View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1139_low_33 (Length: 507)

Name: NF1139_low_33
Description: NF1139
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1139_low_33
NF1139_low_33
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (3-501)||(16743990-16744489)
chr3 (127-416)||(17912483-17912771)
chr3 (54-422)||(12030073-12030443)
chr3 (54-422)||(2049777-2050147)
chr3 (54-422)||(14842487-14842856)
chr3 (101-433)||(15858996-15859331)
chr3 (54-432)||(13838852-13839232)
chr3 (127-293)||(2449238-2449404)
chr3 (117-433)||(51158008-51158325)
chr3 (134-422)||(15936634-15936922)
chr3 (9-189)||(19231982-19232166)
chr3 (134-422)||(15938476-15938764)
chr3 (127-422)||(45860773-45861068)
chr3 (171-415)||(15614808-15615053)
chr3 (313-503)||(15468520-15468711)
chr3 (127-422)||(13954890-13955185)
chr3 (127-422)||(13975722-13976017)
chr3 (54-173)||(19260749-19260869)
chr3 (313-503)||(22275094-22275285)
chr3 (139-422)||(55316187-55316471)
chr3 (139-422)||(41270043-41270327)
chr3 (161-430)||(16821099-16821369)
chr3 (280-415)||(47984624-47984759)
chr3 (280-415)||(48003198-48003333)
chr3 (9-88)||(15857118-15857198)
chr3 (280-415)||(47993911-47994046)
chr3 (280-415)||(48012484-48012619)
chr3 (9-85)||(3992873-3992950)
chr3 (9-85)||(55513193-55513270)
chr3 (448-507)||(2449391-2449450)
chr3 (9-85)||(2844514-2844591)
chr3 (9-85)||(54037979-54038056)
chr3 (9-85)||(17955835-17955916)
chr3 (9-85)||(7854305-7854382)
chr3 (25-85)||(45581954-45582016)
chr3 (143-184)||(14080715-14080756)
chr3 (373-422)||(19231945-19231994)
chr3 (13-65)||(12031852-12031904)
chr3 (13-65)||(17205024-17205076)
chr3 (401-433)||(22144532-22144564)
chr3 (429-503)||(18969974-18970048)
chr3 (272-393)||(12264932-12265053)
chr3 (278-393)||(11329098-11329214)
chr3 (134-206)||(11986173-11986245)
chr3 (13-65)||(17191884-17191936)
chr3 (13-65)||(38810868-38810920)
chr3 (134-206)||(54651642-54651714)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (127-503)||(22907214-22907590)
chr8 (54-415)||(16193643-16194005)
chr8 (9-422)||(16404855-16405268)
chr8 (54-422)||(43373392-43373761)
chr8 (54-432)||(24928716-24929096)
chr8 (127-293)||(5238184-5238350)
chr8 (127-293)||(24661248-24661414)
chr8 (127-293)||(43685643-43685809)
chr8 (127-419)||(17345540-17345832)
chr8 (139-415)||(24548956-24549233)
chr8 (139-415)||(6774258-6774535)
chr8 (143-422)||(21844576-21844856)
chr8 (143-422)||(21851969-21852249)
chr8 (139-422)||(30120690-30120974)
chr8 (202-422)||(222754-222975)
chr8 (202-422)||(736377-736598)
chr8 (202-422)||(860272-860493)
chr8 (448-507)||(5238138-5238197)
chr8 (448-507)||(24661401-24661460)
chr8 (448-503)||(43685601-43685656)
chr8 (139-418)||(16674392-16674672)
chr8 (9-85)||(274766-274843)
chr8 (9-85)||(641006-641083)
chr8 (9-85)||(826812-826889)
chr8 (9-85)||(24716717-24716794)
chr8 (278-432)||(23837154-23837308)
chr8 (9-85)||(39115598-39115675)
chr8 (311-433)||(41246613-41246735)
chr8 (452-503)||(22321597-22321648)
chr8 (360-430)||(13662492-13662561)
chr8 (143-184)||(23149985-23150026)
chr8 (143-184)||(23226076-23226117)
chr8 (13-65)||(17285548-17285600)
chr8 (13-65)||(21198005-21198057)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (127-503)||(26680087-26680463)
chr4 (9-433)||(54118123-54118551)
chr4 (54-433)||(13246386-13246769)
chr4 (54-418)||(15675009-15675381)
chr4 (54-259)||(122020-122226)
chr4 (127-293)||(10488659-10488825)
chr4 (127-293)||(16327926-16328092)
chr4 (154-415)||(31115603-31115865)
chr4 (54-418)||(10104170-10104523)
chr4 (143-422)||(10644187-10644467)
chr4 (127-422)||(13048221-13048517)
chr4 (139-422)||(47357622-47357906)
chr4 (291-422)||(111362-111493)
chr4 (54-189)||(33240901-33241043)
chr4 (9-85)||(25119062-25119139)
chr4 (448-507)||(10488613-10488672)
chr4 (448-504)||(16328079-16328135)
chr4 (143-325)||(40885570-40885753)
chr4 (9-85)||(5682383-5682460)
chr4 (344-419)||(7849970-7850044)
chr4 (278-422)||(15044794-15044938)
chr4 (278-367)||(41166083-41166172)
chr4 (54-159)||(31132545-31132657)
chr4 (401-433)||(44055870-44055902)
chr4 (278-365)||(7185981-7186068)
chr4 (144-184)||(13809511-13809551)
chr4 (13-65)||(41165808-41165860)
chr4 (13-65)||(47534933-47534985)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (127-503)||(7292903-7293279)
chr7 (54-434)||(13036938-13037322)
chr7 (54-422)||(16211733-16212103)
chr7 (13-422)||(3059933-3060344)
chr7 (54-422)||(11580661-11581035)
chr7 (54-422)||(36052634-36053003)
chr7 (127-293)||(11516324-11516490)
chr7 (127-293)||(15441564-15441730)
chr7 (127-293)||(30262129-30262295)
chr7 (127-415)||(47481031-47481320)
chr7 (134-422)||(18253842-18254130)
chr7 (128-415)||(13320988-13321278)
chr7 (145-419)||(16478968-16479244)
chr7 (127-422)||(25292338-25292633)
chr7 (139-422)||(10989378-10989661)
chr7 (143-422)||(13572644-13572924)
chr7 (139-404)||(13911024-13911292)
chr7 (138-422)||(2437425-2437710)
chr7 (448-507)||(15441717-15441776)
chr7 (448-507)||(30262282-30262341)
chr7 (9-85)||(32493901-32493978)
chr7 (62-419)||(295900-296257)
chr7 (448-503)||(11516282-11516337)
chr7 (9-85)||(126738-126815)
chr7 (9-85)||(1936872-1936949)
chr7 (127-169)||(14113989-14114031)
chr7 (127-169)||(14423639-14423681)
chr7 (9-85)||(111124-111201)
chr7 (9-65)||(7283911-7283967)
chr7 (13-65)||(13377872-13377924)
chr7 (13-65)||(13389698-13389750)
chr7 (401-433)||(15822691-15822723)
chr7 (13-65)||(16919874-16919926)
chr7 (278-433)||(17224075-17224230)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (127-503)||(37066-37442)
scaffold0078 (9-85)||(41632-41709)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (3-419)||(41394191-41394610)
chr1 (54-422)||(20445646-20446019)
chr1 (66-422)||(20531411-20531770)
chr1 (54-422)||(20931312-20931682)
chr1 (54-433)||(20893551-20893933)
chr1 (54-422)||(20913004-20913367)
chr1 (54-422)||(37844374-37844746)
chr1 (127-293)||(51452589-51452755)
chr1 (139-415)||(2116228-2116506)
chr1 (138-422)||(22227777-22228061)
chr1 (138-422)||(22232474-22232758)
chr1 (139-422)||(5072388-5072672)
chr1 (139-422)||(18601118-18601402)
chr1 (139-415)||(45051416-45051674)
chr1 (448-507)||(51452543-51452602)
chr1 (9-85)||(21860334-21860411)
chr1 (12-85)||(44034829-44034903)
chr1 (9-65)||(41218749-41218805)
chr1 (13-65)||(27675139-27675191)
chr1 (401-432)||(49967607-49967638)
chr1 (13-69)||(20177513-20177570)
chr1 (143-184)||(22143361-22143402)
chr1 (13-65)||(13376711-13376763)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (9-433)||(19794584-19795011)
chr2 (9-422)||(20627193-20627609)
chr2 (9-422)||(43642836-43643250)
chr2 (54-422)||(36982364-36982737)
chr2 (54-422)||(462706-463075)
chr2 (60-422)||(8891209-8891574)
chr2 (54-418)||(24341309-24341681)
chr2 (127-293)||(19689401-19689567)
chr2 (127-293)||(23820168-23820334)
chr2 (127-293)||(14906440-14906606)
chr2 (127-415)||(25265390-25265679)
chr2 (127-293)||(20015108-20015274)
chr2 (127-422)||(17396653-17396948)
chr2 (177-419)||(7507894-7508138)
chr2 (139-422)||(19886661-19886945)
chr2 (54-149)||(22863169-22863267)
chr2 (9-85)||(22275045-22275122)
chr2 (9-85)||(22284278-22284355)
chr2 (9-84)||(15633538-15633614)
chr2 (448-507)||(14906593-14906652)
chr2 (448-507)||(20015062-20015121)
chr2 (448-507)||(23820122-23820181)
chr2 (448-494)||(19689554-19689600)
chr2 (13-69)||(19660217-19660273)
chr2 (311-367)||(19669279-19669335)
chr2 (13-65)||(43646237-43646289)
chr2 (401-433)||(32465813-32465845)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (54-422)||(1091-1462)
scaffold0266 (54-422)||(3508-3877)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (54-422)||(48565-48935)
scaffold0023 (161-418)||(36065-36323)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (53-422)||(36836-37209)
scaffold0077 (9-65)||(15322-15378)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (62-422)||(19173-19537)
scaffold0195 (127-422)||(21257-21553)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (54-433)||(23153403-23153786)
chr6 (98-415)||(14626089-14626407)
chr6 (127-422)||(35009439-35009735)
chr6 (127-419)||(1657748-1658040)
chr6 (127-419)||(15862443-15862734)
chr6 (139-415)||(1650105-1650382)
chr6 (139-422)||(25175531-25175815)
chr6 (139-422)||(27653983-27654267)
chr6 (139-422)||(16825752-16826038)
chr6 (9-85)||(19983147-19983224)
chr6 (286-419)||(27740808-27740941)
chr6 (9-85)||(35015012-35015089)
chr6 (54-122)||(23148266-23148335)
chr6 (279-433)||(18381821-18381975)
chr6 (127-210)||(27751605-27751688)
chr6 (127-325)||(29665937-29666137)
chr6 (9-85)||(18583640-18583717)
chr6 (13-65)||(21623511-21623563)
chr6 (302-408)||(22361926-22362032)
chr6 (143-184)||(16887792-16887833)
chr6 (404-433)||(32898745-32898774)
chr6 (143-184)||(33324898-33324939)
chr6 (143-184)||(35136013-35136054)
chr6 (13-65)||(22361619-22361671)
chr6 (278-393)||(25367374-25367490)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (54-422)||(23506932-23507302)
chr5 (54-433)||(27182471-27182854)
chr5 (54-418)||(22053753-22054125)
chr5 (54-414)||(18530988-18531355)
chr5 (127-293)||(20623066-20623232)
chr5 (127-293)||(21233528-21233694)
chr5 (127-290)||(37052844-37053007)
chr5 (127-293)||(16536294-16536460)
chr5 (127-419)||(34939248-34939540)
chr5 (129-293)||(25900408-25900571)
chr5 (139-422)||(22366481-22366765)
chr5 (139-422)||(25426596-25426880)
chr5 (142-422)||(18777995-18778276)
chr5 (139-422)||(12342-12626)
chr5 (139-422)||(19499867-19500151)
chr5 (139-422)||(21073595-21073879)
chr5 (139-403)||(4199985-4200251)
chr5 (142-422)||(43443398-43443679)
chr5 (143-422)||(27009809-27010089)
chr5 (313-432)||(17471768-17471887)
chr5 (139-259)||(29188284-29188404)
chr5 (448-507)||(20623020-20623079)
chr5 (448-507)||(21233681-21233740)
chr5 (341-415)||(29190478-29190552)
chr5 (448-507)||(25900558-25900617)
chr5 (448-507)||(37052795-37052854)
chr5 (448-507)||(16536248-16536307)
chr5 (9-65)||(11584394-11584450)
chr5 (278-411)||(19862186-19862319)
chr5 (278-422)||(23493885-23494029)
chr5 (143-184)||(21310709-21310750)
chr5 (143-184)||(23981516-23981557)
chr5 (13-65)||(21222462-21222514)
chr5 (134-206)||(32950879-32950951)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (54-433)||(41686-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (54-422)||(882-1250)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (54-422)||(12083-12450)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (54-422)||(5990-6358)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (54-422)||(128095-128464)
scaffold0008 (161-403)||(31697-31942)
scaffold0008 (401-429)||(22650-22678)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (54-422)||(247366-247738)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (54-432)||(171863-172242)
scaffold0001 (54-432)||(177566-177945)
scaffold0001 (401-433)||(70882-70914)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (54-422)||(123087-123460)
scaffold0011 (401-433)||(255074-255106)
scaffold0011 (401-433)||(261680-261712)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (63-422)||(4996-5356)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (54-422)||(8846-9215)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (54-422)||(26340-26710)
scaffold0162 (127-415)||(8180-8466)
scaffold0162 (13-65)||(6877-6929)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (65-418)||(8820-9180)
scaffold0025 (95-422)||(148688-149018)
scaffold0025 (54-153)||(146838-146938)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (54-432)||(271983-272362)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (127-293)||(26892-27058)
scaffold0141 (134-293)||(22637-22796)
scaffold0141 (448-507)||(22591-22650)
scaffold0141 (448-507)||(26846-26905)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (127-293)||(1582-1748)
scaffold0124 (448-507)||(1735-1794)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (134-422)||(48155-48443)
scaffold0049 (9-65)||(20513-20569)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (66-259)||(51121-51314)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (127-415)||(13480-13769)
scaffold0132 (9-85)||(42677-42751)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (127-415)||(41622-41911)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (134-422)||(107715-108003)
scaffold0026 (143-422)||(64527-64812)
scaffold0026 (142-184)||(89863-89905)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (127-420)||(534-828)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (127-419)||(34460-34755)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (54-259)||(89378-89586)
scaffold0028 (54-178)||(107708-107835)
scaffold0028 (311-393)||(79533-79616)
scaffold0028 (143-184)||(79745-79786)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (138-415)||(2936-3215)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (161-415)||(9371-9626)
scaffold0215 (161-415)||(16269-16524)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (291-433)||(9338-9480)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (162-422)||(42965-43226)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (134-259)||(5660-5785)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (177-422)||(5254-5498)
scaffold0022 (144-184)||(102923-102963)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (177-422)||(3690-3936)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (143-422)||(3-283)
scaffold0116 (9-65)||(30438-30494)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (161-422)||(14083-14344)
scaffold0139 (138-422)||(21115-21399)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (300-422)||(48482-48603)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (139-259)||(13325-13445)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (300-422)||(26-147)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (9-85)||(80187-80264)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (9-86)||(166119-166197)
scaffold0016 (12-86)||(162036-162111)
scaffold0016 (13-65)||(116410-116462)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (9-85)||(31135-31212)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (139-259)||(1304-1424)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (12-85)||(5735-5809)
scaffold0686 (12-85)||(5941-6015)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (9-86)||(307-385)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (177-393)||(54412-54630)
scaffold0066 (349-393)||(45007-45051)
scaffold0066 (177-325)||(45094-45244)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (373-422)||(1815-1863)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (345-414)||(3183-3252)
scaffold0361 (127-210)||(3370-3453)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (9-65)||(1721-1777)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (9-65)||(19805-19861)
scaffold0122 (9-65)||(24109-24165)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (278-433)||(76984-77139)
scaffold0053 (13-65)||(76699-76751)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (311-433)||(132420-132542)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (143-184)||(1546-1587)
scaffold0456 (143-184)||(8691-8732)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (143-184)||(8216-8257)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (134-252)||(56106-56226)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (143-184)||(70307-70348)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (9-65)||(114-170)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (9-65)||(6259-6315)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (13-65)||(35821-35873)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (143-181)||(1348-1386)
scaffold0409 (143-181)||(9603-9641)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (404-433)||(7522-7551)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (143-184)||(22422-22463)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (404-433)||(38253-38282)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (143-184)||(93773-93814)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (13-65)||(447-499)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (311-367)||(2476-2532)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (13-65)||(1363-1415)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (144-184)||(10868-10908)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 501
Target Start/End: Original strand, 16743990 - 16744489
Alignment:
Q  3 tggagtatcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaatt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16743990 tggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaatt 16744089  T
Q  102 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16744090 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatg 16744189  T
Q  202 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatg 301  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16744190 attgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatg 16744289  T
Q  302 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaatt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744290 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaatt 16744389  T
Q  402 gttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744390 gttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgaggaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 16744489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 127 - 416
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912771
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 326  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgt 17912681  T
Q  327 tgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttg 416  Q
    || |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17912682 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgtgggtgttttg 17912771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030443
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
     ||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatga 12030372  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12030373 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 12030443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049777
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| | |||| || || |||||    
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatga 2049848  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2049847 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 2049777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842856
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatga 14842786  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842787 ataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 14842856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 101 - 433
Target Start/End: Original strand, 15858996 - 15859331
Alignment:
Q  101 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15858996 tttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 15859095  T
Q  199 atgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagc 297  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||||||||||     
T  15859096 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagt 15859195  T
Q  298 tatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttg 397  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15859196 tatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttg 15859295  T
Q  398 aattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  15859296 aattgttgttgttgttttggtgaaaatggtgaattg 15859331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838852
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  252 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatg 350  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 13838933  T
Q  351 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||| || ||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  13838932 aatcattgtttgggtatgcatattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 13838852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449404
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 117 - 433
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158325
Alignment:
Q  117 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagatt 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  217 ccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaatt 315  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaatt 51158207  T
Q  316 gatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgtt-ggtgttt 414  Q
    |||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||  ||||||    
T  51158208 gatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgttaatttgagatgttgttaagtgttt 51158307  T
Q  415 tggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    || | ||||||||||||||    
T  51158308 tgct-aaatttgtgaattg 51158325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 134 - 422
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936922
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 332  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15936833  T
Q  333 tagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15936834 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 15936922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19232166 - 19231982
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19232166 atcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaa 19232067  T
Q  107 atgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 189  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19232066 atgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgat 19231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 134 - 422
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938764
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 332  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15938675  T
Q  333 tagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15938676 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgctgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 15938764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860773
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 324  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  325 gatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 45860773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15615053 - 15614808
Alignment:
Q  171 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||  ||| | |||    
T  15615053 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtga 15614954  T
Q  271 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatac 369  Q
    ||||  | | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15614953 attttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 15614854  T
Q  370 atgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15614853 atattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 15614808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 313 - 503
Target Start/End: Original strand, 15468520 - 15468711
Alignment:
Q  313 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgt 412  Q
    ||||||||||||  || |||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15468520 attgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttgttgt 15468619  T
Q  413 tttggtgaaatttgtg-aattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 503  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| ||||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||| ||||    
T  15468620 tttggtgaaatttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaacatgatggaatgtatgatcataagttgtggttgtggttaattg 15468711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 422
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955185
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 324  Q
    ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  325 gatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgataatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13955185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 422
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13976017
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 324  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  325 gatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgataatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13976017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  153 tccaactttgatgatatgttt 173  Q
    || || | |||||||||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 313 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22275285 - 22275094
Alignment:
Q  313 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgt 412  Q
    ||||||||||||  || |||  |||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275285 attgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgt 22275186  T
Q  413 tttggtgaaatttgtg-aattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 503  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||| ||||| | ||||||||||||  |||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||| ||||    
T  22275185 tttggtgaaatttgtgaaattagtgaattatgacatgttgttgttgaaacatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattg 22275094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316187
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 55316187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270043
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||   ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 41270043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821099
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||  |||||||     
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 358  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||    
T  16821269 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 16821170  T
Q  359 cttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaa 430  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  16821169 cttgggtttgcatattcatggattaatgatgataa-ataaatggttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 16821099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 280 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984624
Alignment:
Q  280 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatgg 379  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  380 attgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  47984659 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 47984624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 280 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003198
Alignment:
Q  280 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatgg 379  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  380 attgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48003233 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 48003198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 15857118 - 15857198
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcat 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15857118 atcataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993911
Alignment:
Q  280 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatgg 379  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| || | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  380 attgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  47993946 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 47993911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012484
Alignment:
Q  280 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatgg 379  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| || | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  380 attgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48012519 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 48012484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3992950 - 3992873
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  3992950 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 55513270 - 55513193
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  55513270 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 2449391 - 2449450
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2449391 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatga 2449450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2844591 - 2844514
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  2844591 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 54037979 - 54038056
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  54037979 atcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 17955835 - 17955916
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctag----agctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17955835 atcataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7854382 - 7854305
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  7854382 atcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  25 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa--ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19231994 - 19231945
Alignment:
Q  373 ttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19231994 ttcatgaattgatgatgataatttggattgttgttggtgttttggtgaaa 19231945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 12031904 - 12031852
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  12031904 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 12031852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17205076 - 17205024
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17205076 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 17205024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Original strand, 22144532 - 22144564
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144532 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 22144564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18970048 - 18969974
Alignment:
Q  429 aattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 503  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  18970048 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattctgatggaaagcatgattataagttgtggttgtggttgattg 18969974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 393
Target Start/End: Original strand, 12264932 - 12265053
Alignment:
Q  272 tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat 371  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||| | || | ||||| ||  |||||||||||||    
T  12264932 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat 12265031  T
Q  372 gttcatggattgatgatgagaa 393  Q
      | ||||||||||||||||||    
T  12265032 aattatggattgatgatgagaa 12265053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 393
Target Start/End: Original strand, 11329098 - 11329214
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatg-ttca 376  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||| | |||| |||||||||| |||| ||||    
T  11329098 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattca 11329197  T
Q  377 tggattgatgatgagaa 393  Q
    ||  ||| |||||||||    
T  11329198 tgatttgttgatgagaa 11329214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 206
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986245
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgt 206  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| || || |||| |||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgt 11986245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191884
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 17191884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 38810868 - 38810920
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||| ||||||||||||    
T  38810868 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataactaaggtaagggg 38810920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 54651714 - 54651642
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgt 206  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  54651714 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgt 54651642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 127 - 503
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907590
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 326  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 22907413  T
Q  327 tgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907414 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 22907513  T
Q  427 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 503  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907514 tgaattgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 22907590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 415
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16194005
Alignment:
Q  54 taaggtaaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgct 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193643 taaggtaaggggttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgct 16193742  T
Q  154 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  16193743 ccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16193842  T
Q  254 ttgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaa 352  Q
    ||||||  ||| | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||    
T  16193843 ttgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaa 16193942  T
Q  353 tcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  16193943 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgttaatttgagatgttgttggtgtttt 16194005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 422
Target Start/End: Original strand, 16404855 - 16405268
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  16404855 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaa 16404953  T
Q  108 tgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattg 205  Q
    |||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16404954 tgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattg 16405053  T
Q  206 ttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgatt 304  Q
    ||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| ||||||  |||||||    
T  16405054 ttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaaattgacatatgatt 16405150  T
Q  305 cttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgtt 404  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||  ||||    
T  16405151 cttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatgataatttgagatgtt 16405250  T
Q  405 gttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||| |||||    
T  16405251 gttggtgttttgatgaaa 16405268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373761
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | ||||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgat 43373691  T
Q  350 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  43373692 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaa---ttgttggtgttttggtgaaa 43373761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929096
Alignment:
Q  54 taaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 151  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  252 aattgtgcaaaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatg 350  Q
    ||||||||  ||| | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||| |  ||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatg 24929015  T
Q  351 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| || ||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24929016 aatcattgcttgggtatgcatattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 24929096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238184
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661414
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685643
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345540
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattg 17345634  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17345633 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 17345540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 139 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548956
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 337  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 24549034  T
Q  338 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24549033 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 24548956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 139 - 415
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774535
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 337  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 6774457  T
Q  338 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6774458 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgatttgttgttggtgtttt 6774535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 143 - 422
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844856
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  243 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 340  Q
    ||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  21844676 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21844775  T
Q  341 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21844776 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21844856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 143 - 422
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852249
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||| |    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  243 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 340  Q
    ||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  21852069 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21852168  T
Q  341 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21852169 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21852249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120690
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatgataatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 30120690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 422
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222975
Alignment:
Q  202 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 299  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  300 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaa 399  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 222953  T
Q  400 ttgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  222954 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 222975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 422
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736598
Alignment:
Q  202 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 299  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  300 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaa 399  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 736576  T
Q  400 ttgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  736577 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 736598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 422
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860493
Alignment:
Q  202 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 299  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  300 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaa 399  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 860471  T
Q  400 ttgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  860472 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 860493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 5238197 - 5238138
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238197 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 5238138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 24661401 - 24661460
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661401 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 24661460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 448 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 43685656 - 43685601
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685656 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 43685601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 418
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674672
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    |  |||  || |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggt 16674672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 274843 - 274766
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  274843 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 641006 - 641083
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  641006 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 826812 - 826889
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  826812 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 24716717 - 24716794
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24716717 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837154
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 376  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||  ||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattca 23837209  T
Q  377 tggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    ||  ||| |||||||||  ||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23837208 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttggtggtggttttgtgaaattggtgaatt 23837154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 39115675 - 39115598
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  39115675 atcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 41246735 - 41246613
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatg-ttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttgg 409  Q
    ||||||||||||||| || |||   ||||| | | |||| | |||| |||||||| | |||| ||||||| ||| || |||||| | ||| |||||||||    
T  41246735 caattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaat-gaaatgttgttgg 41246637  T
Q  410 tgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41246636 tgttttggtgaaatttgtgaattg 41246613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 503
Target Start/End: Original strand, 22321597 - 22321648
Alignment:
Q  452 ttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 503  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22321597 ttgttaaattgtgatggaatgcatgattatatgttgtgattgtggttgattg 22321648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 360 - 430
Target Start/End: Original strand, 13662492 - 13662561
Alignment:
Q  360 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaa 430  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  13662492 ttgggtatacataattatggattgatgatgagaa-ctaaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 13662561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23150026 - 23149985
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  23150026 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 23149985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226117
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23226117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17285600 - 17285548
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17285600 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaattggtgataattaaggtaagggg 17285548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 21198005 - 21198057
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| |||||||    
T  21198005 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggg 21198057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 127 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680087
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 326  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 26680264  T
Q  327 tgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680263 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 26680164  T
Q  427 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 503  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680163 ggaatcgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 26680087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 433
Target Start/End: Original strand, 54118123 - 54118551
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaa 107  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54118123 atcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaa 54118222  T
Q  108 tgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattg 205  Q
    |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  54118223 tgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattg 54118322  T
Q  206 ttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgatt 304  Q
    ||||| | ||| |||||| ||||| | | || ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||    
T  54118323 ttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgatt 54118422  T
Q  305 cttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgtt 404  Q
    ||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54118423 cttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgtt 54118522  T
Q  405 gttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  54118523 gttggtgttttggtgaaaatggtgaattg 54118551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246386
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13246470  T
Q  350 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246469 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 13246386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 418
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675381
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  147 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  247 atgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagt 345  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||    
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgt 15675308  T
Q  346 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15675309 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 15675381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 122020
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  122026 attgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488659
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328092
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115603
Alignment:
Q  154 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||  | |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  254 ttgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaa 352  Q
    || |||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaa 31115666  T
Q  353 tcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31115665 tcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 31115603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 418
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104523
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    |||   | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  147 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 246  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  247 atgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagt 345  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||                   ||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgtt-------------------gt 10104450  T
Q  346 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10104451 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 10104523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644187
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||  |    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  243 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 340  Q
    ||||||||  ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 10644268  T
Q  341 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10644267 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 10644187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 422
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048517
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 324  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  325 gatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     ||| || |||||  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatagttaatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13048517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357622
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||  ||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatgagaatttgagctg-tgttggtgttttggtgaaa 47357622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 291 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111362
Alignment:
Q  291 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 390  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatga 111394  T
Q  391 gaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  111393 taatttgagatgttgttggtgttttgatgaaa 111362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240901
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  147 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 33240901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 25119062 - 25119139
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  25119062 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 10488672 - 10488613
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10488672 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatga 10488613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 504
Target Start/End: Original strand, 16328079 - 16328135
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattga 504  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16328079 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattga 16328135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 325
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885753
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa-tatgtagaaatgag 241  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||| | ||| |||||| ||| |||||| |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  242 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 5682383 - 5682460
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag-gggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5682383 atcataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7850044 - 7849970
Alignment:
Q  344 gttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7850044 gttgatgaatcatgacttgagtatacataatcatgaattggtgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtg 7849970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044794
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 376  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||| |||||||| | |||   |||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatca 15044839  T
Q  377 tggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||  |||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  15044838 tgatttgatgatgagaa-ataaattgttgttgttgctttggtgaaa 15044794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166172
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtat 367  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtat 41166172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31132657 - 31132545
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  31132657 taaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 31132558  T
Q  147 tcgtgctccaact 159  Q
    |||||||||||||    
T  31132557 tcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 44055902 - 44055870
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44055902 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 44055870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 365
Target Start/End: Original strand, 7185981 - 7186068
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggt 365  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  7185981 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggt 7186068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Original strand, 13809511 - 13809551
Alignment:
Q  144 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  13809511 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 13809551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 41165808 - 41165860
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  41165808 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggg 41165860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 47534933 - 47534985
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | || || | |||| ||||||||||||||||||    
T  47534933 taggagctaaagtgaagcttgggcgaggaattggtgataattaaggtaagggg 47534985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 127 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7292903
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 326  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 7293080  T
Q  327 tgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293079 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 7292980  T
Q  427 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 503  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7292979 tgaattgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgattg 7292903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 434
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037322
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||| |||||| | ||||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgat 13037237  T
Q  350 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattga 434  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037238 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattga 13037322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211733
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16211804  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16211803 ttcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatgaagagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 16211733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3059933
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggggtta-gtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgtt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 3060245  T
Q  112 gtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggtt 211  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | |||||||     
T  3060244 atatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtg 3060145  T
Q  212 agattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgt 309  Q
    | ||| |||||| ||||||||| |||||| || || |||||||| |||  |||||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  3060144 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatgg-tgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgt 3060046  T
Q  310 gcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttgg 409  Q
     ||||||||||| |   || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||  |||||| ||    
T  3060045 tcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgataatttgagatgttgtggg 3059946  T
Q  410 tgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||| |||||    
T  3059945 tgttttgatgaaa 3059933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11581035
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattc 148  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| |||||||||||    
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  149 gtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttat 248  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  249 gaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttg 347  Q
    |||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 11580960  T
Q  348 atgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580961 atgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgaggacgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 11581035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052634
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||| | ||||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgat 36052707  T
Q  350 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052706 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 36052634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516324
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441730
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262295
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 415
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481320
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |    
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcg 47481230  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
     |  |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47481231 ctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgataatttgaattgttgttggtgtttt 47481320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 422
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254130
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 332  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 18254041  T
Q  333 tagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18254042 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 18254130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 128 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13320988
Alignment:
Q  128 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--a 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||  |    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  226 aatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 323  Q
    | |||||| |||||  |||||||| |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 13321080  T
Q  324 tgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    || || |||| |||||| | |||||||||||||  ||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13321079 tgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatgagaatttggattgttgttggtgtttt 13320988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 419
Target Start/End: Original strand, 16478968 - 16479244
Alignment:
Q  145 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaag 244  Q
    ||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||    
T  16478968 attcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 16479067  T
Q  245 ttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttata 343  Q
    || ||||||||||||  ||| | ||||||| |  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||| |     
T  16479068 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgtt 16479167  T
Q  344 gttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16479168 gttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 16479244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 422
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292633
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||| |||||||  ||| | |||||| |   | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |      
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaattctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 25292537  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| || | ||| ||||   | |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25292538 atgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttaatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 25292633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989378
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  | |  ||||| ||  | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgta-atttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 10989378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572644
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  243 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 340  Q
    ||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  13572824 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 13572725  T
Q  341 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13572724 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13572644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 404
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911292
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 335  Q
    || |||||||||| ||| |||  ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | |    
T  13911124 gataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttg 13911223  T
Q  336 atgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgtt 404  Q
    || ||||  ||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911224 atattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattgtt 13911292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437425
Alignment:
Q  138 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 335  Q
    ||| |||||||||| ||||||   ||| | |||||||  | |  ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | |    
T  2437610 tgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 2437511  T
Q  336 atgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || ||||  ||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2437510 atattatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 2437425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 15441717 - 15441776
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441717 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 15441776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 30262282 - 30262341
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262282 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 30262341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 32493901 - 32493978
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  32493901 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 419
Target Start/End: Original strand, 295900 - 296257
Alignment:
Q  62 ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 159  Q
    |||||| ||||| | ||||||  |||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||||| || || |    
T  295900 ggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgttctaatt 295998  T
Q  160 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt-g 258  Q
      | || ||||||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||| |      
T  295999 gaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaattatat 296098  T
Q  259 caaaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 356  Q
    | |||||| |||| ||||  |  ||| |  |||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||   |||||||||| |     
T  296099 ccaaatgg-tgaattttgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgttgttgctattaattgatgtt---gttgatgaattac 296194  T
Q  357 tgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
    || |||||||| | | |||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  296195 tgattgggtatgcttattcatggattgatgttgaaaaattgaatttgtgttggtgttttggtg 296257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11516337 - 11516282
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11516337 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgagtatatgttatgattgtggttgattg 11516282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 126815 - 126738
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  126815 atcataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 1936872 - 1936949
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1936872 atcatagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 111124 - 111201
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  111124 atcataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 7283911 - 7283967
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  7283911 atcataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggg 7283967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377872
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13377872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13389750 - 13389698
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13389750 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13389698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Original strand, 15822691 - 15822723
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822691 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 15822723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 16919926 - 16919874
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| |||||||    
T  16919926 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggg 16919874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 433
Target Start/End: Original strand, 17224075 - 17224230
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 376  Q
    ||||||| |||||||||   || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |   |||||| |||| |||||||||| |||  ||||    
T  17224075 atgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttgggtattcataattca 17224174  T
Q  377 tggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||  ||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  17224175 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtaaaattggtgaattg 17224230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 127 - 503
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37442
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 326  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 37265  T
Q  327 tgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37266 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 37365  T
Q  427 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 503  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37366 tgaattgatgaaatatgataagtttttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgattg 37442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41709 - 41632
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  41709 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41394610 - 41394191
Alignment:
Q  3 tggagtatcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaatt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41394610 tggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaatt 41394511  T
Q  102 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  41394510 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatg 41394411  T
Q  202 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctat 300  Q
    ||||||||| |  || |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |    
T  41394410 attgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagattt 41394311  T
Q  301 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa-tttgaa 399  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  41394310 gattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaa 41394211  T
Q  400 ttgttgttggtgttttggtg 419  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41394210 ttgttgttggtgttttggtg 41394191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445646
Alignment:
Q  54 taaggtaaggg-gttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 249  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  250 aaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttga 348  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| |||||||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20445720  T
Q  349 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20445719 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20445646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 66 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20531770 - 20531411
Alignment:
Q  66 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttga 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20531770 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtga 20531671  T
Q  164 tgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaa 263  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||||||||||||  ||    
T  20531670 taatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaa 20531571  T
Q  264 tggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttg 362  Q
    | | |||||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20531570 ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttg 20531471  T
Q  363 ggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531470 ggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20531411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931312
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 20931383  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20931382 ataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20931312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893933
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgt-aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||| | ||||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 20893849  T
Q  350 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20893850 gaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttgaagaaatttgtgaattg 20893933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913004
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| || | ||||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatga 20913075  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913074 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20913004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844746
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta-tg 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||  || ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  250 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttga 348  Q
    ||||||||||  |||  ||||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 37844673  T
Q  349 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37844674 tgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 37844746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452589
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 139 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116228
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctat-gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||  | | ||||||||  ||||||||||| | | || |||| ||    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 2116307  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2116306 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 2116228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 138 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22228061 - 22227777
Alignment:
Q  138 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||    
T  22228061 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22227962  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    ||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||    
T  22227961 tgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattga 22227862  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22227861 tgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22227777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 138 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22232758 - 22232474
Alignment:
Q  138 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||    
T  22232758 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22232659  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    ||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||    
T  22232658 tgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattga 22232559  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22232558 tgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22232474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072672
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaattagagttg-tgttggtgttttggtgaaa 5072672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601402
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 18601317  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  18601318 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaattagagttg-tgttggtgttttggtgaaa 18601402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 45051674 - 45051416
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||| ||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  45051674 tgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 45051575  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 337  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  |||||||||                      
T  45051574 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatg------------------ 45051493  T
Q  338 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45051492 -ttattgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 45051416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 51452602 - 51452543
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51452602 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtagttgattgatga 51452543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21860411 - 21860334
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  21860411 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034903
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41218805 - 41218749
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41218805 atcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggg 41218749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675139
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggg 27675139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 49967638 - 49967607
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49967638 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 49967607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20177570 - 20177513
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttag 69  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20177570 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttag 20177513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 22143361 - 22143402
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22143361 aaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaa 22143402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376763
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13376763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 433
Target Start/End: Original strand, 19794584 - 19795011
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaa 107  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  19794584 atcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaa 19794682  T
Q  108 tgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattg 205  Q
    |||||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19794683 tgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattg 19794782  T
Q  206 ttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgatt 304  Q
    ||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19794783 ttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgatt 19794882  T
Q  305 cttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgtt 404  Q
    ||||| ||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19794883 cttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattttt 19794982  T
Q  405 gttggtg-ttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19794983 gttggtgtttttggtgaaa-ttgtgaattg 19795011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 422
Target Start/End: Original strand, 20627193 - 20627609
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaa 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20627193 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaa 20627292  T
Q  107 atgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgt 206  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  20627293 atattgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgt 20627392  T
Q  207 tggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattc 305  Q
    |||| | ||| |||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | ||||    
T  20627393 tggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattc 20627492  T
Q  306 ttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttg 405  Q
    |||| |||||||| || | | || |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||| |||||||  |||||    
T  20627493 ttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatgataatttgagatgttg 20627592  T
Q  406 ttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||||| |||||    
T  20627593 ttggtgttttgatgaaa 20627609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 422
Target Start/End: Original strand, 43642836 - 43643250
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642836 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaa 43642935  T
Q  108 tgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattg 205  Q
    |||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43642936 tgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattg 43643035  T
Q  206 ttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctatgatt 304  Q
    ||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | |||||  || | ||||| |||||||    
T  43643036 ttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgatt 43643135  T
Q  305 cttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgtt 404  Q
    ||||| ||||||||| | ||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||   | |    
T  43643136 cttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgataatttga---gat 43643232  T
Q  405 gttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||| |||||    
T  43643233 gttggtgttttgatgaaa 43643250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982737
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 149  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  250 aaaattgtgcaaaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttga 348  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttga 36982663  T
Q  349 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36982664 tgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttagtgaaa 36982737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462706
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    ||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||  |  |||||||    
T  462875 attgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatga 462776  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  462775 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggataagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 462706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8891574 - 8891209
Alignment:
Q  60 aaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaa 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8891574 aaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaa 8891475  T
Q  158 ctttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt 257  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||    
T  8891474 ctgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 8891375  T
Q  258 gcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 356  Q
    ||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||| | |||||||||||||    
T  8891374 gctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcat 8891275  T
Q  357 tgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8891274 tgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtgaaa 8891209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 418
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341681
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  147 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 246  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  ||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  247 atgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagt 345  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||   ||    
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgt 24341608  T
Q  346 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24341609 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattattgttggtgttttggt 24341681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689567
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820168
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906606
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 127 - 415
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265679
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 25265589  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
     || |||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25265590 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 25265679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015108
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 127 - 422
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396948
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 324  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  325 gatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     ||| || | ||| ||||  || ||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 17396948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 177 - 419
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508138
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttga 276  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||   ||| | ||||||||     
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttgg 7507993  T
Q  277 c-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc-aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgtt 374  Q
    | | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||   |||||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  7507994 ctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatatt 7508092  T
Q  375 catggattgatgatgagaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7508093 catggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 7508138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886945
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 19886945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863169
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 149  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22275122 - 22275045
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  22275122 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22284355 - 22284278
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22284355 atcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15633614 - 15633538
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatca 84  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15633614 atcataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 14906593 - 14906652
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14906593 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatga 14906652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20015121 - 20015062
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20015121 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatga 20015062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23820181 - 23820122
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23820181 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatga 23820122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 494
Target Start/End: Original strand, 19689554 - 19689600
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgt 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689554 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgt 19689600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660217
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggggttag 69  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaaggggttag 19660217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 367
Target Start/End: Original strand, 19669279 - 19669335
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtat 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  19669279 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgattcatggcttgggtat 19669335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 43646289 - 43646237
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  43646289 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 43646237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32465845 - 32465813
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32465845 tgttgttggtgttttggtgaaatttatgaattg 32465813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1091
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  252 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatg 350  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| || | |||||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatg 1163  T
Q  351 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1162 aataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3877
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | | || ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||| ||    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagga 3807  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3808 ataattgcttgggtatgcatattgatggattgatgaggagagtttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 3877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48565
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    |||||||  | | | |||| ||||  | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||| | ||||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatga 48636  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48635 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 48565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36065
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  261 aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 358  Q
    |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| |||| |||||| |  ||| || | |||  |||  ||||||||| ||||    
T  36223 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattg 36124  T
Q  359 cttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36123 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttatggt 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 53 - 422
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37209
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  250 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttga 348  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||| | |||||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttga 37135  T
Q  349 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37136 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 37209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 15322 - 15378
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15322 atcataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggg 15378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 62 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19537 - 19173
Alignment:
Q  62 ggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaac 158  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19537 ggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaac 19438  T
Q  159 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  19437 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 19338  T
Q  259 caaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 357  Q
    |  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  19337 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcatt 19238  T
Q  358 gcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19237 gcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 19173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 127 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21257
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 21354  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21353 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 21257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153403
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | | || |||| |||||| | ||||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgat 23153487  T
Q  350 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153486 gaatcattacttgggtatacatattcatgaattaaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 23153403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 415
Target Start/End: Original strand, 14626089 - 14626407
Alignment:
Q  98 aattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtg 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  14626089 aattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 14626188  T
Q  198 tatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgag 296  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||| ||  | ||||| ||| | |||||    
T  14626189 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattggtgaattatgctaagttgttgttaacttgag 14626288  T
Q  297 ctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaattt 396  Q
     | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  14626289 atttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaattt 14626388  T
Q  397 gaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14626389 gaattgttgttggtgtttt 14626407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 127 - 422
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009735
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 35009638  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35009639 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 35009735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 419
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1658040
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 1657946  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1657947 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 1658040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862443
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattg 15862537  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862536 ctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 15862443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 139 - 415
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650382
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 337  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 1650304  T
Q  338 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650305 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 1650382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175531
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || || || |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 25175531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654267
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatgagaatttgaattg-tgtcggtgttttggtgaaa 27654267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826038
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgta--tgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaa 236  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||  | ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  237 atgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatg--ttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 334  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||| | || ||||  | |   |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| ||       
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  335 gatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| ||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 16826038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 19983147 - 19983224
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  19983147 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740808
Alignment:
Q  286 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgat 385  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||| | || |||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  386 gatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27740841 gatgaaaatttgaattggtgttggtgttttggtg 27740808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 35015012 - 35015089
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  35015012 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt 122  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 433
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381975
Alignment:
Q  279 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttcat 377  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||  |||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcat 18381920  T
Q  378 ggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |  ||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  18381921 gatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattg 18381975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751605
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 210  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665937
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt-- 224  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||      
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  225 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 323  Q
    || |||| | |||||  |||||||| ||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgt 29665939  T
Q  324 tg 325  Q
    ||    
T  29665938 tg 29665937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18583717 - 18583640
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  18583717 atcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 21623563 - 21623511
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  21623563 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 21623511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 408
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362032
Alignment:
Q  302 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttcatggattgatgatgagaatttgaat 400  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||| |||| |||||||| | |||  |||||| |||||||||||||| |||| |    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaa-ttgagt 22362024  T
Q  401 tgttgttg 408  Q
    ||||||||    
T  22362025 tgttgttg 22362032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 16887792 - 16887833
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16887792 aaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaa 16887833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32898774 - 32898745
Alignment:
Q  404 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32898774 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 32898745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33324939 - 33324898
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33324939 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaa 33324898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 35136013 - 35136054
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35136013 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaa 35136054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 22361619 - 22361671
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  22361619 taggagctaaagtgaagcttggcctaggaattggtgataattaaggtaagggg 22361671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 393
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367490
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatg-ttca 376  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |  | ||| | |||| |||||||| | |||| ||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattca 25367473  T
Q  377 tggattgatgatgagaa 393  Q
    || |||| |||||||||    
T  25367474 tgaattgttgatgagaa 25367490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506932
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 23507003  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507002 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 23506932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182854
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 27182770  T
Q  350 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27182771 gaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttttgaattg 27182854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 418
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054125
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat--tttgtgaa--ttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  147 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  247 atgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagt 345  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||    
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 22054052  T
Q  346 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22054053 tgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 22054125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 414
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531355
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatc---atcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  148 cgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  248 tgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagtt 346  Q
    |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgtt 18531287  T
Q  347 gatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttt 414  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18531288 gatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 18531355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623066
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233694
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052844
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttga 290  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536294
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939248
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||  | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 34939342  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34939341 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 34939248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 293
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900571
Alignment:
Q  129 ggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaat 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  229 atgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366765
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22366765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426596
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 25426596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 422
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778276
Alignment:
Q  142 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgag 241  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||||     
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  242 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 339  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| |    
T  18778095 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatat 18778194  T
Q  340 tatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18778195 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 18778276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12342
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 12342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499867
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 19499867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073879
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||    |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21073879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 403
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200251
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||| ||| |||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  4200085 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 4200184  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgt 403  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4200185 tattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatgagaatttgaattgt 4200251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 422
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443679
Alignment:
Q  142 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgag 241  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||||     
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  242 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 339  Q
    |||||||||| |||||||  ||| | |||||||    |  ||||| ||||| ||||| | ||| |||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| |    
T  43443498 aagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 43443597  T
Q  340 tatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43443598 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaggatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 43443679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009809
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  243 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 340  Q
    ||||||||| ||||| |  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  27009989 agttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 27009890  T
Q  341 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27009889 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 27009809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 313 - 432
Target Start/End: Original strand, 17471768 - 17471887
Alignment:
Q  313 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgt 412  Q
    ||||||||||||  || |||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471768 attgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgt 17471867  T
Q  413 tttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  17471868 tttggtgaaattggtgaatt 17471887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188404
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20623079 - 20623020
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623079 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 20623020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 21233681 - 21233740
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233681 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 21233740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 341 - 415
Target Start/End: Original strand, 29190478 - 29190552
Alignment:
Q  341 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29190478 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 29190552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 25900558 - 25900617
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25900558 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatga 25900617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 37052854 - 37052795
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37052854 gttgttgttgagttatgatggagggtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 37052795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16536307 - 16536248
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16536307 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattgtatgttatgattgtagttgattgatga 16536248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 11584450 - 11584394
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11584450 atcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 11584394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19862319 - 19862186
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 376  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | |||  ||||    
T  19862319 atgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgacttgggtgttcataattca 19862220  T
Q  377 tggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtg 411  Q
    ||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  19862219 tgatttgatgatgagaa-atgagttgttgttggtg 19862186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493885
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 376  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||| |||||||| | |||  ||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  377 tggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||  |||||||||||||  | | ||||||||| || ||||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatgagaa-ataagttgttgttgttggtttggtgaaa 23493885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310750
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaa 21310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981557
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23981557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 21222462 - 21222514
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  21222462 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtatgggg 21222514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950879
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgt 206  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || || |||| ||||| |||| |||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgt 32950879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41686
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| | ||| |||| | ||||||||| |||||| || || |||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | | | || |||| | |||| ||| ||||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatga 41767  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41766 atcattggttgggtatgcatattcatgaattgattattagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa-ttgtgaattg 41686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 882 - 1250
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| |||||||||  | | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  |||||||  |||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 1180  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1181 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgtt-ttggtgttttggtgaaa 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12083
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgt-aactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  252 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatg 350  Q
    |||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  || |||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatg 12154  T
Q  351 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12153 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttagtgaaa 12083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6358
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||    
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||   ||||||  |||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatga 6288  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6289 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 6358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128464
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |  ||  ||||| |||||    
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| |  ||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatga 128393  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128394 ataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 128464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 403
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31942
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| ||| |||     
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T
Q  261 aaatggatgaatttgacat---gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 357  Q
     ||| | |||||||  | |   ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || |  || ||||  ||||||||| |||    
T  31797 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataatt 31896  T
Q  358 gcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgt 403  Q
    |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31897 gcttgggtttgcatattcatggattaatgatgagaatttgaattgt 31942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22678 - 22650
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22678 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247738
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | | || ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||| | ||||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 247665  T
Q  350 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  247666 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaactgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtgaaa 247738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171863
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 171943  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| || | ||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  171942 atcattgcttaggtatgcatattcatgatttgttgttaagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 171863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177566
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 177646  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| || | ||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  177645 atcattgcttaggtatgcatattcatgatttgttgttaagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Original strand, 70882 - 70914
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70882 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 70914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123460
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 149  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 249  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  250 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttga 348  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 123386  T
Q  349 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123387 tgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 123460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Original strand, 255074 - 255106
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  255074 tgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaattg 255106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Original strand, 261680 - 261712
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  261680 tgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaattg 261712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 422
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5356
Alignment:
Q  63 gggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaacttt 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaa 261  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  262 aatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgct 360  Q
    ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  5196 aattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgct 5295  T
Q  361 tgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5296 tgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 5356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8846
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||  ||||| |||||    
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 8916  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8915 ataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 8846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26710
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  252 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatg 350  Q
    |||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| |  ||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatg 26639  T
Q  351 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  26640 aatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatgagaatttg-agtgttgttggtgttttgatgaaa 26710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 415
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8466
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||| || ||| ||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 8376  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
     || |||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8377 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatgagaatttgaattgttgctggtgtttt 8466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 6877 - 6929
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  6877 taggagttaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 6929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 65 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9180 - 8820
Alignment:
Q  65 gttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaattcgtgctccaac 158  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  9180 gttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatc 9081  T
Q  159 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  9080 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtg 8981  T
Q  259 caaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 357  Q
    |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  8980 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcatt 8881  T
Q  358 gcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8880 gcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaatttttgttggtgttttggt 8820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 95 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 149018 - 148688
Alignment:
Q  95 gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataat 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  149018 gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 148919  T
Q  193 aagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaa 291  Q
    || |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| |     
T  148918 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaat 148819  T
Q  292 ttgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgag 391  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  148818 ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatgag 148719  T
Q  392 aatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148718 aatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 148688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146838
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattcatgc 146839  T
Q  153 t 153  Q
    |    
T  146838 t 146838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 271983
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 351  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatga 272063  T
Q  352 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |   |||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  272062 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgttatagagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattagtgaatt 271983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26892
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 134 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22637
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||     
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22650 - 22591
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22650 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatga 22591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 26905 - 26846
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26905 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatga 26846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1748
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 1735 - 1794
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1735 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatga 1794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 134 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48155
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 332  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaa 48244  T
Q  333 tagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48243 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 48155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 20569 - 20513
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20569 atcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 20513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Original strand, 51121 - 51314
Alignment:
Q  66 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51121 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatg 51220  T
Q  166 atatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  51221 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13480
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 13570  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13569 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatgagaatttgaatttttgtaggtgtttt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42751 - 42677
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  42751 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41622
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     |||||| ||||| |||||| |||||||||||   ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 41712  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
     || |||  |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41711 ttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 41622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107715
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| || |    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 332  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 107804  T
Q  333 tagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  107803 ttgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 107715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 422
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64812
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatt-----gataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||| ||||||||||||     ||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 335  Q
    ||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 64726  T
Q  336 atgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || ||||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  64727 atattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 64812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 184
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  142 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 127 - 420
Target Start/End: Original strand, 534 - 828
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
    ||| | | ||||||  |||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | |    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatgg 733  T
Q  326 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtga 420  Q
     ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  734 ctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtga 828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 127 - 419
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34755
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgtt 324  Q
     | |||| ||||  |||||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttatt 34659  T
Q  325 gatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
    | || || | |||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  34660 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 34755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89586
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||| | ||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  89578 aaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 178
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatg 178  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 79616 - 79533
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttcatggattgatgatgagaa 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||    
T  79616 caattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaa 79533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 79786 - 79745
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  79786 aaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 79745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 138 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2936
Alignment:
Q  138 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatag 335  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 3016  T
Q  336 atgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3015 atgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 2936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 415
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9626
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 9470  T
Q  261 aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 359  Q
     ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9471 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 9570  T
Q  360 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9571 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 9626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 415
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16524
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 16368  T
Q  261 aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 359  Q
     ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16369 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 16468  T
Q  360 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16469 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 16524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9338
Alignment:
Q  291 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 390  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatga 9381  T
Q  391 gaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9380 gaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaattg 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 162 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 42965
Alignment:
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaa 261  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  262 aatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 359  Q
    ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||    
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 43027  T
Q  360 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43026 ttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttaaattg-tgttggtgttttggtgaaa 42965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5660
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| |||| ||||| |||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 177 - 422
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5498
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttga 276  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||      
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 5353  T
Q  277 cat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttc 375  Q
    |   ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  || |||||| ||||||||||| | ||| |||    
T  5354 ctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatattc 5452  T
Q  376 atggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5453 atggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 5498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Original strand, 102923 - 102963
Alignment:
Q  144 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  102923 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 102963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3690
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa-tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttg 275  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||   ||| | |||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  276 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgtt 374  Q
     | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||| | ||| ||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  375 catggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttgatgttttggtgaaa 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 3
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  243 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 340  Q
    ||||||| | |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  183 agttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 84  T
Q  341 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||  || |||||| ||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  83 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 30494 - 30438
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  30494 atcatagaagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggg 30438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14344
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgct 14182  T
Q  261 aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 359  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| | | | ||||| |  ||||||||| ||||| ||||| |  ||| |  | ||||||||  ||||||||| |||||    
T  14183 caattggtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgc 14282  T
Q  360 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| || | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14283 ttgagtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 14344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 422
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21399
Alignment:
Q  138 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    ||| |||||||||| |||| ||  ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| |  ||||||||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  21215 tgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttga 21314  T
Q  337 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21315 tgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatgaaaatttgaactg-tgttggtgttttggtgaaa 21399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 300 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48482
Alignment:
Q  300 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaa 399  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 48504  T
Q  400 ttgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  48503 ttg-tgttggtgttttgatgaaa 48482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13445
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 300 - 422
Target Start/End: Original strand, 26 - 147
Alignment:
Q  300 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaa 399  Q
    |||||||||| ||| |||| || |  ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26 tgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 125  T
Q  400 ttgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  126 ttgtt-ttggtgttttggtgaaa 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 80264 - 80187
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  80264 atcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 166119 - 166197
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  166119 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162111
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116462
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 116462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 31135 - 31212
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  31135 atcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1424
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5809
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6015
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 307 - 385
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  307 atcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54412
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa--tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||  |||||| |||||  ||||||||||| |||| |  ||| | |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  275 -gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgt 373  Q
     || ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||| | || | ||||||||   |||||||||||| |    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T
Q  374 tcatggattgatgatgagaa 393  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  54431 ttatggattgatgatgagaa 54412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 45051 - 45007
Alignment:
Q  349 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa 393  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  45051 tgaatcatgacttgggtatacatatttatggattgatgatgagaa 45007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45094
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tt 273  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||  || |||||| |||||  ||||| || ||||||| |  ||| | |||| ||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg-aaattgtactcaattggtgaattt 45146  T
Q  274 tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
    ||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | |||||||||||||    
T  45145 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttg 45094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1863 - 1815
Alignment:
Q  373 ttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1863 ttcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3252 - 3183
Alignment:
Q  345 ttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttt 414  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3252 ttgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatgaagagaattggaattgttgttggtgttt 3183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3370
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 210  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggt 3370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 1777 - 1721
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1777 atcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 1721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 19805 - 19861
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19805 atcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 19861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 24109 - 24165
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24109 atcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 24165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 433
Target Start/End: Original strand, 76984 - 77139
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 376  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| || |  ||||||| |||| |||||||||| |||  ||||    
T  76984 atgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggcttgggtattcataattca 77083  T
Q  377 tggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||  ||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  77084 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattg 77139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 76699 - 76751
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  76699 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggg 76751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 433
Target Start/End: Original strand, 132420 - 132542
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatg-ttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttgg 409  Q
    ||||||||||||||| || |||   ||||| | | |||| | |||| |||||||| | |||| ||||||| ||| || |||||| | ||| |||||||||    
T  132420 caattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaat-gaaatgttgttgg 132518  T
Q  410 tgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  132519 tgttttggtgaaatttgtgaattg 132542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8216
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56226
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--aaatatg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | | ||| |||||||  || ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  232 tagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaaa 56226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 170 - 114
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  170 atcattggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 6259 - 6315
Alignment:
Q  9 atcataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||||||||||    
T  6259 atcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggg 6315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 35873 - 35821
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  35873 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 35821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 181
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1386
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat 181  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1348 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcat 1386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 181
Target Start/End: Original strand, 9603 - 9641
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat 181  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9603 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcat 9641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7551 - 7522
Alignment:
Q  404 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7551 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 22422 - 22463
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  22422 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgtatgcatgaa 22463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38282 - 38253
Alignment:
Q  404 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38282 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 93773 - 93814
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  93773 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaa 93814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 447
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | ||||||||||    
T  499 taggagctaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataactgaggtaagggg 447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2476
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtat 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtat 2476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 1363 - 1415
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||    
T  1363 taggaactaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggg 1415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10908 - 10868
Alignment:
Q  144 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  10908 aattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaa 10868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University