View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11386A_low_543 (Length: 209)

Name: NF11386A_low_543
Description: NF11386A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11386A_low_543
NF11386A_low_543
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (16-194)||(16413753-16413931)
chr8 (12-194)||(32121343-32121536)
chr8 (65-187)||(23913674-23913796)
chr8 (65-187)||(18863251-18863373)
chr8 (65-187)||(21828620-21828742)
chr8 (68-187)||(21386739-21386858)
chr8 (72-187)||(30940683-30940798)
chr8 (66-187)||(21410329-21410450)
chr8 (66-187)||(21804821-21804942)
chr8 (65-187)||(14398429-14398549)
chr8 (72-186)||(43251220-43251335)
chr8 (65-186)||(21973163-21973285)
chr8 (65-186)||(21977254-21977376)
chr8 (86-187)||(44385227-44385328)
chr8 (72-186)||(22111340-22111455)
chr8 (16-194)||(18832981-18833174)
chr8 (101-194)||(42819100-42819193)
chr8 (65-171)||(5760131-5760237)
chr8 (101-150)||(5760200-5760249)
chr8 (101-156)||(6102834-6102889)
chr8 (133-194)||(19929971-19930032)
chr8 (101-148)||(37515201-37515248)
chr8 (131-171)||(37515198-37515238)
chr8 (131-171)||(42819156-42819196)
chr8 (19-58)||(18832920-18832959)
chr8 (131-167)||(6102856-6102892)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (12-198)||(32215385-32215582)
chr2 (65-187)||(9784413-9784535)
chr2 (72-187)||(41531586-41531701)
chr2 (65-187)||(1282791-1282913)
chr2 (65-187)||(31344541-31344662)
chr2 (72-187)||(30345597-30345712)
chr2 (12-114)||(24367340-24367442)
chr2 (65-194)||(17306201-17306338)
chr2 (72-186)||(10102235-10102350)
chr2 (72-186)||(24629061-24629176)
chr2 (72-186)||(24648764-24648879)
chr2 (72-186)||(27380014-27380129)
chr2 (72-186)||(27384060-27384175)
chr2 (72-186)||(27601201-27601316)
chr2 (95-187)||(12902097-12902189)
chr2 (23-114)||(38966989-38967080)
chr2 (65-181)||(36838918-36839042)
chr2 (131-194)||(28653703-28653766)
chr2 (131-194)||(24514974-24515037)
chr2 (140-187)||(38967084-38967131)
chr2 (140-187)||(24367446-24367493)
chr2 (65-114)||(24514933-24514982)
chr2 (16-58)||(36838850-36838892)
chr2 (65-114)||(28653758-28653807)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (12-194)||(3484694-3484887)
chr4 (65-187)||(20160452-20160574)
chr4 (65-194)||(37018314-37018443)
chr4 (65-187)||(20157776-20157898)
chr4 (65-187)||(20163230-20163352)
chr4 (72-187)||(14954773-14954888)
chr4 (65-187)||(631334-631456)
chr4 (65-187)||(10712258-10712380)
chr4 (65-187)||(10926028-10926150)
chr4 (65-194)||(35812625-35812762)
chr4 (72-186)||(5757512-5757627)
chr4 (72-186)||(9555939-9556054)
chr4 (72-186)||(12487094-12487209)
chr4 (72-186)||(14758009-14758124)
chr4 (72-187)||(15224452-15224567)
chr4 (72-186)||(33741789-33741904)
chr4 (65-194)||(14548425-14548562)
chr4 (72-186)||(4561907-4562022)
chr4 (65-187)||(17048690-17048812)
chr4 (65-194)||(16997240-16997377)
chr4 (111-186)||(17809723-17809798)
chr4 (101-190)||(13592532-13592621)
chr4 (131-194)||(15042316-15042379)
chr4 (131-194)||(15112045-15112108)
chr4 (131-194)||(25090441-25090504)
chr4 (134-194)||(42874589-42874649)
chr4 (142-185)||(27533457-27533500)
chr4 (72-138)||(25689312-25689378)
chr4 (142-187)||(25689349-25689394)
chr4 (100-138)||(17809745-17809783)
chr4 (131-171)||(13592584-13592624)
chr4 (70-114)||(14650373-14650417)
chr4 (133-192)||(14650411-14650470)
chr4 (72-138)||(27533420-27533486)
chr4 (16-58)||(33185493-33185535)
chr4 (65-114)||(25090400-25090449)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (12-194)||(24274692-24274882)
chr7 (65-187)||(20487199-20487321)
chr7 (17-144)||(14933112-14933247)
chr7 (17-144)||(15356547-15356682)
chr7 (17-144)||(15360661-15360796)
chr7 (65-186)||(13919077-13919198)
chr7 (65-187)||(12705240-12705362)
chr7 (65-187)||(39721644-39721766)
chr7 (65-187)||(25927822-25927946)
chr7 (72-187)||(2530735-2530850)
chr7 (72-187)||(45170612-45170727)
chr7 (65-187)||(2832778-2832900)
chr7 (65-187)||(15083574-15083696)
chr7 (65-187)||(18301704-18301826)
chr7 (65-186)||(1859406-1859527)
chr7 (22-114)||(15082374-15082466)
chr7 (65-194)||(16585101-16585238)
chr7 (72-186)||(71349-71464)
chr7 (72-186)||(75458-75573)
chr7 (72-186)||(16907793-16907908)
chr7 (72-186)||(18282775-18282890)
chr7 (72-187)||(18425070-18425185)
chr7 (72-187)||(26291782-26291897)
chr7 (101-194)||(14257914-14258007)
chr7 (101-194)||(16579246-16579339)
chr7 (101-194)||(16586323-16586416)
chr7 (72-186)||(32518-32633)
chr7 (72-186)||(12718077-12718192)
chr7 (72-186)||(12722988-12723103)
chr7 (72-186)||(16113650-16113765)
chr7 (72-186)||(16116803-16116918)
chr7 (72-186)||(18278812-18278927)
chr7 (101-192)||(20585193-20585284)
chr7 (68-194)||(12466466-12466600)
chr7 (65-171)||(14257837-14257951)
chr7 (127-194)||(16461493-16461560)
chr7 (126-187)||(15605873-15605934)
chr7 (131-194)||(32300802-32300865)
chr7 (131-194)||(14183812-14183875)
chr7 (131-171)||(14933118-14933158)
chr7 (131-171)||(15356553-15356593)
chr7 (131-171)||(15360667-15360707)
chr7 (140-187)||(15082324-15082370)
chr7 (65-139)||(7519669-7519743)
chr7 (65-114)||(14183867-14183916)
chr7 (65-114)||(32300761-32300810)
chr7 (131-171)||(20585190-20585230)
chr7 (131-171)||(16579243-16579283)
chr7 (131-171)||(16586379-16586419)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (12-194)||(10556-10749)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (12-194)||(1052-1245)
scaffold0109 (72-187)||(36570-36685)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (12-194)||(18052-18245)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (12-194)||(14238688-14238885)
chr1 (65-187)||(22131461-22131583)
chr1 (65-187)||(41781879-41782001)
chr1 (65-187)||(48602884-48603006)
chr1 (65-194)||(42911764-42911901)
chr1 (72-187)||(1925735-1925850)
chr1 (72-187)||(20924749-20924864)
chr1 (65-188)||(33796922-33797045)
chr1 (72-187)||(41388600-41388715)
chr1 (72-186)||(1010132-1010247)
chr1 (72-186)||(16376040-16376155)
chr1 (72-187)||(39244500-39244615)
chr1 (72-187)||(39248055-39248170)
chr1 (72-186)||(52638950-52639065)
chr1 (65-194)||(23967357-23967494)
chr1 (72-187)||(20229588-20229703)
chr1 (72-187)||(21406766-21406881)
chr1 (101-194)||(48519938-48520031)
chr1 (131-194)||(19675540-19675603)
chr1 (131-194)||(20241616-20241679)
chr1 (65-171)||(48519861-48519975)
chr1 (161-194)||(4597047-4597080)
chr1 (65-114)||(4597107-4597156)
chr1 (66-114)||(20241576-20241624)
chr1 (147-194)||(20316106-20316153)
chr1 (16-58)||(42911696-42911738)
chr1 (16-58)||(48519793-48519835)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (16-187)||(29158-29337)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (12-194)||(23992027-23992187)
chr6 (14-194)||(34962972-34963130)
chr6 (65-187)||(2076875-2076997)
chr6 (65-187)||(22074567-22074689)
chr6 (65-187)||(23414308-23414430)
chr6 (72-187)||(31478565-31478680)
chr6 (65-194)||(19774053-19774190)
chr6 (65-194)||(22805377-22805514)
chr6 (72-187)||(1643920-1644035)
chr6 (72-186)||(8243242-8243357)
chr6 (72-186)||(11566271-11566386)
chr6 (72-186)||(12619424-12619539)
chr6 (72-187)||(14471623-14471738)
chr6 (72-186)||(22862355-22862470)
chr6 (72-186)||(23394477-23394592)
chr6 (72-186)||(23989329-23989444)
chr6 (100-190)||(23538215-23538305)
chr6 (101-194)||(17105321-17105414)
chr6 (80-187)||(16623772-16623879)
chr6 (108-194)||(19656614-19656700)
chr6 (101-194)||(15705929-15706022)
chr6 (101-194)||(17742841-17742934)
chr6 (111-186)||(19870039-19870114)
chr6 (128-194)||(27126599-27126665)
chr6 (100-176)||(16759708-16759784)
chr6 (16-155)||(17105193-17105342)
chr6 (72-171)||(16759646-16759746)
chr6 (65-171)||(17742764-17742878)
chr6 (65-171)||(19656762-19656869)
chr6 (131-194)||(7825433-7825496)
chr6 (65-171)||(20182325-20182440)
chr6 (65-171)||(22153551-22153666)
chr6 (65-171)||(15705985-15706099)
chr6 (101-154)||(19656746-19656799)
chr6 (137-186)||(27416508-27416557)
chr6 (65-145)||(27556079-27556159)
chr6 (72-138)||(22948526-22948592)
chr6 (72-138)||(22952482-22952548)
chr6 (72-138)||(23870970-23871036)
chr6 (72-138)||(23874926-23874992)
chr6 (142-187)||(22948563-22948608)
chr6 (142-187)||(22952519-22952564)
chr6 (142-187)||(23871007-23871052)
chr6 (142-187)||(23874963-23875008)
chr6 (100-151)||(20182402-20182453)
chr6 (100-151)||(22153538-22153589)
chr6 (16-58)||(17742621-17742663)
chr6 (50-114)||(20078560-20078625)
chr6 (131-171)||(19656695-19656735)
chr6 (148-187)||(18917990-18918029)
chr6 (100-138)||(17105353-17105391)
chr6 (100-138)||(19870061-19870099)
chr6 (65-114)||(7825392-7825441)
chr6 (50-114)||(18452876-18452941)
chr6 (65-106)||(27126665-27126706)
chr6 (158-187)||(27556159-27556188)
chr6 (18-58)||(17742687-17742727)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (12-193)||(13543579-13543738)
chr3 (12-194)||(46821821-46821981)
chr3 (65-184)||(12339107-12339225)
chr3 (65-187)||(14665056-14665178)
chr3 (65-187)||(14668212-14668334)
chr3 (65-187)||(15464505-15464627)
chr3 (72-187)||(15964357-15964472)
chr3 (72-187)||(15968281-15968396)
chr3 (72-187)||(15972205-15972320)
chr3 (65-187)||(37440218-37440340)
chr3 (72-187)||(16750922-16751037)
chr3 (12-114)||(12120224-12120326)
chr3 (12-114)||(38962342-38962444)
chr3 (72-187)||(19774980-19775095)
chr3 (101-194)||(18700862-18700955)
chr3 (65-187)||(8489768-8489887)
chr3 (72-182)||(4107985-4108096)
chr3 (72-182)||(4111837-4111948)
chr3 (72-187)||(4589494-4589609)
chr3 (72-186)||(11069480-11069595)
chr3 (72-186)||(14498737-14498852)
chr3 (72-186)||(22321076-22321191)
chr3 (72-186)||(22336131-22336246)
chr3 (72-186)||(27410226-27410341)
chr3 (72-186)||(28949134-28949249)
chr3 (72-186)||(55022277-55022392)
chr3 (65-187)||(12852891-12853013)
chr3 (65-194)||(2842654-2842791)
chr3 (72-186)||(7109108-7109223)
chr3 (72-186)||(7113043-7113158)
chr3 (72-186)||(11166111-11166226)
chr3 (72-186)||(15616786-15616901)
chr3 (109-187)||(5222772-5222850)
chr3 (65-187)||(16795914-16796036)
chr3 (101-194)||(14441067-14441160)
chr3 (65-194)||(10543007-10543144)
chr3 (72-187)||(17317709-17317824)
chr3 (101-187)||(14670512-14670598)
chr3 (101-194)||(43890172-43890265)
chr3 (101-187)||(14682034-14682120)
chr3 (65-171)||(14440997-14441104)
chr3 (131-194)||(35353358-35353421)
chr3 (131-194)||(10562476-10562539)
chr3 (135-194)||(42353672-42353731)
chr3 (134-194)||(5214723-5214783)
chr3 (101-171)||(15565301-15565371)
chr3 (111-171)||(13520978-13521038)
chr3 (142-194)||(44269408-44269460)
chr3 (140-187)||(12120173-12120220)
chr3 (140-187)||(38962291-38962338)
chr3 (65-171)||(43890228-43890342)
chr3 (87-150)||(14067289-14067352)
chr3 (132-178)||(19884816-19884862)
chr3 (144-187)||(30065432-30065475)
chr3 (65-114)||(35353317-35353366)
chr3 (131-171)||(15565298-15565338)
chr3 (65-113)||(19884859-19884907)
chr3 (101-140)||(13520976-13521015)
chr3 (132-171)||(18700918-18700957)
chr3 (16-58)||(2842817-2842859)
chr3 (16-58)||(5214589-5214631)
chr3 (101-138)||(5222797-5222834)
chr3 (101-194)||(15565334-15565425)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (65-187)||(6472-6594)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (65-187)||(36692-36814)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (28-194)||(19263-19440)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (28-194)||(63443-63620)
[»] scaffold0601 (2 HSPs)
scaffold0601 (100-194)||(8030-8124)
scaffold0601 (65-167)||(8090-8192)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (65-187)||(14693-14815)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (65-187)||(18355620-18355742)
chr5 (65-187)||(11230524-11230646)
chr5 (65-187)||(11224712-11224834)
chr5 (72-186)||(40724198-40724312)
chr5 (72-187)||(11228542-11228657)
chr5 (73-187)||(11220134-11220248)
chr5 (73-187)||(11226553-11226667)
chr5 (72-186)||(20295256-20295371)
chr5 (72-187)||(10752602-10752715)
chr5 (72-187)||(15237416-15237530)
chr5 (134-187)||(22107993-22108046)
chr5 (65-138)||(22108009-22108082)
chr5 (131-190)||(33896114-33896173)
chr5 (72-138)||(19473315-19473381)
chr5 (142-187)||(19473299-19473344)
chr5 (65-138)||(24767898-24767971)
chr5 (143-187)||(20911515-20911559)
chr5 (65-138)||(20911531-20911604)
chr5 (142-182)||(24767887-24767927)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (101-194)||(12698-12791)
scaffold0494 (132-171)||(12754-12793)
scaffold0494 (74-106)||(12797-12829)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (65-187)||(8171-8293)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (65-187)||(208194-208316)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (65-187)||(189983-190105)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (12-104)||(3598-3690)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (65-187)||(97-220)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (65-187)||(11373-11495)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (65-187)||(25177-25299)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (73-187)||(62189-62303)
scaffold0029 (73-187)||(66105-66219)
scaffold0029 (72-186)||(79951-80066)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (65-187)||(73900-74022)
[»] scaffold1662 (2 HSPs)
scaffold1662 (101-194)||(622-715)
scaffold1662 (131-171)||(678-718)
[»] scaffold0486 (2 HSPs)
scaffold0486 (58-187)||(9248-9377)
scaffold0486 (104-194)||(8177-8267)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (65-194)||(13906-14043)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (72-186)||(5681-5796)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (72-186)||(11831-11946)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (72-186)||(33268-33383)
[»] scaffold0061 (3 HSPs)
scaffold0061 (72-186)||(67883-67998)
scaffold0061 (101-194)||(19606-19699)
scaffold0061 (131-170)||(19663-19702)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (72-186)||(59301-59416)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (65-195)||(263-393)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (80-187)||(20785-20894)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (65-171)||(4343-4449)
scaffold0292 (101-194)||(4412-4505)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (65-187)||(3134-3256)
scaffold0165 (65-187)||(7197-7319)
[»] scaffold0207 (7 HSPs)
scaffold0207 (101-194)||(15534-15627)
scaffold0207 (101-171)||(15656-15726)
scaffold0207 (101-171)||(15689-15759)
scaffold0207 (101-171)||(15590-15660)
scaffold0207 (101-171)||(15623-15693)
scaffold0207 (101-171)||(15722-15792)
scaffold0207 (131-171)||(15755-15795)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (95-187)||(4450-4542)
[»] scaffold0111 (5 HSPs)
scaffold0111 (65-194)||(20003-20140)
scaffold0111 (142-194)||(7093-7145)
scaffold0111 (142-194)||(14212-14264)
scaffold0111 (65-106)||(7057-7098)
scaffold0111 (65-106)||(14176-14217)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (14-138)||(28704-28836)
scaffold0019 (131-187)||(28796-28852)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (101-194)||(821-914)
scaffold0058 (63-167)||(881-993)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (101-194)||(7237-7327)
scaffold0278 (101-171)||(7204-7274)
scaffold0278 (131-171)||(7201-7241)
[»] scaffold1633 (2 HSPs)
scaffold1633 (101-194)||(26-119)
scaffold1633 (128-171)||(20-63)
[»] scaffold0301 (2 HSPs)
scaffold0301 (131-194)||(10704-10767)
scaffold0301 (65-114)||(10663-10712)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (131-194)||(116617-116680)
scaffold0034 (74-114)||(116585-116625)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (12-62)||(4289-4339)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (131-190)||(102302-102361)
scaffold0040 (63-114)||(102353-102404)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (137-187)||(70804-70854)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (133-194)||(56612-56673)
scaffold0073 (70-114)||(56574-56618)
[»] scaffold0166 (2 HSPs)
scaffold0166 (65-138)||(10395-10468)
scaffold0166 (142-182)||(10384-10424)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (147-187)||(6426-6466)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (107-156)||(20938-20987)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (70-114)||(15118-15162)
scaffold0359 (133-194)||(15156-15217)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (70-114)||(166875-166919)
scaffold0005 (133-192)||(166822-166881)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (69-114)||(7212-7257)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (74-114)||(7852-7892)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16413931 - 16413753
Alignment:
Q  16 catcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactc 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413931 catcatagtcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactc 16413832  T
Q  116 atgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413831 atggatgataattcatcaacaacttaataactcatgtatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 16413753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 32121343 - 32121536
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaag----------- 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  32121343 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaactcaaca 32121442  T
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121443 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcctcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 32121536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 23913674 - 23913796
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23913674 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaaattaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 23913773  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23913774 caacaacgactttgactcgacaa 23913796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18863373 - 18863251
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18863373 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 18863274  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18863273 caacaacgactttgactcgacaa 18863251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21828742 - 21828620
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828742 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 21828643  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21828642 caacaacgactttgactcgacaa 21828620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Original strand, 21386739 - 21386858
Alignment:
Q  68 ataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaa 167  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21386739 ataagtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcaaagatgataatttatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaa 21386838  T
Q  168 caacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21386839 caacgactttgactcgacaa 21386858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30940798 - 30940683
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940798 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 30940699  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||    
T  30940698 gactttgactcgacaa 30940683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 187
Target Start/End: Original strand, 21410329 - 21410450
Alignment:
Q  66 tcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatc 165  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410329 tcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataaatcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatc 21410428  T
Q  166 aacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  21410429 aacaacgaccttgactcgacaa 21410450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 187
Target Start/End: Original strand, 21804821 - 21804942
Alignment:
Q  66 tcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatc 165  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21804821 tcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataaatcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatc 21804920  T
Q  166 aacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  21804921 aacaacgaccttgactcgacaa 21804942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14398549 - 14398429
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14398549 ttcatatgtacttctttaacaacacatgggtagaaaacaactcgacaactcag--atgataattcatcaacaacttaacaattcatggatgataattcat 14398452  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14398451 caacaacgactttgactcgacaa 14398429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 43251220 - 43251335
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251220 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 43251319  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  43251320 cgaccttgactcgaca 43251335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21973285 - 21973163
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattca 163  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973285 ttcataggtacttcttcaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattca 21973186  T
Q  164 tcaacaacgactttgactcgaca 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  21973185 tcaacaacgaccttgactcgaca 21973163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21977376 - 21977254
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattca 163  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21977376 ttcataggtacttcttcaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattca 21977277  T
Q  164 tcaacaacgactttgactcgaca 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  21977276 tcaacaacgaccttgactcgaca 21977254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44385328 - 44385227
Alignment:
Q  86 acacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgac 185  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44385328 acacatgggtagaagacaactcaacaacacatagatgataattcattaacaacttaacaactcatgaatgataattcatcaacaacgactttgacttgac 44385229  T
Q  186 aa 187  Q
    ||    
T  44385228 aa 44385227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 22111340 - 22111455
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111340 gtacttctttaacaacacatgggtagaacataactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 22111439  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  22111440 cgaccttgactcgaca 22111455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 18832981 - 18833174
Alignment:
Q  16 catcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattatt-------cataagtacttcattaactacacatggatagaagacaa---- 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||        |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||        
T  18832981 catcataatcaatatcataaacaacataacaacgtcataatcaatatcatataatctgcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactca 18833080  T
Q  105 ----cttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
        |||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  18833081 acaacttaacaactcatggatgacaactcgtcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacaactttgacttggcaatgcaact 18833174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42819193 - 42819100
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  42819193 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacaacttggactcgacaatgcaact 42819100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Original strand, 5760131 - 5760237
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcat-gataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattca 163  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5760131 ttcataagcacttcattaacaacacatggatagaagacaac-taacaactcatggatagaagataactcaacaacttaacaactcatggatgacaattca 5760229  T
Q  164 tcaacaac 171  Q
    ||||||||    
T  5760230 tcaacaac 5760237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 150
Target Start/End: Original strand, 5760200 - 5760249
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcat 150  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5760200 acaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcat 5760249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6102889 - 6102834
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6102889 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaaaaacttaacaactcatggatga 6102834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19930032 - 19929971
Alignment:
Q  133 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19930032 aacaacttgacaactcatggataacaacttattaacaacgactttgactcgacaatgcaact 19929971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 148
Target Start/End: Original strand, 37515201 - 37515248
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactc 148  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37515201 acaacttaacaactcatgaatgacaattcatcaacaacttaacgactc 37515248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Original strand, 37515198 - 37515238
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37515198 tcaacaacttaacaactcatgaatgacaattcatcaacaac 37515238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 42819196 - 42819156
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  42819196 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 42819156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Original strand, 18832920 - 18832959
Alignment:
Q  19 cataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatca 58  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18832920 cataatcaatatcataaacaacataacaacgtcataatca 18832959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 6102892 - 6102856
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6102892 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaa 6102856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32215582 - 32215385
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaact----- 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||         
T  32215582 acataatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaacaacacatggatagaatacaactcaaca 32215483  T
Q  107 ------taacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaactccaa 198  Q
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215482 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaactccaa 32215385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 9784413 - 9784535
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784413 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagaaaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 9784512  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9784513 caacaacgactttgactcgacaa 9784535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41531701 - 41531586
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531701 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 41531602  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||    
T  41531601 gactttgactcgacaa 41531586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 1282791 - 1282913
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1282791 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaacttatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 1282890  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1282891 caacaacgactttgactcgacaa 1282913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 31344541 - 31344662
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31344541 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatca-caacttaacaactcatggatgataattcat 31344639  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31344640 caacaacgactttgactcgacaa 31344662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30345712 - 30345597
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30345712 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 30345613  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  30345612 gaccttgactcgacaa 30345597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 114
Target Start/End: Original strand, 24367340 - 24367442
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaaca 111  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  24367340 acatcatcaaaatcaatatcataaacaacataacaatctcataatcataattattcataagtacttcattaacaacacatggatagaagacagctcaaca 24367439  T
Q  112 act 114  Q
    |||    
T  24367440 act 24367442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 17306201 - 17306338
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaa--------cttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||        |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17306201 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactgaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 17306300  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17306301 caactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 17306338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10102350 - 10102235
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10102350 gtacttctttaacgacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 10102251  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  10102250 cgaccttgactcgaca 10102235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24629176 - 24629061
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24629176 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 24629077  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  24629076 cgaccttgactcgaca 24629061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 24648764 - 24648879
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24648764 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 24648863  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  24648864 cgaccttgactcgaca 24648879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27380129 - 27380014
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380129 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 27380030  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  27380029 cgaccttgactcgaca 27380014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27384175 - 27384060
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27384175 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 27384076  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  27384075 cgaccttgactcgaca 27384060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 27601201 - 27601316
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601201 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 27601300  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  27601301 cgaccttgactcgaca 27601316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12902189 - 12902097
Alignment:
Q  95 tagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12902189 tagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaa 12902097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 114
Target Start/End: Original strand, 38966989 - 38967080
Alignment:
Q  23 atcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  38966989 atcaatatcataaacaacatagcaatgtcataatcataattattcataagtactttattaacaacacatggatagaaaacaactcaacaact 38967080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 181
Target Start/End: Original strand, 36838918 - 36839042
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaa--------cttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||        |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36838918 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatgaatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 36839017  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgact 181  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  36839018 caactcatcaacaacgactttgact 36839042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28653766 - 28653703
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28653766 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 28653703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 24514974 - 24515037
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24514974 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacattgcaact 24515037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 187
Target Start/End: Original strand, 38967084 - 38967131
Alignment:
Q  140 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967084 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 38967131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 187
Target Start/End: Original strand, 24367446 - 24367493
Alignment:
Q  140 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367446 taacaactcatgaatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 24367493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Original strand, 24514933 - 24514982
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24514933 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaact 24514982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Original strand, 36838850 - 36838892
Alignment:
Q  16 catcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatca 58  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36838850 catcataatcaatatcataaacaacataacaacatcataatca 36838892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 28653807 - 28653758
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  28653807 ttcataagcacttcattaacaacatgtggatagaagacaactcaacaact 28653758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 3484694 - 3484887
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaag----------- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||               
T  3484694 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaacaacacatggatagaagacaactcaaca 3484793  T
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3484794 acaacttaacaactcatggatgataattcaacaacaacttaacagctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 3484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20160574 - 20160452
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20160574 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaattcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 20160475  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20160474 caacaacgactttgactcgacaa 20160452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 37018314 - 37018443
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  37018314 ttcataagtacttcatgaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcat 37018413  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37018414 caacaacgactttgactcgacaatacaact 37018443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20157898 - 20157776
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20157898 ttcataggtacttatttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 20157799  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  20157798 caacaacgagtttgactcgacaa 20157776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20163352 - 20163230
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20163352 ttcataggtacttctttaacaacacataggtagaagacaacccgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 20163253  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20163252 caacaacgactttgactcgacaa 20163230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14954888 - 14954773
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954888 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaacttatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 14954789  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||    
T  14954788 gactttgactcgacaa 14954773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 631456 - 631334
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  631456 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcat 631357  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  631356 caacaatgactttgactcgacaa 631334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 10712258 - 10712380
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10712258 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtaaaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcgtggatgataattcat 10712357  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  10712358 caacaacgaccttgactcgacaa 10712380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 10926028 - 10926150
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10926028 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtaaaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcgtggatgataattcat 10926127  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  10926128 caacaacgaccttgactcgacaa 10926150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35812762 - 35812625
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact--------catgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||        |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35812762 ttcataagcacttcattaacaacacatggatagaagacaactcaacaacttaacaattcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 35812663  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35812662 cgactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 35812625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5757627 - 5757512
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757627 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 5757528  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  5757527 cgaccttgactcgaca 5757512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 9555939 - 9556054
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9555939 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 9556038  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  9556039 cgaccttgactcgaca 9556054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 12487094 - 12487209
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487094 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 12487193  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  12487194 cgaccttgactcgaca 12487209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14758124 - 14758009
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758124 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 14758025  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  14758024 cgaccttgactcgaca 14758009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 15224452 - 15224567
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15224452 gtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacagc 15224551  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  15224552 gaccttgactcgacaa 15224567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 33741789 - 33741904
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33741789 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 33741888  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  33741889 cgaccttgactcgaca 33741904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 14548425 - 14548562
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact--------catgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||        |||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14548425 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttagcaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcaaggatga 14548524  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14548525 caactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 14548562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4562022 - 4561907
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4562022 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttgacaactcatggatgataattcatcaacaa 4561923  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  4561922 cgaccttgactcgaca 4561907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17048812 - 17048690
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| || || |||||| | ||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17048812 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtataatacaactcagcaactcatagatgataattcgttaacaacttaacaactcgtggatgataattcat 17048713  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  17048712 caacaacgactttgaatcgacaa 17048690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 16997240 - 16997377
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaact--------taacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||        |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16997240 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacctaacaactcatggatgtcaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 16997339  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16997340 caactcattaacaacgactttgactcgacagtgcaact 16997377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 186
Target Start/End: Original strand, 17809723 - 17809798
Alignment:
Q  111 aactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgaca 186  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17809723 aactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgaca 17809798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13592621 - 13592532
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgc 190  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13592621 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacgactcatcaacaacgactttgactcaacaatgc 13592532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15042379 - 15042316
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15042379 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 15042316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 15112045 - 15112108
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15112045 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 15112108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 25090441 - 25090504
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25090441 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 25090504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 194
Target Start/End: Original strand, 42874589 - 42874649
Alignment:
Q  134 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42874589 acaactcaacaactcatgaatgacaactcatcaacaacgactttgattcgacaatgcaact 42874649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 185
Target Start/End: Original strand, 27533457 - 27533500
Alignment:
Q  142 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgac 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27533457 acaactcatggatgataattcatcgacaacgactttgactcgac 27533500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 25689312 - 25689378
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25689312 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 25689378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Original strand, 25689349 - 25689394
Alignment:
Q  142 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25689349 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaa 25689394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Original strand, 17809745 - 17809783
Alignment:
Q  100 gacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17809745 gacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 17809783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13592624 - 13592584
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13592624 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 13592584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 114
Target Start/End: Original strand, 14650373 - 14650417
Alignment:
Q  70 aagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14650373 aagtacttcgttaacaactcatggatagaagacaacttaacaact 14650417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 192
Target Start/End: Original strand, 14650411 - 14650470
Alignment:
Q  133 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaa 192  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14650411 aacaacttgacaacgcatggataaaaacttatcgacaacgactttgactcgacaatgcaa 14650470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 27533420 - 27533486
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27533420 gtacttctttaacaacacatgggtagaacgcaactcgacaactcatggatgataattcatcgacaac 27533486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Original strand, 33185493 - 33185535
Alignment:
Q  16 catcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatca 58  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  33185493 catcataatcaatatcataaacaacataacaacatcataatca 33185535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Original strand, 25090400 - 25090449
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  25090400 ttcataagcacttcattaacaacaagtggatagaagacaactcaacaact 25090449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 24274692 - 24274882
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaa------- 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  24274692 acatcatcataatcaatatcacaaaca---taacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaactcaaca 24274788  T
Q  105 ----cttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24274789 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcctcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 24274882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 20487199 - 20487321
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20487199 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 20487298  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20487299 caacaacgactttgactcgacaa 20487321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14933247 - 14933112
Alignment:
Q  17 atcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagac--------aactta 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        ||||||    
T  14933247 atcataaacaatatcataaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtactttattaacaacacatggatagaagacaactcaacaactta 14933148  T
Q  109 acaactcatgcatgataattcatcaacaacttaaca 144  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14933147 acaactcatggatgataattcatcaacaacttaaca 14933112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15356682 - 15356547
Alignment:
Q  17 atcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagac--------aactta 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        ||||||    
T  15356682 atcataaacaatatcataaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtactttattaacaacacatggatagaagacaactcaacaactta 15356583  T
Q  109 acaactcatgcatgataattcatcaacaacttaaca 144  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15356582 acaactcatggatgataattcatcaacaacttaaca 15356547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15360796 - 15360661
Alignment:
Q  17 atcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagac--------aactta 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        ||||||    
T  15360796 atcataaacaatatcataaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtactttattaacaacacatggatagaagacaactcaacaactta 15360697  T
Q  109 acaactcatgcatgataattcatcaacaacttaaca 144  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15360696 acaactcatggatgataattcatcaacaacttaaca 15360661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13919198 - 13919077
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13919198 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 13919099  T
Q  165 caacaacgactttgactcgaca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13919098 caacaacgactttgactcgaca 13919077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12705362 - 12705240
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12705362 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 12705263  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  12705262 caacaacgaccttgactcgacaa 12705240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 39721644 - 39721766
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39721644 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 39721743  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
     ||||||||| ||||||||||||    
T  39721744 taacaacgaccttgactcgacaa 39721766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25927946 - 25927822
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaa--cttaacaactcatggatgataattc 162  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25927946 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaaaaaaacttaacaactcatggatgataattc 25927847  T
Q  163 atcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25927846 atcaacaacgactttgactcgacaa 25927822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2530850 - 2530735
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2530850 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcttagatgataattcatcaacaacttaacaattcatggatgataattcatcaacaac 2530751  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||    
T  2530750 gactttgactcgacaa 2530735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45170727 - 45170612
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45170727 gtacttctttaacaacacatgggtagaaaacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 45170628  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||    
T  45170627 gactttgactcgacaa 45170612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2832900 - 2832778
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2832900 ttcataggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaaatcatggatgataattcat 2832801  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  2832800 caacaacgactttgacttgacaa 2832778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 15083574 - 15083696
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15083574 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgatatttcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 15083673  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  15083674 caacaacgaccttgactcgacaa 15083696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 18301704 - 18301826
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301704 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcat 18301803  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  18301804 caacaatgactttgactcgacaa 18301826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1859527 - 1859406
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859527 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaaaacaactcgacaactcgtagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 1859428  T
Q  165 caacaacgactttgactcgaca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1859427 caacaacgactttgactcgaca 1859406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15082466 - 15082374
Alignment:
Q  22 aatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15082466 aatcaatatcataaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaataacacatggatagaagacaactcaacaact 15082374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 16585101 - 16585238
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact--------catgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||        |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16585101 ttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 16585200  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16585201 caactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 16585238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 71464 - 71349
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71464 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 71365  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  71364 cgaccttgactcgaca 71349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 75573 - 75458
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75573 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 75474  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  75473 cgaccttgactcgaca 75458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16907908 - 16907793
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907908 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 16907809  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  16907808 cgaccttgactcgaca 16907793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 18282775 - 18282890
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18282775 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 18282874  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  18282875 cgaccttgactcgaca 18282890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 18425070 - 18425185
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18425070 gtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataactcatcaacaac 18425169  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  18425170 gaccttgactcgacaa 18425185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 26291782 - 26291897
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26291782 gtacttctttaacaacacataggtggaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 26291881  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  26291882 gaccttgactcgacaa 26291897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Original strand, 14257914 - 14258007
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14257914 acaacttaacaactcatggatgacaattcctcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcggcaatgcaact 14258007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Original strand, 16579246 - 16579339
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579246 acaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 16579339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16586416 - 16586323
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16586416 acaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 16586323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 32518 - 32633
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32518 gtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 32617  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  32618 cgaccttgactcgaca 32633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 12718077 - 12718192
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718077 gtacttctttaacaatacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 12718176  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  12718177 cgaccttgactcgaca 12718192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 12722988 - 12723103
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12722988 gtacttctttaacaatacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 12723087  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  12723088 cgaccttgactcgaca 12723103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 16113650 - 16113765
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16113650 gtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 16113749  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  16113750 cgaccttgactcgaca 16113765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 16116803 - 16116918
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16116803 gtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 16116902  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  16116903 cgaccttgactcgaca 16116918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 18278812 - 18278927
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18278812 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 18278911  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||| ||||    
T  18278912 cgaccttgacttgaca 18278927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 192
Target Start/End: Original strand, 20585193 - 20585284
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaa 192  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20585193 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaatgactttgactcgacaatgcaa 20585284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12466600 - 12466466
Alignment:
Q  68 ataagtacttcattaactacacatggatagaagac--------aacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataa 159  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||        |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12466600 ataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatgtatgacaactcatccacaacttaacaactcatggatgacaa 12466501  T
Q  160 ttcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12466500 ctcatcaacaatgactttgattcgacaatgcaact 12466466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Original strand, 14257837 - 14257951
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaa--------cttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||        |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14257837 ttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaattcgtcaacaacttaacaactcatggatga 14257936  T
Q  157 taattcatcaacaac 171  Q
     ||||| ||||||||    
T  14257937 caattcctcaacaac 14257951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16461560 - 16461493
Alignment:
Q  127 ttcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16461560 ttcattaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcaacaatgcaact 16461493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15605934 - 15605873
Alignment:
Q  126 attcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15605934 attcatcaacaactcaaaaactcatggatgataattcatcaacaacgaatttgactcgacaa 15605873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 32300802 - 32300865
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32300802 tcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcaacaatgcaact 32300865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14183875 - 14183812
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14183875 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactaatcaaaaacgactttgactcgacaatgaaact 14183812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14933158 - 14933118
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14933158 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 14933118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15356593 - 15356553
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356593 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 15356553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15360707 - 15360667
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15360707 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 15360667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15082370 - 15082324
Alignment:
Q  140 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15082370 taacaactcatggatgataattcatc-acaacgactttgactcgacaa 15082324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7519743 - 7519669
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaact 139  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  7519743 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaact 7519669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14183916 - 14183867
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14183916 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaact 14183867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Original strand, 32300761 - 32300810
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  32300761 ttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 32300810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Original strand, 20585190 - 20585230
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20585190 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 20585230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Original strand, 16579243 - 16579283
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  16579243 tcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaac 16579283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16586419 - 16586379
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  16586419 tcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaac 16586379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 132; Significance: 9e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 10556 - 10749
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaa-----------g 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                
T  10556 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaacaacacatggatagaacacaactcaaca 10655  T
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10656 acaacttaacaactcatggatggtaattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgacattgactcggcaatgcaact 10749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 132; Significance: 9e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1245 - 1052
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaa-----------g 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                
T  1245 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaacaacacatggatagaacacaactcaaca 1146  T
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1145 acaacttaacaactcatggatggtaattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgacattgactcggcaatgcaact 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36685 - 36570
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36685 gtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 36586  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  36585 gaccttgactcgacaa 36570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 132; Significance: 9e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18245 - 18052
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagac--------- 102  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             
T  18245 acataatcataatcaatatcaaaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaaatacacatggatagaagacaactcaaca 18146  T
Q  103 --aacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18145 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcaaggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatacaact 18052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14238885 - 14238688
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagac--------- 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||             
T  14238885 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaacaacacatggatagaagacaactcaaca 14238786  T
Q  103 --aacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatg----ataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14238785 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgatatataattcatcaacaacgactttgactcgacaatacaact 14238688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22131583 - 22131461
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131583 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagatgacagctcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 22131484  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22131483 caacaacgactttgactcgacaa 22131461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41782001 - 41781879
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41782001 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 41781902  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  41781901 caacaacagctttgactcgacaa 41781879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 48602884 - 48603006
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48602884 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcagcaactcatagatgataattcattaacagcttaacaactcatggatgataattcat 48602983  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  48602984 caacaacgactttgactcgacaa 48603006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 42911764 - 42911901
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaa--------cttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||        |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42911764 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggatga 42911863  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42911864 caactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 42911901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1925850 - 1925735
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1925850 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 1925751  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  1925750 gaccttgactcgacaa 1925735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20924864 - 20924749
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20924864 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 20924765  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  20924764 gaccttgactcgacaa 20924749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 188
Target Start/End: Original strand, 33796922 - 33797045
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33796922 ttcataggtacttctttaataacacatgggtggaagacaactcgacaactcatagatgataatttatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 33797021  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaat 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33797022 caacaacgactttgactcgacaat 33797045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41388715 - 41388600
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41388715 gtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 41388616  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  41388615 gaccttgactcgacaa 41388600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 1010132 - 1010247
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010132 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 1010231  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  1010232 cgaccttgactcgaca 1010247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16376155 - 16376040
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376155 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 16376056  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  16376055 cgaccttgactcgaca 16376040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39244615 - 39244500
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244615 gtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 39244516  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  39244515 gaccttgactcgacaa 39244500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39248170 - 39248055
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39248170 gtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 39248071  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  39248070 gaccttgactcgacaa 39248055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 52638950 - 52639065
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52638950 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 52639049  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  52639050 cgacattgactcgaca 52639065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 23967357 - 23967494
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaact--------taacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||        |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23967357 ttcataagtacttcattaacaacacatatgtagaagacaactcaactacttaacaactcatggatgacaattcagcaacaacttaacaactcatggatga 23967456  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23967457 caactcatcaacaacgactttgactcggcaatgcaact 23967494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20229703 - 20229588
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| |   ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20229703 gtacttctttaacaacacataggcggaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 20229604  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  20229603 gaccttgactcgacaa 20229588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 21406766 - 21406881
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21406766 gtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacagctcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 21406865  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| || |||||||||    
T  21406866 gaccttaactcgacaa 21406881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Original strand, 48519938 - 48520031
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  48519938 acaacctaacaactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacaactttgactaaacaatgcaact 48520031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 19675540 - 19675603
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19675540 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 19675603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 20241616 - 20241679
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20241616 tcaacaacttaacaactcatggacgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 20241679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Original strand, 48519861 - 48519975
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaa--------cttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||        |||||||||||||| |||| || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  48519861 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaactcgtcaacaacctaacaactcatggatga 48519960  T
Q  157 taattcatcaacaac 171  Q
     ||||||||||||||    
T  48519961 caattcatcaacaac 48519975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4597080 - 4597047
Alignment:
Q  161 tcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4597080 tcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 4597047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 4597156 - 4597107
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4597156 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaact 4597107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 114
Target Start/End: Original strand, 20241576 - 20241624
Alignment:
Q  66 tcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20241576 tcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaact 20241624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 194
Target Start/End: Original strand, 20316106 - 20316153
Alignment:
Q  147 tcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20316106 tcatagatgacaactcatcaacaacgactttgacacgacaatgcaact 20316153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Original strand, 42911696 - 42911738
Alignment:
Q  16 catcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatca 58  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  42911696 catcataatcaatatcataaacaacataacaacatcataatca 42911738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Original strand, 48519793 - 48519835
Alignment:
Q  16 catcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatca 58  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  48519793 catcataatcaatatcataaacaacataacaacatcataatca 48519835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 127; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 29158 - 29337
Alignment:
Q  16 catcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaag--------acaactt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||        |||||||    
T  29158 catcataatcaatatcataaacaacataacaatgtcataatcataattattcaaaagtactttattaacaacacatggatagaagacaactcaacaactt 29257  T
Q  108 aacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29258 aacaactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggataataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 29337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 23992027 - 23992187
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23992027 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaactcaaca 23992126  T
Q  112 actcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23992127 a----------------------caacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgaatcgacaatgcaact 23992187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 34962972 - 34963130
Alignment:
Q  14 atcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||     
T  34962972 atcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaacaacatatggatagaatacaactcaacaa- 34963070  T
Q  114 tcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
                         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963071 ---------------------caacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 34963130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 2076875 - 2076997
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2076875 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 2076974  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2076975 caacaacgactttgactcgacaa 2076997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22074689 - 22074567
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074689 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagataactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 22074590  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22074589 caacaacgactttgactcgacaa 22074567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 23414308 - 23414430
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414308 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 23414407  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23414408 caacaacgactttgactcgacaa 23414430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31478680 - 31478565
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478680 gtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 31478581  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  31478580 gaccttgactcgacaa 31478565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19774190 - 19774053
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaact--------taacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||        |||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19774190 ttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaactcgtcaacaacttaacaactcatggatga 19774091  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774090 caagtcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 19774053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 22805377 - 22805514
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact--------catgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||        |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22805377 ttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 22805476  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22805477 caactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 22805514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 1643920 - 1644035
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1643920 gtacttctttaacaacacataggtggaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 1644019  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  1644020 gaccttgactcgacaa 1644035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 8243242 - 8243357
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8243242 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 8243341  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  8243342 cgaccttgactcgaca 8243357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 11566271 - 11566386
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566271 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 11566370  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  11566371 cgaccttgactcgaca 11566386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12619539 - 12619424
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12619539 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 12619440  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  12619439 cgaccttgactcgaca 12619424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 14471623 - 14471738
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14471623 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacgactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatagatgatagttcatcaacaac 14471722  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||    
T  14471723 gactttgactcgacaa 14471738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 22862355 - 22862470
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22862355 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 22862454  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  22862455 cgaccttgactcgaca 22862470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 23394477 - 23394592
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23394477 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 23394576  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  23394577 cgaccttgactcgaca 23394592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 23989329 - 23989444
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989329 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 23989428  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  23989429 cgaccttgactcgaca 23989444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 23538215 - 23538305
Alignment:
Q  100 gacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgc 190  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23538215 gacaacttaacaactcttgaatgataattcatcaacaacttaacaactcttggatgataattcatcaacaacgaatttgactagacaatgc 23538305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Original strand, 17105321 - 17105414
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17105321 acaacttaacaactcatggatgccaactcatcgacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 17105414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 187
Target Start/End: Original strand, 16623772 - 16623879
Alignment:
Q  80 ttaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttga 179  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16623772 ttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgaccttga 16623871  T
Q  180 ctcgacaa 187  Q
    ||||||||    
T  16623872 ctcgacaa 16623879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19656700 - 19656614
Alignment:
Q  108 aacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656700 aacaactcatggatgagaattcatcatcaacttaacaactcatggatgacaactcatcgacaacgactttgactcgacaatgcaact 19656614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15706022 - 15705929
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15706022 acaacttaaccactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgaatttgacttgacaatgcaact 15705929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Original strand, 17742841 - 17742934
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17742841 acaactttacaactcatggatgtcaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcggtaatgcaact 17742934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 186
Target Start/End: Original strand, 19870039 - 19870114
Alignment:
Q  111 aactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgaca 186  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19870039 aactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcgtggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgaca 19870114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27126665 - 27126599
Alignment:
Q  128 tcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27126665 tcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 27126599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 176
Target Start/End: Original strand, 16759708 - 16759784
Alignment:
Q  100 gacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactt 176  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16759708 gacaacttaacaactaatggatgataattcatcgacaacttaacagctaatggatgataattcatcaacaacgactt 16759784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Original strand, 17105193 - 17105342
Alignment:
Q  16 catcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaag-----------acaa 104  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||           ||||    
T  17105193 catcataatcaatatcataa-caacataacaacatcataatcataattcctcataagcacttcattaacaacacatggatagaagacaactcaataacaa 17105291  T
Q  105 cttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatg 155  Q
    ||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17105292 cttaacaactcgtggatgacgactcatcaacaacttaacaactcatggatg 17105342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 171
Target Start/End: Original strand, 16759646 - 16759746
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16759646 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactaatggatgataattcatcgacaa 16759745  T
Q  171 c 171  Q
    |    
T  16759746 c 16759746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Original strand, 17742764 - 17742878
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaa--------cttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||        |||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  17742764 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggaggacaattcatcaacaactttacaactcatggatgt 17742863  T
Q  157 taattcatcaacaac 171  Q
     ||||||||||||||    
T  17742864 caattcatcaacaac 17742878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19656869 - 19656762
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattca--tcaacaacttaacaactcatggatgataattc 162  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | ||  ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19656869 ttcataagcacttcattaacaacacatagatagaagacaactcaacaactcatggat-agaagacaactcaacaacttagcaactcatggatgacaattc 19656771  T
Q  163 atcaacaac 171  Q
    |||||||||    
T  19656770 atcaacaac 19656762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 7825433 - 7825496
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7825433 tcaacaacttaacaactcgtggatgacaactcatcaacaacgactttgattcgacaatgcaact 7825496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Original strand, 20182325 - 20182440
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaact---------taacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatg 155  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||         |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  20182325 ttcataagcacttcatttacaacacatgggtagaagacaactcaacaactttaacaactcatgtatgacaattcatcgacaactcaacaactcgtggatg 20182424  T
Q  156 ataattcatcaacaac 171  Q
    | ||||||||||||||    
T  20182425 acaattcatcaacaac 20182440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22153666 - 22153551
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaact---------taacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatg 155  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||         |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  22153666 ttcataagcacttcatttacaacacatgggtagaagacaactcaacaactttaacaactcatgtatgacaattcatcgacaactcaacaactcgtggatg 22153567  T
Q  156 ataattcatcaacaac 171  Q
    | ||||||||||||||    
T  22153566 acaattcatcaacaac 22153551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15706099 - 15705985
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact--------catgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||        |||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15706099 ttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacgactcatagatgacaactcatcaacaacttaaccactcatggatga 15706000  T
Q  157 taattcatcaacaac 171  Q
     || |||||||||||    
T  15705999 caactcatcaacaac 15705985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19656799 - 19656746
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggat 154  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656799 acaacttagcaactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggat 19656746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27416557 - 27416508
Alignment:
Q  137 acttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgaca 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27416557 acttaacaactcatagatgataattcatcaacaacgacttcgactcgaca 27416508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 27556079 - 27556159
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaa 145  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  27556079 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaaaacaactcgacaactcatagatgataattcatcatcaacttaacaa 27556159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 22948526 - 22948592
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22948526 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 22948592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 22952482 - 22952548
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22952482 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 22952548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 23870970 - 23871036
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23870970 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 23871036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 23874926 - 23874992
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23874926 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 23874992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Original strand, 22948563 - 22948608
Alignment:
Q  142 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22948563 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaa 22948608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Original strand, 22952519 - 22952564
Alignment:
Q  142 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22952519 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaa 22952564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Original strand, 23871007 - 23871052
Alignment:
Q  142 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23871007 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaa 23871052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Original strand, 23874963 - 23875008
Alignment:
Q  142 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23874963 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaa 23875008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 151
Target Start/End: Original strand, 20182402 - 20182453
Alignment:
Q  100 gacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 151  Q
    ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20182402 gacaactcaacaactcgtggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatg 20182453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22153589 - 22153538
Alignment:
Q  100 gacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 151  Q
    ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22153589 gacaactcaacaactcgtggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatg 22153538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Original strand, 17742621 - 17742663
Alignment:
Q  16 catcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatca 58  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17742621 catcataatcaatatcataaacaacataacaacgtcataatca 17742663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 20078625 - 20078560
Alignment:
Q  50 tcataatcataattattcataagt-acttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  20078625 tcataatcataattcttcataaaacacttcattaacaactcatgtatagaagacaacttaacaact 20078560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19656735 - 19656695
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19656735 tcaacaacttaacaactcatggatgacaatttatcaacaac 19656695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18918029 - 18917990
Alignment:
Q  148 catggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18918029 catggatgataattcatcaccaacgactttgactcaacaa 18917990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Original strand, 17105353 - 17105391
Alignment:
Q  100 gacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17105353 gacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaac 17105391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Original strand, 19870061 - 19870099
Alignment:
Q  100 gacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19870061 gacaacttaacaactcgtggatgataattcatcaacaac 19870099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Original strand, 7825392 - 7825441
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||    
T  7825392 ttcataagcacttcattaacaactcgtggatagaagacaactcaacaact 7825441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Original strand, 18452876 - 18452941
Alignment:
Q  50 tcataatcataattattcataagt-acttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||    
T  18452876 tcataatcataattcttcataaaacacttcattaacaactcatgtatagaaggcaacttaacaact 18452941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27126706 - 27126665
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaact 106  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27126706 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaact 27126665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 187
Target Start/End: Original strand, 27556159 - 27556188
Alignment:
Q  158 aattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556159 aattcatcaacaacgactttgactcgacaa 27556188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 58
Target Start/End: Original strand, 17742687 - 17742727
Alignment:
Q  18 tcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatca 58  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  17742687 tcataatcaatatcataaacaacataacaacatcataatca 17742727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 13543579 - 13543738
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13543579 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaactcaaca 13543678  T
Q  112 actcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaac 193  Q
    |                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13543679 a----------------------caacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgccaatgcaac 13543738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 46821821 - 46821981
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  46821821 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaa------------ 46821908  T
Q  112 actcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
              ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46821909 ----------gataactcaataacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatacaact 46821981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 184
Target Start/End: Original strand, 12339107 - 12339225
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339107 ttcataggtacttctttaacaacacatgg-tagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 12339205  T
Q  165 caacaacgactttgactcga 184  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12339206 caacaacgactttgactcga 12339225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 14665056 - 14665178
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14665056 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgaatgataattcat 14665155  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14665156 caacaacgactttgactcgacaa 14665178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 14668212 - 14668334
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668212 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagataactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 14668311  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14668312 caacaacgactttgactcgacaa 14668334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 15464505 - 15464627
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464505 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcgtagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 15464604  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15464605 caacaacgactttgactcgacaa 15464627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 15964357 - 15964472
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15964357 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 15964456  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||    
T  15964457 gactttgactcgacaa 15964472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 15968281 - 15968396
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15968281 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 15968380  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||    
T  15968381 gactttgactcgacaa 15968396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 15972205 - 15972320
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15972205 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 15972304  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||    
T  15972305 gactttgactcgacaa 15972320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37440340 - 37440218
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440340 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 37440241  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  37440240 caacaacgaccttgactcgacaa 37440218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16751037 - 16750922
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751037 gtacttctttaacaacacataggtagaagacaacttaacaactcatagatgataattcattgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 16750938  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  16750937 gaccttgactcgacaa 16750922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 12120326 - 12120224
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaaca 111  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  12120326 acatcatcaaaatcaatatcataaacaacataacgatgtcataatcataattattcataagtacttcattaacgacacatggatagaaaacaactcaaca 12120227  T
Q  112 act 114  Q
    |||    
T  12120226 act 12120224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 38962444 - 38962342
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaaca 111  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||    
T  38962444 acatcatcaaaatcaatatcataaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaacaacacgtggatagaagacatctcaaca 38962345  T
Q  112 act 114  Q
    |||    
T  38962344 act 38962342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 19774980 - 19775095
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774980 gtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 19775079  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  19775080 gaccttgactcgacaa 19775095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18700955 - 18700862
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18700955 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 18700862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8489887 - 8489768
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  8489887 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaac---ttaacaactcatggatgaaaattcat 8489791  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8489790 caacaacgactttgactcgacaa 8489768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4108096 - 4107985
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4108096 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 4107997  T
Q  171 cgactttgactc 182  Q
    |||| |||||||    
T  4107996 cgaccttgactc 4107985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4111948 - 4111837
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111948 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 4111849  T
Q  171 cgactttgactc 182  Q
    |||| |||||||    
T  4111848 cgaccttgactc 4111837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4589609 - 4589494
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4589609 gtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatagatgataattcatcaacaac 4589510  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
     |||||||||||||||    
T  4589509 aactttgactcgacaa 4589494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 11069480 - 11069595
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11069480 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 11069579  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  11069580 cgaccttgactcgaca 11069595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 14498737 - 14498852
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14498737 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 14498836  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  14498837 cgaccttgactcgaca 14498852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 22321076 - 22321191
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321076 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 22321175  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  22321176 cgaccttgactcgaca 22321191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 22336131 - 22336246
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336131 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 22336230  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  22336231 cgaccttgactcgaca 22336246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27410341 - 27410226
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27410341 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 27410242  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  27410241 cgaccttgactcgaca 27410226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 28949134 - 28949249
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949134 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 28949233  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  28949234 cgaccttgactcgaca 28949249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 55022277 - 55022392
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022277 gtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 55022376  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  55022377 cgaccttgactcgaca 55022392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12853013 - 12852891
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12853013 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactaagaaactcaaagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcat 12852914  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||  |||||||||||||||    
T  12852913 caacaataactttgactcgacaa 12852891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2842791 - 2842654
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact--------catgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||        |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2842791 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaactttacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 2842692  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2842691 caactcatcaacaacgactttgactcgaaaatgcaact 2842654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 7109108 - 7109223
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109108 gtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 7109207  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  7109208 cgaccttgactcgaca 7109223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 7113043 - 7113158
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113043 gtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 7113142  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  7113143 cgaccttgactcgaca 7113158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11166226 - 11166111
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11166226 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 11166127  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||| ||||||    
T  11166126 cgaccttgaatcgaca 11166111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 15616786 - 15616901
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15616786 gtacttctttaacaacacatgggtagaacataactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 15616885  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  15616886 cgaccttgactcgaca 15616901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 187
Target Start/End: Original strand, 5222772 - 5222850
Alignment:
Q  109 acaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5222772 acaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataatttatcaacaacgactttgactcgacaa 5222850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 16795914 - 16796036
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16795914 ttcataggtacttctttaacaacacatgagtagaatacaactcagcaactcatagatgataattcattaataacttaacaactcatggatgataattcat 16796013  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||| |||| |||||    
T  16796014 caacaacgacttcgactagacaa 16796036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Original strand, 14441067 - 14441160
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14441067 acaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacttaacagctcatggataacaactcatcgacaacgactttgactcgacaatgcaact 14441160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10543144 - 10543007
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactca--------tgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | |        || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10543144 ttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaatttaacgaatcgtggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 10543045  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10543044 caactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 10543007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17317824 - 17317709
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17317824 gtacttctttaacaacatataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacgacttaacaattcatggatgataattcatcaacaac 17317725  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  17317724 gaccttgactcgacaa 17317709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 187
Target Start/End: Original strand, 14670512 - 14670598
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670512 acaactcaacaactcatggatgacaactcgtcaacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgactttgactcgacaa 14670598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 43890265 - 43890172
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43890265 acaacttaacaactcatggatgacaactcgtcaacaacttaacaatccatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 43890172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 187
Target Start/End: Original strand, 14682034 - 14682120
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682034 acaacttaacaactcatggatgacaacttgtcaacaacttaacaactcatgcatgacaattcatcaacaacgactttgactcgacaa 14682120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Original strand, 14440997 - 14441104
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcat-gataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattca 163  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14440997 ttcataagcactttattaacaacacatggatagaagacaactcaacaactcatggatagaagacaaatcaacaacttaacaactcatggatgacaattca 14441096  T
Q  164 tcaacaac 171  Q
    ||||||||    
T  14441097 tcaacaac 14441104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 35353358 - 35353421
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35353358 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 35353421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 10562476 - 10562539
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10562476 tcaacaacttaataactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 10562539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42353731 - 42353672
Alignment:
Q  135 caacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42353731 caacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 42353672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 194
Target Start/End: Original strand, 5214723 - 5214783
Alignment:
Q  134 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5214723 acaacttaataactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 5214783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 171
Target Start/End: Original strand, 15565301 - 15565371
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15565301 acaacttaacaactcgtggatgacaattcatcaacaacctaacaactcacggatgacaattcatcaacaac 15565371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13521038 - 13520978
Alignment:
Q  111 aactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13521038 aactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgaaaattcatcaacaac 13520978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Original strand, 44269408 - 44269460
Alignment:
Q  142 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44269408 acaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 44269460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12120220 - 12120173
Alignment:
Q  140 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12120220 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcaacaa 12120173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38962338 - 38962291
Alignment:
Q  140 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962338 taacaactcatgaatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 38962291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 43890342 - 43890228
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa--------ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||        |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43890342 ttcataagcacttcataaacaacacatgggtagaagacaactcaacaaattaacgactcatgaatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 43890243  T
Q  157 taattcatcaacaac 171  Q
     || || ||||||||    
T  43890242 caactcgtcaacaac 43890228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14067352 - 14067289
Alignment:
Q  87 cacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcat 150  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14067352 cacatgggtagaacacaactcgacaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 14067289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19884862 - 19884816
Alignment:
Q  132 caacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19884862 caacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttg 19884816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 187
Target Start/End: Original strand, 30065432 - 30065475
Alignment:
Q  144 aactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30065432 aactcatggatgataattcatcgacaacgaccttgactcgacaa 30065475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Original strand, 35353317 - 35353366
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35353317 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaact 35353366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Original strand, 15565298 - 15565338
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15565298 tcaacaacttaacaactcgtggatgacaattcatcaacaac 15565338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19884907 - 19884859
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaac 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19884907 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaac 19884859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13521015 - 13520976
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaactt 140  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13521015 acaacttaacaactcatggatgaaaattcatcaacaactt 13520976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 18700957 - 18700918
Alignment:
Q  132 caacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18700957 caacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 18700918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 2842859 - 2842817
Alignment:
Q  16 catcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatca 58  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  2842859 catcataatcaatatcataaacaacataacaacatcataatca 2842817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Original strand, 5214589 - 5214631
Alignment:
Q  16 catcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatca 58  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  5214589 catcataatcaatatcataaacaacataacaacatcataatca 5214631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 138
Target Start/End: Original strand, 5222797 - 5222834
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5222797 acaacttaacaactcatggatgataatttatcaacaac 5222834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Original strand, 15565334 - 15565425
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaac---tcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||   | ||| |||| ||||||||||||||    || ||||||||||||||||    
T  15565334 acaacctaacaactcacggatgacaattcatcaacaacttaacaacaacttatg-atgacaattcatcaacaac----ttaactcgacaatgcaact 15565425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6594 - 6472
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 6495  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6494 caacaacgactttgactcgacaa 6472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36814 - 36692
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36814 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 36715  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36714 caacaacgactttgactcgacaa 36692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19440 - 19263
Alignment:
Q  28 tatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaac-----------tca 116  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||           |||    
T  19440 tatcataaacaacataacaacatcataatcataattcttcataagcacctcattaacaacacatggataaaagacaacttaacaacaacttaacaactca 19341  T
Q  117 tgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19340 tggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgattttgactcgacaatgcaact 19263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 63620 - 63443
Alignment:
Q  28 tatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaact-----------taacaactca 116  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||    
T  63620 tatcataaacaacataacaacatcataatcataattcttcataagcacctcattaacaacacatggatagaagacaactcaacaacaacttaacaactca 63521  T
Q  117 tgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  63520 tggttgacaattcatcaagaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgaatttgactcgacaatgcaact 63443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8124 - 8030
Alignment:
Q  100 gacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8124 gacaacttaacaactcatggatgataattcatcaaaaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 8030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8192 - 8090
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8192 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgacaattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 8093  T
Q  165 caa 167  Q
    |||    
T  8092 caa 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14815 - 14693
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14815 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 14716  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14715 caacaacgactttgactcgacaa 14693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 18355620 - 18355742
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18355620 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 18355719  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  18355720 caacaacgacttcgactcgacaa 18355742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 11230524 - 11230646
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11230524 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 11230623  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  11230624 caacaacgaccttgactcgacaa 11230646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 11224712 - 11224834
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11224712 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaaatcatggatgataattcat 11224811  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  11224812 caacaacgaccttgactcgacaa 11224834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40724312 - 40724198
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40724312 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 40724213  T
Q  172 gactttgactcgaca 186  Q
    |||||||||| ||||    
T  40724212 gactttgacttgaca 40724198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 11228542 - 11228657
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11228542 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgtcaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 11228641  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  11228642 gaccttgactcgacaa 11228657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 187
Target Start/End: Original strand, 11220134 - 11220248
Alignment:
Q  73 tacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacg 172  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11220134 tacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgtcaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacg 11220233  T
Q  173 actttgactcgacaa 187  Q
    || ||||||||||||    
T  11220234 accttgactcgacaa 11220248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 187
Target Start/End: Original strand, 11226553 - 11226667
Alignment:
Q  73 tacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacg 172  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11226553 tacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacg 11226652  T
Q  173 actttgactcgacaa 187  Q
    |  ||||||||||||    
T  11226653 atcttgactcgacaa 11226667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 20295256 - 20295371
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295256 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 20295355  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  20295356 cgaccttgactcgaca 20295371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 10752602 - 10752715
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752602 gtacttctttaacaacatataggtagaagacaactcgacaactcag--atgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 10752699  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  10752700 gaccttgactcgacaa 10752715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15237530 - 15237416
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15237530 gtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatc-acaac 15237432  T
Q  172 gactttgactcgacaa 187  Q
    ||| ||||||||||||    
T  15237431 gaccttgactcgacaa 15237416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22108046 - 22107993
Alignment:
Q  134 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108046 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 22107993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22108082 - 22108009
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22108082 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 22108009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33896173 - 33896114
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgc 190  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33896173 tcaacaatttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcaacaatgc 33896114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19473381 - 19473315
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19473381 gtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 19473315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19473344 - 19473299
Alignment:
Q  142 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19473344 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaa 19473299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24767971 - 24767898
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24767971 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcacagatgataattcatcaacaac 24767898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20911559 - 20911515
Alignment:
Q  143 caactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911559 caactaatagatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 20911515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20911604 - 20911531
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  20911604 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgtcaactaatagatgataattcatcaacaac 20911531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 24767927 - 24767887
Alignment:
Q  142 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactc 182  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24767927 acaactcacagatgataattcatcaacaacgactttgactc 24767887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12791 - 12698
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12791 acaacttaacaactcatggatgataatacatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 12698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12793 - 12754
Alignment:
Q  132 caacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12793 caacaacttaacaactcatggatgataatacatcaacaac 12754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12829 - 12797
Alignment:
Q  74 acttcattaactacacatggatagaagacaact 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12829 acttcattaacaacacatggatagaagacaact 12797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8293 - 8171
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8293 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaacttagcaactcaaagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcat 8194  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  8193 caacaatgactttgactcgacaa 8171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 208316 - 208194
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208316 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaagtcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 208217  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  208216 caacaacgactttgacttgacaa 208194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 190105 - 189983
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  190105 ttcataggtacttctttaacaacacatgggaagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggattataattcat 190006  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  190005 caacaacgactttgactcgacaa 189983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Original strand, 3598 - 3690
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaa 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3598 acatcatcaaaatcaatatcataaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaacaacacatggatagaagacaa 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 220 - 97
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattca 163  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  220 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattca 121  T
Q  164 tcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  120 tcaacaacgaccttgactcgacaa 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 11373 - 11495
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11373 ttcataggtacttctttaacaagacatgggtagaagacaactcgacaactcgtagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 11472  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    
T  11473 caacaatgactttgactcaacaa 11495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25299 - 25177
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25299 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaactcgtagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcat 25200  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  25199 caacaatgactttgactcgacaa 25177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 62303 - 62189
Alignment:
Q  73 tacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacg 172  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62303 tacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacgactcatgtatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacg 62204  T
Q  173 actttgactcgacaa 187  Q
    ||||||| |||||||    
T  62203 actttgaatcgacaa 62189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 66219 - 66105
Alignment:
Q  73 tacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacg 172  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  66219 tacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacgactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcataaacaacg 66120  T
Q  173 actttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||    
T  66119 actttgactcgacaa 66105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 79951 - 80066
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  79951 gtacttctttaataacacataggtagaagacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaacttatggatgataattcatcaacaa 80050  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||| ||||    
T  80051 cgaccttgacttgaca 80066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 74022 - 73900
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  74022 ttcataggtacttctttaacaacacttaggtagaagacaactcgacaactcttagatgataattcatcaacaactgaacaactcatggatgataattcat 73923  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  73922 caacaacgactttgactcgacaa 73900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 622
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  715 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgagaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 678
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  718 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 187
Target Start/End: Original strand, 9248 - 9377
Alignment:
Q  58 ataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgat 157  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| |||| | | || |||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9248 ataattcttcataggtacttctttaacaacacttaggtataagacagctcgacaattcttggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgat 9347  T
Q  158 aattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9348 aattcatcaacaacgactttgactcgacaa 9377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 194
Target Start/End: Original strand, 8177 - 8267
Alignment:
Q  104 acttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8177 acttaacgactcatgaatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgacttagactcgacaatgcaact 8267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14043 - 13906
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaaga--------caacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||        ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14043 ttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagataactcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 13944  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13943 caactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 13906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5796 - 5681
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5796 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 5697  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  5696 cgaccttgactcgaca 5681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 11831 - 11946
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11831 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 11930  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  11931 cgaccttgactcgaca 11946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33383 - 33268
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33383 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 33284  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  33283 cgaccttgactcgaca 33268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 67998 - 67883
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67998 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 67899  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  67898 cgaccttgactcgaca 67883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19699 - 19606
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19699 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaaattagcaactcatggatgacaactcattaacaacgactttaactcgacaatgcaact 19606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19702 - 19663
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19702 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaa 19663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 59416 - 59301
Alignment:
Q  72 gtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaa-ctcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59416 gtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 59317  T
Q  171 cgactttgactcgaca 186  Q
    |||| |||||||||||    
T  59316 cgaccttgactcgaca 59301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 195
Target Start/End: Original strand, 263 - 393
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||| | ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  263 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaataaaactcagcaactcatagatgataattcattaacaacttgacaactcatggatgataattcat 362  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaatgcaactc 195  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  363 caacaacgacattgacttgacaatgcgactc 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20894 - 20785
Alignment:
Q  80 ttaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaa--cttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgacttt 177  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20894 ttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaaaaaaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacaacttt 20795  T
Q  178 gactcgacaa 187  Q
    ||||||||||    
T  20794 gactcgacaa 20785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Original strand, 4343 - 4449
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4343 ttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcat 4442  T
Q  165 caacaac 171  Q
    |||||||    
T  4443 caacaac 4449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Original strand, 4412 - 4505
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4412 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaatgattttgactcgacaatgcaact 4505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 3134 - 3256
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3134 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaactcatagatgataattcgttaacaacttagcaacacatggatgataattcat 3233  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3234 caacaacgactttgactcgacaa 3256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 7197 - 7319
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 164  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7197 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaactcatagatgataattcgttaacaacttagcaacacatggatgataattcat 7296  T
Q  165 caacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7297 caacaacgactttgactcgacaa 7319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 70; Significance: 9e-32; HSPs: 7)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15627 - 15534
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15627 acaactaaacaactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgactttaactcgataatgcaact 15534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15726 - 15656
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15726 acaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaactaaacaactcatggatcacaattcatcaacaac 15656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15689
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15759 acaacctaacaactcacggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaac 15689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15660 - 15590
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15660 acaacttaacaactcatggacgacaattcatgaacaactaaacaactcatggatgacaattcatcaacaac 15590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15693 - 15623
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  15693 acaactaaacaactcatggatcacaattcatcaacaacttaacaactcatggacgacaattcatgaacaac 15623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15792 - 15722
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15792 acaacttaacgactcgtggatgacaattcatcaacaacctaacaactcacggatgacaattcatcaacaac 15722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15795 - 15755
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15795 tcaacaacttaacgactcgtggatgacaattcatcaacaac 15755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4542 - 4450
Alignment:
Q  95 tagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4542 tagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaa 4450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20140 - 20003
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaact--------taacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||        |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20140 ttcataagcacttcattaacgacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 20041  T
Q  157 taattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
     || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20040 caactcatcaacaatgactttcactcgacaatgcaact 20003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Original strand, 7093 - 7145
Alignment:
Q  142 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7093 acaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcggcaatgcaact 7145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Original strand, 14212 - 14264
Alignment:
Q  142 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14212 acaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcggcaatgcaact 14264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 106
Target Start/End: Original strand, 7057 - 7098
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaact 106  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7057 ttcataagcacttcattaacaacacatggatagaagacaact 7098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 106
Target Start/End: Original strand, 14176 - 14217
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaact 106  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14176 ttcataagcacttcattaacaacacatggatagaagacaact 14217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Original strand, 28704 - 28836
Alignment:
Q  14 atcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataattattcataagtacttcattaactacacatggatagaag--------acaac 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||        |||||    
T  28704 atcatcataatcaatatcataaacaacttttcaatgtcataatcataatttttcataagtactttattaacaacacatagatagaagacaactcaacaac 28803  T
Q  106 ttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28804 ttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 28836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 187
Target Start/End: Original strand, 28796 - 28852
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28796 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 28852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 821
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  914 acaacttaacaactcatggatgacaattcctcaataacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaaagactttgactcggcaatgcaact 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 993 - 881
Alignment:
Q  63 tattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaa--------cttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggat 154  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||        |||||||||||||| |||| || || || |||||||||||||||||||||    
T  993 tattcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaaatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcgtctacaacttaacaactcatggat 894  T
Q  155 gataattcatcaa 167  Q
    || ||||| ||||    
T  893 gacaattcctcaa 881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Original strand, 7237 - 7327
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7237 acaacttgacaactcatggatgacaattcatcaacaacttaac---tcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgagaatgcaact 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 171
Target Start/End: Original strand, 7204 - 7274
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7204 acaacttaacaactcatagatgacaattcatcaacaacttgacaactcatggatgacaattcatcaacaac 7274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Original strand, 7201 - 7241
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7201 tcaacaacttaacaactcatagatgacaattcatcaacaac 7241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Original strand, 26 - 119
Alignment:
Q  101 acaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26 acaacttaaccactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatgaacaacgacattgactcgaaaatgcaact 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 171
Target Start/End: Original strand, 20 - 63
Alignment:
Q  128 tcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 171  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  20 tcatcaacaacttaaccactcatggatgacaactcatcaacaac 63  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 10704 - 10767
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10704 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 10767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Original strand, 10663 - 10712
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  10663 ttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagataactcaacaact 10712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 116617 - 116680
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116617 tcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 116680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Original strand, 116585 - 116625
Alignment:
Q  74 acttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  116585 acttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 116625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 4289 - 4339
Alignment:
Q  12 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataat 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4289 acatcatcataatcaatatcacaaacaacataacaatgtcataatcataat 4339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 102361 - 102302
Alignment:
Q  131 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgc 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  102361 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgacttgacaatgc 102302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 102404 - 102353
Alignment:
Q  63 tattcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  102404 tattcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaact 102353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 70804 - 70854
Alignment:
Q  137 acttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  70804 acttaacaactcatagatgataattcatcaacaacgacttagactcgacaa 70854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 194
Target Start/End: Original strand, 56612 - 56673
Alignment:
Q  133 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56612 aacaacttgacaactcatggataataacttatcgacaacgactttgactcgacaatgcaact 56673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 114
Target Start/End: Original strand, 56574 - 56618
Alignment:
Q  70 aagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  56574 aagtacttcgttaacaactcatggatagaagacaacttaacaact 56618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10468 - 10395
Alignment:
Q  65 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatgcatgataattcatcaacaac 138  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  10468 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcacagatgataattcatcaacaac 10395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10424 - 10384
Alignment:
Q  142 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactc 182  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424 acaactcacagatgataattcatcaacaacgactttgactc 10384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 6426 - 6466
Alignment:
Q  147 tcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6426 tcatagatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 6466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 156
Target Start/End: Original strand, 20938 - 20987
Alignment:
Q  107 taacaactcatgcatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 156  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20938 taacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 20987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 114
Target Start/End: Original strand, 15118 - 15162
Alignment:
Q  70 aagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15118 aagtacttcgttaacaactcatggatagaagacaacttaacaact 15162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 194
Target Start/End: Original strand, 15156 - 15217
Alignment:
Q  133 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaact 194  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15156 aacaacttgacaactcatggataacaacttatcgacaacgactttgactcgataatgtaact 15217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 166919 - 166875
Alignment:
Q  70 aagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  166919 aagtacttcgttaacaactcatggatagaagacaacttaacaact 166875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 166881 - 166822
Alignment:
Q  133 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaa 192  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  166881 aacaacttgacaacgcatggataaaaacttatcgacaacgactttgactcgacaatgcaa 166822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 7212 - 7257
Alignment:
Q  69 taagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7212 taagtacttcgttaacaactcatggatagaagacaacttaaaaact 7257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Original strand, 7852 - 7892
Alignment:
Q  74 acttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaact 114  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  7852 acttcattaacaactcatgtatagaagacaacttaacaact 7892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University