View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11385A_low_106 (Length: 300)

Name: NF11385A_low_106
Description: NF11385A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11385A_low_106
NF11385A_low_106
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (7-300)||(21576-21869)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (7-300)||(18797250-18797543)
chr6 (7-300)||(34643014-34643307)
chr6 (6-300)||(21567418-21567712)
chr6 (7-296)||(10466276-10466565)
chr6 (7-300)||(14377344-14377637)
chr6 (7-246)||(19455637-19455876)
chr6 (22-291)||(21474169-21474438)
chr6 (7-300)||(24366960-24367253)
chr6 (7-246)||(19437616-19437855)
chr6 (7-246)||(24515842-24516081)
chr6 (7-227)||(15461969-15462189)
chr6 (7-295)||(25770409-25770697)
chr6 (19-290)||(19486734-19487003)
chr6 (7-226)||(16925068-16925287)
chr6 (7-226)||(27559397-27559616)
chr6 (7-226)||(29589867-29590086)
chr6 (12-127)||(23085258-23085373)
chr6 (7-183)||(16574567-16574743)
chr6 (7-183)||(16620637-16620813)
chr6 (7-226)||(2872230-2872449)
chr6 (7-226)||(25115186-25115405)
chr6 (7-178)||(28260625-28260796)
chr6 (7-178)||(28285120-28285291)
chr6 (7-178)||(28312312-28312483)
chr6 (7-178)||(28339374-28339545)
chr6 (12-296)||(18182800-18183084)
chr6 (7-300)||(18405372-18405665)
chr6 (18-178)||(23081105-23081265)
chr6 (7-183)||(24293210-24293386)
chr6 (7-178)||(5836656-5836827)
chr6 (7-193)||(22436536-22436722)
chr6 (24-178)||(27190118-27190272)
chr6 (24-178)||(27258968-27259122)
chr6 (12-102)||(20010887-20010977)
chr6 (21-262)||(30678466-30678706)
chr6 (24-127)||(19867420-19867523)
chr6 (7-55)||(19465973-19466021)
chr6 (157-298)||(8761332-8761473)
chr6 (72-226)||(22827848-22828002)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (7-300)||(115287-115580)
scaffold0029 (7-298)||(94180-94471)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (7-300)||(18051223-18051516)
chr7 (12-300)||(11385704-11385992)
chr7 (7-296)||(14140369-14140658)
chr7 (7-300)||(14283644-14283937)
chr7 (7-300)||(15343117-15343410)
chr7 (7-300)||(13024031-13024324)
chr7 (7-300)||(16947742-16948035)
chr7 (7-298)||(12459316-12459607)
chr7 (21-300)||(21755098-21755377)
chr7 (7-246)||(13676191-13676430)
chr7 (7-300)||(15099873-15100166)
chr7 (7-298)||(19149699-19149990)
chr7 (7-298)||(20749098-20749389)
chr7 (7-292)||(26092068-26092353)
chr7 (7-300)||(26115860-26116153)
chr7 (7-292)||(49154995-49155280)
chr7 (7-300)||(13965938-13966231)
chr7 (7-300)||(12798771-12799064)
chr7 (7-232)||(40925087-40925312)
chr7 (7-298)||(14261516-14261806)
chr7 (18-196)||(12204081-12204259)
chr7 (7-235)||(14957304-14957532)
chr7 (157-300)||(19615361-19615504)
chr7 (7-235)||(17703747-17703975)
chr7 (7-226)||(8200807-8201026)
chr7 (7-235)||(9591118-9591342)
chr7 (13-226)||(10873449-10873662)
chr7 (19-236)||(12690251-12690468)
chr7 (7-183)||(14335198-14335374)
chr7 (7-183)||(18180545-18180721)
chr7 (7-183)||(44788643-44788819)
chr7 (7-193)||(11550394-11550580)
chr7 (123-300)||(16069683-16069860)
chr7 (7-226)||(11234505-11234724)
chr7 (7-226)||(13688800-13689019)
chr7 (7-183)||(8710407-8710583)
chr7 (7-178)||(18587463-18587634)
chr7 (7-226)||(15158349-15158568)
chr7 (12-99)||(15146220-15146307)
chr7 (33-291)||(15627218-15627476)
chr7 (18-99)||(14042581-14042662)
chr7 (18-99)||(14352611-14352692)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (7-300)||(831-1124)
scaffold0476 (12-296)||(10515-10799)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (7-300)||(17188699-17188992)
chr3 (7-300)||(8744901-8745194)
chr3 (7-300)||(24189629-24189922)
chr3 (18-300)||(13944349-13944631)
chr3 (7-293)||(16832039-16832325)
chr3 (18-296)||(16378456-16378734)
chr3 (7-296)||(11958692-11958981)
chr3 (7-250)||(16327220-16327463)
chr3 (7-246)||(12272717-12272956)
chr3 (7-300)||(12509994-12510287)
chr3 (7-292)||(47126277-47126562)
chr3 (7-246)||(18131857-18132096)
chr3 (7-236)||(17494035-17494265)
chr3 (7-296)||(14575315-14575604)
chr3 (7-236)||(31692696-31692925)
chr3 (7-246)||(12358038-12358277)
chr3 (7-236)||(10408357-10408586)
chr3 (7-296)||(16825792-16826081)
chr3 (7-236)||(28756708-28756937)
chr3 (7-246)||(31941282-31941521)
chr3 (7-295)||(14291043-14291331)
chr3 (12-235)||(12180734-12180957)
chr3 (7-298)||(10417556-10417847)
chr3 (18-232)||(15229996-15230210)
chr3 (18-232)||(15235864-15236078)
chr3 (7-193)||(12858006-12858192)
chr3 (90-246)||(11949502-11949658)
chr3 (157-292)||(13969781-13969916)
chr3 (157-300)||(14088998-14089141)
chr3 (90-246)||(13318096-13318252)
chr3 (12-296)||(15261949-15262233)
chr3 (157-300)||(44779572-44779715)
chr3 (7-196)||(15065490-15065679)
chr3 (7-235)||(24185570-24185798)
chr3 (7-226)||(16638162-16638381)
chr3 (7-226)||(43165064-43165283)
chr3 (7-183)||(12889141-12889317)
chr3 (7-183)||(13255122-13255298)
chr3 (7-183)||(20059576-20059752)
chr3 (7-183)||(48427879-48428055)
chr3 (7-226)||(10007989-10008208)
chr3 (7-235)||(16694544-16694772)
chr3 (7-226)||(10908599-10908818)
chr3 (7-226)||(15713578-15713797)
chr3 (7-178)||(16754223-16754394)
chr3 (12-298)||(14578935-14579221)
chr3 (7-183)||(3688375-3688551)
chr3 (7-127)||(15358571-15358691)
chr3 (12-196)||(16804474-16804658)
chr3 (7-226)||(15400039-15400258)
chr3 (7-178)||(15586914-15587085)
chr3 (7-226)||(26790935-26791154)
chr3 (7-178)||(53382540-53382711)
chr3 (7-183)||(5422452-5422628)
chr3 (7-127)||(6603223-6603343)
chr3 (7-127)||(15345767-15345887)
chr3 (12-193)||(12843630-12843811)
chr3 (12-127)||(14874095-14874210)
chr3 (7-292)||(17492174-17492459)
chr3 (7-71)||(11949436-11949500)
chr3 (12-103)||(15013285-15013376)
chr3 (7-48)||(13318045-13318086)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (7-300)||(3456-3749)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (7-300)||(51604075-51604368)
chr4 (7-236)||(20892791-20893020)
chr4 (12-300)||(11204520-11204808)
chr4 (7-300)||(44659149-44659442)
chr4 (7-292)||(3262077-3262362)
chr4 (7-296)||(29450820-29451109)
chr4 (7-246)||(27903135-27903374)
chr4 (32-236)||(15258687-15258891)
chr4 (7-298)||(14993650-14993941)
chr4 (7-295)||(15073060-15073348)
chr4 (7-185)||(15354323-15354501)
chr4 (7-235)||(18224469-18224697)
chr4 (7-235)||(16250873-16251101)
chr4 (12-235)||(14696862-14697085)
chr4 (7-183)||(14162283-14162459)
chr4 (7-193)||(14683370-14683556)
chr4 (7-183)||(12479413-12479589)
chr4 (7-183)||(16234015-16234191)
chr4 (7-183)||(17092172-17092348)
chr4 (7-226)||(8389182-8389401)
chr4 (7-183)||(40475853-40476029)
chr4 (7-226)||(19634906-19635125)
chr4 (7-226)||(23958517-23958736)
chr4 (7-226)||(8050646-8050865)
chr4 (7-226)||(14301002-14301221)
chr4 (18-296)||(14188206-14188484)
chr4 (7-127)||(15144915-15145035)
chr4 (7-103)||(16150529-16150625)
chr4 (7-103)||(16154675-16154771)
chr4 (7-183)||(19775816-19775992)
chr4 (92-262)||(8708641-8708811)
chr4 (7-69)||(53750753-53750815)
chr4 (42-235)||(16218991-16219184)
chr4 (42-235)||(16222311-16222504)
chr4 (7-183)||(27714149-27714325)
chr4 (12-99)||(16063-16150)
chr4 (12-127)||(16350582-16350697)
chr4 (172-299)||(16150408-16150531)
chr4 (172-299)||(16154554-16154677)
chr4 (180-246)||(15356576-15356642)
chr4 (7-61)||(13513285-13513339)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (7-300)||(12576680-12576973)
chr2 (6-300)||(23097840-23098134)
chr2 (13-300)||(19716846-19717133)
chr2 (7-225)||(23273995-23274213)
chr2 (18-262)||(23113088-23113332)
chr2 (60-236)||(23279167-23279343)
chr2 (157-300)||(27790067-27790210)
chr2 (7-196)||(24657481-24657670)
chr2 (7-127)||(20848089-20848209)
chr2 (7-226)||(9337983-9338202)
chr2 (7-226)||(9486617-9486836)
chr2 (7-183)||(16983684-16983860)
chr2 (7-183)||(17001444-17001620)
chr2 (7-183)||(22323165-22323341)
chr2 (7-183)||(24712478-24712654)
chr2 (7-183)||(27220460-27220636)
chr2 (7-183)||(44383393-44383569)
chr2 (7-226)||(11351534-11351753)
chr2 (7-183)||(27373713-27373889)
chr2 (7-183)||(45673835-45674011)
chr2 (7-226)||(21142864-21143083)
chr2 (7-127)||(23105551-23105671)
chr2 (7-183)||(24677931-24678107)
chr2 (12-112)||(24817668-24817768)
chr2 (7-183)||(23074307-23074483)
chr2 (7-235)||(23204706-23204934)
chr2 (7-183)||(24874573-24874749)
chr2 (7-226)||(10871251-10871470)
chr2 (7-226)||(24705305-24705524)
chr2 (24-226)||(24264771-24264973)
chr2 (18-127)||(21323100-21323209)
chr2 (7-127)||(23029284-23029404)
chr2 (7-99)||(22733597-22733689)
chr2 (7-127)||(41606210-41606328)
chr2 (7-67)||(22742789-22742849)
chr2 (7-67)||(23064973-23065033)
chr2 (42-151)||(19817323-19817432)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (7-300)||(262951-263244)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (7-296)||(10072-10361)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (12-300)||(17266804-17267092)
chr5 (7-300)||(23078370-23078663)
chr5 (12-300)||(22505289-22505577)
chr5 (7-246)||(23563633-23563872)
chr5 (7-300)||(20344892-20345185)
chr5 (7-292)||(14884456-14884741)
chr5 (7-246)||(20778577-20778816)
chr5 (18-292)||(21983653-21983927)
chr5 (7-232)||(25850750-25850975)
chr5 (7-246)||(20824117-20824356)
chr5 (7-298)||(28892407-28892698)
chr5 (18-232)||(21561501-21561715)
chr5 (7-235)||(22464625-22464853)
chr5 (7-235)||(18781807-18782035)
chr5 (157-300)||(21676449-21676592)
chr5 (7-226)||(16359204-16359423)
chr5 (7-226)||(20803299-20803518)
chr5 (7-226)||(27521108-27521327)
chr5 (7-226)||(34569196-34569415)
chr5 (7-193)||(21882509-21882695)
chr5 (7-196)||(21342879-21343068)
chr5 (12-296)||(23473827-23474111)
chr5 (7-183)||(40711525-40711701)
chr5 (7-226)||(22137370-22137589)
chr5 (7-226)||(29473538-29473757)
chr5 (7-183)||(27613101-27613277)
chr5 (7-183)||(41773587-41773763)
chr5 (7-226)||(22330352-22330571)
chr5 (7-183)||(22350664-22350840)
chr5 (12-292)||(25429057-25429337)
chr5 (12-296)||(26736197-26736481)
chr5 (7-183)||(27665955-27666131)
chr5 (7-226)||(14997204-14997423)
chr5 (157-298)||(22233535-22233676)
chr5 (7-183)||(37288961-37289137)
chr5 (7-127)||(19772761-19772881)
chr5 (12-236)||(21336764-21336988)
chr5 (12-124)||(27682870-27682982)
chr5 (23-124)||(20311654-20311755)
chr5 (21-236)||(21409826-21410041)
chr5 (12-67)||(21631869-21631924)
chr5 (157-292)||(24796012-24796147)
chr5 (169-247)||(449-527)
chr5 (7-67)||(23460832-23460892)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (7-300)||(53709-54002)
scaffold0076 (157-300)||(31113-31256)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (7-300)||(65584-65877)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (7-298)||(21849-22140)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (7-300)||(120-413)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (12-300)||(24096975-24097263)
chr1 (7-300)||(20297123-20297416)
chr1 (7-236)||(22016100-22016329)
chr1 (7-246)||(19857070-19857309)
chr1 (22-292)||(38910196-38910466)
chr1 (7-300)||(31537352-31537645)
chr1 (7-292)||(48425623-48425908)
chr1 (7-292)||(52988491-52988776)
chr1 (7-246)||(20833255-20833494)
chr1 (7-298)||(21739391-21739682)
chr1 (7-236)||(12200324-12200553)
chr1 (7-296)||(21742907-21743196)
chr1 (7-236)||(37679855-37680084)
chr1 (7-298)||(20854115-20854406)
chr1 (12-296)||(16378809-16379093)
chr1 (7-235)||(17042370-17042598)
chr1 (7-196)||(24785212-24785401)
chr1 (7-220)||(51330847-51331060)
chr1 (7-183)||(16347950-16348126)
chr1 (21-127)||(18710300-18710406)
chr1 (7-178)||(19109201-19109372)
chr1 (7-183)||(21833130-21833306)
chr1 (7-183)||(33388384-33388560)
chr1 (7-127)||(20081731-20081851)
chr1 (7-178)||(41351023-41351194)
chr1 (7-127)||(21842096-21842216)
chr1 (7-101)||(22496611-22496705)
chr1 (7-69)||(20075064-20075126)
chr1 (218-296)||(41311272-41311350)
chr1 (105-235)||(21233184-21233314)
chr1 (24-70)||(21751988-21752034)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (12-298)||(14850-15136)
scaffold0074 (12-300)||(5838-6126)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (7-300)||(186-479)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (18-298)||(7471-7751)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (12-236)||(67399-67623)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (7-262)||(514639-514894)
scaffold0001 (12-110)||(441568-441666)
scaffold0001 (12-193)||(495852-496033)
scaffold0001 (157-298)||(452649-452790)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (7-286)||(22053639-22053918)
chr8 (12-300)||(22028011-22028299)
chr8 (7-300)||(31414258-31414551)
chr8 (7-300)||(16268950-16269243)
chr8 (7-292)||(28983681-28983966)
chr8 (7-292)||(29301152-29301437)
chr8 (7-292)||(28988900-28989185)
chr8 (7-232)||(27357366-27357591)
chr8 (7-292)||(21928198-21928483)
chr8 (7-295)||(19984947-19985235)
chr8 (7-295)||(22373636-22373924)
chr8 (18-292)||(20390856-20391130)
chr8 (7-235)||(32602972-32603200)
chr8 (7-235)||(22129343-22129571)
chr8 (7-235)||(30310870-30311098)
chr8 (18-235)||(22042654-22042871)
chr8 (7-183)||(17671748-17671924)
chr8 (7-183)||(19115279-19115455)
chr8 (7-226)||(22126685-22126904)
chr8 (157-300)||(31568720-31568862)
chr8 (7-235)||(15536210-15536438)
chr8 (7-183)||(20015989-20016165)
chr8 (7-183)||(22117901-22118077)
chr8 (12-235)||(22421623-22421846)
chr8 (12-193)||(22375185-22375365)
chr8 (12-193)||(22523415-22523596)
chr8 (7-127)||(18859512-18859632)
chr8 (7-126)||(21391587-21391706)
chr8 (7-126)||(21780913-21781032)
chr8 (7-126)||(21786081-21786200)
chr8 (12-235)||(22989872-22990095)
chr8 (7-101)||(21164264-21164358)
chr8 (7-112)||(21253895-21254000)
chr8 (7-127)||(19980902-19981022)
chr8 (7-178)||(19481798-19481969)
chr8 (7-196)||(22030969-22031158)
chr8 (24-193)||(22246176-22246345)
chr8 (24-113)||(22245758-22245847)
chr8 (157-246)||(21323155-21323244)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (18-296)||(8343-8621)
scaffold0420 (177-296)||(1374-1493)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (19-300)||(5443-5724)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (7-236)||(10766-10995)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (7-296)||(49466-49755)
scaffold0067 (7-296)||(58500-58789)
scaffold0067 (7-296)||(64888-65177)
scaffold0067 (7-300)||(29349-29642)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (7-300)||(251347-251640)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (7-298)||(773-1064)
scaffold0222 (7-229)||(20610-20832)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (7-298)||(2598-2889)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (12-246)||(98874-99108)
scaffold0020 (7-296)||(175717-176006)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (7-296)||(5135-5424)
scaffold0348 (7-300)||(17770-18062)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (7-300)||(8748-9040)
scaffold0235 (7-300)||(18962-19254)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (7-246)||(362-601)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (12-246)||(151346-151580)
scaffold0011 (12-235)||(23824-24047)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (7-296)||(42427-42716)
scaffold0102 (7-127)||(50631-50751)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (7-246)||(141-380)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (7-246)||(36718-36957)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (7-298)||(49832-50123)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (7-298)||(63805-64096)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (7-298)||(44713-45004)
scaffold0010 (7-236)||(39619-39848)
scaffold0010 (12-235)||(14214-14437)
scaffold0010 (12-296)||(4644-4928)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (7-300)||(11534-11827)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (7-292)||(11693-11978)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (7-236)||(60528-60757)
scaffold0046 (157-296)||(79267-79406)
scaffold0046 (7-54)||(70079-70126)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (7-246)||(10058-10297)
scaffold0243 (12-296)||(24236-24520)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (7-226)||(919-1138)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (7-246)||(110389-110628)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (7-245)||(6818-7056)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (7-296)||(39787-40076)
scaffold0114 (7-172)||(17635-17799)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (7-196)||(1169-1358)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (23-296)||(30628-30894)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (7-298)||(49163-49454)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (7-246)||(325486-325725)
scaffold0004 (18-292)||(200765-201039)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (18-292)||(11563-11837)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (135-300)||(1-166)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (18-230)||(1608-1820)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (7-298)||(43705-43996)
scaffold0104 (33-300)||(24941-25208)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (12-246)||(5500-5734)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (7-236)||(53836-54065)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (7-232)||(41528-41753)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (7-295)||(1558-1846)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (12-196)||(1145-1329)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (7-295)||(28571-28859)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (21-236)||(9527-9741)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (7-298)||(25839-26130)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (7-160)||(203246-203399)
scaffold0003 (7-67)||(424266-424326)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (7-246)||(2238-2478)
scaffold0034 (7-246)||(70151-70390)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (7-290)||(5337-5620)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (7-250)||(29709-29952)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (12-246)||(998-1224)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (7-236)||(4970-5199)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (7-295)||(29257-29545)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (21-300)||(34062-34341)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (18-292)||(4386-4660)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (90-246)||(5530-5686)
scaffold0035 (7-141)||(5689-5823)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (21-225)||(164701-164905)
scaffold0023 (7-133)||(151973-152099)
scaffold0023 (7-78)||(30860-30931)
scaffold0023 (12-127)||(47274-47388)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (7-219)||(20814-21024)
scaffold0261 (12-219)||(12639-12844)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (18-229)||(4186-4397)
scaffold0130 (7-127)||(8065-8187)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (96-298)||(3445-3647)
scaffold0079 (7-226)||(36297-36516)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (12-295)||(54367-54650)
scaffold0080 (7-235)||(10524-10752)
scaffold0080 (7-235)||(13179-13407)
scaffold0080 (12-193)||(31715-31896)
scaffold0080 (12-193)||(37181-37362)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (7-181)||(1565-1739)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (7-196)||(17352-17541)
scaffold0017 (12-236)||(24095-24319)
scaffold0017 (33-100)||(195150-195217)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (7-226)||(29214-29433)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (7-159)||(12593-12745)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (7-142)||(1101-1236)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (7-226)||(22046-22265)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (12-295)||(26082-26365)
scaffold0042 (7-101)||(37106-37200)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (12-298)||(15270-15556)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (7-228)||(11642-11863)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (7-196)||(16989-17178)
scaffold0044 (7-226)||(3223-3442)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (7-235)||(13410-13638)
scaffold0109 (7-183)||(40997-41173)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (12-228)||(23589-23805)
scaffold0018 (12-112)||(9642-9742)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (7-226)||(1318-1537)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (12-295)||(4818-5101)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (12-235)||(13770-13993)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (12-235)||(6663-6886)
scaffold0270 (12-235)||(13793-14016)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (7-226)||(11268-11487)
scaffold0028 (7-226)||(17736-17955)
scaffold0028 (33-226)||(53526-53719)
scaffold0028 (157-246)||(47950-48039)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (12-234)||(216711-216933)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (7-172)||(8803-8968)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (7-296)||(18379-18668)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (7-183)||(10210-10386)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (12-296)||(14557-14841)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (7-183)||(24998-25174)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (7-172)||(2549-2714)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (7-127)||(39-159)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (7-235)||(8048-8276)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (162-246)||(19075-19159)
scaffold0077 (24-133)||(57917-58026)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (12-296)||(17607-17891)
scaffold0040 (24-295)||(111210-111481)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (136-292)||(51545-51701)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (12-178)||(10449-10615)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (168-246)||(5521-5599)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (7-112)||(11166-11271)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (12-193)||(12495-12676)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (12-193)||(15254-15435)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (7-99)||(8336-8428)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (7-183)||(8065-8241)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (7-127)||(35001-35121)
scaffold0022 (34-235)||(41422-41623)
scaffold0022 (34-235)||(75142-75343)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (12-235)||(4224-4447)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (157-300)||(80-223)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (7-196)||(766-955)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (7-112)||(664-769)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (92-229)||(1218-1355)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (139-292)||(4668-4821)
scaffold0335 (7-77)||(4590-4660)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (157-246)||(921-1010)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (12-112)||(1902-2002)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (12-296)||(103956-104240)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (7-70)||(6543-6606)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (21-297)||(21485-21763)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (7-183)||(3443-3619)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (7-183)||(13926-14102)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (12-99)||(55761-55848)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (12-278)||(1746-2012)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (157-295)||(114474-114612)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (12-183)||(4425-4596)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (7-78)||(7183-7254)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (13-127)||(21502-21616)
scaffold0081 (13-127)||(36926-37040)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (7-112)||(895-1000)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (18-99)||(8036-8117)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (7-63)||(14873-14929)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (12-76)||(40798-40862)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (7-77)||(1055-1125)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (186-292)||(23053-23159)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (33-151)||(83833-83951)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (7-64)||(1-58)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (218-295)||(16503-16580)


Alignment Details
Target: scaffold0090 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21869 - 21576
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21869 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgttcggtaggga 21770  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21769 ttttgaggtagacttagtttgtttaccgctgacgggaatggatgttatttttgggattaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttaac 21670  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21669 aagaccgtgcatttttcttctgctgaagaagagggtggagttgaattttttactacgaaagagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 21576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18797543 - 18797250
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18797543 ctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtttcctatatctatgtttggtaggga 18797444  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  18797443 ttttgaggtagacttagtgtgtttaccgctgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaactgctttagc 18797344  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797343 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaagagggtggagttgaatttttgactacgaaacagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 18797250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 34643014 - 34643307
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34643014 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtaggga 34643113  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  34643114 ttttgaagtagacctagtttgcttacctttgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttaat 34643213  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  34643214 aagactgtacatttttcttctgctgaagaagagagtggagttgagattttaactacgaaagagatgaagcaactagaacgagacgggattctga 34643307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 300
Target Start/End: Original strand, 21567418 - 21567712
Alignment:
Q  6 actgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggg 105  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21567418 actgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 21567517  T
Q  106 attttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaa 205  Q
    ||||||  || || ||||| ||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  21567518 attttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgtcatttttggaatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 21567617  T
Q  206 caagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21567618 taagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagggtggagttgaattcttgaccacgaagcagatgaagcagttaaaacgtgatggaattctga 21567712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Original strand, 10466276 - 10466565
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  10466276 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctatgtttggtaggga 10466375  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||  || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  10466376 ctttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggataaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagt 10466475  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10466476 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacaaaacagatgaaacagctggaacgtgatggaatt 10466565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 14377344 - 14377637
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||    
T  14377344 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 14377443  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     || ||||| || |||||||| ||  || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  14377444 cttcgaagtcgacttagtttgtttgtcgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagt 14377543  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14377544 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatggaattctga 14377637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19455876 - 19455637
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||| |  | |||||||||||||| ||    
T  19455876 ctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctatgtttggtagaga 19455777  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  19455776 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 19455677  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  19455676 aagacggtgcatttttcttcttcttaagaagagagtggag 19455637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21474438 - 21474169
Alignment:
Q  22 aaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagattt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||||||||||| || |||||||| ||| |    
T  21474438 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatct 21474339  T
Q  122 agtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttt 221  Q
     || || ||  || ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||  ||||| || ||||||    
T  21474338 tgtatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgttttagtaagacggtacatttt 21474239  T
Q  222 tcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatg 291  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21474238 tcttctgctgaggaagaaggtgaagttgagttgttgactactaaatagatgaagcagctagaacgtgatg 21474169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24367253 - 24366960
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  24367253 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatctttggtagaga 24367154  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||     
T  24367153 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttcacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtttaatcgagtccatatcaactgctataat 24367054  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||  || || |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  24367053 aagacggtgcatttctcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagcttctgtctacaaaacagatgaaacagtttgaacgtgatggaattctga 24366960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19437855 - 19437616
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||  | | |||||||| ||| ||    
T  19437855 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtttatgtttgttagaga 19437756  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| || ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  19437755 ctttgaagtcgacttagtttgttttcctttgactggtatggatgttatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 19437656  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  19437655 aagacggtgcatttttcttctgtggaagaagagggtggag 19437616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 24515842 - 24516081
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  24515842 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 24515941  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| |||| || |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  24515942 ctttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacgggaatggacattatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 24516041  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  24516042 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 24516081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15462189 - 15461969
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  15462189 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttatctatgtttggtagaga 15462090  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| || || ||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||  | ||||||    
T  15462089 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttatcttcgggatgaattggttagaatataaccgagtttgtattaattgttttaac 15461990  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttct 227  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  15461989 aagacggtgcatttttcttct 15461969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25770697 - 25770409
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  25770697 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 25770598  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||  | || || || ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    ||||      
T  25770597 ctttgaagttgaccttgtatgtttgccattgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattattttagt 25770498  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||| || |||||||| ||  || |||||||| |||||||  |||||||    
T  25770497 aagacaatacatttttcttctgctgaggaagagagtgaagttgacttattgactactaaatagttgaagcagttagaacgatatggaat 25770409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Original strand, 19486734 - 19487003
Alignment:
Q  19 gagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtaga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19486734 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttga 19486833  T
Q  119 tttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcat 218  Q
    | |||| || || |  |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  | ||||  |||||  |||||    
T  19486834 tctagtatgtttgc--ctgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatgaattgttttagtaagacgatgcat 19486931  T
Q  219 ttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgat 290  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||  || ||| || |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||    
T  19486932 ttttcttctgctgaggaagatagtaaagctgatttcttgactactaaacagctgaagcagttagaacgtgat 19487003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 16925068 - 16925287
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16925068 ctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctatgtttggtcgtga 16925167  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | ||||||||||| || ||  |||  || ||||| || ||  |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  16925168 ttttgaaatggatttagtttgtttgcctttgagtggtatggacgtcatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 16925267  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| ||||| |||| |||||    
T  16925268 aagtcagtgtatttctcttc 16925287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 27559397 - 27559616
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||| | ||    
T  27559397 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27559496  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  |||   |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  27559497 ttttgaaatggatttagtttgtctacttttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 27559596  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| ||||| |||| |||||    
T  27559597 aagtcagtgtatttctcttc 27559616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 29589867 - 29590086
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  29589867 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 29589966  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  29589967 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 29590066  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  29590067 aagtcagtgcatttctcttc 29590086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 23085258 - 23085373
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23085258 atgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttg 23085357  T
Q  112 aagtagatttagtttg 127  Q
    || | ||||| |||||    
T  23085358 aaattgatttggtttg 23085373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16574743 - 16574567
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16574743 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16574644  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||| ||| | |||||||||||| ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16574643 tttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 16574567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 16620637 - 16620813
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16620637 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16620736  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||| ||| | |||||||||||| ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16620737 tttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 16620813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 2872230 - 2872449
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  2872230 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 2872329  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  2872330 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 2872429  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  2872430 aagtcagtgcatttctcttc 2872449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25115405 - 25115186
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  25115405 ctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 25115306  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  25115305 ttttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 25115206  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  25115205 aagtcagtgcatttctcttc 25115186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 28260625 - 28260796
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  28260625 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 28260724  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  28260725 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagta 28260796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28285291 - 28285120
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  28285291 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 28285192  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  28285191 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagta 28285120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28312483 - 28312312
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  28312483 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 28312384  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  28312383 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 28312312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 28339374 - 28339545
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  28339374 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 28339473  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  28339474 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagta 28339545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 18182800 - 18183084
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| | | |||||| ||||| | |||||||    
T  18182800 atgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgcttggtcgagattttg 18182899  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | |||    |||| |||||  ||   || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||    ||||  ||| |    
T  18182900 aaattgatacgttttgtttacctttgtgtggaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattattttagtaagtc 18182999  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |  ||||||  || || ||| |||| ||| || |||||||  ||| |||||||||||||    
T  18183000 agtgtacttttcttctgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagtagctgaagcaattaggacgtgatggaatt 18183084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 18405372 - 18405665
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||| | | ||    
T  18405372 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctatgtttgattgtga 18405471  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| |  |||| |||||  | ||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || |   | ||||      
T  18405472 ttttgaaattaatttggtttgtctgcctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagt 18405571  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||  ||||| |||| ||||||||||||||  |  |||| |   | |||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18405572 aaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattctga 18405665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23081265 - 23081105
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | |||| |||| | |    
T  23081265 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattatgaaattg 23081166  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    | || ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  23081165 acttggtttgtttacctttgattggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 23081105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 24293210 - 24293386
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  24293210 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24293309  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    |||  || | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  24293310 tttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 24293386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 5836656 - 5836827
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||  |||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  5836656 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactaccactctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtga 5836755  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||||| | |||||||||||  | ||  |||  || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  5836756 ttttgaaatggatttagtttgtctccctttgagcggtatggatgttattcttggtaggaattggttagagta 5836827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22436722 - 22436536
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  ||| || | |||||||||||| | ||    
T  22436722 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtga 22436623  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    ||||||  | ||| | |||||||| ||  |||  || ||||  || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22436622 ttttgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatgggcgtcattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 22436536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27190272 - 27190118
Alignment:
Q  24 atggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttag 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||| |||||| | ||||||||| | |||||||    
T  27190272 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttag 27190173  T
Q  124 tttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  27190172 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 27190118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Original strand, 27258968 - 27259122
Alignment:
Q  24 atggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttag 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||| |||||| | ||||||||| | |||||||    
T  27258968 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttag 27259067  T
Q  124 tttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  27259068 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 27259122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 102
Target Start/End: Original strand, 20010887 - 20010977
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggta 102  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| |||||||    
T  20010887 atgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatttttggta 20010977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Original strand, 30678466 - 30678706
Alignment:
Q  21 gaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatt 120  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| ||| |||| |  | || ||||||||| | || |||||||| ||||    
T  30678466 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgatgtttggtcgagactttgaagttgatt 30678565  T
Q  121 tagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcattt 220  Q
    |||| || || ||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  | ||||  |||| | |||||||    
T  30678566 tagtctgttttcctttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaattggttggagtataaccatgttcacattaattgttttagtaaga-aatgcattt 30678664  T
Q  221 ttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactac 262  Q
    |||||||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||    
T  30678665 ttcttctgctgaagaagagagtgaagctgagttcttgactac 30678706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19867523 - 19867420
Alignment:
Q  24 atggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttag 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||| ||  | |||||||    
T  19867523 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttag 19867424  T
Q  124 tttg 127  Q
    ||||    
T  19867423 tttg 19867420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 19466021 - 19465973
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagt 55  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19466021 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 19465973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 298
Target Start/End: Original strand, 8761332 - 8761473
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||| || ||||||  || || ||    
T  8761332 ttggtatgaactggttggagtataaccatgtccatatcaattgctttagcaagacggtgcaattttcttctgcgaaagaagagagtggagcagagttctt 8761431  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
     ||||| ||  || |||||||| | || ||||||||||||||    
T  8761432 aactactaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaattct 8761473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 22827848 - 22828002
Alignment:
Q  72 tgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggt 171  Q
    |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || |||||||| |    
T  22827848 tgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattgct 22827947  T
Q  172 tagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |||| |||||||||| |||||    
T  22827948 tagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttc 22828002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 115580 - 115287
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  115580 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatctatgtttggtaggga 115481  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  115480 ttttgaagtagatttagtttgcttaccactgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgcttcaac 115381  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  115380 aagaccgtgcatttttcttctgccgaagaagagagtggagttgagattttatctacgaaagagatgaagcagctagaacgagatgggattctga 115287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 94180 - 94471
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  94180 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 94279  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||  | ||||||    
T  94280 ttttgaagtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagaatataaccgagtctgtattaattgttttaac 94379  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||||| || |||| |  || ||| | ||||| ||  || |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  94380 aagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggggcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatggaattct 94471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 18051223 - 18051516
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  18051223 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 18051322  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18051323 ttttgaagtagatttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 18051422  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18051423 aagactgtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagttgaaattttatctacaaagcagatgaagcagttagaacgtgatggaattctga 18051516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 11385704 - 11385992
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11385704 atgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 11385803  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    | ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  11385804 aggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttaatatcaactgctttagcaagac 11385903  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11385904 ggtgcatttttcttctgctgaagaagagggtggagttgaattcttgactacgaaacatatgaagcagttagaacgtgatggaattctga 11385992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14140658 - 14140369
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14140658 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 14140559  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  14140558 ttttgaggtagacttagtctgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaaatggttagagtataaccgagttcatatcaactgttttagt 14140459  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14140458 aagacggtacatttttcttctgctgaagaagagggtggagttgagttcttgaatacaaagcagatgaagcagttagaacgtgatggaatt 14140369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 14283644 - 14283937
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14283644 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 14283743  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  14283744 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcagctgctttagt 14283843  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14283844 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagggtggagttgagttcttgactacgaaacatatgaagcagtttgaacgtgatggaattctga 14283937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15343410 - 15343117
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15343410 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 15343311  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||      
T  15343310 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacattatttttggaatgaattggttagagtataacagagttcatatcaattgctttagt 15343211  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15343210 aagacggtacatttttcttctgctgaagaagagggtggagttgagttcttgactacgaaacagatgaagcagttagaacatgatggaattctga 15343117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13024324 - 13024031
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  13024324 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtaggga 13024225  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||   || || ||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  13024224 ttttttggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 13024125  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| || ||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13024124 aagacggtgcatttttcttctgcttaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacagctagaacgggatggaattctga 13024031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 16947742 - 16948035
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  16947742 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 16947841  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  16947842 ctttgtagtcgacttagtttgcttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 16947941  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |  | ||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16947942 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagtttagctcttgtctacaaaatagatgaaacagctagaacgtgatggaattctga 16948035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12459607 - 12459316
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  12459607 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctatgtttggtagaga 12459508  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||  || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||      
T  12459507 ctttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgggttcatatcaactgctttagt 12459408  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  | ||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12459407 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagatattgtctacaaaacagatgaaacagctagaacgggacggaattct 12459316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21755377 - 21755098
Alignment:
Q  21 gaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatt 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||    
T  21755377 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtggttgatt 21755278  T
Q  121 tagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcattt 220  Q
    |||||||  | ||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||  |||||||    
T  21755277 tagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcacatcaactgctatagtaagacgatgcattt 21755178  T
Q  221 ttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  21755177 ttcttctgttgaagaagagggtgaagttgaacttttgtctacaaaacagatgaaacagtttgaacgtgatggaattctga 21755098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13676430 - 13676191
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  13676430 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 13676331  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  13676330 ctttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 13676231  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  13676230 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 13676191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 15099873 - 15100166
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||    
T  15099873 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 15099972  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15099973 ctttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 15100072  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||  |  |||| ||  || |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  15100073 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagctgagttcctatctactaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaattctga 15100166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19149990 - 19149699
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  19149990 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 19149891  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||||||  || |||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||      
T  19149890 ctttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 19149791  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||| || ||| || ||| || |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19149790 aagacgatacatttttcttctgctgaagaagagagtgaagctgagttcttgactacgaaacagttgaagcagttagaacgtgatggaattct 19149699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20749389 - 20749098
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  20749389 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 20749290  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||||||  || |||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||      
T  20749289 ctttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 20749190  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||| || ||| || ||| || |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20749189 aagacgatacatttttcttctgctgaagaagagagtgaagctgagttcttgactacgaaacagttgaagcagttagaacgtgatggaattct 20749098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 26092068 - 26092353
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26092068 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 26092167  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  26092168 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 26092267  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||  || || |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||    
T  26092268 aagacggtacatttctcttctgctgaagaagaaggtgaggttgagcttctgtctacgaaacagatgaaacagtttgaacgtgatgg 26092353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 26115860 - 26116153
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26115860 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 26115959  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||     
T  26115960 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtttaatcgagtccatatcaactgctataat 26116059  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||  || || |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  26116060 aagacggtgcatttctcttctgctgaagaagaaggtgaggttgagcttctgtctacaaaacagatgaaacagtttgaacgtgatggaattctga 26116153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 49155280 - 49154995
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  49155280 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagaga 49155181  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  49155180 ttttgtgattgatttggtttgcctgccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 49155081  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||  || || |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||    
T  49155080 aagacggtacatttctcttctgctgaagaagaaggtgaggttgagcttctgtctacgaaacagatgaaacagtttgaacgtgatgg 49154995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 13965938 - 13966231
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13965938 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 13966037  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||  || |||||||||||  | ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||      
T  13966038 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattagttagaatataatcgagttcatatcaactgctatagt 13966137  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||  ||||| ||| || |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  13966138 aagacggtgcatttttcttctactgaggaagaaggtgaggttgagtttctgtctacaaaacagatgaaacagtttgaacgtgatggaattctga 13966231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 12798771 - 12799064
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || ||||   | |||||||||||||| ||    
T  12798771 ctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtctaagttgtctgttgtctatgtttggtagaga 12798870  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| |||| || || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||       
T  12798871 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttggt 12798970  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||  | ||||||||  || |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  12798971 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagttgagttcctaactacgaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaattctga 12799064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 232
Target Start/End: Original strand, 40925087 - 40925312
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40925087 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtaggga 40925186  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  40925187 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagt 40925286  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctga 232  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||    
T  40925287 aagacggtacatttctcttctgctga 40925312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 14261516 - 14261806
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  14261516 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 14261615  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
      ||||||| ||| |||| ||  | ||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||      
T  14261616 -attgaagtcgatctagtatgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtattcatattaattgctttagt 14261714  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| || | | || ||| || |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14261715 aagacggtgcatttttcttctgctgaggaagagagcgaagctgagttcttgactacaaaacagttgaagcagttagaacgtgatgaaattct 14261806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Original strand, 12204081 - 12204259
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||  |    
T  12204081 ggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagatg 12204180  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 196  Q
    || | || || || | | | ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12204181 atcttgtgtgtttgctgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatcaa 12204259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14957532 - 14957304
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  14957532 ctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 14957433  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||  | |||| |    
T  14957432 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 14957333  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| || |||||    
T  14957332 aagtcagtgtatttctcttccgccgaaga 14957304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19615504 - 19615361
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||    
T  19615504 ttggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaaatggagttgaaatttt 19615405  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19615404 gactacgaaagagatgaagcagctagaacgagatgggattctga 19615361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 17703747 - 17703975
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  17703747 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17703846  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||| || ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  17703847 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagc 17703946  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  17703947 aagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 17703975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8201026 - 8200807
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  8201026 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 8200927  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  8200926 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 8200827  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  8200826 aagtcagtgcatttctcttc 8200807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9591342 - 9591118
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||    
T  9591342 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtga 9591243  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | ||||||||    |||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||  | |||| |    
T  9591242 ttttgaaatggatttagt----ttacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgtacatatcaattgttttagc 9591147  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| || || |||| ||||| ||||||||    
T  9591146 aagtcaatgtatttctcttccgctgaaga 9591118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873449
Alignment:
Q  13 tgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttga 112  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 10873563  T
Q  113 agtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagaca 212  Q
    | | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |||| ||    
T  10873562 aatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtca 10873463  T
Q  213 gtgcatttttcttc 226  Q
    |||||||| |||||    
T  10873462 gtgcatttctcttc 10873449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12690468 - 12690251
Alignment:
Q  19 gagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtaga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||||||||| | ||    
T  12690468 gagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 12690369  T
Q  119 tttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcat 218  Q
    |||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| || |  |||||||| ||  | |||| |||| ||||| ||    
T  12690368 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaagcatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtat 12690269  T
Q  219 ttttcttctgctgaagaa 236  Q
    || ||||| || ||||||    
T  12690268 ttctcttccgccgaagaa 12690251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14335374 - 14335198
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  14335374 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 14335275  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  14335274 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 14335198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18180721 - 18180545
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  18180721 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18180622  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  18180621 ttttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 18180545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 44788643 - 44788819
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  44788643 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 44788742  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  44788743 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 44788819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 11550394 - 11550580
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  11550394 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 11550493  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  11550494 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatat 11550580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 300
Target Start/End: Original strand, 16069683 - 16069860
Alignment:
Q  123 gtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcattttt 222  Q
    ||||| |||||  ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||    
T  16069683 gtttgtttaccattgacgtgtatggatgtagtttttgggatgaattggttagagtataactgagttcatattaattgctttagtaagacggtgcattttt 16069782  T
Q  223 cttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||  | ||||  ||  || |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  16069783 cttctgctgaagaagagagtggagctgagttcctaactaataaacagttgaagcagttggagcgtgatggaattctga 16069860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 11234505 - 11234724
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  11234505 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 11234604  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  11234605 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 11234704  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  11234705 aagtcagtgcatttctcttc 11234724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13689019 - 13688800
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  13689019 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 13688920  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  13688919 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 13688820  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  13688819 aagtcagtgcatttctcttc 13688800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8710583 - 8710407
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  8710583 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 8710484  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  8710483 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 8710407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 18587463 - 18587634
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  18587463 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18587562  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  18587563 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 18587634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 15158349 - 15158568
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  15158349 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15158448  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||  || | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  15158449 tttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 15158548  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  15158549 aagtcagtgcatttctcttc 15158568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 15146220 - 15146307
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 99  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||  |||||| ||||||||||||    
T  15146220 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgtttg 15146307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15627476 - 15627218
Alignment:
Q  33 gaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttac 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||| || |  | ||||||||| | || |||||| | ||||||||||| || |    
T  15627476 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgc 15627377  T
Q  133 cgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctga 232  Q
       |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  | ||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||    
T  15627376 atttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataagtcggtgtatttttcttctgcgga 15627277  T
Q  233 agaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatg 291  Q
    |||| || ||||||  || || || ||||| ||| || |||||| | |||| |||||||    
T  15627276 agaagagagtggagcggagttcttaactactaagcagctgaagctgttagagcgtgatg 15627218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14042662 - 14042581
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 99  Q
    ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  || |||||| | ||||||||||    
T  14042662 ggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttg 14042581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14352692 - 14352611
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 99  Q
    ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  || |||||| | ||||||||||    
T  14352692 ggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttg 14352611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 831 - 1124
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  831 ctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctatgtttggtaggga 930  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  931 ttttgaggtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgtcatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaactactttagc 1030  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1031 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaagagggtggagttgaattcttgactacgaaacagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10799 - 10515
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||||||||||| | |||||||    
T  10799 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctatgtttggtcgtgattttg 10700  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||||||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||  | ||||  ||| |    
T  10699 aaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtc 10600  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    |||| |||| |||||||| |||||  |  || | || || |||||| |||| ||| || |||||||| | |||| ||||||||||    
T  10599 agtgtatttctcttctgcggaagaggaaagtagcgtagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacctgatggaatt 10515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17188992 - 17188699
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17188992 ctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 17188893  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17188892 ttttgaagtagacttagtttgtttactgctgacgggaatagatgttatttttagaatgaattggttagaatataaccgagttcatatcaactgctttagc 17188793  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17188792 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagggtggagttgaattcttgactacgaaacagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 17188699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 8744901 - 8745194
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  8744901 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 8745000  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  8745001 ttttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaattgctttaac 8745100  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8745101 aagactgtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagttgaaattttatctacaaagcagatgaagcagttagaacgtgatggaattctga 8745194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24189922 - 24189629
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24189922 ctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 24189823  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  24189822 ttttgaggtagacttagtttttttaccgctgacgggaatggatgttatttttggaatgaattggttagaatataaccgagttcatatcaactgctttagc 24189723  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24189722 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagggtggagttgaattcttgactacgaaacagaagaagcagctagaacgtgacggaattctga 24189629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13944631 - 13944349
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13944631 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtag 13944532  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  13944531 acttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagactgtgca 13944432  T
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13944431 tttttcttctgctgaagaagagagtggagttgaaattttatctacaaagcagatgaagcagttagaacgggatggaattctga 13944349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 293
Target Start/End: Original strand, 16832039 - 16832325
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16832039 ctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 16832138  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  16832139 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 16832238  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgga 293  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16832239 aagacggtacatttttcttctgctgaagaagagggtggagttgagttcttgactacgaagcagatgaagcagttagaacgtgatgga 16832325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Original strand, 16378456 - 16378734
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16378456 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatatctatgtttggtagagattttgaggtag 16378555  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    | |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| || ||    
T  16378556 acttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgttttagtaagacggtaca 16378655  T
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16378656 tttttcttctgctgaagaagagggtgaagttgagttcttgaatacaaagcaaatgaagcagttagaacgtgatggaatt 16378734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Original strand, 11958692 - 11958981
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11958692 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 11958791  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||  || ||||||||||| ||  || || |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||      
T  11958792 ctttgtggttgatttagtttgtttgtcgttgtcgggtatggatgttattttcggtatgaattggttagagtataatccagttcatatcaactgctttagt 11958891  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11958892 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacaaaacagatgaaacagctagaacgtgatggaatt 11958981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 16327220 - 16327463
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16327220 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 16327319  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| |  || |||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  16327320 tttcgtggttgatttagtttgcttgccgttgtcgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagt 16327419  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttga 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  16327420 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttga 16327463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12272956 - 12272717
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  12272956 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagaga 12272857  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  12272856 ctttgaagtcgatctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 12272757  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12272756 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggag 12272717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 12509994 - 12510287
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  |||||  || |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12509994 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttggggtgtcttatatctatgtttggtagaga 12510093  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||  || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      
T  12510094 ttttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctatagt 12510193  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| || ||||| |||| ||| ||||||| ||| | ||||| || || |||||||    
T  12510194 aagacagtgcatttttcttctactgaagaagaaggtgaagtttaacttttgtctacaaagcagatgaaacagtttgaacgggacgggattctga 12510287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47126562 - 47126277
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47126562 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 47126463  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||| | | |||||||||||  | ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  47126462 ttttgtaattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 47126363  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||  || || |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||    
T  47126362 aagacggtacatttctcttctgctgaagaagaaggtgaggttgagcttctgtctacgaaacagatgaaacagtttgaacgtgatgg 47126277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 18131857 - 18132096
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||    
T  18131857 ctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 18131956  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     | |||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  18131957 ctatgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggtatggatgttattttttggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 18132056  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  18132057 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 18132096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17494265 - 17494035
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaa-ctccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggg 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | || |||||  | |||||||||||||| |    
T  17494265 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 17494166  T
Q  106 attttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaa 205  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  17494165 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatgtatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 17494066  T
Q  206 caagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17494065 caagacggtggatttttcttctgctgaagaa 17494035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14575604 - 14575315
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  14575604 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 14575505  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| || ||| ||  ||||||      
T  14575504 ctttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttggaatgaactggttagattataaccgagctcgtattaattgctttagt 14575405  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||| || ||| || |||||||||||  || |||||||| | || ||||||||||||    
T  14575404 aagacgatgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagctgagttcttgactacgaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaatt 14575315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 31692696 - 31692925
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  31692696 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 31692795  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  31692796 ctttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactgattagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 31692895  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31692896 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaa 31692925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 12358038 - 12358277
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  12358038 ctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 12358137  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  12358138 ctttgaagtcgacttagtttgtttagcgttgacgggtatggatgttatttttgcgatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 12358237  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    || || ||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  12358238 aaaacggtgcatttttcttctacggaagaagagagtggag 12358277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10408586 - 10408357
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10408586 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 10408487  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||      
T  10408486 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgggttcatatcaactgctttagt 10408387  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  10408386 aagacggtacatttctcttctgctgaagaa 10408357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Original strand, 16825792 - 16826081
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||  | |||||  ||||||| ||    
T  16825792 ctgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctataattggtagaga 16825891  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  16825892 ctttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 16825991  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||  | ||||| ||  || |||||| | ||||| |||||||||||    
T  16825992 aagacgatgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagctgagttcctaactactaaacagttgaagcggttagaatgtgatggaatt 16826081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28756937 - 28756708
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28756937 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctatgtttggtagaga 28756838  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  28756837 ttttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagt 28756738  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  28756737 aagacggtacatttctcttctgctgaagaa 28756708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31941521 - 31941282
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||  | ||||||||||| || ||    
T  31941521 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgcccgttgtctatgtttggcagaga 31941422  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |    
T  31941421 ctttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatataaattgttttagc 31941322  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  31941321 aagacagtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 31941282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Original strand, 14291043 - 14291331
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  14291043 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 14291142  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| | || || || ||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||      
T  14291143 ctttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccatgttcatattaattgctttagt 14291242  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
    ||||| ||||||||||||  || ||||||| || ||| || ||| || |||||||| ||  |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  14291243 aagacggtgcatttttctcttgttgaagaagagagtgaagctgagttcttgactactaaacaattgaagcagttagaacgtgatggaat 14291331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12180957 - 12180734
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||  | |||||||||||||| || ||||    
T  12180957 atgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 12180858  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |||| || |||||||  |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||    
T  12180857 aagtcgacttagtttctttaccgttgacgggtatggttgttatctttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcagaac 12180758  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
     |||| ||||||||||||||||||    
T  12180757 ggtgcttttttcttctgctgaaga 12180734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 10417556 - 10417847
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  10417556 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 10417655  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| || || || ||||| ||  ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||  | ||||||    
T  10417656 tttcgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataactgagtttgtattaattgttttaac 10417755  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||||| || ||||||  || ||| | ||||| ||  || |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  10417756 aagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatggaattct 10417847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15230210 - 15229996
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  15230210 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttgaagttg 15230111  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    || | || || || ||| | ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  ||||| || ||    
T  15230110 atcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaactagttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacggtaca 15230011  T
Q  218 tttttcttctgctga 232  Q
    |||||||||||||||    
T  15230010 tttttcttctgctga 15229996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15236078 - 15235864
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  15236078 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttgaagttg 15235979  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    || | || || || ||| | ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  ||||| || ||    
T  15235978 atcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaactagttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacggtaca 15235879  T
Q  218 tttttcttctgctga 232  Q
    |||||||||||||||    
T  15235878 tttttcttctgctga 15235864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 12858006 - 12858192
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  12858006 ctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagtga 12858105  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
     |||||||| ||| | || || || ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12858106 ctttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatat 12858192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 246
Target Start/End: Original strand, 11949502 - 11949658
Alignment:
Q  90 tctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttc 189  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11949502 tctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgatgggaatggatgttatttttgcgatgaactggttcgagtataaccgagttc 11949601  T
Q  190 atatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    |||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  11949602 atatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 11949658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 292
Target Start/End: Original strand, 13969781 - 13969916
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| ||||    
T  13969781 ttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgctttaacaagacagtgcatttttcttccgccgaagaagagagtggagttgaaatttt 13969880  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13969881 gactacgaaagagatgaagcagctagaacgagatgg 13969916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14089141 - 14088998
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||    
T  14089141 ttggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaaatggagttgaaatttt 14089042  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14089041 gactacgaaagagatgaagcagctagaacgagatgggattctga 14088998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 246
Target Start/End: Original strand, 13318096 - 13318252
Alignment:
Q  90 tctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttc 189  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| | || ||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318096 tctatgtttggtagagattttgaggttgatcttgtatgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttc 13318195  T
Q  190 atatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    |||| ||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  13318196 atataaattgttttaacaagacggtgtatttttcttctgcggaagaagagagtggag 13318252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15262233 - 15261949
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  15262233 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttg 15262134  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  ||||  |||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  15262133 aaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtgtgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 15262034  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |  |||| |  || |||||| |||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  15262033 agtgtatttttcttctactgaagaagaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatt 15261949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44779715 - 44779572
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||    
T  44779715 ttggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaaatggagttgaaatttt 44779616  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
      |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44779615 atctacaaagcagatgaagcagttagaacgtgatggaattctga 44779572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15065679 - 15065490
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  15065679 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15065580  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 196  Q
    ||||||  | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15065579 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaa 15065490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24185798 - 24185570
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  24185798 ctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24185699  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||  | |||| |    
T  24185698 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 24185599  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| || |||||    
T  24185598 aagtcagtgtatttctcttccgccgaaga 24185570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16638381 - 16638162
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16638381 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16638282  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  16638281 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 16638182  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  16638181 aagtcagtgcatttctcttc 16638162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43165283 - 43165064
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  43165283 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 43165184  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  43165183 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 43165084  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  43165083 aagtcagtgcatttctcttc 43165064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12889317 - 12889141
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  12889317 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 12889218  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  12889217 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 12889141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13255298 - 13255122
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  13255298 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 13255199  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  13255198 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 13255122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 20059576 - 20059752
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  20059576 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 20059675  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  20059676 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 20059752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 48428055 - 48427879
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  48428055 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 48427956  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  48427955 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 48427879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10008208 - 10007989
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  10008208 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcga 10008109  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  10008108 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 10008009  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  10008008 aagtcagtgcatttctcttc 10007989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16694772 - 16694544
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16694772 ctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16694673  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  ||  ||||| | ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  16694672 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatttaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 16694573  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| || || |||| ||||| ||||||||    
T  16694572 aagtcaatgtatttctcttccgctgaaga 16694544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10908818 - 10908599
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| |  |    
T  10908818 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtca 10908719  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  10908718 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 10908619  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  10908618 aagtcagtgcatttctcttc 10908599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 15713578 - 15713797
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  15713578 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15713677  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  15713678 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 15713777  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  15713778 aagtcagtgcatttctcttc 15713797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 16754223 - 16754394
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16754223 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtga 16754322  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  16754323 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 16754394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 298
Target Start/End: Original strand, 14578935 - 14579221
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| || |||||| | |||||||||| | | |||||||    
T  14578935 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttg 14579034  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||| ||||| || ||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  14579035 aaattgatttggtttgtttgcctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 14579134  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
     ||| |||| ||||||||||||||  |  |||| |  ||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14579135 ggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagaatttttatctactaagcagctgaagcagttagaacgagatggaattct 14579221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3688551 - 3688375
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  3688551 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 3688452  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||    
T  3688451 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttacagtacaacc 3688375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15358691 - 15358571
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  15358691 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15358592  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  15358591 ttttgaaatggatttagtttg 15358571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 196
Target Start/End: Original strand, 16804474 - 16804658
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||| | |||| | | |||||||||||| | |||||||    
T  16804474 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgattttg 16804573  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 196  Q
    || | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16804574 aaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaa 16804658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 15400039 - 15400258
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  15400039 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15400138  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  | ||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | ||||      
T  15400139 ttttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagt 15400238  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  15400239 aagtcagtgcatttttcttc 15400258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 15586914 - 15587085
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  15586914 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15587013  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  15587014 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgaatggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 15587085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 26790935 - 26791154
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  26790935 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 26791034  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  26791035 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 26791134  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  26791135 aagtcagtgcatttctcttc 26791154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 53382540 - 53382711
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  53382540 ctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 53382639  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  53382640 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttggagta 53382711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 5422452 - 5422628
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||| | | |||||||||||| | ||    
T  5422452 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtga 5422551  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  5422552 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 5422628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6603343 - 6603223
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  6603343 ctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 6603244  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  6603243 ttttgaaatggatttagtttg 6603223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 15345767 - 15345887
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  15345767 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15345866  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||| ||| | |||||||||||    
T  15345867 tttcgaaatggatttagtttg 15345887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 12843630 - 12843811
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | | |||||||| | | |||||||    
T  12843630 atgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtttatgtttgatcgtgattttg 12843729  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    || | || || ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  12843730 aaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatat 12843811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 14874095 - 14874210
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||   || || | |||||||||||| | |||||||    
T  14874095 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattttg 14874194  T
Q  112 aagtagatttagtttg 127  Q
    |  | |||||||||||    
T  14874195 agatggatttagtttg 14874210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17492459 - 17492174
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||  | | |||||||| | | ||    
T  17492459 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtttatgtttgatcgtga 17492360  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||  | ||||| |||||  ||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||  | ||||      
T  17492359 ttttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 17492260  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||  | ||| |||| ||||||||||||||  |  |||| |  || |||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  17492259 aaatctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcggagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatgg 17492174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Original strand, 11949436 - 11949500
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtt 71  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11949436 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtt 11949500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 103
Target Start/End: Original strand, 15013285 - 15013376
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtag 103  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||| | || |||||||||||    
T  15013285 atgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtag 15013376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 48
Target Start/End: Original strand, 13318045 - 13318086
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagg 48  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13318045 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 3456 - 3749
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3456 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtaggga 3555  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  3556 ttttgaagtagacttagtttgcttaccactgacagggatggatgtgatatttgggatgaattggttagagtataactgagttcatatcaactgctttagc 3655  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  3656 aagaccgtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagtcgagattttatctacgaaagagatgaagcagctagaacgagacgggattctga 3749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 51604075 - 51604368
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  51604075 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 51604174  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  51604175 ttttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 51604274  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  51604275 aagactgtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagttgaaattttatctacaaagcagatgaagcaattagaacgtgatggaattctga 51604368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20893020 - 20892791
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20893020 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtatcctatatctatgtttggtagaga 20892921  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||  || ||| |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  20892920 ttttgtggttgatctagtttgcttgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagt 20892821  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20892820 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaa 20892791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 11204520 - 11204808
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11204520 atgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctaaatctatgtttggtagagattttg 11204619  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
      || |||||||||||  | ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||    
T  11204620 tggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctatagtaagac 11204719  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||  || || |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  11204720 ggtgcatttttcttctgctgaggaagaaggtgaggttgagcttctgtctacaaaacagatgaaacagtttgaacgtgatggaattctga 11204808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 44659149 - 44659442
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44659149 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 44659248  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||     
T  44659249 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtttaatcgagtccatatcaactgctataat 44659348  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||  || || |||||||  ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||    
T  44659349 aagacggtgcatttctcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagcttctgtctacgaaacagatgaaacagtttgaaagtgatggaattctga 44659442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 3262077 - 3262362
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3262077 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 3262176  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  3262177 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 3262276  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||  || || |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||    
T  3262277 aagacggtacatttctcttctgctgaagaagaaggtgaggttgagcttctgtctacgaaacagatgaaacagtttgaacgtgatgg 3262362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Original strand, 29450820 - 29451109
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29450820 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 29450919  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||      
T  29450920 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgggttcatatcaactgctttagt 29451019  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  || || |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  29451020 aagacggtacatttttcttctgctgaggaagaaggtgaagttgagcttctgtctacaaaacagatgaaacagtttgaacgtgatggaatt 29451109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27903374 - 27903135
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  27903374 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 27903275  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| || || ||||| ||  ||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | || |||    
T  27903274 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgaatgttattttagggatgaattggttagagtataaccgagtttatataaattgtttcaac 27903175  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  27903174 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaaaagagtggag 27903135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15258891 - 15258687
Alignment:
Q  32 tgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgctta 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| || |||| ||| ||  | ||||| |||    
T  15258891 tgaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtagtcgaccttgtttgttta 15258792  T
Q  132 ccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctg 231  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15258791 ccgttgacgggtatggatgtcattttttggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgctg 15258692  T
Q  232 aagaa 236  Q
    |||||    
T  15258691 aagaa 15258687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 14993650 - 14993941
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | || |||||  | |||||||||||| | |     
T  14993650 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtggagg 14993749  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||  | ||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||      
T  14993750 ctttgaagtcgaccttgtttgtttaccgttgacgggtatgcatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagt 14993849  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||  | ||||| ||  || |||||||| | || ||||||||||||||    
T  14993850 aagacggtgcatttttcttctgctaaagaagtgagtggagctgaattcctaactactaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaattct 14993941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15073348 - 15073060
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||    
T  15073348 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagaga 15073249  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| | || ||  | ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||      
T  15073248 ctttgaagttgatcttgtatgtctgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagt 15073149  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||| ||  || || |||||||  ||  || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15073148 aagacggtacatttttcttctgctgaggaagagagtgaagccgagttcttgactaataaacagttgaagcagttagaatgtgatggaat 15073060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Original strand, 15354323 - 15354501
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||   | |||||||||||||| ||    
T  15354323 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagaga 15354422  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccga 185  Q
     ||| |||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15354423 ctttaaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactgattagagtataaccga 15354501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 18224469 - 18224697
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  18224469 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18224568  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||  | |||| |    
T  18224569 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgttattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcataacaattgttttagc 18224668  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| | ||||||    
T  18224669 aagtcagtgtatttctcttccgttgaaga 18224697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 16250873 - 16251101
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16250873 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16250972  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  16250973 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtataaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 16251072  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  16251073 aagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 16251101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14697085 - 14696862
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||  | |||||||||||| | |||||||    
T  14697085 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagattttg 14696986  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||||||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  14696985 aaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 14696886  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  14696885 agtgtatttttcttctgctgaaga 14696862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14162459 - 14162283
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| || | | ||    
T  14162459 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctatgtatgatcgtga 14162360  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  14162359 ttttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaacc 14162283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14683556 - 14683370
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  14683556 ctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 14683457  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||   | |||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  14683456 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcagtatggatgtgattctgggaatgaattggttggagtacaaccatgttcatat 14683370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12479589 - 12479413
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  12479589 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 12479490  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  12479489 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 12479413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 16234015 - 16234191
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16234015 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16234114  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16234115 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 16234191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 17092172 - 17092348
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  17092172 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17092271  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  17092272 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 17092348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8389401 - 8389182
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  8389401 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 8389302  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  8389301 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggaatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 8389202  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  8389201 aagtcagtgcatttctcttc 8389182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40476029 - 40475853
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  40476029 ctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 40475930  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  40475929 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 40475853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19635125 - 19634906
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||| ||| | ||    
T  19635125 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtga 19635026  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  19635025 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 19634926  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  19634925 aagtcagtgcatttctcttc 19634906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23958736 - 23958517
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  23958736 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 23958637  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  23958636 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 23958537  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  23958536 aagtcagtgcatttctcttc 23958517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 8050646 - 8050865
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  | |||| | |||||||||||| | ||    
T  8050646 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtga 8050745  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  8050746 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 8050845  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  8050846 aagtcagtgcatttctcttc 8050865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 14301002 - 14301221
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||| |||||| | ||    
T  14301002 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtga 14301101  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  14301102 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 14301201  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  14301202 aagtcagtgcatttctcttc 14301221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14188484 - 14188206
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| |||||| | | ||||||||| | |    
T  14188484 ggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctttgtttgatcgtgattttgaaatgg 14188385  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    |||||||||| |||||  |||  || ||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||| | |||| |||  | |||      
T  14188384 atttagtttgtttacctttgagtggaatgaatgtgattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcttatcaactgttttagcaattcggtgtc 14188285  T
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
     |  || |||||||||||| |  ||||||| || || ||| |||| ||| || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  14188284 ctcctcctctgctgaagaagaaagtggagtggagttcttgtctactaagcagctgaagcaactagaacgagatggaatt 14188206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 15144915 - 15145035
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  15144915 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15145014  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  15145015 ttttgaaatggatttagtttg 15145035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16150625 - 16150529
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtag 103  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  16150625 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtag 16150529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16154771 - 16154675
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtag 103  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  16154771 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtag 16154675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 19775816 - 19775992
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  19775816 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 19775915  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  19775916 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 19775992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8708811 - 8708641
Alignment:
Q  92 tatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcat 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||  || ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||    
T  8708811 tatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggcgtataaccatgttcat 8708712  T
Q  192 atcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactac 262  Q
    |||||  | ||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||| || ||  |||||| || ||||||||    
T  8708711 atcaattgttttagtaagacgatgcatttttcttctgctgaggaagagagtaaagttgagttcttgactac 8708641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 53750753 - 53750815
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttg 69  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53750753 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttg 53750815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16219184 - 16218991
Alignment:
Q  42 gctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacgg 141  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||  |    
T  16219184 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16219085  T
Q  142 ggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  16219084 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaaga 16218991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16222504 - 16222311
Alignment:
Q  42 gctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacgg 141  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||  |    
T  16222504 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16222405  T
Q  142 ggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  16222404 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaaga 16222311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27714325 - 27714149
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||| | | |||||||||||| | ||    
T  27714325 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtga 27714226  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  27714225 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 27714149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 16063 - 16150
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 99  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||    
T  16063 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 16150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 16350582 - 16350697
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||| |||| | ||||| |    
T  16350582 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtctggtcgtgatttcg 16350681  T
Q  112 aagtagatttagtttg 127  Q
    || | ||| |||||||    
T  16350682 aaatggatctagtttg 16350697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16150531 - 16150408
Alignment:
Q  172 tagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagat 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||    ||||||| || ||  |  |||| ||  ||||    
T  16150531 tagagtatagccgagttcatatcaattgctttagcaagatggtgcatttttcttctgtggaagaa----gtggagtagagttcctatctactaaacagat 16150436  T
Q  272 gaagcagctagaacgtgatggaattctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16150435 gaagcagctagaacgtgatggaattctg 16150408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16154677 - 16154554
Alignment:
Q  172 tagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagat 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||    ||||||| || ||  |  |||| ||  ||||    
T  16154677 tagagtatagccgagttcatatcaattgctttagcaagatggtgcatttttcttctgtggaagaa----gtggagtagagttcctatctactaaacagat 16154582  T
Q  272 gaagcagctagaacgtgatggaattctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16154581 gaagcagctagaacgtgatggaattctg 16154554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 15356576 - 15356642
Alignment:
Q  180 aaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  15356576 aaccgagttcatatcaattgctttagcaagaccgtgcatttttcttcatctgaagaagagagtggag 15356642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13513339 - 13513285
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactac 61  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13513339 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12576973 - 12576680
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  12576973 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 12576874  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12576873 ttttgaagtagacttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 12576774  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12576773 aagactgtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagttgaaattttatctacaaagcagatgaagcagttagaacgtgatggaattctga 12576680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 300
Target Start/End: Original strand, 23097840 - 23098134
Alignment:
Q  6 actgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggg 105  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23097840 actgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 23097939  T
Q  106 attttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaa 205  Q
    ||||||  || || ||||| ||  ||||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||||     
T  23097940 attttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggtatggatgtcatttttggaatgaactgggtagagtataaccgtgttcatatcaattgttttag 23098039  T
Q  206 caagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23098040 caagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagggtggagttgaattcttgactacgaaacagatgaagcagttagaacgtgatggaattctga 23098134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Original strand, 19716846 - 19717133
Alignment:
Q  13 tgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttga 112  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || |||||    
T  19716846 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttga 19716945  T
Q  113 agtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagaca 212  Q
    ||| || |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||     
T  19716946 agtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacg 19717045  T
Q  213 gtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||  |||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  19717046 gtgcatttttcatctgctgaagaagagggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatcaaacaactagaacatgatggaattctga 19717133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23274213 - 23273995
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  23274213 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 23274114  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  23274113 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 23274014  T
Q  207 aagacagtgcatttttctt 225  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  23274013 aagacggtgcatttttctt 23273995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23113332 - 23113088
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23113332 ggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttg 23113233  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    || |||| || || ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||  | ||||  |||||  | ||    
T  23113232 atctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgtttatataaattgttttagtaagacgataca 23113133  T
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactac 262  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||  |||||| || ||||||||    
T  23113132 tttttcttctgctgaggaagagagtaaagttgagttcttgactac 23113088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23279343 - 23279167
Alignment:
Q  60 acttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttg 159  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23279343 acttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttg 23279244  T
Q  160 ggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  23279243 ggatggactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctacggaagaa 23279167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27790210 - 27790067
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  27790210 ttggtatgaactggttggagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagttgaaatttt 27790111  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
      |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27790110 atctacaaagcagatgaagcagttagaacgtgatggaattctga 27790067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Original strand, 24657481 - 24657670
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||| | ||    
T  24657481 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24657580  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 196  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| |||  ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||    
T  24657581 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttgatatgaattgggtagagtacaaccatgttcatatcaa 24657670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20848209 - 20848089
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20848209 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 20848110  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    |||||   | |||||||||||    
T  20848109 ttttgtgattgatttagtttg 20848089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9338202 - 9337983
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  9338202 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 9338103  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  9338102 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 9338003  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  9338002 aagtcagtgcatttctcttc 9337983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9486836 - 9486617
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  9486836 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 9486737  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  9486736 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 9486637  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  9486636 aagtcagtgcatttctcttc 9486617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16983860 - 16983684
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16983860 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16983761  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16983760 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 16983684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17001620 - 17001444
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  17001620 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17001521  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  17001520 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 17001444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 22323165 - 22323341
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  22323165 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22323264  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  22323265 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttaggtatgaactggttagagtacaacc 22323341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24712654 - 24712478
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  24712654 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24712555  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  24712554 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 24712478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27220636 - 27220460
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  27220636 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27220537  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  27220536 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 27220460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 44383393 - 44383569
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  44383393 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 44383492  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  44383493 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 44383569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 11351534 - 11351753
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  11351534 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 11351633  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  |  |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  | |||| |    
T  11351634 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 11351733  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| ||||| |||| |||||    
T  11351734 aagtcagtgtatttctcttc 11351753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27373889 - 27373713
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  27373889 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27373790  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||| ||| | |||||||||||| ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  27373789 tttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 27373713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 45673835 - 45674011
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| | | |||||||||||| | ||    
T  45673835 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcttttgtctatgtttggtcgtga 45673934  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| |  ||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  45673935 ttttgaaatgaatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 45674011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 21142864 - 21143083
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  21142864 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 21142963  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  21142964 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 21143063  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  21143064 aagtcagtgcatttctcttc 21143083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 23105551 - 23105671
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  23105551 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 23105650  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||||||  | |||||||||||    
T  23105651 ttttgagatggatttagtttg 23105671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24678107 - 24677931
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||| | ||    
T  24678107 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24678008  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||  | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  24678007 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 24677931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Original strand, 24817668 - 24817768
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24817668 atgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttg 24817767  T
Q  112 a 112  Q
    |    
T  24817768 a 24817768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23074483 - 23074307
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| |   ||    
T  23074483 ctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcttga 23074384  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||  | ||||| |||||  ||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23074383 ttttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaattggttagagtacaacc 23074307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23204934 - 23204706
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | | | |||||| | ||||||  |||| | ||    
T  23204934 ctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgctcgcgatgtcctttgtctatggatggtcgtga 23204835  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  23204834 ttttgtaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 23204735  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  23204734 aagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 23204706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 24874573 - 24874749
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  24874573 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24874672  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  24874673 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 24874749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10871470 - 10871251
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||| | | |||||||||||| | ||    
T  10871470 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctatgtttggtcgtga 10871371  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  10871370 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 10871271  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  10871270 aagtcagtgcatttctcttc 10871251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 24705305 - 24705524
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||||||||| | ||    
T  24705305 ctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctatgtttggtcgtga 24705404  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || ||  || | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  24705405 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtattaatatgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 24705504  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| ||||| |||| |||||    
T  24705505 aagtcagtgtatttctcttc 24705524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24264973 - 24264771
Alignment:
Q  24 atggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttag 123  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | | |||||||||| | ||||| ||| | |||||||    
T  24264973 atggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttag 24264874  T
Q  124 tttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttc 223  Q
    ||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |||| |||||||||| ||    
T  24264873 tttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctc 24264774  T
Q  224 ttc 226  Q
    |||    
T  24264773 ttc 24264771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Original strand, 21323100 - 21323209
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||| ||  | |    
T  21323100 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatgg 21323199  T
Q  118 atttagtttg 127  Q
    ||||||||||    
T  21323200 atttagtttg 21323209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 23029284 - 23029404
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||| | ||    
T  23029284 ctgatatgaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 23029383  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||| ||  | |||||||||||    
T  23029384 tttcgagatggatttagtttg 23029404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 99
Target Start/End: Original strand, 22733597 - 22733689
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 99  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||  | ||||||||||    
T  22733597 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctatgtttg 22733689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 41606210 - 41606328
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  41606210 ctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcct-tgtctatgtttggtcgtga 41606307  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||| ||| | |||||||||||    
T  41606308 tttcgaaatggatttagtttg 41606328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Original strand, 22742789 - 22742849
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 67  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22742789 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23065033 - 23064973
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 67  Q
    |||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23065033 ctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19817432 - 19817323
Alignment:
Q  42 gctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacgg 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| || |||| | || || |||||||| ||||||| ||| || ||||| || || ||| |||  |    
T  19817432 gctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtttcctttgtcgatatttggtagagattttgcagtggacttagtctgtttgccgttgagtg 19817333  T
Q  142 ggatggatgt 151  Q
    ||||||||||    
T  19817332 ggatggatgt 19817323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 263244 - 262951
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  263244 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 263145  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  263144 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 263045  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  263044 aagacggtacatttttcttctgctgaagaagagggtggagttgagttcttgactacgaaacagatgaagcagttagaacgtgatggaattctga 262951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Original strand, 10072 - 10361
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10072 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 10171  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  10172 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttattttttgaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 10271  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10272 aagacggtacatttttcttctgctgaagaagagggtggagttgagttcttgactacgaaacagatgaagcagttagaacgtgatggaatt 10361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 17266804 - 17267092
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  17266804 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttg 17266903  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||  |||||    
T  17266904 aagtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataactgagttcatatcaactgttttagtaagac 17267003  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
     || ||||||||||| || |||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17267004 ggtacatttttcttccgccgaagaagagagtgaagttgagtttttgaatacgaagcaaatgaagcagttggaacgtgatggaattctga 17267092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 23078370 - 23078663
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  23078370 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 23078469  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||| ||| ||| || |||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||      
T  23078470 ctttgtagttgatctaatttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcacatgaactgctttagt 23078569  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||| |||||||  ||||||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  23078570 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacagctagaacgagacgaaattctga 23078663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22505577 - 22505289
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  22505577 atgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttcatagagattttg 22505478  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
      || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||    
T  22505477 tggtggatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctatagtaagac 22505378  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||||  || |  |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  22505377 aatgcatttttcttctgttgaagaagaaggtgaggttgagcttctatctacaaaacagatgaaacagtttgaacgtgatggaattctga 22505289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 23563633 - 23563872
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |  | |||||||||||||| ||    
T  23563633 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctatgtttggtagaga 23563732  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  23563733 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 23563832  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  23563833 aagacggtgcatttttcttctacagaagaagagagtggag 23563872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20345185 - 20344892
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20345185 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctttgtttggtagaga 20345086  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||  || |||||||||||  | ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||      
T  20345085 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctatagt 20344986  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||  || || |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  20344985 aagacggtgcatttttcttctgctgaggaagaaggtgaggttgagcttctgtctacaaaacagatgaaacagtttgaacgtgatggaattctga 20344892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 14884456 - 14884741
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14884456 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 14884555  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||      
T  14884556 ttttgtgattgatttagtttgtcttccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgggttcatatcaactgctttagt 14884655  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||| || ||||| ||||||| ||||||| | ||||  |||||  || || |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||    
T  14884656 aagacggtacatttctcttctgttgaagaagaaggtgaggttgagcttctgtctacgaaacagatgaaacagtttgaacgtgatgg 14884741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20778816 - 20778577
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  20778816 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20778717  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| || || ||||| ||  ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||  | ||||||    
T  20778716 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaac 20778617  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||    
T  20778616 aagacggtgcacttttcttctgcggaagaagagagtggag 20778577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Original strand, 21983653 - 21983927
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  | | |||||||||||| ||||||||||| |    
T  21983653 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttatgtttggtagagattttgaagttg 21983752  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    || |||| || || ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||  ||||| |||||    
T  21983753 atctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttagtaagacggtgca 21983852  T
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  || ||| || |||||||| ||  || |||||||  |||||||||||||    
T  21983853 tttttcttctgctgaggaagagggtaaagctgagttcttgactactaaacagctgaagcaattagaacgtgatgg 21983927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25850975 - 25850750
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25850975 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 25850876  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||      
T  25850875 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatgaatgttatttttggaatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaattgctatagt 25850776  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctga 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25850775 aagacggtgcatttttcttctgctga 25850750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20824356 - 20824117
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  20824356 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20824257  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| || || |||||||| ||  ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||  | ||||||    
T  20824256 tttcgaggtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaac 20824157  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||||| || ||||||    
T  20824156 aagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggag 20824117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 28892407 - 28892698
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  28892407 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 28892506  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||||| || ||||| ||  ||||| ||  |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||  | ||||||    
T  28892507 ttttgaagtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgtcatcttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaac 28892606  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||||| || ||||||  || ||| | ||||| ||  || |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  28892607 aagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatggaattct 28892698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Original strand, 21561501 - 21561715
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21561501 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttg 21561600  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    || |||| || || ||  |||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||  || || |||||    
T  21561601 atctagtatgtttgccattgacgggtgtggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttagtaaaacggtgca 21561700  T
Q  218 tttttcttctgctga 232  Q
    |||||||||||||||    
T  21561701 tttttcttctgctga 21561715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22464853 - 22464625
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  22464853 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 22464754  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| || || ||||| ||  ||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||  | ||||||    
T  22464753 ttttgaggtcgacttagtatgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtacaaccgagtctgtataaattgttttaac 22464654  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22464653 aagacggtgcacttttcttctgcggaaga 22464625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18782035 - 18781807
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  18782035 ctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18781936  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||| ||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  18781935 ttttgaaatggattaagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 18781836  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  18781835 aagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 18781807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Original strand, 21676449 - 21676592
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||    
T  21676449 ttggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaaatggagttgaaatttt 21676548  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  21676549 gactacgaaagagatgaagcagctagaatgagatgggattctga 21676592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16359423 - 16359204
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16359423 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16359324  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  16359323 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 16359224  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  16359223 aagtcagtgcatttctcttc 16359204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20803518 - 20803299
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  20803518 ctgatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 20803419  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||| |    
T  20803418 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaagtggttagagtacaaccatgttcatatcaattgctttagc 20803319  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| ||||| |||| |||||    
T  20803318 aagtcagtgtatttctcttc 20803299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27521327 - 27521108
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  27521327 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27521228  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  27521227 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27521128  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  27521127 aagtcagtgcatttctcttc 27521108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34569415 - 34569196
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  34569415 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 34569316  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  34569315 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 34569216  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  34569215 aagtcagtgcatttctcttc 34569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21882695 - 21882509
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||| | ||    
T  21882695 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 21882596  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    ||||||  | |||||||||||  ||||  | |  || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  21882595 ttttgagatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 21882509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Original strand, 21342879 - 21343068
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||| | | ||    
T  21342879 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21342978  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 196  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21342979 ttttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaa 21343068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23474111 - 23473827
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  || |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  23474111 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtattaaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttg 23474012  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | || || ||||| |||||  |||  || ||||| || ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  23474011 aaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggacgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 23473912  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |  |||| |  ||||| ||| |||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  23473911 ggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggtgcagaattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatt 23473827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40711701 - 40711525
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  40711701 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 40711602  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  40711601 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 40711525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22137589 - 22137370
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | | |||||||||| | ||    
T  22137589 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtga 22137490  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  22137489 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22137390  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  22137389 aagtcagtgcatttctcttc 22137370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 29473538 - 29473757
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  29473538 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 29473637  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  29473638 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 29473737  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  29473738 aagtcagtgcatttctcttc 29473757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27613277 - 27613101
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  27613277 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27613178  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  27613177 ttttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 27613101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41773763 - 41773587
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  ||| || | |||||||||||| | ||    
T  41773763 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctatgtttggtcgcga 41773664  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  41773663 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 41773587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 22330352 - 22330571
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  22330352 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22330451  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  22330452 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22330551  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  22330552 aagtcagtgcatttctcttc 22330571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22350840 - 22350664
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  22350840 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcga 22350741  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  22350740 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 22350664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25429337 - 25429057
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||  | |||||||||| | | |||||||    
T  25429337 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttg 25429238  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |  | ||||| |||||  ||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||  | ||||  ||  |    
T  25429237 agattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatc 25429138  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  |  |||| |  || |||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  25429137 agtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatgg 25429057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 26736197 - 26736481
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | |||||||    
T  26736197 atgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttg 26736296  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  26736297 aaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 26736396  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
     ||| |||| ||||||||||||||  |  |||| |   |||||||| ||| |||| || |||||||  ||||||||| |||||||    
T  26736397 ggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaatttttgtctatgaagcagctgaagcaattagaacgtggtggaatt 26736481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 27665955 - 27666131
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  27665955 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27666054  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  27666055 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 27666131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 14997204 - 14997423
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  14997204 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 14997303  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  14997304 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 14997403  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  14997404 aagtcagtgcatttctcttc 14997423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 298
Target Start/End: Original strand, 22233535 - 22233676
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||  |||||||| ||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| || ||| || ||    
T  22233535 ttggtatgaactggttggaatataaccatgttcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagctgagttctt 22233634  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    |||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22233635 gactacgaaacagttgaagcagttagaacgtgatggaattct 22233676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 37288961 - 37289137
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | ||| |||||||| | ||    
T  37288961 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggtcgtga 37289060  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  37289061 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 37289137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19772881 - 19772761
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  19772881 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 19772782  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||| ||| | |||||||||||    
T  19772781 tttcgaaatggatttagtttg 19772761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 21336764 - 21336988
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| || |||| | | |||||||||||| | |||||||    
T  21336764 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtcttttgtctatgtttggtcgcgattttg 21336863  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | || || | ||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  21336864 aaattgacttggattgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 21336963  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  21336964 ggtgtatttttcttctgctgaagaa 21336988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Original strand, 27682870 - 27682982
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||| |    
T  27682870 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcg 27682969  T
Q  112 aagtagatttagt 124  Q
    || | ||||||||    
T  27682970 aaatggatttagt 27682982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20311755 - 20311654
Alignment:
Q  23 aatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagattta 122  Q
    |||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||| || |||    
T  20311755 aatggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggactta 20311656  T
Q  123 gt 124  Q
    ||    
T  20311655 gt 20311654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21410041 - 21409826
Alignment:
Q  21 gaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatt 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||| || || |||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||| ||| || |    
T  21410041 gaaatggttgtcgaaaccccggctaaggcttcggtgactagttctctagtatgcttgaagtgtcctttgttgatgtttggtagagattttgcagtggact 21409942  T
Q  121 tagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcattt 220  Q
    |||| || || ||| |||| ||||||||||| ||  | || ||||| ||||| || | |||||  |||||||| ||  | |||   ||||| |||| |||    
T  21409941 tagtctgtttgccgttgactgggatggatgtaatactaggtatgaactggttggaatttaaccttgttcatattaaatgttttcgaaagacggtgcgttt 21409842  T
Q  221 ttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||||||| ||||||    
T  21409841 ttcttctgccgaagaa 21409826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Original strand, 21631869 - 21631924
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 67  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21631869 atgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 292
Target Start/End: Original strand, 24796012 - 24796147
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||||  || || ||    
T  24796012 ttggtatgaactggttggagtatacccatgttcatatcaattgcttaaacaagacggtgcatttttcttctgcggaggaagagagtggagcagagttctt 24796111  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
     ||||| ||  || |||||||| | |||||||||||    
T  24796112 aactacaaaacagttgaagcagtttgaacgtgatgg 24796147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 247
Target Start/End: Original strand, 449 - 527
Alignment:
Q  169 ggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagt 247  Q
    |||| ||||||||||  || ||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  449 ggttggagtataaccatgtccatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagt 527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23460892 - 23460832
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 67  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23460892 ctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 53709 - 54002
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  53709 ctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 53808  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  53809 ctttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 53908  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  53909 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatggaattctga 54002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Original strand, 31113 - 31256
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||    
T  31113 ttggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaaatggagttgaaatttt 31212  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  31213 gactacgaaagagatgaagcagctagaaagagatgggattctga 31256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 65584 - 65877
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  65584 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccatgtttggtagaga 65683  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||      
T  65684 ttttgaagttgacttagtatgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaattgctttagt 65783  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||| | || ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  65784 aagacggtacatttttcttctgctgaagaagagggtgaagtggagttcttgtcaacaaaacagatgaaacaactagaacgtgatggaattctga 65877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22140 - 21849
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  22140 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagaga 22041  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  22040 ttttgaggtcgatttagtttgtttgccgctgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 21941  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  21940 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagatcgtgatggaattct 21849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 120 - 413
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  120 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttgttaggga 219  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||  || ||||||||||| || ||| || |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  220 ctttgtggtggatttagtttgtttgccgttgtcgggtatgaatgtgatttttggtatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagt 319  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  320 aagacggtacatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgaatttttgtctacgaaacagatgaaacagctagaacgggacgggattctga 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 24096975 - 24097263
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || ||||    
T  24096975 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttg 24097074  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
     ||| || |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  24097075 tagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttagaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagac 24097174  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24097175 ggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacagctagaacgtgatggaattctga 24097263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20297416 - 20297123
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20297416 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatttatgtttggtagaga 20297317  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||  || |||||||||||  | ||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      
T  20297316 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatctttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctatagt 20297217  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  20297216 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgaacttttgtctacaaaacagatgaaacagtttgaacgtgatggaattctga 20297123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 22016100 - 22016329
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  22016100 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 22016199  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  22016200 ctttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 22016299  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22016300 aagacggtgcatttttcttctgcagaagaa 22016329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19857309 - 19857070
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  19857309 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 19857210  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  19857209 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgactggtatggatgatatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 19857110  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19857109 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggag 19857070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 38910196 - 38910466
Alignment:
Q  22 aaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagattt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||    
T  38910196 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgattt 38910295  T
Q  122 agtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttt 221  Q
    ||||||  | ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||     
T  38910296 agtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctataataagacggtgcatttc 38910395  T
Q  222 tcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||  || || |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||    
T  38910396 tcttctgctgaagaagaaggtgaggttgagcttctgtctacgaaacagatgaaacagtttgaacgtgatgg 38910466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 31537352 - 31537645
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31537352 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 31537451  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  31537452 ttttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagt 31537551  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||  || || |||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  31537552 aagacggtacatttctcttctgctgaagaagaaggtgaggttgagcttctgtctacaaaacagatgaaacagtttgaacgtgatggtattctga 31537645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48425908 - 48425623
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48425908 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 48425809  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  48425808 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 48425709  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||  || || |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||    
T  48425708 aagacggtacatttctcttctgctgaagaagaaggtgaggttgagcttctgtctacgaaacagatgaaacagtttgaacgtgatgg 48425623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 52988776 - 52988491
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52988776 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 52988677  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  52988676 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 52988577  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||  || || |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||    
T  52988576 aagacggtacatttctcttctgctgaagaagaaggtgaggttgagcttctgtctacgaaacagatgaaacagtttgaacgtgatgg 52988491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 20833255 - 20833494
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  20833255 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20833354  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  20833355 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 20833454  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  20833455 aagacggtgcatttttcttctacggaagaagagagtggag 20833494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 21739391 - 21739682
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  21739391 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 21739490  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| |||| || || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||      
T  21739491 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 21739590  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||| || ||| || || ||||| ||  || |||||||  | || ||||||||||||||    
T  21739591 aagacggcgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagctgagttcttaactactaaacagttgaagcaattggagcgtgatggaattct 21739682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12200553 - 12200324
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12200553 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagaga 12200454  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||| ||  | ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  12200453 ttttgtgattgatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctataat 12200354  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12200353 aagacggtgcatttctcttctgctgaagaa 12200324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Original strand, 21742907 - 21743196
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||    
T  21742907 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagaga 21743006  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| |||| || || ||| || ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||      
T  21743007 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtgtggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccattttcatattaactgctttagt 21743106  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| || | | || |||||||||||  || |||||||| | || ||||||||||||    
T  21743107 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagctaagttcttgactacgaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaatt 21743196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37680084 - 37679855
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37680084 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 37679985  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||| ||      
T  37679984 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtttaatcgagtccacatcaactgctatagt 37679885  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37679884 aagacggtgcatttctcttctgctgaagaa 37679855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 20854115 - 20854406
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  20854115 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20854214  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| || || ||||| ||  ||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||  | ||||||    
T  20854215 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtataaattgttttaac 20854314  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||  || ||||||  || ||| | ||||| ||  || |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  20854315 aagacggtgcacttttcttctgcggaagaggagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatggaattct 20854406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16379093 - 16378809
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  16379093 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttg 16378994  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |  | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  | |||| |||| |    
T  16378993 agattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtaatcctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtc 16378894  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| || ||||||   | |||||| |||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  16378893 agtgtatttctcttctgctgaggaagagagtggagcaaagtttttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatt 16378809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 17042370 - 17042598
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  17042370 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17042469  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  17042470 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 17042569  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  17042570 aagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 17042598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Original strand, 24785212 - 24785401
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  24785212 ctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24785311  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 196  Q
    ||||||| | ||| | |||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24785312 ttttgaaatggatctggtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaa 24785401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 51330847 - 51331060
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  51330847 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 51330946  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  51330947 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 51331046  T
Q  207 aagacagtgcattt 220  Q
    ||| ||||||||||    
T  51331047 aagtcagtgcattt 51331060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 16347950 - 16348126
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16347950 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16348049  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16348050 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 16348126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18710406 - 18710300
Alignment:
Q  21 gaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatt 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| || |||||||| || |    
T  18710406 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgact 18710307  T
Q  121 tagtttg 127  Q
    |||||||    
T  18710306 tagtttg 18710300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19109372 - 19109201
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||||||   ||    
T  19109372 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcatga 19109273  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  19109272 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 19109201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21833306 - 21833130
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||    
T  21833306 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtga 21833207  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    |||  || | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  21833206 tttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 21833130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 33388384 - 33388560
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  33388384 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 33388483  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  33388484 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 33388560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 20081731 - 20081851
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  20081731 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 20081830  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||||||  | |||||||||||    
T  20081831 ttttgagatggatttagtttg 20081851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 41351023 - 41351194
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||| || | ||    
T  41351023 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtga 41351122  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  41351123 ttttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 41351194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21842216 - 21842096
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||| | | |||||||||||| | ||    
T  21842216 ctgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtga 21842117  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  21842116 ttttgaaatggatttagtttg 21842096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 22496611 - 22496705
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggt 101  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  22496611 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 20075064 - 20075126
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttg 69  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20075064 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41311350 - 41311272
Alignment:
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||||||||||||||||| || | | |||||| || |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  41311350 tttttcttctgctgaagaagagagcgaagttgagttcttgactacgaaacagttgaagcagttagaacgtgatggaatt 41311272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Original strand, 21233184 - 21233314
Alignment:
Q  105 gattttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagcttta 204  Q
    ||||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | ||||    
T  21233184 gattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgtttta 21233283  T
Q  205 acaagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
     |||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  21233284 gcaagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 21233314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21752034 - 21751988
Alignment:
Q  24 atggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgt 70  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21752034 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15136 - 14850
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||  | ||||||||| |||| |||||||    
T  15136 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttcgtagagattttg 15037  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |||| || |||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  15036 aagtcgacttagtttgtttgccgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagac 14937  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14936 ggtgcatttttcttctgctgaagaagagggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatggaattct 14850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6126 - 5838
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||| | || ||||||||| | ||| |||    
T  6126 atgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtttggtcgagatgttg 6027  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||  |||   |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  6026 aaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtgcaacaacgttcatattaattgttttagtaagtc 5927  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
     ||| |||||||||| | ||||||| |  ||||||  || || ||  |||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5926 ggtgtatttttcttcggttgaagaagaaagtggagcagagttcttatctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattctga 5838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 479 - 186
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  479 ctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 380  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||  || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      
T  379 ttttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctatagt 280  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| || ||||| |||| ||  ||||||| ||| | ||||| || || |||||||    
T  279 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttaaacttttgtctacaaaacagatgaaacagtttgaacgggacgggattctga 186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7751 - 7471
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| || |||||||| |    
T  7751 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 7652  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    || | ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||  ||||    
T  7651 atcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacgatgca 7552  T
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7551 tttttcttctgctgaagaagagggtgaagttgagttcttgtctacgaaatagatgaagcaactagaacgtgatggaattct 7471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 67399 - 67623
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  67399 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 67498  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
      || ||| |||||||||| ||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  67499 tggttgatctagtttgcttgccgttgtcgggtatggacgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagtaagac 67598  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  67599 ggtgcatttttcttctgctgaagaa 67623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 262
Target Start/End: Original strand, 514639 - 514894
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  514639 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 514738  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||  || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||      
T  514739 ttttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagaataaccgagttcatatcaactgctatagt 514838  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactac 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||    
T  514839 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgaacttttgtctac 514894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 441666 - 441568
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggatttt 110  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  441666 atgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttt 441568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 496033 - 495852
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||| || | |||||||||||| | ||||||     
T  496033 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattttt 495934  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    || | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  495933 aaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatat 495852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 298
Target Start/End: Original strand, 452649 - 452790
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  | ||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||| ||| ||  |    
T  452649 ttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttagtaagacggtgtacttttcttctgctgaagaagagagtggagctgagttcct 452748  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
     ||||| ||  || |||||||| | || ||||||||||||||    
T  452749 aactactaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaattct 452790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22053918 - 22053639
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22053918 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtgtcctacatctatgtttggtagaga 22053819  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||  || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||      
T  22053818 ctttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgggttcatatcaattgctttagt 22053719  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacg 286  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||  ||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  22053718 aagacgatgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaaattgagcttttgtctacaaaacagatgaaacagctagaacg 22053639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 22028011 - 22028299
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  22028011 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttg 22028110  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    | || || ||||| || || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||  |||||    
T  22028111 aggtcgacttagtatgtttgccgttgacgggtatgaatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaattgttttagtaagac 22028210  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || || ||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22028211 ggtgcatttttcttctgttgaagaagagggtgaagtggagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatggaattctga 22028299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 31414258 - 31414551
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  31414258 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 31414357  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||| ||  || |||||||| ||  || ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  31414358 ctttgtagccgacttagtttgtttgtcgttgacgagtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 31414457  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| || ||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31414458 aagacggtgcatttttcttctgctaaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaatagctagaacgtgatggaattctga 31414551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 16268950 - 16269243
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16268950 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 16269049  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| |  || |||||||||||  | ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      
T  16269050 tttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctatagt 16269149  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |  || || |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  16269150 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaggttaagcttctgtctacaaaacagatgaaacagtttgaacgtgatggaattctga 16269243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28983966 - 28983681
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28983966 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 28983867  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | || || |||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  28983866 ttttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 28983767  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||  || || |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||    
T  28983766 aagacggtacatttctcttctgctgaagaagaaggtgaggttgagcttctgtctacgaaacagatgaaacagtttgaacgtgatgg 28983681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 29301152 - 29301437
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  29301152 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 29301251  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||  || ||||||||||| || ||| |  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| | |  |||    
T  29301252 ctttgtggttgatttagtttgtttgccgttatcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataatcgagttcacattaactgttacaac 29301351  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| || || ||||| ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  29301352 aagacggtgcatttttcttctgctgaggaagaaggtgaagttgagttcttaactactaagcagttgaagcagttagaacgtgatgg 29301437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28989185 - 28988900
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28989185 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 28989086  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | || || |||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  28989085 ttttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 28988986  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||  || || |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||    
T  28988985 aagacggtacatttctcttctgctgaagaagaaggtgaggttgagcttctgtctacgaaacagatgaaacagtttgaacgtgatgg 28988900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27357591 - 27357366
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27357591 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 27357492  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||  || |||||||||||  | ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||      
T  27357491 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagattataatcgtgttcatatcaactgctatagt 27357392  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctga 232  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    
T  27357391 aagacggttcatttttcttctgctga 27357366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21928483 - 21928198
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||| ||    
T  21928483 ctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagctgtgcgttgtctatgtttggtagaga 21928384  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| |||| || || ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||      
T  21928383 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatataatttttgggatgaactggatagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 21928284  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||| || |||||| || ||||||| ||| || ||| || ||| || |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||    
T  21928283 aagacggtacattttgctactgctgaggaagagagtgaagctgagttcttgactactaaacagttgaagcagttagaacgtgatgg 21928198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19985235 - 19984947
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  19985235 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 19985136  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| |||| || ||  || |||||   |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||      
T  19985135 ctttgaagtcgatctagtatgtttgtcgttgacgaatatggatgtaatctttgggataaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagt 19985036  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
    |||||  | |||||||| |||||||| ||| || ||| || ||| || |||||||| ||  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  19985035 aagacgatacatttttcgtctgctgaggaagagagtgaagctgagttcttgactactaaacagttgaagcagttagaacgtgatggaat 19984947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22373924 - 22373636
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||| ||    
T  22373924 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttgatagaga 22373825  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| | || || || ||   ||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||      
T  22373824 ctttgaagttgatcttgtatgtttgccatcgacaggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagt 22373725  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||| ||  || || |||||||| ||  || |||||||  ||||||||||||||||    
T  22373724 aagacggtacatttttcttctgctgaggaagagagtgaagccgagttcttgactactaaatagttgaagcatttagaacgtgatggaat 22373636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20391130 - 20390856
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20391130 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttg 20391031  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    || | || || || ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    ||||  |||||  ||||    
T  20391030 atcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattattttagtaagacgatgca 20390931  T
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||  || ||| || |||||||| ||  || |||||||  |||||||||||||    
T  20390930 tttttcttctgctgaggaagagagtaaagctgagttcttgactactaaacagctgaagcaattagaacgtgatgg 20390856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32603200 - 32602972
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  32603200 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtga 32603101  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  32603100 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 32603001  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  32603000 aagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 32602972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 22129343 - 22129571
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  22129343 ctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22129442  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  22129443 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 22129542  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  22129543 aagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 22129571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 30310870 - 30311098
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  30310870 ctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 30310969  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  30310970 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 30311069  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  30311070 aagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 30311098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22042871 - 22042654
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | ||||||||| | |    
T  22042871 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 22042772  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    ||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||| || ||||  |||||||||||  | |||| ||||  |||| |    
T  22042771 atttagtttgtctacctttgaacggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagttagtgta 22042672  T
Q  218 tttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  22042671 tttctcttccgctgaaga 22042654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 17671748 - 17671924
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  17671748 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17671847  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  17671848 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 17671924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19115455 - 19115279
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  19115455 ctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 19115356  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  19115355 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 19115279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 22126685 - 22126904
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  22126685 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22126784  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  |||| ||||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  22126785 tttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22126884  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  22126885 aagtcagtgcatttctcttc 22126904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Original strand, 31568720 - 31568862
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| || ||| |||||| |||||    
T  31568720 ttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgctttaacaagacggtgcatttt-cttctgcggaagaagagagtgaagttgagttttt 31568818  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
     | ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31568819 aaatacgaagcaaatgaagcagttagaacgtgatggaattctga 31568862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15536438 - 15536210
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | |||||| | ||||| |||||| | ||    
T  15536438 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtga 15536339  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || ||| |||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  | |||| |    
T  15536338 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgaatgtgattttgggtacgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 15536239  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  15536238 aagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 15536210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 20015989 - 20016165
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  20015989 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 20016088  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | | |||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  20016089 ttttgaaatgggtttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 20016165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 22117901 - 22118077
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  22117901 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22118000  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||| ||| | |||||||||||  |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  22118001 tttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 22118077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 22421623 - 22421846
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| | | |||||||    
T  22421623 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttg 22421722  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | || || ||||| |||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| | ||||| ||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  22421723 aaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaattcttggcatgaactagttagtgtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 22421822  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
     ||| |||| ||||||||||||||    
T  22421823 ggtgtatttctcttctgctgaaga 22421846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 22375185 - 22375365
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||| || |||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  22375185 atgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtagagattttg 22375283  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    || | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22375284 aaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatat 22375365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22523596 - 22523415
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| || | ||||||||||||   |||||||    
T  22523596 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggtcttgattttg 22523497  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    || | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22523496 aaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatat 22523415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18859632 - 18859512
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  18859632 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18859533  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  18859532 ttttgaaatggatttagtttg 18859512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 21391587 - 21391706
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  21391587 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21391686  T
Q  107 ttttgaagtagatttagttt 126  Q
    ||||||  | ||||||||||    
T  21391687 ttttgagatggatttagttt 21391706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 21780913 - 21781032
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  21780913 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21781012  T
Q  107 ttttgaagtagatttagttt 126  Q
    ||||||  | ||||||||||    
T  21781013 ttttgagatggatttagttt 21781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 21786081 - 21786200
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  21786081 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21786180  T
Q  107 ttttgaagtagatttagttt 126  Q
    ||||||  | ||||||||||    
T  21786181 ttttgagatggatttagttt 21786200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22990095 - 22989872
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||  | |||||||||||| | |||||||    
T  22990095 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgtgattttg 22989996  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | || || ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  22989995 aaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 22989896  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
     ||| |||| ||||||||||||||    
T  22989895 ggtgtatttctcttctgctgaaga 22989872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 21164264 - 21164358
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggt 101  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  21164264 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggt 21164358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21254000 - 21253895
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  21254000 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21253901  T
Q  107 ttttga 112  Q
    ||||||    
T  21253900 ttttga 21253895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19981022 - 19980902
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  19981022 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 19980923  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||||||  | |||||||||||    
T  19980922 ttttgagatggatttagtttg 19980902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 19481798 - 19481969
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||| || | ||    
T  19481798 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtga 19481897  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  19481898 ttttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 19481969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22031158 - 22030969
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| | ||||||||||||   ||    
T  22031158 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcatga 22031059  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 196  Q
    ||| ||| | |||||||||||  |||   | |  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22031058 tttcgaaatggatttagtttgtctacatttaagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaa 22030969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Original strand, 22246176 - 22246345
Alignment:
Q  24 atggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttag 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |  |||||| | |||||||||||| | ||||||||| |  |||| |    
T  22246176 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttgg 22246275  T
Q  124 tttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    |||| |||||  |||  |  |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22246276 tttgtttacctttgagtgaaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 22246345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Original strand, 22245758 - 22245847
Alignment:
Q  24 atggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaa 113  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |  |||||| | |||||||||||| | |||||||||    
T  22245758 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaa 22245847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Original strand, 21323155 - 21323244
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  21323155 ttggtatgaactggttggagtataaccatgtccatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 21323244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8621 - 8343
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || |    
T  8621 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcg 8522  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    | ||||| || || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||    
T  8521 acttagtatgtttgccgttgacgtgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgca 8422  T
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||  |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8421 tttttcttctgctgaagaagagggtgaagttaagttcttatctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatggaatt 8343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1493 - 1374
Alignment:
Q  177 tataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagc 276  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||  |||||||  ||||||| |    
T  1493 tataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagggtgaagttaagttcttatctacgaaacagatgaaac 1394  T
Q  277 agctagaacgtgatggaatt 296  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  1393 aactagaacgtgatggaatt 1374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 5443 - 5724
Alignment:
Q  19 gagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtaga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  | | |||||||||||| |||||||  || ||    
T  5443 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccattgtttatgtttggtagagattttgtggttga 5542  T
Q  119 tttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcat 218  Q
    ||||||||| || ||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||  |||||    
T  5543 tttagtttgtttgccgttgtcgcgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgcttcagtaagacgatgcat 5642  T
Q  219 ttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5643 ttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacgaaatagatgaaacagctaaaacgtgatggaattctga 5724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10995 - 10766
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10995 ctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtaggga 10896  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||  || |||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  10895 ctttgtggttgatttagtttgcttgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagt 10796  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10795 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaa 10766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Original strand, 49466 - 49755
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  49466 ctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 49565  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| || || ||||| ||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  49566 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 49665  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| || ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49666 aagacggtgcattttgcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaagtagctagaacgtgatggaatt 49755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Original strand, 58500 - 58789
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  58500 ctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 58599  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| || || ||||| ||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  58600 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 58699  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| || ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  58700 aagacggtgcattttgcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaagtagctagaacgtgatggaatt 58789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Original strand, 64888 - 65177
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  64888 ctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 64987  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| || || ||||| ||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  64988 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 65087  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| || ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  65088 aagacggtgcattttgcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaagtagctagaacgtgatggaatt 65177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29642 - 29349
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  29642 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagaga 29543  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||  ||| ||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29542 ctttgaagtcgacctagcttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 29443  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||  |  |||| ||  || |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  29442 aagacgatgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagctgagttcctatctactaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaattctga 29349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 251640 - 251347
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  251640 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 251541  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||| ||| ||| ||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||      
T  251540 ctttgtagtcgatctagtttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcaaataaactgctttagt 251441  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| || ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  251440 aagacggtgcatttttcttctgctaaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacagctagaacgtgacgggattctga 251347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 773 - 1064
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||  | ||||||||| |||| ||    
T  773 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagaga 872  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  873 ctttgaagtcgacttagttggttttccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 972  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    || |  ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  973 aatatggtgcatttttcttctactgaagaagagggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatggaattct 1064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20832 - 20610
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||  | |||||||||||||| ||    
T  20832 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 20733  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  20732 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 20633  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20632 aagacagtgcatttttcttctgc 20610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2889 - 2598
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  2889 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 2790  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| |||| || || ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||      
T  2789 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatagatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagt 2690  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| || |||||||||||  || ||||| || | || ||||||||||||||    
T  2689 aagacggtgcatttttcttccgctgaagaagagagtgaagctgagttcttgactacgaaacagttgaagtagttggagcgtgatggaattct 2598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 246
Target Start/End: Original strand, 98874 - 99108
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |  | |||||||||||||| || ||||    
T  98874 atgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctatgtttggtagagactttg 98973  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |||| || |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||    
T  98974 aagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagac 99073  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  99074 ggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 99108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 176006 - 175717
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  176006 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 175907  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||||| ||| | || || || ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||  | ||||      
T  175906 ttttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagaataatcgtgttcatatcaattgttttagt 175807  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    |||||  | ||||||||||||||||  ||| || ||| |||||| || |||||||| ||  || ||||| || |||||||||||||||||    
T  175806 aagacgatacatttttcttctgctggggaagagagtgaagttgagttcttgactactaaacagttgaagtagttagaacgtgatggaatt 175717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Original strand, 5135 - 5424
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  5135 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 5234  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||  || || ||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||      
T  5235 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcagttgctttagt 5334  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||| || || ||| |||||||  ||||||| || || |||||||||||||||    
T  5335 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagtggagttcttgtctacgaaacagatgaaacaacttgaacgtgatggaatt 5424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 17770 - 18062
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||   |  ||||||||||||| ||    
T  17770 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggagtcagttgactatgtttggtagaga 17869  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||  || || ||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||      
T  17870 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaataaattggttagagtataatcaagttcatatcaactgctttagt 17969  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||| | |||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  17970 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtc-acgaaacagatgaaacagctagaaagtgatgggattctga 18062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 8748 - 9040
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  8748 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 8847  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| |||| || |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||  | |||| |    
T  8848 ctttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacaggaatggacgttatttttgggataaactagttagagtataaccgggttcatatcaattgttttagc 8947  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  8948 aagacagtgca-ttttcttctgttgaagaagagggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatggatttctga 9040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 18962 - 19254
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  18962 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 19061  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| |||| || |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||  | |||| |    
T  19062 ctttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacaggaatggacgttatttttgggataaactagttagagtataaccgggttcatatcaattgttttagc 19161  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  19162 aagacagtgca-ttttcttctgttgaagaagagggtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatggatttctga 19254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 601 - 362
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  601 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 502  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  501 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgggttcatatcaattgctttagc 402  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  401 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 151580 - 151346
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||  | |||||||||||||| ||  |||    
T  151580 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacattg 151481  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |||| || |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||    
T  151480 aagtcgacttagtttgtttacagttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagac 151381  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  151380 ggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 151346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 23824 - 24047
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| || | |||||||||||| | |||||||    
T  23824 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattttg 23923  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  23924 aaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 24023  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
     ||  |||||||||||||||||||    
T  24024 ggtatatttttcttctgctgaaga 24047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 42716 - 42427
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  42716 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 42617  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||  |||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||      
T  42616 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagt 42517  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||| | ||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||||||  | ||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  42516 aagccggtgcattattcttctactgaagaagaaggtgaagttgagctcttgtctacgaaacagttgaagcagttagaacgtgatggaatt 42427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 50631 - 50751
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  50631 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 50730  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||||||  | |||||||||||    
T  50731 ttttgagatggatttagtttg 50751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 141 - 380
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||| |  | |||||||||||||| ||    
T  141 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataagatgtacgttgtctatgtttggtagaga 240  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| |    
T  241 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagggtataaccgagttcatattaattgctttagc 340  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  341 aaaacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggag 380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36957 - 36718
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  36957 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 36858  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |    
T  36857 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgatatttttgggatgaactgtttagagtataatcgagttcatatcaatttctttagc 36758  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  36757 aagacggcgcatttttcttctgctgaagaagagagtggag 36718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 50123 - 49832
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||  | |||||||||||||| ||    
T  50123 ctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 50024  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||      
T  50023 ctttgaagtcgatcttgtttgcttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaaatggttagagtataaccaagttcatatcaattgctttagt 49924  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| || ||| ||  | ||||| ||  || | ||| || |||||||||||||||||||    
T  49923 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtgaagctgagttcctaactactaaacagttcaagtagttagaacgtgatggaattct 49832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 63805 - 64096
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  63805 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 63904  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| |||| || || ||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  63905 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgttgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 64004  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||| || ||| || ||| || || ||||| ||  || |||||||| | || ||||||||||||||    
T  64005 aagacgatgcatttttcttctactgaagaagagagtgaagctgagttcttaactactaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaattct 64096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 44713 - 45004
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  44713 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 44812  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  44813 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 44912  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||||  || ||  | ||||||||  || |||||||| | || ||||||||||||||    
T  44913 aagacggtgcatttttcttctacggaagaagagagtggagcagagttcctaactacgaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaattct 45004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 39619 - 39848
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39619 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 39718  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  39719 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 39818  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  39819 aagacggtacatttctcttctgctgaagaa 39848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14437 - 14214
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||| | |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  14437 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttg 14338  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |||| |    
T  14337 aaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtc 14238  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    |||| |||||||||| ||||||||    
T  14237 agtgtatttttcttccgctgaaga 14214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4928 - 4644
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |  |||||| | ||| ||||||||   || ||||    
T  4928 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtgtgtttaacatgtcctttgtctttgtttggtcaagagtttg 4829  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | || |||||||| |||||  |||  || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  4828 aaattgacttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 4729  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    |||  ||||||||||| | |||||| || ||||||  ||||| ||| |||| ||| || |||||||  ||||||| |||||||||    
T  4728 agtatatttttcttctaccgaagaagagagtggagcagaattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgcgatggaatt 4644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11827 - 11534
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11827 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 11728  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||      
T  11727 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgggttcatatcaactgctttagt 11628  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||| | ||||  |||||  || || |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  11627 aagacggtacatttctcttctgctgaggaagaaggtgaggttgagcttctgtctacaaaacagatgaaacagtttgaacgtgatggaattctga 11534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11978 - 11693
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||  |    
T  11978 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagata 11879  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||| || ||| | ||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||      
T  11878 ctttgaggttgatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 11779  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||| || ||| || |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||    
T  11778 aagacggtacatttttcttctgctgaggaagagagtgaagctgagttcttgactactaaacagttgaagcagttagaacgtgatgg 11693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 60757 - 60528
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  60757 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 60658  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| |||| || || ||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||      
T  60657 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 60558  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  60557 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaa 60528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 296
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79406
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||    
T  79267 ttggtatgaactggttggagtataaccatgtccatatcaattgctttagtaagatggtgcatttttcttctgctgaagaagagggtaaagtggagttttt 79366  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    | |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  79367 gtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatggaatt 79406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 70126 - 70079
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcag 54  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  70126 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 10058 - 10297
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||  | ||||||||| |||| ||    
T  10058 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagaga 10157  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  10158 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 10257  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  10258 aagacggtgcatttttcttttgcggaagaagagagtggag 10297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 24236 - 24520
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||| | | ||||||     
T  24236 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatttta 24335  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
       | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||  |    
T  24336 ggattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaaatc 24435  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
     ||| |||| ||||||||||||||  |  |||| |  || |||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  24436 ggtgtatttctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatt 24520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1138 - 919
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||    
T  1138 ctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 1039  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  1038 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 939  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  938 aagacggtgcatttttcttc 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 110628 - 110389
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  110628 ctgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 110529  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||||||  |  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  110528 ctttgaagtcaacctagtttgtttacctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 110429  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  110428 aagacggtgcatttttcttctgcagaagaagagagtggag 110389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7056 - 6818
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  7056 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 6957  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||| |||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  6956 ctttaaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 6857  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtgga 245  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||| || |||||    
T  6856 aagacggtgcatttttcttttgcggaagaagagagtgga 6818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40076 - 39787
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  40076 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 39977  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||  || || ||||| ||  ||||| |||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||      
T  39976 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacaggtatggatgttagttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatataaattgctttagt 39877  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||  || || || ||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39876 aagacggtgcatttttcttccgatgaagaagagggtgatgtggagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatggaatt 39787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Original strand, 17635 - 17799
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  17635 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcct-tgtctatgtttgatcgtga 17733  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggtt 172  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  17734 ttttgagatggatttagtttgcttacctttgagtggtatggatgtgattattggtatgaactggtt 17799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Original strand, 1169 - 1358
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||  | |||||||||||||| ||    
T  1169 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagaga 1268  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 196  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1269 ctttgaagtggacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaa 1358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Original strand, 30628 - 30894
Alignment:
Q  23 aatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagattta 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| || ||||  || ||||||    
T  30628 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtggttgattta 30727  T
Q  123 gtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcattttt 222  Q
    ||||| || ||| || |||| ||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| || |||||||    
T  30728 gtttgtttgccgttgtcgggtat-------atttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaaatgctttagtaagacggtacattttt 30820  T
Q  223 cttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30821 cttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacaaaacagatgaaacagctagaacgtgatggaatt 30894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 49163 - 49454
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||    
T  49163 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagaga 49262  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| |||| |  || ||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||      
T  49263 ctttgaagtcgatctagtatatttgccgttgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagt 49362  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || | | |  ||| || |||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  49363 aagacagtgcatttttcttctgctgaggaagagagcgaaactgagttattgactacgaaacagttgaagcagttagaaagtgatgaaattct 49454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 325725 - 325486
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||   | |||||||||||||| ||    
T  325725 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagaga 325626  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||      
T  325625 ctttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattattttaga 325526  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  325525 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 325486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Original strand, 200765 - 201039
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||   | |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  200765 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttg 200864  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    || |||| || || ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||  ||||| |||||    
T  200865 atctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttagtaagacggtgca 200964  T
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    |||||||||||| || ||| || ||  |||||| || |||||||| ||  || ||||| || |||||||||||||    
T  200965 tttttcttctgcggaggaagagagtaaagttgagttcttgactactaaacagctgaagtagttagaacgtgatgg 201039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11837 - 11563
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11837 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaagttg 11738  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    || | || || || | | || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  11737 atcttgtatgtttgctgttgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaactgttttagtaagacagtgca 11638  T
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    |||||||| |||||| ||| || ||  |||||| || |||||||| ||  || | |||||| |||||||||||||    
T  11637 tttttcttttgctgaggaagagagtaaagttgagttcttgactactaaacagctaaagcagttagaacgtgatgg 11563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Original strand, 1 - 166
Alignment:
Q  135 ctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaag 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  1 ctgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttaacaagaccgtacatttttcttctgccgaag 100  T
Q  235 aatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    || || ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  101 aagagagtggagttgaaattttaactacgaaagagatgaagcaggtagaacgagatgggattctga 166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 1608 - 1820
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| || |||||||| |    
T  1608 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 1707  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    || | ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||  ||||    
T  1708 atcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacgatgca 1807  T
Q  218 tttttcttctgct 230  Q
    |||||||||||||    
T  1808 tttttcttctgct 1820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 43705 - 43996
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||  |    
T  43705 ctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagata 43804  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||| | ||| |||| || || ||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||      
T  43805 ctttgaactcgatctagtatgtttgccattgacgggtatgaatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaatttctttagt 43904  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || || ||| || ||| || |||||||||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43905 aagacagtgcatttttcttctgttgaaaaagagagtgaagctgagttcttgactacgaaacaattgaagcagttagaacgtgatggaattct 43996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25208 - 24941
Alignment:
Q  33 gaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttac 132  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||||||| ||  | || ||||| ||||    
T  25208 gaaactcgagctaagggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttgaggttaacttggtttgtttac 25109  T
Q  133 cgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctga 232  Q
    || ||||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||  |||||||||  |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25108 cgttgacgggaatggatgtaatccttggtatgaactggttgaagtataaccatgttcatattaattgctttagtaagaccgtgcatttttcttctgctga 25009  T
Q  233 agaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    || | | |||| |||| | || ||| |||||||  |||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  25008 aggagaaggtgaagttaagttattgtctacgaaacagatgttacagctagaatgtgatggaattctga 24941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 246
Target Start/End: Original strand, 5500 - 5734
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||   | |||||||||||||| || |||     
T  5500 atgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagacttta 5599  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |||| || ||||| || |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||    
T  5600 aagtcgacttagtctgtttaccgttgacgggtatggatattatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcagtttctttagccagac 5699  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  5700 ggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 5734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 54065 - 53836
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  54065 ctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 53966  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||| |||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| |    
T  53965 cttttaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatctattgttttagc 53866  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  53865 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaa 53836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41753 - 41528
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41753 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtaggga 41654  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||   | |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  41653 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagt 41554  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctga 232  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||    
T  41553 aagacggtacatttctcttctgctga 41528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Original strand, 1558 - 1846
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  1558 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 1657  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| | || || || ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||      
T  1658 ctttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatataaccgtgttcatattaattgttttagt 1757  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
    |||||  | |||||||||||||| || ||| | |||| |||||| || |||||||| ||  ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  1758 aagacgatacatttttcttctgcggaggaagaaggtgaagttgagttgttgactactaaacagatgaagcaattggaacgtgatggaat 1846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 196
Target Start/End: Original strand, 1145 - 1329
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  | |||||||||||||| || ||||    
T  1145 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 1244  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 196  Q
    |||| || ||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1245 aagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgagaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaa 1329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Original strand, 28571 - 28859
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  28571 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 28670  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| | || || || ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||      
T  28671 ctttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatataaccgtgttcatattaattgttttagt 28770  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
    |||||  | |||||||||||||| || ||| | |||| |||||| || |||||||| ||  ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  28771 aagacgatacatttttcttctgcggaggaagaaggtgaagttgagttgttgactactaaacagatgaagcaattggaacgtgatggaat 28859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 9527 - 9741
Alignment:
Q  21 gaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatt 120  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||  || |||| || |    
T  9527 gaaatagttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagacattaaagtcgact 9626  T
Q  121 tagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcattt 220  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||    
T  9627 tagtttgtttaccgttgacggg-atggatgttattttttggatgaactggttagaatataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcattt 9725  T
Q  221 ttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||||||| ||||||    
T  9726 ttcttctgcggaagaa 9741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26130 - 25839
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  26130 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 26031  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| || || ||||| ||  ||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  | ||||||    
T  26030 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtttgtataaattgttttaac 25931  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | |||||| |  ||||||  || ||| | ||||| ||  || |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  25930 aagacggtgcacttttcttcttcggaagaacatagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatggaattct 25839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 203399 - 203246
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  203399 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 203300  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgg 160  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  203299 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttgg 203246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 424326 - 424266
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 67  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  424326 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 2238 - 2478
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||| |  | |||||||||||||| ||    
T  2238 ctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgttcgttgtctatgtttggtagaga 2337  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttg-ggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaa 205  Q
     |||||||| || |||||||| |||| | |||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  2338 ctttgaagtcgacttagtttgtttactgttgaccgctatggatgttatttttgaggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 2437  T
Q  206 caagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  2438 caagacggtgcatttttcttttgcggaagaagagagtggag 2478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 70390 - 70151
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  70390 ctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 70291  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||| || || ||||| ||  ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | || |||    
T  70290 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgtatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagtttatataaattgtttcaac 70191  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    ||||  |||||||| |||||||| |||||| || ||||||    
T  70190 aagatggtgcatttgtcttctgcggaagaagagagtggag 70151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5620 - 5337
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||    
T  5620 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgtttgacttgtccgttgtctatgtttggtagaga 5521  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||||||  || |||| || || ||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||      
T  5520 ctttgaagtcaatctagtatgtttgccgttgtcgggcatggatgtaatttttgggatgaattggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 5421  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgat 290  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||| || | | || ||| || ||| |||| ||  || |||||||| |||||||||||    
T  5420 aagacggtacatttttcttctgttgaagaagagagcgaagctgagttcttgcctactaaacagttgaagcagttagaacgtgat 5337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29952 - 29709
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29952 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 29853  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    |||||  || |||||||||||  | ||| ||  ||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||      
T  29852 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgttgggtatggatgtgatttttggaatgaattggtcagagtataatcgagttcatatcaactgctatagt 29753  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttga 250  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||| ||||||    
T  29752 aagacggtgcatttttcttctactgaggaagaaggtgaagttga 29709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1224 - 998
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| | || ||||   | |||||||||||||| || ||||    
T  1224 atgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggtt--------acttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttg 1133  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  1132 aagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataatcgagttcatatcaattgctttagcaagac 1033  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
     |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1032 ggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggag 998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5199 - 4970
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| | || |||||  | || ||||||||||| ||    
T  5199 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtcaatgtttggtagaga 5100  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||      
T  5099 ctttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcacatcatttgctttagt 5000  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4999 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaa 4970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29545 - 29257
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  29545 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 29446  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     ||||| || ||| | || || || ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||      
T  29445 ctttgaggttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagt 29346  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
    ||||  || |||||||||| || ||| ||| || ||| || ||| || |||||||| ||  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  29345 aagatggtacatttttcttatgttgaggaagagagtgaagctgagttcttgactactaaacagttgaagcagttagaacgtgatggaat 29257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34341 - 34062
Alignment:
Q  21 gaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatt 120  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||  || |||||||| ||      
T  34341 gaaatggttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtaaagactttgaagtcgacc 34242  T
Q  121 tagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcattt 220  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||    
T  34241 tagtttgtttatcgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtacaatcgagttcatatcaattactttagcaagacggtgcattt 34142  T
Q  221 ttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||  || ||  |  |||| ||  || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34141 ttcttctactgaagaagagagtggagcggagttcctatctactaaacagttgaagcagttggaacgtgatggaattctga 34062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Original strand, 4386 - 4660
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||| |    
T  4386 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttgaagttg 4485  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    || | || || || ||| |||||||  ||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||  ||||| || ||    
T  4486 atcttgtatgtttgccgttgacgggtttggatgtaatccttgggatgaactggttagaatataaccgtgttcatatcaactgttttagtaagacggtaca 4585  T
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    ||| ||||||||||| ||| |  ||  || ||| || |||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||    
T  4586 tttctcttctgctgaggaagaaagtaaagctgagttcttgactactaagcagctgaagtagttagaacgtgatgg 4660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5686 - 5530
Alignment:
Q  90 tctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttc 189  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5686 tctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgggttc 5587  T
Q  190 atatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  5586 atatcaattgctttagcaagacagtgcatttttcttctacggaagaagagagtggag 5530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5823 - 5689
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||  | |||||||||||||| ||    
T  5823 ctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagaga 5724  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacgg 141  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  5723 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgg 5689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 164701 - 164905
Alignment:
Q  21 gaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatt 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| | | |||||||   | ||||||||||||||||| ||| | || ||||    
T  164701 gaaatggttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctcttgtttatctaaggtgtctattgtctatgtttggtagggactttcaggtcgatt 164800  T
Q  121 tagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcattt 220  Q
    |||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||    
T  164801 tagtgtgtttaccgttgacgggaatagatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcattt 164900  T
Q  221 ttctt 225  Q
    |||||    
T  164901 ttctt 164905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 152099 - 151973
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  152099 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 152000  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttacc 133  Q
    ||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  151999 ttttgagattgatttggtttgtttacc 151973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 30860 - 30931
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttga 78  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  30860 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 30931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 47274 - 47388
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | |||||||||| | | |||||||    
T  47274 atgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagg-ttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtctatgtttgatcgtgattttg 47372  T
Q  112 aagtagatttagtttg 127  Q
    || | ||||| |||||    
T  47373 aaattgatttggtttg 47388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 20814 - 21024
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  20814 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20913  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
     |||||||| ||  ||||||| |||||| || |     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  20914 ctttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgtc--tcttggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 21011  T
Q  207 aagacagtgcatt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  21012 aagacggtgcatt 21024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 12639 - 12844
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| || ||||    
T  12639 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 12738  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |||| ||  ||||||| |||||| || |     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  12739 aagtcgacctagtttgtttaccgttgtc--tcttggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagac 12836  T
Q  212 agtgcatt 219  Q
     |||||||    
T  12837 ggtgcatt 12844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 4186 - 4397
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||   | |||||||||||||| || | ||||||||    
T  4186 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgtttaagatgtcaattgtctatgtttggtagagaatatgaagtag 4285  T
Q  118 atttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgca 217  Q
    |  |||| || |||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  ||||| || ||    
T  4286 aaatagtatgtttaccgttaaagggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacggtaca 4385  T
Q  218 tttttcttctgc 229  Q
     |||||||||||    
T  4386 cttttcttctgc 4397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 8065 - 8187
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactact--tctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagg 104  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||| || |||||| | ||| || | |||||||||||| |     
T  8065 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctctctcgtatgtttgcgatgttctttgtctatgtttggtcgt 8164  T
Q  105 gattttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||||||||| | |||||||||||    
T  8165 gattttgaaatggatttagtttg 8187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3647 - 3445
Alignment:
Q  96 tttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatca 195  Q
    |||||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647 tttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatca 3548  T
Q  196 acagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
    |   ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||  | ||||| ||  || |||||||| | || |||||||||||    
T  3547 attactttagcaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagctgagttcctaactactaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaat 3448  T
Q  296 tct 298  Q
    |||    
T  3447 tct 3445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36516 - 36297
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||| | ||    
T  36516 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 36417  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | ||| |||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  | |||| |    
T  36416 ttttgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 36317  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| ||||| |||| |||||    
T  36316 aagtcagtgtatttctcttc 36297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 54650 - 54367
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | |||||||    
T  54650 atgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcgtgattttg 54551  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |  | ||||||||||| |||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  54550 agatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 54451  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
     ||| |||| ||||||||||||||  |  |||| |  || |||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  54450 ggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagttgaagcagttagaacgtgatggaat 54367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 10524 - 10752
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||||||||||| | ||    
T  10524 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtga 10623  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  | |||| |    
T  10624 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagc 10723  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  10724 aagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 10752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 13179 - 13407
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| || ||||||||||| | ||    
T  13179 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttaactatgtttggtcgtga 13278  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  | |||| |    
T  13279 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagc 13378  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  13379 aagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 13407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31896 - 31715
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  31896 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttg 31797  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    |  | |||||||||||  ||||  |||  ||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  31796 atatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 31715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37362 - 37181
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  37362 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttg 37263  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    |  | |||||||||||  ||||  |||  ||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  37262 atatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 37181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1739 - 1565
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||  | |||||||||||||| ||    
T  1739 ctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttctttgtttgagttttccactgtctatgtttggtagaga 1640  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 181  Q
     |||||||| ||| |||| || || ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1639 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 1565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Original strand, 17352 - 17541
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||    
T  17352 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtga 17451  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 196  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  |  |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17452 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaa 17541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24319 - 24095
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| ||||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  24319 atgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttg 24220  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
     ||| ||  |||| || ||  || |||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||| |||| |||||  |||||||| ||  ||||||  |||||    
T  24219 tagtggacctagtctgtttgtcgttgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaaccatgttcatattaattgctttagaaagac 24120  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaa 236  Q
     |||| |||||||||||| ||||||    
T  24119 ggtgcgtttttcttctgccgaagaa 24095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Original strand, 195150 - 195217
Alignment:
Q  33 gaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||    
T  195150 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttgg 195217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 29214 - 29433
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||    
T  29214 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtga 29313  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  |||   |||  || |||||||| ||| | |  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  29314 ttttgaaatggatttagtttgtctacatttgagcggtatggatgtgattctggatatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 29413  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| ||||| |||| |||||    
T  29414 aagtcagtgtatttctcttc 29433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12745 - 12593
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||| ||    
T  12745 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagttgtccattgtctatgtttggtagaga 12646  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttg 159  Q
     |||||| |  || | ||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  12645 ctttgaaatcaatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttg 12593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 1101 - 1236
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||  | |||||||||||||| ||    
T  1101 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctatgtttggtagaga 1200  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggg 142  Q
     |||||||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  1201 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacggg 1236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22265 - 22046
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  22265 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22166  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  22165 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22066  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  22065 aagtcagtgcatttctcttc 22046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26365 - 26082
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||| | || ||||    
T  26365 atgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactttg 26266  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||| ||||| || ||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  | ||||| ||| |    
T  26265 aaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataagtc 26166  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
     ||  |||||||||||| | ||||| || |||| |  || ||||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||    
T  26165 ggtatatttttcttctgttaaagaagagagtggggcggagtttttgactactaagcagctaaagcagttagagcgtgatggaat 26082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 37106 - 37200
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggt 101  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  37106 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggt 37200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 298
Target Start/End: Original strand, 15270 - 15556
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| || | |||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  15270 atgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattttg 15369  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |  | ||||| ||||| || ||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||  | | ||||||| |    
T  15370 agattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaagtc 15469  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattct 298  Q
    |||| ||||||||||||  |||||| || ||||||  || || ||| |||| ||| || |||| ||| |||| ||||||| ||||||    
T  15470 agtgtatttttcttctgtcgaagaagagagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaaacagttagagcgtgatgaaattct 15556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 11642 - 11863
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||||||| || | ||    
T  11642 ctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttagtcgtga 11741  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| |  ||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  11742 ttttgaaatgaatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 11841  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctg 228  Q
    ||| ||||| |||| |||||||    
T  11842 aagtcagtgtatttctcttctg 11863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17178 - 16989
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||| || | ||    
T  17178 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttaagatgccctttatctatgtttagtcgtga 17079  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 196  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17078 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccgtgttcatatcaa 16989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3442 - 3223
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  3442 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 3343  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  3342 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 3243  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  3242 aagtcagtgcatttctcttc 3223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 13410 - 13638
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  13410 ctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaatggttggtcgtga 13509  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  | |||| |    
T  13510 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgttatggatgtgattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagc 13609  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  13610 aagtcagtgtatttctcttccgctgaaga 13638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41173 - 40997
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  41173 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 41074  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  41073 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaacc 40997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 23589 - 23805
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  23589 atgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttatctatgtttggtagagattttg 23688  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |  | ||||| ||||| || ||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||  | | ||||||| |    
T  23689 agattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaagtc 23788  T
Q  212 agtgcatttttcttctg 228  Q
     ||| ||||||||||||    
T  23789 ggtgtatttttcttctg 23805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Original strand, 9642 - 9742
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9642 atgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttg 9741  T
Q  112 a 112  Q
    |    
T  9742 a 9742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 1318 - 1537
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  1318 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 1417  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||  | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||  | |||| |    
T  1418 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttacagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 1517  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| ||||| |||| |||||    
T  1518 aagtcagtgtatttctcttc 1537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5101 - 4818
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||| | || ||||||||| | || ||||    
T  5101 atgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtttggtcgagactttg 5002  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||||||||| ||  |  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  | || || ||| |    
T  5001 aaattgatttagtttgtttgtctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgtttcaataagtc 4902  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
     ||  |||||||||||||||||||| || ||||||   | || |||||||| ||| || ||||| || |||| |||||||||||    
T  4901 ggtatatttttcttctgctgaagaagagagtggagcaaagttattgactactaagcagctgaagtagttagagcgtgatggaat 4818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 13770 - 13993
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || |||||  | |||||||||||| | ||||||     
T  13770 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctatgtttggtcgagatttta 13869  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||||||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  13870 aaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 13969  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  13970 agtgtatttttcttctgctgaaga 13993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6886 - 6663
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  6886 atgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttg 6787  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | || || ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  6786 aaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 6687  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
     ||| |||| ||||||||||||||    
T  6686 ggtgtatttctcttctgctgaaga 6663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14016 - 13793
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  14016 atgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttg 13917  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | || || ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  13916 aaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 13817  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
     ||| |||| ||||||||||||||    
T  13816 ggtgtatttctcttctgctgaaga 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11487 - 11268
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  11487 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 11388  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | ||||| |||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  11387 ttttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 11288  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  11287 aagtcagtgcatttctcttc 11268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17955 - 17736
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  17955 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17856  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | ||||| |||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |    
T  17855 ttttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 17756  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttc 226  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  17755 aagtcagtgcatttctcttc 17736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 53719 - 53526
Alignment:
Q  33 gaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttac 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||  |||    
T  53719 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctac 53620  T
Q  133 cgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttc 226  Q
    |  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||  | |||| |||| |||||||||| |||||    
T  53619 ctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttc 53526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Original strand, 47950 - 48039
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  47950 ttggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctacggaagaagagagtggag 48039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 216711 - 216933
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||| ||||| | ||||||     
T  216711 atgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttcagatgtcctttgtctatgattggtcgagatttta 216810  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  216811 aaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 216910  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaag 234  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  216911 ggtgtatttttcttctgctgaag 216933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8968 - 8803
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  8968 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtga 8869  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggtt 172  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  8868 ttttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggtt 8803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18668 - 18379
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  18668 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtga 18569  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||  | ||||      
T  18568 ttttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 18469  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
    ||| | ||| |||| ||||||||||||||  |  |||| |  || |||||| |||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  18468 aagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagtagttagaacgtgatggaatt 18379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10386 - 10210
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  10386 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 10287  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  10286 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 10210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 14557 - 14841
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  14557 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttg 14656  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||| ||||| |||||  |||  || ||||| || ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  |||      
T  14657 aaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggaagtaatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtt 14756  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
     ||| |||||||||||||||||||  |  |||| |   |||| ||| |||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  14757 ggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcataattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatt 14841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 24998 - 25174
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| | | ||    
T  24998 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtga 25097  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| | ||||||||| ||||    
T  25098 ttttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactagttagagtacaacc 25174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Original strand, 2549 - 2714
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  2549 ctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 2648  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggtt 172  Q
    ||||||  ||||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  2649 ttttgagatagatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggtt 2714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 159 - 39
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||   ||    
T  159 ctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcatga 60  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  59 ttttgaaatggatttagtttg 39  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8276 - 8048
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||   |||||  | |||||||||||| | ||    
T  8276 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtga 8177  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaac 206  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||  | |||| |    
T  8176 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 8077  T
Q  207 aagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||| ||||| |||| ||||| || |||||    
T  8076 aagtcagtgtatttctcttccgccgaaga 8048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 246
Target Start/End: Original strand, 19075 - 19159
Alignment:
Q  162 atgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19075 atgaattggttacagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggag 19159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 133
Target Start/End: Original strand, 57917 - 58026
Alignment:
Q  24 atggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttag 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| | ||||||||| | ||||| |    
T  57917 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttgg 58016  T
Q  124 tttgcttacc 133  Q
    |||| |||||    
T  58017 tttgtttacc 58026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17891 - 17607
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| | || ||||    
T  17891 atgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagactttg 17792  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||  | |||   ||| |    
T  17791 aaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgttttgttaagtc 17692  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
     ||| ||||||||||| ||| |||| |  ||||||  || |||||| |||| ||| || |||||||  ||||||| |||||||||    
T  17691 ggtgtatttttcttctactgtagaagaaagtggagcagagtttttgtctactaagtagctgaagcaattagaacgcgatggaatt 17607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 295
Target Start/End: Original strand, 111210 - 111481
Alignment:
Q  24 atggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttag 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| || || ||| | | |||||||| | | ||||||||| | || || |    
T  111210 atggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgtttaagatgccctttgtttatgtttgatcgtgattttgaaattgacttgg 111309  T
Q  124 tttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttc 223  Q
    |||| |||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| | ||| |||| ||    
T  111310 tttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctc 111409  T
Q  224 ttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
    |||||||||| |  |  |||| |  || |||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  111410 ttctgctgaaaaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaat 111481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 51701 - 51545
Alignment:
Q  136 tgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||  ||||| || |||||||||||| |||| ||    
T  51701 tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttattaagactgtacatttttcttctactgagga 51602  T
Q  236 atagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    | || ||| |||||| || |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||    
T  51601 agagagtgaagttgagttcttgactactaaatagttgaagcagttagaacgtgatgg 51545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 10449 - 10615
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  10449 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttg 10548  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 178  Q
    |  | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  10549 agatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagta 10615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 168 - 246
Target Start/End: Original strand, 5521 - 5599
Alignment:
Q  168 tggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5521 tggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggag 5599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Original strand, 11166 - 11271
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  11166 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 11265  T
Q  107 ttttga 112  Q
    ||||||    
T  11266 ttttga 11271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12676 - 12495
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  12676 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttg 12577  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    |  | ||| | |||||||| ||  |||  || ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  12576 agattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatggacgtcattcttggtctgaattggttagagtacaaccatgttcatat 12495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15435 - 15254
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||| | ||||| | |||||||    
T  15435 atgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattttg 15336  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 193  Q
    || | ||||| ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  15335 aaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatat 15254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8428 - 8336
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 99  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  8428 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttg 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8241 - 8065
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  8241 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 8142  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||  |  |||| |||||  ||||| |||  |  |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8141 ttttgagattcatttggtttgtctaccgttgagtgctatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaacc 8065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 35001 - 35121
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  35001 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 35100  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttg 127  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  35101 ttttgaaatggatttagtttg 35121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41623 - 41422
Alignment:
Q  34 aaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttacc 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  41623 aaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacc 41524  T
Q  134 gctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaa 233  Q
      |||  || |||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  41523 tttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaa 41424  T
Q  234 ga 235  Q
    ||    
T  41423 ga 41422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 75343 - 75142
Alignment:
Q  34 aaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttacc 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  75343 aaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacc 75244  T
Q  134 gctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaa 233  Q
      |||  || |||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  75243 tttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaa 75144  T
Q  234 ga 235  Q
    ||    
T  75143 ga 75142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4447 - 4224
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | |||||||    
T  4447 atgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttg 4348  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    |  | ||||| ||||| |||||  |||  || ||| |||| ||| |||| |  |||||||||||||| ||||  |||||||| ||  | ||||  ||| |    
T  4347 agatcgatttggtttgtttacctttgagtggtatgaatgtgattcttggcaaaaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtc 4248  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaaga 235  Q
     ||| |||| ||||||||||||||    
T  4247 ggtgtatttctcttctgctgaaga 4224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 223 - 80
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||  |    
T  223 ttggtatgaactggatggagcataaccgagttcatatcaattgctttaacaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagctgagttcct 124  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattctga 300  Q
      |||| ||  || |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  123 atctactaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaattctga 80  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Original strand, 766 - 955
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || || | ||  |||||| ||| |||||||||| | ||    
T  766 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtga 865  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 196  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  866 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtgcaaccatgttcatatcaa 955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Original strand, 664 - 769
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  664 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 763  T
Q  107 ttttga 112  Q
    ||||||    
T  764 ttttga 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1355 - 1218
Alignment:
Q  92 tatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcat 191  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||  ||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   |    
T  1355 tatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagattataaccgagtctgt 1256  T
Q  192 atcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgc 229  Q
    || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1255 ataaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgc 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 292
Target Start/End: Original strand, 4668 - 4821
Alignment:
Q  139 cggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaata 238  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||  |||||  | ||||||||||||||||| ||| |    
T  4668 cgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacgatacatttttcttctgctgaggaaga 4767  T
Q  239 gggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatgg 292  Q
    | ||| || ||| ||  ||||||||||  || |||||||| |||| ||||||||    
T  4768 gagtgaagctgagttcgtgactacgaaacagttgaagcaggtagagcgtgatgg 4821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 4590 - 4660
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttg 77  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  4590 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtatgtttg 4660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Original strand, 921 - 1010
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggag 246  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  921 ttggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgcttttgcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 1010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2002 - 1902
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | |||||||    
T  2002 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttg 1903  T
Q  112 a 112  Q
    |    
T  1902 a 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 104240 - 103956
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | |||||||    
T  104240 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttg 104141  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
    || | || || ||||| |||||  |||  || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || |   | |||| |||| |    
T  104140 aaattgacttggtttgtttacctttgagtggcatggatgtaatcatgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagcaagtc 104041  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaatt 296  Q
     ||| |||| ||||||||||||||  |  |||| |  || |||||| |||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  104040 ggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatt 103956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 6543 - 6606
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgt 70  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6543 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Original strand, 21485 - 21763
Alignment:
Q  21 gaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatt 120  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||  | || ||||||||| | || |||||||| ||||    
T  21485 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttgaagttgatt 21584  T
Q  121 tagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttaga-gta-taaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcat 218  Q
    ||||||| || ||  |||  || |||||| | ||  |||| ||||  || || || ||| |||||  ||| |||| ||| | ||||  ||||| || |||    
T  21585 tagtttgtttgcctttgagtggaatggatctaatacttggtatgagctgcttggatgtaataaccatgtttatattaactgttttagtaagacggtacat 21684  T
Q  219 ttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaattc 297  Q
    |||||||||||||||||| || ||| || ||| || |||||||| ||| || | |||||| |||  |||||||||||||    
T  21685 ttttcttctgctgaagaagagagtgaagctgagttcttgactactaagcagcttaagcagttagcgcgtgatggaattc 21763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3619 - 3443
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||    
T  3619 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 3520  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    ||||||| | ||||| |||||  ||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  3519 ttttgaaattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaacc 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14102 - 13926
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| || | ||||| |||| | | ||    
T  14102 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgttctttgtctatttttgatcgtga 14003  T
Q  107 ttttgaagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
     |||||  | ||||| |||||  ||||  |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  14002 ctttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaacc 13926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 55761 - 55848
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 99  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||| | ||||||||||    
T  55761 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtcctttgtctatgtttg 55848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2012 - 1746
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||| ||||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  2012 atgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctttagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttg 1913  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagac 211  Q
     |||  | ||||| ||||| ||  | |  ||||||||||| ||  | || || || ||||| |||| ||||   |||||||||||  | ||||  |||||    
T  1912 cagtgaacttagtctgcttgccattcagtgggatggatgtgatactaggtataaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgttttagtaagac 1813  T
Q  212 agtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcag 278  Q
      |||  |||||||||||||||||| | |||| | |||| || |||||||| ||| || ||||||||    
T  1812 tatgcgcttttcttctgctgaagaagaaggtgaaattgagttcttgactaccaagtagttgaagcag 1746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 295
Target Start/End: Original strand, 114474 - 114612
Alignment:
Q  157 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaattttt 256  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| |||| ||  | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| || | | |||||    
T  114474 ttggtatgaactggttggagtataaccatgtttatattaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagctaagttttt 114573  T
Q  257 gactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
    |||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||    
T  114574 gactactaagcagctgaagcagttagagcgtgatggaat 114612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4596 - 4425
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttg 111  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| | |||||||||| |   |||||||    
T  4596 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaagaagtcctttgtctatgtttgatcatgattttg 4497  T
Q  112 aagtagatttagtttgcttaccgctgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 183  Q
    || | ||||| ||||| |||||  ||   || |||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  4496 aaattgatttggtttgtttacctttgtgtggtatggatgtaattcttgtcatgaactggttagagtacaacc 4425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 7254 - 7183
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttga 78  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  7254 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 7183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21616 - 21502
Alignment:
Q  13 tgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttga 112  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||  | |||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  21616 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 21517  T
Q  113 agtagatttagtttg 127  Q
      | |||||||||||    
T  21516 gatggatttagtttg 21502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 37040 - 36926
Alignment:
Q  13 tgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttga 112  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||  | |||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  37040 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 36941  T
Q  113 agtagatttagtttg 127  Q
      | |||||||||||    
T  36940 gatggatttagtttg 36926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 1000 - 895
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtaggga 106  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || || || | ||||||| | |||||||||| | | ||    
T  1000 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtga 901  T
Q  107 ttttga 112  Q
    ||||||    
T  900 ttttga 895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Original strand, 8036 - 8117
Alignment:
Q  18 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 99  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||    
T  8036 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 14929 - 14873
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactactt 63  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14929 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Original strand, 40798 - 40862
Alignment:
Q  12 atgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgttt 76  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40798 atgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgttt 40862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 1055 - 1125
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttg 77  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  1055 ctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 292
Target Start/End: Original strand, 23053 - 23159
Alignment:
Q  186 gttcatatcaacagctttaacaagacagtgcatttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaac 285  Q
    |||||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  || ||| || |||||||| ||  || ||||||||||||||     
T  23053 gttcatatcaattgttttagtaagacagtgcatttttcttctgctgaggaagagagtaaagctgagttcttgactactaaacagctgaagcagctagaat 23152  T
Q  286 gtgatgg 292  Q
    |||||||    
T  23153 gtgatgg 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 151
Target Start/End: Original strand, 83833 - 83951
Alignment:
Q  33 gaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttac 132  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| || || |||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||| |    
T  83833 gaaaccccggctaaggattcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttagtctgcttgc 83932  T
Q  133 cgctgacggggatggatgt 151  Q
    || | |  |||||||||||    
T  83933 cgttaagtgggatggatgt 83951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 58 - 1
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttc 64  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  58 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16580 - 16503
Alignment:
Q  218 tttttcttctgctgaagaatagggtggagttgaatttttgactacgaaggagatgaagcagctagaacgtgatggaat 295  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||  || ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||    
T  16580 tttttcttctgcttaagaagagagtggagcagagtttttgactactaagcagctgaaacagttagagcgtgatggaat 16503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University