View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11386A_low_326 (Length: 249)

Name: NF11386A_low_326
Description: NF11386A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11386A_low_326
NF11386A_low_326
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (19-237)||(38968377-38968595)
chr5 (19-237)||(19228248-19228465)
chr5 (19-237)||(42537429-42537646)
chr5 (19-237)||(512348-512565)
chr5 (19-236)||(8701801-8702017)
chr5 (19-237)||(7757604-7757821)
chr5 (19-237)||(14265-14482)
chr5 (19-237)||(8580081-8580298)
chr5 (19-237)||(42942063-42942279)
chr5 (48-237)||(17658631-17658819)
chr5 (19-237)||(28876923-28877140)
chr5 (19-237)||(28241375-28241592)
chr5 (19-237)||(40624490-40624716)
chr5 (19-237)||(20422219-20422446)
chr5 (138-237)||(19040693-19040792)
chr5 (138-237)||(5197371-5197470)
chr5 (138-237)||(27673229-27673328)
chr5 (140-237)||(30705536-30705633)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (19-237)||(6320139-6320356)
chr6 (19-237)||(24088358-24088575)
chr6 (19-237)||(31768981-31769202)
chr6 (138-237)||(21601002-21601101)
chr6 (138-237)||(24722326-24722425)
chr6 (138-237)||(26423395-26423494)
chr6 (48-214)||(3381082-3381258)
chr6 (138-237)||(3501567-3501666)
chr6 (142-237)||(6201550-6201645)
chr6 (142-237)||(11688517-11688612)
chr6 (138-237)||(22301578-22301677)
chr6 (138-237)||(27617113-27617212)
chr6 (142-237)||(30829228-30829323)
chr6 (23-103)||(30424143-30424223)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (19-237)||(20917593-20917810)
chr3 (19-237)||(20926555-20926772)
chr3 (19-237)||(49196023-49196240)
chr3 (19-237)||(48889023-48889240)
chr3 (19-237)||(30255578-30255795)
chr3 (19-237)||(42756433-42756648)
chr3 (19-237)||(42165442-42165659)
chr3 (19-237)||(4007899-4008116)
chr3 (19-236)||(44229993-44230209)
chr3 (19-237)||(47073783-47074000)
chr3 (19-237)||(50963234-50963451)
chr3 (19-230)||(50216461-50216671)
chr3 (19-237)||(597038-597255)
chr3 (19-237)||(3975986-3976203)
chr3 (58-237)||(42805838-42806016)
chr3 (19-228)||(3501477-3501685)
chr3 (19-184)||(51807249-51807413)
chr3 (19-237)||(48563223-48563424)
chr3 (138-237)||(16611475-16611574)
chr3 (138-237)||(22047679-22047778)
chr3 (140-237)||(17567640-17567737)
chr3 (138-237)||(41612765-41612864)
chr3 (138-237)||(52390972-52391071)
chr3 (19-237)||(31045170-31045386)
chr3 (138-237)||(2274490-2274589)
chr3 (138-237)||(29009257-29009356)
chr3 (138-237)||(20351042-20351141)
chr3 (138-237)||(4178201-4178300)
chr3 (138-237)||(36127834-36127933)
chr3 (142-237)||(42903766-42903861)
chr3 (142-237)||(46389363-46389458)
chr3 (142-237)||(50480360-50480455)
chr3 (142-237)||(54386525-54386620)
chr3 (142-237)||(49144039-49144133)
chr3 (142-237)||(34045778-34045872)
chr3 (142-237)||(46701601-46701696)
chr3 (138-237)||(4172203-4172302)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (19-238)||(45825156-45825375)
chr1 (19-237)||(35258449-35258666)
chr1 (19-237)||(51320994-51321211)
chr1 (19-235)||(23275681-23275897)
chr1 (19-237)||(47502595-47502812)
chr1 (19-238)||(19527118-19527336)
chr1 (19-237)||(31783304-31783521)
chr1 (19-237)||(52802411-52802628)
chr1 (19-237)||(49857522-49857736)
chr1 (19-237)||(19925022-19925239)
chr1 (19-237)||(30890341-30890558)
chr1 (21-238)||(17514271-17514497)
chr1 (19-131)||(29622105-29622217)
chr1 (138-237)||(50343545-50343644)
chr1 (125-237)||(47656256-47656367)
chr1 (138-237)||(21141425-21141524)
chr1 (19-107)||(11183461-11183549)
chr1 (19-103)||(11196160-11196244)
chr1 (138-237)||(2365634-2365733)
chr1 (138-237)||(19156413-19156512)
chr1 (139-237)||(22524534-22524630)
chr1 (138-237)||(97524-97623)
chr1 (139-233)||(2424948-2425040)
chr1 (142-237)||(3731957-3732052)
chr1 (138-237)||(13639599-13639698)
chr1 (142-237)||(26876059-26876154)
chr1 (138-237)||(38127058-38127158)
chr1 (20-73)||(22524407-22524460)
chr1 (142-214)||(8474187-8474259)
chr1 (19-73)||(2425114-2425168)
chr1 (167-237)||(25166976-25167046)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (19-237)||(36977878-36978095)
chr7 (19-237)||(47672661-47672878)
chr7 (19-237)||(39460808-39461025)
chr7 (19-237)||(9494371-9494588)
chr7 (19-237)||(17835356-17835573)
chr7 (19-237)||(37340584-37340801)
chr7 (19-237)||(10517260-10517477)
chr7 (19-237)||(47776614-47776831)
chr7 (19-235)||(27453197-27453412)
chr7 (19-237)||(34738646-34738863)
chr7 (19-237)||(15073804-15074021)
chr7 (19-237)||(42507603-42507820)
chr7 (48-237)||(14689634-14689822)
chr7 (19-237)||(17741024-17741251)
chr7 (138-237)||(556222-556321)
chr7 (138-237)||(5541116-5541215)
chr7 (138-237)||(41880888-41880987)
chr7 (138-237)||(48403755-48403854)
chr7 (125-233)||(46740127-46740234)
chr7 (142-237)||(35609992-35610087)
chr7 (140-237)||(16675186-16675283)
chr7 (140-237)||(17649554-17649651)
chr7 (154-237)||(45257401-45257484)
chr7 (138-205)||(17465329-17465396)
chr7 (138-205)||(17587818-17587885)
chr7 (175-237)||(9370966-9371028)
chr7 (138-187)||(41734561-41734610)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (19-237)||(48256147-48256364)
chr4 (19-237)||(51683482-51683699)
chr4 (19-237)||(55407363-55407580)
chr4 (19-237)||(67871-68088)
chr4 (19-237)||(21022464-21022681)
chr4 (19-237)||(50275014-50275231)
chr4 (19-237)||(37021659-37021876)
chr4 (19-237)||(40357856-40358073)
chr4 (31-237)||(46436536-46436741)
chr4 (19-237)||(50901760-50901976)
chr4 (48-237)||(30726317-30726505)
chr4 (19-237)||(1089160-1089377)
chr4 (19-237)||(1308690-1308907)
chr4 (19-237)||(21538028-21538255)
chr4 (19-233)||(10753007-10753230)
chr4 (19-233)||(10966776-10966999)
chr4 (19-237)||(14297405-14297632)
chr4 (19-237)||(14315654-14315881)
chr4 (19-237)||(11083582-11083809)
chr4 (138-237)||(11050099-11050198)
chr4 (138-237)||(50023119-50023218)
chr4 (138-237)||(41798571-41798670)
chr4 (19-233)||(4719958-4720161)
chr4 (138-237)||(9892844-9892943)
chr4 (138-237)||(41933199-41933298)
chr4 (138-237)||(50030237-50030336)
chr4 (142-237)||(6181366-6181461)
chr4 (138-237)||(30704421-30704520)
chr4 (142-237)||(49090822-49090917)
chr4 (138-237)||(49165431-49165530)
chr4 (125-237)||(44679651-44679762)
chr4 (138-237)||(3184354-3184453)
chr4 (138-237)||(3185460-3185559)
chr4 (138-237)||(3185668-3185767)
chr4 (142-237)||(31422099-31422195)
chr4 (154-233)||(50193893-50193972)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (23-237)||(5303797-5304010)
chr8 (19-237)||(40076826-40077043)
chr8 (19-237)||(39601995-39602212)
chr8 (19-237)||(34822593-34822810)
chr8 (19-237)||(39846562-39846779)
chr8 (19-237)||(43211785-43212002)
chr8 (20-237)||(15036304-15036520)
chr8 (19-237)||(43188329-43188546)
chr8 (19-237)||(39252292-39252508)
chr8 (19-237)||(39938792-39939009)
chr8 (19-186)||(41249700-41249866)
chr8 (19-237)||(42485114-42485331)
chr8 (48-237)||(489205-489393)
chr8 (19-237)||(45064521-45064728)
chr8 (19-237)||(37327084-37327280)
chr8 (19-235)||(24249763-24249977)
chr8 (19-132)||(25864620-25864732)
chr8 (19-237)||(2984402-2984619)
chr8 (138-237)||(35552063-35552162)
chr8 (138-237)||(20857683-20857782)
chr8 (142-237)||(25103-25198)
chr8 (142-237)||(1052926-1053021)
chr8 (142-237)||(23021897-23021992)
chr8 (142-237)||(26659848-26659943)
chr8 (138-237)||(45128147-45128246)
chr8 (138-230)||(5677468-5677560)
chr8 (154-237)||(34371470-34371553)
chr8 (48-104)||(22495216-22495272)
chr8 (36-82)||(35026740-35026786)
chr8 (138-233)||(22495315-22495410)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (19-237)||(15199-15416)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (19-237)||(39947880-39948097)
chr2 (19-237)||(28468921-28469138)
chr2 (19-228)||(25965100-25965308)
chr2 (19-237)||(21998470-21998687)
chr2 (19-237)||(45428871-45429088)
chr2 (19-237)||(32955934-32956147)
chr2 (19-237)||(17420847-17421064)
chr2 (19-192)||(7185309-7185481)
chr2 (19-132)||(45137112-45137225)
chr2 (138-237)||(29401180-29401279)
chr2 (140-237)||(36655926-36656023)
chr2 (138-237)||(20938294-20938393)
chr2 (138-237)||(25515386-25515484)
chr2 (138-237)||(45284570-45284669)
chr2 (138-237)||(45291933-45292032)
chr2 (142-237)||(3940305-3940400)
chr2 (142-237)||(5352367-5352462)
chr2 (138-237)||(10828601-10828700)
chr2 (138-237)||(15831526-15831625)
chr2 (142-237)||(30496523-30496618)
chr2 (142-237)||(43978922-43979017)
chr2 (149-224)||(45136881-45136956)
chr2 (142-237)||(43539314-43539409)
chr2 (19-103)||(35464313-35464397)
chr2 (19-107)||(31367309-31367397)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (19-237)||(7698-7915)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (19-237)||(304-521)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (19-118)||(8483-8582)
scaffold0155 (147-237)||(10761-10851)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (138-237)||(18509-18608)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (140-237)||(4230-4327)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (19-233)||(251056-251268)
scaffold0007 (166-214)||(246180-246228)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (19-101)||(40746-40828)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 38968377 - 38968595
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968377 agtttgcatgtggttagggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 38968476  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968477 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 38968576  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38968577 tatattgattatttagtta 38968595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19228465 - 19228248
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228465 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 19228366  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228365 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 19228267  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19228266 tatattgattatttagtta 19228248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 42537429 - 42537646
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537429 agtttgcatgttgttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 42537528  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42537529 aaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaatt 42537627  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42537628 tatattgattatttagtta 42537646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 512565 - 512348
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  512565 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtt 512466  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  512465 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacccaaagtgtttgatcaaatacctcaatgaaaat 512367  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  512366 tatattgcttatttagtta 512348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8702017 - 8701801
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8702017 agtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagtagttgcatatgttgtt 8701918  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8701917 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 8701819  T
Q  219 tatattgattatttagtt 236  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8701818 tatattgattatttagtt 8701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 7757604 - 7757821
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757604 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 7757703  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  7757704 taaattataatgtg-gttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaacatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 7757802  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  7757803 tttattgattatttagtta 7757821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14482 - 14265
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14482 agtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgaaaatttgatgattgcatgcgtagtttaggaattgataaataaatgtagttgttgcctatgttgtt 14383  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14382 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataat 14284  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  14283 tttattgattatttagtta 14265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8580298 - 8580081
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8580298 agtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtt 8580199  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  8580198 taaatcataatgtagctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 8580100  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  8580099 tttattgattatttagtta 8580081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42942279 - 42942063
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42942279 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgctgtt 42942180  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  42942179 taaatcataatatggctt-tgaattgtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 42942081  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  42942080 tttattgatt-tttagtta 42942063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Original strand, 17658631 - 17658819
Alignment:
Q  48 aattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtgg 147  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  17658631 aattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatttattgataaatgaatgtagttgtggcctatgttgtttaaatcataatgtggttt-tgaatggtgg 17658729  T
Q  148 caaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17658730 caaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 17658819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 28876923 - 28877140
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  28876923 agtttgtatgtggttagggttgaattcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattaaatgtagttgttgcctatattgtt 28877022  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  28877023 taaatcataatgtgggtt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 28877121  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  28877122 tttattgattatttagtta 28877140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28241592 - 28241375
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28241592 agtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtt 28241493  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||    
T  28241492 taaattataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaat 28241394  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  28241393 tttattgattatttagtta 28241375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40624716 - 40624490
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40624716 agtttgcatgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgctgtt 40624618  T
Q  119 aaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcct 208  Q
     |||| ||          ||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40624617 taaatgatgtttaatgataatgtggttt-tgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcct 40624519  T
Q  209 caatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
     ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  40624518 taataacaattttattgattatttagtta 40624490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 20422219 - 20422446
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| || |   |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20422219 agtttgcatgtggttagggttgatgtaggaattgacaatttgatgattggatgtgtagtgtatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttatt 20422318  T
Q  119 aaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcct 208  Q
     |||| ||          ||||| | || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  20422319 taaatgatgttctagtataatgt-agttttaaatggtgccaaatgaacacattttgaatatgtttgatacttttcacacaaagtgtttgataaaatgccc 20422417  T
Q  209 caatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20422418 caatgacaattattttgattatttagtta 20422446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19040792 - 19040693
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  19040792 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattgattatttagtta 19040693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 5197371 - 5197470
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5197371 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 5197470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27673328 - 27673229
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27673328 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 27673229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 30705536 - 30705633
Alignment:
Q  140 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30705536 aatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 30705633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6320356 - 6320139
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320356 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 6320257  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6320256 aaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagcgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 6320158  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6320157 tatattgattatttagtta 6320139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24088575 - 24088358
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24088575 agtttgcatgtggttagtgttgattttaaaattgacaatttgataattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtt 24088476  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24088475 taaatgataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgtttgatcaaatgtctcaatgaaaat 24088377  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24088376 tatattgattatttagtta 24088358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 31768981 - 31769202
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgc----atgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 114  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31768981 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaatcgacaatttgatgattgcttgcatgtgtggtttaggaattgacaaatgaatgtagttgttgcttatgt 31769080  T
Q  115 tgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 214  Q
    |||| |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31769081 tgtttaaatcataatgtggttt-tgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 31769179  T
Q  215 aaattatattgattatttagtta 237  Q
     || | |||||||||||||||||    
T  31769180 caaatttattgattatttagtta 31769202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 21601002 - 21601101
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21601002 tgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaatgagaattatattgattatttagtta 21601101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 24722326 - 24722425
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24722326 tgaatggtgtcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcgtcaatgacaattttattgattatttagtta 24722425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 26423395 - 26423494
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  26423395 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgtttatttagtta 26423494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 3381082 - 3381258
Alignment:
Q  48 aattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatca-------taatgt---gactta 137  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |       | ||||   ||   |    
T  3381082 aattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgcattgatgaatgaatatagttgttgcctatgctgtttcaatgaatgtagtttatgtattgataaa 3381181  T
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3381182 tgaatggtgtcaaatgaacacaatttgaatatgttttatatattgcacacaaagtggttgataaaatgcctcaatga 3381258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 3501567 - 3501666
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  3501567 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaaggacaattttattgtttatttagtta 3501666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 6201550 - 6201645
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6201550 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 6201645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 11688517 - 11688612
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11688517 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 11688612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 22301578 - 22301677
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22301578 tgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 22301677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 27617113 - 27617212
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  27617113 tgaatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattgattatttagtta 27617212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30829323 - 30829228
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30829323 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 30829228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 30424223 - 30424143
Alignment:
Q  23 tgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagtt 103  Q
    ||||||||||||  |||||| |   |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30424223 tgcatgtggttagagtttatgtatgaattgacattttgatgattgcatgtatagtttaggaattgataaatgaatgtagtt 30424143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20917810 - 20917593
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917810 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 20917711  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917710 aaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 20917612  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20917611 tatattgattatttagtta 20917593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20926772 - 20926555
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926772 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 20926673  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926672 aaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 20926574  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20926573 tatattgattatttagtta 20926555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 49196240 - 49196023
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49196240 agtttgcatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 49196141  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49196140 aaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcttcaatgaaaat 49196042  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  49196041 tatattgattatttagtta 49196023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 48889023 - 48889240
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889023 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 48889122  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48889123 taaatcataatgtgactt-tgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaaggcctcaatgaaaat 48889221  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  48889222 tatattgattatttagtta 48889240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30255795 - 30255578
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255795 agtttgcatgtggttagggttgattttaaagttgacaatttgatgattgcatgtttagtttgtgaattgctaaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 30255696  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30255695 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaatt 30255597  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30255596 tatattgattatttagtta 30255578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 42756433 - 42756648
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42756433 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatggatgtagttgttgtctatgttgtt 42756532  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42756533 taaatcataatgtcgctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 42756631  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
      |||||||||||||||||    
T  42756632 --tattgattatttagtta 42756648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 42165442 - 42165659
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165442 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 42165541  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  42165542 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 42165640  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  42165641 tttattgattatttagtta 42165659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4008116 - 4007899
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4008116 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 4008017  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  4008016 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 4007918  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  4007917 tttattgattatttagtta 4007899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Original strand, 44229993 - 44230209
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44229993 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 44230092  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  44230093 taaaacataatgtggctt-tgaacggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaatgtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 44230191  T
Q  219 tatattgattatttagtt 236  Q
    | ||||||||||||||||    
T  44230192 tttattgattatttagtt 44230209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47074000 - 47073783
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47074000 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgaatgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatattgtt 47073901  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  47073900 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 47073802  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  47073801 tttattgattatttagtta 47073783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 50963234 - 50963451
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963234 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 50963333  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  50963334 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtttgataaaatgcctcagtgacaat 50963432  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||  ||||||||||||    
T  50963433 tttataaattatttagtta 50963451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50216671 - 50216461
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50216671 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgtgtaatttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 50216572  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  50216571 taaatcataatgtg-gttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcttcaatgacaat 50216473  T
Q  219 tatattgattat 230  Q
    | ||||||||||    
T  50216472 tttattgattat 50216461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 597038 - 597255
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  597038 agtttgcatgtggttagggttgatttaaatattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcccatgttgtt 597137  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  597138 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaaagaacacattttgattatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 597236  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  597237 tttattgattatttagtta 597255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 3975986 - 3976203
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||| |||    
T  3975986 agtttgtatgtggttagggttgatttaaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattggcaattgaatgtagttgttgcctatgtagtt 3976085  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  3976086 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 3976184  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3976185 tttattgattatttagtta 3976203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 58 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42806016 - 42805838
Alignment:
Q  58 ttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaaca 157  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  42806016 ttgataattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaaca 42805918  T
Q  158 caatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805917 caatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 42805838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3501685 - 3501477
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3501685 agtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtt 3501586  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  3501585 taaatcataatgtgggtt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 3501487  T
Q  219 tatattgatt 228  Q
    | ||||||||    
T  3501486 tttattgatt 3501477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 51807249 - 51807413
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51807249 agtttgcatgtggttatgattgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtt 51807348  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 184  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51807349 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 51807413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 48563223 - 48563424
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |                ||||||    
T  48563223 agtttgcatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtctatgaattgataaatata----------------gttgtt 48563306  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48563307 taaatcataatgtgtctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 48563405  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  48563406 tatattgattatttagtta 48563424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 16611475 - 16611574
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16611475 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 16611574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22047778 - 22047679
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22047778 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 22047679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17567737 - 17567640
Alignment:
Q  140 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17567737 aatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 17567640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 41612765 - 41612864
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  41612765 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatctagtta 41612864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 52391071 - 52390972
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  52391071 tgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattgattatttagtta 52390972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31045386 - 31045170
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||    || ||||    
T  31045386 agtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacattttgatgattgcatgtgtagtttataaattgataaacgaatgtagttaatgtaattgatgtt 31045287  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     || | | ||||||  || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||    
T  31045286 taagtaa-aatgtggttt-tgaatggtgtcaaaataacacaatgtgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgccaaaatgagaat 31045189  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |  ||| ||||||||||||    
T  31045188 tgcatttattatttagtta 31045170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2274589 - 2274490
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2274589 tgaatggtgggaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 2274490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 29009257 - 29009356
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29009257 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 29009356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 20351042 - 20351141
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttga-tcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20351042 tgaatggtggcaaaagaacaca-tttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgattaaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagtt 20351140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 4178201 - 4178300
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4178201 tgaatggtgtcaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattttattgattatttagtta 4178300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 36127834 - 36127933
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| | |||||||||| ||||    
T  36127834 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttcttgattatttggtta 36127933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42903861 - 42903766
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  42903861 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 42903766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 46389363 - 46389458
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  46389363 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 46389458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50480455 - 50480360
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  50480455 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 50480360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 54386525 - 54386620
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  54386525 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 54386620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 49144133 - 49144039
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  49144133 tggtggcaaaataacacattttgaatat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 49144039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 34045778 - 34045872
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34045778 tggtggcaaaataacacattttgagtat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 34045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46701696 - 46701601
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  || ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  46701696 tggtggcaaaataagacattttgagcatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 46701601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 4172203 - 4172302
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4172203 tgaatggtgttaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacaaaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgagaattttattgattatttagtta 4172302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 45825156 - 45825375
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825156 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 45825255  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatac-tttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaa 217  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825256 aaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatacttttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaa 45825354  T
Q  218 ttatattgattatttagttaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45825355 ttatattgattatttagttaa 45825375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35258666 - 35258449
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35258666 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatttagttgttgcctatgttgtt 35258567  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258566 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 35258468  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35258467 tatattgattatttagtta 35258449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 51320994 - 51321211
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51320994 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatattgtt 51321093  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321094 taaatcataatgtgactt-tgaatagtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 51321192  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51321193 tatattgattatttagtta 51321211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23275897 - 23275681
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275897 agtttgcatgtggttagggttgatttttaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 23275798  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaat-ggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaa 217  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275797 taaatcataatgtgactt-tgaatgggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaa 23275699  T
Q  218 ttatattgattatttagt 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23275698 ttatattgattatttagt 23275681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 47502595 - 47502812
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502595 agtttgcatgtggttagagttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtaatttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 47502694  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  47502695 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttggtaaaatgcctcaatgacaat 47502793  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  47502794 tttattgattatttagtta 47502812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19527336 - 19527118
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19527336 agtttgcatgtggttatggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 19527237  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  19527236 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatggacacaatttgaatatgttttatgttttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataacaat 19527138  T
Q  219 tatattgattatttagttaa 238  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  19527137 tttattgattatgtagttaa 19527118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31783521 - 31783304
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  31783521 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgtatgtgtagtttaggaattgataaataaatgtagttgttgcctatgttctt 31783422  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31783421 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 31783323  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  31783322 tttattgattatttagtta 31783304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 52802411 - 52802628
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52802411 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaagaattgataaatgaatgtagttgttgcttatgttgtt 52802510  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  52802511 taagtcataatgtga-ttttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 52802609  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  52802610 tttattgattgtttagtta 52802628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 49857736 - 49857522
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857736 agtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgataattttatcattgcatgtgtagtttatgttttgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 49857637  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  49857636 taaatgagaatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctca---aaaat 49857541  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  49857540 tatattgattatttagtta 49857522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 19925022 - 19925239
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19925022 agtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtt 19925121  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||    
T  19925122 taaattataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaat 19925220  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  19925221 tttattgattatttagtta 19925239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 30890341 - 30890558
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  30890341 agtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtt 30890440  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||    
T  30890441 taaattataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaat 30890539  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  30890540 tttattgattatttagtta 30890558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17514497 - 17514271
Alignment:
Q  21 tttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaa 120  Q
    |||||||||||||| |||||||     |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    || |||| |    
T  17514497 tttgcatgtggttagggtttataaatgaattgacattttgaagattacgtgtgtagtttatgaattgataaatgaatatagttgttgtaattgatgttta 17514398  T
Q  121 aat----------cataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctca 210  Q
    |||           ||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  17514397 aatgatgtataagtataatgtg-gttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgattctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaa 17514299  T
Q  211 atgaaaattatattgattatttagttaa 238  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  17514298 ataaaaattatattgattatttagttaa 17514271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 29622217 - 29622105
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29622217 agtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtt 29622118  T
Q  119 aaaatcataatgt 131  Q
     ||||||||||||    
T  29622117 taaatcataatgt 29622105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50343644 - 50343545
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  50343644 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 50343545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 237
Target Start/End: Original strand, 47656256 - 47656367
Alignment:
Q  125 ataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatatt 224  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  47656256 ataatgtgattt-tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttatt 47656354  T
Q  225 gattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||    
T  47656355 gattatttagtta 47656367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 21141425 - 21141524
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21141425 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 21141524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 107
Target Start/End: Original strand, 11183461 - 11183549
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttg 107  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11183461 agtttgcatgtggttagagttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaattaatgtagttgttg 11183549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Original strand, 11196160 - 11196244
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagtt 103  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11196160 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacattttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaattaatgtagtt 11196244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 2365634 - 2365733
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2365634 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 2365733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 19156413 - 19156512
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19156413 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 19156512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 22524534 - 22524630
Alignment:
Q  139 gaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||| | ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22524534 gaatggagccaaataaacataatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 22524630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 97623 - 97524
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  97623 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgtacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgataattttattgtttatttagtta 97524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2425040 - 2424948
Alignment:
Q  139 gaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattattta 233  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  2425040 gaatggagccaaataaacacaatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataacaattttattgattattta 2424948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3732052 - 3731957
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3732052 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 3731957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13639698 - 13639599
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13639698 tgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 13639599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 26876059 - 26876154
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26876059 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 26876154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38127158 - 38127058
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaa-cacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtt 236  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38127158 tgaatggtggcaaaaaaaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaaaattttattgattacttagtt 38127059  T
Q  237 a 237  Q
    |    
T  38127058 a 38127058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 73
Target Start/End: Original strand, 22524407 - 22524460
Alignment:
Q  20 gtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtg 73  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22524407 gtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgtg 22524460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Original strand, 8474187 - 8474259
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 214  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  8474187 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatga 8474259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 2425168 - 2425114
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtg 73  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2425168 agtttgtatgtggttagagttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgtg 2425114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 237
Target Start/End: Original strand, 25166976 - 25167046
Alignment:
Q  167 tatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||  |||| ||||||| ||| ||||    
T  25166976 tatgtttcatactttgcactcaaagtgtttgataaaattcctaaatgaggattacattgatttttttgtta 25167046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 36977878 - 36978095
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36977878 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 36977977  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36977978 taaatcataatgtgactt-tgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 36978076  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36978077 tatattgattatttagtta 36978095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47672878 - 47672661
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47672878 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtataatctatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 47672779  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47672778 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 47672680  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47672679 tatattgattatttagtta 47672661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 39460808 - 39461025
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39460808 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctattttgtt 39460907  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39460908 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 39461006  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  39461007 tttattgattatttagtta 39461025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9494588 - 9494371
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494588 agtttgcatgtggtttgggttgattttaaaattgaaaatttgatggttgcatgtgtaatttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 9494489  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9494488 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcgtcaatgaaaat 9494390  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9494389 tatattgattatttagtta 9494371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 17835356 - 17835573
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835356 agtttgtatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 17835455  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  17835456 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 17835554  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  17835555 tttattgattatttagtta 17835573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 37340584 - 37340801
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37340584 agtttggatgtggttaggattgattttaaaattgacaatttgatgatttcatgtgtagtttatgaattgaaaaatgaatgtacttgttgcctatgttgtt 37340683  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37340684 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 37340782  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37340783 tatattgattatttagtta 37340801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 10517260 - 10517477
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517260 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 10517359  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  10517360 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 10517458  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  10517459 tttattgattatttagtta 10517477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 47776614 - 47776831
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47776614 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 47776713  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  47776714 taaatcataatgtggctt-tgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaaa 47776812  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  47776813 tttattgattatttagtta 47776831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27453412 - 27453197
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27453412 agtttgcatgtggttagagttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttacctatgttgtt 27453313  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||    
T  27453312 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcattgacaat 27453214  T
Q  219 tatattgattatttagt 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  27453213 tttattgattatttagt 27453197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 34738646 - 34738863
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34738646 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttacctatgttgtt 34738745  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  34738746 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgctcacaaagtgtttgataaaatgtctcgatgacaat 34738844  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  34738845 tttattgattatgtagtta 34738863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15074021 - 15073804
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15074021 agtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtt 15073922  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  15073921 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 15073823  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  15073822 tttattgattatttagtta 15073804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42507820 - 42507603
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||| ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42507820 agtttgcatgtggttaggttttataaatgaattaacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtt 42507721  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  42507720 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 42507622  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  42507621 tttattgattatttagtta 42507603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14689822 - 14689634
Alignment:
Q  48 aattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtgg 147  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||| ||||| ||||    
T  14689822 aattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatttattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtagctt-tgaatagtgg 14689724  T
Q  148 caaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14689723 caaataaacacaatttgaatatcttttatactttgcatacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 14689634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17741251 - 17741024
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    || | ||    
T  17741251 agtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacattttgaagattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtaattgatatt 17741152  T
Q  119 aaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcct 208  Q
     |||| ||          ||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  17741151 taaatgatgtttaagtataatgtggttt-tgaatggtgccatatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaattccc 17741053  T
Q  209 caatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17741052 aaatgagaattatattgattatttagtta 17741024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 556321 - 556222
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  556321 tgaatggtggcaaatgaacatattttgagtatgtttgatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttatttattatttagtta 556222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5541215 - 5541116
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| || || | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5541215 tgaatggtggcaaaagatcatattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 5541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 41880888 - 41880987
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  41880888 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 41880987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 48403755 - 48403854
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48403755 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgataattttattgattatttagtta 48403854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46740234 - 46740127
Alignment:
Q  125 ataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatatt 224  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||| ||||    
T  46740234 ataatgtgattt-tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgattgataaaatgtgtcaatgacaattttatt 46740136  T
Q  225 gattattta 233  Q
    |||||||||    
T  46740135 gattattta 46740127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35610087 - 35609992
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35610087 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 35609992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 16675186 - 16675283
Alignment:
Q  140 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  16675186 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgtta 16675283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 17649554 - 17649651
Alignment:
Q  140 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  17649554 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgtta 17649651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Original strand, 45257401 - 45257484
Alignment:
Q  154 aacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45257401 aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 45257484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17465396 - 17465329
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 205  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17465396 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 17465329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 205
Target Start/End: Original strand, 17587818 - 17587885
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 205  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17587818 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 17587885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9371028 - 9370966
Alignment:
Q  175 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9371028 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 9370966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 187
Target Start/End: Original strand, 41734561 - 41734610
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacac 187  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41734561 tgaatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacac 41734610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48256364 - 48256147
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48256364 agtttgcatgtggttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtt 48256265  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256264 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaaaacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 48256166  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  48256165 tatattgattatttagtta 48256147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 51683482 - 51683699
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51683482 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtt 51683581  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683582 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 51683680  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51683681 tatattgattatttagtta 51683699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 55407580 - 55407363
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407580 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 55407481  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  55407480 aaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcgaatgcctcattgaaaat 55407382  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  55407381 tatattgattatttagtta 55407363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 67871 - 68088
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  67871 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttaatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaataaatgtagttgttgcctatgttgtt 67970  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67971 taaatgataatgtggctt-tgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacataaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 68069  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  68070 tatattgattatttagtta 68088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21022681 - 21022464
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022681 agtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 21022582  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  21022581 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 21022483  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  21022482 tttattgattatttagtta 21022464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 50275014 - 50275231
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50275014 agtttgcatgtggttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 50275113  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  50275114 taaatcagaatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 50275212  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  50275213 tttattgattatgtagtta 50275231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37021876 - 37021659
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37021876 agtttgtatgtggttagagttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcatatgttgtt 37021777  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  37021776 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcttcaatgacaat 37021678  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  37021677 tttattgattatttagtta 37021659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40358073 - 40357856
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40358073 agtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtt 40357974  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  40357973 taaatcataatgtggatt-tgaatggtggcaaatgaacacagtttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 40357875  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  40357874 tttattgattatttagtta 40357856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 46436536 - 46436741
Alignment:
Q  31 gttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatg 130  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||    
T  46436536 gttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattaataaacgaatgtagttgttgcttatgctgtttaaatgatattg 46436635  T
Q  131 tgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattat 230  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  46436636 tgg-ttctgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatggcaattttattgattat 46436734  T
Q  231 ttagtta 237  Q
    |||||||    
T  46436735 ttagtta 46436741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 50901760 - 50901976
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50901760 agtttacatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtt 50901859  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     || |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||    
T  50901860 taattcataatgtggctt-tgaatggtgttaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgacaat 50901958  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  50901959 tttattgatt-tttagtta 50901976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30726505 - 30726317
Alignment:
Q  48 aattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtgg 147  Q
    |||||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30726505 aattgacaatttcatcattgcacgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctt-tgaatggtgg 30726407  T
Q  148 caaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30726406 caaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagtta 30726317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1089377 - 1089160
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  1089377 agtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcaagtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcatatgtagtt 1089278  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  1089277 taaataataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 1089179  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  1089178 tttattgattatttagtta 1089160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1308907 - 1308690
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  1308907 agtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcatatgtagtt 1308808  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||    
T  1308807 taaattataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaat 1308709  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  1308708 tttattgattatttagtta 1308690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21538255 - 21538028
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21538255 agtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgggtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 21538156  T
Q  119 aaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcct 208  Q
     |||| ||          ||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21538155 taaatgatgtttaatgataatgtggttt-tgaatgatgccaaatgaacacaatttgaatctgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcct 21538057  T
Q  209 caatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21538056 caatgataattatattgattatttagtta 21538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10753230 - 10753007
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10753230 agtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagatgttgcctatgctgtt 10753131  T
Q  119 aaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcct 208  Q
     |||| ||          ||||||  || |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10753130 taaatgatgtttaatgataatgtggttt-tgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcct 10753032  T
Q  209 caatgaaaattatattgattattta 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  10753031 caatgataattatattgattattta 10753007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10966999 - 10966776
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10966999 agtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagatgttgcctatgctgtt 10966900  T
Q  119 aaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcct 208  Q
     |||| ||          ||||||  || |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10966899 taaatgatgtttaatgataatgtggttt-tgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcct 10966801  T
Q  209 caatgaaaattatattgattattta 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  10966800 caatgataattatattgattattta 10966776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 14297405 - 14297632
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14297405 agtttgcatgtggttaggttttatgaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 14297504  T
Q  119 aaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcct 208  Q
     |||| ||          ||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||     
T  14297505 taaatgatgtataataaaaatgtg-gttttgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaatgccc 14297603  T
Q  209 caatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14297604 aaatgaaaattgtattgattattgagtta 14297632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 14315654 - 14315881
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14315654 agtttgcatgtggttaggttttatgaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 14315753  T
Q  119 aaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcct 208  Q
     |||| ||          ||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||     
T  14315754 taaatgatgtataataaaaatgtg-gttttgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaatgccc 14315852  T
Q  209 caatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14315853 aaatgaaaattgtattgattattgagtta 14315881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11083809 - 11083582
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11083809 agtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgctgtt 11083710  T
Q  119 aaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcct 208  Q
     |||| ||          ||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||     
T  11083709 taaatgatgtataataaaaatgtg-gttttgaatggtgtcaaatgaacacattttgagtatgtttgatgctttgcacacaaagtgtttgacaaaatgccc 11083611  T
Q  209 caatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
     |||||||||| || |||||||| |||||    
T  11083610 aaatgaaaattgtactgattattgagtta 11083582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11050198 - 11050099
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11050198 tgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtatttgataaaatgcatcaatgaaaattatattgattatttagtta 11050099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50023218 - 50023119
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  50023218 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 50023119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41798670 - 41798571
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || || | |||||||||||||||||    
T  41798670 tgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaacgacaaatttattgattatttagtta 41798571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4720161 - 4719958
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || || |      
T  4720161 agtttgcatgtggttagggtttacgtaagaattgacattttgatgattgcgtgtgtagtttatgaattggtaaatgaatgtaattgatgtttaagtag-- 4720064  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
            ||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  4720063 --------aatgtgattt-tgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaat 4719973  T
Q  219 tatattgattattta 233  Q
    |  ||||||||||||    
T  4719972 tgcattgattattta 4719958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9892943 - 9892844
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9892943 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 9892844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41933298 - 41933199
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41933298 tgaatggtgtcaaatgaagattatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaaagccccaatgaaaattatattgattattgagtta 41933199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50030336 - 50030237
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  50030336 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcatcaatgacaattttactgattatttagtta 50030237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6181461 - 6181366
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6181461 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 6181366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 30704421 - 30704520
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30704421 tgaatggtgggaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatatctcaatgacaattttattgattatttagtta 30704520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 49090822 - 49090917
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  49090822 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 49090917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 49165431 - 49165530
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  49165431 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatagtttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 49165530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44679762 - 44679651
Alignment:
Q  125 ataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatatt 224  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||  |||    
T  44679762 ataatgtgattt-tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgaccatttcatt 44679664  T
Q  225 gattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||    
T  44679663 gattatttagtta 44679651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 3184354 - 3184453
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  3184354 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattttttatttagtta 3184453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3185559 - 3185460
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  3185559 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattttttatttagtta 3185460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3185767 - 3185668
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  3185767 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattttttatttagtta 3185668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 31422099 - 31422195
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttg-atcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31422099 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgaataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 31422195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 50193893 - 50193972
Alignment:
Q  154 aacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattattta 233  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  50193893 aacacattttgagtatgtttgatactttgcacataaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattattta 50193972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5304010 - 5303797
Alignment:
Q  23 tgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaa 122  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5304010 tgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttcatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaa 5303911  T
Q  123 tcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattata 222  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303910 tcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattata 5303812  T
Q  223 ttgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||    
T  5303811 ttgattatttagtta 5303797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40077043 - 40076826
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40077043 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattatatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagctgttgcctatgttgtt 40076944  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40076943 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttataatttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 40076845  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40076844 tatattgattatttagtta 40076826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 39601995 - 39602212
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39601995 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 39602094  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39602095 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 39602193  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  39602194 tttattgattatttagtta 39602212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34822810 - 34822593
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34822810 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttggt 34822711  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822710 taaatcataatgtggctt-tgaatgactgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactctgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 34822612  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34822611 tatattgattatttagtta 34822593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39846779 - 39846562
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846779 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 39846680  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||| |||| |||    
T  39846679 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgtttgataaactgtctccatgacaat 39846581  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  39846580 tttattgattatttagtta 39846562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 43211785 - 43212002
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43211785 agtttgtatgtgcttagggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 43211884  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  43211885 taaatcataatgtggctt-tgaatggtgggaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 43211983  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  43211984 tttattgattatttagtta 43212002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15036520 - 15036304
Alignment:
Q  20 gtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtta 119  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15036520 gtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagttcaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttt 15036421  T
Q  120 aaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaatt 219  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  15036420 aaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaatt 15036322  T
Q  220 atattgattatttagtta 237  Q
     |||||||||||||||||    
T  15036321 ttattgattatttagtta 15036304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 43188329 - 43188546
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43188329 agtttgcatgtggttatggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattaataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtt 43188428  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| |||    
T  43188429 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacgatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgacaat 43188527  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  43188528 tttattgattatttagtta 43188546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 39252292 - 39252508
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39252292 agtttgtatgtggtta-ggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattaataaatgaatgtagttgttgcatatgttgtt 39252390  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  39252391 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaatacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 39252489  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  39252490 tttattgattatttagtta 39252508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39939009 - 39938792
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39939009 agtttacatgtggttagggttgattttaaaattgataatttgatgattacatgtatagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 39938910  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  39938909 taaatcataatggggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaataagttttatactttgcacacaaagtatttgataaaatgtctcaatgacaat 39938811  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  39938810 tttattgattatgtagtta 39938792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41249866 - 41249700
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41249866 agtttgcatgtggttagggtagattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 41249767  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcaca 186  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41249766 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgctttatactttgcaca 41249700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42485331 - 42485114
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  42485331 agtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtt 42485232  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||    
T  42485231 taaattataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaat 42485133  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  42485132 tttattgattatttagtta 42485114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 489393 - 489205
Alignment:
Q  48 aattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtgg 147  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||||||| |    
T  489393 aattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctt-tgaatggttg 489295  T
Q  148 caaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  489294 caaatgaacacaatttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagtta 489205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 45064521 - 45064728
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45064521 agtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtt 45064620  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  45064621 taaatcttaatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaat----------ttttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 45064709  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  45064710 tttattgattatttagtta 45064728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 37327084 - 37327280
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||                      
T  37327084 agtttgcatgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgta------------------ 37327164  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
      ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  37327165 --aatgataatgtgattt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 37327261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 24249763 - 24249977
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| || |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||    
T  24249763 agtttgcatgtggttagggttgatataggaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtaattgatgtt 24249862  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     || | ||||||||  || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  24249863 taagt-ataatgtggttt-tgaatggtgtcaaatgagcacattttgaatatgtttgatactttgcacataaagtatttgataaaatgccccaatgagaat 24249960  T
Q  219 tatattgattatttagt 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  24249961 tatattgattatttagt 24249977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25864732 - 25864620
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25864732 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtt-atgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 25864634  T
Q  119 aaaatcataatgtg 132  Q
     |||||||||||||    
T  25864633 taaatcataatgtg 25864620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 2984402 - 2984619
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcct--atgttg 116  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||  | ||| ||||||||| ||| |   |  ||| |     
T  2984402 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgttgttaa-gatgttatagatgaatgtaattgatctttgaatgatt 2984500  T
Q  117 ttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaa 216  Q
    || || | ||||||||  || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  2984501 tttaagt-ataatgtggttt-tgaatgatgccaaataaacacaatttgaataagtttcatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaacgaca 2984598  T
Q  217 attatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2984599 attatattgattatttagtta 2984619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 35552063 - 35552162
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35552063 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 35552162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 20857683 - 20857782
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20857683 tgaatggttgcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 20857782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25198 - 25103
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25198 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 25103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 1052926 - 1053021
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1052926 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtatcaatgacaattttattgattatttagtta 1053021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23021992 - 23021897
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23021992 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 23021897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 26659848 - 26659943
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26659848 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 26659943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 45128147 - 45128246
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  45128147 tgaatggtggcaaaagaacacgttttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgccccaatgtgaattgtattgattattgagtta 45128246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 230
Target Start/End: Original strand, 5677468 - 5677560
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattat 230  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5677468 tgaatggtagcaaaagaatacattttgagtatgtttgatgttttgcacagaaagtgtttgataaaatgccccaatgaaaattatattgattat 5677560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34371553 - 34371470
Alignment:
Q  154 aacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  34371553 aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaatttttttgattatttagtta 34371470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 104
Target Start/End: Original strand, 22495216 - 22495272
Alignment:
Q  48 aattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttg 104  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22495216 aattgacattttgatggttgcatgtgtagtttacgaattgataaatgaatgtagttg 22495272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Original strand, 35026740 - 35026786
Alignment:
Q  36 ggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatg 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35026740 ggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatg 35026786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 22495315 - 22495410
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattattta 233  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |   | |||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  22495315 tgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacaaatgttttttgataaaatgcccaaatgaaaattgcattgattattta 22495410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15416 - 15199
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15416 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataaatgaatgtagttattgcctatgttgtt 15317  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15316 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 15218  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  15217 tttattgattatttagtta 15199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 39947880 - 39948097
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39947880 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 39947979  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39947980 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 39948078  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  39948079 tttattgattatttagtta 39948097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 28468921 - 28469138
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28468921 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtaattgttgcctatgttgtt 28469020  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  28469021 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 28469119  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  28469120 tttattgattatttagtta 28469138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Original strand, 25965100 - 25965308
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25965100 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgtttcctatgttgtt 25965199  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  25965200 taaatcataatgtggctt-tgaatgttggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgataat 25965298  T
Q  219 tatattgatt 228  Q
    | ||||||||    
T  25965299 tttattgatt 25965308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 21998470 - 21998687
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||    
T  21998470 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagtaattgataattgaatttatttgttgtctatgttgtt 21998569  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  21998570 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 21998668  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  21998669 tttattgattatttagtta 21998687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 45428871 - 45429088
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  45428871 agtttgtatgtggttagggttgatttaaaaaatgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctacgtagtt 45428970  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  45428971 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 45429069  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  45429070 tttattgattatttagtta 45429088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32956147 - 32955934
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32956147 agtttgtatgtggtttgggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtacttgttgcctatgttgtt 32956048  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32956047 taaattataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat 32955949  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
        |||||||||||||||    
T  32955948 ----ttgattatttagtta 32955934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 17420847 - 17421064
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17420847 agtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgatcattgaatgtagttgttgcctatgttgtt 17420946  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  17420947 taaatcataatgtgggtt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacatcaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 17421045  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||||||||||||    
T  17421046 tttattgattatttagtta 17421064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 7185309 - 7185481
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7185309 agtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgttgtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 7185408  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 192  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7185409 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 7185481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45137225 - 45137112
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  45137225 agtttgcatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttcttgcctatgttatt 45137126  T
Q  119 aaaatcataatgtg 132  Q
     |||||||||||||    
T  45137125 taaatcataatgtg 45137112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29401279 - 29401180
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29401279 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 29401180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36656023 - 36655926
Alignment:
Q  140 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36656023 aatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaacattttattgattatttagtta 36655926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 20938294 - 20938393
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20938294 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 20938393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25515484 - 25515386
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25515484 tgaatggtggcaaa-gagcacgatttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgagaattatattgattattgagtta 25515386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 45284570 - 45284669
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45284570 tgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattgattatttagtta 45284669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 45291933 - 45292032
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45291933 tgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattgattatttagtta 45292032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3940400 - 3940305
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3940400 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 3940305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 5352367 - 5352462
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5352367 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 5352462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10828700 - 10828601
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||| |||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10828700 tgaattgtggcaaaagaacgcattttgagtatgtttgatactttggacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagtta 10828601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 15831526 - 15831625
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15831526 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtctttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 15831625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30496618 - 30496523
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30496618 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 30496523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 43978922 - 43979017
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43978922 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 43979017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45136956 - 45136881
Alignment:
Q  149 aaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatatt 224  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  45136956 aaatgaacacaatttaaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttatt 45136881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43539409 - 43539314
Alignment:
Q  142 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43539409 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaatgtttttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 43539314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 35464397 - 35464313
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagtt 103  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |   |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35464397 agtttgcatgtggttaggatttatgtatgaattgacattctgatgattgcatgtgtagtttatgaatttataaatgaatgtagtt 35464313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 107
Target Start/End: Original strand, 31367309 - 31367397
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttg 107  Q
    |||||||||||||||| |||| || |   |||||| | |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  31367309 agtttgcatgtggttagggttgatgtaggaattgatattttgatgattgcatatatagtttatgaatttataaatgaatttatttgttg 31367397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 7698 - 7915
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7698 agtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 7797  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  7798 taaatcataatgtggctt-tgaatgatggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtatttgataaaatgcctcaatgacaat 7896  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  7897 tttattgattttttagtta 7915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 521 - 304
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  521 agtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgtagtt 422  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  421 taaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaacgtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 323  T
Q  219 tatattgattatttagtta 237  Q
    | |||| ||||||||||||    
T  322 tttattaattatttagtta 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 8483 - 8582
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8483 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 8582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Original strand, 10761 - 10851
Alignment:
Q  147 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10761 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtttgaaaaaatgtctcaatgacaattatattgattatttagtta 10851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18608 - 18509
Alignment:
Q  138 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18608 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 18509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4327 - 4230
Alignment:
Q  140 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 237  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4327 aatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatgttttgcacacaaagtgtttgataaagtgccccaatgagaattatattgattattgagtta 4230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 251268 - 251056
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 118  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  |   ||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    || ||||    
T  251268 agtttgcatatggttagggtttacgtatgaattggcattttgataattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgatgtaattgatgtt 251169  T
Q  119 aaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 218  Q
      ||  | ||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||  ||||||   |||||||||    
T  251168 -taagaagaatgtg-gttttgaatggtgtcaaattaacacaataagaatatgtttgatattttacacataaagtgattgacaaaatgctcaaatgaaaat 251071  T
Q  219 tatattgattattta 233  Q
    |  ||||||||||||    
T  251070 tgcattgattattta 251056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 246180 - 246228
Alignment:
Q  166 atatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  246180 atatgttttatactttgcacccaaagtgtttgataaaatgcctaaatga 246228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 40828 - 40746
Alignment:
Q  19 agtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtag 101  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  40828 agtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtag 40746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University