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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF11386A_low_26 (Length: 447)
Name: NF11386A_low_26
Description: NF11386A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF11386A_low_26 |
 |  |
|
| [»] scaffold0011 (6 HSPs) |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0078 (3 HSPs) |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0018 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0396 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0009 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0692 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0407 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0116 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0213 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0138 (6 HSPs) |
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| [»] scaffold0032 (3 HSPs) |
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| [»] scaffold0465 (1 HSPs) |
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| [»] scaffold0346 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0023 (4 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0124 (2 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0315 (2 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold1753 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold1140 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0218 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0003 (4 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0761 (2 HSPs) |
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| [»] scaffold0076 (1 HSPs) |
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| [»] scaffold0106 (2 HSPs) |
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|
| [»] scaffold0031 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0589 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0158 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0303 (1 HSPs) |
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| [»] scaffold0610 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0107 (1 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
|
| [»] scaffold0554 (1 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
|
| [»] scaffold0215 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0498 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0467 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0462 (1 HSPs) |
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|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0051 (3 HSPs) |
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| [»] scaffold0310 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0183 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0225 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0109 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0342 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0066 (3 HSPs) |
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| [»] scaffold0004 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0507 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0521 (1 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0151 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0456 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 87)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 821646 - 821196
Alignment:
| Q |
4 |
ataataaggctattgaattaccnnnnnnntataataaaggactcgtacaaggactcgataatgcgacaacaat---------------ccacaattttca |
88 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
821646 |
ataataaggctattgaattaccaaaaaaagataataaaggactcgtacaaggactcgataatgcgacaacaattcataattttcacctccacaattttca |
821547 |
T |
 |
| Q |
89 |
cctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacc |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
821546 |
cctcaatatatacgacaacatccaattatattgattatcttcacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacc |
821447 |
T |
 |
| Q |
189 |
atcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaaga |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
821446 |
atcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattccttacattctaagtaaga |
821347 |
T |
 |
| Q |
289 |
tagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggta |
388 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
821346 |
tagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttggtcatataagaataatcacaaccattcataaggta |
821247 |
T |
 |
| Q |
389 |
attgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggcg |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
821246 |
attgactcaagaaaacatttccgacc--aaaccgtatcaagtggcaactggcg |
821196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Original strand, 44054612 - 44054997
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44054612 |
gactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
44054711 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |
|
|
| T |
44054712 |
catgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactattacatttagctt |
44054811 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaa |
354 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44054812 |
caccattcaagcatttcttacattctaagtaagatagcatacatatctcgtgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatataacttcacttag |
44054911 |
T |
 |
| Q |
355 |
tcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44054912 |
tcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
44054997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Original strand, 33738948 - 33739339
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
33738948 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaaaacatttgcattatc |
33739047 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33739048 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcaccttcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
33739147 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33739148 |
atagcttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
33739247 |
T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||| |||| || |||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
33739248 |
cacttagttatataaaaatggtcaccacaattcttaatacaattggttcaag-aaatatttccgaccaaaaaccgtgtcaagtggcaaacggc |
33739339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 45460432 - 45460040
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45460432 |
gtacaaggactcaataatgcgacgacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctctacaacatttgcattatc |
45460333 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||| ||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
45460332 |
aagaaaacatgtccgtacacaattaaatcataagattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctca |
45460233 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
45460232 |
tatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacacacctcatgataaacatcatatccaatacaatcatttaatcatacaact |
45460133 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45460132 |
tcacttagtcatataagaatagtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
45460040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Original strand, 16521479 - 16521863
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16521479 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16521577 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16521578 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcactatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
16521677 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16521678 |
caccatttcaagcattccttacattctaagtaagatcacatacatatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
16521777 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16521778 |
gccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaccgtgtcaagtggcaaacggc |
16521863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Original strand, 44345510 - 44345902
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44345510 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatgggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcattatc |
44345609 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44345610 |
aagaaatcatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcttcaccacattaacatgattattaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
44345709 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44345710 |
tatagtttcaacattcaagcattctttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgatacacaacatatccaaaacaatcattcattcatacaact |
44345809 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||| |||| || |||| |||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
44345810 |
tcacttagttatataaacatagtcaccacaattcttaagacaattggttcaag-aaacgttttcgaccaaaaaccatatcaaggggccaccggc |
44345902 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
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Target Start/End: Complemental strand, 12901240 - 12900853
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Q |
| |
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|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
12901141 |
T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12901140 |
catgcccatacacaaataattcatagcattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatatcattaaacatcaactatcacatatagttt |
12901041 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12901040 |
caccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatatacatctcatgataaacatcatatccaaaatacaatcattcatttatacaacttcaat |
12900941 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||| ||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |
|
|
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tagtcatacatgaatggtcacaacaaatcataagacaatttgctcaag-aaacatttccgaccaaaatccgtgtcaagtggcaaacggc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
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Target Start/End: Complemental strand, 25120589 - 25120215
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
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25120391 |
T |
 |
| Q |
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cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
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|||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
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25120390 |
caccaattcaaacattccttacattct-agtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccattataatcattcattcatacaaattcactta |
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T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagt |
430 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||| |
|
|
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gtcatacaagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaataaaacatcgccgatcaaaacccatatcaagt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21960936 |
catgctcatacacaaataaatcatagtattcatcaccacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcatttaacatcaactattacatatagttt |
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T |
 |
| Q |
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caccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaa |
354 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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caccattcaagcattccatacattctaagtaaggtagcatacacatctcaagataaacatcgtatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttag |
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T |
 |
| Q |
355 |
tcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||| | ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
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21960736 |
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T |
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Target: chr4; HSP #10
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Q |
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T |
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Q |
| |
|
| || | ||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |
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|
| T |
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T |
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attctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
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atttcttacattctaatcaagatagcatacacatcacatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaaatttacttagtcatataagagt |
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T |
 |
| Q |
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aatcacaaccattcataaggtaattgac-tcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
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Target Start/End: Original strand, 10642874 - 10643145
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Q |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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|
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T |
 |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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gtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa |
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Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10643073 |
gttccaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaa |
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Target: chr4; HSP #12
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| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatg----------atcaacaatgtcattccacatcaactatcacatatag |
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T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54119543 |
tttcaccaattcaa-catttcttacattctaagtaagatagcttacacatctcaagataaatatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcac |
54119445 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||| |||| | | ||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||||| |||| || |||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
54119444 |
ttagtcatacaagaatggtcaccataactcacaagataattggctcaag-aaatatttccgacaaaaatccaaatcatgtggcaaacggc |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 19999215 - 19999547
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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19999411 |
T |
 |
| Q |
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tttcaccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| | | |||| |||||||| | ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19999412 |
tttcaccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatctcatgacaaatatcatatccaatacaatcattcattcatataacttc |
19999510 |
T |
 |
| Q |
349 |
acttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |
|
|
| T |
19999511 |
acttagccatataagaatagtcaccacaattcataag |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
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Target Start/End: Original strand, 13245139 - 13245447
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaaatcaacatgattatcaataatcaacaatgacattcaacatcaactatcacatatag |
13245336 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13245337 |
tttcaccaattcaa-catttcttacattctaagtaagataacatacacatctcatgataaatatcatatccaaaataatcatccattcatacattttcac |
13245435 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||| | |||||| |
|
|
| T |
13245436 |
ttagttatataa |
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Target: chr4; HSP #15
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|
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T |
 |
| Q |
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atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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atgccc--acacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
14995084 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | | |||| |||||||| | | || |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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caccattcaagcattc-tcatattccaagtaagagggaaaacaacatctcatgataaatatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaacttcact |
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T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||| |
|
|
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tagtcatacaagaataatc |
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Target: chr4; HSP #16
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T |
 |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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tttcacca |
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| |
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|
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| |
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|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
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|
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catcacacataaaaatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaag |
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 |
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atagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
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Q |
| |
|
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|
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| |
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|
| T |
53909238 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatacaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
53909139 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53909138 |
catgcccacacacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
53909047 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
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Target Start/End: Complemental strand, 7133924 - 7133711
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
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gtacaaggactcgataatgcgacaacatttcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatc |
7133825 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7133824 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcgcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
7133725 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
7133724 |
atagtttcaccatt |
7133711 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
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Target Start/End: Original strand, 10487358 - 10487682
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
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|
| T |
10487456 |
aaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
10487555 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata--cacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
10487556 |
tttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcactccttcatacaact |
10487654 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10487655 |
tcacttagtcatacaagaataatcacaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #21
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Target Start/End: Complemental strand, 23271342 - 23271015
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203 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| |
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|
| T |
23271342 |
caacattcaattatattaattatcttcacaacatt-gcattaacaagaaaacatgcccacacacaaataaatcgtagtattcatcatcgcacaacaacat |
23271244 |
T |
 |
| Q |
204 |
gattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacattt |
302 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23271243 |
gattatcaataatcaacaatgttatccaacatcaactatcacatatagtttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaagatagcatacatatct |
23271145 |
T |
 |
| Q |
303 |
catgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaa |
402 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
23271144 |
catgacaaccatcatatccaatacgatcatccattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcacgataaatcataagacaattgactcaag--a |
23271047 |
T |
 |
| Q |
403 |
acatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Target: chr4; HSP #22
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18167481 |
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18167578 |
T |
 |
| Q |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18167579 |
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18167676 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
18167677 |
tttcaccatt |
18167686 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16329393 - 16329069
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16329393 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16329296 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
16329196 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata--cacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
16329195 |
tttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcactccttcatacaact |
16329097 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16329096 |
tcacttagtcatacaagaataatcacaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #24
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Target Start/End: Original strand, 9294212 - 9294419
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9294310 |
aaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatag |
9294409 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
9294410 |
tttcaccatt |
9294419 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15288479 - 15288271
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15288479 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaaact-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15288382 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15288381 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatgaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
15288282 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
15288281 |
tttcaccattc |
15288271 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 110171 - 110371
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
110171 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
110269 |
T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
110270 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
110369 |
T |
 |
| Q |
255 |
ca |
256 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
110370 |
ca |
110371 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 55 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15274226 - 15273958
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
15274226 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
15274129 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15274128 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagttt |
15274029 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| | | |||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15274028 |
caccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatttcatgacaaatatcatatccaa |
15273958 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
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Target Start/End: Complemental strand, 15273949 - 15273736
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatcacatacatatctcatgataaacatcatatccaata |
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T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
15273849 |
caatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaccgtgt |
15273751 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
15273750 |
caagtggcaaacggc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Original strand, 14950707 - 14950914
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaatatt-gcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || || ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14950805 |
aaacatgcccacacaaaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
14950904 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
14950905 |
tttcaccatt |
14950914 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22356033 - 22355826
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22356033 |
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22355936 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22355935 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaatattcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
22355836 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
22355835 |
tttcaccatt |
22355826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 261
Target Start/End: Original strand, 8373042 - 8373249
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53 |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8373042 |
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T |
 |
| Q |
153 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagt |
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Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8373141 |
aacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacaccgcaacatgattatcaataaccaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagt |
8373240 |
T |
 |
| Q |
253 |
ttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
8373241 |
ttcaccatt |
8373249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8873961 - 8873770
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8873961 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaaaatttgcattatcaagaaaa |
8873863 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8873862 |
catgcccatacacaattaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
8873770 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15295589 - 15295381
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
15295589 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaaact-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattctcaaga |
15295492 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15295491 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacctatcaacatgattatgaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
15295392 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
15295391 |
tttcaccattc |
15295381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 262
Target Start/End: Original strand, 18246881 - 18247083
Alignment:
| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18246881 |
actcgataatgcgacaaaaaatcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
18246978 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18246979 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtttc |
18247076 |
T |
 |
| Q |
256 |
accattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
18247077 |
accattc |
18247083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 47356013 - 47356214
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
47356013 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatta-ttgcattatcaaga |
47356111 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47356112 |
aaacattcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
47356211 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtt |
253 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
47356212 |
gtt |
47356214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 55 - 259
Target Start/End: Original strand, 34393744 - 34393948
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34393744 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
34393842 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34393843 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagtt |
34393942 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacca |
259 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
34393943 |
tcacca |
34393948 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Original strand, 18247155 - 18247299
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18247155 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatattcaata |
18247254 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18247255 |
caatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
18247299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18495880 - 18495604
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18495880 |
acaaagactcgataatgcgacatctttccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatcttcacaacatttgcattatcaa |
18495781 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
18495780 |
gaaaacatgtccatacccaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacaacaactatctcata |
18495681 |
T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18495680 |
tagttttaccatttcaaacatttcttacatcctaagtaagagagcatacaacattccatgataaacatcatatccaa |
18495604 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5684370 - 5684153
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5684370 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttgtccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
5684272 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5684271 |
catgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagtt |
5684172 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacc-attcaagtattct |
271 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
5684171 |
tcaccaattcaagcattct |
5684153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Original strand, 26338173 - 26338355
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26338173 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
26338270 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26338271 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
26338355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 234 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7133631 - 7133479
Alignment:
| Q |
234 |
atcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcataca-catttcatgataaacatcatatccaatacaatcat |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7133631 |
atcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacaacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcat |
7133532 |
T |
 |
| Q |
333 |
tcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||| |||| |
|
|
| T |
7133531 |
tcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcgtaag |
7133479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 262
Target Start/End: Original strand, 15212032 - 15212239
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15212032 |
gactcgataatgcgacaacaatt-acaattttatccacaatatataggacaacatccgattatattgttcatcttcacatcatttgcattatcaagaaaa |
15212130 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15212131 |
catgcccacacacaattaaatcataacattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtt |
15212230 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
15212231 |
tcaccattc |
15212239 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 225 - 372
Target Start/End: Original strand, 9294491 - 9294638
Alignment:
| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaat |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9294491 |
tcattcaacatcaattatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacatatctcatgataaacatcatatccaat |
9294590 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
9294591 |
acaatcattcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcac |
9294638 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18294354 - 18294100
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaa |
286 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
18294354 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaaatatcacatatagtttcacgatttcaagcattccttacattccaagtaa |
18294255 |
T |
 |
| Q |
287 |
gatagcatacacatttcatgataaacatcatatc--caatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataa |
384 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| | ||| || |
|
|
| T |
18294254 |
gatagcatacatatctcatgataatcatcatatcaaaaatataatcactcattcatacaacttcacttagttatacaagaatggtcacaataactcacaa |
18294155 |
T |
 |
| Q |
385 |
ggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
| ||||| || ||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
18294154 |
gacaattggctaaag-aaacatttccgacaaaaatccaaatcatgtggcaaacggc |
18294100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 227 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19698657 - 19698447
Alignment:
| Q |
227 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aat |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19698657 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaat |
19698558 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgta |
424 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
19698557 |
ataatcactcatt----caacttcacttagtcatataagaatagtcaccataaatcataagacaaatgactcaa-aaaacatttccgacaaaaatccaaa |
19698463 |
T |
 |
| Q |
425 |
tcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
19698462 |
tcatgtggcaaacggc |
19698447 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 227 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19709242 - 19709032
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| Q |
227 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aat |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19709242 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaat |
19709143 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgta |
424 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
19709142 |
ataatcactcatt----caacttcacttagtcatataagaatagtcaccataaatcataagacaaatgactcaa-aaaacatttccgacaaaaatccaaa |
19709048 |
T |
 |
| Q |
425 |
tcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
19709047 |
tcatgtggcaaacggc |
19709032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Original strand, 26679002 - 26679152
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
26679002 |
cattaaacatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
26679101 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26679102 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatcacaa |
26679152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 225 - 335
Target Start/End: Original strand, 15212413 - 15212523
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225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaat |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15212413 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatctaat |
15212512 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattca |
335 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
15212513 |
acaatcattca |
15212523 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
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atcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaatacaatcat |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18167766 |
atcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacaacatctcttgataaacatcatatccaatacaatcac |
18167865 |
T |
 |
| Q |
333 |
tcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
18167866 |
tcattcatacaacttcacttagccatacaagaataatc |
18167903 |
T |
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Target: chr4; HSP #50
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22355754 |
cattaaacatcaactatcacatatagtttcaccatctaagcattccttacattctaagtaagataacatacatatctcgtgataaacatcatatccaaaa |
22355655 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22355654 |
tataatcactcattcatacaacttcacttaatcatacaagaataatcacaa |
22355604 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26678732 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcat-------- |
26678821 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| | | |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26678822 |
--acatgcccatacacaatttaatcatgatattcaccatcacacttcaacataattatcaataatcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
26678919 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
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50 |
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149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
13811103 |
acaaagactcgataatgcgacattacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgattatttccacaacaattccattatcaa |
13811004 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaac |
239 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| ||| || ||||| | |||| || ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
13811003 |
gaaatcatgtccatacacaaccaaatcataattcaaatatgattctttattacatcatcaacatgatcatcaacaatcaacaacgtcattcaacatccac |
13810904 |
T |
 |
| Q |
240 |
tatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattca |
335 |
Q |
| |
|
|| | | ||| ||| | || |||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
13810903 |
tacctgagataattttatcatttcaagcatttcttacattctaagtaaaagaacatacaacatcccatgataaacatcatatccaacatataatcattca |
13810804 |
T |
 |
| Q |
336 |
ttcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaaga-aaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtg |
431 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||| || | || |||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
13810803 |
tccatacaacttcacttagtcatataagaatagtcacgataaatcataagacaattgacttaaaagaaccatttccgac--aataccgtatcaagtg |
13810709 |
T |
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Target: chr4; HSP #53
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13049630 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
13049533 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
13049532 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaataatatcattca |
13049455 |
T |
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Target: chr4; HSP #54
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Target Start/End: Complemental strand, 55377873 - 55377673
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235 |
tcaactatcacatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcatt |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
55377873 |
tcaactatcacgtatagtttcaccaatacaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatacttatctcatgataaacatcatattcaatacaatcatt |
55377774 |
T |
 |
| Q |
334 |
cattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggc |
433 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||| |
|
|
| T |
55377773 |
caattttacaacttcacttagtcatataagaatggtcacaataactcacaagacaattgacttaag-aaacatttccgacaaaaatccaaatcatgtggc |
55377675 |
T |
 |
| Q |
434 |
aa |
435 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
55377674 |
aa |
55377673 |
T |
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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18294580 - 18294418
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105 |
aacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatg |
204 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
18294580 |
aacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcataacattcatcatcacc-----acatg |
18294486 |
T |
 |
| Q |
205 |
attatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacc-attcaagtattct |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
18294485 |
atcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagtttcaccaattcaagcattct |
18294418 |
T |
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Target: chr4; HSP #56
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tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
226 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
8044021 |
tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacctcaacatgatcataaacaatcaacaatgtt |
8044120 |
T |
 |
| Q |
227 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8044121 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
8044153 |
T |
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| Q |
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ctatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcat |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
18251232 |
ctatcacatataatttcactattcaaacattccttacattctaagtaagataacatacatatctcatgataaacatcatttccaaaatataatcactcat |
18251133 |
T |
 |
| Q |
337 |
tcatacaacttcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
18251132 |
tcatacaacttcacttagtcatacaagaat |
18251103 |
T |
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
15212311 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagt-tcttagcatacacatctcatgataaacatcatatctatta |
15212409 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattca |
335 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
15212410 |
caatcattca |
15212419 |
T |
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| Q |
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcata |
318 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15288198 |
cattaaacatcaactatcaaatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcata |
15288106 |
T |
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcata |
318 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15295308 |
cattaaacatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgatatacatcata |
15295216 |
T |
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Target: chr4; HSP #61
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tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattga |
393 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| || |||| |||| ||||| |
|
|
| T |
53706039 |
tacacatctcatgataaacatcatatccaatataatcattcattcatacaacttcacttagttatataaacatagtcaccacaattcttaagacaattgg |
53705940 |
T |
 |
| Q |
394 |
ctcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
53705939 |
ttcgag-aaacatttccgactaaaaaccatatcaagtgg |
53705902 |
T |
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catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaa |
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Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||| |||||| |
|
|
| T |
34394020 |
catcatacatcaacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaaaatcaactatcacatatagtttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaa |
34394118 |
T |
 |
| Q |
287 |
gatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34394119 |
gagggaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaa |
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T |
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188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaa |
286 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | | |||| |||||| |
|
|
| T |
18110038 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttgttccacatcaactatcacatatagtttcaccaattcaagcatt-atcatattccaagtaa |
18109940 |
T |
 |
| Q |
287 |
gatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcata |
383 |
Q |
| |
|
| | | || | || |||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
18109939 |
tagggaaaacaatatctcattataaatatcatatccaaaatataatcactcattcatacaacttcacttagtcataaaagaatggtcaccacaattcata |
18109840 |
T |
 |
| Q |
384 |
ag |
385 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
18109839 |
ag |
18109838 |
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395 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| |||| ||| || ||||| ||||| | |
|
|
| T |
8873774 |
cacatctcatgataaatatcatatccaacacaatcattcattcatataacttcacttagttatataaacatagtcaccaccgtttataagacaattggtt |
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T |
 |
| Q |
396 |
caagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
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Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
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caag-aaacattttcgaccaaaaaccatatcaactggccaccggc |
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Q |
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|
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|
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19019506 |
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T |
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| Q |
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tttccgaccaaaaa |
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Q |
| |
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|
|
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tttccgacaaaaaa |
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Q |
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|
| T |
53909031 |
tacacatctcatgataaacatcatatccaaaacaatcattcattcatacaacttcacttagttatataa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13751769 - 13751694
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgat |
123 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13751769 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataacacaactcccaattatattgat |
13751694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43282855 - 43282757
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43282855 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa |
43282757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 52266938 - 52266840
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
52266938 |
gactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggataacttccaaatatattgatcatctctacaacaattgcattatcaagaaa |
52266840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 335
Target Start/End: Original strand, 15212552 - 15212611
Alignment:
| Q |
276 |
attctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattca |
335 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15212552 |
attccaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatcccatacaatcattca |
15212611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15852769 - 15852696
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15852769 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctctacaacatttgcattatcaagaaa |
15852696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Original strand, 19019390 - 19019439
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
237 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19019390 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
19019439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 319
Target Start/End: Original strand, 8373321 - 8373415
Alignment:
| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatat |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | | |||| |||||||| || | || |||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8373321 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattccagcattc-tcatattccaagtaagagagaaaacaacatctcatgataaatatcatat |
8373415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 8373431 - 8373478
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8373431 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
8373478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 145
Target Start/End: Original strand, 15043631 - 15043721
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
145 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15043631 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcatta |
15043721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15110793 - 15110703
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
145 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15110793 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcatta |
15110703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Original strand, 47356297 - 47356343
Alignment:
| Q |
189 |
atcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
235 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47356297 |
atcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
47356343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 362
Target Start/End: Original strand, 110391 - 110456
Alignment:
| Q |
297 |
acatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
110391 |
acatctcatgatagacatcatatcccacataatcattcattcatacaacttcacttagttatataa |
110456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 27959759 - 27959820
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27959759 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccactacgtttgcattatcaagaaa |
27959820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34197605 - 34197544
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34197605 |
caatataaaggacaacttccaaatatattggtcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
34197544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18110176 - 18110114
Alignment:
| Q |
200 |
acatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
18110176 |
acatgattatcaataatcaacaacatcattcaacattaactatatcatatagcttaaccattc |
18110114 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37958489 - 37958436
Alignment:
| Q |
100 |
aggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37958489 |
aggacaacttccaaatatattgatcatctctacaacatttgcattatcaagaaa |
37958436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41167375 - 41167314
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41167375 |
caatataaatgacaactttcaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
41167314 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 320
Target Start/End: Original strand, 15043789 - 15043898
Alignment:
| Q |
212 |
ataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataa |
310 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| | | |||| |||||||| | |||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
15043789 |
ataatcatcaatatcattcaacatcaactacatcatatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaagtaagagaacataaacatcttatgataa |
15043888 |
T |
 |
| Q |
311 |
acatcatatc |
320 |
Q |
| |
|
| |||||||| |
|
|
| T |
15043889 |
atatcatatc |
15043898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15110635 - 15110526
Alignment:
| Q |
212 |
ataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataa |
310 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| | | |||| |||||||| | |||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
15110635 |
ataatcatcaatatcattcaacatcaactacatcatatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaagtaagagaacataaacatcttatgataa |
15110536 |
T |
 |
| Q |
311 |
acatcatatc |
320 |
Q |
| |
|
| |||||||| |
|
|
| T |
15110535 |
atatcatatc |
15110526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41257797 - 41257728
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41257797 |
aattttcacaacaatataaaggataacttccaattatattgatcatctcaaccacaattgcattatcaag |
41257728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 253
Target Start/End: Original strand, 15212605 - 15212633
Alignment:
| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15212605 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtt |
15212633 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22407676 - 22407286
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22407676 |
gtacaaggactggataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
22407577 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22407576 |
aagaaaacatgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcatacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactattacat |
22407477 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22407476 |
ttagtttcaccattcaagcatttcttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatataactt |
22407377 |
T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccg |
438 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22407376 |
cacttagtcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccg |
22407286 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 48 - 435
Target Start/End: Original strand, 49966331 - 49966717
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49966331 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
49966430 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
49966431 |
aagaaaacatgtccataaacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactattacat |
49966530 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
49966531 |
atagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcaaatacaatca-tcattcatacaactt |
49966629 |
T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49966630 |
cacttagtcatataagaataatcataaccattcacaaggtaattgactcaagaaaacattttgcaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
49966717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 52 - 433
Target Start/End: Original strand, 18506043 - 18506422
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18506043 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccgcaacattagcattatcaaga |
18506142 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||| |||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18506143 |
aaa-atgcccacacacaagtaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
18506241 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18506242 |
tttcaccatttaagcattccttacatcctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttaact |
18506341 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggc |
433 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18506342 |
tagtcatataaaaatggtcacaacaattcataagaccattggttcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtggc |
18506422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 55 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2422445 - 2422065
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55 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2422445 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaactttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaccacatttgcattatcaagaaaa |
2422346 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2422345 |
catgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcgacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
2422246 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
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|||| || |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2422245 |
caccaatacaagcatttcttacatcctgagtaagatagcatacacatctcatgatacacatcatattcaatacaatcattcagtcatacaacttcactta |
2422146 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2422145 |
gtcatataagaatggtcagaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttgcgaccaaagaccgtgtcaagtggcaa |
2422065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 55 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44036373 - 44036024
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44036373 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatgtataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
44036275 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
44036274 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtct |
44036175 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44036174 |
caccaattcaa-cattccttatattct-agtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
44036077 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacat |
406 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44036076 |
gtcatacaagaataatcacaaccatttctaaggtaattgactcaagaaaacat |
44036024 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 52 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15862908 - 15862592
Alignment:
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgaatatctccacaacatt-gcattatcaagg |
15862811 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862810 |
aaacatgcccacacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
15862711 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15862710 |
tttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaaaatcatattcaatacaatcattcattcatacaacttcact |
15862611 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
15862610 |
tagtcatgcaagaataatc |
15862592 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
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Target Start/End: Original strand, 41210732 - 41211119
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41210732 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
41210831 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
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| T |
41210832 |
aaacatggccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacgccaactatcacatatag |
41210931 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
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| T |
41210932 |
-ttcaccaattcaagcatttcttacatcccaagtaagatagcatacacatatcatgataaatatcatatccaaaacaatcattccttcatacaacttcac |
41211030 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||| | |||||| |||||||| || |||| || | ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41211031 |
ttagttatataaacataatcaccacaattcttaggacaattggttcaa-aaaacattttcgaccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
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Target Start/End: Original strand, 21716895 - 21717271
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55 |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21716895 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgctcatctccacaacatttgcattatcaaaaaaa |
21716994 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21716995 |
catgtccatacacaaccaaatcatagaattcatcatcacatatcaacatgattatcaat---caacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagttt |
21717091 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21717092 |
caacatttcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatgtccaatacaatcattcattcatacaacttcacttc |
21717191 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21717192 |
gtcatataagaatattcacaataattcataagacaattcgctcaa-aaaacatttccgacc-aaaaccatatcaagtggcaa |
21717271 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
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Target Start/End: Original strand, 35053532 - 35053909
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| Q |
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35053532 |
gactcaataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
35053631 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatataattt |
35053728 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35053729 |
caccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatacacatatcatgataaatatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaacttcact |
35053828 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggc |
433 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
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tagtcatacaagaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtggc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 35523894 - 35523508
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| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35523894 |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
35523794 |
catgtccatacgcaaccaa-tcatagaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcacccaacatcatttatctcatatggttt |
35523696 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35523695 |
caccatttcaaacattccttacattctaagtaagatagcatacacaactcatgataaacatcatatccaaaatacaagcattcatttatacaacttcact |
35523596 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
35523595 |
tagtcatacaagaatgatcacaataactcataagtaaattggctcaag-aaacatttccgatccaaaaccatatcaagtggcaaacggc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5676074 - 5675690
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55 |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5676074 |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5675975 |
catgtctatatacaatcaattcatagtatccaccttcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
5675876 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5675875 |
caccaattcaagcatttcttacatcctaagtaaggtaacatacatatctcatgataaacatcatatccaacacaattattcattcatacaacttcactta |
5675776 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| |||| || |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5675775 |
gttatataaaaatggtcaccacaattcttaagacaattggttcaag-aaacatttccgaccaaaaaccgtgtcaagtggcaaacggc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
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Target Start/End: Complemental strand, 22250430 - 22250113
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22250430 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggactacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccat-cacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22250331 |
aaacatgttcatacacaattaaatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacaaata |
22250232 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttca |
349 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22250231 |
gtt-caccaattcaagcattctc-atattccaagtaagatagcatatacatctcatgataaacatcatattcaatacaatcattcattcatacaacttca |
22250134 |
T |
 |
| Q |
350 |
cttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||| |
|
|
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22250133 |
cttagtcatacaagaataatc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 52 - 385
Target Start/End: Original strand, 17147468 - 17147801
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| |
|
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|
|
| T |
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T |
 |
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152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17147566 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattctcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
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T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttc |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||| | | |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |
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| T |
17147666 |
tttcaccattgcaagcattc-tcatattccaagtaatatagcatacatatctcatgataaacatcatgtccaaaatataatcactcattcatacaacttc |
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T |
 |
| Q |
349 |
acttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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acttagtcatagaagaatggtcacaataattcataag |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
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Target Start/End: Original strand, 41218143 - 41218442
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| |
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| T |
41218143 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacattatttgcattatcaagaaaa |
41218241 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaa-caatgtcattcaacatcaactatcacatatagt |
252 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41218242 |
catgctcatacacaattaaatcatagaattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaatcattgttattctacatcaacaatcacatatagt |
41218341 |
T |
 |
| Q |
253 |
ttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41218342 |
ttcaccattcaagcattccttacatactaggtaagatagcctacacctctcatgatcaaaatcatatccaatacaatcattcatacatacaacttcactt |
41218441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 325
Target Start/End: Original strand, 21858246 - 21858515
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21858246 |
gactcgataatgcaacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgtttacctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
21858344 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21858345 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
21858444 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||| |||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21858445 |
caccaattctaacattccttacattct-agtaagatagcatacacatctcatgctaaacatcatatccaata |
21858515 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20895169 - 20894886
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgccacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacacaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
20895071 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20895070 |
aaacatgcccacacacaattaaataatagtattcatcatcacacatcaacatgattttcaataatcaacaatatcattc-acatcaactatcacatatag |
20894972 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcac-cattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcat |
336 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
20894971 |
tttcacgaattcaaacatttcttacattttaagtaaggtagcttacacatctcatgataaatatcatatcaaacacaatcattcat |
20894886 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
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Target Start/End: Original strand, 22353097 - 22353279
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287 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22353097 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatatcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaag |
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T |
 |
| Q |
288 |
atagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22353197 |
atagcatacacatctcatgataaacatcatattcaatacaataattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
22353279 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 52 - 366
Target Start/End: Original strand, 22365441 - 22365757
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22365441 |
aaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22365539 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22365540 |
aaacatgttcatacacaattaaatcatagcattcatcattatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
22365639 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||| |||| | | |||| |||||||| | | || |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22365640 |
g-ttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagagggaaaacaacatctcatgataaatatcatatccaaaatataatcactcattcatacaact |
22365737 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
22365738 |
tcacttagtaatacaagaat |
22365757 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 326
Target Start/End: Original strand, 45050370 - 45050642
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
45050370 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
45050467 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
45050468 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaactaccacatttag |
45050567 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatac |
326 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45050568 |
tttcaccacttcaaacattccttacattct-agtaagatagcatacacatctcatgatgaacatcatattcaatac |
45050642 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20826696 - 20826428
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| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
20826696 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
20826599 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20826598 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagttt |
20826499 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| | | |||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20826498 |
caccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatttcatgacaaatatcatatccaa |
20826428 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 226 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20826419 - 20826206
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20826419 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatcacatacatatctcatgataaacatcatatccaata |
20826320 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
20826319 |
caatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaccgtgt |
20826221 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
20826220 |
caagtggcaaacggc |
20826206 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37845939 - 37845737
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37845939 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgtttacctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
37845841 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37845840 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtct |
37845741 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc |
258 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
37845740 |
cacc |
37845737 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 51657805 - 51657400
Alignment:
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48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51657805 |
gtacaaagactcgataatgcaacatcacttcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatc |
51657706 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
237 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||||| ||| || ||||| | ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51657705 |
atgaaatcatgtccatacacaatcaaatcataattcaattaagattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
51657606 |
T |
 |
| Q |
238 |
actatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcatt |
333 |
Q |
| |
|
|| | | |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
51657605 |
accacctcatatattttcaccatttcaagcattggttacattctaagtaagagaacatacgacatctcatgataaacatcatatccaacatacaatcatt |
51657506 |
T |
 |
| Q |
334 |
cattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaac-atttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | | ||||||| |||||||| || ||| ||||||||| || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
51657505 |
cattcatacaacttcacttagtcatataagaacagtcacgataaatcataagacaattgacttaaatgaactatttccgac--aataccgtaccaagtgg |
51657408 |
T |
 |
| Q |
433 |
caaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
51657407 |
caaccggc |
51657400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7642068 - 7641803
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
7642068 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatgatctccacaacatt-gtattatcaaga |
7641971 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||| | || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7641970 |
aaacatacccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatag |
7641873 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagc-atacacatttcatgataaacatcatatcc |
321 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
7641872 |
-ttcaccaattcaagcattc-tcacattccaagtaagatagcaaaatacatctcatgataatcatcacatcc |
7641803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 22352814 - 22353015
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22352814 |
aaggactcgataatgcgacaacaaacaacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22352912 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22352913 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcattacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
22353012 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtt |
253 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
22353013 |
gtt |
22353015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Original strand, 51451299 - 51451623
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51451299 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
51451396 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
51451397 |
gaacatgcccataaacaattaaatcatagcattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
51451496 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata--cacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
51451497 |
tttcaccatttcatgcattc-tcatattccaagtaatagggaaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcactccttcatacaact |
51451595 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51451596 |
tcacttggtcatacaagaataatcacaa |
51451623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9785707 - 9785340
Alignment:
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9785707 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacactcaattatattgttcctctccacatcatttgcattatcaagaaag |
9785609 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9785608 |
catgcacatacacaattaaatcatagtattcatcatcgcacatcaacatgatta-------tcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
9785516 |
T |
 |
| Q |
255 |
cac-cattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9785515 |
cactcattcaagcatttcctacatcataagtaagatagcatatacatctcatgataaatatcat----------atcattcattcatacaactacactta |
9785426 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| |||| || |||| |||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9785425 |
gttatataaacatagtcaccacaattcttaagacaattggttcaag-aaacgttttttaccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
9785340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Original strand, 20444442 - 20444638
Alignment:
| Q |
61 |
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160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20444442 |
ataatgcgacaacaatc-ataattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatgatttgcattatcaagaaaacatgcc |
20444540 |
T |
 |
| Q |
161 |
catacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacc |
258 |
Q |
| |
|
||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20444541 |
cattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaaatatcacatatagtttcacc |
20444638 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Original strand, 20530207 - 20530403
Alignment:
| Q |
61 |
ataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgct |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20530207 |
ataatgcgacaacaatc-ataattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatgatttgcattatcaagaaaacatgcc |
20530305 |
T |
 |
| Q |
161 |
catacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacc |
258 |
Q |
| |
|
||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20530306 |
cattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaaatatcacatatagtttcacc |
20530403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 258
Target Start/End: Original strand, 20526808 - 20527010
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| || ||| |||||||| | || |||||| |||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
20526808 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaactttctccacaatatataggacaccacccagttatattgttcatctccacatgatttacattatcaagaaga |
20526906 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20526907 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
20527006 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc |
258 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
20527007 |
cacc |
20527010 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18061085 - 18060885
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
18061085 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggactacacccaattatattgattatatccacaacatt-gcattaccaagg |
18060988 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18060987 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
18060888 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtt |
253 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
18060887 |
gtt |
18060885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 211 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27331088 - 27330861
Alignment:
| Q |
211 |
aataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27331088 |
aataatcaacaatgtcattcaacattaactatctcatatagtttcaccatttcaagcatttcttacattctaatcaa--tagcatacacatcacatgata |
27330991 |
T |
 |
| Q |
310 |
aacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgac-tcaagaaaacattt |
408 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| | || || ||||| |
|
|
| T |
27330990 |
aacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatataagagtaatcacaacaatttataatgtaattgacttgaaagaaccattt |
27330891 |
T |
 |
| Q |
409 |
ccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27330890 |
ccgac--aataccgtatcaagtggcaaacggc |
27330861 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Original strand, 17003511 - 17003747
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17003511 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
17003608 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17003609 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagaattcatcatcccacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
17003705 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17003706 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
17003747 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Original strand, 22034535 - 22034717
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22034535 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
22034632 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22034633 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
22034717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21651412 - 21651228
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21651412 |
aaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
21651315 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21651314 |
caacatgcccatgcacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
21651228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Original strand, 41393138 - 41393346
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41393138 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcagtatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattatcaagg |
41393235 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| | || || || |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41393236 |
aaacatgtctacacacagttacatcatagcattcatcatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
41393335 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
41393336 |
tttcaccattc |
41393346 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 258
Target Start/End: Original strand, 20930163 - 20930367
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20930163 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
20930261 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca-acatcaactatcacatatagt |
252 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | || |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20930262 |
catgctcatacacaattaaaatcatagtattcatcaccgcacatcaacatgattatcaacaatcaataaggtccttcattcatcaactatcacatatagt |
20930361 |
T |
 |
| Q |
253 |
ttcacc |
258 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
20930362 |
ttcacc |
20930367 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Original strand, 22029383 - 22029566
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22029383 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaag |
22029480 |
T |
 |
| Q |
151 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22029481 |
aaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaatagtcaacaatgtcattcaacatcaa |
22029566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
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Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22226667 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
22226765 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22226766 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
22226846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18602518 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
18602421 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18602420 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
18602351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5073775 - 5073608
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5073775 |
gactcgataatgcgacaccaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
5073678 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5073677 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
5073608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20956278 - 20956127
Alignment:
| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcataca-catttcatgataaacatcatatcca |
322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20956278 |
tcattcaacatcaactacctcatatagttttaccatttcaagtatttctcacattctaagtaagagaacatacaacatctcatgataaacatcatatccg |
20956179 |
T |
 |
| Q |
323 |
a--tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20956178 |
acatataatcattcattcatacaatttcacttagtcatataagaatagtcac |
20956127 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
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Target Start/End: Complemental strand, 20122098 - 20121965
Alignment:
| Q |
90 |
ctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || || ||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
20122098 |
ctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaacatgcccacacacagttaaatcatagtattcctca |
20122000 |
T |
 |
| Q |
190 |
tcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20121999 |
tcacaccaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
20121965 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #44
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167 |
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238 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
22031078 |
caaataaatcatagtattcctcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
22031007 |
T |
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Target: chr1; HSP #45
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| Q |
80 |
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153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38035070 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
38034997 |
T |
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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
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| Q |
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150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22836723 |
gactcgataatgcgacatcacctcataattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatttccacaacaattgcattaccaag |
22836628 |
T |
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Target: chr1; HSP #47
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27673543 |
gactcgataatgcgacaccacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccaaaacaattgtattatcaagaaa |
27673641 |
T |
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| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
237 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20253246 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
20253295 |
T |
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Target: chr1; HSP #49
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| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36357786 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
36357713 |
T |
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| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
37845722 |
tacacatctcatgatagacatcatatcccacataatcattcattcatacaacttcacttagttatataa |
37845654 |
T |
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Target: chr1; HSP #51
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| Q |
78 |
cacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20956416 |
cacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaa |
20956341 |
T |
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Target: chr1; HSP #52
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| Q |
199 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaaga |
288 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||| || | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22836568 |
aacataatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaactacctcatatagtttttccatttcaagtgtttctcacattctaagtaaga |
22836478 |
T |
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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
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Target Start/End: Original strand, 19601911 - 19601972
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| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19601911 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatgatctccacaacatttgcattgtcaagaaa |
19601972 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
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Target Start/End: Original strand, 20930380 - 20930450
Alignment:
| Q |
292 |
catacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
20930380 |
catacacatctcatgatagacatcatatctcacataaccattcattcatacaacttcacttagttatataa |
20930450 |
T |
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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
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Target Start/End: Complemental strand, 37235405 - 37235336
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37235405 |
aattttcacaacaatttaaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
37235336 |
T |
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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
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Target Start/End: Original strand, 20444653 - 20444721
Alignment:
| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
20444653 |
tacacatctcatgatagacatcatatcccacataatcattcatttatacaatttcacttagttatataa |
20444721 |
T |
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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 362
Target Start/End: Original strand, 20527025 - 20527092
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| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
20527025 |
tacacatctcatgatagacatcatatcccact-aatcattcattcatacaacttcacttagttatataa |
20527092 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 362
Target Start/End: Original strand, 20530418 - 20530486
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| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
20530418 |
tacacatctcatgatagacatcatatcccacataatcattcatttatacaatttcacttagttatataa |
20530486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 256
Target Start/End: Original strand, 27673692 - 27673740
Alignment:
| Q |
208 |
atcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttca |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
27673692 |
atcaataatcaaccatatcattcaacatcaactacctcatatagtttca |
27673740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 5471816 - 5471758
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| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5471816 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcacctccaccacaattgcattatcaag |
5471758 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 81 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8539396 - 8539328
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| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8539396 |
aattttcacgacaatataaatgataacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaa |
8539328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8604635 - 8604567
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8604635 |
aattttcacgacaatataaatgataacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaa |
8604567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 91)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 48 - 435
Target Start/End: Original strand, 25121227 - 25121614
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25121227 |
gtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacttccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
25121326 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25121327 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacacattaacataattatcaataatcaacaaggtcattcaacatcaactatcacat |
25121426 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25121427 |
atagttttaccattcaagcatttcttacattctaagtaagatagcatgcacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcatttatacaactt |
25121526 |
T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25121527 |
cacttagtcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttttgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
25121614 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19994626 - 19994234
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
19994626 |
gtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacacaactatattgattatctccatttcatttacattatc |
19994527 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19994526 |
aagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
19994427 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19994426 |
tatagtttcaccattcaagcattctttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgatacacatcatattcaaaacaatcattcattcatacaact |
19994327 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||| |||| || |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19994326 |
tcacttagttatataaacatagtcaccacaattcttaagacaattgattcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
19994234 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 48 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22322909 - 22322525
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| Q |
48 |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22322909 |
gtacaaggacttgataatgcgacaataatccataattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgattacctccacaacatt-gcattatt |
22322811 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaa-tgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22322810 |
aagaaaacatgcccatacacaattaattcatagtattcatcatctcacatcaacatgattatcaataatcaaaaaatgtcattcaacatcaactatcaca |
22322711 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22322710 |
tgtggtttcaccattcaagcattccttacatactaggtaagatagcatacacctctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
22322611 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22322610 |
tcacttagtcatataaaaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaagaaaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtgg |
22322525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 48 - 362
Target Start/End: Original strand, 41245348 - 41245662
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
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| T |
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41245447 |
T |
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148 |
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247 |
Q |
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41245547 |
T |
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347 |
Q |
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41245647 |
T |
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362 |
Q |
| |
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41245662 |
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Target: chr8; HSP #5
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Target Start/End: Original strand, 29758984 - 29759358
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T |
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| Q |
155 |
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254 |
Q |
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T |
 |
| Q |
255 |
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353 |
Q |
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| T |
29759183 |
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T |
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| Q |
354 |
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430 |
Q |
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gtcatacaagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaataaaacatctccgatcaaaacccatatcaagt |
29759358 |
T |
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Target: chr8; HSP #6
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Target Start/End: Complemental strand, 24718887 - 24718564
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Q |
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T |
 |
| Q |
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251 |
Q |
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| T |
24718787 |
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24718688 |
T |
 |
| Q |
252 |
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349 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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350 |
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Q |
| |
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24718588 |
cttagtcatacaaaaataatcacaa |
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Target: chr8; HSP #7
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Q |
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T |
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253 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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Q |
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| T |
37610258 |
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T |
 |
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440 |
Q |
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| T |
37610358 |
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T |
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Target: chr8; HSP #8
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Q |
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T |
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Q |
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T |
 |
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Q |
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T |
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352 |
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Q |
| |
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Target: chr8; HSP #9
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Target Start/End: Complemental strand, 43375051 - 43374782
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
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| T |
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aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
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T |
 |
| Q |
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323 |
Q |
| |
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|
|
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43374853 |
tttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacatatctcatgataaacatcatatccaa |
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Target Start/End: Original strand, 20480365 - 20480748
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T |
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254 |
Q |
| |
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| T |
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catgtctatacacaattaaatcataacattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatataattt |
20480560 |
T |
 |
| Q |
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351 |
Q |
| |
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|
| T |
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20480660 |
T |
 |
| Q |
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440 |
Q |
| |
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|
| T |
20480661 |
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Target: chr8; HSP #11
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Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
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T |
 |
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cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
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|
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caccatttcaagcattccttacattctaagtaagataccatacccaactcatgataaacatcatatccaaaatacaatcattcatttataaaacttcact |
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T |
 |
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385 |
Q |
| |
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Target: chr8; HSP #12
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||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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aaacatgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
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T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttca |
349 |
Q |
| |
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| T |
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-ttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaacaacatctcatgataaatatcatatccaatacaatcattcattcataca--ttca |
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T |
 |
| Q |
350 |
cttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| |
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| T |
3432750 |
cttagccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaacgtgtcaagtggcaaacggc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
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Target Start/End: Complemental strand, 24387175 - 24386843
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| |
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|
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
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Q |
| |
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cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
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| |
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caccaattcaaacattccttacatcttaagtaagatagcatacacttctcatgataattatcataaccaaaatacaatctttcattcatacaacttcact |
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T |
 |
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taatcatataagaataatcacaaccattcataag |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
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|
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T |
 |
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aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
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||||||||||| || | ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
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| T |
16417045 |
aagaaaacatgtccacgcacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaatactcaacaatgttattccacatcaactatcaca |
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T |
 |
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tatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaac |
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Q |
| |
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16417145 |
tatagtttcaccaattcaagcatttcttacatcctaagtaaggtagcatgcacatctcacgataagcatcatatctcatacaatcattcaatcatacaat |
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T |
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| Q |
346 |
ttcacttaatcatataagaata |
367 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16417245 |
ttcacttagtcatataagaata |
16417266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 52 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16874407 - 16874074
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16874407 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
16874310 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16874309 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattctcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
16874210 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttc |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||| | | |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
16874209 |
tttcaccattgcaagcattc-tcatattccaagtaatatagcatacatatctcatgataaacatcatgtccaaaatataatcactcattcatacaacttc |
16874111 |
T |
 |
| Q |
349 |
acttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16874110 |
acttagtcatagaagaatggtcacaataattcataag |
16874074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 367
Target Start/End: Original strand, 21679889 - 21680209
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21679889 |
acaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatagatgacaacttccaaatatattgttcatctccaccacatttgcattatcaa |
21679988 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21679989 |
gagaacatgtccatacacaatgaaatcataagattcattatcacaacatcgacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
21680088 |
T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaac |
345 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21680089 |
tattttcaccatttcaagcatttcttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgat-aacatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaac |
21680187 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcacttaatcatataagaata |
367 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21680188 |
ttcacttagtcatataagaata |
21680209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22007948 - 22007638
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22007948 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatcttcacaacatt-gcattatcaaga |
22007850 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22007849 |
aaacattcccatacacaattaaatcatagaattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaa-------caatgttattcaacatcaactatcacatata |
22007757 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttca |
349 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
22007756 |
gtt-cacctattcaagcattctc-atattccaagtaagatagcatacacatctcatgttaaacatcatattcaatacaatcattcattcatacaacttca |
22007659 |
T |
 |
| Q |
350 |
cttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22007658 |
cttagtcatacaagaataatc |
22007638 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20568734 - 20568356
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20568734 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaag |
20568635 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
20568634 |
catgtccatacacaatcaaatcataacactcatcatcaccatatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatttactatctcatgtagtc |
20568535 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20568534 |
tcaccatttcaacatgtctcacattctaagtaagatagcatacacatctcatgat-atcatcatattaatcatacaattattcattcatacaacttcact |
20568436 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20568435 |
tagtcatataagaatagtcacgatatttcataagataattggctcaag-aaacattttcgaccaaaaaccgtgtcaagtgg |
20568356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20574927 - 20574549
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20574927 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaag |
20574828 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
20574827 |
catgtccatacacaatcaaatcataacactcatcatcaccatatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatttactatctcatgtagtc |
20574728 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20574727 |
tcaccatttcaacatgtctcacattctaagtaagatagcatacacatctcatgat-atcatcatattaatcatacaattattcattcatacaacttcact |
20574629 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20574628 |
tagtcatataagaatagtcacgatatttcataagataattggctcaag-aaacattttcgaccaaaaaccgtgtcaagtgg |
20574549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Original strand, 21696253 - 21696639
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21696253 |
gactcgataatgcaacatcaatccacagtattcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
21696352 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || ||||| ||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
21696353 |
tatgcccatacacaaacaaatcataagattcattatcgcaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactaccttatatagtt |
21696452 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21696453 |
tcaccatttcaagcatttcttacattctaagtaagagaacatacacatctcatgataaacatcatatccaacatacaatcattcattcatacaacttcac |
21696552 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||| |||| | | |||||| |||||||| || || |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21696553 |
ttagccatgtaagaatagtcacgatga-acataagacaattgacttaaagaaccatttccgac--aataccgtatcaagtggcaaacggc |
21696639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6775701 - 6775492
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6775701 |
aaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
6775603 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6775602 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
6775503 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
6775502 |
tttcaccattc |
6775492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Original strand, 5236883 - 5237207
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5236883 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
5236980 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5236981 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
5237080 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata--cacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
5237081 |
tttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcactccttcatacaact |
5237179 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5237180 |
tcacttagtcatacaagaataatcacaa |
5237207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24662715 - 24662391
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24662715 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
24662618 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24662617 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
24662518 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata--cacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
24662517 |
tttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcactccttcatacaact |
24662419 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24662418 |
tcacttagtcatacaagaataatcacaa |
24662391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22908956 - 22908745
Alignment:
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49 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
148 |
Q |
| |
|
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|
|
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tacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatca |
22908858 |
T |
 |
| Q |
149 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22908857 |
agaaaacatgcccata--caaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcat |
22908760 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
22908759 |
atagtttcaccattc |
22908745 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 326
Target Start/End: Original strand, 24547909 - 24548181
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
24547909 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
24548006 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
24548007 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaactaccacatttag |
24548106 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatac |
326 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
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24548107 |
tttcaccacttcaaacattccttacattct-agtaagatagcatacacatctcatgatgaacatcatattcaatac |
24548181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24930582 - 24930375
Alignment:
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24930582 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaggaaa |
24930483 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| | ||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24930482 |
catgtccctacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
24930383 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
24930382 |
tcaccatt |
24930375 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 224631 - 224430
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
224631 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
224533 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
224532 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
224433 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtt |
253 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
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224432 |
gtt |
224430 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 701044 - 700843
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
701044 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
700946 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
700945 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
700846 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtt |
253 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
700845 |
gtt |
700843 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 738254 - 738053
Alignment:
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
738254 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
738156 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
738155 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
738056 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtt |
253 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
738055 |
gtt |
738053 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 862149 - 861948
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
862149 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
862051 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
862050 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
861951 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtt |
253 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
861950 |
gtt |
861948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
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Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13664105 - 13663905
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13664105 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
13664007 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13664006 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcaca-tcacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
13663908 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtt |
253 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
13663907 |
gtt |
13663905 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13723380 - 13723180
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13723380 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
13723282 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13723281 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcaca-tcacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
13723183 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtt |
253 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
13723182 |
gtt |
13723180 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17730936 - 17730612
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17730936 |
acaaagactcgataatgcgacatcaccccacaattttc-ccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattaacaa |
17730838 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17730837 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatctcata |
17730738 |
T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaa |
344 |
Q |
| |
|
||||| || | ||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17730737 |
cagttttactatttcaaacatttcttacatcctaagtaagagaacatacaacattccatgataaacatcatatccaacatataatcattcattcatacaa |
17730638 |
T |
 |
| Q |
345 |
cttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17730637 |
attcactcaatcatagaagaataatc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
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Target Start/End: Complemental strand, 24108050 - 24107848
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56 |
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155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24108050 |
actcgataatgcgacaaca--ccacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatt-gcattatcaagaaaac |
24107954 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24107953 |
atgcccgtacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
24107854 |
T |
 |
| Q |
256 |
accatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
24107853 |
accatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Original strand, 43684342 - 43684666
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43684342 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
43684439 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43684440 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
43684539 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatac--acatttcatgataaacatcatatccaa--tacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||| |
|
|
| T |
43684540 |
tttcaccatttcaagcattctc-atattccaagtaatagggaaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcacttcctcatgcaacc |
43684638 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43684639 |
tcacttagtcatacaagaataatcacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
272671 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
272574 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
272573 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
272477 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
272476 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
272435 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
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Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Original strand, 643178 - 643414
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
643178 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
643275 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
643276 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
643372 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
643373 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
643414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Original strand, 828984 - 829220
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
828984 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
829081 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
829082 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
829178 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
829179 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
829220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16195202 - 16195001
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57 |
ctcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaaca |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16195202 |
ctcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaaca |
16195104 |
T |
 |
| Q |
157 |
tgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||| | || |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16195103 |
tgcccattcacaatttaaatcatagtattcatcatcacacatcaatatgattatcaataatcaataatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
16195004 |
T |
 |
| Q |
256 |
acc |
258 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
16195003 |
acc |
16195001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 226 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24107775 - 24107629
Alignment:
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325 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaaacattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaata |
24107676 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
24107675 |
caatcattcattcaaacatcttcacttagtcatataaggatagtcac |
24107629 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 320
Target Start/End: Original strand, 270429 - 270687
Alignment:
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
270429 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaa |
270527 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
270528 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgatt-------atcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
270620 |
T |
 |
| Q |
255 |
cac-cattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatc |
320 |
Q |
| |
|
||| ||||||| || || || ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
270621 |
cactcattcaaacgtttcctaaatcataagtaagataacatatacatctcatgataaatatcatatc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 645491 - 645233
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| Q |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcaacatcatttgcattatcaagaaaa |
645393 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
645392 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgatta-------tcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
645300 |
T |
 |
| Q |
255 |
cac-cattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatc |
320 |
Q |
| |
|
||| ||||||| || || || ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| |
|
|
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cactcattcaaacgtttcctaaatcataagtaagataacatatacatctcatgataaatatcatatc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 831226 - 830968
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
831226 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaa |
831128 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
831127 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgatta-------tcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
831035 |
T |
 |
| Q |
255 |
cac-cattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatc |
320 |
Q |
| |
|
||| ||||||| || || || ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
831034 |
cactcattcaaacgtttcctaaatcataagtaagataacatatacatctcatgataaatatcatatc |
830968 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22089911 - 22089729
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22089911 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
22089814 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22089813 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 226 - 366
Target Start/End: Original strand, 28836562 - 28836704
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226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa-- |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28836562 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaaag |
28836661 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
28836662 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaat |
28836704 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 188 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13663823 - 13663635
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| Q |
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catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaa |
286 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
13663823 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag-ttcaccaattcaagcatttctcacattccaagtaa |
13663725 |
T |
 |
| Q |
287 |
gatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13663724 |
gatagcatacatatctcatgataagcatcatatccaaaatataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatcacaa |
13663635 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15320527 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattgtattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15320430 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15320429 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
15320345 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15500896 - 15500714
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15500896 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattgtattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15500799 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15500798 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 435
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233 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16042424 |
catttgcattctcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaac |
16042325 |
T |
 |
| Q |
234 |
atcaactatcacatatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcc--aatacaat |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || | |||| |||||| || | | || |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
16042324 |
atcaactatcacatatagtttcaccaattcaagcat--ttcatattccaagtaatatggaaaacaacatctcatgataaatatcatatccaaaatataat |
16042227 |
T |
 |
| Q |
330 |
cattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaag |
429 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
16042226 |
cactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatggtcacaacaattcataagacaattagtttaag-aaacatttccgacc-aagaccgtgtcaag |
16042129 |
T |
 |
| Q |
430 |
tggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
16042128 |
tggcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 227 - 440
Target Start/End: Original strand, 18611377 - 18611587
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| Q |
227 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aat |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18611377 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaat |
18611476 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgta |
424 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
18611477 |
ataatcactcatt----caacttcacttagtcatataagaatagtcaccataaatcataagacaaatgactcaa-aaaacatttccgacaaaaatccaaa |
18611571 |
T |
 |
| Q |
425 |
tcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
18611572 |
tcatgtggcaaacggc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
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catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcac-cattcaagtattctttacattctaagtaa |
286 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
13722358 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag-ttcactaattcaagcatttctcacattccaagtaa |
13722260 |
T |
 |
| Q |
287 |
gatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
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13722259 |
gatagcatacatatctcatgataagcatcatatccaaaatataatcactcattcatacaacttcacttagtcatataagaataatc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
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acaaagactcgataatgcgacatcacttcacaatttctaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattatattatcaa |
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T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaac |
239 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| ||| || | ||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gaaatcatatccatacacaatcaagttatagttcaaataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaac |
38532535 |
T |
 |
| Q |
240 |
tatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattca |
335 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
38532536 |
tacctcatatagttttaccatttcaagcatttattacattataagtaagagaacatacaacatcccatgataaacatcatatccaacatataatcattca |
38532635 |
T |
 |
| Q |
336 |
ttcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
38532636 |
ttcatacaatttcacttagtcatataagaatagtcacgataattcataag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaa |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
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tacaataattcattcatacaacttcacgtagtcatacaagaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
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221 |
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| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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atgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
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324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
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Q |
| |
|
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|
| T |
24930202 |
tacattcattcactcatacaacttcacttagtcatacaagaat |
24930160 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Original strand, 28543628 - 28543826
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28543628 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattatcaccacaatatagaggacaacttccacatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
28543727 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| || ||||| || ||| |||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |
|
|
| T |
28543728 |
catgttcatacacaatcaaatcataatactcatcatcaccaa--atcatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacattaattattccatatagttt |
28543825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16040748 - 16040621
Alignment:
| Q |
135 |
catttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16040748 |
catttgcattctcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaac |
16040649 |
T |
 |
| Q |
234 |
atcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16040648 |
atcaactatcacatatagtttcaccatt |
16040621 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16675791 - 16675624
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16675791 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
16675694 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16675693 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
16675624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21853361 - 21853199
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21853361 |
gactcgataatgcgacagcaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
21853264 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
219 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21853263 |
catgcccacacacaattaaatcatagtatccatcatcacacaacaaattgattatcaacaatcaa |
21853199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 154
Target Start/End: Original strand, 37605685 - 37605783
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37605685 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
37605783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21845956 - 21845794
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21845956 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatcaacacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
21845859 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
219 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21845858 |
catgcccacacacaattaaatcatagtatccatcatcacacaacaaattgattatcaacaatcaa |
21845794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 226 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6775420 - 6775326
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatat |
319 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6775420 |
cattcaaaatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacaacatctcatgataaacatcatat |
6775326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 372
Target Start/End: Original strand, 28556874 - 28556998
Alignment:
| Q |
250 |
agtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28556874 |
agtttcaccatttcaagcatttcttacattctaagtaagatatcatacacatctcataataaacatcatatccaaaatacaatcatccattcatacaact |
28556973 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28556974 |
tca-ttagtcatataagaatagtcac |
28556998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13722506 - 13722433
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13722506 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
13722433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13722654 - 13722581
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13722654 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
13722581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13722802 - 13722729
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13722802 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
13722729 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13722950 - 13722877
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13722950 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
13722877 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13723098 - 13723025
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13723098 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
13723025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16040549 - 16040335
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcataca-catttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | |||| |||||| || | | ||| ||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16040549 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccaattcaagcatt--tcatattccaagtaatatggaaaacaacatctcatgataaatatcatatccaa |
16040452 |
T |
 |
| Q |
324 |
--tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaacc |
421 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
16040451 |
aatataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatggtcacaacaattcataagacaattagtttaag-aaacatttccgacc-aagacc |
16040354 |
T |
 |
| Q |
422 |
gtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16040353 |
gtgtcaagtggcaaacggc |
16040335 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18768233 - 18768135
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18768233 |
gactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatatttatcatctccacaacaattgcattatcaagaaa |
18768135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16406295 - 16406149
Alignment:
| Q |
293 |
atacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattg |
392 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||| || | ||||| |
|
|
| T |
16406295 |
atacacatctcatgataaatatcatatccaaaacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaaacatagtcacctcaattcttaggacaattg |
16406196 |
T |
 |
| Q |
393 |
actcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
16406195 |
gttcaag-aaacgttttcgaccaaaaaccatatcatgtggccaccggc |
16406149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16203804 - 16203739
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattg |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16203804 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg |
16203739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39448271 - 39448198
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39448271 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttcaaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
39448198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17151445 - 17151399
Alignment:
| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattct |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17151445 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattct |
17151399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Original strand, 18618138 - 18618187
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
237 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18618138 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
18618187 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21199608 - 21199547
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21199608 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
21199547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31195719 - 31195658
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31195719 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccgcaacatttgcattatcaagaaa |
31195658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17151561 - 17151521
Alignment:
| Q |
217 |
caacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcac |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17151561 |
caacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcac |
17151521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 224348 - 224301
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
224348 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
224301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 700761 - 700714
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
700761 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
700714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 737971 - 737924
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
737971 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
737924 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #82
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Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 861866 - 861819
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| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
861866 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
861819 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #83
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| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17151335 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
17151288 |
T |
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Target: chr8; HSP #84
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363 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
16194986 |
tacacatcttatgatagacatcatatcccacataatcattcattcatacaacttcacttagttatataag |
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T |
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227 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18618028 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
18618062 |
T |
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Target: chr8; HSP #86
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286 |
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383 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| | | ||||| |
|
|
| T |
22144136 |
agatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcactcatt----caacttcgcttagtcatataagaatattcaccataaatcata |
22144231 |
T |
 |
| Q |
384 |
aggtaattgactcaagaaa |
402 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| |
|
|
| T |
22144232 |
agacaaatgactcaagaaa |
22144250 |
T |
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Target: chr8; HSP #87
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| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23148624 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcacctcaacaacatttgcattatcaag |
23148682 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #88
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| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21192181 |
caatataaatgacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgtattatcaagaaa |
21192120 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #89
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaa-tccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || || |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22737349 |
gactcgataatgtgacatcacctcaacaattttcaccaccatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccaccacaaatgcattaccaagaaa |
22737250 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37654952 - 37654901
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| Q |
208 |
atcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37654952 |
atcaataatcatcaatatcattcaacatcaactacatcatatagtttcacca |
37654901 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 150
Target Start/End: Original strand, 23835950 - 23836008
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23835950 |
caatataaaggaaaacttccaaatatattgatcatttcctcaacaattgcattatcaag |
23836008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 85)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
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Target Start/End: Original strand, 21392874 - 21393265
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21392874 |
gtacaaggactccataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaaaacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
21392973 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21392974 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
21393073 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
21393074 |
atagtttcaccattcaagtactccttacattctaagtaagatcgcatacacatttcatgataaacaacatatctcatacaatcattctttcatacaacgt |
21393173 |
T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||| |
|
|
| T |
21393174 |
cacttagtcttataagaatagtcacaataattcataagacaattgactcaag-aaacaattccgaccaaaaaccataccaagtggcaaacggc |
21393265 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 48 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21652877 - 21652485
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21652877 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
21652778 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
21652777 |
aagaaaacatgttcatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatcacgt |
21652678 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa--tacaatcattcattcatacaa |
344 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21652677 |
atagtttcaccaattcaaacattccttacatcctaagtaagatagcatatacatctcatgataaacatcatattcaaactacaatcattcattcatacaa |
21652578 |
T |
 |
| Q |
345 |
cttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccg |
438 |
Q |
| |
|
|||| ||| | |||||| |||| ||| || |||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21652577 |
cttcttttagttatataaaaatagccaccacaattcttaagataattggttcaag-gaacattttcgaccaaaaaccatatcaagtggccaccg |
21652485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Original strand, 20710823 - 20711214
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20710823 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattatctccacaacattcgcattatc |
20710922 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20710923 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaattatcacat |
20711021 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaac-atcatatccaatacaatcattcattcatacaac |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20711022 |
atagtttcaccatttcaagcattcattacattct-agtaagatatcatacacacctcatgataaacaatcatatccaacacaatcattcaatcatacaac |
20711120 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20711121 |
ttcacttagtcatataagaatgggcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
20711214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 48 - 432
Target Start/End: Original strand, 28258286 - 28258669
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28258286 |
gtacaaggactcgataatgcgacgacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaacatt-gcattatc |
28258384 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaa-catgattatcaataatcaacaa-tgtcattcaacatcaactatcac |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28258385 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaatcatgattatcattaatcaacaaatgtcattcaacatcaactatcac |
28258484 |
T |
 |
| Q |
246 |
atatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaac |
345 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28258485 |
atatagtttcaccattcaatcattccttacatctcaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaacacaatcattcattcatacaac |
28258584 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||| || || |||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28258585 |
ttcacttagtcatataagaatagtcaccacagtttataatacaattggctcaag-aaacatttccgacc-aaaaccatatcaagtgg |
28258669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 48 - 418
Target Start/End: Original strand, 23510676 - 23511044
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23510676 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttctacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatc |
23510774 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa-catcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | |||| ||| |||||| ||||| || |||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23510775 |
aagaaaacatgcccacatgcaattaaatcatagcattcatcaccaca--tcaacatgatcatcaataatcaacaatgctattcaatcatcaactatcaca |
23510872 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaac |
345 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23510873 |
tttagtttcaccgattcaaacattccttacattcta-gtaatataacatacacatctcatgataaacatcatatccaatacattcattcattcatacaac |
23510971 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaa |
418 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
23510972 |
ttcacttaatcatacaagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacctctccgatcaaaa |
23511044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 55 - 370
Target Start/End: Original strand, 16534999 - 16535313
Alignment:
| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16534999 |
gacttgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16535097 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16535098 |
catgcccatatacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
16535197 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaa |
354 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16535198 |
caccatttaagcatttcttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatattcaatacaatcattcattcatacaacttcacttag |
16535297 |
T |
 |
| Q |
355 |
tcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16535298 |
tcatacaagaataatc |
16535313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24184681 - 24184295
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| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24184681 |
gactcgataatgcgacaacaatacacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
24184582 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
24184581 |
catgtccatacacaaccaaatcatggaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcatttatctcatatggttt |
24184482 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24184481 |
caccatttcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacaactcatgataaacatcatatccaaaatacaagcattcatttatacaacttcact |
24184382 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24184381 |
tagtcatacaagaatgatcacaataactcataagacaattggctcaag-aagcatttccgacc-aaaaccgtatcaagtggcaaacggc |
24184295 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 56 - 440
Target Start/End: Original strand, 4863961 - 4864343
Alignment:
| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4863961 |
actcaataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaac |
4864059 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4864060 |
atgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
4864159 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
|||| || |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4864160 |
caccaatacaagcatttcttacatcctaagtaagataacatacacatctcatgataaatatcatatccaaaacaatcattcattcatacaacttcactta |
4864259 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| |||| ||||| | |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4864260 |
gttatataa-catagtcaccaccatccttaagacaattggttcaag--aacattttcgaccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
4864343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Original strand, 11582564 - 11582774
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11582564 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
11582663 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11582664 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
11582763 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
11582764 |
tttcaccattc |
11582774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 52 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22884771 - 22884454
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22884771 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatt-gcattatcaaga |
22884673 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22884672 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaactgtcacatata |
22884573 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttca |
349 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22884572 |
gtt-caccaattcaagcattctc-atattccaagtaagataacatatacatctcatgataaacatcatattcaatacaatcattcattcatacaacttca |
22884475 |
T |
 |
| Q |
350 |
cttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22884474 |
cttagtcatacaagaataatc |
22884454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 367
Target Start/End: Original strand, 19404268 - 19404588
Alignment:
| Q |
50 |
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149 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19404268 |
acaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgttcatctccaccacatttgcattatcaa |
19404367 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19404368 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
19404467 |
T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaac |
345 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19404468 |
taatttcaccatttcaagcatttcttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgat-aacatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaac |
19404566 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcacttaatcatataagaata |
367 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19404567 |
ttcacttagtcatataagaata |
19404588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Original strand, 21649523 - 21649855
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21649523 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggataacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
21649621 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21649622 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacgatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
21649721 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21649722 |
caccaattcaaacattccttacatcttaagtaagatagcatacacttctcatgataattatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaactttact |
21649821 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21649822 |
tagtcatacaagaatggtcacaacaattcataag |
21649855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1170129 - 1169923
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1170129 |
gactcgataacgcgacaacaatccaaaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
1170030 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1170029 |
catgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatgtagttt |
1169930 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
1169929 |
caccatt |
1169923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11338341 - 11338021
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11338341 |
gtacaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaat-tccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
11338243 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
11338242 |
aagaaaacatgtccatacataatcaaatcataagattcatcatcactacatcaacatgattatcaataatcaacaaggtcattcaacattaactatctca |
11338143 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa--tacaatcattcattcataca |
343 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11338142 |
tatagttgcaccatttcaagcatttcttaccttctaagtaagatagcatacacattttatgataaacatcatatccaaactacaatcaatcattcataca |
11338043 |
T |
 |
| Q |
344 |
acttcacttaatcatataagaa |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11338042 |
acttcacttagtcatataagaa |
11338021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 188 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1169848 - 1169602
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaag |
287 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1169848 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaag |
1169749 |
T |
 |
| Q |
288 |
atagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggt |
387 |
Q |
| |
|
|| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
1169748 |
atgacatacatatctcatgataatcatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatcataacaaatcataagac |
1169649 |
T |
 |
| Q |
388 |
aattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |
|
|
| T |
1169648 |
aattggctcaag-aaacatttccgacaaaaatccaaatcatgtggcaa |
1169602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 323
Target Start/End: Original strand, 11341326 - 11341597
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11341326 |
aaggactcaataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
11341423 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11341424 |
aaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
11341523 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| | | |||| |||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11341524 |
tttcaccatttcaagcatttctcatattccaagtaagagaacatacaacatctcatgacaaacatcatatccaa |
11341597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 440
Target Start/End: Original strand, 23453638 - 23454032
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23453638 |
acaaggactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
23453737 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| | |||| |
|
|
| T |
23453738 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaaaaaccaacaatgtcattcaaaatcaactacctcata |
23453837 |
T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaa |
344 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23453838 |
tagttttaccatttcaaacatttcttacatcctaagtaagagaacatacaacattccatgataaacatcatatccaacatttaatcattcattcatacaa |
23453937 |
T |
 |
| Q |
345 |
cttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgact--caagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||| || |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
23453938 |
cttcacttagtcatataagaataatctcaataaatcataagcctattgacttacaag-aaccatttccgac--aataccgtatcaagtggcaaacggc |
23454032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 440
Target Start/End: Original strand, 23465143 - 23465537
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| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23465143 |
acaaggactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
23465242 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| | |||| |
|
|
| T |
23465243 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaaaaaccaacaatgtcattcaaaatcaactacctcata |
23465342 |
T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaa |
344 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23465343 |
tagttttaccatttcaaacatttcttacatcctaagtaagagaacatacaacattccatgataaacatcatatccaacatttaatcattcattcatacaa |
23465442 |
T |
 |
| Q |
345 |
cttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgact--caagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||| || |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
23465443 |
cttcacttagtcatataagaataatctcaataaatcataagcctattgacttacaag-aaccatttccgac--aataccgtatcaagtggcaaacggc |
23465537 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1221319 - 1221112
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
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| T |
1221319 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaacttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
1221221 |
T |
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| Q |
152 |
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251 |
Q |
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| T |
1221220 |
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1221123 |
T |
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| Q |
252 |
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262 |
Q |
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| T |
1221122 |
tttcaccattc |
1221112 |
T |
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Target: chr5; HSP #20
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151 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
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| T |
22367973 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
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T |
 |
| Q |
252 |
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262 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr5; HSP #21
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52 |
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151 |
Q |
| |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
152 |
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251 |
Q |
| |
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| T |
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7424564 |
T |
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| Q |
252 |
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262 |
Q |
| |
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||||||||||| |
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T |
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Target: chr5; HSP #22
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
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| T |
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aaacatgcttatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatcattcaacattaactatatcatatag |
17473161 |
T |
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| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
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| T |
17473160 |
tttcaccattc |
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T |
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Target: chr5; HSP #23
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52 |
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Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
252 |
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346 |
Q |
| |
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| T |
21234796 |
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T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
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|
| T |
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tcacttagtcatacaagaataatcacaa |
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T |
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Q |
| |
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T |
 |
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152 |
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251 |
Q |
| |
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21074881 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
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||||||||||| |
|
|
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tttcaccattc |
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T |
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
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| T |
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aaacatgcccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattattaataatcaacaatgtcatccaacatcaactatcacatatag |
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T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
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Q |
| |
|
|||||||||| |
|
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110373 |
tttcaccatt |
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T |
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Target: chr5; HSP #26
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
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| T |
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aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
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T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
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|||||||||| |
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| T |
4201356 |
tttcaccatt |
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T |
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Target: chr5; HSP #27
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9732154 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagttt |
9732055 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| | | |||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9732054 |
caccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatttcatgacaaatatcatatccaa |
9731984 |
T |
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Target: chr5; HSP #28
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatatccacaaca-ttgcattatcaaga |
23513584 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
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|
| T |
23513585 |
aaacatgcccacacacaaatagatcatagtaatcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacattta |
23513684 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcacca |
259 |
Q |
| |
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|||| |||| |
|
|
| T |
23513685 |
gttttacca |
23513693 |
T |
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Target: chr5; HSP #29
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11044 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
11141 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11142 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtttc |
11239 |
T |
 |
| Q |
256 |
accattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
11240 |
accattc |
11246 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatcacatacatatctcatgataaacatcatatccaata |
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T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
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|
| T |
9731875 |
caatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaccgtgt |
9731777 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
9731776 |
caagtggcaaacggc |
9731762 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20615305 |
gactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaa |
20615402 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
20615403 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataatcaacaatgtcatgtatcatcaactatatcatatagttt |
20615502 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata--cacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttca |
349 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |
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|
| T |
20615503 |
caccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaaacaacatctcatgagaaacatcatatccaaaatataatcactccttcatacaacttca |
20615601 |
T |
 |
| Q |
350 |
cttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
20615602 |
cttagtcatacaagaataatcacaa |
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Target: chr5; HSP #32
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| |
|
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|
| T |
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catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccaatacaagcatttcttacatcctaagtaa |
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T |
 |
| Q |
287 |
gatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataagg |
386 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||| |
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|
| T |
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T |
 |
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387 |
taattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
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| |
|
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|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25192586 - 25192390
Alignment:
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25192586 |
aaggactcgataatgcgacaacaaac-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaga |
25192488 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatat |
249 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25192487 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatat |
25192390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 56 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29192203 - 29192004
Alignment:
| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29192203 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
29192106 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29192105 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtttc |
29192008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10779767 - 10779560
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10779767 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatatatgataacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
10779669 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10779668 |
aaacatgcccacac--aaataaatcataatattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
10779571 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
10779570 |
tttcaccattc |
10779560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 323
Target Start/End: Original strand, 25425312 - 25425580
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25425312 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
25425409 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25425410 |
aa-catgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
25425506 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| || | | | |||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25425507 |
tttcaccattccaaataattctcatattccaagtaagataacatacaacatctcatgacaaatatcatatccaa |
25425580 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 43445342 - 43445142
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43445342 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
43445244 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43445243 |
aaacatgcccatacacaaataa-tcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgatattcaacatcaactatcacatata |
43445145 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtt |
253 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
43445144 |
gtt |
43445142 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18779583 - 18779374
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18779583 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatatatgacgacaaccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18779486 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaa-catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18779485 |
aaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaatcatgattatcgataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatata |
18779386 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
18779385 |
gtttcaccattc |
18779374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 225 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10779489 - 10779344
Alignment:
| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaat |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10779489 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatattcaat |
10779390 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10779389 |
acaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
10779344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 55 - 374
Target Start/End: Original strand, 37051677 - 37051998
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37051677 |
gactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaa |
37051774 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
37051775 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacgtaattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcagctatatcatatagttt |
37051874 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt-caagtattctttacattctaagtaaga-tagcatac-acatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttca |
349 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| | | |||| |||||| | | | || |||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
37051875 |
caccattccaagcattc-tcatattccaagtaataggaaaaaacaacatctcatgagaaatatcatatccaaaatataatcactccttcatacaacttca |
37051973 |
T |
 |
| Q |
350 |
cttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37051974 |
cttagtcatacaagaataatcacaa |
37051998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Original strand, 11318 - 11462
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11318 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatattcaata |
11417 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11418 |
caatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
11462 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29191929 - 29191785
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29191929 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcgttccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatattcaata |
29191830 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29191829 |
caatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
29191785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21933748 - 21933512
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21933748 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
21933651 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21933650 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attagcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
21933554 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21933553 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
21933512 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21939918 - 21939682
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21939918 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
21939821 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21939820 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attagcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
21939724 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21939723 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
21939682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27185301 - 27185095
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27185301 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattctcaccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
27185203 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| ||| |||||| ||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27185202 |
catgtctatacacaattaaatcatagcattcatcttcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagtt |
27185103 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
27185102 |
tcaccatt |
27185095 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Original strand, 35580944 - 35581180
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35580944 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
35581041 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35581042 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attagcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
35581138 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35581139 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
35581180 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37010752 - 37010516
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52 |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37010752 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
37010655 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37010654 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcgtcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
37010558 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37010557 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
37010516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 323
Target Start/End: Original strand, 19498490 - 19498752
Alignment:
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19498490 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattatcaaga |
19498587 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19498588 |
aa-catgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc------catcaactatatcatatag |
19498678 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattcaag-tattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || | | | |||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19498679 |
tttcaccattccagataattctcatattccaagtaagagaacatacaacatctcatgataaacatcatatccaa |
19498752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 226 - 435
Target Start/End: Original strand, 11582846 - 11583055
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11582846 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacatatctcatgataaacatcatatccaata |
11582945 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactc-aagaaaacatttccgaccaaaaaccgta |
424 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||| || ||| |||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
11582946 |
caatcattcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatcataagaaaattggttcaaaggaaacatttcc-aacaaaaaccgta |
11583044 |
T |
 |
| Q |
425 |
tcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
11583045 |
tcaagtggcaa |
11583055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Original strand, 23327643 - 23327825
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23327643 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
23327740 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23327741 |
aaacatgtccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
23327825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Original strand, 24595191 - 24595373
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24595191 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
24595288 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24595289 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaaaatcaa |
24595373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 225 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 110292 - 110145
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| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaat |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
110292 |
tcattcaacatcaactatcacatacagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatggtaaacatcatatccaat |
110193 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
110192 |
acgatcattcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcac |
110145 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25901911 - 25901707
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
25901911 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcctcaacatt-gcattactaagaaaa |
25901814 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25901813 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataattaacaatgtcaagcaacatcaactatatcatatagttt |
25901714 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
25901713 |
caccatt |
25901707 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35792719 - 35792544
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35792719 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
35792621 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35792620 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatcattca |
35792544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1221040 - 1220890
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
1221040 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatctaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
1220941 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1220940 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatcacaa |
1220890 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
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Query Start/End: Original strand, 226 - 374
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
4201274 |
cattaaacatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
4201175 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4201174 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatcacaa |
4201124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11213183 - 11212986
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| Q |
60 |
gataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgc |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11213183 |
gataatgcgaca-caatc-acaattttcaacacaatatataggacgacacccaattatattgttcatcacaacatcatttgcattatcaagaaaacatgc |
11213086 |
T |
 |
| Q |
160 |
tcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
259 |
Q |
| |
|
| || ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11213085 |
ccgcacacaattagatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaattatcgcatatagtttcacca |
11212986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 226 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27185023 - 27184830
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27185023 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaaacattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
27184924 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaa |
418 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27184923 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatggtcacaataactcacaagacaattgactaaag-aaacatttccgacaaaaa |
27184830 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 226 - 435
Target Start/End: Original strand, 23513767 - 23513977
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa-- |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23513767 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcacacatatctcatggtaaacatcatatccaaag |
23513866 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgt |
423 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
23513867 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatggtcacaacaactcacaagacaattggctaaag-aaacatttccgacaaaaatccaa |
23513965 |
T |
 |
| Q |
424 |
atcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |
|
|
| T |
23513966 |
atcatgtggcaa |
23513977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18779301 - 18779155
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| Q |
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
18779301 |
cattcaacatcaacttccacatatagtttcaccattcaaccattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
18779202 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
18779201 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagagtaatc |
18779155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 226 - 366
Target Start/End: Original strand, 25425589 - 25425732
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa- |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25425589 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacaacatctcatgataaacatcatatccaaa |
25425688 |
T |
 |
| Q |
324 |
-tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
25425689 |
gtataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaat |
25425732 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 136 - 440
Target Start/End: Original strand, 24474367 - 24474654
Alignment:
| Q |
136 |
atttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24474367 |
atttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgatt-------atcaacaatgttattcaacaa |
24474459 |
T |
 |
| Q |
236 |
caactatcacatatagtttcac-cattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
24474460 |
caactatcacatatagtttcactcattcaagcatttcctacatcataagtaagatagcatatacatctaatgataaatatcat----------atcattc |
24474549 |
T |
 |
| Q |
335 |
attcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggca |
434 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| || |||| ||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24474550 |
attcatacaacttcacttagttatataaacatagtcaccacaattcttaatacaattggttcaag-aaacgtttttgaccaaaaaccatatcaagtggcc |
24474648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22367793 - 22367647
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22367793 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatctaaacattccttacattctaagtaagataacatacatatctcgtgataaacatcatatccaaaa |
22367694 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22367693 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
22367647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 225 - 370
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225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11341605 |
tcattcaacatcaactatcacatatagct-caccaattcaagcattctc-atattccaagtaagatagcatatacatctcatgataaacatcatattcaa |
11341702 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11341703 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 370
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| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcc-- |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25901635 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaaggattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatctcatgataaacatcgtatccaa |
25901537 |
T |
 |
| Q |
322 |
aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25901536 |
aatataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
25901488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
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Target Start/End: Original strand, 7424648 - 7424740
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcata |
318 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7424648 |
cattaaacatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcata |
7424740 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 219
Target Start/End: Original strand, 27008705 - 27008867
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27008705 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaccaca-ttgcattaccaagaaaa |
27008802 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
219 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27008803 |
catgcccatatacagttaaatcatagtattcatcatcacacaacaatttgattatcaacaatcaa |
27008867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 229 - 319
Target Start/End: Original strand, 19498764 - 19498855
Alignment:
| Q |
229 |
tcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatat |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19498764 |
tcaacatcaactgtcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacaacatctcatgataaacatcatat |
19498855 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35792456 - 35792275
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| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaa |
286 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | | |||| |||||| |
|
|
| T |
35792456 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttgttccacatcaactatcacatatagtttcaccaattcaagcatt-atcatattccaagtaa |
35792358 |
T |
 |
| Q |
287 |
gatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
| | | || | || |||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
35792357 |
tagggaaaacaatatctcatgataaatatcatatccaaaatataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaat |
35792275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 7727296 - 7727369
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| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7727296 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccataacatttgcattatcaagaaa |
7727369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Original strand, 3672685 - 3672780
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3672685 |
gactcgataatgcgatatcacatcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaagtatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
3672780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #72
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Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 23492722 - 23492794
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| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23492722 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacattt-cattatcaagaaa |
23492794 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 435
Target Start/End: Original strand, 23505663 - 23505802
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| Q |
297 |
acatttcatgataaacatcatatccaa--tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgac |
394 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | || |||||||| ||||| | |
|
|
| T |
23505663 |
acatctcatgataatcatcatatccaaaatataattactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatagtctccacaattcataaaacaattggc |
23505762 |
T |
 |
| Q |
395 |
tcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |
|
|
| T |
23505763 |
tcaag-aaacatttccgacaaaaatccaaatcatgtggcaa |
23505802 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32967608 - 32967547
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32967608 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
32967547 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 37189561 - 37189501
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
37189561 |
caatataaaggacaacctccaaatatattgatcatttccacaacatttgcatcatcaagaa |
37189501 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43445060 - 43445013
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43445060 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
43445013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Original strand, 24470996 - 24471049
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacat |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24470996 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacat |
24471049 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 153
Target Start/End: Original strand, 431149 - 431221
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| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
431149 |
aattttcacaacaatacaaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa |
431221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Original strand, 28888649 - 28888709
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28888649 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatatccactacatttgcattatcaagaa |
28888709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5452130 - 5452007
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| Q |
199 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac- |
296 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5452130 |
aacataatcatcaataatcaacagtatcattcaacatcaactaccttgtatagttttaccatttcaagtatttctcacattctaagtaagaggacataca |
5452031 |
T |
 |
| Q |
297 |
acatttcatgataaacatcatatc |
320 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5452030 |
acatcacatgataaatatcatatc |
5452007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 5452285 - 5452190
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
5452285 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaacatattgatcatctccagaacaattgcattaccaag |
5452190 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Original strand, 21615735 - 21615804
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21615735 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaag |
21615804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24226911 - 24226842
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24226911 |
aattttcacgacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacaattgcattatcaag |
24226842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Original strand, 3672849 - 3672900
Alignment:
| Q |
208 |
atcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3672849 |
atcaataatcatcaatatcattcaacatcaactaaatcatatagtttcacca |
3672900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 150
Target Start/End: Original strand, 19860967 - 19861025
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19860967 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaag |
19861025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 83)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 49 - 436
Target Start/End: Original strand, 44863930 - 44864316
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| Q |
49 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44863930 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacagcatttgcattatca |
44864029 |
T |
 |
| Q |
149 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44864030 |
agaaaacatgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcacacattagcatgattatcaatgatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
44864129 |
T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttc |
348 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
44864130 |
tactttcaccattcaagtattccttacattccaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcgcatacaatcattctttcatacaacgtc |
44864229 |
T |
 |
| Q |
349 |
acttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaac |
436 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
44864230 |
acttagtcatataagaatagtcacaataattcacaagacaattgactcaag-aaacatttccgaccaaaaatcataccaagtggcaac |
44864316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Original strand, 47288461 - 47288852
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47288461 |
gtacaaggactcgataatgcaacaacaatccacaattttcacctcaaaatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
47288560 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47288561 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
47288660 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47288661 |
atggtttcaccattcaagcattccttacattataagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
47288760 |
T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||| |||| || |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
47288761 |
cacttatttatataaaaatggtcaccacaattcttaaaacaattggttcaa-aaaacatttccgaccaaaaaccgtgtcaagtggcaaacggc |
47288852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 48 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12545190 - 12544801
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12545190 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttccattatc |
12545091 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
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12545090 |
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12544991 |
T |
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| Q |
248 |
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346 |
Q |
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| T |
12544990 |
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12544892 |
T |
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438 |
Q |
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tcacctagtcatataagaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtggccaccg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 48 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13867552 - 13867163
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T |
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247 |
Q |
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T |
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248 |
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345 |
Q |
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| T |
13867352 |
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13867253 |
T |
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| Q |
346 |
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435 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
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Target Start/End: Original strand, 369580 - 369965
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Q |
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T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
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catgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcctttaacatcaactatcacatatagttt |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
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T |
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Q |
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gccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaccgtgtcaagtggcaaacggc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
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Target Start/End: Complemental strand, 45453728 - 45453346
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Q |
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T |
 |
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253 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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352 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
353 |
aatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccg |
438 |
Q |
| |
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| T |
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agtcatataagaatggtcacaacaaatcataagacaattggctcaagaaca---ttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccg |
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T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #7
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Target Start/End: Complemental strand, 15823888 - 15823514
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Q |
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T |
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| Q |
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aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtat----tcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatc |
243 |
Q |
| |
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| T |
15823788 |
aagaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtatatattcaccatcacatattaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacatcaactatc |
15823689 |
T |
 |
| Q |
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acatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcataca |
343 |
Q |
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| T |
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acatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgagaaacatcatatcttatacaatcattcactcatacg |
15823589 |
T |
 |
| Q |
344 |
acttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaa |
418 |
Q |
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acttcacttagtcatacaagaatagtcacaacaattcacaaaacaattagctcaagaaaacatttccgaccaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
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Target Start/End: Complemental strand, 26071743 - 26071396
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Q |
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T |
 |
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247 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgact |
395 |
Q |
| |
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26071444 |
tcacttagtcatataagagtaatcacaataattcataaggtaattgact |
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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
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Target Start/End: Complemental strand, 26095530 - 26095183
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
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|
| T |
26095430 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctcat |
26095332 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
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|
|
| T |
26095331 |
atagtttcaccgtttcaagcatttcttacattctaatcaagatagcatacacatcacatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
26095232 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgact |
395 |
Q |
| |
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|
| T |
26095231 |
tcacttagtcatataagagtaatcacaataattcataaggtaattgact |
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T |
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Target: chr7; HSP #10
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Target Start/End: Original strand, 12753575 - 12753958
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Q |
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T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
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Q |
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catgtccatacacaaacaaattatagtactcatctccacacattaacatgattatcaataatcaataatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
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T |
 |
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Q |
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| T |
12753774 |
caccatttcaagcattatttacattctaagtaagataacatatacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcaatcatacaacttcactta |
12753873 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
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gtcatataagaatgatcacaacaaatcataagacaattgactcaag-aaacatttccgacc-aaaatcatatcaagtggcaaacggc |
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Target: chr7; HSP #11
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| |
|
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T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
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| T |
125619 |
catgcccattcacgattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaactatcacatttagttt |
125718 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
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|
|
| T |
125719 |
caccaattcaaacattccttacattcta-gtaagatagcatacacatctcatgattaacatcatatcaaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
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T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaa |
428 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||| |
|
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gtcatacaagaataatcacaaccattcatgaggtaattgactcaataaaacatctccgatcaaaacccatatcaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
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Target Start/End: Original strand, 11285904 - 11286247
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T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca--ttaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagt |
252 |
Q |
| |
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T |
 |
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ttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgact |
395 |
Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Original strand, 3893789 - 3894173
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
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| T |
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catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcaccaca--tcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
3893985 |
T |
 |
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255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
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Q |
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| T |
3893986 |
caccacttcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcgtacacatctcatgataaatatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaacttcact |
3894085 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
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|| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3894086 |
tagtcatacaagaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
3894173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 112767 - 112381
Alignment:
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
112767 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacatcacccaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
112669 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
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| T |
112668 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacagtgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
112569 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
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| T |
112568 |
caccaaatcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatacatatctcatgataattatcatatccaaaatacaaccattcattcgtacaacttcact |
112469 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
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|
| T |
112468 |
tagtcatacaagaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaacaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
112381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Original strand, 142313 - 142708
Alignment:
| Q |
48 |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
142313 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatc |
142412 |
T |
 |
| Q |
148 |
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246 |
Q |
| |
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| T |
142413 |
aagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacataatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcaca |
142512 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcataca |
343 |
Q |
| |
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| T |
142513 |
tatagtttcaccaattcaaacatttcttacatcctaagtaagataacatacccatctcatgataaatatcatatccaaaatacaatcatccattcataca |
142612 |
T |
 |
| Q |
344 |
acttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
142613 |
acttcacttagtcatacaagaatagtaacctcagttcataagacaattggctcaag-aaacatttctgaccaaaaaccgtgtcaagtggcaaacggc |
142708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 52 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18981379 - 18981044
Alignment:
| Q |
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151 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa-catcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
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|
| T |
18981281 |
aaacatgcccacatacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaatcatcaactatcacatata |
18981182 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcac-cattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
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| T |
18981181 |
gtttcacaaattcaaacattccttacatcttaagtaagatggcatacacctctcatgataattatcatatccaaaatacaatcatccattcatacaactt |
18981082 |
T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
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| T |
18981081 |
cacttagtcatacaagaatggtcacaacaattcataag |
18981044 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 52 - 323
Target Start/End: Original strand, 36051355 - 36051624
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
36051355 |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattttcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
36051552 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
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|
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| T |
36051553 |
tttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatatatatctcatgataaacatcatatccaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 52 - 385
Target Start/End: Original strand, 13757270 - 13757603
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13757270 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
13757367 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
13757368 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattctcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
13757467 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttc |
348 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13757468 |
tttcaccattgcaagcattc-tcatattccaagtaatatagcatacatatctcatgataaacatcatgtccaaaatataatcactcattcatacaacttc |
13757566 |
T |
 |
| Q |
349 |
acttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13757567 |
acttagtcatagaagaatggtcacaataattcataag |
13757603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 262
Target Start/End: Original strand, 7291540 - 7291753
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7291540 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
7291638 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7291639 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcat |
7291738 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
7291739 |
atagtttcaccattc |
7291753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12249584 - 12249263
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12249584 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaactaccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
12249485 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
12249484 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactacctcatatagtt |
12249385 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
|
| |||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12249384 |
ttaccatttcaagcatttcttacatcctaagtaagataacatacacatcttatgataaacatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaactttag |
12249285 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
12249284 |
ttagtcatatgagaatagtcac |
12249263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 55 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1938240 - 1937973
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1938240 |
gactcgataatgcgacaacaattca--attttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1938142 |
catgctcattcataattaaatcataatattcatcattacacatcaacattattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
1938043 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1938042 |
caccaattcaa-cattccttacattct-agtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaata |
1937973 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 199 - 370
Target Start/End: Original strand, 15851163 - 15851334
Alignment:
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacac |
15851262 |
T |
 |
| Q |
299 |
atttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15851263 |
atctcatgataaacatcatattcaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 56 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15952563 - 15952360
Alignment:
| Q |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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actcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
15952465 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtttc |
15952367 |
T |
 |
| Q |
256 |
accattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
15952366 |
accattc |
15952360 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15443031 - 15442707
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15443031 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15442934 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15442933 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
15442834 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata--cacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
15442833 |
tttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcactccttcatacaact |
15442735 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15442734 |
tcacttagtcatacaagaataatcacaa |
15442707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 32496025 - 32495819
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
32496025 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
32495927 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32495926 |
catgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
32495827 |
T |
 |
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254 |
tcaccatt |
261 |
Q |
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tcaccatt |
32495819 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 3058741 - 3058941
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154 |
Q |
| |
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| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
3058839 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
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||||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
3058840 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacagtatcattcaacatcaactatcacatatagttt |
3058939 |
T |
 |
| Q |
255 |
ca |
256 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
3058940 |
ca |
3058941 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 13038576 - 13038373
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| Q |
54 |
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153 |
Q |
| |
|
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|
|
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13038479 |
T |
 |
| Q |
154 |
acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13038478 |
acatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
13038379 |
T |
 |
| Q |
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tcacca |
259 |
Q |
| |
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|||||| |
|
|
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tcacca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 55 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11582311 - 11582109
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11582311 |
gactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacactcaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaagaaaa |
11582214 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
11582213 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaccacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
11582114 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca |
259 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
11582113 |
cacca |
11582109 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16571568 - 16571246
Alignment:
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147 |
Q |
| |
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| T |
16571568 |
acaaagactcgataatgagacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaactttcatatatatattgatcatctcaacaacatttgcattatc |
16571469 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
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|
| T |
16571468 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctca |
16571369 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcataca |
343 |
Q |
| |
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| T |
16571368 |
tatagttttaccatttcaagcattc-ttacattctaagtaagagaacatacacatctcatgatattcatcatatccaacatataatcattctttcataca |
16571270 |
T |
 |
| Q |
344 |
acttcacttaatcatataagaata |
367 |
Q |
| |
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|||||||||| | ||||||||||| |
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| T |
16571269 |
acttcacttagtgatataagaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 367
Target Start/End: Original strand, 16594094 - 16594416
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50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatcca-at-tatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16594094 |
acaaagactcgataatgagacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaactttcatatatatattgatcatctcaacaacatttgcattatc |
16594193 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
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|
| T |
16594194 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctca |
16594293 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcataca |
343 |
Q |
| |
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|||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |
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|
| T |
16594294 |
tatagttttaccatttcaagcattc-ttacattctaagtaagagaacatacacatctcatgatattcatcatatccaacatataatcattctttcataca |
16594392 |
T |
 |
| Q |
344 |
acttcacttaatcatataagaata |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
16594393 |
acttcacttagtgatataagaata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
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Target Start/End: Original strand, 2027250 - 2027457
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2027250 |
gactcgataatgcgacaacaatcacaaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
2027349 |
T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|| || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
2027350 |
cacgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattgaacatcaactatatcatatagttt |
2027449 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattc |
262 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
2027450 |
caccattc |
2027457 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
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Target Start/End: Original strand, 16210471 - 16210676
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacctaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
16210568 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
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|||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
16210569 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccaacacacatcaacatgtttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatataa |
16210668 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
16210669 |
tttcacca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
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Target Start/End: Original strand, 16417162 - 16417364
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56 |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16417162 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
16417259 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16417260 |
atgcccacac--aaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtttc |
16417357 |
T |
 |
| Q |
256 |
accattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
16417358 |
accattc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
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Target Start/End: Complemental strand, 14252491 - 14252277
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatgcacatctcatgataaacatcatatccaaaa |
14252392 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14252391 |
caatcattcattcatacaacttcacttagttatataaacatagccaccacaattcttaagacaattggttcaaaaaaatatttccgactaaaaaccgtat |
14252292 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
14252291 |
caagtggcaaacggc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 55 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30263593 - 30263272
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |
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|
| T |
30263593 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcctcaacatt-gcattaccaagaaaa |
30263496 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
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||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
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catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataattaacaatgtcaagcaacatcaactatatcatatagttt |
30263396 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata--cacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttca |
349 |
Q |
| |
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||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |
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| T |
30263395 |
caccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcactccttcatacaacttca |
30263297 |
T |
 |
| Q |
350 |
cttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
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cttagtcatacaagaataatcacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
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| T |
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aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
27102825 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
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| T |
27102824 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
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Target Start/End: Complemental strand, 27110367 - 27110131
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27110367 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27110269 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
27110173 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Original strand, 27175307 - 27175543
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27175307 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
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| T |
27175405 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
27175501 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38785111 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
38785014 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38785013 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
38784917 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38784916 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
38784875 |
T |
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Target: chr7; HSP #40
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2192169 |
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2192071 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
2192070 |
aaacatgcccatacaaaaataaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatcattcaacattaactatatcatatag |
2191971 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
2191970 |
cttcactattc |
2191960 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
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Target Start/End: Complemental strand, 13912582 - 13912378
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
13912582 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
13912485 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13912484 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacatttcaacataattatcaataatcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatagttt |
13912385 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
13912384 |
caccatt |
13912378 |
T |
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Target: chr7; HSP #42
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Target Start/End: Complemental strand, 16480408 - 16480200
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
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aaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagg |
16480311 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16480310 |
aaacatgcccatatacaattacatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
16480211 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
16480210 |
tttcaccattc |
16480200 |
T |
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Target: chr7; HSP #43
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273 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |
|
|
| T |
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tcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaactatcacatatagtttcaccaattcaaacatttctt |
39047943 |
T |
 |
| Q |
274 |
acattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcaca |
373 |
Q |
| |
|
|| || |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| |
|
|
| T |
39047942 |
actttataagtataatagcatacacatctcatgataaatatcatatccaaaacaatcattcattcatacaacttcacttagttatataaacatagccacc |
39047843 |
T |
 |
| Q |
374 |
accattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39047842 |
gcaattcttaagacaattggttcaag-aaacatttccgactaaaaattgtatcaagtgg |
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T |
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Target: chr7; HSP #44
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Target Start/End: Original strand, 16417436 - 16417580
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacacatctcatgataaacatcatattcaata |
16417535 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16417536 |
caatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
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T |
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Target: chr7; HSP #45
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7821615 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
7821712 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7821713 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-aatatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
7821809 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7821810 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
7821851 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
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Target Start/End: Original strand, 7828926 - 7829162
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7828926 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
7829023 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7829024 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-aatatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
7829120 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7829121 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
7829162 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
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Target Start/End: Original strand, 13273431 - 13273833
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13273431 |
acaaagactcgataatgcgacattacttcacaactttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaa |
13273530 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaac |
239 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| ||| || ||||| | ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13273531 |
gaaatcatgtccatacacaatcaattcataattcaaacaagattcattatcacaacaacaacatgatcatcaataatcaacaatgtaattcaacatcaac |
13273630 |
T |
 |
| Q |
240 |
tatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattca |
335 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
13273631 |
taactcatatagttttaccatttcaagcatttcttacattctaagtaagagaacatacaacatcccatgataaacatcatatccaacatataatcattca |
13273730 |
T |
 |
| Q |
336 |
ttcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13273731 |
ttcatacaactttacttagtcatataagaatagtcacgataattcataagcagattgacacaaaggaacattttcgac--aataccgtatcaagtggcaa |
13273828 |
T |
 |
| Q |
436 |
ccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
13273829 |
acggc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag- |
15926155 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15926156 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagcattcatcatcatcaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatata |
15926252 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcacca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
15926253 |
gtttcacca |
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T |
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Target: chr7; HSP #49
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
11514816 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcctcaacatt-gcattaccaagaaaa |
11514913 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11514914 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataattaacaatgtcaagcaacatcaactatatcatatagttt |
11515013 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
11515014 |
caccatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26010663 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
26010566 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| || || || || ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26010565 |
aaacatgtccacacacagttacatcaaagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatccacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
26010466 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
26010465 |
tttcaccattc |
26010455 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 240
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15525957 |
aaggactcgataatgcgacaacgattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
15525859 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact |
240 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| || ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15525858 |
aaacatgcacacacacaaatagatcatagtattcatcattcacataataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacatcaact |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
32495747 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatccaagcattccttacattctaagtaagataacatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
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T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgt |
423 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
32495647 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatcacaataactcacaagacaatttgctcaag-aaacatttccgacaaaaatccaa |
32495549 |
T |
 |
| Q |
424 |
atcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
32495548 |
atcatgtggcaaacggc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
15952280 |
atcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatattcaatacaaacatt |
15952181 |
T |
 |
| Q |
334 |
cattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |
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|
| T |
15952180 |
cattcatacaacttcgcttagtcatacaagaataatc |
15952144 |
T |
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Target: chr7; HSP #54
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Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13912305 - 13912155
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323 |
Q |
| |
|
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|
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cattaaacatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
13912206 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
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| T |
13912205 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatcacaa |
13912155 |
T |
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Target: chr7; HSP #55
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Target Start/End: Original strand, 7291825 - 7291966
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226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
7291825 |
cattcaacatcaactaacacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
7291924 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaa |
365 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
7291925 |
tacaatcattcattcatacaacttcacgtagtcatacaagaa |
7291966 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
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Target Start/End: Original strand, 15629459 - 15629860
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149 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
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acaaagactcgataatgcgacgtcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatttccacaacaattgtattatcaa |
15629558 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaac |
239 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| ||| || || || | ||||| | | | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
15629559 |
gaaatcatgtccatacacaatcaattcttaattcaaataagattcattaacttaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaac |
15629658 |
T |
 |
| Q |
240 |
tatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaataca-atcattcat |
336 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | | ||||||||| |
|
|
| T |
15629659 |
tatctcatatagttttatcatttcaagcatttcttacattctaagtaagagaacatacaacattccatgataaacattatattcaacatatatcattcat |
15629758 |
T |
 |
| Q |
337 |
tcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaac |
436 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15629759 |
tcataccacttcacttagtcatataagaatagtcacgataaatcataagtcggttgactcaaaggaacatttccgacc--ataccgtatcaagtggcaaa |
15629856 |
T |
 |
| Q |
437 |
cggc |
440 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
15629857 |
cggc |
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T |
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Target: chr7; HSP #57
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Target Start/End: Complemental strand, 15761839 - 15761634
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattt-ctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcctcatcatttgcattatcaagaaaa |
15761742 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
15761741 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaattttacccaacatcgactatcacatatagtt |
15761642 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
15761641 |
tcaccatt |
15761634 |
T |
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Target: chr7; HSP #58
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Target Start/End: Complemental strand, 49049277 - 49048942
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149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49049277 |
acaaagactcgataatgcgacatcaactcacaatttccaccacaatataaaggacaactttcaaatatgttgatcatctccaccacaattgcattatcaa |
49049178 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaac |
239 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| ||| || ||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49049177 |
gaaatcatgtctatacacaatcaagtcatatttcaaataagattcatcatcacatcatcaacatgatcatca-taattaacaatgtcattcaacatcaac |
49049079 |
T |
 |
| Q |
240 |
tatcacatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcataca-catttcatgataaacatcatatccaataca--atcattca |
335 |
Q |
| |
|
|| | |||| ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
49049078 |
tacctcatacagttttaccatttcaagcatttcttacattctaagtaagagaacatacaacatcccatgataaacatcatatccaacacataatcattca |
49048979 |
T |
 |
| Q |
336 |
ttcatacaacttcacttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
49048978 |
ttcatacaacttcacttagtcatataagaatagtcac |
49048942 |
T |
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Target: chr7; HSP #59
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Target Start/End: Original strand, 11515198 - 11515345
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225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--a |
322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
11515198 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacatatctcatgataaacatcgtatccaaa |
11515297 |
T |
 |
| Q |
323 |
atacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11515298 |
atataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
11515345 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
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Target Start/End: Complemental strand, 42057632 - 42057458
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| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
42057632 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
42057535 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42057534 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
42057458 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 226 - 440
Target Start/End: Original strand, 2027529 - 2027742
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccat-tcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaat |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
2027529 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccaactcaacatttctt-acattctaagtaaaatagtatacacatctcatgataatcatcatatctcat |
2027627 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgta |
424 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
2027628 |
acaatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttttgaccaaagaccgtg |
2027726 |
T |
 |
| Q |
425 |
tcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2027727 |
tcaagtggcaaacggc |
2027742 |
T |
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Target: chr7; HSP #62
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Target Start/End: Complemental strand, 7285510 - 7285361
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225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--a |
322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7285510 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcaagataaacatcatatccaaa |
7285411 |
T |
 |
| Q |
323 |
atacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
7285410 |
atataaccattcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcac |
7285361 |
T |
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Target: chr7; HSP #63
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag- |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
18255295 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatccccacaaca-ttacattatcaagc |
18255197 |
T |
 |
| Q |
151 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||| | |||||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
18255196 |
aaaacatgcccacatacaaatagattatagtattcatcattcacaccataacttgattatcaacaatcaacaaagacattcaacttcaattatcacttat |
18255097 |
T |
 |
| Q |
250 |
agtttca |
256 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
18255096 |
agtttca |
18255090 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13571525 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataagacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
13571622 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
232 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
13571623 |
catgcccaaacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaataatatcattcaa |
13571701 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
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Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
10862187 |
tcaccatcacatcatcaacataatcatcaaataatcaacaatatcattcaacatcaactat-tcatatagttttaccatttcaagtatttctcacattct |
10862089 |
T |
 |
| Q |
281 |
aagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaacca |
377 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||| | |||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| | |
|
|
| T |
10862088 |
aagtaagataacatacaacatctcatgacaaatatcatattcaaaatataaccattcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatag |
10861989 |
T |
 |
| Q |
378 |
ttcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10861988 |
atcataagataattgactcaaaggaacatttccga-caagtaccgtatcaagtggcaaacggc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
2436315 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
2436413 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca |
194 |
Q |
| |
|
||| ||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2436414 |
aaaaatgtccacacacaattaattcatagtattcatcatcaca |
2436456 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25293747 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
25293650 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca |
196 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25293649 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaca |
25293608 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
10988303 |
aaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaag- |
10988399 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattc |
230 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
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gaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaccaacaacttgattatcaacaatcaataatatcattc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
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Target Start/End: Complemental strand, 2191884 - 2191684
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaa |
286 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | | |||| |||||| |
|
|
| T |
2191884 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttgttccacatcaactatcacatatagtttcaccaattcaagcatt-atcatattccaagtaa |
2191786 |
T |
 |
| Q |
287 |
gatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcata |
383 |
Q |
| |
|
| | | || | || |||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
2191785 |
tagggaaaacaatatctcataataaatatcatatccaaaatataatcactcattcatacaacttcacttagtcataaaagaatggtcaccacaattcata |
2191686 |
T |
 |
| Q |
384 |
ag |
385 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
2191685 |
ag |
2191684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16480120 - 16480034
Alignment:
| Q |
234 |
atcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatat |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16480120 |
atcaactatcacatatagtttcaccattcgagcattccttacattctaagtaagataacatacaacatctcatgataaacatcatat |
16480034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7285603 - 7285504
Alignment:
| Q |
236 |
caactatcacatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7285603 |
caactatcacatatagtttcaccaatacaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatactcatctcatgat-aacatcatattcaatacaatcattc |
7285505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11582095 - 11582027
Alignment:
| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
11582095 |
tacacatttcatgataaacattatatccaatataatcattcattcatacaacttcacttagttatataa |
11582027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 11515092 - 11515138
Alignment:
| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattct |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11515092 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaaggattct |
11515138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15761558 - 15761509
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
237 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15761558 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
15761509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 362
Target Start/End: Original strand, 16210691 - 16210759
Alignment:
| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
16210691 |
tacacatctcatgataaatatcatatcccacataatcattcattcatacaacttcacttagttatataa |
16210759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 385
Target Start/End: Original strand, 3048688 - 3048751
Alignment:
| Q |
322 |
aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3048688 |
aatacaatcatttattcatacaacttcacttagtcatacaagaatggtcacaacaattcataag |
3048751 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13038350 - 13038299
Alignment:
| Q |
302 |
tcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13038350 |
tcatgataaacatcatatcccacataatcattcattcatacaacttcactta |
13038299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 9058076 - 9058007
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9058076 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
9058007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10862326 - 10862231
Alignment:
| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccac-aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
10862326 |
actcgataatgcgacatcacctcacaaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatacattgatcatctccacaacaattgcattaccaag |
10862231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15913874 - 15913817
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15913874 |
caatataaatgacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
15913817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 362
Target Start/End: Original strand, 3058966 - 3059026
Alignment:
| Q |
302 |
tcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
3058966 |
tcatgatagacatcatatcccacataatcattcgttcatacaacttcacttagttatataa |
3059026 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 440
Target Start/End: Original strand, 35093783 - 35093890
Alignment:
| Q |
332 |
ttcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtg |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| || |||| |||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35093783 |
ttcattcatacaacttcacttagttatataaacatagtcaccacaattcttaagacaattggttcaag-aaacgtttttgaccaaaaaccatatcaagtg |
35093881 |
T |
 |
| Q |
432 |
gcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| |||||| |
|
|
| T |
35093882 |
gccaccggc |
35093890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 153
Target Start/End: Original strand, 13376423 - 13376461
Alignment:
| Q |
115 |
tatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13376423 |
tatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
13376461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 79)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 55 - 438
Target Start/End: Original strand, 32897419 - 32897802
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32897419 |
gactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactctcaattttattgatcatctccacaacatttacattatcaagaaaa |
32897518 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
32897519 |
catgcccatacacaaataattcatggtattcatcatcacacattaatatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaattattacatttagttt |
32897618 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaa |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32897619 |
caccattcaaacatttcttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatataacttcacttag |
32897718 |
T |
 |
| Q |
355 |
tcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccg |
438 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32897719 |
tcatataagaataatcataaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccg |
32897802 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 48 - 436
Target Start/End: Original strand, 18431322 - 18431708
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18431322 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
18431421 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18431422 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
18431521 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
18431522 |
atagtttcaccattcaagcattccttacattccaagtaagatagcatacacatctcatgat-aacatcatatttaatgcaatcattctttcatacaacct |
18431620 |
T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaac |
436 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
18431621 |
cacttagtgatataagaatagtcacaataattcacaagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccataccaagtggcaac |
18431708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 48 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 25646302 - 25645918
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25646302 |
gtacaaggacttgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattttattgattatctccacaacatttgcattatc |
25646203 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25646202 |
aaggaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaataatgtcattcaacatcaattatcacat |
25646103 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25646102 |
atagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatgcacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
25646003 |
T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggc |
433 |
Q |
| |
|
|||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25646002 |
cacttagtaagataagaatggtcacaacaattcataagacaattggctaaag-aaacatttccgaccaaacaccatatcaagtggc |
25645918 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 18569280 - 18569660
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18569280 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
18569378 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18569379 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatag |
18569478 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcac-cattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18569479 |
tttcactaattcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatacacatctcatgataaatatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaacttc |
18569578 |
T |
 |
| Q |
349 |
acttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18569579 |
acttagtcatacaagaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaagatttccgacc-aaaaccatatcaagtgg |
18569660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 55 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19984671 - 19984298
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19984671 |
gactagataattcgacaacaatc-acaattt-ctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatttccacatcatttgcattatcaagaaaa |
19984574 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19984573 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaactatcacatttagttt |
19984474 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19984473 |
caccaattcaaacattccttacattcta-gtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
19984375 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagt |
430 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |
|
|
| T |
19984374 |
gtcatacaagaataatcacaaccattcataaggtaatttactcaagaaaacatctccgatcaaaacccatatcaagt |
19984298 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 52 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35017152 - 35016770
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35017053 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
35016954 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttca |
349 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||| |||| | | |||| |||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
35016953 |
gtttaaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaagataacatacatatctcatgataatcatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttca |
35016855 |
T |
 |
| Q |
350 |
cttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||| |||||||||| || |||| || |||| ||||||| |
|
|
| T |
35016854 |
cttagtcatataagaataatcacaataactcacaagacaattggctcaag-aaacatttccaacaaaaatccaaatcatgtggcaa |
35016770 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Original strand, 18775907 - 18776291
Alignment:
| Q |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
18776005 |
T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
18776006 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
18776103 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
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|||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
18776104 |
caccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatatacatctcatgataaatatcatatccagaatacaatcattcattcatacaacttcact |
18776203 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
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|| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18776204 |
tagtcataaaagaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccaaccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
18776291 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Original strand, 16105254 - 16105638
Alignment:
| Q |
55 |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataacgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaa-catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
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| T |
16105354 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcaccacacatcaatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactattacatatagtt |
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T |
 |
| Q |
254 |
tcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16105454 |
tcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcaagataaacatcatatccaatacaatcttcttttcgtacaacttcactta |
16105553 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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gtcatataaaaatgatcacaataactcataaaacaattggctcaag-aaacattttcgacc-aaatccatatcaagtggcaaacggc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 52 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18088182 - 18087846
Alignment:
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
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18088084 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa-catcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaatcatcaactatcacatata |
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T |
 |
| Q |
251 |
gtttcac-cattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
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|
| T |
18087983 |
gtttcacaaattcaaacattccttacatcttaagtaagatggcatacacctctcatgataattatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaactt |
18087884 |
T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |
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|
| T |
18087883 |
cacttagtcatacaagaatggtcacaacaattcataag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 18004448 - 18004234
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
18004349 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18004348 |
aagaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcat |
18004249 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
18004248 |
atagtttcaccattc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
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Target Start/End: Complemental strand, 1659182 - 1658915
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| Q |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1659083 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatggtcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
1658984 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatat |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1658983 |
gtttcaccattcaagcattccttgcattctaagtaagataccatacacatctcatgataaacatcatat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
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Target Start/End: Original strand, 23151956 - 23152318
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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23152054 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| | | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23152055 |
catgctcattcacaattgaatcatagtattcatcctcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagctc |
23152154 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23152155 |
caccaattcaaacatttcttacatcctaggtaagataacatgcacatctcatgataaatatcttatccaacacaatcattcattcatacaacttaactta |
23152254 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaa |
418 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| | ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
23152255 |
atcatacaagaatggtcacaataactcacaagacaattggctcaag-aaacatttccgacaaaaa |
23152318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 52 - 385
Target Start/End: Original strand, 23976263 - 23976595
Alignment:
| Q |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23976263 |
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23976361 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23976362 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcagcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatgatatag |
23976459 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| | | |||| |||||||| | ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23976460 |
tttcaccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatctcatgacaaatatcatatccaatacaatcattcattcatataacttc |
23976558 |
T |
 |
| Q |
349 |
acttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |
|
|
| T |
23976559 |
acttagccatataagaatagtcaccacaattcataag |
23976595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 48 - 264
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| Q |
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147 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15736656 |
gtacacggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
15736557 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15736556 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcat |
15736457 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaa |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15736456 |
atagtttcaccattcaa |
15736440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 55 - 432
Target Start/End: Original strand, 22430944 - 22431320
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| Q |
55 |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| || || ||| ||| |||||| ||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
22431043 |
catgtccacacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattctacatcaactttcatatatagtt |
22431142 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactt |
352 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tcaccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagataacatacgcatcttatgataagcatcataccccatacaatcattcaatcatacaacttcactt |
22431242 |
T |
 |
| Q |
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aatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||| || | || ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
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agtcatataaaaatagtctccacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgacc-aaaaccatatcaagtgg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 93 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 25745763 - 25745422
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||| | || | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
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aataaataggacaacacccaattatattgttcatctacacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatca |
25745664 |
T |
 |
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c-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcac-cattcaagtattctttacattctaagtaagata |
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Q |
| |
|
| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25745663 |
ccacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttttactaattcaagcatttcctacatcataagtaagata |
25745564 |
T |
 |
| Q |
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gcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaat |
390 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
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gcatacacatctcatgataaatatcatatcctacacaatcattcgttcatacaacttcacttagttatataaacgtagtcaccaccatttataagacaat |
25745464 |
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 |
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tgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggc |
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Q |
| |
|
|| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25745463 |
tggttcaag-aaacattttcgaccaaaaaccatatcaagtggc |
25745422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27655555 - 27655348
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27655555 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaacatt-gcattatcaaga |
27655457 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27655456 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
27655359 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
27655358 |
tttcaccattc |
27655348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16827346 - 16827138
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16827346 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgtattatcaaga |
16827248 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16827247 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
16827148 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
16827147 |
tttcaccatt |
16827138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Original strand, 4989591 - 4989797
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4989591 |
aaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
4989689 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4989690 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagcattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaactatcacatatag |
4989787 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
4989788 |
tttcaccatt |
4989797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 323
Target Start/End: Original strand, 16230278 - 16230546
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
16230278 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
16230375 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16230376 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagttt |
16230475 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| | | |||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16230476 |
caccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatttcatgacaaatatcatatccaa |
16230546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 226 - 440
Target Start/End: Original strand, 16230555 - 16230768
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16230555 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatcacatacatatctcatgataaacatcatatccaata |
16230654 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
16230655 |
caatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaccgtgt |
16230753 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
16230754 |
caagtggcaaacggc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33316050 - 33315844
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33316050 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
33315952 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
33315951 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatccacatgattatcaataatcaaccatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
33315854 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
33315853 |
tttcaccatt |
33315844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Original strand, 31627134 - 31627322
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31627134 |
gactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatataggacaatccccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
31627233 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatc |
243 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31627234 |
catgtccatacacaaacaaatcatagtattcatcaccacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatc |
31627322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1651420 - 1651148
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
1651420 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
1651323 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
1651322 |
aaacatgtccacacacaattatatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaactaccacatttag |
1651223 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatac |
326 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1651222 |
tttcaccacttcaaacattccttacattct-agtaagatagcatacacatctcatgatgaacatcatattcaatac |
1651148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 56 - 262
Target Start/End: Original strand, 25174253 - 25174455
Alignment:
| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25174253 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacactcaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
25174350 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25174351 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtttc |
25174448 |
T |
 |
| Q |
256 |
accattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
25174449 |
accattc |
25174455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 412
Target Start/End: Original strand, 18397622 - 18397982
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18397622 |
gactcgataatgcgacaacaatctacaattttcaccacaatatatagggcaactcccaattatattgattatccccacaacattttcattatcaagaaaa |
18397721 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| || ||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
18397722 |
catgtccatacacaatcaattcataatactcatcatcaccacatcaatatgatcatcaatactcaacaatgtcattcaacattcactatctcatgtagct |
18397821 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|| ||||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18397822 |
tccccatttcaacatgtctcacattctaagtaagataacatacacatctcatgat-atcatcatatcaatcatacaattattcattcatacaacttcact |
18397920 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgac-tcaagaaaacatttccga |
412 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18397921 |
tagtcatataagaatactcacgatacttcataagacaattgacttaaagaaaccatttccga |
18397982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 246
Target Start/End: Original strand, 11214836 - 11215026
Alignment:
| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11214836 |
actctataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
11214934 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11214935 |
atgcccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacaacaactatcaca |
11215026 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 225 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18824847 - 18824637
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| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaat |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18824847 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaat |
18824748 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactc-aagaaaacatttccgaccaaaaaccgt |
423 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18824747 |
acaatcattcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacaatagattataagaaaattggttcaaaggaaacatttccga-caaaaaccgt |
18824649 |
T |
 |
| Q |
424 |
atcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
18824648 |
atcaagtggcaa |
18824637 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 161 - 417
Target Start/End: Original strand, 16084882 - 16085136
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161 |
catacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaa-catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
259 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16084882 |
catacacaattaaatcgtagtattcatcaccacacatcaatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactattacatatagtttcaccc |
16084981 |
T |
 |
| Q |
260 |
ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcata |
359 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
16084982 |
ttcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcaagataaacatcatatccaatacaatcttctattcatacaact--acttagtcata |
16085079 |
T |
 |
| Q |
360 |
taagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaa |
417 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16085080 |
taaaaatgatcacaagaactcataaaacaattggctcaag-aaacattttcgaccaaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 256
Target Start/End: Original strand, 16239057 - 16239262
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52 |
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150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16239057 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacaccaaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaag |
16239155 |
T |
 |
| Q |
151 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccat-cacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16239156 |
aaaacatgcccacacacaaatagatcatcgtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaataatgtcattcaacatcaactatcacatat |
16239255 |
T |
 |
| Q |
250 |
agtttca |
256 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
16239256 |
agtttca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Original strand, 25174527 - 25174671
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25174527 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatattcaata |
25174626 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25174627 |
caatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
25174671 |
T |
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Target: chr6; HSP #32
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225 |
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324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4989869 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaat |
4989968 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactc-aagaaaacatttccgaccaaaaaccgt |
423 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| | | ||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
4989969 |
acaatcattcattcaaacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagattataagaaaattggttcaaaggaaacatttccga-caaaaaccgt |
4990067 |
T |
 |
| Q |
424 |
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435 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
4990068 |
atcaagtggcaa |
4990079 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 10487573 - 10487809
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
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10487573 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
10487670 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10487671 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
10487767 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10487768 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
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T |
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Target: chr6; HSP #34
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147 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtacacggactcgataatgcaaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaactcccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
13622490 |
T |
 |
| Q |
148 |
aag-aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
13622489 |
aagaaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcaccacacattatcatgattattactaatcaacaacatcattcaacattaactatatca |
13622390 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
13622389 |
tatagtttcaccattc |
13622374 |
T |
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Target: chr6; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16377754 - 16377518
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16377754 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16377657 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16377656 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
16377560 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16377559 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
16377518 |
T |
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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16385078 - 16384842
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16385078 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16384981 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16384980 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
16384884 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16384883 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
16384842 |
T |
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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14628079 - 14627871
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
14628079 |
aaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagg |
14627982 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14627981 |
aaacatgcccatacacaattacatcataacattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
14627882 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
14627881 |
tttcaccattc |
14627871 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 13016260 - 13015910
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48 |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13016260 |
gtacaaggactcgataatgcgactacaatccataattttcacctcaatatataggtctatatccaattatattgattacctccacaaca-ttgcattatc |
13016162 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaac-aatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||| || | ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |||| |
|
|
| T |
13016161 |
aagaaaacatgcccatacacaattaattcatagtattcatcatctcatgtcaacatgattctcaa-aatcaacaaatgtcactcaacatcaattaccaca |
13016063 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaac |
345 |
Q |
| |
|
| | |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13016062 |
tgtggtttcaccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatactcat------------------cccaatacaatcattcattcatacaac |
13015981 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaa |
418 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13015980 |
ttcacttagtcatataggaat-atcataacaattcataagacaattggtttaag-aaacatttccgaccaaaa |
13015910 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
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Target Start/End: Original strand, 15861425 - 15861642
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15861425 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattt-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaggaaa |
15861521 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgt--cattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15861522 |
catgctcacacacaaataaatcatagtattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaacaatcaacaatgttatattcaacatcaactatcacatatag |
15861621 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattct |
271 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
15861622 |
tttcaccagttcaagcattct |
15861642 |
T |
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Target: chr6; HSP #40
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Target Start/End: Complemental strand, 27655287 - 27655147
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caacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaat |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27655287 |
caacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatattcaatacaat |
27655188 |
T |
 |
| Q |
330 |
cattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27655187 |
cattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
27655147 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 225 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18840702 - 18840555
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| Q |
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tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaat |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18840702 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaat |
18840603 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
18840602 |
acaatcattcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcac |
18840555 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 56 - 261
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18825128 |
atgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
18825029 |
T |
 |
| Q |
256 |
accatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
18825028 |
accatt |
18825023 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 56 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18843286 - 18843083
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| || | || |||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18843286 |
actcgataatgcgacgacaaac-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattataatgttcatctccacatcatt-gcattatcaagaaaac |
18843189 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18843188 |
atgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaaaaatcaacaattttattcaacatcaactatcacatatagtttc |
18843089 |
T |
 |
| Q |
256 |
accatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
18843088 |
accatt |
18843083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 231 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33315767 - 33315628
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aacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatc |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33315767 |
aacatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatattcaatacaatc |
33315668 |
T |
 |
| Q |
331 |
attcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33315667 |
attcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
33315628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacaacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcat |
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T |
 |
| Q |
333 |
tcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |
|
|
| T |
18004054 |
tcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcataag |
18004002 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15736362 - 15736160
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15736362 |
atcaactatcacatatagttttaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacaacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcat |
15736263 |
T |
 |
| Q |
333 |
tcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||| || |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15736262 |
tcattcatacaactttacttagttatataaacatagccaccacaattcttaagacaattggttcaaaaaaacatttccgactaaaagccgtatcaagtgg |
15736163 |
T |
 |
| Q |
433 |
caa |
435 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
15736162 |
caa |
15736160 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 226 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13622302 - 13622160
Alignment:
| Q |
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13622302 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaaaa |
13622203 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
13622202 |
tacagtcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaat |
13622160 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
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Query Start/End: Original strand, 225 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18824951 - 18824841
Alignment:
| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaat |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18824951 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaat |
18824852 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattca |
335 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
18824851 |
acaatcattca |
18824841 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 225 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18840806 - 18840696
Alignment:
| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaat |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18840806 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaat |
18840707 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattca |
335 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
18840706 |
acaatcattca |
18840696 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Original strand, 18128981 - 18129129
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18128981 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaggaaa |
18129079 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatg |
204 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18129080 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatg |
18129129 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17343754 - 17343578
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| Q |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17343754 |
aaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagc |
17343656 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17343655 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
17343578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Original strand, 1554536 - 1554741
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1554536 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattt-ctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccgcatcatttgcattatcaagaaaa |
1554633 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1554634 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaattttacccaacatcgactatcacatatagtt |
1554733 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
1554734 |
tcaccatt |
1554741 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16557483 - 16557301
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16557483 |
aaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaagtatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16557386 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16557385 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
16557301 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16650713 - 16650531
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16650713 |
aaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaagtatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16650616 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16650615 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
16650531 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 226 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16827065 - 16826872
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16827065 |
cattcaaaatcaactatcacatatagtttcaccatccaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
16826966 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaa |
418 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16826965 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatggtcacaataactcataagacaattggctaaag-aaacatttccgacaaaaa |
16826872 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 226 - 440
Target Start/End: Original strand, 18582151 - 18582367
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--a |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
18582151 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaca |
18582250 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaaga-aaacatttccgaccaaaaaccg |
422 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18582251 |
tataaccattcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatcataagaaaattggttcaaaagaaacttttccga-caaaaacca |
18582349 |
T |
 |
| Q |
423 |
tatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18582350 |
tatcaagtggcaaacggc |
18582367 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29870943 - 29870760
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29870943 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaag |
29870846 |
T |
 |
| Q |
151 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29870845 |
aaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
29870760 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
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Query Start/End: Original strand, 55 - 238
Target Start/End: Original strand, 26088532 - 26088713
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
26088532 |
gactcgataatgcaacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaag |
26088629 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26088630 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
26088713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28196255 - 28195924
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| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
28196255 |
acaaagactcgataatgcgacaacactccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaccaattgcattatcaa |
28196156 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagt---attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcac |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| ||| || | ||| | | | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
28196155 |
gaaatcatgtccatacacaatcaagttataattcaaataagaatcacatcatcaacatgattatcaataatcaacaatattattcaacctcaactacttc |
28196056 |
T |
 |
| Q |
246 |
atatagtttcacca--ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcat |
340 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
28196055 |
atatagttttaccattttcaagcatttcttacatcctaagtaagagatcatacaacaacccatgataaacatcatgtccaatatataatcaattattcat |
28195956 |
T |
 |
| Q |
341 |
acaacttcacttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28195955 |
acaacctcacttagtcatataagaatagtcac |
28195924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #60
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Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25368827 - 25368428
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaa-ttttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25368827 |
gactcgataatgcgacatcactccacaaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaa |
25368728 |
T |
 |
| Q |
154 |
acatgctcat--acg--caa---ataactca--tagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatc |
243 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||| ||| |||| ||| || ||||| |||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
25368727 |
tcacgtccatgcacgatcaagtcataattcaaataagattcatcatcacttcatcaacatgatcattaataatcaacaatatcattcaacataaactacc |
25368628 |
T |
 |
| Q |
244 |
acatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcataca-catttcatgataaacatcatatccaa--tacaatcattcattca |
339 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||| ||| | || || ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |
|
|
| T |
25368627 |
tcatatagttttaccatttcaagcatttctcaccttttaagtaagagagcatacaacatcacatgataaacatcatatccgacatataatcattcattca |
25368528 |
T |
 |
| Q |
340 |
tacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccgg |
439 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| | |||| | | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
25368527 |
tacaacttcacttagtcatataagaacagtcacgataaatcataagtcgattgactcaaaggaacatttccga-taaataccgtatcaagtggcaaacgg |
25368429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #61
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Target Start/End: Complemental strand, 14627791 - 14627658
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234 |
atcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcataca-catttcatgataaacatcatatccaatacaatcat |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
14627791 |
atcaactatcacatatagtttcaccattcaagcatttcttacattctaagtaagataacatacaacatctcatgataaacgtcatatccaatacaattat |
14627692 |
T |
 |
| Q |
333 |
tcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
14627691 |
tcattcatacaacttcacttagtcatacaagaat |
14627658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 23993858 - 23994032
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
23993858 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
23993955 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23993956 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
23994032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 418
Target Start/End: Original strand, 19628302 - 19628490
Alignment:
| Q |
227 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aat |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
19628302 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatattcaaaat |
19628401 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaa |
418 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| | | ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19628402 |
ataatcactcatt----caacttcgcttagtcatataagaatagtcaccataaatcataagacaaatgactcaa-aaaacatttccgacaaaaa |
19628490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 367
Target Start/End: Original strand, 22866864 - 22867166
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22866864 |
gactcaataatgcgaaatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaataaattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
22866963 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || | ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22866964 |
catgtccatacacaatcaaatgataagattcattatcaccacatcaacatgattatcaaaaa-------------tcaacatttactatctcatatagtt |
22867050 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22867051 |
tcatcattcaaacattctttacgttctaaataagagaacatgcacatctcatgatattcattatatccaacatacaatcatttattcatacaacttcact |
22867150 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaata |
367 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22867151 |
tagtcatataaaaata |
22867166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22227111 - 22226926
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22227111 |
aaggactcgaaaatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
22227013 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22227012 |
aaacatatccacacacaaataaatcaaagtactcatcatcacacgtcaacatatttatcagtaatcaacaatgtcatccaacatcaa |
22226926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Original strand, 19609191 - 19609310
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19609191 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
19609288 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataa |
173 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
19609289 |
aaacatgcccatacacaaataa |
19609310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 318
Target Start/End: Original strand, 19609350 - 19609442
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcata |
318 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19609350 |
cattaaacatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcata |
19609442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 158
Target Start/End: Original strand, 16084112 - 16084215
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16084112 |
gactcgataatgcgaaaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16084211 |
T |
 |
| Q |
155 |
catg |
158 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
16084212 |
catg |
16084215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 276 - 385
Target Start/End: Original strand, 26088782 - 26088893
Alignment:
| Q |
276 |
attctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa--tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcaca |
373 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
26088782 |
attccaagtaagatagcatacacttctcatgataattatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatggtcaca |
26088881 |
T |
 |
| Q |
374 |
accattcataag |
385 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |
|
|
| T |
26088882 |
acaattcataag |
26088893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 241 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21776870 - 21776791
Alignment:
| Q |
241 |
atcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatat |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21776870 |
atcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacaacatctcatgataaacatcatat |
21776791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Original strand, 15738945 - 15739043
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15738945 |
gactcgataatgcgacatcacttcacaatttttaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaagaaa |
15739043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 25903975 - 25904033
Alignment:
| Q |
312 |
catcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25903975 |
catcatattcaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
25904033 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16301178 - 16301107
Alignment:
| Q |
235 |
tcaactatcacatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcat |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
16301178 |
tcaactatcacatatagtttcaccaatacaagcattccttacattctaagtaagataacatacacatctcat |
16301107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Original strand, 1554817 - 1554866
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
237 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1554817 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
1554866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 113
Target Start/End: Original strand, 18741146 - 18741203
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaa |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18741146 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaa |
18741203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16889183 - 16889122
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16889183 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaa |
16889122 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 33323532 - 33323605
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33323532 |
caattttcacaacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa |
33323605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35137399 - 35137326
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35137399 |
caattttcacaacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa |
35137326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 150
Target Start/End: Original strand, 22846867 - 22846923
Alignment:
| Q |
94 |
atatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
22846867 |
atataaaggataacttccaaatatattgattatctccacaacaattgaattatcaag |
22846923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 48 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 256384 - 256001
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
256384 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacattt-cattatc |
256286 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaa-tgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
256285 |
aagaaaacatgctcatacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaaatgtcattcaacttcaactatcaca |
256186 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
256185 |
tatagtttcaccattcaagcattccttacatcctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
256086 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
256085 |
taacttagtcatataaaaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtgg |
256001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 63 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 262975 - 262607
Alignment:
| Q |
63 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctca |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
262975 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgctca |
262877 |
T |
 |
| Q |
163 |
tacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaa-tgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
262876 |
tacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaaatgtcattcaacttcaactatcacatatagtttcaccatt |
262777 |
T |
 |
| Q |
262 |
caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatata |
361 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
262776 |
caagcattccttacatcctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttaacttagtcatata |
262677 |
T |
 |
| Q |
362 |
agaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
262676 |
aaaatggtcacaacaattcataagactattggttcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtgg |
262607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 52 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 124762 - 124454
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
124762 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
124665 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
124664 |
aaacatgcccacacccaattaaatcatagtattcatcatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaaaatcattcaacatcaactatcacatatag |
124565 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttca-ccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
124564 |
tttcacccattcaa-catttcttacattctaagtaagatagcataccaatctcatgataaatatcatatccaaaataatcatccattcatacatcttcac |
124466 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||| | |||||| |
|
|
| T |
124465 |
ttagttatataa |
124454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 52 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 76163 - 75855
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
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251 |
Q |
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350 |
Q |
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T |
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T |
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251 |
Q |
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| T |
193401 |
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193500 |
T |
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252 |
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Q |
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T |
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T |
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Name: scaffold0001
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Target: scaffold0001; HSP #1
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T |
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Q |
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T |
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354 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Target: scaffold0480 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
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Q |
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T |
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246 |
Q |
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| Q |
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346 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
347 |
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432 |
Q |
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T |
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Target: scaffold0037 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
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Q |
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T |
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| Q |
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aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
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26101 |
aagaaaacatgtctatacacagataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctcat |
26002 |
T |
 |
| Q |
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346 |
Q |
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| T |
26001 |
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25902 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
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Q |
| |
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tcacttagtcatataagaatagtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
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T |
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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247 |
Q |
| |
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| T |
70773 |
aagaaatcatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
70674 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
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| T |
70673 |
atagtttcaccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagatagtgtacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcaatcatacaact |
70574 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
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70573 |
tcacttagtcatataagaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaag-atacattctcgaccaaaaaccgtgtcaagtggcaa |
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Target: scaffold0037; HSP #3
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T |
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| Q |
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Q |
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acacacatctcatgataatcatcatatctcatacaatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaata |
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T |
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T |
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248 |
Q |
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348 |
Q |
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T |
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440 |
Q |
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Q |
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T |
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| Q |
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242 |
Q |
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| T |
16183389 |
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T |
 |
| Q |
243 |
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342 |
Q |
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| T |
16183289 |
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T |
 |
| Q |
343 |
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Q |
| |
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
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T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
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50113407 |
atagtttcaccattcaagcattctttatattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatataatcattcattcatacaactt |
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T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
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Q |
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50113307 |
cacttagttatataaacatggtcaccacaattcttaagacaattggttcaag-aaacatttccgaccaaaa--cgtgtcaagtggcaaacggc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
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Query Start/End: Original strand, 55 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22145740 - 22145362
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Q |
| |
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22145740 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
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22145642 |
catgcccctacaccattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
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caccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaa |
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22145542 |
catcatccaagcattccttacatcttaagtaagatagcatacacatatcatgataaatatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttaacttag |
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T |
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| Q |
355 |
tcatat-aagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| |||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
22145442 |
tcatataaaaaatggtcacgacaattcataagacaattgactcaag-aaacatttccgaccaagaactatgtcaagtggcaa |
22145362 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
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Target Start/End: Original strand, 17099397 - 17099789
Alignment:
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtacaaggactcgataatgcgtcagcaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
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T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| || | ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
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| T |
17099497 |
aagaaaacatgtccataaacaatcaaattataagattcatcatcactacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctca |
17099596 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaac |
345 |
Q |
| |
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|
|
| T |
17099597 |
tatagtttcaccatttcaagcatttcttacattctaagcaagattgcatacacattacatgataa-catcatatccaatacaatcattcattcatacaac |
17099695 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgac-tcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | || || |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17099696 |
ttcacttagtcatataagagtaatcacaacaatttataaggtaattgacttgaaagaaccatttccgac--aataccgtatcaagtggcaaacggc |
17099789 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 52 - 362
Target Start/End: Original strand, 13816200 - 13816511
Alignment:
| Q |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattctcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
13816299 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaacatgcccacacacaattgaatcatagcattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
13816399 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttcaccaattcaaacatttcttacattctaagtaagatagcttacacatctcatgataaatatcatatccaaaacaatcattcattcatacaacttcac |
13816499 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||| | |||||| |
|
|
| T |
13816500 |
ttacttatataa |
13816511 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 52 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19572242 - 19571932
Alignment:
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgtgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| | | |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19572142 |
aaacatggccacacacaattgaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaacta-cacatatag |
19572044 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19572043 |
tttcaccaattcaaacatttcttacattctaagtaagatagcttacacatctcatgataaatatcatatccaaaacaatcattcattcatacaacttcac |
19571944 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||| | |||||| |
|
|
| T |
19571943 |
ttagttatataa |
19571932 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 319081 - 318695
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
319081 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggataacacccaattatattgttcatttccacatcatttgcattatcaagaaaa |
318983 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactat-cacatatagt |
252 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | | ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
318982 |
catgcccatacacgattaaatcataacattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactattcacatatagt |
318883 |
T |
 |
| Q |
253 |
ttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
318882 |
ttcaccaattcaagcatttcttacaccttaagtaagatagcatacacatctgatgataaatatcatatccaacacaatcattcattcatacaacttcact |
318783 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
318782 |
tagtcatataagaatagtcaccacaatttataagacaattggttcaag-aaacatttttgaccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
318695 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Original strand, 35122377 - 35122763
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35122377 |
gactcgataatgcgacaacaattcataattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
35122476 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
35122477 |
catgtccatacacaaccaaatcatagaattcatcatcacacatcaacatgattgtcaataatcaacaatgtcattcaacatcatttatctcatatggttt |
35122576 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
35122577 |
caccatttcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacaactcatgataaccatcatatccaaaatacaagcattcatttatacaatttcact |
35122676 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
35122677 |
tagtcatacaagaatgatcacaataactcataagacgattggctcaag-aaacatttccgacc-aaaaccgtatcaagtggcaaacggc |
35122763 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 52 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15860617 - 15860308
Alignment:
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15860519 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15860518 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtatttatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaactatcacatatag |
15860419 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15860418 |
cttcaccaattcaa-catttcttacattctaagtaagatagcatacacatcttatgataaatatcatatccaaaacaatcattcattcatacaacttcac |
15860320 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||| | |||||| |
|
|
| T |
15860319 |
ttagttatataa |
15860308 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Original strand, 8630538 - 8630920
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| Q |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8630538 |
gactcgataatgcaacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaga |
8630636 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8630637 |
catgcacatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaaagtcattcaacgtcaattatcacatatagttt |
8630736 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaa |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8630737 |
caccattcaaacattccttacattccgaacaagatagcatacacatctcatgat-aatatcatgcctcaaacaatcattcattcatacaacttcacttag |
8630835 |
T |
 |
| Q |
355 |
tcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8630836 |
tcatataagaatagtcaccacaattcataagacaattggttcaag-aaacattttcaaccaaagaccgtgtcaagtggcaaacggc |
8630920 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 56 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15469931 - 15469552
Alignment:
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155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |
|
|
| T |
15469931 |
actcgataatgcgacaataatc-acaattt-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaggaa-c |
15469836 |
T |
 |
| Q |
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atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15469835 |
atgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaactatcacatttagtttc |
15469736 |
T |
 |
| Q |
256 |
acc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaa |
354 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15469735 |
accaattcaaacattccttacattct-agtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatctttcattcatacaacttcacttag |
15469637 |
T |
 |
| Q |
355 |
tcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||| | |||| |||||| | ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
15469636 |
tcatacaggaatggtcacaataactcacaagacaattggttcaag-aaacatttccgacaaaaatccaaatcatgtggcaaacggc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 55 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 53899989 - 53899605
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53899989 |
gactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacattatataggacaactcccaattatattgatcatctccaccacatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
53899889 |
catgtccatatacaaccaa-tcatagaattcatcatcacacatcaacataattatcaataatcaacaatatcattcaacatcatttatctcatatggttt |
53899791 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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caccattccaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacaactcatgataaacatcatatccaaaatacaagtattcatttatacaacttcact |
53899691 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccg |
438 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 50 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 11199045 - 11198653
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Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
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gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctcata |
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T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaac |
345 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tagttttaccatttcaaacatttcttacattctaagtaagagaacatacacatctcatgatattcatcatatccaacatacaatcattcattcatacaac |
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T |
 |
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346 |
ttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccgg |
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||| | | || |||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ctcacttagtcatataagaatagtcacgataaatcttaagacaattgacttaag-gaacatttctgactaaaaaccgtatcaagtggcaaccgg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 92 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 47786314 - 47786041
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatc |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
47786314 |
caatatataggacaactcccaattatattgatcatctccaccacattttcattatcaagaaagcatgtccatacacaatcaaatcataggattcatcatc |
47786215 |
T |
 |
| Q |
192 |
acacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattct-ttacattctaagtaagat |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47786214 |
acacatcaacatgattatcaataatcaacattgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatttcaagcattctcttacattctaagtaagat |
47786115 |
T |
 |
| Q |
290 |
agcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataag |
363 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
47786114 |
agcatacacgtctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtaatataag |
47786041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 55 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12351312 - 12350934
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12351312 |
gactcgataattcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
12351214 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| | || ||| ||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12351213 |
catgtccgcacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacaacaacatgatcatcaataatcaacaatgttattccacatcaactatcacatatagtt |
12351114 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactt |
352 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12351113 |
tcaccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatacacatctcatgataagcatcatattttatacaatcattcaatcatacaacttcactt |
12351014 |
T |
 |
| Q |
353 |
aatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccga-ccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| || | || ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
12351013 |
agtcatataagaatagtctctacaattcataagacaattggctcaag-aaacatatccgacccaaaaaccatatcgagtgg |
12350934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 370
Target Start/End: Original strand, 25057531 - 25057856
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25057531 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacaacatttgcattatc |
25057629 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa-catcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25057630 |
aagaaaacatgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaatatgattatcaataatcaacaatgtcatccaatcatcaactatcaca |
25057729 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcac-cattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcataca |
343 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25057730 |
tatagtttcgcaaattcaaacattctttacatcttaagtaagatagcatacacttatcatgataattatcatatccaaaatacaatcattcattcataca |
25057829 |
T |
 |
| Q |
344 |
acttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25057830 |
acttcccttagtcatacaagaataatc |
25057856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 60 - 385
Target Start/End: Original strand, 23491202 - 23491530
Alignment:
| Q |
60 |
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159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23491202 |
gataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggaaaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgc |
23491300 |
T |
 |
| Q |
160 |
tcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa-catcaactatcacatatagtttcac- |
257 |
Q |
| |
|
||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23491301 |
ccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacgtgattatcaataatcaacgatgtcattcaatcatcaactatcacatatagtttcaca |
23491400 |
T |
 |
| Q |
258 |
cattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcacttaat |
355 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23491401 |
aattcaaacattccttacatcttaagtaagatagcatacacttctcatgataattatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaacttcacttagt |
23491500 |
T |
 |
| Q |
356 |
catataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23491501 |
catataagaatgatcacaacaattcataag |
23491530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Original strand, 14297188 - 14297574
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14297188 |
gactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
14297287 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| || ||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |
|
|
| T |
14297288 |
catgtccatactcaatcaaatcataatactcattatcaccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcatttatctcatatggtt |
14297387 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc-aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14297388 |
tcaccatttcaatcattccttacattctaagtaagatagcatacacaactcatgataagaatcatatccaaataatatcattcattcatacaacttca-t |
14297486 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |
|
|
| T |
14297487 |
tagtcatataagaatagccacgataagtcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccataccaagtggcaaacggc |
14297574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Original strand, 14302815 - 14303201
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14302815 |
gactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
14302914 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| || ||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |
|
|
| T |
14302915 |
catgtccatactcaatcaaatcataatactcattatcaccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcatttatctcatatggtt |
14303014 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc-aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14303015 |
tcaccatttcaatcattccttacattctaagtaagatagcatacacaactcatgataagaatcatatccaaataatatcattcattcatacaacttca-t |
14303113 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |
|
|
| T |
14303114 |
tagtcatataagaatagccacgataagtcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccataccaagtggcaaacggc |
14303201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 367
Target Start/End: Original strand, 14294114 - 14294434
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14294114 |
acaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatacaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
14294213 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
14294214 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctcata |
14294313 |
T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaac |
345 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14294314 |
tagttttaccatttcaagcattc-ttacattctaagtaagagaacatacacatctcatgatattcatcatatccaacatacaatcattccttcatacaac |
14294412 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcacttaatcatataagaata |
367 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14294413 |
ttcacttagtcatataagaata |
14294434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11062504 - 11062184
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11062504 |
gactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa-aaaa |
11062406 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11062405 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagcc |
11062306 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
|
| |||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11062305 |
ttaccatttcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacattatatccataatacaatcattcattcatacaacttcac |
11062206 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
11062205 |
ttagtcatatgagaatagtcac |
11062184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 367
Target Start/End: Original strand, 14299741 - 14300061
Alignment:
| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14299741 |
acaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatacaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
14299840 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
14299841 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctcata |
14299940 |
T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaac |
345 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14299941 |
tagttttaccatttcaagcattc-ttacattctaagtaagagaacatacacatctcatgatattcatcatatccaacatacaatcattccttcatacaac |
14300039 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcacttaatcatataagaata |
367 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14300040 |
ttcacttagtcatataagaata |
14300061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 367
Target Start/End: Original strand, 40938421 - 40938736
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40938421 |
gactcgataatgcgacaccaatttacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccataacatttgcattatcaagaaaa |
40938520 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40938521 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacttgatcatcaacaatcaacaatgtcattcaacatttactatctcatatagtt |
40938620 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40938621 |
tcaccattcaagcattctttacattataagtaagagaacatacacatctcatgatattcactatatccaacatacaatcatccattcatacaacttcact |
40938720 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaata |
367 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40938721 |
tagtcatataagaata |
40938736 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12562944 - 12562563
Alignment:
| Q |
58 |
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156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12562944 |
tcgataatgcgacaacacttcacaaattttcaccacaatatagaggaaaaattccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaaaca |
12562845 |
T |
 |
| Q |
157 |
tgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
12562844 |
tgtccgtacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactacctcatatagtttt |
12562745 |
T |
 |
| Q |
256 |
acc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaacttcactt |
352 |
Q |
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| T |
12562744 |
accaattcaagcattccttacattctaagtaagagaacatacacatctcaagataaatatcatatccaacatacaatcattcattcatacaacttcactt |
12562645 |
T |
 |
| Q |
353 |
aatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
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| |||||||||||| |||| | | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
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| T |
12562644 |
agtcatataagaatggtcacgatagaacgtaagacaattgactcaag-gaacatttccgcccaaaaaccgtaccaagtggcaa |
12562563 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Original strand, 16819597 - 16819802
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151 |
Q |
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||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
152 |
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251 |
Q |
| |
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| T |
16819695 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
16819792 |
T |
 |
| Q |
252 |
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261 |
Q |
| |
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|||||||||| |
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tttcaccatt |
16819802 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 55 - 262
Target Start/End: Original strand, 33340534 - 33340740
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154 |
Q |
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| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
155 |
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254 |
Q |
| |
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| T |
33340633 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
33340732 |
T |
 |
| Q |
255 |
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262 |
Q |
| |
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| T |
33340733 |
caccattc |
33340740 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 52 - 323
Target Start/End: Original strand, 18909378 - 18909647
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151 |
Q |
| |
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| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18909475 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
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| T |
18909476 |
aaacatccacacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
18909573 |
T |
 |
| Q |
252 |
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323 |
Q |
| |
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| T |
18909574 |
tttcaccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatttcatgacaaatatcatatccaa |
18909647 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 326
Target Start/End: Original strand, 15574730 - 15575002
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151 |
Q |
| |
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|
| T |
15574730 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
15574827 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
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| T |
15574828 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaactaccacatttag |
15574927 |
T |
 |
| Q |
252 |
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326 |
Q |
| |
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|
| T |
15574928 |
tttcaccacttcaaacattccttacattct-agtaagatagcatacacatctcatgatgaacatcatattcaatac |
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T |
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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 435
Target Start/End: Original strand, 19945317 - 19945700
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154 |
Q |
| |
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|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
19945415 |
T |
 |
| Q |
155 |
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253 |
Q |
| |
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| T |
19945416 |
catgctcatacacaattaaatcatatcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagtt |
19945515 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaacttca |
349 |
Q |
| |
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| T |
19945516 |
tcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaacgatatctcatgataaacatcatatcaaacatataaccattcattcacacatcttca |
19945614 |
T |
 |
| Q |
350 |
cttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactc-aagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19945615 |
cttagtcatataaggatagtcacgatagatcataagaaaattggttcaaaggaaacatttccga-caaaaaccgtatcaagtggcaa |
19945700 |
T |
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Target: chr3; HSP #31
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Target Start/End: Complemental strand, 17957802 - 17957533
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatgtccacatcatttgcattatcaagaaaa |
17957704 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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catgtccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgacattcaacatcaactatatcatatagttt |
17957604 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
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|||||||| || |||| | | |||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |
|
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| T |
17957603 |
caccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatctcatgataaatatcatatccaa |
17957533 |
T |
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Target: chr3; HSP #32
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Target Start/End: Complemental strand, 51159945 - 51159742
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Q |
| |
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||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
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gactcgataatgcgacaccaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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catgtccatacacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
51159747 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca |
259 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
51159746 |
cacca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 323
Target Start/End: Original strand, 53769350 - 53769618
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
53769350 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
53769447 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
53769448 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagttt |
53769547 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| | | |||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
53769548 |
caccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatttcatgacaaatatcatatccaa |
53769618 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
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Target Start/End: Original strand, 15613749 - 15614021
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
15613749 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattaatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
15613846 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
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|
| T |
15613847 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaactaccacatttag |
15613946 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatac |
326 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15613947 |
tttcaccacttcaaacattccttacattct-agtaagatagcatacacatctcatgatgaacatcatattcaatac |
15614021 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
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Q |
| |
|
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|
| T |
22273737 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
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T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22273835 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtttc |
22273932 |
T |
 |
| Q |
256 |
accattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
22273933 |
accattc |
22273939 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8269772 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatag |
8269675 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8276981 - 8276784
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8276981 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
8276884 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8276883 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatag |
8276786 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
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Target Start/End: Original strand, 18909656 - 18909869
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18909656 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatcacatacatatctcatgataaacatcatatccaata |
18909755 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
18909756 |
caatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaccgtgt |
18909854 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
18909855 |
caagtggcaaacggc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
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Query Start/End: Original strand, 226 - 440
Target Start/End: Original strand, 53769627 - 53769840
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226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
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Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
53769627 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatcacatacatatctcatgataaacatcatatccaata |
53769726 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
53769727 |
caatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaccgtgt |
53769825 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
53769826 |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 2048751 - 2048953
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
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2048751 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
2048849 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2048850 |
catgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
2048949 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcac |
257 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
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2048950 |
tcac |
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T |
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Target: chr3; HSP #41
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Target Start/End: Original strand, 19230751 - 19230953
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55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
19230849 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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19230949 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc |
258 |
Q |
| |
|
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|
|
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19230950 |
cacc |
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T |
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Target: chr3; HSP #42
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2450791 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
2450694 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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atgcccacac--aaataaatcatagtattc-ccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtttc |
2450597 |
T |
 |
| Q |
256 |
accattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
2450596 |
accattc |
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T |
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Target: chr3; HSP #43
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Target Start/End: Original strand, 49230901 - 49231102
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
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49230999 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaactgtcacatata |
49231099 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtt |
253 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
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49231100 |
gtt |
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Target: chr3; HSP #44
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325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatattcaata |
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T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22274111 |
caatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
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T |
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Target: chr3; HSP #45
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1469121 |
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1469024 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1469023 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
1468927 |
T |
 |
| Q |
252 |
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293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1468926 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
1468885 |
T |
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Target: chr3; HSP #46
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7852499 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttacattatcaagaaaa |
7852597 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7852598 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcctcatcacacatcaacataattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagttt |
7852697 |
T |
 |
| Q |
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caccattc |
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Q |
| |
|
||| |||| |
|
|
| T |
7852698 |
cactattc |
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T |
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325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2450518 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacccatctcatgataaacatcatattcaata |
2450419 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2450418 |
caatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
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T |
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Target: chr3; HSP #48
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||| |
|
|
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catcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaatatcatatccaaaacaaacat |
13837832 |
T |
 |
| Q |
333 |
tcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || |||| |||| |
|
|
| T |
13837833 |
tcattcatacaacttcacttagtcatataagaatagtcaccataaatcataagacaattgactcaag--aacatttccgacaaaaatccaaatcatgtgg |
13837930 |
T |
 |
| Q |
433 |
caaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||| |||| |
|
|
| T |
13837931 |
caaacggc |
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T |
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Target: chr3; HSP #49
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Target Start/End: Complemental strand, 16745639 - 16745433
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
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16745542 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16745541 |
aaacatgcccaaacacaattaaatcatagtattcaccaacacacttcaacatgattaacaataatcaacaa-gtcatgcaacatcaactatatcatatag |
16745443 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
16745442 |
tttcaccatt |
16745433 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
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154 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17913717 |
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17913620 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17913619 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgcttatcaataatcaacaatgccattcaacatcaactatcacat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16259732 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16259830 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |
|
|
| T |
16259831 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgataatcaataatcaacaacatcattcaacattaactatatcatatagctt |
16259930 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattc |
262 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
16259931 |
caccattc |
16259938 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
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Target Start/End: Original strand, 44228115 - 44228354
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
44228115 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagg |
44228212 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | | ||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44228213 |
aaacatgcccatacacgattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
44228312 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44228313 |
g-ttcaccgattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
44228354 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
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328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
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caacatcaactatcacatatagtttcacccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacacatctcatgataaacatcatatccaataaaa |
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T |
 |
| Q |
329 |
tcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17957420 |
tcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatcacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
27839394 |
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T |
 |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
27839493 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacattaacatgatcatcaacaatcaacattatcattca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
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Target Start/End: Complemental strand, 14522775 - 14522580
Alignment:
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14522775 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
14522676 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatat |
249 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| || ||||| || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
14522675 |
catgcccatacacaatcaaatcataatactcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctcatat |
14522580 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Original strand, 30152023 - 30152205
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30152023 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
30152120 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30152121 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatattaatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
30152205 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
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| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcataca-catttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
49231180 |
tcattcataatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatataacatctcatgataaacatcatattcaa |
49231279 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
49231280 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
49231326 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
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| Q |
234 |
atcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcataca-catttcatgataaacatcatatccaatacaatcat |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16819882 |
atcaactatcacatatagtttcaccatttaagcattccttacattctaagtaagataacatacaacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcat |
16819981 |
T |
 |
| Q |
333 |
tcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
16819982 |
tcattcatacaacttcacttagccatacaagaataatc |
16820019 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
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Target Start/End: Original strand, 17937333 - 17937492
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201 |
catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacaca |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17937333 |
catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatactttcaccaatactagcatttcttacatcctatgtaagatagcatacaca |
17937432 |
T |
 |
| Q |
300 |
tttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcata |
359 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17937433 |
taatatgataaacatcgtatccaatacaatcattcattcatacatcttcacttagtcata |
17937492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
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Query Start/End: Original strand, 226 - 440
Target Start/End: Original strand, 7852777 - 7852993
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
7852777 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaaaatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
7852876 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactc-aagaaaacatttccgaccaaaaaccg |
422 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| || | | ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7852877 |
tataaccattcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcgcgatagatcataagaaaattggttcaaaggaaacatttccga-caaaaaccg |
7852975 |
T |
 |
| Q |
423 |
tatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7852976 |
tatcaagtggcaaacggc |
7852993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 186
Target Start/End: Original strand, 30205137 - 30205274
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
30205137 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctgaatatattggacaacacccaattatattgattatctccacaac-tttgctttatc |
30205235 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30205236 |
aagaaaacatgcacatacacaattaattcatagtattca |
30205274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 225 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 51159669 - 51159475
Alignment:
| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--a |
322 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
51159669 |
tcattcaacatcaactatcatatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaa |
51159570 |
T |
 |
| Q |
323 |
atacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaa |
418 |
Q |
| |
|
||| ||| | || |||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| | ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
51159569 |
atataattactctttcatacaacttcacttagtcatacaaaaatagtcacaataactcacaagacaattggctcaag-aaacatttccgacaaaaa |
51159475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Original strand, 17138157 - 17138553
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
17138157 |
gactcgataatgcgacatcactttacaattttcacctcaatataaaggacaactcccaactatattgatcatctccacaacaattgaattatcaagacat |
17138256 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagt--------attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcac |
245 |
Q |
| |
|
|||| | ||| ||| ||| ||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||| || || |||| |||||| | | |
|
|
| T |
17138257 |
catgtccttacacaattaaatcataattcaataagattcatcatcacatcatcaacatgatcatcaatcatcataaatatcgtttaacaacaactacctc |
17138356 |
T |
 |
| Q |
246 |
atatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcataca-catttcatgataaacatcatatccaa--tacaatcattcattcata |
341 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||||| | ||| || ||| | ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17138357 |
atatagttttaccatttcaagcatttcttacatcctaagtaagagaacatgcaacatcacttgataaacatcatttccaacatataatcattcattcata |
17138456 |
T |
 |
| Q |
342 |
caacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17138457 |
taacttcacttaatcatataagaatagtcacgataattcataagtcaattggctcaaaagaacatttccgac--aataccgtatcaagtggcaaacggc |
17138553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 290 - 435
Target Start/End: Original strand, 54423001 - 54423145
Alignment:
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290 |
agcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaa |
389 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
54423001 |
agcatacacatcacatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatataagagtaatcacaacaattcataaggtaa |
54423100 |
T |
 |
| Q |
390 |
ttgac-tcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
||||| | || || |||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54423101 |
ttgacttgaaagaaccatttccgac--aataccgtatcaagtggcaa |
54423145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12265960 - 12265775
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
12265960 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
12265862 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||||| || | ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12265861 |
aaacatgtccacagacaaataaatcatagtatttatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatctaacatcaa |
12265775 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17523884 - 17523691
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17523884 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacggttttcaccccaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccgcaacatgtgcattatc |
17523785 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatc |
243 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||| ||| ||||| || ||| |||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17523784 |
aagaaatcatgtccatacacaattaattcatactactcatcatcaccaa--atcatgatcatcaataatcaataatgtcattcaacattaactatc |
17523691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15939930 - 15939725
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag- |
150 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15939930 |
aaggactcaataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaatgtatatgacaacacccaattatattgattatccccataaca-ttgaattatcaagc |
15939832 |
T |
 |
| Q |
151 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatat |
249 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||| |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
15939831 |
aaaacatgcccacatacaaatagatcatagtattcatcattcacaccataacttgattatcaacaatcaacaaagtcattcaacttcaattatcacttat |
15939732 |
T |
 |
| Q |
250 |
agtttca |
256 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
15939731 |
agtttca |
15939725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 238
Target Start/End: Original strand, 5227406 - 5227585
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5227406 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
5227504 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | | | ||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5227505 |
catgctcatatacaattca---aatgtattcatcattacacctcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
5227585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Original strand, 10737247 - 10737386
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| | || | |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10737247 |
gactcgataatgcgacaacaata-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattgtattgttcatcttcacatcatttgcattatcaagaaaa |
10737345 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac |
195 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10737346 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatgacac |
10737386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14846131 - 14846034
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14846131 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
14846034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 226 - 362
Target Start/End: Original strand, 33340812 - 33340949
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaat |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33340812 |
cattcaacatcaaccacatcatatagtttcaccaattcaaacatttcttacattctaagtaagatagcttacacatctcatgataaatatcatatccaaa |
33340911 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
33340912 |
acaatcattcattcatacaacttcacttagttatataa |
33340949 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 45859709 - 45859884
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45859709 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacatccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
45859806 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
45859807 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaataatatcattca |
45859884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 223
Target Start/End: Original strand, 55315085 - 55315252
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
55315085 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
55315182 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
55315183 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
55315252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12031364 - 12031249
Alignment:
| Q |
143 |
ttatcaagaaaacatgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaacta |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| | ||| | || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12031364 |
ttatcaagaaaacacgcccattcacaatttaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaataatgtcattcaacatcaacta |
12031265 |
T |
 |
| Q |
242 |
tcacatatagtttcac |
257 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12031264 |
tcacatatcgtttcac |
12031249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16935286 - 16935168
Alignment:
| Q |
115 |
tatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaata |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16935286 |
tatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaata |
16935190 |
T |
 |
| Q |
215 |
atcaacaatgtcattcaacatc |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16935189 |
atcaacaatgtcatccaacatc |
16935168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8305790 - 8305693
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8305790 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
8305693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 302 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17523690 - 17523552
Alignment:
| Q |
302 |
tcatgataaacatcatatccaa--tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaag |
399 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17523690 |
tcatgataaacatcatatccaaaatacaatcattcattcatgcaacgtca-ttagtcatataagaatagtcacgataaatcataagacaattgactcaag |
17523592 |
T |
 |
| Q |
400 |
aaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17523591 |
aag-catttccgaccaaaaaccatatcaagtggcaaacggc |
17523552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 16260014 - 16260261
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaa |
286 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | | |||| |||||| |
|
|
| T |
16260014 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttgttccacatcaactatcacatatagtttcaccaattcaagcatt-atcatattccaagtaa |
16260112 |
T |
 |
| Q |
287 |
gatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
| | | || | || |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || |||| |||| |
|
|
| T |
16260113 |
tagggaaaacaatatctcatgataaatatcat-----atataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatagtcaccacaattcgtaag |
16260207 |
T |
 |
| Q |
386 |
gtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
16260208 |
acaattagttcaag-aaacattttcgaccaaagaccgtgtcaattggcaaacggc |
16260261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18905267 - 18905171
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18905267 |
aaggactcaataatgcgaaaacaatc-acaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
18905171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 208 - 372
Target Start/End: Original strand, 39654757 - 39654925
Alignment:
| Q |
208 |
atcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcat |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| | || |
|
|
| T |
39654757 |
atcaataatcaacaatatcattcaacattaactacctcatatagttttaccatttcaagtatttctcacattctaagtaagaggacatacaacatcttat |
39654856 |
T |
 |
| Q |
306 |
gataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39654857 |
gacaaatatcatatccaacatataaccattcattcacacatcttcacttagtcatataagaatagtcac |
39654925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 223
Target Start/End: Original strand, 41268931 - 41269098
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | | |||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |
|
|
| T |
41268931 |
gactcgataatgcgacaacatttctcaatct-caactcaatacataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagagaa |
41269028 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca-ttaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
||| | || || || ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41269029 |
catacccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacagacaacttgattatcaacaatcaacaat |
41269098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13977101 - 13976964
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctca--atatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
13977101 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaa-tgtcaactcaatatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagga |
13977004 |
T |
 |
| Q |
153 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca |
192 |
Q |
| |
|
||||||| || || || ||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13977003 |
aacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatca |
13976964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13956269 - 13956132
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctca--atatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
13956269 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaa-tgtcaactcaatatatataggacaacacccaattattttgattatctccacaaca-ttgcattaccaagga |
13956172 |
T |
 |
| Q |
153 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca |
192 |
Q |
| |
|
||||||| || || || ||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13956171 |
aacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatca |
13956132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14843919 - 14843815
Alignment:
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
14843919 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagcattcatcatcacataataacttgattatcaccaatcaacaatatcattcaacacccactatcacatatag |
14843820 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttca |
256 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
14843819 |
tttca |
14843815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 147
Target Start/End: Original strand, 12951743 - 12951835
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12951743 |
gactcgataatgcgacatcatctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatc |
12951835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Original strand, 15874893 - 15874953
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15874893 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaa |
15874953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 385
Target Start/End: Original strand, 38167007 - 38167070
Alignment:
| Q |
322 |
aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38167007 |
aatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatggtcacaacaattcataag |
38167070 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9303802 - 9303753
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
237 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9303802 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
9303753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12031233 - 12031164
Alignment:
| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataag |
363 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
12031233 |
tacacatctcatgatagacatcatatcccacataatcattcattcatacaacttcacttagttatataag |
12031164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11330442 - 11330382
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11330442 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccaccacatttgcattatcaagaa |
11330382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14522538 - 14522487
Alignment:
| Q |
272 |
ttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14522538 |
ttacattctaagtaagataacatacacatctcatgataaatatcatatccaa |
14522487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Original strand, 15516426 - 15516521
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
15516426 |
gacttgataatgcgacatcaactcaaaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaag |
15516521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11883580 - 11883518
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| Q |
199 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11883580 |
aacataatcatcgataatcaacaatatcattcaacatcaactatctcatatagttttaccatt |
11883518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #94
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Query Start/End: Original strand, 294 - 363
Target Start/End: Original strand, 2048969 - 2049038
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| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataag |
363 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |
|
|
| T |
2048969 |
tacacatctcatgatagacatcatatcccacataatcattcattcatacaactttacttagttatataag |
2049038 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #95
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Target Start/End: Original strand, 10737388 - 10737476
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| Q |
235 |
tcaactatcacatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| | | || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10737388 |
tcaactatcacatatagtttcaccatttcaggcattctc-atactccaagtaagatagcatacatatctcatgataatcatcatatccaa |
10737476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #96
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Query Start/End: Original strand, 208 - 288
Target Start/End: Original strand, 15516590 - 15516671
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| Q |
208 |
atcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaaga |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15516590 |
atcaataatcaacaatatcattcaacagcaactacctcatatagtcttaccacttcaagtatttctcacattctaagtaaga |
15516671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #97
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Target Start/End: Complemental strand, 38812436 - 38812367
Alignment:
| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38812436 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
38812367 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #98
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| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12490177 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacattttcattatcaagaaa |
12490105 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #99
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| Q |
50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatata |
98 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14287780 |
acaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatata |
14287828 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #100
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| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
19230968 |
tacacatcttatgatagacatcatatcccacataatcattcattcatacaacttcacttagttatataa |
19231036 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #101
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcat |
143 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39654607 |
gactcgataatgcaacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcat |
39654695 |
T |
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Target: chr3; HSP #102
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| Q |
175 |
tcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18898045 |
tcatagtattcatcatcccacatcaacgtatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
18897982 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #103
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
145 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11883735 |
gactcgataatgcgacatcacctcacactttccacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacattagcatta |
11883645 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #104
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Query Start/End: Original strand, 52 - 85
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt |
85 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11813553 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt |
11813586 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #105
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Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33370169 - 33370118
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| Q |
208 |
atcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
33370169 |
atcaataatcatcaatatcattcaacatcaactacatcatatagtttcacca |
33370118 |
T |
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Target: chr3; HSP #106
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Target Start/End: Complemental strand, 14060675 - 14060614
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14060675 |
caatataaaggacaacttcaaactatattgatcatccccacaatatttgcattatcaagaaa |
14060614 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #107
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Query Start/End: Original strand, 80 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 55442218 - 55442145
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacat-ccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
55442218 |
caattttcacaacaatataaaggacatctttccaattatattgatcatctccacaacattcgcattattaagaa |
55442145 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #108
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Query Start/End: Original strand, 55 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 47786339 - 47786311
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaat |
83 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47786339 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaat |
47786311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 48 - 411
Target Start/End: Original strand, 6232 - 6594
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6232 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
6331 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6332 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
6431 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6432 |
atagtttcaccattcaagcattatttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
6531 |
T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccg |
411 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||| |||| || |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6532 |
cacttagttatataaaaatggtcaccacaattcttaagacaattggttcaag-aaacatttccg |
6594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2317 - 1925
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2317 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccacttatattgattatctccacatcatttgcattatc |
2218 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||| ||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2217 |
aagaaaacatgcccacacacaattaaattatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
2118 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2117 |
tatagttttatcattcaagcattctttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgatacacatcatatccaaaacaatcattcattcatacaact |
2018 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||| |||| || |||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2017 |
tcacttagttatataaacatagtcaccacaattcttaagacaattggttcaag-aaacatttccgaccgaaaaccgtgtcaagtggcaaacggc |
1925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13217 - 12826
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |
|
|
| T |
13217 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccataattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcaacaacatttgcattgtc |
13118 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13117 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
13018 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13017 |
atagtttcaccattcaagcattccttacattataagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaataaaattattcattcatacaactt |
12918 |
T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||| |||| || |||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12917 |
cacttagttatataaaaatggtcaccacaattcttaagacaattggtttaag-aaacatttccgaccaaaaaccgtgtcaagtggcaaacggc |
12826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 199 - 440
Target Start/End: Original strand, 161 - 400
Alignment:
| Q |
199 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacac |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
161 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatttcaacattcattacattct-agtaaggtagcatacac |
259 |
T |
 |
| Q |
299 |
atttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaa |
398 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
260 |
ctctcatgataagcatcatatcctatacaatcattcaatcatacaaattcacttagtcacataagaatggtcacaacaattcataagacaattggcttaa |
359 |
T |
 |
| Q |
399 |
gaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
360 |
-aaaacatttccgtccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36892185 - 36891794
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36892185 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaactcccaattatattgattatctccacaacattttcattatc |
36892086 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36892085 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcgactatcacat |
36891987 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaac-atcatatccaatacaatcattcattcatacaac |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
36891986 |
atagtttcaccatttcaagcattcattacattct-agtaagatatcatacacacctcatgataaacaatcatatccaatacaatctttcaatcatacaac |
36891888 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36891887 |
ttcacttagtcatataagaatgatcacaataattcataagacaattggctcaag-aaacattttcgaccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
36891794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 55 - 430
Target Start/End: Original strand, 22273577 - 22273951
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22273577 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaa |
22273675 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
22273676 |
catgcacattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaactatcaaatttagttt |
22273775 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22273776 |
caccaattcaatcattccttacattcta-gtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
22273874 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagt |
430 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| || |||||||| |
|
|
| T |
22273875 |
gtcatacaagaataatcacaaccattcattaggtaattgactcaataaaacatctcctatcaaaacccatatcaagt |
22273951 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 55 - 430
Target Start/End: Original strand, 22282810 - 22283184
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22282810 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacagcacctaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
22282908 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
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|
| T |
22282909 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaactatcaaatttagttt |
22283008 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
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|
| T |
22283009 |
caccaattcaaacattccttacattcta-gtaagatagcatacacatctcaagataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
22283107 |
T |
 |
| Q |
354 |
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430 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| || |||||||| |
|
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| T |
22283108 |
gtcatacaagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaataaaacatctccaatcaaaacccatatcaagt |
22283184 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4449698 - 4449312
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154 |
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|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaacttccaattatattgatcattttcgcaacatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
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| T |
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catgtccatacacaaccaa-tcatagaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcatttatctcctatggttt |
4449500 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |
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| T |
4449499 |
caccatttcaagcatttcttacattctaagtaagatagcatacacaactcatgataaacatcatatccaaaatacaagcattcatttatacaacttcact |
4449400 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||| | |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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tagtcatacaagaatgatcacaataactcataagacaattggcccaag-aaacatttccgatccaaaaccatatcaagtggcaaacggc |
4449312 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 8942334 - 8942715
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Q |
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|
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|
|
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
8942432 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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aaacatgctcatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaactatcacatata |
8942532 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcaccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
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| T |
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gtttcaccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatttcatgacaaatatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
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T |
 |
| Q |
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cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
8942632 |
cacttagccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaacgtgtcaagtgg |
8942715 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12637633 - 12637255
Alignment:
| Q |
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150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggataacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaag |
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T |
 |
| Q |
151 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
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aaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatata |
12637438 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcaccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
|
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|
| T |
12637437 |
gtttcaccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatttcatgacaaatatcatatccaatacaatcattcattcatacaactt |
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T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
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|
| T |
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cacttaaccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaacgtgtcaagtgg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
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Q |
| |
|
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|
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gactcgataatgcgaccacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcctttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatc-acacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||| |||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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catgtccatacataattaaatcatagcattcatcatcgccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagtt |
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T |
 |
| Q |
254 |
tc-accattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
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| T |
6878333 |
tcaacaattcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatacacatctcatgataaatatcatatccaaaatacaattattcgttcacacaacttcac |
6878432 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6878433 |
ttagttatataagaatggtcaccacaattcataagacaattggctcaag-aaatatttccgaccaaaaaccatatcaagtgg |
6878513 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 55 - 323
Target Start/End: Original strand, 8886832 - 8887099
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Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8886931 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
8887030 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8887031 |
caccaattcaa-tatttcttacattttaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaa |
8887099 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 323
Target Start/End: Original strand, 22862179 - 22862446
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |
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|
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22862179 |
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T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22862278 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaatatcaactatcacaaatagttt |
22862377 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22862378 |
caccaattcaa-catttcttacattctaagtaagataacatacatatatcatgataaatatcatatccaa |
22862446 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Original strand, 25600652 - 25600858
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| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25600752 |
catgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
25600851 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
25600852 |
caccatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 55 - 395
Target Start/End: Original strand, 27260274 - 27260592
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
27260274 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccataatatataggacaactcccaattatattgaccatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
27260373 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27260374 |
catgtccatatacaatcaattcatagtattcatcatcacac----------------------aacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
27260451 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || | || ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
27260452 |
caccatttcaagcatcccttgcattcta-gtatgatagcatacacctctcatgataaacatcatatccaataaaatcgttcattcatacaacttcactta |
27260550 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgact |
395 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27260551 |
gtcatataagaatagtcacaacaattcataaggtaattgact |
27260592 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 321
Target Start/End: Original strand, 12726741 - 12727010
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12726741 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
12726838 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12726839 |
aaacatgcccatacacaattaaatcttagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
12726938 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| | | |||| |||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12726939 |
tttcaccatttcaagcatttctcatattccaagtaagagaacatacaacatctcatgacaaacatcatatcc |
12727010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Original strand, 20013810 - 20014131
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20013810 |
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20013907 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20013908 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
20014007 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttc |
348 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| ||| |
|
|
| T |
20014008 |
tttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaata-gggaaaaacatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcactccttcatacaaattc |
20014105 |
T |
 |
| Q |
349 |
acttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20014106 |
acttagtcatacaagaataatcacaa |
20014131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14907907 - 14907583
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14907907 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
14907810 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14907809 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
14907710 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata--cacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
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|||||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |
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|
| T |
14907709 |
tttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcactccttcatacaact |
14907611 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14907610 |
tcacttagtcatacaagaataatcacaa |
14907583 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 55 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22581402 - 22581094
Alignment:
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55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22581402 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacgtttgcattatcaagaaaa |
22581303 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
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|
| T |
22581302 |
catgtccatacataatcaaatcataagattcattctcacaacatcaacatgatcatcaacaatcaacaatgtcattcaacatcaactacctcatatagtt |
22581203 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
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| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
22581202 |
ttaccaattcaagcatttcttacattctaagtaagagaacatacacatctcatgataaacatcatatccaacatacaatcattcattcatacaacttcac |
22581103 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcata |
359 |
Q |
| |
|
||| ||||| |
|
|
| T |
22581102 |
ttagtcata |
22581094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Original strand, 23818867 - 23819191
Alignment:
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23818867 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
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|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
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| T |
23818965 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
23819064 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata--cacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
23819065 |
tttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcactccttcatacaact |
23819163 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23819164 |
tcacttagtcatacaagaataatcacaa |
23819191 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Original strand, 34822886 - 34823093
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
34822983 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
34822984 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
34823083 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
34823084 |
tttcaccatt |
34823093 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21275995 - 21275788
Alignment:
| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21275995 |
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21275897 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21275896 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
21275799 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
21275798 |
tttcaccattc |
21275788 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3800581 - 3800375
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3800581 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
3800483 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3800482 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaaccatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
3800385 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
3800384 |
tttcaccatt |
3800375 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5889765 - 5889559
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5889765 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
5889667 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
5889666 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactataccgtatag |
5889569 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
5889568 |
tttcaccatt |
5889559 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 262
Target Start/End: Original strand, 24966987 - 24967195
Alignment:
| Q |
54 |
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153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24966987 |
ggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
24967086 |
T |
 |
| Q |
154 |
acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | ||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24967087 |
acatgcccatacacgaataaatcatagtattcatcaccacacgttatcatgattatcaataatcaacaacatcattcaacattaactatatcatatagtt |
24967186 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
24967187 |
tcaccattc |
24967195 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 226 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21275716 - 21275503
Alignment:
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21275716 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacatatctcatgataaacatcatatccaata |
21275617 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
21275616 |
caatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaccgtgt |
21275518 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
21275517 |
caagtggcaaacggc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
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Target Start/End: Complemental strand, 19888243 - 19888041
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
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actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
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T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19888145 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtttc |
19888048 |
T |
 |
| Q |
256 |
accattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
19888047 |
accattc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 262
Target Start/End: Original strand, 21140569 - 21140771
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| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
21140569 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaa-c |
21140666 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21140667 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtttc |
21140764 |
T |
 |
| Q |
256 |
accattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
21140765 |
accattc |
21140771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 226 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12643214 - 12643001
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12643214 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatcacatacatatctcatgataaacatcatatccaata |
12643115 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
12643114 |
caatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaccgtgt |
12643016 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
12643015 |
caagtggcaaacggc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25877399 - 25877210
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aatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataa |
173 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
25877399 |
aatccacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatggccatacacaattaa |
25877301 |
T |
 |
| Q |
174 |
ctcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaac-aatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25877300 |
ttcatagtattcattatcacacatcaacatgattatcaataatcaacgaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 55 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12643491 - 12643223
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
12643491 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
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T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12643393 |
catggccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagttt |
12643294 |
T |
 |
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caccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| | | |||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12643293 |
caccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatttcatgacaaatatcatatccaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 24572865 - 24572526
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
24572865 |
acaaagactcgataatgcgataacacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
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T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
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|
| T |
24572765 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcacaagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaaaaatcaacaatgtcattcgacatctactacctcata |
24572666 |
T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaac |
345 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24572665 |
tagttttaccatttcaaacattcctcacattctaagtaagagaacatacacatctcatgacaagcatcatatccaacatataattattcattcatacaac |
24572566 |
T |
 |
| Q |
346 |
ttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| || ||| || ||||||| |
|
|
| T |
24572565 |
ttcacttagtcatataagaatattctcaatcaatcataag |
24572526 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 56 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43644442 - 43644243
Alignment:
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43644442 |
actcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaac |
43644344 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43644343 |
atgcccattcacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacattgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
43644244 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 259
Target Start/End: Original strand, 461426 - 461631
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
461426 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
461523 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
461524 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaacatcagctatcagatatag |
461623 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
461624 |
tttcacca |
461631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 323
Target Start/End: Original strand, 7320174 - 7320450
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| Q |
50 |
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149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7320174 |
acaaagactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgataatctccacaacatttgcattatcaa |
7320273 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
7320274 |
gaaaacatgtccatacaaaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactacctcata |
7320373 |
T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7320374 |
tagttttaccatttcaagcatttcttacattctaagtaagagaacatacaacatcccatgataaacatcatatccaa |
7320450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24828034 - 24827831
Alignment:
| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24828034 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
24827936 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
24827935 |
atgccc--acacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
24827838 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
24827837 |
caccatt |
24827831 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 42179555 - 42179342
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| Q |
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
42179555 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatgcacatctcatgataaacatcatatccaaaa |
42179456 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| ||| || |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42179455 |
caatcattcattcatacaactccacttagttatataaacatagccaccacaattcttaagacaattggttcaa-aaaacatttccgactaaaaaccgtat |
42179357 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
42179356 |
caagtggcaaacggc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19887969 - 19887825
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19887969 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatattcaata |
19887870 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19887869 |
caatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
19887825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11232720 - 11232484
Alignment:
| Q |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11232720 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
11232623 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11232622 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
11232526 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
11232484 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22514567 - 22514331
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22514567 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
22514470 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22514469 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
22514373 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22514372 |
tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
22514331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 206 - 359
Target Start/End: Original strand, 16900207 - 16900361
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| Q |
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ttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttca |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16900207 |
ttatcaataatcaacattgtcatttaacatcaactatcacatatagtttcaccatttcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctca |
16900306 |
T |
 |
| Q |
305 |
tgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcata |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16900307 |
tgataaacatcatacccaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcata |
16900361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 206 - 359
Target Start/End: Original strand, 16993598 - 16993752
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| Q |
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ttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttca |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16993598 |
ttatcaataatcaacattgtcatttaacatcaactatcacatatagtttcaccatttcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctca |
16993697 |
T |
 |
| Q |
305 |
tgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcata |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16993698 |
tgataaacatcatacccaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcata |
16993752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20628864 - 20628662
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20628864 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccactatttcaacctcaatatataggacgatacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
20628767 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20628766 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacat---catgattatcaataatcaacaatgacattcaacatcaactatcacatatag |
20628670 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
20628669 |
tttcacca |
20628662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Original strand, 21140843 - 21140987
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| Q |
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21140843 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatattcaata |
21140942 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21140943 |
caatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
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50 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
28972727 |
acaaagactcgataatgcgacaccaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacatccatatatattgatcatctccaca-catttgcattactaa |
28972825 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacata |
248 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || | |
|
|
| T |
28972826 |
gaaa-catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcgacatgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacatcaaacacctcaca |
28972924 |
T |
 |
| Q |
249 |
tagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaatacaat----cattcattcataca |
343 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
28972925 |
tagttttaccatttaagcattccttacatcctaggtaagatcacatacaacattccatgataaacatcatatcca--acatttggccattcgttcataca |
28973022 |
T |
 |
| Q |
344 |
acttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||| ||||| | | | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
28973023 |
acttcacttagtcatataaaaatgatcacgataaaacccaagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaacggc |
28973118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28777168 - 28776932
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28777168 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
28777071 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28777070 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagaattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
28776974 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
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|
| T |
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tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 226 - 385
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Q |
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|
|
| T |
3800195 |
cattaaacatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatattcaata |
3800096 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
3800095 |
caatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccaaaattcataag |
3800036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22691426 - 22691175
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147 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22691426 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
22691327 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| || ||||| || || ||||| || || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
22691326 |
aagaaaacatgtctatacacaatcaaatcatactactcgtcatcatcaaat---catgatcatcaataatcaacaaagtcattcaacattaactatctca |
22691230 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcaccat-tcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacat |
300 |
Q |
| |
|
| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22691229 |
tgtagtttcactatctcaagcatttcttacattctaagtaagataacatacacat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22696073 - 22695822
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22696073 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
22695974 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| || ||||| || || ||||| || || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
22695973 |
aagaaaacatgtctatacacaatcaaatcatactactcgtcatcatcaaat---catgatcatcaataatcaacaaagtcattcaacattaactatctca |
22695877 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcaccat-tcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacat |
300 |
Q |
| |
|
| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22695876 |
tgtagtttcactatctcaagcatttcttacattctaagtaagataacatacacat |
22695822 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9654296 - 9653983
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9654296 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatatagagcaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattaacaagaaaa |
9654198 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9654197 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcatcacataacaacatgatta-------tcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
9654105 |
T |
 |
| Q |
255 |
cac-cattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
9654104 |
cactcattcaagcatttcctacatcataagtaagatagcatatacatctcatgataaatatcat----------atcattcattcatacaacttcacata |
9654015 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9654014 |
gttatacaagaatggtcacaacaattcataag |
9653983 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
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Target Start/End: Original strand, 23773225 - 23773407
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23773225 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcgacaacatt-gcattatcaaga |
23773322 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23773323 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttataaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
23773407 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24687136 - 24686954
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24687136 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
24687039 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24687038 |
aaacatgcc--tacacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
24686954 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 237
Target Start/End: Original strand, 15632088 - 15632269
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15632088 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattctcaacacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcaattgcattatcaagaaaa |
15632186 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
237 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
15632187 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcccacattaacatgattatcaataatcaacgacatcattcaacatca |
15632269 |
T |
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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 250 - 372
Target Start/End: Original strand, 25211866 - 25211988
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| Q |
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agtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttca |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
25211866 |
agtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcacacatcttca |
25211965 |
T |
 |
| Q |
350 |
cttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
25211966 |
cttagtcatataaggatagtcac |
25211988 |
T |
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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 435
Target Start/End: Original strand, 270035 - 270226
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| Q |
245 |
catatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcata |
341 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
270035 |
catatggtttcaccatttcaagcattccttacactctaagtaagatagcatacacaactcatgataaacatcatatccaaaatacaagcattcatttata |
270134 |
T |
 |
| Q |
342 |
caacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
270135 |
caacttcacttagtcatacaagaatgatcacaataactcataagacaactggctcaag-aaacatttccgacc-aaaaccatatcaagtggcaa |
270226 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 225 - 370
Target Start/End: Original strand, 34823165 - 34823309
Alignment:
| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
34823165 |
tcattcaacatcaactatcacatatagct-caccaattcaagcattctc-atattccaagtaagatagcatatacatctcatgataaacatcatattcaa |
34823262 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34823263 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
34823309 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 370
Target Start/End: Original strand, 12727126 - 12727270
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| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12727126 |
tcattcaacatcaactatcacatatagct-caccaattcaagcattctc-atattccaagtaagatagcatatacatctcatgataaacatcatattcaa |
12727223 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12727224 |
tacaatcattcattcatacaatttcacttagtcatacaagaataatc |
12727270 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 158
Target Start/End: Original strand, 269878 - 269981
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| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
269878 |
gactcgataatgcgaccacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
269977 |
T |
 |
| Q |
155 |
catg |
158 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
269978 |
catg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 223
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17398061 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcaacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
17397964 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17397963 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacagaaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
17397894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 440
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| Q |
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aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac- |
296 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| || | |||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||| |
|
|
| T |
22787351 |
aacatgatcatcaataatccacaatatcattcaacatcaactacctcatatggttttacaatttcaagtatttctcacattctaattaagagaacataca |
22787252 |
T |
 |
| Q |
297 |
acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgac |
394 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22787251 |
acatcttatgataaatatcatattcaacatataacaattcattcacacatcttcatttagtcatataagaatagtcacgatagatcataagacaattgac |
22787152 |
T |
 |
| Q |
395 |
tcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
22787151 |
tcaag-gaacatttccga-caattaccgtatcaactggcaaacggc |
22787108 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
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Query Start/End: Original strand, 55 - 150
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
721162 |
gactcgataatgcgacatcactacacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaag |
721257 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
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Target Start/End: Complemental strand, 20628647 - 20628580
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| Q |
295 |
acacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
20628647 |
acacatctcatgataaacatcatatccaatataattattcattcatacaacttcacttagttatataa |
20628580 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
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Query Start/End: Original strand, 199 - 288
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199 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaaga |
288 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
721317 |
aacataatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaactacctcatatagttttaccatttcaagtatttctcacattctaagtaaga |
721407 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
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Query Start/End: Original strand, 80 - 153
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caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23822967 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
23822894 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
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caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23824911 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
23824838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23832046 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
23831973 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
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Target Start/End: Complemental strand, 22787506 - 22787408
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22787506 |
gactcgataatgcgacatcaactcacagtcttcaccacaatatagaggacgacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaagaaa |
22787408 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19670576 - 19670515
Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19670576 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
19670515 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #65
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| Q |
138 |
ttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22693040 |
ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
22693133 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #66
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Target Start/End: Original strand, 22697687 - 22697780
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| Q |
138 |
ttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22697687 |
ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
22697780 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #67
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Target Start/End: Complemental strand, 24088683 - 24088566
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| Q |
208 |
atcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata-cacatttcat |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| | || |
|
|
| T |
24088683 |
atcaataatcaacaatatcatttaacatcaactacctcatatagtcttaccacttcaagtatttctcacattctaagtaagaggacataccacatcttat |
24088584 |
T |
 |
| Q |
306 |
gataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24088583 |
gataaatatcatatccaa |
24088566 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #68
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Target Start/End: Original strand, 22692978 - 22693028
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagg |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22692978 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatatagg |
22693028 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #69
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Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Original strand, 22697625 - 22697675
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagg |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22697625 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatatagg |
22697675 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #70
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Target Start/End: Complemental strand, 24088810 - 24088752
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| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
24088810 |
caatataaaggacaacttccaattatattgattatctccacaacaattgcattaccaag |
24088752 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #71
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Target Start/End: Complemental strand, 4735 - 4663
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4735 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagaaa |
4663 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24296031 - 24295958
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24296031 |
caattttcacaacaatataaaggacaactttcaaatatattgatcatctccaaaacatttgcattatcaagaaa |
24295958 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #73
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Query Start/End: Original strand, 294 - 362
Target Start/End: Original strand, 461646 - 461714
Alignment:
| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
461646 |
tacacatctcatgatagacatcatatcccacataatcattcattcatacaacttcatttagttatataa |
461714 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #74
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Query Start/End: Original strand, 226 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3800302 - 3800257
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattct |
271 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
3800302 |
cattaaacatcaactatcacatatagtttcactattcaagcattct |
3800257 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
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Alignment:
| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19658678 |
caatataaaggacaacttccagatatgttgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
19658739 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 323
Target Start/End: Original strand, 12727020 - 12727118
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| Q |
225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca |
322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | | |||| |||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12727020 |
tcattcaacatcaactatcacatatag-ctcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatctcatgacaaacatcatatcca |
12727117 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43644226 - 43644158
Alignment:
| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
43644226 |
tacacatctcatgatagacatcatatcccacataaccattcattcatacaactacacttagttatataa |
43644158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 138286 - 137897
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
138286 |
gtacagggactcgataatgcgacaacaatccacaattt-cacttcaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaacatt-gtattatc |
138189 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
138188 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
138089 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
138088 |
atagtttcaccaattcaagcattcattacatt-ttagtaagatagcatacacttctcatgataaacatcatatccaatacaatcattcaatcatacaact |
137990 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
137989 |
tcacttagtcatataagattactcaccaccattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcgagttgccaccggc |
137897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 48 - 440
Target Start/End: Original strand, 87127 - 87504
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
87127 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcatt--c |
87223 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
87224 |
aagaaaacatgtccatacacaaataaatcgtagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctcat |
87323 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaaca-tcatatccaatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
87324 |
atagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatatcatacacacctcatgataaacaatcatatccaatacaatcattcaatcatacaact |
87423 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
87424 |
tcacttagtcatataagaatggtcacaac------------aattggctcaagaaa-cattttcgaccaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
87504 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 435
Target Start/End: Original strand, 10351 - 10740
Alignment:
| Q |
49 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
148 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10351 |
tacaaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatca |
10450 |
T |
 |
| Q |
149 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || |||| ||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |
|
|
| T |
10451 |
agaaaacatatccatacacaatcaaagcataagattcattatcaccatatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcattcaatatcaactacctcac |
10550 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcata-cacatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaa |
344 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
10551 |
atagttttaccattcaatcattccttacattctaagtaagagcacataccacattctatgataaacgtcatatccaacatacaaccattcgtttatacaa |
10650 |
T |
 |
| Q |
345 |
cttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||| | | | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10651 |
cttcacttagtcatataaaaataatcacgataaaacctaagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
10740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 103
Target Start/End: Original strand, 77069 - 77124
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagga |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
77069 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagga |
77124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:
Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 55 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 32660 - 32287
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32660 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacagccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
32562 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32561 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcagcaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
32462 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32461 |
caccaattcaa-cattccttacattct-agtaagatagcatacacatctcatcataaacatcatatccaatacaatcatttattcatacaacttcactta |
32364 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagt |
430 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| |
|
|
| T |
32363 |
gtcatacaagaataatcacaacaattcctaaggtaattgactcaagaaaacatctccgattaaaacccatatcaagt |
32287 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 159
Target Start/End: Original strand, 34037 - 34147
Alignment:
| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34037 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
34135 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgc |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
34136 |
aagaaaacatgc |
34147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 55 - 430
Target Start/End: Original strand, 40184 - 40557
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
40184 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacagccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
40282 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40283 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcagcaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
40382 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
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|||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40383 |
caccaattcaa-cattccttacattct-agtaagatagcatacacatctcatcataaacatcatatccaatacaatcatttattcatacaacttcactta |
40480 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagt |
430 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| |
|
|
| T |
40481 |
gtcatacaagaataatcacaacaattcctaaggtaattgactcaagaaaacatctccgattaaaacccatatcaagt |
40557 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38807 - 38594
Alignment:
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48 |
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147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38807 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
38709 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38708 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcat |
38609 |
T |
 |
| Q |
248 |
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262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
38608 |
atagtttcaccattc |
38594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38522 - 38372
Alignment:
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226 |
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323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
38522 |
cattcaacatcaactaacacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
38423 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38422 |
tataatcactcattcatacaacttcaattagtcatacaagaataatcacaa |
38372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 55 - 395
Target Start/End: Original strand, 7485 - 7827
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7485 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggaccactcccaattatattgatcatctccaaaacatttgcattatcaagaaaa |
7584 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| || ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
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| T |
7585 |
catgtccatgcacaatcaaatcataagattcatcatcaccacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacataaactatctcatatagtt |
7684 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactt |
352 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
7685 |
tcaccatttcaagcattcattacattctaagtaagatagcatacacatctcatgatacacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactt |
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T |
 |
| Q |
353 |
aatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgact |
395 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attcatataagaatagtcacaacaattcataaggtaattgact |
7827 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:
Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 55 - 353
Target Start/End: Original strand, 8125 - 8424
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagaacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
8224 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8225 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatataattt |
8324 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
|||| |||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8325 |
caccaattcaaacatatcttacatcctaggtaagataacatacacatctcatgataaatatcttatccaacacaatcattcattcatacaacttcactta |
8424 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 55 - 433
Target Start/End: Original strand, 3318 - 3695
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3318 |
gactcgataatgcgacaacaatct-caattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
3416 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3417 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
3514 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3515 |
caccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagataggatacacatctcatgataaatatcatatccaaaatacaatcatttattcatacaacttcact |
3614 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggc |
433 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3615 |
tagtcatacaagaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtggc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 433
Target Start/End: Original strand, 8256 - 8309
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379 |
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433 |
Q |
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|
|
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8309 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5926 |
gactcgataatgcgacaacaatct-caattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6025 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
6122 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6123 |
caccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagataggatacacatctcatgataaatatcatatccaaaatacaatcatttattcatacaacttcact |
6222 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggc |
433 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6223 |
tagtcatacaagaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaaaaccatatcaagtggc |
6303 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 188 - 370
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1518
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Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1336 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaag |
1435 |
T |
 |
| Q |
288 |
atagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1436 |
atagcatacacatctcatgataaacatcatattcaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
1518 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
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Target Start/End: Original strand, 1057 - 1262
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1057 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
1155 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1156 |
catgcccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
1255 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
1256 |
caccatt |
1262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 55 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8123 - 7781
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8123 |
gactcaataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
8024 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
8023 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaattatctcatatggttt |
7924 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7923 |
caccatttcatgcattccttacattctaagtaggatatcatacacatctcatgataaacatcatattcaatataataattcattcatacaactttactta |
7824 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactc |
396 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7823 |
gtcatataagaatagtcacaacaattcatacggtaattgactc |
7781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 55 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13512 - 13170
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13512 |
gactcaataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
13413 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
13412 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaattatctcatatggttt |
13313 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13312 |
caccatttcatgcattccttacattctaagtaggatatcatacacatctcatgataaacatcatattcaatataataattcattcatacaactttactta |
13213 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactc |
396 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13212 |
gtcatataagaatagtcacaacaattcatacggtaattgactc |
13170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 323
Target Start/End: Original strand, 20084 - 20351
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20084 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
20182 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|| || ||| | ||| ||| |||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20183 |
caagcacatccacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaagatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
20282 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20283 |
caccaattcaa-catttcttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaa |
20351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 55 - 323
Target Start/End: Original strand, 18000 - 18267
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Q |
| |
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| T |
18000 |
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18098 |
T |
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| Q |
155 |
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254 |
Q |
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| T |
18099 |
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18198 |
T |
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| Q |
255 |
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323 |
Q |
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| T |
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caccaattcaa-catttcttacattctaggtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaa |
18267 |
T |
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Target: scaffold0434 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
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Target: scaffold0434; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 3352 - 3692
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Q |
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gactcgataatgcaacaacaatacaaaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatatccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
155 |
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254 |
Q |
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| T |
3452 |
tatgtccatacacaatcaattcatagcattcctcatcacacatcaacatgattatcgataatcaacaatgtcattcagcatcaactatcacatatagttt |
3551 |
T |
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255 |
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353 |
Q |
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| T |
3552 |
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3650 |
T |
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| Q |
354 |
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395 |
Q |
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3651 |
gtcataaaagagtagtcacaacaattcaaaaggtaattgact |
3692 |
T |
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Target: scaffold0008 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
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Target: scaffold0008; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 21351 - 21696
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Q |
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gactcgataatacgacaacaaaccacaattttcacttcagtatataggacaacaccgaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
21450 |
T |
 |
| Q |
155 |
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254 |
Q |
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| T |
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catgcacatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
21550 |
T |
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| Q |
255 |
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354 |
Q |
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| T |
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21630 |
T |
 |
| Q |
355 |
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421 |
Q |
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tcatataagaatgggcacgacaaatcataagacaattggctcaag-aaacatttccgacccaaaacc |
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T |
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Target: scaffold0008; HSP #2
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Q |
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| T |
129668 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaacaaaa |
129570 |
T |
 |
| Q |
155 |
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252 |
Q |
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| T |
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129470 |
T |
 |
| Q |
253 |
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256 |
Q |
| |
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|||| |
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129469 |
ttca |
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Target: scaffold0008; HSP #3
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Target Start/End: Complemental strand, 129451 - 129390
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Q |
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catacacatctcatgatagacatcatatctcacataatcattcattcatacaacttcactta |
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Target: scaffold0083; HSP #1
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| |
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| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
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253 |
Q |
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| T |
12990 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcacctcatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaattatcacatatagtt |
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T |
 |
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352 |
Q |
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| T |
13090 |
tcaccaattcaagcatttcctacatcctaggtaagatagcatacacatctcatgataaatatcatatccaacacaatcattcattcatacaaattcactt |
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T |
 |
| Q |
353 |
aatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
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| |||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||| ||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |
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| T |
13190 |
agccatataagaatagtcaccacaatt-ataagacaattggctcgag-aaacattttcgactaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
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Target: scaffold0068; HSP #1
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| T |
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T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
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catgtccatacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacattaacatgattatcaataattaacaatgtcattcaacatcaactatcgcatatagtt |
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T |
 |
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tcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactt |
352 |
Q |
| |
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| T |
47017 |
tcaccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagataacatgcacatctcatgataaatatcatatccaacacaatcattcattcatacaacttcactt |
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T |
 |
| Q |
353 |
aatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccg |
438 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| |
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47117 |
agtcatataagaatagtcaccacaatttataagacaattggctcaa-taaacattttcgcccaaaaaccatatcaagtggccaccg |
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T |
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Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
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Target Start/End: Original strand, 60267 - 60649
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Q |
| |
|
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| T |
60267 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaat-atattgttcatctccacatcatttgcattatgaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
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| T |
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catgtccatacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacattaacatgattatcaataattaacaatgtcattcaacatcaactatcgcatatagtt |
60464 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactt |
352 |
Q |
| |
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|||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
60465 |
tcaccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagataacatgcacatctcatgataaatatcatatccaacacaatcattcattcatacaacttcactt |
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T |
 |
| Q |
353 |
aatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccg |
438 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
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agtcatataagaatagtcaccacaatttataagacaattggctcaa-taaacattttcgcccaaaaaccatatcaagtggccaccg |
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Target: scaffold0034 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
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Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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| T |
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taggattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttaca |
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T |
 |
| Q |
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ttctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc-aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaac |
375 |
Q |
| |
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| T |
44713 |
ttctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagcatagtctccac |
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T |
 |
| Q |
376 |
cattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
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|
| T |
44813 |
aattcataaaacaattggttcaag-aaacatttccgacc-aaaaccatgtcaagtggcaaacggc |
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T |
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Target: scaffold0034; HSP #2
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38903 |
gactcgataatgcaacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
|||| || || ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
39003 |
catgtccacacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
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T |
 |
| Q |
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tcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattca |
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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39103 |
tcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaatacaatcattca |
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Q |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
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|
| T |
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aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcactatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaacatcaactatcacatatag |
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T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaactt |
347 |
Q |
| |
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|||||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | || |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |
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| T |
78441 |
tttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaacaacatctcatgataatcatcatatccaaaatataatcactcattcatacaactt |
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T |
 |
| Q |
348 |
cacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
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|||||| ||||| |||||| |
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|
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cacttattcatacaagaat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
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|
| T |
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tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcataaccaaa |
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T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgt |
423 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |
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| T |
39278 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatagtctccacaattcataaaacaattggttcaag-aaacatttccgacc-aaaaccat |
39375 |
T |
 |
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atcaagtggcaaccggc |
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Q |
| |
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|
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gtcaagtggcaaacggc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
128 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
227 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20692 |
tccacaacacttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
20593 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaataca |
327 |
Q |
| |
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|
|
| T |
20592 |
ttcaacatcaactatcacatatagtttcaccattttattttttcttacattctaagtaagatagcatacacatctcatgataaacatcatatccaataca |
20493 |
T |
 |
| Q |
328 |
atcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
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| T |
20492 |
atcattcattcatacaacttcacttattcatacaagaataatcacaa |
20446 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
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Target Start/End: Complemental strand, 20716 - 20686
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52 |
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82 |
Q |
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||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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20716 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaa |
20686 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
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Target Start/End: Complemental strand, 52743 - 52361
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Q |
| |
|
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|
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| T |
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gactcgataatgtgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
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||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
52644 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatacagttt |
52545 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
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| T |
52544 |
caccatttcaagcattcattacattct-agtaagatagcatacacctcccatgataaacatcatatcggatacaatcattcaatcatataacttcacctt |
52446 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
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|
|
| T |
52445 |
gtcatataagaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgatc-caaaccatatcaagtggcaaacggc |
52361 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 55 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 56695 - 56313
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154 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
56695 |
gactcgataatgtgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaa |
56597 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
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||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
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| T |
56596 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatacagttt |
56497 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
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||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | |
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| T |
56496 |
caccatttcaagcattcattacattct-agtaagatagcatacacctcccatgataaacatcatatcggatacaatcattcaatcatataacttcacctt |
56398 |
T |
 |
| Q |
354 |
atcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
56397 |
gtcatataagaatggtcacaacaattcataagacaattggctcaag-aaacatttccgatc-caaaccatatcaagtggcaaacggc |
56313 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
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Target Start/End: Complemental strand, 13660 - 13283
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157 |
Q |
| |
|
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| T |
13660 |
tcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaatat |
13562 |
T |
 |
| Q |
158 |
gctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttca |
256 |
Q |
| |
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| T |
13561 |
gtccacacccaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattccacatcaactatcacatttagtttca |
13462 |
T |
 |
| Q |
257 |
cca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaat |
355 |
Q |
| |
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| T |
13461 |
ccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatacacatctcatgataagcatcatatcccatacaatcattcaatcatacaacttcacttagt |
13362 |
T |
 |
| Q |
356 |
catataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
13361 |
catataagaatagtctccacaattcataaaacaattggctcaag-aaacatttccgaccaaacaccatgtcaagtggcaa |
13283 |
T |
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Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 16132 - 16311
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
16132 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaagg |
16230 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16231 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
16311 |
T |
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Target: scaffold0009 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 236874 - 237261
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaatttccaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcttttgcattatcaagaaaa |
236972 |
T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
||| ||||| || ||| |||||| ||||| |||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
236973 |
tatgtccatacataattaaatcatagcattcatcatctccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagtt |
237072 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
237073 |
tcaccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcatacacatttcatgataaatatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaacttcac |
237172 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||| | || ||| ||| |||| || |||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
237173 |
ttagttatgtaaaaatggtcaccacgattcttaagacaattggttcaag-aaacatttacgaccaaaaaccgtgtcaagtggcaaacggc |
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T |
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Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
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Target Start/End: Original strand, 270813 - 271020
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactc-atagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagt |
252 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
270912 |
catgcccatacacaattaaaaccatagtattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagt |
271011 |
T |
 |
| Q |
253 |
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261 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
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271012 |
ttcaccatt |
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T |
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Target: scaffold0692 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
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Target: scaffold0692; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 861 - 505
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
861 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaacatttgcattatcaagaaatcat |
762 |
T |
 |
| Q |
158 |
gctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcac |
257 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
761 |
gcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatttacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacgttaactatcacatatagtttcac |
662 |
T |
 |
| Q |
258 |
c-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatc |
356 |
Q |
| |
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| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
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| T |
661 |
caattcaagcatttcttacatcctaagtaagatagtatactcatct------------------caatacaatcattcattcatacaacttcgtttagtc |
580 |
T |
 |
| Q |
357 |
atataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| || | |||| ||||| || ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
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579 |
atataagaatattcacaacaatccctaagacaattggcttaag-aagcatttccgacctaaaacgatatcaagtgg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0407 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
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Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 63 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6069 - 5770
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6069 |
aatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgccca |
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T |
 |
| Q |
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tacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa-catcaactatcacatatagtttcacca-t |
260 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5971 |
cacacaattaaatcatagtatttatcatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaatcatcaactatcacatatagtttcaccaat |
5872 |
T |
 |
| Q |
261 |
tcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatat |
360 |
Q |
| |
|
|||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
5871 |
tcaaacctttcttacatcctaagtaagatagcatacacatctcatgataattatcatatccaaaacaatcattcattcatacaacttcacttagttatat |
5772 |
T |
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Target: scaffold0116 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 2)
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Target: scaffold0116; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 28574 - 28780
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
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aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28673 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
28772 |
T |
 |
| Q |
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tttcacca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
28773 |
tttcacca |
28780 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 188 - 435
Target Start/End: Original strand, 28857 - 29104
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Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |
|
|
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catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacagatagtttcaccatttcaagcattccttacattccaagtaa |
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T |
 |
| Q |
287 |
gatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataagg |
386 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
28957 |
aatagcatacatatctcatgataatcatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatgatcacaataactcacaaga |
29056 |
T |
 |
| Q |
387 |
taattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |
|
|
| T |
29057 |
caattggctcaag-aaacatttccgacaaaaatccaaatcatgtggcaa |
29104 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0213 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
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Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 55 - 370
Target Start/End: Original strand, 27714 - 28028
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
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| T |
27714 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccat-cacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
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Q |
| |
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|||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
27813 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcaccattcacaaaataacttatttatcaaaaatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacaaatagtt |
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T |
 |
| Q |
254 |
tcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactt |
352 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
27913 |
-caccaattcaagcattctc-atattccaagtaagatagcctacacatctcatgataaacatcatattcaatacaatcattcattcatacaacttcactt |
28010 |
T |
 |
| Q |
353 |
aatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28011 |
agtcatacaagaataatc |
28028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 6)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 52 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14735 - 14350
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14735 |
aaggactcgataatgcgacaaaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
14637 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14636 |
aa-catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgacactcctcatcaactatcacatatag |
14538 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14537 |
tttcaccaattcaa-catttcttacattctaagtaagataacatacacatcccatgataaatatcatatccaaaacaatcatccattcataccacttcac |
14439 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||| | |||||| ||| |||| || |||| || | ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14438 |
ttagttatataaacatagtcaccacaattcttaggacaattggttcaag-aaacgtttttgaccaaaaaccatgtcaagtggctaccggc |
14350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 259
Target Start/End: Original strand, 28261 - 28394
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128 |
tccacaacatttgcattatcaagaaa-acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28261 |
tccacatcatttgcattatcaagcaatacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgt |
28360 |
T |
 |
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28361 |
tattcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
28394 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 259
Target Start/End: Original strand, 40257 - 40390
Alignment:
| Q |
128 |
tccacaacatttgcattatcaagaaa-acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgt |
225 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40257 |
tccacatcatttgcattatcaagcaatacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgt |
40356 |
T |
 |
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40357 |
tattcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
40390 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 261
Target Start/End: Original strand, 28472 - 28545
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188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28472 |
catcatacatcaacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaacatcaattatcacatataatttcaccatt |
28545 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 261
Target Start/End: Original strand, 40468 - 40541
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| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
40468 |
catcatacatcaacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaaaatcaaatatcacatataatttcaccatt |
40541 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23862 - 23801
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| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23862 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccataacatttgcattatcaagaaa |
23801 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:
Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
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Target Start/End: Complemental strand, 15338 - 15064
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15338 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatc |
15240 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15239 |
aagaaaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcat |
15142 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||| | | |||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15141 |
atagtttcaccattccaaacaattc-tcatattccaagtaagagaacatacaacatttcatgacaaatatcatatccaa |
15064 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 226 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15055 - 14842
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15055 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatcacatacatatctcatgataaacatcatatccaata |
14956 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
14955 |
caatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcataagacaattagttcaag-aaacatttccgaccaaagaccgtgt |
14857 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
14856 |
caagtggcaaacggc |
14842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0395 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:
Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 295
Target Start/End: Original strand, 14364 - 14613
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| Q |
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14364 |
gtacaaggactcgacaatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaatatttgcattatc |
14463 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataa-tcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
246 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14464 |
aagaaatcatgtctatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataattcaacaatgtcattcaacatcaactatcaca |
14563 |
T |
 |
| Q |
247 |
tatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcata |
295 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14564 |
tatagtttcaccaattcaagcatttcttacatcctaagtaagatagcata |
14613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 319
Target Start/End: Original strand, 32268 - 32541
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32268 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
32367 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32368 |
aagaaaacatgtacatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcgacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
32467 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatat |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32468 |
gtagtttcaccatttcaagtatttctcacattctaagtaagagaacatacaacatctcatgataaatatcatat |
32541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Original strand, 95006 - 95219
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| Q |
48 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
95006 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatatagaacaacactcaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
95105 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
95106 |
aagaaaacatgcccatacacagttaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatttaacatcaactttcacat |
95205 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
95206 |
atagtttcaccatt |
95219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 95294 - 95545
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| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaag |
287 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
95294 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtagg |
95393 |
T |
 |
| Q |
288 |
atagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
95394 |
atagcatacatatctcatgataattatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatggtcacaataactcacaagac |
95493 |
T |
 |
| Q |
388 |
aattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
95494 |
aattggctcaag-aaacatttccgacaaaaatccaaatcatgtggcaaacggc |
95545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 66907 - 66745
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
66907 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
66810 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
219 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
66809 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaatttgattatcaacaatcaa |
66745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Original strand, 54330 - 54653
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54330 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
54428 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54429 |
catgcacattcataattaaatcatagtattcatcattacacattaacatgattatcaa-------caatgttattcaacatcaactatcacatatagttt |
54521 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa--tacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54522 |
caccaattcaac-attccttacattcta-gtaagatagcatacacatctcctgagaaacatcatatccaaaatacaatcattcattcatacaacttcact |
54619 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
54620 |
tagtcatacaagaatggtcacaacaattcataag |
54653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 109553 - 109344
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
109553 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
109455 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
109454 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
109355 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
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tttcaccattc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14645 - 14590
Alignment:
| Q |
313 |
atcatatccaa--tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
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Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
14645 |
atcatatccaacatataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaat |
14590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:
Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 52 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19050 - 18831
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19050 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatgtccacatcatttgcattatcaaga |
18951 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18950 |
aaacatgcacatgcacaaataaatcatagtattcacaattacacattaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacatcaactatcacatatag |
18851 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattcaagtattct |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18850 |
tttcaccattcaagtattct |
18831 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18767 - 18510
Alignment:
| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcac-atatagtttca-ccattcaagtattctttacattctaagt- |
284 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
18767 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacaatatagtttcatccattcaaacatttcttacatcctaagta |
18668 |
T |
 |
| Q |
285 |
aagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaa-taatcacaaccattca |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||| |
|
|
| T |
18667 |
aagatagcatacacatctcacgataaatatcatatccaaaatataatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaattggtcacaacaattca |
18568 |
T |
 |
| Q |
382 |
taaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18567 |
taagacaattggctcaag-aaacatttccgatcaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
18510 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0465 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:
Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11062
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11394 |
gactcgataatgcgacaaaaatc-acaattttctccacaatatataggacaagacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
11296 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11295 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcaacattacacatcaacaagattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagatt |
11196 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11195 |
caccaattcaaacattccttacatctcaagtaagatagcatacacttctcatgataattaccataaccaaaatacaatctttcattcatacaacttcact |
11096 |
T |
 |
| Q |
352 |
taatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11095 |
tagtcatataagaattgtcacaacaattcataag |
11062 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 249008 - 248741
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
249008 |
gactcgataatgcaacaaaaatc-acaattttctccacaatatataagacaacacccaattatattgttcattcccacatcatctgcattatcaagaaaa |
248910 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
248909 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacaaatagttt |
248810 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
248809 |
caccaattcaa-catttcttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaa |
248741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0346 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:
Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3124 - 2925
Alignment:
| Q |
193 |
cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaagatag |
291 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3124 |
cacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctcatatagtttcaccatttcaagtattccttacattctaagtaagatag |
3025 |
T |
 |
| Q |
292 |
catacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaatt |
391 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3024 |
catacgcatctcatgatacacatcatatccaatacaaacattcattcatacaacttcacttagtcatataagaatagtcacaacaattcataaggtaatt |
2925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 56 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 155821 - 155618
Alignment:
| Q |
56 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
155821 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
155723 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
155722 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtttc |
155625 |
T |
 |
| Q |
256 |
accattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
155624 |
accattc |
155618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 155546 - 155402
Alignment:
| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
155546 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatatcatacataactcatgataaacatcatatccaata |
155447 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
155446 |
caatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
155402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 732
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
914 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
817 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
816 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
732 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 194
Target Start/End: Original strand, 35023 - 35163
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
35023 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
35120 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca |
194 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
35121 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagttttcatcatcaca |
35163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3045 - 2723
Alignment:
| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3045 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
2948 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2947 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
2850 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc--aagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| | | || | |||||||| | ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||| || || || ||||||||||| |
|
|
| T |
2849 |
tttcaccattccaaacaattc-tcatatcccaagtaagagaacatacaacatctcatgacaaatatcatatccaacatataaccactccttcatacaact |
2751 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2750 |
tcacttagtcatacaagaataatcacaa |
2723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23168 - 22940
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23168 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
23069 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
23068 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcac-----aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattc-acatcaattatctcatatagttt |
22975 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaaga |
288 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22974 |
taccaattcaagcatttcttacattctaagtaaga |
22940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0244 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:
Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 128 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 17797 - 17485
Alignment:
| Q |
128 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
226 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
17797 |
tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaacaaagtt |
17698 |
T |
 |
| Q |
227 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
17697 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcaccaattcaagcatttcttacattctaagtaagatagcacacacatctcatgataatcatcatatctcata |
17598 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17597 |
caatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccataattcgaaagacaattggttc-aggaaacatttccgaccaaaaaccatat |
17499 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccgg |
439 |
Q |
| |
|
||||| || ||||| |
|
|
| T |
17498 |
caagttgctaccgg |
17485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 128 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24216 - 23903
Alignment:
| Q |
128 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
226 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24216 |
tccacatcatttgcattatcaagaaaatatgtccatacacaattaaatcataacattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaaagtt |
24117 |
T |
 |
| Q |
227 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
24116 |
attcaatatcaattatcacatatagtttcaccaattcaagcatttcttacattctaagtaagatagcacacacatctcatgataatcatcatatctcata |
24017 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtat |
425 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | |||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24016 |
caattattcattcatacaacttcacttagccatataaaaatagtcaccataattcgaaagacaattggttc-aggaaacatttccgaccaaaaaccatat |
23918 |
T |
 |
| Q |
426 |
caagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |
|
|
| T |
23917 |
caagtggccaccggc |
23903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 271
Target Start/End: Original strand, 145223 - 145438
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
145223 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatatgcattattaagaaaa |
145321 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
145322 |
catgcccatacataaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacatcaactatcacatatagttt |
145421 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccattcaagtattct |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
145422 |
caccattcaagcattct |
145438 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
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Target Start/End: Original strand, 145502 - 145757
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188 |
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285 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
145502 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaaggtcatttaacatcaactatcacaatatagtttcaccaattcaaacatttcttacatcctaagta |
145601 |
T |
 |
| Q |
286 |
agatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcata |
383 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
145602 |
agatagcatacacatctcatgataaatatcatatccaaaataaaatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaataatggtcacaacaattcata |
145701 |
T |
 |
| Q |
384 |
aggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
145702 |
agacaattggctcaag-aaacatttccgatcaaaaaccatatcaagtggccaccggc |
145757 |
T |
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Target: scaffold0025; HSP #3
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
147482 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggaaaacacccaattatattgttcatctccacatcatatgcattatcaagaaaa |
147580 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaa-ataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
||||| || | ||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
147581 |
catgccaattcacaatttaaatcatagtattcatcaccacacatcaacatgattatcaacaatcaataagatccttcaacatcaacaatcacatatagtt |
147680 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcacc |
258 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
147681 |
tcacc |
147685 |
T |
 |
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Target: scaffold0025; HSP #4
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| Q |
292 |
catacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataag |
363 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
147698 |
catacacatctcatgatagacatcatatctctcataatcattcattcatacaacttcacttagttatataag |
147769 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
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Target Start/End: Complemental strand, 90353 - 90147
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
90353 |
aaggactcgataatgcgacaa---tccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
90258 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
90257 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
90158 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
90157 |
tttcaccattc |
90147 |
T |
 |
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Target: scaffold0028; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 129075 - 129281
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
129075 |
aaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
129173 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
129174 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagcattcaccatcatgcctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
129271 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
129272 |
tttcaccatt |
129281 |
T |
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Target: scaffold0028; HSP #3
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225 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaat |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
129353 |
tcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcagacacatctcatgataaacatcatatccaat |
129452 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactc-aagaaaacatttccgaccaaaaaccgt |
423 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| | | ||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
129453 |
acaatcattcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagattataagaaaattggttcaaaggaaacatttccga-caaaaaccgt |
129551 |
T |
 |
| Q |
424 |
atcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |
|
|
| T |
129552 |
atcaagtggcaaacggc |
129568 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #4
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Query Start/End: Original strand, 226 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 90075 - 89938
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaat |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
90075 |
cattcaacatcaaccacatcatatagtttcaccaattcaaacatttcttacattctaagtaagatagcttacacatctcatgataaatatcatatccaaa |
89976 |
T |
 |
| Q |
325 |
acaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
89975 |
acaatcattcgttcatacaacttcacttagttatataa |
89938 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #5
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Target Start/End: Original strand, 78410 - 78471
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| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78410 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
78471 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
4530 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-tagcattatcaaga |
4628 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4629 |
aaacatgcccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
4728 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttca |
256 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
4729 |
gtttca |
4734 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0315 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:
Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Original strand, 17340 - 17545
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17340 |
gactcgataatgcgacaacaatcc-caattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
17438 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17439 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacaactcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcatatatagttt |
17538 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
17539 |
caccatt |
17545 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Original strand, 17618 - 17764
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
17618 |
cattcaaaatcaactatcacatatagtttcaccatccaagcattccttacagtctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
17717 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17718 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
17764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27983 - 27781
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27983 |
aaggactcgataatgggacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
27886 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27885 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactttcacatatag |
27786 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttca |
256 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
27785 |
tttca |
27781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 294 - 362
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| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
27763 |
tacacatctcatgatagacatcatatccac-ataatcattcattcatacaactgcacttagttatataa |
27696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0597 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
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Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
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62 |
taatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctc |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
2593 |
taatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtcc |
2495 |
T |
 |
| Q |
162 |
atacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||| || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2494 |
atacacatttaaatcatagtattcaccatcacacatcaatatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
2395 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0597; HSP #2
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230 |
caacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aataca |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
2319 |
caacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatttcatgataaacatcatatccaaaatata |
2220 |
T |
 |
| Q |
328 |
atcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2219 |
atcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatggtcacaacaattcataag |
2162 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Original strand, 25591 - 25915
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25591 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatgtcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
25688 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25689 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
25788 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata--cacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
25789 |
tttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaaaatataatcacttcctcatacaact |
25887 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25888 |
tcacttagtcatacaagaataatcacaa |
25915 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Original strand, 21336 - 21660
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52 |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21336 |
aaggactcgataatgcgataacaatc-accatgtcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
21433 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21434 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaactatatcatatag |
21533 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcata--cacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaact |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| | | |||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
21534 |
tttcaccatttcaagcattc-tcatattccaagtaatagggaaaaacaacatgtcatgataaacatcatatccaaaatataatcacttcctcatacaact |
21632 |
T |
 |
| Q |
347 |
tcacttaatcatataagaataatcacaa |
374 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21633 |
tcacttagtcatacaagaataatcacaa |
21660 |
T |
 |
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Name: scaffold0014
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Target: scaffold0014; HSP #1
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147 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
145616 |
acaaagacttgataatgcgacatcaattcacgattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatatattgatcatctccacaacattagcattatc |
145715 |
T |
 |
| Q |
148 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
145716 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaca-----acatgatcatcaataatcaacaatgtcattca-catccactatctcat |
145809 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa--tacaatcattcattcatacaa |
344 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
145810 |
atagttttaccaattcaagaatttcttacattctaagtaagagaacatacacatctcatgataatcatcatatccaacatacaatcattcatttatacaa |
145909 |
T |
 |
| Q |
345 |
cttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccga-ccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
145910 |
cttcacttagtcatataagaatagtcacgatagaacataagataattgactcgag-gaacgttttcgacccaaaaaccgtatcaagtggcaaacggc |
146005 |
T |
 |
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Target: scaffold1753 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:
Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
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Target Start/End: Original strand, 154 - 467
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
154 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaactcccagttatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
252 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
253 |
tatgtccatacataattaaatcatagtatccaccatcacacatcgacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
352 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcac |
350 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| | |||| |||||| | | || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
353 |
caccatttcaagcattc-ccatattccaagtaataggaaaaacaacatctcatgataaacatcatatccaaaatcaaatcactcattcatacaacttcac |
451 |
T |
 |
| Q |
351 |
ttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
452 |
ttagtcatacaagaat |
467 |
T |
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Target: scaffold1140; HSP #1
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1873 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
1970 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1971 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcttcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatgg |
2070 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
2071 |
tttcacca |
2078 |
T |
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acacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
2085 |
acacatctcatgataaacatcatatgcaatataatcattcattcatacaacttcacttagttatataa |
2152 |
T |
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Target: scaffold0218; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 6620 - 6415
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6620 |
aaggactcgataatgcgacaataatccacaatttcaacctcaatatataggacgacgcccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
6523 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6522 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacaagattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
6423 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
6422 |
tttcacca |
6415 |
T |
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Target: scaffold0218; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 6400 - 6332
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tacacatttcatgata-aacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
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6400 |
tacacatctcatgatagaacatcatatccac-ataatcattcattcatacaacttcacttagttatataa |
6332 |
T |
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Target: scaffold0003 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
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155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5874 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
5971 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttc |
255 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5972 |
atgcccacac--aaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatagtttc |
6069 |
T |
 |
| Q |
256 |
accattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
6070 |
accattc |
6076 |
T |
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Target: scaffold0003; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 55 - 257
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
217218 |
gactcgataatgcgacaacaatc-ataattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
217120 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataac-tcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
217119 |
catgcccatacacaattaaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgtttatcaataatcaacaatgtcattcaaaatcaactatcacatatagtt |
217020 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcac |
257 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
217019 |
tcac |
217016 |
T |
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Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Original strand, 6148 - 6292
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226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6148 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagataacatacacatctcatgataaacatcatattcaata |
6247 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6248 |
caatcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaataatc |
6292 |
T |
 |
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Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 217000 - 216932
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| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
217000 |
tacacatctcatgatagacatcatatccctcataatcattcattcatacaacttcacttagttatataa |
216932 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0761 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:
Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3163 - 2958
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3163 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacactcaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
3065 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
3064 |
aaacatgcccacacacaaatagatcatagtatttaccattcacacattaacttgattatgaacaatcaacaatgtcattcaacataaactatcacattta |
2965 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtttcac |
257 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
2964 |
gtttcac |
2958 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2882 - 2740
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa-- |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2882 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatggtaaaaatcatatccaaag |
2783 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
2782 |
tataatcactcattcatacaactccacttagtcatacaagaat |
2740 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
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Target Start/End: Original strand, 8771 - 8957
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8771 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
8870 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaacta |
241 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8871 |
catgtccatacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcatcatgttcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaacta |
8957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1404 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
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Target: scaffold1404; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 244 - 446
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
244 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-taacattatcaaga |
342 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatata |
250 |
Q |
| |
|
|||||| | || || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
343 |
aaacatacccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaataatgtcattcaacatcaactatcacatata |
442 |
T |
 |
| Q |
251 |
gttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
443 |
gttt |
446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
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Target: scaffold0091; HSP #1
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tatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatg |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43275 |
tatcaataatcaacaatgtcattaaacatcaactatcacatatgatttcaccattcaagcattccttacattctaagtaagatagcatacacatctcatg |
43176 |
T |
 |
| Q |
307 |
ataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacat |
406 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| || |||| |||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
43175 |
ataaacatcatatttaatacaatcattcattcatacaacttcacttagttatataaacatagccaccacaattcttaagacaattggttcaag-aaacat |
43077 |
T |
 |
| Q |
407 |
ttccgaccaaaaaccgtatcaagtgg |
432 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
43076 |
tttcgaccaaaaatcatatcaagtgg |
43051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 4)
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Target: scaffold0022; HSP #1
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297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
113883 |
aacatgattatcaattatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatgtagtttcaccgtttcaagcattccttacattcta-gtaagatagcataca |
113785 |
T |
 |
| Q |
298 |
catttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactca |
397 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| | | ||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
113784 |
catctcatgataaatatcatattcaatacaatcattcattcatacaacttcccttagtcatataagagtagtcacgataaatcataagacaattggctca |
113685 |
T |
 |
| Q |
398 |
agaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtg |
431 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
113684 |
ag-gaacacttccgaccaaaaaccttatcaagtg |
113652 |
T |
 |
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55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
108343 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaatttccaccacaatataaaggacaatttctaaatatattgatcatctccagaacaattgcattattaagaaat |
108442 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| | ||||| ||||| |||| | |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
108443 |
catgtccatacacaatcaaatcataattcaaataagattcattatcaccacatcatcatgatcattaataatcaacaatgttcttcaacatcaactacct |
108542 |
T |
 |
| Q |
245 |
catatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa--tacaatcattcattcata |
341 |
Q |
| |
|
||||||||| | || |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
108543 |
tatatagttttatcacttcaagcatttctcacattccaagtaagatagcatacatatctcatgataagcatcatatccaacatataatcattcattcata |
108642 |
T |
 |
| Q |
342 |
caacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
108643 |
caacttcacttaatcatataagaatagtcacgatgaatcataagccaattgactcaaagaaacatttccgac--aataccatatcaagtggcaaacggc |
108739 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
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151 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6620 |
aaggactcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
6522 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6521 |
aaacatgcccacacacaaataaatcaaagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
6441 |
T |
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153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
106370 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
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T |
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Target: scaffold0132 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
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Target: scaffold0132; HSP #1
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41399 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
41497 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtt |
253 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||| | ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41498 |
catgcccattcacaattaagtcatagcactcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaattatcacatatagtt |
41597 |
T |
 |
| Q |
254 |
tcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
41598 |
tcaccatt |
41605 |
T |
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Target: scaffold0132; HSP #2
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41677 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatccaagcattccttacattctaagtaa |
41737 |
T |
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Target: scaffold0076 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
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Target: scaffold0076; HSP #1
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37977 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
38074 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38075 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaactatatcatatag |
38171 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagca |
293 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttcaccaattcaagcattc-tcatattccaagtaagatagca |
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T |
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Target: scaffold1734 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
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Target: scaffold1734; HSP #1
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286 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
164 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatttcaaggattccttacattctaagtaa |
263 |
T |
 |
| Q |
287 |
gatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
264 |
gatagcatacatatctcatgataatcatcatatccaaaatacattcattcactcatacaacttcacttagtcatacaagaat |
345 |
T |
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Target: scaffold1734; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 1 - 86
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175 |
tcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
259 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1 |
tcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
86 |
T |
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Target: scaffold0106 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
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Target: scaffold0106; HSP #1
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40291 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaaaacccaattatattgttcatctacacaacatttgcattatcaagaaaa |
40389 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40390 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcat------tcaactatcacatatagttt |
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T |
 |
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Target: scaffold0106; HSP #2
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| Q |
294 |
tacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcact |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40502 |
tacacatttcatgatatacatcatatcccacataatcattcattcatacaactccact |
40559 |
T |
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Target: scaffold0031 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
69456 |
aggactcgatagtgcgacaacaattcacaattttaaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaa |
69555 |
T |
 |
| Q |
153 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatc |
243 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
69556 |
aacatgtccatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcatcatgataatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatc |
69646 |
T |
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Target: scaffold0031; HSP #2
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30768 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
30867 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatc |
243 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
30868 |
catgtccatacacaatcaaatcataacattcattatcaccacatgaacaagatcatcaataatcaacaatgtcattcaatattaactatc |
30957 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
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Target: scaffold0589; HSP #1
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acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6570 |
acaaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgaattatcaa |
6669 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaac |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| | |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6670 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataattcaattaagattccttatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaac |
6769 |
T |
 |
| Q |
240 |
tatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattca |
335 |
Q |
| |
|
|| | |||||||| | | || |||||| ||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
6770 |
tacctcatatagtcttatcatttcaagcatttcttacgttctaagtaagagaacttacaacattccatgataaacatcatatccaacatataatcattca |
6869 |
T |
 |
| Q |
336 |
ttcatacaacttcacttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
6870 |
ttcatacaacttcacttagtcatatatgaatagtcac |
6906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
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catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt-caagtattctttacattctaagtaa |
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
23898 |
catcatacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactataacatacaatttcaccagtacaagcatttcttacatcctaagtaa |
23997 |
T |
 |
| Q |
287 |
gatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataagg |
386 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| || | || || |||||| |
|
|
| T |
23998 |
gatagcatactcatctcatgatgaacatcatattcaatacaatcattcaatcatacaacttcacttagttatacaagaatagtctccacaatccataaga |
24097 |
T |
 |
| Q |
387 |
taattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaa |
419 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24098 |
caattggctcaag--aacatttccgaccaaaaa |
24128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0303 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:
Target: scaffold0303; HSP #1
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226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaata |
325 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1666 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaaccattccttacattataagtaagttagcatacatatctcatgataaacatcatatccaata |
1567 |
T |
 |
| Q |
326 |
caatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataag |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |
|
|
| T |
1566 |
caatcattcattcatacaacttcacttagccatataagaatagtcaccacaattcataag |
1507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
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Target: scaffold0610; HSP #1
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Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2095 |
gactctataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcgacaacatttgcattatcaagaaaa |
1996 |
T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
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Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
1995 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcactcaacaacaattatctcatatggttt |
1896 |
T |
 |
| Q |
255 |
caccatt |
261 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
1895 |
caccatt |
1889 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 1884 - 1817
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329 |
tcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactc |
396 |
Q |
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|||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1884 |
tcatacattcatacaactttacttagtcatataagaatagtcacaacaattcataaggtaattgactc |
1817 |
T |
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Target: scaffold0107; HSP #1
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30041 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
30138 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30139 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
30223 |
T |
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Target: scaffold0120 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
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216 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
29942 |
attgatcatctccacaacatttgcattatcataaaatcatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattaccaataatt |
30041 |
T |
 |
| Q |
217 |
caacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacc-attcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatt |
301 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30042 |
caacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccaattcaagcatttcttgcatcctaagtaagatagcatacacatt |
30127 |
T |
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Target: scaffold0120; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 18263 - 18410
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391 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
18263 |
catacacatctcatgataaacatcatatccaaatcaatcattcaatcatacaacttcagttagtcatataagaataggcataacaattcataagacaatt |
18362 |
T |
 |
| Q |
392 |
gactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18363 |
ggctcaag-aaacatttccgaccaaaatccatatcaagtggcaaacggc |
18410 |
T |
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Target: scaffold0120; HSP #3
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124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27260 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaaaacccaattatattgatt |
27336 |
T |
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Target: scaffold0808 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:
Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
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149 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
2942 |
acaaagactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattttattatcaa |
2843 |
T |
 |
| Q |
150 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaac |
239 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| ||| || | ||| | ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2842 |
gaaatcatttccatacacaatcaatttatatttcaaataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaac |
2743 |
T |
 |
| Q |
240 |
tatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattca |
335 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |
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|
| T |
2742 |
tacctcatatagttttaccatttcaaacattttttacattctaagttagagaaaatacaacatcccatgataaacatcatgtccaacatataatcattca |
2643 |
T |
 |
| Q |
336 |
ttcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaa |
435 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2642 |
ctcatacaacttcacttagtcatataagaatagtcatgataattcataagccgattgactcaaaggaacatttccgac--aataccgtatcaagtggcaa |
2545 |
T |
 |
| Q |
436 |
ccggc |
440 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
2544 |
acggc |
2540 |
T |
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Target: scaffold0554 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
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306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |
|
|
| T |
754 |
atcaataatcaacaatgtcattcaacattaactatctcatatagttttaccatttcaagcatttcttacagtctaagtaagagaacatacacatctcgtg |
853 |
T |
 |
| Q |
307 |
ataaacatcatatcca--atacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaac |
404 |
Q |
| |
|
| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | | ||||||| ||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
854 |
acattcatcatacccaccatacaatcattcattcatacaacttcacttagtcgtataagaatagtcacgataaatcataagacaattggctcaag--aac |
951 |
T |
 |
| Q |
405 |
atttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaacc |
437 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
952 |
atttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaacc |
984 |
T |
 |
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Target: scaffold0269 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0269
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Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
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Target Start/End: Original strand, 935 - 1077
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
935 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatccaagcattccttacattctaagtaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
1034 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
1035 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaat |
1077 |
T |
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Target: scaffold0269; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 226 - 366
Target Start/End: Original strand, 15191 - 15333
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cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatcc--aa |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
15191 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatccaagcattccttacattctaagtaaaataacatacatatctcatgataaacatcatatccaaaa |
15290 |
T |
 |
| Q |
324 |
tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
15291 |
tataatcactcattcatacaacttcacttagtcatacaagaat |
15333 |
T |
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Target: scaffold0269; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 55 - 165
Target Start/End: Original strand, 771 - 880
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| Q |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
771 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
869 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatac |
165 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
870 |
catgcccatac |
880 |
T |
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Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 165
Target Start/End: Original strand, 15027 - 15136
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15027 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
15125 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatac |
165 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
15126 |
catgcccatac |
15136 |
T |
 |
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Target: scaffold0269; HSP #5
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Target Start/End: Original strand, 12021 - 12129
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331 |
attcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagt |
430 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||| || |||| || |
|
|
| T |
12021 |
attcattcatacaacttcacttagtcatacaagaatggtcacaataactcataagacaattggctgaag-aaacatttccgacaaaaatccaaatcatgt |
12119 |
T |
 |
| Q |
431 |
ggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
12120 |
ggcaaacggc |
12129 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
106689 |
aaggactcgataatgcgacaaaaatccacagtttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
106787 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
106788 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
106867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0750 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0750
Description:
Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6805 - 6577
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6805 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaaaatttgcattatcatgaaaa |
6706 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
6705 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcac-----aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattc-acatcaattatctcatatagttt |
6612 |
T |
 |
| Q |
255 |
cacc-attcaagtattctttacattctaagtaaga |
288 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6611 |
taccaattcaagcatttcttacattctaagtaaga |
6577 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0750; HSP #2
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274 |
acattctaagtaagatagcataca-catttcatgataaacatcatatccaa--tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatc |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5676 |
acattctaagtaagagcacatacaacattccatgataa-catcacatccaacatatagtcattcgttcatacaacttcacttagtcatataagaataatc |
5578 |
T |
 |
| Q |
371 |
acaaccattcataaggtaattgactcaagaaaacatttccgaccaaaaaccgtatcaagtggca |
434 |
Q |
| |
|
| | | | |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5577 |
gcgataaaacctaagacaattggctcaag-aaacatttctgaccaaaaactgtatcaagtggca |
5515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
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Target: scaffold0215; HSP #1
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17561 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaatgatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
17464 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||||| | || || || ||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17463 |
aaacatgtctacacacagttacatcacagcattcatcatcacacatcaacacgattatcagtaatcaacaatgtcattcaacatcaactatatcatatag |
17364 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
17363 |
tttcaccattc |
17353 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
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Target: scaffold0498; HSP #1
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55 |
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7673 |
gactcgataatacgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatatagttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
7771 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca-acatcaactatcacatatagt |
252 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||| || ||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7772 |
catgcccatacacaattaaaatcatagtattcatcaccacacaacaacatgattatcaacaatcaataaggtcttccactcatcaactatcacatatagt |
7871 |
T |
 |
| Q |
253 |
ttca |
256 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
7872 |
ttca |
7875 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498; HSP #2
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292 |
catacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataa |
362 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
7890 |
catacacatctcatgatagacatcatatctcacataatcattcattcatacaacttcacttagttatataa |
7960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0467 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:
Target: scaffold0467; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 11504 - 11322
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11504 |
gactcgataatgcaacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaaggaaa |
11406 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||| || | ||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11405 |
catgcccacatacaattaaatcatagtattcatcatcacacctcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
11322 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
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Target: scaffold0266; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 5067 - 4862
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5067 |
gactcgacaatgcgacaataatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
4969 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaa--ataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca-acatcaactatcacatatag |
251 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||||| || ||| | || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4968 |
catgcccatacacaattaaaaatcatagtattcatcaccgcacatcaacatgattatcaacaatcaataaggtcttccactcatcaactatcacatatag |
4869 |
T |
 |
| Q |
252 |
tttcacc |
258 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
4868 |
tttcacc |
4862 |
T |
 |
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Target: scaffold0266; HSP #2
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292 |
catacacatttcatgataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcactta |
353 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4849 |
catacacatctcatgatagacatcatttctcacataatcattcattcatacaacttcactta |
4788 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:
Target: scaffold0104; HSP #1
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52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
51719 |
aaggaatcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
51817 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
51818 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttggttatcaacaatcaacaatatcattca |
51897 |
T |
 |
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Target: scaffold0462 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0462; HSP #1
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56 |
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155 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4823 |
actcgataacacgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaac |
4922 |
T |
 |
| Q |
156 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacat |
203 |
Q |
| |
|
|||| || |||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4923 |
atgcccacacgcaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacat |
4970 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0092; HSP #1
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| Q |
58 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacat |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
2114 |
tcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttttattattaagaaatcat |
2213 |
T |
 |
| Q |
158 |
gctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacat |
247 |
Q |
| |
|
||||| ||| || | ||| | |||| |||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
2214 |
ttccatacacaatcaatttatattttaattaagattctttatcacaacatcaacatgatcatctataatcaacaatgtcattcaacatcaactacctcat |
2313 |
T |
 |
| Q |
248 |
atagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-acatttcatgataaacatcatatcca--atacaatcattcattcataca |
343 |
Q |
| |
|
||||| | | || |||||| ||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2314 |
atagtcttatcatttcaagcatttcttacgttctaagtaagagaacttacaacattccatgataaacatcatatccaacatataatcattcattcataca |
2413 |
T |
 |
| Q |
344 |
acttcacttaatcatataagaataatcac |
372 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
2414 |
acttctcttagtcatatatgaatagtcac |
2442 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0051 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:
Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 180
Target Start/End: Original strand, 58899 - 59016
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63 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctca |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
58899 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataagacgacacccaattatattgatcatctccgcatcatttgcattatcaagaaaacatgccca |
58998 |
T |
 |
| Q |
163 |
tacgcaaataactcatag |
180 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
58999 |
tacacaaataattcatag |
59016 |
T |
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Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 201 - 314
Target Start/End: Original strand, 59561 - 59675
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| Q |
201 |
catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacaca |
299 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
59561 |
catgatcattaataaccaacaatgtcattcaacatcaattatcttatatagtttcaccatttcaaacattccttacattctaagtaagatatcatacaca |
59660 |
T |
 |
| Q |
300 |
tttcatgataaacat |
314 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |
|
|
| T |
59661 |
tctcatgataaacat |
59675 |
T |
 |
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Target: scaffold0051; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 59375 - 59422
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176 |
catagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaat |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
59375 |
catagtattcaccatcacacatcatcatgatcatcaataatcatcaat |
59422 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:
Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
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Target Start/End: Complemental strand, 1672 - 1575
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| Q |
226 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagtattctttacattctaagtaagatagcatacacatttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1672 |
cattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattcaagcattccttacattctatgcaagatagcatacatatctcatgataaacatcatatccaa |
1575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 259
Target Start/End: Original strand, 34334 - 34466
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| Q |
128 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgtc |
226 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34334 |
tccacatcatttgtattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtt |
34433 |
T |
 |
| Q |
227 |
attcaacatcaactatcacatatagtttcacca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34434 |
attcaacattaactatcacatatagtttcacca |
34466 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:
Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1078
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt-----tcac-ctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
145 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1263 |
aaggactcgataatgcgaccacaattcacaatttcaatctcaatctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcatta |
1165 |
T |
 |
| Q |
146 |
tcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
1164 |
ccaaggaaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacattatcattca |
1078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0183 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:
Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
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Target Start/End: Original strand, 5700 - 5867
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| Q |
68 |
gacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacg |
166 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
5700 |
gacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctcaacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacac- |
5796 |
T |
 |
| Q |
167 |
caaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
5797 |
-aaataaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatacaaaatcaa |
5867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
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Target Start/End: Complemental strand, 9397 - 9291
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
9397 |
aaggactcgataatgctacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacagcacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
9299 |
T |
 |
| Q |
152 |
aaacatgc |
159 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
9298 |
aaacatgc |
9291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0225 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:
Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
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Target Start/End: Original strand, 14987 - 15073
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatt |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14987 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacttcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt |
15073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
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Target Start/End: Original strand, 20391 - 20600
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391 |
gactcgataatgcgacatcaactcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatatccacaacaattgcattatcaagaaat |
20490 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatca |
244 |
Q |
| |
|
|| | ||||| | | || ||||| | |||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20491 |
cacgtccatacacgatcaagtcataattcaaataagattcactatcacatcatcaacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaactacct |
20590 |
T |
 |
| Q |
245 |
catatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
20591 |
catatagttt |
20600 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 254
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27220 |
gactcgataatgcgacatcaactcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatatccacaacaattgcattatcaagaaat |
27319 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatca |
244 |
Q |
| |
|
|| | ||||| | | || ||||| | |||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27320 |
cacgtccatacacgatcaagtcataattcaaataagattcactatcacatcatcaacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaactacct |
27419 |
T |
 |
| Q |
245 |
catatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
27420 |
catatagttt |
27429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
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Target: scaffold0483; HSP #1
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4218 |
gactcgataatgcgacaagaatc-acaattttctcctcaatatatatgacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattaccaagaaaa |
4120 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagta |
182 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
4119 |
catgcgcatacacaattaaatcatagta |
4092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
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Query Start/End: Original strand, 55 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 49058 - 48932
Alignment:
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55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
49058 |
gactcgataatgcgacaagaatc-acaattttctcctcaatatatatgacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattaccaagaaaa |
48960 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaaataactcatagta |
182 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
48959 |
catgcgcatacacaattaaatcatagta |
48932 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 4534 - 4648
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
4534 |
gactcgataatgtgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattattttgatcatctccacaacatttgcatcatcaataaaa |
4633 |
T |
 |
| Q |
155 |
catgctcatacgcaa |
169 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
4634 |
tatgtccatacgcaa |
4648 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
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Target Start/End: Original strand, 53462 - 53593
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| Q |
306 |
gataaacatcatatccaatacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaataatcacaaccattcataaggtaattgactcaagaaaaca |
405 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
53462 |
gataaacatcacattcaa-acaatcattcaatcatacaacttcacttagtcatataagaatagtcacaacaattcataagacaattggcttaag-aaaca |
53559 |
T |
 |
| Q |
406 |
tttccgaccaaaaaccgtatcaagtggcaaccggc |
440 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
53560 |
tttccgacc-aaaaccgtgtcaagtggcaaacggc |
53593 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 53141 - 53203
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| Q |
199 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
261 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53141 |
aacatgatcatcaataatcaacaatgttatccaacatcaactatcacatatagtttcaccatt |
53203 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066; HSP #3
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| Q |
188 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
237 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53279 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
53328 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattat |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
197572 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattat |
197482 |
T |
 |
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Target: scaffold0004; HSP #2
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| Q |
311 |
acatcatatccaa--tacaatcattcattcatacaacttcacttaatcatataagaat |
366 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
331021 |
acatcatatccaaaatacattcattcattcatacaacttcacttagtcatacaagaat |
330964 |
T |
 |
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Target: scaffold0772 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
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| Q |
60 |
gataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgc |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4469 |
gataatgcgacaacaattctcaatctcgac-tcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaacatgc |
4566 |
T |
 |
| Q |
160 |
tcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca |
196 |
Q |
| |
|
|| || || ||| ||| |||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
4567 |
ccacacacagttaaatcacagtatttatcatcacaca |
4603 |
T |
 |
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Target: scaffold0507 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
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Target: scaffold0507; HSP #1
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| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4801 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacattagcattatcaagaaa |
4728 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0095 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:
Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
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Target Start/End: Complemental strand, 7114 - 7041
Alignment:
| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7114 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttcaaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
7041 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0521 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:
Target: scaffold0521; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 7290 - 7387
Alignment:
| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
7290 |
gactcgataatgcgacatcaccccacaatttccacaacaatataaaggacaacatccaaatatattgatcacctctacaacaattacattatcaagaa |
7387 |
T |
 |
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Target: scaffold0058 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
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Target: scaffold0058; HSP #1
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| Q |
80 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
71728 |
caattttcacaacaatataaaggacaccttccaattatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa |
71655 |
T |
 |
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Target: scaffold0243 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
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Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
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| Q |
81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3739 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa |
3667 |
T |
 |
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Target: scaffold2147 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold2147; HSP #1
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| Q |
52 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacct |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
991 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacct |
1030 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold1752 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
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Target: scaffold1752; HSP #1
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| Q |
199 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagttt |
254 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
429 |
aacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaactacctcatatagttt |
484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0090; HSP #1
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| Q |
55 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
6116 |
gactcgataatgcaacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgataatctccacaacaatttcattatcaag |
6021 |
T |
 |
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Description:
Target: scaffold0327; HSP #1
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| Q |
92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
4759 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccacaacatctgcattctcaagaaa |
4820 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
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81 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
118049 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattattaagaaa |
117977 |
T |
 |
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Target: scaffold0151 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0151; HSP #1
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202 |
atgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcacca-ttcaagtattctttacattctaagtaagatagcatac-aca |
299 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| | | |||| |||||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
23786 |
atgatcatcaataatcatcaatatcattcaacatcaactacatcagatagtttcaccacttcaattatttctcatattccaagtaagagaacatacaaca |
23687 |
T |
 |
| Q |
300 |
tttcatgataaacatcatatccaa |
323 |
Q |
| |
|
| | |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23686 |
tcttatgataaatatcatatccaa |
23663 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0456; HSP #1
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103 |
acaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
153 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12936 |
acaacttccaattatattgatcatctccacaacattagcattatcaagaaa |
12986 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0053; HSP #1
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aatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
78265 |
aatataaaggacagcctccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaa |
78206 |
T |
 |
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212 |
ataatcaacaatgtcattcaacatcaactatcacatatagtttcaccattc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6450 |
ataatcatcaatatcattcaacattaactatgtcatatagtttcaccattc |
6400 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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92 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34203 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaag |
34261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0369 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
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Target: scaffold0369; HSP #1
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caaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattca |
231 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2696 |
caaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca |
2761 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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