View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1139_low_27 (Length: 521)

Name: NF1139_low_27
Description: NF1139
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1139_low_27
NF1139_low_27
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (42-513)||(6364188-6364658)
chr8 (87-315)||(7460584-7460812)
chr8 (89-338)||(6275645-6275894)
chr8 (87-231)||(6353596-6353740)
chr8 (50-229)||(6392094-6392274)
chr8 (89-344)||(6290391-6290646)
chr8 (87-325)||(6425192-6425430)
chr8 (89-358)||(6333053-6333322)
chr8 (45-229)||(6411258-6411442)
chr8 (89-339)||(6322505-6322755)
chr8 (87-231)||(6371300-6371444)
chr8 (101-231)||(6264927-6265057)
chr8 (138-228)||(6458262-6458352)
chr8 (138-223)||(6452174-6452259)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (90-232)||(9603035-9603177)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (93-225)||(42694394-42694526)
chr2 (98-225)||(42687136-42687263)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (93-228)||(36743886-36744021)
chr3 (155-223)||(35722304-35722372)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 448; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 6364658 - 6364188
Alignment:
Q  42 aaattctcttttccaaaaacttgacacaatcaatgactacaattttgtagacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6364658 aaattctcttttccaaaaacttgacacaatcaatgactacaattttgtagacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtctactacagacaaga 6364559  T
Q  142 agaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatgggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggtgatgtggacaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6364558 agaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatgggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggtgatgtggacaag 6364459  T
Q  242 aacgctagtttggctcgtcctgttgttggaggatctagcaccctcccttaccctcgaagagggagaaccggcaggaaagcagctcgtaaaggttataaac 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6364458 aacgctagtttggctcgtcctgttgttggaggatctagcaccctcccttaccctcgaagagggagaaccggcaggaaagcagctcgtaaaggttat-aac 6364360  T
Q  342 tttatgttctatcttaacacttgagtatgttatattttaagaaattctggcaaaaattaagtgatatggtactaaaatgtgaaattgtattctacttgac 441  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6364359 tttacgttctatcttaacacttgagtatgttatattttaagaaattctggcaaaaattaagtgatatggtactaaaatgtgaaattgtattctacttgac 6364260  T
Q  442 aactaatgtttttatccctgatgttgtttactaagtctttttgttgatacaaatgtttactctgcctatgat 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6364259 aactaatgtttttatccctgatgttgtttactaagtctttttgttgatacaaatgtttactctgcttatgat 6364188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 87 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7460812 - 7460584
Alignment:
Q  87 tgtagacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaagga 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7460812 tgtagacataccttccaagtgcaacaccagctccattagtgtactacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaacgggagagcgcaagga 7460713  T
Q  187 atgggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggtgatgtggacaagaacgctagtttggctcgtcctgttgttggaggatctagcaccctc 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| || | | | |     
T  7460712 atgggacagaatatatgattatgatgtctacaatgacttgggtgatcccgaccagaaagctagcttggctcgtcctgttgctggaggacctggaaacttg 7460613  T
Q  287 ccttaccctcgaagagggagaaccggcag 315  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||    
T  7460612 ccttaccctcgaaggggaagaaccggcag 7460584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 89 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6275894 - 6275645
Alignment:
Q  89 tagacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6275894 tagacatatcttccaagtgaaacaccacctccattagtctactatagacaagaagagttgaacactttaagaggagatggaacaggagagcgtaaagaat 6275795  T
Q  189 gggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggtgatgtggacaagaacgctagtttggctcgtcctgttgttggaggatctagcaccctccc 288  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||||   |||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||| | |||| | ||    
T  6275794 gggaaaggatctatgactacgatgtctacaatgatgtgggtgatcctgacaagaaagcaagcttggctcgtcccgttattggaggatccaacaccttgcc 6275695  T
Q  289 ttaccctcgaagagggagaaccggcaggaaagcagctcgtaaaggttata 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  6275694 ttaccctcgaagagggagaaccggcaggaaaccagctaagaaaggttata 6275645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 87 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6353740 - 6353596
Alignment:
Q  87 tgtagacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaagga 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6353740 tgtagacataccttccaagtgaaacaccggctccattagtgtactacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgcaagga 6353641  T
Q  187 atgggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggtga 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6353640 atgggaaagaatatatgattacgatgtctacaatgatttgggtga 6353596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6392274 - 6392094
Alignment:
Q  50 ttttccaaaaacttgaca-caatcaatgactacaattttgtagacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattg 148  Q
    |||| ||||||||||||| ||  |||||  || |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6392274 tttttcaaaaacttgacagcacccaatggttaaaattttgtaggcataccttctaagggaaacaccagctccattactgtactacagacaagaagaattg 6392175  T
Q  149 aagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatgggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggt 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6392174 aatactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatgggacagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggt 6392094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6290646 - 6290391
Alignment:
Q  89 tagacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaat 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6290646 tagacataccttccaagtgaaacaccagctccattagtgtactatagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaacaggagagcgcaaggaat 6290547  T
Q  189 gggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggtgatgtggacaagaacgctagtttggctcgtcctgttgttggaggatctagcaccctccc 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    |||  |||  ||   ||||| ||||   || |||| ||||| ||||   ||||    
T  6290546 gggaaagaatatatgattacgatgtctacaatgatttaggtgagcctgactcgaaacctcaattggcgcgtcaaattcttgggggatcgagcaatttccc 6290447  T
Q  289 ttaccctcgaagagggagaaccggcaggaaagcagctcgtaaaggttataaacttt 344  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||    
T  6290446 ttaccctcgaaggggaagaaccggcagggaaccagctaagaaaggttataaacttt 6290391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6425430 - 6425192
Alignment:
Q  87 tgtagacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaagga 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  6425430 tgtagacataccttccaagtgaaacaccggctccattggtgtactatagacaagaagagttgaagactttaagaggagatggaaaaggagagcgcaagga 6425331  T
Q  187 atgggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggtgatgtggacaagaacgctagtttggctcgtcctgttgttggaggatctagcaccctc 286  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    |||  |||  |||  |||| |||||| ||| |||||||||| |||||| |     
T  6425330 atgggaaaggatctatgattacgatgtctacaatgatttgggtgagcctgactcgaaacctaccttgggtcgtccagttcttggaggatcgagcaccttg 6425231  T
Q  287 ccttaccctcgaagagggagaaccggcaggaaagcagct 325  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  6425230 ccttaccctcgaagggggagaacaggcagaaaaccagct 6425192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6333322 - 6333053
Alignment:
Q  89 tagacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaat 188  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  6333322 tagacgtaccttccaagcgaaacaccagctccattagtctactacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaacgggtgagcgcaaagaat 6333223  T
Q  189 gggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggtgatgtggacaagaacgctagtttggctcgtcctgttgttggaggatctagcaccctccc 288  Q
     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||   |||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| |  | | | ||    
T  6333222 cggataggatctatgactacgatgtttacaatgacttgggtgatcctgacaagaaagaaagcttggctcgtcccgttgttggaggatccaataacttgcc 6333123  T
Q  289 ttaccctcgaagagggagaaccggcaggaaagcagctcgtaaaggttataaactttatgttctatcttaa 358  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||   |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6333122 ttaccctcgaagggggagaaccggcaggaaacatgctaaaaaaggtgataaactttatgctctatcttaa 6333053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6411442 - 6411258
Alignment:
Q  45 ttctcttttccaaaaacttgacacaatcaatgactacaattttgtagacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaaga 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||  || |||| ||||| |||||||||||||| || |||||   || ||||||| |||||   |||||||    
T  6411442 ttctctttttcaaaaacttgacagcaccaatggttaaaattatgtaggcataccttccaagtcaagcaccacaaccattagtgtactacatcaaagaaga 6411343  T
Q  145 attgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatgggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6411342 attgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggtatgggacagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggt 6411258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6322755 - 6322505
Alignment:
Q  89 tagacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaat 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||     
T  6322755 tagacataccttccaagtgaaacaccagctccattagtctactatagagaagaagaattgaagactttaagaggagatggaacgggtcagcgcaaggaac 6322656  T
Q  189 gggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggtgatgtggacaagaacgctagtttggctcgtcctgttgttggaggatctagcaccctccc 288  Q
      || ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||   |||||| ||||    ||||||||||| ||| ||||||||||   |||| | ||    
T  6322655 acgatagaatctatgactacgatgtttacaatgacttgggtgatcctgacaagtacgcacacttggctcgtcccgttattggaggatccgacaccttgcc 6322556  T
Q  289 ttaccctcgaagagggagaaccggcaggaaagcagctcgtaaaggttataa 339  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||   |||||||||||    
T  6322555 ttaccctcgaaggggcagaaccggcaggaaaccagctaaaaaaggttataa 6322505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6371444 - 6371300
Alignment:
Q  87 tgtagacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaagga 186  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  6371444 tgtagacataccttctaagtgaaacaccagctccattagtctactacagacaagaagagttgaagactttaagaggagatggaacgggtgagcgcaaaga 6371345  T
Q  187 atgggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggtga 231  Q
    |||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6371344 atgggataggatctatgactacgatgtctacaatgatttgggtga 6371300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6265057 - 6264927
Alignment:
Q  101 ccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatgggaaagaatat 200  Q
    |||||||||||||| |||||  | || | ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | |    
T  6265057 ccaagtgaaacacctgctccacttgtctactatagacaattagagttgaagactttaagaggagatggaacgggggagcgcaaagaatgggacagagttt 6264958  T
Q  201 atgattatgatgtctacaatgatttgggtga 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6264957 atgattatgatgtttacaatgatttgggtga 6264927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6458352 - 6458262
Alignment:
Q  138 aagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatgggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttggg 228  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||| | |||||||||||| | || |||||||||||    
T  6458352 aagaagagttgcagactctaagaggagatggaactggagagcgcaaagaagcggatagagtttatgattatgatatttataatgatttggg 6458262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6452259 - 6452174
Alignment:
Q  138 aagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatgggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgat 223  Q
    ||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  6452259 aagaagagttgcagaatctaagaggagatggaaccggagaacgcaaagaatgggataggatatacgattatgatgtttataatgat 6452174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 232
Target Start/End: Original strand, 9603035 - 9603177
Alignment:
Q  90 agacataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatg 189  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| |||||| | || || |||||    
T  9603035 agacatatcttccaagtcaaacaccagctccattagtctactacagacaagaagaattgcaaaatctaagaggagatggtactggacaacgaaaagaatg 9603134  T
Q  190 ggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgatttgggtgat 232  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9603135 ggaaagagtttatgattatgatgtctacaatgatcttggtgat 9603177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42694526 - 42694394
Alignment:
Q  93 cataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatggga 192  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    || ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  42694526 catatcttcctagtgaaacaccggctccattagtccattatagagaagaagaattgaacaatttaagaggagatggaacaggagaacgcaaagaatggga 42694427  T
Q  193 aagaatatatgattatgatgtctacaatgattt 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42694426 aagaatctatgattatgatgtctacaatgattt 42694394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Original strand, 42687136 - 42687263
Alignment:
Q  98 cttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatgggaaagaa 197  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||    || ||| ||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||| |||  |   ||||| |    
T  42687136 cttccaagtgaaacaccatctccactagtcaagtatagagaagaagaattgcaaaatttaaggggagatggaacaggagagcgcaagttacatgaaagga 42687235  T
Q  198 tatatgattatgatgtctacaatgattt 225  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||    
T  42687236 tctacgattacgatgtctacaatgattt 42687263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 36743886 - 36744021
Alignment:
Q  93 cataccttccaagtgaaacaccagctcctttagtgttctacagacaagaagaattgaagactttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatggga 192  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||  ||||   ||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  36743886 cataccttccacatgaaatgccagctccactagttaactacagacatgtagaattggatactttaaggggagatggaacagcaaagcgtgaggaatggga 36743985  T
Q  193 aagaatatatgattatgatgtctacaatgatttggg 228  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36743986 cagaatctatgattatgatgtttacaatgatttggg 36744021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 223
Target Start/End: Original strand, 35722304 - 35722372
Alignment:
Q  155 ttaagaggagatggaactggagagcgtaaggaatgggaaagaatatatgattatgatgtctacaatgat 223  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35722304 ttaagaggaaatggagaaggagagcgtaagaaatcagacagaatctatgattatgatgtctacaatgat 35722372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University