - 29129065
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat-ccatgtagccgatccaa 271  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   | || |||| |||||||||||| || |    
T  29128937 gagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgatcccatgtagccgacccca 29129036  T
Q  272 cttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  29129037 cttagtgagataaggcttggtttttgttg 29129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 8796406 - 8796492
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8796406 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 8796492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9599686 - 9599432
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||  | ||| || | ||| |||| | ||||    | |||  |    
T  9599686 agagagagttggagtaacacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaa 9599587  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||| |||||| |||  ||| | | |||||||||||||||| |||  ||||| |   ||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  9599586 agagtagatcagatggaggagagtcagatcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagt 9599487  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 263  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||  |||| | | ||||||||||||||||    
T  9599486 ttgatccagatatggtttatgatagaacgttatggcgtaatttgatccatgtagc 9599432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444641
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 34444638  T
Q  302 tgt 304  Q
    |||    
T  34444639 tgt 34444641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 304
Target Start/End: Original strand, 51584948 - 51585029
Alignment:
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  51584948 gtttttgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 51585029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 36340095 - 36339804
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||   || |||||     
T  36340095 agagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaagg 36339996  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
     | |  ||||| |||||| | | | || | |  ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  36339995 cgggttgatcagatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatgagt 36339897  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||   ||| ||||||  ||||| |||| |||||  | |||||||||||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36339896 tggacagaaacatggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 36339804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3818984 - 3818853
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    ||    
T  3818984 gagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcac 3818885  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  3818884 ttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgt 3818853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Original strand, 50846759 - 50846846
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  50846759 aaatatagtttatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttg 50846846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084260
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggttgttattgt 6084257  T
Q  302 tgt 304  Q
    |||    
T  6084258 tgt 6084260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 300
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175426
Alignment:
Q  215 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttg 22175426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25715411 - 25715326
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25715411 aaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31274499 - 31274398
Alignment:
Q  203 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||  |||| | | ||||||||  |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31274499 atgagttagattgaaatatggtttatgatataacgttatggcgtaatttgatctgtgtagctgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtt 31274400  T
Q  303 gt 304  Q
    ||    
T  31274399 gt 31274398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 36624012 - 36623884
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||| | |    |||||||||||| ||| || ||    
T  36624012 gagaaactattagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggc-tgtaatgatccatgtagtcgaccctac 36623914  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  36623913 ttagtgggataaggctttgttgtcgttgtt 36623884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 218 - 303
Target Start/End: Original strand, 38869081 - 38869166
Alignment:
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  38869081 atatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgctgttgttg 38869166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Original strand, 1661420 - 1661500
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  1661420 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagacc 1661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Original strand, 5113952 - 5114028
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  5113952 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataacgtttggttgttgttgttgt 5114028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15438906 - 15438800
Alignment:
Q  188 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 287  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||| ||    
T  15438906 aagatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaa---aatgacgttatttgatgcatgtagccgaccccacttagt-agataaggc 15438811  T
Q  288 ttggttgttgt 298  Q
    |||||||||||    
T  15438810 ttggttgttgt 15438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877343
Alignment:
Q  229 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgt 38877343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43481851 - 43481795
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43481851 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43481795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Original strand, 50636278 - 50636366
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  50636278 aaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcgattctacttagcgggataaggcttgattgttgttgttgt 50636366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37430472 - 37430417
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37430472 tttgatccatatagccgatcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgt 37430417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44905483 - 44905404
Alignment:
Q  174 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 253  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  44905483 agaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatggcataatttga 44905404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290033
Alignment:
Q  213 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4318900 - 4318842
Alignment:
Q  246 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4318900 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 4318842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27520428 - 27520246
Alignment:
Q  76 gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta--agaaaaccatttg 173  Q
    |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||      ||| || || || |||||||||| |||||||  ||  | ||||| ||  |    
T  27520428 gtagagagaagacatgtagatgtcgttgtaagaagagtagatca------gaaaaatcaagtcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataag 27520335  T
Q  174 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 262  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||| |||||||    
T  27520334 agaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgattcatgtag 27520246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Original strand, 41165509 - 41165567
Alignment:
Q  246 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  41165509 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 41165567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 5338881 - 5338998
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| |||| || ||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |    
T  5338881 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatgtgatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataagg 5338980  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
    || |||||||||||||||    
T  5338981 ctcggttgttgttgttgt 5338998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7762565 - 7762496
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  7762565 gagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatg 7762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 48865821 - 48865744
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 264  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||   | |||||||||||||||||    
T  48865821 aaagatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagcc 48865744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 301
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257852
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgt 50257852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Original strand, 1704836 - 1704912
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| || || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1704836 tgatagaacatcatggcataatttgatccatgttgctgaccccacttagtgtgataagacttggttgttgttgttgt 1704912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10569144 - 10569068
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  10569144 tgatagaacattataatatcatttgatccatgtagccggttccacttaaagggataaggcttggttgttgttgttgt 10569068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19908144 - 19908040
Alignment:
Q  192 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 291  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||  | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||     
T  19908144 tttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttga 19908045  T
Q  292 ttgtt 296  Q
    |||||    
T  19908044 ttgtt 19908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 29808053 - 29808121
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  29808053 aaatatggtttttgataaaacactatggcgacatttgattcatgtagccgattccacttagtgggataa 29808121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 35828829 - 35828725
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||| ||| |||||||||||||||  |||||   || ||||| ||||||||||| |    
T  35828829 gtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagagagaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcata 35828730  T
Q  122 tggag 126  Q
    |||||    
T  35828729 tggag 35828725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 304
Target Start/End: Original strand, 52832170 - 52832330
Alignment:
Q  144 aggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 243  Q
    ||||||||||| | |||  |||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||  || ||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  52832170 aggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtattagaaaagatttagaggttgataagttgaatacaaatattgtttcagatagaacattatga 52832269  T
Q  244 catcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | | ||||||||||| |||  ||| ||| |||||  |||||   |||||||||||||||||    
T  52832270 cgtaatttgatccatatagttgattcaatttagtaggataagatttggttgttgttgttgt 52832330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2914175 - 2914120
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2914175 tttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2914120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11941700 - 11941577
Alignment:
Q  181 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 280  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||| ||||  | |||||||| ||||| |||| |||| | |  |||||||||||||| ||  |  |||||||| |    
T  11941700 attagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtattttgatccatgtagtcggcctcacttagtggg 11941601  T
Q  281 ataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  11941600 atacggcttggttgttgttgttgt 11941577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 40416361 - 40416448
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 96  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  40416361 agagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagat 40416448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 43423709 - 43423788
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  43423709 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagac 43423788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628248
Alignment:
Q  139 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 237  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||  |||||||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaaca 8628248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16272903 - 16272818
Alignment:
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 305  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  16272903 tatggtttatgatagaacaatatgacatattttgatccatgtaatcaatcc-acttagtgggataatgtctggatgttgttgttgtc 16272818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38758067 - 38758017
Alignment:
Q  254 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38758067 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38758017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 45510917 - 45510831
Alignment:
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  45510917 aatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggctgatgttgttg 45510831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18793270 - 18793201
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  18793270 ggggtaggacttattgtagaaaagatggtagaaactagacttagttgattttggcatgcagagagaagac 18793201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072491
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 297  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |   ||||||| || || ||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtgggaaaaggcttggttgttg 27072491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33560927 - 33560858
Alignment:
Q  232 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  33560927 agaacattatgacattgtttgatccatgtagccaaccctacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 33560858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4590585 - 4590533
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4590585 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7133355 - 7133299
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7133355 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 7133299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12930408 - 12930308
Alignment:
Q  204 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||| | || ||||||    |||| | ||||||||||||||||    
T  12930408 tgagttggatccaaatatgatttatgatagaagattatgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccacttagcaaaataaggattggttgttgttgttg 12930309  T
Q  304 t 304  Q
    |    
T  12930308 t 12930308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 13828009 - 13827929
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  13828009 agagagatttggggcagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagacc 13827929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15437206 - 15437130
Alignment:
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15437206 gtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 15437130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Original strand, 26299297 - 26299353
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  26299297 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgctgttgttgt 26299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32112062 - 32111986
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  32112062 tgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgt 32111986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 43898439 - 43898491
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43898439 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 43898491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 48801700 - 48801625
Alignment:
Q  214 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||    
T  48801700 ccaaatatggtttatgatagaacattac-acataatttgatccatgtagctgatcccacttagcgggaaaatgcttg 48801625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 303
Target Start/End: Original strand, 14224286 - 14224368
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||| |||||| || |||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  14224286 atggtttttgatagaccactatggcgtcattt-attcatgcagccgaccctacttagtgggacaaggattggttgttgttgttg 14224368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637846
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| || ||| | |||||||||| |||||    
T  27637913 ggtagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagac 27637846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 289
Target Start/End: Original strand, 30445304 - 30445375
Alignment:
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |  | |||||||| ||||| ||||    
T  30445304 atatggtttttgatagaacaccatgacgtcgtttgattcatgtagccaactccacttagtgggataaagctt 30445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35828661 - 35828562
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||  |||||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  35828661 aatgagttggatggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggaaaagacttggttgttgttgt 35828562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 52633257 - 52633166
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 307  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | | |   ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  52633257 aaatatggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcaacctcgcttagtgggatggtgtttggttgttgttgttgtcgt 52633166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 52814346 - 52814291
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  52814346 tttgatccatgtagcctatcccacttagtgggttaaggcttggttgtttttgttgt 52814291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8676993 - 8676897
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt---tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||||  |   |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8676993 gagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggcataatttgatccatgtagccga 8676897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 298
Target Start/End: Original strand, 16943364 - 16943434
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16943364 tgatagaacattatggcggcgtttgatccatgtagtcgaccccacctagtgagataatgcttggttgttgt 16943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 278
Target Start/End: Original strand, 28528556 - 28528614
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28528556 atggtttttgatagaccactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 28528614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29577256 - 29577147
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||| ||||| | |||||| | |||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||  | ||||||||| | || |||||||| |||| ||    
T  29577256 aaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatggttat-gatagaacattatggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggatagtg 29577158  T
Q  287 cttggttgttg 297  Q
    |||||||||||    
T  29577157 cttggttgttg 29577147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 37263331 - 37263397
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||   || ||| | |||||||||||||    
T  37263331 ggggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaa 37263397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 52073745 - 52073675
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | | ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  52073745 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 10272260 - 10272329
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  || ||| | |||||||||||||||||    
T  10272260 gggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggttttggcatgtagagagaagacc 10272329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11331332 - 11331247
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 258  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  11331332 gagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11489353 - 11489268
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 258  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  11489353 gagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 304
Target Start/End: Original strand, 22930645 - 22930678
Alignment:
Q  271 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22930645 acttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 22930678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26113521 - 26113456
Alignment:
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 284  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  26113521 tatggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataa 26113456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42539265 - 42539208
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 305  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  42539265 atttgatccatgtagacgaccccacttagtgggaaaaggcttggttattgttgttgtc 42539208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Original strand, 44008806 - 44008859
Alignment:
Q  247 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  44008806 catttgatccatttagccgaacctacttagtgagatacggcttggttgttgttg 44008859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 301
Target Start/End: Original strand, 50806864 - 50806949
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |  |||||| |||||| |||| || | ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  50806864 aaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgt 50806949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Original strand, 4380013 - 4380081
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 87  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||   |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  4380013 ggggtagcaactatagtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338831
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| || ||| | |||| |||||||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||||| |    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  122 tggag 126  Q
    |||||    
T  5338827 tggag 5338831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8194773 - 8194721
Alignment:
Q  250 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8194773 ttgatctatgtagccggtcctactttgtatgataatgtttggttgttgttgtt 8194721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 301
Target Start/End: Original strand, 12231592 - 12231640
Alignment:
Q  253 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  12231592 atccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 12231640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13827854 - 13827746
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||  | || || ||| |||||||||||||||||   |||||| | || ||||| |||| |||    
T  13827854 tgggggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtaga 13827755  T
Q  117 tcaaatgga 125  Q
    ||| |||||    
T  13827754 tcatatgga 13827746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 51812515 - 51812591
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 85  Q
    ||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  |||||| | |||||||||||||    
T  51812515 agagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtgatttgggcatgtagagagaa 51812591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Original strand, 51812677 - 51812725
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 235  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51812677 aaagatctagatgttaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaa 51812725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Original strand, 52292268 - 52292320
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||||||||||| || | || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52292268 atttgatccatgtaaccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52292320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 52900754 - 52900682
Alignment:
Q  189 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 261  Q
    |||||||||| | |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  52900754 agatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 114)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 38429874 - 38430168
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  38429874 agagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaaga 38429973  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38429974 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 38430073  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  38430074 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgg-tgttgttgttgt 38430168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 12734689 - 12734985
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12734689 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 12734788  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagagg-tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12734789 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgag 12734888  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12734889 ttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12734985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 25834671 - 25834963
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  25834671 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggatgccgttgtaaga 25834770  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25834771 agagtagatcaaatggaggagtt--aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 25834867  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25834868 tggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25834963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 3866062 - 3866357
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  3866062 agagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaaga 3866161  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3866162 agagtagatcaaatggaggagagacaaattaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 3866261  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  3866262 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 3866357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41197509 - 41197224
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41197509 gggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatca 41197410  T
Q  120 aatggagaagaaccaggttaaaaga-ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    ||||||| |||  |||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  41197409 aatggaggagagtcaggttaaaaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaa 41197310  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  41197309 tatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgttgttgttgt 41197224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45367908 - 45367622
Alignment:
Q  18 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||    
T  45367908 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagat 45367809  T
Q  118 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 217  Q
    ||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45367808 caaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaa 45367709  T
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  45367708 atatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataaaacttgtttgttgttgttgt 45367622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Original strand, 2610578 - 2610874
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  2610578 agagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaaga 2610677  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2610678 agagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 2610777  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 305  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2610778 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgtc 2610874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11992400 - 11992108
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  11992400 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 11992301  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    ||||  |||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11992300 agagtggatcaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagt 11992201  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  11992200 tagatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 11992108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41763324 - 41763043
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  41763324 ggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatc 41763225  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  41763224 aaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaa 41763126  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||| |||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41763125 tatgttttttgatagaacacccgggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38452977 - 38452686
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38452977 agagagagtgggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 38452878  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    ||| | |||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38452877 agata-gatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 38452779  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||||||||| |||| | ||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38452778 tggatccaaatttggtgtatgataaaacactatggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38452686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3243945 - 3243654
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3243945 agagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 3243846  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3243845 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 3243746  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    | ||||||| | |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3243745 tggatccaagtttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 308
Target Start/End: Original strand, 36183441 - 36183740
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36183441 agagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 36183540  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36183541 agagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagt 36183640  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtc 308  Q
    | ||||||||| || | | |||||||||||||||    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36183641 tggatccaaatttgatgtatgatagaacactatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgtcgtcgtc 36183740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 299
Target Start/End: Original strand, 8180770 - 8181060
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  8180770 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaaga 8180869  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||||||  || |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8180870 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 8180969  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  8180970 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 4807586 - 4807880
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | ||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  4807586 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaaga 4807684  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||||||| || |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4807685 agagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagt 4807784  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||  ||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4807785 tggatccaaattcggtgtacgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 4807880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451645
Alignment:
Q  40 aagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  140 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 239  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | || | ||||||||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  240 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttgt 451645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18424669 - 18424378
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||    
T  18424669 agagagagtgggtgtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaaga 18424570  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||  ||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||    
T  18424569 agattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagt 18424470  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  18424469 ttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta-ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18424378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7326388 - 7326157
Alignment:
Q  73 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||  || |||||| |||     
T  7326388 catgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacataggaaaactatta 7326289  T
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||    
T  7326288 gagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccac 7326189  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7326188 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 7326157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 304
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029872
Alignment:
Q  76 gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgag 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  176 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca------tgtagccgatcc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||      ||||||||| ||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccc 39029837  T
Q  270 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  39029838 cacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 39029872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 302
Target Start/End: Original strand, 28508749 - 28508961
Alignment:
Q  90 cgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa 189  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  28508749 cgtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaag 28508848  T
Q  190 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 289  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  28508849 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 28508948  T
Q  290 ggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||||||||    
T  28508949 ggttgttgttgtt 28508961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583630
Alignment:
Q  26 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  126 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg-gt 224  Q
    | |||  || |||||||||| |||| |||||   || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-caaatttgagt 24583709  T
Q  225 ttt-tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||| |||||| |||||||||| | |||| ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  24583708 tttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgttgtt 24583630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 275
Target Start/End: Original strand, 23997630 - 23997858
Alignment:
Q  35 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 134  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  23997630 tagaaaatttggtagaaaatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtca 23997729  T
Q  135 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 234  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  23997730 ggttaaaagaggtggaagaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaa 23997817  T
Q  235 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 275  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||| |||| || |||||    
T  23997818 acactatggcgttatttgattcatgtatccgaccccactta 23997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 136 - 304
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643233
Alignment:
Q  136 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 235  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  236 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 35643233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Original strand, 31959635 - 31959803
Alignment:
Q  133 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 232  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31959635 caggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgata 31959734  T
Q  233 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  31959735 gaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 31959803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 304
Target Start/End: Original strand, 30306190 - 30306317
Alignment:
Q  177 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 276  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30306190 aaccattagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 30306289  T
Q  277 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  30306290 tgggataaggcttggttgttgttgttgt 30306317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635320
Alignment:
Q  199 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T
Q  299 tgttgt 304  Q
    ||||||    
T  3635325 tgttgt 3635320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 304
Target Start/End: Original strand, 227360 - 227474
Alignment:
Q  190 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 289  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  227360 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 227459  T
Q  290 ggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||    
T  227460 ggttgttgttgttgt 227474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543074
Alignment:
Q  139 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 238  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  239 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||| | |  ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgttg 45543074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6238014 - 6237750
Alignment:
Q  40 aagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 139  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |   ||| |||||||||| |||||| |||||| |||  || || |    
T  6238014 aagttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtca 6237915  T
Q  140 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 239  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||| |   || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  6237914 aaagaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacact 6237815  T
Q  240 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||  || |||||||| || ||| ||| || ||||| ||  | || ||||  |||||||||||||    
T  6237814 atgggatgatttgatctatatagtcgaccccacttaatggaagaaagcttaattgttgttgttgt 6237750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Original strand, 12141544 - 12141829
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||| | || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||||    
T  12141544 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatc 12141643  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    | || ||| | |  ||  ||| |||||||||||||||| |||  ||| | ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| || ||||||||    
T  12141644 agattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaa 12141743  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| | || | |||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  12141744 tatggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgttgt 12141829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 9496034 - 9496151
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |||||||| || || |    
T  9496034 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggacaagg 9496133  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9496134 cttggttgttgttgttgt 9496151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9996754 - 9996623
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9996754 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccac 9996655  T
Q  273 ttagt---gtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||    | ||||| ||||||||||||||||    
T  9996654 ttagaagagggataaggcttggttgttgttgt 9996623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16097270 - 16097192
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtaga 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16097270 tgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtaga 16097192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38328489 - 38328367
Alignment:
Q  180 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  38328489 cattagaaaggatttagaggtcaatgaag--gatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38328392  T
Q  280 gataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  38328391 gataaggcttggttgttgttgttgt 38328367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 38434941 - 38435234
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttaga-tgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |  || ||| | |||||| |||||||||  |||||| |  | |||||    
T  38434941 agagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaag 38435040  T
Q  108 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
     |||| |||||| |||||| | |  ||| | |  ||||| ||||| ||| |||  ||||| |   ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||| |    
T  38435041 gagagtagatcatatggaggatagtcagatcactagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtg 38435140  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    || |||| |||| |||||| |||| ||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  38435141 ttggatcgaaatttggtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12882173 - 12882042
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || | | ||||||||||||||||| | |  ||    
T  12882173 gagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcac 12882074  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12882073 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12882042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43752239 - 43751944
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||   || ||| |     
T  43752239 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtagtaggg 43752140  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||| |||||| | |  ||| | |   |||| | ||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  43752139 agagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 43752040  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | || | ||| ||||| | |||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| |  |||||||  || || |||  ||||||||||||||    
T  43752039 tggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccgacctcacttagttggaaaaggctcagttgttgttgttgt 43751944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 304
Target Start/End: Original strand, 15025698 - 15025779
Alignment:
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15025698 gtttttgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 15025779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573127
Alignment:
Q  143 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 242  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||| | ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  243 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
     | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43573188 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43573127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19337007 - 19336896
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  19337007 aaagatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaag 19336908  T
Q  287 cttggttgttgt 298  Q
    ||||||||||||    
T  19336907 cttggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 302
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743812
Alignment:
Q  176 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||||||| || || ||| |  |||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaactcactta 30743785  T
Q  276 gtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  30743786 gtgagataaggctttgttgttgttgtt 30743812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 18958907 - 18959192
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttaga----catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| |     |||| |||||||||||| | || |   || ||||| |||| |    
T  18958907 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagta 18959006  T
Q  115 gatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatc 214  Q
    ||||| |||||| | |  ||| | |  ||||| ||||||||| |||  ||||| |   ||||||| || || ||||| || ||| | |||||||| ||||    
T  18959007 gatcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatc 18959106  T
Q  215 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
     ||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18959107 aaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 43238377 - 43238305
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  43238377 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagacc 43238305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531597
Alignment:
Q  213 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 9531597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44438005 - 44437718
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 116  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  || ||| | ||  |||| ||   |||    
T  44438005 tgggggtaacccctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtataga 44437906  T
Q  117 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 216  Q
    | | ||||||  ||  ||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| || |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||||| ||   |    
T  44437905 tgagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaa 44437806  T
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44437805 aacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44437718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520060
Alignment:
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12520060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12475000 - 12474927
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12475000 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12474927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670753
Alignment:
Q  231 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 17670753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 302
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863517
Alignment:
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19863517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 302
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867849
Alignment:
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19867849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 302
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872750
Alignment:
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 304
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287706
Alignment:
Q  147 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 246  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  247 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
      |||||||| ||||||| |  | |||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttgt 33287706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35755376 - 35755242
Alignment:
Q  174 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga----gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcc 269  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |    ||| |||||||||||||||| |||||||||| | || | | |||||||||||| |||||| ||    
T  35755376 agaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttggatccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccc 35755277  T
Q  270 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  35755276 tacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 35755242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 299
Target Start/End: Original strand, 13149460 - 13149612
Alignment:
Q  147 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 246  Q
    ||||||||||  || |||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  13149460 tagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacat 13149559  T
Q  247 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||| || |||||  |||||||||||||    
T  13149560 aatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709202
Alignment:
Q  204 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Original strand, 41545559 - 41545671
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||  ||    
T  41545559 gagaaaccattataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaacactatgacttaatttgatttatttagccgatctcac 41545658  T
Q  273 ttagtgtgataat 285  Q
    ||| || ||||||    
T  41545659 ttaatgagataat 41545671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8197669 - 8197538
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||| | | |||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| || ||    
T  8197669 gagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctac 8197570  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8197569 ttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 8197538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8202429 - 8202298
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||| | | |||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| || ||    
T  8202429 gagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctac 8202330  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8202329 ttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 8202298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Original strand, 43832309 - 43832383
Alignment:
Q  230 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  43832309 atagaacattatgacggcatttgatccatgtagctgacccaacttagtttgataaggcttggttgttgttgttgt 43832383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12489940 - 12489799
Alignment:
Q  163 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 262  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | | ||||||||||||| |||||| || | || |||||| |||||||    
T  12489940 aaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttgattcatgtag 12489841  T
Q  263 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12489840 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12489799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Original strand, 17429259 - 17429332
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17429259 tgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 17429332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626357
Alignment:
Q  231 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 17626357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 298
Target Start/End: Original strand, 45077895 - 45078008
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgag--ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 284  Q
    |||||||||||| | ||||||  || |||| |||||| |||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  45077895 aaagatttagagattaatgagagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataa 45077994  T
Q  285 tgcttggttgttgt 298  Q
     |||||||||||||    
T  45077995 agcttggttgttgt 45078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 304
Target Start/End: Original strand, 6219126 - 6219250
Alignment:
Q  180 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 279  Q
    |||||| |||||||||||| | | |||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || || ||||      
T  6219126 cattaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttg 6219225  T
Q  280 gataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    
T  6219226 gataaggcttggttgttattgttgt 6219250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 301
Target Start/End: Original strand, 11412865 - 11412992
Alignment:
Q  176 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag---aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||| ||||   | ||||||||||||||||||| |  ||    
T  11412865 aaactattaggaaagatt-agagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcac 11412963  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  11412964 ttagtaggataaggcttggttgttgttgt 11412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19334233 - 19334187
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19334233 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccga 19334187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9556650 - 9556366
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||| || | |||    
T  9556650 ggggtaacacttatagtagaaaaat-ggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatc 9556552  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    | |||||| | |  ||   ||  ||||| | ||||||| ||   ||||| ||  || |||| ||||  |||||| ||| | | |||||||| |||| | |    
T  9556551 agatggaggatagtcaaactactagaggcaaaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaaga 9556452  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||| |||||||||| || |   | ||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  9556451 tatggtttatgatagaacattagggtgtaatttgatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgttgt 9556366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 304
Target Start/End: Original strand, 15015149 - 15015230
Alignment:
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||| ||   || |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  15015149 gtttttgatagaacactctggtttcgtttgattcatgtagccgacgcaacttagtgggataaggcttggttgctgttgttgt 15015230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 297
Target Start/End: Original strand, 33504421 - 33504502
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 297  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33504421 aaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 299
Target Start/End: Original strand, 34931631 - 34931712
Alignment:
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| || || ||||||||||||||    
T  34931631 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 34931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Original strand, 3481351 - 3481439
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  3481351 aaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgt 3481439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13443995 - 13443907
Alignment:
Q  214 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  13443995 ccaaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttagttattgttgtt 13443907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 263
Target Start/End: Original strand, 36650610 - 36650686
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 263  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  36650610 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagc 36650686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Original strand, 42543440 - 42543520
Alignment:
Q  224 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42543440 tttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 42543520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 56
Target Start/End: Original strand, 227312 - 227359
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 56  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  227312 agagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatag 227359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 4598854 - 4598775
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | || ||| ||||| |||| |||||||    
T  4598854 agagagagttggggtagcacctatagtagtaaagatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagac 4598775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42549917 - 42549834
Alignment:
Q  221 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| ||||||||||  ||| | | ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42549917 tggtttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 42549834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384754
Alignment:
Q  230 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataaggcttggtggttgttgttgt 25384754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 301
Target Start/End: Original strand, 36993755 - 36993816
Alignment:
Q  239 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36993755 tatgacgtaatttgatccatgtagccta-ccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36993816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 624764 - 624687
Alignment:
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  |||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  624764 gtttttgatagaacgctatggtatagtttgattcatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttg 624687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4598638 - 4598569
Alignment:
Q  225 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 294  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| | |||||| | ||||| |||||||||    
T  4598638 ttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtaaccgattccacttagcgggataaggcttggttg 4598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5759076 - 5758995
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5759076 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggtagctgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 5758995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8560852 - 8560803
Alignment:
Q  255 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  8560852 ccatgtagccgacccaacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 8560803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10516802 - 10516749
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10516802 atttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10516749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16521060 - 16521007
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16521060 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 16521007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 308
Target Start/End: Original strand, 17581643 - 17581748
Alignment:
Q  203 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||  || | || |||||| |||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||||||    
T  17581643 atgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacaatatgacatatttcggtctatgtagtcgatcccacttagtaggataaagtttggtggttgttgtt 17581742  T
Q  303 gtcgtc 308  Q
    ||||||    
T  17581743 gtcgtc 17581748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12470978 - 12470894
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | || |||| | ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  12470978 atggtttttgatatatcactatggcgtcgtttgcttcatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggtggttgttgttgt 12470894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15775898 - 15775842
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  15775898 atttggtccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgttgt 15775842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 23714542 - 23714474
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||    
T  23714542 gggtagcacatatagtagaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagac 23714474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24102214 - 24102146
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||    
T  24102214 gggtagcacatatagtagaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagac 24102146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28960294 - 28960210
Alignment:
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   || |||||| ||||||| |||  | | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28960294 atatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgtagtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 28960210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 302
Target Start/End: Original strand, 32402667 - 32402783
Alignment:
Q  186 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 285  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||  ||||| ||| | |||||||||| ||||   |||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||     
T  32402667 aaaagatctagagattaatgagttggatagaaataaggtatatgatagaacattatggtttcatttgatccacgtagacgatcctgcttagtgggataag 32402766  T
Q  286 gcttggttgttgttgtt 302  Q
     ||||| ||||||||||    
T  32402767 acttggctgttgttgtt 32402783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Original strand, 33393319 - 33393394
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33393319 tgatagaaca-tatgtcatagtttgatccatgtaaccgaccccacttactgggataaagcttggttgttgttgttgt 33393394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470124
Alignment:
Q  145 ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 244  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||  ||||||| ||||| | |||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||  | |||||||||| ||||      
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggt 37470190  T
Q  245 atcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg----cttggttgttgttgttgtcg 306  Q
     |  |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |    || |||||||||||||||||    
T  37470189 gtagtttgatccatgtagctaatcccacttagtgggataaggctctctcggttgttgttgttgtcg 37470124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 186230 - 186135
Alignment:
Q  203 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  186230 atgagttggatccaaataaagtttaagatagaacatcatgtcataatttgattcatgtggccgacctcacttagtgggataaagcttggttgttgt 186135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Original strand, 3481134 - 3481248
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||   ||| |||| ||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| | || | |||     
T  3481134 agagggaattggggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaagg 3481230  T
Q  109 agagaagatcaaatggag 126  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  3481231 agagtagatcagatggag 3481248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 304
Target Start/End: Original strand, 14444899 - 14444954
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14444899 tttgatccatgtagccatccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14444954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 887139 - 887065
Alignment:
Q  227 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat-gcttggttgttgttg 300  Q
    ||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  887139 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgggataatggcttggttgttgttg 887065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4682291 - 4682253
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4682291 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtt 4682253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14197279 - 14197205
Alignment:
Q  229 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||| |  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  14197279 gatagagcattatgacatcgtttgattcatgtacccgacctcacttactggggtaatgcttggttgttgttgttg 14197205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33594354 - 33594272
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgat-ccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || |||||  ||||||| |||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  33594354 atggttttggatagaacactatgatgtcgtttgactcatgtagtcgatccccacttaatgtgataaagctttgttgttgttgt 33594272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Original strand, 36616856 - 36616910
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  36616856 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactat 36616910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 38860165 - 38860243
Alignment:
Q  11 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||    
T  38860165 agagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagacc 38860243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Original strand, 11412711 - 11412764
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 62  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  11412711 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttag 11412764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 304
Target Start/End: Original strand, 14530532 - 14530565
Alignment:
Q  271 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14530532 acttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 14530565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 277
Target Start/End: Original strand, 19224990 - 19225039
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 277  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||    
T  19224990 tgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagt 19225039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Original strand, 32706472 - 32706525
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||  |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32706472 atttgatggatgtagtcgattccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 32706525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45483038 - 45482989
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 297  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45483038 atttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 45482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Original strand, 522445 - 522509
Alignment:
Q  235 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  522445 acactatggcgtcatttgatccatgtagcagatcacacttaatgggataaggctttgttgttgtt 522509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 786833 - 786873
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 62  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  786833 gtagcacctatagtagaaaagatggcagaaactagacttag 786873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720438
Alignment:
Q  206 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 278  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 3720438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 6218967 - 6219031
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 83  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || || ||||| ||||| || ||| |||||||||||||    
T  6218967 ggggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagag 6219031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Original strand, 9078792 - 9078836
Alignment:
Q  234 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 278  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  9078792 aacattatgacatcatatgatccatgtagccgagcccacttagtg 9078836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 9578995 - 9578915
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||||| | |||||  ||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  9578995 agagagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatgtaaaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 9578915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  32 tagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||||||| |||| |||| | | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 155)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27450471 - 27450180
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27450471 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 27450372  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27450371 agagtagatcaaatggagtagaatcaggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagt 27450272  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  27450271 tggatccaaatat-gattttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgttgt 27450180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 436219 - 436514
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  436219 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaaga 436318  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  436319 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagt 436418  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |  |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  436419 tgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 436514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 52569807 - 52569512
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  52569807 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 52569708  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52569707 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 52569608  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52569607 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 52569512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31960106 - 31959814
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31960106 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 31960007  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31960006 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagt 31959907  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31959906 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31959814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48174385 - 48174090
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48174385 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 48174286  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48174285 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 48174186  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48174185 tggatccaaatttggtgtatgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48174090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 48622835 - 48622543
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  48622835 agagagagtgggggtagcacccatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaaga 48622736  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48622735 aaagaagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagt 48622636  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48622635 ttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48622543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33191140 - 33190846
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  33191140 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaaga 33191041  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    || | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33191040 agggtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 33190941  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |  |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  33190940 tgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtttttgttg 33190846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 38 - 302
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479321
Alignment:
Q  38 aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 137  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  138 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 237  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  238 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgtt 32479321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Original strand, 56375280 - 56375573
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  56375280 agagagagtaggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 56375379  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  56375380 agagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagt 56375479  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  56375480 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 56375573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 4440843 - 4441138
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  4440843 agagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaaga 4440942  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4440943 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 4441042  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| || || ||||||||    
T  4441043 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgtcgtcgttgttgt 4441138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 33227199 - 33227494
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  33227199 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaaga 33227298  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33227299 agagtagatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 33227398  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  33227399 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacctagtggaataaggcttggttgtttttgttgt 33227494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1777295 - 1777016
Alignment:
Q  23 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaat 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  1777295 tagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaat 1777196  T
Q  123 ggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg 222  Q
    |||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1777195 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 1777096  T
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  1777095 gtgtatgatagaacagtatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgtt 1777016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 43433914 - 43434209
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43433914 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 43434013  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  43434014 agagtaaatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagt 43434113  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
      ||||||||| || | |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43434114 cggatccaaatttgatgtaggatagaacactacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43434209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Original strand, 53707786 - 53708079
Alignment:
Q  11 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaag 110  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  53707786 agagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaag 53707885  T
Q  111 agaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtta 210  Q
    || | ||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  53707886 agtatatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 53707985  T
Q  211 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  53707986 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 53708079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 37797842 - 37798136
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  37797842 agagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaaga 37797941  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37797942 agagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttagaggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagt 37798040  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  37798041 tgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcatttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgttgt 37798136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Original strand, 27983190 - 27983476
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27983190 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagg-------cttagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaaga 27983282  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27983283 agagtatatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacataagaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaat 27983382  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  27983383 tggatcaaaatatggatttttatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttgttgtt 27983476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39100827 - 39100533
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  39100827 agagagagtgggggtagcacctatagaagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatgc-gttgtaaga 39100729  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||| |||||  | |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39100728 agagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagt 39100629  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||||| |||| | |||||||| |||| | | || | |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39100628 tggatccaaatattgtttatcatagaacattatggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 39100533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23906587 - 23906297
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||    
T  23906587 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaaga 23906490  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||| |||||||| |||  || ||||||| ||||| | ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23906489 agagtagattaaatggaggagagtcaagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 23906390  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23906389 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 23906297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 304
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286724
Alignment:
Q  43 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 142  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  143 ga--------ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 234  Q
    ||        |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  235 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 8286724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26037797 - 26037506
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatg-tagagagaagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||  ||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  26037797 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt-gatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaag 26037699  T
Q  108 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    ||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26037698 aagagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatgag 26037599  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  26037598 ttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 46583116 - 46582823
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagaccc-gtagataccgttgtaag 107  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || | ||||||||||  |||||| ||||||  ||| |||||    
T  46583116 agagagagtggggatagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaag 46583019  T
Q  108 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  46583018 aagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgag 46582919  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  46582918 ttggatccaaatttggtgtatgatagaaccctatggcgtcatttgatccatgtagccta-cccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 46582823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 294
Target Start/End: Original strand, 39708424 - 39708708
Alignment:
Q  10 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 109  Q
    |||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  39708424 gagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatgccgtcgtaagaa 39708523  T
Q  110 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 209  Q
    ||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39708524 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 39708623  T
Q  210 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 294  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||||    
T  39708624 ggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttggttg 39708708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 306
Target Start/End: Original strand, 28236173 - 28236469
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||    
T  28236173 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaaga 28236272  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    ||||  |||||||||| | |||| || |||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28236273 agagttgatcaaatggcggagaatcaagttaaaa-tggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagt 28236371  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcg 306  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||| | ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  28236372 tggatccaaatttggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgtcg 28236469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192311
Alignment:
Q  11 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaag 110  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  111 agaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtta 210  Q
    || | ||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||     
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  211 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    ||||||||| || | | |||||||||| |||||| | ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat-caagtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgt 20192311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37773733 - 37773486
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||    
T  37773733 ggggtagcacctatagtagaaaagtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatc 37773634  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    |||||||  |||  ||  |||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  37773633 aaatggatgagagtcaatttaaaagaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaga 37773534  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  37773533 tttggtttatgatagaacactatgacataatttgatctatatagccga 37773486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47265494 - 47265193
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac-------ccgtagataccgt 101  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||       |||||||| ||||    
T  47265494 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaaggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgt 47265395  T
Q  102 tgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtc 201  Q
     |||||||||| |||  |||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47265394 cgtaagaagagtagactaaatggaggagattctagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtc 47265295  T
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  47265294 aatgagttggatccaaatttgatctatgatagaacactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgt 47265195  T
Q  302 tg 303  Q
    ||    
T  47265194 tg 47265193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 147 - 304
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528573
Alignment:
Q  147 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||        
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  247 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 21528573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 275
Target Start/End: Original strand, 50286970 - 50287217
Alignment:
Q  27 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  50286970 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggag 50287069  T
Q  127 aagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttt 226  Q
     |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || | |    
T  50287070 gagagtcaagttaaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgt 50287169  T
Q  227 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 275  Q
     |||||||||||||||    |||||||||||||||| ||| || |||||    
T  50287170 atgatagaacactatg-ggccatttgatccatgtagtcgaccccactta 50287217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 114 - 304
Target Start/End: Original strand, 21236953 - 21237143
Alignment:
Q  114 agatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagat 213  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21236953 agatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 21237052  T
Q  214 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  21237053 ccaaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgttgt 21237143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 304
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957883
Alignment:
Q  147 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 246  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||| |    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  247 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 6957883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 298
Target Start/End: Original strand, 1793459 - 1793741
Alignment:
Q  18 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||  ||| ||||||| || ||||    
T  1793459 gggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagat 1793558  T
Q  118 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatta----gaaaagatttagaggtcaatgagttagat 213  Q
    || |||||| ||    |  | ||||||||||||| |||| ||   ||||| ||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1793559 cagatggaggagtcgta--tcaaaagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggat 1793656  T
Q  214 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  1793657 ccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 1793741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 304
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494948
Alignment:
Q  147 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 246  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  247 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12494948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 51811442 - 51811280
Alignment:
Q  137 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 236  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51811442 ttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaac 51811343  T
Q  237 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  51811342 actatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt-gttgttgttgt 51811280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20591591 - 20591353
Alignment:
Q  10 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 109  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| | |||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||    
T  20591591 gagagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtcgt-gtaagaa 20591493  T
Q  110 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 209  Q
    ||| | |||| |||||| |||  || ||    ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20591492 gagtatatcagatggaggagagtcaagt----agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 20591397  T
Q  210 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 254  Q
     ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  20591396 ggattcaaatatgg-ttatgatagaacacaatgacgtaatttgat 20591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Original strand, 51421730 - 51422013
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||||||| |||||||||  || || |||||||||| ||||| || ||| | ||| || |||||||||| ||||||   ||  || |||||| |||||    
T  51421730 ggggtagcacatatagtagattagatgatagaaaataggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatc 51421829  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    ||||||||      ||| | ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51421830 aaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagaggaagatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaa 51421929  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51421930 aatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 51422013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  147 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 246  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| |  |    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  247 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 296  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Original strand, 50679588 - 50679736
Alignment:
Q  103 gtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 202  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50679588 gtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtca 50679687  T
Q  203 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 251  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  50679688 atgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20601917 - 20601669
Alignment:
Q  30 tatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||    
T  20601917 tatagtagaaaagttggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggag 20601818  T
Q  130 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 229  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||| ||  ||||||||||||||||        ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||    
T  20601817 agtcaggtcaaaagaggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccattagaaa-----gtcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatg 20601724  T
Q  230 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 284  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| |||||| | || || |||||||| |||||    
T  20601723 atagaacattatgacgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataa 20601669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41009641 - 41009414
Alignment:
Q  10 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggt-agaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||  || ||| | || ||||||    
T  41009641 gagataatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaaga 41009542  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    | |  |||||| |||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||     
T  41009541 aaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgaga 41009443  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaaca 237  Q
    | ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  41009442 tggattcaaatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 300
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548303
Alignment:
Q  137 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 236  Q
    |||||| ||| |||||| || ||| |||||| ||| |||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  237 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttggttgttgttg 4548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45205131 - 45204837
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt--agatgatttagacatgtagagagaagacccgtag-------ataccgttgtaag 107  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || |||   || |||||||||||||| ||||       ||   |||||| |    
T  45205131 tgggggtagtgcctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacg 45205032  T
Q  108 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| | || | ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| ||    
T  45205031 aagagtagatcagatggaggagagc-agatcaaaagaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataag 45204933  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| || | | | |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45204932 ttggatccaaatatggtttatgatagaacatta-ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45204837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821001
Alignment:
Q  53 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 152  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |  ||| || || |||| | |||||| |||| ||| | |||||||||||| |    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  153 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata----gaacactatgacatca 248  Q
    |||| ||| |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    |||||||||  ||| |    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaac-attagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacgaacactatatcataa 20821057  T
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  20821056 ttcgatccatgtagctgatcttacttagtaagataaggtttggttattgttgttgt 20821001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154860
Alignment:
Q  191 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  291 gttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||    
T  19154873 gttgttgttgttgt 19154860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 196 - 304
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969466
Alignment:
Q  196 gaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  296 tgttgttgt 304  Q
    |||||||||    
T  19969458 tgttgttgt 19969466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 258
Target Start/End: Original strand, 16002933 - 16003165
Alignment:
Q  25 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 124  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | | |||| ||||    
T  16002933 gcacctatggtataaaagttgatagaaaatagtcttagatggttga-acatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatgg 16003031  T
Q  125 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 224  Q
    |  | |   | || ||||||  |||||||| | |  | ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  16003032 atgaaagttatgtcaaaagaaatagaggaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgat 16003131  T
Q  225 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 258  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  16003132 ttatgataaaacactatgacgtaatttaatccat 16003165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 304
Target Start/End: Original strand, 35690391 - 35690556
Alignment:
Q  139 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 238  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||     
T  35690391 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacat 35690490  T
Q  239 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  35690491 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttgt 35690556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 55007914 - 55008031
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  55007914 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 55008013  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||    
T  55008014 cttggttgttgttgttgt 55008031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28550583 - 28550455
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  || |||||||| ||||||| || || ||    
T  28550583 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgaccccac 28550484  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  28550483 ttattgggataaggtttggttgttgttgt 28550455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Original strand, 31043226 - 31043357
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||| || || ||    
T  31043226 gagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcataatttgatccttgcagctgaccccac 31043325  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||  |||| |||| ||| ||||||||||    
T  31043326 ttagtgcaataaagcttagttattgttgttgt 31043357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 302
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351842
Alignment:
Q  77 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 176  Q
    ||||||||||||| |||||  | || ||||| |||| |||||| |||||| | |  ||| ||| ||||||||||| |||| |||  ||||| ||  ||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  177 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 276  Q
    ||| ||||  |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |  ||||||  ||||  || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttag 28351816  T
Q  277 tgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||    
T  28351817 tggggtaaggcttggctgttgttgtt 28351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 883448 - 883357
Alignment:
Q  213 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  883448 tccaaatataatttttgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccactcagggatataatgcttggttattgttgttgt 883357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1211683 - 1211389
Alignment:
Q  10 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga--cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||||| |  |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||  || |||||    
T  1211683 gagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagttggtaggaaatatatgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaag 1211584  T
Q  108 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    ||||| |||||| |||||| |||  | | | ||||||| ||||||||||  || || ||| ||  || |||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1211583 aagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaaagagatagaggaagacataggagaactataagataaattattagaaaaaatt-agaggtcaatgag 1211485  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat-catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || |||||  || |||||| | ||||||||||| | | |  ||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  1211484 ttggatcc--atttggtttctcatagaacactaaggcgtaaatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgttgt 1211389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31961394 - 31961263
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||| ||   | | |||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |  ||    
T  31961394 gagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgacctcac 31961295  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31961294 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31961263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19062017 - 19061932
Alignment:
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19062017 tatggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 19061932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 49939809 - 49939733
Alignment:
Q  226 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  49939809 tttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgtt 49939733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 226
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862851
Alignment:
Q  140 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttga-gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttt 226  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggttt 50862851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53518483 - 53518325
Alignment:
Q  141 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 240  Q
    |||||||||||||||  |||  ||||| ||  || |||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  53518483 aagaggtagaggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacacta 53518384  T
Q  241 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    || | | |||||||||||| || ||| || |||||||| ||||   || |||||||||||    
T  53518383 tggcgtaatttgatccatgcag-cgaccccacttagtgggataggactcggttgttgttg 53518325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Original strand, 2589255 - 2589357
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||  | || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2589255 aatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2589354  T
Q  302 tgt 304  Q
    |||    
T  2589355 tgt 2589357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Original strand, 12494740 - 12494794
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttaga 63  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12494740 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 25574992 - 25575109
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||   | |||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |    
T  25574992 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataagg 25575091  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25575092 cttggttgttgttgttgt 25575109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 56225236 - 56225353
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| |    
T  56225236 aaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttatagaacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataagg 56225335  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
     | |||||||||||||||    
T  56225336 atcggttgttgttgttgt 56225353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13805350 - 13805262
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  13805350 aaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttgt 13805262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 304
Target Start/End: Original strand, 31459151 - 31459279
Alignment:
Q  176 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 275  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||| |||| |   | |||||||||||| |||| || |||||    
T  31459151 aaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccactta 31459250  T
Q  276 gtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  31459251 gtgggataaggcttggttgttgtcgttgt 31459279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208266
Alignment:
Q  192 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 291  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||||||||  ||| ||  |||| || ||||| ||||||    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  292 ttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||    
T  34208278 ttgttgttgttgt 34208266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443379
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatcccaaatcgtaggataaggcttggttgttgttgttg 12443379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32633482 - 32633403
Alignment:
Q  225 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  32633482 ttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 32633403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 41192826 - 41192913
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 96  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  41192826 agagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatggtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagat 41192913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238612
Alignment:
Q  237 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 50238612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238698
Alignment:
Q  237 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 50238698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 298
Target Start/End: Original strand, 13262413 - 13262491
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13262413 atggtttttgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgt 13262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024846
Alignment:
Q  163 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 262  Q
    ||||| || |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| ||||   | |||| ||||||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  263 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 305  Q
    |||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26024888 ccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgctgtc 26024846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 35555928 - 35555859
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  35555928 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacc 35555859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37042792 - 37042667
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| | | |||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||| || ||    
T  37042792 gagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacccgac 37042693  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    
T  37042692 ttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 220 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 50869961 - 50869876
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 305  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50869961 atggtttttggtagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 50869876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6958323 - 6958236
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  6958323 aaatatggttttggatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgggataa-cattggttgttgttgttgt 6958236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7066575 - 7066496
Alignment:
Q  224 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7066575 tttttgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 7066496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30634159 - 30634103
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30634159 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30634103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Original strand, 51438642 - 51438730
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||| | | |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51438642 aaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51438730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 55388325 - 55388213
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||   | ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| |    
T  55388325 aaagatttggagattaatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataagg 55388226  T
Q  287 cttggttgttgtt 299  Q
    |||||||||||||    
T  55388225 cttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Original strand, 37488245 - 37488376
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||| |||| |||| ||||||||||  ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||   || ||    
T  37488245 gagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgtaatttgatccatgtagccagccccac 37488344  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37488345 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 37488376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 44047640 - 44047553
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 96  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  44047640 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagagttaagacctgtagat 44047553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45209257 - 45209202
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45209257 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45209202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 301
Target Start/End: Original strand, 47372915 - 47372986
Alignment:
Q  230 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  47372915 atagaacattatgacatcgtctgatccatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 47372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 54470197 - 54470276
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  54470197 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 54470276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Original strand, 5306479 - 5306581
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| | | ||||||||||| ||||  | || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5306479 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccacttggtgggataaggcttggttgttgttgt 5306578  T
Q  302 tgt 304  Q
    |||    
T  5306579 tgt 5306581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Original strand, 31459032 - 31459098
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 87  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||    
T  31459032 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Original strand, 46372024 - 46372306
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||| || |||   ||||||||||||||||  || ||| | ||  ||||||||| |||||    
T  46372024 ggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgtactaagaagagcagatc 46372123  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    | || |||  || |||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | |    
T  46372124 agatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaaga 46372223  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
     |||||||||||||||||||  |  | || |||||| |||||||| || || |||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  46372224 catggtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagttgggtaaggcttggttgttgttgt 46372306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540575
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  || |||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| ||   ||||||||||| |||||||||| |||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattat 53540512  T
Q  242 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | || ||| |||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  53540513 ggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgggataagacttggttgttattgttgt 53540575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 304
Target Start/End: Original strand, 46153940 - 46153993
Alignment:
Q  251 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46153940 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 46153993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1328667 - 1328611
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1328667 atttgatccatgtatccgatcctacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1328611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Original strand, 29399001 - 29399089
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| | | ||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  29399001 aaataaggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 29399089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35622757 - 35622673
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  35622757 atggtttttgatagaacgctagggcatcgtttgattcaggtagctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgt 35622673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 38017319 - 38017371
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  38017319 tttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttgggtgttgttgt 38017371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42285784 - 42285700
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||| | || |||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  42285784 atggtttttgatagaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccacttagttggataagacttggttgttgttgttgt 42285700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 302
Target Start/End: Original strand, 44360289 - 44360369
Alignment:
Q  222 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||| || ||||||||    
T  44360289 ggtttttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataaggcttgtttattgttgtt 44360369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Original strand, 56130404 - 56130456
Alignment:
Q  253 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 305  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  56130404 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 56130456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 302
Target Start/End: Original strand, 41192229 - 41192344
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | || ||||||| |||| | || || ||||||||||||||| || || ||||  ||||| |    
T  41192229 aaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccgacccgacatagttggataagg 41192328  T
Q  287 cttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||||||||    
T  41192329 cttggttgttgttgtt 41192344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44719413 - 44719358
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  44719413 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 44719358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809061
Alignment:
Q  143 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 230  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccagatatggtatttga 55809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 2588991 - 2589056
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 85  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  2588991 ggggtagtacctatagt-gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaa 2589056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 15665330 - 15665384
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15665330 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 15665384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 88
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356688
Alignment:
Q  26 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||  ||||||||||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagac 26356688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729509
Alignment:
Q  200 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatg 41729509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285882
Alignment:
Q  29 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| || ||| | || || ||||||| ||||||    
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtggattctgtagtcagaagagcagatca 42285882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42293416 - 42293262
Alignment:
Q  150 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 249  Q
    |||| ||||||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||  | ||||||| | ||||||| || || || |||||    
T  42293416 aggatgaactaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatagacatatggtatatgatagagcattacgatatcat 42293317  T
Q  250 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || ||| |||||||||  || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  42293316 ttaatctatgtagccggccccacttagtggaataaggcctggttgttgttgttgt 42293262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 304
Target Start/End: Original strand, 54935348 - 54935434
Alignment:
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | || |||| ||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  54935348 atatggtttatgatagaacattataacataatttgatccatgtagcctaccccacttggtgggacagggcttggttgttattgttgt 54935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 300
Target Start/End: Original strand, 3979124 - 3979201
Alignment:
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3979124 gtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgttg 3979201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22873698 - 22873601
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    |||||||| | ||||||||||| || |||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  22873698 aatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataaggcttggtagttgtt 22873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31897509 - 31897428
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  31897509 atggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31897428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4879162 - 4879106
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  4879162 atttgatccatgtagccgacctcacttactgggataaggcttggttgttgttgttgt 4879106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15661925 - 15661869
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  15661925 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgtcgttgt 15661869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20105603 - 20105515
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||  || || ||||||| |||||||||||    
T  20105603 aaatatggtatatgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagccaatctcacttagtaggacaaggcttggtggttgttgttgt 20105515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 30621486 - 30621418
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 87  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | || ||||||||||||    
T  30621486 ggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaaga 30621418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Original strand, 32339768 - 32339844
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||| | |||| | || |||||||||||||| | || | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32339768 tgatagaaaattatggcgtcgtttgatccatgtagtctattctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32339844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34233123 - 34233031
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 294  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |  | | |||||||||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||    
T  34233123 aatgagttagatcaaaataaggtttatgatagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccgacgccactcagtgggacaatgcttggttg 34233031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41009347 - 41009283
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 237  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  41009347 gagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgatataaca 41009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 42639301 - 42639233
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  42639301 gggttgcacctatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 42639233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 49738602 - 49738550
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49738602 tttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49738550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 296
Target Start/End: Original strand, 50862860 - 50862908
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 296  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  50862860 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 50862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 299
Target Start/End: Original strand, 1095642 - 1095725
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| |||| ||   |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1095642 aaatatggtttatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataaggcttggttgttgtt 1095725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4136795 - 4136744
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  4136795 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgagataaaacttggttgttgttg 4136744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 299
Target Start/End: Original strand, 34585691 - 34585762
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34585691 tgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcttaacccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 34585762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 36799740 - 36799657
Alignment:
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  36799740 atatggtttatgattgaacaatatcgcataatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggataaagcttaattgttgttgt 36799657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 44360077 - 44360155
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||| | ||||||||||||||||    
T  44360077 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactaga-ttaggttgtttgggcatgtagagagaagac 44360155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 51252753 - 51252674
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || | | | ||||||||||||||||    
T  51252753 agagagagttggggtagcacctctagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatgggcatgtagagagaagac 51252674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 10209034 - 10209104
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| || ||| | ||||||| |||||||||    
T  10209034 ggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaacttagttggtttgggcatgtagcgagaagacc 10209104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 17900480 - 17900550
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |  || ||| | || ||||||||||||||    
T  17900480 ggggtagcacctatagtagaaaagacggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagacc 17900550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 33709914 - 33709992
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 87  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  33709914 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaaga 33709992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Original strand, 36198977 - 36199059
Alignment:
Q  181 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 263  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||   ||| |||| ||||||   | ||||||||||||||    
T  36198977 attagaaaagatttagaggttattgagtttgattcaaatatggtttcaaataaaacattatgacgaaacttgatccatgtagc 36199059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Original strand, 50680746 - 50680844
Alignment:
Q  26 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattta-gacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatg 123  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||| |  |||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  50680746 cacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagagagaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatg 50680844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 50967081 - 50967027
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  50967081 atttgatccatgtagccgacctcacttagtggaataaagcttggttgttgttgtt 50967027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 55768783 - 55768717
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  55768783 ggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 55833039 - 55832973
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  55833039 ggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3601449 - 3601416
Alignment:
Q  271 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3601449 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 3601416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Original strand, 8284348 - 8284421
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||    
T  8284348 tgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctacttagtgggattaggcttgattgatgttgt 8284421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Original strand, 10209237 - 10209319
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||||  || | || |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  10209237 atggtttttgatagaacac--tggcgtcgtttgattcaagtagccgaccccacttagtgggataaggcgtggttgttgctgttgt 10209319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10775550 - 10775468
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10775550 atggtttttgatagaacact--gacattgtttgatttatgtcgccgaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtttttgt 10775468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 242
Target Start/End: Original strand, 26510558 - 26510611
Alignment:
Q  189 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 242  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26510558 agatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgcgatagaacattatg 26510611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Original strand, 28497480 - 28497596
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||   || |||||     
T  28497480 agagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagg 28497578  T
Q  109 agagaagatcaaatggag 126  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  28497579 agagtagatcagatggag 28497596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 36557321 - 36557268
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 62  Q
    ||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  36557321 agagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag 36557268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 49738886 - 49738809
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||   | |||| ||||||||||| |||||    
T  49738886 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagacccatagat 49738809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7544584 - 7544528
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||    
T  7544584 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagccttggttgtcgttattgt 7544528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 28348287 - 28348339
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28348287 tttgaaccatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28348339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 263
Target Start/End: Original strand, 28486089 - 28486165
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 263  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||   || ||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  28486089 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagc 28486165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30621329 - 30621241
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 261  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | |||| ||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | | ||||||||||||    
T  30621329 gagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgta 30621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 30662106 - 30662042
Alignment:
Q  238 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  30662106 ctatgacatcatttaatccaagtggctgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 30662042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35555731 - 35555647
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | || |||||| |||||||||||  | | |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  35555731 atggtttttgatagtacagtatggcgtcgtttgattcatgtagccgactccatttagtgggacaaggcttggttgtttttgttgt 35555647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 36556841 - 36556757
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |  |||||| | |||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  36556841 atggtttttgataggacactatggcgttgtttgattcgtgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttgt 36556757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 40932997 - 40932921
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  40932997 tgatagaacattatggcggcgtttgatgcatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgttgttgt 40932921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45184214 - 45184130
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||| | ||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  45184214 atggtttataataaaacattatgacgtaattcgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgttattgt 45184130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Original strand, 45423617 - 45423681
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 85  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  || ||| |||||||||| ||||    
T  45423617 ggtagcacctataatagaaaagatggtagaaacttgacttacgtggttttgacatgtagaaagaa 45423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 46236719 - 46236771
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  46236719 tttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggtggttgttgt 46236771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 50471757 - 50471809
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50471757 tttgatccatgtaatcgaccccacttagtgggataacgcttggttgttgttgt 50471809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Original strand, 54963648 - 54963735
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | |||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  54963648 aaatatggtatatgatagaaca-tatggcctaattttatccatgtacctgacccaacttagtgggataagacttagttgttgttgttgt 54963735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 283
Target Start/End: Original strand, 55579200 - 55579295
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 283  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||  ||| | ||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  55579200 aaagatttaaaggttcatgagttggatttaaacaaggtttatgata-aacattatgatataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgtgata 55579295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 111)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42854296 - 42854001
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42854296 agagagagtgggggtaacacctatagcagagaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 42854197  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42854196 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 42854097  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| | ||||| |||||||||||    
T  42854096 tggatccaaatatggtttttgatataacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggtttggtggttgttgttgt 42854001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 36545139 - 36545434
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36545139 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 36545238  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| | |  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36545239 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 36545338  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36545339 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 36545434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11524016 - 11523720
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt-agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11524016 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaag 11523917  T
Q  108 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11523916 aagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgag 11523817  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11523816 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 11523720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 40813314 - 40813609
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||    
T  40813314 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaaga 40813413  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40813414 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagt 40813513  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  40813514 tggatccaaatttggtgtgtgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgttgt 40813609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36565533 - 36565239
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  36565533 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaaga 36565434  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    || | ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36565433 agggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 36565334  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  36565333 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 36565239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491141
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  121 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 220  Q
    ||| || |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  221 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 93 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469724
Alignment:
Q  93 agataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagat 192  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  193 ttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggt 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggt 42469736  T
Q  293 tgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||    
T  42469735 tgttgttgttgt 42469724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 298
Target Start/End: Original strand, 8932692 - 8932982
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgt-agataccgttgtaag 107  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | || || |||||||    
T  8932692 agagagagtgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatccgttaaatgccattgtaag 8932791  T
Q  108 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    ||||| | ||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8932792 aagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttaaaggttaatgag 8932891  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    || |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  8932892 ttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgaaataaagcttggttgttgt 8932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36395242 - 36394949
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt-agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  36395242 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaag 36395143  T
Q  108 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  || ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36395142 aagagtagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgag 36395043  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacacta---tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||   || |||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  36395042 ttagatccaaatttggtgtatgatagaacactattgtggcat--tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttg 36394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Original strand, 18125163 - 18125454
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18125163 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaaga 18125262  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    | || ||||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18125263 atagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-aaagaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaagtcaatgagt 18125361  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||| ||||||   | |||||||| |||||| | | || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18125362 tggatccaaatatgatttatgatagaatactatggtgt-atttgatcaatgtagtcaacccgacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 18125454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Original strand, 39946855 - 39947091
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||    
T  39946855 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtaga 39946954  T
Q  117 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 216  Q
    |||||||||| |||  || |||| ||||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39946955 tcaaatggaggagactcaagttagaagaggtagaggacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatcca 39947054  T
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 253  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  39947055 aatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttga 39947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 304
Target Start/End: Original strand, 21121177 - 21121430
Alignment:
Q  50 aaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtag 149  Q
    |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  21121177 aaaataggtttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtag 21121276  T
Q  150 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 249  Q
    ||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||    
T  21121277 agggagacctaagaaatctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 21121376  T
Q  250 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21121377 ttgat-catgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 21121430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Original strand, 2796547 - 2796818
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    | |||||| || ||||||||    
T  2796547 agagagagtgggggtagcgcctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga----ctgtagatgccattgtaaga 2796642  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  2796643 agagtaaatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagt 2796742  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 284  Q
    |  |  ||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  2796743 tgaactcaaatttggtttttgatagaacagtatggcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgggataa 2796818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742079
Alignment:
Q  146 gtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |     
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaata---tttttgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  246 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14742079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904950
Alignment:
Q  39 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||| |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  139 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  239 tatgacatcatttgatccat 258  Q
    |||| | | |||||||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccat 26904950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 304
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027815
Alignment:
Q  120 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 219  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2027815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Original strand, 37077768 - 37078034
Alignment:
Q  34 gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |    
T  37077768 gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 37077865  T
Q  134 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 233  Q
     ||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |    |||||    
T  37077866 gggtcaaaataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatag 37077965  T
Q  234 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||  |||| | |||||||||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  37077966 aacac--tgacgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataaaacttggttgttgttgttgt 37078034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8879732 - 8879446
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    | |||| ||||||    
T  8879732 agagagaatgggggaagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagacccg----tgccgtcgtaaga 8879637  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    ||||  ||||| |||||| ||   | |||  |||||| | |||| |||  || |||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||    
T  8879636 agagttgatcagatggaggagggtcgggtccaaagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagt 8879537  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |  ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| | |||| ||||||||||||||  | ||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  8879536 tgaatccaaatatggtttatgatataacac--tgacgtaatttaatccatgtagccgactccacttattaggataaagcttggttgttgttgt 8879446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 297
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026058
Alignment:
Q  77 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 176  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||             
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaac--------- 12025937  T
Q  177 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga---catcatttgatccatgtagccgatccaact 273  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||| || |||    
T  12025938 ---cattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctact 12026034  T
Q  274 tagtgtgataatgcttggttgttg 297  Q
    |||||  |||| | ||||||||||    
T  12026035 tagtggaataaggtttggttgttg 12026058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 45419227 - 45419517
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||| |||||  |  | ||| ||    
T  45419227 agagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc--tagtatga 45419324  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||| |||||| |||  ||| |   |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||| |||| |    |||||||    
T  45419325 agagtagatcagatggaggagagtcagatctgaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagt 45419424  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45419425 ttgatccaaatttggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45419517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15215533 - 15215409
Alignment:
Q  180 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 279  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||      
T  15215533 cattagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtag 15215434  T
Q  280 gataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15215433 gataaggcttggttgttgttgttgt 15215409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25473531 - 25473402
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  25473531 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 25473432  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25473431 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 25473402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 301
Target Start/End: Original strand, 44529395 - 44529507
Alignment:
Q  189 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  44529395 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 44529494  T
Q  289 tggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||||||    
T  44529495 tggttgttgttgt 44529507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18752167 - 18751996
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||| | |    
T  18752167 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag-cttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaa 18752069  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 181  Q
    ||||  ||||||||||| || |   || |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||    
T  18752068 agagtggatcaaatggaaaatagttagattaaaagaggtagaggaatacctaaaaaaaccattagcgaaacca 18751996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047529
Alignment:
Q  192 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  292 ttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||    
T  44047541 ttgttgttgttgt 44047529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Original strand, 25288918 - 25289045
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||| || || ||    
T  25288918 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctgaccccac 25289017  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
     |||||  |||| |||||||||||||||    
T  25289018 ctagtggtataaggcttggttgttgttg 25289045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Original strand, 25300253 - 25300380
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||    
T  25300253 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctgaccccac 25300352  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
     |||||  | || ||||||| |||||||    
T  25300353 ctagtggaacaaggcttggtggttgttg 25300380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 490503 - 490620
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  490503 aaagatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 490602  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| |||||||||||||    
T  490603 cttgtttgttgttgttgt 490620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 29520803 - 29520931
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||||||  |||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |     
T  29520803 gagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcccaccccat 29520902  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29520903 ttagtgggataatgcttggttgttgttgt 29520931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35643765 - 35643605
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||  ||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  35643765 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacact-- 35643668  T
Q  242 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35643667 gccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 35643605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45041443 - 45041315
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||  || |||| | | |||||||||||||||| || || ||    
T  45041443 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 45041345  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  45041344 ttagtgggataaggcttggttgttgatgtt 45041315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Original strand, 30559847 - 30559983
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta-----gccgat 267  Q
    ||||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||     |||||     
T  30559847 gagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtaatgtagccgac 30559946  T
Q  268 ccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30559947 cccagttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30559983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 304
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931245
Alignment:
Q  28 cctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaga 127  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||| |||||||||| |||| | |  ||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||     
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatctatagattctgtagtaaggagactagatcagatggagg 32931069  T
Q  128 agaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt 227  Q
    | |  ||  | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || | ||||||||| |     
T  32931070 atagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgta 32931168  T
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || ||  ||||||||||| ||||||    
T  32931169 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttgatgttgt 32931245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12796980 - 12796894
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||    
T  12796980 ggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaagactcgttgattccgtcgtaag 12796894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216568
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| |||  ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactatta-agaagatttagagatcaatgagttggatcctaatatg-tttatgatagaacattat 2216508  T
Q  242 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
        | ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  2216509 agtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgttgt 2216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 6510707 - 6510617
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  6510707 gtagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagag 6510617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39967551 - 39967497
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39967551 tttgatccatgtagccgatcccacttattgtgataatgcttggttgttgttgttg 39967497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 39953556 - 39953263
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||  | |||   || |||||     
T  39953556 agagagagttgggatagcacctatatgagaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaagg 39953457  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||| ||| ||  ||| ||| | |  |||||||| || ||| ||| |||||| |   ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||    
T  39953456 agagtagatcagatgaaggcgaatcagatcactagaggtaggggtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagt 39953357  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||   ||| |||||||||||| | ||||||||   |  |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  39953356 tagagaaaaacatggtttttgatgggacactatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 39953263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 42584527 - 42584643
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||| || |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||      
T  42584527 aaagatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat-cttgtagccgaccccacttagtgggataaga 42584625  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| |||||||||||||    
T  42584626 cttgattgttgttgttgt 42584643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43904947 - 43904700
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga---cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||     ||||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||  |||||    
T  43904947 gtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatc 43904848  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    | |||||| | |  ||  ||| |||||||| ||||||| |||  || || ||  |||||||  |||  | |||||||||| | |||||||| |||| |||    
T  43904847 agatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaa 43904748  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||    
T  43904747 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27556375 - 27556299
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  27556375 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgttgttgt 27556299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Original strand, 30689939 - 30690023
Alignment:
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 307  Q
    |||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  30689939 gtttatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggtttttattgttgtcgt 30690023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35914729 - 35914601
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||  || | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || ||    
T  35914729 gagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 35914630  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35914629 ttagtgagataagacttggttgttgttgt 35914601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41031505 - 41031417
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41031505 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41031417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41031611 - 41031523
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41031611 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41031523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255528
Alignment:
Q  212 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca--acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 8255528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 304
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169676
Alignment:
Q  141 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 240  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||| ||||| || | ||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgataaaatatta 28169613  T
Q  241 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||   | |||| |||||| || || | || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28169614 tggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagtg-gataaggcttggttgatgttgttgt 28169676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928585
Alignment:
Q  229 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1928585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10668569 - 10668495
Alignment:
Q  229 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10668569 gatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 10668495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 21425214 - 21425331
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| || || ||||||||  |||  |    
T  21425214 aaagatatagagattaatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtggaatatgg 21425313  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  21425314 cttggttattgttgttgt 21425331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 303
Target Start/End: Original strand, 23492217 - 23492318
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||  ||||||| | | |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23492217 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgttgt 23492316  T
Q  302 tg 303  Q
    ||    
T  23492317 tg 23492318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 36042401 - 36042486
Alignment:
Q  222 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  36042401 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcggaccccaattaatgggaaaagatttggttgttgttgttgtcgt 36042486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Original strand, 14459049 - 14459177
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaa 271  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||   | |||||||||||||||||||  || |    
T  14459049 gagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccca 14459148  T
Q  272 cttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  14459149 ctttgtgggataagccttggttgttgttg 14459177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 304
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716107
Alignment:
Q  191 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca--acttagtgtgataatgct 288  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||    |||  |||||||| ||||| |||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcgtcaccaccacttagtgggataaggct 31716091  T
Q  289 tggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||    
T  31716092 tggttgttgttgttgt 31716107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 32043580 - 32043872
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| | || ||| | ||||||||||||||||| || |||   || |||||     
T  32043580 agagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtagaaactagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaagg 32043679  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||  |||||| ||||||  |   ||  | |  |||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||| || |  || ||| || || |||||||||    
T  32043680 agaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggggaagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagt 32043779  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||   | | ||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  32043780 tggagaaagacatggtttttgatagaacactatggc--cgtttgattcatgta-ctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 32043872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Original strand, 32276894 - 32276970
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32276894 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 32276970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32569783 - 32569707
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || | |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  32569783 tgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 32569707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 300
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143622
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || || ||||  || || |||||||||||||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgttgttg 36143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30812897 - 30812814
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||||    
T  30812897 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgttg 30812814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18474055 - 18473973
Alignment:
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  18474055 atatggtatttgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7531725 - 7531641
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7531725 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgttcttgt 7531641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 12611727 - 12611779
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12611727 tttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 12611779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 297
Target Start/End: Original strand, 26055651 - 26055699
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26055651 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 26055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 303
Target Start/End: Original strand, 35323993 - 35324057
Alignment:
Q  239 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35323993 tatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35324057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35362803 - 35362651
Alignment:
Q  148 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 247  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| |||| | |     
T  35362803 agaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagttggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgta 35362704  T
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||||||||| |||| | || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  35362703 atttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41444456 - 41444336
Alignment:
Q  184 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 283  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||  || | |||||| |||||||||| | || ||||| ||  |||    
T  41444456 agaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacattacaacgtaatttgaaccatgtagccaaacccacttaatggaata 41444357  T
Q  284 atgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  41444356 atgcttggtcgttgttgttgt 41444336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 303
Target Start/End: Original strand, 43733410 - 43733490
Alignment:
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  43733410 gttttggatagaacactatggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtggctgttgttg 43733490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 298
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699745
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    ||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2776513 - 2776434
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | | ||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  2776513 tgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagacccgtagat 2776434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10824274 - 10824187
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||| ||  | ||||  || || ||||||||||||||||||    
T  10824274 aaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgaccccgcctagtcggaaaaggcttggttgttgttgttg 10824187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 295
Target Start/End: Original strand, 16351578 - 16351653
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||  |||| ||||||||||    
T  16351578 atggtttttaatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagacgaccccacttagtggaataaggcttggttgt 16351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 60
Target Start/End: Original strand, 25985509 - 25985560
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 60  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25985509 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 25985560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 301
Target Start/End: Original strand, 26363655 - 26363768
Alignment:
Q  186 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 285  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |    | ||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||     
T  26363655 aaaatatttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataag 26363752  T
Q  286 gcttggttgttgttgt 301  Q
     |||||||||||||||    
T  26363753 acttggttgttgttgt 26363768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30198365 - 30198262
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| |||||||| | ||||   |  ||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30198365 aatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattatggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30198266  T
Q  302 tgtc 305  Q
    ||||    
T  30198265 tgtc 30198262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 304
Target Start/End: Original strand, 1064955 - 1065005
Alignment:
Q  254 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1064955 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 25985881 - 25985839
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25985881 ggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta 25985839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Original strand, 39702154 - 39702232
Alignment:
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| |  | |||||| |||||  |||||||||||    
T  39702154 tatggtttttgatagaacattatggtatcatttgatctatgtagccgaccacatttagtgggataaaacttggttgttg 39702232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 305
Target Start/End: Original strand, 41212064 - 41212149
Alignment:
Q  222 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta--gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 305  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||  ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41212064 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttgtc 41212149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2518493 - 2518400
Alignment:
Q  206 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  2518493 agtttgatcgaaatatgatttctgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagtaagataaggtttggttgttgtt 2518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 9695631 - 9695708
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  9695631 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagtcctgtagat 9695708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 304
Target Start/End: Original strand, 16921451 - 16921504
Alignment:
Q  251 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16921451 tgatccatgtagccgaccgtacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 16921504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35647003 - 35646930
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  35647003 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtgtaacaaggcttggttgttgttgt 35646930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 126
Target Start/End: Original strand, 36143367 - 36143472
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 120  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||| ||||||  ||||| | || ||| | |||| |||||||    
T  36143367 ggtagcacctatagcagaatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaa 36143466  T
Q  121 atggag 126  Q
    ||||||    
T  36143467 atggag 36143472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38901900 - 38901815
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||| || || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38901900 atggtttttgatataacactatggcggcatttgattcatgtagcggaccccatatagtgggataaggcttgattgttgttgttgtc 38901815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Original strand, 7103274 - 7103326
Alignment:
Q  23 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacat 75  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  7103274 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactaggcttaggtgttttagacat 7103326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 304
Target Start/End: Original strand, 32978115 - 32978159
Alignment:
Q  260 tagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32978115 tagccgacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32978159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 299
Target Start/End: Original strand, 16917352 - 16917462
Alignment:
Q  188 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 287  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| | |||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||  || |||||||| |||||  |    
T  16917352 aagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacatt-tgactgcttttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataagac 16917450  T
Q  288 ttggttgttgtt 299  Q
    |||||| |||||    
T  16917451 ttggttattgtt 16917462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Original strand, 25439479 - 25439530
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 224  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  25439479 gagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatggt 25439530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38392046 - 38391919
Alignment:
Q  148 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 247  Q
    ||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||  |||||| || || | |||||||  |||| ||||||||| | |||||||| | |||| | |     
T  38392046 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgta 38391947  T
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaactta 275  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  38391946 atttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39651081 - 39651026
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39651081 atttgatccatatacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 39651026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 298
Target Start/End: Original strand, 1313773 - 1313843
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    |||||||||| |||| | | |||| ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1313773 tgatagaacattatggcgtaattttatccatgtagttgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 1313843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11130004 - 11129951
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  11130004 tttgatccatgtagccta-ccaacttaatgagataatacttggttgttgttgttg 11129951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12966428 - 12966347
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgat--agaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    |||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||| ||||  ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12966428 aaagatttagagattaatgagttgaattcaaatatggtttatgatagagagcattatgacataatttgatccatatagccga 12966347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 13986494 - 13986536
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  13986494 ggggtagcacctatagtacaaaatatggtagaaaatagactta 13986536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Original strand, 14903744 - 14903846
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||  | || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  14903744 aatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagcttaccccacttagtggggaaaaacttggttgttgttgt 14903843  T
Q  302 tgt 304  Q
    |||    
T  14903844 tgt 14903846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16035822 - 16035744
Alignment:
Q  206 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 284  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  16035822 agttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggataa 16035744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 300
Target Start/End: Original strand, 36069774 - 36069883
Alignment:
Q  191 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 290  Q
    |||||||| | |||||||| | |  ||||||||||| |||||||||| || | | | ||||||||||| ||||| | || ||||| ||  ||||||||||    
T  36069774 atttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacccacttactggaataatgcttg 36069873  T
Q  291 gttgttgttg 300  Q
     |||||||||    
T  36069874 attgttgttg 36069883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 41444608 - 41444547
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtaga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || ||| ||||||||||    
T  41444608 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4558259 - 4558207
Alignment:
Q  250 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4558259 ttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 4558207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 4955345 - 4955473
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||  | |||||||| |||  ||||||| ||| | ||| |||| || ||| | |||||||  |||||| |||||  ||    
T  4955345 gagaaactattaaaaaagacttagaaattaatgagtttgatttaaatatgatttataataaaacattacgacgtaatttgatttatgtagtcgatctcac 4955444  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  4955445 ttagtgagataaggtttggttgttgttgt 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Original strand, 12985919 - 12985975
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  12985919 atttgatccatgaagccgagcccatttagcgggataaggcttggttgttgttgttgt 12985975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16971824 - 16971772
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||    
T  16971824 tttgatccatgtagccgacccaatttagtgggattaggcttcgttgttgttgt 16971772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30456377 - 30456329
Alignment:
Q  218 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||    
T  30456377 atattgtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccga 30456329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 30456488 - 30456452
Alignment:
Q  25 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30456488 gcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactta 30456452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30783201 - 30783077
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||   |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| |||| |||    
T  30783201 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataaaacattat 30783102  T
Q  242 gacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||    
T  30783101 gaggtagtttgatccatgtagccga 30783077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35085186 - 35085134
Alignment:
Q  252 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | || ||||||||||||||    
T  35085186 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataagggttagttgttgttgttgt 35085134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 40982949 - 40982893
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40982949 atttgatccatgttgccgaccccatttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 40982893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42493514 - 42493426
Alignment:
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 305  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| | || | |||||  || || |||||||||||| |||||||    
T  42493514 aatatggtatttaatagaaaactatggcatcgtttgatctatgtagccaaccccatttagtaggacaaggcttggttgttggtgttgtc 42493426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44681319 - 44681251
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||| | ||| || || |||||||||||||    
T  44681319 ggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataagcttagaaggtttggaaatctagagagaagacc 44681251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45512654 - 45512558
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa-tatggtttttgatagaaca 237  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45512654 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaaatatggtttatgatagaaca 45512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 45512777 - 45512709
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||||| ||| | ||| || ||||||||    
T  45512777 ggggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaaga 45512709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5258440 - 5258145
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5258440 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaaga 5258341  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5258340 agagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagagaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagc 5258241  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  5258240 tagatccaaatatggtttttgattaaacactatggcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgttgt 5258145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 28085366 - 28085661
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||    
T  28085366 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaaga 28085465  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28085466 agagtagatcaaatggagtagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 28085565  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28085566 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28085661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 298
Target Start/End: Original strand, 30031254 - 30031535
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
T  30031254 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtaga 30031353  T
Q  117 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 216  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |    
T  30031354 tcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattta 30031453  T
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30031454 aatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 32755911 - 32756206
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||||  |||  |||||    
T  32755911 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataaga 32756010  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32756011 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 32756110  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||| ||||||||||||    
T  32756111 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgttgt 32756206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21352129 - 21351872
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| |||    
T  21352129 agagagagtggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttaga 21352030  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21352029 agaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 21351930  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  21351929 tggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagccga 21351872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35043722 - 35043441
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 119  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  35043722 gggtagtacctaaagtagaaaagttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatca 35043623  T
Q  120 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 219  Q
    ||||||  |||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35043622 aatggacgagagtcaggttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaat 35043523  T
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  35043522 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcaatgtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgttgt 35043441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Original strand, 608147 - 608442
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  608147 agagagagtgagggtatcacctatagtagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaaga 608246  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaa----gaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaat 204  Q
    ||||  |||||||||||| |||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  608247 agagtggatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggttgatgaagacctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaat 608346  T
Q  205 gagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  608347 gagttggatccaaatatggtttttgatagaatactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 261
Target Start/End: Original strand, 5631812 - 5632064
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  5631812 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaaga 5631911  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    | || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||  | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5631912 atagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagagacaaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 5632011  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 261  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5632012 tggatccaaatatggtttttgatataacactatgacgtcatttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 9706766 - 9707052
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||      ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  9706766 agagagagtggaggtagcacctattgtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt------gtagagagaagacccatagaagccgttgttaga 9706859  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||| || ||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  9706860 agagtagatcaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtacgggaagggctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagt 9706959  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9706960 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9707052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20427928 - 20427633
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20427928 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 20427829  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| | ||||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20427828 agagtaaatcaaatagaggggagtcaggttacaagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaa-atttagaggttaatgagt 20427730  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg-cttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  20427729 tggatccaaatatggtttttaatagaatactatggcgacatttaatcaatgtagccgacccgacttagtgggataaagacttggttgttgttgttgt 20427633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 12890575 - 12890860
Alignment:
Q  10 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||         ||| ||||| |||| |||||||    
T  12890575 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgta---------cccatagatgccgtcgtaagaa 12890665  T
Q  110 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 209  Q
    ||| |||||| |||||| |||   |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12890666 gagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagacgtcaatgagtt 12890765  T
Q  210 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12890766 agatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12890860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Original strand, 14030805 - 14031080
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||| |||    
T  14030805 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtaga 14030904  T
Q  117 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 216  Q
    |||||| | | |||  | | |||||||||||||||||||| ||||||            ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14030905 tcaaatagtggagagtcggattaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaacattagaaaagatttagaggtcaatgggttagatcca 14030992  T
Q  217 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||| || | |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14030993 aatatgatttttgatagaatactataacgtcatttgatccatataaccgaccctatttagtgggataaagtttggttgttgttgttgt 14031080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 303
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679680
Alignment:
Q  30 tatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  130 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 229  Q
    |  || |||| |||||||| ||||||          || ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| |||||||||  ||| | ||    
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaag----------actattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  230 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgttgttg 30679680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10100151 - 10099993
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10100151 agagagagtgggggtcgcacatatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaaga 10100052  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 167  Q
    |||| |||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10100051 agagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 10099993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143762
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  242 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgt 34143762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156378
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  242 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgt 34156378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |  | || |||||||||||||||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  120 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 219  Q
    |||| || ||   || ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33497062 aatgaaggagt--caagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 258  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||  | | |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206456
Alignment:
Q  182 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  282 taatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||  ||||||| ||||||||||    
T  3206478 taagacttggttattgttgttgt 3206456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9593988 - 9593709
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| |||||    
T  9593988 ggggtagcaccattagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatc 9593889  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    | |||||| |||  ||  |   |||||||||||||||| |||  ||||  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||    
T  9593888 agatggaggagagtcaaat--caagaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaa 9593791  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||| |||| || |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  9593790 tatggtttatgatagaacattatg--gtaatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgttgtt 9593709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 304
Target Start/End: Original strand, 31819004 - 31819116
Alignment:
Q  192 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  31819004 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgg 31819103  T
Q  292 ttgttgttgttgt 304  Q
    |||| ||||||||    
T  31819104 ttgtggttgttgt 31819116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34934941 - 34934830
Alignment:
Q  190 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 289  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  34934941 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 34934842  T
Q  290 ggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||    
T  34934841 ggttgttgttgt 34934830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Original strand, 5080905 - 5081083
Alignment:
Q  84 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 183  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||| |||  |  |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||    
T  5080905 aagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcatt 5081004  T
Q  184 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 262  Q
      |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5081005 caaaattatttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 196
Target Start/End: Original strand, 7133800 - 7133923
Alignment:
Q  73 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 172  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||     
T  7133800 catgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatta 7133899  T
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttag 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7133900 gagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 196
Target Start/End: Original strand, 7136723 - 7136846
Alignment:
Q  73 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 172  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||     
T  7136723 catgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatta 7136822  T
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttag 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7136823 gagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 301
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689915
Alignment:
Q  25 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 124  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| || |    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  125 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 224  Q
    || |||  || || |||||||||      ||| |||  ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||| ||||||| ||    
T  2689746 agtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcagcgaattggatgcaaatattgt 2689839  T
Q  225 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    || | |||||| |||||||| | ||||||| ||| ||  ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2689840 ttat-atagaatactatgacgtaatttgattcatataatcgaccttacttagtatgataatgtttggttgttgttgt 2689915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 301
Target Start/End: Original strand, 5095956 - 5096116
Alignment:
Q  141 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 240  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |   |||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  5095956 aagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacatta 5096055  T
Q  241 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    || | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  5096056 tggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 5096116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30789155 - 30789071
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  30789155 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 30789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28027108 - 28026896
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||| || ||| |||||| | || ||| |||||| | |||    
T  28027108 ggggtagcacctatagtagaaaatgtggtagaaaataggcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatc 28027010  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    | |||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||  || |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||  || ||||    
T  28027009 agatggaggagagtcagattagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaa 28026910  T
Q  219 tatggtttttgata 232  Q
    |||||||| |||||    
T  28026909 tatggtttatgata 28026896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10099022 - 10098893
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||| || ||    
T  10099022 gagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccccac 10098925  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  10098924 ttagtgggataagacttgattgttgttgttgt 10098893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34502
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  242 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | | | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 34502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4245957 - 4245869
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4245957 aaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgttgt 4245869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 303
Target Start/End: Original strand, 5897619 - 5897741
Alignment:
Q  181 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 280  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||| |||| ||||||||| | || ||||| | |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  5897619 attagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtggg 5897718  T
Q  281 ataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  5897719 ataaggcttgattgttgttgttg 5897741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 31818685 - 31818813
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| ||| | |||||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||    
T  31818685 gagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagtatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 31818784  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||| | || || ||||||||||||||||    
T  31818785 ttagcgggaaaaagcttggttgttgttgt 31818813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Original strand, 24665965 - 24666058
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||    
T  24665965 gagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccga 24666058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6055933 - 6055806
Alignment:
Q  139 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 238  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||     
T  6055933 aaaaaaggtagaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacat 6055834  T
Q  239 tatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    || ||| | ||||||| |||||||||||    
T  6055833 tacgacgtaatttgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 299
Target Start/End: Original strand, 7492550 - 7492669
Alignment:
Q  180 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 279  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||  | | |||||  ||| |||||||| || ||||||||     
T  7492550 cattaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtgg 7492649  T
Q  280 gataatgcttggttgttgtt 299  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  7492650 gataaggattggttgttgtt 7492669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12119729 - 12119642
Alignment:
Q  215 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12119729 caaatatgatttttaatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 12119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1615296 - 1615223
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  1615296 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgt 1615223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24665887
Alignment:
Q  27 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 96  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagat 24665887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Original strand, 579615 - 579703
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||| |||  ||| | |||| | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  579615 aaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 579703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Original strand, 33084048 - 33084128
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  33084048 agagagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagacc 33084128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12133973 - 12133901
Alignment:
Q  230 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12133973 atagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgttgtt 12133901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9109582 - 9109507
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9109582 tgatagaatactatgaagtagtttgatccatgtagccgaccccagttagtgagataatgcttagttgttgttgttg 9109507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6293491 - 6293389
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||||||| || |||| || | |||| || |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  6293491 aatgagttagatagaaatatggtatatgatagagcattatggcaacgtttggtcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgcggttgt 6293392  T
Q  302 tgt 304  Q
    |||    
T  6293391 tgt 6293389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14389275 - 14389202
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 260  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | | | |||||||||||||    
T  14389275 aaagatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 298
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886383
Alignment:
Q  229 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataaggcttagttgttgt 21886383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Original strand, 33730194 - 33730247
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33730194 atttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33730247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Original strand, 38976 - 39056
Alignment:
Q  224 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||||  | ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  38976 tttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgagtccactaagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 39056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 302
Target Start/End: Original strand, 8364679 - 8364839
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||  | ||| |||| ||   ||| ||||||| |||||||||| |||    
T  8364679 agaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattat 8364778  T
Q  242 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || || ||||  |||||||||||    
T  8364779 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaggctttattgttgttgtt 8364839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 2079341 - 2079408
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 87  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||  || |||||  ||||||||||||||    
T  2079341 gggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaaga 2079408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 52
Target Start/End: Original strand, 5080853 - 5080888
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 52  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5080853 tgggggtatcacctatagtagaaaagttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6906878 - 6906819
Alignment:
Q  250 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtct 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||||||||| |||||||    
T  6906878 ttgatccatgtagccgacccaacttagtgcgataagactttgatgttgttgtcgtcgtct 6906819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 298
Target Start/End: Original strand, 21089606 - 21089676
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21089606 tgatagaacattatggcattgtttgatccatgtagctgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 21089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3127306 - 3127273
Alignment:
Q  271 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3127306 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 3127273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4878327 - 4878294
Alignment:
Q  271 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4878327 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 4878294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6641691 - 6641650
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 60  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6641691 ggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 6641650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Original strand, 8364575 - 8364635
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagaga 82  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||    
T  8364575 gtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 304
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568983
Alignment:
Q  204 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||| | | ||||||||||| ||||| | || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagcc-aacccacttaatgggatagagcttgtttgttgttgttg 9568982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14389447 - 14389380
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||  | |||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  14389447 ggtagcacctatcgtagaaaagatggtggaaacaa-acttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 14389380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Original strand, 30642998 - 30643054
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| | | ||| |||||||||||||||||||    
T  30642998 atttgatctatgtagccgaccccacttagcgggttaaggcttggttgttgttgttgt 30643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 104)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 294
Target Start/End: Original strand, 38684957 - 38685242
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38684957 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaaga 38685056  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38685057 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 38685156  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 294  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  38685157 tggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 38685242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 3301834 - 3302126
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3301834 agagagagtgagggtagcccctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 3301933  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3301934 agaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagt 3302033  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3302034 tggatccaaatatggtttttgatagaacactacggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3302126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 4496374 - 4496669
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4496374 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagctggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4496473  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4496474 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 4496573  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4496574 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 4496669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16347670 - 16347380
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  16347670 agagagagcgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaaga 16347571  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16347570 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatt 16347471  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  16347470 tggatacaaatatggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgt 16347380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12492679 - 12492381
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcaccta---tagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgta 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  12492679 agagagagtgggggtagcacctactatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgtta 12492580  T
Q  106 agaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12492579 agaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatg 12492480  T
Q  206 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12492479 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12492381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28977151 - 28976856
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  28977151 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaaga 28977052  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    || | ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28977051 agggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagt 28976952  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28976951 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28976856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1287871 - 1287578
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  1287871 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaaga 1287772  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1287771 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 1287672  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    | ||||||||| |||| | |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  1287671 tggatccaaatttggtgtatgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgatgtt 1287578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Original strand, 24178500 - 24178793
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24178500 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 24178599  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24178600 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagt 24178699  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    | ||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  24178700 tggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcatcatttgatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgtt 24178793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 14665704 - 14665997
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14665704 agagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaaga 14665803  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  14665804 agagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagt 14665903  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||  | | | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14665904 tggatccaaatatggtttatgatagaactct--ggcgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14665997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457054
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  122 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 221  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||| |    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  222 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    | | | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 304
Target Start/End: Original strand, 10639314 - 10639587
Alignment:
Q  29 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  10639314 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggagga 10639413  T
Q  129 gaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttttt 228  Q
    |   || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |    
T  10639414 gt--caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 10639511  T
Q  229 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10639512 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 10639587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2075766 - 2075475
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2075766 agagagagtgggggtaacacctacagtagaaaagttggtagacaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 2075667  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgag 207  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2075666 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgag 2075567  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    || ||||||||| |||| | |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2075566 ttggatccaaatttggtgtatgatagaatactatggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Original strand, 1275264 - 1275549
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||    
T  1275264 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatc 1275363  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    |||||||| |||  || ||||| || |||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||    
T  1275364 aaatggaggagagtcaagttaacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaa 1275463  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  1275464 tttggtgtttgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgttgttgttgt 1275549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561384
Alignment:
Q  108 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttg 13561384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 77 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915493
Alignment:
Q  77 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 176  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  177 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-ttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  277 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  2915520 tgggataaggcttggttattgttgttgt 2915493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 34273017 - 34273297
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||    
T  34273017 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaaga 34273116  T
Q  109 agagaaga-tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 207  Q
    |||| ||| ||||               ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34273117 agaggagagtcaa---------------gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgag 34273201  T
Q  208 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  34273202 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgttg 34273297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 304
Target Start/End: Original strand, 14911267 - 14911457
Alignment:
Q  114 agatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagat 213  Q
    |||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14911267 agatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggat 14911366  T
Q  214 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| | |||||||||||| ||||    
T  14911367 ccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgttcttgt 14911457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 304
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816667
Alignment:
Q  150 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 249  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  250 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29816667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26884979 - 26884686
Alignment:
Q  11 agagaatgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||| ||||   ||||||   || |||||||    
T  26884979 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaa 26884880  T
Q  110 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 209  Q
    ||| |||||| |||||| |||  | ||| ||||||||||||||| || ||| |||||| |   || |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||     
T  26884879 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggatgagctaggaaaactaa--gaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtc 26884782  T
Q  210 agatccaaa-tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  26884781 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgttgttgt 26884686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 163 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913882
Alignment:
Q  163 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 262  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtag 16913922  T
Q  263 ccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16913921 ccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16913882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 302
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558424
Alignment:
Q  192 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 291  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  292 ttgttgttgtt 302  Q
    |||| ||||||    
T  5558414 ttgtcgttgtt 5558424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 304
Target Start/End: Original strand, 2393038 - 2393161
Alignment:
Q  180 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  2393038 cattagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 2393137  T
Q  280 gataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  2393138 gataaagctt-gttgttgttgttgt 2393161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 254
Target Start/End: Original strand, 14749297 - 14749542
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||     
T  14749297 agagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggattctgttgtaagg 14749396  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    ||||  ||||| ||||||  ||  ||  | |  | ||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| || |  || ||| ||||| | || ||||    
T  14749397 agagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatcaagaaggatctagagattaacgagt 14749496  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 254  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14749497 tggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 304
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213860
Alignment:
Q  199 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttt 30213854  T
Q  299 tgttgt 304  Q
    ||||||    
T  30213855 tgttgt 30213860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 28002 - 28165
Alignment:
Q  139 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 238  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28002 aaaagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacac 28101  T
Q  239 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| || || | |||||  |||||  ||||||| ||||||||    
T  28102 tatggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgtt 28165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38501660 - 38501422
Alignment:
Q  59 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 158  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| | |||||| |||  | | | ||||||| | || ||||| |    
T  38501660 ttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatggatgaagacc 38501561  T
Q  159 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 258  Q
    || || ||| ||   |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||    | || ||||| ||    
T  38501560 taggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaatatgatcgat 38501461  T
Q  259 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 297  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  38501460 gtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 261
Target Start/End: Original strand, 36215489 - 36215730
Alignment:
Q  10 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 109  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| | || ||||| |||| || |||| ||  ||||| |||||    
T  36215489 gagagagtggaggtagcatctatagtagaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaa 36215588  T
Q  110 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 209  Q
    ||| |||||  |||||| |||  ||||| |||||||||||||          |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  36215589 gagtagatcggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag----------gaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaatt 36215678  T
Q  210 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 261  Q
      ||||||| |||  || ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  36215679 gaatccaaacatgacttatgatagaacactatgatgtgatttgattcatgta 36215730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Original strand, 28276392 - 28276523
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||   | ||||||||||||||||| |  | ||    
T  28276392 gagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactccac 28276491  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  28276492 ttagcgggataaggcttggttgttgttgttgt 28276523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 302
Target Start/End: Original strand, 18855799 - 18855890
Alignment:
Q  211 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18855799 gatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 18855890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 304
Target Start/End: Original strand, 39040918 - 39041041
Alignment:
Q  181 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  39040918 attagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggg 39041017  T
Q  281 ataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||  |||| ||||||| |||||    
T  39041018 ataagacttgattgttgtagttgt 39041041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 418153 - 418031
Alignment:
Q  182 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 281  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  418153 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtggga 418054  T
Q  282 taatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||  |||||  ||||||||||||    
T  418053 tatggcttgaatgttgttgttgt 418031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442123
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataa-gcttggttattgttgt 32442126  T
Q  302 tgt 304  Q
    |||    
T  32442125 tgt 32442123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 31636202 - 31636129
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgt 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  31636202 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgt 31636129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 32516546 - 32516806
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | || ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||| |||| ||| || ||  |||||| | || ||| |     
T  32516546 agagagagttggagtaacacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatgg 32516645  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||  ||| || | || ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||||  |||||||||| | ||  |||    
T  32516646 agagtagatcggatgaaggataatcagattacaagaggtagaggaagacctaa-aaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagt 32516744  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca 270  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||| || || ||||||||    
T  32516745 tggattcaaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatcgatataaccgatcca 32516806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 33667216 - 33667286
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  33667216 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 33667286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43557947 - 43557833
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||||| ||| | | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  43557947 aaagatttggagattattgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagg 43557848  T
Q  287 cttggttgttgttgt 301  Q
    | |||||||||||||    
T  43557847 cctggttgttgttgt 43557833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408492
Alignment:
Q  230 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 408492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 14667939 - 14668056
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||      
T  14667939 aaagatctagagattaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaga 14668038  T
Q  287 cttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14668039 cttggttgtagttgttgt 14668056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 289
Target Start/End: Original strand, 9235201 - 9235316
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9235201 gagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccga-cccac 9235299  T
Q  273 ttagtgtgataatgctt 289  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  9235300 ttagtgggataaggctt 9235316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3442952 - 3442873
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  3442952 atggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 3442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 303
Target Start/End: Original strand, 11675683 - 11675814
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcc-aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 271  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| |||   ||||||||||| |||||||||| |||| | |  ||| |||||||||||||| || |    
T  11675683 gagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgtagtttaatccatgtagccgacccca 11675782  T
Q  272 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  11675783 cttagttggataaggcttggttgttgttgttg 11675814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 301
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220664
Alignment:
Q  182 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 281  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||| || ||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgatag-atattatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  282 taatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  31220645 taaggtttggttgttgttgt 31220664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640510
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataaggctcggttgttgt 7640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Original strand, 20367076 - 20367178
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||| | ||||||||||| ||||| | || |||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  20367076 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccacttggtaggataaggcttggttgttgttgt 20367175  T
Q  302 tgt 304  Q
    |||    
T  20367176 tgt 20367178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Original strand, 79503 - 79620
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | | |||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| | || |||||     
T  79503 agagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaagg 79602  T
Q  109 agagaagatcaaatggag 126  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  79603 agagtcgatcaaatggag 79620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 302
Target Start/End: Original strand, 2090575 - 2090696
Alignment:
Q  181 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 280  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | | |||||||||||||| |||| || | | |||| |    
T  2090575 attaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccattgagtggg 2090674  T
Q  281 ataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  2090675 ataaggctttgttgttgttgtt 2090696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 302
Target Start/End: Original strand, 36551320 - 36551429
Alignment:
Q  193 ttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggt 292  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |  |||| || || |  || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  36551320 ttagagattaatgagttgcatccaaatatggtttgtattagatcattacggtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggt 36551419  T
Q  293 tgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||    
T  36551420 tgttgttgtt 36551429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42504358 - 42504293
Alignment:
Q  190 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 255  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  42504358 gatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatc 42504293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 301
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525923
Alignment:
Q  26 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 125  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||  || | |  || || |||| |||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  126 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 225  Q
    | |||  ||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| |   ||||||| ||||| || |||  |||| | |||||||| ||   | | ||||||    
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtt 1525850  T
Q  226 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1525851 tttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga-cca--ttagtgagataaggcttggttgttgttgt 1525923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Original strand, 6859578 - 6859666
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  6859578 aaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagtgggataaggcttggtagttgttgttgt 6859666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 302
Target Start/End: Original strand, 7678601 - 7678760
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||   |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| |||| |||    
T  7678601 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata-aacattat 7678699  T
Q  242 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||  |  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  7678700 gaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 7678760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411961
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28411961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Original strand, 42199277 - 42199394
Alignment:
Q  8 cagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 107  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | || |||||    
T  42199277 cagagagaattggggtagcactta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgtagtaag 42199374  T
Q  108 aagagaagatcaaatggaga 127  Q
     |||| |||||| |||||||    
T  42199375 gagagtagatcacatggaga 42199394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Original strand, 42576239 - 42576295
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42576239 atttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 42576295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 296
Target Start/End: Original strand, 2713146 - 2713213
Alignment:
Q  229 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 296  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  2713146 gatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccacttagtgggataaggcttggttgtt 2713213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8082059 - 8081967
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8082059 aatgagttagatccgaatatggttta----agaacattatgacatgatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttg 8081967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11002499 - 11002424
Alignment:
Q  223 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11002499 gtttttgatagaacactatggcattgtttgattcatgtagtcgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgt 11002424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 2645187 - 2645273
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2645187 aaatgtggtatttgataaaacattatagcatcgtttgatccatgtagccggccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 2645273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 10083030 - 10082952
Alignment:
Q  10 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  10083030 gagagcattggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagac 10082952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Original strand, 15168791 - 15168869
Alignment:
Q  18 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||||    
T  15168791 gggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctaaggtggtttggacatgttgagaaatgacctgtagat 15168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 302
Target Start/End: Original strand, 38132545 - 38132619
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38132545 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 38132619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9121155 - 9121078
Alignment:
Q  224 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  9121155 tttttgacagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgtcgttgt 9121078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Original strand, 14667753 - 14667806
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 62  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14667753 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttag 14667806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676665
Alignment:
Q  20 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacc 28676665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 30588615 - 30588712
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 284  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  30588615 aaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttataatagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21193737 - 21193649
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  21193737 aaatatggtttatgatagatcattatgacataatttgattcatgtatccgaccccacgtagtggaataaggcttggttattgttgttgt 21193649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  23 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 87  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 303
Target Start/End: Original strand, 5860035 - 5860118
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||||| ||||||| || |||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  5860035 atggtttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 5860118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7359539 - 7359259
Alignment:
Q  21 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 120  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||| || ||| | |||||||||||||||   |||||| | || ||||| |||| ||||||     
T  7359539 ggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcag 7359441  T
Q  121 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt-agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 219  Q
    |||||| | |  ||  | |  ||||| |||||||   |||  ||||||||  ||||||| ||| |||||| || ||||| | ||| |||| |||| ||||    
T  7359440 atggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactatttagaaaa-atctagagattaataagttggatcgaaat 7359342  T
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||  |||| |||| |||||| | |||||||||||||||| || || |||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  7359341 atggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttg 7359259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Original strand, 32366187 - 32366262
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32366187 tgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32366262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 239
Target Start/End: Original strand, 2552936 - 2553002
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 239  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  2552936 gagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 2712944 - 2713014
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  2712944 ggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 2713014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 301
Target Start/End: Original strand, 9234106 - 9234168
Alignment:
Q  239 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  9234106 tatgacataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9234168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17340550 - 17340500
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 237  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17340550 aaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 18351190 - 18351112
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagaca-tgtagagagaagacccgtagat 96  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||| | || ||||||||||||||| ||||||    
T  18351190 ggggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagat 18351112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 304
Target Start/End: Original strand, 14725675 - 14725803
Alignment:
Q  176 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca-actt 274  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| |||| ||| || | ||||| ||||    
T  14725675 aaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatcgaacaatacgacataattcgatctatgcagtc-atccacactt 14725773  T
Q  275 agtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | | ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14725774 aatatgataagactttgttgttgttgttgt 14725803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 307
Target Start/End: Original strand, 23980127 - 23980232
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||  |||||||||  | | || |||||||| ||||||  ||| || |||||||    
T  23980127 aatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgacatatttcaatccatgtaatcaaccccacttagtgggataatatttgatttttgttgt 23980226  T
Q  302 tgtcgt 307  Q
    ||||||    
T  23980227 tgtcgt 23980232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Original strand, 27386569 - 27386622
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  27386569 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgt 27386622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 304
Target Start/End: Original strand, 27800036 - 27800113
Alignment:
Q  227 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27800036 ttgatagaacattatggtataatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtttttgt 27800113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 302
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272760
Alignment:
Q  229 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctaagttgttgttgtt 42272760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18351001 - 18350937
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 266  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  18351001 aatgagttggatagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccga 18350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Original strand, 21952364 - 21952424
Alignment:
Q  26 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaag 86  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  21952364 cacctatagtagaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaag 21952424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41200419 - 41200343
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || | | ||||||||||||    
T  41200419 tgatagaacgttatggcatcatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataaggccttgctgttgttgttgt 41200343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Original strand, 9400708 - 9400795
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||| || | |||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  9400708 aaatttggtttatgatataatactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccatttagtgggattaggcttggttattgttgttg 9400795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 296
Target Start/End: Original strand, 28985285 - 28985360
Alignment:
Q  221 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 296  Q
    |||||| |||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  28985285 tggtttgtgatagaacattatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 28985360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 302
Target Start/End: Original strand, 38684648 - 38684763
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||| ||||| | ||| |||| |||  |||||||||  ||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||  || || ||||||||  |||| |    
T  38684648 aaagatctagagattaattagttggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtagttgaccccacttagtggaataaag 38684747  T
Q  287 cttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||||||||    
T  38684748 cttggttgttgttgtt 38684763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 277
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808180
Alignment:
Q  202 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 277  Q
    |||||||| |||  ||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatctgacttagt 41808180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Original strand, 41894229 - 41894358
Alignment:
Q  182 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt-------ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactt 274  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||       || ||||| |||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||||    
T  41894229 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgaattatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccactt 41894328  T
Q  275 agtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  41894329 agtgggataagactttgttgttgttgttgt 41894358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 263
Target Start/End: Original strand, 6889147 - 6889237
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 263  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| |  | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||    
T  6889147 gagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Original strand, 3000968 - 3001021
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||  |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3000968 atttgatggatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3001021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 304
Target Start/End: Original strand, 4653476 - 4653537
Alignment:
Q  243 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4653476 acataatttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgttgt 4653537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 302
Target Start/End: Original strand, 5303681 - 5303730
Alignment:
Q  253 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  5303681 atccatgtagccgatcccacttagtgggataagtcctggttgttgttgtt 5303730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Original strand, 6888993 - 6889062
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 88  Q
    |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  6888993 ggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttggacatgtagagagaagac 6889062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9917530 - 9917458
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||   |||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  9917530 tgatagaacagtataacatcgtttga---atgtagccgaccccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 9917458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12576974 - 12576861
Alignment:
Q  187 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 286  Q
    |||||| ||||| | ||||||||  ||  ||||||||| | ||||||| || ||||   |||||| || ||||||||||| || | |||||| ||||| |    
T  12576974 aaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattatggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaag 12576875  T
Q  287 cttggttgttgttg 300  Q
    ||||||||||||||    
T  12576874 cttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28186855 - 28186782
Alignment:
Q  228 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  28186855 tgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccgaccctactcaatgggataaggcttggttgttgttgt 28186782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 36200886 - 36200935
Alignment:
Q  176 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 225  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36200886 aaactattataaaagatatagaggttaatgagttggatccaaatatggtt 36200935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7367220 - 7367172
Alignment:
Q  253 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7367220 atccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttattgt 7367172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15588503 - 15588399
Alignment:
Q  188 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 287  Q
    |||||||||||   |||||||| |||  ||| ||||| | ||| |||||| |||| | || ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  15588503 aagatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatggcgtcgtttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggc 15588404  T
Q  288 ttggt 292  Q
    |||||    
T  15588403 ttggt 15588399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36123234 - 36123178
Alignment:
Q  249 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 305  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  36123234 tttgatccatgtaatcggtcccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgtc 36123178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 303
Target Start/End: Original strand, 37065677 - 37065761
Alignment:
Q  220 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || ||| ||||||||||    
T  37065677 atggtttttgatagagcactatgaagtcgtttgattcatgtagccgaccccagcttagtgggataagactaggtcgttgttgttg 37065761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39322132 - 39322096
Alignment:
Q  248 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 284  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  39322132 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 39322096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 242
Target Start/End: Original strand, 43035104 - 43035204
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||  |  ||||||| || | ||||||||| | |||||||||| |||    
T  43035104 agaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgagaaactattaggaaaaatttggaaatttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattat 43035203  T
Q  242 g 242  Q
    |    
T  43035204 g 43035204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475347
Alignment:
Q  22 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||| |  ||  |||||||||||| ||||||   || ||||| |||| |||||| |    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  122 tggag 126  Q
    |||||    
T  43475343 tggag 43475347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1240 - 945
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1240 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 1141  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1140 agagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagt 1041  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1040 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 31458 - 31753
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  31458 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaaga 31557  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31558 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 31657  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | ||||||||| |||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31658 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactgtgaagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44150 - 44080
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  44150 ggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 44080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 82711 - 83000
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | || ||||||    
T  82711 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaaga 82810  T
Q  109 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 208  Q
    || | | ||||||||||| |||    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  82811 agggtatatcaaatggaggagagt--ggttaagagaggtagaggaagacctaggaaaactata-gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 82907  T
Q  209 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  82908 tggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgt 83000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Original strand, 16692 - 16860
Alignment:
Q  133 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16692 caggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 16791  T
Q  233 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 301  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16792 gaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 86877 - 86606
Alignment:
Q  33 agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaac 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||      
T  86877 agtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagt 86778  T
Q  133 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 232  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||| |   ||| |||||||||||| | | |||||    
T  86777 caggttaaaagaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgata 86678  T
Q  233 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||   |||| |||||||||||||    
T  86677 gaacactatgacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggatacgacttgtttgttgttgttgt 86606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 304
Target Start/End: Original strand, 4706 - 4921
Alignment:
Q  89 ccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaa 188  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||   || |||||||||||||| ||||   || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  4706 ccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaa 4805  T
Q  189 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 288  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||| |||    
T  4806 ggatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacgct 4905  T
Q  289 tggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||||||||||    
T  4906 tggttgttgttgttgt 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4553 - 4277
Alignment:
Q  19 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| | |||||||| ||||||| ||||||  | || |||||||||| |||||    
T  4553 ggggtggcacctatagtagaaaagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatc 4454  T
Q  119 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 218  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||| |||||          ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  4453 aaatggaggagaatcaagttaaaagaggtataggaa----------aactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaa 4364  T
Q  219 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  || | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  4363 tttggtttataatagaacactatgacgttatttgatccatgtaggcgacccccatttaatgggataaggcttggttcttgttgttgt 4277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25529
Alignment:
Q  147 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 246  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  247 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 25737 - 25683
Alignment:
Q  9 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttaga 63  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25737 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11546
Alignment:
Q  61 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 160  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||  || |||| |||||||||| ||| | |||    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  161 agaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 260  Q
     |||||| ||| |||||| | |||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttgg--tttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  261 agccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    |||||| || |||||||  ||||| | ||||||| |||||||||    
T  11589 agccgaccccacttagtaggataaggtttggttgctgttgttgt 11546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 11880 - 11810
Alignment:
Q  17 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  11880 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 302
Target Start/End: Original strand, 485 - 614
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  485 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 584  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  585 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Original strand, 14737 - 14868
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14737 gagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccac 14836  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
     ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  14837 gtagtgggataaatcttggttgttgttgttgt 14868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28886
Alignment:
Q  211 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58223
Alignment:
Q  142 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 241  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  |||||||  |||| ||| | || ||| |||||||||| || | | ||||||||| |||||||||| |||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattat 58286  T
Q  242 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||    
T  58285 gtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggcttcattattgttgttgt 58223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Original strand, 7580 - 7720
Alignment:
Q  159 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 258  Q
    ||||||||| ||  || |||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||   |||||||||||||| | | |||||||||||    
T  7580 taagaaaactataagataaactattagaaaagattcagaggtcatttagttggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccat 7679  T
Q  259 gtagccgatc-caacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    | |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7680 gcagcc-atctccacttagtgggataaagcttggttgttgtt 7720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1647 - 1519
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |   |||| |  ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || || ||    
T  1647 gagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgagttagatctga---tggtatgagatagaacattatgacgtaatttgatcaatgtagctgaccccac 1551  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  1550 ttattaagataaagcttggttgttgttgttgt 1519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 160452 - 160325
Alignment:
Q  173 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 272  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||  ||||||||| | || ||    
T  160452 gagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtagccaaccccac 160353  T
Q  273 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 300  Q
    |||||| || || |||||||||||||||    
T  160352 ttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16438
Alignment:
Q  213 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6771
Alignment:
Q  216 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 302  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  6857 aaatatggtatatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggctgttattgtt 6771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 304
Target Start/End: Original strand, 19149 - 19202
Alignment:
Q  251 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 304  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  19149 tgatccacgtagccgaccccacttagtgagataaagtttggttgttgttgttgt 19202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 237
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39537
Alignment:
Q  181 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 237  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39481 attaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaaca 39537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University