View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1139_low_63 (Length: 427)

Name: NF1139_low_63
Description: NF1139
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1139_low_63
NF1139_low_63
[»] chr1 (93 HSPs)
chr1 (40-386)||(844674-845021)
chr1 (42-378)||(35387269-35387606)
chr1 (40-378)||(42510402-42510741)
chr1 (45-378)||(45490833-45491167)
chr1 (43-378)||(1351393-1351728)
chr1 (42-378)||(6711004-6711342)
chr1 (33-375)||(41972782-41973124)
chr1 (43-378)||(16386734-16387069)
chr1 (43-378)||(28340262-28340597)
chr1 (45-378)||(16451009-16451343)
chr1 (45-375)||(32270240-32270566)
chr1 (45-378)||(51264377-51264711)
chr1 (44-374)||(17887828-17888160)
chr1 (42-380)||(7183797-7184136)
chr1 (45-347)||(12890120-12890423)
chr1 (38-386)||(44737992-44738340)
chr1 (94-378)||(26118173-26118458)
chr1 (45-378)||(24339596-24339929)
chr1 (45-378)||(50540226-50540560)
chr1 (51-383)||(50304540-50304872)
chr1 (51-378)||(31004021-31004348)
chr1 (38-384)||(16476107-16476453)
chr1 (46-378)||(17327607-17327940)
chr1 (94-374)||(30105641-30105923)
chr1 (44-378)||(41967806-41968142)
chr1 (40-378)||(39281772-39282110)
chr1 (44-374)||(16437259-16437574)
chr1 (51-378)||(42512728-42513052)
chr1 (43-375)||(46154780-46155120)
chr1 (81-378)||(32289302-32289600)
chr1 (51-385)||(11772583-11772917)
chr1 (44-378)||(51703121-51703455)
chr1 (44-378)||(1601049-1601386)
chr1 (42-378)||(6029254-6029595)
chr1 (44-378)||(26764753-26765082)
chr1 (61-384)||(15539842-15540165)
chr1 (102-378)||(45658761-45659037)
chr1 (107-378)||(49303312-49303583)
chr1 (45-375)||(3414814-3415146)
chr1 (46-378)||(5109614-5109944)
chr1 (132-378)||(42705195-42705442)
chr1 (51-359)||(38086973-38087281)
chr1 (51-378)||(10384256-10384578)
chr1 (46-375)||(6143947-6144276)
chr1 (42-361)||(16704605-16704925)
chr1 (42-282)||(25539735-25539975)
chr1 (45-347)||(13994064-13994366)
chr1 (51-257)||(38663021-38663227)
chr1 (91-317)||(20494927-20495137)
chr1 (131-373)||(50382363-50382608)
chr1 (178-378)||(7837149-7837350)
chr1 (42-247)||(34663821-34664012)
chr1 (251-378)||(8838986-8839113)
chr1 (57-322)||(570281-570549)
chr1 (114-331)||(25343213-25343431)
chr1 (275-378)||(21071727-21071830)
chr1 (283-378)||(38663228-38663323)
chr1 (102-333)||(504394-504625)
chr1 (133-380)||(6771338-6771586)
chr1 (51-206)||(8838827-8838987)
chr1 (302-385)||(40811322-40811405)
chr1 (262-363)||(7837474-7837575)
chr1 (186-383)||(26733579-26733776)
chr1 (163-285)||(46447665-46447787)
chr1 (181-378)||(39792826-39793022)
chr1 (54-165)||(21071621-21071727)
chr1 (132-247)||(32467910-32468025)
chr1 (262-384)||(33316499-33316621)
chr1 (114-240)||(34283912-34284040)
chr1 (159-384)||(46815682-46815906)
chr1 (121-341)||(2761551-2761770)
chr1 (195-375)||(17291612-17291791)
chr1 (203-270)||(23799603-23799670)
chr1 (114-206)||(15324109-15324201)
chr1 (107-375)||(47242477-47242743)
chr1 (129-375)||(31574320-31574566)
chr1 (179-384)||(40610739-40610944)
chr1 (325-378)||(25539981-25540034)
chr1 (42-87)||(30105915-30105960)
chr1 (303-375)||(23799531-23799603)
chr1 (43-87)||(26118450-26118494)
chr1 (51-130)||(23799670-23799749)
chr1 (336-378)||(16643190-16643232)
chr1 (107-209)||(49799322-49799424)
chr1 (104-192)||(7836542-7836630)
chr1 (155-246)||(16643272-16643361)
chr1 (107-211)||(52030330-52030434)
chr1 (261-388)||(7146859-7146986)
chr1 (251-341)||(8780601-8780690)
chr1 (222-375)||(30798557-30798705)
chr1 (114-172)||(47093006-47093064)
chr1 (127-203)||(30798824-30798900)
chr1 (261-325)||(35335799-35335863)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (39-385)||(36769446-36769793)
chr7 (44-378)||(47953066-47953401)
chr7 (40-385)||(10932434-10932780)
chr7 (43-378)||(3922587-3922923)
chr7 (43-378)||(11321769-11322105)
chr7 (44-378)||(26994109-26994444)
chr7 (46-383)||(43158565-43158903)
chr7 (42-378)||(46633571-46633903)
chr7 (46-378)||(21784749-21785082)
chr7 (40-378)||(43189126-43189466)
chr7 (39-384)||(18386396-18386741)
chr7 (51-373)||(18470567-18470888)
chr7 (55-378)||(26371693-26372017)
chr7 (51-376)||(41211086-41211413)
chr7 (45-375)||(32873659-32873987)
chr7 (42-386)||(43368076-43368420)
chr7 (45-374)||(1870011-1870342)
chr7 (42-378)||(40753044-40753366)
chr7 (45-378)||(30849130-30849464)
chr7 (45-378)||(47316582-47316901)
chr7 (100-378)||(29661255-29661533)
chr7 (51-374)||(3891930-3892238)
chr7 (42-388)||(9913400-9913745)
chr7 (42-388)||(9927088-9927433)
chr7 (104-384)||(11250558-11250834)
chr7 (41-378)||(48894591-48894928)
chr7 (51-378)||(34295295-34295615)
chr7 (51-378)||(329354-329687)
chr7 (132-378)||(44748660-44748906)
chr7 (42-378)||(38301223-38301554)
chr7 (42-331)||(30598939-30599229)
chr7 (68-374)||(1363538-1363843)
chr7 (52-384)||(11822116-11822440)
chr7 (43-344)||(23349209-23349510)
chr7 (51-379)||(20127171-20127501)
chr7 (102-376)||(43213811-43214085)
chr7 (51-375)||(37966858-37967182)
chr7 (50-386)||(48445404-48445740)
chr7 (126-383)||(17237035-17237292)
chr7 (51-378)||(22723916-22724243)
chr7 (54-364)||(22724429-22724739)
chr7 (45-378)||(26910295-26910624)
chr7 (44-233)||(47947636-47947826)
chr7 (43-296)||(46408771-46409021)
chr7 (45-362)||(21133248-21133567)
chr7 (51-266)||(26652750-26652965)
chr7 (203-385)||(16963174-16963356)
chr7 (126-378)||(46448528-46448780)
chr7 (114-378)||(15035135-15035401)
chr7 (114-297)||(34117399-34117581)
chr7 (186-384)||(34519527-34519725)
chr7 (43-165)||(12982178-12982301)
chr7 (51-269)||(41665568-41665786)
chr7 (42-208)||(16962986-16963149)
chr7 (262-378)||(26700572-26700688)
chr7 (44-282)||(22631609-22631853)
chr7 (132-256)||(46627135-46627259)
chr7 (142-363)||(21408526-21408745)
chr7 (103-269)||(48699334-48699500)
chr7 (102-333)||(29455778-29456006)
chr7 (126-277)||(29372764-29372915)
chr7 (287-375)||(41665485-41665573)
chr7 (123-249)||(35645403-35645529)
chr7 (300-378)||(41223320-41223398)
chr7 (102-323)||(2048887-2049107)
chr7 (262-326)||(3359773-3359837)
chr7 (44-92)||(34117349-34117397)
chr7 (100-170)||(47442769-47442840)
chr7 (167-245)||(42332059-42332137)
chr7 (126-231)||(30259938-30260043)
chr7 (271-366)||(16027823-16027918)
chr7 (177-214)||(8453285-8453322)
chr7 (46-79)||(17237005-17237038)
chr7 (143-216)||(29992741-29992813)
chr7 (129-185)||(8453204-8453260)
chr7 (149-213)||(41903603-41903667)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (42-378)||(51259657-51259994)
chr3 (42-378)||(28675661-28675998)
chr3 (40-375)||(1344587-1344923)
chr3 (51-378)||(12349048-12349376)
chr3 (45-378)||(2134944-2135278)
chr3 (45-378)||(29584749-29585083)
chr3 (43-383)||(31882894-31883234)
chr3 (46-378)||(21221238-21221570)
chr3 (42-375)||(24571153-24571486)
chr3 (42-374)||(53557676-53558009)
chr3 (45-378)||(47958309-47958643)
chr3 (37-378)||(39052715-39053058)
chr3 (79-378)||(40094411-40094711)
chr3 (45-364)||(25860312-25860632)
chr3 (91-378)||(44116859-44117147)
chr3 (51-378)||(25927204-25927533)
chr3 (38-378)||(4851340-4851674)
chr3 (43-370)||(34026554-34026867)
chr3 (51-384)||(3864548-3864879)
chr3 (51-378)||(50386333-50386660)
chr3 (100-385)||(42636273-42636559)
chr3 (41-378)||(51925085-51925422)
chr3 (40-385)||(5442160-5442494)
chr3 (43-359)||(20609544-20609846)
chr3 (132-378)||(20255007-20255252)
chr3 (40-378)||(33364655-33364993)
chr3 (44-378)||(38213227-38213562)
chr3 (44-384)||(22484614-22484954)
chr3 (51-378)||(3867526-3867848)
chr3 (43-375)||(21373812-21374135)
chr3 (44-324)||(26282315-26282599)
chr3 (51-374)||(29645946-29646270)
chr3 (126-374)||(54622678-54622925)
chr3 (55-379)||(3964173-3964497)
chr3 (141-378)||(49748788-49749025)
chr3 (133-378)||(51296544-51296787)
chr3 (43-383)||(45690778-45691112)
chr3 (51-378)||(50678677-50679006)
chr3 (94-378)||(3695184-3695449)
chr3 (41-376)||(10747088-10747406)
chr3 (175-379)||(19906767-19906971)
chr3 (149-378)||(24721463-24721693)
chr3 (233-378)||(41682930-41683075)
chr3 (51-234)||(53046667-53046846)
chr3 (38-186)||(43175436-43175585)
chr3 (114-383)||(6179376-6179639)
chr3 (126-372)||(44000217-44000462)
chr3 (119-375)||(44267691-44267941)
chr3 (284-383)||(43175589-43175688)
chr3 (172-364)||(52300439-52300633)
chr3 (109-320)||(34351303-34351514)
chr3 (114-231)||(41694925-41695042)
chr3 (177-320)||(39215404-39215547)
chr3 (126-274)||(25954407-25954554)
chr3 (136-378)||(8253640-8253881)
chr3 (258-321)||(53046605-53046668)
chr3 (102-374)||(8066939-8067210)
chr3 (126-374)||(25395570-25395818)
chr3 (195-375)||(26847351-26847532)
chr3 (109-281)||(42035652-42035824)
chr3 (187-278)||(14155438-14155528)
chr3 (129-219)||(32621828-32621918)
chr3 (166-331)||(32768588-32768755)
chr3 (104-321)||(17264606-17264822)
chr3 (260-363)||(30258962-30259065)
chr3 (41-87)||(20254945-20254991)
chr3 (187-245)||(23322158-23322216)
chr3 (119-212)||(41538131-41538225)
chr3 (42-152)||(54963985-54964095)
chr3 (43-87)||(3695441-3695485)
chr3 (114-173)||(28625001-28625060)
chr3 (258-301)||(53046517-53046560)
chr3 (151-201)||(8165833-8165883)
chr3 (302-374)||(8025895-8025967)
chr3 (107-155)||(42547463-42547511)
[»] chr2 (71 HSPs)
chr2 (43-383)||(34338681-34339022)
chr2 (54-378)||(9732813-9733138)
chr2 (41-378)||(18685705-18686043)
chr2 (42-378)||(32497785-32498122)
chr2 (43-374)||(35114656-35114988)
chr2 (46-378)||(17540588-17540922)
chr2 (40-378)||(2644970-2645308)
chr2 (40-376)||(5278720-5279056)
chr2 (43-375)||(33366481-33366814)
chr2 (43-378)||(30326215-30326550)
chr2 (43-378)||(44284508-44284836)
chr2 (43-378)||(37308527-37308863)
chr2 (68-385)||(7258792-7259111)
chr2 (46-378)||(30798372-30798703)
chr2 (45-378)||(19513571-19513906)
chr2 (45-361)||(42706231-42706549)
chr2 (40-356)||(16104142-16104459)
chr2 (42-378)||(33889128-33889450)
chr2 (45-375)||(39461187-39461518)
chr2 (132-383)||(7761451-7761702)
chr2 (43-378)||(40692176-40692504)
chr2 (51-384)||(42365456-42365790)
chr2 (46-378)||(2085946-2086269)
chr2 (42-378)||(3913343-3913679)
chr2 (56-378)||(28824440-28824762)
chr2 (42-375)||(16177769-16178100)
chr2 (43-363)||(4641387-4641706)
chr2 (42-378)||(6896040-6896375)
chr2 (108-378)||(32766387-32766658)
chr2 (43-370)||(40832360-40832692)
chr2 (45-378)||(38992954-38993284)
chr2 (42-375)||(10399756-10400084)
chr2 (141-366)||(12672373-12672594)
chr2 (42-273)||(37003856-37004089)
chr2 (46-379)||(30712732-30713068)
chr2 (51-375)||(11114752-11115074)
chr2 (42-285)||(26418793-26419037)
chr2 (51-378)||(13829318-13829633)
chr2 (51-379)||(27462684-27463010)
chr2 (55-375)||(8112189-8112505)
chr2 (39-364)||(26981606-26981912)
chr2 (44-269)||(9717113-9717322)
chr2 (89-377)||(12939202-12939474)
chr2 (45-216)||(18793306-18793478)
chr2 (200-375)||(38623190-38623365)
chr2 (252-374)||(18793180-18793300)
chr2 (278-385)||(37863242-37863349)
chr2 (182-378)||(41365993-41366189)
chr2 (114-378)||(45463005-45463256)
chr2 (65-274)||(1247049-1247250)
chr2 (287-378)||(9717317-9717408)
chr2 (55-374)||(41934465-41934785)
chr2 (45-246)||(20907468-20907664)
chr2 (294-378)||(37003774-37003858)
chr2 (101-294)||(35472967-35473160)
chr2 (116-274)||(37088218-37088376)
chr2 (187-331)||(40876554-40876697)
chr2 (40-119)||(12672596-12672674)
chr2 (195-321)||(15303180-15303306)
chr2 (115-325)||(26796173-26796382)
chr2 (275-375)||(83374-83474)
chr2 (116-240)||(13249421-13249545)
chr2 (195-375)||(18278926-18279104)
chr2 (260-326)||(6453249-6453315)
chr2 (176-375)||(16061980-16062178)
chr2 (335-378)||(26419045-26419089)
chr2 (142-289)||(38786503-38786647)
chr2 (343-378)||(1247257-1247292)
chr2 (148-206)||(31148786-31148844)
chr2 (306-375)||(31193954-31194023)
chr2 (260-315)||(12217650-12217706)
[»] chr4 (115 HSPs)
chr4 (40-378)||(23521751-23522090)
chr4 (40-384)||(24002209-24002555)
chr4 (42-384)||(56154494-56154837)
chr4 (42-378)||(29785412-29785750)
chr4 (42-378)||(38486133-38486465)
chr4 (43-378)||(20802407-20802743)
chr4 (43-378)||(49151976-49152311)
chr4 (51-378)||(55065209-55065536)
chr4 (44-378)||(12600761-12601096)
chr4 (43-378)||(21579900-21580235)
chr4 (42-376)||(33176910-33177245)
chr4 (43-378)||(52319200-52319538)
chr4 (42-378)||(9512216-9512553)
chr4 (43-362)||(37865627-37865947)
chr4 (46-378)||(55593759-55594096)
chr4 (43-355)||(21202614-21202926)
chr4 (42-378)||(36743565-36743901)
chr4 (51-378)||(50178368-50178696)
chr4 (45-378)||(6776460-6776788)
chr4 (94-388)||(33552708-33553003)
chr4 (51-378)||(52949604-52949930)
chr4 (59-378)||(54542881-54543198)
chr4 (94-378)||(1231236-1231521)
chr4 (40-375)||(20694247-20694578)
chr4 (106-376)||(2725011-2725281)
chr4 (40-378)||(36885817-36886142)
chr4 (81-385)||(20517890-20518196)
chr4 (94-374)||(24210243-24210525)
chr4 (55-378)||(44649040-44649361)
chr4 (114-378)||(50727789-50728054)
chr4 (114-378)||(50735803-50736068)
chr4 (42-378)||(9807030-9807365)
chr4 (46-378)||(42869859-42870181)
chr4 (102-378)||(44324218-44324494)
chr4 (107-378)||(46680386-46680658)
chr4 (94-378)||(29616095-29616376)
chr4 (42-378)||(29592774-29593105)
chr4 (51-378)||(3649519-3649846)
chr4 (100-378)||(36497148-36497427)
chr4 (132-378)||(38812484-38812730)
chr4 (51-363)||(34929797-34930110)
chr4 (40-378)||(2786836-2787174)
chr4 (42-357)||(47642388-47642703)
chr4 (102-378)||(32181197-32181473)
chr4 (39-274)||(43640969-43641205)
chr4 (51-378)||(50186411-50186738)
chr4 (94-378)||(47361289-47361570)
chr4 (109-378)||(4325731-4326001)
chr4 (103-384)||(11055977-11056258)
chr4 (127-378)||(41711806-41712057)
chr4 (51-388)||(22318250-22318587)
chr4 (39-378)||(7554833-7555172)
chr4 (54-325)||(37695470-37695741)
chr4 (103-375)||(39078596-39078868)
chr4 (45-378)||(53200519-53200858)
chr4 (187-378)||(2629827-2630018)
chr4 (55-384)||(16320408-16320734)
chr4 (175-378)||(50729418-50729621)
chr4 (65-378)||(26083235-26083547)
chr4 (158-374)||(28115243-28115457)
chr4 (46-268)||(37931798-37932020)
chr4 (43-219)||(14296471-14296648)
chr4 (51-375)||(30942671-30942995)
chr4 (43-219)||(14314719-14314896)
chr4 (222-378)||(6973789-6973945)
chr4 (246-378)||(14296645-14296777)
chr4 (246-378)||(14314893-14315025)
chr4 (212-378)||(42772832-42772998)
chr4 (102-269)||(23327850-23328020)
chr4 (201-378)||(25978488-25978664)
chr4 (51-289)||(13110211-13110448)
chr4 (251-378)||(56487163-56487285)
chr4 (287-378)||(23328015-23328106)
chr4 (62-292)||(7001748-7001976)
chr4 (102-277)||(43739395-43739570)
chr4 (186-323)||(9947947-9948084)
chr4 (102-323)||(45577619-45577842)
chr4 (114-375)||(44355734-44355995)
chr4 (134-228)||(42772724-42772818)
chr4 (116-388)||(20644107-20644379)
chr4 (262-378)||(44640417-44640532)
chr4 (102-380)||(43189636-43189914)
chr4 (305-375)||(13110443-13110513)
chr4 (94-171)||(53343560-53343638)
chr4 (323-375)||(2114191-2114243)
chr4 (132-214)||(56487292-56487374)
chr4 (186-322)||(3579142-3579279)
chr4 (101-213)||(985216-985327)
chr4 (195-378)||(52673838-52674024)
chr4 (65-249)||(52755417-52755601)
chr4 (102-362)||(31445768-31446027)
chr4 (287-374)||(43739557-43739644)
chr4 (46-98)||(32181161-32181213)
chr4 (43-103)||(38520438-38520498)
chr4 (51-139)||(50729641-50729729)
chr4 (43-89)||(2725283-2725329)
chr4 (102-164)||(10184879-10184941)
chr4 (187-249)||(38520518-38520580)
chr4 (45-87)||(46680658-46680700)
chr4 (46-87)||(33552995-33553036)
chr4 (160-213)||(40792409-40792462)
chr4 (102-155)||(52673762-52673815)
chr4 (91-135)||(32081080-32081124)
chr4 (339-378)||(38520597-38520637)
chr4 (104-228)||(41720779-41720903)
chr4 (312-364)||(44365940-44365992)
chr4 (45-85)||(50728048-50728088)
chr4 (45-85)||(50736062-50736102)
chr4 (40-79)||(23327803-23327842)
chr4 (121-172)||(32858276-32858327)
chr4 (59-106)||(39433510-39433557)
chr4 (126-245)||(43893535-43893654)
chr4 (61-139)||(47669219-47669297)
chr4 (277-323)||(51518482-51518528)
chr4 (101-185)||(36679926-36680009)
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (39-384)||(27103826-27104172)
chr8 (42-378)||(45446325-45446662)
chr8 (42-378)||(34062998-34063335)
chr8 (42-378)||(41709647-41709984)
chr8 (45-378)||(32019899-32020233)
chr8 (43-378)||(34101379-34101715)
chr8 (42-383)||(31513476-31513818)
chr8 (42-378)||(8672953-8673290)
chr8 (43-383)||(3251549-3251890)
chr8 (40-386)||(6386444-6386791)
chr8 (43-378)||(29672220-29672557)
chr8 (42-344)||(29563158-29563461)
chr8 (46-384)||(7394706-7395045)
chr8 (42-378)||(25478118-25478450)
chr8 (94-378)||(4052404-4052687)
chr8 (68-378)||(5968762-5969073)
chr8 (45-377)||(13406834-13407167)
chr8 (43-378)||(31731935-31732257)
chr8 (94-383)||(30542915-30543205)
chr8 (42-378)||(37618290-37618626)
chr8 (94-378)||(37664180-37664466)
chr8 (51-375)||(12753226-12753550)
chr8 (102-378)||(10466995-10467271)
chr8 (42-376)||(22999128-22999463)
chr8 (42-375)||(40388911-40389244)
chr8 (82-378)||(7591345-7591641)
chr8 (51-376)||(15001346-15001671)
chr8 (51-383)||(39642763-39643095)
chr8 (45-378)||(17805563-17805898)
chr8 (102-383)||(41548549-41548830)
chr8 (38-377)||(14004943-14005268)
chr8 (40-385)||(35225531-35225876)
chr8 (45-378)||(45113929-45114262)
chr8 (42-378)||(30501016-30501352)
chr8 (43-269)||(32303592-32303819)
chr8 (102-378)||(29610953-29611229)
chr8 (51-383)||(37474599-37474912)
chr8 (178-378)||(37861866-37862065)
chr8 (43-375)||(17520468-17520798)
chr8 (109-378)||(16485707-16485976)
chr8 (124-375)||(10656587-10656838)
chr8 (56-363)||(16595063-16595369)
chr8 (163-378)||(21272676-21272874)
chr8 (129-375)||(10320180-10320424)
chr8 (60-378)||(6460152-6460465)
chr8 (287-383)||(32303501-32303597)
chr8 (306-384)||(38047481-38047559)
chr8 (84-285)||(27109532-27109735)
chr8 (186-385)||(22756307-22756501)
chr8 (126-375)||(10932691-10932940)
chr8 (117-323)||(54117-54322)
chr8 (51-135)||(21272592-21272676)
chr8 (94-155)||(37861803-37861865)
chr8 (42-155)||(37861766-37861865)
chr8 (40-111)||(955102-955173)
chr8 (137-363)||(10531244-10531472)
chr8 (176-324)||(36426201-36426347)
chr8 (128-211)||(32918842-32918925)
chr8 (150-331)||(11944854-11945035)
chr8 (102-215)||(28746254-28746367)
chr8 (43-87)||(4052368-4052412)
chr8 (160-240)||(14958948-14959027)
chr8 (298-378)||(15351820-15351900)
chr8 (116-215)||(5859533-5859632)
chr8 (114-172)||(9624180-9624239)
chr8 (150-213)||(11926893-11926956)
chr8 (121-212)||(15351686-15351776)
chr8 (45-87)||(30543197-30543239)
chr8 (46-87)||(37664458-37664499)
chr8 (264-352)||(9624310-9624397)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (51-383)||(11963220-11963553)
chr5 (42-378)||(32528585-32528922)
chr5 (40-375)||(7523039-7523376)
chr5 (42-378)||(35701147-35701484)
chr5 (44-384)||(2351552-2351893)
chr5 (77-379)||(31770479-31770782)
chr5 (51-389)||(34794766-34795105)
chr5 (38-378)||(39918374-39918714)
chr5 (42-378)||(24181513-24181835)
chr5 (42-388)||(41790342-41790688)
chr5 (94-384)||(41459511-41459801)
chr5 (94-378)||(29241300-29241585)
chr5 (43-335)||(21739093-21739381)
chr5 (43-378)||(6284189-6284524)
chr5 (43-383)||(8136710-8137049)
chr5 (51-378)||(3735237-3735564)
chr5 (44-322)||(4818085-4818364)
chr5 (51-378)||(7770168-7770495)
chr5 (42-376)||(4689589-4689923)
chr5 (43-364)||(22493322-22493643)
chr5 (42-384)||(31644318-31644659)
chr5 (44-378)||(24036105-24036436)
chr5 (94-383)||(31879960-31880250)
chr5 (94-385)||(7208112-7208404)
chr5 (67-378)||(40489232-40489543)
chr5 (94-378)||(39788114-39788400)
chr5 (94-378)||(23091193-23091478)
chr5 (51-374)||(18470321-18470644)
chr5 (40-374)||(7725702-7726036)
chr5 (60-326)||(28090461-28090726)
chr5 (133-375)||(553358-553601)
chr5 (104-378)||(5571546-5571806)
chr5 (122-378)||(8560871-8561126)
chr5 (65-375)||(32092874-32093183)
chr5 (71-355)||(700513-700798)
chr5 (46-370)||(5673018-5673329)
chr5 (51-378)||(37148478-37148790)
chr5 (43-263)||(40182335-40182556)
chr5 (160-390)||(27838951-27839180)
chr5 (102-333)||(22432243-22432471)
chr5 (175-378)||(5598484-5598687)
chr5 (263-378)||(4664923-4665038)
chr5 (148-364)||(17031134-17031350)
chr5 (43-175)||(20119642-20119777)
chr5 (42-119)||(548218-548295)
chr5 (46-183)||(32313713-32313850)
chr5 (336-378)||(40182553-40182595)
chr5 (152-212)||(1338601-1338661)
chr5 (43-87)||(29241264-29241308)
chr5 (43-87)||(31880242-31880286)
chr5 (105-218)||(29788507-29788618)
chr5 (42-87)||(7208396-7208441)
chr5 (344-378)||(21739019-21739053)
chr5 (260-322)||(35955088-35955150)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (42-375)||(2614766-2615100)
chr6 (39-384)||(15276853-15277199)
chr6 (42-383)||(3259548-3259895)
chr6 (51-385)||(17867714-17868049)
chr6 (51-385)||(17877497-17877832)
chr6 (55-378)||(32409774-32410098)
chr6 (45-378)||(24203236-24203569)
chr6 (51-350)||(24242543-24242843)
chr6 (59-385)||(15277195-15277522)
chr6 (43-376)||(10959872-10960205)
chr6 (46-378)||(11212131-11212464)
chr6 (44-378)||(3932729-3933064)
chr6 (54-376)||(10324035-10324358)
chr6 (94-379)||(166844-167130)
chr6 (42-383)||(11613708-11614035)
chr6 (51-378)||(10485038-10485364)
chr6 (94-378)||(34176752-34177037)
chr6 (44-378)||(17443135-17443464)
chr6 (84-338)||(32132342-32132597)
chr6 (148-378)||(11382041-11382269)
chr6 (43-378)||(14925378-14925713)
chr6 (51-378)||(18057399-18057726)
chr6 (133-376)||(11279090-11279333)
chr6 (51-378)||(31870019-31870349)
chr6 (56-378)||(11675296-11675619)
chr6 (51-376)||(3379591-3379915)
chr6 (51-378)||(18597080-18597407)
chr6 (42-383)||(32859922-32860263)
chr6 (134-378)||(3290635-3290866)
chr6 (42-378)||(8177804-8178141)
chr6 (52-378)||(29054239-29054563)
chr6 (45-376)||(23636097-23636428)
chr6 (102-379)||(9902579-9902857)
chr6 (51-335)||(4494079-4494348)
chr6 (39-364)||(34683929-34684247)
chr6 (46-378)||(14807940-14808254)
chr6 (43-193)||(29814736-29814887)
chr6 (43-193)||(28502330-28502482)
chr6 (121-378)||(7396048-7396302)
chr6 (195-374)||(9613998-9614177)
chr6 (42-136)||(32805348-32805442)
chr6 (102-341)||(35004087-35004326)
chr6 (102-333)||(27824620-27824849)
chr6 (43-119)||(11381964-11382040)
chr6 (302-378)||(14925139-14925215)
chr6 (197-371)||(9200316-9200491)
chr6 (308-377)||(33041403-33041472)
chr6 (45-108)||(11279012-11279075)
chr6 (308-375)||(13415861-13415928)
chr6 (180-374)||(28967221-28967414)
chr6 (225-375)||(34402850-34402992)
chr6 (102-208)||(32614030-32614136)
chr6 (42-87)||(34176715-34176760)
chr6 (39-87)||(167122-167170)
chr6 (180-236)||(27756314-27756370)
chr6 (302-374)||(29424498-29424570)
chr6 (122-237)||(29202990-29203104)
chr6 (135-213)||(16542362-16542440)
chr6 (222-284)||(24785106-24785168)
chr6 (133-215)||(29424652-29424734)
chr6 (122-213)||(15400672-15400760)
chr6 (122-213)||(15412459-15412547)
chr6 (122-213)||(15428053-15428141)
chr6 (102-206)||(7365318-7365422)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (42-378)||(101819-102156)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (43-383)||(23448-23787)
scaffold0054 (121-326)||(19857-20062)
[»] scaffold0208 (1 HSPs)
scaffold0208 (40-384)||(2222-2566)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (44-378)||(51311-51645)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (38-383)||(15038-15384)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (44-339)||(17982-18278)
scaffold0169 (44-276)||(12527-12760)
[»] scaffold0729 (1 HSPs)
scaffold0729 (45-378)||(4468-4796)
[»] scaffold0957 (1 HSPs)
scaffold0957 (68-378)||(2385-2695)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (51-374)||(5332-5656)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (100-370)||(18989-19258)
[»] scaffold0360 (3 HSPs)
scaffold0360 (94-378)||(15262-15551)
scaffold0360 (142-292)||(13554-13704)
scaffold0360 (43-87)||(15543-15587)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (132-375)||(372856-373099)
scaffold0004 (41-87)||(373130-373176)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (41-378)||(13576-13913)
[»] scaffold0650 (1 HSPs)
scaffold0650 (40-379)||(1531-1870)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (40-375)||(42843-43176)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (222-378)||(19044-19201)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (133-282)||(33530-33678)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (104-212)||(3683-3791)
[»] scaffold1112 (1 HSPs)
scaffold1112 (149-198)||(1078-1127)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (42-87)||(338757-338802)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 93)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 40 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 845021 - 844674
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  845021 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 844922  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  844921 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 844822  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  844821 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 844722  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 386  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  844721 tgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaaga 844674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35387606 - 35387269
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35387606 agggtctgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataataatacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttttatgg 35387507  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  35387506 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggttt 35387407  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387406 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 35387307  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387306 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 35387269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 40 - 378
Target Start/End: Original strand, 42510402 - 42510741
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  42510402 taagggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 42510501  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42510502 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 42510601  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42510602 ttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacgaatcaaacactggacaactagagt 42510701  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42510702 tgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 42510741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45491167 - 45490833
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45491167 gtgtgtttggtatgcaaaacagcaattactggacagaacaatataagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttgtatggcat 45491068  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  45491067 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 45490968  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45490967 gagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttc 45490868  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45490867 tgtcctgtctttcattttttagcaaatcaaacgca 45490833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1351728 - 1351393
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1351728 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggc 1351629  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  1351628 attgagta-ttttttgttttatatgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 1351530  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351529 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 1351430  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351429 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 1351393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6711342 - 6711004
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggttt-gcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atg 139  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6711342 agggtgtgtttggttttgcaaaacatcaagtactggacagaacagtacaaaatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaattttttatg 6711243  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  6711242 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtt 6711143  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711142 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 6711043  T
Q  340 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711042 gttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 6711004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 33 - 375
Target Start/End: Original strand, 41972782 - 41973124
Alignment:
Q  33 ttaagtctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat 132  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41972782 ttaagtttatgggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaat 41972881  T
Q  133 tttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||     
T  41972882 tttttatggcattaagtaattttttgttttatacgatttt-gagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgta 41972980  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972981 gtgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 41973080  T
Q  332 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41973081 ctagagttgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 41973124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Original strand, 16386734 - 16387069
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16386734 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaatacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 16386833  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16386834 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 16386933  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  16386934 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagaactgt 16387033  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16387034 tctgtcatgtccttcattttttag-aaatcaaacgca 16387069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28340597 - 28340262
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  28340597 gggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaatttttttatggc 28340498  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  28340497 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 28340398  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340397 atgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 28340298  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28340297 tctatcctgtcctt-attttttagcaaatcaaacgca 28340262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Original strand, 16451009 - 16451343
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  16451009 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaatagtacaacacatggcagaatagcacaggacaaattttttatggcat 16451108  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16451109 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 16451208  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16451209 gagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgtta 16451308  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16451309 tgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 16451343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 45 - 375
Target Start/End: Original strand, 32270240 - 32270566
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| || |||    || |||||||||||||    
T  32270240 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaataggaca----aattttttatggcatt 32270335  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32270336 gagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtg 32270435  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32270436 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctctacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 32270535  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32270536 gtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 32270566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Original strand, 51264377 - 51264711
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  51264377 gtgtgtttggtttgcaaatcagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaatagcacaggacaaattttttatggcat 51264476  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  51264477 tgagtaattttttgttttatacgatttttaaaggacaaaatgctattttagtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 51264576  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51264577 gagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattc 51264676  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51264677 tgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 51264711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 44 - 374
Target Start/End: Original strand, 17887828 - 17888160
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17887828 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacgggacagaatagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggca 17887927  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  17887928 ttgagtaatttgttgttttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 17888027  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17888028 gcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactagagttgt 17888127  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17888128 tttgtcatgtcattcattttttagcaaatcaaa 17888160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 42 - 380
Target Start/End: Original strand, 7183797 - 7184136
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  7183797 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacaatacaggacaaattttttatgg 7183896  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  7183897 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatactatattggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggttt 7183996  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  7183997 ggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacatatcaaacactggacaactaaagtta 7184096  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaac 380  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  7184097 ttctgtcctgtctttcaaattttagcaaatcaaacgcaac 7184136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 45 - 347
Target Start/End: Original strand, 12890120 - 12890423
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12890120 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatggcat 12890219  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  12890220 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtatcttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgat 12890319  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890320 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 12890419  T
Q  344 tgtc 347  Q
    ||||    
T  12890420 tgtc 12890423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 38 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 44738340 - 44737992
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt- 136  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  44738340 tctaaggatgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtagaagatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttt 44738241  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  44738240 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaataaaaa-ctattttgctattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtg 44738142  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 336  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44738141 gtttggtgagggacaaaaatatgagttttggtcctgtcccttgcctccaagttgtcatgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaattaga 44738042  T
Q  337 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 386  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44738041 gttgttctgtcttgtctttcattttttagcaaaacaaacgcaccctaaga 44737992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26118458 - 26118173
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26118458 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 26118359  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26118358 ggtattttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtc 26118259  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26118258 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcatacgca 26118173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24339929 - 24339596
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24339929 gtgtgtttggtctgcaaaacagcaaatactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 24339830  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt-gg 242  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  24339829 tgaataattttttgttttatacgatgtttgggggacaa--tgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgttgtggttttgg 24339732  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24339731 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttatacaaatcaaacactgaacaactagagttgtt 24339632  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24339631 ctgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 24339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Original strand, 50540226 - 50540560
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  50540226 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtataagatagaacagtacaacacacgtcagaacagcacagggcaaattttttatggcat 50540325  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |    
T  50540326 tgagtaatttgttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgat 50540425  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  50540426 gaaggacaaaaatatgagtttatgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagctgttt 50540525  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  50540526 tgttctgtcctttcttttttagcaaatcaaacgca 50540560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 51 - 383
Target Start/End: Original strand, 50304540 - 50304872
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  50304540 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 50304639  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||     
T  50304640 ttttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttaaacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttgcagagggac 50304739  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50304740 aaaaatatcagtttttgtcttgtttcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctg 50304839  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50304840 tccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 50304872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Original strand, 31004021 - 31004348
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31004021 ttggtttgcaaaacagcaagtactgtacagaacagtacaagaaagaacagcgcaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatggcattgaataa 31004120  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  31004121 ttttttgttttataggatttttgggggacgaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 31004220  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  31004221 aaaaacatcagtttttgtcctgtcccgtgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctg 31004320  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31004321 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 31004348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 38 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16476453 - 16476107
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   || ||| |||| | |||| |||||||||||||| ||    
T  16476453 tctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatataagatagaacaacacgacataaggcataacaccacatgacaaatttgta 16476354  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16476353 tggcattgaataattttatgttttatacaatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtgg 16476254  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16476253 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaa 16476154  T
Q  338 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||| || || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16476153 ttgtcctctcctctccttcattttttagcaaatcaaacacaccctaa 16476107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 46 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17327940 - 17327607
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 144  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || | ||||||||||| ||||| ||    
T  17327940 tgtgtttgatttgcaaaaaagtaagtattggacagaacagtataagatagaacagtacaatacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcgtt 17327841  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  17327840 gagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatattattttggtattttagataatttgtacatgagacaaaaagttgtgctgtgatttggtg 17327741  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17327740 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgactccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgtttt 17327641  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17327640 gtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 17327607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 94 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30105923 - 30105641
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30105923 agaacagtacaacacaaggcagaacaacactggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 30105824  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30105823 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 30105724  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaa 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30105723 ctttacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcctgtccttcatttttttagcaaatcaaa 30105641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41968142 - 41967806
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  41968142 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtgctggacagaacagtacaagacagaacaacacaacacaaggcggaacaatacatgacaaattttttatgaca 41968043  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  41968042 atgagtaattttttgttttatacaatttttgggagacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgg 41967943  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41967942 taagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagagttgtt 41967843  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttag-caaatcaaacgca 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41967842 ctgtcctgtccttcattttttagtcaaatcaaacgca 41967806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 40 - 378
Target Start/End: Original strand, 39281772 - 39282110
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | | |||| |||||||||| ||| ||||    
T  39281772 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaatagtataagatagaacagcacaacacaatgcataacaacacatgacaactttgtatg 39281871  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  39281872 acattgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggtt 39281971  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  39281972 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagtt 39282071  T
Q  340 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
     |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39282072 atcttgtcatgtccttcatgttttagcaaatcaaacgca 39282110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 44 - 374
Target Start/End: Original strand, 16437259 - 16437574
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 143  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||               | ||| ||||||||||||||||||    
T  16437259 ggtgtgtttggtttgtaaaacagcaaatactggacagaacagtataagatagaacagtaca---------------gtacaggacaaatttttatggcat 16437343  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16437344 tgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 16437443  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16437444 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctctagtttgtcctgtagctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgttc 16437543  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16437544 tattctgtccttcattttttagcaaatcaaa 16437574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42513052 - 42512728
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  42513052 ttggtttgcaaaaca---agtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatcacattgaataa 42512956  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||| |     
T  42512955 ttttttgttttatacgatttttgggggacaaaattctattttgatattttagacaatttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcac 42512856  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  42512855 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctg 42512756  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42512755 tcctttattttttagcaaatcaaacgca 42512728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 43 - 375
Target Start/End: Original strand, 46154780 - 46155120
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  46154780 gggtgtgtttagtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtataacacaagacataacggcacatgacaaattttttatgac 46154879  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc-------tg 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||       ||    
T  46154880 attgaataattttttgttttataagatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtgctgtagtttg 46154979  T
Q  235 tggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 334  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  46154980 tagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctcacctccagtttgtccagtacctgaaataattttacaaatcaaacactgaacaatta 46155079  T
Q  335 gagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46155080 gagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 46155120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32289600 - 32289302
Alignment:
Q  81 aacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggac 179  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||| |||  |||||| || | || |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  32289600 aacagtacaagatagaagagtataacataagccagaacaacataggataaatattttatgacattgaataattttatgttttatataatttttgagggac 32289501  T
Q  180 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 279  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32289500 aaaatgctattttggtattttaaacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttg 32289401  T
Q  280 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32289400 cctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 32289302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 51 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11772917 - 11772583
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||   ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  |||| | |    
T  11772917 ttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaagacataacaacacaacacaaggcagaatagcacaggacaaatttttatggttttgaatta 11772818  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| | |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  11772817 ttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatactattttggtatttaaaacaatttgtaggtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 11772718  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  11772717 aaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgcctccagattgccttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtcctg 11772618  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11772617 tccttcattttctagcaaatcaaacgcaccctaag 11772583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 51703455 - 51703121
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  51703455 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatataacagaacaacacaaggcaaaacaatacatgacaaattttttatggca 51703356  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  51703355 ttgagtaattttttgttttataccatttt-gagggacaaaatgttatttttgtattttagacaacatgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtt-gg 51703258  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51703257 tgaggaacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgccttcagtttatcctgtacttgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgtt 51703158  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttag-caaatcaaacgca 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51703157 ctgtcttgtccttcattttttagtcaaatcaaacgca 51703121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Original strand, 1601049 - 1601386
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaa-----ggtagaacagcacatgacaaatttt-ta 137  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||   |||||||||     || |||||| |||| |||||||||| ||    
T  1601049 ggtgtgtttggtctgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagaaagaacaacacaacacaacacaaggcagaacaacacaagacaaatttttta 1601148  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  1601149 tggcaatgagtaattttttgttttgtacgatttttggtggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 1601248  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1601249 tttggtgagggacaaaa--atgagtttttgttctatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaccgttttacaaatcaaacactgaacaactaaag 1601346  T
Q  338 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1601347 ttgttctgtcatgttcttca-tttttagcaaatcaaacgca 1601386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6029595 - 6029254
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||     
T  6029595 agggtgcgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagcacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttttatggt 6029496  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  6029495 attgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 6029396  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6029395 gtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 6029296  T
Q  342 tc-----tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6029295 tctgtcctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 6029254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26765082 - 26764753
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 143  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||| ||||    
T  26765082 ggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacaacacaacacaaggcagaacaatataggacaaatttttatagcat 26764983  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||   |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  26764982 tga---atttttt--tatatacgatttttgagggacgaaatattattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttcggt 26764888  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26764887 gagggacaaaaatataagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttatcttgtacctaaaacaattgtacaaatcaaacactggacaactggagttgttc 26764788  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26764787 tgtcatgtcttttattttttagcaaatcaaacgca 26764753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 61 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15540165 - 15539842
Alignment:
Q  61 aaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15540165 aaacagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacagcacaacacaaggcataacaacacatgacaagtttttatggtattgaataattttttgttt 15540066  T
Q  161 tatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatga 260  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||  || |||| | | |    
T  15540065 tatatgatttttgggggacaaaatgttattttggtgttttagacaacttctacgtatgacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaagacaaaagtttca 15539966  T
Q  261 gtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattt 360  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15539965 ggttttgtcctgtctcttgcctccagtttgttctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctgtccttcattt 15539866  T
Q  361 tttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  15539865 tttaacaaatcaaacgcaccctaa 15539842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 102 - 378
Target Start/End: Original strand, 45658761 - 45659037
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  45658761 acaacacaagacagaatagcacatgacaaatttttatggctttgaataattttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaa 45658860  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
     |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  45658861 aacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagcgacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgtctccagtttgtcctgtacttg 45658960  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45658961 aaacagttttacaaatcagacactagacaactggagttgttttgtcctgtccttcattttctagcaaatcaaacgca 45659037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 107 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49303583 - 49303312
Alignment:
Q  107 acaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagaca 205  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  49303583 acaaggcagaacatcacatgacaactattttacgtcattgagtaattttttgttttatacgatttttg-gggacaaaatgttattttagtattttagaca 49303485  T
Q  206 acttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 305  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  49303484 acttgtacgtaggataaaaaattgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttctcttgtcccttgtctccagtttgtcttatacctgaaac 49303385  T
Q  306 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49303384 agttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttttgtcttgtactttattttttagcaaatcaaacgca 49303312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3415146 - 3414814
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatg-acaaatttttatggcat 143  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||  | |||| |||||| |    ||||||||||||    
T  3415146 gtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagatagaacaatataacacaagacaaaacaacacatgtaattttttttatggcat 3415047  T
Q  144 tgagtaa-ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| || || ||| ||||||    
T  3415046 tgagtaatttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttaaacaactagtacgtgggataaaaaattatgatgtagtttgg 3414947  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3414946 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctcgtctccagattgtccagtacctaaaatagttttacaaatcaaacactggataattagagttgtt 3414847  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
     |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  3414846 ttgtcatatccttcatattttaacaaatcaaac 3414814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 46 - 378
Target Start/End: Original strand, 5109614 - 5109944
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 145  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||  |  |||||||| | | |||| || |||||||||||||| | |||||    
T  5109614 tgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggactgaagagtacaagacaaaatagcgcaacacaaagcataacaccatatgacaaatttttacgacattg 5109713  T
Q  146 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 245  Q
    | |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  5109714 atttttttttt-ttttatacaatttttgggggacaaaatgttattttgc-attttagacaacttgtactttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtga 5109811  T
Q  246 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 345  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5109812 gggacaaaaacatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttctg 5109911  T
Q  346 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5109912 tcctgcacttcattttttagcaaatcaaacgca 5109944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 132 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42705442 - 42705195
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42705442 tttttatggcaatgagtaattttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttgacatttcagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgtg 42705343  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagt-ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggaca 330  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42705342 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttttttcccgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaaca 42705243  T
Q  331 actagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |  ||||||||| || ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42705242 atcagagttgttatgacatattctttattttttcgcaaatcaaacgca 42705195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38087281 - 38086973
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  38087281 ttggtttgcaaaacattaagtactggacataacagtacaagacagaacagtacaacataaggcagaacagcacaggacaaatttttatggcattgaataa 38087182  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    | ||||| ||||| | ||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||| |||     
T  38087181 tattttgctttatgcaatttttggggaacgaaatgctattttggatttttagacaacttgtacttgggacaaaaagttgtgatgtggtttagtgaaggac 38087082  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |     
T  38087081 aaaaatatgagtttttgtcatgtccattgcatccattttatcctgtacttgaaactgttttataaatcaaacacaggacaactgaagttgttttgtccta 38086982  T
Q  351 tccttcatt 359  Q
    |||||||||    
T  38086981 tccttcatt 38086973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Original strand, 10384256 - 10384578
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||| | |||||||| || | |||| |||  ||||| ||||||| ||||||| |||    
T  10384256 ttggtttgcaaaacagtaagtactgggcataacagtacaagaccgaacagcacaacacagggcaaaacaacactggacaattttttattgcattgaataa 10384355  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||     
T  10384356 ttttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttgaatttttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttagtgaaggac 10384455  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |    
T  10384456 aaaaatatgagtttttgtcttgtcctttgcatccaatttgtactgtacctgaaataattttacaaatcaaacactagacaactagagttgttc-----ag 10384550  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10384551 ttcttcattttttagcaaatcaaacgca 10384578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6144276 - 6143947
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||  |   |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  6144276 tgtgtttggtttgcaaaacagtaatcactgaacagaacagtacaagatagggcaacacaacataaggcagaacatcacaagacaaatttttatggtattg 6144177  T
Q  146 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 245  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||  ||    
T  6144176 aataattttctgttttatatgatttttgggtgacaaaatgttatttttgtgttttagacaacttctacgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttgccga 6144077  T
Q  246 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 345  Q
    |||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  6144076 gggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtctctgaaactgttttacaaatcaaacattggacaactgcagttgttctg 6143977  T
Q  346 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  6143976 tcctgtccttcattttgtatcaaatcaaac 6143947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 361
Target Start/End: Original strand, 16704605 - 16704925
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  | |||| |||||   | |||| || | |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  16704605 agggtgagtttggttttcaaaacagaaagtactggacataacaacacaagacagaacaacaaaacataaagcagaatagtacaagacaaatttttatggc 16704704  T
Q  142 attgagtaa-ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  || ||||||| ||||||||    
T  16704705 attaaataaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaaagctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaagagttgtgatgtggttt 16704804  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||    
T  16704805 ggtaagggacaaaaatatatgtttttgtcgtgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaattgaagttg 16704904  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcatttt 361  Q
    ||||||| ||||||| |||||    
T  16704905 ttctgtcctgtcctttatttt 16704925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 282
Target Start/End: Original strand, 25539735 - 25539975
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||  |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25539735 agggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaagacataacaatacaacacaaggcagaatagcacaggacaaatttttatggc 25539834  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  25539835 tttgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaaaacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 25539934  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 282  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  25539935 gtgagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgcct 25539975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13994366 - 13994064
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||  |||||| |  ||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||  ||    
T  13994366 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtacagaacaaaacaacataagacaacacaacacaatacaaggcagaacaacacaagacaaattttgtatgatat 13994267  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||    
T  13994266 tgaataattttatgttttatatgatttttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgtgttgtggtttggt 13994168  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13994167 gagggacaaaaatttcagtttttgtccagttccttgcctccaatttgtcatgtccatgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttc 13994068  T
Q  344 tgtc 347  Q
    ||||    
T  13994067 tgtc 13994064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 257
Target Start/End: Original strand, 38663021 - 38663227
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| |||||   |||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  38663021 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacaacacaatataagggagaacaacacaggacaaatttttatgacattgaataa 38663120  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  38663121 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 38663220  T
Q  251 aaaaata 257  Q
    |||||||    
T  38663221 aaaaata 38663227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20495137 - 20494927
Alignment:
Q  91 gatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 189  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20495137 gatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatactatttttgagggacaaaatgctat 20495038  T
Q  190 tttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||                   ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20495037 tttggtattttagacaacttgtacgtggga-----------------cattggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 20494955  T
Q  290 gtcctgtacctgaaacagttttacaaat 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20494954 gtcctgtacctgaaacaattttacaaat 20494927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 131 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 50382608 - 50382363
Alignment:
Q  131 atttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgt 230  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50382608 atttttatggtattgaataatattttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttatttttgtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 50382509  T
Q  231 gctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg---cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgg 327  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| ||||| |||   ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  50382508 gttgtggtttggtgaaggacaaaaatttcagtttttgtcctgtccattgcctcctccagtttgttatgtccctgaaacagttttaaaaatcaaacactaa 50382409  T
Q  328 acaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaa 373  Q
    |||  |||||||||| |||  | ||||||||||| || ||||||||    
T  50382408 acatgtagagttgttttgtattctccttcattttataacaaatcaa 50382363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 7837149 - 7837350
Alignment:
Q  178 acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||| |||| |||||| | ||| |||||  | | ||||||||||||||||    
T  7837149 acaaaatactattttgatattttagacaacttgtctgtgagacaaaaagttgtgatgtgatttggtaatggacaaaaaattcaatttttgtcatgtccct 7837248  T
Q  278 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacg 376  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  7837249 tgcctctagtttgtcatgttcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgttctatcatatccttcatttttttagcaaatcaagcg 7837348  T
Q  377 ca 378  Q
    ||    
T  7837349 ca 7837350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 247
Target Start/End: Original strand, 34663821 - 34664012
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34663821 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacataaggtagaagagcacatgacaaattttttatgg 34663905  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||   |||||||||| ||||||||    
T  34663906 cattaagtaattttttgttttatatgatttttgagtgacaaaatgttattttgatattttagacaatttataagtgggtcaaaaagttgtgttgtggttt 34664005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Original strand, 8838986 - 8839113
Alignment:
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  8838986 aaaaatatcagtttttgtcatgtccatttcctccagtttgtcttgtaccagaaacagttttacaaatcaaacattggacaattggagttgttctgtcttg 8839085  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8839086 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 8839113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 322
Target Start/End: Original strand, 570281 - 570549
Alignment:
Q  57 tgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttttt 156  Q
    |||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||   |||||| || | |||||| |||| || |||||||||||| | ||| || ||||||    
T  570281 tgcaaaacagtaagtattagacaaaatagtacaagatagaacaacacaacataaagcagaacaacacaagataaatttttatggtactgaatactttttt 570380  T
Q  157 gttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc--tgtggtttggtgagggataaaa 254  Q
     | |||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  570381 atcttatacaatttttggtggaaaaaatgttattttgatattttagacaacttatacgcgagacaaaaagttgtgcattgtggtttggtgagggacaaaa 570480  T
Q  255 atatgagtttttgtcatgtccc-ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 322  Q
    || |  |||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  570481 atttctgtttttatcatgtccctttgcctccagtttatcttgtcgctgaaacaattttataaatcaaac 570549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25343431 - 25343213
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  25343431 agaacaacacaagacaaatttttatgacattgaataattttttgctttatgcgatttttgagggacgaaatactattttggatttttggacaacttgtac 25343332  T
Q  214 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc-cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 312  Q
    ||| ||  ||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||| |||||| || | |||  |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  25343331 gtgcgacaaaaagttgtactatggtttagtgaaggacaaaaatatgtgtttttatcctatccatttgcatccagtttgtcctgtatatgaaactgtttta 25343232  T
Q  313 caaatcaaacactggacaa 331  Q
     ||||||||| | ||||||    
T  25343231 taaatcaaacgcaggacaa 25343213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 378
Target Start/End: Original strand, 21071727 - 21071830
Alignment:
Q  275 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21071727 ccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattgaagttgttctgtcatgtacttcattctttagcaaatcaaa 21071826  T
Q  375 cgca 378  Q
    ||||    
T  21071827 cgca 21071830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 283 - 378
Target Start/End: Original strand, 38663228 - 38663323
Alignment:
Q  283 ccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38663228 ccagtttatcctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 38663323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 504625 - 504394
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||| ||  | |||||||||||  | |||||| |||| |||| |||||||    
T  504625 acaacacaaagtagaataacacatgtcaaatttttatggtattggacaatttttagtcctctacgatttttggtgaacaaaaagctactttggtatttta 504526  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    |||||||| || ||||||  |||| ||||| | |||||| ||||| || |||| | | |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||     
T  504525 gacaacttctatgtgggacaaaaaattgtgttatggtttagtgagagacaaaattttcagtttttgtgttgtcccttgcctcaagtttgtcttgtcccta 504426  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||    
T  504425 aaacaattttgcaaatcaaacgctgtacaact 504394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 380
Target Start/End: Original strand, 6771338 - 6771586
Alignment:
Q  133 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttg-agggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    |||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  6771338 ttttatggtattgaataatacttagtcttatacgatttttttatggacaaaatattattttgatattttagtcaacttgtatgtgggagaaaaagttgtg 6771437  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
     |||| ||| ||||| || || ||| | |||||||||| ||||||||| ||| | ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  6771438 ttgtgatttagtgagtgacaagaattttagtttttgtcttgtcccttgtctctaatttatcatgtccctaaaacagttttataaatcaaacaccgcacaa 6771537  T
Q  332 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaac 380  Q
     || | ||||  |||| ||||||||  ||||||||| || ||| |||||    
T  6771538 ataaaattgtcatgtcttgtccttctatttttagcagattaaatgcaac 6771586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 206
Target Start/End: Original strand, 8838827 - 8838987
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||   |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  8838827 ttggtttgcaaaacagtaaatactagacataactgtataagacagaacaacacaacacaagatagaaaaacacataacaaatttttatagcattgaataa 8838926  T
Q  151 -ttttttgtt----ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 206  Q
     |||||||||    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8838927 tttttttgttttaattatatgatttttgggggacgaaatgccattttgatattttagacaa 8838987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 302 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 40811405 - 40811322
Alignment:
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40811405 aaacagttttataaatcaaacgctggacaactaaagttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 40811322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 363
Target Start/End: Original strand, 7837474 - 7837575
Alignment:
Q  262 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttt 361  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||| |||||||||||    
T  7837474 tttttgtcatgtcccctgcctctagtttgtcatgttcctgaaacagttttataaatcaaacactgaacaactgaagttattctatcatatccttcatttt 7837573  T
Q  362 tt 363  Q
    ||    
T  7837574 tt 7837575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 383
Target Start/End: Original strand, 26733579 - 26733776
Alignment:
Q  186 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |   |||||||||| | |||||| ||| |||| || ||| | |||||||||||||||| | | ||| |    
T  26733579 ctattttggtattttagacaacttgtacatgaggcaaaaagttgtgttatggtttagtgggggacaagaatttcagtttttgtcatgtccatcgtctcta 26733678  T
Q  286 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||||| || |   ||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  26733679 gtttgtccggtcctaaaaacagttttacaaatcaaacatcgtacaactgaagttgtcatgtcttgttcttcattttttagcaagtcaaatgcacccta 26733776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 285
Target Start/End: Original strand, 46447665 - 46447787
Alignment:
Q  163 tacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||  |||   |||| |||||||| | |||    
T  46447665 tacgatttttgatggacaaaagactattttgatattttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtgatgtaatttaaggaggaataaaaattttagt 46447764  T
Q  263 ttttgtcatgtcccttgcctcca 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  46447765 ttttgtcaggtcccttgcctcca 46447787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 378
Target Start/End: Original strand, 39792826 - 39793022
Alignment:
Q  181 aaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgc 280  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||  |  | |||||||| ||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||| ||  |||     
T  39792826 aaatgttattttattattttagacaatttgtacgtgaaacaacaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaagaatttcaatttttgtcatatcttttgt 39792925  T
Q  281 ctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| ||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39792926 ctccaatttatcttgtccctaaaacagttttgcaaatcaaacactgtacaacctaagttgtcatttcatgtcctcca-tttttagcaaatcaaacgca 39793022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Original strand, 21071621 - 21071727
Alignment:
Q  54 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattt 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||     ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  21071621 gtttgtaaaacagtaagtactggactaaacagtacaagatagcac-----aacacaaggcagaacaatacatgacaaatttttattacattgaataattt 21071715  T
Q  154 tttgttttatac 165  Q
    ||||||||||||    
T  21071716 tttgttttatac 21071727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32468025 - 32467910
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||   | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  32468025 tttttatggtattgactaattttttgtcttatatgattttttgtgaacaaaaaactattttgatattgtagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtg 32467926  T
Q  232 ctgtggtttggtgagg 247  Q
    |  |||||| ||||||    
T  32467925 cgttggtttagtgagg 32467910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 384
Target Start/End: Original strand, 33316499 - 33316621
Alignment:
Q  262 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttt 361  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||| | |||   ||||||||||||    
T  33316499 tttttgttttgtctcttgcgtccagtttgttttgtccctgaaacagatttacagatcaaatactgtagaactagagttgctatgtatcgtccttcatttt 33316598  T
Q  362 ttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  33316599 ttagcagatcaaacgcatcctaa 33316621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34284040 - 34283912
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattt--tagacaacttgt 211  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  || |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||  || | |||||||    
T  34284040 agaacaacacaagacaaacttttatggtattgaataagtttttgccttgtacgattttttatggacaaaagactattttgatattttatatataacttgt 34283941  T
Q  212 acgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  34283940 acgtgagataaaaagttgtgttgtggttt 34283912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46815906 - 46815682
Alignment:
Q  159 tttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatat 258  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| | |||||| |||||||| ||   | |    
T  46815906 tttagacggtttttggcggacaaaatgttattttggtattttagacaactagtacgtgggaaaaaaggttgtgatatggtttagtgaggga-aatttttt 46815808  T
Q  259 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcat 358  Q
     ||||| ||| ||||||||||| ||   |||||| | |   ||||||| ||||||||| ||||| | | |  | ||||||| |  |||| ||||||||||    
T  46815807 tagtttgtgttatgtcccttgcgtctgatttgtcttatctttgaaacaattttacaaaccaaactccgtattattagagttatcatgtcttgtccttcat 46815708  T
Q  359 tttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||    
T  46815707 tttttagcagatcaaacgcaccctaa 46815682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2761770 - 2761551
Alignment:
Q  121 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggat 220  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||  |||||||  ||||||||| || |||||| || ||     
T  2761770 cacatgacagacttttatagtattgaataatttttggttttatatgatttttgttg-acaaaaatctatttttgtattttagataatttgtacttgagac 2761672  T
Q  221 gaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 320  Q
     |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  |  ||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||  |  ||||| |||||||||| ||    
T  2761671 aaaaaattgtgttgtggtttagtgagggatataaaattttgtttttgttttgtcccttgcctctagtttatcatgtcgcataaacaattttacaaattaa 2761572  T
Q  321 acactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||   |||||| |||||||    
T  2761571 acaccatacaacttgagttgt 2761551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 375
Target Start/End: Original strand, 17291612 - 17291791
Alignment:
Q  195 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 294  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||  ||||||| || |||||||| ||| |||| |||||| |  ||||||||| |||| |||| || ||  || ||||    
T  17291612 tattttatataacttgtacgagggacaaaaagttttgttgtggtttagtg-gggacaaaaatttatgtttttgtcctgtctcttgacttcaacttatcct 17291710  T
Q  295 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    || |   |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  17291711 gtcctaaaaacagttttacaaatcaaataccgtacaactggagttgtcctgtcatgttctcaattttttagcagatcaaac 17291791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23799670 - 23799603
Alignment:
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtca 270  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23799670 acaacttaaacgtgcgataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtca 23799603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Original strand, 15324109 - 15324201
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 206  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15324109 agaacaacacatgaaaagcttttatggtaataaataattttttgtcttatacgatgtttgatggacaaattactattttgatattttagacaa 15324201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47242743 - 47242477
Alignment:
Q  107 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 206  Q
    |||||| |||||  |||||||||||  |||| |  ||||| ||||||||  | |||||| |||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  47242743 acaaggcagaacgacacatgacaaacatttacgatattgaataatttttgatcttatacaattttt-atgtacaaaagactattttggtattttagacaa 47242645  T
Q  207 cttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaca 306  Q
    ||   ||||| ||  ||||||||| ||  | |||  |||| || |||||| | |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||| ||  |||||    
T  47242644 ctaacacgtgagacaaaaagttgtactaggttttaatgagagaaaaaaattt-agtttttgtcttgtcacctacctccagtttgtcatgtcccataaaca 47242546  T
Q  307 gttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
     |||||||||| ||||||   ||||||  ||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  47242545 attttacaaattaaacaccatacaactgaagttgtcatgtcatgtcatttattttttagcaaatgaaac 47242477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 375
Target Start/End: Original strand, 31574320 - 31574566
Alignment:
Q  129 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggac-aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagt 227  Q
    |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||  |||||||  ||||||| ||||||||||  | |||  | ||||    
T  31574320 aaatttttgtgatattgaataattttttgttttatgcgattttttgtagactaaaaaactatttttgtattttaaacaacttgtatataggacaataagt 31574419  T
Q  228 tgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgg 327  Q
    || | ||||  || ||||| |||| |||| | ||||||||||||||  |||  |||||||||||  |||   ||||| |||||||||||||||| | ||     
T  31574420 tgcgttgtgaattagtgagagatacaaattttagtttttgtcatgtttcttatctccagtttgttttgtttttgaaatagttttacaaatcaaa-attgt 31574518  T
Q  328 acaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  31574519 acaactgaagttgtcatgtcatgtgcttcatttcttagcagatcaaac 31574566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Original strand, 40610739 - 40610944
Alignment:
Q  179 caaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc-cct 277  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||||||| ||   |    
T  40610739 caaaatgttattttggtattttagacaacttatatatgtgataaaaagttgtgttgtggtttgatgagggagaagaat-tttgtttttgtcatatctttt 40610837  T
Q  278 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 377  Q
    ||||| || |||||||||   | | ||||||||||||||||||||| || | || | || ||||  | |||| | ||||||||||||  ||||||||| |    
T  40610838 tgccttcaatttgtcctgccgccggaacagttttacaaatcaaacattgtaaaatttgaattgtcatatcatatacttcattttttaataaatcaaacac 40610937  T
Q  378 aacctaa 384  Q
    | |||||    
T  40610938 accctaa 40610944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 378
Target Start/End: Original strand, 25539981 - 25540034
Alignment:
Q  325 tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25539981 tggacaactggagttgttctgtcctatccttcattttctagcaaatcaaacgca 25540034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 30105960 - 30105915
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30105960 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 30105915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23799603 - 23799531
Alignment:
Q  303 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||  | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23799603 aacagttttataaatcaaacactaaacaactgaaattgttgtgtcatgtcattcaatttttagcaaatcaaac 23799531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 26118494 - 26118450
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26118494 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 26118450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23799749 - 23799670
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaa 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  23799749 ttggtttacaaaacagtaagtactgtatagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaacacatgacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16643232 - 16643190
Alignment:
Q  336 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16643232 agttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 16643190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 49799322 - 49799424
Alignment:
Q  107 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 206  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| |||| ||| || |||| | |||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  49799322 acaagctagaacaccacaagacaaacttttatgatattgaataatatttggtcttattcaattttttatggacaaaagtctattttggtattttagacaa 49799421  T
Q  207 ctt 209  Q
    |||    
T  49799422 ctt 49799424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 192
Target Start/End: Original strand, 7836542 - 7836630
Alignment:
Q  104 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    |||| ||||||||| | ||||  |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  7836542 aacataaggtagaataacacagaacaagttattatgatattgaataattttttgttttatacgagttttggggcacaaaatgctttttt 7836630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16643361 - 16643272
Alignment:
Q  155 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgag 246  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||| |||||||||    
T  16643361 ttgttttatacgattttgg--ggacgaaatggtatttttgtattttagacaacctgtatgtgggacaaaaagttgtgtcgtgatttggtgag 16643272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 52030434 - 52030330
Alignment:
Q  107 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 206  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||| | |||||||||| |||| |||||||   ||||||||  |||||||  ||||||||| ||    
T  52030434 acaaggcataacagcacatggcaaacttttacggtattgaatcattttttgttatatatgattttttgtggacaaaaaactatttttgtattttagataa 52030335  T
Q  207 cttgt 211  Q
    |||||    
T  52030334 cttgt 52030330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 388
Target Start/End: Original strand, 7146859 - 7146986
Alignment:
Q  261 gtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattt 360  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||| ||||| | |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||| | ||||| | ||    
T  7146859 gtttttgttttgtcctttgtctctagtttattctgtcccaaaaacaattttacaaatcaaacactatacaactgaagttgttatgtcttatcctttaatt 7146958  T
Q  361 tttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 388  Q
    ||||||  ||||||| || |||||||||    
T  7146959 tttagctgatcaaacacaccctaagaat 7146986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8780690 - 8780601
Alignment:
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||| | |||||||| |||||| |||| | |||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  8780690 aaaaatttcagtttttggcatgtctcttgtccccagtttgttatgtccatgaaacagttttac-aatcaaacacagtacaactacagttgt 8780601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30798705 - 30798557
Alignment:
Q  222 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 321  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| || | | | |||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  30798705 aaaagttgtgatgtgggttagtgagggacaagactttcagtttt-gtcatgtcccctgcctccaatttgttatgtccctaaaacagtctttcaaatcaaa 30798607  T
Q  322 cactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaac 375  Q
    || || | || | ||||     |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30798606 cagtgtaaaattcgagt-----tgtcatgtccttcatttttttagcagatcaaac 30798557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 47093064 - 47093006
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  47093064 agaacaacacatgacaaatttttataatattgaataattttttgccttatacgattttt 47093006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30798900 - 30798824
Alignment:
Q  127 acaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttaga 203  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||| |  |||||||| |||||||||    
T  30798900 acaaaattttatgatattgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaacaaactattttggtattttaga 30798824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 325
Target Start/End: Original strand, 35335799 - 35335863
Alignment:
Q  261 gtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||  |||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  35335799 gtttttgtcatgtctcttgtctccattttgttatgtctctacaacagttttacaaatcaaacact 35335863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 39 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36769793 - 36769446
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-a 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  36769793 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttta 36769694  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36769693 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 36769594  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36769593 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 36769494  T
Q  338 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  36769493 ttgttctattctgtccttcattttttagcaaatcaaacacaccctaag 36769446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Original strand, 47953066 - 47953401
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 142  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47953066 ggtgtgtttgctctgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 47953165  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  47953166 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 47953265  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47953266 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 47953365  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47953366 ctgtcctgtcgttcattttttagcaaatcaaacgca 47953401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 40 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 10932780 - 10932434
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||    
T  10932780 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacacggcagaacagcataggacaaattttttat 10932681  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  10932680 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagt 10932581  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10932580 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagt 10932481  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10932480 tgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 10932434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3922923 - 3922587
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3922923 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaccagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 3922824  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3922823 attgagtatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 3922724  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3922723 gtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaataaaacactggacaactagagttgt 3922624  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3922623 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3922587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11322105 - 11321769
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11322105 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatcggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatggc 11322006  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11322005 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 11321906  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11321905 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccgttgcctccagtttgtcctgtacctgaatcagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 11321806  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11321805 tctgtcatgttcttcattttttagcaaatcaaacgca 11321769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26994444 - 26994109
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26994444 ggtgtgtttggtttgcaaaacagaaagtactggacagaacaggacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggca 26994345  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26994344 ttgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 26994245  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26994244 tgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 26994145  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26994144 ctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 26994109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 46 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 43158903 - 43158565
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  43158903 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagatagagcagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagtacaggacaaattttttatggcatt 43158804  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||     
T  43158803 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggta 43158704  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43158703 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 43158604  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43158603 gtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 43158565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 46633571 - 46633903
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  46633571 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacataatagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatgg 46633670  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46633671 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 46633770  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46633771 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcttg-----ttcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 46633865  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46633866 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 46633903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 46 - 378
Target Start/End: Original strand, 21784749 - 21785082
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcatt 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  21784749 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaatcttttatggcatt 21784848  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21784849 gagtaattttatgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 21784948  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21784949 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcatgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttct 21785048  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21785049 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 21785082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 40 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43189466 - 43189126
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||    
T  43189466 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaatagtgcatgacaaattttttat 43189367  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43189366 ggcattgagtaatttgttgtttcatacgatttttggggggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtgg 43189267  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43189266 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttacctccagtttgtcctgtacctgaaacatttttataaatcaaacactggacaactagag 43189167  T
Q  338 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43189166 ttgttttgtcatgtcctccattttttagcaaatcaaacgca 43189126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 39 - 384
Target Start/End: Original strand, 18386396 - 18386741
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-a 137  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  18386396 ctaagggtgagtttggtttgcaaaacagcaagtattggacaaaacggtacaaaatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatttttta 18386495  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18386496 tgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 18386595  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18386596 tttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaa 18386694  T
Q  338 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18386695 ttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacacaccctaa 18386741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 18470567 - 18470888
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18470567 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagta 18470666  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18470667 attttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagaga 18470766  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  18470767 caaaaatatgagtttttgtcctgt--cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactcgacaactagagttgttctatcct 18470864  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaa 373  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  18470865 gtccttcattttgtagcaaatcaa 18470888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 55 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26372017 - 26371693
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattt 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26372017 tttgaaaaacagtaagtactggacataacagtacaagatagaacagtacaacataaaacagaacatcacatgacaaattttttatggcattgaataattt 26371918  T
Q  154 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26371917 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaa 26371818  T
Q  254 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcc 353  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26371817 aatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttgcaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctatcc 26371718  T
Q  354 ttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26371717 ttcattttttagcaaatcaaacgca 26371693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 51 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41211413 - 41211086
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  41211413 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagta 41211314  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41211313 attttttgttttatacgattttttagggataaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 41211214  T
Q  249 ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtca 348  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  41211213 acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgggcaacttgagttgttctgtcc 41211114  T
Q  349 tgtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41211113 tgtccttcattttttagcaaatcaaacg 41211086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 45 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32873987 - 32873659
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32873987 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcat 32873888  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  32873887 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtatttcagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggt 32873788  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||     
T  32873787 gaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatccggtacctgaaacaattttacaaatcaaacaatggacaactaga---gttt 32873691  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32873690 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 32873659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 42 - 386
Target Start/End: Original strand, 43368076 - 43368420
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  43368076 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacatgacaaatttttatcac 43368175  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  43368176 attgaataattttttgttttatacgattttggagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttg 43368275  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
     ||||| | |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43368276 ctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcccgtctcttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 43368375  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 386  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43368376 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacggaccctaaga 43368420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 45 - 374
Target Start/End: Original strand, 1870011 - 1870342
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  1870011 gtgtgtttggtttgcaaaacagcatgtactgtacataacagtacaatatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgataaattttttatgacat 1870110  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttg-agggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  1870111 tgagtaattttttgttttatacgatttttttagggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 1870210  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1870211 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgtt 1870310  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1870311 ctgcactgtccttcattttttagcaaatcaaa 1870342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 40753044 - 40753366
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  40753044 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaagcagaacaacacaggacaaattttttatgg 40753128  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  40753129 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgattt 40753228  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40753229 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaacgagagttg 40753328  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40753329 ttctgtcatgtcccttattttttagcaaatcaaacgca 40753366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30849464 - 30849130
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  30849464 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacaacacaggacaatttttttatggcat 30849365  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  30849364 tgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttatacaacttgtatatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 30849265  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  30849264 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccaccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaatcattggacaactagaattgttc 30849165  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30849164 tgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 30849130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47316901 - 47316582
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||          |||    || |||||||||||||    
T  47316901 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacggtacaagatagaacagtacaacacaag----------aca----aattttttatggcatt 47316816  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  47316815 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtaatttagacaacttgcatgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 47316716  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47316715 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttattct 47316616  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47316615 gtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgca 47316582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 100 - 378
Target Start/End: Original strand, 29661255 - 29661533
Alignment:
Q  100 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 198  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29661255 gtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatagcattgagtaattttttgttttatacgatttttgtgggacaaaatgctattttggtatt 29661354  T
Q  199 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 298  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29661355 ttagataacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtac 29661454  T
Q  299 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661455 ctgaatcagttctacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatc-tatccttcattttttagcaaatcaaacgca 29661533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 51 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3892238 - 3891930
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3892238 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcatatgacaaattttttatggcattgagta 3892139  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3892138 attttttgttttacacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattctagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagaga 3892039  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  3892038 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcc----------------ttacaaatcaaacattggacaactagagttgttctgtcct 3891955  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3891954 gtccttcattttttagcaaatcaaa 3891930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 388
Target Start/End: Original strand, 9913400 - 9913745
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  9913400 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaatttttatgga 9913499  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  9913500 attgaataatttttagttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttg 9913599  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||| ||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9913600 gtgagcga-caaaatatcaatttttgtcctgtcccttgcctctagtttatcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgt 9913698  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  9913699 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcacccttagaat 9913745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 388
Target Start/End: Original strand, 9927088 - 9927433
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  9927088 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaatttttatgga 9927187  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  9927188 attgaataatttttagttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttg 9927287  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||| ||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9927288 gtgagcga-caaaatatcaatttttgtcctgtcccttgcctctagtttatcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgt 9927386  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  9927387 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcacccttagaat 9927433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 104 - 384
Target Start/End: Original strand, 11250558 - 11250834
Alignment:
Q  104 aacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 202  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11250558 aacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctagtttggtattttag 11250657  T
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 302  Q
    ||||||      |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250658 acaacta-----tgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgattttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 11250752  T
Q  303 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11250753 aacaattttacaaatgaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 11250834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 378
Target Start/End: Original strand, 48894591 - 48894928
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |    
T  48894591 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatatttgacataacagtacaagaccgaacagtacaacacaaggtaaaacagcactggacaattttttattg 48894690  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||  | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  48894691 cattgaataattttttgttttataagatttttgggggacaaaatgttattttggatttttagatgatttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 48894790  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
     ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48894791 agtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatccagtttgtactgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactggagttg 48894890  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48894891 ttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 48894928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34295615 - 34295295
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  34295615 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatgacattgaataa 34295516  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  34295515 ttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 34295416  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |     
T  34295415 aaaaatatcagtttttgt-------cttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtccta 34295323  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    || || |||||||||| |||||||||||    
T  34295322 tcttttattttttagctaatcaaacgca 34295295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Original strand, 329354 - 329687
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| | ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  329354 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacagcacaacacaaggcataacagtacatgacaaatttttatggtattgaataa 329453  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  329454 tttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtgttttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggac 329553  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac------tagagttgttct 344  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||      | |||||||| |    
T  329554 aaaaatttcagtttttgtcttgtcctttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacacgggacaactggagttggagttgtttt 329653  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  329654 gtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 329687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 132 - 378
Target Start/End: Original strand, 44748660 - 44748906
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  44748660 tttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgta 44748759  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748760 ttgtggtttggtgagggacaaaaatttgagtttttgttctgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 44748859  T
Q  332 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44748860 ctagagttgttttgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 44748906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 38301223 - 38301554
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||      ||||||||| |    
T  38301223 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaacacag-----atttttatgac 38301317  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  38301318 attgaataattttttgtttaatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgt-cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 38301416  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38301417 ctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattggagttgt 38301516  T
Q  342 tctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38301517 tctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 38301554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30599229 - 30598939
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||     
T  30599229 agggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatga 30599130  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  30599129 aattgagtaatttgttgttttatacgatttttaggggacaaaatgttattttggtattttagataatttgtacttgagacaaaaagttgtgttgtggttt 30599030  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30599029 gatgagggacaaaaatatgagcttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatgaaacagtggacaa 30598939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 68 - 374
Target Start/End: Original strand, 1363538 - 1363843
Alignment:
Q  68 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacga 167  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||   ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1363538 aagtactggacataacaatataagatagaacaacacatcagaaggtagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacaa 1363637  T
Q  168 tttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttg 267  Q
    |||||| || || ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  1363638 tttttg-ggtacgaaatgctatttttgtatttttgacaacctgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttgatgagggacaaaaatatcagcttttg 1363736  T
Q  268 tcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  1363737 tcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacatgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttgtcctatcctttattttttagca 1363836  T
Q  368 aatcaaa 374  Q
    |||||||    
T  1363837 aatcaaa 1363843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 384
Target Start/End: Original strand, 11822116 - 11822440
Alignment:
Q  52 tggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| |  |    
T  11822116 tggtttgcaaaacagtaagtactgaacataacagtataaaatagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggacaaatttttatggcattgaat--t 11822213  T
Q  152 tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggata 251  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||      ||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  11822214 ttttttttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttgaatttttaaacaac------gtgggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaaggaca 11822307  T
Q  252 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||    
T  11822308 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgtcctgtacctcaaacagttttacgaatcaaacactggacaagtgaagttgttctgtcctgt 11822407  T
Q  352 ccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11822408 cctttattttttagtaaatcaaacgcaccctaa 11822440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 43 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23349510 - 23349209
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23349510 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtaatggacataacagtacaagatagaacaaaacaacataaggtagaacagcacatgacaaatttttataaca 23349411  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  23349410 ttgaataattttttgttttctacgattgttgggggacgaaatgtcattttagtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 23349311  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  23349310 tgagggacaaaaatatcagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacttgaaatagttttacaattcaaacactggacaactggagtagtt 23349211  T
Q  343 ct 344  Q
    ||    
T  23349210 ct 23349209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 51 - 379
Target Start/End: Original strand, 20127171 - 20127501
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg----a 146  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| | |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    |    
T  20127171 ttggtttgcaaaacagtaagtac--gatagaacagtacaagacaaaacaacacaacacaagatagaacagcacatgacaaatttttgtagcattgaatta 20127268  T
Q  147 gtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgag 246  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  20127269 ttatttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgtcattttggtattttacacaaattgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttgctgag 20127368  T
Q  247 ggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgt 346  Q
    | | |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20127369 gaacaaaaatatcagcttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttaaaaatcaaacactggacaactggagttgttctgt 20127468  T
Q  347 catgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 379  Q
    | | || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20127469 cctatctttcatttattagcaaatcaaacgcaa 20127501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 102 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43214085 - 43213811
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||     
T  43214085 acaacacaaggtagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaatcattttttgttttataggatttttgaggcacgaaatgctattttggtattttt 43213986  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||       
T  43213985 gacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagcttttatcttgtcccttgccttcagtttgtcctgtactga 43213886  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43213885 aaacagttttacaaatcaaacactagacaactgaagttgttctgtcctgttcttcattttttagcaaatcaaacg 43213811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 375
Target Start/End: Original strand, 37966858 - 37967182
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||| | ||| | ||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||| ||| | |||    
T  37966858 ttggtttgcaaaatagtaagtactagacataataatataagacataacagcacaacacaaagcagaatagtacataacaaatttttatggtattaaataa 37966957  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||| | ||||  ||     
T  37966958 ttttttgttttatacgatttttttgggacgaaatgctattttggatttttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtgatgtggtctagtgaaagac 37967057  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  37967058 aaaaatatgggtttttgtcttgtcccttgcatccaatttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggagaactaaagttgttttgtcatg 37967157  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37967158 tccttcattttttagcaaatcaaac 37967182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 50 - 386
Target Start/End: Original strand, 48445404 - 48445740
Alignment:
Q  50 attggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||   | |||   ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48445404 attggtttgcaagacagtaagtactggacaaaacagtacaatgcataacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaatttttatggtattgaata 48445503  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| | | ||  ||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  48445504 atttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgttattttcgtgttttagacaacttgtatgcgagacaaaaagttgtcctgtgatttggtgaagga 48445603  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| |    
T  48445604 caaaaatttcagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgttctgtccctcaaacagttttacaaattaaacattggataactggagttgttctgtctt 48445703  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 386  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  48445704 ttccttcattttttaacaaattaaacgcaccctaaga 48445740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 126 - 383
Target Start/End: Original strand, 17237035 - 17237292
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||   ||||||| || ||||||||| ||  ||||    
T  17237035 gacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgagacaaaaa 17237134  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17237135 gttgtgttgtggtttagtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcatgttccttgcatccagtttgtactgtacctgaaataattttacaaatcaaacact 17237234  T
Q  326 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17237235 ggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 17237292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22724243 - 22723916
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||| || |||||||||||| ||   |||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||    
T  22724243 ttggtttgcaaaatagtaaataccggacaaaatagtataagataggacaacacaacataaggcagaacaacacaagataaatttttatggtattgaataa 22724144  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||     
T  22724143 ttttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttatacaacttgtacgtgggataaaaagttgcgttgtggtttggcgatggac 22724044  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    ||| ||   |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  22724043 aaacattgcagtttttgtcctgtcccttacctcgagtttgtccggtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcaca 22723944  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22723943 tccttcattttttatcaaatcaaacgca 22723916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22724739 - 22724429
Alignment:
Q  54 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattt 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||| |||| |||||| |||| || |||||||| ||| ||||| ||||||    
T  22724739 gtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaatatcacaacataaggcagaacaacacaagataaatttttctggtattgaataattt 22724640  T
Q  154 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 253  Q
    | ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22724639 tctgtattatatgatttttgggcgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgcgctgtggtttggtgagggacaaa 22724540  T
Q  254 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcc 353  Q
    |||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| | |||    
T  22724539 aattgcagcttttgtcatatcccttgcctccagtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacgctgaacaactggaattgttctgtcctatcc 22724440  T
Q  354 ttcatttttta 364  Q
    || | ||||||    
T  22724439 tttacttttta 22724429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26910624 - 26910295
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||   | |||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||    
T  26910624 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatataggataggacatcataacacaaggtagaacagcgcaagacaaatttt-atggtatt 26910526  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    || ||||||| || |||||  |||||||| | ||| || | |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| |    
T  26910525 gaataattttctgatttat--gatttttgggtgacgaattactatttttgtatttttgacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttggcg 26910428  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26910427 agggacaaaaattgcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgccctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactgtagttgttct 26910328  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  26910327 gtcatgtccttca-tttatatcaaatcaaacgca 26910295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 47947636 - 47947826
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 142  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47947636 ggtgtgtttgctctgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 47947735  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47947736 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgct 47947826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 296
Target Start/End: Original strand, 46408771 - 46409021
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||      |||||||||||    
T  46408771 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacat------tttttatggca 46408864  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  46408865 ttgagtaattttttattttatacgatttttgagagacaatatgctattttgatattttagacaacttgtatgtcggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 46408964  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc----cttgcctccagtttgtcctgt 296  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||    
T  46408965 tgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtccctttcttgtctccagtttgtcctgt 46409021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 362
Target Start/End: Original strand, 21133248 - 21133567
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||| |||| || |||| |||||   ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| ||| |||    
T  21133248 gtgtgtttggttggcaaaatagtaagtactatacataacaatacaagaaagaacatcacaacacaaggcagaacaacacagtacaaattttttatgacat 21133347  T
Q  144 tgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||      
T  21133348 tgagtaatttttttgttttatacgatttttgggagacgaaatgctattttggtattttagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttat 21133447  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||    
T  21133448 tgagggaaaataatatcagtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaattaaacattaaataactagagttgtt 21133547  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttt 362  Q
    || |||| ||||||||||||    
T  21133548 ctatcatttccttcattttt 21133567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 266
Target Start/End: Original strand, 26652750 - 26652965
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||| ||||||  |||||| | ||| |||||||||||| | ||| | |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||    
T  26652750 ttggtttgtaaaacatcaagtacagtacataacagtataagaaaaaacagcacaatacaagggagaacagcataggacaaatttttatgacattgaataa 26652849  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  26652850 ttttttgttttatacgatttttggcggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 26652949  T
Q  251 aaaaatatgagttttt 266  Q
    |||||||| |||||||    
T  26652950 aaaaatatcagttttt 26652965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 203 - 385
Target Start/End: Original strand, 16963174 - 16963356
Alignment:
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 302  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16963174 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtattgtggtttgataagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcctctagtttgtcatgtacctga 16963273  T
Q  303 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16963274 aacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgcaccctaag 16963356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 126 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 46448780 - 46448528
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||   ||||||| || || ||| |||||  ||||    
T  46448780 gacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttaggggacgaaatgttattttggatttttagataatttatacatgggacaaaaa 46448681  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46448680 gttgtgctgtggtttagtgacggacaaaaatatgagtttttatcatgtcccttgcatccagtttgtaccgtacctgaaacaattttacaaatcaaacact 46448581  T
Q  326 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
     |||||||  ||||||||| || |||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  46448580 agacaactgaagttgttctatcttgtcttctattttttaacaaatcaaacgca 46448528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 114 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15035401 - 15035135
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  15035401 agaacaacacatgacaaatttttatggtattgaataattttttgttttgtacgatttttggtgggcaaaatgttattttgatattttagacaatttgtat 15035302  T
Q  214 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacag--tttt 311  Q
    |||| |  |||||||||| |||||| |||||||| | || ||| | | |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | || | |||  ||||    
T  15035301 gtggtacaaaaagttgtgttgtggtctggtgaggaacaagaatttcaattttcgtcctgtcctttgcttccagtttgtcctgtccttggagcagtttttt 15035202  T
Q  312 acaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||||| || | || |||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15035201 acaaattaaacattgtataattagagttgtcatgtcatgtatttcattttttagcaaatcaaacgca 15035135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 34117399 - 34117581
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34117399 agaacaacacaagacaaatttttatggcattgaataatttttcgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggcattttagacaacttgtac 34117498  T
Q  214 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgta 297  Q
     ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  34117499 atggaacaaaaaattgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcatat-ccttgccttaagtttgtcctgta 34117581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 186 - 384
Target Start/End: Original strand, 34519527 - 34519725
Alignment:
Q  186 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 285  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  34519527 ctatttttgtattttagacaacttgtacctgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctcca 34519626  T
Q  286 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  34519627 gcttgtcatgtccctgaaactgttttacaattcgaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtcctttattttttattaaatcaaacgcaccctaa 34519725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 165
Target Start/End: Original strand, 12982178 - 12982301
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgac-aaatttttatggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12982178 gggtgtgtttggtttgcaaaagagcaagtactggagagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggc 12982277  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12982278 attgagtaattttttgttttatac 12982301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 51 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41665786 - 41665568
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||| || | |||||| || | | || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  41665786 ttggtttacaaaacagtaagtacggaacataacaatacaagataggacagcacaacataacgcataatagcacaagacaaatttttatggtattgaataa 41665687  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||| |||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||     
T  41665686 ttttctgttttatataatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggcgagggac 41665587  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtc 269  Q
    ||||||   ||||||||||    
T  41665586 aaaaattgcagtttttgtc 41665568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Original strand, 16962986 - 16963149
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |   | | ||| | ||      ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16962986 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaacacaaggcagaacagcgcat-----aacagcacatgacaaattttttatgg 16963080  T
Q  141 cattgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16963081 cattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaact 16963149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 262 - 378
Target Start/End: Original strand, 26700572 - 26700688
Alignment:
Q  262 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttt 361  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  26700572 tttttgtcctttctcttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttatacaaatcaaacactggacaactggaattgttatgtcatgtccttcatttt 26700671  T
Q  362 ttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||| |||||||||||||    
T  26700672 ttaccaaatcaaacgca 26700688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 22631609 - 22631853
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaa-----ggtagaacagcacatgacaaatttttat 138  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||   |||||||||     || |||||| ||||||||||||| |||     
T  22631609 ggtgtgtttcgtttgcaaaacaataagtattggacagaacagtacaagacataacaacacaacacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattattag 22631708  T
Q  139 ggcattgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
     ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||   |  ||||||| || |||||    
T  22631709 agcattaaataatttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatatcattttggtattttagacaacttgtacgtataacaaaaagttatgttgtgg 22631808  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 282  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  22631809 tttggtgaaggacaaaaatatcagttattgtcgcgtcccttgcct 22631853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Original strand, 46627135 - 46627259
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||  ||||||||||||   ||||||| ||  |||| |||||    
T  46627135 tttttatggcattgaataattttttgttttatacaatttttgggagacgaaatactatttttgtattttagacaatccgtacgtgagacaaaaaattgtg 46627234  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaat 256  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  46627235 ctgtggtttgatgagggataaaaat 46627259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21408745 - 21408526
Alignment:
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||   |||| |||  |||||||  ||||||||| ||||||||| ||  || ||||||| || ||||||||     
T  21408745 attgaataattttttatcttatacgatttttagtggacgaaaa-ctatttttgtattttagataacttgtacatgaaataaaaagttatgttgtggttta 21408647  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
     ||||||| |||  | |  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||    
T  21408646 atgagggacaaatgtttt-gtctttgtcatgtcccttgcctccagtttgtgttgtcccaaaaacagctttacaaatcaaatattgtacaactagagatgt 21408548  T
Q  342 tctgtcatgtccttcatttttt 363  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  21408547 catgtcatgtccttcatttttt 21408526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 269
Target Start/End: Original strand, 48699334 - 48699500
Alignment:
Q  103 caacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 202  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | | |||| || || ||||||||||   ||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  48699334 caacataaggcagaacagcacaagacaagcttttatggtattgaatgacttttggtcttgtacgattttttgtggacataagtctattttggtattttag 48699433  T
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtc 269  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||    
T  48699434 acaacttgtacgtggaacaaatagttgtgttgtggtttagtgagggacaagaatttcagtttttgtc 48699500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29456006 - 29455778
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| || ||||| |||||| | || |||||| ||||||||| |||||||    
T  29456006 acaacataaggcaaaacaacacatgacaaacttttatggtattgaataatatttggtcttatatgattttggtgg-acaaaacgctattttggtatttta 29455908  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
     |  ||| ||| ||||||  |||||||||| ||| |||  | || ||| || ||| | | ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||  |||    
T  29455907 ta--actagtatgtgggacaaaaagttgtgttgttgttaagcgaaggacaagaatttcactttttgttatgtcccttgcctccaatttctactgtctctg 29455810  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
    ||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  29455809 aaatagtgttacaaatcaaacattgcacaact 29455778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29372915 - 29372764
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||| |   |||    
T  29372915 gacaaacttttatggtattaaataatttttggtcttatatgatttttggtggataaaaggttaatttgaaattttagacaacttgtacatggaacagaaa 29372816  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 277  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  29372815 gttgtgttgtggtttagtgacggacaaaaattttagtttttgtcgtgtccct 29372764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41665573 - 41665485
Alignment:
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  41665573 tttgtcctgttcttgaaacagttttataattgaaacactggacaactggagttgttctgtcctatcctttattatttatcaaatcaaac 41665485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 249
Target Start/End: Original strand, 35645403 - 35645529
Alignment:
Q  123 catgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg-ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatg 221  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||| || ||||||| | |||||||||||| || | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||     
T  35645403 catgataaacttttatggtgttgggtcattttttatcttatacgattttggatgaa-aaaatgactattttattattttagacaacttgtacgtacgata 35645501  T
Q  222 aaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35645502 aaaagttgtgttgtggtttagtgaggga 35645529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 378
Target Start/End: Original strand, 41223320 - 41223398
Alignment:
Q  300 tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41223320 tgaaacagttttacaaatcaaacacggaacaatcggaattgttttatcatatccttcattttttagcatatcaaacgca 41223398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 323
Target Start/End: Original strand, 2048887 - 2049107
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |  ||||| |||   ||| |||| || |||||| |||||| | ||||||||  |||||||  ||||||     
T  2048887 acaacacaaggcagaacaacacatgataaactcgtatggtattacataagttttggtcttatacaattttttatggacaaaaa-ctatttttgtattttt 2048985  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
     | ||||| |||||||||  ||| ||| || |||||||| |||| ||| |||||| |   ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||      
T  2048986 tataacttctacgtgggacaaaatgttttgttgtggtttagtgatggacaaaaatttatatttttgttatgttccttgcctctagtttgtcccgtcccaa 2049085  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaaca 323  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
T  2049086 aaacaatttttcaaatcaaaca 2049107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3359837 - 3359773
Alignment:
Q  262 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 326  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3359837 tttttgtcatgtcccttacctctagtttatcttgtgccagaaacagttttacaaatcaaagactg 3359773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 92
Target Start/End: Original strand, 34117349 - 34117397
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataaga 92  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34117349 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaaga 34117397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 170
Target Start/End: Original strand, 47442769 - 47442840
Alignment:
Q  100 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgattt 170  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47442769 gtacaacataaggcagaacactacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacaattt 47442840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Original strand, 42332059 - 42332137
Alignment:
Q  167 atttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 245  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  42332059 atttttggtggataaaatgttattttgatatttaagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggtga 42332137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30260043 - 30259938
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| | | ||||   || ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||    
T  30260043 gacaaatttttatgatattgaataatttttgatcttatacgagttttgatgaataaaaaattaatttgatattttagacaacttgtaagtaagataaaaa 30259944  T
Q  226 gttgtg 231  Q
    ||||||    
T  30259943 gttgtg 30259938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16027918 - 16027823
Alignment:
Q  271 tgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagc 366  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||| |||||| || ||||||    
T  16027918 tgtccattgtctccaatttgtcttgtctttgaaacaattttacaaatcaaacactatacaactagagttatcttgtcatatccttcgttctttagc 16027823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 8453285 - 8453322
Alignment:
Q  177 gacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8453285 gacaaaatgttattttgatattttagacaatttgtacg 8453322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 79
Target Start/End: Original strand, 17237005 - 17237038
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggaca 79  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17237005 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggaca 17237038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29992813 - 29992741
Alignment:
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 216  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29992813 ttgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaaattattttg-tattttagataacttgtacgtg 29992741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 185
Target Start/End: Original strand, 8453204 - 8453260
Alignment:
Q  129 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg 185  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  8453204 aaatttttatggtattgaatatttgtttgtcttatacgatttttaagagacaaaatg 8453260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41903667 - 41903603
Alignment:
Q  149 aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  41903667 aattttttgttttatatgatgtttggtggacaaaagactattttagtattttagacaatttgtac 41903603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 51259994 - 51259657
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatgg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  51259994 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaaatttttatgg 51259895  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  51259894 cattgagtaattttttgttttatatgatttttaagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtggttt 51259795  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51259794 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 51259695  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51259694 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 51259657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 28675661 - 28675998
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  28675661 agggtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatgg 28675760  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  28675761 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 28675860  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28675861 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattg 28675960  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28675961 ttctgtcctgttcttcattttttaacaaatcaaacgca 28675998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 40 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1344923 - 1344587
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||    
T  1344923 taagggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacatcacatgacaatttttttat 1344824  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  1344823 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggt 1344724  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1344723 ttggtgagggacaaaaatatgagtttctgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 1344624  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1344623 tgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 1344587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12349376 - 12349048
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12349376 ttggtttgcaaaagagcaagtattggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagta 12349277  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12349276 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgtgctgtggtttggtgagaga 12349177  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  12349176 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtcct 12349077  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12349076 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 12349048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Original strand, 2134944 - 2135278
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  2134944 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacgttacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcat 2135043  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2135044 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaagtgctattttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 2135143  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2135144 gagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 2135243  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2135244 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2135278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Original strand, 29584749 - 29585083
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||| || ||||    
T  29584749 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagtacagaacaaattttttattgcat 29584848  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  29584849 tgagtaattttttattttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 29584948  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584949 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 29585048  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29585049 tgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 29585083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 31883234 - 31882894
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  31883234 gggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacaacacaggacaaatttttatgaca 31883135  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  31883134 ttgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgc 31883035  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31883034 tgaggcacaaaaatatcagtttttgtcgtgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgtt 31882935  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31882934 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 31882894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 46 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21221570 - 21221238
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 144  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21221570 tgtgtttggtttgcaatacagcaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatggcatt 21221471  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21221470 gagtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 21221371  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21221370 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccag-ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatattggacaactagagttgttct 21221272  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21221271 gtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 21221238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 42 - 375
Target Start/End: Original strand, 24571153 - 24571486
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24571153 agggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacaga-cactataagatagaacaatacaacataaggcagaacagtacatgacaaattttttatgg 24571251  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24571252 cattgagtaatttgttgttttattcgatttttgggggacaaaatcctatttttgtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggttt 24571351  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24571352 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 24571451  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24571452 ttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 24571486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 53558009 - 53557676
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53558009 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacaatacaaggtataacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 53557910  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  53557909 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgcagtggttt 53557810  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53557809 ggtgagggacaaaactatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacattgaacaactagagttg 53557710  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  53557709 ctctgtcatatcctttattttttagcaaatcaaa 53557676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47958643 - 47958309
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||| ||| |||    
T  47958643 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagatagaacactacaatacaaggcagaacagcatagaacaaattttttatgtcat 47958544  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  47958543 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagtttggt 47958444  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47958443 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttttcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 47958344  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    | |  ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  47958343 tatactgtccatcgttttttagcaaatcaaacgca 47958309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 37 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39053058 - 39052715
Alignment:
Q  37 gtctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt 136  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39053058 gtcttagggtgtgtttggtttgcaaaatagtaaatgctgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagatagaacaacacatgacaaattttt 39052959  T
Q  137 --atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctg 234  Q
      || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  39052958 ttatagcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttg 39052859  T
Q  235 tggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 334  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39052858 tggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtcctgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaacta 39052759  T
Q  335 gagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39052758 gagttgttttgtcttgtctttcattttttagcaaatcaaacgca 39052715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 79 - 378
Target Start/End: Original strand, 40094411 - 40094711
Alignment:
Q  79 agaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg 177  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40094411 agaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatgcgatttttgaggg 40094510  T
Q  178 acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 277  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  40094511 acaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgaaacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccct 40094610  T
Q  278 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 377  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40094611 tgcctccagtttgttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 40094710  T
Q  378 a 378  Q
    |    
T  40094711 a 40094711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 45 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25860632 - 25860312
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||     
T  25860632 gtgtgtttggtttgcaaaacggtaagcactggacagaacagtacaagatagaacagcacaacaaaaggcataacaacacaggacaaattttttatggcaa 25860533  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  25860532 tgagtaattttttgttttatacgatttttggagaacaaaatgctatttcggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggt 25860433  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25860432 gagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 25860333  T
Q  344 tgtcatgtccttcatttttta 364  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  25860332 tgtcaagtccttcatttttta 25860312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 378
Target Start/End: Original strand, 44116859 - 44117147
Alignment:
Q  91 gatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 189  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116859 gatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 44116958  T
Q  190 tttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 289  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44116959 ttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 44117058  T
Q  290 gtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44117059 gtcctgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtccagtccttcattttttagcaaatcaaacgca 44117147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25927533 - 25927204
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaa-cagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagt 148  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25927533 ttggtttgcaaaaacaacaagtaccggacaaaacagtataagatagaacagtacaatacaaggtagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagt 25927434  T
Q  149 aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  25927433 gattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgttttggtaaggg 25927334  T
Q  249 ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtca 348  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  25927333 acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtatttgaaacagttttacaaatcaaacattagacaactagagttgttctgtcc 25927234  T
Q  349 tgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25927233 tgtccatcattttttagcaaatcaaacgca 25927204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 38 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4851674 - 4851340
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt- 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||     
T  4851674 tctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtaccggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaagacaggacaaatttttt 4851575  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4851574 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 4851475  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 336  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4851474 ggttggtgagggacaaaa--atgagtttttgtcctgtcccttgcctccaaattgtcttgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 4851377  T
Q  337 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4851376 gttgttc-----tgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 4851340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 43 - 370
Target Start/End: Original strand, 34026554 - 34026867
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  34026554 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggt 34026638  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  34026639 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttg 34026738  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34026739 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaaatagagttgt 34026838  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaat 370  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34026839 tctgtcctgtccttcattttttagcaaat 34026867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 51 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3864879 - 3864548
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| || | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3864879 ttggtttgcaaaacagtaagtactgcacagaacagtacaagatagaacattacaacataacgcataacagcacaggacaaattttttatggcattgagta 3864780  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3864779 attttttgttttatatgatttttg-gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgaggga 3864681  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  3864680 caaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactaaagttgttctgtcct 3864581  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3864580 gtc--tcattttttagcaaatgaaacgcaccctaa 3864548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50386660 - 50386333
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || | ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  50386660 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaaaaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatcacattgaataa 50386561  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |     
T  50386560 ttttttgttttatacaatttttggggaacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttgttgaggcac 50386461  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  50386460 aaaaatatcaatttttgtcatgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactggagttgttctgtcctg 50386361  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50386360 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 50386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 100 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 42636559 - 42636273
Alignment:
Q  100 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42636559 gtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttaaacgatttttgagggacaaaatgttattttggtatt 42636460  T
Q  199 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 298  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  42636459 ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgtcctatac 42636360  T
Q  299 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42636359 ctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcaccctaag 42636273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 51925422 - 51925085
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 140  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51925422 aagggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggatataacagtacaagacataacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttatgg 51925323  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  51925322 cattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattaaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 51925223  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51925222 ggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactggagttg 51925123  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51925122 ttctgtcctatccttcattttctagcaaatcaaacgca 51925085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 40 - 385
Target Start/End: Original strand, 5442160 - 5442494
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  5442160 taagggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtactggacagaacagtacaatttagaacagtacaatacaaggtataacaacacatgacaaattttttat 5442259  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  5442260 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggataaaatgctattttgatattttagacagcttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgat 5442359  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| |||||            || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5442360 ttggtgagggacaaaaa-----------ctc-tgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagctttacaaatcaaacactggacaactagagt 5442447  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5442448 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 5442494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20609846 - 20609544
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  20609846 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgac 20609762  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20609761 attgagtaattttttgttatatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 20609662  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20609661 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccaccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 20609562  T
Q  342 tctgtcatgtccttcatt 359  Q
    |||||| |||||||||||    
T  20609561 tctgtcctgtccttcatt 20609544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 132 - 378
Target Start/End: Original strand, 20255007 - 20255252
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||    
T  20255007 tttttatggcattgagtaattttttgttttataagatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta-gtgggacaagaagttgtg 20255105  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20255106 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 20255205  T
Q  332 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20255206 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 20255252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 40 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33364993 - 33364655
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| ||||  | |||| |||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  33364993 taagggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaatagcacaatacaagagagaacaacccaggacaaatttttatg 33364894  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  33364893 acattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtt 33364794  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    || ||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  33364793 tgctgaggggcaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaataaaacactggacaactgaagtt 33364694  T
Q  340 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33364693 gttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 33364655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Original strand, 38213227 - 38213562
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||   | ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38213227 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattgtacagaacagtacaagacaaaacaacataacattaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 38213326  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |    
T  38213327 atgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatggtattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttcg 38213426  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38213427 tgagtgacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagattgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 38213526  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    || || |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38213527 ctatcctgtctttcattttttagcaaataaaacgca 38213562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22484954 - 22484614
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22484954 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtataagataggacaacacaacataaggtagaacagcacaagacaaatttttatggtat 22484855  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||| ||||||| ||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||     
T  22484854 tgaataattttctgtattatataatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggc 22484755  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
     ||| | ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22484754 aaggaacaaaaattgtagcttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcatgtccctgaaactgttttacaaatcaatcactggacaattggagttgttc 22484655  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22484654 tgtcctgtccttcattttttatcaaatcaaacgcaccctaa 22484614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3867848 - 3867526
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||   |||||||     ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  3867848 ttggtttgcaaaacagtaagtactgaacataacagtacaatgcagaacgg-----cacaaggcataacaacacatgacaagtttttatggtattgaataa 3867754  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3867753 tttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtgttttagaaaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 3867654  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||| | || |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  3867653 aaaaatttcaggttttgtcatgtctcttgtctccagtatgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgttctgtcttg 3867554  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3867553 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 3867526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 43 - 375
Target Start/End: Original strand, 21373812 - 21374135
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||         |||| |||||||||||||||||    
T  21373812 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacaatacaagacagaacagcacaacacaaga--------cacaggacaaatttttatggca 21373903  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||   ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  21373904 ttgaataattttta-ttttatacgatttttggccgaagaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 21374002  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  21374003 tgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactgaagttgtt 21374102  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  21374103 atgtcattttcttcattttttagcaaaccaaac 21374135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 44 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26282599 - 26282315
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26282599 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagcacatgacaaattttttatggca 26282500  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  26282499 ttgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttga 26282400  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga---aacagttttacaaatcaaacac 324  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |   || |||||||||||||||||||    
T  26282399 tgagagacaaaaatataagtttttgtcccgtctcttacctccagtttgtcttgtaccttaaataatagttttacaaatcaaacac 26282315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 374
Target Start/End: Original strand, 29645946 - 29646270
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| || |||| | |||   |||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  29645946 ttggtttgcaaaataacaagtattggacagaacaatacaagacaaaacaacacaacataaggtataacatcacaagacaaatttttatggcattaaataa 29646045  T
Q  151 tttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29646046 tttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggga 29646145  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |    
T  29646146 caaaaatatatgtttttgtcctatcccttgcctccagtttatcgtgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggaattgttttgtctt 29646245  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  29646246 gtccttcattttttagaaaatcaaa 29646270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 126 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54622925 - 54622678
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54622925 gacaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaa 54622826  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  54622825 gttgtgttgtggtttcgtgagcgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatttagtttgt-cagtacctgaaacagttttacaaatcaaatacc 54622727  T
Q  326 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54622726 ggacaactgaagttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 54622678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 379
Target Start/End: Original strand, 3964173 - 3964497
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattt 153  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| |  ||   |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  3964173 tttgcaaaacagtaagtacttgatagaacagcacaagacaacacaacacaatacaaggcagaacagcacaagacaaattttgtatgatattgaataattt 3964272  T
Q  154 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 253  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3964273 tatgttttatatgatttttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaa 3964371  T
Q  254 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcc 353  Q
    ||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||    
T  3964372 aatttcagtttttgtccagttccttgcctccaatttgtcatgtccatgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctatcc 3964471  T
Q  354 ttcattttttagcaaatcaaacgcaa 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3964472 ttcattttttatcaaatcaaacgcaa 3964497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 141 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49749025 - 49748788
Alignment:
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  49749025 cattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtatttaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 49748926  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  49748925 ggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactaaacaacttgagttg 49748826  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49748825 ttctatcctatccttcattttctagcaaatcaaacgca 49748788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 133 - 378
Target Start/End: Original strand, 51296544 - 51296787
Alignment:
Q  133 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  |||| |||||     
T  51296544 ttttatggtattgagtaattttttgttttatacgattttttggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttaggacaaaaaattgtgt 51296643  T
Q  233 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  51296644 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaat 51296743  T
Q  333 tagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||  |||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  51296744 tagagttgttctgttctgtcttt--atttttagcaaatcaaacgca 51296787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 43 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 45691112 - 45690778
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||   |||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  45691112 gggtgtgtttgatttacaaaacactaagtactggatagaacagtacaagacagaacaacacaatataagatagaataacacatgacaaatttttatagca 45691013  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||        
T  45691012 ttgaataattttt-gttttatacgatttttggaggacgaaatgcgattttggtattttagacaacttatgcgtgagacaaaaagttgtgctgtggt---- 45690918  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
     |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45690917 -gagggagaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccaatttatcctgtacctgaaacagttttgcaaatcaaacactggacaactgaagttgtt 45690819  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    || || ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  45690818 ctatcctgtccttcactttatagcaaatcaaacgcacccta 45690778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Original strand, 50678677 - 50679006
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||  | |||||| |||||| || | | || |||||||||||||   ||||| | |    
T  50678677 ttggtttacgaaaccgtaagtactagacataacaatataagatagaatagcacaacataaggtataatatcgcaagacaaatttttatattattgaatta 50678776  T
Q  151 --ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 248  Q
      |||||||||||||| ||||| || || |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |    
T  50678777 ttttttttgttttataggatttatgtggaatgaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagag 50678876  T
Q  249 ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtca 348  Q
    | |||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||     
T  50678877 acaaaaatatcagtttttgtcctgttctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttttcaaatcaaacactggacaacttgaattgttatgtct 50678976  T
Q  349 tgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50678977 tgtacttcattttttagcaaatcaaacgca 50679006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3695449 - 3695184
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg 193  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  3695449 agaacagtacaacacaaggcagaacaggaca----aattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacaatttttgggggataaaatactattttg 3695354  T
Q  194 atattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcc 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||               |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  3695353 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaggttgtgatgtggtttggtgag---------------tttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtca 3695269  T
Q  294 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3695268 tgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3695184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 376
Target Start/End: Original strand, 10747088 - 10747406
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 140  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||| | | | ||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  10747088 aagggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtataaaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatga 10747187  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgattttt-gagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||    
T  10747188 cattgaataattttttgttttatacgatttttggggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg------------------tgtggtt 10747269  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    || ||| | | |||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  10747270 tgctgacgaacaaaaatatcagtttttgtcctatctcttgtctccagtttgtcctgtacctaaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactgaaatt 10747369  T
Q  340 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10747370 gttttgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacg 10747406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 175 - 379
Target Start/End: Original strand, 19906767 - 19906971
Alignment:
Q  175 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  19906767 gggacgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtc 19906866  T
Q  275 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||     
T  19906867 ccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttatcctgtccttcattttttaacaaatcaat 19906966  T
Q  375 cgcaa 379  Q
    |||||    
T  19906967 cgcaa 19906971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 149 - 378
Target Start/End: Original strand, 24721463 - 24721693
Alignment:
Q  149 aattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 247  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| ||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  24721463 aatttcttgttttatatgctttttggggggatgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttgttgagg 24721562  T
Q  248 gataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 347  Q
     |  ||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24721563 taccaaaattttagtttttgtcctgtcctttacctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtc 24721662  T
Q  348 atgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24721663 atgtccttcattttttaacaaattaaacgca 24721693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 233 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41683075 - 41682930
Alignment:
Q  233 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 332  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683075 tgtggtttgctgagggacaaaagtatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 41682976  T
Q  333 tagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41682975 tgaagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 41682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 53046846 - 53046667
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  53046846 ttggtttgcaaaacaacaagtactgaacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaattttttatggcattgagta 53046747  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||  |||||||||||||    
T  53046746 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgctg 53046667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 186
Target Start/End: Original strand, 43175436 - 43175585
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-ttttt 136  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||  ||||||||||| || ||| |||||    
T  43175436 tctatgggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtataatacaagacagaacagcacacgataaatttttt 43175535  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43175536 atggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 43175585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 383
Target Start/End: Original strand, 6179376 - 6179639
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||| |||||||  | ||| ||||| ||||||  |||||||||||       |    
T  6179376 agaacaacacaagacgaatttttatggtattgaataattttctttattatatgattttttggtgacgaaatgttatttttgtattttagaca-------c 6179468  T
Q  214 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg-ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 312  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  6179469 gtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttggcgaggggacaaaaattacagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgacctgtttctgaaactgtttta 6179568  T
Q  313 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  6179569 caaatcaaacactggacaactggagttgttttatcctgtccttcattttttataaaatcaaacgcacccta 6179639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 372
Target Start/End: Original strand, 44000217 - 44000462
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||  ||||    
T  44000217 gacaaacttttatggtattgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaaactatttttgtatttcagataacttgtacgtgggacaaaaa 44000316  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
     ||||| |||||||| |||||||| |||||  |  ||||||||||||||| ||||||  ||||| || | | ||  |||||||||||||||| ||||||     
T  44000317 attgtgatgtggtttagtgagggaaaaaaaattctgtttttgtcatgtcctttgccttgagtttatcatttcccaaaaacagttttacaaatgaaacacg 44000416  T
Q  326 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatca 372  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44000417 gtacaactagagttgtcatgtcatgtcattca-tttttagcaaatca 44000462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 375
Target Start/End: Original strand, 44267691 - 44267941
Alignment:
Q  119 agcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggg 218  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  44267691 agcacaagacaaatttttatcgtattcaataattttttgttttatatgatttttggatgacgaaatgctatttttgtattttagacaatttgtatgtggg 44267790  T
Q  219 atgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatc 318  Q
    || ||||||| || |||||||||| |||||| |     || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||| ||||||||||||    
T  44267791 ataaaaagttatgttgtggtttggcgagggaca-----attattttttgtcatgtcccttacctacagtttgtcatat-cctaaaactgttttacaaatc 44267884  T
Q  319 aaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||  | ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44267885 aaacatcgaacaactgaagttgttcgatcatgtccttcattttttatcaaataaaac 44267941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 284 - 383
Target Start/End: Original strand, 43175589 - 43175688
Alignment:
Q  284 cagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43175589 cagtttgtcctatacctgaaatagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 43175688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 364
Target Start/End: Original strand, 52300439 - 52300633
Alignment:
Q  172 tgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcat 271  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| |    
T  52300439 tgagggacgaaatgatattttggtgttttagacaacttgtac-tgggacaaaaaattgcgttgtggtttggtgatggacaaaaatttcagtttttgtcct 52300537  T
Q  272 gtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag---agttgttctgtcatgtccttcatttttta 364  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52300538 gtcccttacctgcagtttgtcccgtctctgaaacagttttatgaatcaaacattggacaacaaccgaagttgttctgtcatgtccttcatttttta 52300633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34351514 - 34351303
Alignment:
Q  109 aaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 208  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||| | || || ||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34351514 aaggcagaacaacatatgacgaatttttatagtattgaataatttatggtcttgtacgattttttgtggataaaatgttattttgatattttagacaact 34351415  T
Q  209 tgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagt 308  Q
    |||| ||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||||| ||||  || |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  34351414 tgtatgtgcgacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaataatttttgtttttgtcgtgtctatttcctctagtttgtcatgtccctgaaacagt 34351315  T
Q  309 tttacaaatcaa 320  Q
    ||||||||||||    
T  34351314 tttacaaatcaa 34351303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41695042 - 41694925
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  41695042 agaacagcacagaacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctatttcagtattttagacaacttgtat 41694943  T
Q  214 gtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  41694942 gtgggacaaaaagttgtg 41694925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 39215547 - 39215404
Alignment:
Q  177 gacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccc 276  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || || | ||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  39215547 gacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattatgatttggttcggtaaggggtaaaaatttcagtttttgtcttgtccc 39215448  T
Q  277 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 320  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39215447 ttacctccggtttgtcctgttcttgaaacagttttacaaatcaa 39215404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 274
Target Start/End: Original strand, 25954407 - 25954554
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||| ||||||| || ||| ||  ||||    
T  25954407 gacaaatttttatgatattgaataattttttattttatacgctttttg-gggacgaaatgttatattagtattttaaacaacttatatgtgagacaaaaa 25954505  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
    ||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  25954506 gttgtgctgtaatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcgtgtc 25954554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 378
Target Start/End: Original strand, 8253640 - 8253881
Alignment:
Q  136 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||   || |||||||  ||    
T  8253640 tatggtattgattaatttttaatcttatacaatttttgatgaataaaatgttattttggtattttagacaacttttaattggggcaaagagttgtgtcgt 8253739  T
Q  236 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 335  Q
    ||||| || || || || ||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||| |||| |  ||||||||    
T  8253740 ggtttagt-agagacaagaacttcagtttttatcatgttccttgactccagtttgtcttgtccttgaaacaactttacaaatcgaacattatacaactag 8253838  T
Q  336 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8253839 agttgtcttgtcttatccttcattttttagtagatcaaacgca 8253881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 53046668 - 53046605
Alignment:
Q  258 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 321  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53046668 tgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaa 53046605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8067210 - 8066939
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||  ||| || ||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||  | ||||| ||||| |   |||||||| |||||||||||||||||    
T  8067210 acaacacaagacagaccaacacatgacatacttttatggtattgaatgatttttgatcttatatgatttctagtggacaaaaagctattttgatatttta 8067111  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
     | |||||||||||| ||  ||||||||| || || ||| |||| ||| | |||| | |  ||||||| |||| | |||||| |  ||||  ||| ||||    
T  8067110 tataacttgtacgtgtgacaaaaagttgtactatgattttgtgaaggacacaaatttta-attttgtcttgtcacctgcctcaatcttgttttgtccctg 8067012  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    ||||| ||||||||||||||  | | | |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  8067011 aaacaattttacaaatcaaatgcggtataactagtgttgttatgtcttgtccctcattttttaacagatcaaa 8066939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 374
Target Start/End: Original strand, 25395570 - 25395818
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    |||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||| ||||    
T  25395570 gacaaacttttatgacattgcattattttttgttttatacgatttttagtgaacaaaatgttattttggtattttagacaacttatatttaggataaaaa 25395669  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 324  Q
    ||||   | ||||||  ||||||| || ||| | |||||||||| | |  |||| || |||  ||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||      
T  25395670 gttgcattttggtttaatgagggacaagaatttcagtttttgtcttatgtcttgccccccaacttgtcatgtccctaaaacagttttac-aataaaacga 25395768  T
Q  325 tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    || |||||| |||||||| | ||||||  || |||| |||||||||||||    
T  25395769 tgtacaactggagttgttatatcatgtgatttatttcttagcaaatcaaa 25395818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 375
Target Start/End: Original strand, 26847351 - 26847532
Alignment:
Q  195 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcc 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||| |||  | ||||| |  ||| | |||||||||| |||| |||||||||| |||||      
T  26847351 tattttagacaacttgtatgtgggacaaaaaagttttgttgtgattttataagggacatgaatttcagtttttgtcctgtctcttgcctccaatttgtta 26847450  T
Q  294 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    | |  || |||||||||||||||| |||||||  |||| | |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26847451 tatcacttaaacagttttacaaattaaacactatacaagtggagttgtcatgtcatatgcttcattttttagcaaatcaaac 26847532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 42035824 - 42035652
Alignment:
Q  109 aaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 208  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||||| || |||   |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  42035824 aaggtagaacaacacttgacaaacttttatggtattgaacaattttttctcttatactatgttttgtggacaaaatgctgttttgctattttacacaact 42035725  T
Q  209 tgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 281  Q
    ||||| |||| ||  ||||||   |||||||| ||||  || || ||| | |||||||||  |||||||||||    
T  42035724 tgtacttgggttgccaagttgcattgtggtttagtgaaagacaagaatttcagtttttgttgtgtcccttgcc 42035652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14155528 - 14155438
Alignment:
Q  187 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccctt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| | || ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  14155528 tattttgatattttagacaacttgtacttgagacaaaaagttgtgttatgatttagtgagggat-aaaatttcagtttttgtcatgtccctt 14155438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 219
Target Start/End: Original strand, 32621828 - 32621918
Alignment:
Q  129 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga 219  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32621828 aaattgttatgctattgaataattttttgttgtatacaatttttgatggacaacatattattttggtattttagacaacttgtacatggga 32621918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 331
Target Start/End: Original strand, 32768588 - 32768755
Alignment:
Q  166 gatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttt 265  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||||  |||||||||||| | |||  ||| | | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | | ||||    
T  32768588 gatttttgggtgacaaaaggttattttagtattttagacaaatagtaattggaacggaaagttgtgatgtggtttagtgagggacaataatttcaatttt 32768687  T
Q  266 tgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctg--tacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
    ||||||||| ||||| |   ||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32768688 tgtcatgtctcttgctttttgtttgtcatgtctccctgaaacaattttacaaatcaaacactgtacaa 32768755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17264822 - 17264606
Alignment:
Q  104 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagg--gacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| ||  || |||||| ||||||| ||  |||||||  |||||||  |||||||    
T  17264822 aacataaggtagatcagcacaagacaaaattttatggtactgaataatgtt--gtcttatacaatttttgtggtcgacaaaaa-ctatttttgtatttta 17264726  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
     |||||||||||||||||  |||  || |  |||||||| |||| |||||| ||| | || |||||||||||  ||||| ||| ||||||  |||   ||    
T  17264725 cacaacttgtacgtgggacaaaatttttttatgtggtttagtgaaggataataatttcagcttttgtcatgtatcttgcttcctgtttgttatgtttttg 17264626  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaa 321  Q
     |||||||||||||||||||    
T  17264625 taacagttttacaaatcaaa 17264606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 363
Target Start/End: Original strand, 30258962 - 30259065
Alignment:
Q  260 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 359  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||   ||| |||||||||||    
T  30258962 agtttttgtcttgcccattgcctcgagtttatcctgtctttgaaacaattttacaaatcaaacattgtataactagggttgtcgcgtcttgtccttcatt 30259061  T
Q  360 tttt 363  Q
    ||||    
T  30259062 tttt 30259065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 87
Target Start/End: Original strand, 20254945 - 20254991
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20254945 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagta 20254991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 245
Target Start/End: Original strand, 23322158 - 23322216
Alignment:
Q  187 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23322158 tattttgatatattagacaacttgtacgagagataaaaagttgtgttgtggtttagtga 23322216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41538225 - 41538131
Alignment:
Q  119 agcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta-ttttgatattttagacaacttgta 212  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||| | ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  41538225 agcacatgataaacttttatgatattgaatgatttttgattttatacgattttttatggacaaaatactatttttgacattttaaacaacttgta 41538131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 54964095 - 54963985
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| || | ||| || ||||  ||||||||||||||     
T  54964095 agggtatgtttggtttgcaaaatagtacgtactggacataacagtataagataggacaccataacataaagcagagcaacacaaaacaaatttttatggt 54963996  T
Q  142 attgagtaatt 152  Q
    ||||| |||||    
T  54963995 attgaataatt 54963985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 3695485 - 3695441
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3695485 gggtgtgtttggtttgcaaaaatgtaagtactggacagaacagta 3695441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28625060 - 28625001
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttg 173  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28625060 agaacaacacaagacaaacttttatggtattgaataattttttgtcttataagatttttg 28625001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 53046560 - 53046517
Alignment:
Q  258 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53046560 tgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctatacctg 53046517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8165883 - 8165833
Alignment:
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  8165883 ttttttgttttatactatgtttgatggacaaaatgttagtttgatatttta 8165833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8025967 - 8025895
Alignment:
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| |||||| || ||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  8025967 aaacagttttacatatcaaccgctgtacaacttgaattgttcgatcatatcctttattttttagcagatcaaa 8025895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42547511 - 42547463
Alignment:
Q  107 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  42547511 acaaggtagaacaacacatgacaaacttttatgatattgaataattttt 42547463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 43 - 383
Target Start/End: Original strand, 34338681 - 34339022
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34338681 gggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatggc 34338780  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34338781 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 34338880  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34338881 gtgagggtcaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 34338980  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34338981 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 34339022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 54 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9733138 - 9732813
Alignment:
Q  54 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaatt 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9733138 gtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggcattgaataatt 9733039  T
Q  153 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9733038 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 9732939  T
Q  253 aaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtc 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9732938 aaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtc 9732839  T
Q  353 cttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  9732838 cttcattttttaacaaatcaaacgca 9732813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 41 - 378
Target Start/End: Original strand, 18685705 - 18686043
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatg 139  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18685705 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatg 18685804  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18685805 gcattgagtaattttttgttttataggatttttgagggacaaaatgttattttaatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtt 18685904  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18685905 tggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 18686004  T
Q  340 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18686005 attctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 18686043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 32497785 - 32498122
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32497785 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 32497884  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  32497885 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 32497984  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32497985 ggtgaggtacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 32498084  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32498085 ttctgccatgcccttcattttttagcaaatcaaacgca 32498122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 35114656 - 35114988
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  35114656 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggc 35114755  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  35114756 aatgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttg 35114855  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35114856 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactagagttgt 35114955  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35114956 cctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaa 35114988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 46 - 378
Target Start/End: Original strand, 17540588 - 17540922
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17540588 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacatattttttatggcatt 17540687  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt-gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17540688 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactatttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 17540787  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17540788 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattgttc 17540887  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  17540888 tgtcatatctttcattttttaacaaatcaaacgca 17540922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 40 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2645308 - 2644970
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  2645308 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtacttgatagaacagtataagatagaacagtacaacataaggcagaacagcactggacaaattttttat 2645209  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  2645208 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 2645109  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645108 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctct-ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 2645010  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645009 tgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2644970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 40 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5279056 - 5278720
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5279056 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 5278957  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  5278956 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgctgtggt 5278857  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||    
T  5278856 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacacctaacaattagagt 5278757  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5278756 tgttctgtcatatcctt-attttttagcaaatcaaacg 5278720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 43 - 375
Target Start/End: Original strand, 33366481 - 33366814
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33366481 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggc 33366580  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  33366581 attgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttg 33366680  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33366681 gtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagaattgt 33366780  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33366781 tctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaac 33366814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30326550 - 30326215
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||     
T  30326550 gggtgtgtttggtttgcaaaagagcaagtactggacagaacagtacaagatagaaccgtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatgga 30326451  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  30326450 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 30326351  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    | ||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30326350 gcgagagacaaaa-tatgagtttttgtcctgtcccctgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgc 30326252  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326251 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 30326215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Original strand, 44284508 - 44284836
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44284508 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaac--------acaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggc 44284599  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||     
T  44284600 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgttattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggttta 44284699  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  44284700 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactctagttgt 44284799  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44284800 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 44284836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Original strand, 37308527 - 37308863
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37308527 gggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggc 37308626  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  37308627 attgagtaatttttttgttt-tacgattttttagggacaaaatactattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 37308725  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37308726 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 37308825  T
Q  342 tctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37308826 tctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 37308863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 68 - 385
Target Start/End: Original strand, 7258792 - 7259111
Alignment:
Q  68 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacg 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7258792 aagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaatagtacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttataca 7258891  T
Q  167 atttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttt 265  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7258892 atttttgagggacaaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 7258991  T
Q  266 tgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttag 365  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7258992 tgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacagctagagttgttctgtcatgtccttcattttttaa 7259091  T
Q  366 caaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  7259092 caaatcaaacgcagcctaag 7259111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 46 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30798703 - 30798372
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30798703 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagta--acataagacagaacagcacatgacaaattttgtatggtatt 30798606  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30798605 tagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtg 30798506  T
Q  245 agggataaaaatatgagt-ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798505 agggacaaaaatatgagttttttttcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 30798406  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30798405 tgtc-tgcccttcattttttagcaaatcaaacgca 30798372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19513906 - 19513571
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| | |||  ||||||||||  ||||||||||| |||| ||    
T  19513906 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggataaaacagtacaagatagaacagtacaatagaagacagaacagcacgggacaaattttttatggtat 19513807  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19513806 tgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 19513707  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19513706 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctcccgtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggaaaactagagttgttc 19513607  T
Q  344 tgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19513606 tgtcctgtccttcatttttttagcaaatgaaacgca 19513571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 45 - 361
Target Start/End: Original strand, 42706231 - 42706549
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42706231 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagcacttgacataacagtacaagatagaacaatacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatggcat 42706330  T
Q  144 tgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  42706331 tgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 42706430  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42706431 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgtt 42706530  T
Q  343 ctgtcatgtccttcatttt 361  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  42706531 ctgtcctgtcctttatttt 42706549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 40 - 356
Target Start/End: Original strand, 16104142 - 16104459
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 138  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||    
T  16104142 taagggtgtatttggtttgcaaaacaacaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagggcaaattttttat 16104241  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  16104242 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggt 16104341  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16104342 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcgtgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagt 16104441  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttc 356  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  16104442 tgttctgtcctatccttc 16104459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 33889128 - 33889450
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33889128 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacataacaaattttttatgg 33889212  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33889213 tattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 33889312  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33889313 ggtgagggaaaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactagagttg 33889412  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33889413 ttctgtcctgtccttcattttttagtaaatcaaacgca 33889450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 45 - 375
Target Start/End: Original strand, 39461187 - 39461518
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39461187 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcat 39461286  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttg---tgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||   || |||| |||    
T  39461287 tgagtaattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacagcttgtacgtgagataaaaagttgtgttgttgtgattt 39461386  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| |||||    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39461387 ggtgagggacaaaaa---caatttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 39461483  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39461484 ttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 39461518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 132 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 7761702 - 7761451
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  7761702 tttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtg 7761603  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761602 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 7761503  T
Q  332 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7761502 ctagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 7761451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Original strand, 40692176 - 40692504
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40692176 gggtgtgtttgatttgcaaaacagtaaatactagacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggc 40692275  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  40692276 attgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatt--------ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgttctgtggtttg 40692367  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40692368 gtgagggacaaaaatacgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcttgtacctaaaacagtttcacaaattaaacactggacaactagagttgt 40692467  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40692468 tctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 40692504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 51 - 384
Target Start/End: Original strand, 42365456 - 42365790
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  42365456 ttggtttgcaaaacagtaagtattggaaaaaacaacataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggcattgagta 42365555  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  42365556 attttttgttttatatgatttttaggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtccgtgatataaaaagttgtgttgtggtttgatgaagga 42365655  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42365656 caaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactagacaactagagttgttatgtcat 42365755  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  42365756 gtccttcattttttagcaaatcaaacacaccctaa 42365790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 46 - 378
Target Start/End: Original strand, 2085946 - 2086269
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  2085946 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgccatt 2086045  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||      
T  2086046 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtatttcagacaacttgtacgtgaaacaaaaagttgtactgtggtttgggt 2086145  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2086146 agggacaaaaatatgagtttttg---------ttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg-tct 2086235  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2086236 gtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2086269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3913679 - 3913343
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||| || | || |||||||||||||    
T  3913679 agggtgtgtttgatttgcaaaacagtaaatacttgatagaacagtataagacagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggataaatttttatggc 3913580  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  3913579 attgaataatattttgttttatacgatttttggggagcaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgtggtttg 3913480  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3913479 gtgagggacaaacatgtgagtttttgtcctgtttcttgcctccagtttgtcatatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgt 3913380  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3913379 tttgtcatgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 3913343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 56 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28824762 - 28824440
Alignment:
Q  56 ttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | |||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||    
T  28824762 ttgcaaaacagtaagtactggactgaacagtacaagacagaacagcacaacataagacagaacaatacatgacaaatttttatgacatggaataaatttt 28824663  T
Q  156 tgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaa 255  Q
    |||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28824662 tgttttatacaatttttggggtgcgaaatgctattttagtattttagacaacttgcacgtgagataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaa 28824563  T
Q  256 tatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcctt 355  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28824562 tatgagtttttgtcctgacccttgactccagtatgtgctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcatgtcctt 28824463  T
Q  356 cattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28824462 cattttttagcaaatcaaacgca 28824440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16178100 - 16177769
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  16178100 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtgcaagacatatcaacacaacacaagatagaacaacacacgacaaatttttatagc 16178001  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  16178000 attgaataatttt--gttttatacgatttttgggggacgaaattccattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttg 16177903  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    || || || |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16177902 gtaagcgacaaaaatatcagtttatgtcctgtccattgcctccagtttatcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattggagttgt 16177803  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16177802 tatgtcatatccttcattttttagcaaatcaaac 16177769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 43 - 363
Target Start/End: Original strand, 4641387 - 4641706
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||  |    
T  4641387 gggtgtgtttgctttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtaaaatatagaacagtacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttatacc 4641486  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  4641487 attgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattttaaacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 4641586  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||   |||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4641587 gtgagagacaaaaatatgaatttttgttccgtccc--acctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgt 4641684  T
Q  342 tctgtcatgtccttcatttttt 363  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  4641685 tctgtcttttccttcatttttt 4641706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 6896040 - 6896375
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||   ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||     
T  6896040 agggtgcgtttggtttgcaaaacagtaagtacta-acagaacagtataatgcagaacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaatttttatggt 6896138  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  6896139 attgaataatttcttgttttatatgccttttgggggacgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgttgtttg 6896238  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6896239 gtgagggacaaaaatttcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgttttgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 6896338  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6896339 tctgtcctgtctttcattttttaacaaatcaaacgca 6896375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 108 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32766658 - 32766387
Alignment:
Q  108 caaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaac 207  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32766658 caagggagaacaacacaggacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttggaggacgaaatgttattttggtattttagacaac 32766559  T
Q  208 ttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaca 306  Q
     ||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32766558 ctgtacgtaggacaaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaaca 32766459  T
Q  307 gttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32766458 gttttacaaatcaaacactggacaattatagttgttctgttctgtccttcgttttttagcaaatcaaacgca 32766387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 43 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40832692 - 40832360
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagta---agtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40832692 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtagtaagtattagacagaatagtacaagatagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttata 40832593  T
Q  140 gcattgagtaat--tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
      ||||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  40832592 ttattgaattattatttttgttttatacgatttttgggggacgaaatactattttggtattttagactacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtgg 40832493  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40832492 tttggtgagggacaaaaatatccgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaatagctttacaaatcaaacactggacaacttaag 40832393  T
Q  338 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaat 370  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  40832392 ttgttatgtcatgtgcttccttttttagcaaat 40832360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38993284 - 38992954
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||   |||| |||    
T  38993284 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacaatataagataggacagcacaacataaggcagaacaacacaagacaaatt---atggtatt 38993188  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    || ||||||| ||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |    
T  38993187 gaataattttctgtattatattatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgacg 38993088  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||| | ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38993087 aggaacaaaaattgtagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctcttcctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactggagttattct 38992988  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38992987 gtcatgtccttcattttttatcaaatcaaacgca 38992954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10400084 - 10399756
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||| | |||   |||||| ||||     |||||||||| |||||||||||||    
T  10400084 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtgagtactgaacacaatagtacaagacaaaacatcacaacataagg-----cagcacatgataaatttttatggc 10399990  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| || ||  |||||||||| ||||||||     
T  10399989 attgaataattttttgttttatacgacttttgggggacaaaatgctattttggatttttagacaacttatacatgagacaaaaagttgtgttgtggttta 10399890  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  10399889 gtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtatcttgcatctagtttgtcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgt 10399790  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399789 tctatcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 10399756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 141 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12672594 - 12672373
Alignment:
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||    
T  12672594 cattgagtaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacttgggataaaaacttgtgttgtggttt 12672495  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12672494 ggtgagggacaaaaatatgagattttgtcccgtcccttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacacaggacaactagagttg 12672395  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagc 366  Q
     |||    ||||||||||||||||||    
T  12672394 ctct----tgtccttcattttttagc 12672373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37004089 - 37003856
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatg-acaaattttt-atg 139  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||    
T  37004089 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtataagatagaacagtacaatacaaggtaaaacagcacaaggacaaattttttatg 37003990  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  37003989 gcattgaataattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 37003890  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgt 273  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37003889 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgttatgt 37003856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 46 - 379
Target Start/End: Original strand, 30712732 - 30713068
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 145  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||   ||||||||  | | ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  30712732 tgtgtttggtttgtaaaaaagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacaacacaacacagcgcataacagcaaaggacaaatttttatggtattg 30712831  T
Q  146 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt----tg 241  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    ||    
T  30712832 aataattttttgttttatatgatttttg-gggatgaaatgatattttggtgttttagacaacttctacgtgggataaaaagttgtgttgtggttaatttg 30712930  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30712931 gtgagggacaaaaatttcagtttgtgtcctgtcccttgcctccaggttgttctgtccctgaaacagtattacaaatcaaacactggataactggagttgt 30713030  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 379  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30713031 tttgtcatgtctttcattttttaacaaatcaaacgcaa 30713068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 51 - 375
Target Start/End: Original strand, 11114752 - 11115074
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| |||| |||||   ||||||||||  ||||||  | | || |||||||||||||||||| |||    
T  11114752 ttggtttgcaaaacagtaagtactaaacataattgtacaagacagaacaacacaacacaagacagaacaatataagaaaaatttttatggcattgaataa 11114851  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |     
T  11114852 tttttcgttttatacgattgttagcggacgaaatactattttggaattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggaac 11114951  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||    
T  11114952 aaaaatatgattttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaactg-aacag-tttacaaatcaaacattggacaattggagttgttttgtcctg 11115049  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11115050 tccttcattttttagcaaatcaaac 11115074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 285
Target Start/End: Original strand, 26418793 - 26419037
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| ||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26418793 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatttgacagaacagtgcaagacagaacagcacaacgcaaggcagaacaacacatgacaaaaattttatgg 26418892  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26418893 caatgagtaattttttgttttatacaatttttgggggataaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 26418992  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 285  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26418993 ggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcatgtccctcgcctcca 26419037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Original strand, 13829318 - 13829633
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||   ||||| | ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||  ||||| |||    
T  13829318 ttggtttgcaaaacagtaattattggacaaaacagtacaaagcagaacagcacaacacaaggcagaacatcacagaacaaatttttatgatattgaataa 13829417  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||| | |||| |||     
T  13829418 ttttttgttttatatgatttttgagggacgaaatgatattttggtgttttagataacttgtacctgggacaaaaagttgtgatgtggtctagtgatggac 13829517  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||            |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13829518 aaaaatttcagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcct------------gtttcacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctg 13829605  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13829606 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 13829633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27463010 - 27462684
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||  || | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  27463010 ttggtttgcaaaacagcaagtattggataaaacagtgcaaaacagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttatatgacattgaataa 27462911  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || ||||||||||||| |||||| |||||  |||| | | ||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  27462910 ttttttgtttt-tacgatttttagggcacgaaatgctattttggtatttttgacaatatgtatg-gtgataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 27462813  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||  || ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | || ||    
T  27462812 aaaaataacagcttttgtcttgtcccttgtctacagtttgtcatgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaaattgttatatcctg 27462713  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 379  Q
    || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  27462712 tctttcatcttttaaaaaatcaaacgcaa 27462684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 375
Target Start/End: Original strand, 8112189 - 8112505
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattt 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||        | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8112189 tttgcaaaacagtaagtactcgacggaacaatataagatagaacaatacaacacaa--------atcacatgacaaattttgtatgacattgagtaattt 8112280  T
Q  154 tttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatatttt-agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggata 251  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||| |||| | |||||  ||| |  |||||||||| |||||||||||||| || |    
T  8112281 tttgttttatacgatttttaagggaaaaaaatgttattttggtatttttagactatttgtatctggaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagaca 8112380  T
Q  252 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca-ctggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||  |||||||    
T  8112381 aaaatatgagtttttgtattgtctcttgcctccagtttgttctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacaccttgacaactagagtagtattgtcatg 8112480  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    | ||| || |||||| |||||||||    
T  8112481 ttctttatcttttagtaaatcaaac 8112505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26981912 - 26981606
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-- 136  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||      
T  26981912 ctaagggggtgtttggtttgcaag-caataagtactggacagaacagtacaagacaaaacagcacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttt 26981814  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||| | |  ||||||| || ||||    
T  26981813 atgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttgg--------------------tattttagacaacttgtacgtagaacaaaaagttttgttgtg 26981734  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 336  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26981733 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcatttgcctcccgtttgtcttgtatctggaacagttttacaaatcaaacactggacaactgga 26981634  T
Q  337 gttgttctgtcatgtccttcatttttta 364  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26981633 gttgttctgttctgtccttcatttttta 26981606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 269
Target Start/End: Original strand, 9717113 - 9717322
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||              |||||||||||||||    
T  9717113 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacga--ta--------------aaatttttatggcat 9717196  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9717197 tgggtaattttttgtttgatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 9717296  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtc 269  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    
T  9717297 gagggacaaaaacatgagtttttgtc 9717322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12939474 - 12939202
Alignment:
Q  89 aagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat--tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 186  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||  |||||| || |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  12939474 aagacagaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttaataacattgaatattgttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgt 12939375  T
Q  187 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccag 286  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12939374 tattttggtatcttagacaacttgtacgtgagataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcccttgcctccag 12939275  T
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 377  Q
                      |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12939274 ------------------cagttttataaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcttatccttcattttttagtaaatcaaacgc 12939202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18793478 - 18793306
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||    
T  18793478 gtgtgtttggtttgcaaaataataagtactggacaaaacagtataaaatagaacagtacaacataaggtagaacatcacaagacaaattttttatgggat 18793379  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18793378 tgagtaattttttgttttatacaatttttggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtg 18793306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38623365 - 38623190
Alignment:
Q  200 tagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacc 299  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  38623365 tagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttttccattgcctcaagtttgtcctgtccc 38623266  T
Q  300 tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38623265 tgaaacagttttacaaatcaaacattggataactgaagttgttatgtcatgtccttcaatttttaacaaatcaaac 38623190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18793300 - 18793180
Alignment:
Q  252 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18793300 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc--tttgtactgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgagcaactagagttgttctgtcatgt 18793203  T
Q  352 ccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18793202 ccttcattttttagcaaatcaaa 18793180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 278 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37863349 - 37863242
Alignment:
Q  278 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37863349 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaagcgc 37863250  T
Q  378 aacctaag 385  Q
    | ||||||    
T  37863249 accctaag 37863242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41366189 - 41365993
Alignment:
Q  182 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 281  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | || ||||||    
T  41366189 aatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctatctcttgcc 41366090  T
Q  282 tccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||| | |||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  41366089 tccagtttgtcatgtccctgaaactgtttcacaaatcaaacattgcacaattggagttgttctatcttgtttttcagtttttagcaaatcaaacgca 41365993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45463256 - 45463005
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  45463256 agaacaacacatgacaaatttttattgcattaaataattttttgttttatacgatttctg-gggacgaaatgttattttgatattttagacaatctgtac 45463158  T
Q  214 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttac 313  Q
    ||  ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||             |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  45463157 gtatgacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagtgacaaaaat-------------atgtctattgcctcctgtttgtcttgtacctgaagcagttttac 45463071  T
Q  314 aaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattt-tttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||   || |||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  45463070 aaatcaaatgttgaacaactggagttgttatgtcatctctttcatttgtttaacaaatcaaacgca 45463005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Original strand, 1247049 - 1247250
Alignment:
Q  65 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 164  Q
    |||||||| | |||| ||||||| |||| |||||   ||||||||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1247049 agtaagtagttgacataacagtacaagacagaacaacacaacacaaagcagtacagtacaagacaaatttttatggcattgaataattttttattttata 1247148  T
Q  165 cgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttt 264  Q
    ||||||||| || || ||||||        |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1247149 cgatttttggggaacgaaatgc--------tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttggtgagggacaaaaatatgagatt 1247240  T
Q  265 ttgtcatgtc 274  Q
    ||||| ||||    
T  1247241 ttgtcctgtc 1247250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 287 - 378
Target Start/End: Original strand, 9717317 - 9717408
Alignment:
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717317 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 9717408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 374
Target Start/End: Original strand, 41934465 - 41934785
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttt 154  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  |||||| ||||||||||   |||||||||| || || | | ||| ||||||||||| || ||||| | |||||    
T  41934465 tttgcaaaacagtaagtaccgtataacacagtacaagatagaacaacacaacacaagataaaataacgcataacaaatttttacggtattgaatgatttt 41934564  T
Q  155 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 254  Q
     ||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||| |||| | | || |    
T  41934565 atgtcttatatgatttttggtggacaaaatgttattttggtattttagacaacttatacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaagtacaaga 41934664  T
Q  255 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag-ttgttctgtcatgtcc 353  Q
    || | |||||||||| ||||  |||| |||||||| ||   | ||| || ||||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||  | |||||| |    
T  41934665 atttcagtttttgtcttgtcttttgcatccagtttatctcatcccttaatcagttttacaaatcacacactatacaacttgagtttgtcatatcatgttc 41934764  T
Q  354 ttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  41934765 ttcattttttaacaaatcaaa 41934785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 246
Target Start/End: Original strand, 20907468 - 20907664
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||| | | ||||||||| |||| |||||     ||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  20907468 gtgtgtttggtttgcaaaatagcaggtaccgtatagaacagtacaagaaagaac-----aacacaagggagaacaacatatgacaaatttttatgtcatt 20907562  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||| |||| |||||| | |||  |||| |||| |||||||||||||    
T  20907563 gaataattttttgttttgtacgatttttgggggataaaatgttattttagtattttatacaatttgtacataggacaaaaaattgttctgtggtttggtg 20907662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37003858 - 37003774
Alignment:
Q  294 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37003858 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaacttgagttgttatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 37003774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35473160 - 35472967
Alignment:
Q  101 tacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||| | |||||||| || |||||| | |||| | |||||||| | |||| || ||||||    
T  35473160 tacaatacaagttagaacaacatatgacaaattttgatggtattaaataatttttggtcttatacaaatttttatggacaaaaggatattatggtatttt 35473061  T
Q  201 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 294  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||    ||||||| |||||| |||| ||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  35473060 agacaacttgtacgtgggacaaaaaattgcagagtggtttagtgaggaataagaatttcagtttttgacttgtcccttgcctccaatttgtcct 35472967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 274
Target Start/End: Original strand, 37088218 - 37088376
Alignment:
Q  116 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 215  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  |    
T  37088218 aacagcacaagacaaatttgtatggtattgaacaattttgtgtcttatccgatgtttgatggacaaaatgctattttggtattttaaacatcatgtattt 37088317  T
Q  216 gggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
     |||||||||| |||| ||||| || |||||||| || ||| | |||||||||| ||||    
T  37088318 aggatgaaaagatgtgttgtggcttagtgagggacaagaatttcagtttttgtcttgtc 37088376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40876697 - 40876554
Alignment:
Q  187 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccag 286  Q
    ||||||| ||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  40876697 tattttggtatattaaacaatttgtacttgg-atgaaaagttgtgttgtggtttaatgaaagataaaaatttgagcttttgtcatgtcccttacctccgg 40876599  T
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
    | |||| ||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40876598 tgtgtcatgtccttaaaatagttttacaaatcaaacattggacaa 40876554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12672674 - 12672596
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaaca 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12672674 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactagacataa-aatataagatagaacagtacaacacaaggcagaaca 12672596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15303306 - 15303180
Alignment:
Q  195 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 294  Q
    |||||||||||||||  | |||| |  |||||||||| ||| ||||| | | ||| |||||| |  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15303306 tattttagacaacttacatgtggaacaaaaagttgtgatgtagtttgataaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtgtcttgcctctagtttgtcct 15303207  T
Q  295 gtacctgaaacagttttacaaatcaaa 321  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  15303206 gtctctgaagcagttttacaaatcaaa 15303180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 325
Target Start/End: Original strand, 26796173 - 26796382
Alignment:
Q  115 gaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg 214  Q
    ||||| |||| |||||| | || ||| |||||||| ||||   | ||||| ||||||||  ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26796173 gaacaacacaagacaaactattctggtattgagtatttttggctcttatatgatttttggtggacaaaagactatttgg-tattttagacaacttgtacg 26796271  T
Q  215 tgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttaca 314  Q
    || ||  |||||||| | |||| ||| |||||||| | |||| | | ||||| || | ||| ||||||  |||||||  ||| | || ||||||||||||    
T  26796272 tgtgacaaaaagttgcgttgtgctttagtgagggacacaaattttaatttttatcctatccattgcctgaagtttgttttgtccttgtaacagttttaca 26796371  T
Q  315 aatcaaacact 325  Q
    |||||||||||    
T  26796372 aatcaaacact 26796382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 375
Target Start/End: Original strand, 83374 - 83474
Alignment:
Q  275 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  83374 ccttacctctagtttgtcatgtcccacaaacagttttacaaatcaaacactgtgcaactgaagttgtcttgtcatgtccttcgttttttaacagatcaaa 83473  T
Q  375 c 375  Q
    |    
T  83474 c 83474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13249545 - 13249421
Alignment:
Q  116 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 215  Q
    |||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13249545 aacaacacaagacacatttttaagacattgaataattttttattatattctatatttgatggacaaaagtctattttgatattttaaacaacttgtactt 13249446  T
Q  216 gggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
     |||  |||| ||||| ||||||||    
T  13249445 tggacaaaaaattgtgttgtggttt 13249421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 375
Target Start/End: Original strand, 18278926 - 18279104
Alignment:
Q  195 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 294  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| ||  ||||||||||  ||| ||| |||||| | |||||| | |||||||||   |||| ||| |||||||||||| |    
T  18278926 tattttatacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgacgtgatttagtgaggaacaaaaattttagtttttgtgccgtcctttgtctccagtttgtctt 18279025  T
Q  295 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||| | ||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18279026 gtccctaaaaca-ttttataaatcaaacattgcacaacta-aattgtcatgtcctgtccttaattttttagcagatcaaac 18279104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6453315 - 6453249
Alignment:
Q  260 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 326  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6453315 agtttttgtcttgtcccttacctccggtttatcctgtccctgaaacaattttaaaaatcaaacactg 6453249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16062178 - 16061980
Alignment:
Q  176 ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||   || ||||| ||||||| || ||| |  ||||||||||| ||    
T  16062178 ggacaaaatgttattttgtcattttagacaa-ttgtatgtgggacaaaaaagttgtatcgtagtttgatgagggacaagaatttatgtttttgtcatatc 16062080  T
Q  275 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    |||| || ||| ||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  || | | || || |||||| |||||||||||    
T  16062079 ccttaccaccaatttattttgtgtctg-aacagttttacaaatcaaaaactgtacaacttgagttgtcttgacctatcttttatttttgagcaaatcaaa 16061981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 378
Target Start/End: Original strand, 26419045 - 26419089
Alignment:
Q  335 gagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26419045 gagttgttatgtcatgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 26419089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 38786647 - 38786503
Alignment:
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||  | ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||  ||| |||||| | ||||||     
T  38786647 attgaataatttttggtgttctacgattttgtacggacaaaagtctattttcatattt-agacaacttatacgtgagacaaaatgttgtgttttggttta 38786549  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 289  Q
    ||||| ||  ||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  38786548 gtgagaga--aaaatttcagtttttatcttgtccattgcctccagttt 38786503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 1247257 - 1247292
Alignment:
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1247257 ctgtcatgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 1247292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 31148786 - 31148844
Alignment:
Q  148 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 206  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  31148786 taattttttgttttatacaatttgtgttggataaaaaactattttgatattttagacaa 31148844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31194023 - 31193954
Alignment:
Q  306 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||    
T  31194023 agttttacaaatcaaacattatacaactgaagttgttatgttttatccttcattttttagcatatcaaac 31193954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12217706 - 12217650
Alignment:
Q  260 agtttttgtcatgtcccttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaa 315  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  12217706 agtttttgtcatgtctcttgtcccccagtttgccctgtccctgtaacagttttacaa 12217650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 115)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 40 - 378
Target Start/End: Original strand, 23521751 - 23522090
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  23521751 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagataaaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttat 23521850  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23521851 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 23521950  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23521951 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcttccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 23522050  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23522051 tgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 23522090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 40 - 384
Target Start/End: Original strand, 24002209 - 24002555
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttat- 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |     
T  24002209 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttttt 24002308  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24002309 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 24002408  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24002409 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactagag 24002508  T
Q  338 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24002509 ttgttctgtactgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 24002555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Original strand, 56154494 - 56154837
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  56154494 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatgg 56154593  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  56154594 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 56154693  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56154694 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctccagtttttcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttg 56154793  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56154794 ttctgtcctaaccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 56154837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29785750 - 29785412
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29785750 agggtgtgtttgatttgcaaaacaataagtactgaacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 29785651  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  29785650 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagctgtgttgtggttt 29785551  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29785550 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 29785451  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29785450 ttctgtcatgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 29785412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38486465 - 38486133
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |     ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38486465 agggtgtgtttcgtttgcaaaacagtaagtactagacagaacagtgcaagatagaacag-----cacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 38486371  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  38486370 cgttgagtaattttttgttttatactatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgttagacaaaaagttgtgctgtggttt 38486271  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38486270 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttatcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 38486171  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38486170 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 38486133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20802743 - 20802407
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  20802743 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggc 20802644  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  20802643 attgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 20802544  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20802543 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactaaagttgt 20802444  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20802443 tctgtcctatccttcattttttaacaaatcaaacgca 20802407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49152311 - 49151976
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  49152311 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 49152212  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49152211 attgagtaattttttgttttatacgatttttgatggacaaaatgttattttggt-ttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtggtttg 49152113  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  49152112 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcgtgtcccttgcatccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggataactaaagttgt 49152013  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49152012 tctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 49151976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 55065536 - 55065209
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55065536 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtataagataaaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttatggcattgagtaa 55065437  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  55065436 ttttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 55065337  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  55065336 aaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaataactagagttgttctgtcat 55065237  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55065236 gtcctt-attttttagcaaattaaacgca 55065209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Original strand, 12600761 - 12601096
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12600761 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacttgacaaattttttatggca 12600860  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||     
T  12600861 ttgagtagttttttgttttaaacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttga 12600960  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12600961 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttatctccagtttgtcctgtacctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 12601060  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12601061 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 12601096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Original strand, 21579900 - 21580235
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||     
T  21579900 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggt 21579999  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  21580000 attgagtaatttttagttttatacgatttttgagggacaacatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttg 21580099  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  21580100 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaattagaattgt 21580199  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21580200 tctgtcctgtcctt-attttttagcaaatcaaacgca 21580235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 42 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33177245 - 33176910
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || | ||||||| ||||||||    
T  33177245 agggtgtgcttggtttgcaaaacggtaagtacttgacagaacagtataagatagaacagtacaacacaagacagaacaacaaaggacaaatattttatgg 33177146  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33177145 cattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 33177046  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33177045 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 33176946  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33176945 ttctgtcatatcctttattttttagcaaatcaaacg 33176910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Original strand, 52319200 - 52319538
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  52319200 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggc 52319299  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52319300 attgagtaattt---gttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttgacattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 52319396  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt--- 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       
T  52319397 gtgagggacaaaaatatgagttttcgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 52319496  T
Q  339 --tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
      ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52319497 tctgttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 52319538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9512553 - 9512216
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||  || ||||| |||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9512553 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtacgtgacagaacagtacaagatagaatagtgcaacaaaagacagaatagcacatgacaaattttttatgg 9512454  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9512453 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 9512354  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9512353 ggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgttacttgcctccagtttatcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttg 9512254  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9512253 ttctatcatgtccttcgttttttagcaaatcaaacgca 9512216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 43 - 362
Target Start/End: Original strand, 37865627 - 37865947
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  37865627 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacgggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaatttttttatggc 37865726  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||    
T  37865727 attgaataattttttgttttatacgatttctgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtgatttg 37865826  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37865827 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtctcttgcctccagattgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 37865926  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttt 362  Q
    | |||| ||||||||||||||    
T  37865927 tatgtcgtgtccttcattttt 37865947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 46 - 378
Target Start/End: Original strand, 55593759 - 55594096
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggac---agaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||  ||||||||| ||||||    
T  55593759 tgtgtttggtttgtaaatcagtaagtactggacgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaatgcaaaacaaattttttatggc 55593858  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55593859 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttg 55593958  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55593959 gtgagggactaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagagttgt 55594058  T
Q  342 tctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  55594059 tctgtcctgttcttcatttttttagcaaatcaaacgca 55594096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Original strand, 21202614 - 21202926
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21202614 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacaaaacagtacaagacagaacagcacaacacaaaacagaacagcacatgacaaattttttatggc 21202713  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  21202714 aatgagtaattttttgttttatacgatttttg-gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 21202812  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21202813 gtgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 21202912  T
Q  342 tctgtcatgtcctt 355  Q
    |||||| |||||||    
T  21202913 tctgtcctgtcctt 21202926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36743901 - 36743565
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||   ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36743901 agggtgtgtttggtttgaaaaatagtaagtactagatagaacggtacaagatagaataatacaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatgg 36743802  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  36743801 cattgagtaatttgttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagttt 36743702  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36743701 ggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaattcaaacactgaacaactagagttg 36743602  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    || ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36743601 ttttgttatatccttcat-ttttagcaaatcaaacgca 36743565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50178696 - 50178368
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  50178696 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacatcacaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatgacattgaataa 50178597  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  50178596 ttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggtttgctgaggca 50178497  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  50178496 caaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcct 50178397  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50178396 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 50178368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Original strand, 6776460 - 6776788
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6776460 gtgtgtttggtttgcaaaacag------ctggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 6776553  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  6776554 tgagtaattttttgttttatacgattttttagagacaaaatgatattttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 6776653  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6776654 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctatacctaaatcaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 6776753  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6776754 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 6776788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33553003 - 33552708
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33553003 agaacagtacaacacaaggcaaaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 33552904  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  33552903 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcatccaatttgtc 33552804  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33552803 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttttgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgcacccttagaat 33552708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Original strand, 52949604 - 52949930
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  52949604 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaatagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 52949703  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||     
T  52949704 tttt-tgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggac 52949802  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  52949803 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatgaaacactggacaactagagttgttttgtcgtg 52949902  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  52949903 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 52949930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 59 - 378
Target Start/End: Original strand, 54542881 - 54543198
Alignment:
Q  59 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttg 157  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  54542881 caaaacagtaagtacta-acagaatagtacaggatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaagacaaattttttatgtcattgagtaattttttg 54542979  T
Q  158 ttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  54542980 ttttatacgatttttgagggacaaaatgatattttggtattttagacaacttgtacgtgggac-aaaagttgtgctatggtttggtgagggacaaaaata 54543078  T
Q  258 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54543079 tgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacttgaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcatgt-cttca 54543177  T
Q  358 ttttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  54543178 ttttttagcaaatcaaacgca 54543198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Original strand, 1231236 - 1231521
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1231236 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaagataaattttttatggcattatgtaatattttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 1231335  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  1231336 gatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttttgtgagggacaaaaatatgagtttttgtccagtctcttgcctccagtttatc 1231435  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1231436 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgca 1231521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 40 - 375
Target Start/End: Original strand, 20694247 - 20694578
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||     ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  20694247 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtaatggatagaacagtacaagatagaac-----aacacaaggcagaatagcacatgacaaattttgtat 20694341  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||    
T  20694342 ggcaatgagtaattttttgttttatataatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgttggacaaaaagttgcgttgtggt 20694441  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20694442 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgccttcagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagt 20694541  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20694542 tgttctgtgttgtccttcagtttttagcaaatcaaac 20694578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 106 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2725281 - 2725011
Alignment:
Q  106 cacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagac 204  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2725281 cacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagac 2725182  T
Q  205 aacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaa 304  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2725181 aacttgtacgtgg-acaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctaaaa 2725083  T
Q  305 cagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2725082 gagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 2725011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 40 - 378
Target Start/End: Original strand, 36885817 - 36886142
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |          |||    || ||||||||    
T  36885817 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcgagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacagg----------aca----aattttttatg 36885902  T
Q  140 gcattgagt-aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36885903 gcattgagttaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttaggtattttagacaatttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggt 36886002  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36886003 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 36886102  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36886103 tgttttgtcttgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 36886142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 81 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20518196 - 20517890
Alignment:
Q  81 aacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggac 179  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20518196 aacagtacaagatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatagaatttttgagggac 20518097  T
Q  180 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 279  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  20518096 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaagaagttatgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgactttttgtcctgtctcttg 20517997  T
Q  280 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20517996 cctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 20517897  T
Q  379 acctaag 385  Q
     ||||||    
T  20517896 ccctaag 20517890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 94 - 374
Target Start/End: Original strand, 24210243 - 24210525
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattt 191  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24210243 agaacgatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctattt 24210342  T
Q  192 tgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgt 291  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24210343 tggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaataatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgt 24210442  T
Q  292 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  24210443 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaattagagttgttccgtcctatctttcattttttagcaaatcaaa 24210525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 55 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44649361 - 44649040
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttt 154  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  44649361 tttgcaaaacggcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagtacaatacaagggagaacaacacatgacaaattttgatgacattgaataatttt 44649262  T
Q  155 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 254  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  44649261 --gttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaa 44649164  T
Q  255 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcct 354  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  44649163 atatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaaactggataactggagttgttctgtcctgtcct 44649064  T
Q  355 tcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44649063 tcattttttagcaaatcaaacgca 44649040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 114 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50728054 - 50727789
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50728054 agaacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta 50727955  T
Q  213 cgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 312  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50727954 cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagtttta 50727855  T
Q  313 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50727854 caaatcaaacacttgacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 50727789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 114 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50736068 - 50735803
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50736068 agaacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta 50735969  T
Q  213 cgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 312  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50735968 cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagtttta 50735869  T
Q  313 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50735868 caaatcaaacacttgacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 50735803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 9807030 - 9807365
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9807030 agggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggc 9807129  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  9807130 attgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggtttg 9807229  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||| ||| |||||  |||||||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9807230 gtga-ggacaaaaagttgagtttttgtcctgtccattgcatctagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 9807328  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
     ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9807329 cctgtcctatccttcatgttttagcaaatcaaacgca 9807365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 46 - 378
Target Start/End: Original strand, 42869859 - 42870181
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaagg-tagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||         || |||||||||||||    
T  42869859 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactcgacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggatagaaca---------aattttttatggcatt 42869949  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  42869950 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggac---aagttgtgctgtggtttggt 42870046  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  42870047 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcccccagtttgtcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactagagttgtta 42870146  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42870147 tgtcatgtccttcatttcttagcaaatcaaacgca 42870181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 102 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44324494 - 44324218
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  44324494 acaacataaggcagaacagcacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaa 44324395  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  44324394 aacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcccgtcttttgcctctagtttgtcctgtacctg 44324295  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44324294 aaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttctagcaaatcaaacgca 44324218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 107 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 46680658 - 46680386
Alignment:
Q  107 acaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagaca 205  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46680658 acaagatagaacagtacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgattttttagggacaaaatgctattatggtattttagaca 46680559  T
Q  206 acttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 305  Q
    | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46680558 atttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 46680459  T
Q  306 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46680458 agttttacaaatcaaacactgaacaactagaattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 46680386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Original strand, 29616095 - 29616376
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29616095 agaacagtacaacacaagacagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttaagggacaaaatgttatttt 29616194  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29616195 ggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtc-----agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 29616289  T
Q  293 ctgtacct-gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29616290 ctgtaccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 29616376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 29592774 - 29593105
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||     ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  29592774 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactggacatatcagtacaagacagaac-----aacacaaggcagaacagaacaagacaaatttttttggc 29592868  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||   ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||     
T  29592869 attgaataattttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgccattttggatttttagacaacttttatgtgggacaaaaagttgtgctgtggttta 29592968  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  29592969 gtgaagtacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaaggtgt 29593068  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29593069 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 29593105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Original strand, 3649519 - 3649846
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  3649519 ttggtttgcaaaatagtaagtactggacaacacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacatcacaaatttttatggtattgaataa 3649618  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3649619 tttcttgttttatatgttttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 3649718  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  3649719 aaaaattttagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactggagttgttctgtcttg 3649818  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3649819 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 3649846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 100 - 378
Target Start/End: Original strand, 36497148 - 36497427
Alignment:
Q  100 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatt-tttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 198  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36497148 gtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaaaaatttatagcattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacagaatgctattttgatatt 36497247  T
Q  199 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 298  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36497248 ttagacaacttgtatgttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgtctccagtttgtcctgtac 36497347  T
Q  299 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36497348 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgca 36497427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 132 - 378
Target Start/End: Original strand, 38812484 - 38812730
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38812484 tttttatgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttgcggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 38812583  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38812584 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 38812683  T
Q  332 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38812684 ctagagttgttatgtcctgtcctttattttttagcaaatgaaacgca 38812730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 51 - 363
Target Start/End: Original strand, 34929797 - 34930110
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| || ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34929797 ttggtttgcaaaacagtaaaaactagacaaaacagtacaaaataaaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggcattcagta 34929896  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34929897 aatttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtatatggggcaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggaa 34929996  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34929997 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttattctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttattctgtcat 34930096  T
Q  350 gtccttcatttttt 363  Q
    |  ||| |||||||    
T  34930097 gatctttatttttt 34930110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 378
Target Start/End: Original strand, 2786836 - 2787174
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||   |||||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||     
T  2786836 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagaccgaacaacacaacataaggcaaaacagcactagacaattttttatt 2786935  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||   ||||||| || ||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  2786936 gcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgggacaaaaatttgtgatgtggtt 2787035  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2787036 tagtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatccagtttgtactgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactagagtt 2787135  T
Q  340 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2787136 gttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2787174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47642703 - 47642388
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |||||  | ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  47642703 agggtgcgtttggtttgcaaaacaacaagtatagtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaggataaatttttatgac 47642604  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  47642603 attgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 47642504  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  47642503 ctgagggacaaaaatatcagtttttatcttgtctcttacctccagtttgtcctgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgt 47642404  T
Q  342 tctgtcatgtccttca 357  Q
    |||||| |||||||||    
T  47642403 tctgtcctgtccttca 47642388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 102 - 378
Target Start/End: Original strand, 32181197 - 32181473
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32181197 acaatacaagatagaacagcacaggacaaatttgtatgacattgaataattttatgttttatactatttttgggggacgaaatgctattttggtatttta 32181296  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  32181297 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacttg 32181396  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32181397 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgtcatgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgca 32181473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 39 - 274
Target Start/End: Original strand, 43640969 - 43641205
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-ttttta 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  43640969 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaattttta 43641068  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43641069 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 43641168  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43641169 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 43641205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Original strand, 50186411 - 50186738
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||  | |||||| |||  | |||| || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  50186411 ttggtttgcaaaacagtaagtacttgactgaacagtataagacaaaatagcacaacataagacataacaacataggacaaatttttatgacattgaataa 50186510  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  50186511 ttttttattttatacgatttttggggtgcgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 50186610  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  50186611 aaaaatatgagtttttatcccgtcccttgcctctagtttgtcctgcacctaaaacaattttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctttcttg 50186710  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50186711 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 50186738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47361570 - 47361289
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47361570 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgatattgagtaattttttgttttatacgaatttttagggacaaaatgctatttt 47361471  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||     |||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  47361470 ggtattttagacaacttgtt----ggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaatttt-gtcttgtcccttgcctccggtttgtc 47361376  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47361375 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 47361289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 109 - 378
Target Start/End: Original strand, 4325731 - 4326001
Alignment:
Q  109 aaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaac 207  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4325731 aaggcagaacaacacacgacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatgcgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaac 4325830  T
Q  208 ttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacag 307  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4325831 ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgcggttttgtgagagacaaaaatatgagtttttctcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacag 4325930  T
Q  308 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4325931 ttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttttgtcttgtactttattttttagcaaatcaaacgca 4326001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 103 - 384
Target Start/End: Original strand, 11055977 - 11056258
Alignment:
Q  103 caacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 202  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| |    
T  11055977 caacacaaggtagaacagtacgggacaaatctttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgaggcacgaaatgttattttggtatttttg 11056076  T
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 302  Q
    ||||  ||||| |||||   ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11056077 acaatctgtacatgggacataaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 11056176  T
Q  303 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11056177 aacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttatcctgaccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 11056258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 127 - 378
Target Start/End: Original strand, 41711806 - 41712057
Alignment:
Q  127 acaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaag 226  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||    
T  41711806 acaaatttttatgctattgaataattttttgttttatacgatatttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgagacaaaaag 41711905  T
Q  227 ttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 326  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41711906 ttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtctttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagctttacaaatcaaacactg 41712005  T
Q  327 gacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||    
T  41712006 gacaactagagttgttctgttctatcattcattttttagtaaatcaaacgca 41712057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 51 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22318587 - 22318250
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||| | ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  22318587 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaagagtacaatgcagaacagcacaacacaagacataacaacacatgacaaatttttatgatattgaataa 22318488  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| |||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  22318487 tttcttgttttatatgatttttggatgacaaaatgttattttggtgttttagacaacttctacgtaagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 22318388  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||| | |  ||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  22318387 aaaaatttcaaattttgtcctgtctcttgccttcagtttgttctgtccctaaaacagttttacaaatcaaacactagacagctggggttgttctgtcatg 22318288  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 388  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22318287 tccttcattttttaacaaatcaaacgcaccctaagaat 22318250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 39 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7555172 - 7554833
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttat 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| | |||   ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  7555172 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtattggacttaacagtacaagacaaaacaacacaacacaagacagaacatcacacgacaaatttttat 7555073  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||    
T  7555072 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttggaggccgaaatgctattttggatttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggt 7554973  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    || |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  7554972 ttagtgaaggacaaaaatacgagtttttatcatgtctcttgcattcagtttgttttgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctgaaat 7554873  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  7554872 tgttctgtcatatctttcactttttagcaaatcaaacgca 7554833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37695741 - 37695470
Alignment:
Q  54 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattt 153  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37695741 gtttgcaaaacaacaagtactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatggcattgaataattt 37695642  T
Q  154 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  37695641 tttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttgatattttagacaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaa 37695542  T
Q  254 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37695541 aatatcagtttttgtcttgtctcttacctccaatttatcatgtacctgaaacagttttccaaataaaacact 37695470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 375
Target Start/End: Original strand, 39078596 - 39078868
Alignment:
Q  103 caacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 202  Q
    |||||||||| | |||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  39078596 caacacaaggcataacaacacaggataaatttttatggtattgaataatttcttattttatatgatttttgggggacaaaatgttattttggtgttttag 39078695  T
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 302  Q
    |||||| |||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||||    
T  39078696 acaactcgtacgtaggacaaaaatttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcaggttttgtcctatctcttgcctccagtttgttctgtccctga 39078795  T
Q  303 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39078796 aacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttaacaaatcaaac 39078868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 53200858 - 53200519
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaaca-----gtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     ||| || | |||||   |||||| |||| | |||| ||||  |||||||||||||    
T  53200858 gtgtgtttggtttgcaaaagagtaagtactggatagaacatatcagtacaaaacagaacatcacaacataaggcataacaacacagaacaaatttttatg 53200759  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggt 238  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  53200758 gtattgaataattttttgttttgtatgatttttgagggacgaaatactattttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggt 53200659  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||  |||    
T  53200658 ttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcatgttccttgcctccagtttatcctgtctctgaaacagttttgcaaatcaaacactaaacagctgaagt 53200559  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    | || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53200558 tattatgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 53200519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 187 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2630018 - 2629827
Alignment:
Q  187 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccag 286  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2630018 tattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatttggtctggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcctttgcctctag 2629919  T
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629918 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacacgggacaactagagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2629827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 384
Target Start/End: Original strand, 16320408 - 16320734
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttt 154  Q
    |||||||||||| |||||||| | | | || || |||| |||||   |||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16320408 tttgcaaaacagcaagtactgtataaagcaatacaagaaagaacaacacaatagaagggagaacaacacaagacaaatttttatggcattgaataatttt 16320507  T
Q  155 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 254  Q
      ||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16320508 --gttttatacgagttttgggggatgaaattctatttttgtattttaggcaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaa 16320605  T
Q  255 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcct 354  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16320606 atatcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttttcctatacctgagacagttttacaaatcaaatactggacaactggagttgttctgtccagtcct 16320705  T
Q  355 tcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16320706 t-attttttagcatatcaaacgcaccctaa 16320734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 175 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50729621 - 50729418
Alignment:
Q  175 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||    
T  50729621 gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatagacaaaaatttcagtttttgtcatgtc 50729522  T
Q  275 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  50729521 ccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaa 50729422  T
Q  375 cgca 378  Q
    ||||    
T  50729421 cgca 50729418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 378
Target Start/End: Original strand, 26083235 - 26083547
Alignment:
Q  65 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 164  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||   |||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  26083235 agtaagtattggactgaacaatataatgcagaacaacacaacacaaggcataacagtacacgacaaatttttatggtattgaataatttcatgttttata 26083334  T
Q  165 cgatttttgagggacaaaatgctattttga-tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtt 263  Q
     | |||||| ||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  26083335 tgctttttgggggacgaaatgttattttgggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtt 26083434  T
Q  264 tttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  26083435 tttgtcatgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactaaacaactgaagttgttctgt--tgtccttcattttct 26083532  T
Q  364 agcaaatcaaacgca 378  Q
    | ||||| |||||||    
T  26083533 aacaaattaaacgca 26083547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 158 - 374
Target Start/End: Original strand, 28115243 - 28115457
Alignment:
Q  158 ttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 257  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28115243 ttttataagattcttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 28115341  T
Q  258 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca 357  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | | |||||    
T  28115342 tcaatttttctcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacc-aaaacagttttacaaatcaaacactagacaacttgagttgttctgccctttgcttca 28115440  T
Q  358 ttttttagcaaatcaaa 374  Q
    |||||||||||||||||    
T  28115441 ttttttagcaaatcaaa 28115457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 268
Target Start/End: Original strand, 37931798 - 37932020
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||    | || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37931798 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagacataataacataatacaaggcagaacagcacaagacaactttttatggcattg 37931897  T
Q  146 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 245  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  37931898 aataatttttcgttttatacaatttttgggggacgaaatgctattttgacattttaaacaacttgtatgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 37931997  T
Q  246 gggataaaaatatgagtttttgt 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  37931998 gggacaaaaatatgagtttttgt 37932020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 14296471 - 14296648
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14296471 gggtgtgtttgatttgcaaaacaataagtactggacagaacagaacaatatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggc 14296570  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14296571 attgagtaattttttgttttatacgatttttgggagacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtggga 14296648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 375
Target Start/End: Original strand, 30942671 - 30942995
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||  ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30942671 ttggtttgtaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaattaagaacattacaatacaaggtataatagcatatgacaaatttttatagcattgaataa 30942770  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||| |   ||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  30942771 tttcttgttttatatgatttttgggggatgaaatgatattttggtgttttagacaacttatatgtgaggcaaaatgttgtgttgtggtttggtgagagac 30942870  T
Q  251 aaaaatatgag-tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
    | |||| | || ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |    
T  30942871 agaaatttcagttttttgtcccgtctcttgcctccaatttgttctgtccctgaaacagttttataaatcaaacactgaataactggagttgttctgtctt 30942970  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||    
T  30942971 atcctt-attttttaacaaatcaaac 30942995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 14314719 - 14314896
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14314719 gggtgtgtttgatttgctaaacaataagtactggacagaacagaacaatatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggc 14314818  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14314819 attgagtaattttttgttttatacgatttttgggagacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtggga 14314896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 222 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6973945 - 6973789
Alignment:
Q  222 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 321  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6973945 aaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtcaattgcctcccgtttgtccagtacctgaaacagttttacaaatcaaa 6973846  T
Q  322 cactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6973845 cactggacaacaaaagttgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 6973789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 246 - 378
Target Start/End: Original strand, 14296645 - 14296777
Alignment:
Q  246 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 345  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14296645 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttatg 14296744  T
Q  346 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14296745 tcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 14296777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 246 - 378
Target Start/End: Original strand, 14314893 - 14315025
Alignment:
Q  246 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 345  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14314893 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttatg 14314992  T
Q  346 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14314993 tcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 14315025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 42772832 - 42772998
Alignment:
Q  212 acgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttt 311  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  42772832 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctcaagtttgtcatgtacctgaaacaatttt 42772931  T
Q  312 acaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  42772932 acaaatcaaacacttgaaaactaaagttgttatgtcatgtcattcattttttaatgaatcaaacgca 42772998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 269
Target Start/End: Original strand, 23327850 - 23328020
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt-gagggacaaaatgctattttgatattt 199  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||||    
T  23327850 acaacacaaagtagaacattacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttggggggataaaatgttattttggtattt 23327949  T
Q  200 tagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtc 269  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23327950 tagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatatgagtttttgtc 23328020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25978664 - 25978488
Alignment:
Q  201 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 300  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||| |||    
T  25978664 agacaacttgtaagtgagacaaaaagttgtgatatggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgttcattgcctccaatttgtcatgt-cct 25978566  T
Q  301 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25978565 gaaacagttttacaaatcaaacactggataattgaagttgttttgtcatgtcctttattttttaacaaatcaaacgca 25978488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 289
Target Start/End: Original strand, 13110211 - 13110448
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||   | | |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||  |||    
T  13110211 ttggtttgcaaaacagtaagtagtggataaaacaatacaagatagaacaacatagcacaaggtagaacaacgcagaacaaatttttatggcattgcataa 13110310  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg-tttggtgaggga 249  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||| || |||||||||  || ||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  13110311 ttttt-gttttgtatgatttttgggggacgaaatgctattttggatttttagacaaattttacgtgggacaaacagttgtgttgtggttttagtgaagga 13110409  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 289  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13110410 caaaaatatgag-ttttgtcatgtcctttgcatccagttt 13110448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 56487285 - 56487163
Alignment:
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  56487285 aaaaatataaatttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatatctgaaacagttttacaaatcaaac-----acaactagagttgttctgtcatg 56487191  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  56487190 tctttcattttttagcaaatcaaacgca 56487163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 378
Target Start/End: Original strand, 23328015 - 23328106
Alignment:
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23328015 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaagtcaaacacatgacaactagagttgttctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgca 23328106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 292
Target Start/End: Original strand, 7001748 - 7001976
Alignment:
Q  62 aacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgtttt 161  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||   ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  7001748 aacagtaaatactggacaaaatagtacaagacagaacatcacaacacaagacagaacaatacaggacaaatttttatggcattgaataatttttggtctt 7001847  T
Q  162 atacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgag 261  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| ||||||| || |||||||||||| ||| | | |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  7001848 atacgatttttggtggac-aaatgttattttggta-tttagacaacttatacatagaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttttg 7001945  T
Q  262 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  7001946 tttttgttctgtctcttgcctcgagtttgtc 7001976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 277
Target Start/End: Original strand, 43739395 - 43739570
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||| | |||||||| || |||||| ||||||   ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  43739395 acaacataaggcagaacaacacatgataaatttttttggtattaaataatttttggtcttatacaattttttgtggataaaatgttattttaatatttta 43739494  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 277  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||    
T  43739495 gacaacttgtatgtgggacaaaatgttgtgttgtggtttggtgagggacaataatttcagtttttgtcatgtccct 43739570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 323
Target Start/End: Original strand, 9947947 - 9948084
Alignment:
Q  186 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 285  Q
    |||||||| ||||||  | |||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |    
T  9947947 ctattttggtattttgaataacttgtacgtgagacaaaaagttgtaatgtggtttagtgagggataagaattttagtttttgtcatgtctcttgcctcaa 9948046  T
Q  286 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 323  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9948047 gtttgtcatgttccttaaacagttttacaaatcaaaca 9948084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 45577842 - 45577619
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |||  | ||||||   ||||||||||  |||||| |||||||    
T  45577842 acaacataaggttgaacaacacatgacaaagttttatggtattgaataatttt--gtcttaatcaattttttgtggacaaaatgtcattttggtatttta 45577745  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaat---atgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 298  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| | |||| | || |||   ||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  45577744 gacaacttgcacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttagcgaggaacaagaatttcatttttttttgtcatgtctcttgcctccagtttgtcatgtcc 45577645  T
Q  299 ctgaaacag-ttttacaaatcaaaca 323  Q
     | |||||| ||||||||||||||||    
T  45577644 ataaaacagcttttacaaatcaaaca 45577619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44355995 - 44355734
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| |||| | |||| |||||||  ||||| ||| |||| || || |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  44355995 agaacaacacaggccaaacttttatgctattgaataacttttggtcttgtacgatttttgatggacaaaagactattttggtatatcatacaacttgtac 44355896  T
Q  214 gtgggatgaaaag-ttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 312  Q
    ||  ||  ||||  ||||| ||||||||  ||||||| |||||| | | |||||||| | || ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  44355895 gtaagacaaaaaaattgtgttgtggtttaatgagggacaaaaatttcaatttttgtcctctctcttacctccagtttgtcctatccctaaaacag-ttta 44355797  T
Q  313 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| || |||||||    
T  44355796 caaatcaaacaccacacaactagatttgtcatatcatatccttcattttttaacatatcaaac 44355734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 228
Target Start/End: Original strand, 42772724 - 42772818
Alignment:
Q  134 tttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  42772724 tttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttggaggaaaaaatgttattttggtattttagataacttatacgtgggacaaaaagtt 42772818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 20644379 - 20644107
Alignment:
Q  116 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 215  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||  ||| ||||| |||||||||      
T  20644379 aacaacacatgacacacttttatcgcattgaataatttttgattttatacgatttttggtgtacaaaaatctatttttgtatcttagataacttgtacac 20644280  T
Q  216 gggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaa 315  Q
    | ||  | ||| || | |||||||| ||||| || |||||| |   |||||| ||||| | ||||||| |||||    ||| || |||| |||||| |||    
T  20644279 gagacaagaagctgggatgtggtttagtgagagacaaaaatttatatttttgacatgttcattgcctctagtttagattgtcccagaaatagttttgcaa 20644180  T
Q  316 atcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 388  Q
    ||||||||| | | ||||  | || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  20644179 atcaaacaccgtataactgaaattatcctgtcatgtccttcattttttaacagatcaaacgcaccctaagaat 20644107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 378
Target Start/End: Original strand, 44640417 - 44640532
Alignment:
Q  262 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttt 361  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  44640417 tttttgtcttgtctcttgcctctagtttgtcattttccataaacagttttacaaatcaaacactgtacaactgaagttgttctgtc-tgtcattcatttt 44640515  T
Q  362 ttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| | ||||||||||    
T  44640516 ttagtagatcaaacgca 44640532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43189914 - 43189636
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||   |||||| | | ||||||  ||||| |    
T  43189914 acaatacaaggaagagcaacacatgataaacttttatggtattgaataattttttgtcttatacgatatttagtggacaataagttatttttgtattt-a 43189816  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    || |||||| |  |||||  |||| |||||  ||||||| |||||  | |||||  |  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |  |      
T  43189815 gataacttgcatttgggacaaaaacttgtgtcgtggtttagtgagacacaaaaaattatgtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgtcatatttcaa 43189716  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgcaac 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| | || |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  43189715 aaacaattttacaaatcaaacactgtacaactaaaattgttatgtcttatctttcatttttttagcagatcaaatgcaac 43189636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Original strand, 13110443 - 13110513
Alignment:
Q  305 cagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13110443 cagttttacaaatcaaacactggacaactgaaatttttctgtcatgtctttcattttttagcaaatcaaac 13110513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 53343638 - 53343560
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttt 171  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53343638 agaacagtacaacacaatgcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttt 53343560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 375
Target Start/End: Original strand, 2114191 - 2114243
Alignment:
Q  323 actggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2114191 actggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 2114243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 56487374 - 56487292
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg 214  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  56487374 tttttatgtcattgattgattttttgttttatatgatttttggaggacaaaatgttattttggtattttaaacaacttgtacg 56487292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 322
Target Start/End: Original strand, 3579142 - 3579279
Alignment:
Q  186 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataa-aaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || |||  |||||||||| | |||||| |||| ||| || |||| |   ||||||||||||||||||||||     
T  3579142 ctattttggtattttagacaacttgaatgttggacaaaaagttgtgatatggtttagtgatggaaaataaatttacttttttgtcatgtcccttgcctca 3579241  T
Q  285 agtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 322  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  3579242 agtttgtcctgcccctaaaacagatttacgaatcaaac 3579279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Original strand, 985216 - 985327
Alignment:
Q  101 tacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 200  Q
    |||||||||||  | |||| || | |||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  985216 tacaacacaagacaaaacatcataagacaaatttttatggt-ttgaataatttttggtcttatatgatttttgctggacaaaagactattttgatatttt 985314  T
Q  201 agacaacttgtac 213  Q
    | |||||||||||    
T  985315 aaacaacttgtac 985327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 378
Target Start/End: Original strand, 52673838 - 52674024
Alignment:
Q  195 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttg---t 291  Q
    ||||||||| ||||  |||||| ||  |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  52673838 tattttagataactcatacgtgagacaaaaaattgtgttgaggtttagtgagggacaaaaatttctgtttttgtcatgtcccttgactccagtttgtgat 52673937  T
Q  292 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||  | ||  ||||||||||| ||| || | |||  |||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  52673938 cccttcccaaaaacagttttataaaccagatactatacaactggagttatcttatcatgtccttcgttttttagcagatcaaacgca 52674024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Original strand, 52755417 - 52755601
Alignment:
Q  65 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 164  Q
    |||||||||| || ||||| ||| ||||||| |  || ||| ||||||| ||||| | |  |||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  52755417 agtaagtacttgatagaaccgtaaaagataggatagtgcaaaacaaggttgaacaacgctggacaaattgttatggtgttgaacaattttttgttttata 52755516  T
Q  165 cgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    | || ||||| ||| |||||| ||||||| || |||| ||| ||||| | ||| |  |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  52755517 caatgtttgatggaaaaaatgttattttgctaatttacacagcttgtgcttggaacaaaaagttgttttgtgctttggtgaggga 52755601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31446027 - 31445768
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  | || ||||||||||   | |||||| | ||||||  |||||||    
T  31446027 acaacacaaagtagaaaaacacatgacaaacttttatggtattggataattttta-tcttgtacgattttttgtgaacaaaaagttatttttgtatttta 31445929  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    || || ||||||||| |   |||||||||| ||| |||| ||| |||| |||  | |  ||||| ||  ||||| |||||||| ||||||| | |  |      
T  31445928 gataatttgtacgtgtggcaaaaagttgtgatgttgtttagtg-gggacaaaggtttatgtttt-gtgttgtcctttgcctcccgtttgtcatatctcaa 31445831  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacac--tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttt 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31445830 aaacagttttacaaatcaaagacattgtacaactagagttgtcatgtcatgtccttcattttt 31445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 374
Target Start/End: Original strand, 43739557 - 43739644
Alignment:
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43739557 tttgtcatgtccctcaaacagttttacaaatcaaacattttacaactgaagttgtcttatcacgtccttcattttttagcaaatcaaa 43739644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 98
Target Start/End: Original strand, 32181161 - 32181213
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaac 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  32181161 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacaatacaagatagaac 32181213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 103
Target Start/End: Original strand, 38520438 - 38520498
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtac 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38520438 gggtgtgtttggtttgcaaaacaactagtattggacagaacagtataagatagaacagtac 38520498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 50729729 - 50729641
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||   ||||| | ||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||    
T  50729729 ttggtttgcaaaatagtaaatactggacggcacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacagaacaaatttttatg 50729641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 2725329 - 2725283
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtata 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2725329 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatata 2725283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10184941 - 10184879
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 164  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  10184941 acaatacaaggtggaacagcacatgacaaacttttatggtattgaacaattttttgtcttata 10184879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 249
Target Start/End: Original strand, 38520518 - 38520580
Alignment:
Q  187 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  38520518 tattttggtattttatacaacttgtgcgtgggacaaaaaattatgctgtggtttggtgaggga 38520580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 46680700 - 46680658
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46680700 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagta 46680658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 33553036 - 33552995
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33553036 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 33552995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Original strand, 40792409 - 40792462
Alignment:
Q  160 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  40792409 ttatacgatttttgatggacaaaaagctatttttgtattttagataacttgtac 40792462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Original strand, 52673762 - 52673815
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 155  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  52673762 acaacacaaggcagaactgcacatgacaaacttttatggtattgaataattttt 52673815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 135
Target Start/End: Original strand, 32081080 - 32081124
Alignment:
Q  91 gatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt 135  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32081080 gatagaacagtacaacataaggtagaacagcacaagacaaatttt 32081124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 378
Target Start/End: Original strand, 38520597 - 38520637
Alignment:
Q  339 tgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38520597 tgttctgtcatgtccttcattcttttagcaaatcaaacgca 38520637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 41720779 - 41720903
Alignment:
Q  104 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttaga 203  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||  |||||||| || |||||| ||||||   ||||||||   ||||||  |||||||||    
T  41720779 aacacaaagtagaacaacacatgacaaactttaatgatattgtataatttttagtcttatactattttttgtggacaaaaaattatttttgtattttaga 41720878  T
Q  204 caacttgtacgtgggatgaaaagtt 228  Q
     || ||||||||||||  |||||||    
T  41720879 taatttgtacgtgggacaaaaagtt 41720903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44365992 - 44365940
Alignment:
Q  312 acaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttttta 364  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44365992 acaaatcagacattgtacaacttgagttgttctgtcatgtacttcatttttta 44365940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 50728088 - 50728048
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacag 85  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50728088 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacag 50728048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 50736102 - 50736062
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacag 85  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50736102 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacag 50736062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 79
Target Start/End: Original strand, 23327803 - 23327842
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggaca 79  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23327803 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtaccggaca 23327842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 172
Target Start/End: Original strand, 32858276 - 32858327
Alignment:
Q  121 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt 172  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32858276 cacatgccaaatttttatagtattgaataattttttgttttatacaattttt 32858327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 39433557 - 39433510
Alignment:
Q  59 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaac 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  39433557 caaaatagtaagtactggacagaacagtgtaagataggacagtacaac 39433510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 245
Target Start/End: Original strand, 43893535 - 43893654
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||  |||||||  ||||||||  |||||||  ||||||||| ||| || ||||| ||  ||||    
T  43893535 gacaactttttatggtattgattttttttttgttttatataatttttggtggacaaaaaactatttttgtattttagataacctgcacgtgagacaaaaa 43893634  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtga 245  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  43893635 attgtgttgtggtttagtga 43893654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 47669297 - 47669219
Alignment:
Q  61 aaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||| |||| | |||||| || |||||| |||||||    
T  47669297 aaacagtaagtattggacagaacaatacaagatggaacaatacaacataaggcaaaacagcgcacgacaaacttttatg 47669219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 323
Target Start/End: Original strand, 51518482 - 51518528
Alignment:
Q  277 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 323  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51518482 ttgcttccagcttgtcctgtatcagaaacagttttacaaatcaaaca 51518528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 185
Target Start/End: Original strand, 36679926 - 36680009
Alignment:
Q  101 tacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg 185  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  36679926 tacaacataaggtagaacaatacatga-atttttttatggtattgatcaatgttttgttttataagatgtttgatggacaaaatg 36680009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 39 - 384
Target Start/End: Original strand, 27103826 - 27104172
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-ta 137  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  27103826 ctaagggtgtgtttgatttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacattacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttta 27103925  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27103926 tggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtgg 27104025  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27104026 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattgaacaactagag 27104125  T
Q  338 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27104126 ttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 27104172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 45446325 - 45446662
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  45446325 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 45446424  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45446425 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 45446524  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45446525 ggtgaggaacaaaaatatgagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgtcgtgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtta 45446624  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45446625 ttttgtcttatccttcattttttagcaaatcaaacgca 45446662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 34062998 - 34063335
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  34062998 agggtgtgtttggtttgcaaaaccgcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagcacaacacatgacaaattttttatgg 34063097  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34063098 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 34063197  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063198 ggcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaagagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 34063297  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063298 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 34063335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 41709647 - 41709984
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  41709647 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaatttttttatgg 41709746  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  41709747 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgttggacaaaaagttgtgctgtggttt 41709846  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41709847 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcatttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 41709946  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41709947 ttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 41709984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32020233 - 32019899
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32020233 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcat 32020134  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  32020133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggt 32020034  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32020033 gagggataaaaatatgagtttttgtcctaccccttgcttccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttc 32019934  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32019933 tgtcctgtccttcaatttttagcaaatcaaacgca 32019899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Original strand, 34101379 - 34101715
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  34101379 gggtgtgtttggtttgcaaaaaagtaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacaggacaaattttttatggc 34101478  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||    
T  34101479 gttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaaaaaaaagttatgttgtggtttg 34101578  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34101579 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtgttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 34101678  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34101679 tctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 34101715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 42 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 31513818 - 31513476
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31513818 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgg 31513719  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  31513718 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacctaggacaaaaagttgtgctgtggttt 31513619  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31513618 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatctacctgaaacaattttacaaatcaaacactggataactagagttg 31513519  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31513518 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 31513476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8673290 - 8672953
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  8673290 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaaatttttatgg 8673191  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8673190 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 8673091  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8673090 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttg 8672991  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8672990 ttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 8672953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 43 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 3251890 - 3251549
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  3251890 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatcggacagaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaattttttatggc 3251791  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  3251790 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggataaaaagttgtgatgtggtttg 3251691  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3251690 gtgagggacaaaaatataagtttttgttctgtcgcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactagagttgt 3251591  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3251590 tctgtcttatcctttattttttagcaaatcaaacgcacccta 3251549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 40 - 386
Target Start/End: Original strand, 6386444 - 6386791
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||    
T  6386444 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaaaacaaattttttat 6386543  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  6386544 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggt 6386643  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6386644 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcttttacctccagtttgtcctatacctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactacagt 6386743  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 386  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6386744 tgttatgttttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaaga 6386791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29672557 - 29672220
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  29672557 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagaactggacagaacaatacaagatagaacagtgcaacacaagacagaacaacacaggacaaatttttcatggc 29672458  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  29672457 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 29672358  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29672357 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacgaatcaaacactggacaactagagttgt 29672258  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttt-tagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29672257 tctgtcttgtccttcatttttaaagcaaatcaaacgca 29672220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 42 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29563461 - 29563158
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29563461 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatgg 29563362  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  29563361 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 29563262  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29563261 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcgagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttg 29563162  T
Q  341 ttct 344  Q
    ||||    
T  29563161 ttct 29563158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 46 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7395045 - 7394706
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |    
T  7395045 tgtgtttggtttgcaaaacagtaggtacttgacagaacaatataagatagaacagtacaacacaagacagaacagcataggacaagttttttatggcact 7394946  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||    
T  7394945 gagtaattttttgttttatgcgatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggtttggtg 7394846  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394845 agggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttgtaaatcaaacactggacaactagagttgttct 7394746  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7394745 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 7394706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 25478118 - 25478450
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||    || ||||||||||    
T  25478118 agggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtacttgacaaaacagtataagatagaacaatacaacacaaggcagaacaggaca----aattttttatggc 25478213  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  25478214 attgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttg 25478313  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25478314 atgagggacaaaaatatgagtttttttcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgt 25478413  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25478414 tatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 25478450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Original strand, 4052404 - 4052687
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4052404 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttt--gttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 4052501  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4052502 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtc 4052601  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4052602 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 4052687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 68 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5969073 - 5968762
Alignment:
Q  68 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacg 166  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5969073 aagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacg 5968974  T
Q  167 atttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttttt 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5968973 atttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaatttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagttttt 5968874  T
Q  267 gtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagc 366  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  5968873 gtcctgtcccttgcctctagtttgtcatgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctatccttcattttttagc 5968774  T
Q  367 aaatcaaacgca 378  Q
    |||| |||||||    
T  5968773 aaattaaacgca 5968762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 45 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13407167 - 13406834
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  13407167 gtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtacaatatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatagcat 13407068  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  13407067 tgagtaattttttgttttatacgatttttggggcacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaaattatgctgtggtttggt 13406968  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13406967 gagggacaaaaatatgagtttttgttctgttccttgcctccagtttgtcatatacctgaaacagttttacaaattaaacactagacaactagagttgttc 13406868  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 377  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13406867 tgccctatccttcattttttagcaaatcaaacgc 13406834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Original strand, 31731935 - 31732257
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31731935 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaaaagtataagatagaacagtacaacacaagacagaatagcacatgacaaaatttttatggc 31732034  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  31732035 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtactgtggtttg 31732134  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31732135 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcaagtttgtc--------------gttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgt 31732220  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31732221 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 31732257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 94 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 30543205 - 30542915
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30543205 agaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaatattttatggcattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttatttt 30543106  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30543105 ggtattttagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtc 30543006  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30543005 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 30542915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37618626 - 37618290
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || | | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37618626 agggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaaaacataacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatgtttatggc 37618527  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  37618526 attgaataattttttgttttatacaatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaaaacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttg 37618427  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37618426 gtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgt 37618327  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37618326 tctgtcatgtccttcattttctagcaaatcaaacgca 37618290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37664466 - 37664180
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37664466 agaacagtacaacacaatgcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagcgacaaaatgctatttt 37664367  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37664366 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtc 37664267  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37664266 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 37664180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 51 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12753550 - 12753226
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12753550 ttggtttgcaaaacag-aagtattggacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaagacagaacaacacatgacaaaaattttatggcattgagta 12753452  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12753451 atttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaa 12753352  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12753351 caaaaatatgagtttttgtcttgtcatttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagtcttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcct 12753252  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12753251 gtccttcattttttagcaaatcaaac 12753226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 102 - 378
Target Start/End: Original strand, 10466995 - 10467271
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10466995 acaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacatagaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatatttta 10467094  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  10467095 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtaccta 10467194  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10467195 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 10467271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 42 - 376
Target Start/End: Original strand, 22999128 - 22999463
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  22999128 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacaatacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacagaacaaatttttatgac 22999227  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||    
T  22999228 attgaataattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttgatattttagacaagttgtacgtgggacaaaaaagttttgctatggttt 22999327  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22999328 gctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaaccggagttg 22999427  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999428 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 22999463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 42 - 375
Target Start/End: Original strand, 40388911 - 40389244
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| | ||| | ||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||||    
T  40388911 agggtgcgtttggtttgcaaaatggtaagtactggacataagagtacaagacataacagcacaacacaaggcagaacaacacaggaaaaaattttatggc 40389010  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40389011 attgaataattttttattttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggcatttaaaacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 40389110  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40389111 gtgagagataaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 40389210  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40389211 tctgtcatgtccttcattttctagcaaatcaaac 40389244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 82 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7591641 - 7591345
Alignment:
Q  82 acagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaa 181  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7591641 acagtacaagaaagaacagtacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaa 7591542  T
Q  182 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  7591541 aatgctattttgatattttagacaacttatacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcc 7591442  T
Q  282 tccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7591441 tccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaaacaaacgca 7591345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 51 - 376
Target Start/End: Original strand, 15001346 - 15001671
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||| ||||| ||    
T  15001346 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagacagaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggtattgaata 15001445  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15001446 attttctgttttatatgatttttgggggacaaa-tgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggga 15001544  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     |||||| | |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  15001545 caaaaatttcagtttttgttctgtctattgcctccagtttgtcctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcct 15001644  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15001645 gtccttcattttttatcaaatcaaacg 15001671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 51 - 383
Target Start/End: Original strand, 39642763 - 39643095
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||| |||||   ||||   |||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  39642763 ttggtttgcaaaatagtaagtattgtacagaatagtacaagaaagaacaacacaatgtaagagagaacatcacaagacaaatttttatgacattgaataa 39642862  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||     
T  39642863 ttttttgttttatacaatttttgggggatgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgggacagaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 39642962  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39642963 aaaaatatcagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttaaaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcatg 39643062  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39643063 tccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 39643095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Original strand, 17805563 - 17805898
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||     
T  17805563 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacaaaacagtacaagacagaataacacaacacaaggtagaacaacacaggacaaattttttagggcaa 17805662  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgag-ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||    
T  17805663 cgagtaattttttgttttatacgatttttgggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaagagttgtgctttggtttgg 17805762  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  17805763 tgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctctagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattagagttggt 17805862  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  17805863 ctgttatgtccttcatttttaaacaaattaaacgca 17805898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 102 - 383
Target Start/End: Original strand, 41548549 - 41548830
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41548549 acaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatatttta 41548648  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  41548649 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtctgctgaggtacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcatgtatctg 41548748  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41548749 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaattaaacgcacccta 41548830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 38 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14005268 - 14004943
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt- 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||               |||||||||  |||||| || | |||||||||||     
T  14005268 tctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta---------------caacacaagacagaacaacataggacaaatttttt 14005184  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  14005183 atgacattgagtaattttttgttttatacaattttttatggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 14005084  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 336  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14005083 gtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctcaaacagttttacaaatcaaatactggacaactaaa 14004984  T
Q  337 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 377  Q
     ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14004983 attgttatgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgc 14004943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 40 - 385
Target Start/End: Original strand, 35225531 - 35225876
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||   ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  35225531 taaggatgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaatagtacaagacaggacaacacaacacaagacagaacaacacaagacaaatttttatg 35225630  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    | ||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||    
T  35225631 gtattgaataatttcctgttttatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttgtgacaaaaagttgtgatgtggtt 35225730  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    ||| |||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35225731 tggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaaccaaacactggacaactggagtt 35225830  T
Q  340 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35225831 gttctgtcctatccttcattttttatcaaatcaaacgcaccctaag 35225876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Original strand, 45113929 - 45114262
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  45113929 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagatagagcagcacaacacaaggcataacaacacatgataaatttgtatgacatt 45114028  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  45114029 gaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacctatgacaaaaagttgtactgtggtttggtg 45114128  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||  |    
T  45114129 agggacaaaaatatgagtttttgtcctctcccttgcatctcgtttgttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattgaagttgtcat 45114228  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45114229 gtcctgtccttcatgttttagcaaatcaaacgca 45114262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 30501016 - 30501352
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||  || |||| |||| || |||| |||| |||||   |||||| |||  | |||| || | |||||||||||||| |    
T  30501016 agggtgcgtttggtttgcaaaacaacaaatacttgacataatagtacaagacagaacaacacaacataagacaaaacaccataggacaaatttttatgac 30501115  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30501116 attgaataattttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 30501215  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  30501216 gtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgggcaactgaagttgt 30501315  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30501316 tctgccatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 30501352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32303819 - 32303592
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32303819 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 32303720  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  32303719 attgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 32303620  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtc 269  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32303619 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtc 32303592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 102 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29611229 - 29610953
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||    
T  29611229 acaacacaaggcataacaacacaggacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgctattttggtgtttta 29611130  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29611129 gacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgttctgtccctg 29611030  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29611029 aaacagttttacaaatcaaacattggacaactgaagttgttctgtcatgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 29610953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 383
Target Start/End: Original strand, 37474599 - 37474912
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | | | ||||| |||| ||||| | |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37474599 ttggtttgcaaaacagcaagtacagcatatagcagtacaagaaagaacagcacaatacaagggataacagcacatgacaaatttttatgacattgaataa 37474698  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | |||| |||| |||| |||||||||||||||||||                   ||||||||| |||||||     
T  37474699 ttttttattttatacgatttttggggaaaaaaacgctagtttggtattttagacaacttgtac-------------------tgtggtttgctgagggac 37474779  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  37474780 aaaaatataagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcata 37474879  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37474880 tccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 37474912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 37861866 - 37862065
Alignment:
Q  178 acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  37861866 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttatgatgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcact 37861965  T
Q  278 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37861966 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttactaatcaaacattgaacaactagagttg-tatgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 37862064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 375
Target Start/End: Original strand, 17520468 - 17520798
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtata-----agatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     ||| ||||    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  17520468 gggtgtggttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagaacagaagaagacagaataacacaacacaagacagaacagtacaggacaaattttta 17520567  T
Q  138 tggcattgagtaatttttt--gttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 235  Q
    | || |||  | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  17520568 tagcgttggattattttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg--------gacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgt 17520659  T
Q  236 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 335  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| || || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17520660 ggtttggtgagggacaaaa-tataagtttttgccctgtcccttgcctccattttatcatgcacctaaaacacttttacaaatcaaacaccggacaactgg 17520758  T
Q  336 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17520759 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaattaaac 17520798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 109 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16485976 - 16485707
Alignment:
Q  109 aaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 208  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  16485976 aaggcagaacagcacaaaacaaatttttatggtattgaataattttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagaaaact 16485877  T
Q  209 tgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagt 308  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||  ||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||  |    
T  16485876 tatacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgttctgtcctttgccttcaatttgtcatgtccctgaaactat 16485777  T
Q  309 tttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16485776 tttacaaatcaaacactggacaactgaaattgttctatcatgtccttcattctttatcaaatcaaacgca 16485707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 124 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10656838 - 10656587
Alignment:
Q  124 atgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaa 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  10656838 atgacaaatttttatgttattgaataattttttcttttatacgattttttgtggacaaattgttattttgatattttagacaatttgtacgtgagacaaa 10656739  T
Q  224 aagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 323  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| |||||  | |||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||  || ||| || ||||||||||||| |    
T  10656738 aagttgtgttgtggttttgtgaaggacaaaaaattcagtttttgtcctgtcttttgcctctagtttgtcatgtctctaaaaaagatttacaaatcaaata 10656639  T
Q  324 ctggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10656638 ctggacaattgaggttgttctgacatgtccttcattttttagcaaatcaaac 10656587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16595369 - 16595063
Alignment:
Q  56 ttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 155  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||| |||| || | ||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  16595369 ttgctaaacagtatgtactggacagaacagtataagacagaacaacaaaacacaaggcagaaaagtaaatggcaaacttttttggtattgaataattttt 16595270  T
Q  156 tgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaa 255  Q
     || ||||||||||||||  | |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| || | |||||| ||||     
T  16595269 ggtcttatacgatttttggtgaacaaaaagctatttttgtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattagcgagggacaaaac 16595170  T
Q  256 tatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcctt 355  Q
    |    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||| |  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16595169 ttcatgtttttgtcctgtcccttgcctacagtttgttctgtcccagaaaca-atttacaaatcaaacaatatacaactggtgttgtcctgtcatgtcctt 16595071  T
Q  356 catttttt 363  Q
    ||||||||    
T  16595070 catttttt 16595063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 163 - 378
Target Start/End: Original strand, 21272676 - 21272874
Alignment:
Q  163 tacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagt 262  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21272676 tacgatttttaaaggacaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagt 21272775  T
Q  263 ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttt 362  Q
    ||||||| ||||                  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| ||    
T  21272776 ttttgtcctgtc-----------------gctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctctcgtgtcattcattctt 21272858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10320424 - 10320180
Alignment:
Q  129 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagtt 228  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  10320424 aaatttttatggtattgaataatttttggttttatacgattgttgttagacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgtggtaaaaagtt 10320325  T
Q  229 gtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 328  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||| |   |||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |  |    
T  10320324 gtgttgtggtttggtgagggataagaatttctgttttt-tttcgtcccttg-ctcaagtttgtcatgtccctaaaacggttttacaaatcaaacattata 10320227  T
Q  329 caactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||| || ||||| || || |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  10320226 caacttgaattgttttg-cacggtcttcatttttttagcaaatcaaac 10320180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 378
Target Start/End: Original strand, 6460152 - 6460465
Alignment:
Q  60 aaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgtt 159  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| | || | ||| | ||| |||| || |||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||     
T  6460152 aaaacagtaagtacttgacaaaacagtacaggacaaaacagcacagcacagggcagagtagcacaggacaaatttttatggtattgaataatttt--gtc 6460249  T
Q  160 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatat 258  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||| || |||         
T  6460250 ttatacgattttttatggacaaaatgttattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagagacaaa----- 6460344  T
Q  259 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttac-aaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca 357  Q
       |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||| || |||||| | ||| |  |||| | |||||||    
T  6460345 ---tttttgtcttgtcccttgcctccagattgtcatgtctctaaaacagctttacaaaatcaaacaatgtacaacttgggttatcatgtcttatccttca 6460441  T
Q  358 ---ttttttagcaaatcaaacgca 378  Q
       |||||||||||||||||||||    
T  6460442 tttttttttagcaaatcaaacgca 6460465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 287 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 32303597 - 32303501
Alignment:
Q  287 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32303597 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgttctatcatttccttcgttttttagcaaatcaaacgcacccta 32303501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 306 - 384
Target Start/End: Original strand, 38047481 - 38047559
Alignment:
Q  306 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38047481 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 38047559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27109735 - 27109532
Alignment:
Q  84 agtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttttt--gttttatacgatttttgagggacaa 181  Q
    |||| ||||||||||   |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |    
T  27109735 agtacaagatagaacaacacaatacaatgcagaacggtacaggacaaattttaatagcattgaataattttttttgttttatatgatttttgggggacga 27109636  T
Q  182 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 281  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  27109635 aatgttattttggtattttaaacaatttgtacgcgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaaggaacaaaaatatctgattttatcatgtcccttgcc 27109536  T
Q  282 tcca 285  Q
    ||||    
T  27109535 tcca 27109532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22756501 - 22756307
Alignment:
Q  186 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 285  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||| |||||| |  |||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||| |    
T  22756501 ctatttttgtattttagataacttgtacgtgatacaaaaagttgtgttgtggtataatgagggataaaaatttatgtttttgtcttgtctcttgcctcaa 22756402  T
Q  286 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  22756401 atttgtcctatcccagaaacagttttacaaatcaaacattgtataactggagttgtt-----ttgtccttcattttttagcagatcaaacacaccctaag 22756307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 375
Target Start/End: Original strand, 10932691 - 10932940
Alignment:
Q  126 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 225  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||  |  ||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||    
T  10932691 gacaaatttgtatggtattgaataatttttggtcttataaaaaattttatggacaaaagactattttggtattttagacaaattgtacgtggaactaaaa 10932790  T
Q  226 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 325  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||     
T  10932791 gttgtgatgtggtttagtgaggga-caaaattttagtttttatcatgtctcttgcctctactttgtcttgtcccataaacaattttataaatcaaacacc 10932889  T
Q  326 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaac 375  Q
      ||||||  |||||||  ||| ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  10932890 atacaactgaagttgtttggtcttgtcctttatttttttagtaaatcaaac 10932940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 323
Target Start/End: Original strand, 54117 - 54322
Alignment:
Q  117 acagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 216  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||| |||||  ||||||| |||||| || |||||||| |||    
T  54117 acagcacaagataaacttttatggtattgaataattttttgtcttaaacgattttttgtggataaaatattattttg-tattttcgataacttgtatgtg 54215  T
Q  217 ggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaa 316  Q
    |||  |||||||||| |||||||| |  | ||| |||||| |  |||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  54216 ggacaaaaagttgtgatgtggtttagcaaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtcccttgtgtccggattgtcatgtctcagaaacagttttacaaa 54315  T
Q  317 tcaaaca 323  Q
    |||||||    
T  54316 tcaaaca 54322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 135
Target Start/End: Original strand, 21272592 - 21272676
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt 135  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  21272592 ttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacaatacaagatagatcagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaatttt 21272676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 37861803 - 37861865
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagtaattttt 155  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37861803 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttt 37861865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 37861766 - 37861865
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatgg 140  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  37861766 agggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaaca---------------gtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 37861850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 955173 - 955102
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaag 111  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  955173 taagagtgtgtttggtttacaaaacagcaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaag 955102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 363
Target Start/End: Original strand, 10531244 - 10531472
Alignment:
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||   ||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||| |||||||||  | ||    
T  10531244 atggtattgaataattttttatcttataagattttttatggacaaaagattattttggtattctaaacaatttgtatgtgagataaaaagttgtattttg 10531343  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga--aacagttttacaaatcaaacactggacaacta 334  Q
    |||| |||||| | || ||| | ||||||| |||||||  |||| ||| ||||||| | | ||  |  || |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  10531344 gtttagtgaggaacaagaatttcagtttttatcatgtcttttgcatccggtttgtcatatgcccaataaatagttctacaaatcaaacattgtacaacta 10531443  T
Q  335 gagttgttctgtcatgtccttcatttttt 363  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||    
T  10531444 gagttgttttgtcttgtacttaatttttt 10531472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36426347 - 36426201
Alignment:
Q  176 ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc 275  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||| || |  || |||| | | |||||||||| | |||    
T  36426347 ggacaaaagactattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagatgtgttgtggtttagtaaatgacaaaatttttagtttttgtcttatcc 36426248  T
Q  276 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 324  Q
    |||||||| || ||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  36426247 cttgcctcaagattgtcgtgt--ctgaaccaattttacaaatcaaacac 36426201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 211
Target Start/End: Original strand, 32918842 - 32918925
Alignment:
Q  128 caaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgt 211  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  32918842 caaatttttatgacattaaataattttttgttttatacaattttggggggacgaaatgctattttggtattaaaaacaacttgt 32918925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 331
Target Start/End: Original strand, 11944854 - 11945035
Alignment:
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||| |||||| || ||  |||||||||  |||||||| ||| || |    
T  11944854 atttttagtcttatacaatttttgaggcaaaaaagactattttggtattttagacaaattgtacatgagacaaaaagttgtagtgtggtttagtggggaa 11944953  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
      | | | |||||||||   ||||| |||||||| |||||||| | | | | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  11944954 ctagagtttgagtttttactatgtctcttgcctctagtttgtcatctccataaaacaattttacatatcaaacactgtacaa 11945035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Original strand, 28746254 - 28746367
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  | || |||||||||||  | |||||||  ||||||| |||||||    
T  28746254 acaacataagataaaacagcacatgataaatttttatgacattgaataatttttgatcttgtacgatttttggtgaacaaaattttattttggtatttta 28746353  T
Q  202 gacaacttgtacgt 215  Q
     | | |||||||||    
T  28746354 aatagcttgtacgt 28746367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Original strand, 4052368 - 4052412
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4052368 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 4052412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 240
Target Start/End: Original strand, 14958948 - 14959027
Alignment:
Q  160 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  14958948 ttatacgattttttgtgggcaaaaagttattttgatattttagaca-cttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 14959027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Original strand, 15351820 - 15351900
Alignment:
Q  298 cctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  15351820 cctgaaacaattttacaaatcaaacacggcataactgtagttgttctgttacatcattcattttttagcaaatgaaacgca 15351900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5859632 - 5859533
Alignment:
Q  116 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 215  Q
    |||| ||||| | ||| |||||| | ||||| ||||| || || ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  5859632 aacatcacataagaaacttttattgtattgattaattattggtcttataagattttttatggacaaaatactattttagtattttagataacttgtacgt 5859533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 172
Target Start/End: Original strand, 9624180 - 9624239
Alignment:
Q  114 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa-ttttttgttttatacgattttt 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  9624180 agaacaacacatgacaaatttttatggtattgaataatttttttgtcttatacaattttt 9624239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11926956 - 11926893
Alignment:
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11926956 atttttagtcttatacaatttttgaggcacaaaagactattttggtattttagacaaattgtac 11926893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 212
Target Start/End: Original strand, 15351686 - 15351776
Alignment:
Q  121 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||   ||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15351686 cacatgataaatttttatgatattgaataattttga-ttttatacgatttttggttgataaaatgttattttggtattttagacaatttgta 15351776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 30543239 - 30543197
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30543239 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtattggacagaacagta 30543197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 37664499 - 37664458
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37664499 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagcactggacagaacagta 37664458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 352
Target Start/End: Original strand, 9624310 - 9624397
Alignment:
Q  264 tttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtc 352  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||| || ||||||  ||||||  |||||||||    
T  9624310 tttgtcatgtctcttgtctcccgtttgtcttgtcccagaaacaattttacaaat-aaacagtgtacaactgaagttgtcatgtcatgtc 9624397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 51 - 383
Target Start/End: Original strand, 11963220 - 11963553
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11963220 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaagcagaataacacatgacaaattttttatggcattgagta 11963319  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11963320 attttgtattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgcacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 11963419  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11963420 caaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcct 11963519  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11963520 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 11963553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 32528585 - 32528922
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32528585 agggtgtgtttgatttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 32528684  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  32528685 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 32528784  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32528785 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttg 32528884  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32528885 tcctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 32528922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 40 - 375
Target Start/End: Original strand, 7523039 - 7523376
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7523039 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaggaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 7523138  T
Q  139 ggcattgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  7523139 gacattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtgg 7523238  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7523239 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaa 7523338  T
Q  338 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7523339 ttgttctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaac 7523376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 35701147 - 35701484
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||    
T  35701147 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaataacacaggacaaattttttatgg 35701246  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||    
T  35701247 caatgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttatgttgtggttt 35701346  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701347 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 35701446  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701447 ttctatcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 35701484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Original strand, 2351552 - 2351893
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  2351552 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggataaattttttatggca 2351651  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2351652 ttgagtaattttttgttttgtacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 2351751  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2351752 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctataccttaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgtc 2351851  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2351852 ctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 2351893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31770782 - 31770479
Alignment:
Q  77 acagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgag 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31770782 acagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgag 31770683  T
Q  176 ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31770682 ggacaaaatgctattttggtatttcagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcc 31770583  T
Q  276 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31770582 cttgcctccagtttgtcttgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttatgtcatgtcctttattttttagcaaatcaaac 31770483  T
Q  376 gcaa 379  Q
    ||||    
T  31770482 gcaa 31770479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 51 - 389
Target Start/End: Original strand, 34794766 - 34795105
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta-tggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  34794766 ttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgataaattttttgtggcattgaata 34794865  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  34794866 attttttgttttatacgaattttggggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggga 34794965  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34794966 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatattggacaactagagttgttctgtcat 34795065  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaatg 389  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  34795066 gtccttcattttttaacaaatcaaacgcaccctaataatg 34795105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 38 - 378
Target Start/End: Original strand, 39918374 - 39918714
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-tttt 136  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  39918374 tctatgggtgtgtttggtttgcaat-cagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacaggacaaatatttt 39918472  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  39918473 atagtattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtg 39918572  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 336  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39918573 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 39918672  T
Q  337 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39918673 gttgtcttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 39918714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24181835 - 24181513
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24181835 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 24181751  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24181750 cattgagtaatttgttgttttatacgatctttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttatgctgtggttt 24181651  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181650 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttggctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 24181551  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181550 ttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 24181513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 41790688 - 41790342
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatgg 140  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41790688 agggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtataaaatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatgg 41790589  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  41790588 cattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttagtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggttt 41790489  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  41790488 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtttattgcctccagtttgtcctgta-ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 41790390  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 388  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  41790389 ttctgtcctgtctttcattttttagcgaatcaaatgcatcctaagaat 41790342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 94 - 384
Target Start/End: Original strand, 41459511 - 41459801
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta-tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41459511 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaggacaaaaatttaatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 41459610  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41459611 gatattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctctggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt-tcttgtcccttgcctccagtttgtc 41459709  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41459710 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactaaacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 41459801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Original strand, 29241300 - 29241585
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29241300 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 29241399  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  29241400 gatattttagccaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaatatgagcttttggcctgtcccttgcctccaatttgtc 29241499  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29241500 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctggcctggccttcattttttagcaaatcaaacgca 29241585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 43 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21739381 - 21739093
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||    || |||||||||||    
T  21739381 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacaatataagatagaacagtacaacacaagacagaacaggaca----aattttttatggca 21739286  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21739285 ttgtgtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 21739186  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739185 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 21739093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6284524 - 6284189
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  6284524 gggtgtgtttgatttacaaaacagcaagtactggacagaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagtacagcacaagacaaattttttatggc 6284425  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt-gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  6284424 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttttggtattttggacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 6284325  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6284324 ggtgagggacaaaaaaataagtttttgtcctgtcccatgcctccagtttgtcctgtacctgaagcagttttacaaatcaaacactggacaactaaagtta 6284225  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6284224 ttc--tcccgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 6284189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 43 - 383
Target Start/End: Original strand, 8136710 - 8137049
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  8136710 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacagaatagtacaagatagaacagtacaacacaaggcataacaacacaggacaatttttttatggc 8136809  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||    
T  8136810 attgagtaatgttttgttttatactattttttggggacaa--tgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttg 8136907  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8136908 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaaacaaacactggacaactagagttgt 8137007  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8137008 tctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 8137049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Original strand, 3735237 - 3735564
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||  | |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||    
T  3735237 ttggtttgcaaaacagcaggtactgtacagaacagtacaagaaagaatagcacaatacaagggagaacagcataggacaaatttttatgacattgaataa 3735336  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  3735337 ttttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatggac 3735436  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3735437 aaaaatatcagtttttgtcctgtccattgcctccattttgtcatgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatg 3735536  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3735537 ttcttcattttttagcaaatcaaacgca 3735564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 44 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4818364 - 4818085
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  4818364 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtgcaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggca 4818265  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4818264 ttgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 4818165  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4818164 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgttccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 4818085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7770495 - 7770168
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||   ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  7770495 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacataatcgtacaagacagaacaacacaacacaagacagaatagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 7770396  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  7770395 ttttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggac 7770296  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7770295 aaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcatg 7770196  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7770195 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 7770168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 42 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4689923 - 4689589
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||   |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4689923 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtaatggacataacagtacaagacagaacaacacaacataaggcagaacaacacatgacaaatttttatgac 4689824  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  4689823 attgaataattttttgttttatacgacttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 4689724  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4689723 gtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 4689624  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689623 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 4689589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 43 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22493643 - 22493322
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||| ||||    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  22493643 gggtgtgtttggttcgcaaaacaacaagtattggacagaacagtgcaagacagaataacacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatggc 22493544  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  22493543 aatgagtaattttttgttttatacgatttttgcgg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttg 22493445  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22493444 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttggctccagtttatcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgt 22493345  T
Q  342 tctgtcatgtccttcatttttta 364  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  22493344 tctgtcctgtccttcatttttta 22493322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Original strand, 31644318 - 31644659
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | |||| |  |||||||||| |||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  31644318 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcatgtacagtgcagaacagtacaaga-agaatagcacaatacaaggtagaacaacacaagacaaatttttatgac 31644416  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31644417 attgaataattttatgttttatatgatttttaggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 31644516  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31644517 gtgagggacaaaaatatgagtatttgtcttg-ctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 31644615  T
Q  342 tctgtcatgtccttcatttttt-agcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31644616 tctgtcccgtccttcattttttaagcaaatcaaacgcaccctaa 31644659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Original strand, 24036105 - 24036436
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||| | |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  24036105 ggtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactgtactgaacagtacaagacagaacagcacaacataagacagaacaacacatgacaaattttt--gacat 24036202  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24036203 tgaataattttttgttttatacgatttttggggtgcaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggt 24036302  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||     
T  24036303 gagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctgtacctgaaacagttttccaaatcaaacactggacaacttgaattgttt 24036402  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24036403 tgtcctgt-cttcattttttagcaaatcaaacgca 24036436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 94 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 31880250 - 31879960
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31880250 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatgacattgaataattttttgtattatacgattgttgggggacaaaatgctatttt 31880151  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31880150 ggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtc 31880051  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31880050 ctgtacctgaaacagttttactaatcaaacactgaacaactagagttgttatatcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 31879960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 94 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7208404 - 7208112
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| |||||| |||||   |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7208404 agaacagtacaatacaagacggaacagcacgggacaaatattttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctatttt 7208305  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  7208304 ggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttggttctgtctcttgcatccagtttgtc 7208205  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7208204 ccgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcaccctaag 7208112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 67 - 378
Target Start/End: Original strand, 40489232 - 40489543
Alignment:
Q  67 taagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatac 165  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| || | ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40489232 taagtattggacagaatagtacaagattgaacagtacaacataaagcagaacaatgcatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatac 40489331  T
Q  166 gatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttt 265  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40489332 aatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttt 40489431  T
Q  266 tgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttag 365  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  40489432 tgtcccgtcccttgcctccagtttgtcttctacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattagagttattctgtcctgtcctt-attttttag 40489530  T
Q  366 caaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||    
T  40489531 caaatcaaacgca 40489543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Original strand, 39788114 - 39788400
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattt 191  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  39788114 agaacagtacaacataatgcagaacagcacatgacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaaatgttattt 39788213  T
Q  192 tgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgt 291  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  39788214 tagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctacagtttgt 39788313  T
Q  292 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39788314 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagaattgttctgtcctgtcctttattttttaacaaatcaaacgca 39788400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23091478 - 23091193
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattt-ttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23091478 agaacagtacaacacaagatagaacaacacaagacaaatttcttatggcattgagtaatgttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 23091379  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  23091378 gatattttagacaatttatacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgatgacggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttatc 23091279  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23091278 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacttgagtagttatatcttgtcattcattttttagcaaatcaaacgca 23091193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 51 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18470644 - 18470321
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||| | |||| |||||  | |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  18470644 ttggtttgcaaaatagtaagtactggacagcacagtataatgcagaacagcacaatacaagacataacagcacagaacaaatttttatggtattgaataa 18470545  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  18470544 tttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtaagggac 18470445  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  18470444 aaaaatttcagtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtcttg 18470345  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  18470344 tccttcattttttaacaaatcaaa 18470321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7726036 - 7725702
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||   |||||||||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  7726036 taagggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactagacataacagtacaagacagtacatcacaacacaaggtagaatagtataggacaaatttttatg 7725937  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg-atattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  7725936 gaattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggatattt-agacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 7725838  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  7725837 ttaatgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgttctgcacctgaaacaattttactaatcaaacactggacaactgaagt 7725738  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7725737 tgttttgtcctgtccttaattttttagcaaatcaaa 7725702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28090726 - 28090461
Alignment:
Q  60 aaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgt 158  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  28090726 aaaacattaagtattggacagaaca--ataagatagaacagtacaactcacggcagaacagtacaggacaaattttttatattattgagtaattttttgt 28090629  T
Q  159 tttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28090628 tttatacgatttttgagggacaaaatgttatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggtgagggacaaaaatat 28090529  T
Q  259 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28090528 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgccttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 28090461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 133 - 375
Target Start/End: Original strand, 553358 - 553601
Alignment:
Q  133 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  553358 ttttatggcattgaataattttatgttttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 553457  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  553458 ttgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttataaatcaaacactagacaa 553557  T
Q  332 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
     || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  553558 ttaaagttgttctgtcatattcttcattttttagcaaatcaaac 553601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 104 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5571806 - 5571546
Alignment:
Q  104 aacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 202  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  5571806 aacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaa--tgctattttggtattttag 5571709  T
Q  203 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 302  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5571708 acaacttgtacgttggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg- 5571610  T
Q  303 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
                |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5571609 ------------aatcaaacactggacaactagagttgttttgttttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 5571546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8561126 - 8560871
Alignment:
Q  122 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |      
T  8561126 acatgacaaatttttatggcattgattaattttttgttttatacgatttttg-gggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacctggaaca 8561028  T
Q  222 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8561027 aaaagttgtgatgtggtttggtgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgctttcagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaa 8560928  T
Q  322 cactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| | ||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8560927 cactgaataactgaagttgttatgtcacgtccttcgttttttagcaaatcaaacgca 8560871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 65 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32093183 - 32092874
Alignment:
Q  65 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 164  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||   | ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||  | |||| |||||||||    
T  32093183 agtaagtactggacagaacagtaagagacagaacaacataacacaaggcagaacagcacaacacaaatttttatggtattgaaaatttttatgttttata 32093084  T
Q  165 cgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttt 264  Q
      ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||    
T  32093083 taatttttgggggacgaaatgctattttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtga-ggacaaaaatttcagttt 32092985  T
Q  265 ttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttttta 364  Q
    ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32092984 ttgtcctatcctttgcctccaatttgtcctgttcctgaaacaattttacaaatcaaacactgcacaactggagttgttctgtcttgtccttcatttttta 32092885  T
Q  365 gcaaatcaaac 375  Q
      |||||||||    
T  32092884 taaaatcaaac 32092874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 71 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 700798 - 700513
Alignment:
Q  71 tactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatt 169  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  700798 tactggacataacagtacaagacaaaataatacaacacaaggtagaacagcacatgacaaaatttttatggcaatgagtaattttttgttttatatgatt 700699  T
Q  170 tttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtc 269  Q
    || | ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||     
T  700698 ttcgggggacaaaataatattttggtattttagataacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaacaaaaatatgaatttttgtt 700599  T
Q  270 atgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcctt 355  Q
     ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  700598 ttgtcccttgtctcttgtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaatcattgaacaactagagttgttttgtcatgtcctt 700513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Original strand, 5673018 - 5673329
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcatt 144  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||| || | ||||||| |||||||||| |    
T  5673018 tgtgtttggtttacaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatataacagcacaacacaaggcataacatcaaaggacaaatattttatggcaat 5673117  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  5673118 gagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 5673212  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||         ||||||||||||    ||||||||||||||| |    
T  5673213 agggacaaaaatatgagtttttgacttgtcccttgcctccagtttatcgtgtacctga---------acaaatcaaacatcaaacaactagagttgttat 5673303  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaat 370  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5673304 gtcttgtccttcattttttagcaaat 5673329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37148790 - 37148478
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  37148790 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtataatacagaacagcacaacacaaggtataacagcacaggacaaatttttatggtattgaataa 37148691  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||| || |||||||   |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||               |||||||| |||||||||||||| |     
T  37148690 tttcttattttatattctttttgggggacgaaatgctattttggtgttttagacaactt---------------agttgtgccgtggtttggtgaggaac 37148606  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||     
T  37148605 aaaaatttcagtttttgtcccgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacaattgacaactggagttgttctgtcata 37148506  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37148505 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 37148478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 263
Target Start/End: Original strand, 40182335 - 40182556
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  40182335 gggtgtgtttggtttccaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagaaagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacatgacaaattttttatggc 40182434  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  40182435 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 40182534  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtt 263  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  40182535 gtgagggacaaaaatataagtt 40182556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27839180 - 27838951
Alignment:
Q  160 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatg 259  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |     
T  27839180 ttatacgatttttggaggacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgttttatggtttggtgagggacaaaaattta 27839081  T
Q  260 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 359  Q
     |||||  || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27839080 tgtttta-tcctgtccattgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcatt 27838982  T
Q  360 ttttagcaaatcaaacgcaacctaagaatga 390  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  27838981 ttttaacaaatcaaacgcaccctaaggatga 27838951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22432471 - 22432243
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |   ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22432471 acaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttatatgattgatt---ttttttttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttta 22432375  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    |||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22432374 gacaacttgtacttgagacaaaaaattgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttatcctgaacctg 22432275  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22432274 aaacagttttacaaatcaaacataggacaact 22432243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 175 - 378
Target Start/End: Original strand, 5598484 - 5598687
Alignment:
Q  175 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 274  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||| | ||    
T  5598484 gggacgaaatgttattttgatattttagacaagttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgttgtttgatgaaggacaaaaatatctgtttttgtcctctc 5598583  T
Q  275 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5598584 ccttgcctccagtttgtctcgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaacttgagttgttctgttctgtgcttcattttttagcaaatcaaa 5598683  T
Q  375 cgca 378  Q
    ||||    
T  5598684 cgca 5598687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 263 - 378
Target Start/End: Original strand, 4664923 - 4665038
Alignment:
Q  263 ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttt 362  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4664923 ttttgtcatgtcccttgcctcctgtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtcatgtccttcattttt 4665022  T
Q  363 tagcaaatcaaacgca 378  Q
     | |||||||||||||    
T  4665023 aatcaaatcaaacgca 4665038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 364
Target Start/End: Original strand, 17031134 - 17031350
Alignment:
Q  148 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 247  Q
    |||||||| || ||||| |||||||   |||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||    
T  17031134 taatttttggtcttatatgattttttgtggacaaaaagctatttttgtattttaaataacttgtacgtgggacgaaaagttgtgctgtgatttaatgagg 17031233  T
Q  248 gataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 347  Q
    |  |||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||  ||||    
T  17031234 ggcaaaaatttatgtttttgtcctgtcctttgcctccaatttgtactgtccctgaaacagttttacaaatcaaacattatacaagtggagttgtgttgtc 17031333  T
Q  348 atgtccttcatttttta 364  Q
     ||||||||||||||||    
T  17031334 ttgtccttcatttttta 17031350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 175
Target Start/End: Original strand, 20119642 - 20119777
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||    
T  20119642 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagcacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttaatagca 20119741  T
Q  143 ttgagtaa---ttttttgttttatacgatttttgag 175  Q
    |||| |||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  20119742 ttgaataatatttgtttgttttatatgatttttgag 20119777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 119
Target Start/End: Original strand, 548218 - 548295
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  548218 agggtgtgtttggtttgcaaaacattaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaaca 548295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Original strand, 32313713 - 32313850
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 145  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||| |||||   | ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  32313713 tgtgtttgatttgctaaacaataagtacttgacataaaagtataagacagaacaacataacacaagacagaacaacacatgacaaatttgtatagtattg 32313812  T
Q  146 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa 183  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||    
T  32313813 attaatttttgatcttatacgatttttgctggacaaaa 32313850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 378
Target Start/End: Original strand, 40182553 - 40182595
Alignment:
Q  336 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40182553 agttgttctgtcatttccttcattttttagcaaatcaaacgca 40182595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 212
Target Start/End: Original strand, 1338601 - 1338661
Alignment:
Q  152 tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1338601 tttttgttatatacgatatttgatggacaaaaaattattttgatattttagacaacttgta 1338661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Original strand, 29241264 - 29241308
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29241264 gggtgtgcttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 29241308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 31880286 - 31880242
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31880286 gggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 31880242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29788618 - 29788507
Alignment:
Q  105 acacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagac 204  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||  || |||||| |||||||   ||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  29788618 acacaagatagaacaacacatgataaacttttatggtattgaatagtttt--gtcttatacaatttttggttgatcaaatgttattttaatattttagac 29788521  T
Q  205 aacttgtacgtggg 218  Q
    |||||| |||||||    
T  29788520 aacttgaacgtggg 29788507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7208441 - 7208396
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7208441 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagta 7208396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21739053 - 21739019
Alignment:
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739053 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 21739019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 322
Target Start/End: Original strand, 35955088 - 35955150
Alignment:
Q  260 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 322  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||    
T  35955088 agtttttgtcttgtctcatgcctccagtttgtcatgtctttgaaacaattttacaaatcaaac 35955150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 42 - 375
Target Start/End: Original strand, 2614766 - 2615100
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2614766 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgg 2614865  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2614866 cattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 2614965  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2614966 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacagtggacaactagagttg 2615065  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2615066 ttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaac 2615100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 39 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15277199 - 15276853
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-tttta 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||    
T  15277199 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgacaaaaatttta 15277100  T
Q  138 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  15277099 tggcattgagtaattttttgttttataagatttttgagggacaaaatgctattttgttcttttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtgg 15277000  T
Q  238 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15276999 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattagacaactagag 15276900  T
Q  338 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15276899 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaatgcaccctaa 15276853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 42 - 383
Target Start/End: Original strand, 3259548 - 3259895
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgac------aaatttt 135  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||      || ||||    
T  3259548 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaggattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacatgacaaattttt 3259647  T
Q  136 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3259648 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgt 3259747  T
Q  236 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259748 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 3259847  T
Q  336 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3259848 agttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcatccta 3259895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 51 - 385
Target Start/End: Original strand, 17867714 - 17868049
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17867714 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaacatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagta 17867813  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17867814 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgaggga 17867913  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17867914 caaaaatatgagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctagagttgttctgtcct 17868013  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17868014 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 17868049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 51 - 385
Target Start/End: Original strand, 17877497 - 17877832
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17877497 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaacatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagta 17877596  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17877597 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgaggga 17877696  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17877697 caaaaatatgagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctagagttgttctgtcct 17877796  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17877797 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 17877832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 55 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32410098 - 32409774
Alignment:
Q  55 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattt 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  32410098 tttgcaaaacagtaaatactagacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgaataattt 32409999  T
Q  154 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32409998 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtgagtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaa 32409899  T
Q  254 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcc 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32409898 aatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttattctgtcatgtcc 32409799  T
Q  354 ttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32409798 ttcattttttagcaaatcaaacgca 32409774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Original strand, 24203236 - 24203569
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24203236 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacatgatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggcat 24203335  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24203336 tgagtaattttttgttttatacaatttt-gagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 24203434  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24203435 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttgttc 24203534  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24203535 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 24203569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 51 - 350
Target Start/End: Original strand, 24242543 - 24242843
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  24242543 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagataaaagagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagta 24242642  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24242643 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggga 24242742  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24242743 caaaaatatgagtttttgttgtgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 24242842  T
Q  350 g 350  Q
    |    
T  24242843 g 24242843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 59 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15277522 - 15277195
Alignment:
Q  59 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  15277522 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggtaaaacaacacagaacaaattttttatagcattgagtaatttgttg 15277423  T
Q  158 ttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 257  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15277422 ttttatacgatttttggaagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 15277323  T
Q  258 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca 357  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  15277322 tgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaccttaaacaattttacaaatcaaacactggacaaatagagttgttttgtcttgtctttca 15277223  T
Q  358 ttttttagcaaatcaaacgcaacctaag 385  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15277222 ttttttagcaaatcaaacgcaccctaag 15277195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 43 - 376
Target Start/End: Original strand, 10959872 - 10960205
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||   ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10959872 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacagtacaagacagaacatcacagcacaaggcagaacaacacatgacaaatttttatggca 10959971  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||     
T  10959972 ttgaatgatattttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgt 10960071  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10960072 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgtt 10960171  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10960172 ctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacg 10960205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 46 - 378
Target Start/End: Original strand, 11212131 - 11212464
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcatt 144  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  11212131 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatgttttatggcctt 11212230  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||| || ||||||||||||    
T  11212231 gagtaattttttgttttattcgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgcacgtgagacaaaaggttatgttgtggtttggtg 11212330  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212331 agggacaaaagtatgagtttttgtcatgtcccttatctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 11212430  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212431 gtcccgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 11212464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3933064 - 3932729
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| ||||||||||||| |  ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3933064 ggtgtgtttggtttgcaaaataacaagtattggataaaacagtataagatagaacagtacaacacaagacaaaacagcacaggacaaattttttatggca 3932965  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  3932964 ttgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttgg 3932865  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3932864 tgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgccccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagaattgtt 3932765  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3932764 ctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3932729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 54 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10324358 - 10324035
Alignment:
Q  54 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaatt 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  10324358 gtttgcaaaacagtaagtaccggacagaacagtacaagatagaacattacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatgggattgagtaatt 10324259  T
Q  153 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataa 252  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10324258 ttttgttttatacgattttttggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 10324159  T
Q  253 aaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtc 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  10324158 aaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactgaacaactagagttgttctgttctgtc 10324059  T
Q  353 cttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10324058 cttcattttttagcaaatcaaacg 10324035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 167130 - 166844
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  167130 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatatgatttttaagggacgaaatgctatttt 167031  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  167030 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttatgtcccttgcctctagtttgtc 166931  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  166930 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaagtagagttgttctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 166844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 42 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11614035 - 11613708
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |          |||    || ||||||||||    
T  11614035 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacacgatagaacagtacaacacagg----------aca----aattttttatggc 11613950  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11613949 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttatacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 11613850  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11613849 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgtctccattttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgt 11613750  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11613749 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 11613708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Original strand, 10485038 - 10485364
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| | |||| |||| ||||||| |||||| |||||| |||    
T  10485038 ttggtttgtaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaaggga-aacaacacaggacaaatatttatgacattgaataa 10485136  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  10485137 ttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 10485236  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  10485237 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaataattttacaaatcaaacactggacaactggagttgttttgtcttg 10485336  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10485337 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 10485364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Original strand, 34176752 - 34177037
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34176752 agaacagtacaacataagacagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 34176851  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34176852 ggtattttagactacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcatgtcacttgcctccagtttgtc 34176951  T
Q  293 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34176952 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaagtgacaactagagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 34177037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Original strand, 17443135 - 17443464
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  17443135 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatattggacagaacagtacaagatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatgacat 17443234  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  17443235 tgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggt 17443334  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||         
T  17443335 gagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacctgaaatggttttacaaatcaaacactggacaactaaagt----- 17443429  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17443430 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 17443464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 84 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32132597 - 32132342
Alignment:
Q  84 agtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaa 182  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32132597 agtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaa 32132498  T
Q  183 atgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32132497 atgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcct 32132398  T
Q  283 ccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32132397 ccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 32132342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 148 - 378
Target Start/End: Original strand, 11382041 - 11382269
Alignment:
Q  148 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  11382041 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgag- 11382139  T
Q  248 gataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 347  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11382140 -acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgttctgtc 11382238  T
Q  348 atgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11382239 atgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 11382269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14925713 - 14925378
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 142  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  14925713 gggtgtgtttggtttgcaaagaagtaagtacgggacataacagtaaaagatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatgaca 14925614  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  14925613 ttgaataattttatgttttatacgatttttaggggacggaatgctattttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggtttgg 14925514  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  14925513 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtc 14925414  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
     |||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14925413 atgtcctgtccttcattttttaacgaatcaaacgca 14925378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Original strand, 18057399 - 18057726
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||| |||||| |||    
T  18057399 ttggtttgcaaaacagtaagtattggatagaacagtaaaagatagaacagcacaacacaaggcataatagcacaggacaaatttgtatgacattgaataa 18057498  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18057499 ttttatgttttatacgatttttagaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggac 18057598  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || || ||    
T  18057599 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttacatctagtttgtcatgtatctcaaacagttttacaaatcaaacattggacaattgaagttgtcctatcctg 18057698  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18057699 tccttcattttttagcgaatcaaacgca 18057726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 133 - 376
Target Start/End: Original strand, 11279090 - 11279333
Alignment:
Q  133 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||     
T  11279090 ttttatggccttgagtaattttttgttttattcgatttttgagggataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgt 11279189  T
Q  233 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279190 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccatgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 11279289  T
Q  333 tagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11279290 tggagttgttctgtcccgtctttcattttttagcaaatcaaacg 11279333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31870349 - 31870019
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| |||| |||||   |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31870349 ttggtttgcaaaacatcaagtattgtacataacagtacaagaaagaacaacacaatataagggagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaataa 31870250  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  31870249 ttttttgttttatacgagttttgggggacgaaatgctatttttgtattttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 31870150  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcc---tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 347  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31870149 aaaaatatcagtttttgttttgtcccttgcctctagtttgttctgttgttcctgagacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtc 31870050  T
Q  348 atgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31870049 cagtccttcattttttagcaaatcaaacgca 31870019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 56 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11675619 - 11675296
Alignment:
Q  56 ttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| |||||   |||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  11675619 ttgcaaaacagtaagtattggacataacaatacaagacagaacaacacaacaaaaggtaaaatagcacatgacaaatttctatagcattgaataattttt 11675520  T
Q  156 t-gttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 254  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  11675519 ttgttttatacgatttttgggggacgagatgccatttaggtattttacaaagcttgtacgtgggataaaaagttgtgttatggtttggtgagagacaaaa 11675420  T
Q  255 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcct 354  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||| |    
T  11675419 atatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggaattgttttgtcttgtctt 11675320  T
Q  355 tcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |  |||||||||||||||||||||    
T  11675319 tatttttttagcaaatcaaacgca 11675296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 51 - 376
Target Start/End: Original strand, 3379591 - 3379915
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||| | |||||  |||||||||| || |||| ||||    ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  ||    
T  3379591 ttggtttgcaaaaccgcaagtatcggacagaacaatacaagacagaataacacaacacaatgcagaacagtacatgtcaaattttaa--gcattgaacaa 3379688  T
Q  151 tttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3379689 tttttttgttttatatgatttttggaggacgaaatgctattttggtatttaagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctatggtttggtgagcga 3379788  T
Q  250 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
     |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3379789 caaaaatatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactaaagttgttctatcat 3379888  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3379889 gtccttcattttttagcaaatcaaacg 3379915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18597407 - 18597080
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||   ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  18597407 ttggtttgtaaaacagtaagtattggacagaacagtacaaagcagaacaacacaacactaggtagaacaacacataataaatttttatggtattgaataa 18597308  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  18597307 ttttttgttttatatgatttttgagggacgaagtactattttagcgttttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 18597208  T
Q  251 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 350  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||  |    
T  18597207 aaaaatttcagattttgtcatgtcccttgcctccggtttgtcatatccctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaaattgttcaatcccg 18597108  T
Q  351 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18597107 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 18597080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 383
Target Start/End: Original strand, 32859922 - 32860263
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||   |||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||     
T  32859922 agggtgtgtttgatttgtagaacagtaagtattggacataacagtacaagataggacaacacaatataaggcagaacagcacaatacaaatttttatggt 32860021  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||  |||||||| | ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  32860022 attgaataattttctgtattatttgatttttgggtgacgaaatgttatttttgtattttagaaaacttgtacgtgagacaaaaggttgtgctgtggtttg 32860121  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    | || ||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32860122 gcgatggacaaaaattgcagcttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcatgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaattggagttgt 32860221  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32860222 tttgtcatgtccttcattttttatcaaatcaaacgcacccta 32860263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 134 - 378
Target Start/End: Original strand, 3290635 - 3290866
Alignment:
Q  134 tttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgct 233  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |    
T  3290635 tttatgacattgaataattgtttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtggga--aaaagttgtgtt 3290732  T
Q  234 gtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3290733 gtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt-----------tgacacagttatacaaatcaaacactgaacaact 3290821  T
Q  334 agagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3290822 agagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3290866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8178141 - 8177804
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||| || |||||||||  | ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||    
T  8178141 agggtgtgtttggtttgcaaaacatgaagcactggatagaacaatacaagatagaatagcacaacacaagacagaacagtacatgacaagttttaatagc 8178042  T
Q  142 attga--gtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    |||||   |  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||    
T  8178041 attgaacatttttttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgaacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 8177942  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |  ||||    
T  8177941 tggtaagggacaaaaatatca-tttttatcctgtcccttgcctccagtttgttttgtacctgaaacagttttataaatcaaacaccggataattgaagtt 8177843  T
Q  340 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8177842 gttttttcatgtcctttattttttagcaaatcaatcgca 8177804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 378
Target Start/End: Original strand, 29054239 - 29054563
Alignment:
Q  52 tggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat 151  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||   |||||| |||  ||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||    
T  29054239 tggtttgcaaaataataagtactggacataacagtacaagataggacaacacaacataagacagaacagcacaagataaatttt-atggtattgaataat 29054337  T
Q  152 tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggata 251  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  29054338 tttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgttattttg-tattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggaca 29054436  T
Q  252 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgt 351  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  | || ||||||  |||    
T  29054437 aaaattgtagtttttgtcatgtcccttgcttccaatttgtcctgttcctgaaactgttttacaaatcaaacattggacagctttaattattctgttctgt 29054536  T
Q  352 ccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29054537 ccttcattttttatcaaatcaaacgca 29054563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 23636097 - 23636428
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||   |||||| |||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  23636097 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactggatataacagtacaagacagaacaacacaacagaaggcagaactgtacatgacagttttttatggcatt 23636196  T
Q  145 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 244  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||   ||||| | |||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||  ||    
T  23636197 gaataattttttgttttatacaattttggggggacgaaatgctattttggatttttaaataacttgtacgtgagacaaaaatttgtgttgtggtttaatg 23636296  T
Q  245 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 344  Q
    |   | |||||||||||||||| || | | |||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  23636297 aataacaaaaatatgagtttttatcctattccttgcatccagtttatcatgtacctaaaacaattttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgttct 23636396  T
Q  345 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23636397 gtcatatccttcattttttagcaaatcaaacg 23636428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 102 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9902857 - 9902579
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat-tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 200  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||  |||||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9902857 acaacacaaggcagatcagtacataacaattttttataacattgaataaaatttttggtttatatgatttttgggggacgaaatgttattttggtatttt 9902758  T
Q  201 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  9902757 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttaatgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcccttacctctagtttgtcctatacct 9902658  T
Q  301 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 379  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9902657 gaaacagttcaacaaattaaacactgaacaactgaagttgttctatcctatccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 9902579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4494348 - 4494079
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  4494348 ttggtttgcaaaacagtaagtactagacagaacagtacaggatagaacagcacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcaatgagta 4494249  T
Q  150 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 249  Q
    ||||||||                 ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4494248 attttttg-----------------gggacaaaatgttatttcggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgaggga 4494166  T
Q  250 taaaaatatgagt-ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 335  Q
     |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4494165 caaaaatatgagttttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaagagtcttacaaatcaaacactggacaactag 4494079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34684247 - 34683929
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatt--ttt 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||   |||||| |||| | |||| |||| || |||    |||    
T  34684247 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaagacaggacaacacaacataaggcataacaacacaggataaaaaagttt 34684148  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgata-ttttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 235  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  34684147 atgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtatttttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgt 34684048  T
Q  236 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 335  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34684047 ggtttggtgagggacaaaa--atgagtttttgtcgtgtcccttgcctccagtttgtcatgtacc--------ttttacaaatcaaaaactggacaactag 34683958  T
Q  336 agttgttctgtcatgtccttcatttttta 364  Q
    ||||| |||| | | ||||| ||||||||    
T  34683957 agttggtctgacctatcctttatttttta 34683929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14808254 - 14807940
Alignment:
Q  46 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 145  Q
    |||| |||||||||||||||  || || || ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14808254 tgtgtttggtttgcaaaacaacaaatattgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaatagcacaggacaaatttttatggaattg 14808155  T
Q  146 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 245  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  14808154 aataatttttagttttatacgatttttgggggatgaaatgttattttggta-cttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 14808056  T
Q  246 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 345  Q
    |||| |||||||| | ||||| || | ||||||||||| |||||                  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14808055 gggacaaaaatatcaatttttatcctatcccttgcctctagttt-----------------attttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctg 14807973  T
Q  346 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807972 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 14807940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 193
Target Start/End: Original strand, 29814736 - 29814887
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaa-atttttatggc 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  29814736 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttatggc 29814835  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29814836 attgagtaatgttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttg 29814887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 193
Target Start/End: Original strand, 28502330 - 28502482
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt--atgg 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||   |||    
T  28502330 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttattgg 28502429  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28502430 cattgagtaatgttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttg 28502482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7396302 - 7396048
Alignment:
Q  121 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggat 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | |||| |||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||     
T  7396302 cacatgacaaatttttatggtattgaataatttt--gtctcataccatttttgatggacaaaacactatttttgtattttagataacttgtacgtgagac 7396205  T
Q  221 gaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 320  Q
     ||||||||||  ||||||| |||||||| || | | |  ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  7396204 aaaaagttgtgtagtggtttagtgagggacaagatt-tctgtttttgtcctgtccattgcttccagcttgtcatgtcccagaaacagctttacaaatcaa 7396106  T
Q  321 acactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||   ||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7396105 acaccatacaactgaaattgttttgtcatgtccttcatttcttagcaaatcaaacgca 7396048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 9613998 - 9614177
Alignment:
Q  195 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||| || ||||| |||||  | |||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9613998 tattttagacaacttatacgtggaacaaaaaattgtgttgcggtttagtgagtaacaaaaacttcaaattttgtcatgtcccttgcctccagtttatcct 9614097  T
Q  295 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9614098 gtccttgaaacagttttacaaatcaaacattgtacaactgaagttttcttgttatgtccttcattttttagcagatcaaa 9614177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 136
Target Start/End: Original strand, 32805348 - 32805442
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32805348 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttt 32805442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35004326 - 35004087
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| || ||||| || |||||| |||||| |  |||||||  ||||||||||||||||    
T  35004326 acaatacaaggcagaacaacacataacaaacttttatgatattgaatagtttttggtattatacaattttttattgacaaaaatctattttgatatttta 35004227  T
Q  202 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 301  Q
    || |||||||||||||||  || ||||||| |||||||   |||| || |||||  | |||||||||| |||| |||| |||| |||| || ||| |       
T  35004226 gaaaacttgtacgtgggacaaagagttgtgttgtggttatatgagagacaaaaaatttagtttttgtcttgtctcttgtctccggtttatcttgtcctat 35004127  T
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  35004126 aaaccgttttacaaatcaaacaccgcacaactggagttgt 35004087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27824849 - 27824620
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtag-aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 200  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||    
T  27824849 acaacacaaggttggaacaatacatgacaaacttttatggtattgaataatttttgatcttatatgatttttgttggacaaaaagctatttttgtatttt 27824750  T
Q  201 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 300  Q
     || |||| ||||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||| ||   | |   || || || | ||||||||||| |||||||||| | ||     
T  27824749 ggataactcgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtataatgagggacaatttttt---ttcttctcttatcccttgcctctagtttgtcctttccca 27824653  T
Q  301 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 333  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27824652 aaaacagttttacaaatcaaacactgtacaact 27824620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 119
Target Start/End: Original strand, 11381964 - 11382040
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaaca 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11381964 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaaca 11382040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14925215 - 14925139
Alignment:
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14925215 aaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 14925139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9200491 - 9200316
Alignment:
Q  197 ttttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccctt-gcctccagtttgtcctg 295  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||  | ||||||||||||||| || ||| |  ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  9200491 ttttaaacaatttgtatgtgggacaaaaagttgttatatggtttggtgagggagaagaatttttgtttttgtcttgtctcttagcctctagtttgtcatg 9200392  T
Q  296 tacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatc 371  Q
    |   | |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  9200391 tctttaaaacagttttacaaatcaaacattgtacaacttgagttgtcatgtcttgtccttaactttttagcaaatc 9200316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Original strand, 33041403 - 33041472
Alignment:
Q  308 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||    
T  33041403 ttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctattcttcattttttaacaaatcaaacgc 33041472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 11279012 - 11279075
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacac 108  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11279012 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacac 11279075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 308 - 375
Target Start/End: Original strand, 13415861 - 13415928
Alignment:
Q  308 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13415861 ttttacaaatcaaacactgtacaactagagttgttatgttctgtctttcgttttttagcaaatcaaac 13415928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28967414 - 28967221
Alignment:
Q  180 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |||||||| | |||||||  ||||   | ||  |  |  |||||||||  ||| | ||    
T  28967414 aaaatgctattttgataatttagacaacttgtacttgaaataaaaagttgggttgtggttcagtgaaaaacaatcacttttgtttttgtcccgtctcgtg 28967315  T
Q  280 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||| |||  | || |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28967314 cctccagtttgtcatgttcttggaacagttttacaaattaaagactctataattgaagtt-ttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 28967221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 375
Target Start/End: Original strand, 34402850 - 34402992
Alignment:
Q  225 agttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 324  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| || ||| | |||||||||| | |||||   |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    |    
T  34402850 agttgtgctgtgatttgataagggacaataatttcagtttttgtcgtatccct---ctccagtttgttttgt-cctgaaacaattttacaaatca----c 34402941  T
Q  325 tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34402942 tggacaattgaagttgttctgtcttgtcctccattttttaacaaatcaaac 34402992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32614136 - 32614030
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    ||||||||||| | |||| || |||||||| |||||||| |||   |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||    
T  32614136 acaacacaaggcataacaacatatgacaaacttttatggtattatataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaagttatttttatatttta 32614037  T
Q  202 gacaact 208  Q
    || ||||    
T  32614036 gataact 32614030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Original strand, 34176715 - 34176760
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34176715 agggtgggtttggtttgcaaaacggtaagtactggacagaacagta 34176760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 167170 - 167122
Alignment:
Q  39 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  167170 ctaagggtgtgtttgatgtgcaaaacagtaaatactggacagaacagta 167122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Original strand, 27756314 - 27756370
Alignment:
Q  180 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||    
T  27756314 aaaatgttattttgatattttagacaacttatacgggggacaaaaagttgtgttgtg 27756370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29424570 - 29424498
Alignment:
Q  302 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  | || |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29424570 aaacaattttacaaataaaacactatagaattagagttgtcatgtcatgtcctttattttctagcaaatcaaa 29424498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29203104 - 29202990
Alignment:
Q  122 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatg 221  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| || ||||   ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| || ||      
T  29203104 acatgacaaatttttatgatattgaacaattatttgtcttatatgaatttttgtggacaaaatgct-ctttggtattttaaacaacttgtacttgagaga 29203006  T
Q  222 aaaagttgtgctgtgg 237  Q
    |||||||||| |||||    
T  29203005 aaaagttgtgttgtgg 29202990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16542440 - 16542362
Alignment:
Q  135 ttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||||  | | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16542440 ttatggtattgaataattttttatcttatacaatttttgttgcataaaaggttattttggtattttagacaacttgtac 16542362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 284
Target Start/End: Original strand, 24785106 - 24785168
Alignment:
Q  222 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc 284  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24785106 aaaaattgtgttgtggtttagtgagcgacaagaatttcagtttttgtcatgtcccttgcctcc 24785168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29424734 - 29424652
Alignment:
Q  133 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 215  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||  ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  29424734 ttttatggtattgaataatttttggtcttgtacgttttttggtggacaaaaaactatttttgtattttagataacttgtacgt 29424652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15400760 - 15400672
Alignment:
Q  122 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15400760 acatgacaaacttttatggtattga---attttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtac 15400672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15412547 - 15412459
Alignment:
Q  122 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15412547 acatgacaaacttttatggtattga---attttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtac 15412459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15428141 - 15428053
Alignment:
Q  122 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15428141 acatgacaaacttttatggtattga---attttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtac 15428053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 206
Target Start/End: Original strand, 7365318 - 7365422
Alignment:
Q  102 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 201  Q
    |||||||||| || || | ||||| | | |||||||||| ||| | |||||||| || |||||| ||||||   |||||||   ||||||||||||||||    
T  7365318 acaacacaagttaaaataacacataatatatttttatggtattaaataatttttagtcttataccattttttgcggacaaatgactattttgatatttta 7365417  T
Q  202 gacaa 206  Q
    |||||    
T  7365418 gacaa 7365422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 101819 - 102156
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  101819 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtaccggacagaacagtataagatagaacagtacaatataaggtagaacagcacaggacaaattttttatgg 101918  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  101919 cattgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 102018  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  102019 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtccgttgcctccaagttgtcctgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttg 102118  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102119 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 102156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 43 - 383
Target Start/End: Original strand, 23448 - 23787
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  23448 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactggacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcactggacaaattttttatggc 23547  T
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23548 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaa--tgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 23645  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 341  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23646 gtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcaagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 23745  T
Q  342 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23746 tctgtcctgcccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 23787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 326
Target Start/End: Original strand, 19857 - 20062
Alignment:
Q  121 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggat 220  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |  |||| |||||||||| | ||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||  |     
T  19857 cacatgacaaacttttatggtattgaataatatttggcgttatgcgatttttgatgaacaaaagactattttggtatttcaaacaacttgtacgtgaaac 19956  T
Q  221 gaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 320  Q
     ||||||||| | ||||||| ||||| || || ||| | |||||||||||| ||||||  || || |||||| | |  || ||||||||||||| |||||    
T  19957 aaaaagttgtacagtggtttagtgagtgacaagaatttcagtttttgtcatatcccttttctacaatttgtcttatctctaaaacagttttacatatcaa 20056  T
Q  321 acactg 326  Q
    ||||||    
T  20057 acactg 20062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 40 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2566 - 2222
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2566 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttat 2467  T
Q  139 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 238  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2466 gacattgagtaattttttgttttataggatttttatgggacaaaaaactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 2367  T
Q  239 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  2366 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact-gaaaactaaagt 2268  T
Q  339 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 384  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2267 tgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 2222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Original strand, 51311 - 51645
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  51311 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaatatagaacagtataatacaagacagaacagcacaagacaaattttttatgaca 51410  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  51411 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt-g 51509  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  51510 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcatccagtttgttctgcacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattaaagttgtt 51609  T
Q  343 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51610 ctgttttgtccttcattttttatcaaatcaaacgca 51645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 38 - 383
Target Start/End: Original strand, 15038 - 15384
Alignment:
Q  38 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatt-ttt 136  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||   |||    
T  15038 tctatgggggtgtttggtttgcaaaacagtaagtaccggacagaacagtacaaaatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgaaaaaaaattt 15137  T
Q  137 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  15138 atggcattgagtaatttgttgttttataagatttttgggggacaaaatactattttagtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtg 15237  T
Q  237 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 336  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15238 gtttggtgggggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattaga 15337  T
Q  337 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 383  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15338 gttgttttgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 15384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 44 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18278 - 17982
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  18278 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagca 18179  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  18178 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 18079  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 17982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 44 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12760 - 12527
Alignment:
Q  44 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  12760 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagca 12661  T
Q  143 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12660 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 12561  T
Q  243 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccc 276  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12560 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccc 12527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0729 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0729
Description:

Target: scaffold0729; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4796 - 4468
Alignment:
Q  45 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4796 gtgtgtttggtttgcaaaacag------ctggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 4703  T
Q  144 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  4702 tgagtaattttttgttttatacgattttttagagacaaaatgatattttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 4603  T
Q  244 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4602 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctatacctaaatcaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 4503  T
Q  344 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4502 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 4468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0957 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0957
Description:

Target: scaffold0957; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 68 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2695 - 2385
Alignment:
Q  68 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacg 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  2695 aagtactggacataacagtataagatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatgagattgggtaattttttgttttatacg 2596  T
Q  167 atttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttttt 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  2595 atttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagac-aatagttgtgttgtggtttggttagggacaaagatatgagttttt 2497  T
Q  267 gtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagc 366  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  2496 gtcctgtccctttcctccaatttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttatgtcttgtccttcaatttttagc 2397  T
Q  367 aaatcaaacgca 378  Q
    ||||||||||||    
T  2396 aaatcaaacgca 2385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 51 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5656 - 5332
Alignment:
Q  51 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  5656 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagacagaacaacacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 5557  T
Q  151 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  5556 ttttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggac 5457  T
Q  251 aaaaatatgag-tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 349  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  5456 aaaaatatgtgttttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgttct 5357  T
Q  350 gtccttcattttttagcaaatcaaa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5356 gtccttcattttttagcaaatcaaa 5332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 100 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19258 - 18989
Alignment:
Q  100 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  19258 gtacaacacaaggtagaacagcacatggcaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgttattttggtatt 19159  T
Q  199 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 298  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19158 ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtac 19060  T
Q  299 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaat 370  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19059 ctg-aacagttttacaaatcaaacactggacaaatataattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaat 18989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15551 - 15262
Alignment:
Q  94 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  15551 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagg----aaatgctatttt 15456  T
Q  193 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtca--------tgtcccttgcctcc 284  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  15455 ggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtgatcttgtcccttgcctcc 15356  T
Q  285 agtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15355 agtttatcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctatcatgttcttcattttttagcaaatcaaacgca 15262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13554
Alignment:
Q  142 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 241  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||  ||  |||     
T  13704 attgattaattattggtcttatacgatttttgatggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacatgtgacaaaaagttgtgtcgtatttta 13605  T
Q  242 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 292  Q
    ||||| || | |||| | | |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  13604 gtgagagacacaaatttcaatttttgtcatgtctattgcctccaatttgtc 13554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15587 - 15543
Alignment:
Q  43 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacagaacagta 15543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 132 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 373099 - 372856
Alignment:
Q  132 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  373099 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgatattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 373000  T
Q  232 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 331  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  372999 ttatggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatatcccttgtctccagttttttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacatttgacaa 372900  T
Q  332 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  372899 ctaaaattgttctgtcatatccttcattttttagcaaataaaac 372856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 373176 - 373130
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  373176 aaggatgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactgaacagaacagta 373130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13913 - 13576
Alignment:
Q  41 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 140  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   | || |||||| | ||  ||||| |||||||||||||||    
T  13913 aagggtgcgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataatgcagaacaacaaaatacaaggcataattgcacaggacaaatttttatgg 13814  T
Q  141 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 240  Q
     ||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  13813 tattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacggaatgctattttggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggttt 13714  T
Q  241 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 340  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13713 ggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctatcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactggagttg 13614  T
Q  341 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13613 ttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 13576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0650 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0650
Description:

Target: scaffold0650; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1870 - 1531
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||   | ||| | ||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||    
T  1870 taagggtgcgtttgatttgcaaaacaataagtatttgacagaactgtacaaagcaaaacagcacaacacaagagagaacaacacagaacaaatttttatg 1771  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  1770 gtattgaataattttttgttttatatgacttttgagggacgaaatgctattttggttttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 1671  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  1670 tggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctatccttgaaacagttttacaaatcaaacactggagaactgaagtt 1571  T
Q  340 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 379  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1570 gttctgttttgtccttcattttttaacaaatcaaacgcaa 1531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43176 - 42843
Alignment:
Q  40 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 139  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||| | |||| |||||| | || |  |||   ||||||||| ||    
T  43176 taagggtgcgtttggtttgcaaaacagtaagtactagacagagcagtacaatgcagaacagcacaatacaaggcataataatacagatcaaatttttgtg 43077  T
Q  140 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 239  Q
    | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  43076 gtattgaataatttcttgttttatatgattgtttggggacaacatgctattttggtgttttagacaa-ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 42978  T
Q  240 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 339  Q
    |||||||||| | |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  42977 tggtgagggacacaaatttcagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacta-tggagtt 42879  T
Q  340 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 375  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  42878 gttctgtcttatccttcattttttaacaaatcaaac 42843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 222 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19201 - 19044
Alignment:
Q  222 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 321  Q
    |||||||||| || | |||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19201 aaaagttgtgttgagctttgatgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtccattgcctcctgtttattctgtccctgaaacagttttacaaatcaaa 19102  T
Q  322 cactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 378  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19101 cactggataactggaattgttatgtcctatccttcatttttttaacaaatcaaacgca 19044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33678 - 33530
Alignment:
Q  133 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc 232  Q
    |||||||  ||||| |||||||| || |||||| | |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||     
T  33678 ttttatgatattgaataatttttggtcttatacaagttttgatggacaaaagcctattttggtattttatacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgt 33579  T
Q  233 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 282  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||||    
T  33578 tgtggtttgatgagggacaagaatttca-tttttgtcatgtcccttgcct 33530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3791 - 3683
Alignment:
Q  104 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttaga 203  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||||  |||||||  |||||||||    
T  3791 aacacaaggtagaatagtacatgacaaacttttatgatattgaataattttttatcttatatgatttttggtggataaaaaactatttttgtattttaga 3692  T
Q  204 caacttgta 212  Q
     ||||||||    
T  3691 taacttgta 3683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1112 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1112
Description:

Target: scaffold1112; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 198
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1127
Alignment:
Q  149 aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1078 aatttttggttttatacgatttttgagggacaagatgatattttgatatt 1127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Original strand, 338757 - 338802
Alignment:
Q  42 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  338757 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagta 338802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University