View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11374_low_20 (Length: 367)

Name: NF11374_low_20
Description: NF11374
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11374_low_20
NF11374_low_20
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (44-236)||(41334571-41334763)
chr5 (50-236)||(2614563-2614749)
chr5 (44-238)||(18033980-18034174)
chr5 (42-240)||(7617129-7617327)
chr5 (43-239)||(5256992-5257188)
chr5 (69-236)||(22512305-22512472)
chr5 (43-238)||(33801467-33801662)
chr5 (50-238)||(38470577-38470765)
chr5 (42-234)||(25914902-25915085)
chr5 (69-237)||(39122366-39122533)
chr5 (42-149)||(39122262-39122369)
chr5 (137-236)||(32473395-32473494)
chr5 (161-236)||(33855068-33855143)
chr5 (44-242)||(30622627-30622824)
chr5 (137-237)||(17208073-17208173)
chr5 (45-116)||(32473303-32473374)
chr5 (70-133)||(6679724-6679788)
chr5 (70-133)||(28177801-28177865)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (43-243)||(36743390-36743590)
chr8 (50-236)||(11582766-11582952)
chr8 (50-242)||(29705356-29705548)
chr8 (45-237)||(42197344-42197536)
chr8 (42-241)||(30660648-30660847)
chr8 (42-234)||(30912468-30912660)
chr8 (43-235)||(45397317-45397508)
chr8 (48-234)||(29800862-29801048)
chr8 (44-237)||(2546995-2547188)
chr8 (45-234)||(26125637-26125825)
chr8 (42-234)||(20148762-20148954)
chr8 (50-236)||(2165877-2166063)
chr8 (44-242)||(31384658-31384856)
chr8 (44-240)||(42295191-42295386)
chr8 (44-194)||(9241594-9241744)
chr8 (67-239)||(5754900-5755072)
chr8 (42-236)||(1375542-1375736)
chr8 (44-240)||(3743767-3743963)
chr8 (44-237)||(40528542-40528736)
chr8 (140-234)||(42699259-42699353)
chr8 (137-239)||(35181513-35181615)
chr8 (42-238)||(34304786-34304981)
chr8 (137-242)||(33629994-33630099)
chr8 (137-237)||(18066719-18066819)
chr8 (143-237)||(16603633-16603727)
chr8 (192-242)||(19386626-19386676)
chr8 (44-116)||(10678060-10678132)
chr8 (142-240)||(16358839-16358938)
chr8 (197-242)||(10678201-10678246)
chr8 (43-116)||(35181636-35181709)
chr8 (44-116)||(33629901-33629973)
chr8 (201-236)||(28977146-28977181)
chr8 (134-234)||(32328815-32328908)
chr8 (44-116)||(19386473-19386545)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (42-245)||(36150121-36150324)
chr3 (44-239)||(24688310-24688505)
chr3 (44-235)||(54237097-54237288)
chr3 (42-235)||(42394325-42394518)
chr3 (44-238)||(40808863-40809057)
chr3 (42-241)||(54246054-54246253)
chr3 (43-241)||(46941048-46941246)
chr3 (44-235)||(40480750-40480941)
chr3 (43-237)||(25413680-25413874)
chr3 (44-234)||(53581766-53581956)
chr3 (44-236)||(45126836-45127028)
chr3 (42-238)||(47190932-47191127)
chr3 (52-236)||(42100688-42100872)
chr3 (44-234)||(27748565-27748746)
chr3 (43-194)||(52629870-52630021)
chr3 (42-234)||(1078229-1078412)
chr3 (42-238)||(53273599-53273786)
chr3 (92-221)||(51249323-51249452)
chr3 (137-241)||(4190266-4190370)
chr3 (42-240)||(11064628-11064824)
chr3 (44-240)||(9434120-9434316)
chr3 (42-134)||(29556865-29556956)
chr3 (134-245)||(29558232-29558343)
chr3 (137-238)||(10457893-10457994)
chr3 (148-237)||(25996267-25996356)
chr3 (42-122)||(19148882-19148962)
chr3 (137-242)||(34791823-34791928)
chr3 (137-238)||(52627978-52628079)
chr3 (137-236)||(51757593-51757692)
chr3 (44-116)||(51757713-51757784)
chr3 (42-116)||(4190171-4190245)
chr3 (44-106)||(54429173-54429235)
chr3 (142-193)||(19148822-19148873)
chr3 (70-132)||(26141543-26141606)
chr3 (42-116)||(10457798-10457872)
chr3 (208-240)||(47532019-47532051)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (48-240)||(7292743-7292935)
chr6 (50-237)||(9698247-9698434)
chr6 (42-241)||(26669915-26670114)
chr6 (45-236)||(13743130-13743321)
chr6 (45-236)||(13748630-13748821)
chr6 (42-240)||(26466795-26466993)
chr6 (42-239)||(3213397-3213594)
chr6 (50-239)||(7367546-7367735)
chr6 (42-237)||(21279928-21280123)
chr6 (42-239)||(7273241-7273438)
chr6 (44-234)||(24203895-24204085)
chr6 (44-234)||(30735984-30736174)
chr6 (45-236)||(30014343-30014534)
chr6 (43-237)||(21293584-21293778)
chr6 (137-234)||(27441544-27441641)
chr6 (44-238)||(33242401-33242595)
chr6 (137-237)||(31109223-31109323)
chr6 (137-236)||(33253913-33254012)
chr6 (42-116)||(27441662-27441736)
chr6 (43-116)||(33254034-33254107)
chr6 (42-116)||(31109128-31109202)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (44-240)||(5489772-5489968)
chr1 (44-236)||(43570994-43571186)
chr1 (44-238)||(48498870-48499064)
chr1 (45-242)||(37814772-37814969)
chr1 (44-239)||(23989431-23989627)
chr1 (42-239)||(24769405-24769602)
chr1 (43-236)||(50448167-50448360)
chr1 (42-234)||(7447828-7448019)
chr1 (42-237)||(750211-750406)
chr1 (43-234)||(4401329-4401521)
chr1 (43-234)||(2497469-2497660)
chr1 (43-186)||(4888093-4888235)
chr1 (137-238)||(44112675-44112776)
chr1 (137-236)||(48119628-48119727)
chr1 (137-236)||(35003294-35003393)
chr1 (137-237)||(41065152-41065252)
chr1 (137-236)||(38335918-38336017)
chr1 (137-236)||(46168383-46168482)
chr1 (137-237)||(45427746-45427846)
chr1 (143-237)||(38113202-38113296)
chr1 (137-238)||(45639733-45639834)
chr1 (44-116)||(35000021-35000093)
chr1 (42-116)||(35003414-35003488)
chr1 (42-116)||(44112797-44112871)
chr1 (137-237)||(45705824-45705924)
chr1 (44-116)||(45705945-45706017)
chr1 (137-236)||(35000114-35000213)
chr1 (189-238)||(14427345-14427394)
chr1 (47-116)||(48119748-48119817)
chr1 (44-116)||(45639640-45639712)
chr1 (42-116)||(26585582-26585656)
chr1 (42-116)||(38113101-38113175)
chr1 (43-113)||(45427652-45427722)
chr1 (137-238)||(26585460-26585561)
chr1 (43-116)||(41065271-41065344)
chr1 (70-133)||(45044570-45044634)
chr1 (64-116)||(46168503-46168555)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (50-236)||(24000926-24001112)
chr7 (50-236)||(42538345-42538531)
chr7 (44-238)||(41861672-41861868)
chr7 (42-236)||(5810830-5811024)
chr7 (48-242)||(5015389-5015583)
chr7 (42-234)||(44326180-44326372)
chr7 (50-236)||(42972852-42973038)
chr7 (44-233)||(26898310-26898499)
chr7 (43-234)||(44416841-44417032)
chr7 (44-234)||(43343532-43343722)
chr7 (50-227)||(32029731-32029908)
chr7 (42-234)||(16180263-16180454)
chr7 (43-234)||(4638106-4638297)
chr7 (42-236)||(45326020-45326214)
chr7 (42-237)||(35069720-35069915)
chr7 (50-220)||(27393174-27393344)
chr7 (44-234)||(10573751-10573941)
chr7 (44-242)||(43317437-43317635)
chr7 (50-237)||(9216301-9216487)
chr7 (62-213)||(38160505-38160656)
chr7 (44-237)||(5194139-5194332)
chr7 (95-237)||(24280555-24280697)
chr7 (43-239)||(40236916-40237112)
chr7 (137-236)||(31513287-31513386)
chr7 (42-156)||(47279630-47279744)
chr7 (137-235)||(31408634-31408732)
chr7 (137-239)||(27535232-27535334)
chr7 (137-240)||(33384866-33384970)
chr7 (169-236)||(39998408-39998475)
chr7 (42-116)||(31408539-31408613)
chr7 (42-116)||(33384991-33385065)
chr7 (42-116)||(27535137-27535211)
chr7 (42-116)||(31513407-31513481)
chr7 (183-237)||(47279744-47279798)
chr7 (70-114)||(35522902-35522947)
chr7 (208-237)||(38160666-38160695)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (42-235)||(112656-112849)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (42-235)||(19047158-19047351)
chr2 (42-237)||(30838631-30838826)
chr2 (44-242)||(1750408-1750606)
chr2 (42-234)||(43490307-43490499)
chr2 (50-239)||(12302167-12302356)
chr2 (43-243)||(4764633-4764833)
chr2 (44-236)||(16096747-16096940)
chr2 (44-238)||(43335671-43335865)
chr2 (45-236)||(42849768-42849946)
chr2 (42-235)||(34817682-34817875)
chr2 (77-246)||(13780676-13780846)
chr2 (50-237)||(42026766-42026955)
chr2 (94-234)||(8896541-8896681)
chr2 (43-194)||(39149201-39149350)
chr2 (137-239)||(43114554-43114656)
chr2 (44-234)||(11825562-11825752)
chr2 (137-238)||(16803966-16804067)
chr2 (137-238)||(16843248-16843349)
chr2 (137-234)||(41281975-41282072)
chr2 (137-236)||(12415461-12415560)
chr2 (137-236)||(12427521-12427620)
chr2 (142-234)||(33229303-33229396)
chr2 (42-239)||(34895647-34895844)
chr2 (143-237)||(18491704-18491798)
chr2 (137-238)||(966835-966936)
chr2 (151-234)||(6518484-6518566)
chr2 (154-237)||(14285675-14285758)
chr2 (42-116)||(6518400-6518474)
chr2 (42-116)||(18491825-18491899)
chr2 (42-116)||(41281880-41281954)
chr2 (44-116)||(966742-966814)
chr2 (44-116)||(43114677-43114749)
chr2 (151-234)||(4299435-4299518)
chr2 (147-234)||(7070418-7070505)
chr2 (137-194)||(4451951-4452008)
chr2 (44-108)||(12415368-12415432)
chr2 (44-108)||(12427428-12427492)
chr2 (44-116)||(16804088-16804160)
chr2 (44-116)||(16843370-16843442)
chr2 (42-116)||(12531569-12531643)
chr2 (44-116)||(4299328-4299400)
chr2 (70-132)||(40613913-40613976)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (42-241)||(680-879)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (42-236)||(27550309-27550503)
chr4 (42-238)||(1771172-1771368)
chr4 (43-242)||(23035974-23036173)
chr4 (44-238)||(25051691-25051885)
chr4 (42-238)||(28982728-28982924)
chr4 (42-239)||(55966252-55966449)
chr4 (44-234)||(27893750-27893940)
chr4 (44-238)||(33703139-33703333)
chr4 (42-239)||(27864561-27864758)
chr4 (44-236)||(35017733-35017924)
chr4 (44-234)||(43514594-43514784)
chr4 (44-233)||(23204686-23204875)
chr4 (44-234)||(43949709-43949900)
chr4 (43-234)||(31680904-31681095)
chr4 (42-239)||(28988470-28988666)
chr4 (42-234)||(43735744-43735936)
chr4 (50-236)||(12496956-12497142)
chr4 (43-236)||(27316619-27316813)
chr4 (47-237)||(48463361-48463551)
chr4 (48-242)||(45490225-45490419)
chr4 (42-237)||(21687005-21687200)
chr4 (42-235)||(41878407-41878593)
chr4 (44-194)||(51512173-51512323)
chr4 (62-234)||(39631102-39631275)
chr4 (49-242)||(41847965-41848158)
chr4 (71-234)||(41327478-41327641)
chr4 (237-348)||(48187351-48187464)
chr4 (43-195)||(56215805-56215956)
chr4 (137-238)||(711958-712059)
chr4 (56-183)||(46412389-46412516)
chr4 (137-236)||(17619153-17619252)
chr4 (44-236)||(55272284-55272476)
chr4 (156-238)||(960890-960972)
chr4 (142-234)||(3756252-3756344)
chr4 (137-237)||(32728356-32728456)
chr4 (148-240)||(35037001-35037093)
chr4 (137-237)||(48435580-48435680)
chr4 (43-116)||(19880074-19880147)
chr4 (151-239)||(46827721-46827809)
chr4 (45-116)||(35037125-35037195)
chr4 (42-116)||(17619058-17619132)
chr4 (48-116)||(712080-712148)
chr4 (44-116)||(48435487-48435559)
chr4 (42-116)||(46827612-46827686)
chr4 (156-237)||(49229684-49229765)
chr4 (42-82)||(32728511-32728551)
chr4 (197-236)||(36004165-36004204)
chr4 (46-92)||(960753-960799)
chr4 (188-242)||(30189267-30189321)
chr4 (43-116)||(3756159-3756232)
chr4 (137-234)||(38851515-38851612)
[»] scaffold0187 (2 HSPs)
scaffold0187 (44-237)||(14097-14289)
scaffold0187 (44-237)||(24425-24617)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (44-238)||(11249-11443)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (50-236)||(23335-23521)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (137-234)||(45720-45817)
scaffold0003 (42-116)||(45625-45699)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (137-236)||(35457-35556)
scaffold0100 (50-101)||(35370-35421)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Original strand, 41334571 - 41334763
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334571 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 41334670  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334671 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatgaggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 41334763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 236
Target Start/End: Original strand, 2614563 - 2614749
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2614563 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 2614662  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2614663 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 2614749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18034174 - 18033980
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18034174 gagtgatgatacatgtaccaccccatatggcaatacaccctttacacccatataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 18034075  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18034074 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 18033980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7617327 - 7617129
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| |||| | || |||||| |||||||||||    
T  7617327 aagagtgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacaccttttacaccaacacaaaattctgacatgtgacaacttagatcccacataaatagaagat 7617228  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617227 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtataatggagtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 7617129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5257188 - 5256992
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  5257188 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagata 5257089  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  5257088 aagtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttttcttt 5256992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22512472 - 22512305
Alignment:
Q  69 tgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 168  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22512472 tgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 22512373  T
Q  169 aaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22512372 aaaatatccctaatacatggagtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 22512305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33801662 - 33801467
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33801662 agagtgatgatatatgtaccttcccatgtggcaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaagata 33801563  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33801562 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaatggggtgtagaaataaaggatgttcatgtaacattttcctt 33801467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38470765 - 38470577
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38470765 tgatacatgtaccacctcatatggcaatacaccctttacacccacataaaattctgatacgtggtaatctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 38470666  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38470665 attgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatggaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcctt 38470577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Original strand, 25914902 - 25915085
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25914902 aagagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 25915001  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |        || |||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25915002 a--------ttatgagatgaacctacaaaaatat-tctaatacattgggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 25915085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 39122366 - 39122533
Alignment:
Q  69 tgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 168  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39122366 tgtgacaatatatcatttacatccacacaagattctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaatagaagataaagtgtagttgtgagatgaatttacc 39122465  T
Q  169 aaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  39122466 aaaatattcctaatacat-gggtgtctaattagatgtatgaataaaaggtgttcatgtaatagtttcct 39122533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 149
Target Start/End: Original strand, 39122262 - 39122369
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39122262 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtgacaatatatcatttacatccacacaagattctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaatagaagat 39122361  T
Q  142 aaagtgtg 149  Q
    ||||||||    
T  39122362 aaagtgtg 39122369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Original strand, 32473395 - 32473494
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32473395 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatgcatgtggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 32473494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 236
Target Start/End: Original strand, 33855068 - 33855143
Alignment:
Q  161 aacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33855068 aacttaccaaaatgttcctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 33855143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 242
Target Start/End: Original strand, 30622627 - 30622824
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaa---atagaaga 140  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||   |||    | | |    ||  ||||    
T  30622627 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattttgacatgtggcaa---ggaaaagagagaggagatgaaaga 30622723  T
Q  141 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 240  Q
     ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| || | || ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30622724 gaaagtatggttgtgagataaatttaccaaaatatccttaatgcatgggct-tacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcctttt 30622822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17208173 - 17208073
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17208173 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatgcatggggtgtacaataaagtgtatgattaaagggtgttcacgtaacattttcc 17208074  T
Q  237 t 237  Q
    |    
T  17208073 t 17208073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 116
Target Start/End: Original strand, 32473303 - 32473374
Alignment:
Q  45 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32473303 agtggtgatacatgtacacctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 32473374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Original strand, 6679724 - 6679788
Alignment:
Q  70 gtggcaatacaccattt-acacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaa 133  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  6679724 gtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaa 6679788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Original strand, 28177801 - 28177865
Alignment:
Q  70 gtggcaatacaccattt-acacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaa 133  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  28177801 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaa 28177865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 43 - 243
Target Start/End: Original strand, 36743390 - 36743590
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36743390 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 36743489  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36743490 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 36743589  T
Q  243 a 243  Q
    |    
T  36743590 a 36743590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11582952 - 11582766
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582952 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 11582853  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582852 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 11582766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 50 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29705548 - 29705356
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29705548 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccgcacaaatagaagataaagtgtg 29705449  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29705448 gttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttccattttt 29705356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Original strand, 42197344 - 42197536
Alignment:
Q  45 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42197344 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaa 42197443  T
Q  145 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42197444 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagtgtgtgcaatggggtgtaggaataaatggtgttcatgtaacattttcct 42197536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 241
Target Start/End: Original strand, 30660648 - 30660847
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30660648 aagagtgatgatacatgtatcatcctatgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 30660747  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30660748 aaagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 30660847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Original strand, 30912468 - 30912660
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30912468 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagat 30912567  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30912568 aaggtgcggttgtgagatgaacttaccaaaatacccctaatacatgaagtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 30912660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45397508 - 45397317
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45397508 agagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggcaacacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaatctggagcccacacaaatagaagata 45397410  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 235  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45397409 aattgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtagaatggggtgtaggaataaagggtgttcacgtaacattttc 45397317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Original strand, 29800862 - 29801048
Alignment:
Q  48 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29800862 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataaagtg 29800961  T
Q  148 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29800962 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 29801048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2547188 - 2546995
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2547188 gagtgatgatacatgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaagataa 2547089  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2547088 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcct 2546995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26125825 - 26125637
Alignment:
Q  45 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 144  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26125825 agtggtgatatatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccgcataaaattctgacacgtggcaatctggaccc-acataaatagaagataaa 26125727  T
Q  145 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26125726 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 26125637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20148954 - 20148762
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  20148954 aagagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgat 20148855  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20148854 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgaggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 20148762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 236
Target Start/End: Original strand, 2165877 - 2166063
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2165877 tgatacatgtaccatcccatgtgacaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaaccccacacaaatagaagataaagtgtg 2165976  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2165977 gttatgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtatacaatggggtgtaggaataaatggtgttcatgtaatattttcc 2166063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31384856 - 31384658
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31384856 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtggcaatataccctttacatccacataaaattctgacacgtagcaacctggaccccacacaaatagaagataa 31384757  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  31384756 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatattcctaatacatggggtgtacaatagaatgtaagaataaagggtgttcatgtaatactttcctatttt 31384658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42295386 - 42295191
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  42295386 gagtgatgataaatgtaccatcctatgtggcaatataccctttacatccacacaaaattctgacatgtggcaacttggaccc-acataaatagaagataa 42295288  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42295287 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggagtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttttctttt 42295191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9241744 - 9241594
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9241744 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaacacaccctttgcacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 9241645  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9241644 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatatatagggtgta 9241594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 67 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5755072 - 5754900
Alignment:
Q  67 catgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaactta 166  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5755072 catggggcaatacaccctttacacccacacaaaattctaacacgtggcaacttggatcccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaactta 5754973  T
Q  167 ccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5754972 ccaaaatatccctaatatatgggatgtacaatgggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 5754900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1375736 - 1375542
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  1375736 aagagtggtgatacatgtaccaccctatgtgacaatacattctttacacccacacaagattctaacacgtggcaatctgaactccacacaaatagaagat 1375637  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1375636 aaagtgtagttgtgagataaatttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaattgggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaaaattttcc 1375542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3743963 - 3743767
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  3743963 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtagcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctgaaccctacataaatagaagataa 3743864  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  3743863 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatacttaatatatggggtgtataatgggagggatgaataaagggtgtatatggaacatttttctttt 3743767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Original strand, 40528542 - 40528736
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  40528542 gagtggtgatacatgtgcaccctcatgtgacaatatatcatttacatccacacaaaattatgacatgtgacaacttgaaccccacacaaatagaagagaa 40528641  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaat-aaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  40528642 agtgtggttgtgagataaatttatcaaaatgtccctaatatatggggtgtacaatggggtttgtgaataaaagggtgttcatgtattattttcct 40528736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42699353 - 42699259
Alignment:
Q  140 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42699353 ataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccataatacataaggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 42699259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35181615 - 35181513
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35181615 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 35181516  T
Q  237 ttt 239  Q
    |||    
T  35181515 ttt 35181513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34304981 - 34304786
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||     |        | ||  ||||     
T  34304981 aagagtggtgatacatgtac-accccatgtggcaatacacctcttacacccaaacaaaatcctgacatgtggcaaggaaaagtgagaggagatgaaagag 34304883  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34304882 aaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcctt 34304786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 242
Target Start/End: Original strand, 33629994 - 33630099
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  33629994 aagagaaagtatagttgtgagatgaaattactaaaatgtccctaatgcatagggtgtacaatgaggtgtatgattaaagggtgttcgtgtaacatttttc 33630093  T
Q  237 tttttt 242  Q
    ||||||    
T  33630094 tttttt 33630099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Original strand, 18066719 - 18066819
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18066719 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattactaaaatatccctaatacatgggatgtacaatagaatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 18066818  T
Q  237 t 237  Q
    |    
T  18066819 t 18066819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Original strand, 16603633 - 16603727
Alignment:
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16603633 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtctttaatgcatggggtgtataataaggtgtatgattaaagggtgtgcatgtaacattttcct 16603727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 242
Target Start/End: Original strand, 19386626 - 19386676
Alignment:
Q  192 gtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19386626 gtataatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 19386676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Original strand, 10678060 - 10678132
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  10678060 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 10678132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Original strand, 16358839 - 16358938
Alignment:
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttc-atgtaacattttcctttt 240  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| ||| || |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  16358839 aaagtatggttgtgagatgaatttatcaaaatattcttaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtcttcaatgtaacattttcttttt 16358938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 242
Target Start/End: Original strand, 10678201 - 10678246
Alignment:
Q  197 atggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10678201 atggggtgtatgattaaagggtattcatgtaacattttcctttttt 10678246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 35181709 - 35181636
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  35181709 agagtggtgatacatgtacaccttcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35181636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Original strand, 33629901 - 33629973
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  33629901 gagtggtgatatatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacctacacaaaattttgacatgtggcaa 33629973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28977181 - 28977146
Alignment:
Q  201 ggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28977181 ggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 28977146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 32328815 - 32328908
Alignment:
Q  134 tagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattt 233  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |       ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  32328815 tagaagagaaagtatagttgtgagataaacttaccaaaatattcctaatgcataag-------atgcggtgtatgaaaaaatggtgttcacgtaacattt 32328907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Original strand, 19386473 - 19386545
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19386473 gagtggtgatacatgtacatctccatgtggtaatgcacctcatacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 19386545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36150324 - 36150121
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36150324 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagat 36150225  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  36150224 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctgatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtattcatgtaacattttccacttt 36150125  T
Q  242 taaa 245  Q
    ||||    
T  36150124 taaa 36150121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Original strand, 24688310 - 24688505
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24688310 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacccccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 24688409  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688410 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggagtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 24688505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54237288 - 54237097
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54237288 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaatattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 54237189  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54237188 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 54237097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Original strand, 42394325 - 42394518
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42394325 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagat 42394424  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42394425 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 42394518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40809057 - 40808863
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40809057 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 40808958  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40808957 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacattttcctt 40808863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 241
Target Start/End: Original strand, 54246054 - 54246253
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54246054 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacattctttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 54246153  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54246154 aaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatctctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 54246253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46941246 - 46941048
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46941246 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 46941147  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46941146 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 46941048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40480941 - 40480750
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40480941 gagtgatgatacatgtatcaccccatgcggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccctacacaaatagaagataa 40480842  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40480841 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacataggatgtacaatggggcatatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 40480750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25413874 - 25413680
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25413874 agagtgatgatacatgtaccaccccatatgacaatacaccctttacacccacacaaaactctgacacgtggtaacctggaccccacacaaatagaagata 25413775  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25413774 aagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataaggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 25413680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 53581766 - 53581956
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53581766 gagtgatgatacctgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 53581865  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53581866 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacataggatgtacaatggagtgtatgaataaagagtgttcatgtaacatttt 53581956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Original strand, 45126836 - 45127028
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| || |||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  45126836 gagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctggcatgtggtaatctggaccccacataaatagaaaataa 45126935  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45126936 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcc 45127028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 47190932 - 47191127
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47190932 aagagtgatgatacatgtaccattccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacatgtggtaacttggaccccacacaaatagaagat 47191031  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47191032 aaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacat-gggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 47191127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42100872 - 42100688
Alignment:
Q  52 atacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggt 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42100872 atacatgtaccacctcatgtggcaatgcaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaataaaagataaaatgtggt 42100773  T
Q  152 tgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42100772 tgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 42100688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27748746 - 27748565
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27748746 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccg---------acacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 27748656  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27748655 agtattgttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacataaggtgtataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 27748565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 52630021 - 52629870
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  52630021 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtagcaacctggaccctacataaatagaagata 52629922  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  52629921 aagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccttaatacatagggtgta 52629870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1078412 - 1078229
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1078412 aagagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaatagaagat 1078313  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |        ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1078312 a--------ttgtgagatgaacctacaaaaatat-cctaatacattaggtgtacaatgaggtgcaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 1078229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 53273599 - 53273786
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||      |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  53273599 aagagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacacc---tacac------aaaattctgatacgtggtaacctggatcccacataaataaaagat 53273689  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| || ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  53273690 aaagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaggtataggaataaatgatgttcatataacattttcctt 53273786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 51249452 - 51249323
Alignment:
Q  92 catacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggt 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||    
T  51249452 catacaaaattctgacatgtggcaatctggatcccacacaaatagaagagaaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgaggt 51249353  T
Q  192 gtataatggggtgtatgaataaagggtgtt 221  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  51249352 gtataatgggttgggtgaataaagggtgtt 51249323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 241
Target Start/End: Original strand, 4190266 - 4190370
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4190266 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatctctaatacataaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 4190365  T
Q  237 ttttt 241  Q
    |||||    
T  4190366 ttttt 4190370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 240
Target Start/End: Original strand, 11064628 - 11064824
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||   |   |||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||||||||     
T  11064628 aagagtggtgatacatgtacactcttgtgtgacaatacaccccttacacccacacaaaattttgacatgtggtaatctagaccccacacaaatagaagag 11064727  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 240  Q
     ||||||| || ||||||||| | | ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  11064728 taagtgtgattatgagatgaattaatcaaaatatctctaaagcatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaatgatgttca--taacattttcctttt 11064824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9434316 - 9434120
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||     |        | ||  |||| ||    
T  9434316 gagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaaggaaaagtgagaggagatgaaagagaa 9434217  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 240  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9434216 agtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctttt 9434120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Original strand, 29556865 - 29556956
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29556865 aagagtggtgatacatgtaccactacatgtggcaatacacaatttacacccatataaaa-tctgacatgtggcaacctgaaccccacacaaat 29556956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 245
Target Start/End: Original strand, 29558232 - 29558343
Alignment:
Q  134 tagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattt 233  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  29558232 tagaaaataaaatgtgattgtgagatgaatttaccaatatattcctaatatatagggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgttcatataacattg 29558331  T
Q  234 tccttttttaaa 245  Q
    ||||||| ||||    
T  29558332 tccttttataaa 29558343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Original strand, 10457893 - 10457994
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  10457893 aagagaaagtatggttgtgagataaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacattttcc 10457992  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  10457993 tt 10457994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25996356 - 25996267
Alignment:
Q  148 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||| |||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25996356 tggttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatatatggggtgtacaataagatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcct 25996267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19148962 - 19148882
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctgga 122  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19148962 aagaatggtgacacatgtacacccccatgtggcaatacaccacttacacccacacaaaattctgacatatggcaacctgga 19148882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34791928 - 34791823
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||  ||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34791928 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattattaaaatgtccctaatgcatgaggtttacaatatggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 34791829  T
Q  237 tttttt 242  Q
     |||||    
T  34791828 attttt 34791823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Original strand, 52627978 - 52628079
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||  |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  52627978 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttaccaaaatatacttaatgcatgaggtgtacaataggatgtatgattaaagggtgttcacgtaacattttcc 52628077  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  52628078 tt 52628079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 51757692 - 51757593
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  51757692 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattactaaaatgtccataatgcatgaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgtttatgtaatattttcc 51757593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 51757784 - 51757713
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  51757784 gagtggtgatacatgtac-accccatgtggcaatatacctcttacacccacacacaatcctgacatgtggcaa 51757713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 4190171 - 4190245
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  4190171 aagagtggtgatacatgtatacccttatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 4190245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 106
Target Start/End: Original strand, 54429173 - 54429235
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctga 106  Q
    |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  54429173 gagtggcgatacatgtacacccccatatggcaatacacctcttacacccacacaaaattctga 54429235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19148873 - 19148822
Alignment:
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgt 193  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19148873 aaagtgtgattgtgagataaatttactaaaatgtccctaatacatagggtgt 19148822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26141606 - 26141543
Alignment:
Q  70 gtggcaatacaccattta-cacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaa 132  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  26141606 gtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccacacaa 26141543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 10457798 - 10457872
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  10457798 aagagtgttgatacatgtataccctcatgtggcaatacacctcttacatccacacaaaatcctgacatgtggcaa 10457872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 240
Target Start/End: Original strand, 47532019 - 47532051
Alignment:
Q  208 gaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47532019 gaataaagggtgtttatgtaacattttcctttt 47532051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7292935 - 7292743
Alignment:
Q  48 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292935 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacacaaacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 7292836  T
Q  148 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7292835 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatgaggtgtatgaataaatggtgttcttgtaacattttcctttt 7292743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 237
Target Start/End: Original strand, 9698247 - 9698434
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698247 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 9698346  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698347 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 9698434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 241
Target Start/End: Original strand, 26669915 - 26670114
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26669915 aagagcggtgatatatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagat 26670014  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670015 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 26670114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 236
Target Start/End: Original strand, 13743130 - 13743321
Alignment:
Q  45 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743130 agtggtgatacatgtaccaccctatgtggcaatatatcctttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 13743229  T
Q  145 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13743230 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaattggatgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 13743321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 236
Target Start/End: Original strand, 13748630 - 13748821
Alignment:
Q  45 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748630 agtggtgatacatgtaccaccctatgtggcaatatatcctttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 13748729  T
Q  145 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13748730 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaattggatgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 13748821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26466993 - 26466795
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26466993 aagagtgatgatacatttaccaccctatgtggcaatacaccttttacacccatacaaaatcctgatacgtggcaacctgaaccccaaacaaatagaagat 26466894  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26466893 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaataaccctaatacatggagtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgtttatgtaacattttcctttt 26466795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3213594 - 3213397
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3213594 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagat 3213495  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3213494 aaagtatggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttccttt 3213397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7367735 - 7367546
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  7367735 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaaaataaagtgtg 7367636  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  7367635 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaggtgtatgaataaatgatgttcatataacattttccttt 7367546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21280123 - 21279928
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21280123 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatataccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 21280024  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21280023 aaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatccctaatacatgggatgtgcaatggaatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 21279928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 239
Target Start/End: Original strand, 7273241 - 7273438
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7273241 aagagtgatgatgcatgtaccaccccatgtggtaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagat 7273340  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273341 aaagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgtacaataaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 7273438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 24203895 - 24204085
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24203895 gagtgatgatacatgtaccactccatgtgacaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaatataa 24203994  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24203995 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggagtgtacaatagggtgtaggaataaatggtgttcatgtaacatttt 24204085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30736174 - 30735984
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30736174 gagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 30736075  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  30736074 agtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatcactaatacatgaggtgtacaatggggtgtaggaataaaaagtgttcatgtaacatttt 30735984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30014534 - 30014343
Alignment:
Q  45 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 144  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  30014534 agtgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggtaacttggaccccatataaatagaagataaa 30014435  T
Q  145 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30014434 gtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatgcctaatacatgggatgtataatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 30014343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Original strand, 21293584 - 21293778
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21293584 agagtggtgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagata 21293683  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21293684 aagtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacagtgaaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcct 21293778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27441641 - 27441544
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27441641 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatacataggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 27441544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33242595 - 33242401
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||     |        | ||  |||| ||    
T  33242595 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaaggaaaagggagaggagatgaaagagaa 33242496  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33242495 agtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatacatggggtgtacaataaggtgtatgattaaatggtgttcatgtaacattttcctt 33242401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Original strand, 31109223 - 31109323
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||| |||||| || || |||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31109223 aagagaaaatgtggtcgtaagttgaatttatcaaaatatccctagtgcatggggtgtataatgggatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 31109322  T
Q  237 t 237  Q
    |    
T  31109323 t 31109323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33254012 - 33253913
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33254012 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacattttcc 33253913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 27441736 - 27441662
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  27441736 aagagtggtgatacatgtacacacccatgtggcaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 27441662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 33254107 - 33254034
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  33254107 agagtggtgatacatgtacacctccatgtggcaatacaccttttatacccacacaaaatccggacatgtggcaa 33254034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 31109128 - 31109202
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||| ||| |||||| |  ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  31109128 aagagtgttgacacatgtgcacccctatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 31109202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 44 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5489968 - 5489772
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5489968 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 5489869  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5489868 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 5489772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Original strand, 43570994 - 43571186
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43570994 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 43571093  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43571094 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 43571186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 48498870 - 48499064
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48498870 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 48498969  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48498970 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcctt 48499064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37814969 - 37814772
Alignment:
Q  45 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37814969 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccatataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagataaa 37814870  T
Q  145 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37814869 gtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcccttttt 37814772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Original strand, 23989431 - 23989627
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989431 gagtggtgatacatgtaccaccctatatggcaatacaccctttacacccacacaagattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 23989530  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaat-aaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989531 agtgtggttgtgagataaatttaccaaaatatccctaatacatagggtatacaattgagtgtatgaataaaagggtgttcatgtaacattttccttt 23989627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 239
Target Start/End: Original strand, 24769405 - 24769602
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24769405 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 24769504  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24769505 aaagtgtggttgtgataagaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggagtgtagaaataaaaggtgttcatgaaacattttccttt 24769602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Original strand, 50448167 - 50448360
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  50448167 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacatggaacccacaaaaatagaagata 50448266  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50448267 aaatgtggttgtaagatgaacttacaaaaatatccctaatacataaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcc 50448360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7448019 - 7447828
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7448019 aagagtgatgatacatgtaccattccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 7447920  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7447919 aaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctgtaatacat-gggtgtacaatgggatgtaggaataaaggatgttcatgtaacatttt 7447828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 237
Target Start/End: Original strand, 750211 - 750406
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  750211 aagagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggtaacatggaccccacacaaatagaagat 750310  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  750311 aaagtgtggttttgagatgaatttatcaaaatatccctgatacatggggtgtacaatggggtgtaggaaataagggtgttcacgtaacattttcct 750406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4401521 - 4401329
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  4401521 agagtgatgatacatgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcatattggaccccacacaaatagaagata 4401422  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaat-aaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  4401421 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgtacaatgaagtgtaggaataaaagagtgttcatgtatcatttt 4401329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 2497469 - 2497660
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  2497469 agagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttatacccacataaaattctgacacgtgacaatctggatcccacataaatagatgata 2497568  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2497569 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccttaatatatggggtgtacaatggaatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 2497660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4888235 - 4888093
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||| |||    
T  4888235 agagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggcaatatatcctttacatccacacaaaattctgatacatggcaatttggacaccacacaaatagaaaata 4888137  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 186  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4888136 aagtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatccctaatacat 4888093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44112776 - 44112675
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44112776 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 44112677  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  44112676 tt 44112675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48119727 - 48119628
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48119727 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 48119628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35003393 - 35003294
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35003393 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgtatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 35003294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41065252 - 41065152
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41065252 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgcccctaatgcatggggtgtacaacagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 41065153  T
Q  237 t 237  Q
    |    
T  41065152 t 41065152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38336017 - 38335918
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38336017 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgggatgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 38335918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 46168482 - 46168383
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46168482 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcattgggtgtacaataggatatatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 46168383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Original strand, 45427746 - 45427846
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  45427746 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggagtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtattcatgtaacattttcc 45427845  T
Q  237 t 237  Q
    |    
T  45427846 t 45427846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Original strand, 38113202 - 38113296
Alignment:
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38113202 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtcattaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatataacattttcct 38113296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Original strand, 45639733 - 45639834
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45639733 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgtatggggtgtacaataggatgtatgattaaagagtgttcatgtaacattttcc 45639832  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  45639833 tt 45639834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Original strand, 35000021 - 35000093
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35000021 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacatctcttacacccatacaaaatcctgacatgtggcaa 35000093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 35003488 - 35003414
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  35003488 aagagtggtgatacatgcacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35003414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 44112871 - 44112797
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44112871 aagagtggtgatacatgtacaccttcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 44112797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45705924 - 45705824
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||| | ||||| ||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45705924 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttatcaaaatgtccataatgcatggagtgtacaatagaatgtatgattaaagggtgttcatataacattttcc 45705825  T
Q  237 t 237  Q
    |    
T  45705824 t 45705824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 45706017 - 45705945
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  45706017 gagtggtgatacatgtacacctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 45705945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Original strand, 35000114 - 35000213
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||   || || ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  35000114 aagagaaagtatggttgtgagataaatttatcaaaatgtccctaatacatgaagtatacaatagagtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacattttcc 35000213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14427394 - 14427345
Alignment:
Q  189 ggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14427394 ggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctt 14427345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 48119817 - 48119748
Alignment:
Q  47 tggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  48119817 tggtgatacatgtacacccccacgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 48119748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Original strand, 45639640 - 45639712
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  45639640 gagtggtgatacatgtacacccccttgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctaacatgtggcaa 45639712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26585656 - 26585582
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  26585656 aagagtggtgatacatgtacacccccatgcggcaatacatctcttacatccacacaaaatcctgacatgtggcaa 26585582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 38113101 - 38113175
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  38113101 aagagtggtgattcatgtacacctccatgtgacaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 38113175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 113
Target Start/End: Original strand, 45427652 - 45427722
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtgg 113  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  || || ||| ||||||| |||||| ||||    
T  45427652 agagtggtgatacatgtacatccccatgtggcaatacacctcttccatccacacaaaatcctgacatgtgg 45427722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26585561 - 26585460
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| |||   |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  26585561 aagagaaagtatgattgcgagatgaatttactaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatatagtgtatgattaaagaatgttcatctaacattttcc 26585462  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  26585461 tt 26585460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 41065344 - 41065271
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |||||| |||||||    
T  41065344 agagtggtgatatatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacatccgcacaaaatcctgacatgtggcaa 41065271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 45044634 - 45044570
Alignment:
Q  70 gtggcaatacaccattt-acacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || || || |||||||| ||||||    
T  45044634 gtggcaatacaccatttgacacccatacaaaaatctgacatgtagccacatggaccccgcacaaa 45044570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 46168555 - 46168503
Alignment:
Q  64 ccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  46168555 ccccatgtggcaatacatctcttacacccacacaaaattatgacatgtggcaa 46168503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 236
Target Start/End: Original strand, 24000926 - 24001112
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24000926 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 24001025  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24001026 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 24001112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 236
Target Start/End: Original strand, 42538345 - 42538531
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538345 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 42538444  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538445 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 42538531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41861868 - 41861672
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41861868 gagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccatacaaatagaagataa 41861769  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccc--taatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41861768 agtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatctctataatacatagggtgtataattgggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 41861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 236
Target Start/End: Original strand, 5810830 - 5811024
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5810830 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacatgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 5810929  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5810930 aaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatatatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtggtcatgtaacattttcc 5811024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5015583 - 5015389
Alignment:
Q  48 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5015583 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacactcacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtg 5015484  T
Q  148 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5015483 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcctttttt 5015389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44326372 - 44326180
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  44326372 aagagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgat 44326273  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44326272 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgaggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 44326180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42973038 - 42972852
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42973038 tgatacatgtactatcctatgtggcaatacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaaatgtg 42972939  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  42972938 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtaggaataaaggatgttcaggtaacattttcc 42972852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 26898310 - 26898499
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26898310 gagtggtgatacatgtaccatcctatgtggcaatacaccttttacacccacataaaattctgacacgtggtaacctggaccccacacaaatagaatataa 26898409  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26898410 agtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggaatgtacaattgggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattt 26898499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 44416841 - 44417032
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44416841 agagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 44416940  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||||    
T  44416941 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatagggtgtagaaataaatgatgttcatgtaacatttt 44417032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 43343532 - 43343722
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43343532 gagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 43343631  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||||    
T  43343632 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatagggtgtagaaataaatgatgttcatgtaacatttt 43343722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 227
Target Start/End: Original strand, 32029731 - 32029908
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32029731 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtg 32029830  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgta 227  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  32029831 gttgttagatgaatttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaaaagtgtttatgta 32029908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Original strand, 16180263 - 16180454
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16180263 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 16180362  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16180363 aaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatttataatacgtggggtgtacaat-gggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacatttt 16180454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 4638106 - 4638297
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4638106 agagtggtgatacatgtaccaccctacgtgacaatacaccctttacatccatacaagattctgacacgtggtaacctagaccccacacaaatagaagata 4638205  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4638206 aagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatccataatatatggggtgtacaattgagtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 4638297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45326214 - 45326020
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  45326214 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtgacaatacaccatttacacccacataaaattctgacaggtggtagtctggaccccacataaatagaagat 45326115  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  45326114 aaagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaatgtgatgtatgaataaaaggtgtttatgtaacactttcc 45326020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35069915 - 35069720
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  35069915 aagagtgatgatacatgtaccatcctatgtggcaatatatcctttacatctacacaaaattctgacacgtggcaacttggacctcacataaatagaagat 35069816  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35069815 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagagtgttcatgtaacattttcct 35069720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Original strand, 27393174 - 27393344
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27393174 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacatcctttacacccacataaaattctgacatgaggcaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 27393273  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgt 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||||    
T  27393274 gttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagagtgtacaataggatgtaggaataaagggtgt 27393344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10573941 - 10573751
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | | |||||||||| | |||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  10573941 gagtggtgatacatgtaccaccgcatgtgacaatatatcctttacacccacataaaattctgatatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataa 10573842  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10573841 agtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatattcctaatacatggggtgtacaataggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 10573751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43317635 - 43317437
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  43317635 gagtggtgatacatgtacacccttgtgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagta 43317536  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  43317535 agtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatatccctaaagcataggatgtacaatgaggtgtatgaataaatggtgttcatgtaacattttcctatttt 43317437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9216487 - 9216301
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9216487 tgatatatataccaccccatgtgacaatacaccttttacatccacacaaaattctgacatgcggcaacttaaaccccacacaaatagaagataaaatgtg 9216388  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9216387 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatgcat-gggtgtacaataggatataggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 9216301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 213
Target Start/End: Original strand, 38160505 - 38160656
Alignment:
Q  62 caccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatga 161  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38160505 caccccatgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtagttgtgagatga 38160604  T
Q  162 acttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataa 213  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  38160605 agttactaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggagtgtaagaataa 38160656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Original strand, 5194139 - 5194332
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    |||| |||||||||||||  ||   |||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  5194139 gagtagtgatacatgtacacccttgtgtggcaatacaacccttacacccacacaaaattttgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagta 5194238  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5194239 agtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatatccttaaaacatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaatggtgttcatgtaacattttcct 5194332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 237
Target Start/End: Original strand, 24280555 - 24280697
Alignment:
Q  95 acaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 194  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||| || ||||    
T  24280555 acaaaattctgatatatggcaacttggaccccacacaaatagaagagaaagtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatatttctagtgcatgggatgta 24280654  T
Q  195 taatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24280655 gaatagggtgtatgaataaagggtgttcacgtaacattttcct 24280697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40237112 - 40236916
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||     |        | ||  |||| |    
T  40237112 agagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaaggaaaagtgagaggagatgaaagaga 40237013  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237012 aaatatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataggatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttccttt 40236916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31513386 - 31513287
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31513386 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtatacaatagggtgtatgattaaagagtgttcatgtaacattttcc 31513287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 156
Target Start/End: Original strand, 47279630 - 47279744
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| | |||||||||| | |||| || ||||| || | | |||||||||||    
T  47279630 aagagtggtgatacatgtaccatcccatctgacaatacaccctttatacccacataaaattctgatatgtggtaatctggatcctatataaatagaagat 47279729  T
Q  142 aaagtgtggttgtga 156  Q
    |||||||||||||||    
T  47279730 aaagtgtggttgtga 47279744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Original strand, 31408634 - 31408732
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 235  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31408634 aagagaaagtatggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgggatgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttc 31408732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 239
Target Start/End: Original strand, 27535232 - 27535334
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||| | ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27535232 aagagaaagtatagttgtgagatgaaattaccaaaatgtctttaacacatggagtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 27535331  T
Q  237 ttt 239  Q
    |||    
T  27535332 ttt 27535334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33384970 - 33384866
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataat-ggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 235  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | || || ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  33384970 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatgtccctaatgcatggagtatacaataggggtgtatgattaaatgatgttcatgtaacattttc 33384871  T
Q  236 ctttt 240  Q
    |||||    
T  33384870 ctttt 33384866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39998475 - 39998408
Alignment:
Q  169 aaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  39998475 aaaatatccctaatacatggggtgtacaataggatgtatgattaaaatgtgttcatgtaacattttcc 39998408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 31408539 - 31408613
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  31408539 aagagtggtgatacatgtacacccccatgtgacaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 31408613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 33385065 - 33384991
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  33385065 aagagtggtgatacatgtaaacccccatgtgacaatacacctcttacacccatacaaaatcctgatatgtggcaa 33384991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 27535137 - 27535211
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  27535137 aagagtggtgatacatgtattcctccatgtggcaatacatctcttacatccacacaaaattctgacatgtggcaa 27535211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 31513481 - 31513407
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||  ||||| | | ||||||| |||||| |||||||    
T  31513481 aagagtggtgatacatgtacacccttatgtggcaatacacctcttacatctacacaaaatcctgacatgtggcaa 31513407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 237
Target Start/End: Original strand, 47279744 - 47279798
Alignment:
Q  183 acatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  47279744 acatggggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtatttatgtaatattttcct 47279798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 114
Target Start/End: Original strand, 35522902 - 35522947
Alignment:
Q  70 gtggcaatacaccattta-cacccatacaaaattctgacacgtggc 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  35522902 gtggcaatacaccatttaacacccacacaaaaatctgacacgtggc 35522947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 237
Target Start/End: Original strand, 38160666 - 38160695
Alignment:
Q  208 gaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38160666 gaataaagggtgttcatgtaacattttcct 38160695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 112849 - 112656
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  112849 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagat 112750  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  112749 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 112656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19047351 - 19047158
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19047351 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagat 19047252  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19047251 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 19047158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30838826 - 30838631
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30838826 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacacctacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 30838727  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30838726 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaataagatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 30838631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1750606 - 1750408
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1750606 gagtgatgatatttgtaccaccccatgtggcaacacaccctttacactcacacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 1750507  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1750506 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccattttt 1750408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Original strand, 43490307 - 43490499
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43490307 aagagtgatgctacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagat 43490406  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43490407 aaagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagagtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 43490499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 239
Target Start/End: Original strand, 12302167 - 12302356
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12302167 tgatacatgtatcaccccatgtggcaatacatcctttacatccacacaaaattctgacacatggtaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 12302266  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302267 gttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 12302356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 243
Target Start/End: Original strand, 4764633 - 4764833
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764633 agagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 4764732  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4764733 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatttataatacatggggtgtacaatagggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacattttcctttttt 4764832  T
Q  243 a 243  Q
    |    
T  4764833 a 4764833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16096940 - 16096747
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggacccc-acacaaatagaagata 142  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||    
T  16096940 gagtgatgatacatgtaccacatcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttagacccccacataagtagaagata 16096841  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16096840 aagtgtggttgtgagattaactcaccaaaatatccctaatacatggggtgtataatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 16096747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 43335671 - 43335865
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43335671 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatataccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaagataa 43335770  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  43335771 agtgtagttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaggtgtaggaataaatgatgttcatataacattttcctt 43335865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 236
Target Start/End: Original strand, 42849768 - 42849946
Alignment:
Q  45 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42849768 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaa-ataaa 42849866  T
Q  145 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42849867 gtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatac------------atggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 42849946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Original strand, 34817682 - 34817875
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||     
T  34817682 aagagtgatgatacatgtacacccccatgtggcaatgctccccttacacccatacaaaattctgacatgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagag 34817781  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | || | ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34817782 aaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatgtgcgtagtgcatggggtgtacaatgaggtgtgtgaataaagggtgttcatgtaacattttc 34817875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 246
Target Start/End: Original strand, 13780676 - 13780846
Alignment:
Q  77 tacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 176  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13780676 tacaccctttacacctatacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagagaaagtgtggttgtgagatgaatttatcaaaatatc 13780775  T
Q  177 cctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc-ttttttaaag 246  Q
    ||||||  || ||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13780776 cctaatgtatggggtgtacaatgaggtgtgtgaataaaatgtgttgatgtaacattttccattttttaaag 13780846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42026955 - 42026766
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||     
T  42026955 tgatacatgtacacctccatgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacatcttgcaacctagaccccacacaaatagaaaagaaagtgta 42026856  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaa--gggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| |   || |||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42026855 gttgtgagatgaatttgccaaaatatccctaatgcgcgggatgtacaatggaatgtatgaataaattgggtgttcatgtaacattttcct 42026766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 234
Target Start/End: Original strand, 8896541 - 8896681
Alignment:
Q  94 tacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgt 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  8896541 tacaaaattctgacatgtggcaacctgaacctcacacaaatagaaaagaaagtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatattcctattgtatagggtgt 8896640  T
Q  194 ataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    | |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8896641 acaatggaatgtgtgaataaagggtgttcatgtaacatttt 8896681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 194
Target Start/End: Original strand, 39149201 - 39149350
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||  | ||||| ||||||||| ||||||    
T  39149201 agagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggtaatacaccttttacacccacacaaaattatgagacgtggtaatttagaccc-acacaaataaaagata 39149298  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 194  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39149299 aagtgtagttgtgggatgaacttaccaaaatatctctaatacataggatgta 39149350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43114656 - 43114554
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43114656 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 43114557  T
Q  237 ttt 239  Q
    |||    
T  43114556 ttt 43114554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 11825562 - 11825752
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||     |        | ||  |||| ||    
T  11825562 gagtggtgatacatgtacatccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaaggaaaagggagaggagatgaaagagaa 11825661  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11825662 agtatgattgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 11825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16804067 - 16803966
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16804067 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 16803968  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  16803967 tt 16803966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16843349 - 16843248
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16843349 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 16843250  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  16843249 tt 16843248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 234
Target Start/End: Original strand, 41281975 - 41282072
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41281975 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 41282072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Original strand, 12415461 - 12415560
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12415461 aagagaaagtatggttgtgagataaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 12415560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Original strand, 12427521 - 12427620
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12427521 aagagaaagtatggttgtgagataaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 12427620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33229396 - 33229303
Alignment:
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaat-aaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33229396 aaagtgtgattgtatgatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaaagggtgttcatgtatcatttt 33229303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 239
Target Start/End: Original strand, 34895647 - 34895844
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||     |        | ||  |||||    
T  34895647 aagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaaggaaaagggagaggagatgaaagat 34895746  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34895747 aaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacactttccttt 34895844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18491798 - 18491704
Alignment:
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18491798 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgttcttaatgcatgaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcct 18491704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Original strand, 966835 - 966936
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||  | | |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  966835 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaacgttcttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 966934  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  966935 tt 966936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 234
Target Start/End: Original strand, 6518484 - 6518566
Alignment:
Q  151 ttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6518484 ttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagagtgtatgattaaa-ggtgttcatgtaacatttt 6518566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14285758 - 14285675
Alignment:
Q  154 tgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  14285758 tgagatgaatttaccaaaatatctttaatatatagggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgtttgtgtaatattttcct 14285675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 6518400 - 6518474
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  6518400 aagagtggtgatacatgtacacctccatgtgtcaatacaccttttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 6518474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18491899 - 18491825
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  18491899 aagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctaacatgtggcaa 18491825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 41281880 - 41281954
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  41281880 aagagtggtgatacatgtacacccccatatggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 41281954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Original strand, 966742 - 966814
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  966742 gagtggtgatacatgtacatccccatgtggaaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 966814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 43114749 - 43114677
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  43114749 gagtggtgatacatgtacaccctcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacaagtggcaa 43114677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 234
Target Start/End: Original strand, 4299435 - 4299518
Alignment:
Q  151 ttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4299435 ttgtgagatgaatttaccaaaatgtcattaatgcatggagtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatataacatttt 4299518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7070505 - 7070418
Alignment:
Q  147 gtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||| || | |  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7070505 gtggttgtaagatgaatttatcaaaatgtccccaataaatggaggttacaatgggatgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 7070418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 194
Target Start/End: Original strand, 4451951 - 4452008
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4451951 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccctaatgcatatggtgta 4452008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 108
Target Start/End: Original strand, 12415368 - 12415432
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgaca 108  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  12415368 gagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacacctcttacatccacacaaaattctgaca 12415432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 108
Target Start/End: Original strand, 12427428 - 12427492
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgaca 108  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  12427428 gagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacacctcttacatccacacaaaattctgaca 12427492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16804160 - 16804088
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || || |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16804160 gagtggtgatacatgtacacccctatatgacaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16804088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16843442 - 16843370
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || || |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16843442 gagtggtgatacatgtacacccctatatgacaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16843370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 12531569 - 12531643
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  12531569 aagagtgatgatacatgtacacctccatatggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 12531643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Original strand, 4299328 - 4299400
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  4299328 gagtggtgatacatgtacaccttcatgtggcaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 4299400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 40613976 - 40613913
Alignment:
Q  70 gtggcaatacaccattt-acacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaa 132  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  40613976 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaa 40613913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 879 - 680
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  879 aagagcggtgatatatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagat 780  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  779 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttttt 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27550503 - 27550309
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27550503 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagat 27550404  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27550403 aaagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcc 27550309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 1771172 - 1771368
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1771172 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgagacgtggcaacttggaccccacataaatagaagat 1771271  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1771272 aaaatgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 1771368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 43 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23036173 - 23035974
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23036173 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaacacatcctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagata 23036074  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23036073 aagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatatatagggtgtacaatagggtgtaggaataaaggaggttcatgtaacattttcctttttt 23035974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25051885 - 25051691
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25051885 gagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacatcatttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataa 25051786  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25051785 agtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagtgtgttcatgtgacattttcctt 25051691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 28982728 - 28982924
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28982728 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 28982827  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28982828 aaagtgcggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgggatgtacaatagggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 28982924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 239
Target Start/End: Original strand, 55966252 - 55966449
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  55966252 aagagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacaggtggcaatctagaccccacataaatagaagat 55966351  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55966352 aaattgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttccttt 55966449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 27893750 - 27893940
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  27893750 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataa 27893849  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27893850 agtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 27893940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33703333 - 33703139
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  33703333 gagtgatgatacatgtaccaccccatatggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccgcacaaatagaagataa 33703234  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703233 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaataagatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 33703139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27864758 - 27864561
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||| ||    
T  27864758 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaat 27864659  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27864658 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacattttccttt 27864561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35017924 - 35017733
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35017924 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacatcttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 35017825  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35017824 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccct-atacatggggtgtacaatgagatataggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 35017733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 43514594 - 43514784
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43514594 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacatccacaaaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagataa 43514693  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43514694 ggtgtggttgtgagatgaacttaccaaaataaccctaatacatgaagtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 43514784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 23204686 - 23204875
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23204686 gagtgatgatacacgtaccatcccatgtggcaatatatcctttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 23204785  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattt 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23204786 agtgtggttgtgacatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatgggatgtaggaataaagagtgttcatgtaacattt 23204875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 43949709 - 43949900
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||    
T  43949709 gagtgatgatacatgtaccaccctatttggcaatacaccctttatacccatacaaaattctgacacgtggcatattggatcccgcacaaatagaagataa 43949808  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaat-aaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43949809 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgcaggaataaaagggtgttcatgtatcatttt 43949900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31681095 - 31680904
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  31681095 agagtggtgatacatgtagcatcccatgtggcaatacaccctttacacctacataaaattctgacacgtggcaatctaaaccccacataaatagaagata 31680996  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  31680995 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatacggggtgtacaatggaatgtatgaataaatggtgtttacgtaacatttt 31680904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28988666 - 28988470
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28988666 aagagtggtgatacatgtacaccctcatgtgacaatacaccccttac-ctcatacaaaattctgacatatggcaacctggaccccacacaaatagaagag 28988568  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28988567 aaagtgtggttatgagatgaatttatcaaaatgtccctagtgcatggggtgtacaatgaggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 28988470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43735936 - 43735744
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  43735936 aagagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacacgtgacaacttggatcccacacaaatagaagat 43735837  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43735836 aaagtgtgattgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacatggaatgtataatgagatgtaggaataaaggatgttcatgtaatatttt 43735744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12497142 - 12496956
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12497142 tgatacatgcaccaccccatgtgacaatacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataaagtgtg 12497043  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12497042 attgtaagatgaacttaccaaaatatctctaatacatgggatgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatataacattttcc 12496956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Original strand, 27316619 - 27316813
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaa-ttctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||    
T  27316619 agagtgatgatacatttatcatcccatgtgacaatacaccctttacatccacacaaaaattctgacacgtggcaacttggactccaaataaatagaagat 27316718  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27316719 aaagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatatccttaatacatggggtgtataatgaggtgtaggaataaagggtgttcgtttaacattttcc 27316813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 237
Target Start/End: Original strand, 48463361 - 48463551
Alignment:
Q  47 tggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagt 146  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  48463361 tggtgatacatgtaccactctatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaataaagt 48463460  T
Q  147 gtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48463461 atggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaaatgtatgaataaatggtgtttatgtaacattttcct 48463551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Original strand, 45490225 - 45490419
Alignment:
Q  48 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 147  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  45490225 ggtgatacatgtagtaccctatgtggcaatatatcatttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagataaagtg 45490324  T
Q  148 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||| || ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  45490325 tggttgtgagatgaatttactaaagtatccctaatacatgaggtgtacaattggatgtataaataaaatgtgttcatgtaacattttccattttt 45490419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21687200 - 21687005
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||   ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  21687200 aagagtgatgatatatgtaccaacctatgtggcaatacattctttacattcacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccagacaaatagaagat 21687101  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21687100 aaagtatggttatgagatgaacttactaaaatatttctaatacataagatgtataatggggtgtaaaaataaaggatgttcatgtaacattttcct 21687005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41878593 - 41878407
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||     ||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  41878593 aagagtggtgatacatgtaccacc-----tg--aatacactctttacaccaacacaaaattctgacacgtgacaatctggaccccacacaaatagaagag 41878501  T
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 235  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41878500 aaggtttggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatggatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaagagtgttcatgtaacattttc 41878407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 194
Target Start/End: Original strand, 51512173 - 51512323
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51512173 gagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacatctttaatacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaataaaagataa 51512272  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 194  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  51512273 agtgtggttataagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgta 51512323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39631275 - 39631102
Alignment:
Q  62 caccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatga 161  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39631275 caccccatgtgacaatacatcctttacacccacacaaaattctgacacgtgacatattgaaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatga 39631176  T
Q  162 acttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaat-aaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  39631175 acttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaaagggggttcatgtatcatttt 39631102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41848158 - 41847965
Alignment:
Q  49 gtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgt 148  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41848158 gtgatacatgtacacccccatgtggcaatacaccccttacatccacgcaaaattctgacatgtgacaatctgaaccccacacaaatagaagagaaagtgt 41848059  T
Q  149 ggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| || ||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  41848058 ggttgtgcgatgaatttgccaaaatgtctctaatgcatggggtgtacaatgaggtgtgtgaaaaaaggatgttcttgtaacattttccgttttt 41847965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 234
Target Start/End: Original strand, 41327478 - 41327641
Alignment:
Q  71 tggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaa 170  Q
    ||||||||||||  |||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41327478 tggcaatacaccccttacactcacaaaaaattctaacatgtggcaacctggaccccacacaaattgaagagaaagtgtggatgtgagatgaatttaccaa 41327577  T
Q  171 aatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||| ||| || | |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41327578 aatgtccgtagtgcataaggtgtacaatggggtgtgtgaataaagggtgtctatgtaacatttt 41327641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 237 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 48187464 - 48187351
Alignment:
Q  237 ttttttaaagctaaaacaaatgcatcctttattattttatatttcaaatgttggatacag--nnnnnnnngtctaatatttggttcttaatagtattatt 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48187464 ttttttaaagttaaaacaaatgcatcctttattattttatatttcaaatgttggatacagaaaaaaaaaagtctaatatttggttcttaatagtattatt 48187365  T
Q  335 gctgaatttttaaa 348  Q
    ||||||||||||||    
T  48187364 gctgaatttttaaa 48187351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 195
Target Start/End: Original strand, 56215805 - 56215956
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 142  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  56215805 agagtggtgatacatgtacaccaccatgtggccatacacctcttacacccacacaaaattctgacatatagcaacctagaccccacacaaatag-agaga 56215903  T
Q  143 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtat 195  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  56215904 aagtgtggttgtgagataaattttccaaaatatcgctaatgcataggatgtat 56215956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 712059 - 711958
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  712059 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatagggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 711960  T
Q  237 tt 238  Q
    ||    
T  711959 tt 711958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 183
Target Start/End: Original strand, 46412389 - 46412516
Alignment:
Q  56 atgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtg 155  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46412389 atgtaccaccctatatgacaatatactttttacatctacacaaaattctgacacgtggcaatttaaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtg 46412488  T
Q  156 agatgaacttaccaaaatatccctaata 183  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  46412489 agaagaacttaccaaaatatctctaata 46412516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Original strand, 17619153 - 17619252
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17619153 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacattttcc 17619252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Original strand, 55272284 - 55272476
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||     |        | ||  |||| ||    
T  55272284 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaaggaaaagggagaggagatgaaagagaa 55272383  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  55272384 agtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagagtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcc 55272476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 960890 - 960972
Alignment:
Q  156 agatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  960890 agatgaatttaccaaaatgtccctaatgtatagggtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctt 960972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 234
Target Start/End: Original strand, 3756252 - 3756344
Alignment:
Q  142 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    ||||| || ||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3756252 aaagtatgattgtgagataaatttactaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 3756344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32728456 - 32728356
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32728456 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttactaaaatgtccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcc 32728357  T
Q  237 t 237  Q
    |    
T  32728356 t 32728356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35037093 - 35037001
Alignment:
Q  148 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttt 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35037093 tggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagagtgtatggttaaagggtgctcatgtaacatttttctttt 35037001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Original strand, 48435580 - 48435680
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  48435580 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacactttcc 48435679  T
Q  237 t 237  Q
    |    
T  48435680 t 48435680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19880147 - 19880074
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19880147 agagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 19880074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 239
Target Start/End: Original strand, 46827721 - 46827809
Alignment:
Q  151 ttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 239  Q
    ||||||||| || |||||||||  | | |||| ||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46827721 ttgtgagataaatttaccaaaacgttcttaatgcattgggtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttccttt 46827809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 35037195 - 35037125
Alignment:
Q  45 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  35037195 agtggtgatacatgtac-actccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35037125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 17619058 - 17619132
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  17619058 aagagtggtgatacatgtacatccccacctggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 17619132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 712148 - 712080
Alignment:
Q  48 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  712148 ggtgatacatgtacacctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 712080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Original strand, 48435487 - 48435559
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  48435487 gagtggtgatacatgtacacccccatgtgacaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 48435559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 46827612 - 46827686
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  46827612 aagagtggtgatacatgtacacctccatgtggaaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 46827686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Original strand, 49229684 - 49229765
Alignment:
Q  156 agatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| |||   ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  49229684 agatgaatttaccagaatatccttaatgcatgaagtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatataacattttcct 49229765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 32728551 - 32728511
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacacc 82  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32728551 aagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacc 32728511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 236
Target Start/End: Original strand, 36004165 - 36004204
Alignment:
Q  197 atggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  36004165 atggggtgtatgattaaagggtattcatgtaacattttcc 36004204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 92
Target Start/End: Original strand, 960753 - 960799
Alignment:
Q  46 gtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacaccc 92  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  960753 gtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacaccc 960799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30189321 - 30189267
Alignment:
Q  188 gggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttttt 242  Q
    |||||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30189321 gggtgtacgatggagtgtgtgaataaatggtgttcatgtaacattttcctatttt 30189267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 116
Target Start/End: Original strand, 3756159 - 3756232
Alignment:
Q  43 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||  ||||| |||||||    
T  3756159 agagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacaactcttacacccacataaaatcatgacatgtggcaa 3756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38851612 - 38851515
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||| | ||||| | |  | ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  38851612 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttatcaaaatgtccataatgcatggagtgtacattatgatgtatgattaaaggatattcatgtaacatttt 38851515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Original strand, 14097 - 14289
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14097 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc-acacaaatagaagataa 14195  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14196 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 14289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Original strand, 24425 - 24617
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24425 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc-acacaaatagaagataa 24523  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24524 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 24617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11443 - 11249
Alignment:
Q  44 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  11443 gagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacactatttacacctacacaaaattctgacacgtagcaacttggaccccacatcaatagaagataa 11344  T
Q  144 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11343 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaatggggtgtatgaataaagtgtgttcatgtgacattttcctt 11249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 236
Target Start/End: Original strand, 23335 - 23521
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23335 tgatacatgcaccaccccatgtgacaatacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataaagtgtg 23434  T
Q  150 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23435 attgtaagatgaacttaccaaaatatctctaatacatgggatgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatataacattttcc 23521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 234
Target Start/End: Original strand, 45720 - 45817
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 234  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45720 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatacataggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 45817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 45625 - 45699
Alignment:
Q  42 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  45625 aagagtggtgatacatgtacacacccatgtggcaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 45699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Original strand, 35457 - 35556
Alignment:
Q  137 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  35457 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatatggtgtatgattaaatggtgtttatgtaacattttcc 35556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Original strand, 35370 - 35421
Alignment:
Q  50 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaat 101  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35370 tgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccatacaaaat 35421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University